Genes within 1Mb (chr1:34283059:C:T):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD


Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000116544 DLGAP3 -646591 sc-eQTL 9.28e-01 -0.0101 0.111 0.182 B L1
ENSG00000116560 SFPQ -910086 sc-eQTL 7.60e-01 -0.0129 0.0422 0.182 B L1
ENSG00000134686 PHC2 852007 sc-eQTL 5.05e-01 -0.0594 0.089 0.182 B L1
ENSG00000146463 ZMYM4 -985650 sc-eQTL 1.54e-01 -0.105 0.0731 0.182 B L1
ENSG00000163866 SMIM12 -576696 sc-eQTL 7.70e-01 -0.0276 0.0942 0.182 B L1
ENSG00000163867 ZMYM6 -748886 sc-eQTL 3.27e-01 0.101 0.103 0.182 B L1
ENSG00000197056 ZMYM1 -749113 sc-eQTL 8.82e-01 0.0149 0.0998 0.182 B L1
ENSG00000243749 TMEM35B -702294 sc-eQTL 2.65e-02 0.133 0.0596 0.182 B L1
ENSG00000116544 DLGAP3 -646591 sc-eQTL 1.85e-01 -0.123 0.0927 0.182 CD4T L1
ENSG00000116560 SFPQ -910086 sc-eQTL 6.74e-01 -0.0151 0.0358 0.182 CD4T L1
ENSG00000134686 PHC2 852007 sc-eQTL 9.74e-01 0.00247 0.0748 0.182 CD4T L1
ENSG00000146463 ZMYM4 -985650 sc-eQTL 1.63e-01 0.0873 0.0624 0.182 CD4T L1
ENSG00000163866 SMIM12 -576696 sc-eQTL 6.97e-01 0.0305 0.0783 0.182 CD4T L1
ENSG00000163867 ZMYM6 -748886 sc-eQTL 6.39e-01 0.0452 0.0964 0.182 CD4T L1
ENSG00000197056 ZMYM1 -749113 sc-eQTL 2.78e-01 0.0717 0.066 0.182 CD4T L1
ENSG00000243749 TMEM35B -702294 sc-eQTL 7.67e-02 0.0759 0.0427 0.182 CD4T L1
ENSG00000116544 DLGAP3 -646591 sc-eQTL 8.39e-03 0.284 0.107 0.182 CD8T L1
ENSG00000116560 SFPQ -910086 sc-eQTL 1.37e-01 -0.0559 0.0375 0.182 CD8T L1
ENSG00000134686 PHC2 852007 sc-eQTL 9.32e-01 0.00728 0.0851 0.182 CD8T L1
ENSG00000146463 ZMYM4 -985650 sc-eQTL 1.37e-01 -0.124 0.0832 0.182 CD8T L1
ENSG00000163866 SMIM12 -576696 sc-eQTL 4.16e-01 0.0735 0.0902 0.182 CD8T L1
ENSG00000163867 ZMYM6 -748886 sc-eQTL 9.66e-03 0.286 0.109 0.182 CD8T L1
ENSG00000197056 ZMYM1 -749113 sc-eQTL 2.95e-01 0.0994 0.0947 0.182 CD8T L1
ENSG00000243749 TMEM35B -702294 sc-eQTL 5.47e-01 0.033 0.0548 0.182 CD8T L1
ENSG00000116544 DLGAP3 -646591 sc-eQTL 4.99e-01 0.0717 0.106 0.185 DC L1
ENSG00000116560 SFPQ -910086 sc-eQTL 8.94e-01 -0.00883 0.066 0.185 DC L1
ENSG00000134686 PHC2 852007 sc-eQTL 4.92e-01 0.0529 0.0768 0.185 DC L1
ENSG00000146463 ZMYM4 -985650 sc-eQTL 4.69e-01 -0.071 0.0978 0.185 DC L1
ENSG00000163866 SMIM12 -576696 sc-eQTL 3.76e-01 -0.0927 0.105 0.185 DC L1
ENSG00000163867 ZMYM6 -748886 sc-eQTL 8.01e-01 0.025 0.0992 0.185 DC L1
ENSG00000197056 ZMYM1 -749113 sc-eQTL 2.11e-01 -0.135 0.107 0.185 DC L1
ENSG00000243749 TMEM35B -702294 sc-eQTL 9.79e-01 0.00246 0.0952 0.185 DC L1
ENSG00000116544 DLGAP3 -646591 sc-eQTL 7.61e-01 -0.0321 0.106 0.182 Mono L1
ENSG00000116560 SFPQ -910086 sc-eQTL 7.19e-01 0.0196 0.0543 0.182 Mono L1
ENSG00000134686 PHC2 852007 sc-eQTL 8.26e-01 0.0124 0.0561 0.182 Mono L1
ENSG00000146463 ZMYM4 -985650 sc-eQTL 2.07e-01 -0.0837 0.0661 0.182 Mono L1
ENSG00000163866 SMIM12 -576696 sc-eQTL 1.48e-01 -0.116 0.0797 0.182 Mono L1
ENSG00000163867 ZMYM6 -748886 sc-eQTL 1.58e-01 0.112 0.0788 0.182 Mono L1
ENSG00000197056 ZMYM1 -749113 sc-eQTL 6.92e-02 0.163 0.0895 0.182 Mono L1
ENSG00000243749 TMEM35B -702294 sc-eQTL 5.07e-01 0.0506 0.0763 0.182 Mono L1
ENSG00000116544 DLGAP3 -646591 sc-eQTL 2.30e-01 0.136 0.113 0.182 NK L1
ENSG00000116560 SFPQ -910086 sc-eQTL 4.16e-01 -0.0417 0.0511 0.182 NK L1
ENSG00000134686 PHC2 852007 sc-eQTL 1.69e-01 0.119 0.0866 0.182 NK L1
ENSG00000146463 ZMYM4 -985650 sc-eQTL 6.39e-01 -0.0309 0.0657 0.182 NK L1
ENSG00000163866 SMIM12 -576696 sc-eQTL 9.89e-01 -0.00138 0.0988 0.182 NK L1
ENSG00000163867 ZMYM6 -748886 sc-eQTL 1.72e-01 0.147 0.107 0.182 NK L1
ENSG00000197056 ZMYM1 -749113 sc-eQTL 4.99e-01 -0.0679 0.1 0.182 NK L1
ENSG00000243749 TMEM35B -702294 sc-eQTL 6.38e-01 0.0243 0.0515 0.182 NK L1
ENSG00000116544 DLGAP3 -646591 sc-eQTL 2.81e-01 -0.125 0.115 0.182 Other_T L1
ENSG00000116560 SFPQ -910086 sc-eQTL 2.20e-01 0.0734 0.0597 0.182 Other_T L1
ENSG00000134686 PHC2 852007 sc-eQTL 1.87e-02 -0.211 0.0891 0.182 Other_T L1
ENSG00000146463 ZMYM4 -985650 sc-eQTL 1.34e-01 -0.142 0.0942 0.182 Other_T L1
ENSG00000163866 SMIM12 -576696 sc-eQTL 6.79e-01 -0.0406 0.0979 0.182 Other_T L1
ENSG00000163867 ZMYM6 -748886 sc-eQTL 8.60e-01 0.0206 0.117 0.182 Other_T L1
ENSG00000197056 ZMYM1 -749113 sc-eQTL 9.70e-01 0.0037 0.0983 0.182 Other_T L1
ENSG00000243749 TMEM35B -702294 sc-eQTL 1.46e-01 -0.0937 0.0642 0.182 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000116544 DLGAP3 -646591 sc-eQTL 1.32e-01 -0.158 0.104 0.179 B_Activated L2
ENSG00000116560 SFPQ -910086 sc-eQTL 7.03e-01 -0.0311 0.0814 0.179 B_Activated L2
ENSG00000134686 PHC2 852007 sc-eQTL 7.92e-01 0.0331 0.126 0.179 B_Activated L2
ENSG00000146463 ZMYM4 -985650 sc-eQTL 7.29e-01 -0.0471 0.136 0.179 B_Activated L2
ENSG00000163866 SMIM12 -576696 sc-eQTL 1.03e-01 0.223 0.136 0.179 B_Activated L2
ENSG00000163867 ZMYM6 -748886 sc-eQTL 4.28e-01 0.108 0.136 0.179 B_Activated L2
ENSG00000197056 ZMYM1 -749113 sc-eQTL 8.22e-01 0.0256 0.114 0.179 B_Activated L2
ENSG00000243749 TMEM35B -702294 sc-eQTL 5.06e-01 -0.0749 0.112 0.179 B_Activated L2
ENSG00000116544 DLGAP3 -646591 sc-eQTL 5.51e-01 0.0673 0.113 0.18 B_Intermediate L2
ENSG00000116560 SFPQ -910086 sc-eQTL 8.52e-01 -0.0116 0.0621 0.18 B_Intermediate L2
ENSG00000134686 PHC2 852007 sc-eQTL 7.52e-01 -0.0312 0.0985 0.18 B_Intermediate L2
ENSG00000146463 ZMYM4 -985650 sc-eQTL 8.10e-01 0.0239 0.0993 0.18 B_Intermediate L2
ENSG00000163866 SMIM12 -576696 sc-eQTL 5.74e-01 -0.0658 0.117 0.18 B_Intermediate L2
ENSG00000163867 ZMYM6 -748886 sc-eQTL 4.71e-01 0.083 0.115 0.18 B_Intermediate L2
ENSG00000197056 ZMYM1 -749113 sc-eQTL 5.00e-01 -0.0804 0.119 0.18 B_Intermediate L2
ENSG00000243749 TMEM35B -702294 sc-eQTL 1.18e-01 0.138 0.0877 0.18 B_Intermediate L2
ENSG00000116544 DLGAP3 -646591 sc-eQTL 9.89e-01 -0.00145 0.108 0.181 B_Memory L2
ENSG00000116560 SFPQ -910086 sc-eQTL 8.86e-01 -0.00989 0.069 0.181 B_Memory L2
ENSG00000134686 PHC2 852007 sc-eQTL 6.05e-01 -0.0538 0.104 0.181 B_Memory L2
ENSG00000146463 ZMYM4 -985650 sc-eQTL 8.96e-01 -0.014 0.107 0.181 B_Memory L2
ENSG00000163866 SMIM12 -576696 sc-eQTL 2.49e-01 0.133 0.115 0.181 B_Memory L2
ENSG00000163867 ZMYM6 -748886 sc-eQTL 4.20e-01 0.0968 0.12 0.181 B_Memory L2
ENSG00000197056 ZMYM1 -749113 sc-eQTL 1.04e-01 -0.187 0.114 0.181 B_Memory L2
ENSG00000243749 TMEM35B -702294 sc-eQTL 9.44e-01 0.00592 0.0839 0.181 B_Memory L2
ENSG00000116544 DLGAP3 -646591 sc-eQTL 2.94e-01 0.119 0.113 0.182 B_Naive1 L2
ENSG00000116560 SFPQ -910086 sc-eQTL 3.31e-01 -0.0507 0.052 0.182 B_Naive1 L2
ENSG00000134686 PHC2 852007 sc-eQTL 6.95e-01 -0.0372 0.0948 0.182 B_Naive1 L2
ENSG00000146463 ZMYM4 -985650 sc-eQTL 3.14e-01 -0.0909 0.0901 0.182 B_Naive1 L2
ENSG00000163866 SMIM12 -576696 sc-eQTL 8.24e-01 -0.0247 0.111 0.182 B_Naive1 L2
ENSG00000163867 ZMYM6 -748886 sc-eQTL 9.80e-01 0.00288 0.114 0.182 B_Naive1 L2
ENSG00000197056 ZMYM1 -749113 sc-eQTL 8.21e-01 0.0243 0.107 0.182 B_Naive1 L2
ENSG00000243749 TMEM35B -702294 sc-eQTL 4.19e-01 0.0669 0.0827 0.182 B_Naive1 L2
ENSG00000116544 DLGAP3 -646591 sc-eQTL 4.45e-01 -0.0968 0.127 0.18 B_Naive2 L2
ENSG00000116560 SFPQ -910086 sc-eQTL 9.30e-01 0.00585 0.0661 0.18 B_Naive2 L2
ENSG00000134686 PHC2 852007 sc-eQTL 6.05e-01 -0.0544 0.105 0.18 B_Naive2 L2
ENSG00000146463 ZMYM4 -985650 sc-eQTL 5.49e-01 -0.062 0.103 0.18 B_Naive2 L2
ENSG00000163866 SMIM12 -576696 sc-eQTL 3.09e-01 -0.126 0.124 0.18 B_Naive2 L2
ENSG00000163867 ZMYM6 -748886 sc-eQTL 9.47e-01 0.00822 0.124 0.18 B_Naive2 L2
ENSG00000197056 ZMYM1 -749113 sc-eQTL 1.44e-01 0.171 0.117 0.18 B_Naive2 L2
ENSG00000243749 TMEM35B -702294 sc-eQTL 1.67e-01 0.117 0.0842 0.18 B_Naive2 L2
ENSG00000116544 DLGAP3 -646591 sc-eQTL 4.75e-01 -0.0801 0.112 0.182 CD4_CTL L2
ENSG00000116560 SFPQ -910086 sc-eQTL 2.19e-01 0.0992 0.0804 0.182 CD4_CTL L2
ENSG00000134686 PHC2 852007 sc-eQTL 4.83e-02 -0.211 0.106 0.182 CD4_CTL L2
ENSG00000146463 ZMYM4 -985650 sc-eQTL 2.23e-01 0.148 0.121 0.182 CD4_CTL L2
ENSG00000163866 SMIM12 -576696 sc-eQTL 4.67e-01 0.0836 0.115 0.182 CD4_CTL L2
ENSG00000163867 ZMYM6 -748886 sc-eQTL 7.88e-01 0.0335 0.124 0.182 CD4_CTL L2
ENSG00000197056 ZMYM1 -749113 sc-eQTL 7.34e-01 -0.0428 0.126 0.182 CD4_CTL L2
ENSG00000243749 TMEM35B -702294 sc-eQTL 1.77e-01 0.128 0.0948 0.182 CD4_CTL L2
ENSG00000116544 DLGAP3 -646591 sc-eQTL 8.76e-01 0.0168 0.108 0.182 CD4_Naive L2
ENSG00000116560 SFPQ -910086 sc-eQTL 7.59e-01 -0.0115 0.0375 0.182 CD4_Naive L2
ENSG00000134686 PHC2 852007 sc-eQTL 7.32e-01 0.0267 0.0778 0.182 CD4_Naive L2
ENSG00000146463 ZMYM4 -985650 sc-eQTL 2.76e-01 0.0739 0.0678 0.182 CD4_Naive L2
ENSG00000163866 SMIM12 -576696 sc-eQTL 6.78e-01 -0.0318 0.0764 0.182 CD4_Naive L2
ENSG00000163867 ZMYM6 -748886 sc-eQTL 8.49e-01 0.0196 0.103 0.182 CD4_Naive L2
ENSG00000197056 ZMYM1 -749113 sc-eQTL 4.15e-01 0.0641 0.0785 0.182 CD4_Naive L2
ENSG00000243749 TMEM35B -702294 sc-eQTL 7.06e-01 0.0176 0.0467 0.182 CD4_Naive L2
ENSG00000116544 DLGAP3 -646591 sc-eQTL 2.17e-01 -0.117 0.0947 0.182 CD4_TCM L2
ENSG00000116560 SFPQ -910086 sc-eQTL 5.50e-01 -0.0269 0.0449 0.182 CD4_TCM L2
ENSG00000134686 PHC2 852007 sc-eQTL 7.74e-01 0.0252 0.0879 0.182 CD4_TCM L2
ENSG00000146463 ZMYM4 -985650 sc-eQTL 2.97e-01 0.0884 0.0846 0.182 CD4_TCM L2
ENSG00000163866 SMIM12 -576696 sc-eQTL 3.11e-01 0.101 0.0994 0.182 CD4_TCM L2
ENSG00000163867 ZMYM6 -748886 sc-eQTL 7.45e-01 0.0364 0.112 0.182 CD4_TCM L2
ENSG00000197056 ZMYM1 -749113 sc-eQTL 3.06e-01 -0.0921 0.0897 0.182 CD4_TCM L2
ENSG00000243749 TMEM35B -702294 sc-eQTL 3.49e-02 0.107 0.0506 0.182 CD4_TCM L2
ENSG00000116544 DLGAP3 -646591 sc-eQTL 1.90e-01 -0.152 0.116 0.182 CD4_TEM L2
ENSG00000116560 SFPQ -910086 sc-eQTL 5.02e-01 0.0352 0.0523 0.182 CD4_TEM L2
ENSG00000134686 PHC2 852007 sc-eQTL 9.42e-01 -0.00751 0.103 0.182 CD4_TEM L2
ENSG00000146463 ZMYM4 -985650 sc-eQTL 9.37e-01 0.00851 0.107 0.182 CD4_TEM L2
ENSG00000163866 SMIM12 -576696 sc-eQTL 1.16e-01 -0.171 0.108 0.182 CD4_TEM L2
ENSG00000163867 ZMYM6 -748886 sc-eQTL 4.09e-01 -0.0923 0.112 0.182 CD4_TEM L2
ENSG00000197056 ZMYM1 -749113 sc-eQTL 6.99e-02 0.197 0.108 0.182 CD4_TEM L2
ENSG00000243749 TMEM35B -702294 sc-eQTL 5.72e-01 0.0393 0.0695 0.182 CD4_TEM L2
ENSG00000116544 DLGAP3 -646591 sc-eQTL 7.86e-01 0.0309 0.114 0.182 CD8_CTL L2
ENSG00000116560 SFPQ -910086 sc-eQTL 7.37e-01 0.0205 0.0608 0.182 CD8_CTL L2
ENSG00000134686 PHC2 852007 sc-eQTL 6.88e-01 -0.0378 0.0941 0.182 CD8_CTL L2
ENSG00000146463 ZMYM4 -985650 sc-eQTL 1.58e-01 -0.13 0.092 0.182 CD8_CTL L2
ENSG00000163866 SMIM12 -576696 sc-eQTL 2.65e-01 -0.123 0.11 0.182 CD8_CTL L2
ENSG00000163867 ZMYM6 -748886 sc-eQTL 7.82e-01 0.0324 0.117 0.182 CD8_CTL L2
ENSG00000197056 ZMYM1 -749113 sc-eQTL 6.11e-01 0.0517 0.101 0.182 CD8_CTL L2
ENSG00000243749 TMEM35B -702294 sc-eQTL 8.88e-01 0.00981 0.0693 0.182 CD8_CTL L2
ENSG00000116544 DLGAP3 -646591 sc-eQTL 2.92e-01 0.122 0.116 0.182 CD8_Naive L2
ENSG00000116560 SFPQ -910086 sc-eQTL 6.92e-01 -0.0182 0.0459 0.182 CD8_Naive L2
ENSG00000134686 PHC2 852007 sc-eQTL 7.36e-01 0.0323 0.0957 0.182 CD8_Naive L2
ENSG00000146463 ZMYM4 -985650 sc-eQTL 4.02e-01 -0.0703 0.0838 0.182 CD8_Naive L2
ENSG00000163866 SMIM12 -576696 sc-eQTL 1.35e-01 0.144 0.0959 0.182 CD8_Naive L2
ENSG00000163867 ZMYM6 -748886 sc-eQTL 1.79e-02 0.266 0.111 0.182 CD8_Naive L2
ENSG00000197056 ZMYM1 -749113 sc-eQTL 4.83e-02 0.209 0.105 0.182 CD8_Naive L2
ENSG00000243749 TMEM35B -702294 sc-eQTL 5.26e-01 -0.0395 0.0622 0.182 CD8_Naive L2
ENSG00000116544 DLGAP3 -646591 sc-eQTL 8.98e-02 0.202 0.119 0.176 CD8_TCM L2
ENSG00000116560 SFPQ -910086 sc-eQTL 2.05e-01 0.0861 0.0677 0.176 CD8_TCM L2
ENSG00000134686 PHC2 852007 sc-eQTL 2.20e-01 0.12 0.0978 0.176 CD8_TCM L2
ENSG00000146463 ZMYM4 -985650 sc-eQTL 3.85e-02 0.242 0.116 0.176 CD8_TCM L2
ENSG00000163866 SMIM12 -576696 sc-eQTL 1.62e-01 0.163 0.116 0.176 CD8_TCM L2
ENSG00000163867 ZMYM6 -748886 sc-eQTL 3.85e-01 -0.111 0.127 0.176 CD8_TCM L2
ENSG00000197056 ZMYM1 -749113 sc-eQTL 4.61e-02 -0.232 0.116 0.176 CD8_TCM L2
ENSG00000243749 TMEM35B -702294 sc-eQTL 4.86e-01 0.0655 0.0938 0.176 CD8_TCM L2
ENSG00000116544 DLGAP3 -646591 sc-eQTL 7.66e-01 0.0346 0.116 0.174 CD8_TEM L2
ENSG00000116560 SFPQ -910086 sc-eQTL 1.15e-01 -0.116 0.0732 0.174 CD8_TEM L2
ENSG00000134686 PHC2 852007 sc-eQTL 7.81e-01 0.0344 0.123 0.174 CD8_TEM L2
ENSG00000146463 ZMYM4 -985650 sc-eQTL 7.60e-02 -0.23 0.129 0.174 CD8_TEM L2
ENSG00000163866 SMIM12 -576696 sc-eQTL 5.36e-02 0.248 0.128 0.174 CD8_TEM L2
ENSG00000163867 ZMYM6 -748886 sc-eQTL 7.68e-02 0.226 0.127 0.174 CD8_TEM L2
ENSG00000197056 ZMYM1 -749113 sc-eQTL 9.61e-01 -0.00592 0.12 0.174 CD8_TEM L2
ENSG00000243749 TMEM35B -702294 sc-eQTL 1.80e-01 0.123 0.0914 0.174 CD8_TEM L2
ENSG00000116544 DLGAP3 -646591 sc-eQTL 2.78e-02 -0.251 0.113 0.18 MAIT L2
ENSG00000116560 SFPQ -910086 sc-eQTL 5.83e-01 0.0333 0.0605 0.18 MAIT L2
ENSG00000134686 PHC2 852007 sc-eQTL 9.84e-01 0.00207 0.101 0.18 MAIT L2
ENSG00000146463 ZMYM4 -985650 sc-eQTL 6.06e-01 -0.056 0.108 0.18 MAIT L2
ENSG00000163866 SMIM12 -576696 sc-eQTL 6.58e-01 -0.0512 0.116 0.18 MAIT L2
ENSG00000163867 ZMYM6 -748886 sc-eQTL 2.84e-01 0.129 0.12 0.18 MAIT L2
ENSG00000197056 ZMYM1 -749113 sc-eQTL 5.48e-01 -0.069 0.115 0.18 MAIT L2
ENSG00000243749 TMEM35B -702294 sc-eQTL 3.84e-01 -0.0769 0.0881 0.18 MAIT L2
ENSG00000116544 DLGAP3 -646591 sc-eQTL 1.56e-01 -0.16 0.113 0.187 NK_CD56bright L2
ENSG00000116560 SFPQ -910086 sc-eQTL 3.34e-01 0.0715 0.0739 0.187 NK_CD56bright L2
ENSG00000134686 PHC2 852007 sc-eQTL 6.20e-01 -0.0522 0.105 0.187 NK_CD56bright L2
ENSG00000146463 ZMYM4 -985650 sc-eQTL 9.63e-01 -0.00491 0.105 0.187 NK_CD56bright L2
ENSG00000163866 SMIM12 -576696 sc-eQTL 6.44e-01 0.0577 0.125 0.187 NK_CD56bright L2
ENSG00000163867 ZMYM6 -748886 sc-eQTL 2.43e-01 -0.145 0.124 0.187 NK_CD56bright L2
ENSG00000197056 ZMYM1 -749113 sc-eQTL 3.05e-01 0.113 0.11 0.187 NK_CD56bright L2
ENSG00000243749 TMEM35B -702294 sc-eQTL 6.01e-01 -0.0504 0.0963 0.187 NK_CD56bright L2
ENSG00000116544 DLGAP3 -646591 sc-eQTL 3.15e-01 0.111 0.11 0.181 NK_CD56dim L2
ENSG00000116560 SFPQ -910086 sc-eQTL 8.88e-01 0.00848 0.0603 0.181 NK_CD56dim L2
ENSG00000134686 PHC2 852007 sc-eQTL 1.88e-01 0.125 0.0947 0.181 NK_CD56dim L2
ENSG00000146463 ZMYM4 -985650 sc-eQTL 3.68e-01 -0.0716 0.0794 0.181 NK_CD56dim L2
ENSG00000163866 SMIM12 -576696 sc-eQTL 2.29e-01 -0.128 0.106 0.181 NK_CD56dim L2
ENSG00000163867 ZMYM6 -748886 sc-eQTL 3.36e-01 0.109 0.113 0.181 NK_CD56dim L2
ENSG00000197056 ZMYM1 -749113 sc-eQTL 2.52e-01 -0.122 0.106 0.181 NK_CD56dim L2
ENSG00000243749 TMEM35B -702294 sc-eQTL 3.54e-01 0.0572 0.0616 0.181 NK_CD56dim L2
ENSG00000116544 DLGAP3 -646591 sc-eQTL 9.93e-01 -0.000982 0.109 0.18 NK_HLA L2
ENSG00000116560 SFPQ -910086 sc-eQTL 9.80e-01 -0.002 0.0806 0.18 NK_HLA L2
ENSG00000134686 PHC2 852007 sc-eQTL 1.09e-01 0.166 0.103 0.18 NK_HLA L2
ENSG00000146463 ZMYM4 -985650 sc-eQTL 1.15e-01 0.174 0.11 0.18 NK_HLA L2
ENSG00000163866 SMIM12 -576696 sc-eQTL 2.22e-01 0.142 0.116 0.18 NK_HLA L2
ENSG00000163867 ZMYM6 -748886 sc-eQTL 7.84e-01 0.0333 0.121 0.18 NK_HLA L2
ENSG00000197056 ZMYM1 -749113 sc-eQTL 5.44e-01 -0.0696 0.114 0.18 NK_HLA L2
ENSG00000243749 TMEM35B -702294 sc-eQTL 9.97e-01 0.000379 0.0957 0.18 NK_HLA L2
ENSG00000116544 DLGAP3 -646591 sc-eQTL 5.99e-02 0.216 0.114 0.181 NK_cytokine L2
ENSG00000116560 SFPQ -910086 sc-eQTL 8.34e-01 0.0142 0.0675 0.181 NK_cytokine L2
ENSG00000134686 PHC2 852007 sc-eQTL 6.46e-01 0.045 0.098 0.181 NK_cytokine L2
ENSG00000146463 ZMYM4 -985650 sc-eQTL 7.27e-01 -0.0301 0.0862 0.181 NK_cytokine L2
ENSG00000163866 SMIM12 -576696 sc-eQTL 6.70e-01 -0.0445 0.104 0.181 NK_cytokine L2
ENSG00000163867 ZMYM6 -748886 sc-eQTL 3.33e-01 0.116 0.119 0.181 NK_cytokine L2
ENSG00000197056 ZMYM1 -749113 sc-eQTL 9.68e-01 -0.00442 0.11 0.181 NK_cytokine L2
ENSG00000243749 TMEM35B -702294 sc-eQTL 3.72e-01 0.0557 0.0622 0.181 NK_cytokine L2
ENSG00000116544 DLGAP3 -646591 sc-eQTL 1.36e-01 -0.216 0.144 0.193 PB L2
ENSG00000116560 SFPQ -910086 sc-eQTL 5.46e-01 -0.0506 0.0836 0.193 PB L2
ENSG00000134686 PHC2 852007 sc-eQTL 8.70e-01 -0.023 0.141 0.193 PB L2
ENSG00000146463 ZMYM4 -985650 sc-eQTL 8.59e-01 -0.0279 0.156 0.193 PB L2
ENSG00000163866 SMIM12 -576696 sc-eQTL 2.08e-01 0.167 0.132 0.193 PB L2
ENSG00000163867 ZMYM6 -748886 sc-eQTL 7.46e-01 0.051 0.157 0.193 PB L2
ENSG00000197056 ZMYM1 -749113 sc-eQTL 3.89e-01 0.117 0.136 0.193 PB L2
ENSG00000243749 TMEM35B -702294 sc-eQTL 6.55e-01 0.0586 0.131 0.193 PB L2
ENSG00000116544 DLGAP3 -646591 sc-eQTL 7.17e-01 -0.0371 0.102 0.183 Pro_T L2
ENSG00000116560 SFPQ -910086 sc-eQTL 1.42e-01 0.114 0.0775 0.183 Pro_T L2
ENSG00000134686 PHC2 852007 sc-eQTL 1.81e-01 -0.122 0.0905 0.183 Pro_T L2
ENSG00000146463 ZMYM4 -985650 sc-eQTL 2.31e-01 -0.139 0.116 0.183 Pro_T L2
ENSG00000163866 SMIM12 -576696 sc-eQTL 2.69e-01 -0.123 0.111 0.183 Pro_T L2
ENSG00000163867 ZMYM6 -748886 sc-eQTL 1.60e-01 -0.17 0.12 0.183 Pro_T L2
ENSG00000197056 ZMYM1 -749113 sc-eQTL 9.40e-01 -0.00761 0.101 0.183 Pro_T L2
ENSG00000243749 TMEM35B -702294 sc-eQTL 6.29e-01 -0.044 0.0909 0.183 Pro_T L2
ENSG00000116544 DLGAP3 -646591 sc-eQTL 3.80e-01 -0.103 0.117 0.182 Treg L2
ENSG00000116560 SFPQ -910086 sc-eQTL 4.22e-01 -0.0458 0.057 0.182 Treg L2
ENSG00000134686 PHC2 852007 sc-eQTL 8.91e-01 -0.0143 0.104 0.182 Treg L2
ENSG00000146463 ZMYM4 -985650 sc-eQTL 8.63e-01 -0.018 0.104 0.182 Treg L2
ENSG00000163866 SMIM12 -576696 sc-eQTL 5.72e-01 0.0643 0.114 0.182 Treg L2
ENSG00000163867 ZMYM6 -748886 sc-eQTL 9.20e-02 0.207 0.122 0.182 Treg L2
ENSG00000197056 ZMYM1 -749113 sc-eQTL 2.27e-01 0.126 0.104 0.182 Treg L2
ENSG00000243749 TMEM35B -702294 sc-eQTL 8.82e-01 -0.0123 0.0827 0.182 Treg L2
ENSG00000116544 DLGAP3 -646591 sc-eQTL 8.18e-01 0.0277 0.12 0.183 cDC L2
ENSG00000116560 SFPQ -910086 sc-eQTL 6.63e-01 -0.0333 0.0761 0.183 cDC L2
ENSG00000134686 PHC2 852007 sc-eQTL 1.24e-01 0.128 0.0826 0.183 cDC L2
ENSG00000146463 ZMYM4 -985650 sc-eQTL 2.27e-01 -0.126 0.104 0.183 cDC L2
ENSG00000163866 SMIM12 -576696 sc-eQTL 1.32e-01 -0.171 0.113 0.183 cDC L2
ENSG00000163867 ZMYM6 -748886 sc-eQTL 8.02e-01 0.03 0.119 0.183 cDC L2
ENSG00000197056 ZMYM1 -749113 sc-eQTL 3.19e-02 -0.241 0.112 0.183 cDC L2
ENSG00000243749 TMEM35B -702294 sc-eQTL 6.19e-01 0.0556 0.112 0.183 cDC L2
ENSG00000116544 DLGAP3 -646591 sc-eQTL 6.33e-01 -0.054 0.113 0.182 cMono_IL1B L2
ENSG00000116560 SFPQ -910086 sc-eQTL 5.40e-01 0.0354 0.0577 0.182 cMono_IL1B L2
ENSG00000134686 PHC2 852007 sc-eQTL 9.55e-01 0.00325 0.0571 0.182 cMono_IL1B L2
ENSG00000146463 ZMYM4 -985650 sc-eQTL 2.51e-01 -0.0866 0.0752 0.182 cMono_IL1B L2
ENSG00000163866 SMIM12 -576696 sc-eQTL 8.53e-02 -0.15 0.0866 0.182 cMono_IL1B L2
ENSG00000163867 ZMYM6 -748886 sc-eQTL 1.43e-01 0.13 0.0882 0.182 cMono_IL1B L2
ENSG00000197056 ZMYM1 -749113 sc-eQTL 3.45e-01 0.0971 0.103 0.182 cMono_IL1B L2
ENSG00000243749 TMEM35B -702294 sc-eQTL 3.22e-01 0.0838 0.0844 0.182 cMono_IL1B L2
ENSG00000116544 DLGAP3 -646591 sc-eQTL 9.09e-01 -0.013 0.114 0.182 cMono_S100A L2
ENSG00000116560 SFPQ -910086 sc-eQTL 4.53e-01 -0.0482 0.0641 0.182 cMono_S100A L2
ENSG00000134686 PHC2 852007 sc-eQTL 4.73e-01 0.0435 0.0605 0.182 cMono_S100A L2
ENSG00000146463 ZMYM4 -985650 sc-eQTL 5.58e-01 -0.0505 0.086 0.182 cMono_S100A L2
ENSG00000163866 SMIM12 -576696 sc-eQTL 5.89e-01 0.0545 0.101 0.182 cMono_S100A L2
ENSG00000163867 ZMYM6 -748886 sc-eQTL 7.09e-01 0.0396 0.106 0.182 cMono_S100A L2
ENSG00000197056 ZMYM1 -749113 sc-eQTL 5.27e-02 0.2 0.103 0.182 cMono_S100A L2
ENSG00000243749 TMEM35B -702294 sc-eQTL 6.83e-01 0.0373 0.0912 0.182 cMono_S100A L2
ENSG00000116544 DLGAP3 -646591 sc-eQTL 1.57e-01 0.2 0.141 0.179 gdT L2
ENSG00000116560 SFPQ -910086 sc-eQTL 3.02e-03 0.273 0.0906 0.179 gdT L2
ENSG00000134686 PHC2 852007 sc-eQTL 2.94e-01 -0.131 0.124 0.179 gdT L2
ENSG00000146463 ZMYM4 -985650 sc-eQTL 6.45e-01 0.063 0.137 0.179 gdT L2
ENSG00000163866 SMIM12 -576696 sc-eQTL 5.41e-01 -0.0905 0.148 0.179 gdT L2
ENSG00000163867 ZMYM6 -748886 sc-eQTL 7.45e-01 0.0499 0.153 0.179 gdT L2
ENSG00000197056 ZMYM1 -749113 sc-eQTL 5.36e-01 0.0852 0.137 0.179 gdT L2
ENSG00000243749 TMEM35B -702294 sc-eQTL 6.62e-01 0.0476 0.109 0.179 gdT L2
ENSG00000116544 DLGAP3 -646591 sc-eQTL 4.37e-01 0.0878 0.113 0.18 intMono L2
ENSG00000116560 SFPQ -910086 sc-eQTL 2.74e-01 0.0946 0.0863 0.18 intMono L2
ENSG00000134686 PHC2 852007 sc-eQTL 2.07e-01 -0.085 0.0672 0.18 intMono L2
ENSG00000146463 ZMYM4 -985650 sc-eQTL 5.80e-01 -0.0609 0.11 0.18 intMono L2
ENSG00000163866 SMIM12 -576696 sc-eQTL 6.94e-01 -0.0454 0.115 0.18 intMono L2
ENSG00000163867 ZMYM6 -748886 sc-eQTL 5.82e-01 0.0655 0.119 0.18 intMono L2
ENSG00000197056 ZMYM1 -749113 sc-eQTL 4.30e-01 -0.0828 0.105 0.18 intMono L2
ENSG00000243749 TMEM35B -702294 sc-eQTL 9.24e-01 -0.00973 0.102 0.18 intMono L2
ENSG00000116544 DLGAP3 -646591 sc-eQTL 2.67e-01 -0.11 0.0988 0.181 ncMono L2
ENSG00000116560 SFPQ -910086 sc-eQTL 4.10e-01 -0.0745 0.0901 0.181 ncMono L2
ENSG00000134686 PHC2 852007 sc-eQTL 2.18e-01 0.0961 0.0777 0.181 ncMono L2
ENSG00000146463 ZMYM4 -985650 sc-eQTL 2.66e-01 -0.107 0.0963 0.181 ncMono L2
ENSG00000163866 SMIM12 -576696 sc-eQTL 3.89e-01 -0.0932 0.108 0.181 ncMono L2
ENSG00000163867 ZMYM6 -748886 sc-eQTL 7.73e-01 0.0324 0.112 0.181 ncMono L2
ENSG00000197056 ZMYM1 -749113 sc-eQTL 4.27e-01 0.0843 0.106 0.181 ncMono L2
ENSG00000243749 TMEM35B -702294 sc-eQTL 1.22e-01 0.159 0.103 0.181 ncMono L2
ENSG00000116544 DLGAP3 -646591 sc-eQTL 4.23e-01 0.105 0.131 0.167 pDC L2
ENSG00000116560 SFPQ -910086 sc-eQTL 1.50e-01 0.124 0.0856 0.167 pDC L2
ENSG00000134686 PHC2 852007 sc-eQTL 2.80e-01 -0.117 0.108 0.167 pDC L2
ENSG00000146463 ZMYM4 -985650 sc-eQTL 8.01e-01 -0.0331 0.131 0.167 pDC L2
ENSG00000163866 SMIM12 -576696 sc-eQTL 9.30e-01 0.0121 0.137 0.167 pDC L2
ENSG00000163867 ZMYM6 -748886 sc-eQTL 7.85e-01 0.0334 0.122 0.167 pDC L2
ENSG00000197056 ZMYM1 -749113 sc-eQTL 7.71e-01 0.0367 0.126 0.167 pDC L2
ENSG00000243749 TMEM35B -702294 sc-eQTL 4.86e-01 -0.0781 0.112 0.167 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000116544 DLGAP3 -646591 sc-eQTL 9.76e-01 -0.0035 0.115 0.182 B_Memory LOneK1K
ENSG00000116560 SFPQ -910086 sc-eQTL 7.86e-01 -0.0143 0.0527 0.182 B_Memory LOneK1K
ENSG00000134686 PHC2 852007 sc-eQTL 7.97e-01 0.0248 0.0962 0.182 B_Memory LOneK1K
ENSG00000146463 ZMYM4 -985650 sc-eQTL 8.89e-01 -0.0126 0.09 0.182 B_Memory LOneK1K
ENSG00000163866 SMIM12 -576696 sc-eQTL 5.57e-01 0.0659 0.112 0.182 B_Memory LOneK1K
ENSG00000163867 ZMYM6 -748886 sc-eQTL 5.55e-02 0.207 0.107 0.182 B_Memory LOneK1K
ENSG00000197056 ZMYM1 -749113 sc-eQTL 2.29e-01 -0.139 0.115 0.182 B_Memory LOneK1K
ENSG00000243749 TMEM35B -702294 sc-eQTL 1.89e-01 0.0957 0.0727 0.182 B_Memory LOneK1K
ENSG00000116544 DLGAP3 -646591 sc-eQTL 7.42e-01 0.0393 0.119 0.182 B_Naive LOneK1K
ENSG00000116560 SFPQ -910086 sc-eQTL 4.57e-01 -0.0376 0.0506 0.182 B_Naive LOneK1K
ENSG00000134686 PHC2 852007 sc-eQTL 7.18e-01 -0.0346 0.0957 0.182 B_Naive LOneK1K
ENSG00000146463 ZMYM4 -985650 sc-eQTL 1.29e-01 -0.131 0.0858 0.182 B_Naive LOneK1K
ENSG00000163866 SMIM12 -576696 sc-eQTL 3.64e-01 -0.1 0.11 0.182 B_Naive LOneK1K
ENSG00000163867 ZMYM6 -748886 sc-eQTL 8.30e-01 -0.0251 0.116 0.182 B_Naive LOneK1K
ENSG00000197056 ZMYM1 -749113 sc-eQTL 3.28e-01 0.108 0.11 0.182 B_Naive LOneK1K
ENSG00000243749 TMEM35B -702294 sc-eQTL 9.28e-02 0.115 0.0683 0.182 B_Naive LOneK1K
ENSG00000116544 DLGAP3 -646591 sc-eQTL 6.47e-01 -0.0511 0.111 0.182 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000116560 SFPQ -910086 sc-eQTL 8.03e-01 0.0132 0.0528 0.182 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000134686 PHC2 852007 sc-eQTL 6.62e-01 0.0244 0.0559 0.182 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000146463 ZMYM4 -985650 sc-eQTL 2.53e-01 -0.0789 0.0689 0.182 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000163866 SMIM12 -576696 sc-eQTL 2.82e-01 -0.0866 0.0803 0.182 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000163867 ZMYM6 -748886 sc-eQTL 2.85e-01 0.0893 0.0833 0.182 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000197056 ZMYM1 -749113 sc-eQTL 1.01e-01 0.154 0.0934 0.182 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000243749 TMEM35B -702294 sc-eQTL 4.55e-01 0.0586 0.0783 0.182 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000116544 DLGAP3 -646591 sc-eQTL 7.47e-01 0.0296 0.0918 0.181 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000116560 SFPQ -910086 sc-eQTL 7.85e-01 -0.0203 0.0743 0.181 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000134686 PHC2 852007 sc-eQTL 9.01e-01 0.00835 0.0667 0.181 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000146463 ZMYM4 -985650 sc-eQTL 3.07e-01 -0.095 0.0927 0.181 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000163866 SMIM12 -576696 sc-eQTL 4.63e-01 -0.074 0.101 0.181 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000163867 ZMYM6 -748886 sc-eQTL 7.68e-01 0.0322 0.109 0.181 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000197056 ZMYM1 -749113 sc-eQTL 7.73e-01 0.0292 0.101 0.181 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000243749 TMEM35B -702294 sc-eQTL 1.70e-01 0.128 0.0932 0.181 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000116544 DLGAP3 -646591 sc-eQTL 1.36e-01 0.168 0.113 0.181 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000116560 SFPQ -910086 sc-eQTL 4.25e-01 -0.0441 0.0551 0.181 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000134686 PHC2 852007 sc-eQTL 1.20e-01 0.137 0.0876 0.181 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000146463 ZMYM4 -985650 sc-eQTL 7.46e-01 -0.0231 0.0714 0.181 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000163866 SMIM12 -576696 sc-eQTL 6.20e-01 -0.0496 0.1 0.181 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000163867 ZMYM6 -748886 sc-eQTL 5.38e-02 0.209 0.108 0.181 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000197056 ZMYM1 -749113 sc-eQTL 3.01e-01 -0.106 0.102 0.181 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000243749 TMEM35B -702294 sc-eQTL 6.00e-01 0.0273 0.052 0.181 NK_CD56dim LOneK1K


Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF


Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina
ENSG00000134686 \N 852007 2.95e-07 1.36e-07 5.93e-08 1.9e-07 1.03e-07 8.45e-08 1.81e-07 5.56e-08 1.59e-07 7.6e-08 1.59e-07 1.19e-07 1.79e-07 7.64e-08 5.72e-08 7.98e-08 4.45e-08 1.64e-07 7.12e-08 4.92e-08 1.27e-07 1.39e-07 1.58e-07 3.17e-08 1.68e-07 1.31e-07 1.17e-07 1.04e-07 1.31e-07 1e-07 1.07e-07 2.93e-08 3.43e-08 9.52e-08 3.46e-08 2.95e-08 5.7e-08 8.72e-08 6.43e-08 3.82e-08 5.24e-08 1.46e-07 5.22e-08 1.45e-08 3.83e-08 1.92e-08 1.11e-07 1.88e-09 4.99e-08