logo

Genes within 1Mb (chr1:33930020:A:G):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD

Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000004455 AK2 849024 sc-eQTL 1.16e-01 -0.0932 0.059 0.241 B L1
ENSG00000116514 RNF19B 965335 sc-eQTL 7.40e-01 -0.0242 0.0728 0.241 B L1
ENSG00000116525 TRIM62 747961 sc-eQTL 8.59e-01 0.0149 0.0838 0.241 B L1
ENSG00000116544 DLGAP3 -999630 sc-eQTL 6.66e-01 -0.0412 0.0951 0.241 B L1
ENSG00000134686 PHC2 498968 sc-eQTL 9.55e-01 -0.00428 0.0763 0.241 B L1
ENSG00000160094 ZNF362 673528 sc-eQTL 7.44e-01 -0.0267 0.0816 0.241 B L1
ENSG00000163866 SMIM12 -929735 sc-eQTL 8.28e-01 -0.0175 0.0807 0.241 B L1
ENSG00000004455 AK2 849024 sc-eQTL 4.66e-01 -0.0345 0.0472 0.241 CD4T L1
ENSG00000116514 RNF19B 965335 sc-eQTL 7.53e-01 0.0163 0.0518 0.241 CD4T L1
ENSG00000116525 TRIM62 747961 sc-eQTL 7.15e-02 0.119 0.0655 0.241 CD4T L1
ENSG00000116544 DLGAP3 -999630 sc-eQTL 4.00e-01 -0.0674 0.0799 0.241 CD4T L1
ENSG00000134686 PHC2 498968 sc-eQTL 4.42e-01 0.0495 0.0642 0.241 CD4T L1
ENSG00000142920 AZIN2 848916 sc-eQTL 1.35e-01 0.13 0.087 0.241 CD4T L1
ENSG00000160094 ZNF362 673528 sc-eQTL 4.69e-01 -0.0501 0.069 0.241 CD4T L1
ENSG00000163866 SMIM12 -929735 sc-eQTL 9.75e-01 -0.00214 0.0673 0.241 CD4T L1
ENSG00000004455 AK2 849024 sc-eQTL 5.75e-01 0.0344 0.0612 0.241 CD8T L1
ENSG00000116514 RNF19B 965335 sc-eQTL 1.94e-01 -0.0736 0.0565 0.241 CD8T L1
ENSG00000116525 TRIM62 747961 sc-eQTL 9.35e-01 -0.00713 0.0869 0.241 CD8T L1
ENSG00000116544 DLGAP3 -999630 sc-eQTL 4.45e-01 -0.0727 0.095 0.241 CD8T L1
ENSG00000134686 PHC2 498968 sc-eQTL 6.65e-01 0.0323 0.0746 0.241 CD8T L1
ENSG00000142920 AZIN2 848916 sc-eQTL 7.77e-01 -0.0241 0.085 0.241 CD8T L1
ENSG00000160094 ZNF362 673528 sc-eQTL 3.27e-02 -0.154 0.0717 0.241 CD8T L1
ENSG00000163866 SMIM12 -929735 sc-eQTL 1.47e-01 -0.115 0.0787 0.241 CD8T L1
ENSG00000004455 AK2 849024 sc-eQTL 6.93e-01 0.0376 0.0951 0.245 DC L1
ENSG00000116514 RNF19B 965335 sc-eQTL 9.03e-01 0.0117 0.096 0.245 DC L1
ENSG00000116525 TRIM62 747961 sc-eQTL 3.11e-01 0.105 0.103 0.245 DC L1
ENSG00000116544 DLGAP3 -999630 sc-eQTL 8.09e-01 0.023 0.0953 0.245 DC L1
ENSG00000134686 PHC2 498968 sc-eQTL 4.32e-02 0.139 0.0684 0.245 DC L1
ENSG00000142920 AZIN2 848916 sc-eQTL 8.06e-01 -0.0137 0.0557 0.245 DC L1
ENSG00000160094 ZNF362 673528 sc-eQTL 8.72e-01 0.0145 0.0898 0.245 DC L1
ENSG00000163866 SMIM12 -929735 sc-eQTL 4.30e-01 -0.0744 0.094 0.245 DC L1
ENSG00000004455 AK2 849024 sc-eQTL 9.96e-01 0.00038 0.0766 0.241 Mono L1
ENSG00000116514 RNF19B 965335 sc-eQTL 2.03e-01 0.0708 0.0554 0.241 Mono L1
ENSG00000116525 TRIM62 747961 sc-eQTL 5.01e-01 0.0629 0.0932 0.241 Mono L1
ENSG00000116544 DLGAP3 -999630 sc-eQTL 8.84e-01 0.0138 0.0942 0.241 Mono L1
ENSG00000134686 PHC2 498968 sc-eQTL 7.72e-01 -0.0145 0.0501 0.241 Mono L1
ENSG00000160094 ZNF362 673528 sc-eQTL 3.17e-01 -0.0828 0.0826 0.241 Mono L1
ENSG00000163866 SMIM12 -929735 sc-eQTL 8.38e-01 -0.0147 0.0715 0.241 Mono L1
ENSG00000004455 AK2 849024 sc-eQTL 6.76e-01 0.03 0.0716 0.242 NK L1
ENSG00000116514 RNF19B 965335 sc-eQTL 2.50e-01 0.0825 0.0714 0.242 NK L1
ENSG00000116525 TRIM62 747961 sc-eQTL 2.87e-01 -0.0865 0.081 0.242 NK L1
ENSG00000116544 DLGAP3 -999630 sc-eQTL 8.45e-01 0.0193 0.0989 0.242 NK L1
ENSG00000134686 PHC2 498968 sc-eQTL 6.29e-01 -0.0366 0.0756 0.242 NK L1
ENSG00000160094 ZNF362 673528 sc-eQTL 6.86e-02 -0.155 0.0845 0.242 NK L1
ENSG00000163866 SMIM12 -929735 sc-eQTL 3.54e-01 -0.0796 0.0858 0.242 NK L1
ENSG00000004455 AK2 849024 sc-eQTL 5.62e-01 0.0318 0.0548 0.241 Other_T L1
ENSG00000116514 RNF19B 965335 sc-eQTL 1.24e-02 -0.183 0.0724 0.241 Other_T L1
ENSG00000116525 TRIM62 747961 sc-eQTL 4.44e-01 0.0736 0.0959 0.241 Other_T L1
ENSG00000116544 DLGAP3 -999630 sc-eQTL 7.28e-01 -0.0356 0.102 0.241 Other_T L1
ENSG00000134686 PHC2 498968 sc-eQTL 3.94e-01 0.0681 0.0798 0.241 Other_T L1
ENSG00000142920 AZIN2 848916 sc-eQTL 2.35e-01 0.117 0.0986 0.241 Other_T L1
ENSG00000160094 ZNF362 673528 sc-eQTL 5.08e-01 -0.0558 0.0843 0.241 Other_T L1
ENSG00000163866 SMIM12 -929735 sc-eQTL 1.39e-01 -0.128 0.0863 0.241 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000004455 AK2 849024 sc-eQTL 4.80e-01 -0.08 0.113 0.247 B_Activated L2
ENSG00000116514 RNF19B 965335 sc-eQTL 9.16e-01 0.0114 0.108 0.247 B_Activated L2
ENSG00000116525 TRIM62 747961 sc-eQTL 4.71e-02 -0.206 0.103 0.247 B_Activated L2
ENSG00000116544 DLGAP3 -999630 sc-eQTL 3.92e-02 -0.179 0.0863 0.247 B_Activated L2
ENSG00000134686 PHC2 498968 sc-eQTL 1.27e-01 -0.159 0.104 0.247 B_Activated L2
ENSG00000160094 ZNF362 673528 sc-eQTL 9.36e-01 -0.0088 0.11 0.247 B_Activated L2
ENSG00000163866 SMIM12 -929735 sc-eQTL 6.59e-01 -0.0503 0.114 0.247 B_Activated L2
ENSG00000004455 AK2 849024 sc-eQTL 1.33e-01 -0.124 0.0823 0.238 B_Intermediate L2
ENSG00000116514 RNF19B 965335 sc-eQTL 5.76e-01 -0.0472 0.0844 0.238 B_Intermediate L2
ENSG00000116525 TRIM62 747961 sc-eQTL 3.85e-01 0.0828 0.095 0.238 B_Intermediate L2
ENSG00000116544 DLGAP3 -999630 sc-eQTL 3.58e-01 0.0876 0.0951 0.238 B_Intermediate L2
ENSG00000134686 PHC2 498968 sc-eQTL 5.31e-01 -0.0522 0.0831 0.238 B_Intermediate L2
ENSG00000160094 ZNF362 673528 sc-eQTL 9.83e-01 -0.002 0.0954 0.238 B_Intermediate L2
ENSG00000163866 SMIM12 -929735 sc-eQTL 4.31e-01 0.0778 0.0986 0.238 B_Intermediate L2
ENSG00000004455 AK2 849024 sc-eQTL 3.32e-01 -0.0994 0.102 0.244 B_Memory L2
ENSG00000116514 RNF19B 965335 sc-eQTL 5.55e-01 -0.0555 0.0938 0.244 B_Memory L2
ENSG00000116525 TRIM62 747961 sc-eQTL 4.36e-01 0.0836 0.107 0.244 B_Memory L2
ENSG00000116544 DLGAP3 -999630 sc-eQTL 6.89e-01 -0.0385 0.0961 0.244 B_Memory L2
ENSG00000134686 PHC2 498968 sc-eQTL 5.24e-01 -0.059 0.0924 0.244 B_Memory L2
ENSG00000160094 ZNF362 673528 sc-eQTL 5.62e-01 -0.0585 0.101 0.244 B_Memory L2
ENSG00000163866 SMIM12 -929735 sc-eQTL 3.01e-01 -0.106 0.102 0.244 B_Memory L2
ENSG00000004455 AK2 849024 sc-eQTL 7.53e-01 0.0213 0.0677 0.241 B_Naive1 L2
ENSG00000116514 RNF19B 965335 sc-eQTL 8.25e-01 0.017 0.0764 0.241 B_Naive1 L2
ENSG00000116525 TRIM62 747961 sc-eQTL 5.64e-01 -0.0552 0.0954 0.241 B_Naive1 L2
ENSG00000116544 DLGAP3 -999630 sc-eQTL 7.20e-01 -0.0346 0.0965 0.241 B_Naive1 L2
ENSG00000134686 PHC2 498968 sc-eQTL 6.27e-01 0.0394 0.0809 0.241 B_Naive1 L2
ENSG00000160094 ZNF362 673528 sc-eQTL 3.86e-01 -0.082 0.0944 0.241 B_Naive1 L2
ENSG00000163866 SMIM12 -929735 sc-eQTL 8.95e-01 0.0125 0.0943 0.241 B_Naive1 L2
ENSG00000004455 AK2 849024 sc-eQTL 9.65e-01 -0.00418 0.0942 0.242 B_Naive2 L2
ENSG00000116514 RNF19B 965335 sc-eQTL 4.32e-01 -0.0801 0.102 0.242 B_Naive2 L2
ENSG00000116525 TRIM62 747961 sc-eQTL 5.47e-01 -0.0634 0.105 0.242 B_Naive2 L2
ENSG00000116544 DLGAP3 -999630 sc-eQTL 9.00e-01 0.0139 0.111 0.242 B_Naive2 L2
ENSG00000134686 PHC2 498968 sc-eQTL 8.46e-01 -0.0179 0.092 0.242 B_Naive2 L2
ENSG00000160094 ZNF362 673528 sc-eQTL 3.56e-01 -0.0922 0.0997 0.242 B_Naive2 L2
ENSG00000163866 SMIM12 -929735 sc-eQTL 7.10e-01 0.0405 0.109 0.242 B_Naive2 L2
ENSG00000004455 AK2 849024 sc-eQTL 1.95e-01 0.132 0.102 0.227 CD4_CTL L2
ENSG00000116514 RNF19B 965335 sc-eQTL 9.48e-01 -0.00646 0.099 0.227 CD4_CTL L2
ENSG00000116525 TRIM62 747961 sc-eQTL 4.72e-01 0.072 0.1 0.227 CD4_CTL L2
ENSG00000116544 DLGAP3 -999630 sc-eQTL 9.83e-01 0.00217 0.0988 0.227 CD4_CTL L2
ENSG00000134686 PHC2 498968 sc-eQTL 5.02e-01 0.0637 0.0947 0.227 CD4_CTL L2
ENSG00000142920 AZIN2 848916 sc-eQTL 4.64e-02 0.193 0.0964 0.227 CD4_CTL L2
ENSG00000160094 ZNF362 673528 sc-eQTL 7.78e-01 0.0283 0.1 0.227 CD4_CTL L2
ENSG00000163866 SMIM12 -929735 sc-eQTL 7.56e-01 -0.0315 0.101 0.227 CD4_CTL L2
ENSG00000004455 AK2 849024 sc-eQTL 2.61e-01 -0.064 0.0569 0.241 CD4_Naive L2
ENSG00000116514 RNF19B 965335 sc-eQTL 1.54e-01 0.0841 0.0588 0.241 CD4_Naive L2
ENSG00000116525 TRIM62 747961 sc-eQTL 1.98e-01 0.0991 0.0767 0.241 CD4_Naive L2
ENSG00000116544 DLGAP3 -999630 sc-eQTL 5.35e-01 -0.0586 0.0942 0.241 CD4_Naive L2
ENSG00000134686 PHC2 498968 sc-eQTL 6.24e-01 -0.0335 0.0682 0.241 CD4_Naive L2
ENSG00000142920 AZIN2 848916 sc-eQTL 1.70e-01 0.128 0.0929 0.241 CD4_Naive L2
ENSG00000160094 ZNF362 673528 sc-eQTL 5.27e-01 -0.046 0.0726 0.241 CD4_Naive L2
ENSG00000163866 SMIM12 -929735 sc-eQTL 9.17e-01 -0.00696 0.0669 0.241 CD4_Naive L2
ENSG00000004455 AK2 849024 sc-eQTL 4.20e-01 -0.0541 0.0671 0.241 CD4_TCM L2
ENSG00000116514 RNF19B 965335 sc-eQTL 7.50e-01 -0.0214 0.0672 0.241 CD4_TCM L2
ENSG00000116525 TRIM62 747961 sc-eQTL 8.22e-01 0.0178 0.079 0.241 CD4_TCM L2
ENSG00000116544 DLGAP3 -999630 sc-eQTL 4.36e-01 -0.0636 0.0815 0.241 CD4_TCM L2
ENSG00000134686 PHC2 498968 sc-eQTL 1.50e-02 0.183 0.0744 0.241 CD4_TCM L2
ENSG00000142920 AZIN2 848916 sc-eQTL 8.13e-01 0.0226 0.0953 0.241 CD4_TCM L2
ENSG00000160094 ZNF362 673528 sc-eQTL 3.07e-01 -0.0819 0.08 0.241 CD4_TCM L2
ENSG00000163866 SMIM12 -929735 sc-eQTL 4.50e-01 0.0646 0.0854 0.241 CD4_TCM L2
ENSG00000004455 AK2 849024 sc-eQTL 8.04e-01 0.021 0.0846 0.241 CD4_TEM L2
ENSG00000116514 RNF19B 965335 sc-eQTL 2.25e-02 0.185 0.0805 0.241 CD4_TEM L2
ENSG00000116525 TRIM62 747961 sc-eQTL 3.62e-01 0.0901 0.0986 0.241 CD4_TEM L2
ENSG00000116544 DLGAP3 -999630 sc-eQTL 9.79e-01 0.00271 0.103 0.241 CD4_TEM L2
ENSG00000134686 PHC2 498968 sc-eQTL 4.11e-01 0.0754 0.0916 0.241 CD4_TEM L2
ENSG00000142920 AZIN2 848916 sc-eQTL 1.00e-01 0.172 0.104 0.241 CD4_TEM L2
ENSG00000160094 ZNF362 673528 sc-eQTL 2.75e-01 -0.11 0.1 0.241 CD4_TEM L2
ENSG00000163866 SMIM12 -929735 sc-eQTL 9.85e-01 -0.00179 0.0966 0.241 CD4_TEM L2
ENSG00000004455 AK2 849024 sc-eQTL 7.55e-01 -0.0257 0.0823 0.241 CD8_CTL L2
ENSG00000116514 RNF19B 965335 sc-eQTL 7.87e-01 0.0209 0.0773 0.241 CD8_CTL L2
ENSG00000116525 TRIM62 747961 sc-eQTL 8.86e-01 0.0132 0.092 0.241 CD8_CTL L2
ENSG00000116544 DLGAP3 -999630 sc-eQTL 9.32e-01 0.00848 0.0996 0.241 CD8_CTL L2
ENSG00000134686 PHC2 498968 sc-eQTL 1.94e-01 -0.107 0.082 0.241 CD8_CTL L2
ENSG00000142920 AZIN2 848916 sc-eQTL 5.05e-02 0.193 0.0984 0.241 CD8_CTL L2
ENSG00000160094 ZNF362 673528 sc-eQTL 8.39e-02 -0.15 0.0864 0.241 CD8_CTL L2
ENSG00000163866 SMIM12 -929735 sc-eQTL 8.69e-02 -0.165 0.0957 0.241 CD8_CTL L2
ENSG00000004455 AK2 849024 sc-eQTL 9.80e-01 -0.00185 0.0745 0.241 CD8_Naive L2
ENSG00000116514 RNF19B 965335 sc-eQTL 8.54e-01 0.0151 0.0818 0.241 CD8_Naive L2
ENSG00000116525 TRIM62 747961 sc-eQTL 9.18e-01 -0.0102 0.0996 0.241 CD8_Naive L2
ENSG00000116544 DLGAP3 -999630 sc-eQTL 2.97e-01 -0.108 0.103 0.241 CD8_Naive L2
ENSG00000134686 PHC2 498968 sc-eQTL 1.75e-01 0.116 0.0852 0.241 CD8_Naive L2
ENSG00000142920 AZIN2 848916 sc-eQTL 3.90e-01 -0.0849 0.0986 0.241 CD8_Naive L2
ENSG00000160094 ZNF362 673528 sc-eQTL 7.35e-01 -0.0306 0.0901 0.241 CD8_Naive L2
ENSG00000163866 SMIM12 -929735 sc-eQTL 2.65e-01 -0.0961 0.086 0.241 CD8_Naive L2
ENSG00000004455 AK2 849024 sc-eQTL 9.32e-01 0.00893 0.104 0.238 CD8_TCM L2
ENSG00000116514 RNF19B 965335 sc-eQTL 1.94e-01 0.131 0.1 0.238 CD8_TCM L2
ENSG00000116525 TRIM62 747961 sc-eQTL 7.76e-01 -0.0327 0.115 0.238 CD8_TCM L2
ENSG00000116544 DLGAP3 -999630 sc-eQTL 9.31e-01 -0.00949 0.109 0.238 CD8_TCM L2
ENSG00000134686 PHC2 498968 sc-eQTL 8.07e-01 0.0219 0.0894 0.238 CD8_TCM L2
ENSG00000142920 AZIN2 848916 sc-eQTL 5.54e-01 -0.0643 0.108 0.238 CD8_TCM L2
ENSG00000160094 ZNF362 673528 sc-eQTL 8.35e-01 0.0223 0.107 0.238 CD8_TCM L2
ENSG00000163866 SMIM12 -929735 sc-eQTL 9.84e-01 -0.00208 0.106 0.238 CD8_TCM L2
ENSG00000004455 AK2 849024 sc-eQTL 4.42e-01 0.082 0.106 0.235 CD8_TEM L2
ENSG00000116514 RNF19B 965335 sc-eQTL 4.71e-01 -0.0767 0.106 0.235 CD8_TEM L2
ENSG00000116525 TRIM62 747961 sc-eQTL 6.67e-01 -0.0475 0.11 0.235 CD8_TEM L2
ENSG00000116544 DLGAP3 -999630 sc-eQTL 6.23e-01 0.0478 0.0971 0.235 CD8_TEM L2
ENSG00000134686 PHC2 498968 sc-eQTL 4.92e-01 -0.071 0.103 0.235 CD8_TEM L2
ENSG00000142920 AZIN2 848916 sc-eQTL 6.75e-01 0.039 0.0928 0.235 CD8_TEM L2
ENSG00000160094 ZNF362 673528 sc-eQTL 1.02e-01 -0.171 0.104 0.235 CD8_TEM L2
ENSG00000163866 SMIM12 -929735 sc-eQTL 7.76e-01 0.0308 0.108 0.235 CD8_TEM L2
ENSG00000004455 AK2 849024 sc-eQTL 8.38e-01 0.0186 0.091 0.24 MAIT L2
ENSG00000116514 RNF19B 965335 sc-eQTL 2.80e-02 -0.185 0.0837 0.24 MAIT L2
ENSG00000116525 TRIM62 747961 sc-eQTL 4.30e-01 0.0832 0.105 0.24 MAIT L2
ENSG00000116544 DLGAP3 -999630 sc-eQTL 2.44e-01 -0.116 0.0991 0.24 MAIT L2
ENSG00000134686 PHC2 498968 sc-eQTL 7.94e-01 0.0229 0.0875 0.24 MAIT L2
ENSG00000142920 AZIN2 848916 sc-eQTL 3.81e-01 0.0885 0.101 0.24 MAIT L2
ENSG00000160094 ZNF362 673528 sc-eQTL 8.92e-01 -0.0132 0.0976 0.24 MAIT L2
ENSG00000163866 SMIM12 -929735 sc-eQTL 3.63e-01 -0.0912 0.1 0.24 MAIT L2
ENSG00000004455 AK2 849024 sc-eQTL 5.49e-01 0.0631 0.105 0.238 NK_CD56bright L2
ENSG00000116514 RNF19B 965335 sc-eQTL 1.38e-01 0.146 0.0977 0.238 NK_CD56bright L2
ENSG00000116525 TRIM62 747961 sc-eQTL 9.17e-01 -0.0109 0.105 0.238 NK_CD56bright L2
ENSG00000116544 DLGAP3 -999630 sc-eQTL 8.51e-01 0.0192 0.102 0.238 NK_CD56bright L2
ENSG00000134686 PHC2 498968 sc-eQTL 2.64e-03 -0.283 0.0929 0.238 NK_CD56bright L2
ENSG00000160094 ZNF362 673528 sc-eQTL 9.01e-01 -0.0135 0.108 0.238 NK_CD56bright L2
ENSG00000163866 SMIM12 -929735 sc-eQTL 8.01e-02 0.197 0.112 0.238 NK_CD56bright L2
ENSG00000004455 AK2 849024 sc-eQTL 9.79e-01 -0.00232 0.0862 0.239 NK_CD56dim L2
ENSG00000116514 RNF19B 965335 sc-eQTL 2.50e-01 0.0895 0.0777 0.239 NK_CD56dim L2
ENSG00000116525 TRIM62 747961 sc-eQTL 9.93e-01 -0.000782 0.0907 0.239 NK_CD56dim L2
ENSG00000116544 DLGAP3 -999630 sc-eQTL 7.16e-01 0.0354 0.0971 0.239 NK_CD56dim L2
ENSG00000134686 PHC2 498968 sc-eQTL 1.86e-01 0.111 0.0834 0.239 NK_CD56dim L2
ENSG00000160094 ZNF362 673528 sc-eQTL 1.95e-02 -0.221 0.094 0.239 NK_CD56dim L2
ENSG00000163866 SMIM12 -929735 sc-eQTL 4.23e-01 -0.0749 0.0933 0.239 NK_CD56dim L2
ENSG00000004455 AK2 849024 sc-eQTL 5.29e-01 0.0677 0.107 0.226 NK_HLA L2
ENSG00000116514 RNF19B 965335 sc-eQTL 5.22e-01 0.066 0.103 0.226 NK_HLA L2
ENSG00000116525 TRIM62 747961 sc-eQTL 4.45e-02 -0.218 0.108 0.226 NK_HLA L2
ENSG00000116544 DLGAP3 -999630 sc-eQTL 2.83e-01 -0.107 0.0998 0.226 NK_HLA L2
ENSG00000134686 PHC2 498968 sc-eQTL 3.96e-01 0.0805 0.0947 0.226 NK_HLA L2
ENSG00000160094 ZNF362 673528 sc-eQTL 6.96e-01 -0.0425 0.109 0.226 NK_HLA L2
ENSG00000163866 SMIM12 -929735 sc-eQTL 3.98e-01 -0.0901 0.106 0.226 NK_HLA L2
ENSG00000004455 AK2 849024 sc-eQTL 5.05e-01 0.0614 0.0919 0.239 NK_cytokine L2
ENSG00000116514 RNF19B 965335 sc-eQTL 5.45e-01 -0.0509 0.0839 0.239 NK_cytokine L2
ENSG00000116525 TRIM62 747961 sc-eQTL 4.16e-01 -0.0828 0.102 0.239 NK_cytokine L2
ENSG00000116544 DLGAP3 -999630 sc-eQTL 7.97e-01 0.0262 0.102 0.239 NK_cytokine L2
ENSG00000134686 PHC2 498968 sc-eQTL 5.50e-01 -0.0518 0.0865 0.239 NK_cytokine L2
ENSG00000160094 ZNF362 673528 sc-eQTL 4.73e-01 -0.0683 0.0951 0.239 NK_cytokine L2
ENSG00000163866 SMIM12 -929735 sc-eQTL 4.99e-01 -0.0622 0.0919 0.239 NK_cytokine L2
ENSG00000004455 AK2 849024 sc-eQTL 4.30e-02 -0.217 0.106 0.27 PB L2
ENSG00000116514 RNF19B 965335 sc-eQTL 5.53e-01 -0.0727 0.122 0.27 PB L2
ENSG00000116525 TRIM62 747961 sc-eQTL 8.78e-01 0.0185 0.12 0.27 PB L2
ENSG00000116544 DLGAP3 -999630 sc-eQTL 8.75e-01 0.0197 0.124 0.27 PB L2
ENSG00000134686 PHC2 498968 sc-eQTL 3.46e-01 0.113 0.12 0.27 PB L2
ENSG00000160094 ZNF362 673528 sc-eQTL 2.69e-01 0.138 0.124 0.27 PB L2
ENSG00000163866 SMIM12 -929735 sc-eQTL 5.06e-01 -0.0758 0.113 0.27 PB L2
ENSG00000004455 AK2 849024 sc-eQTL 2.16e-01 0.0904 0.0728 0.243 Pro_T L2
ENSG00000116514 RNF19B 965335 sc-eQTL 4.11e-01 -0.0807 0.0979 0.243 Pro_T L2
ENSG00000116525 TRIM62 747961 sc-eQTL 3.09e-02 0.208 0.0958 0.243 Pro_T L2
ENSG00000116544 DLGAP3 -999630 sc-eQTL 6.06e-01 0.0476 0.0922 0.243 Pro_T L2
ENSG00000134686 PHC2 498968 sc-eQTL 1.21e-01 0.127 0.0814 0.243 Pro_T L2
ENSG00000142920 AZIN2 848916 sc-eQTL 6.29e-01 -0.0395 0.0816 0.243 Pro_T L2
ENSG00000160094 ZNF362 673528 sc-eQTL 9.33e-01 0.00818 0.097 0.243 Pro_T L2
ENSG00000163866 SMIM12 -929735 sc-eQTL 5.26e-01 0.0637 0.1 0.243 Pro_T L2
ENSG00000004455 AK2 849024 sc-eQTL 6.93e-01 -0.0364 0.0922 0.241 Treg L2
ENSG00000116514 RNF19B 965335 sc-eQTL 3.24e-01 -0.0807 0.0816 0.241 Treg L2
ENSG00000116525 TRIM62 747961 sc-eQTL 9.29e-01 -0.00873 0.0985 0.241 Treg L2
ENSG00000116544 DLGAP3 -999630 sc-eQTL 7.50e-01 0.032 0.1 0.241 Treg L2
ENSG00000134686 PHC2 498968 sc-eQTL 6.27e-01 0.0433 0.0888 0.241 Treg L2
ENSG00000142920 AZIN2 848916 sc-eQTL 2.82e-01 0.0929 0.0861 0.241 Treg L2
ENSG00000160094 ZNF362 673528 sc-eQTL 3.78e-01 -0.0831 0.0939 0.241 Treg L2
ENSG00000163866 SMIM12 -929735 sc-eQTL 7.62e-01 -0.0294 0.0971 0.241 Treg L2
ENSG00000004455 AK2 849024 sc-eQTL 5.81e-01 0.0568 0.103 0.246 cDC L2
ENSG00000116514 RNF19B 965335 sc-eQTL 8.87e-01 -0.0133 0.0941 0.246 cDC L2
ENSG00000116525 TRIM62 747961 sc-eQTL 1.87e-01 0.141 0.106 0.246 cDC L2
ENSG00000116544 DLGAP3 -999630 sc-eQTL 9.84e-01 0.00217 0.106 0.246 cDC L2
ENSG00000134686 PHC2 498968 sc-eQTL 2.15e-02 0.168 0.0723 0.246 cDC L2
ENSG00000142920 AZIN2 848916 sc-eQTL 8.27e-01 -0.0127 0.0578 0.246 cDC L2
ENSG00000160094 ZNF362 673528 sc-eQTL 7.23e-01 -0.0358 0.101 0.246 cDC L2
ENSG00000163866 SMIM12 -929735 sc-eQTL 6.51e-01 0.0456 0.1 0.246 cDC L2
ENSG00000004455 AK2 849024 sc-eQTL 6.83e-01 0.0348 0.0852 0.241 cMono_IL1B L2
ENSG00000116514 RNF19B 965335 sc-eQTL 6.07e-01 0.0307 0.0596 0.241 cMono_IL1B L2
ENSG00000116525 TRIM62 747961 sc-eQTL 9.29e-01 -0.00871 0.0982 0.241 cMono_IL1B L2
ENSG00000116544 DLGAP3 -999630 sc-eQTL 3.53e-01 0.0935 0.1 0.241 cMono_IL1B L2
ENSG00000134686 PHC2 498968 sc-eQTL 6.40e-01 -0.0238 0.0509 0.241 cMono_IL1B L2
ENSG00000160094 ZNF362 673528 sc-eQTL 5.63e-01 -0.0519 0.0897 0.241 cMono_IL1B L2
ENSG00000163866 SMIM12 -929735 sc-eQTL 1.94e-01 -0.101 0.0775 0.241 cMono_IL1B L2
ENSG00000004455 AK2 849024 sc-eQTL 1.07e-01 -0.141 0.0871 0.241 cMono_S100A L2
ENSG00000116514 RNF19B 965335 sc-eQTL 6.18e-01 0.0352 0.0705 0.241 cMono_S100A L2
ENSG00000116525 TRIM62 747961 sc-eQTL 2.42e-01 0.122 0.104 0.241 cMono_S100A L2
ENSG00000116544 DLGAP3 -999630 sc-eQTL 2.83e-01 -0.109 0.101 0.241 cMono_S100A L2
ENSG00000134686 PHC2 498968 sc-eQTL 7.35e-01 -0.0182 0.0537 0.241 cMono_S100A L2
ENSG00000160094 ZNF362 673528 sc-eQTL 6.69e-01 0.0412 0.0961 0.241 cMono_S100A L2
ENSG00000163866 SMIM12 -929735 sc-eQTL 2.22e-01 0.109 0.089 0.241 cMono_S100A L2
ENSG00000004455 AK2 849024 sc-eQTL 6.45e-01 0.0606 0.131 0.218 gdT L2
ENSG00000116514 RNF19B 965335 sc-eQTL 8.71e-01 -0.0196 0.12 0.218 gdT L2
ENSG00000116525 TRIM62 747961 sc-eQTL 4.15e-01 -0.115 0.141 0.218 gdT L2
ENSG00000116544 DLGAP3 -999630 sc-eQTL 7.92e-01 0.0356 0.135 0.218 gdT L2
ENSG00000134686 PHC2 498968 sc-eQTL 3.68e-01 -0.106 0.118 0.218 gdT L2
ENSG00000142920 AZIN2 848916 sc-eQTL 3.94e-01 0.103 0.121 0.218 gdT L2
ENSG00000160094 ZNF362 673528 sc-eQTL 1.38e-01 -0.203 0.136 0.218 gdT L2
ENSG00000163866 SMIM12 -929735 sc-eQTL 4.51e-02 -0.28 0.139 0.218 gdT L2
ENSG00000004455 AK2 849024 sc-eQTL 4.20e-01 0.0811 0.1 0.249 intMono L2
ENSG00000116514 RNF19B 965335 sc-eQTL 7.01e-01 0.033 0.0858 0.249 intMono L2
ENSG00000116525 TRIM62 747961 sc-eQTL 4.89e-01 -0.0719 0.104 0.249 intMono L2
ENSG00000116544 DLGAP3 -999630 sc-eQTL 5.37e-01 0.0618 0.0998 0.249 intMono L2
ENSG00000134686 PHC2 498968 sc-eQTL 8.60e-01 -0.0105 0.0597 0.249 intMono L2
ENSG00000160094 ZNF362 673528 sc-eQTL 3.49e-01 -0.0997 0.106 0.249 intMono L2
ENSG00000163866 SMIM12 -929735 sc-eQTL 7.96e-01 0.0264 0.102 0.249 intMono L2
ENSG00000004455 AK2 849024 sc-eQTL 4.38e-01 -0.0759 0.0976 0.251 ncMono L2
ENSG00000116514 RNF19B 965335 sc-eQTL 4.08e-01 0.0754 0.0909 0.251 ncMono L2
ENSG00000116525 TRIM62 747961 sc-eQTL 8.96e-01 0.0119 0.0906 0.251 ncMono L2
ENSG00000116544 DLGAP3 -999630 sc-eQTL 5.48e-01 -0.0529 0.0879 0.251 ncMono L2
ENSG00000134686 PHC2 498968 sc-eQTL 3.97e-01 0.0587 0.0691 0.251 ncMono L2
ENSG00000160094 ZNF362 673528 sc-eQTL 1.00e-02 -0.272 0.105 0.251 ncMono L2
ENSG00000163866 SMIM12 -929735 sc-eQTL 8.40e-01 0.0195 0.0961 0.251 ncMono L2
ENSG00000004455 AK2 849024 sc-eQTL 1.83e-01 -0.157 0.118 0.232 pDC L2
ENSG00000116514 RNF19B 965335 sc-eQTL 4.44e-01 -0.0912 0.119 0.232 pDC L2
ENSG00000116525 TRIM62 747961 sc-eQTL 8.02e-01 0.0296 0.118 0.232 pDC L2
ENSG00000116544 DLGAP3 -999630 sc-eQTL 4.89e-01 0.0804 0.116 0.232 pDC L2
ENSG00000134686 PHC2 498968 sc-eQTL 3.45e-01 0.0904 0.0955 0.232 pDC L2
ENSG00000142920 AZIN2 848916 sc-eQTL 5.23e-01 0.053 0.0827 0.232 pDC L2
ENSG00000160094 ZNF362 673528 sc-eQTL 3.97e-01 0.0875 0.103 0.232 pDC L2
ENSG00000163866 SMIM12 -929735 sc-eQTL 9.56e-01 -0.00663 0.121 0.232 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000004455 AK2 849024 sc-eQTL 6.42e-02 -0.15 0.0808 0.241 B_Memory LOneK1K
ENSG00000116514 RNF19B 965335 sc-eQTL 3.95e-01 -0.0727 0.0853 0.241 B_Memory LOneK1K
ENSG00000116525 TRIM62 747961 sc-eQTL 5.29e-01 0.0581 0.0921 0.241 B_Memory LOneK1K
ENSG00000116544 DLGAP3 -999630 sc-eQTL 6.06e-01 -0.0516 0.0999 0.241 B_Memory LOneK1K
ENSG00000134686 PHC2 498968 sc-eQTL 3.90e-01 -0.072 0.0835 0.241 B_Memory LOneK1K
ENSG00000160094 ZNF362 673528 sc-eQTL 8.13e-01 0.0224 0.0946 0.241 B_Memory LOneK1K
ENSG00000163866 SMIM12 -929735 sc-eQTL 8.07e-01 0.0239 0.0975 0.241 B_Memory LOneK1K
ENSG00000004455 AK2 849024 sc-eQTL 7.04e-01 0.0257 0.0676 0.241 B_Naive LOneK1K
ENSG00000116514 RNF19B 965335 sc-eQTL 9.06e-01 -0.00922 0.0776 0.241 B_Naive LOneK1K
ENSG00000116525 TRIM62 747961 sc-eQTL 6.23e-01 -0.0459 0.0933 0.241 B_Naive LOneK1K
ENSG00000116544 DLGAP3 -999630 sc-eQTL 9.97e-01 -0.000407 0.102 0.241 B_Naive LOneK1K
ENSG00000134686 PHC2 498968 sc-eQTL 6.16e-01 0.0412 0.0821 0.241 B_Naive LOneK1K
ENSG00000160094 ZNF362 673528 sc-eQTL 2.36e-01 -0.107 0.0898 0.241 B_Naive LOneK1K
ENSG00000163866 SMIM12 -929735 sc-eQTL 8.23e-01 0.0212 0.0947 0.241 B_Naive LOneK1K
ENSG00000004455 AK2 849024 sc-eQTL 5.56e-01 -0.0465 0.0789 0.241 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000116514 RNF19B 965335 sc-eQTL 1.92e-01 0.0703 0.0537 0.241 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000116525 TRIM62 747961 sc-eQTL 6.99e-01 0.0378 0.0976 0.241 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000116544 DLGAP3 -999630 sc-eQTL 9.21e-01 0.00982 0.0995 0.241 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000134686 PHC2 498968 sc-eQTL 5.72e-01 -0.0282 0.0499 0.241 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000160094 ZNF362 673528 sc-eQTL 6.48e-01 -0.0388 0.0848 0.241 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000163866 SMIM12 -929735 sc-eQTL 6.41e-01 -0.0335 0.0719 0.241 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000004455 AK2 849024 sc-eQTL 7.83e-01 0.0252 0.0915 0.244 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000116514 RNF19B 965335 sc-eQTL 2.60e-01 0.0907 0.0802 0.244 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000116525 TRIM62 747961 sc-eQTL 9.78e-01 0.00255 0.0933 0.244 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000116544 DLGAP3 -999630 sc-eQTL 7.39e-01 0.0269 0.0806 0.244 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000134686 PHC2 498968 sc-eQTL 4.02e-01 0.0491 0.0585 0.244 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000160094 ZNF362 673528 sc-eQTL 1.07e-02 -0.24 0.0933 0.244 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000163866 SMIM12 -929735 sc-eQTL 8.35e-01 0.0184 0.0885 0.244 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000004455 AK2 849024 sc-eQTL 8.79e-01 -0.0115 0.0755 0.239 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000116514 RNF19B 965335 sc-eQTL 5.34e-01 0.0468 0.075 0.239 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000116525 TRIM62 747961 sc-eQTL 2.46e-01 -0.0968 0.0832 0.239 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000116544 DLGAP3 -999630 sc-eQTL 7.55e-01 0.0308 0.0988 0.239 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000134686 PHC2 498968 sc-eQTL 7.40e-01 0.0256 0.077 0.239 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000160094 ZNF362 673528 sc-eQTL 5.52e-02 -0.17 0.088 0.239 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000163866 SMIM12 -929735 sc-eQTL 1.78e-01 -0.118 0.087 0.239 NK_CD56dim LOneK1K

Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF
ENSG00000163866 SMIM12 -929735 eQTL 0.021 -0.0756 0.0327 0.0 0.0 0.207

Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina
ENSG00000116525 \N 747961 2.95e-07 1.53e-07 5.93e-08 2.22e-07 9.8e-08 8.33e-08 1.81e-07 5.75e-08 1.5e-07 6.75e-08 1.59e-07 1.19e-07 2.05e-07 8e-08 5.43e-08 7.89e-08 4.45e-08 1.56e-07 7.18e-08 5.46e-08 1.22e-07 1.31e-07 1.58e-07 3.22e-08 1.85e-07 1.23e-07 1.17e-07 1.12e-07 1.31e-07 1.07e-07 1.06e-07 3.84e-08 3.46e-08 9.52e-08 3.51e-08 3.07e-08 3.7e-08 8.25e-08 6.39e-08 4.08e-08 5.59e-08 1.5e-07 4.76e-08 1.09e-08 3.41e-08 1.19e-08 8.74e-08 2.1e-09 4.69e-08