logo

Genes within 1Mb (chr1:30921330:G:T):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD

Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000060688 SNRNP40 -375458 sc-eQTL 3.05e-01 0.153 0.149 0.071 B L1
ENSG00000121766 ZCCHC17 -375652 sc-eQTL 1.21e-01 -0.185 0.119 0.071 B L1
ENSG00000134644 PUM1 -144661 sc-eQTL 4.19e-01 -0.0809 0.0999 0.071 B L1
ENSG00000162510 MATN1 197745 sc-eQTL 8.63e-01 -0.0182 0.105 0.071 B L1
ENSG00000162511 LAPTM5 163556 sc-eQTL 4.55e-01 -0.0616 0.0823 0.071 B L1
ENSG00000162517 PEF1 -723566 sc-eQTL 8.13e-01 -0.0295 0.124 0.071 B L1
ENSG00000186056 MATN1-AS1 202826 sc-eQTL 3.00e-01 -0.1 0.0963 0.071 B L1
ENSG00000287510 AL137857.1 189637 sc-eQTL 9.95e-01 0.000688 0.114 0.071 B L1
ENSG00000060688 SNRNP40 -375458 sc-eQTL 1.58e-01 -0.181 0.127 0.071 CD4T L1
ENSG00000121766 ZCCHC17 -375652 sc-eQTL 3.75e-01 0.0887 0.0998 0.071 CD4T L1
ENSG00000134644 PUM1 -144661 sc-eQTL 6.18e-01 0.0444 0.089 0.071 CD4T L1
ENSG00000162511 LAPTM5 163556 sc-eQTL 8.98e-01 -0.0127 0.0986 0.071 CD4T L1
ENSG00000162517 PEF1 -723566 sc-eQTL 9.51e-01 -0.00633 0.103 0.071 CD4T L1
ENSG00000186056 MATN1-AS1 202826 sc-eQTL 4.23e-01 -0.0708 0.0881 0.071 CD4T L1
ENSG00000287510 AL137857.1 189637 sc-eQTL 5.73e-01 -0.0597 0.106 0.071 CD4T L1
ENSG00000060688 SNRNP40 -375458 sc-eQTL 1.03e-01 -0.276 0.168 0.071 CD8T L1
ENSG00000121766 ZCCHC17 -375652 sc-eQTL 5.73e-01 0.0637 0.113 0.071 CD8T L1
ENSG00000134644 PUM1 -144661 sc-eQTL 3.75e-01 -0.0883 0.0992 0.071 CD8T L1
ENSG00000162511 LAPTM5 163556 sc-eQTL 7.29e-01 -0.0334 0.0965 0.071 CD8T L1
ENSG00000162517 PEF1 -723566 sc-eQTL 4.22e-01 -0.0954 0.119 0.071 CD8T L1
ENSG00000186056 MATN1-AS1 202826 sc-eQTL 3.82e-01 -0.0989 0.113 0.071 CD8T L1
ENSG00000287510 AL137857.1 189637 sc-eQTL 7.85e-01 -0.0388 0.142 0.071 CD8T L1
ENSG00000060688 SNRNP40 -375458 sc-eQTL 7.65e-01 -0.0449 0.15 0.072 DC L1
ENSG00000121766 ZCCHC17 -375652 sc-eQTL 6.78e-01 0.0739 0.178 0.072 DC L1
ENSG00000134644 PUM1 -144661 sc-eQTL 8.32e-01 0.0297 0.139 0.072 DC L1
ENSG00000162511 LAPTM5 163556 sc-eQTL 4.95e-02 0.195 0.0986 0.072 DC L1
ENSG00000162517 PEF1 -723566 sc-eQTL 4.66e-01 0.118 0.161 0.072 DC L1
ENSG00000168528 SERINC2 -488235 sc-eQTL 4.14e-01 -0.134 0.164 0.072 DC L1
ENSG00000284543 LINC01226 -584896 sc-eQTL 3.90e-01 0.0935 0.109 0.072 DC L1
ENSG00000287510 AL137857.1 189637 sc-eQTL 4.64e-01 -0.115 0.157 0.072 DC L1
ENSG00000060688 SNRNP40 -375458 sc-eQTL 6.25e-01 0.0576 0.118 0.071 Mono L1
ENSG00000121766 ZCCHC17 -375652 sc-eQTL 2.15e-01 0.181 0.145 0.071 Mono L1
ENSG00000134644 PUM1 -144661 sc-eQTL 6.62e-01 0.0409 0.0936 0.071 Mono L1
ENSG00000162511 LAPTM5 163556 sc-eQTL 1.76e-01 0.116 0.0857 0.071 Mono L1
ENSG00000162512 SDC3 12572 sc-eQTL 1.22e-05 -0.708 0.158 0.071 Mono L1
ENSG00000162517 PEF1 -723566 sc-eQTL 9.56e-01 -0.00638 0.116 0.071 Mono L1
ENSG00000168528 SERINC2 -488235 sc-eQTL 6.72e-01 0.0751 0.178 0.071 Mono L1
ENSG00000284543 LINC01226 -584896 sc-eQTL 7.50e-01 -0.0498 0.156 0.071 Mono L1
ENSG00000287510 AL137857.1 189637 sc-eQTL 2.39e-01 -0.161 0.136 0.071 Mono L1
ENSG00000060688 SNRNP40 -375458 sc-eQTL 5.29e-02 -0.31 0.159 0.071 NK L1
ENSG00000121753 ADGRB2 -843563 sc-eQTL 7.05e-01 0.0523 0.138 0.071 NK L1
ENSG00000121766 ZCCHC17 -375652 sc-eQTL 8.66e-01 -0.0185 0.11 0.071 NK L1
ENSG00000134644 PUM1 -144661 sc-eQTL 3.13e-02 -0.247 0.114 0.071 NK L1
ENSG00000162511 LAPTM5 163556 sc-eQTL 5.49e-01 0.0795 0.132 0.071 NK L1
ENSG00000162517 PEF1 -723566 sc-eQTL 6.62e-01 -0.0423 0.0967 0.071 NK L1
ENSG00000186056 MATN1-AS1 202826 sc-eQTL 7.36e-01 0.0503 0.149 0.071 NK L1
ENSG00000287510 AL137857.1 189637 sc-eQTL 9.31e-01 0.0119 0.138 0.071 NK L1
ENSG00000060688 SNRNP40 -375458 sc-eQTL 3.83e-01 0.109 0.124 0.071 Other_T L1
ENSG00000121766 ZCCHC17 -375652 sc-eQTL 5.66e-02 -0.253 0.132 0.071 Other_T L1
ENSG00000134644 PUM1 -144661 sc-eQTL 8.34e-01 -0.0252 0.12 0.071 Other_T L1
ENSG00000162511 LAPTM5 163556 sc-eQTL 3.25e-01 -0.0965 0.0979 0.071 Other_T L1
ENSG00000162517 PEF1 -723566 sc-eQTL 8.41e-02 0.226 0.13 0.071 Other_T L1
ENSG00000186056 MATN1-AS1 202826 sc-eQTL 8.89e-01 -0.0225 0.161 0.071 Other_T L1
ENSG00000287510 AL137857.1 189637 sc-eQTL 4.20e-01 0.135 0.167 0.071 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000060688 SNRNP40 -375458 sc-eQTL 3.32e-01 0.187 0.192 0.069 B_Activated L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -375652 sc-eQTL 3.57e-01 0.179 0.194 0.069 B_Activated L2
ENSG00000134644 PUM1 -144661 sc-eQTL 7.88e-01 -0.0487 0.181 0.069 B_Activated L2
ENSG00000162510 MATN1 197745 sc-eQTL 4.99e-01 0.107 0.158 0.069 B_Activated L2
ENSG00000162511 LAPTM5 163556 sc-eQTL 2.03e-01 -0.14 0.11 0.069 B_Activated L2
ENSG00000162517 PEF1 -723566 sc-eQTL 3.08e-01 -0.191 0.187 0.069 B_Activated L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 202826 sc-eQTL 2.33e-01 0.212 0.177 0.069 B_Activated L2
ENSG00000287510 AL137857.1 189637 sc-eQTL 5.30e-01 0.099 0.157 0.069 B_Activated L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -375458 sc-eQTL 5.85e-01 0.0995 0.182 0.071 B_Intermediate L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -375652 sc-eQTL 1.10e-01 -0.242 0.151 0.071 B_Intermediate L2
ENSG00000134644 PUM1 -144661 sc-eQTL 2.58e-01 0.162 0.143 0.071 B_Intermediate L2
ENSG00000162510 MATN1 197745 sc-eQTL 3.14e-01 0.15 0.149 0.071 B_Intermediate L2
ENSG00000162511 LAPTM5 163556 sc-eQTL 3.52e-01 -0.0851 0.0912 0.071 B_Intermediate L2
ENSG00000162517 PEF1 -723566 sc-eQTL 2.58e-01 -0.192 0.169 0.071 B_Intermediate L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 202826 sc-eQTL 7.82e-01 0.0355 0.128 0.071 B_Intermediate L2
ENSG00000287510 AL137857.1 189637 sc-eQTL 9.23e-01 -0.0139 0.144 0.071 B_Intermediate L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -375458 sc-eQTL 8.92e-01 0.0239 0.176 0.071 B_Memory L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -375652 sc-eQTL 9.07e-01 0.0191 0.163 0.071 B_Memory L2
ENSG00000134644 PUM1 -144661 sc-eQTL 3.07e-01 0.145 0.141 0.071 B_Memory L2
ENSG00000162510 MATN1 197745 sc-eQTL 3.74e-01 -0.12 0.135 0.071 B_Memory L2
ENSG00000162511 LAPTM5 163556 sc-eQTL 4.23e-01 -0.0961 0.12 0.071 B_Memory L2
ENSG00000162517 PEF1 -723566 sc-eQTL 4.65e-02 0.318 0.159 0.071 B_Memory L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 202826 sc-eQTL 7.70e-01 -0.0402 0.137 0.071 B_Memory L2
ENSG00000287510 AL137857.1 189637 sc-eQTL 9.14e-01 0.0174 0.161 0.071 B_Memory L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -375458 sc-eQTL 8.60e-01 0.029 0.165 0.071 B_Naive1 L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -375652 sc-eQTL 2.23e-01 -0.173 0.142 0.071 B_Naive1 L2
ENSG00000134644 PUM1 -144661 sc-eQTL 7.01e-01 -0.0481 0.125 0.071 B_Naive1 L2
ENSG00000162510 MATN1 197745 sc-eQTL 8.21e-01 -0.0289 0.127 0.071 B_Naive1 L2
ENSG00000162511 LAPTM5 163556 sc-eQTL 4.10e-01 0.07 0.0848 0.071 B_Naive1 L2
ENSG00000162517 PEF1 -723566 sc-eQTL 9.35e-01 0.0122 0.15 0.071 B_Naive1 L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 202826 sc-eQTL 9.28e-01 -0.0101 0.112 0.071 B_Naive1 L2
ENSG00000287510 AL137857.1 189637 sc-eQTL 7.42e-01 -0.0455 0.138 0.071 B_Naive1 L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -375458 sc-eQTL 2.24e-01 0.209 0.171 0.071 B_Naive2 L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -375652 sc-eQTL 3.58e-01 -0.13 0.142 0.071 B_Naive2 L2
ENSG00000134644 PUM1 -144661 sc-eQTL 2.44e-01 -0.162 0.138 0.071 B_Naive2 L2
ENSG00000162510 MATN1 197745 sc-eQTL 3.30e-01 -0.13 0.133 0.071 B_Naive2 L2
ENSG00000162511 LAPTM5 163556 sc-eQTL 8.59e-01 -0.0161 0.0905 0.071 B_Naive2 L2
ENSG00000162517 PEF1 -723566 sc-eQTL 1.49e-02 -0.398 0.162 0.071 B_Naive2 L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 202826 sc-eQTL 5.12e-01 -0.0865 0.132 0.071 B_Naive2 L2
ENSG00000287510 AL137857.1 189637 sc-eQTL 6.51e-01 -0.0644 0.142 0.071 B_Naive2 L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -375458 sc-eQTL 9.86e-01 -0.00303 0.174 0.07 CD4_CTL L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -375652 sc-eQTL 3.91e-01 -0.147 0.171 0.07 CD4_CTL L2
ENSG00000134644 PUM1 -144661 sc-eQTL 6.46e-01 -0.0771 0.168 0.07 CD4_CTL L2
ENSG00000162511 LAPTM5 163556 sc-eQTL 1.95e-01 0.194 0.149 0.07 CD4_CTL L2
ENSG00000162517 PEF1 -723566 sc-eQTL 5.28e-01 0.0969 0.153 0.07 CD4_CTL L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 202826 sc-eQTL 2.79e-01 -0.177 0.163 0.07 CD4_CTL L2
ENSG00000287510 AL137857.1 189637 sc-eQTL 5.00e-01 -0.0974 0.144 0.07 CD4_CTL L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -375458 sc-eQTL 1.50e-01 -0.192 0.133 0.071 CD4_Naive L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -375652 sc-eQTL 5.01e-01 0.0798 0.118 0.071 CD4_Naive L2
ENSG00000134644 PUM1 -144661 sc-eQTL 3.44e-01 0.0895 0.0944 0.071 CD4_Naive L2
ENSG00000162511 LAPTM5 163556 sc-eQTL 5.18e-01 -0.0656 0.101 0.071 CD4_Naive L2
ENSG00000162517 PEF1 -723566 sc-eQTL 5.13e-01 -0.0728 0.111 0.071 CD4_Naive L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 202826 sc-eQTL 7.77e-01 -0.0292 0.103 0.071 CD4_Naive L2
ENSG00000287510 AL137857.1 189637 sc-eQTL 3.27e-01 -0.116 0.118 0.071 CD4_Naive L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -375458 sc-eQTL 8.85e-02 -0.284 0.166 0.071 CD4_TCM L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -375652 sc-eQTL 1.01e-01 0.221 0.134 0.071 CD4_TCM L2
ENSG00000134644 PUM1 -144661 sc-eQTL 5.21e-01 0.0768 0.119 0.071 CD4_TCM L2
ENSG00000162511 LAPTM5 163556 sc-eQTL 6.14e-01 0.05 0.099 0.071 CD4_TCM L2
ENSG00000162517 PEF1 -723566 sc-eQTL 7.04e-01 0.0506 0.133 0.071 CD4_TCM L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 202826 sc-eQTL 8.72e-01 -0.0203 0.126 0.071 CD4_TCM L2
ENSG00000287510 AL137857.1 189637 sc-eQTL 7.67e-01 0.0415 0.14 0.071 CD4_TCM L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -375458 sc-eQTL 1.08e-01 0.267 0.166 0.071 CD4_TEM L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -375652 sc-eQTL 4.23e-01 -0.127 0.159 0.071 CD4_TEM L2
ENSG00000134644 PUM1 -144661 sc-eQTL 7.76e-01 0.0376 0.132 0.071 CD4_TEM L2
ENSG00000162511 LAPTM5 163556 sc-eQTL 9.99e-01 -0.000169 0.134 0.071 CD4_TEM L2
ENSG00000162517 PEF1 -723566 sc-eQTL 5.09e-01 0.099 0.15 0.071 CD4_TEM L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 202826 sc-eQTL 4.42e-01 -0.12 0.156 0.071 CD4_TEM L2
ENSG00000287510 AL137857.1 189637 sc-eQTL 1.47e-01 -0.224 0.153 0.071 CD4_TEM L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -375458 sc-eQTL 1.19e-02 -0.456 0.18 0.071 CD8_CTL L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -375652 sc-eQTL 7.07e-01 0.0526 0.14 0.071 CD8_CTL L2
ENSG00000134644 PUM1 -144661 sc-eQTL 6.72e-01 0.0576 0.136 0.071 CD8_CTL L2
ENSG00000162511 LAPTM5 163556 sc-eQTL 4.00e-01 0.127 0.15 0.071 CD8_CTL L2
ENSG00000162517 PEF1 -723566 sc-eQTL 6.96e-01 -0.0513 0.131 0.071 CD8_CTL L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 202826 sc-eQTL 6.49e-01 -0.072 0.158 0.071 CD8_CTL L2
ENSG00000287510 AL137857.1 189637 sc-eQTL 9.37e-01 0.0118 0.149 0.071 CD8_CTL L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -375458 sc-eQTL 8.54e-01 -0.0311 0.169 0.071 CD8_Naive L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -375652 sc-eQTL 8.80e-01 -0.0221 0.146 0.071 CD8_Naive L2
ENSG00000134644 PUM1 -144661 sc-eQTL 8.78e-01 0.0181 0.117 0.071 CD8_Naive L2
ENSG00000162511 LAPTM5 163556 sc-eQTL 7.14e-01 -0.0412 0.112 0.071 CD8_Naive L2
ENSG00000162517 PEF1 -723566 sc-eQTL 3.96e-01 -0.132 0.156 0.071 CD8_Naive L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 202826 sc-eQTL 3.22e-01 -0.139 0.14 0.071 CD8_Naive L2
ENSG00000287510 AL137857.1 189637 sc-eQTL 6.52e-01 0.0689 0.152 0.071 CD8_Naive L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -375458 sc-eQTL 4.67e-01 -0.15 0.205 0.065 CD8_TCM L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -375652 sc-eQTL 1.64e-01 0.262 0.188 0.065 CD8_TCM L2
ENSG00000134644 PUM1 -144661 sc-eQTL 5.69e-02 -0.336 0.176 0.065 CD8_TCM L2
ENSG00000162511 LAPTM5 163556 sc-eQTL 4.28e-01 -0.147 0.185 0.065 CD8_TCM L2
ENSG00000162517 PEF1 -723566 sc-eQTL 1.79e-01 0.255 0.189 0.065 CD8_TCM L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 202826 sc-eQTL 9.01e-01 -0.0214 0.172 0.065 CD8_TCM L2
ENSG00000287510 AL137857.1 189637 sc-eQTL 8.78e-01 -0.0266 0.174 0.065 CD8_TCM L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -375458 sc-eQTL 1.36e-01 0.274 0.183 0.073 CD8_TEM L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -375652 sc-eQTL 6.99e-01 -0.0684 0.177 0.073 CD8_TEM L2
ENSG00000134644 PUM1 -144661 sc-eQTL 6.67e-01 -0.0779 0.181 0.073 CD8_TEM L2
ENSG00000162511 LAPTM5 163556 sc-eQTL 3.00e-01 0.176 0.169 0.073 CD8_TEM L2
ENSG00000162517 PEF1 -723566 sc-eQTL 2.49e-01 -0.184 0.159 0.073 CD8_TEM L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 202826 sc-eQTL 1.91e-02 -0.411 0.174 0.073 CD8_TEM L2
ENSG00000287510 AL137857.1 189637 sc-eQTL 1.49e-02 -0.386 0.157 0.073 CD8_TEM L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -375458 sc-eQTL 9.30e-01 0.0158 0.18 0.069 MAIT L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -375652 sc-eQTL 3.04e-02 -0.345 0.158 0.069 MAIT L2
ENSG00000134644 PUM1 -144661 sc-eQTL 9.77e-01 0.00446 0.153 0.069 MAIT L2
ENSG00000162511 LAPTM5 163556 sc-eQTL 4.66e-01 -0.105 0.144 0.069 MAIT L2
ENSG00000162517 PEF1 -723566 sc-eQTL 1.03e-01 0.258 0.158 0.069 MAIT L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 202826 sc-eQTL 8.82e-01 0.0238 0.161 0.069 MAIT L2
ENSG00000287510 AL137857.1 189637 sc-eQTL 4.60e-01 0.123 0.166 0.069 MAIT L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -375458 sc-eQTL 6.27e-01 -0.0873 0.18 0.073 NK_CD56bright L2
ENSG00000121753 ADGRB2 -843563 sc-eQTL 3.24e-01 0.139 0.14 0.073 NK_CD56bright L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -375652 sc-eQTL 6.51e-01 -0.0688 0.152 0.073 NK_CD56bright L2
ENSG00000134644 PUM1 -144661 sc-eQTL 9.53e-01 -0.00938 0.159 0.073 NK_CD56bright L2
ENSG00000162511 LAPTM5 163556 sc-eQTL 7.13e-01 -0.0579 0.157 0.073 NK_CD56bright L2
ENSG00000162517 PEF1 -723566 sc-eQTL 1.27e-01 0.233 0.152 0.073 NK_CD56bright L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 202826 sc-eQTL 6.96e-01 0.0619 0.158 0.073 NK_CD56bright L2
ENSG00000287510 AL137857.1 189637 sc-eQTL 2.93e-01 -0.164 0.155 0.073 NK_CD56bright L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -375458 sc-eQTL 1.90e-01 -0.223 0.17 0.071 NK_CD56dim L2
ENSG00000121753 ADGRB2 -843563 sc-eQTL 8.35e-01 0.0312 0.15 0.071 NK_CD56dim L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -375652 sc-eQTL 5.27e-01 -0.0797 0.126 0.071 NK_CD56dim L2
ENSG00000134644 PUM1 -144661 sc-eQTL 2.89e-02 -0.281 0.128 0.071 NK_CD56dim L2
ENSG00000162511 LAPTM5 163556 sc-eQTL 9.23e-01 0.0133 0.138 0.071 NK_CD56dim L2
ENSG00000162517 PEF1 -723566 sc-eQTL 4.08e-02 -0.25 0.121 0.071 NK_CD56dim L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 202826 sc-eQTL 8.32e-01 -0.0367 0.173 0.071 NK_CD56dim L2
ENSG00000287510 AL137857.1 189637 sc-eQTL 9.93e-01 0.00119 0.142 0.071 NK_CD56dim L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -375458 sc-eQTL 3.58e-01 0.167 0.182 0.068 NK_HLA L2
ENSG00000121753 ADGRB2 -843563 sc-eQTL 8.32e-01 0.0307 0.145 0.068 NK_HLA L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -375652 sc-eQTL 3.42e-01 0.155 0.162 0.068 NK_HLA L2
ENSG00000134644 PUM1 -144661 sc-eQTL 3.39e-01 -0.152 0.158 0.068 NK_HLA L2
ENSG00000162511 LAPTM5 163556 sc-eQTL 1.55e-01 0.215 0.15 0.068 NK_HLA L2
ENSG00000162517 PEF1 -723566 sc-eQTL 7.64e-01 -0.0512 0.17 0.068 NK_HLA L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 202826 sc-eQTL 1.43e-01 -0.235 0.16 0.068 NK_HLA L2
ENSG00000287510 AL137857.1 189637 sc-eQTL 8.10e-01 0.0374 0.156 0.068 NK_HLA L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -375458 sc-eQTL 1.34e-01 -0.249 0.166 0.071 NK_cytokine L2
ENSG00000121753 ADGRB2 -843563 sc-eQTL 5.54e-01 0.0893 0.151 0.071 NK_cytokine L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -375652 sc-eQTL 4.93e-01 -0.0893 0.13 0.071 NK_cytokine L2
ENSG00000134644 PUM1 -144661 sc-eQTL 6.73e-01 -0.0596 0.141 0.071 NK_cytokine L2
ENSG00000162511 LAPTM5 163556 sc-eQTL 7.81e-01 0.0431 0.155 0.071 NK_cytokine L2
ENSG00000162517 PEF1 -723566 sc-eQTL 2.80e-01 0.143 0.132 0.071 NK_cytokine L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 202826 sc-eQTL 5.00e-01 0.111 0.164 0.071 NK_cytokine L2
ENSG00000287510 AL137857.1 189637 sc-eQTL 3.12e-01 -0.155 0.153 0.071 NK_cytokine L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -375458 sc-eQTL 8.01e-01 0.0446 0.177 0.081 PB L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -375652 sc-eQTL 8.98e-01 -0.0265 0.205 0.081 PB L2
ENSG00000134644 PUM1 -144661 sc-eQTL 3.77e-01 -0.158 0.178 0.081 PB L2
ENSG00000162510 MATN1 197745 sc-eQTL 3.89e-01 -0.143 0.166 0.081 PB L2
ENSG00000162511 LAPTM5 163556 sc-eQTL 4.07e-02 0.241 0.117 0.081 PB L2
ENSG00000162517 PEF1 -723566 sc-eQTL 2.01e-01 -0.234 0.181 0.081 PB L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 202826 sc-eQTL 3.72e-01 -0.145 0.162 0.081 PB L2
ENSG00000287510 AL137857.1 189637 sc-eQTL 1.09e-01 -0.276 0.171 0.081 PB L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -375458 sc-eQTL 6.24e-01 0.0668 0.136 0.067 Pro_T L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -375652 sc-eQTL 7.51e-01 0.0548 0.173 0.067 Pro_T L2
ENSG00000134644 PUM1 -144661 sc-eQTL 9.50e-01 0.0102 0.161 0.067 Pro_T L2
ENSG00000162511 LAPTM5 163556 sc-eQTL 7.89e-01 0.031 0.115 0.067 Pro_T L2
ENSG00000162517 PEF1 -723566 sc-eQTL 7.59e-01 -0.052 0.169 0.067 Pro_T L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 202826 sc-eQTL 9.86e-01 0.00292 0.161 0.067 Pro_T L2
ENSG00000287510 AL137857.1 189637 sc-eQTL 6.09e-01 0.076 0.148 0.067 Pro_T L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -375458 sc-eQTL 3.55e-01 -0.16 0.173 0.071 Treg L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -375652 sc-eQTL 6.65e-01 -0.0725 0.167 0.071 Treg L2
ENSG00000134644 PUM1 -144661 sc-eQTL 2.02e-01 -0.171 0.133 0.071 Treg L2
ENSG00000162511 LAPTM5 163556 sc-eQTL 3.30e-01 -0.149 0.153 0.071 Treg L2
ENSG00000162517 PEF1 -723566 sc-eQTL 2.91e-01 0.175 0.165 0.071 Treg L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 202826 sc-eQTL 8.80e-01 -0.0236 0.156 0.071 Treg L2
ENSG00000287510 AL137857.1 189637 sc-eQTL 2.82e-01 -0.168 0.156 0.071 Treg L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -375458 sc-eQTL 2.42e-01 -0.199 0.17 0.076 cDC L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -375652 sc-eQTL 8.65e-01 0.0315 0.185 0.076 cDC L2
ENSG00000134644 PUM1 -144661 sc-eQTL 6.23e-01 -0.0779 0.158 0.076 cDC L2
ENSG00000162511 LAPTM5 163556 sc-eQTL 9.80e-01 -0.00274 0.111 0.076 cDC L2
ENSG00000162517 PEF1 -723566 sc-eQTL 6.05e-01 -0.0833 0.161 0.076 cDC L2
ENSG00000168528 SERINC2 -488235 sc-eQTL 5.08e-01 -0.0946 0.142 0.076 cDC L2
ENSG00000284543 LINC01226 -584896 sc-eQTL 4.62e-01 -0.103 0.14 0.076 cDC L2
ENSG00000287510 AL137857.1 189637 sc-eQTL 9.61e-01 -0.00747 0.151 0.076 cDC L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -375458 sc-eQTL 8.51e-01 0.0265 0.141 0.071 cMono_IL1B L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -375652 sc-eQTL 3.21e-01 0.156 0.157 0.071 cMono_IL1B L2
ENSG00000134644 PUM1 -144661 sc-eQTL 3.33e-01 0.103 0.106 0.071 cMono_IL1B L2
ENSG00000162511 LAPTM5 163556 sc-eQTL 8.81e-02 0.159 0.0927 0.071 cMono_IL1B L2
ENSG00000162512 SDC3 12572 sc-eQTL 2.16e-03 -0.534 0.172 0.071 cMono_IL1B L2
ENSG00000162517 PEF1 -723566 sc-eQTL 5.53e-02 -0.274 0.142 0.071 cMono_IL1B L2
ENSG00000168528 SERINC2 -488235 sc-eQTL 6.90e-01 0.0711 0.178 0.071 cMono_IL1B L2
ENSG00000284543 LINC01226 -584896 sc-eQTL 6.33e-01 -0.0752 0.157 0.071 cMono_IL1B L2
ENSG00000287510 AL137857.1 189637 sc-eQTL 2.20e-01 -0.18 0.146 0.071 cMono_IL1B L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -375458 sc-eQTL 5.23e-01 0.094 0.147 0.071 cMono_S100A L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -375652 sc-eQTL 9.45e-01 0.012 0.174 0.071 cMono_S100A L2
ENSG00000134644 PUM1 -144661 sc-eQTL 4.23e-01 -0.101 0.125 0.071 cMono_S100A L2
ENSG00000162511 LAPTM5 163556 sc-eQTL 8.42e-01 0.0192 0.0965 0.071 cMono_S100A L2
ENSG00000162512 SDC3 12572 sc-eQTL 8.76e-03 -0.434 0.164 0.071 cMono_S100A L2
ENSG00000162517 PEF1 -723566 sc-eQTL 5.06e-01 0.1 0.15 0.071 cMono_S100A L2
ENSG00000168528 SERINC2 -488235 sc-eQTL 7.94e-01 0.0461 0.177 0.071 cMono_S100A L2
ENSG00000284543 LINC01226 -584896 sc-eQTL 2.50e-01 -0.165 0.143 0.071 cMono_S100A L2
ENSG00000287510 AL137857.1 189637 sc-eQTL 6.11e-01 -0.0734 0.144 0.071 cMono_S100A L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -375458 sc-eQTL 1.18e-01 0.354 0.226 0.067 gdT L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -375652 sc-eQTL 4.67e-01 -0.142 0.195 0.067 gdT L2
ENSG00000134644 PUM1 -144661 sc-eQTL 3.51e-01 -0.188 0.201 0.067 gdT L2
ENSG00000162511 LAPTM5 163556 sc-eQTL 9.01e-01 0.0273 0.219 0.067 gdT L2
ENSG00000162517 PEF1 -723566 sc-eQTL 8.87e-01 -0.0285 0.2 0.067 gdT L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 202826 sc-eQTL 2.65e-01 -0.225 0.201 0.067 gdT L2
ENSG00000287510 AL137857.1 189637 sc-eQTL 7.08e-01 0.0735 0.196 0.067 gdT L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -375458 sc-eQTL 4.26e-01 -0.129 0.162 0.071 intMono L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -375652 sc-eQTL 1.28e-01 0.266 0.174 0.071 intMono L2
ENSG00000134644 PUM1 -144661 sc-eQTL 6.10e-01 -0.0758 0.148 0.071 intMono L2
ENSG00000162511 LAPTM5 163556 sc-eQTL 6.16e-03 0.316 0.114 0.071 intMono L2
ENSG00000162512 SDC3 12572 sc-eQTL 5.98e-03 -0.434 0.156 0.071 intMono L2
ENSG00000162517 PEF1 -723566 sc-eQTL 1.94e-01 0.217 0.167 0.071 intMono L2
ENSG00000168528 SERINC2 -488235 sc-eQTL 3.36e-01 -0.16 0.166 0.071 intMono L2
ENSG00000284543 LINC01226 -584896 sc-eQTL 7.29e-01 0.0548 0.158 0.071 intMono L2
ENSG00000287510 AL137857.1 189637 sc-eQTL 9.48e-01 -0.0104 0.158 0.071 intMono L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -375458 sc-eQTL 8.40e-01 0.0307 0.152 0.07 ncMono L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -375652 sc-eQTL 4.58e-01 0.12 0.161 0.07 ncMono L2
ENSG00000134644 PUM1 -144661 sc-eQTL 6.20e-01 0.0655 0.132 0.07 ncMono L2
ENSG00000162511 LAPTM5 163556 sc-eQTL 6.62e-03 0.323 0.118 0.07 ncMono L2
ENSG00000162512 SDC3 12572 sc-eQTL 7.25e-03 -0.358 0.132 0.07 ncMono L2
ENSG00000162517 PEF1 -723566 sc-eQTL 7.72e-01 0.0446 0.154 0.07 ncMono L2
ENSG00000168528 SERINC2 -488235 sc-eQTL 6.44e-01 -0.0678 0.147 0.07 ncMono L2
ENSG00000284543 LINC01226 -584896 sc-eQTL 8.06e-01 0.0361 0.147 0.07 ncMono L2
ENSG00000287510 AL137857.1 189637 sc-eQTL 2.26e-01 -0.184 0.151 0.07 ncMono L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -375458 sc-eQTL 9.52e-01 0.00992 0.164 0.079 pDC L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -375652 sc-eQTL 7.85e-01 0.0491 0.18 0.079 pDC L2
ENSG00000134644 PUM1 -144661 sc-eQTL 2.01e-01 0.19 0.148 0.079 pDC L2
ENSG00000162511 LAPTM5 163556 sc-eQTL 5.69e-04 0.47 0.133 0.079 pDC L2
ENSG00000162517 PEF1 -723566 sc-eQTL 5.11e-01 0.118 0.18 0.079 pDC L2
ENSG00000168528 SERINC2 -488235 sc-eQTL 9.51e-01 0.0104 0.168 0.079 pDC L2
ENSG00000284543 LINC01226 -584896 sc-eQTL 5.07e-01 0.0867 0.13 0.079 pDC L2
ENSG00000287510 AL137857.1 189637 sc-eQTL 3.06e-01 -0.157 0.153 0.079 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000060688 SNRNP40 -375458 sc-eQTL 5.56e-01 0.103 0.174 0.071 B_Memory LOneK1K
ENSG00000121766 ZCCHC17 -375652 sc-eQTL 4.87e-01 -0.101 0.145 0.071 B_Memory LOneK1K
ENSG00000134644 PUM1 -144661 sc-eQTL 2.75e-01 0.14 0.128 0.071 B_Memory LOneK1K
ENSG00000162510 MATN1 197745 sc-eQTL 9.31e-02 0.246 0.146 0.071 B_Memory LOneK1K
ENSG00000162511 LAPTM5 163556 sc-eQTL 1.18e-01 -0.144 0.0916 0.071 B_Memory LOneK1K
ENSG00000162517 PEF1 -723566 sc-eQTL 5.93e-01 0.0817 0.152 0.071 B_Memory LOneK1K
ENSG00000186056 MATN1-AS1 202826 sc-eQTL 8.38e-01 0.025 0.122 0.071 B_Memory LOneK1K
ENSG00000287510 AL137857.1 189637 sc-eQTL 9.08e-01 0.0154 0.133 0.071 B_Memory LOneK1K
ENSG00000060688 SNRNP40 -375458 sc-eQTL 3.60e-01 0.145 0.158 0.071 B_Naive LOneK1K
ENSG00000121766 ZCCHC17 -375652 sc-eQTL 6.04e-02 -0.235 0.124 0.071 B_Naive LOneK1K
ENSG00000134644 PUM1 -144661 sc-eQTL 2.83e-01 -0.127 0.118 0.071 B_Naive LOneK1K
ENSG00000162510 MATN1 197745 sc-eQTL 4.90e-01 -0.079 0.114 0.071 B_Naive LOneK1K
ENSG00000162511 LAPTM5 163556 sc-eQTL 5.93e-01 0.043 0.0804 0.071 B_Naive LOneK1K
ENSG00000162517 PEF1 -723566 sc-eQTL 4.43e-01 -0.113 0.147 0.071 B_Naive LOneK1K
ENSG00000186056 MATN1-AS1 202826 sc-eQTL 7.10e-01 -0.0387 0.104 0.071 B_Naive LOneK1K
ENSG00000287510 AL137857.1 189637 sc-eQTL 9.39e-01 -0.00938 0.123 0.071 B_Naive LOneK1K
ENSG00000060688 SNRNP40 -375458 sc-eQTL 4.10e-01 0.111 0.134 0.071 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000121766 ZCCHC17 -375652 sc-eQTL 6.02e-01 0.0792 0.152 0.071 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000134644 PUM1 -144661 sc-eQTL 7.12e-01 0.0358 0.0969 0.071 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000162511 LAPTM5 163556 sc-eQTL 4.57e-01 0.0634 0.0851 0.071 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000162512 SDC3 12572 sc-eQTL 6.17e-05 -0.684 0.167 0.071 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000162517 PEF1 -723566 sc-eQTL 6.38e-01 -0.0575 0.122 0.071 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000168528 SERINC2 -488235 sc-eQTL 6.48e-01 0.0816 0.179 0.071 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000284543 LINC01226 -584896 sc-eQTL 4.18e-01 -0.119 0.146 0.071 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000287510 AL137857.1 189637 sc-eQTL 1.22e-01 -0.212 0.136 0.071 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000060688 SNRNP40 -375458 sc-eQTL 9.74e-01 -0.0048 0.145 0.071 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000121766 ZCCHC17 -375652 sc-eQTL 7.23e-02 0.285 0.158 0.071 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000134644 PUM1 -144661 sc-eQTL 6.84e-01 -0.053 0.13 0.071 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000162511 LAPTM5 163556 sc-eQTL 6.28e-03 0.282 0.102 0.071 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000162512 SDC3 12572 sc-eQTL 1.07e-02 -0.385 0.15 0.071 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000162517 PEF1 -723566 sc-eQTL 7.90e-01 0.0368 0.138 0.071 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000168528 SERINC2 -488235 sc-eQTL 5.19e-01 -0.102 0.157 0.071 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000284543 LINC01226 -584896 sc-eQTL 6.78e-01 0.0622 0.15 0.071 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000287510 AL137857.1 189637 sc-eQTL 7.41e-01 -0.0495 0.15 0.071 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000060688 SNRNP40 -375458 sc-eQTL 1.03e-01 -0.264 0.161 0.071 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000121753 ADGRB2 -843563 sc-eQTL 8.91e-01 0.019 0.138 0.071 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000121766 ZCCHC17 -375652 sc-eQTL 9.66e-01 -0.00472 0.111 0.071 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000134644 PUM1 -144661 sc-eQTL 5.83e-02 -0.229 0.12 0.071 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000162511 LAPTM5 163556 sc-eQTL 5.00e-01 0.0915 0.135 0.071 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000162517 PEF1 -723566 sc-eQTL 4.65e-01 -0.0753 0.103 0.071 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000186056 MATN1-AS1 202826 sc-eQTL 9.92e-01 -0.00151 0.156 0.071 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000287510 AL137857.1 189637 sc-eQTL 8.14e-01 -0.0318 0.135 0.071 NK_CD56dim LOneK1K

Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF

Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina
ENSG00000162512 \N 12572 3.59e-05 3.25e-05 6.31e-06 1.56e-05 5.94e-06 1.5e-05 4.47e-05 4.59e-06 2.95e-05 1.47e-05 3.73e-05 1.77e-05 4.54e-05 1.38e-05 7.12e-06 1.81e-05 1.7e-05 2.61e-05 7.63e-06 6.66e-06 1.49e-05 3.08e-05 3.2e-05 9.15e-06 4.33e-05 8.36e-06 1.32e-05 1.28e-05 3.26e-05 2.4e-05 1.92e-05 1.64e-06 2.57e-06 7.75e-06 1.17e-05 5.85e-06 3.2e-06 3.15e-06 5.03e-06 3.22e-06 1.71e-06 3.45e-05 3.58e-06 3.84e-07 2.59e-06 4.15e-06 4.14e-06 1.67e-06 1.53e-06