logo

Genes within 1Mb (chr1:33931342:T:A):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD

Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000004455 AK2 850346 sc-eQTL 5.64e-01 -0.0554 0.0959 0.075 B L1
ENSG00000116514 RNF19B 966657 sc-eQTL 6.38e-01 -0.0554 0.118 0.075 B L1
ENSG00000116525 TRIM62 749283 sc-eQTL 9.86e-01 0.00234 0.136 0.075 B L1
ENSG00000116544 DLGAP3 -998308 sc-eQTL 6.82e-01 0.0632 0.154 0.075 B L1
ENSG00000134686 PHC2 500290 sc-eQTL 6.64e-01 -0.0537 0.123 0.075 B L1
ENSG00000160094 ZNF362 674850 sc-eQTL 2.37e-01 -0.156 0.132 0.075 B L1
ENSG00000163866 SMIM12 -928413 sc-eQTL 4.65e-02 0.259 0.129 0.075 B L1
ENSG00000004455 AK2 850346 sc-eQTL 4.33e-01 -0.0595 0.0758 0.075 CD4T L1
ENSG00000116514 RNF19B 966657 sc-eQTL 5.08e-01 -0.0551 0.0831 0.075 CD4T L1
ENSG00000116525 TRIM62 749283 sc-eQTL 5.37e-01 0.0656 0.106 0.075 CD4T L1
ENSG00000116544 DLGAP3 -998308 sc-eQTL 7.83e-01 0.0354 0.129 0.075 CD4T L1
ENSG00000134686 PHC2 500290 sc-eQTL 9.99e-01 -0.00014 0.103 0.075 CD4T L1
ENSG00000142920 AZIN2 850238 sc-eQTL 2.64e-02 0.31 0.139 0.075 CD4T L1
ENSG00000160094 ZNF362 674850 sc-eQTL 2.72e-01 0.122 0.111 0.075 CD4T L1
ENSG00000163866 SMIM12 -928413 sc-eQTL 9.51e-01 0.0066 0.108 0.075 CD4T L1
ENSG00000004455 AK2 850346 sc-eQTL 2.29e-01 -0.116 0.0966 0.075 CD8T L1
ENSG00000116514 RNF19B 966657 sc-eQTL 4.87e-01 0.0625 0.0897 0.075 CD8T L1
ENSG00000116525 TRIM62 749283 sc-eQTL 9.98e-01 -0.00037 0.138 0.075 CD8T L1
ENSG00000116544 DLGAP3 -998308 sc-eQTL 3.33e-01 0.146 0.15 0.075 CD8T L1
ENSG00000134686 PHC2 500290 sc-eQTL 8.71e-01 0.0193 0.118 0.075 CD8T L1
ENSG00000142920 AZIN2 850238 sc-eQTL 7.65e-01 -0.0403 0.135 0.075 CD8T L1
ENSG00000160094 ZNF362 674850 sc-eQTL 5.70e-01 0.0652 0.115 0.075 CD8T L1
ENSG00000163866 SMIM12 -928413 sc-eQTL 7.10e-01 -0.0466 0.125 0.075 CD8T L1
ENSG00000004455 AK2 850346 sc-eQTL 5.93e-01 0.0795 0.148 0.077 DC L1
ENSG00000116514 RNF19B 966657 sc-eQTL 4.05e-02 0.306 0.148 0.077 DC L1
ENSG00000116525 TRIM62 749283 sc-eQTL 1.29e-01 -0.244 0.16 0.077 DC L1
ENSG00000116544 DLGAP3 -998308 sc-eQTL 1.38e-01 -0.22 0.148 0.077 DC L1
ENSG00000134686 PHC2 500290 sc-eQTL 4.31e-01 -0.0849 0.108 0.077 DC L1
ENSG00000142920 AZIN2 850238 sc-eQTL 6.10e-01 -0.0444 0.0869 0.077 DC L1
ENSG00000160094 ZNF362 674850 sc-eQTL 3.93e-01 0.12 0.14 0.077 DC L1
ENSG00000163866 SMIM12 -928413 sc-eQTL 5.02e-01 0.0987 0.147 0.077 DC L1
ENSG00000004455 AK2 850346 sc-eQTL 4.51e-01 0.0916 0.121 0.075 Mono L1
ENSG00000116514 RNF19B 966657 sc-eQTL 2.95e-01 -0.0924 0.0881 0.075 Mono L1
ENSG00000116525 TRIM62 749283 sc-eQTL 4.71e-01 0.107 0.148 0.075 Mono L1
ENSG00000116544 DLGAP3 -998308 sc-eQTL 6.27e-01 -0.0727 0.15 0.075 Mono L1
ENSG00000134686 PHC2 500290 sc-eQTL 5.64e-01 0.046 0.0795 0.075 Mono L1
ENSG00000160094 ZNF362 674850 sc-eQTL 2.06e-01 -0.166 0.131 0.075 Mono L1
ENSG00000163866 SMIM12 -928413 sc-eQTL 3.79e-01 0.0998 0.113 0.075 Mono L1
ENSG00000004455 AK2 850346 sc-eQTL 9.35e-01 -0.00935 0.115 0.073 NK L1
ENSG00000116514 RNF19B 966657 sc-eQTL 9.98e-01 0.000311 0.115 0.073 NK L1
ENSG00000116525 TRIM62 749283 sc-eQTL 3.09e-02 -0.279 0.129 0.073 NK L1
ENSG00000116544 DLGAP3 -998308 sc-eQTL 6.70e-01 0.0675 0.158 0.073 NK L1
ENSG00000134686 PHC2 500290 sc-eQTL 6.88e-01 0.0486 0.121 0.073 NK L1
ENSG00000160094 ZNF362 674850 sc-eQTL 2.28e-01 0.164 0.136 0.073 NK L1
ENSG00000163866 SMIM12 -928413 sc-eQTL 8.08e-02 0.24 0.137 0.073 NK L1
ENSG00000004455 AK2 850346 sc-eQTL 1.82e-01 0.114 0.0855 0.075 Other_T L1
ENSG00000116514 RNF19B 966657 sc-eQTL 7.77e-01 0.0325 0.115 0.075 Other_T L1
ENSG00000116525 TRIM62 749283 sc-eQTL 9.16e-01 0.0158 0.15 0.075 Other_T L1
ENSG00000116544 DLGAP3 -998308 sc-eQTL 3.78e-01 -0.141 0.16 0.075 Other_T L1
ENSG00000134686 PHC2 500290 sc-eQTL 9.53e-01 0.00742 0.125 0.075 Other_T L1
ENSG00000142920 AZIN2 850238 sc-eQTL 4.82e-01 0.109 0.155 0.075 Other_T L1
ENSG00000160094 ZNF362 674850 sc-eQTL 4.72e-01 -0.095 0.132 0.075 Other_T L1
ENSG00000163866 SMIM12 -928413 sc-eQTL 9.93e-01 -0.00124 0.136 0.075 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000004455 AK2 850346 sc-eQTL 8.89e-01 -0.0259 0.186 0.071 B_Activated L2
ENSG00000116514 RNF19B 966657 sc-eQTL 7.14e-01 -0.0648 0.176 0.071 B_Activated L2
ENSG00000116525 TRIM62 749283 sc-eQTL 4.42e-01 0.132 0.171 0.071 B_Activated L2
ENSG00000116544 DLGAP3 -998308 sc-eQTL 1.91e-01 0.187 0.143 0.071 B_Activated L2
ENSG00000134686 PHC2 500290 sc-eQTL 8.02e-01 0.043 0.171 0.071 B_Activated L2
ENSG00000160094 ZNF362 674850 sc-eQTL 8.77e-02 0.307 0.179 0.071 B_Activated L2
ENSG00000163866 SMIM12 -928413 sc-eQTL 4.09e-01 0.154 0.187 0.071 B_Activated L2
ENSG00000004455 AK2 850346 sc-eQTL 1.21e-01 -0.206 0.132 0.075 B_Intermediate L2
ENSG00000116514 RNF19B 966657 sc-eQTL 1.54e-01 -0.193 0.135 0.075 B_Intermediate L2
ENSG00000116525 TRIM62 749283 sc-eQTL 6.59e-01 -0.0675 0.153 0.075 B_Intermediate L2
ENSG00000116544 DLGAP3 -998308 sc-eQTL 2.76e-01 0.167 0.153 0.075 B_Intermediate L2
ENSG00000134686 PHC2 500290 sc-eQTL 7.36e-01 0.0451 0.134 0.075 B_Intermediate L2
ENSG00000160094 ZNF362 674850 sc-eQTL 7.51e-01 -0.0487 0.153 0.075 B_Intermediate L2
ENSG00000163866 SMIM12 -928413 sc-eQTL 8.02e-02 0.277 0.157 0.075 B_Intermediate L2
ENSG00000004455 AK2 850346 sc-eQTL 1.06e-01 -0.256 0.158 0.075 B_Memory L2
ENSG00000116514 RNF19B 966657 sc-eQTL 2.43e-01 0.17 0.145 0.075 B_Memory L2
ENSG00000116525 TRIM62 749283 sc-eQTL 7.42e-01 0.0548 0.166 0.075 B_Memory L2
ENSG00000116544 DLGAP3 -998308 sc-eQTL 6.16e-01 0.0746 0.149 0.075 B_Memory L2
ENSG00000134686 PHC2 500290 sc-eQTL 5.17e-01 -0.0929 0.143 0.075 B_Memory L2
ENSG00000160094 ZNF362 674850 sc-eQTL 5.28e-02 -0.301 0.155 0.075 B_Memory L2
ENSG00000163866 SMIM12 -928413 sc-eQTL 9.44e-01 0.0111 0.159 0.075 B_Memory L2
ENSG00000004455 AK2 850346 sc-eQTL 8.17e-01 0.0251 0.108 0.075 B_Naive1 L2
ENSG00000116514 RNF19B 966657 sc-eQTL 3.02e-01 -0.126 0.122 0.075 B_Naive1 L2
ENSG00000116525 TRIM62 749283 sc-eQTL 6.62e-01 0.0668 0.152 0.075 B_Naive1 L2
ENSG00000116544 DLGAP3 -998308 sc-eQTL 3.79e-01 0.136 0.154 0.075 B_Naive1 L2
ENSG00000134686 PHC2 500290 sc-eQTL 5.15e-01 -0.0842 0.129 0.075 B_Naive1 L2
ENSG00000160094 ZNF362 674850 sc-eQTL 2.03e-01 -0.192 0.15 0.075 B_Naive1 L2
ENSG00000163866 SMIM12 -928413 sc-eQTL 1.76e-02 0.355 0.149 0.075 B_Naive1 L2
ENSG00000004455 AK2 850346 sc-eQTL 3.93e-01 0.127 0.149 0.075 B_Naive2 L2
ENSG00000116514 RNF19B 966657 sc-eQTL 2.36e-01 0.191 0.161 0.075 B_Naive2 L2
ENSG00000116525 TRIM62 749283 sc-eQTL 8.87e-01 0.0236 0.166 0.075 B_Naive2 L2
ENSG00000116544 DLGAP3 -998308 sc-eQTL 7.50e-01 -0.0559 0.175 0.075 B_Naive2 L2
ENSG00000134686 PHC2 500290 sc-eQTL 6.29e-01 -0.0703 0.145 0.075 B_Naive2 L2
ENSG00000160094 ZNF362 674850 sc-eQTL 2.95e-01 -0.165 0.158 0.075 B_Naive2 L2
ENSG00000163866 SMIM12 -928413 sc-eQTL 7.54e-01 0.0539 0.172 0.075 B_Naive2 L2
ENSG00000004455 AK2 850346 sc-eQTL 7.03e-01 -0.0601 0.157 0.08 CD4_CTL L2
ENSG00000116514 RNF19B 966657 sc-eQTL 4.59e-01 0.113 0.152 0.08 CD4_CTL L2
ENSG00000116525 TRIM62 749283 sc-eQTL 9.06e-01 -0.0181 0.154 0.08 CD4_CTL L2
ENSG00000116544 DLGAP3 -998308 sc-eQTL 3.43e-01 -0.144 0.152 0.08 CD4_CTL L2
ENSG00000134686 PHC2 500290 sc-eQTL 8.82e-01 -0.0216 0.146 0.08 CD4_CTL L2
ENSG00000142920 AZIN2 850238 sc-eQTL 6.29e-01 0.0723 0.15 0.08 CD4_CTL L2
ENSG00000160094 ZNF362 674850 sc-eQTL 4.12e-01 0.127 0.154 0.08 CD4_CTL L2
ENSG00000163866 SMIM12 -928413 sc-eQTL 8.35e-02 -0.269 0.155 0.08 CD4_CTL L2
ENSG00000004455 AK2 850346 sc-eQTL 6.71e-01 -0.0385 0.0904 0.075 CD4_Naive L2
ENSG00000116514 RNF19B 966657 sc-eQTL 8.41e-01 0.0188 0.0937 0.075 CD4_Naive L2
ENSG00000116525 TRIM62 749283 sc-eQTL 4.69e-02 0.242 0.121 0.075 CD4_Naive L2
ENSG00000116544 DLGAP3 -998308 sc-eQTL 2.83e-01 0.161 0.149 0.075 CD4_Naive L2
ENSG00000134686 PHC2 500290 sc-eQTL 9.67e-01 0.00443 0.108 0.075 CD4_Naive L2
ENSG00000142920 AZIN2 850238 sc-eQTL 6.67e-03 0.399 0.146 0.075 CD4_Naive L2
ENSG00000160094 ZNF362 674850 sc-eQTL 5.41e-01 0.0705 0.115 0.075 CD4_Naive L2
ENSG00000163866 SMIM12 -928413 sc-eQTL 9.79e-01 0.00281 0.106 0.075 CD4_Naive L2
ENSG00000004455 AK2 850346 sc-eQTL 1.77e-01 -0.146 0.108 0.075 CD4_TCM L2
ENSG00000116514 RNF19B 966657 sc-eQTL 2.99e-01 -0.113 0.108 0.075 CD4_TCM L2
ENSG00000116525 TRIM62 749283 sc-eQTL 6.10e-01 -0.065 0.127 0.075 CD4_TCM L2
ENSG00000116544 DLGAP3 -998308 sc-eQTL 8.05e-01 -0.0326 0.132 0.075 CD4_TCM L2
ENSG00000134686 PHC2 500290 sc-eQTL 7.91e-01 -0.0322 0.122 0.075 CD4_TCM L2
ENSG00000142920 AZIN2 850238 sc-eQTL 2.64e-01 0.172 0.153 0.075 CD4_TCM L2
ENSG00000160094 ZNF362 674850 sc-eQTL 2.21e-01 0.158 0.129 0.075 CD4_TCM L2
ENSG00000163866 SMIM12 -928413 sc-eQTL 5.40e-01 0.0846 0.138 0.075 CD4_TCM L2
ENSG00000004455 AK2 850346 sc-eQTL 4.96e-01 -0.0909 0.133 0.075 CD4_TEM L2
ENSG00000116514 RNF19B 966657 sc-eQTL 3.39e-01 -0.123 0.128 0.075 CD4_TEM L2
ENSG00000116525 TRIM62 749283 sc-eQTL 5.52e-01 0.0928 0.156 0.075 CD4_TEM L2
ENSG00000116544 DLGAP3 -998308 sc-eQTL 7.00e-01 0.0627 0.163 0.075 CD4_TEM L2
ENSG00000134686 PHC2 500290 sc-eQTL 5.38e-01 0.0891 0.145 0.075 CD4_TEM L2
ENSG00000142920 AZIN2 850238 sc-eQTL 4.17e-02 -0.335 0.164 0.075 CD4_TEM L2
ENSG00000160094 ZNF362 674850 sc-eQTL 9.46e-01 0.0107 0.158 0.075 CD4_TEM L2
ENSG00000163866 SMIM12 -928413 sc-eQTL 1.07e-01 0.245 0.151 0.075 CD4_TEM L2
ENSG00000004455 AK2 850346 sc-eQTL 8.14e-01 -0.0308 0.131 0.075 CD8_CTL L2
ENSG00000116514 RNF19B 966657 sc-eQTL 7.80e-01 0.0344 0.123 0.075 CD8_CTL L2
ENSG00000116525 TRIM62 749283 sc-eQTL 4.40e-01 -0.113 0.146 0.075 CD8_CTL L2
ENSG00000116544 DLGAP3 -998308 sc-eQTL 8.68e-01 -0.0264 0.158 0.075 CD8_CTL L2
ENSG00000134686 PHC2 500290 sc-eQTL 7.63e-01 0.0396 0.131 0.075 CD8_CTL L2
ENSG00000142920 AZIN2 850238 sc-eQTL 4.57e-01 -0.117 0.158 0.075 CD8_CTL L2
ENSG00000160094 ZNF362 674850 sc-eQTL 6.10e-01 0.0706 0.138 0.075 CD8_CTL L2
ENSG00000163866 SMIM12 -928413 sc-eQTL 6.19e-01 -0.0762 0.153 0.075 CD8_CTL L2
ENSG00000004455 AK2 850346 sc-eQTL 1.18e-01 -0.182 0.116 0.075 CD8_Naive L2
ENSG00000116514 RNF19B 966657 sc-eQTL 8.78e-01 -0.0197 0.128 0.075 CD8_Naive L2
ENSG00000116525 TRIM62 749283 sc-eQTL 5.31e-01 0.0978 0.156 0.075 CD8_Naive L2
ENSG00000116544 DLGAP3 -998308 sc-eQTL 3.73e-01 0.145 0.162 0.075 CD8_Naive L2
ENSG00000134686 PHC2 500290 sc-eQTL 5.06e-01 -0.0893 0.134 0.075 CD8_Naive L2
ENSG00000142920 AZIN2 850238 sc-eQTL 8.98e-01 0.0199 0.155 0.075 CD8_Naive L2
ENSG00000160094 ZNF362 674850 sc-eQTL 6.38e-01 -0.0666 0.141 0.075 CD8_Naive L2
ENSG00000163866 SMIM12 -928413 sc-eQTL 7.84e-01 -0.0371 0.135 0.075 CD8_Naive L2
ENSG00000004455 AK2 850346 sc-eQTL 1.60e-01 -0.217 0.154 0.079 CD8_TCM L2
ENSG00000116514 RNF19B 966657 sc-eQTL 4.57e-01 0.111 0.149 0.079 CD8_TCM L2
ENSG00000116525 TRIM62 749283 sc-eQTL 2.40e-01 0.199 0.169 0.079 CD8_TCM L2
ENSG00000116544 DLGAP3 -998308 sc-eQTL 1.85e-01 0.214 0.161 0.079 CD8_TCM L2
ENSG00000134686 PHC2 500290 sc-eQTL 9.12e-01 -0.0147 0.132 0.079 CD8_TCM L2
ENSG00000142920 AZIN2 850238 sc-eQTL 4.63e-01 0.118 0.16 0.079 CD8_TCM L2
ENSG00000160094 ZNF362 674850 sc-eQTL 9.64e-01 0.00724 0.158 0.079 CD8_TCM L2
ENSG00000163866 SMIM12 -928413 sc-eQTL 8.81e-01 -0.0235 0.157 0.079 CD8_TCM L2
ENSG00000004455 AK2 850346 sc-eQTL 5.65e-01 0.0953 0.165 0.078 CD8_TEM L2
ENSG00000116514 RNF19B 966657 sc-eQTL 1.37e-01 0.245 0.164 0.078 CD8_TEM L2
ENSG00000116525 TRIM62 749283 sc-eQTL 2.21e-01 -0.209 0.17 0.078 CD8_TEM L2
ENSG00000116544 DLGAP3 -998308 sc-eQTL 5.48e-01 -0.0907 0.151 0.078 CD8_TEM L2
ENSG00000134686 PHC2 500290 sc-eQTL 7.86e-01 0.0435 0.16 0.078 CD8_TEM L2
ENSG00000142920 AZIN2 850238 sc-eQTL 5.70e-01 -0.0821 0.144 0.078 CD8_TEM L2
ENSG00000160094 ZNF362 674850 sc-eQTL 3.50e-01 0.152 0.162 0.078 CD8_TEM L2
ENSG00000163866 SMIM12 -928413 sc-eQTL 7.12e-01 -0.0619 0.168 0.078 CD8_TEM L2
ENSG00000004455 AK2 850346 sc-eQTL 7.96e-01 -0.0372 0.143 0.076 MAIT L2
ENSG00000116514 RNF19B 966657 sc-eQTL 3.36e-01 0.128 0.133 0.076 MAIT L2
ENSG00000116525 TRIM62 749283 sc-eQTL 2.55e-01 -0.189 0.165 0.076 MAIT L2
ENSG00000116544 DLGAP3 -998308 sc-eQTL 2.00e-01 -0.201 0.156 0.076 MAIT L2
ENSG00000134686 PHC2 500290 sc-eQTL 3.92e-01 0.118 0.138 0.076 MAIT L2
ENSG00000142920 AZIN2 850238 sc-eQTL 7.77e-01 0.0452 0.159 0.076 MAIT L2
ENSG00000160094 ZNF362 674850 sc-eQTL 4.82e-01 -0.108 0.154 0.076 MAIT L2
ENSG00000163866 SMIM12 -928413 sc-eQTL 3.64e-01 0.143 0.158 0.076 MAIT L2
ENSG00000004455 AK2 850346 sc-eQTL 6.27e-01 -0.0807 0.166 0.073 NK_CD56bright L2
ENSG00000116514 RNF19B 966657 sc-eQTL 3.83e-01 0.135 0.155 0.073 NK_CD56bright L2
ENSG00000116525 TRIM62 749283 sc-eQTL 1.04e-01 -0.269 0.165 0.073 NK_CD56bright L2
ENSG00000116544 DLGAP3 -998308 sc-eQTL 9.45e-01 -0.0112 0.161 0.073 NK_CD56bright L2
ENSG00000134686 PHC2 500290 sc-eQTL 8.70e-01 -0.0245 0.15 0.073 NK_CD56bright L2
ENSG00000160094 ZNF362 674850 sc-eQTL 1.48e-01 0.246 0.17 0.073 NK_CD56bright L2
ENSG00000163866 SMIM12 -928413 sc-eQTL 4.35e-01 -0.139 0.177 0.073 NK_CD56bright L2
ENSG00000004455 AK2 850346 sc-eQTL 4.25e-01 0.11 0.137 0.073 NK_CD56dim L2
ENSG00000116514 RNF19B 966657 sc-eQTL 6.39e-01 -0.0583 0.124 0.073 NK_CD56dim L2
ENSG00000116525 TRIM62 749283 sc-eQTL 6.58e-02 -0.265 0.143 0.073 NK_CD56dim L2
ENSG00000116544 DLGAP3 -998308 sc-eQTL 5.61e-01 0.0899 0.155 0.073 NK_CD56dim L2
ENSG00000134686 PHC2 500290 sc-eQTL 4.71e-01 0.0963 0.133 0.073 NK_CD56dim L2
ENSG00000160094 ZNF362 674850 sc-eQTL 7.81e-01 -0.0422 0.152 0.073 NK_CD56dim L2
ENSG00000163866 SMIM12 -928413 sc-eQTL 3.08e-02 0.32 0.147 0.073 NK_CD56dim L2
ENSG00000004455 AK2 850346 sc-eQTL 9.83e-01 0.00355 0.169 0.068 NK_HLA L2
ENSG00000116514 RNF19B 966657 sc-eQTL 4.10e-02 0.33 0.16 0.068 NK_HLA L2
ENSG00000116525 TRIM62 749283 sc-eQTL 8.98e-01 0.022 0.171 0.068 NK_HLA L2
ENSG00000116544 DLGAP3 -998308 sc-eQTL 3.18e-01 -0.157 0.157 0.068 NK_HLA L2
ENSG00000134686 PHC2 500290 sc-eQTL 7.21e-01 -0.0533 0.149 0.068 NK_HLA L2
ENSG00000160094 ZNF362 674850 sc-eQTL 7.62e-01 -0.0517 0.17 0.068 NK_HLA L2
ENSG00000163866 SMIM12 -928413 sc-eQTL 3.81e-01 0.147 0.167 0.068 NK_HLA L2
ENSG00000004455 AK2 850346 sc-eQTL 1.67e-01 -0.201 0.145 0.073 NK_cytokine L2
ENSG00000116514 RNF19B 966657 sc-eQTL 9.16e-01 0.014 0.133 0.073 NK_cytokine L2
ENSG00000116525 TRIM62 749283 sc-eQTL 3.38e-01 -0.154 0.16 0.073 NK_cytokine L2
ENSG00000116544 DLGAP3 -998308 sc-eQTL 7.68e-01 -0.0474 0.161 0.073 NK_cytokine L2
ENSG00000134686 PHC2 500290 sc-eQTL 9.60e-01 0.0068 0.137 0.073 NK_cytokine L2
ENSG00000160094 ZNF362 674850 sc-eQTL 1.05e-02 0.382 0.148 0.073 NK_cytokine L2
ENSG00000163866 SMIM12 -928413 sc-eQTL 2.31e-01 0.174 0.145 0.073 NK_cytokine L2
ENSG00000004455 AK2 850346 sc-eQTL 4.29e-02 0.393 0.192 0.078 PB L2
ENSG00000116514 RNF19B 966657 sc-eQTL 8.03e-01 0.0555 0.222 0.078 PB L2
ENSG00000116525 TRIM62 749283 sc-eQTL 8.63e-01 0.0377 0.217 0.078 PB L2
ENSG00000116544 DLGAP3 -998308 sc-eQTL 5.65e-01 -0.13 0.225 0.078 PB L2
ENSG00000134686 PHC2 500290 sc-eQTL 7.83e-01 0.0602 0.218 0.078 PB L2
ENSG00000160094 ZNF362 674850 sc-eQTL 2.55e-01 0.257 0.225 0.078 PB L2
ENSG00000163866 SMIM12 -928413 sc-eQTL 8.45e-01 -0.0404 0.206 0.078 PB L2
ENSG00000004455 AK2 850346 sc-eQTL 3.38e-01 0.109 0.113 0.076 Pro_T L2
ENSG00000116514 RNF19B 966657 sc-eQTL 1.69e-01 -0.209 0.152 0.076 Pro_T L2
ENSG00000116525 TRIM62 749283 sc-eQTL 6.71e-01 -0.0641 0.15 0.076 Pro_T L2
ENSG00000116544 DLGAP3 -998308 sc-eQTL 5.17e-01 0.093 0.143 0.076 Pro_T L2
ENSG00000134686 PHC2 500290 sc-eQTL 2.80e-01 -0.137 0.127 0.076 Pro_T L2
ENSG00000142920 AZIN2 850238 sc-eQTL 7.62e-01 0.0385 0.127 0.076 Pro_T L2
ENSG00000160094 ZNF362 674850 sc-eQTL 8.34e-02 -0.26 0.15 0.076 Pro_T L2
ENSG00000163866 SMIM12 -928413 sc-eQTL 7.14e-01 -0.0572 0.156 0.076 Pro_T L2
ENSG00000004455 AK2 850346 sc-eQTL 9.60e-01 -0.00737 0.147 0.075 Treg L2
ENSG00000116514 RNF19B 966657 sc-eQTL 5.96e-01 0.0693 0.13 0.075 Treg L2
ENSG00000116525 TRIM62 749283 sc-eQTL 2.65e-01 -0.175 0.157 0.075 Treg L2
ENSG00000116544 DLGAP3 -998308 sc-eQTL 1.65e-01 -0.222 0.159 0.075 Treg L2
ENSG00000134686 PHC2 500290 sc-eQTL 4.47e-01 -0.108 0.141 0.075 Treg L2
ENSG00000142920 AZIN2 850238 sc-eQTL 9.45e-01 0.00946 0.138 0.075 Treg L2
ENSG00000160094 ZNF362 674850 sc-eQTL 8.83e-01 0.0221 0.15 0.075 Treg L2
ENSG00000163866 SMIM12 -928413 sc-eQTL 7.39e-01 -0.0517 0.155 0.075 Treg L2
ENSG00000004455 AK2 850346 sc-eQTL 7.85e-01 -0.0448 0.164 0.078 cDC L2
ENSG00000116514 RNF19B 966657 sc-eQTL 1.00e-01 0.246 0.149 0.078 cDC L2
ENSG00000116525 TRIM62 749283 sc-eQTL 4.46e-01 -0.13 0.17 0.078 cDC L2
ENSG00000116544 DLGAP3 -998308 sc-eQTL 3.40e-01 -0.161 0.168 0.078 cDC L2
ENSG00000134686 PHC2 500290 sc-eQTL 1.13e-01 -0.185 0.116 0.078 cDC L2
ENSG00000142920 AZIN2 850238 sc-eQTL 2.49e-01 -0.106 0.0918 0.078 cDC L2
ENSG00000160094 ZNF362 674850 sc-eQTL 6.18e-01 0.0803 0.161 0.078 cDC L2
ENSG00000163866 SMIM12 -928413 sc-eQTL 4.83e-01 -0.113 0.16 0.078 cDC L2
ENSG00000004455 AK2 850346 sc-eQTL 2.77e-01 0.148 0.136 0.075 cMono_IL1B L2
ENSG00000116514 RNF19B 966657 sc-eQTL 7.04e-02 -0.172 0.0948 0.075 cMono_IL1B L2
ENSG00000116525 TRIM62 749283 sc-eQTL 6.51e-01 0.0714 0.157 0.075 cMono_IL1B L2
ENSG00000116544 DLGAP3 -998308 sc-eQTL 5.23e-01 -0.103 0.161 0.075 cMono_IL1B L2
ENSG00000134686 PHC2 500290 sc-eQTL 6.78e-01 0.0339 0.0815 0.075 cMono_IL1B L2
ENSG00000160094 ZNF362 674850 sc-eQTL 5.76e-02 -0.272 0.143 0.075 cMono_IL1B L2
ENSG00000163866 SMIM12 -928413 sc-eQTL 3.14e-01 0.126 0.124 0.075 cMono_IL1B L2
ENSG00000004455 AK2 850346 sc-eQTL 3.06e-01 0.144 0.14 0.075 cMono_S100A L2
ENSG00000116514 RNF19B 966657 sc-eQTL 3.99e-01 -0.0953 0.113 0.075 cMono_S100A L2
ENSG00000116525 TRIM62 749283 sc-eQTL 5.02e-01 0.112 0.167 0.075 cMono_S100A L2
ENSG00000116544 DLGAP3 -998308 sc-eQTL 1.15e-01 0.256 0.161 0.075 cMono_S100A L2
ENSG00000134686 PHC2 500290 sc-eQTL 7.37e-01 0.0289 0.086 0.075 cMono_S100A L2
ENSG00000160094 ZNF362 674850 sc-eQTL 3.28e-01 0.151 0.154 0.075 cMono_S100A L2
ENSG00000163866 SMIM12 -928413 sc-eQTL 9.39e-01 -0.0109 0.143 0.075 cMono_S100A L2
ENSG00000004455 AK2 850346 sc-eQTL 4.40e-01 0.144 0.186 0.076 gdT L2
ENSG00000116514 RNF19B 966657 sc-eQTL 8.28e-01 0.0372 0.171 0.076 gdT L2
ENSG00000116525 TRIM62 749283 sc-eQTL 3.24e-01 0.198 0.2 0.076 gdT L2
ENSG00000116544 DLGAP3 -998308 sc-eQTL 6.39e-01 0.0899 0.191 0.076 gdT L2
ENSG00000134686 PHC2 500290 sc-eQTL 2.42e-01 -0.196 0.167 0.076 gdT L2
ENSG00000142920 AZIN2 850238 sc-eQTL 9.54e-02 -0.286 0.17 0.076 gdT L2
ENSG00000160094 ZNF362 674850 sc-eQTL 6.47e-01 0.0893 0.194 0.076 gdT L2
ENSG00000163866 SMIM12 -928413 sc-eQTL 9.51e-01 0.0123 0.2 0.076 gdT L2
ENSG00000004455 AK2 850346 sc-eQTL 3.13e-01 -0.161 0.16 0.073 intMono L2
ENSG00000116514 RNF19B 966657 sc-eQTL 7.77e-01 -0.0388 0.137 0.073 intMono L2
ENSG00000116525 TRIM62 749283 sc-eQTL 5.62e-01 -0.0958 0.165 0.073 intMono L2
ENSG00000116544 DLGAP3 -998308 sc-eQTL 8.31e-01 -0.034 0.159 0.073 intMono L2
ENSG00000134686 PHC2 500290 sc-eQTL 1.94e-01 -0.123 0.0946 0.073 intMono L2
ENSG00000160094 ZNF362 674850 sc-eQTL 2.40e-01 -0.199 0.169 0.073 intMono L2
ENSG00000163866 SMIM12 -928413 sc-eQTL 8.70e-02 0.278 0.161 0.073 intMono L2
ENSG00000004455 AK2 850346 sc-eQTL 4.19e-02 -0.322 0.157 0.075 ncMono L2
ENSG00000116514 RNF19B 966657 sc-eQTL 5.92e-01 -0.0793 0.148 0.075 ncMono L2
ENSG00000116525 TRIM62 749283 sc-eQTL 8.35e-01 0.0306 0.147 0.075 ncMono L2
ENSG00000116544 DLGAP3 -998308 sc-eQTL 6.46e-03 -0.386 0.14 0.075 ncMono L2
ENSG00000134686 PHC2 500290 sc-eQTL 6.18e-01 -0.0562 0.112 0.075 ncMono L2
ENSG00000160094 ZNF362 674850 sc-eQTL 9.04e-01 -0.0209 0.173 0.075 ncMono L2
ENSG00000163866 SMIM12 -928413 sc-eQTL 8.28e-01 -0.0339 0.156 0.075 ncMono L2
ENSG00000004455 AK2 850346 sc-eQTL 7.51e-02 0.312 0.174 0.076 pDC L2
ENSG00000116514 RNF19B 966657 sc-eQTL 1.59e-01 0.249 0.176 0.076 pDC L2
ENSG00000116525 TRIM62 749283 sc-eQTL 4.70e-01 -0.127 0.175 0.076 pDC L2
ENSG00000116544 DLGAP3 -998308 sc-eQTL 2.89e-01 -0.183 0.172 0.076 pDC L2
ENSG00000134686 PHC2 500290 sc-eQTL 7.21e-01 0.0511 0.143 0.076 pDC L2
ENSG00000142920 AZIN2 850238 sc-eQTL 6.18e-01 -0.0616 0.123 0.076 pDC L2
ENSG00000160094 ZNF362 674850 sc-eQTL 3.68e-01 0.139 0.154 0.076 pDC L2
ENSG00000163866 SMIM12 -928413 sc-eQTL 1.08e-01 0.289 0.179 0.076 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000004455 AK2 850346 sc-eQTL 1.80e-02 -0.305 0.128 0.075 B_Memory LOneK1K
ENSG00000116514 RNF19B 966657 sc-eQTL 4.10e-01 -0.112 0.136 0.075 B_Memory LOneK1K
ENSG00000116525 TRIM62 749283 sc-eQTL 9.60e-01 0.00736 0.147 0.075 B_Memory LOneK1K
ENSG00000116544 DLGAP3 -998308 sc-eQTL 3.08e-01 0.162 0.159 0.075 B_Memory LOneK1K
ENSG00000134686 PHC2 500290 sc-eQTL 9.68e-01 0.00536 0.133 0.075 B_Memory LOneK1K
ENSG00000160094 ZNF362 674850 sc-eQTL 5.45e-01 -0.0913 0.15 0.075 B_Memory LOneK1K
ENSG00000163866 SMIM12 -928413 sc-eQTL 7.48e-02 0.276 0.154 0.075 B_Memory LOneK1K
ENSG00000004455 AK2 850346 sc-eQTL 4.50e-01 0.0813 0.107 0.075 B_Naive LOneK1K
ENSG00000116514 RNF19B 966657 sc-eQTL 6.13e-01 -0.0624 0.123 0.075 B_Naive LOneK1K
ENSG00000116525 TRIM62 749283 sc-eQTL 7.67e-01 0.044 0.148 0.075 B_Naive LOneK1K
ENSG00000116544 DLGAP3 -998308 sc-eQTL 8.30e-01 0.0348 0.162 0.075 B_Naive LOneK1K
ENSG00000134686 PHC2 500290 sc-eQTL 7.02e-01 -0.05 0.131 0.075 B_Naive LOneK1K
ENSG00000160094 ZNF362 674850 sc-eQTL 1.14e-01 -0.226 0.142 0.075 B_Naive LOneK1K
ENSG00000163866 SMIM12 -928413 sc-eQTL 3.56e-02 0.315 0.149 0.075 B_Naive LOneK1K
ENSG00000004455 AK2 850346 sc-eQTL 1.01e-01 0.208 0.127 0.075 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000116514 RNF19B 966657 sc-eQTL 1.57e-01 -0.123 0.0865 0.075 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000116525 TRIM62 749283 sc-eQTL 2.88e-01 0.167 0.157 0.075 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000116544 DLGAP3 -998308 sc-eQTL 9.20e-01 0.0161 0.161 0.075 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000134686 PHC2 500290 sc-eQTL 5.94e-01 0.0429 0.0805 0.075 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000160094 ZNF362 674850 sc-eQTL 2.41e-01 -0.161 0.136 0.075 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000163866 SMIM12 -928413 sc-eQTL 4.46e-01 0.0885 0.116 0.075 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000004455 AK2 850346 sc-eQTL 5.42e-02 -0.279 0.144 0.073 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000116514 RNF19B 966657 sc-eQTL 6.71e-01 -0.0544 0.128 0.073 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000116525 TRIM62 749283 sc-eQTL 8.79e-01 0.0225 0.148 0.073 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000116544 DLGAP3 -998308 sc-eQTL 2.67e-01 -0.142 0.128 0.073 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000134686 PHC2 500290 sc-eQTL 9.86e-01 -0.00165 0.093 0.073 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000160094 ZNF362 674850 sc-eQTL 7.36e-01 -0.0509 0.151 0.073 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000163866 SMIM12 -928413 sc-eQTL 2.29e-01 0.169 0.14 0.073 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000004455 AK2 850346 sc-eQTL 9.47e-01 -0.00798 0.12 0.073 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000116514 RNF19B 966657 sc-eQTL 9.53e-01 0.00702 0.12 0.073 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000116525 TRIM62 749283 sc-eQTL 5.97e-02 -0.25 0.132 0.073 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000116544 DLGAP3 -998308 sc-eQTL 6.62e-01 0.0689 0.157 0.073 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000134686 PHC2 500290 sc-eQTL 6.30e-01 0.0592 0.123 0.073 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000160094 ZNF362 674850 sc-eQTL 3.47e-01 0.133 0.141 0.073 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000163866 SMIM12 -928413 sc-eQTL 4.93e-02 0.273 0.138 0.073 NK_CD56dim LOneK1K

Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF
ENSG00000116514 RNF19B 966657 eQTL 0.0415 -0.0575 0.0282 0.0 0.0 0.0868
ENSG00000184389 A3GALT2 610244 eQTL 0.014 -0.121 0.0491 0.0 0.0 0.0868

Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina
ENSG00000184389 A3GALT2 610244 3.07e-07 1.7e-07 7.16e-08 2.36e-07 1.08e-07 9.31e-08 2.24e-07 6.2e-08 1.71e-07 1.03e-07 1.69e-07 1.37e-07 2.38e-07 8.15e-08 5.97e-08 9.11e-08 5.42e-08 2.04e-07 7.11e-08 6.16e-08 1.33e-07 1.76e-07 1.69e-07 4.27e-08 2.17e-07 1.56e-07 1.25e-07 1.36e-07 1.37e-07 1.39e-07 1.26e-07 5.4e-08 4.97e-08 9.72e-08 6.98e-08 4.6e-08 6.04e-08 6e-08 5.69e-08 7.65e-08 5.03e-08 1.55e-07 3.08e-08 1.58e-08 4.36e-08 1.01e-08 8.93e-08 0.0 4.74e-08