logo

Genes within 1Mb (chr1:30921485:C:T):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD

Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000060688 SNRNP40 -375303 sc-eQTL 3.55e-01 0.139 0.15 0.068 B L1
ENSG00000121766 ZCCHC17 -375497 sc-eQTL 9.75e-02 -0.199 0.119 0.068 B L1
ENSG00000134644 PUM1 -144506 sc-eQTL 4.48e-01 -0.0765 0.101 0.068 B L1
ENSG00000162510 MATN1 197900 sc-eQTL 7.74e-01 -0.0304 0.106 0.068 B L1
ENSG00000162511 LAPTM5 163711 sc-eQTL 4.11e-01 -0.0682 0.0828 0.068 B L1
ENSG00000162517 PEF1 -723411 sc-eQTL 7.92e-01 -0.0331 0.125 0.068 B L1
ENSG00000186056 MATN1-AS1 202981 sc-eQTL 2.66e-01 -0.108 0.0969 0.068 B L1
ENSG00000287510 AL137857.1 189792 sc-eQTL 9.58e-01 -0.0061 0.115 0.068 B L1
ENSG00000060688 SNRNP40 -375303 sc-eQTL 1.14e-01 -0.203 0.128 0.068 CD4T L1
ENSG00000121766 ZCCHC17 -375497 sc-eQTL 3.22e-01 0.0998 0.101 0.068 CD4T L1
ENSG00000134644 PUM1 -144506 sc-eQTL 4.73e-01 0.0644 0.0896 0.068 CD4T L1
ENSG00000162511 LAPTM5 163711 sc-eQTL 8.82e-01 -0.0148 0.0994 0.068 CD4T L1
ENSG00000162517 PEF1 -723411 sc-eQTL 9.66e-01 -0.00448 0.104 0.068 CD4T L1
ENSG00000186056 MATN1-AS1 202981 sc-eQTL 5.05e-01 -0.0593 0.0888 0.068 CD4T L1
ENSG00000287510 AL137857.1 189792 sc-eQTL 6.50e-01 -0.0484 0.106 0.068 CD4T L1
ENSG00000060688 SNRNP40 -375303 sc-eQTL 1.05e-01 -0.276 0.17 0.068 CD8T L1
ENSG00000121766 ZCCHC17 -375497 sc-eQTL 7.72e-01 0.033 0.114 0.068 CD8T L1
ENSG00000134644 PUM1 -144506 sc-eQTL 3.23e-01 -0.0988 0.0998 0.068 CD8T L1
ENSG00000162511 LAPTM5 163711 sc-eQTL 6.61e-01 -0.0426 0.0971 0.068 CD8T L1
ENSG00000162517 PEF1 -723411 sc-eQTL 4.81e-01 -0.0843 0.12 0.068 CD8T L1
ENSG00000186056 MATN1-AS1 202981 sc-eQTL 3.53e-01 -0.106 0.114 0.068 CD8T L1
ENSG00000287510 AL137857.1 189792 sc-eQTL 7.49e-01 -0.0458 0.143 0.068 CD8T L1
ENSG00000060688 SNRNP40 -375303 sc-eQTL 8.49e-01 -0.029 0.152 0.07 DC L1
ENSG00000121766 ZCCHC17 -375497 sc-eQTL 9.44e-01 0.0127 0.18 0.07 DC L1
ENSG00000134644 PUM1 -144506 sc-eQTL 7.52e-01 0.0447 0.141 0.07 DC L1
ENSG00000162511 LAPTM5 163711 sc-eQTL 4.27e-02 0.204 0.0998 0.07 DC L1
ENSG00000162517 PEF1 -723411 sc-eQTL 6.06e-01 0.0843 0.163 0.07 DC L1
ENSG00000168528 SERINC2 -488080 sc-eQTL 3.77e-01 -0.147 0.166 0.07 DC L1
ENSG00000284543 LINC01226 -584741 sc-eQTL 3.67e-01 0.0995 0.11 0.07 DC L1
ENSG00000287510 AL137857.1 189792 sc-eQTL 5.31e-01 -0.0999 0.159 0.07 DC L1
ENSG00000060688 SNRNP40 -375303 sc-eQTL 9.37e-01 -0.00936 0.118 0.068 Mono L1
ENSG00000121766 ZCCHC17 -375497 sc-eQTL 1.40e-01 0.216 0.146 0.068 Mono L1
ENSG00000134644 PUM1 -144506 sc-eQTL 6.48e-01 0.0429 0.094 0.068 Mono L1
ENSG00000162511 LAPTM5 163711 sc-eQTL 6.92e-02 0.157 0.0858 0.068 Mono L1
ENSG00000162512 SDC3 12727 sc-eQTL 2.99e-05 -0.681 0.159 0.068 Mono L1
ENSG00000162517 PEF1 -723411 sc-eQTL 8.90e-01 0.0162 0.117 0.068 Mono L1
ENSG00000168528 SERINC2 -488080 sc-eQTL 8.50e-01 0.0337 0.178 0.068 Mono L1
ENSG00000284543 LINC01226 -584741 sc-eQTL 7.65e-01 -0.0469 0.157 0.068 Mono L1
ENSG00000287510 AL137857.1 189792 sc-eQTL 3.03e-01 -0.141 0.137 0.068 Mono L1
ENSG00000060688 SNRNP40 -375303 sc-eQTL 1.08e-01 -0.259 0.161 0.069 NK L1
ENSG00000121753 ADGRB2 -843408 sc-eQTL 9.91e-01 0.00159 0.139 0.069 NK L1
ENSG00000121766 ZCCHC17 -375497 sc-eQTL 7.79e-01 -0.031 0.111 0.069 NK L1
ENSG00000134644 PUM1 -144506 sc-eQTL 2.75e-02 -0.254 0.115 0.069 NK L1
ENSG00000162511 LAPTM5 163711 sc-eQTL 4.25e-01 0.107 0.133 0.069 NK L1
ENSG00000162517 PEF1 -723411 sc-eQTL 7.87e-01 -0.0263 0.0974 0.069 NK L1
ENSG00000186056 MATN1-AS1 202981 sc-eQTL 8.02e-01 0.0377 0.15 0.069 NK L1
ENSG00000287510 AL137857.1 189792 sc-eQTL 9.34e-01 -0.0114 0.139 0.069 NK L1
ENSG00000060688 SNRNP40 -375303 sc-eQTL 1.78e-01 0.17 0.126 0.068 Other_T L1
ENSG00000121766 ZCCHC17 -375497 sc-eQTL 4.52e-02 -0.269 0.134 0.068 Other_T L1
ENSG00000134644 PUM1 -144506 sc-eQTL 9.47e-01 -0.008 0.121 0.068 Other_T L1
ENSG00000162511 LAPTM5 163711 sc-eQTL 3.16e-01 -0.0996 0.0991 0.068 Other_T L1
ENSG00000162517 PEF1 -723411 sc-eQTL 1.33e-01 0.199 0.132 0.068 Other_T L1
ENSG00000186056 MATN1-AS1 202981 sc-eQTL 8.82e-01 -0.0242 0.163 0.068 Other_T L1
ENSG00000287510 AL137857.1 189792 sc-eQTL 5.36e-01 0.105 0.169 0.068 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000060688 SNRNP40 -375303 sc-eQTL 2.70e-01 0.215 0.194 0.066 B_Activated L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -375497 sc-eQTL 2.96e-01 0.205 0.196 0.066 B_Activated L2
ENSG00000134644 PUM1 -144506 sc-eQTL 6.78e-01 -0.0758 0.182 0.066 B_Activated L2
ENSG00000162510 MATN1 197900 sc-eQTL 4.98e-01 0.108 0.159 0.066 B_Activated L2
ENSG00000162511 LAPTM5 163711 sc-eQTL 1.77e-01 -0.15 0.111 0.066 B_Activated L2
ENSG00000162517 PEF1 -723411 sc-eQTL 1.52e-01 -0.271 0.188 0.066 B_Activated L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 202981 sc-eQTL 2.24e-01 0.218 0.179 0.066 B_Activated L2
ENSG00000287510 AL137857.1 189792 sc-eQTL 7.20e-01 0.0569 0.159 0.066 B_Activated L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -375303 sc-eQTL 6.84e-01 0.0745 0.183 0.069 B_Intermediate L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -375497 sc-eQTL 1.75e-01 -0.207 0.152 0.069 B_Intermediate L2
ENSG00000134644 PUM1 -144506 sc-eQTL 3.28e-01 0.141 0.144 0.069 B_Intermediate L2
ENSG00000162510 MATN1 197900 sc-eQTL 4.21e-01 0.121 0.15 0.069 B_Intermediate L2
ENSG00000162511 LAPTM5 163711 sc-eQTL 3.91e-01 -0.0789 0.0918 0.069 B_Intermediate L2
ENSG00000162517 PEF1 -723411 sc-eQTL 2.15e-01 -0.211 0.17 0.069 B_Intermediate L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 202981 sc-eQTL 8.24e-01 0.0287 0.129 0.069 B_Intermediate L2
ENSG00000287510 AL137857.1 189792 sc-eQTL 7.85e-01 -0.0394 0.144 0.069 B_Intermediate L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -375303 sc-eQTL 8.05e-01 -0.0441 0.178 0.069 B_Memory L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -375497 sc-eQTL 8.73e-01 -0.0262 0.164 0.069 B_Memory L2
ENSG00000134644 PUM1 -144506 sc-eQTL 2.31e-01 0.171 0.142 0.069 B_Memory L2
ENSG00000162510 MATN1 197900 sc-eQTL 3.79e-01 -0.12 0.136 0.069 B_Memory L2
ENSG00000162511 LAPTM5 163711 sc-eQTL 4.10e-01 -0.0997 0.121 0.069 B_Memory L2
ENSG00000162517 PEF1 -723411 sc-eQTL 6.45e-02 0.298 0.16 0.069 B_Memory L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 202981 sc-eQTL 7.47e-01 -0.0447 0.138 0.069 B_Memory L2
ENSG00000287510 AL137857.1 189792 sc-eQTL 8.51e-01 0.0306 0.162 0.069 B_Memory L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -375303 sc-eQTL 9.31e-01 0.0144 0.166 0.068 B_Naive1 L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -375497 sc-eQTL 1.76e-01 -0.194 0.143 0.068 B_Naive1 L2
ENSG00000134644 PUM1 -144506 sc-eQTL 6.56e-01 -0.0564 0.126 0.068 B_Naive1 L2
ENSG00000162510 MATN1 197900 sc-eQTL 7.24e-01 -0.0454 0.128 0.068 B_Naive1 L2
ENSG00000162511 LAPTM5 163711 sc-eQTL 5.60e-01 0.05 0.0857 0.068 B_Naive1 L2
ENSG00000162517 PEF1 -723411 sc-eQTL 9.64e-01 0.00685 0.151 0.068 B_Naive1 L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 202981 sc-eQTL 7.65e-01 -0.0337 0.113 0.068 B_Naive1 L2
ENSG00000287510 AL137857.1 189792 sc-eQTL 7.89e-01 -0.0373 0.139 0.068 B_Naive1 L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -375303 sc-eQTL 1.85e-01 0.228 0.172 0.069 B_Naive2 L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -375497 sc-eQTL 3.66e-01 -0.129 0.142 0.069 B_Naive2 L2
ENSG00000134644 PUM1 -144506 sc-eQTL 3.37e-01 -0.134 0.139 0.069 B_Naive2 L2
ENSG00000162510 MATN1 197900 sc-eQTL 2.48e-01 -0.155 0.133 0.069 B_Naive2 L2
ENSG00000162511 LAPTM5 163711 sc-eQTL 8.42e-01 -0.0181 0.0909 0.069 B_Naive2 L2
ENSG00000162517 PEF1 -723411 sc-eQTL 2.27e-02 -0.375 0.163 0.069 B_Naive2 L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 202981 sc-eQTL 4.62e-01 -0.0974 0.132 0.069 B_Naive2 L2
ENSG00000287510 AL137857.1 189792 sc-eQTL 7.62e-01 -0.0434 0.143 0.069 B_Naive2 L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -375303 sc-eQTL 8.07e-01 -0.0428 0.175 0.068 CD4_CTL L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -375497 sc-eQTL 3.58e-01 -0.158 0.172 0.068 CD4_CTL L2
ENSG00000134644 PUM1 -144506 sc-eQTL 8.57e-01 -0.0303 0.169 0.068 CD4_CTL L2
ENSG00000162511 LAPTM5 163711 sc-eQTL 2.50e-01 0.173 0.15 0.068 CD4_CTL L2
ENSG00000162517 PEF1 -723411 sc-eQTL 4.18e-01 0.125 0.154 0.068 CD4_CTL L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 202981 sc-eQTL 1.82e-01 -0.219 0.164 0.068 CD4_CTL L2
ENSG00000287510 AL137857.1 189792 sc-eQTL 6.22e-01 -0.0716 0.145 0.068 CD4_CTL L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -375303 sc-eQTL 1.25e-01 -0.206 0.134 0.068 CD4_Naive L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -375497 sc-eQTL 4.68e-01 0.0866 0.119 0.068 CD4_Naive L2
ENSG00000134644 PUM1 -144506 sc-eQTL 2.90e-01 0.101 0.095 0.068 CD4_Naive L2
ENSG00000162511 LAPTM5 163711 sc-eQTL 4.84e-01 -0.0715 0.102 0.068 CD4_Naive L2
ENSG00000162517 PEF1 -723411 sc-eQTL 5.81e-01 -0.0618 0.112 0.068 CD4_Naive L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 202981 sc-eQTL 8.68e-01 -0.0172 0.104 0.068 CD4_Naive L2
ENSG00000287510 AL137857.1 189792 sc-eQTL 3.00e-01 -0.123 0.119 0.068 CD4_Naive L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -375303 sc-eQTL 7.12e-02 -0.303 0.167 0.068 CD4_TCM L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -375497 sc-eQTL 9.93e-02 0.224 0.135 0.068 CD4_TCM L2
ENSG00000134644 PUM1 -144506 sc-eQTL 3.45e-01 0.114 0.12 0.068 CD4_TCM L2
ENSG00000162511 LAPTM5 163711 sc-eQTL 5.96e-01 0.0529 0.0997 0.068 CD4_TCM L2
ENSG00000162517 PEF1 -723411 sc-eQTL 8.21e-01 0.0303 0.134 0.068 CD4_TCM L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 202981 sc-eQTL 8.98e-01 -0.0163 0.127 0.068 CD4_TCM L2
ENSG00000287510 AL137857.1 189792 sc-eQTL 6.70e-01 0.0602 0.141 0.068 CD4_TCM L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -375303 sc-eQTL 1.68e-01 0.231 0.167 0.068 CD4_TEM L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -375497 sc-eQTL 4.73e-01 -0.115 0.16 0.068 CD4_TEM L2
ENSG00000134644 PUM1 -144506 sc-eQTL 8.55e-01 0.0243 0.133 0.068 CD4_TEM L2
ENSG00000162511 LAPTM5 163711 sc-eQTL 9.72e-01 0.00467 0.135 0.068 CD4_TEM L2
ENSG00000162517 PEF1 -723411 sc-eQTL 4.33e-01 0.118 0.151 0.068 CD4_TEM L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 202981 sc-eQTL 4.84e-01 -0.11 0.157 0.068 CD4_TEM L2
ENSG00000287510 AL137857.1 189792 sc-eQTL 1.27e-01 -0.236 0.154 0.068 CD4_TEM L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -375303 sc-eQTL 7.15e-03 -0.49 0.18 0.068 CD8_CTL L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -375497 sc-eQTL 6.84e-01 0.0573 0.141 0.068 CD8_CTL L2
ENSG00000134644 PUM1 -144506 sc-eQTL 8.28e-01 0.0297 0.137 0.068 CD8_CTL L2
ENSG00000162511 LAPTM5 163711 sc-eQTL 4.93e-01 0.104 0.151 0.068 CD8_CTL L2
ENSG00000162517 PEF1 -723411 sc-eQTL 9.76e-01 -0.00398 0.132 0.068 CD8_CTL L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 202981 sc-eQTL 5.58e-01 -0.0931 0.159 0.068 CD8_CTL L2
ENSG00000287510 AL137857.1 189792 sc-eQTL 6.32e-01 0.0717 0.149 0.068 CD8_CTL L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -375303 sc-eQTL 9.58e-01 -0.00894 0.17 0.068 CD8_Naive L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -375497 sc-eQTL 7.68e-01 -0.0433 0.147 0.068 CD8_Naive L2
ENSG00000134644 PUM1 -144506 sc-eQTL 8.55e-01 0.0217 0.118 0.068 CD8_Naive L2
ENSG00000162511 LAPTM5 163711 sc-eQTL 7.51e-01 -0.0359 0.113 0.068 CD8_Naive L2
ENSG00000162517 PEF1 -723411 sc-eQTL 3.06e-01 -0.161 0.157 0.068 CD8_Naive L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 202981 sc-eQTL 3.01e-01 -0.146 0.141 0.068 CD8_Naive L2
ENSG00000287510 AL137857.1 189792 sc-eQTL 8.74e-01 0.0244 0.154 0.068 CD8_Naive L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -375303 sc-eQTL 4.41e-01 -0.16 0.207 0.062 CD8_TCM L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -375497 sc-eQTL 2.68e-01 0.211 0.19 0.062 CD8_TCM L2
ENSG00000134644 PUM1 -144506 sc-eQTL 5.78e-02 -0.339 0.177 0.062 CD8_TCM L2
ENSG00000162511 LAPTM5 163711 sc-eQTL 3.87e-01 -0.162 0.187 0.062 CD8_TCM L2
ENSG00000162517 PEF1 -723411 sc-eQTL 2.05e-01 0.243 0.191 0.062 CD8_TCM L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 202981 sc-eQTL 8.53e-01 -0.0322 0.173 0.062 CD8_TCM L2
ENSG00000287510 AL137857.1 189792 sc-eQTL 8.08e-01 -0.0427 0.175 0.062 CD8_TCM L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -375303 sc-eQTL 1.42e-01 0.272 0.185 0.071 CD8_TEM L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -375497 sc-eQTL 5.60e-01 -0.104 0.178 0.071 CD8_TEM L2
ENSG00000134644 PUM1 -144506 sc-eQTL 6.05e-01 -0.0941 0.182 0.071 CD8_TEM L2
ENSG00000162511 LAPTM5 163711 sc-eQTL 2.73e-01 0.188 0.171 0.071 CD8_TEM L2
ENSG00000162517 PEF1 -723411 sc-eQTL 3.13e-01 -0.163 0.161 0.071 CD8_TEM L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 202981 sc-eQTL 2.15e-02 -0.406 0.175 0.071 CD8_TEM L2
ENSG00000287510 AL137857.1 189792 sc-eQTL 1.05e-02 -0.408 0.158 0.071 CD8_TEM L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -375303 sc-eQTL 5.84e-01 0.0996 0.182 0.067 MAIT L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -375497 sc-eQTL 1.90e-02 -0.376 0.159 0.067 MAIT L2
ENSG00000134644 PUM1 -144506 sc-eQTL 8.81e-01 0.0231 0.155 0.067 MAIT L2
ENSG00000162511 LAPTM5 163711 sc-eQTL 4.43e-01 -0.112 0.146 0.067 MAIT L2
ENSG00000162517 PEF1 -723411 sc-eQTL 1.24e-01 0.246 0.159 0.067 MAIT L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 202981 sc-eQTL 9.30e-01 0.0142 0.162 0.067 MAIT L2
ENSG00000287510 AL137857.1 189792 sc-eQTL 5.53e-01 0.0994 0.167 0.067 MAIT L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -375303 sc-eQTL 7.29e-01 -0.0624 0.18 0.071 NK_CD56bright L2
ENSG00000121753 ADGRB2 -843408 sc-eQTL 5.07e-01 0.0935 0.141 0.071 NK_CD56bright L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -375497 sc-eQTL 7.39e-01 -0.0508 0.152 0.071 NK_CD56bright L2
ENSG00000134644 PUM1 -144506 sc-eQTL 9.27e-01 0.0147 0.16 0.071 NK_CD56bright L2
ENSG00000162511 LAPTM5 163711 sc-eQTL 8.60e-01 -0.0279 0.158 0.071 NK_CD56bright L2
ENSG00000162517 PEF1 -723411 sc-eQTL 1.91e-01 0.2 0.152 0.071 NK_CD56bright L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 202981 sc-eQTL 7.09e-01 0.0591 0.158 0.071 NK_CD56bright L2
ENSG00000287510 AL137857.1 189792 sc-eQTL 3.05e-01 -0.16 0.156 0.071 NK_CD56bright L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -375303 sc-eQTL 4.08e-01 -0.142 0.171 0.069 NK_CD56dim L2
ENSG00000121753 ADGRB2 -843408 sc-eQTL 8.66e-01 -0.0254 0.151 0.069 NK_CD56dim L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -375497 sc-eQTL 4.80e-01 -0.0895 0.127 0.069 NK_CD56dim L2
ENSG00000134644 PUM1 -144506 sc-eQTL 2.80e-02 -0.285 0.129 0.069 NK_CD56dim L2
ENSG00000162511 LAPTM5 163711 sc-eQTL 7.06e-01 0.0523 0.139 0.069 NK_CD56dim L2
ENSG00000162517 PEF1 -723411 sc-eQTL 5.53e-02 -0.236 0.122 0.069 NK_CD56dim L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 202981 sc-eQTL 8.75e-01 0.0273 0.174 0.069 NK_CD56dim L2
ENSG00000287510 AL137857.1 189792 sc-eQTL 8.51e-01 0.0269 0.143 0.069 NK_CD56dim L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -375303 sc-eQTL 2.25e-01 0.222 0.183 0.066 NK_HLA L2
ENSG00000121753 ADGRB2 -843408 sc-eQTL 8.10e-01 0.035 0.145 0.066 NK_HLA L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -375497 sc-eQTL 4.11e-01 0.135 0.163 0.066 NK_HLA L2
ENSG00000134644 PUM1 -144506 sc-eQTL 4.28e-01 -0.126 0.159 0.066 NK_HLA L2
ENSG00000162511 LAPTM5 163711 sc-eQTL 1.16e-01 0.239 0.151 0.066 NK_HLA L2
ENSG00000162517 PEF1 -723411 sc-eQTL 9.89e-01 -0.00233 0.171 0.066 NK_HLA L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 202981 sc-eQTL 3.59e-02 -0.338 0.16 0.066 NK_HLA L2
ENSG00000287510 AL137857.1 189792 sc-eQTL 5.95e-01 0.0833 0.156 0.066 NK_HLA L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -375303 sc-eQTL 9.15e-02 -0.282 0.166 0.069 NK_cytokine L2
ENSG00000121753 ADGRB2 -843408 sc-eQTL 5.99e-01 0.0797 0.151 0.069 NK_cytokine L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -375497 sc-eQTL 5.23e-01 -0.0836 0.131 0.069 NK_cytokine L2
ENSG00000134644 PUM1 -144506 sc-eQTL 5.13e-01 -0.0926 0.141 0.069 NK_cytokine L2
ENSG00000162511 LAPTM5 163711 sc-eQTL 7.43e-01 0.0512 0.156 0.069 NK_cytokine L2
ENSG00000162517 PEF1 -723411 sc-eQTL 2.96e-01 0.139 0.132 0.069 NK_cytokine L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 202981 sc-eQTL 5.19e-01 0.106 0.165 0.069 NK_cytokine L2
ENSG00000287510 AL137857.1 189792 sc-eQTL 1.78e-01 -0.206 0.153 0.069 NK_cytokine L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -375303 sc-eQTL 6.60e-01 0.0791 0.179 0.078 PB L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -375497 sc-eQTL 7.50e-01 -0.0664 0.208 0.078 PB L2
ENSG00000134644 PUM1 -144506 sc-eQTL 4.26e-01 -0.144 0.18 0.078 PB L2
ENSG00000162510 MATN1 197900 sc-eQTL 5.87e-01 -0.0915 0.168 0.078 PB L2
ENSG00000162511 LAPTM5 163711 sc-eQTL 6.00e-02 0.225 0.118 0.078 PB L2
ENSG00000162517 PEF1 -723411 sc-eQTL 2.36e-01 -0.219 0.184 0.078 PB L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 202981 sc-eQTL 4.02e-01 -0.138 0.164 0.078 PB L2
ENSG00000287510 AL137857.1 189792 sc-eQTL 1.82e-01 -0.233 0.174 0.078 PB L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -375303 sc-eQTL 6.83e-01 0.0562 0.137 0.065 Pro_T L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -375497 sc-eQTL 8.29e-01 0.0376 0.174 0.065 Pro_T L2
ENSG00000134644 PUM1 -144506 sc-eQTL 9.54e-01 -0.00944 0.162 0.065 Pro_T L2
ENSG00000162511 LAPTM5 163711 sc-eQTL 8.72e-01 0.0187 0.117 0.065 Pro_T L2
ENSG00000162517 PEF1 -723411 sc-eQTL 6.67e-01 -0.0737 0.171 0.065 Pro_T L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 202981 sc-eQTL 9.50e-01 0.0102 0.163 0.065 Pro_T L2
ENSG00000287510 AL137857.1 189792 sc-eQTL 7.89e-01 0.0401 0.15 0.065 Pro_T L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -375303 sc-eQTL 3.15e-01 -0.174 0.173 0.068 Treg L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -375497 sc-eQTL 7.33e-01 -0.0575 0.168 0.068 Treg L2
ENSG00000134644 PUM1 -144506 sc-eQTL 2.64e-01 -0.15 0.134 0.068 Treg L2
ENSG00000162511 LAPTM5 163711 sc-eQTL 4.57e-01 -0.115 0.154 0.068 Treg L2
ENSG00000162517 PEF1 -723411 sc-eQTL 1.99e-01 0.214 0.166 0.068 Treg L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 202981 sc-eQTL 7.53e-01 -0.0495 0.157 0.068 Treg L2
ENSG00000287510 AL137857.1 189792 sc-eQTL 3.32e-01 -0.152 0.156 0.068 Treg L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -375303 sc-eQTL 2.42e-01 -0.199 0.17 0.076 cDC L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -375497 sc-eQTL 8.65e-01 0.0315 0.185 0.076 cDC L2
ENSG00000134644 PUM1 -144506 sc-eQTL 6.23e-01 -0.0779 0.158 0.076 cDC L2
ENSG00000162511 LAPTM5 163711 sc-eQTL 9.80e-01 -0.00274 0.111 0.076 cDC L2
ENSG00000162517 PEF1 -723411 sc-eQTL 6.05e-01 -0.0833 0.161 0.076 cDC L2
ENSG00000168528 SERINC2 -488080 sc-eQTL 5.08e-01 -0.0946 0.142 0.076 cDC L2
ENSG00000284543 LINC01226 -584741 sc-eQTL 4.62e-01 -0.103 0.14 0.076 cDC L2
ENSG00000287510 AL137857.1 189792 sc-eQTL 9.61e-01 -0.00747 0.151 0.076 cDC L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -375303 sc-eQTL 9.28e-01 -0.0128 0.142 0.068 cMono_IL1B L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -375497 sc-eQTL 2.05e-01 0.2 0.157 0.068 cMono_IL1B L2
ENSG00000134644 PUM1 -144506 sc-eQTL 3.30e-01 0.104 0.107 0.068 cMono_IL1B L2
ENSG00000162511 LAPTM5 163711 sc-eQTL 5.14e-02 0.182 0.093 0.068 cMono_IL1B L2
ENSG00000162512 SDC3 12727 sc-eQTL 6.85e-03 -0.474 0.174 0.068 cMono_IL1B L2
ENSG00000162517 PEF1 -723411 sc-eQTL 7.27e-02 -0.258 0.143 0.068 cMono_IL1B L2
ENSG00000168528 SERINC2 -488080 sc-eQTL 8.12e-01 0.0426 0.179 0.068 cMono_IL1B L2
ENSG00000284543 LINC01226 -584741 sc-eQTL 5.53e-01 -0.0938 0.158 0.068 cMono_IL1B L2
ENSG00000287510 AL137857.1 189792 sc-eQTL 2.37e-01 -0.174 0.147 0.068 cMono_IL1B L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -375303 sc-eQTL 9.05e-01 -0.0177 0.148 0.068 cMono_S100A L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -375497 sc-eQTL 8.94e-01 0.0234 0.175 0.068 cMono_S100A L2
ENSG00000134644 PUM1 -144506 sc-eQTL 4.48e-01 -0.0958 0.126 0.068 cMono_S100A L2
ENSG00000162511 LAPTM5 163711 sc-eQTL 3.73e-01 0.0864 0.0968 0.068 cMono_S100A L2
ENSG00000162512 SDC3 12727 sc-eQTL 1.40e-02 -0.409 0.165 0.068 cMono_S100A L2
ENSG00000162517 PEF1 -723411 sc-eQTL 4.21e-01 0.122 0.151 0.068 cMono_S100A L2
ENSG00000168528 SERINC2 -488080 sc-eQTL 9.64e-01 -0.00798 0.177 0.068 cMono_S100A L2
ENSG00000284543 LINC01226 -584741 sc-eQTL 2.94e-01 -0.151 0.144 0.068 cMono_S100A L2
ENSG00000287510 AL137857.1 189792 sc-eQTL 8.60e-01 -0.0256 0.145 0.068 cMono_S100A L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -375303 sc-eQTL 1.18e-01 0.354 0.226 0.067 gdT L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -375497 sc-eQTL 4.67e-01 -0.142 0.195 0.067 gdT L2
ENSG00000134644 PUM1 -144506 sc-eQTL 3.51e-01 -0.188 0.201 0.067 gdT L2
ENSG00000162511 LAPTM5 163711 sc-eQTL 9.01e-01 0.0273 0.219 0.067 gdT L2
ENSG00000162517 PEF1 -723411 sc-eQTL 8.87e-01 -0.0285 0.2 0.067 gdT L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 202981 sc-eQTL 2.65e-01 -0.225 0.201 0.067 gdT L2
ENSG00000287510 AL137857.1 189792 sc-eQTL 7.08e-01 0.0735 0.196 0.067 gdT L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -375303 sc-eQTL 6.01e-01 -0.0857 0.164 0.069 intMono L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -375497 sc-eQTL 1.03e-01 0.287 0.175 0.069 intMono L2
ENSG00000134644 PUM1 -144506 sc-eQTL 6.10e-01 -0.0763 0.149 0.069 intMono L2
ENSG00000162511 LAPTM5 163711 sc-eQTL 7.18e-03 0.313 0.115 0.069 intMono L2
ENSG00000162512 SDC3 12727 sc-eQTL 1.85e-02 -0.376 0.158 0.069 intMono L2
ENSG00000162517 PEF1 -723411 sc-eQTL 1.93e-01 0.219 0.168 0.069 intMono L2
ENSG00000168528 SERINC2 -488080 sc-eQTL 2.31e-01 -0.201 0.167 0.069 intMono L2
ENSG00000284543 LINC01226 -584741 sc-eQTL 6.62e-01 0.0696 0.159 0.069 intMono L2
ENSG00000287510 AL137857.1 189792 sc-eQTL 8.61e-01 -0.0279 0.159 0.069 intMono L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -375303 sc-eQTL 8.40e-01 0.0307 0.152 0.07 ncMono L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -375497 sc-eQTL 4.58e-01 0.12 0.161 0.07 ncMono L2
ENSG00000134644 PUM1 -144506 sc-eQTL 6.20e-01 0.0655 0.132 0.07 ncMono L2
ENSG00000162511 LAPTM5 163711 sc-eQTL 6.62e-03 0.323 0.118 0.07 ncMono L2
ENSG00000162512 SDC3 12727 sc-eQTL 7.25e-03 -0.358 0.132 0.07 ncMono L2
ENSG00000162517 PEF1 -723411 sc-eQTL 7.72e-01 0.0446 0.154 0.07 ncMono L2
ENSG00000168528 SERINC2 -488080 sc-eQTL 6.44e-01 -0.0678 0.147 0.07 ncMono L2
ENSG00000284543 LINC01226 -584741 sc-eQTL 8.06e-01 0.0361 0.147 0.07 ncMono L2
ENSG00000287510 AL137857.1 189792 sc-eQTL 2.26e-01 -0.184 0.151 0.07 ncMono L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -375303 sc-eQTL 9.52e-01 0.00992 0.164 0.079 pDC L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -375497 sc-eQTL 7.85e-01 0.0491 0.18 0.079 pDC L2
ENSG00000134644 PUM1 -144506 sc-eQTL 2.01e-01 0.19 0.148 0.079 pDC L2
ENSG00000162511 LAPTM5 163711 sc-eQTL 5.69e-04 0.47 0.133 0.079 pDC L2
ENSG00000162517 PEF1 -723411 sc-eQTL 5.11e-01 0.118 0.18 0.079 pDC L2
ENSG00000168528 SERINC2 -488080 sc-eQTL 9.51e-01 0.0104 0.168 0.079 pDC L2
ENSG00000284543 LINC01226 -584741 sc-eQTL 5.07e-01 0.0867 0.13 0.079 pDC L2
ENSG00000287510 AL137857.1 189792 sc-eQTL 3.06e-01 -0.157 0.153 0.079 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000060688 SNRNP40 -375303 sc-eQTL 7.90e-01 0.047 0.176 0.068 B_Memory LOneK1K
ENSG00000121766 ZCCHC17 -375497 sc-eQTL 4.55e-01 -0.109 0.146 0.068 B_Memory LOneK1K
ENSG00000134644 PUM1 -144506 sc-eQTL 2.60e-01 0.146 0.129 0.068 B_Memory LOneK1K
ENSG00000162510 MATN1 197900 sc-eQTL 1.27e-01 0.225 0.147 0.068 B_Memory LOneK1K
ENSG00000162511 LAPTM5 163711 sc-eQTL 1.23e-01 -0.143 0.0925 0.068 B_Memory LOneK1K
ENSG00000162517 PEF1 -723411 sc-eQTL 7.36e-01 0.052 0.154 0.068 B_Memory LOneK1K
ENSG00000186056 MATN1-AS1 202981 sc-eQTL 8.64e-01 0.0211 0.123 0.068 B_Memory LOneK1K
ENSG00000287510 AL137857.1 189792 sc-eQTL 9.72e-01 -0.00463 0.134 0.068 B_Memory LOneK1K
ENSG00000060688 SNRNP40 -375303 sc-eQTL 3.85e-01 0.139 0.16 0.068 B_Naive LOneK1K
ENSG00000121766 ZCCHC17 -375497 sc-eQTL 4.88e-02 -0.248 0.125 0.068 B_Naive LOneK1K
ENSG00000134644 PUM1 -144506 sc-eQTL 3.18e-01 -0.12 0.119 0.068 B_Naive LOneK1K
ENSG00000162510 MATN1 197900 sc-eQTL 4.11e-01 -0.0948 0.115 0.068 B_Naive LOneK1K
ENSG00000162511 LAPTM5 163711 sc-eQTL 7.17e-01 0.0294 0.0811 0.068 B_Naive LOneK1K
ENSG00000162517 PEF1 -723411 sc-eQTL 4.82e-01 -0.104 0.148 0.068 B_Naive LOneK1K
ENSG00000186056 MATN1-AS1 202981 sc-eQTL 5.95e-01 -0.0557 0.105 0.068 B_Naive LOneK1K
ENSG00000287510 AL137857.1 189792 sc-eQTL 9.88e-01 -0.0018 0.124 0.068 B_Naive LOneK1K
ENSG00000060688 SNRNP40 -375303 sc-eQTL 8.93e-01 0.0181 0.135 0.068 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000121766 ZCCHC17 -375497 sc-eQTL 4.37e-01 0.119 0.152 0.068 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000134644 PUM1 -144506 sc-eQTL 7.13e-01 0.0359 0.0974 0.068 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000162511 LAPTM5 163711 sc-eQTL 2.10e-01 0.107 0.0853 0.068 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000162512 SDC3 12727 sc-eQTL 2.84e-04 -0.625 0.169 0.068 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000162517 PEF1 -723411 sc-eQTL 7.78e-01 -0.0346 0.123 0.068 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000168528 SERINC2 -488080 sc-eQTL 8.19e-01 0.0412 0.18 0.068 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000284543 LINC01226 -584741 sc-eQTL 3.86e-01 -0.128 0.147 0.068 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000287510 AL137857.1 189792 sc-eQTL 1.91e-01 -0.18 0.137 0.068 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000060688 SNRNP40 -375303 sc-eQTL 8.63e-01 0.0253 0.146 0.069 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000121766 ZCCHC17 -375497 sc-eQTL 7.77e-02 0.281 0.159 0.069 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000134644 PUM1 -144506 sc-eQTL 6.83e-01 -0.0536 0.131 0.069 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000162511 LAPTM5 163711 sc-eQTL 7.48e-03 0.278 0.103 0.069 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000162512 SDC3 12727 sc-eQTL 9.26e-03 -0.396 0.151 0.069 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000162517 PEF1 -723411 sc-eQTL 9.34e-01 0.0115 0.139 0.069 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000168528 SERINC2 -488080 sc-eQTL 4.18e-01 -0.129 0.158 0.069 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000284543 LINC01226 -584741 sc-eQTL 5.84e-01 0.0827 0.151 0.069 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000287510 AL137857.1 189792 sc-eQTL 6.52e-01 -0.0681 0.151 0.069 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000060688 SNRNP40 -375303 sc-eQTL 2.02e-01 -0.208 0.162 0.069 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000121753 ADGRB2 -843408 sc-eQTL 9.41e-01 -0.0103 0.139 0.069 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000121766 ZCCHC17 -375497 sc-eQTL 8.68e-01 -0.0185 0.111 0.069 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000134644 PUM1 -144506 sc-eQTL 5.41e-02 -0.234 0.121 0.069 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000162511 LAPTM5 163711 sc-eQTL 3.86e-01 0.118 0.136 0.069 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000162517 PEF1 -723411 sc-eQTL 5.59e-01 -0.0605 0.103 0.069 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000186056 MATN1-AS1 202981 sc-eQTL 9.01e-01 -0.0195 0.157 0.069 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000287510 AL137857.1 189792 sc-eQTL 6.82e-01 -0.0556 0.136 0.069 NK_CD56dim LOneK1K

Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF
ENSG00000162510 MATN1 197900 eQTL 0.0273 -0.0955 0.0432 0.0 0.0 0.0525
ENSG00000162512 SDC3 12727 eQTL 1.92e-16 -0.439 0.0524 0.424 0.453 0.0525
ENSG00000162517 PEF1 -723411 eQTL 0.0251 0.0734 0.0327 0.0 0.0 0.0525

Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina
ENSG00000162512 SDC3 12727 4.29e-05 3.73e-05 6.57e-06 1.62e-05 6.62e-06 1.59e-05 4.92e-05 5.56e-06 3.69e-05 1.76e-05 4.51e-05 1.99e-05 5.78e-05 1.54e-05 7.89e-06 2.32e-05 1.96e-05 2.91e-05 8.6e-06 7.47e-06 1.82e-05 4.07e-05 3.46e-05 1.02e-05 5.14e-05 9.62e-06 1.69e-05 1.53e-05 3.61e-05 2.67e-05 2.25e-05 1.61e-06 2.75e-06 7.83e-06 1.26e-05 6.29e-06 3.43e-06 3.2e-06 5.45e-06 3.48e-06 1.75e-06 4.41e-05 4.04e-06 4.41e-07 2.78e-06 4.74e-06 4.57e-06 1.8e-06 1.52e-06