logo

Genes within 1Mb (chr1:33962635:C:T):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD

Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000004455 AK2 881639 sc-eQTL 1.71e-01 0.156 0.113 0.06 B L1
ENSG00000116514 RNF19B 997950 sc-eQTL 7.20e-02 0.251 0.139 0.06 B L1
ENSG00000116525 TRIM62 780576 sc-eQTL 7.53e-01 -0.0506 0.161 0.06 B L1
ENSG00000116544 DLGAP3 -967015 sc-eQTL 9.46e-01 0.0123 0.183 0.06 B L1
ENSG00000134686 PHC2 531583 sc-eQTL 4.52e-01 0.11 0.146 0.06 B L1
ENSG00000160094 ZNF362 706143 sc-eQTL 3.14e-01 0.158 0.156 0.06 B L1
ENSG00000163866 SMIM12 -897120 sc-eQTL 3.78e-01 0.136 0.155 0.06 B L1
ENSG00000004455 AK2 881639 sc-eQTL 3.83e-01 -0.0784 0.0897 0.06 CD4T L1
ENSG00000116514 RNF19B 997950 sc-eQTL 1.31e-01 -0.149 0.098 0.06 CD4T L1
ENSG00000116525 TRIM62 780576 sc-eQTL 7.88e-01 -0.0337 0.126 0.06 CD4T L1
ENSG00000116544 DLGAP3 -967015 sc-eQTL 5.98e-01 -0.0803 0.152 0.06 CD4T L1
ENSG00000134686 PHC2 531583 sc-eQTL 3.65e-01 -0.111 0.122 0.06 CD4T L1
ENSG00000142920 AZIN2 881531 sc-eQTL 9.67e-01 0.00687 0.166 0.06 CD4T L1
ENSG00000160094 ZNF362 706143 sc-eQTL 5.90e-01 -0.0708 0.131 0.06 CD4T L1
ENSG00000163866 SMIM12 -897120 sc-eQTL 7.15e-01 -0.0468 0.128 0.06 CD4T L1
ENSG00000004455 AK2 881639 sc-eQTL 1.71e-01 0.156 0.114 0.06 CD8T L1
ENSG00000116514 RNF19B 997950 sc-eQTL 9.72e-02 -0.175 0.105 0.06 CD8T L1
ENSG00000116525 TRIM62 780576 sc-eQTL 8.37e-02 -0.279 0.161 0.06 CD8T L1
ENSG00000116544 DLGAP3 -967015 sc-eQTL 7.95e-01 -0.0462 0.177 0.06 CD8T L1
ENSG00000134686 PHC2 531583 sc-eQTL 4.51e-01 -0.105 0.139 0.06 CD8T L1
ENSG00000142920 AZIN2 881531 sc-eQTL 4.39e-01 -0.123 0.158 0.06 CD8T L1
ENSG00000160094 ZNF362 706143 sc-eQTL 9.25e-01 -0.0127 0.135 0.06 CD8T L1
ENSG00000163866 SMIM12 -897120 sc-eQTL 1.69e-01 -0.202 0.147 0.06 CD8T L1
ENSG00000004455 AK2 881639 sc-eQTL 7.60e-01 -0.0542 0.178 0.061 DC L1
ENSG00000116514 RNF19B 997950 sc-eQTL 6.91e-01 -0.0713 0.179 0.061 DC L1
ENSG00000116525 TRIM62 780576 sc-eQTL 7.92e-01 0.0507 0.192 0.061 DC L1
ENSG00000116544 DLGAP3 -967015 sc-eQTL 4.79e-01 0.126 0.178 0.061 DC L1
ENSG00000134686 PHC2 531583 sc-eQTL 3.34e-01 0.124 0.129 0.061 DC L1
ENSG00000142920 AZIN2 881531 sc-eQTL 4.76e-01 0.0742 0.104 0.061 DC L1
ENSG00000160094 ZNF362 706143 sc-eQTL 4.08e-02 0.341 0.166 0.061 DC L1
ENSG00000163866 SMIM12 -897120 sc-eQTL 7.33e-01 -0.0601 0.176 0.061 DC L1
ENSG00000004455 AK2 881639 sc-eQTL 1.29e-01 -0.214 0.14 0.06 Mono L1
ENSG00000116514 RNF19B 997950 sc-eQTL 1.18e-02 0.256 0.101 0.06 Mono L1
ENSG00000116525 TRIM62 780576 sc-eQTL 8.70e-01 0.0282 0.172 0.06 Mono L1
ENSG00000116544 DLGAP3 -967015 sc-eQTL 2.86e-01 0.185 0.173 0.06 Mono L1
ENSG00000134686 PHC2 531583 sc-eQTL 2.04e-01 -0.117 0.0918 0.06 Mono L1
ENSG00000160094 ZNF362 706143 sc-eQTL 3.20e-01 0.151 0.152 0.06 Mono L1
ENSG00000163866 SMIM12 -897120 sc-eQTL 4.45e-01 -0.1 0.131 0.06 Mono L1
ENSG00000004455 AK2 881639 sc-eQTL 7.49e-01 -0.0441 0.137 0.06 NK L1
ENSG00000116514 RNF19B 997950 sc-eQTL 3.66e-01 0.124 0.137 0.06 NK L1
ENSG00000116525 TRIM62 780576 sc-eQTL 6.88e-01 0.0627 0.156 0.06 NK L1
ENSG00000116544 DLGAP3 -967015 sc-eQTL 3.24e-01 -0.187 0.189 0.06 NK L1
ENSG00000134686 PHC2 531583 sc-eQTL 8.50e-01 0.0274 0.145 0.06 NK L1
ENSG00000160094 ZNF362 706143 sc-eQTL 4.34e-01 -0.128 0.163 0.06 NK L1
ENSG00000163866 SMIM12 -897120 sc-eQTL 6.82e-01 -0.0675 0.165 0.06 NK L1
ENSG00000004455 AK2 881639 sc-eQTL 6.07e-01 -0.0549 0.107 0.06 Other_T L1
ENSG00000116514 RNF19B 997950 sc-eQTL 3.62e-01 -0.13 0.142 0.06 Other_T L1
ENSG00000116525 TRIM62 780576 sc-eQTL 1.40e-01 -0.275 0.186 0.06 Other_T L1
ENSG00000116544 DLGAP3 -967015 sc-eQTL 9.71e-02 0.33 0.198 0.06 Other_T L1
ENSG00000134686 PHC2 531583 sc-eQTL 5.98e-01 0.0821 0.155 0.06 Other_T L1
ENSG00000142920 AZIN2 881531 sc-eQTL 9.15e-01 -0.0205 0.192 0.06 Other_T L1
ENSG00000160094 ZNF362 706143 sc-eQTL 5.19e-01 -0.106 0.164 0.06 Other_T L1
ENSG00000163866 SMIM12 -897120 sc-eQTL 1.34e-01 -0.252 0.168 0.06 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000004455 AK2 881639 sc-eQTL 9.19e-01 0.0232 0.228 0.059 B_Activated L2
ENSG00000116514 RNF19B 997950 sc-eQTL 2.65e-01 -0.241 0.216 0.059 B_Activated L2
ENSG00000116525 TRIM62 780576 sc-eQTL 4.04e-01 -0.176 0.21 0.059 B_Activated L2
ENSG00000116544 DLGAP3 -967015 sc-eQTL 2.65e-01 0.196 0.175 0.059 B_Activated L2
ENSG00000134686 PHC2 531583 sc-eQTL 3.97e-01 -0.178 0.21 0.059 B_Activated L2
ENSG00000160094 ZNF362 706143 sc-eQTL 1.89e-01 -0.29 0.22 0.059 B_Activated L2
ENSG00000163866 SMIM12 -897120 sc-eQTL 4.29e-01 0.182 0.229 0.059 B_Activated L2
ENSG00000004455 AK2 881639 sc-eQTL 7.33e-01 0.0539 0.158 0.06 B_Intermediate L2
ENSG00000116514 RNF19B 997950 sc-eQTL 2.73e-02 0.355 0.16 0.06 B_Intermediate L2
ENSG00000116525 TRIM62 780576 sc-eQTL 6.81e-01 0.0748 0.182 0.06 B_Intermediate L2
ENSG00000116544 DLGAP3 -967015 sc-eQTL 3.99e-02 0.373 0.18 0.06 B_Intermediate L2
ENSG00000134686 PHC2 531583 sc-eQTL 4.41e-01 0.123 0.159 0.06 B_Intermediate L2
ENSG00000160094 ZNF362 706143 sc-eQTL 9.09e-01 0.0209 0.182 0.06 B_Intermediate L2
ENSG00000163866 SMIM12 -897120 sc-eQTL 2.69e-01 0.208 0.188 0.06 B_Intermediate L2
ENSG00000004455 AK2 881639 sc-eQTL 6.65e-01 0.0828 0.191 0.06 B_Memory L2
ENSG00000116514 RNF19B 997950 sc-eQTL 5.09e-01 0.116 0.175 0.06 B_Memory L2
ENSG00000116525 TRIM62 780576 sc-eQTL 4.07e-01 0.166 0.2 0.06 B_Memory L2
ENSG00000116544 DLGAP3 -967015 sc-eQTL 4.23e-01 0.144 0.179 0.06 B_Memory L2
ENSG00000134686 PHC2 531583 sc-eQTL 5.58e-01 -0.101 0.173 0.06 B_Memory L2
ENSG00000160094 ZNF362 706143 sc-eQTL 7.69e-01 -0.0553 0.188 0.06 B_Memory L2
ENSG00000163866 SMIM12 -897120 sc-eQTL 9.93e-01 -0.00178 0.191 0.06 B_Memory L2
ENSG00000004455 AK2 881639 sc-eQTL 2.55e-03 0.386 0.126 0.06 B_Naive1 L2
ENSG00000116514 RNF19B 997950 sc-eQTL 7.47e-02 0.259 0.145 0.06 B_Naive1 L2
ENSG00000116525 TRIM62 780576 sc-eQTL 4.74e-01 -0.13 0.182 0.06 B_Naive1 L2
ENSG00000116544 DLGAP3 -967015 sc-eQTL 4.72e-01 -0.132 0.184 0.06 B_Naive1 L2
ENSG00000134686 PHC2 531583 sc-eQTL 7.21e-01 -0.0552 0.154 0.06 B_Naive1 L2
ENSG00000160094 ZNF362 706143 sc-eQTL 3.90e-01 0.155 0.18 0.06 B_Naive1 L2
ENSG00000163866 SMIM12 -897120 sc-eQTL 7.23e-01 -0.0637 0.18 0.06 B_Naive1 L2
ENSG00000004455 AK2 881639 sc-eQTL 7.89e-01 -0.0476 0.178 0.06 B_Naive2 L2
ENSG00000116514 RNF19B 997950 sc-eQTL 4.30e-01 -0.152 0.192 0.06 B_Naive2 L2
ENSG00000116525 TRIM62 780576 sc-eQTL 4.18e-01 -0.161 0.198 0.06 B_Naive2 L2
ENSG00000116544 DLGAP3 -967015 sc-eQTL 9.65e-01 -0.00931 0.209 0.06 B_Naive2 L2
ENSG00000134686 PHC2 531583 sc-eQTL 4.64e-01 0.127 0.173 0.06 B_Naive2 L2
ENSG00000160094 ZNF362 706143 sc-eQTL 3.35e-01 0.182 0.188 0.06 B_Naive2 L2
ENSG00000163866 SMIM12 -897120 sc-eQTL 2.64e-01 0.229 0.204 0.06 B_Naive2 L2
ENSG00000004455 AK2 881639 sc-eQTL 4.58e-01 0.144 0.194 0.057 CD4_CTL L2
ENSG00000116514 RNF19B 997950 sc-eQTL 1.43e-01 0.274 0.187 0.057 CD4_CTL L2
ENSG00000116525 TRIM62 780576 sc-eQTL 4.48e-01 0.144 0.189 0.057 CD4_CTL L2
ENSG00000116544 DLGAP3 -967015 sc-eQTL 4.60e-01 0.139 0.187 0.057 CD4_CTL L2
ENSG00000134686 PHC2 531583 sc-eQTL 4.02e-01 -0.151 0.179 0.057 CD4_CTL L2
ENSG00000142920 AZIN2 881531 sc-eQTL 5.21e-01 0.118 0.184 0.057 CD4_CTL L2
ENSG00000160094 ZNF362 706143 sc-eQTL 2.63e-01 0.213 0.19 0.057 CD4_CTL L2
ENSG00000163866 SMIM12 -897120 sc-eQTL 2.97e-02 0.415 0.19 0.057 CD4_CTL L2
ENSG00000004455 AK2 881639 sc-eQTL 1.39e-01 -0.159 0.107 0.06 CD4_Naive L2
ENSG00000116514 RNF19B 997950 sc-eQTL 5.28e-01 -0.0705 0.112 0.06 CD4_Naive L2
ENSG00000116525 TRIM62 780576 sc-eQTL 6.16e-01 -0.0729 0.145 0.06 CD4_Naive L2
ENSG00000116544 DLGAP3 -967015 sc-eQTL 6.50e-01 -0.0809 0.178 0.06 CD4_Naive L2
ENSG00000134686 PHC2 531583 sc-eQTL 2.17e-01 -0.159 0.128 0.06 CD4_Naive L2
ENSG00000142920 AZIN2 881531 sc-eQTL 7.09e-01 0.0658 0.176 0.06 CD4_Naive L2
ENSG00000160094 ZNF362 706143 sc-eQTL 5.47e-01 -0.0827 0.137 0.06 CD4_Naive L2
ENSG00000163866 SMIM12 -897120 sc-eQTL 8.08e-01 0.0308 0.126 0.06 CD4_Naive L2
ENSG00000004455 AK2 881639 sc-eQTL 8.37e-01 0.0266 0.129 0.06 CD4_TCM L2
ENSG00000116514 RNF19B 997950 sc-eQTL 1.99e-01 -0.166 0.129 0.06 CD4_TCM L2
ENSG00000116525 TRIM62 780576 sc-eQTL 5.73e-01 -0.0857 0.152 0.06 CD4_TCM L2
ENSG00000116544 DLGAP3 -967015 sc-eQTL 8.04e-01 -0.039 0.157 0.06 CD4_TCM L2
ENSG00000134686 PHC2 531583 sc-eQTL 6.24e-01 0.0711 0.145 0.06 CD4_TCM L2
ENSG00000142920 AZIN2 881531 sc-eQTL 6.29e-01 -0.0886 0.183 0.06 CD4_TCM L2
ENSG00000160094 ZNF362 706143 sc-eQTL 4.26e-01 0.123 0.154 0.06 CD4_TCM L2
ENSG00000163866 SMIM12 -897120 sc-eQTL 9.09e-01 -0.0188 0.165 0.06 CD4_TCM L2
ENSG00000004455 AK2 881639 sc-eQTL 1.40e-01 0.236 0.159 0.06 CD4_TEM L2
ENSG00000116514 RNF19B 997950 sc-eQTL 4.74e-01 0.111 0.154 0.06 CD4_TEM L2
ENSG00000116525 TRIM62 780576 sc-eQTL 9.33e-02 0.313 0.186 0.06 CD4_TEM L2
ENSG00000116544 DLGAP3 -967015 sc-eQTL 2.25e-01 -0.237 0.195 0.06 CD4_TEM L2
ENSG00000134686 PHC2 531583 sc-eQTL 1.93e-01 0.226 0.173 0.06 CD4_TEM L2
ENSG00000142920 AZIN2 881531 sc-eQTL 7.76e-01 0.0564 0.198 0.06 CD4_TEM L2
ENSG00000160094 ZNF362 706143 sc-eQTL 3.88e-01 -0.164 0.19 0.06 CD4_TEM L2
ENSG00000163866 SMIM12 -897120 sc-eQTL 5.44e-02 -0.35 0.181 0.06 CD4_TEM L2
ENSG00000004455 AK2 881639 sc-eQTL 7.13e-01 -0.0568 0.154 0.06 CD8_CTL L2
ENSG00000116514 RNF19B 997950 sc-eQTL 4.74e-01 -0.104 0.145 0.06 CD8_CTL L2
ENSG00000116525 TRIM62 780576 sc-eQTL 6.49e-01 -0.0784 0.172 0.06 CD8_CTL L2
ENSG00000116544 DLGAP3 -967015 sc-eQTL 1.32e-01 0.281 0.186 0.06 CD8_CTL L2
ENSG00000134686 PHC2 531583 sc-eQTL 6.00e-01 -0.081 0.154 0.06 CD8_CTL L2
ENSG00000142920 AZIN2 881531 sc-eQTL 4.37e-01 0.145 0.186 0.06 CD8_CTL L2
ENSG00000160094 ZNF362 706143 sc-eQTL 6.38e-01 -0.0768 0.163 0.06 CD8_CTL L2
ENSG00000163866 SMIM12 -897120 sc-eQTL 2.26e-01 -0.218 0.18 0.06 CD8_CTL L2
ENSG00000004455 AK2 881639 sc-eQTL 3.24e-02 0.296 0.138 0.06 CD8_Naive L2
ENSG00000116514 RNF19B 997950 sc-eQTL 2.82e-01 -0.164 0.152 0.06 CD8_Naive L2
ENSG00000116525 TRIM62 780576 sc-eQTL 7.66e-01 -0.0555 0.186 0.06 CD8_Naive L2
ENSG00000116544 DLGAP3 -967015 sc-eQTL 7.18e-01 -0.0701 0.194 0.06 CD8_Naive L2
ENSG00000134686 PHC2 531583 sc-eQTL 6.58e-01 0.0709 0.16 0.06 CD8_Naive L2
ENSG00000142920 AZIN2 881531 sc-eQTL 6.34e-02 -0.341 0.183 0.06 CD8_Naive L2
ENSG00000160094 ZNF362 706143 sc-eQTL 5.62e-01 0.0976 0.168 0.06 CD8_Naive L2
ENSG00000163866 SMIM12 -897120 sc-eQTL 5.17e-02 -0.312 0.16 0.06 CD8_Naive L2
ENSG00000004455 AK2 881639 sc-eQTL 2.07e-01 -0.24 0.19 0.062 CD8_TCM L2
ENSG00000116514 RNF19B 997950 sc-eQTL 9.90e-01 -0.00227 0.184 0.062 CD8_TCM L2
ENSG00000116525 TRIM62 780576 sc-eQTL 9.48e-04 -0.683 0.203 0.062 CD8_TCM L2
ENSG00000116544 DLGAP3 -967015 sc-eQTL 5.17e-01 -0.129 0.199 0.062 CD8_TCM L2
ENSG00000134686 PHC2 531583 sc-eQTL 4.76e-01 0.116 0.163 0.062 CD8_TCM L2
ENSG00000142920 AZIN2 881531 sc-eQTL 1.12e-01 -0.314 0.196 0.062 CD8_TCM L2
ENSG00000160094 ZNF362 706143 sc-eQTL 4.45e-01 -0.149 0.195 0.062 CD8_TCM L2
ENSG00000163866 SMIM12 -897120 sc-eQTL 2.73e-01 0.212 0.193 0.062 CD8_TCM L2
ENSG00000004455 AK2 881639 sc-eQTL 5.39e-01 -0.122 0.199 0.062 CD8_TEM L2
ENSG00000116514 RNF19B 997950 sc-eQTL 9.27e-01 -0.0181 0.199 0.062 CD8_TEM L2
ENSG00000116525 TRIM62 780576 sc-eQTL 3.48e-01 -0.193 0.205 0.062 CD8_TEM L2
ENSG00000116544 DLGAP3 -967015 sc-eQTL 8.22e-01 -0.041 0.182 0.062 CD8_TEM L2
ENSG00000134686 PHC2 531583 sc-eQTL 8.93e-01 -0.0259 0.193 0.062 CD8_TEM L2
ENSG00000142920 AZIN2 881531 sc-eQTL 9.65e-01 0.00762 0.173 0.062 CD8_TEM L2
ENSG00000160094 ZNF362 706143 sc-eQTL 7.69e-01 0.0574 0.195 0.062 CD8_TEM L2
ENSG00000163866 SMIM12 -897120 sc-eQTL 6.09e-01 -0.103 0.202 0.062 CD8_TEM L2
ENSG00000004455 AK2 881639 sc-eQTL 5.42e-01 -0.105 0.172 0.061 MAIT L2
ENSG00000116514 RNF19B 997950 sc-eQTL 3.93e-01 -0.136 0.159 0.061 MAIT L2
ENSG00000116525 TRIM62 780576 sc-eQTL 5.17e-01 -0.129 0.198 0.061 MAIT L2
ENSG00000116544 DLGAP3 -967015 sc-eQTL 2.44e-01 0.218 0.187 0.061 MAIT L2
ENSG00000134686 PHC2 531583 sc-eQTL 2.54e-01 0.188 0.165 0.061 MAIT L2
ENSG00000142920 AZIN2 881531 sc-eQTL 8.37e-01 0.0393 0.191 0.061 MAIT L2
ENSG00000160094 ZNF362 706143 sc-eQTL 1.68e-01 -0.254 0.183 0.061 MAIT L2
ENSG00000163866 SMIM12 -897120 sc-eQTL 4.52e-01 -0.142 0.189 0.061 MAIT L2
ENSG00000004455 AK2 881639 sc-eQTL 2.07e-01 -0.252 0.199 0.058 NK_CD56bright L2
ENSG00000116514 RNF19B 997950 sc-eQTL 2.03e-01 0.237 0.186 0.058 NK_CD56bright L2
ENSG00000116525 TRIM62 780576 sc-eQTL 4.81e-01 -0.141 0.2 0.058 NK_CD56bright L2
ENSG00000116544 DLGAP3 -967015 sc-eQTL 5.00e-01 0.131 0.194 0.058 NK_CD56bright L2
ENSG00000134686 PHC2 531583 sc-eQTL 5.70e-01 0.103 0.18 0.058 NK_CD56bright L2
ENSG00000160094 ZNF362 706143 sc-eQTL 4.44e-01 -0.157 0.205 0.058 NK_CD56bright L2
ENSG00000163866 SMIM12 -897120 sc-eQTL 8.90e-02 0.363 0.212 0.058 NK_CD56bright L2
ENSG00000004455 AK2 881639 sc-eQTL 8.42e-01 0.0332 0.166 0.058 NK_CD56dim L2
ENSG00000116514 RNF19B 997950 sc-eQTL 6.59e-01 -0.0662 0.15 0.058 NK_CD56dim L2
ENSG00000116525 TRIM62 780576 sc-eQTL 4.04e-01 0.146 0.174 0.058 NK_CD56dim L2
ENSG00000116544 DLGAP3 -967015 sc-eQTL 2.63e-01 -0.209 0.186 0.058 NK_CD56dim L2
ENSG00000134686 PHC2 531583 sc-eQTL 2.98e-01 0.168 0.161 0.058 NK_CD56dim L2
ENSG00000160094 ZNF362 706143 sc-eQTL 3.05e-01 -0.188 0.183 0.058 NK_CD56dim L2
ENSG00000163866 SMIM12 -897120 sc-eQTL 3.37e-01 -0.173 0.179 0.058 NK_CD56dim L2
ENSG00000004455 AK2 881639 sc-eQTL 1.41e-01 0.293 0.198 0.055 NK_HLA L2
ENSG00000116514 RNF19B 997950 sc-eQTL 6.51e-01 0.0867 0.191 0.055 NK_HLA L2
ENSG00000116525 TRIM62 780576 sc-eQTL 1.04e-01 -0.328 0.201 0.055 NK_HLA L2
ENSG00000116544 DLGAP3 -967015 sc-eQTL 7.02e-01 -0.0712 0.186 0.055 NK_HLA L2
ENSG00000134686 PHC2 531583 sc-eQTL 3.42e-01 -0.167 0.176 0.055 NK_HLA L2
ENSG00000160094 ZNF362 706143 sc-eQTL 9.46e-01 -0.0136 0.202 0.055 NK_HLA L2
ENSG00000163866 SMIM12 -897120 sc-eQTL 4.29e-01 0.156 0.197 0.055 NK_HLA L2
ENSG00000004455 AK2 881639 sc-eQTL 4.55e-01 -0.132 0.177 0.058 NK_cytokine L2
ENSG00000116514 RNF19B 997950 sc-eQTL 4.48e-01 0.123 0.162 0.058 NK_cytokine L2
ENSG00000116525 TRIM62 780576 sc-eQTL 8.04e-01 -0.0486 0.196 0.058 NK_cytokine L2
ENSG00000116544 DLGAP3 -967015 sc-eQTL 5.67e-01 -0.112 0.196 0.058 NK_cytokine L2
ENSG00000134686 PHC2 531583 sc-eQTL 7.02e-01 -0.0638 0.167 0.058 NK_cytokine L2
ENSG00000160094 ZNF362 706143 sc-eQTL 6.24e-01 -0.0898 0.183 0.058 NK_cytokine L2
ENSG00000163866 SMIM12 -897120 sc-eQTL 2.50e-01 0.204 0.177 0.058 NK_cytokine L2
ENSG00000004455 AK2 881639 sc-eQTL 1.55e-01 0.193 0.135 0.061 Pro_T L2
ENSG00000116514 RNF19B 997950 sc-eQTL 8.82e-01 -0.0272 0.183 0.061 Pro_T L2
ENSG00000116525 TRIM62 780576 sc-eQTL 5.16e-01 0.117 0.18 0.061 Pro_T L2
ENSG00000116544 DLGAP3 -967015 sc-eQTL 4.27e-01 -0.136 0.171 0.061 Pro_T L2
ENSG00000134686 PHC2 531583 sc-eQTL 5.82e-01 0.0838 0.152 0.061 Pro_T L2
ENSG00000142920 AZIN2 881531 sc-eQTL 4.55e-01 -0.114 0.152 0.061 Pro_T L2
ENSG00000160094 ZNF362 706143 sc-eQTL 9.45e-01 0.0124 0.18 0.061 Pro_T L2
ENSG00000163866 SMIM12 -897120 sc-eQTL 7.82e-01 -0.0518 0.187 0.061 Pro_T L2
ENSG00000004455 AK2 881639 sc-eQTL 4.04e-01 -0.15 0.179 0.06 Treg L2
ENSG00000116514 RNF19B 997950 sc-eQTL 2.06e-01 -0.201 0.159 0.06 Treg L2
ENSG00000116525 TRIM62 780576 sc-eQTL 3.33e-01 -0.185 0.191 0.06 Treg L2
ENSG00000116544 DLGAP3 -967015 sc-eQTL 5.87e-01 -0.106 0.195 0.06 Treg L2
ENSG00000134686 PHC2 531583 sc-eQTL 8.33e-01 -0.0365 0.173 0.06 Treg L2
ENSG00000142920 AZIN2 881531 sc-eQTL 1.00e+00 -9.25e-05 0.168 0.06 Treg L2
ENSG00000160094 ZNF362 706143 sc-eQTL 1.60e-01 -0.257 0.182 0.06 Treg L2
ENSG00000163866 SMIM12 -897120 sc-eQTL 7.14e-01 -0.0692 0.189 0.06 Treg L2
ENSG00000004455 AK2 881639 sc-eQTL 1.40e-01 0.296 0.2 0.059 cDC L2
ENSG00000116514 RNF19B 997950 sc-eQTL 5.79e-01 -0.102 0.184 0.059 cDC L2
ENSG00000116525 TRIM62 780576 sc-eQTL 7.20e-01 0.0749 0.209 0.059 cDC L2
ENSG00000116544 DLGAP3 -967015 sc-eQTL 6.85e-01 0.084 0.207 0.059 cDC L2
ENSG00000134686 PHC2 531583 sc-eQTL 5.17e-01 -0.093 0.143 0.059 cDC L2
ENSG00000142920 AZIN2 881531 sc-eQTL 1.50e-01 -0.163 0.112 0.059 cDC L2
ENSG00000160094 ZNF362 706143 sc-eQTL 4.57e-01 0.147 0.197 0.059 cDC L2
ENSG00000163866 SMIM12 -897120 sc-eQTL 3.33e-01 -0.19 0.196 0.059 cDC L2
ENSG00000004455 AK2 881639 sc-eQTL 4.86e-01 -0.11 0.157 0.06 cMono_IL1B L2
ENSG00000116514 RNF19B 997950 sc-eQTL 1.60e-01 0.155 0.11 0.06 cMono_IL1B L2
ENSG00000116525 TRIM62 780576 sc-eQTL 9.84e-01 0.00357 0.182 0.06 cMono_IL1B L2
ENSG00000116544 DLGAP3 -967015 sc-eQTL 1.91e-03 0.572 0.182 0.06 cMono_IL1B L2
ENSG00000134686 PHC2 531583 sc-eQTL 1.03e-01 -0.153 0.0935 0.06 cMono_IL1B L2
ENSG00000160094 ZNF362 706143 sc-eQTL 5.39e-01 -0.102 0.166 0.06 cMono_IL1B L2
ENSG00000163866 SMIM12 -897120 sc-eQTL 3.74e-01 -0.128 0.144 0.06 cMono_IL1B L2
ENSG00000004455 AK2 881639 sc-eQTL 1.88e-01 -0.217 0.164 0.06 cMono_S100A L2
ENSG00000116514 RNF19B 997950 sc-eQTL 2.67e-03 0.395 0.13 0.06 cMono_S100A L2
ENSG00000116525 TRIM62 780576 sc-eQTL 7.65e-01 0.0588 0.197 0.06 cMono_S100A L2
ENSG00000116544 DLGAP3 -967015 sc-eQTL 9.74e-01 -0.00629 0.191 0.06 cMono_S100A L2
ENSG00000134686 PHC2 531583 sc-eQTL 1.71e-01 -0.138 0.101 0.06 cMono_S100A L2
ENSG00000160094 ZNF362 706143 sc-eQTL 6.30e-03 0.491 0.178 0.06 cMono_S100A L2
ENSG00000163866 SMIM12 -897120 sc-eQTL 8.36e-01 0.0349 0.168 0.06 cMono_S100A L2
ENSG00000004455 AK2 881639 sc-eQTL 8.63e-01 -0.0362 0.21 0.067 gdT L2
ENSG00000116514 RNF19B 997950 sc-eQTL 6.27e-01 -0.0936 0.192 0.067 gdT L2
ENSG00000116525 TRIM62 780576 sc-eQTL 1.48e-01 -0.326 0.224 0.067 gdT L2
ENSG00000116544 DLGAP3 -967015 sc-eQTL 1.73e-01 0.293 0.214 0.067 gdT L2
ENSG00000134686 PHC2 531583 sc-eQTL 7.10e-01 -0.0703 0.189 0.067 gdT L2
ENSG00000142920 AZIN2 881531 sc-eQTL 7.54e-01 -0.0608 0.193 0.067 gdT L2
ENSG00000160094 ZNF362 706143 sc-eQTL 6.88e-01 0.0881 0.219 0.067 gdT L2
ENSG00000163866 SMIM12 -897120 sc-eQTL 8.01e-02 -0.392 0.222 0.067 gdT L2
ENSG00000004455 AK2 881639 sc-eQTL 9.32e-02 -0.314 0.186 0.06 intMono L2
ENSG00000116514 RNF19B 997950 sc-eQTL 8.73e-01 0.0257 0.16 0.06 intMono L2
ENSG00000116525 TRIM62 780576 sc-eQTL 8.80e-01 -0.0293 0.194 0.06 intMono L2
ENSG00000116544 DLGAP3 -967015 sc-eQTL 6.32e-01 -0.0894 0.187 0.06 intMono L2
ENSG00000134686 PHC2 531583 sc-eQTL 7.70e-01 0.0327 0.112 0.06 intMono L2
ENSG00000160094 ZNF362 706143 sc-eQTL 1.03e-01 0.323 0.198 0.06 intMono L2
ENSG00000163866 SMIM12 -897120 sc-eQTL 9.74e-01 0.00617 0.191 0.06 intMono L2
ENSG00000004455 AK2 881639 sc-eQTL 1.64e-01 -0.262 0.187 0.059 ncMono L2
ENSG00000116514 RNF19B 997950 sc-eQTL 3.52e-01 0.163 0.175 0.059 ncMono L2
ENSG00000116525 TRIM62 780576 sc-eQTL 4.25e-01 -0.139 0.174 0.059 ncMono L2
ENSG00000116544 DLGAP3 -967015 sc-eQTL 5.59e-01 -0.099 0.169 0.059 ncMono L2
ENSG00000134686 PHC2 531583 sc-eQTL 4.80e-02 -0.262 0.132 0.059 ncMono L2
ENSG00000160094 ZNF362 706143 sc-eQTL 1.04e-01 -0.333 0.204 0.059 ncMono L2
ENSG00000163866 SMIM12 -897120 sc-eQTL 8.66e-01 -0.0313 0.185 0.059 ncMono L2
ENSG00000004455 AK2 881639 sc-eQTL 9.32e-02 -0.385 0.228 0.059 pDC L2
ENSG00000116514 RNF19B 997950 sc-eQTL 6.25e-01 0.113 0.231 0.059 pDC L2
ENSG00000116525 TRIM62 780576 sc-eQTL 8.94e-01 0.0306 0.229 0.059 pDC L2
ENSG00000116544 DLGAP3 -967015 sc-eQTL 2.41e-01 0.264 0.224 0.059 pDC L2
ENSG00000134686 PHC2 531583 sc-eQTL 7.58e-01 0.0575 0.186 0.059 pDC L2
ENSG00000142920 AZIN2 881531 sc-eQTL 5.91e-02 0.303 0.159 0.059 pDC L2
ENSG00000160094 ZNF362 706143 sc-eQTL 6.31e-01 0.0964 0.201 0.059 pDC L2
ENSG00000163866 SMIM12 -897120 sc-eQTL 9.97e-01 0.000986 0.235 0.059 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000004455 AK2 881639 sc-eQTL 8.36e-01 0.0315 0.152 0.06 B_Memory LOneK1K
ENSG00000116514 RNF19B 997950 sc-eQTL 2.17e-01 0.197 0.159 0.06 B_Memory LOneK1K
ENSG00000116525 TRIM62 780576 sc-eQTL 6.46e-01 0.0792 0.172 0.06 B_Memory LOneK1K
ENSG00000116544 DLGAP3 -967015 sc-eQTL 7.64e-02 0.33 0.185 0.06 B_Memory LOneK1K
ENSG00000134686 PHC2 531583 sc-eQTL 5.33e-01 0.0975 0.156 0.06 B_Memory LOneK1K
ENSG00000160094 ZNF362 706143 sc-eQTL 7.30e-01 -0.0611 0.177 0.06 B_Memory LOneK1K
ENSG00000163866 SMIM12 -897120 sc-eQTL 4.52e-01 0.137 0.182 0.06 B_Memory LOneK1K
ENSG00000004455 AK2 881639 sc-eQTL 1.46e-02 0.311 0.126 0.06 B_Naive LOneK1K
ENSG00000116514 RNF19B 997950 sc-eQTL 3.29e-01 0.143 0.147 0.06 B_Naive LOneK1K
ENSG00000116525 TRIM62 780576 sc-eQTL 4.93e-01 -0.121 0.177 0.06 B_Naive LOneK1K
ENSG00000116544 DLGAP3 -967015 sc-eQTL 4.85e-01 -0.135 0.193 0.06 B_Naive LOneK1K
ENSG00000134686 PHC2 531583 sc-eQTL 7.87e-01 0.0422 0.156 0.06 B_Naive LOneK1K
ENSG00000160094 ZNF362 706143 sc-eQTL 2.14e-01 0.212 0.17 0.06 B_Naive LOneK1K
ENSG00000163866 SMIM12 -897120 sc-eQTL 9.47e-01 -0.0119 0.179 0.06 B_Naive LOneK1K
ENSG00000004455 AK2 881639 sc-eQTL 2.70e-01 -0.161 0.146 0.06 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000116514 RNF19B 997950 sc-eQTL 5.76e-03 0.273 0.0979 0.06 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000116525 TRIM62 780576 sc-eQTL 9.19e-01 0.0185 0.181 0.06 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000116544 DLGAP3 -967015 sc-eQTL 8.74e-02 0.314 0.183 0.06 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000134686 PHC2 531583 sc-eQTL 1.24e-01 -0.142 0.0919 0.06 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000160094 ZNF362 706143 sc-eQTL 2.43e-01 0.183 0.157 0.06 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000163866 SMIM12 -897120 sc-eQTL 5.63e-01 -0.0771 0.133 0.06 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000004455 AK2 881639 sc-eQTL 3.02e-02 -0.368 0.168 0.06 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000116514 RNF19B 997950 sc-eQTL 9.68e-01 -0.00608 0.15 0.06 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000116525 TRIM62 780576 sc-eQTL 7.34e-01 -0.0592 0.174 0.06 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000116544 DLGAP3 -967015 sc-eQTL 1.71e-01 -0.205 0.149 0.06 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000134686 PHC2 531583 sc-eQTL 4.15e-01 -0.0889 0.109 0.06 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000160094 ZNF362 706143 sc-eQTL 7.94e-01 -0.046 0.177 0.06 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000163866 SMIM12 -897120 sc-eQTL 8.65e-01 0.0281 0.165 0.06 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000004455 AK2 881639 sc-eQTL 7.52e-01 -0.0462 0.146 0.058 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000116514 RNF19B 997950 sc-eQTL 6.89e-01 0.0582 0.145 0.058 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000116525 TRIM62 780576 sc-eQTL 7.02e-01 0.0618 0.161 0.058 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000116544 DLGAP3 -967015 sc-eQTL 2.41e-01 -0.224 0.191 0.058 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000134686 PHC2 531583 sc-eQTL 6.46e-01 0.0686 0.149 0.058 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000160094 ZNF362 706143 sc-eQTL 4.42e-01 -0.132 0.172 0.058 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000163866 SMIM12 -897120 sc-eQTL 6.20e-01 -0.0839 0.169 0.058 NK_CD56dim LOneK1K

Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF
ENSG00000121903 ZSCAN20 489990 eQTL 0.0466 0.148 0.0743 0.00111 0.0 0.0383

Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina
ENSG00000116544 \N -967015 2.67e-07 1.11e-07 3.72e-08 1.82e-07 9.01e-08 9.87e-08 1.42e-07 5.19e-08 1.41e-07 4.57e-08 1.62e-07 8.14e-08 1.33e-07 6.38e-08 6e-08 7.17e-08 3.9e-08 1.18e-07 5.21e-08 4.07e-08 1.04e-07 1.26e-07 1.32e-07 4.16e-08 1.32e-07 1.16e-07 1.11e-07 9.36e-08 1.05e-07 1.12e-07 9.91e-08 4.09e-08 3.09e-08 8.49e-08 8.96e-08 3.93e-08 5.01e-08 9.65e-08 7.52e-08 3.55e-08 3.95e-08 1.33e-07 3.91e-08 2.48e-08 5.59e-08 1.66e-08 1.24e-07 3.89e-09 4.85e-08