logo

Genes within 1Mb (chr1:33930234:A:G):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD

Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000004455 AK2 849238 sc-eQTL 6.90e-01 -0.0367 0.092 0.079 B L1
ENSG00000116514 RNF19B 965549 sc-eQTL 9.98e-01 0.000215 0.113 0.079 B L1
ENSG00000116525 TRIM62 748175 sc-eQTL 9.68e-01 0.00528 0.13 0.079 B L1
ENSG00000116544 DLGAP3 -999416 sc-eQTL 9.33e-01 0.0124 0.148 0.079 B L1
ENSG00000134686 PHC2 499182 sc-eQTL 9.63e-01 -0.00553 0.118 0.079 B L1
ENSG00000160094 ZNF362 673742 sc-eQTL 1.98e-01 -0.163 0.126 0.079 B L1
ENSG00000163866 SMIM12 -929521 sc-eQTL 1.34e-02 0.308 0.123 0.079 B L1
ENSG00000004455 AK2 849238 sc-eQTL 5.18e-01 -0.0467 0.0721 0.079 CD4T L1
ENSG00000116514 RNF19B 965549 sc-eQTL 4.71e-01 -0.0571 0.0791 0.079 CD4T L1
ENSG00000116525 TRIM62 748175 sc-eQTL 7.26e-01 0.0354 0.101 0.079 CD4T L1
ENSG00000116544 DLGAP3 -999416 sc-eQTL 7.83e-01 0.0337 0.122 0.079 CD4T L1
ENSG00000134686 PHC2 499182 sc-eQTL 7.25e-01 0.0346 0.0983 0.079 CD4T L1
ENSG00000142920 AZIN2 849130 sc-eQTL 2.74e-02 0.293 0.132 0.079 CD4T L1
ENSG00000160094 ZNF362 673742 sc-eQTL 2.57e-01 0.12 0.105 0.079 CD4T L1
ENSG00000163866 SMIM12 -929521 sc-eQTL 7.18e-01 0.0372 0.103 0.079 CD4T L1
ENSG00000004455 AK2 849238 sc-eQTL 3.41e-01 -0.0884 0.0926 0.079 CD8T L1
ENSG00000116514 RNF19B 965549 sc-eQTL 3.33e-01 0.0832 0.0857 0.079 CD8T L1
ENSG00000116525 TRIM62 748175 sc-eQTL 9.91e-01 0.00154 0.132 0.079 CD8T L1
ENSG00000116544 DLGAP3 -999416 sc-eQTL 3.04e-01 0.148 0.144 0.079 CD8T L1
ENSG00000134686 PHC2 499182 sc-eQTL 4.73e-01 0.0812 0.113 0.079 CD8T L1
ENSG00000142920 AZIN2 849130 sc-eQTL 6.58e-01 -0.0571 0.129 0.079 CD8T L1
ENSG00000160094 ZNF362 673742 sc-eQTL 2.98e-01 0.114 0.11 0.079 CD8T L1
ENSG00000163866 SMIM12 -929521 sc-eQTL 9.31e-01 -0.0104 0.12 0.079 CD8T L1
ENSG00000004455 AK2 849238 sc-eQTL 3.97e-01 0.121 0.142 0.081 DC L1
ENSG00000116514 RNF19B 965549 sc-eQTL 2.84e-02 0.314 0.142 0.081 DC L1
ENSG00000116525 TRIM62 748175 sc-eQTL 1.38e-01 -0.229 0.154 0.081 DC L1
ENSG00000116544 DLGAP3 -999416 sc-eQTL 8.89e-02 -0.242 0.142 0.081 DC L1
ENSG00000134686 PHC2 499182 sc-eQTL 5.40e-01 -0.0634 0.103 0.081 DC L1
ENSG00000142920 AZIN2 849130 sc-eQTL 5.57e-01 -0.0491 0.0834 0.081 DC L1
ENSG00000160094 ZNF362 673742 sc-eQTL 5.54e-01 0.0796 0.134 0.081 DC L1
ENSG00000163866 SMIM12 -929521 sc-eQTL 6.14e-01 0.0713 0.141 0.081 DC L1
ENSG00000004455 AK2 849238 sc-eQTL 3.97e-01 0.0985 0.116 0.079 Mono L1
ENSG00000116514 RNF19B 965549 sc-eQTL 2.74e-01 -0.0924 0.0843 0.079 Mono L1
ENSG00000116525 TRIM62 748175 sc-eQTL 4.79e-01 0.1 0.142 0.079 Mono L1
ENSG00000116544 DLGAP3 -999416 sc-eQTL 4.15e-01 -0.117 0.143 0.079 Mono L1
ENSG00000134686 PHC2 499182 sc-eQTL 2.98e-01 0.0791 0.0759 0.079 Mono L1
ENSG00000160094 ZNF362 673742 sc-eQTL 2.17e-01 -0.155 0.125 0.079 Mono L1
ENSG00000163866 SMIM12 -929521 sc-eQTL 2.28e-01 0.131 0.108 0.079 Mono L1
ENSG00000004455 AK2 849238 sc-eQTL 8.99e-01 -0.0139 0.109 0.077 NK L1
ENSG00000116514 RNF19B 965549 sc-eQTL 8.28e-01 0.0238 0.109 0.077 NK L1
ENSG00000116525 TRIM62 748175 sc-eQTL 3.20e-02 -0.265 0.123 0.077 NK L1
ENSG00000116544 DLGAP3 -999416 sc-eQTL 8.74e-01 0.024 0.151 0.077 NK L1
ENSG00000134686 PHC2 499182 sc-eQTL 5.18e-01 0.0748 0.115 0.077 NK L1
ENSG00000160094 ZNF362 673742 sc-eQTL 2.44e-01 0.152 0.13 0.077 NK L1
ENSG00000163866 SMIM12 -929521 sc-eQTL 2.11e-02 0.301 0.13 0.077 NK L1
ENSG00000004455 AK2 849238 sc-eQTL 1.97e-01 0.106 0.082 0.079 Other_T L1
ENSG00000116514 RNF19B 965549 sc-eQTL 9.76e-01 0.00333 0.11 0.079 Other_T L1
ENSG00000116525 TRIM62 748175 sc-eQTL 9.53e-01 0.00842 0.144 0.079 Other_T L1
ENSG00000116544 DLGAP3 -999416 sc-eQTL 4.26e-01 -0.122 0.153 0.079 Other_T L1
ENSG00000134686 PHC2 499182 sc-eQTL 4.20e-01 0.0967 0.12 0.079 Other_T L1
ENSG00000142920 AZIN2 849130 sc-eQTL 2.58e-01 0.168 0.148 0.079 Other_T L1
ENSG00000160094 ZNF362 673742 sc-eQTL 5.58e-01 -0.0742 0.126 0.079 Other_T L1
ENSG00000163866 SMIM12 -929521 sc-eQTL 1.00e+00 -5.11e-05 0.13 0.079 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000004455 AK2 849238 sc-eQTL 8.61e-01 0.0309 0.176 0.077 B_Activated L2
ENSG00000116514 RNF19B 965549 sc-eQTL 6.99e-01 -0.0647 0.167 0.077 B_Activated L2
ENSG00000116525 TRIM62 748175 sc-eQTL 8.15e-01 0.0379 0.162 0.077 B_Activated L2
ENSG00000116544 DLGAP3 -999416 sc-eQTL 3.00e-01 0.14 0.135 0.077 B_Activated L2
ENSG00000134686 PHC2 499182 sc-eQTL 5.83e-01 0.089 0.162 0.077 B_Activated L2
ENSG00000160094 ZNF362 673742 sc-eQTL 2.44e-01 0.198 0.17 0.077 B_Activated L2
ENSG00000163866 SMIM12 -929521 sc-eQTL 3.37e-01 0.17 0.177 0.077 B_Activated L2
ENSG00000004455 AK2 849238 sc-eQTL 1.19e-01 -0.198 0.126 0.079 B_Intermediate L2
ENSG00000116514 RNF19B 965549 sc-eQTL 3.30e-01 -0.126 0.129 0.079 B_Intermediate L2
ENSG00000116525 TRIM62 748175 sc-eQTL 8.18e-01 -0.0336 0.146 0.079 B_Intermediate L2
ENSG00000116544 DLGAP3 -999416 sc-eQTL 5.07e-01 0.097 0.146 0.079 B_Intermediate L2
ENSG00000134686 PHC2 499182 sc-eQTL 7.63e-01 0.0385 0.128 0.079 B_Intermediate L2
ENSG00000160094 ZNF362 673742 sc-eQTL 6.01e-01 -0.0767 0.146 0.079 B_Intermediate L2
ENSG00000163866 SMIM12 -929521 sc-eQTL 5.51e-02 0.29 0.15 0.079 B_Intermediate L2
ENSG00000004455 AK2 849238 sc-eQTL 2.14e-01 -0.188 0.151 0.08 B_Memory L2
ENSG00000116514 RNF19B 965549 sc-eQTL 1.60e-01 0.194 0.138 0.08 B_Memory L2
ENSG00000116525 TRIM62 748175 sc-eQTL 8.44e-01 0.0312 0.158 0.08 B_Memory L2
ENSG00000116544 DLGAP3 -999416 sc-eQTL 7.51e-01 0.0451 0.142 0.08 B_Memory L2
ENSG00000134686 PHC2 499182 sc-eQTL 4.91e-01 -0.0943 0.137 0.08 B_Memory L2
ENSG00000160094 ZNF362 673742 sc-eQTL 3.65e-02 -0.31 0.147 0.08 B_Memory L2
ENSG00000163866 SMIM12 -929521 sc-eQTL 6.82e-01 0.0621 0.151 0.08 B_Memory L2
ENSG00000004455 AK2 849238 sc-eQTL 9.00e-01 0.0129 0.103 0.079 B_Naive1 L2
ENSG00000116514 RNF19B 965549 sc-eQTL 3.14e-01 -0.117 0.116 0.079 B_Naive1 L2
ENSG00000116525 TRIM62 748175 sc-eQTL 5.73e-01 0.0823 0.146 0.079 B_Naive1 L2
ENSG00000116544 DLGAP3 -999416 sc-eQTL 4.95e-01 0.101 0.147 0.079 B_Naive1 L2
ENSG00000134686 PHC2 499182 sc-eQTL 6.65e-01 -0.0534 0.123 0.079 B_Naive1 L2
ENSG00000160094 ZNF362 673742 sc-eQTL 3.14e-01 -0.145 0.144 0.079 B_Naive1 L2
ENSG00000163866 SMIM12 -929521 sc-eQTL 2.68e-03 0.428 0.141 0.079 B_Naive1 L2
ENSG00000004455 AK2 849238 sc-eQTL 3.17e-01 0.142 0.142 0.079 B_Naive2 L2
ENSG00000116514 RNF19B 965549 sc-eQTL 1.39e-01 0.227 0.153 0.079 B_Naive2 L2
ENSG00000116525 TRIM62 748175 sc-eQTL 9.59e-01 -0.00809 0.158 0.079 B_Naive2 L2
ENSG00000116544 DLGAP3 -999416 sc-eQTL 5.68e-01 -0.0955 0.167 0.079 B_Naive2 L2
ENSG00000134686 PHC2 499182 sc-eQTL 7.34e-01 -0.0471 0.139 0.079 B_Naive2 L2
ENSG00000160094 ZNF362 673742 sc-eQTL 3.59e-01 -0.138 0.15 0.079 B_Naive2 L2
ENSG00000163866 SMIM12 -929521 sc-eQTL 8.45e-01 0.032 0.164 0.079 B_Naive2 L2
ENSG00000004455 AK2 849238 sc-eQTL 4.88e-01 -0.104 0.149 0.084 CD4_CTL L2
ENSG00000116514 RNF19B 965549 sc-eQTL 7.15e-01 0.0527 0.144 0.084 CD4_CTL L2
ENSG00000116525 TRIM62 748175 sc-eQTL 5.77e-01 0.0815 0.146 0.084 CD4_CTL L2
ENSG00000116544 DLGAP3 -999416 sc-eQTL 2.95e-01 -0.151 0.144 0.084 CD4_CTL L2
ENSG00000134686 PHC2 499182 sc-eQTL 4.56e-01 -0.103 0.138 0.084 CD4_CTL L2
ENSG00000142920 AZIN2 849130 sc-eQTL 3.91e-01 0.122 0.142 0.084 CD4_CTL L2
ENSG00000160094 ZNF362 673742 sc-eQTL 7.39e-01 0.0487 0.146 0.084 CD4_CTL L2
ENSG00000163866 SMIM12 -929521 sc-eQTL 1.18e-01 -0.23 0.147 0.084 CD4_CTL L2
ENSG00000004455 AK2 849238 sc-eQTL 6.91e-01 -0.0343 0.086 0.079 CD4_Naive L2
ENSG00000116514 RNF19B 965549 sc-eQTL 9.23e-01 0.00862 0.0891 0.079 CD4_Naive L2
ENSG00000116525 TRIM62 748175 sc-eQTL 1.09e-01 0.185 0.115 0.079 CD4_Naive L2
ENSG00000116544 DLGAP3 -999416 sc-eQTL 3.22e-01 0.141 0.142 0.079 CD4_Naive L2
ENSG00000134686 PHC2 499182 sc-eQTL 7.39e-01 0.0343 0.103 0.079 CD4_Naive L2
ENSG00000142920 AZIN2 849130 sc-eQTL 9.23e-03 0.364 0.138 0.079 CD4_Naive L2
ENSG00000160094 ZNF362 673742 sc-eQTL 3.26e-01 0.108 0.109 0.079 CD4_Naive L2
ENSG00000163866 SMIM12 -929521 sc-eQTL 6.84e-01 0.0411 0.101 0.079 CD4_Naive L2
ENSG00000004455 AK2 849238 sc-eQTL 3.04e-01 -0.106 0.103 0.079 CD4_TCM L2
ENSG00000116514 RNF19B 965549 sc-eQTL 4.06e-01 -0.086 0.103 0.079 CD4_TCM L2
ENSG00000116525 TRIM62 748175 sc-eQTL 7.15e-01 -0.0444 0.122 0.079 CD4_TCM L2
ENSG00000116544 DLGAP3 -999416 sc-eQTL 6.99e-01 -0.0486 0.126 0.079 CD4_TCM L2
ENSG00000134686 PHC2 499182 sc-eQTL 9.67e-01 0.00477 0.116 0.079 CD4_TCM L2
ENSG00000142920 AZIN2 849130 sc-eQTL 1.48e-01 0.212 0.146 0.079 CD4_TCM L2
ENSG00000160094 ZNF362 673742 sc-eQTL 4.37e-01 0.0961 0.123 0.079 CD4_TCM L2
ENSG00000163866 SMIM12 -929521 sc-eQTL 4.78e-01 0.0935 0.132 0.079 CD4_TCM L2
ENSG00000004455 AK2 849238 sc-eQTL 3.60e-01 -0.116 0.127 0.079 CD4_TEM L2
ENSG00000116514 RNF19B 965549 sc-eQTL 3.95e-01 -0.104 0.122 0.079 CD4_TEM L2
ENSG00000116525 TRIM62 748175 sc-eQTL 8.65e-01 0.0253 0.148 0.079 CD4_TEM L2
ENSG00000116544 DLGAP3 -999416 sc-eQTL 5.52e-01 0.0922 0.155 0.079 CD4_TEM L2
ENSG00000134686 PHC2 499182 sc-eQTL 4.92e-01 0.0946 0.138 0.079 CD4_TEM L2
ENSG00000142920 AZIN2 849130 sc-eQTL 1.90e-02 -0.367 0.155 0.079 CD4_TEM L2
ENSG00000160094 ZNF362 673742 sc-eQTL 7.35e-01 0.0512 0.151 0.079 CD4_TEM L2
ENSG00000163866 SMIM12 -929521 sc-eQTL 1.49e-01 0.209 0.144 0.079 CD4_TEM L2
ENSG00000004455 AK2 849238 sc-eQTL 8.77e-01 0.0194 0.125 0.079 CD8_CTL L2
ENSG00000116514 RNF19B 965549 sc-eQTL 3.98e-01 0.0992 0.117 0.079 CD8_CTL L2
ENSG00000116525 TRIM62 748175 sc-eQTL 6.04e-01 -0.0725 0.14 0.079 CD8_CTL L2
ENSG00000116544 DLGAP3 -999416 sc-eQTL 7.01e-01 -0.0582 0.151 0.079 CD8_CTL L2
ENSG00000134686 PHC2 499182 sc-eQTL 6.71e-01 0.0532 0.125 0.079 CD8_CTL L2
ENSG00000142920 AZIN2 849130 sc-eQTL 3.86e-01 -0.131 0.15 0.079 CD8_CTL L2
ENSG00000160094 ZNF362 673742 sc-eQTL 8.47e-01 0.0256 0.132 0.079 CD8_CTL L2
ENSG00000163866 SMIM12 -929521 sc-eQTL 9.37e-01 -0.0116 0.146 0.079 CD8_CTL L2
ENSG00000004455 AK2 849238 sc-eQTL 1.98e-01 -0.143 0.111 0.079 CD8_Naive L2
ENSG00000116514 RNF19B 965549 sc-eQTL 9.80e-01 -0.00314 0.122 0.079 CD8_Naive L2
ENSG00000116525 TRIM62 748175 sc-eQTL 6.47e-01 0.0681 0.149 0.079 CD8_Naive L2
ENSG00000116544 DLGAP3 -999416 sc-eQTL 2.44e-01 0.18 0.154 0.079 CD8_Naive L2
ENSG00000134686 PHC2 499182 sc-eQTL 8.85e-01 -0.0185 0.128 0.079 CD8_Naive L2
ENSG00000142920 AZIN2 849130 sc-eQTL 9.43e-01 0.0106 0.147 0.079 CD8_Naive L2
ENSG00000160094 ZNF362 673742 sc-eQTL 7.22e-01 0.048 0.135 0.079 CD8_Naive L2
ENSG00000163866 SMIM12 -929521 sc-eQTL 8.38e-01 -0.0263 0.129 0.079 CD8_Naive L2
ENSG00000004455 AK2 849238 sc-eQTL 1.56e-01 -0.209 0.146 0.083 CD8_TCM L2
ENSG00000116514 RNF19B 965549 sc-eQTL 6.62e-01 0.0622 0.142 0.083 CD8_TCM L2
ENSG00000116525 TRIM62 748175 sc-eQTL 3.48e-01 0.152 0.161 0.083 CD8_TCM L2
ENSG00000116544 DLGAP3 -999416 sc-eQTL 2.11e-01 0.192 0.153 0.083 CD8_TCM L2
ENSG00000134686 PHC2 499182 sc-eQTL 9.78e-01 -0.00351 0.126 0.083 CD8_TCM L2
ENSG00000142920 AZIN2 849130 sc-eQTL 6.35e-01 0.0727 0.153 0.083 CD8_TCM L2
ENSG00000160094 ZNF362 673742 sc-eQTL 8.70e-01 -0.0248 0.151 0.083 CD8_TCM L2
ENSG00000163866 SMIM12 -929521 sc-eQTL 7.52e-01 0.0473 0.15 0.083 CD8_TCM L2
ENSG00000004455 AK2 849238 sc-eQTL 4.56e-01 0.118 0.158 0.082 CD8_TEM L2
ENSG00000116514 RNF19B 965549 sc-eQTL 2.61e-01 0.177 0.157 0.082 CD8_TEM L2
ENSG00000116525 TRIM62 748175 sc-eQTL 2.68e-01 -0.181 0.163 0.082 CD8_TEM L2
ENSG00000116544 DLGAP3 -999416 sc-eQTL 4.32e-01 -0.113 0.144 0.082 CD8_TEM L2
ENSG00000134686 PHC2 499182 sc-eQTL 4.41e-01 0.118 0.153 0.082 CD8_TEM L2
ENSG00000142920 AZIN2 849130 sc-eQTL 4.10e-01 -0.113 0.137 0.082 CD8_TEM L2
ENSG00000160094 ZNF362 673742 sc-eQTL 3.48e-01 0.146 0.155 0.082 CD8_TEM L2
ENSG00000163866 SMIM12 -929521 sc-eQTL 8.25e-01 -0.0354 0.16 0.082 CD8_TEM L2
ENSG00000004455 AK2 849238 sc-eQTL 8.33e-01 -0.0289 0.137 0.08 MAIT L2
ENSG00000116514 RNF19B 965549 sc-eQTL 6.35e-01 0.0604 0.127 0.08 MAIT L2
ENSG00000116525 TRIM62 748175 sc-eQTL 3.90e-01 -0.136 0.158 0.08 MAIT L2
ENSG00000116544 DLGAP3 -999416 sc-eQTL 1.03e-01 -0.243 0.148 0.08 MAIT L2
ENSG00000134686 PHC2 499182 sc-eQTL 1.36e-01 0.196 0.131 0.08 MAIT L2
ENSG00000142920 AZIN2 849130 sc-eQTL 4.53e-01 0.114 0.152 0.08 MAIT L2
ENSG00000160094 ZNF362 673742 sc-eQTL 4.46e-01 -0.112 0.146 0.08 MAIT L2
ENSG00000163866 SMIM12 -929521 sc-eQTL 6.09e-01 0.077 0.15 0.08 MAIT L2
ENSG00000004455 AK2 849238 sc-eQTL 6.09e-01 -0.0811 0.158 0.078 NK_CD56bright L2
ENSG00000116514 RNF19B 965549 sc-eQTL 4.18e-01 0.12 0.147 0.078 NK_CD56bright L2
ENSG00000116525 TRIM62 748175 sc-eQTL 7.07e-02 -0.285 0.157 0.078 NK_CD56bright L2
ENSG00000116544 DLGAP3 -999416 sc-eQTL 9.67e-01 0.00645 0.154 0.078 NK_CD56bright L2
ENSG00000134686 PHC2 499182 sc-eQTL 7.74e-01 -0.041 0.143 0.078 NK_CD56bright L2
ENSG00000160094 ZNF362 673742 sc-eQTL 1.60e-01 0.228 0.162 0.078 NK_CD56bright L2
ENSG00000163866 SMIM12 -929521 sc-eQTL 6.48e-01 -0.0773 0.169 0.078 NK_CD56bright L2
ENSG00000004455 AK2 849238 sc-eQTL 4.19e-01 0.106 0.131 0.078 NK_CD56dim L2
ENSG00000116514 RNF19B 965549 sc-eQTL 9.66e-01 -0.00499 0.118 0.078 NK_CD56dim L2
ENSG00000116525 TRIM62 748175 sc-eQTL 6.75e-02 -0.251 0.136 0.078 NK_CD56dim L2
ENSG00000116544 DLGAP3 -999416 sc-eQTL 7.33e-01 0.0503 0.147 0.078 NK_CD56dim L2
ENSG00000134686 PHC2 499182 sc-eQTL 3.37e-01 0.122 0.127 0.078 NK_CD56dim L2
ENSG00000160094 ZNF362 673742 sc-eQTL 7.08e-01 -0.0542 0.144 0.078 NK_CD56dim L2
ENSG00000163866 SMIM12 -929521 sc-eQTL 1.16e-02 0.355 0.14 0.078 NK_CD56dim L2
ENSG00000004455 AK2 849238 sc-eQTL 4.58e-01 0.118 0.159 0.073 NK_HLA L2
ENSG00000116514 RNF19B 965549 sc-eQTL 1.59e-02 0.366 0.15 0.073 NK_HLA L2
ENSG00000116525 TRIM62 748175 sc-eQTL 6.32e-01 0.0773 0.161 0.073 NK_HLA L2
ENSG00000116544 DLGAP3 -999416 sc-eQTL 2.29e-01 -0.178 0.148 0.073 NK_HLA L2
ENSG00000134686 PHC2 499182 sc-eQTL 9.29e-01 -0.0125 0.14 0.073 NK_HLA L2
ENSG00000160094 ZNF362 673742 sc-eQTL 8.86e-01 -0.023 0.161 0.073 NK_HLA L2
ENSG00000163866 SMIM12 -929521 sc-eQTL 2.78e-01 0.171 0.157 0.073 NK_HLA L2
ENSG00000004455 AK2 849238 sc-eQTL 1.85e-01 -0.184 0.138 0.078 NK_cytokine L2
ENSG00000116514 RNF19B 965549 sc-eQTL 9.12e-01 0.014 0.127 0.078 NK_cytokine L2
ENSG00000116525 TRIM62 748175 sc-eQTL 3.51e-01 -0.143 0.153 0.078 NK_cytokine L2
ENSG00000116544 DLGAP3 -999416 sc-eQTL 7.23e-01 -0.0544 0.153 0.078 NK_cytokine L2
ENSG00000134686 PHC2 499182 sc-eQTL 8.65e-01 0.0222 0.131 0.078 NK_cytokine L2
ENSG00000160094 ZNF362 673742 sc-eQTL 1.03e-02 0.366 0.141 0.078 NK_cytokine L2
ENSG00000163866 SMIM12 -929521 sc-eQTL 1.01e-01 0.227 0.138 0.078 NK_cytokine L2
ENSG00000004455 AK2 849238 sc-eQTL 1.20e-01 0.277 0.177 0.085 PB L2
ENSG00000116514 RNF19B 965549 sc-eQTL 6.67e-01 -0.087 0.202 0.085 PB L2
ENSG00000116525 TRIM62 748175 sc-eQTL 4.56e-01 0.148 0.198 0.085 PB L2
ENSG00000116544 DLGAP3 -999416 sc-eQTL 8.80e-01 0.031 0.205 0.085 PB L2
ENSG00000134686 PHC2 499182 sc-eQTL 4.75e-01 -0.142 0.198 0.085 PB L2
ENSG00000160094 ZNF362 673742 sc-eQTL 2.05e-01 0.261 0.205 0.085 PB L2
ENSG00000163866 SMIM12 -929521 sc-eQTL 9.42e-01 -0.0138 0.188 0.085 PB L2
ENSG00000004455 AK2 849238 sc-eQTL 5.42e-01 0.0662 0.108 0.08 Pro_T L2
ENSG00000116514 RNF19B 965549 sc-eQTL 2.46e-01 -0.169 0.145 0.08 Pro_T L2
ENSG00000116525 TRIM62 748175 sc-eQTL 4.68e-01 -0.105 0.144 0.08 Pro_T L2
ENSG00000116544 DLGAP3 -999416 sc-eQTL 4.73e-01 0.0984 0.137 0.08 Pro_T L2
ENSG00000134686 PHC2 499182 sc-eQTL 6.71e-01 -0.0517 0.121 0.08 Pro_T L2
ENSG00000142920 AZIN2 849130 sc-eQTL 7.65e-01 0.0362 0.121 0.08 Pro_T L2
ENSG00000160094 ZNF362 673742 sc-eQTL 2.06e-01 -0.182 0.143 0.08 Pro_T L2
ENSG00000163866 SMIM12 -929521 sc-eQTL 8.43e-01 0.0295 0.149 0.08 Pro_T L2
ENSG00000004455 AK2 849238 sc-eQTL 8.08e-01 0.0342 0.14 0.079 Treg L2
ENSG00000116514 RNF19B 965549 sc-eQTL 5.97e-01 0.0659 0.125 0.079 Treg L2
ENSG00000116525 TRIM62 748175 sc-eQTL 3.15e-01 -0.151 0.15 0.079 Treg L2
ENSG00000116544 DLGAP3 -999416 sc-eQTL 1.38e-01 -0.227 0.152 0.079 Treg L2
ENSG00000134686 PHC2 499182 sc-eQTL 5.57e-01 -0.0796 0.135 0.079 Treg L2
ENSG00000142920 AZIN2 849130 sc-eQTL 8.81e-01 0.0197 0.131 0.079 Treg L2
ENSG00000160094 ZNF362 673742 sc-eQTL 9.07e-01 0.0169 0.143 0.079 Treg L2
ENSG00000163866 SMIM12 -929521 sc-eQTL 6.69e-01 -0.0634 0.148 0.079 Treg L2
ENSG00000004455 AK2 849238 sc-eQTL 6.27e-01 0.076 0.156 0.083 cDC L2
ENSG00000116514 RNF19B 965549 sc-eQTL 2.24e-01 0.174 0.142 0.083 cDC L2
ENSG00000116525 TRIM62 748175 sc-eQTL 4.01e-01 -0.136 0.162 0.083 cDC L2
ENSG00000116544 DLGAP3 -999416 sc-eQTL 4.68e-01 -0.117 0.161 0.083 cDC L2
ENSG00000134686 PHC2 499182 sc-eQTL 1.21e-01 -0.173 0.111 0.083 cDC L2
ENSG00000142920 AZIN2 849130 sc-eQTL 2.15e-01 -0.109 0.0876 0.083 cDC L2
ENSG00000160094 ZNF362 673742 sc-eQTL 9.51e-01 -0.00945 0.153 0.083 cDC L2
ENSG00000163866 SMIM12 -929521 sc-eQTL 5.14e-01 -0.0999 0.153 0.083 cDC L2
ENSG00000004455 AK2 849238 sc-eQTL 3.40e-01 0.125 0.13 0.079 cMono_IL1B L2
ENSG00000116514 RNF19B 965549 sc-eQTL 5.67e-02 -0.174 0.0906 0.079 cMono_IL1B L2
ENSG00000116525 TRIM62 748175 sc-eQTL 5.92e-01 0.0807 0.15 0.079 cMono_IL1B L2
ENSG00000116544 DLGAP3 -999416 sc-eQTL 4.16e-01 -0.126 0.154 0.079 cMono_IL1B L2
ENSG00000134686 PHC2 499182 sc-eQTL 3.75e-01 0.0692 0.0779 0.079 cMono_IL1B L2
ENSG00000160094 ZNF362 673742 sc-eQTL 6.16e-02 -0.256 0.136 0.079 cMono_IL1B L2
ENSG00000163866 SMIM12 -929521 sc-eQTL 1.12e-01 0.189 0.119 0.079 cMono_IL1B L2
ENSG00000004455 AK2 849238 sc-eQTL 1.45e-01 0.194 0.133 0.079 cMono_S100A L2
ENSG00000116514 RNF19B 965549 sc-eQTL 5.22e-01 -0.0689 0.107 0.079 cMono_S100A L2
ENSG00000116525 TRIM62 748175 sc-eQTL 3.97e-01 0.135 0.159 0.079 cMono_S100A L2
ENSG00000116544 DLGAP3 -999416 sc-eQTL 2.71e-01 0.17 0.154 0.079 cMono_S100A L2
ENSG00000134686 PHC2 499182 sc-eQTL 4.44e-01 0.0627 0.0817 0.079 cMono_S100A L2
ENSG00000160094 ZNF362 673742 sc-eQTL 3.20e-01 0.146 0.146 0.079 cMono_S100A L2
ENSG00000163866 SMIM12 -929521 sc-eQTL 9.22e-01 -0.0134 0.136 0.079 cMono_S100A L2
ENSG00000004455 AK2 849238 sc-eQTL 4.40e-01 0.144 0.186 0.076 gdT L2
ENSG00000116514 RNF19B 965549 sc-eQTL 8.28e-01 0.0372 0.171 0.076 gdT L2
ENSG00000116525 TRIM62 748175 sc-eQTL 3.24e-01 0.198 0.2 0.076 gdT L2
ENSG00000116544 DLGAP3 -999416 sc-eQTL 6.39e-01 0.0899 0.191 0.076 gdT L2
ENSG00000134686 PHC2 499182 sc-eQTL 2.42e-01 -0.196 0.167 0.076 gdT L2
ENSG00000142920 AZIN2 849130 sc-eQTL 9.54e-02 -0.286 0.17 0.076 gdT L2
ENSG00000160094 ZNF362 673742 sc-eQTL 6.47e-01 0.0893 0.194 0.076 gdT L2
ENSG00000163866 SMIM12 -929521 sc-eQTL 9.51e-01 0.0123 0.2 0.076 gdT L2
ENSG00000004455 AK2 849238 sc-eQTL 2.69e-01 -0.169 0.152 0.078 intMono L2
ENSG00000116514 RNF19B 965549 sc-eQTL 5.74e-01 -0.0733 0.13 0.078 intMono L2
ENSG00000116525 TRIM62 748175 sc-eQTL 4.44e-01 -0.121 0.157 0.078 intMono L2
ENSG00000116544 DLGAP3 -999416 sc-eQTL 8.14e-01 -0.0358 0.152 0.078 intMono L2
ENSG00000134686 PHC2 499182 sc-eQTL 2.15e-01 -0.112 0.0903 0.078 intMono L2
ENSG00000160094 ZNF362 673742 sc-eQTL 2.59e-01 -0.182 0.161 0.078 intMono L2
ENSG00000163866 SMIM12 -929521 sc-eQTL 3.25e-01 0.153 0.155 0.078 intMono L2
ENSG00000004455 AK2 849238 sc-eQTL 6.59e-02 -0.278 0.15 0.079 ncMono L2
ENSG00000116514 RNF19B 965549 sc-eQTL 9.64e-01 0.00638 0.141 0.079 ncMono L2
ENSG00000116525 TRIM62 748175 sc-eQTL 9.19e-01 -0.0143 0.14 0.079 ncMono L2
ENSG00000116544 DLGAP3 -999416 sc-eQTL 5.36e-03 -0.377 0.134 0.079 ncMono L2
ENSG00000134686 PHC2 499182 sc-eQTL 7.41e-01 -0.0355 0.107 0.079 ncMono L2
ENSG00000160094 ZNF362 673742 sc-eQTL 7.75e-01 -0.0474 0.165 0.079 ncMono L2
ENSG00000163866 SMIM12 -929521 sc-eQTL 9.47e-01 0.00998 0.149 0.079 ncMono L2
ENSG00000004455 AK2 849238 sc-eQTL 6.29e-02 0.31 0.165 0.082 pDC L2
ENSG00000116514 RNF19B 965549 sc-eQTL 7.71e-02 0.297 0.167 0.082 pDC L2
ENSG00000116525 TRIM62 748175 sc-eQTL 4.97e-01 -0.114 0.167 0.082 pDC L2
ENSG00000116544 DLGAP3 -999416 sc-eQTL 1.78e-01 -0.221 0.163 0.082 pDC L2
ENSG00000134686 PHC2 499182 sc-eQTL 5.67e-01 0.0778 0.135 0.082 pDC L2
ENSG00000142920 AZIN2 849130 sc-eQTL 5.54e-01 -0.0694 0.117 0.082 pDC L2
ENSG00000160094 ZNF362 673742 sc-eQTL 3.49e-01 0.137 0.146 0.082 pDC L2
ENSG00000163866 SMIM12 -929521 sc-eQTL 1.25e-01 0.262 0.17 0.082 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000004455 AK2 849238 sc-eQTL 5.87e-02 -0.233 0.123 0.079 B_Memory LOneK1K
ENSG00000116514 RNF19B 965549 sc-eQTL 6.92e-01 -0.0514 0.13 0.079 B_Memory LOneK1K
ENSG00000116525 TRIM62 748175 sc-eQTL 9.51e-01 0.00856 0.14 0.079 B_Memory LOneK1K
ENSG00000116544 DLGAP3 -999416 sc-eQTL 4.94e-01 0.104 0.152 0.079 B_Memory LOneK1K
ENSG00000134686 PHC2 499182 sc-eQTL 9.75e-01 -0.00404 0.127 0.079 B_Memory LOneK1K
ENSG00000160094 ZNF362 673742 sc-eQTL 3.20e-01 -0.143 0.144 0.079 B_Memory LOneK1K
ENSG00000163866 SMIM12 -929521 sc-eQTL 3.99e-02 0.304 0.147 0.079 B_Memory LOneK1K
ENSG00000004455 AK2 849238 sc-eQTL 4.42e-01 0.0789 0.102 0.079 B_Naive LOneK1K
ENSG00000116514 RNF19B 965549 sc-eQTL 7.73e-01 -0.034 0.118 0.079 B_Naive LOneK1K
ENSG00000116525 TRIM62 748175 sc-eQTL 7.36e-01 0.0477 0.142 0.079 B_Naive LOneK1K
ENSG00000116544 DLGAP3 -999416 sc-eQTL 9.26e-01 -0.0145 0.155 0.079 B_Naive LOneK1K
ENSG00000134686 PHC2 499182 sc-eQTL 9.31e-01 -0.0109 0.125 0.079 B_Naive LOneK1K
ENSG00000160094 ZNF362 673742 sc-eQTL 1.78e-01 -0.184 0.136 0.079 B_Naive LOneK1K
ENSG00000163866 SMIM12 -929521 sc-eQTL 1.00e-02 0.368 0.141 0.079 B_Naive LOneK1K
ENSG00000004455 AK2 849238 sc-eQTL 7.62e-02 0.215 0.121 0.079 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000116514 RNF19B 965549 sc-eQTL 1.31e-01 -0.125 0.0825 0.079 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000116525 TRIM62 748175 sc-eQTL 2.07e-01 0.189 0.15 0.079 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000116544 DLGAP3 -999416 sc-eQTL 7.36e-01 -0.0516 0.153 0.079 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000134686 PHC2 499182 sc-eQTL 3.21e-01 0.0763 0.0767 0.079 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000160094 ZNF362 673742 sc-eQTL 2.50e-01 -0.15 0.13 0.079 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000163866 SMIM12 -929521 sc-eQTL 2.31e-01 0.133 0.11 0.079 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000004455 AK2 849238 sc-eQTL 6.29e-02 -0.258 0.138 0.078 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000116514 RNF19B 965549 sc-eQTL 8.96e-01 -0.016 0.122 0.078 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000116525 TRIM62 748175 sc-eQTL 9.00e-01 -0.0179 0.142 0.078 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000116544 DLGAP3 -999416 sc-eQTL 2.20e-01 -0.15 0.122 0.078 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000134686 PHC2 499182 sc-eQTL 9.07e-01 0.0104 0.0891 0.078 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000160094 ZNF362 673742 sc-eQTL 7.06e-01 -0.0544 0.144 0.078 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000163866 SMIM12 -929521 sc-eQTL 3.69e-01 0.121 0.134 0.078 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000004455 AK2 849238 sc-eQTL 9.61e-01 -0.00566 0.115 0.078 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000116514 RNF19B 965549 sc-eQTL 7.75e-01 0.0327 0.114 0.078 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000116525 TRIM62 748175 sc-eQTL 7.37e-02 -0.226 0.126 0.078 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000116544 DLGAP3 -999416 sc-eQTL 8.22e-01 0.0338 0.15 0.078 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000134686 PHC2 499182 sc-eQTL 4.53e-01 0.0879 0.117 0.078 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000160094 ZNF362 673742 sc-eQTL 3.70e-01 0.121 0.135 0.078 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000163866 SMIM12 -929521 sc-eQTL 1.33e-02 0.327 0.131 0.078 NK_CD56dim LOneK1K

Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF
ENSG00000116514 RNF19B 965549 eQTL 0.0487 -0.0552 0.028 0.0 0.0 0.0878
ENSG00000184389 A3GALT2 609136 eQTL 0.0167 -0.117 0.0487 0.0 0.0 0.0878

Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina
ENSG00000184389 A3GALT2 609136 3.92e-07 1.92e-07 7.92e-08 2.36e-07 1.05e-07 1.19e-07 2.95e-07 7.65e-08 2.35e-07 1.37e-07 2.38e-07 1.91e-07 3.4e-07 8.54e-08 7.98e-08 1.17e-07 8.64e-08 2.75e-07 8.93e-08 8.69e-08 1.39e-07 2.24e-07 2e-07 4.81e-08 2.86e-07 2e-07 1.48e-07 1.48e-07 1.54e-07 1.81e-07 1.39e-07 5.32e-08 4.76e-08 1.03e-07 7.55e-08 5.14e-08 5.62e-08 5.8e-08 4.75e-08 7.78e-08 4.84e-08 1.79e-07 3.46e-08 1.43e-08 4.91e-08 1.05e-08 9.1e-08 0.0 4.52e-08