logo

Genes within 1Mb (chr1:30932796:G:A):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD

Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000060688 SNRNP40 -363992 sc-eQTL 9.86e-01 -0.00146 0.0832 0.284 B L1
ENSG00000121766 ZCCHC17 -364186 sc-eQTL 7.90e-01 0.0178 0.0666 0.284 B L1
ENSG00000134644 PUM1 -133195 sc-eQTL 1.11e-01 -0.0888 0.0556 0.284 B L1
ENSG00000162510 MATN1 209211 sc-eQTL 3.75e-01 0.0521 0.0587 0.284 B L1
ENSG00000162511 LAPTM5 175022 sc-eQTL 8.51e-01 0.00867 0.046 0.284 B L1
ENSG00000162517 PEF1 -712100 sc-eQTL 4.01e-01 0.0584 0.0694 0.284 B L1
ENSG00000186056 MATN1-AS1 214292 sc-eQTL 7.23e-02 0.0967 0.0535 0.284 B L1
ENSG00000287510 AL137857.1 201103 sc-eQTL 4.03e-01 -0.0534 0.0637 0.284 B L1
ENSG00000060688 SNRNP40 -363992 sc-eQTL 7.12e-01 -0.0265 0.0716 0.284 CD4T L1
ENSG00000121766 ZCCHC17 -364186 sc-eQTL 2.22e-01 0.0682 0.0557 0.284 CD4T L1
ENSG00000134644 PUM1 -133195 sc-eQTL 4.77e-01 -0.0354 0.0497 0.284 CD4T L1
ENSG00000162511 LAPTM5 175022 sc-eQTL 1.66e-01 -0.0764 0.0549 0.284 CD4T L1
ENSG00000162517 PEF1 -712100 sc-eQTL 4.87e-01 -0.0401 0.0576 0.284 CD4T L1
ENSG00000186056 MATN1-AS1 214292 sc-eQTL 2.87e-02 0.107 0.0488 0.284 CD4T L1
ENSG00000287510 AL137857.1 201103 sc-eQTL 7.54e-01 -0.0185 0.0591 0.284 CD4T L1
ENSG00000060688 SNRNP40 -363992 sc-eQTL 8.83e-01 0.0139 0.0941 0.284 CD8T L1
ENSG00000121766 ZCCHC17 -364186 sc-eQTL 6.36e-01 0.0296 0.0626 0.284 CD8T L1
ENSG00000134644 PUM1 -133195 sc-eQTL 1.89e-01 -0.0724 0.0549 0.284 CD8T L1
ENSG00000162511 LAPTM5 175022 sc-eQTL 5.13e-02 -0.104 0.0531 0.284 CD8T L1
ENSG00000162517 PEF1 -712100 sc-eQTL 1.11e-01 -0.105 0.0656 0.284 CD8T L1
ENSG00000186056 MATN1-AS1 214292 sc-eQTL 6.79e-01 -0.026 0.0627 0.284 CD8T L1
ENSG00000287510 AL137857.1 201103 sc-eQTL 2.11e-02 0.181 0.0779 0.284 CD8T L1
ENSG00000060688 SNRNP40 -363992 sc-eQTL 4.65e-01 0.062 0.0847 0.275 DC L1
ENSG00000121766 ZCCHC17 -364186 sc-eQTL 3.84e-01 0.0874 0.1 0.275 DC L1
ENSG00000134644 PUM1 -133195 sc-eQTL 7.93e-01 -0.0207 0.0786 0.275 DC L1
ENSG00000162511 LAPTM5 175022 sc-eQTL 1.96e-01 -0.0726 0.0559 0.275 DC L1
ENSG00000162517 PEF1 -712100 sc-eQTL 6.26e-01 0.0444 0.091 0.275 DC L1
ENSG00000168528 SERINC2 -476769 sc-eQTL 5.52e-01 -0.0551 0.0925 0.275 DC L1
ENSG00000284543 LINC01226 -573430 sc-eQTL 8.52e-01 0.0115 0.0613 0.275 DC L1
ENSG00000287510 AL137857.1 201103 sc-eQTL 8.69e-01 0.0146 0.0888 0.275 DC L1
ENSG00000060688 SNRNP40 -363992 sc-eQTL 3.56e-01 0.0604 0.0654 0.284 Mono L1
ENSG00000121766 ZCCHC17 -364186 sc-eQTL 8.89e-01 -0.0113 0.0812 0.284 Mono L1
ENSG00000134644 PUM1 -133195 sc-eQTL 3.44e-01 -0.0492 0.0519 0.284 Mono L1
ENSG00000162511 LAPTM5 175022 sc-eQTL 3.38e-01 -0.0459 0.0478 0.284 Mono L1
ENSG00000162512 SDC3 24038 sc-eQTL 5.16e-02 0.178 0.0912 0.284 Mono L1
ENSG00000162517 PEF1 -712100 sc-eQTL 7.72e-01 0.0187 0.0645 0.284 Mono L1
ENSG00000168528 SERINC2 -476769 sc-eQTL 6.30e-01 -0.0477 0.0987 0.284 Mono L1
ENSG00000284543 LINC01226 -573430 sc-eQTL 7.24e-02 -0.156 0.0863 0.284 Mono L1
ENSG00000287510 AL137857.1 201103 sc-eQTL 6.18e-02 -0.142 0.0754 0.284 Mono L1
ENSG00000060688 SNRNP40 -363992 sc-eQTL 5.91e-02 -0.171 0.0904 0.283 NK L1
ENSG00000121753 ADGRB2 -832097 sc-eQTL 6.53e-01 -0.0353 0.0784 0.283 NK L1
ENSG00000121766 ZCCHC17 -364186 sc-eQTL 5.93e-03 0.17 0.0613 0.283 NK L1
ENSG00000134644 PUM1 -133195 sc-eQTL 1.06e-01 -0.105 0.065 0.283 NK L1
ENSG00000162511 LAPTM5 175022 sc-eQTL 3.96e-01 -0.0639 0.0752 0.283 NK L1
ENSG00000162517 PEF1 -712100 sc-eQTL 8.54e-01 -0.0101 0.055 0.283 NK L1
ENSG00000186056 MATN1-AS1 214292 sc-eQTL 8.75e-01 0.0133 0.0846 0.283 NK L1
ENSG00000287510 AL137857.1 201103 sc-eQTL 4.23e-01 -0.0626 0.078 0.283 NK L1
ENSG00000060688 SNRNP40 -363992 sc-eQTL 5.43e-01 -0.0416 0.0684 0.284 Other_T L1
ENSG00000121766 ZCCHC17 -364186 sc-eQTL 4.92e-02 0.143 0.0725 0.284 Other_T L1
ENSG00000134644 PUM1 -133195 sc-eQTL 2.85e-01 -0.0703 0.0656 0.284 Other_T L1
ENSG00000162511 LAPTM5 175022 sc-eQTL 2.52e-01 -0.0617 0.0537 0.284 Other_T L1
ENSG00000162517 PEF1 -712100 sc-eQTL 4.53e-01 -0.0541 0.0719 0.284 Other_T L1
ENSG00000186056 MATN1-AS1 214292 sc-eQTL 3.10e-01 0.0897 0.0881 0.284 Other_T L1
ENSG00000287510 AL137857.1 201103 sc-eQTL 8.50e-01 -0.0174 0.0919 0.284 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000060688 SNRNP40 -363992 sc-eQTL 1.92e-01 -0.148 0.113 0.291 B_Activated L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -364186 sc-eQTL 4.60e-01 0.0844 0.114 0.291 B_Activated L2
ENSG00000134644 PUM1 -133195 sc-eQTL 2.21e-01 0.13 0.106 0.291 B_Activated L2
ENSG00000162510 MATN1 209211 sc-eQTL 6.66e-01 -0.0401 0.0927 0.291 B_Activated L2
ENSG00000162511 LAPTM5 175022 sc-eQTL 2.37e-01 -0.0764 0.0644 0.291 B_Activated L2
ENSG00000162517 PEF1 -712100 sc-eQTL 5.09e-02 0.214 0.109 0.291 B_Activated L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 214292 sc-eQTL 9.28e-01 0.00941 0.104 0.291 B_Activated L2
ENSG00000287510 AL137857.1 201103 sc-eQTL 4.77e-01 -0.0658 0.0923 0.291 B_Activated L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -363992 sc-eQTL 5.32e-01 -0.0665 0.106 0.281 B_Intermediate L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -364186 sc-eQTL 4.96e-01 0.0603 0.0886 0.281 B_Intermediate L2
ENSG00000134644 PUM1 -133195 sc-eQTL 8.59e-01 0.0148 0.0836 0.281 B_Intermediate L2
ENSG00000162510 MATN1 209211 sc-eQTL 7.09e-02 0.157 0.0864 0.281 B_Intermediate L2
ENSG00000162511 LAPTM5 175022 sc-eQTL 6.34e-01 0.0254 0.0534 0.281 B_Intermediate L2
ENSG00000162517 PEF1 -712100 sc-eQTL 3.24e-01 -0.0979 0.099 0.281 B_Intermediate L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 214292 sc-eQTL 9.52e-01 -0.00455 0.075 0.281 B_Intermediate L2
ENSG00000287510 AL137857.1 201103 sc-eQTL 8.99e-01 0.0107 0.0839 0.281 B_Intermediate L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -363992 sc-eQTL 9.09e-01 0.0116 0.101 0.282 B_Memory L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -364186 sc-eQTL 4.43e-01 0.0715 0.0931 0.282 B_Memory L2
ENSG00000134644 PUM1 -133195 sc-eQTL 6.84e-02 -0.147 0.0805 0.282 B_Memory L2
ENSG00000162510 MATN1 209211 sc-eQTL 6.86e-01 -0.0315 0.0776 0.282 B_Memory L2
ENSG00000162511 LAPTM5 175022 sc-eQTL 3.33e-01 0.0666 0.0686 0.282 B_Memory L2
ENSG00000162517 PEF1 -712100 sc-eQTL 8.12e-01 0.0218 0.0919 0.282 B_Memory L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 214292 sc-eQTL 1.91e-01 -0.103 0.0784 0.282 B_Memory L2
ENSG00000287510 AL137857.1 201103 sc-eQTL 5.93e-01 -0.0494 0.0921 0.282 B_Memory L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -363992 sc-eQTL 3.68e-01 -0.0825 0.0914 0.284 B_Naive1 L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -364186 sc-eQTL 5.55e-01 0.0467 0.079 0.284 B_Naive1 L2
ENSG00000134644 PUM1 -133195 sc-eQTL 4.73e-02 -0.138 0.0691 0.284 B_Naive1 L2
ENSG00000162510 MATN1 209211 sc-eQTL 5.46e-01 0.0428 0.0707 0.284 B_Naive1 L2
ENSG00000162511 LAPTM5 175022 sc-eQTL 2.81e-01 -0.051 0.0471 0.284 B_Naive1 L2
ENSG00000162517 PEF1 -712100 sc-eQTL 6.08e-01 0.0428 0.0833 0.284 B_Naive1 L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 214292 sc-eQTL 6.67e-02 0.114 0.0616 0.284 B_Naive1 L2
ENSG00000287510 AL137857.1 201103 sc-eQTL 8.86e-01 0.011 0.0767 0.284 B_Naive1 L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -363992 sc-eQTL 2.17e-02 0.223 0.0963 0.283 B_Naive2 L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -364186 sc-eQTL 6.98e-01 0.0312 0.0804 0.283 B_Naive2 L2
ENSG00000134644 PUM1 -133195 sc-eQTL 8.75e-01 -0.0124 0.0787 0.283 B_Naive2 L2
ENSG00000162510 MATN1 209211 sc-eQTL 3.80e-01 -0.0664 0.0755 0.283 B_Naive2 L2
ENSG00000162511 LAPTM5 175022 sc-eQTL 5.35e-01 -0.0319 0.0513 0.283 B_Naive2 L2
ENSG00000162517 PEF1 -712100 sc-eQTL 1.69e-01 0.128 0.093 0.283 B_Naive2 L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 214292 sc-eQTL 9.47e-01 0.00496 0.0748 0.283 B_Naive2 L2
ENSG00000287510 AL137857.1 201103 sc-eQTL 1.51e-02 -0.195 0.0796 0.283 B_Naive2 L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -363992 sc-eQTL 8.62e-01 0.0167 0.0959 0.291 CD4_CTL L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -364186 sc-eQTL 6.86e-01 -0.0382 0.0942 0.291 CD4_CTL L2
ENSG00000134644 PUM1 -133195 sc-eQTL 8.20e-01 -0.0211 0.0925 0.291 CD4_CTL L2
ENSG00000162511 LAPTM5 175022 sc-eQTL 8.26e-01 -0.0182 0.0824 0.291 CD4_CTL L2
ENSG00000162517 PEF1 -712100 sc-eQTL 9.18e-01 -0.00867 0.0845 0.291 CD4_CTL L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 214292 sc-eQTL 1.50e-03 0.283 0.0879 0.291 CD4_CTL L2
ENSG00000287510 AL137857.1 201103 sc-eQTL 7.19e-01 -0.0287 0.0795 0.291 CD4_CTL L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -363992 sc-eQTL 8.23e-01 -0.0168 0.0752 0.284 CD4_Naive L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -364186 sc-eQTL 2.94e-01 0.07 0.0665 0.284 CD4_Naive L2
ENSG00000134644 PUM1 -133195 sc-eQTL 7.85e-01 0.0145 0.0532 0.284 CD4_Naive L2
ENSG00000162511 LAPTM5 175022 sc-eQTL 1.29e-01 -0.0865 0.0567 0.284 CD4_Naive L2
ENSG00000162517 PEF1 -712100 sc-eQTL 6.79e-01 -0.0259 0.0625 0.284 CD4_Naive L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 214292 sc-eQTL 2.79e-02 0.127 0.0572 0.284 CD4_Naive L2
ENSG00000287510 AL137857.1 201103 sc-eQTL 7.30e-01 -0.023 0.0665 0.284 CD4_Naive L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -363992 sc-eQTL 8.81e-01 0.014 0.0933 0.284 CD4_TCM L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -364186 sc-eQTL 3.78e-01 -0.0663 0.0751 0.284 CD4_TCM L2
ENSG00000134644 PUM1 -133195 sc-eQTL 2.22e-02 -0.151 0.0657 0.284 CD4_TCM L2
ENSG00000162511 LAPTM5 175022 sc-eQTL 4.62e-01 -0.0406 0.0552 0.284 CD4_TCM L2
ENSG00000162517 PEF1 -712100 sc-eQTL 4.22e-01 -0.0595 0.0739 0.284 CD4_TCM L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 214292 sc-eQTL 2.01e-01 0.0895 0.0698 0.284 CD4_TCM L2
ENSG00000287510 AL137857.1 201103 sc-eQTL 1.25e-01 -0.119 0.0776 0.284 CD4_TCM L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -363992 sc-eQTL 1.34e-01 -0.139 0.0926 0.284 CD4_TEM L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -364186 sc-eQTL 2.65e-01 0.0989 0.0884 0.284 CD4_TEM L2
ENSG00000134644 PUM1 -133195 sc-eQTL 5.37e-02 -0.142 0.0732 0.284 CD4_TEM L2
ENSG00000162511 LAPTM5 175022 sc-eQTL 9.89e-02 -0.123 0.0743 0.284 CD4_TEM L2
ENSG00000162517 PEF1 -712100 sc-eQTL 8.42e-01 0.0168 0.0837 0.284 CD4_TEM L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 214292 sc-eQTL 9.33e-01 0.00734 0.0874 0.284 CD4_TEM L2
ENSG00000287510 AL137857.1 201103 sc-eQTL 8.18e-01 -0.0198 0.0861 0.284 CD4_TEM L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -363992 sc-eQTL 8.99e-01 -0.0129 0.102 0.284 CD8_CTL L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -364186 sc-eQTL 5.81e-02 -0.148 0.0777 0.284 CD8_CTL L2
ENSG00000134644 PUM1 -133195 sc-eQTL 4.67e-01 -0.0554 0.076 0.284 CD8_CTL L2
ENSG00000162511 LAPTM5 175022 sc-eQTL 4.15e-03 -0.24 0.0827 0.284 CD8_CTL L2
ENSG00000162517 PEF1 -712100 sc-eQTL 6.24e-01 -0.036 0.0734 0.284 CD8_CTL L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 214292 sc-eQTL 1.86e-01 0.117 0.0883 0.284 CD8_CTL L2
ENSG00000287510 AL137857.1 201103 sc-eQTL 4.70e-01 0.0603 0.0833 0.284 CD8_CTL L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -363992 sc-eQTL 5.22e-01 0.0599 0.0934 0.284 CD8_Naive L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -364186 sc-eQTL 1.96e-01 0.104 0.0803 0.284 CD8_Naive L2
ENSG00000134644 PUM1 -133195 sc-eQTL 8.91e-01 -0.00894 0.0649 0.284 CD8_Naive L2
ENSG00000162511 LAPTM5 175022 sc-eQTL 2.78e-02 -0.136 0.0615 0.284 CD8_Naive L2
ENSG00000162517 PEF1 -712100 sc-eQTL 9.79e-02 -0.143 0.0859 0.284 CD8_Naive L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 214292 sc-eQTL 4.79e-01 -0.055 0.0776 0.284 CD8_Naive L2
ENSG00000287510 AL137857.1 201103 sc-eQTL 4.52e-01 0.0636 0.0844 0.284 CD8_Naive L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -363992 sc-eQTL 1.16e-01 0.174 0.11 0.28 CD8_TCM L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -364186 sc-eQTL 4.01e-01 0.0852 0.101 0.28 CD8_TCM L2
ENSG00000134644 PUM1 -133195 sc-eQTL 5.87e-01 -0.0518 0.0952 0.28 CD8_TCM L2
ENSG00000162511 LAPTM5 175022 sc-eQTL 2.38e-01 -0.118 0.0994 0.28 CD8_TCM L2
ENSG00000162517 PEF1 -712100 sc-eQTL 5.86e-02 -0.192 0.101 0.28 CD8_TCM L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 214292 sc-eQTL 9.11e-01 -0.0104 0.0923 0.28 CD8_TCM L2
ENSG00000287510 AL137857.1 201103 sc-eQTL 6.12e-01 0.0474 0.0933 0.28 CD8_TCM L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -363992 sc-eQTL 2.53e-01 -0.114 0.0994 0.29 CD8_TEM L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -364186 sc-eQTL 6.66e-01 0.0413 0.0956 0.29 CD8_TEM L2
ENSG00000134644 PUM1 -133195 sc-eQTL 3.27e-01 -0.0957 0.0975 0.29 CD8_TEM L2
ENSG00000162511 LAPTM5 175022 sc-eQTL 4.97e-02 -0.18 0.091 0.29 CD8_TEM L2
ENSG00000162517 PEF1 -712100 sc-eQTL 5.42e-01 -0.0528 0.0865 0.29 CD8_TEM L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 214292 sc-eQTL 8.29e-01 0.0206 0.0954 0.29 CD8_TEM L2
ENSG00000287510 AL137857.1 201103 sc-eQTL 1.43e-01 0.126 0.0859 0.29 CD8_TEM L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -363992 sc-eQTL 9.89e-01 -0.00135 0.101 0.288 MAIT L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -364186 sc-eQTL 3.61e-01 0.0815 0.0891 0.288 MAIT L2
ENSG00000134644 PUM1 -133195 sc-eQTL 2.58e-01 -0.0967 0.0853 0.288 MAIT L2
ENSG00000162511 LAPTM5 175022 sc-eQTL 9.18e-02 -0.136 0.0802 0.288 MAIT L2
ENSG00000162517 PEF1 -712100 sc-eQTL 4.66e-01 -0.0647 0.0886 0.288 MAIT L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 214292 sc-eQTL 1.61e-01 0.126 0.0895 0.288 MAIT L2
ENSG00000287510 AL137857.1 201103 sc-eQTL 7.91e-01 -0.0246 0.0927 0.288 MAIT L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -363992 sc-eQTL 3.98e-01 -0.0861 0.102 0.282 NK_CD56bright L2
ENSG00000121753 ADGRB2 -832097 sc-eQTL 9.46e-01 0.00536 0.0797 0.282 NK_CD56bright L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -364186 sc-eQTL 6.83e-02 0.156 0.0853 0.282 NK_CD56bright L2
ENSG00000134644 PUM1 -133195 sc-eQTL 2.40e-01 -0.106 0.09 0.282 NK_CD56bright L2
ENSG00000162511 LAPTM5 175022 sc-eQTL 2.12e-01 -0.111 0.0888 0.282 NK_CD56bright L2
ENSG00000162517 PEF1 -712100 sc-eQTL 9.04e-01 0.0105 0.0866 0.282 NK_CD56bright L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 214292 sc-eQTL 3.75e-01 0.0794 0.0894 0.282 NK_CD56bright L2
ENSG00000287510 AL137857.1 201103 sc-eQTL 5.43e-01 0.0537 0.0882 0.282 NK_CD56bright L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -363992 sc-eQTL 1.06e-02 -0.244 0.0948 0.282 NK_CD56dim L2
ENSG00000121753 ADGRB2 -832097 sc-eQTL 1.66e-01 -0.117 0.0843 0.282 NK_CD56dim L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -364186 sc-eQTL 4.95e-02 0.139 0.0705 0.282 NK_CD56dim L2
ENSG00000134644 PUM1 -133195 sc-eQTL 2.39e-01 -0.086 0.0728 0.282 NK_CD56dim L2
ENSG00000162511 LAPTM5 175022 sc-eQTL 7.19e-01 -0.0281 0.0779 0.282 NK_CD56dim L2
ENSG00000162517 PEF1 -712100 sc-eQTL 6.89e-01 -0.0278 0.0693 0.282 NK_CD56dim L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 214292 sc-eQTL 9.01e-01 -0.0122 0.0976 0.282 NK_CD56dim L2
ENSG00000287510 AL137857.1 201103 sc-eQTL 4.27e-01 -0.0639 0.0804 0.282 NK_CD56dim L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -363992 sc-eQTL 5.57e-02 -0.194 0.101 0.295 NK_HLA L2
ENSG00000121753 ADGRB2 -832097 sc-eQTL 5.19e-01 -0.0521 0.0806 0.295 NK_HLA L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -364186 sc-eQTL 8.91e-01 0.0125 0.0907 0.295 NK_HLA L2
ENSG00000134644 PUM1 -133195 sc-eQTL 1.14e-01 -0.139 0.0878 0.295 NK_HLA L2
ENSG00000162511 LAPTM5 175022 sc-eQTL 3.02e-01 -0.0871 0.0841 0.295 NK_HLA L2
ENSG00000162517 PEF1 -712100 sc-eQTL 3.75e-02 0.197 0.094 0.295 NK_HLA L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 214292 sc-eQTL 3.66e-01 -0.0811 0.0895 0.295 NK_HLA L2
ENSG00000287510 AL137857.1 201103 sc-eQTL 2.16e-01 -0.107 0.0864 0.295 NK_HLA L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -363992 sc-eQTL 4.48e-01 0.0711 0.0936 0.282 NK_cytokine L2
ENSG00000121753 ADGRB2 -832097 sc-eQTL 5.31e-01 0.0531 0.0846 0.282 NK_cytokine L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -364186 sc-eQTL 2.06e-01 0.0925 0.0729 0.282 NK_cytokine L2
ENSG00000134644 PUM1 -133195 sc-eQTL 4.11e-01 -0.0651 0.079 0.282 NK_cytokine L2
ENSG00000162511 LAPTM5 175022 sc-eQTL 2.79e-02 -0.191 0.0861 0.282 NK_cytokine L2
ENSG00000162517 PEF1 -712100 sc-eQTL 5.06e-01 -0.0494 0.0741 0.282 NK_cytokine L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 214292 sc-eQTL 5.12e-01 -0.0606 0.0922 0.282 NK_cytokine L2
ENSG00000287510 AL137857.1 201103 sc-eQTL 3.52e-02 -0.18 0.085 0.282 NK_cytokine L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -363992 sc-eQTL 8.80e-01 0.0161 0.107 0.3 PB L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -364186 sc-eQTL 9.55e-01 0.007 0.124 0.3 PB L2
ENSG00000134644 PUM1 -133195 sc-eQTL 8.14e-01 -0.0254 0.108 0.3 PB L2
ENSG00000162510 MATN1 209211 sc-eQTL 4.98e-01 0.068 0.1 0.3 PB L2
ENSG00000162511 LAPTM5 175022 sc-eQTL 8.74e-01 -0.0114 0.0716 0.3 PB L2
ENSG00000162517 PEF1 -712100 sc-eQTL 6.92e-01 0.0438 0.11 0.3 PB L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 214292 sc-eQTL 3.99e-01 0.0827 0.0977 0.3 PB L2
ENSG00000287510 AL137857.1 201103 sc-eQTL 8.22e-02 0.181 0.103 0.3 PB L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -363992 sc-eQTL 1.04e-01 -0.12 0.0736 0.285 Pro_T L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -364186 sc-eQTL 1.55e-03 0.294 0.0918 0.285 Pro_T L2
ENSG00000134644 PUM1 -133195 sc-eQTL 7.50e-01 0.028 0.0877 0.285 Pro_T L2
ENSG00000162511 LAPTM5 175022 sc-eQTL 8.38e-01 -0.0129 0.0629 0.285 Pro_T L2
ENSG00000162517 PEF1 -712100 sc-eQTL 2.89e-01 0.0978 0.0921 0.285 Pro_T L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 214292 sc-eQTL 8.78e-01 0.0136 0.0879 0.285 Pro_T L2
ENSG00000287510 AL137857.1 201103 sc-eQTL 6.93e-01 0.032 0.0808 0.285 Pro_T L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -363992 sc-eQTL 7.14e-01 0.0354 0.0963 0.284 Treg L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -364186 sc-eQTL 5.62e-01 0.0541 0.0931 0.284 Treg L2
ENSG00000134644 PUM1 -133195 sc-eQTL 4.10e-01 0.0614 0.0745 0.284 Treg L2
ENSG00000162511 LAPTM5 175022 sc-eQTL 1.44e-02 -0.208 0.0842 0.284 Treg L2
ENSG00000162517 PEF1 -712100 sc-eQTL 3.31e-01 -0.0897 0.0921 0.284 Treg L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 214292 sc-eQTL 8.38e-01 -0.0178 0.087 0.284 Treg L2
ENSG00000287510 AL137857.1 201103 sc-eQTL 2.27e-01 0.105 0.0866 0.284 Treg L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -363992 sc-eQTL 2.04e-01 0.128 0.1 0.273 cDC L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -364186 sc-eQTL 4.62e-01 0.0804 0.109 0.273 cDC L2
ENSG00000134644 PUM1 -133195 sc-eQTL 3.41e-01 -0.0893 0.0935 0.273 cDC L2
ENSG00000162511 LAPTM5 175022 sc-eQTL 7.01e-01 0.0253 0.0657 0.273 cDC L2
ENSG00000162517 PEF1 -712100 sc-eQTL 5.50e-01 -0.0569 0.0951 0.273 cDC L2
ENSG00000168528 SERINC2 -476769 sc-eQTL 6.96e-01 0.033 0.0844 0.273 cDC L2
ENSG00000284543 LINC01226 -573430 sc-eQTL 2.05e-01 0.105 0.0826 0.273 cDC L2
ENSG00000287510 AL137857.1 201103 sc-eQTL 4.29e-01 -0.0706 0.0891 0.273 cDC L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -363992 sc-eQTL 8.05e-01 0.0195 0.079 0.284 cMono_IL1B L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -364186 sc-eQTL 4.80e-02 0.174 0.0874 0.284 cMono_IL1B L2
ENSG00000134644 PUM1 -133195 sc-eQTL 4.64e-01 -0.0437 0.0596 0.284 cMono_IL1B L2
ENSG00000162511 LAPTM5 175022 sc-eQTL 2.87e-01 -0.0557 0.0522 0.284 cMono_IL1B L2
ENSG00000162512 SDC3 24038 sc-eQTL 8.30e-02 0.171 0.098 0.284 cMono_IL1B L2
ENSG00000162517 PEF1 -712100 sc-eQTL 9.30e-01 0.00705 0.0806 0.284 cMono_IL1B L2
ENSG00000168528 SERINC2 -476769 sc-eQTL 6.94e-01 -0.0393 0.0998 0.284 cMono_IL1B L2
ENSG00000284543 LINC01226 -573430 sc-eQTL 1.20e-01 -0.137 0.0878 0.284 cMono_IL1B L2
ENSG00000287510 AL137857.1 201103 sc-eQTL 1.52e-01 -0.118 0.082 0.284 cMono_IL1B L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -363992 sc-eQTL 6.73e-01 -0.0352 0.0833 0.284 cMono_S100A L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -364186 sc-eQTL 2.28e-02 -0.223 0.0973 0.284 cMono_S100A L2
ENSG00000134644 PUM1 -133195 sc-eQTL 8.18e-01 0.0164 0.0712 0.284 cMono_S100A L2
ENSG00000162511 LAPTM5 175022 sc-eQTL 6.65e-01 -0.0237 0.0547 0.284 cMono_S100A L2
ENSG00000162512 SDC3 24038 sc-eQTL 3.50e-01 0.0884 0.0943 0.284 cMono_S100A L2
ENSG00000162517 PEF1 -712100 sc-eQTL 3.27e-01 0.0837 0.0852 0.284 cMono_S100A L2
ENSG00000168528 SERINC2 -476769 sc-eQTL 3.59e-01 -0.0919 0.0999 0.284 cMono_S100A L2
ENSG00000284543 LINC01226 -573430 sc-eQTL 3.13e-01 -0.082 0.0811 0.284 cMono_S100A L2
ENSG00000287510 AL137857.1 201103 sc-eQTL 3.28e-01 -0.0798 0.0814 0.284 cMono_S100A L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -363992 sc-eQTL 2.42e-01 0.147 0.126 0.276 gdT L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -364186 sc-eQTL 1.83e-01 -0.144 0.108 0.276 gdT L2
ENSG00000134644 PUM1 -133195 sc-eQTL 5.61e-01 0.065 0.112 0.276 gdT L2
ENSG00000162511 LAPTM5 175022 sc-eQTL 2.35e-01 -0.144 0.121 0.276 gdT L2
ENSG00000162517 PEF1 -712100 sc-eQTL 2.05e-01 -0.141 0.11 0.276 gdT L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 214292 sc-eQTL 2.08e-01 0.141 0.111 0.276 gdT L2
ENSG00000287510 AL137857.1 201103 sc-eQTL 4.97e-02 0.212 0.107 0.276 gdT L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -363992 sc-eQTL 6.52e-01 0.0421 0.0931 0.28 intMono L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -364186 sc-eQTL 7.51e-02 -0.178 0.0993 0.28 intMono L2
ENSG00000134644 PUM1 -133195 sc-eQTL 1.43e-01 -0.124 0.0845 0.28 intMono L2
ENSG00000162511 LAPTM5 175022 sc-eQTL 3.02e-01 -0.0688 0.0664 0.28 intMono L2
ENSG00000162512 SDC3 24038 sc-eQTL 3.84e-01 0.0794 0.091 0.28 intMono L2
ENSG00000162517 PEF1 -712100 sc-eQTL 5.23e-01 -0.0612 0.0957 0.28 intMono L2
ENSG00000168528 SERINC2 -476769 sc-eQTL 7.17e-01 -0.0347 0.0954 0.28 intMono L2
ENSG00000284543 LINC01226 -573430 sc-eQTL 5.13e-01 0.0592 0.0904 0.28 intMono L2
ENSG00000287510 AL137857.1 201103 sc-eQTL 8.83e-01 -0.0133 0.0905 0.28 intMono L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -363992 sc-eQTL 6.24e-01 -0.0429 0.0874 0.285 ncMono L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -364186 sc-eQTL 7.92e-01 -0.0246 0.0932 0.285 ncMono L2
ENSG00000134644 PUM1 -133195 sc-eQTL 1.63e-01 -0.106 0.0758 0.285 ncMono L2
ENSG00000162511 LAPTM5 175022 sc-eQTL 3.10e-02 -0.149 0.0684 0.285 ncMono L2
ENSG00000162512 SDC3 24038 sc-eQTL 3.10e-02 0.167 0.0767 0.285 ncMono L2
ENSG00000162517 PEF1 -712100 sc-eQTL 7.68e-01 -0.0262 0.0889 0.285 ncMono L2
ENSG00000168528 SERINC2 -476769 sc-eQTL 6.78e-01 -0.0352 0.0846 0.285 ncMono L2
ENSG00000284543 LINC01226 -573430 sc-eQTL 5.14e-01 -0.0553 0.0845 0.285 ncMono L2
ENSG00000287510 AL137857.1 201103 sc-eQTL 6.17e-01 -0.0438 0.0876 0.285 ncMono L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -363992 sc-eQTL 8.94e-01 -0.0136 0.102 0.266 pDC L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -364186 sc-eQTL 9.41e-01 0.0083 0.112 0.266 pDC L2
ENSG00000134644 PUM1 -133195 sc-eQTL 9.94e-01 0.000686 0.0926 0.266 pDC L2
ENSG00000162511 LAPTM5 175022 sc-eQTL 3.87e-01 -0.0745 0.0859 0.266 pDC L2
ENSG00000162517 PEF1 -712100 sc-eQTL 7.73e-02 0.197 0.111 0.266 pDC L2
ENSG00000168528 SERINC2 -476769 sc-eQTL 4.38e-01 -0.081 0.104 0.266 pDC L2
ENSG00000284543 LINC01226 -573430 sc-eQTL 1.31e-01 0.122 0.0805 0.266 pDC L2
ENSG00000287510 AL137857.1 201103 sc-eQTL 9.43e-01 0.0068 0.0954 0.266 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000060688 SNRNP40 -363992 sc-eQTL 3.60e-01 -0.092 0.1 0.284 B_Memory LOneK1K
ENSG00000121766 ZCCHC17 -364186 sc-eQTL 1.60e-01 0.117 0.0832 0.284 B_Memory LOneK1K
ENSG00000134644 PUM1 -133195 sc-eQTL 2.23e-01 -0.0902 0.0739 0.284 B_Memory LOneK1K
ENSG00000162510 MATN1 209211 sc-eQTL 3.43e-01 0.0802 0.0843 0.284 B_Memory LOneK1K
ENSG00000162511 LAPTM5 175022 sc-eQTL 2.49e-01 0.0612 0.0529 0.284 B_Memory LOneK1K
ENSG00000162517 PEF1 -712100 sc-eQTL 7.97e-01 -0.0226 0.0879 0.284 B_Memory LOneK1K
ENSG00000186056 MATN1-AS1 214292 sc-eQTL 7.16e-01 -0.0255 0.0702 0.284 B_Memory LOneK1K
ENSG00000287510 AL137857.1 201103 sc-eQTL 5.51e-01 -0.0456 0.0765 0.284 B_Memory LOneK1K
ENSG00000060688 SNRNP40 -363992 sc-eQTL 3.16e-01 0.0894 0.0889 0.284 B_Naive LOneK1K
ENSG00000121766 ZCCHC17 -364186 sc-eQTL 8.36e-01 0.0146 0.0704 0.284 B_Naive LOneK1K
ENSG00000134644 PUM1 -133195 sc-eQTL 5.96e-02 -0.125 0.0661 0.284 B_Naive LOneK1K
ENSG00000162510 MATN1 209211 sc-eQTL 7.94e-01 0.0168 0.0641 0.284 B_Naive LOneK1K
ENSG00000162511 LAPTM5 175022 sc-eQTL 2.03e-01 -0.0574 0.045 0.284 B_Naive LOneK1K
ENSG00000162517 PEF1 -712100 sc-eQTL 2.33e-01 0.0983 0.0822 0.284 B_Naive LOneK1K
ENSG00000186056 MATN1-AS1 214292 sc-eQTL 8.51e-02 0.1 0.0579 0.284 B_Naive LOneK1K
ENSG00000287510 AL137857.1 201103 sc-eQTL 3.15e-01 -0.0697 0.0691 0.284 B_Naive LOneK1K
ENSG00000060688 SNRNP40 -363992 sc-eQTL 8.73e-01 0.012 0.075 0.284 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000121766 ZCCHC17 -364186 sc-eQTL 8.41e-01 0.017 0.0849 0.284 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000134644 PUM1 -133195 sc-eQTL 7.40e-01 -0.018 0.0542 0.284 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000162511 LAPTM5 175022 sc-eQTL 6.96e-01 -0.0187 0.0476 0.284 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000162512 SDC3 24038 sc-eQTL 3.41e-02 0.205 0.0962 0.284 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000162517 PEF1 -712100 sc-eQTL 5.97e-01 0.0361 0.0683 0.284 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000168528 SERINC2 -476769 sc-eQTL 5.61e-01 -0.0582 0.0999 0.284 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000284543 LINC01226 -573430 sc-eQTL 8.33e-02 -0.142 0.0814 0.284 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000287510 AL137857.1 201103 sc-eQTL 1.69e-01 -0.106 0.0764 0.284 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000060688 SNRNP40 -363992 sc-eQTL 7.65e-01 0.0245 0.0818 0.282 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000121766 ZCCHC17 -364186 sc-eQTL 5.01e-01 -0.0603 0.0894 0.282 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000134644 PUM1 -133195 sc-eQTL 1.32e-01 -0.11 0.0729 0.282 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000162511 LAPTM5 175022 sc-eQTL 1.58e-01 -0.0828 0.0584 0.282 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000162512 SDC3 24038 sc-eQTL 1.87e-01 0.113 0.0853 0.282 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000162517 PEF1 -712100 sc-eQTL 7.31e-01 -0.0268 0.0778 0.282 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000168528 SERINC2 -476769 sc-eQTL 9.76e-01 -0.00273 0.0889 0.282 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000284543 LINC01226 -573430 sc-eQTL 5.65e-01 -0.0486 0.0843 0.282 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000287510 AL137857.1 201103 sc-eQTL 3.04e-01 -0.0868 0.0842 0.282 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000060688 SNRNP40 -363992 sc-eQTL 9.47e-02 -0.152 0.0905 0.282 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000121753 ADGRB2 -832097 sc-eQTL 5.64e-01 -0.0447 0.0775 0.282 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000121766 ZCCHC17 -364186 sc-eQTL 2.64e-02 0.137 0.0615 0.282 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000134644 PUM1 -133195 sc-eQTL 1.71e-01 -0.0933 0.0678 0.282 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000162511 LAPTM5 175022 sc-eQTL 5.80e-01 -0.0422 0.0761 0.282 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000162517 PEF1 -712100 sc-eQTL 5.73e-01 -0.0326 0.0578 0.282 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000186056 MATN1-AS1 214292 sc-eQTL 8.21e-01 -0.0199 0.0878 0.282 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000287510 AL137857.1 201103 sc-eQTL 1.92e-01 -0.0989 0.0755 0.282 NK_CD56dim LOneK1K

Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF
ENSG00000162512 SDC3 24038 eQTL 1.23e-07 0.139 0.026 0.0 0.00105 0.305

Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina
ENSG00000162512 SDC3 24038 3.08e-05 2.87e-05 5.6e-06 1.62e-05 3.29e-06 1.28e-05 3.09e-05 3.72e-06 2.64e-05 1.2e-05 3.11e-05 1.26e-05 3.96e-05 1.3e-05 5.68e-06 1.17e-05 1.44e-05 2.14e-05 6.14e-06 5.62e-06 1.13e-05 2.44e-05 2.59e-05 6.86e-06 3.77e-05 6.6e-06 9.54e-06 9.23e-06 2.52e-05 1.97e-05 1.69e-05 1.62e-06 2.23e-06 6.27e-06 1.16e-05 4.5e-06 3.2e-06 3.05e-06 3.98e-06 2.3e-06 1.67e-06 3.78e-05 2.7e-06 3.62e-07 1.97e-06 3.13e-06 3.46e-06 1.47e-06 1.38e-06