logo

Genes within 1Mb (chr1:33950120:C:CCTAT):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD

Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000004455 AK2 869124 sc-eQTL 7.67e-01 -0.0218 0.0735 0.15 B L1
ENSG00000116514 RNF19B 985435 sc-eQTL 3.55e-01 -0.0834 0.0899 0.15 B L1
ENSG00000116525 TRIM62 768061 sc-eQTL 9.55e-01 0.00585 0.104 0.15 B L1
ENSG00000116544 DLGAP3 -979530 sc-eQTL 8.71e-01 0.0192 0.118 0.15 B L1
ENSG00000134686 PHC2 519068 sc-eQTL 7.93e-01 0.0249 0.0945 0.15 B L1
ENSG00000160094 ZNF362 693628 sc-eQTL 7.27e-01 -0.0354 0.101 0.15 B L1
ENSG00000163866 SMIM12 -909635 sc-eQTL 5.21e-01 -0.0641 0.0998 0.15 B L1
ENSG00000004455 AK2 869124 sc-eQTL 3.11e-01 0.0593 0.0585 0.15 CD4T L1
ENSG00000116514 RNF19B 985435 sc-eQTL 6.01e-01 0.0337 0.0642 0.15 CD4T L1
ENSG00000116525 TRIM62 768061 sc-eQTL 5.03e-01 0.0549 0.0818 0.15 CD4T L1
ENSG00000116544 DLGAP3 -979530 sc-eQTL 4.49e-01 -0.0752 0.0992 0.15 CD4T L1
ENSG00000134686 PHC2 519068 sc-eQTL 1.10e-01 -0.127 0.0793 0.15 CD4T L1
ENSG00000142920 AZIN2 869016 sc-eQTL 2.73e-01 -0.119 0.108 0.15 CD4T L1
ENSG00000160094 ZNF362 693628 sc-eQTL 7.16e-01 0.0312 0.0857 0.15 CD4T L1
ENSG00000163866 SMIM12 -909635 sc-eQTL 4.66e-01 -0.061 0.0834 0.15 CD4T L1
ENSG00000004455 AK2 869124 sc-eQTL 4.26e-01 0.0594 0.0745 0.15 CD8T L1
ENSG00000116514 RNF19B 985435 sc-eQTL 9.22e-01 -0.00677 0.0691 0.15 CD8T L1
ENSG00000116525 TRIM62 768061 sc-eQTL 7.60e-01 -0.0324 0.106 0.15 CD8T L1
ENSG00000116544 DLGAP3 -979530 sc-eQTL 3.68e-01 -0.104 0.116 0.15 CD8T L1
ENSG00000134686 PHC2 519068 sc-eQTL 1.47e-01 -0.131 0.0904 0.15 CD8T L1
ENSG00000142920 AZIN2 869016 sc-eQTL 7.64e-02 -0.183 0.103 0.15 CD8T L1
ENSG00000160094 ZNF362 693628 sc-eQTL 8.35e-01 -0.0184 0.0883 0.15 CD8T L1
ENSG00000163866 SMIM12 -909635 sc-eQTL 6.86e-01 0.0391 0.0963 0.15 CD8T L1
ENSG00000004455 AK2 869124 sc-eQTL 5.17e-01 0.0761 0.117 0.142 DC L1
ENSG00000116514 RNF19B 985435 sc-eQTL 1.57e-01 0.168 0.118 0.142 DC L1
ENSG00000116525 TRIM62 768061 sc-eQTL 1.85e-01 -0.169 0.127 0.142 DC L1
ENSG00000116544 DLGAP3 -979530 sc-eQTL 8.91e-01 -0.0162 0.118 0.142 DC L1
ENSG00000134686 PHC2 519068 sc-eQTL 2.33e-01 -0.102 0.085 0.142 DC L1
ENSG00000142920 AZIN2 869016 sc-eQTL 7.04e-01 0.0261 0.0687 0.142 DC L1
ENSG00000160094 ZNF362 693628 sc-eQTL 6.77e-01 -0.0463 0.111 0.142 DC L1
ENSG00000163866 SMIM12 -909635 sc-eQTL 9.27e-01 0.0107 0.116 0.142 DC L1
ENSG00000004455 AK2 869124 sc-eQTL 5.55e-01 -0.0541 0.0914 0.15 Mono L1
ENSG00000116514 RNF19B 985435 sc-eQTL 3.57e-01 0.0613 0.0664 0.15 Mono L1
ENSG00000116525 TRIM62 768061 sc-eQTL 1.62e-01 0.156 0.111 0.15 Mono L1
ENSG00000116544 DLGAP3 -979530 sc-eQTL 3.39e-01 -0.108 0.112 0.15 Mono L1
ENSG00000134686 PHC2 519068 sc-eQTL 9.04e-01 0.00719 0.0599 0.15 Mono L1
ENSG00000160094 ZNF362 693628 sc-eQTL 9.04e-01 0.0119 0.0989 0.15 Mono L1
ENSG00000163866 SMIM12 -909635 sc-eQTL 1.84e-01 -0.113 0.0851 0.15 Mono L1
ENSG00000004455 AK2 869124 sc-eQTL 7.98e-01 0.0223 0.0872 0.15 NK L1
ENSG00000116514 RNF19B 985435 sc-eQTL 6.36e-01 -0.0412 0.0871 0.15 NK L1
ENSG00000116525 TRIM62 768061 sc-eQTL 9.58e-03 0.254 0.0972 0.15 NK L1
ENSG00000116544 DLGAP3 -979530 sc-eQTL 2.55e-01 0.137 0.12 0.15 NK L1
ENSG00000134686 PHC2 519068 sc-eQTL 9.30e-02 -0.154 0.0914 0.15 NK L1
ENSG00000160094 ZNF362 693628 sc-eQTL 2.19e-02 0.236 0.102 0.15 NK L1
ENSG00000163866 SMIM12 -909635 sc-eQTL 7.33e-01 0.0357 0.105 0.15 NK L1
ENSG00000004455 AK2 869124 sc-eQTL 9.13e-01 -0.00721 0.0659 0.15 Other_T L1
ENSG00000116514 RNF19B 985435 sc-eQTL 7.30e-01 0.0305 0.0882 0.15 Other_T L1
ENSG00000116525 TRIM62 768061 sc-eQTL 2.20e-01 -0.141 0.115 0.15 Other_T L1
ENSG00000116544 DLGAP3 -979530 sc-eQTL 6.74e-01 -0.0518 0.123 0.15 Other_T L1
ENSG00000134686 PHC2 519068 sc-eQTL 9.12e-01 0.0106 0.0961 0.15 Other_T L1
ENSG00000142920 AZIN2 869016 sc-eQTL 6.16e-02 -0.221 0.118 0.15 Other_T L1
ENSG00000160094 ZNF362 693628 sc-eQTL 5.73e-01 -0.0572 0.101 0.15 Other_T L1
ENSG00000163866 SMIM12 -909635 sc-eQTL 6.81e-01 -0.0429 0.104 0.15 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000004455 AK2 869124 sc-eQTL 1.55e-01 -0.202 0.141 0.148 B_Activated L2
ENSG00000116514 RNF19B 985435 sc-eQTL 6.91e-01 0.0537 0.135 0.148 B_Activated L2
ENSG00000116525 TRIM62 768061 sc-eQTL 4.70e-01 0.0949 0.131 0.148 B_Activated L2
ENSG00000116544 DLGAP3 -979530 sc-eQTL 2.20e-02 0.25 0.108 0.148 B_Activated L2
ENSG00000134686 PHC2 519068 sc-eQTL 4.76e-01 -0.0936 0.131 0.148 B_Activated L2
ENSG00000160094 ZNF362 693628 sc-eQTL 1.61e-01 -0.193 0.137 0.148 B_Activated L2
ENSG00000163866 SMIM12 -909635 sc-eQTL 4.56e-01 -0.107 0.143 0.148 B_Activated L2
ENSG00000004455 AK2 869124 sc-eQTL 8.46e-01 -0.02 0.103 0.15 B_Intermediate L2
ENSG00000116514 RNF19B 985435 sc-eQTL 7.39e-01 -0.0349 0.105 0.15 B_Intermediate L2
ENSG00000116525 TRIM62 768061 sc-eQTL 3.82e-01 -0.103 0.118 0.15 B_Intermediate L2
ENSG00000116544 DLGAP3 -979530 sc-eQTL 1.28e-02 -0.292 0.116 0.15 B_Intermediate L2
ENSG00000134686 PHC2 519068 sc-eQTL 3.68e-01 0.0929 0.103 0.15 B_Intermediate L2
ENSG00000160094 ZNF362 693628 sc-eQTL 8.96e-01 -0.0155 0.118 0.15 B_Intermediate L2
ENSG00000163866 SMIM12 -909635 sc-eQTL 5.49e-01 -0.0734 0.122 0.15 B_Intermediate L2
ENSG00000004455 AK2 869124 sc-eQTL 5.19e-01 -0.0796 0.123 0.149 B_Memory L2
ENSG00000116514 RNF19B 985435 sc-eQTL 4.95e-02 -0.221 0.112 0.149 B_Memory L2
ENSG00000116525 TRIM62 768061 sc-eQTL 1.44e-01 0.188 0.128 0.149 B_Memory L2
ENSG00000116544 DLGAP3 -979530 sc-eQTL 6.76e-01 -0.0483 0.116 0.149 B_Memory L2
ENSG00000134686 PHC2 519068 sc-eQTL 1.04e-01 0.18 0.111 0.149 B_Memory L2
ENSG00000160094 ZNF362 693628 sc-eQTL 6.10e-01 0.0618 0.121 0.149 B_Memory L2
ENSG00000163866 SMIM12 -909635 sc-eQTL 8.65e-01 0.021 0.123 0.149 B_Memory L2
ENSG00000004455 AK2 869124 sc-eQTL 9.30e-01 -0.00732 0.0832 0.15 B_Naive1 L2
ENSG00000116514 RNF19B 985435 sc-eQTL 1.42e-01 -0.138 0.0934 0.15 B_Naive1 L2
ENSG00000116525 TRIM62 768061 sc-eQTL 7.83e-01 -0.0323 0.117 0.15 B_Naive1 L2
ENSG00000116544 DLGAP3 -979530 sc-eQTL 6.86e-01 0.0481 0.119 0.15 B_Naive1 L2
ENSG00000134686 PHC2 519068 sc-eQTL 6.28e-01 -0.0483 0.0993 0.15 B_Naive1 L2
ENSG00000160094 ZNF362 693628 sc-eQTL 2.84e-01 -0.124 0.116 0.15 B_Naive1 L2
ENSG00000163866 SMIM12 -909635 sc-eQTL 4.41e-01 -0.0893 0.116 0.15 B_Naive1 L2
ENSG00000004455 AK2 869124 sc-eQTL 3.91e-01 -0.0977 0.114 0.15 B_Naive2 L2
ENSG00000116514 RNF19B 985435 sc-eQTL 6.77e-02 0.225 0.122 0.15 B_Naive2 L2
ENSG00000116525 TRIM62 768061 sc-eQTL 6.83e-01 0.052 0.127 0.15 B_Naive2 L2
ENSG00000116544 DLGAP3 -979530 sc-eQTL 7.36e-01 -0.0454 0.134 0.15 B_Naive2 L2
ENSG00000134686 PHC2 519068 sc-eQTL 6.11e-01 -0.0566 0.111 0.15 B_Naive2 L2
ENSG00000160094 ZNF362 693628 sc-eQTL 9.64e-01 -0.00541 0.121 0.15 B_Naive2 L2
ENSG00000163866 SMIM12 -909635 sc-eQTL 6.60e-01 -0.0578 0.131 0.15 B_Naive2 L2
ENSG00000004455 AK2 869124 sc-eQTL 8.52e-01 -0.0228 0.122 0.15 CD4_CTL L2
ENSG00000116514 RNF19B 985435 sc-eQTL 1.21e-01 0.183 0.118 0.15 CD4_CTL L2
ENSG00000116525 TRIM62 768061 sc-eQTL 8.39e-01 -0.0244 0.12 0.15 CD4_CTL L2
ENSG00000116544 DLGAP3 -979530 sc-eQTL 2.43e-01 0.138 0.118 0.15 CD4_CTL L2
ENSG00000134686 PHC2 519068 sc-eQTL 4.66e-01 -0.0827 0.113 0.15 CD4_CTL L2
ENSG00000142920 AZIN2 869016 sc-eQTL 9.39e-01 0.00886 0.116 0.15 CD4_CTL L2
ENSG00000160094 ZNF362 693628 sc-eQTL 9.14e-01 -0.013 0.12 0.15 CD4_CTL L2
ENSG00000163866 SMIM12 -909635 sc-eQTL 7.48e-04 0.403 0.118 0.15 CD4_CTL L2
ENSG00000004455 AK2 869124 sc-eQTL 1.74e-01 0.0949 0.0696 0.15 CD4_Naive L2
ENSG00000116514 RNF19B 985435 sc-eQTL 5.13e-01 -0.0474 0.0724 0.15 CD4_Naive L2
ENSG00000116525 TRIM62 768061 sc-eQTL 6.32e-01 -0.0453 0.0944 0.15 CD4_Naive L2
ENSG00000116544 DLGAP3 -979530 sc-eQTL 3.67e-01 -0.104 0.115 0.15 CD4_Naive L2
ENSG00000134686 PHC2 519068 sc-eQTL 3.84e-01 -0.0728 0.0835 0.15 CD4_Naive L2
ENSG00000142920 AZIN2 869016 sc-eQTL 9.81e-02 -0.189 0.114 0.15 CD4_Naive L2
ENSG00000160094 ZNF362 693628 sc-eQTL 9.00e-01 -0.0112 0.0891 0.15 CD4_Naive L2
ENSG00000163866 SMIM12 -909635 sc-eQTL 8.39e-01 0.0167 0.0821 0.15 CD4_Naive L2
ENSG00000004455 AK2 869124 sc-eQTL 5.25e-01 -0.0528 0.0829 0.15 CD4_TCM L2
ENSG00000116514 RNF19B 985435 sc-eQTL 9.38e-01 -0.00647 0.083 0.15 CD4_TCM L2
ENSG00000116525 TRIM62 768061 sc-eQTL 4.54e-02 0.194 0.0966 0.15 CD4_TCM L2
ENSG00000116544 DLGAP3 -979530 sc-eQTL 6.56e-01 -0.045 0.101 0.15 CD4_TCM L2
ENSG00000134686 PHC2 519068 sc-eQTL 5.68e-01 -0.0532 0.0931 0.15 CD4_TCM L2
ENSG00000142920 AZIN2 869016 sc-eQTL 6.20e-01 0.0584 0.118 0.15 CD4_TCM L2
ENSG00000160094 ZNF362 693628 sc-eQTL 5.34e-01 0.0616 0.099 0.15 CD4_TCM L2
ENSG00000163866 SMIM12 -909635 sc-eQTL 8.59e-01 -0.0188 0.106 0.15 CD4_TCM L2
ENSG00000004455 AK2 869124 sc-eQTL 4.86e-01 -0.0712 0.102 0.15 CD4_TEM L2
ENSG00000116514 RNF19B 985435 sc-eQTL 6.21e-01 0.0487 0.0982 0.15 CD4_TEM L2
ENSG00000116525 TRIM62 768061 sc-eQTL 5.47e-01 0.0718 0.119 0.15 CD4_TEM L2
ENSG00000116544 DLGAP3 -979530 sc-eQTL 3.48e-01 -0.117 0.124 0.15 CD4_TEM L2
ENSG00000134686 PHC2 519068 sc-eQTL 5.12e-02 -0.215 0.11 0.15 CD4_TEM L2
ENSG00000142920 AZIN2 869016 sc-eQTL 5.44e-01 -0.0767 0.126 0.15 CD4_TEM L2
ENSG00000160094 ZNF362 693628 sc-eQTL 5.24e-01 0.0774 0.121 0.15 CD4_TEM L2
ENSG00000163866 SMIM12 -909635 sc-eQTL 1.62e-01 -0.163 0.116 0.15 CD4_TEM L2
ENSG00000004455 AK2 869124 sc-eQTL 1.70e-01 0.137 0.0997 0.15 CD8_CTL L2
ENSG00000116514 RNF19B 985435 sc-eQTL 2.13e-01 -0.117 0.0937 0.15 CD8_CTL L2
ENSG00000116525 TRIM62 768061 sc-eQTL 9.52e-01 -0.0067 0.112 0.15 CD8_CTL L2
ENSG00000116544 DLGAP3 -979530 sc-eQTL 1.06e-01 -0.195 0.12 0.15 CD8_CTL L2
ENSG00000134686 PHC2 519068 sc-eQTL 8.44e-02 -0.172 0.0995 0.15 CD8_CTL L2
ENSG00000142920 AZIN2 869016 sc-eQTL 3.22e-02 -0.258 0.119 0.15 CD8_CTL L2
ENSG00000160094 ZNF362 693628 sc-eQTL 9.53e-01 0.00625 0.106 0.15 CD8_CTL L2
ENSG00000163866 SMIM12 -909635 sc-eQTL 7.24e-01 -0.0415 0.117 0.15 CD8_CTL L2
ENSG00000004455 AK2 869124 sc-eQTL 5.65e-01 -0.0519 0.0902 0.15 CD8_Naive L2
ENSG00000116514 RNF19B 985435 sc-eQTL 6.18e-01 -0.0494 0.099 0.15 CD8_Naive L2
ENSG00000116525 TRIM62 768061 sc-eQTL 3.34e-01 -0.117 0.12 0.15 CD8_Naive L2
ENSG00000116544 DLGAP3 -979530 sc-eQTL 3.77e-01 0.111 0.125 0.15 CD8_Naive L2
ENSG00000134686 PHC2 519068 sc-eQTL 5.92e-01 -0.0556 0.104 0.15 CD8_Naive L2
ENSG00000142920 AZIN2 869016 sc-eQTL 6.30e-01 -0.0577 0.12 0.15 CD8_Naive L2
ENSG00000160094 ZNF362 693628 sc-eQTL 8.35e-01 -0.0228 0.109 0.15 CD8_Naive L2
ENSG00000163866 SMIM12 -909635 sc-eQTL 9.14e-01 0.0113 0.104 0.15 CD8_Naive L2
ENSG00000004455 AK2 869124 sc-eQTL 1.12e-01 0.194 0.122 0.148 CD8_TCM L2
ENSG00000116514 RNF19B 985435 sc-eQTL 8.15e-02 0.205 0.117 0.148 CD8_TCM L2
ENSG00000116525 TRIM62 768061 sc-eQTL 5.70e-01 0.0764 0.134 0.148 CD8_TCM L2
ENSG00000116544 DLGAP3 -979530 sc-eQTL 5.63e-01 -0.074 0.128 0.148 CD8_TCM L2
ENSG00000134686 PHC2 519068 sc-eQTL 6.74e-01 0.0441 0.105 0.148 CD8_TCM L2
ENSG00000142920 AZIN2 869016 sc-eQTL 8.79e-01 -0.0193 0.127 0.148 CD8_TCM L2
ENSG00000160094 ZNF362 693628 sc-eQTL 3.86e-01 0.109 0.125 0.148 CD8_TCM L2
ENSG00000163866 SMIM12 -909635 sc-eQTL 2.22e-01 0.152 0.124 0.148 CD8_TCM L2
ENSG00000004455 AK2 869124 sc-eQTL 9.00e-01 0.016 0.128 0.153 CD8_TEM L2
ENSG00000116514 RNF19B 985435 sc-eQTL 7.36e-01 -0.043 0.127 0.153 CD8_TEM L2
ENSG00000116525 TRIM62 768061 sc-eQTL 9.95e-01 0.000812 0.132 0.153 CD8_TEM L2
ENSG00000116544 DLGAP3 -979530 sc-eQTL 7.20e-01 -0.0419 0.116 0.153 CD8_TEM L2
ENSG00000134686 PHC2 519068 sc-eQTL 5.88e-01 -0.0672 0.124 0.153 CD8_TEM L2
ENSG00000142920 AZIN2 869016 sc-eQTL 5.86e-01 0.0606 0.111 0.153 CD8_TEM L2
ENSG00000160094 ZNF362 693628 sc-eQTL 3.83e-01 -0.11 0.125 0.153 CD8_TEM L2
ENSG00000163866 SMIM12 -909635 sc-eQTL 7.50e-01 -0.0412 0.129 0.153 CD8_TEM L2
ENSG00000004455 AK2 869124 sc-eQTL 5.14e-01 0.0708 0.108 0.149 MAIT L2
ENSG00000116514 RNF19B 985435 sc-eQTL 2.59e-01 0.114 0.101 0.149 MAIT L2
ENSG00000116525 TRIM62 768061 sc-eQTL 2.22e-01 -0.153 0.125 0.149 MAIT L2
ENSG00000116544 DLGAP3 -979530 sc-eQTL 8.04e-01 0.0295 0.118 0.149 MAIT L2
ENSG00000134686 PHC2 519068 sc-eQTL 8.21e-01 0.0236 0.104 0.149 MAIT L2
ENSG00000142920 AZIN2 869016 sc-eQTL 3.31e-01 -0.117 0.12 0.149 MAIT L2
ENSG00000160094 ZNF362 693628 sc-eQTL 6.41e-01 0.0543 0.116 0.149 MAIT L2
ENSG00000163866 SMIM12 -909635 sc-eQTL 8.60e-01 -0.021 0.119 0.149 MAIT L2
ENSG00000004455 AK2 869124 sc-eQTL 8.11e-01 0.0298 0.124 0.149 NK_CD56bright L2
ENSG00000116514 RNF19B 985435 sc-eQTL 7.32e-01 0.0398 0.116 0.149 NK_CD56bright L2
ENSG00000116525 TRIM62 768061 sc-eQTL 8.50e-03 0.325 0.122 0.149 NK_CD56bright L2
ENSG00000116544 DLGAP3 -979530 sc-eQTL 1.36e-01 0.18 0.12 0.149 NK_CD56bright L2
ENSG00000134686 PHC2 519068 sc-eQTL 1.10e-02 0.283 0.11 0.149 NK_CD56bright L2
ENSG00000160094 ZNF362 693628 sc-eQTL 5.95e-01 0.068 0.128 0.149 NK_CD56bright L2
ENSG00000163866 SMIM12 -909635 sc-eQTL 5.14e-01 -0.0868 0.133 0.149 NK_CD56bright L2
ENSG00000004455 AK2 869124 sc-eQTL 9.09e-02 0.175 0.103 0.151 NK_CD56dim L2
ENSG00000116514 RNF19B 985435 sc-eQTL 8.23e-01 -0.0209 0.0935 0.151 NK_CD56dim L2
ENSG00000116525 TRIM62 768061 sc-eQTL 3.01e-01 0.112 0.109 0.151 NK_CD56dim L2
ENSG00000116544 DLGAP3 -979530 sc-eQTL 7.57e-01 0.0361 0.117 0.151 NK_CD56dim L2
ENSG00000134686 PHC2 519068 sc-eQTL 8.11e-02 -0.175 0.0998 0.151 NK_CD56dim L2
ENSG00000160094 ZNF362 693628 sc-eQTL 6.37e-03 0.309 0.112 0.151 NK_CD56dim L2
ENSG00000163866 SMIM12 -909635 sc-eQTL 8.46e-01 -0.0218 0.112 0.151 NK_CD56dim L2
ENSG00000004455 AK2 869124 sc-eQTL 5.51e-01 -0.075 0.126 0.155 NK_HLA L2
ENSG00000116514 RNF19B 985435 sc-eQTL 5.65e-01 -0.0694 0.12 0.155 NK_HLA L2
ENSG00000116525 TRIM62 768061 sc-eQTL 1.70e-01 0.174 0.127 0.155 NK_HLA L2
ENSG00000116544 DLGAP3 -979530 sc-eQTL 2.79e-01 0.127 0.117 0.155 NK_HLA L2
ENSG00000134686 PHC2 519068 sc-eQTL 9.19e-03 -0.287 0.109 0.155 NK_HLA L2
ENSG00000160094 ZNF362 693628 sc-eQTL 5.25e-01 0.0807 0.127 0.155 NK_HLA L2
ENSG00000163866 SMIM12 -909635 sc-eQTL 2.29e-01 0.15 0.124 0.155 NK_HLA L2
ENSG00000004455 AK2 869124 sc-eQTL 4.35e-01 -0.0865 0.111 0.151 NK_cytokine L2
ENSG00000116514 RNF19B 985435 sc-eQTL 8.32e-01 -0.0215 0.101 0.151 NK_cytokine L2
ENSG00000116525 TRIM62 768061 sc-eQTL 1.32e-01 0.184 0.122 0.151 NK_cytokine L2
ENSG00000116544 DLGAP3 -979530 sc-eQTL 6.26e-01 -0.0597 0.122 0.151 NK_cytokine L2
ENSG00000134686 PHC2 519068 sc-eQTL 8.58e-02 -0.179 0.104 0.151 NK_cytokine L2
ENSG00000160094 ZNF362 693628 sc-eQTL 1.95e-01 0.149 0.114 0.151 NK_cytokine L2
ENSG00000163866 SMIM12 -909635 sc-eQTL 8.64e-01 0.019 0.111 0.151 NK_cytokine L2
ENSG00000004455 AK2 869124 sc-eQTL 8.30e-01 -0.032 0.149 0.159 PB L2
ENSG00000116514 RNF19B 985435 sc-eQTL 3.54e-01 0.156 0.168 0.159 PB L2
ENSG00000116525 TRIM62 768061 sc-eQTL 6.16e-02 0.308 0.163 0.159 PB L2
ENSG00000116544 DLGAP3 -979530 sc-eQTL 2.58e-01 0.194 0.171 0.159 PB L2
ENSG00000134686 PHC2 519068 sc-eQTL 6.28e-01 -0.0806 0.166 0.159 PB L2
ENSG00000160094 ZNF362 693628 sc-eQTL 4.88e-02 -0.337 0.169 0.159 PB L2
ENSG00000163866 SMIM12 -909635 sc-eQTL 2.67e-01 0.174 0.156 0.159 PB L2
ENSG00000004455 AK2 869124 sc-eQTL 2.66e-01 -0.1 0.0899 0.148 Pro_T L2
ENSG00000116514 RNF19B 985435 sc-eQTL 9.60e-01 -0.0061 0.121 0.148 Pro_T L2
ENSG00000116525 TRIM62 768061 sc-eQTL 4.76e-01 -0.0853 0.12 0.148 Pro_T L2
ENSG00000116544 DLGAP3 -979530 sc-eQTL 8.03e-02 0.199 0.113 0.148 Pro_T L2
ENSG00000134686 PHC2 519068 sc-eQTL 1.45e-02 -0.246 0.0997 0.148 Pro_T L2
ENSG00000142920 AZIN2 869016 sc-eQTL 9.98e-01 -0.000272 0.101 0.148 Pro_T L2
ENSG00000160094 ZNF362 693628 sc-eQTL 2.54e-01 -0.137 0.119 0.148 Pro_T L2
ENSG00000163866 SMIM12 -909635 sc-eQTL 8.89e-01 -0.0174 0.124 0.148 Pro_T L2
ENSG00000004455 AK2 869124 sc-eQTL 1.65e-01 0.159 0.114 0.15 Treg L2
ENSG00000116514 RNF19B 985435 sc-eQTL 7.91e-01 0.0269 0.101 0.15 Treg L2
ENSG00000116525 TRIM62 768061 sc-eQTL 5.54e-01 0.0722 0.122 0.15 Treg L2
ENSG00000116544 DLGAP3 -979530 sc-eQTL 8.53e-01 -0.0231 0.124 0.15 Treg L2
ENSG00000134686 PHC2 519068 sc-eQTL 7.23e-02 -0.197 0.109 0.15 Treg L2
ENSG00000142920 AZIN2 869016 sc-eQTL 2.35e-01 -0.127 0.107 0.15 Treg L2
ENSG00000160094 ZNF362 693628 sc-eQTL 1.10e-01 0.186 0.116 0.15 Treg L2
ENSG00000163866 SMIM12 -909635 sc-eQTL 1.38e-01 -0.178 0.12 0.15 Treg L2
ENSG00000004455 AK2 869124 sc-eQTL 3.89e-01 0.112 0.129 0.137 cDC L2
ENSG00000116514 RNF19B 985435 sc-eQTL 6.75e-02 0.216 0.117 0.137 cDC L2
ENSG00000116525 TRIM62 768061 sc-eQTL 7.79e-01 -0.0377 0.134 0.137 cDC L2
ENSG00000116544 DLGAP3 -979530 sc-eQTL 9.14e-01 -0.0143 0.133 0.137 cDC L2
ENSG00000134686 PHC2 519068 sc-eQTL 1.21e-01 -0.143 0.0917 0.137 cDC L2
ENSG00000142920 AZIN2 869016 sc-eQTL 7.43e-01 0.0239 0.0727 0.137 cDC L2
ENSG00000160094 ZNF362 693628 sc-eQTL 8.06e-01 -0.0312 0.127 0.137 cDC L2
ENSG00000163866 SMIM12 -909635 sc-eQTL 8.68e-01 -0.0211 0.126 0.137 cDC L2
ENSG00000004455 AK2 869124 sc-eQTL 5.35e-01 -0.0647 0.104 0.15 cMono_IL1B L2
ENSG00000116514 RNF19B 985435 sc-eQTL 2.18e-01 0.0896 0.0725 0.15 cMono_IL1B L2
ENSG00000116525 TRIM62 768061 sc-eQTL 1.30e-01 0.181 0.119 0.15 cMono_IL1B L2
ENSG00000116544 DLGAP3 -979530 sc-eQTL 7.16e-01 0.0448 0.123 0.15 cMono_IL1B L2
ENSG00000134686 PHC2 519068 sc-eQTL 7.06e-01 0.0235 0.0622 0.15 cMono_IL1B L2
ENSG00000160094 ZNF362 693628 sc-eQTL 7.05e-01 -0.0415 0.11 0.15 cMono_IL1B L2
ENSG00000163866 SMIM12 -909635 sc-eQTL 3.76e-01 -0.0841 0.0949 0.15 cMono_IL1B L2
ENSG00000004455 AK2 869124 sc-eQTL 2.88e-01 -0.113 0.106 0.15 cMono_S100A L2
ENSG00000116514 RNF19B 985435 sc-eQTL 5.10e-01 0.0563 0.0853 0.15 cMono_S100A L2
ENSG00000116525 TRIM62 768061 sc-eQTL 5.39e-01 0.0778 0.126 0.15 cMono_S100A L2
ENSG00000116544 DLGAP3 -979530 sc-eQTL 1.42e-01 -0.18 0.122 0.15 cMono_S100A L2
ENSG00000134686 PHC2 519068 sc-eQTL 7.51e-01 -0.0207 0.0651 0.15 cMono_S100A L2
ENSG00000160094 ZNF362 693628 sc-eQTL 4.91e-01 -0.0803 0.116 0.15 cMono_S100A L2
ENSG00000163866 SMIM12 -909635 sc-eQTL 1.45e-01 -0.158 0.108 0.15 cMono_S100A L2
ENSG00000004455 AK2 869124 sc-eQTL 9.80e-01 -0.00356 0.139 0.148 gdT L2
ENSG00000116514 RNF19B 985435 sc-eQTL 6.87e-01 -0.0514 0.127 0.148 gdT L2
ENSG00000116525 TRIM62 768061 sc-eQTL 4.59e-02 0.297 0.147 0.148 gdT L2
ENSG00000116544 DLGAP3 -979530 sc-eQTL 5.88e-01 0.0775 0.143 0.148 gdT L2
ENSG00000134686 PHC2 519068 sc-eQTL 4.13e-01 0.102 0.125 0.148 gdT L2
ENSG00000142920 AZIN2 869016 sc-eQTL 6.76e-01 -0.0536 0.128 0.148 gdT L2
ENSG00000160094 ZNF362 693628 sc-eQTL 5.41e-01 -0.0887 0.145 0.148 gdT L2
ENSG00000163866 SMIM12 -909635 sc-eQTL 4.57e-01 0.111 0.149 0.148 gdT L2
ENSG00000004455 AK2 869124 sc-eQTL 7.32e-01 0.0412 0.12 0.147 intMono L2
ENSG00000116514 RNF19B 985435 sc-eQTL 5.55e-01 0.0605 0.102 0.147 intMono L2
ENSG00000116525 TRIM62 768061 sc-eQTL 8.14e-01 -0.0292 0.124 0.147 intMono L2
ENSG00000116544 DLGAP3 -979530 sc-eQTL 9.11e-01 -0.0133 0.119 0.147 intMono L2
ENSG00000134686 PHC2 519068 sc-eQTL 6.78e-01 0.0296 0.0712 0.147 intMono L2
ENSG00000160094 ZNF362 693628 sc-eQTL 8.93e-01 0.0171 0.127 0.147 intMono L2
ENSG00000163866 SMIM12 -909635 sc-eQTL 4.63e-01 0.0895 0.122 0.147 intMono L2
ENSG00000004455 AK2 869124 sc-eQTL 6.12e-03 0.324 0.117 0.143 ncMono L2
ENSG00000116514 RNF19B 985435 sc-eQTL 9.95e-01 0.000691 0.111 0.143 ncMono L2
ENSG00000116525 TRIM62 768061 sc-eQTL 1.88e-01 0.145 0.11 0.143 ncMono L2
ENSG00000116544 DLGAP3 -979530 sc-eQTL 4.40e-01 -0.083 0.107 0.143 ncMono L2
ENSG00000134686 PHC2 519068 sc-eQTL 8.89e-01 0.0118 0.0844 0.143 ncMono L2
ENSG00000160094 ZNF362 693628 sc-eQTL 9.85e-03 0.333 0.128 0.143 ncMono L2
ENSG00000163866 SMIM12 -909635 sc-eQTL 2.18e-01 -0.144 0.117 0.143 ncMono L2
ENSG00000004455 AK2 869124 sc-eQTL 9.81e-01 0.00319 0.137 0.147 pDC L2
ENSG00000116514 RNF19B 985435 sc-eQTL 9.09e-01 0.0157 0.138 0.147 pDC L2
ENSG00000116525 TRIM62 768061 sc-eQTL 8.45e-02 -0.234 0.135 0.147 pDC L2
ENSG00000116544 DLGAP3 -979530 sc-eQTL 5.27e-01 0.085 0.134 0.147 pDC L2
ENSG00000134686 PHC2 519068 sc-eQTL 7.21e-01 0.0397 0.111 0.147 pDC L2
ENSG00000142920 AZIN2 869016 sc-eQTL 9.25e-01 -0.00903 0.0958 0.147 pDC L2
ENSG00000160094 ZNF362 693628 sc-eQTL 4.07e-01 0.0991 0.119 0.147 pDC L2
ENSG00000163866 SMIM12 -909635 sc-eQTL 3.73e-01 -0.125 0.14 0.147 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000004455 AK2 869124 sc-eQTL 4.71e-01 -0.0721 0.0999 0.15 B_Memory LOneK1K
ENSG00000116514 RNF19B 985435 sc-eQTL 4.56e-01 -0.0781 0.105 0.15 B_Memory LOneK1K
ENSG00000116525 TRIM62 768061 sc-eQTL 9.71e-01 0.00417 0.113 0.15 B_Memory LOneK1K
ENSG00000116544 DLGAP3 -979530 sc-eQTL 2.64e-01 -0.137 0.122 0.15 B_Memory LOneK1K
ENSG00000134686 PHC2 519068 sc-eQTL 9.23e-02 0.172 0.102 0.15 B_Memory LOneK1K
ENSG00000160094 ZNF362 693628 sc-eQTL 8.42e-01 -0.0232 0.116 0.15 B_Memory LOneK1K
ENSG00000163866 SMIM12 -909635 sc-eQTL 8.56e-01 -0.0217 0.12 0.15 B_Memory LOneK1K
ENSG00000004455 AK2 869124 sc-eQTL 4.05e-01 -0.0687 0.0824 0.15 B_Naive LOneK1K
ENSG00000116514 RNF19B 985435 sc-eQTL 8.33e-01 -0.02 0.0946 0.15 B_Naive LOneK1K
ENSG00000116525 TRIM62 768061 sc-eQTL 9.59e-01 -0.00591 0.114 0.15 B_Naive LOneK1K
ENSG00000116544 DLGAP3 -979530 sc-eQTL 9.72e-01 -0.00431 0.125 0.15 B_Naive LOneK1K
ENSG00000134686 PHC2 519068 sc-eQTL 3.60e-01 -0.0919 0.1 0.15 B_Naive LOneK1K
ENSG00000160094 ZNF362 693628 sc-eQTL 6.37e-01 -0.0519 0.11 0.15 B_Naive LOneK1K
ENSG00000163866 SMIM12 -909635 sc-eQTL 4.46e-01 -0.0881 0.115 0.15 B_Naive LOneK1K
ENSG00000004455 AK2 869124 sc-eQTL 3.51e-01 -0.0891 0.0953 0.15 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000116514 RNF19B 985435 sc-eQTL 3.49e-01 0.061 0.0651 0.15 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000116525 TRIM62 768061 sc-eQTL 7.98e-02 0.206 0.117 0.15 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000116544 DLGAP3 -979530 sc-eQTL 3.04e-01 -0.124 0.12 0.15 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000134686 PHC2 519068 sc-eQTL 9.27e-01 0.00553 0.0604 0.15 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000160094 ZNF362 693628 sc-eQTL 6.69e-01 -0.0439 0.103 0.15 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000163866 SMIM12 -909635 sc-eQTL 1.18e-01 -0.136 0.0865 0.15 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000004455 AK2 869124 sc-eQTL 3.51e-02 0.233 0.11 0.149 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000116514 RNF19B 985435 sc-eQTL 9.51e-01 0.00598 0.0977 0.149 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000116525 TRIM62 768061 sc-eQTL 9.37e-01 0.00894 0.113 0.149 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000116544 DLGAP3 -979530 sc-eQTL 7.31e-01 -0.0337 0.0978 0.149 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000134686 PHC2 519068 sc-eQTL 8.23e-01 -0.016 0.0711 0.149 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000160094 ZNF362 693628 sc-eQTL 1.05e-02 0.293 0.113 0.149 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000163866 SMIM12 -909635 sc-eQTL 7.57e-01 -0.0333 0.107 0.149 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000004455 AK2 869124 sc-eQTL 7.11e-01 0.0339 0.0914 0.151 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000116514 RNF19B 985435 sc-eQTL 6.96e-01 -0.0355 0.0909 0.151 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000116525 TRIM62 768061 sc-eQTL 7.05e-02 0.182 0.1 0.151 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000116544 DLGAP3 -979530 sc-eQTL 6.95e-01 0.0469 0.12 0.151 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000134686 PHC2 519068 sc-eQTL 1.33e-02 -0.229 0.0918 0.151 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000160094 ZNF362 693628 sc-eQTL 1.55e-02 0.258 0.106 0.151 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000163866 SMIM12 -909635 sc-eQTL 6.24e-01 0.0518 0.106 0.151 NK_CD56dim LOneK1K

Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF
ENSG00000116544 DLGAP3 -979530 eQTL 0.0175 0.0726 0.0305 0.00129 0.0 0.172

Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina
ENSG00000116544 DLGAP3 -979530 2.67e-07 1.3e-07 3.31e-08 1.82e-07 9.21e-08 9.91e-08 1.99e-07 5.49e-08 1.44e-07 4.4e-08 1.69e-07 8.14e-08 1.79e-07 6.76e-08 5.98e-08 7.3e-08 3.88e-08 1.27e-07 5.19e-08 4.03e-08 1.04e-07 1.25e-07 1.32e-07 4.99e-08 1.5e-07 1.19e-07 1.06e-07 9.65e-08 1.08e-07 1.03e-07 9.7e-08 3.68e-08 2.74e-08 8.68e-08 8.94e-08 3.9e-08 4.99e-08 9.26e-08 8.3e-08 3.98e-08 3.61e-08 1.43e-06 4.89e-08 1.57e-08 1.09e-07 1.99e-08 1.37e-07 4.7e-09 4.61e-08
ENSG00000121903 \N 477475 1.28e-06 8.78e-07 7.87e-08 3.96e-07 1.07e-07 3.69e-07 1.59e-06 6.12e-08 6.27e-07 2.12e-07 1.87e-06 3.62e-07 1.73e-06 1.84e-07 5.36e-07 4.14e-07 4.29e-07 5.05e-07 1.62e-07 7.84e-08 1.91e-07 1.17e-06 4.66e-07 3.22e-08 1.59e-06 2.36e-07 3.26e-07 4.71e-07 6.19e-07 9.25e-07 4.47e-07 5.38e-08 4.86e-08 1.23e-07 2.85e-07 5.14e-08 4.43e-08 8.17e-08 5.78e-08 5.32e-08 4.89e-08 1.25e-05 5.89e-08 7.37e-09 4.92e-08 1.61e-08 1.2e-07 3.83e-09 4.79e-08