Genes within 1Mb (chr1:34020624:C:T):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD


Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000004455 AK2 939628 sc-eQTL 8.87e-01 -0.00875 0.0618 0.22 B L1
ENSG00000116525 TRIM62 838565 sc-eQTL 5.58e-01 -0.0512 0.0872 0.22 B L1
ENSG00000116544 DLGAP3 -909026 sc-eQTL 2.53e-01 0.113 0.0987 0.22 B L1
ENSG00000134686 PHC2 589572 sc-eQTL 8.36e-01 0.0164 0.0794 0.22 B L1
ENSG00000160094 ZNF362 764132 sc-eQTL 7.03e-01 -0.0324 0.0849 0.22 B L1
ENSG00000163866 SMIM12 -839131 sc-eQTL 8.01e-02 0.147 0.0834 0.22 B L1
ENSG00000243749 TMEM35B -964729 sc-eQTL 6.10e-01 -0.0274 0.0537 0.22 B L1
ENSG00000004455 AK2 939628 sc-eQTL 7.13e-01 -0.0184 0.0499 0.22 CD4T L1
ENSG00000116525 TRIM62 838565 sc-eQTL 5.37e-01 0.0431 0.0696 0.22 CD4T L1
ENSG00000116544 DLGAP3 -909026 sc-eQTL 2.06e-01 0.107 0.0842 0.22 CD4T L1
ENSG00000134686 PHC2 589572 sc-eQTL 9.24e-01 -0.00649 0.0679 0.22 CD4T L1
ENSG00000142920 AZIN2 939520 sc-eQTL 4.29e-01 -0.0732 0.0922 0.22 CD4T L1
ENSG00000160094 ZNF362 764132 sc-eQTL 9.67e-01 -0.00302 0.073 0.22 CD4T L1
ENSG00000163866 SMIM12 -839131 sc-eQTL 4.13e-01 0.0583 0.071 0.22 CD4T L1
ENSG00000243749 TMEM35B -964729 sc-eQTL 7.33e-01 -0.0133 0.039 0.22 CD4T L1
ENSG00000004455 AK2 939628 sc-eQTL 9.21e-01 -0.00635 0.0639 0.22 CD8T L1
ENSG00000116525 TRIM62 838565 sc-eQTL 1.17e-01 0.142 0.0901 0.22 CD8T L1
ENSG00000116544 DLGAP3 -909026 sc-eQTL 6.54e-01 -0.0445 0.0991 0.22 CD8T L1
ENSG00000134686 PHC2 589572 sc-eQTL 9.76e-01 -0.00234 0.0777 0.22 CD8T L1
ENSG00000142920 AZIN2 939520 sc-eQTL 6.90e-02 -0.161 0.088 0.22 CD8T L1
ENSG00000160094 ZNF362 764132 sc-eQTL 6.40e-01 -0.0354 0.0756 0.22 CD8T L1
ENSG00000163866 SMIM12 -839131 sc-eQTL 5.54e-01 0.0488 0.0824 0.22 CD8T L1
ENSG00000243749 TMEM35B -964729 sc-eQTL 8.51e-01 0.00945 0.0501 0.22 CD8T L1
ENSG00000004455 AK2 939628 sc-eQTL 2.72e-01 -0.109 0.0989 0.221 DC L1
ENSG00000116525 TRIM62 838565 sc-eQTL 3.41e-01 0.102 0.107 0.221 DC L1
ENSG00000116544 DLGAP3 -909026 sc-eQTL 5.58e-01 0.0583 0.0992 0.221 DC L1
ENSG00000134686 PHC2 589572 sc-eQTL 5.48e-01 -0.0433 0.0719 0.221 DC L1
ENSG00000142920 AZIN2 939520 sc-eQTL 3.91e-01 -0.0498 0.0579 0.221 DC L1
ENSG00000160094 ZNF362 764132 sc-eQTL 9.12e-01 -0.0104 0.0935 0.221 DC L1
ENSG00000163866 SMIM12 -839131 sc-eQTL 7.83e-01 -0.027 0.0981 0.221 DC L1
ENSG00000243749 TMEM35B -964729 sc-eQTL 3.99e-01 -0.0753 0.089 0.221 DC L1
ENSG00000004455 AK2 939628 sc-eQTL 9.83e-01 0.00169 0.0789 0.22 Mono L1
ENSG00000116525 TRIM62 838565 sc-eQTL 9.91e-01 -0.00108 0.0962 0.22 Mono L1
ENSG00000116544 DLGAP3 -909026 sc-eQTL 3.58e-01 0.0894 0.097 0.22 Mono L1
ENSG00000134686 PHC2 589572 sc-eQTL 7.29e-01 -0.0179 0.0516 0.22 Mono L1
ENSG00000160094 ZNF362 764132 sc-eQTL 1.53e-01 0.122 0.0849 0.22 Mono L1
ENSG00000163866 SMIM12 -839131 sc-eQTL 1.31e-01 0.111 0.0733 0.22 Mono L1
ENSG00000243749 TMEM35B -964729 sc-eQTL 4.32e-01 -0.0553 0.0702 0.22 Mono L1
ENSG00000004455 AK2 939628 sc-eQTL 8.99e-01 -0.00941 0.074 0.221 NK L1
ENSG00000116525 TRIM62 838565 sc-eQTL 2.82e-01 0.0901 0.0836 0.221 NK L1
ENSG00000116544 DLGAP3 -909026 sc-eQTL 2.42e-01 0.119 0.102 0.221 NK L1
ENSG00000134686 PHC2 589572 sc-eQTL 1.91e-01 -0.102 0.0778 0.221 NK L1
ENSG00000160094 ZNF362 764132 sc-eQTL 8.30e-01 0.0189 0.0879 0.221 NK L1
ENSG00000163866 SMIM12 -839131 sc-eQTL 8.64e-01 0.0152 0.0887 0.221 NK L1
ENSG00000243749 TMEM35B -964729 sc-eQTL 1.91e-01 -0.0604 0.046 0.221 NK L1
ENSG00000004455 AK2 939628 sc-eQTL 9.20e-01 -0.0056 0.056 0.22 Other_T L1
ENSG00000116525 TRIM62 838565 sc-eQTL 8.39e-01 0.0199 0.098 0.22 Other_T L1
ENSG00000116544 DLGAP3 -909026 sc-eQTL 8.52e-01 0.0196 0.105 0.22 Other_T L1
ENSG00000134686 PHC2 589572 sc-eQTL 8.81e-01 -0.0123 0.0817 0.22 Other_T L1
ENSG00000142920 AZIN2 939520 sc-eQTL 1.68e-01 0.139 0.101 0.22 Other_T L1
ENSG00000160094 ZNF362 764132 sc-eQTL 6.68e-01 0.037 0.0861 0.22 Other_T L1
ENSG00000163866 SMIM12 -839131 sc-eQTL 4.84e-01 -0.0621 0.0885 0.22 Other_T L1
ENSG00000243749 TMEM35B -964729 sc-eQTL 7.66e-01 -0.0174 0.0583 0.22 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000004455 AK2 939628 sc-eQTL 6.14e-01 0.0627 0.124 0.219 B_Activated L2
ENSG00000116525 TRIM62 838565 sc-eQTL 1.36e-01 0.17 0.114 0.219 B_Activated L2
ENSG00000116544 DLGAP3 -909026 sc-eQTL 1.05e-01 0.155 0.0951 0.219 B_Activated L2
ENSG00000134686 PHC2 589572 sc-eQTL 6.72e-01 -0.0486 0.114 0.219 B_Activated L2
ENSG00000160094 ZNF362 764132 sc-eQTL 2.52e-01 -0.138 0.12 0.219 B_Activated L2
ENSG00000163866 SMIM12 -839131 sc-eQTL 8.64e-01 0.0215 0.125 0.219 B_Activated L2
ENSG00000243749 TMEM35B -964729 sc-eQTL 2.20e-01 -0.126 0.102 0.219 B_Activated L2
ENSG00000004455 AK2 939628 sc-eQTL 9.43e-01 0.00629 0.088 0.221 B_Intermediate L2
ENSG00000116525 TRIM62 838565 sc-eQTL 3.36e-01 -0.0974 0.101 0.221 B_Intermediate L2
ENSG00000116544 DLGAP3 -909026 sc-eQTL 2.35e-01 -0.12 0.101 0.221 B_Intermediate L2
ENSG00000134686 PHC2 589572 sc-eQTL 4.41e-01 0.0682 0.0883 0.221 B_Intermediate L2
ENSG00000160094 ZNF362 764132 sc-eQTL 1.00e-01 0.166 0.101 0.221 B_Intermediate L2
ENSG00000163866 SMIM12 -839131 sc-eQTL 2.42e-01 0.123 0.105 0.221 B_Intermediate L2
ENSG00000243749 TMEM35B -964729 sc-eQTL 2.45e-01 -0.0921 0.0789 0.221 B_Intermediate L2
ENSG00000004455 AK2 939628 sc-eQTL 2.82e-01 -0.112 0.104 0.22 B_Memory L2
ENSG00000116525 TRIM62 838565 sc-eQTL 4.52e-01 0.0822 0.109 0.22 B_Memory L2
ENSG00000116544 DLGAP3 -909026 sc-eQTL 8.93e-01 0.0131 0.0978 0.22 B_Memory L2
ENSG00000134686 PHC2 589572 sc-eQTL 1.64e-01 0.131 0.0938 0.22 B_Memory L2
ENSG00000160094 ZNF362 764132 sc-eQTL 2.21e-01 -0.125 0.102 0.22 B_Memory L2
ENSG00000163866 SMIM12 -839131 sc-eQTL 6.37e-01 0.0493 0.104 0.22 B_Memory L2
ENSG00000243749 TMEM35B -964729 sc-eQTL 4.28e-01 0.0603 0.0759 0.22 B_Memory L2
ENSG00000004455 AK2 939628 sc-eQTL 7.02e-01 -0.0266 0.0695 0.22 B_Naive1 L2
ENSG00000116525 TRIM62 838565 sc-eQTL 1.56e-01 -0.139 0.0975 0.22 B_Naive1 L2
ENSG00000116544 DLGAP3 -909026 sc-eQTL 7.01e-01 0.0381 0.099 0.22 B_Naive1 L2
ENSG00000134686 PHC2 589572 sc-eQTL 2.92e-01 -0.0875 0.0828 0.22 B_Naive1 L2
ENSG00000160094 ZNF362 764132 sc-eQTL 6.00e-01 -0.051 0.0969 0.22 B_Naive1 L2
ENSG00000163866 SMIM12 -839131 sc-eQTL 1.59e-01 0.136 0.0963 0.22 B_Naive1 L2
ENSG00000243749 TMEM35B -964729 sc-eQTL 6.19e-01 0.0361 0.0725 0.22 B_Naive1 L2
ENSG00000004455 AK2 939628 sc-eQTL 3.70e-01 0.0856 0.0952 0.221 B_Naive2 L2
ENSG00000116525 TRIM62 838565 sc-eQTL 4.12e-01 0.0874 0.106 0.221 B_Naive2 L2
ENSG00000116544 DLGAP3 -909026 sc-eQTL 1.40e-01 0.165 0.112 0.221 B_Naive2 L2
ENSG00000134686 PHC2 589572 sc-eQTL 3.10e-01 -0.0946 0.093 0.221 B_Naive2 L2
ENSG00000160094 ZNF362 764132 sc-eQTL 8.14e-01 0.0239 0.101 0.221 B_Naive2 L2
ENSG00000163866 SMIM12 -839131 sc-eQTL 5.20e-01 0.0708 0.11 0.221 B_Naive2 L2
ENSG00000243749 TMEM35B -964729 sc-eQTL 6.86e-01 -0.0304 0.075 0.221 B_Naive2 L2
ENSG00000004455 AK2 939628 sc-eQTL 2.12e-01 -0.129 0.103 0.22 CD4_CTL L2
ENSG00000116525 TRIM62 838565 sc-eQTL 1.56e-02 -0.243 0.0997 0.22 CD4_CTL L2
ENSG00000116544 DLGAP3 -909026 sc-eQTL 7.86e-01 0.0271 0.0999 0.22 CD4_CTL L2
ENSG00000134686 PHC2 589572 sc-eQTL 1.05e-01 -0.155 0.0952 0.22 CD4_CTL L2
ENSG00000142920 AZIN2 939520 sc-eQTL 9.43e-01 0.00704 0.0984 0.22 CD4_CTL L2
ENSG00000160094 ZNF362 764132 sc-eQTL 8.18e-01 -0.0234 0.101 0.22 CD4_CTL L2
ENSG00000163866 SMIM12 -839131 sc-eQTL 6.08e-01 -0.0525 0.102 0.22 CD4_CTL L2
ENSG00000243749 TMEM35B -964729 sc-eQTL 2.92e-01 -0.0896 0.0847 0.22 CD4_CTL L2
ENSG00000004455 AK2 939628 sc-eQTL 8.54e-01 -0.0109 0.059 0.22 CD4_Naive L2
ENSG00000116525 TRIM62 838565 sc-eQTL 2.11e-01 0.0996 0.0794 0.22 CD4_Naive L2
ENSG00000116544 DLGAP3 -909026 sc-eQTL 1.30e-01 0.147 0.097 0.22 CD4_Naive L2
ENSG00000134686 PHC2 589572 sc-eQTL 5.46e-01 0.0426 0.0705 0.22 CD4_Naive L2
ENSG00000142920 AZIN2 939520 sc-eQTL 2.08e-01 -0.122 0.0962 0.22 CD4_Naive L2
ENSG00000160094 ZNF362 764132 sc-eQTL 9.42e-01 -0.0055 0.0752 0.22 CD4_Naive L2
ENSG00000163866 SMIM12 -839131 sc-eQTL 4.04e-01 0.0578 0.0691 0.22 CD4_Naive L2
ENSG00000243749 TMEM35B -964729 sc-eQTL 8.86e-01 -0.00608 0.0424 0.22 CD4_Naive L2
ENSG00000004455 AK2 939628 sc-eQTL 8.59e-01 -0.0126 0.0711 0.22 CD4_TCM L2
ENSG00000116525 TRIM62 838565 sc-eQTL 7.78e-01 -0.0236 0.0835 0.22 CD4_TCM L2
ENSG00000116544 DLGAP3 -909026 sc-eQTL 8.36e-01 0.0179 0.0863 0.22 CD4_TCM L2
ENSG00000134686 PHC2 589572 sc-eQTL 7.47e-02 -0.142 0.0792 0.22 CD4_TCM L2
ENSG00000142920 AZIN2 939520 sc-eQTL 9.90e-01 -0.00125 0.101 0.22 CD4_TCM L2
ENSG00000160094 ZNF362 764132 sc-eQTL 8.54e-01 -0.0156 0.0849 0.22 CD4_TCM L2
ENSG00000163866 SMIM12 -839131 sc-eQTL 3.85e-01 -0.0786 0.0903 0.22 CD4_TCM L2
ENSG00000243749 TMEM35B -964729 sc-eQTL 5.49e-01 0.0278 0.0464 0.22 CD4_TCM L2
ENSG00000004455 AK2 939628 sc-eQTL 7.60e-01 -0.0266 0.0869 0.22 CD4_TEM L2
ENSG00000116525 TRIM62 838565 sc-eQTL 2.18e-02 -0.232 0.1 0.22 CD4_TEM L2
ENSG00000116544 DLGAP3 -909026 sc-eQTL 3.22e-01 -0.105 0.106 0.22 CD4_TEM L2
ENSG00000134686 PHC2 589572 sc-eQTL 9.08e-01 0.0109 0.0942 0.22 CD4_TEM L2
ENSG00000142920 AZIN2 939520 sc-eQTL 4.52e-01 0.081 0.107 0.22 CD4_TEM L2
ENSG00000160094 ZNF362 764132 sc-eQTL 3.90e-01 0.0887 0.103 0.22 CD4_TEM L2
ENSG00000163866 SMIM12 -839131 sc-eQTL 1.68e-01 0.137 0.0987 0.22 CD4_TEM L2
ENSG00000243749 TMEM35B -964729 sc-eQTL 9.90e-02 -0.104 0.063 0.22 CD4_TEM L2
ENSG00000004455 AK2 939628 sc-eQTL 5.45e-01 -0.0522 0.086 0.22 CD8_CTL L2
ENSG00000116525 TRIM62 838565 sc-eQTL 7.18e-02 0.173 0.0954 0.22 CD8_CTL L2
ENSG00000116544 DLGAP3 -909026 sc-eQTL 3.29e-01 -0.102 0.104 0.22 CD8_CTL L2
ENSG00000134686 PHC2 589572 sc-eQTL 8.97e-01 -0.0112 0.0861 0.22 CD8_CTL L2
ENSG00000142920 AZIN2 939520 sc-eQTL 9.03e-01 0.0126 0.104 0.22 CD8_CTL L2
ENSG00000160094 ZNF362 764132 sc-eQTL 2.20e-01 0.111 0.0906 0.22 CD8_CTL L2
ENSG00000163866 SMIM12 -839131 sc-eQTL 9.94e-01 -0.000766 0.101 0.22 CD8_CTL L2
ENSG00000243749 TMEM35B -964729 sc-eQTL 1.95e-01 0.082 0.0631 0.22 CD8_CTL L2
ENSG00000004455 AK2 939628 sc-eQTL 3.21e-01 -0.0762 0.0766 0.22 CD8_Naive L2
ENSG00000116525 TRIM62 838565 sc-eQTL 3.65e-01 0.0931 0.102 0.22 CD8_Naive L2
ENSG00000116544 DLGAP3 -909026 sc-eQTL 9.30e-01 -0.00946 0.107 0.22 CD8_Naive L2
ENSG00000134686 PHC2 589572 sc-eQTL 2.73e-01 -0.0966 0.088 0.22 CD8_Naive L2
ENSG00000142920 AZIN2 939520 sc-eQTL 1.26e-01 -0.156 0.101 0.22 CD8_Naive L2
ENSG00000160094 ZNF362 764132 sc-eQTL 4.96e-02 -0.182 0.0921 0.22 CD8_Naive L2
ENSG00000163866 SMIM12 -839131 sc-eQTL 7.28e-01 0.0309 0.0888 0.22 CD8_Naive L2
ENSG00000243749 TMEM35B -964729 sc-eQTL 6.47e-01 0.0263 0.0573 0.22 CD8_Naive L2
ENSG00000004455 AK2 939628 sc-eQTL 5.29e-02 0.202 0.104 0.218 CD8_TCM L2
ENSG00000116525 TRIM62 838565 sc-eQTL 4.74e-01 0.0826 0.115 0.218 CD8_TCM L2
ENSG00000116544 DLGAP3 -909026 sc-eQTL 6.71e-01 0.0465 0.109 0.218 CD8_TCM L2
ENSG00000134686 PHC2 589572 sc-eQTL 9.21e-01 0.00893 0.0898 0.218 CD8_TCM L2
ENSG00000142920 AZIN2 939520 sc-eQTL 5.80e-01 -0.0603 0.109 0.218 CD8_TCM L2
ENSG00000160094 ZNF362 764132 sc-eQTL 1.14e-01 0.17 0.107 0.218 CD8_TCM L2
ENSG00000163866 SMIM12 -839131 sc-eQTL 2.57e-01 0.121 0.106 0.218 CD8_TCM L2
ENSG00000243749 TMEM35B -964729 sc-eQTL 4.73e-01 -0.0618 0.0859 0.218 CD8_TCM L2
ENSG00000004455 AK2 939628 sc-eQTL 3.79e-01 0.0972 0.11 0.219 CD8_TEM L2
ENSG00000116525 TRIM62 838565 sc-eQTL 5.26e-01 0.0727 0.114 0.219 CD8_TEM L2
ENSG00000116544 DLGAP3 -909026 sc-eQTL 6.47e-01 0.0462 0.101 0.219 CD8_TEM L2
ENSG00000134686 PHC2 589572 sc-eQTL 5.37e-01 0.0663 0.107 0.219 CD8_TEM L2
ENSG00000142920 AZIN2 939520 sc-eQTL 1.52e-01 0.138 0.0959 0.219 CD8_TEM L2
ENSG00000160094 ZNF362 764132 sc-eQTL 7.57e-01 -0.0337 0.109 0.219 CD8_TEM L2
ENSG00000163866 SMIM12 -839131 sc-eQTL 8.92e-01 -0.0153 0.112 0.219 CD8_TEM L2
ENSG00000243749 TMEM35B -964729 sc-eQTL 3.69e-01 0.0717 0.0797 0.219 CD8_TEM L2
ENSG00000004455 AK2 939628 sc-eQTL 9.49e-02 -0.156 0.0929 0.219 MAIT L2
ENSG00000116525 TRIM62 838565 sc-eQTL 8.29e-01 -0.0234 0.108 0.219 MAIT L2
ENSG00000116544 DLGAP3 -909026 sc-eQTL 6.63e-01 0.0445 0.102 0.219 MAIT L2
ENSG00000134686 PHC2 589572 sc-eQTL 2.48e-01 -0.104 0.0896 0.219 MAIT L2
ENSG00000142920 AZIN2 939520 sc-eQTL 6.05e-02 0.194 0.103 0.219 MAIT L2
ENSG00000160094 ZNF362 764132 sc-eQTL 5.38e-01 0.0618 0.1 0.219 MAIT L2
ENSG00000163866 SMIM12 -839131 sc-eQTL 1.22e-01 -0.159 0.102 0.219 MAIT L2
ENSG00000243749 TMEM35B -964729 sc-eQTL 4.68e-01 0.0571 0.0785 0.219 MAIT L2
ENSG00000004455 AK2 939628 sc-eQTL 2.83e-01 0.116 0.108 0.22 NK_CD56bright L2
ENSG00000116525 TRIM62 838565 sc-eQTL 1.02e-02 0.275 0.106 0.22 NK_CD56bright L2
ENSG00000116544 DLGAP3 -909026 sc-eQTL 4.19e-01 -0.0848 0.105 0.22 NK_CD56bright L2
ENSG00000134686 PHC2 589572 sc-eQTL 2.85e-01 0.104 0.0971 0.22 NK_CD56bright L2
ENSG00000160094 ZNF362 764132 sc-eQTL 5.92e-01 0.0595 0.111 0.22 NK_CD56bright L2
ENSG00000163866 SMIM12 -839131 sc-eQTL 6.62e-02 -0.211 0.114 0.22 NK_CD56bright L2
ENSG00000243749 TMEM35B -964729 sc-eQTL 2.75e-01 -0.0974 0.0889 0.22 NK_CD56bright L2
ENSG00000004455 AK2 939628 sc-eQTL 2.72e-01 0.0979 0.0888 0.222 NK_CD56dim L2
ENSG00000116525 TRIM62 838565 sc-eQTL 6.80e-02 0.17 0.0929 0.222 NK_CD56dim L2
ENSG00000116544 DLGAP3 -909026 sc-eQTL 1.57e-01 0.142 0.0998 0.222 NK_CD56dim L2
ENSG00000134686 PHC2 589572 sc-eQTL 3.50e-02 -0.182 0.0856 0.222 NK_CD56dim L2
ENSG00000160094 ZNF362 764132 sc-eQTL 2.65e-01 0.109 0.098 0.222 NK_CD56dim L2
ENSG00000163866 SMIM12 -839131 sc-eQTL 6.18e-01 -0.0481 0.0964 0.222 NK_CD56dim L2
ENSG00000243749 TMEM35B -964729 sc-eQTL 8.69e-03 -0.146 0.0552 0.222 NK_CD56dim L2
ENSG00000004455 AK2 939628 sc-eQTL 5.74e-01 -0.0598 0.106 0.226 NK_HLA L2
ENSG00000116525 TRIM62 838565 sc-eQTL 5.87e-01 -0.0585 0.107 0.226 NK_HLA L2
ENSG00000116544 DLGAP3 -909026 sc-eQTL 1.59e-01 0.139 0.0983 0.226 NK_HLA L2
ENSG00000134686 PHC2 589572 sc-eQTL 9.91e-01 0.00103 0.0937 0.226 NK_HLA L2
ENSG00000160094 ZNF362 764132 sc-eQTL 9.73e-01 -0.0036 0.107 0.226 NK_HLA L2
ENSG00000163866 SMIM12 -839131 sc-eQTL 1.79e-01 0.141 0.105 0.226 NK_HLA L2
ENSG00000243749 TMEM35B -964729 sc-eQTL 8.38e-01 0.0177 0.0865 0.226 NK_HLA L2
ENSG00000004455 AK2 939628 sc-eQTL 2.17e-01 -0.117 0.0944 0.222 NK_cytokine L2
ENSG00000116525 TRIM62 838565 sc-eQTL 8.84e-01 -0.0153 0.105 0.222 NK_cytokine L2
ENSG00000116544 DLGAP3 -909026 sc-eQTL 4.90e-01 -0.0722 0.105 0.222 NK_cytokine L2
ENSG00000134686 PHC2 589572 sc-eQTL 4.96e-01 -0.0608 0.0891 0.222 NK_cytokine L2
ENSG00000160094 ZNF362 764132 sc-eQTL 4.75e-01 -0.0701 0.0979 0.222 NK_cytokine L2
ENSG00000163866 SMIM12 -839131 sc-eQTL 5.61e-02 0.18 0.0939 0.222 NK_cytokine L2
ENSG00000243749 TMEM35B -964729 sc-eQTL 9.75e-01 -0.00178 0.0566 0.222 NK_cytokine L2
ENSG00000004455 AK2 939628 sc-eQTL 5.04e-01 -0.0819 0.122 0.207 PB L2
ENSG00000116525 TRIM62 838565 sc-eQTL 8.08e-01 0.0332 0.136 0.207 PB L2
ENSG00000116544 DLGAP3 -909026 sc-eQTL 1.42e-01 -0.206 0.139 0.207 PB L2
ENSG00000134686 PHC2 589572 sc-eQTL 5.28e-01 -0.0861 0.136 0.207 PB L2
ENSG00000160094 ZNF362 764132 sc-eQTL 1.39e-02 -0.344 0.138 0.207 PB L2
ENSG00000163866 SMIM12 -839131 sc-eQTL 7.69e-01 -0.0378 0.129 0.207 PB L2
ENSG00000243749 TMEM35B -964729 sc-eQTL 6.94e-01 0.05 0.127 0.207 PB L2
ENSG00000004455 AK2 939628 sc-eQTL 2.99e-01 -0.0768 0.0738 0.217 Pro_T L2
ENSG00000116525 TRIM62 838565 sc-eQTL 4.71e-01 0.0708 0.0981 0.217 Pro_T L2
ENSG00000116544 DLGAP3 -909026 sc-eQTL 2.15e-01 0.116 0.0931 0.217 Pro_T L2
ENSG00000134686 PHC2 589572 sc-eQTL 3.43e-01 0.0787 0.0828 0.217 Pro_T L2
ENSG00000142920 AZIN2 939520 sc-eQTL 6.51e-01 -0.0375 0.0827 0.217 Pro_T L2
ENSG00000160094 ZNF362 764132 sc-eQTL 1.17e-01 -0.154 0.0977 0.217 Pro_T L2
ENSG00000163866 SMIM12 -839131 sc-eQTL 4.13e-01 0.0833 0.102 0.217 Pro_T L2
ENSG00000243749 TMEM35B -964729 sc-eQTL 4.44e-01 -0.0636 0.0829 0.217 Pro_T L2
ENSG00000004455 AK2 939628 sc-eQTL 1.97e-01 0.125 0.0962 0.22 Treg L2
ENSG00000116525 TRIM62 838565 sc-eQTL 1.60e-02 0.247 0.102 0.22 Treg L2
ENSG00000116544 DLGAP3 -909026 sc-eQTL 9.42e-01 0.00764 0.105 0.22 Treg L2
ENSG00000134686 PHC2 589572 sc-eQTL 9.38e-01 -0.0072 0.0931 0.22 Treg L2
ENSG00000142920 AZIN2 939520 sc-eQTL 2.15e-01 -0.112 0.0901 0.22 Treg L2
ENSG00000160094 ZNF362 764132 sc-eQTL 6.31e-01 0.0474 0.0985 0.22 Treg L2
ENSG00000163866 SMIM12 -839131 sc-eQTL 1.66e-01 0.141 0.101 0.22 Treg L2
ENSG00000243749 TMEM35B -964729 sc-eQTL 4.60e-01 -0.0548 0.074 0.22 Treg L2
ENSG00000004455 AK2 939628 sc-eQTL 2.46e-01 -0.126 0.108 0.229 cDC L2
ENSG00000116525 TRIM62 838565 sc-eQTL 7.79e-02 0.198 0.112 0.229 cDC L2
ENSG00000116544 DLGAP3 -909026 sc-eQTL 5.16e-01 0.0727 0.112 0.229 cDC L2
ENSG00000134686 PHC2 589572 sc-eQTL 2.31e-01 -0.0926 0.0771 0.229 cDC L2
ENSG00000142920 AZIN2 939520 sc-eQTL 4.66e-01 0.0445 0.0609 0.229 cDC L2
ENSG00000160094 ZNF362 764132 sc-eQTL 7.66e-01 0.0317 0.106 0.229 cDC L2
ENSG00000163866 SMIM12 -839131 sc-eQTL 3.70e-01 -0.0951 0.106 0.229 cDC L2
ENSG00000243749 TMEM35B -964729 sc-eQTL 4.85e-01 0.0726 0.104 0.229 cDC L2
ENSG00000004455 AK2 939628 sc-eQTL 6.66e-01 0.0384 0.0889 0.22 cMono_IL1B L2
ENSG00000116525 TRIM62 838565 sc-eQTL 7.05e-01 -0.0389 0.102 0.22 cMono_IL1B L2
ENSG00000116544 DLGAP3 -909026 sc-eQTL 4.15e-01 0.0856 0.105 0.22 cMono_IL1B L2
ENSG00000134686 PHC2 589572 sc-eQTL 8.36e-01 0.011 0.0531 0.22 cMono_IL1B L2
ENSG00000160094 ZNF362 764132 sc-eQTL 1.48e-01 0.135 0.0931 0.22 cMono_IL1B L2
ENSG00000163866 SMIM12 -839131 sc-eQTL 2.51e-01 0.0932 0.0809 0.22 cMono_IL1B L2
ENSG00000243749 TMEM35B -964729 sc-eQTL 5.39e-01 0.0484 0.0786 0.22 cMono_IL1B L2
ENSG00000004455 AK2 939628 sc-eQTL 8.01e-01 -0.0232 0.0917 0.22 cMono_S100A L2
ENSG00000116525 TRIM62 838565 sc-eQTL 8.47e-01 -0.0211 0.109 0.22 cMono_S100A L2
ENSG00000116544 DLGAP3 -909026 sc-eQTL 9.91e-01 0.00124 0.106 0.22 cMono_S100A L2
ENSG00000134686 PHC2 589572 sc-eQTL 3.53e-01 -0.0522 0.0561 0.22 cMono_S100A L2
ENSG00000160094 ZNF362 764132 sc-eQTL 6.45e-01 -0.0465 0.101 0.22 cMono_S100A L2
ENSG00000163866 SMIM12 -839131 sc-eQTL 2.51e-01 0.107 0.0932 0.22 cMono_S100A L2
ENSG00000243749 TMEM35B -964729 sc-eQTL 3.25e-01 -0.0834 0.0845 0.22 cMono_S100A L2
ENSG00000004455 AK2 939628 sc-eQTL 1.58e-01 0.174 0.123 0.218 gdT L2
ENSG00000116525 TRIM62 838565 sc-eQTL 9.62e-02 0.221 0.132 0.218 gdT L2
ENSG00000116544 DLGAP3 -909026 sc-eQTL 7.84e-01 -0.0349 0.127 0.218 gdT L2
ENSG00000134686 PHC2 589572 sc-eQTL 2.17e-01 0.137 0.111 0.218 gdT L2
ENSG00000142920 AZIN2 939520 sc-eQTL 7.42e-02 -0.203 0.113 0.218 gdT L2
ENSG00000160094 ZNF362 764132 sc-eQTL 1.74e-01 0.175 0.128 0.218 gdT L2
ENSG00000163866 SMIM12 -839131 sc-eQTL 5.14e-01 0.0867 0.132 0.218 gdT L2
ENSG00000243749 TMEM35B -964729 sc-eQTL 1.29e-01 0.147 0.0966 0.218 gdT L2
ENSG00000004455 AK2 939628 sc-eQTL 2.05e-01 -0.13 0.102 0.227 intMono L2
ENSG00000116525 TRIM62 838565 sc-eQTL 5.15e-01 -0.069 0.106 0.227 intMono L2
ENSG00000116544 DLGAP3 -909026 sc-eQTL 1.57e-01 0.144 0.101 0.227 intMono L2
ENSG00000134686 PHC2 589572 sc-eQTL 4.85e-01 -0.0426 0.0609 0.227 intMono L2
ENSG00000160094 ZNF362 764132 sc-eQTL 8.89e-01 -0.0151 0.109 0.227 intMono L2
ENSG00000163866 SMIM12 -839131 sc-eQTL 1.96e-01 0.135 0.104 0.227 intMono L2
ENSG00000243749 TMEM35B -964729 sc-eQTL 1.72e-01 -0.126 0.0918 0.227 intMono L2
ENSG00000004455 AK2 939628 sc-eQTL 7.69e-01 -0.0292 0.0993 0.226 ncMono L2
ENSG00000116525 TRIM62 838565 sc-eQTL 8.03e-02 0.161 0.0914 0.226 ncMono L2
ENSG00000116544 DLGAP3 -909026 sc-eQTL 1.23e-01 0.138 0.0889 0.226 ncMono L2
ENSG00000134686 PHC2 589572 sc-eQTL 9.31e-01 -0.00606 0.0704 0.226 ncMono L2
ENSG00000160094 ZNF362 764132 sc-eQTL 3.25e-01 0.106 0.108 0.226 ncMono L2
ENSG00000163866 SMIM12 -839131 sc-eQTL 7.11e-01 -0.0362 0.0976 0.226 ncMono L2
ENSG00000243749 TMEM35B -964729 sc-eQTL 6.23e-02 -0.173 0.0923 0.226 ncMono L2
ENSG00000004455 AK2 939628 sc-eQTL 7.82e-01 -0.0307 0.111 0.237 pDC L2
ENSG00000116525 TRIM62 838565 sc-eQTL 4.61e-01 -0.0813 0.11 0.237 pDC L2
ENSG00000116544 DLGAP3 -909026 sc-eQTL 3.72e-01 0.0969 0.108 0.237 pDC L2
ENSG00000134686 PHC2 589572 sc-eQTL 7.97e-01 0.0231 0.0896 0.237 pDC L2
ENSG00000142920 AZIN2 939520 sc-eQTL 1.95e-01 -0.1 0.0771 0.237 pDC L2
ENSG00000160094 ZNF362 764132 sc-eQTL 6.25e-01 -0.0473 0.0965 0.237 pDC L2
ENSG00000163866 SMIM12 -839131 sc-eQTL 6.08e-01 -0.058 0.113 0.237 pDC L2
ENSG00000243749 TMEM35B -964729 sc-eQTL 2.82e-01 -0.0995 0.0923 0.237 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000004455 AK2 939628 sc-eQTL 8.92e-01 -0.0115 0.0844 0.22 B_Memory LOneK1K
ENSG00000116525 TRIM62 838565 sc-eQTL 7.79e-01 0.0268 0.0955 0.22 B_Memory LOneK1K
ENSG00000116544 DLGAP3 -909026 sc-eQTL 8.01e-01 0.0262 0.104 0.22 B_Memory LOneK1K
ENSG00000134686 PHC2 589572 sc-eQTL 1.21e-01 0.134 0.0862 0.22 B_Memory LOneK1K
ENSG00000160094 ZNF362 764132 sc-eQTL 8.79e-01 0.0149 0.098 0.22 B_Memory LOneK1K
ENSG00000163866 SMIM12 -839131 sc-eQTL 2.86e-01 0.108 0.101 0.22 B_Memory LOneK1K
ENSG00000243749 TMEM35B -964729 sc-eQTL 6.93e-01 -0.026 0.0657 0.22 B_Memory LOneK1K
ENSG00000004455 AK2 939628 sc-eQTL 9.52e-01 0.00418 0.0692 0.22 B_Naive LOneK1K
ENSG00000116525 TRIM62 838565 sc-eQTL 5.46e-01 -0.0577 0.0954 0.22 B_Naive LOneK1K
ENSG00000116544 DLGAP3 -909026 sc-eQTL 3.64e-01 0.0948 0.104 0.22 B_Naive LOneK1K
ENSG00000134686 PHC2 589572 sc-eQTL 2.15e-01 -0.104 0.0837 0.22 B_Naive LOneK1K
ENSG00000160094 ZNF362 764132 sc-eQTL 8.59e-01 -0.0164 0.0922 0.22 B_Naive LOneK1K
ENSG00000163866 SMIM12 -839131 sc-eQTL 2.02e-01 0.123 0.0965 0.22 B_Naive LOneK1K
ENSG00000243749 TMEM35B -964729 sc-eQTL 9.59e-01 0.00314 0.0603 0.22 B_Naive LOneK1K
ENSG00000004455 AK2 939628 sc-eQTL 9.04e-01 0.00987 0.0818 0.22 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000116525 TRIM62 838565 sc-eQTL 5.88e-01 -0.0549 0.101 0.22 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000116544 DLGAP3 -909026 sc-eQTL 6.65e-01 0.0447 0.103 0.22 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000134686 PHC2 589572 sc-eQTL 7.35e-01 -0.0176 0.0518 0.22 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000160094 ZNF362 764132 sc-eQTL 1.66e-01 0.122 0.0876 0.22 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000163866 SMIM12 -839131 sc-eQTL 1.50e-01 0.107 0.0742 0.22 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000243749 TMEM35B -964729 sc-eQTL 9.03e-01 0.00885 0.0726 0.22 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000004455 AK2 939628 sc-eQTL 4.46e-01 -0.0717 0.0939 0.222 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000116525 TRIM62 838565 sc-eQTL 4.52e-01 0.0722 0.0958 0.222 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000116544 DLGAP3 -909026 sc-eQTL 2.37e-02 0.187 0.0819 0.222 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000134686 PHC2 589572 sc-eQTL 6.49e-01 -0.0274 0.0602 0.222 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000160094 ZNF362 764132 sc-eQTL 6.45e-01 0.045 0.0974 0.222 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000163866 SMIM12 -839131 sc-eQTL 8.33e-01 0.0192 0.091 0.222 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000243749 TMEM35B -964729 sc-eQTL 8.04e-02 -0.147 0.0839 0.222 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000004455 AK2 939628 sc-eQTL 9.12e-01 -0.00862 0.0781 0.222 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000116525 TRIM62 838565 sc-eQTL 4.29e-01 0.0682 0.0862 0.222 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000116544 DLGAP3 -909026 sc-eQTL 9.30e-02 0.171 0.102 0.222 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000134686 PHC2 589572 sc-eQTL 1.04e-01 -0.129 0.0791 0.222 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000160094 ZNF362 764132 sc-eQTL 9.48e-01 0.00599 0.0918 0.222 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000163866 SMIM12 -839131 sc-eQTL 4.21e-01 0.0728 0.0902 0.222 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000243749 TMEM35B -964729 sc-eQTL 2.06e-01 -0.0593 0.0468 0.222 NK_CD56dim LOneK1K


Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF


Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina
ENSG00000160094 \N 764132 3.53e-07 1.59e-07 6.15e-08 2.24e-07 1.01e-07 8.63e-08 2.4e-07 5.78e-08 1.89e-07 9.72e-08 1.96e-07 1.46e-07 2.74e-07 8.15e-08 5.62e-08 9.6e-08 4.25e-08 2.04e-07 7.39e-08 6.16e-08 1.18e-07 1.76e-07 1.69e-07 3.59e-08 2.36e-07 1.51e-07 1.23e-07 1.36e-07 1.37e-07 1.33e-07 1.27e-07 3.9e-08 3.46e-08 9.72e-08 5.24e-08 3.11e-08 3.7e-08 8.57e-08 6.45e-08 6.31e-08 4.78e-08 1.55e-07 5.27e-08 7.61e-09 3.48e-08 6.39e-09 8.61e-08 1.96e-09 4.81e-08
ENSG00000279179 \N 857773 3.02e-07 1.42e-07 5.64e-08 2.05e-07 1.03e-07 8.33e-08 1.9e-07 5.85e-08 1.59e-07 6.75e-08 1.61e-07 1.2e-07 2.13e-07 8.13e-08 5.82e-08 7.89e-08 4.31e-08 1.64e-07 6.92e-08 5.07e-08 1.25e-07 1.39e-07 1.58e-07 3.22e-08 2.02e-07 1.26e-07 1.17e-07 1.12e-07 1.34e-07 1.07e-07 1.14e-07 3.59e-08 3.51e-08 9.78e-08 3.07e-08 3.22e-08 5.58e-08 8.76e-08 6.41e-08 4.41e-08 6.07e-08 1.52e-07 5.22e-08 1.49e-08 2.82e-08 1.65e-08 1.2e-07 1.89e-09 5.01e-08