logo

Genes within 1Mb (chr1:30919013:G:A):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD

Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000060688 SNRNP40 -377775 sc-eQTL 4.17e-01 -0.0707 0.087 0.239 B L1
ENSG00000121766 ZCCHC17 -377969 sc-eQTL 7.14e-01 -0.0256 0.0697 0.239 B L1
ENSG00000134644 PUM1 -146978 sc-eQTL 2.00e-01 0.0749 0.0583 0.239 B L1
ENSG00000162510 MATN1 195428 sc-eQTL 7.96e-01 -0.016 0.0615 0.239 B L1
ENSG00000162511 LAPTM5 161239 sc-eQTL 6.12e-01 -0.0245 0.0482 0.239 B L1
ENSG00000162517 PEF1 -725883 sc-eQTL 8.58e-01 0.013 0.0727 0.239 B L1
ENSG00000186056 MATN1-AS1 200509 sc-eQTL 4.38e-01 -0.0439 0.0564 0.239 B L1
ENSG00000287510 AL137857.1 187320 sc-eQTL 9.00e-01 0.00844 0.0668 0.239 B L1
ENSG00000060688 SNRNP40 -377775 sc-eQTL 1.72e-01 0.105 0.0763 0.239 CD4T L1
ENSG00000121766 ZCCHC17 -377969 sc-eQTL 6.95e-01 -0.0235 0.0598 0.239 CD4T L1
ENSG00000134644 PUM1 -146978 sc-eQTL 2.48e-01 0.0615 0.0531 0.239 CD4T L1
ENSG00000162511 LAPTM5 161239 sc-eQTL 6.92e-01 -0.0234 0.059 0.239 CD4T L1
ENSG00000162517 PEF1 -725883 sc-eQTL 1.92e-01 0.0804 0.0615 0.239 CD4T L1
ENSG00000186056 MATN1-AS1 200509 sc-eQTL 1.22e-02 -0.132 0.052 0.239 CD4T L1
ENSG00000287510 AL137857.1 187320 sc-eQTL 8.14e-01 0.0149 0.0633 0.239 CD4T L1
ENSG00000060688 SNRNP40 -377775 sc-eQTL 6.27e-01 -0.0482 0.099 0.239 CD8T L1
ENSG00000121766 ZCCHC17 -377969 sc-eQTL 2.96e-01 -0.0689 0.0658 0.239 CD8T L1
ENSG00000134644 PUM1 -146978 sc-eQTL 3.94e-03 0.166 0.0569 0.239 CD8T L1
ENSG00000162511 LAPTM5 161239 sc-eQTL 8.20e-02 0.0978 0.056 0.239 CD8T L1
ENSG00000162517 PEF1 -725883 sc-eQTL 5.89e-01 0.0375 0.0694 0.239 CD8T L1
ENSG00000186056 MATN1-AS1 200509 sc-eQTL 4.28e-01 0.0524 0.066 0.239 CD8T L1
ENSG00000287510 AL137857.1 187320 sc-eQTL 7.96e-02 -0.145 0.0824 0.239 CD8T L1
ENSG00000060688 SNRNP40 -377775 sc-eQTL 9.42e-01 0.00645 0.0887 0.239 DC L1
ENSG00000121766 ZCCHC17 -377969 sc-eQTL 8.43e-01 -0.0208 0.105 0.239 DC L1
ENSG00000134644 PUM1 -146978 sc-eQTL 9.50e-01 0.00512 0.0822 0.239 DC L1
ENSG00000162511 LAPTM5 161239 sc-eQTL 7.01e-01 -0.0226 0.0587 0.239 DC L1
ENSG00000162517 PEF1 -725883 sc-eQTL 8.92e-01 0.0129 0.0952 0.239 DC L1
ENSG00000168528 SERINC2 -490552 sc-eQTL 2.60e-01 0.109 0.0965 0.239 DC L1
ENSG00000284543 LINC01226 -587213 sc-eQTL 7.66e-01 0.0191 0.0641 0.239 DC L1
ENSG00000287510 AL137857.1 187320 sc-eQTL 2.14e-01 0.115 0.0925 0.239 DC L1
ENSG00000060688 SNRNP40 -377775 sc-eQTL 4.21e-01 0.0556 0.0691 0.239 Mono L1
ENSG00000121766 ZCCHC17 -377969 sc-eQTL 4.69e-01 -0.0621 0.0856 0.239 Mono L1
ENSG00000134644 PUM1 -146978 sc-eQTL 8.71e-01 -0.00892 0.055 0.239 Mono L1
ENSG00000162511 LAPTM5 161239 sc-eQTL 4.27e-01 -0.0402 0.0505 0.239 Mono L1
ENSG00000162512 SDC3 10255 sc-eQTL 1.85e-03 -0.299 0.095 0.239 Mono L1
ENSG00000162517 PEF1 -725883 sc-eQTL 3.31e-01 0.0663 0.068 0.239 Mono L1
ENSG00000168528 SERINC2 -490552 sc-eQTL 5.66e-01 0.0599 0.104 0.239 Mono L1
ENSG00000284543 LINC01226 -587213 sc-eQTL 8.82e-01 0.0136 0.0918 0.239 Mono L1
ENSG00000287510 AL137857.1 187320 sc-eQTL 8.83e-01 0.0118 0.0803 0.239 Mono L1
ENSG00000060688 SNRNP40 -377775 sc-eQTL 6.08e-01 0.049 0.0954 0.238 NK L1
ENSG00000121753 ADGRB2 -845880 sc-eQTL 8.03e-01 -0.0205 0.0822 0.238 NK L1
ENSG00000121766 ZCCHC17 -377969 sc-eQTL 1.42e-03 -0.206 0.0638 0.238 NK L1
ENSG00000134644 PUM1 -146978 sc-eQTL 1.24e-01 0.105 0.0682 0.238 NK L1
ENSG00000162511 LAPTM5 161239 sc-eQTL 1.36e-01 0.117 0.0785 0.238 NK L1
ENSG00000162517 PEF1 -725883 sc-eQTL 4.13e-01 -0.0472 0.0575 0.238 NK L1
ENSG00000186056 MATN1-AS1 200509 sc-eQTL 9.31e-01 -0.00766 0.0886 0.238 NK L1
ENSG00000287510 AL137857.1 187320 sc-eQTL 6.40e-01 -0.0383 0.0818 0.238 NK L1
ENSG00000060688 SNRNP40 -377775 sc-eQTL 7.12e-01 -0.0266 0.0721 0.239 Other_T L1
ENSG00000121766 ZCCHC17 -377969 sc-eQTL 6.07e-01 -0.0396 0.077 0.239 Other_T L1
ENSG00000134644 PUM1 -146978 sc-eQTL 1.58e-01 0.0977 0.069 0.239 Other_T L1
ENSG00000162511 LAPTM5 161239 sc-eQTL 6.46e-01 0.0261 0.0568 0.239 Other_T L1
ENSG00000162517 PEF1 -725883 sc-eQTL 9.40e-01 -0.00573 0.0758 0.239 Other_T L1
ENSG00000186056 MATN1-AS1 200509 sc-eQTL 3.11e-01 -0.0942 0.0928 0.239 Other_T L1
ENSG00000287510 AL137857.1 187320 sc-eQTL 1.93e-01 -0.126 0.0965 0.239 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000060688 SNRNP40 -377775 sc-eQTL 9.88e-01 0.00168 0.113 0.247 B_Activated L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -377969 sc-eQTL 9.02e-01 -0.014 0.114 0.247 B_Activated L2
ENSG00000134644 PUM1 -146978 sc-eQTL 7.60e-01 0.0324 0.106 0.247 B_Activated L2
ENSG00000162510 MATN1 195428 sc-eQTL 6.52e-01 -0.0418 0.0925 0.247 B_Activated L2
ENSG00000162511 LAPTM5 161239 sc-eQTL 9.71e-01 -0.00231 0.0646 0.247 B_Activated L2
ENSG00000162517 PEF1 -725883 sc-eQTL 6.37e-01 0.0518 0.11 0.247 B_Activated L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 200509 sc-eQTL 4.41e-01 -0.0804 0.104 0.247 B_Activated L2
ENSG00000287510 AL137857.1 187320 sc-eQTL 4.57e-01 -0.0686 0.0921 0.247 B_Activated L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -377775 sc-eQTL 8.88e-02 -0.183 0.107 0.24 B_Intermediate L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -377969 sc-eQTL 5.20e-01 -0.0577 0.0896 0.24 B_Intermediate L2
ENSG00000134644 PUM1 -146978 sc-eQTL 9.59e-01 0.00431 0.0846 0.24 B_Intermediate L2
ENSG00000162510 MATN1 195428 sc-eQTL 4.27e-01 -0.07 0.0879 0.24 B_Intermediate L2
ENSG00000162511 LAPTM5 161239 sc-eQTL 7.44e-01 -0.0177 0.054 0.24 B_Intermediate L2
ENSG00000162517 PEF1 -725883 sc-eQTL 8.08e-02 -0.175 0.0996 0.24 B_Intermediate L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 200509 sc-eQTL 9.24e-01 -0.00721 0.0759 0.24 B_Intermediate L2
ENSG00000287510 AL137857.1 187320 sc-eQTL 8.20e-01 -0.0193 0.0849 0.24 B_Intermediate L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -377775 sc-eQTL 9.39e-01 -0.00795 0.104 0.239 B_Memory L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -377969 sc-eQTL 3.91e-01 -0.082 0.0954 0.239 B_Memory L2
ENSG00000134644 PUM1 -146978 sc-eQTL 7.48e-01 -0.0267 0.0831 0.239 B_Memory L2
ENSG00000162510 MATN1 195428 sc-eQTL 9.46e-01 0.00538 0.0795 0.239 B_Memory L2
ENSG00000162511 LAPTM5 161239 sc-eQTL 5.66e-01 0.0405 0.0704 0.239 B_Memory L2
ENSG00000162517 PEF1 -725883 sc-eQTL 5.43e-01 0.0573 0.0941 0.239 B_Memory L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 200509 sc-eQTL 9.72e-01 -0.00287 0.0807 0.239 B_Memory L2
ENSG00000287510 AL137857.1 187320 sc-eQTL 7.66e-01 -0.0282 0.0945 0.239 B_Memory L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -377775 sc-eQTL 4.59e-01 0.071 0.0957 0.239 B_Naive1 L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -377969 sc-eQTL 8.32e-01 0.0175 0.0828 0.239 B_Naive1 L2
ENSG00000134644 PUM1 -146978 sc-eQTL 1.95e-01 0.0945 0.0727 0.239 B_Naive1 L2
ENSG00000162510 MATN1 195428 sc-eQTL 5.99e-01 -0.039 0.074 0.239 B_Naive1 L2
ENSG00000162511 LAPTM5 161239 sc-eQTL 4.23e-01 -0.0396 0.0494 0.239 B_Naive1 L2
ENSG00000162517 PEF1 -725883 sc-eQTL 4.82e-01 0.0614 0.0871 0.239 B_Naive1 L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 200509 sc-eQTL 2.70e-01 -0.0716 0.0648 0.239 B_Naive1 L2
ENSG00000287510 AL137857.1 187320 sc-eQTL 4.71e-01 -0.0579 0.0802 0.239 B_Naive1 L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -377775 sc-eQTL 1.35e-01 -0.152 0.101 0.24 B_Naive2 L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -377969 sc-eQTL 5.05e-01 0.0559 0.0837 0.24 B_Naive2 L2
ENSG00000134644 PUM1 -146978 sc-eQTL 2.71e-01 0.0902 0.0817 0.24 B_Naive2 L2
ENSG00000162510 MATN1 195428 sc-eQTL 9.18e-01 0.00811 0.0787 0.24 B_Naive2 L2
ENSG00000162511 LAPTM5 161239 sc-eQTL 2.40e-01 -0.0627 0.0533 0.24 B_Naive2 L2
ENSG00000162517 PEF1 -725883 sc-eQTL 5.08e-01 -0.0644 0.0971 0.24 B_Naive2 L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 200509 sc-eQTL 5.50e-01 0.0466 0.0777 0.24 B_Naive2 L2
ENSG00000287510 AL137857.1 187320 sc-eQTL 4.66e-01 0.0614 0.0839 0.24 B_Naive2 L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -377775 sc-eQTL 9.68e-01 -0.004 0.0994 0.243 CD4_CTL L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -377969 sc-eQTL 9.97e-01 -0.000352 0.0977 0.243 CD4_CTL L2
ENSG00000134644 PUM1 -146978 sc-eQTL 8.61e-01 -0.0168 0.0958 0.243 CD4_CTL L2
ENSG00000162511 LAPTM5 161239 sc-eQTL 2.29e-01 -0.103 0.0851 0.243 CD4_CTL L2
ENSG00000162517 PEF1 -725883 sc-eQTL 8.81e-01 0.0131 0.0876 0.243 CD4_CTL L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 200509 sc-eQTL 3.74e-01 -0.0831 0.0932 0.243 CD4_CTL L2
ENSG00000287510 AL137857.1 187320 sc-eQTL 9.48e-01 -0.00539 0.0825 0.243 CD4_CTL L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -377775 sc-eQTL 6.55e-02 0.146 0.0791 0.239 CD4_Naive L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -377969 sc-eQTL 3.00e-01 -0.0732 0.0705 0.239 CD4_Naive L2
ENSG00000134644 PUM1 -146978 sc-eQTL 4.02e-01 0.0474 0.0563 0.239 CD4_Naive L2
ENSG00000162511 LAPTM5 161239 sc-eQTL 5.89e-01 -0.0327 0.0604 0.239 CD4_Naive L2
ENSG00000162517 PEF1 -725883 sc-eQTL 2.55e-01 0.0754 0.0661 0.239 CD4_Naive L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 200509 sc-eQTL 1.07e-03 -0.198 0.0598 0.239 CD4_Naive L2
ENSG00000287510 AL137857.1 187320 sc-eQTL 9.01e-01 -0.00878 0.0705 0.239 CD4_Naive L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -377775 sc-eQTL 6.84e-01 0.0408 0.1 0.239 CD4_TCM L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -377969 sc-eQTL 5.72e-01 0.0457 0.0807 0.239 CD4_TCM L2
ENSG00000134644 PUM1 -146978 sc-eQTL 3.35e-01 0.069 0.0714 0.239 CD4_TCM L2
ENSG00000162511 LAPTM5 161239 sc-eQTL 5.82e-01 0.0327 0.0593 0.239 CD4_TCM L2
ENSG00000162517 PEF1 -725883 sc-eQTL 5.17e-01 0.0515 0.0794 0.239 CD4_TCM L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 200509 sc-eQTL 7.93e-01 0.0198 0.0753 0.239 CD4_TCM L2
ENSG00000287510 AL137857.1 187320 sc-eQTL 8.22e-01 0.0189 0.0839 0.239 CD4_TCM L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -377775 sc-eQTL 7.02e-01 0.038 0.0992 0.239 CD4_TEM L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -377969 sc-eQTL 3.43e-01 0.0897 0.0944 0.239 CD4_TEM L2
ENSG00000134644 PUM1 -146978 sc-eQTL 7.06e-01 0.0298 0.0788 0.239 CD4_TEM L2
ENSG00000162511 LAPTM5 161239 sc-eQTL 5.24e-01 0.0508 0.0796 0.239 CD4_TEM L2
ENSG00000162517 PEF1 -725883 sc-eQTL 2.20e-01 0.109 0.089 0.239 CD4_TEM L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 200509 sc-eQTL 7.11e-01 -0.0345 0.0932 0.239 CD4_TEM L2
ENSG00000287510 AL137857.1 187320 sc-eQTL 8.21e-01 -0.0208 0.0919 0.239 CD4_TEM L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -377775 sc-eQTL 5.88e-01 0.0589 0.109 0.239 CD8_CTL L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -377969 sc-eQTL 6.44e-01 0.0385 0.0833 0.239 CD8_CTL L2
ENSG00000134644 PUM1 -146978 sc-eQTL 5.21e-02 0.157 0.0802 0.239 CD8_CTL L2
ENSG00000162511 LAPTM5 161239 sc-eQTL 3.16e-03 0.262 0.0878 0.239 CD8_CTL L2
ENSG00000162517 PEF1 -725883 sc-eQTL 1.15e-01 0.123 0.0776 0.239 CD8_CTL L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 200509 sc-eQTL 4.83e-01 -0.0661 0.0941 0.239 CD8_CTL L2
ENSG00000287510 AL137857.1 187320 sc-eQTL 4.69e-02 -0.176 0.0878 0.239 CD8_CTL L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -377775 sc-eQTL 4.63e-01 -0.0725 0.0987 0.239 CD8_Naive L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -377969 sc-eQTL 7.05e-01 -0.0323 0.0852 0.239 CD8_Naive L2
ENSG00000134644 PUM1 -146978 sc-eQTL 1.55e-01 0.0974 0.0683 0.239 CD8_Naive L2
ENSG00000162511 LAPTM5 161239 sc-eQTL 2.64e-01 0.0734 0.0655 0.239 CD8_Naive L2
ENSG00000162517 PEF1 -725883 sc-eQTL 6.53e-01 -0.0412 0.0913 0.239 CD8_Naive L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 200509 sc-eQTL 5.04e-01 0.0548 0.082 0.239 CD8_Naive L2
ENSG00000287510 AL137857.1 187320 sc-eQTL 9.31e-01 -0.00772 0.0893 0.239 CD8_Naive L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -377775 sc-eQTL 5.85e-01 0.061 0.112 0.238 CD8_TCM L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -377969 sc-eQTL 1.84e-01 -0.136 0.102 0.238 CD8_TCM L2
ENSG00000134644 PUM1 -146978 sc-eQTL 5.40e-03 0.266 0.0944 0.238 CD8_TCM L2
ENSG00000162511 LAPTM5 161239 sc-eQTL 7.97e-01 -0.026 0.101 0.238 CD8_TCM L2
ENSG00000162517 PEF1 -725883 sc-eQTL 4.74e-01 0.0738 0.103 0.238 CD8_TCM L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 200509 sc-eQTL 6.33e-01 0.0446 0.0932 0.238 CD8_TCM L2
ENSG00000287510 AL137857.1 187320 sc-eQTL 3.50e-01 0.0882 0.0941 0.238 CD8_TCM L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -377775 sc-eQTL 6.95e-01 0.0409 0.104 0.233 CD8_TEM L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -377969 sc-eQTL 2.47e-01 -0.115 0.0994 0.233 CD8_TEM L2
ENSG00000134644 PUM1 -146978 sc-eQTL 6.06e-01 0.0526 0.102 0.233 CD8_TEM L2
ENSG00000162511 LAPTM5 161239 sc-eQTL 2.76e-01 0.104 0.0956 0.233 CD8_TEM L2
ENSG00000162517 PEF1 -725883 sc-eQTL 3.04e-01 0.0929 0.09 0.233 CD8_TEM L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 200509 sc-eQTL 3.95e-01 -0.0846 0.0993 0.233 CD8_TEM L2
ENSG00000287510 AL137857.1 187320 sc-eQTL 7.34e-01 -0.0306 0.09 0.233 CD8_TEM L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -377775 sc-eQTL 2.50e-01 -0.12 0.104 0.238 MAIT L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -377969 sc-eQTL 7.04e-01 -0.0352 0.0927 0.238 MAIT L2
ENSG00000134644 PUM1 -146978 sc-eQTL 2.31e-01 0.106 0.0886 0.238 MAIT L2
ENSG00000162511 LAPTM5 161239 sc-eQTL 5.98e-01 0.0443 0.0838 0.238 MAIT L2
ENSG00000162517 PEF1 -725883 sc-eQTL 3.48e-01 -0.0865 0.092 0.238 MAIT L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 200509 sc-eQTL 3.43e-01 -0.0886 0.0932 0.238 MAIT L2
ENSG00000287510 AL137857.1 187320 sc-eQTL 7.02e-01 -0.0369 0.0963 0.238 MAIT L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -377775 sc-eQTL 2.57e-01 0.122 0.108 0.238 NK_CD56bright L2
ENSG00000121753 ADGRB2 -845880 sc-eQTL 1.34e-01 -0.127 0.0842 0.238 NK_CD56bright L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -377969 sc-eQTL 4.81e-01 -0.0644 0.0913 0.238 NK_CD56bright L2
ENSG00000134644 PUM1 -146978 sc-eQTL 7.14e-01 0.0352 0.0959 0.238 NK_CD56bright L2
ENSG00000162511 LAPTM5 161239 sc-eQTL 2.19e-01 0.116 0.0943 0.238 NK_CD56bright L2
ENSG00000162517 PEF1 -725883 sc-eQTL 4.98e-01 -0.0624 0.0919 0.238 NK_CD56bright L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 200509 sc-eQTL 8.69e-01 -0.0157 0.0951 0.238 NK_CD56bright L2
ENSG00000287510 AL137857.1 187320 sc-eQTL 6.17e-01 -0.047 0.0937 0.238 NK_CD56bright L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -377775 sc-eQTL 3.49e-01 0.0942 0.1 0.239 NK_CD56dim L2
ENSG00000121753 ADGRB2 -845880 sc-eQTL 4.29e-01 0.07 0.0884 0.239 NK_CD56dim L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -377969 sc-eQTL 1.45e-02 -0.181 0.0734 0.239 NK_CD56dim L2
ENSG00000134644 PUM1 -146978 sc-eQTL 2.68e-01 0.0845 0.0761 0.239 NK_CD56dim L2
ENSG00000162511 LAPTM5 161239 sc-eQTL 1.92e-01 0.106 0.0811 0.239 NK_CD56dim L2
ENSG00000162517 PEF1 -725883 sc-eQTL 7.36e-01 0.0244 0.0724 0.239 NK_CD56dim L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 200509 sc-eQTL 9.97e-01 0.000366 0.102 0.239 NK_CD56dim L2
ENSG00000287510 AL137857.1 187320 sc-eQTL 8.49e-01 -0.0161 0.0841 0.239 NK_CD56dim L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -377775 sc-eQTL 8.96e-01 -0.0144 0.11 0.24 NK_HLA L2
ENSG00000121753 ADGRB2 -845880 sc-eQTL 7.56e-01 -0.0271 0.087 0.24 NK_HLA L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -377969 sc-eQTL 3.60e-01 -0.0897 0.0977 0.24 NK_HLA L2
ENSG00000134644 PUM1 -146978 sc-eQTL 4.67e-01 0.0694 0.0953 0.24 NK_HLA L2
ENSG00000162511 LAPTM5 161239 sc-eQTL 6.99e-01 0.0352 0.091 0.24 NK_HLA L2
ENSG00000162517 PEF1 -725883 sc-eQTL 1.21e-01 -0.159 0.102 0.24 NK_HLA L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 200509 sc-eQTL 8.28e-01 0.0211 0.0968 0.24 NK_HLA L2
ENSG00000287510 AL137857.1 187320 sc-eQTL 6.95e-01 0.0368 0.0936 0.24 NK_HLA L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -377775 sc-eQTL 7.51e-01 -0.0316 0.0994 0.239 NK_cytokine L2
ENSG00000121753 ADGRB2 -845880 sc-eQTL 2.22e-01 -0.11 0.0895 0.239 NK_cytokine L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -377969 sc-eQTL 1.57e-01 -0.11 0.0772 0.239 NK_cytokine L2
ENSG00000134644 PUM1 -146978 sc-eQTL 4.45e-01 0.0642 0.0838 0.239 NK_cytokine L2
ENSG00000162511 LAPTM5 161239 sc-eQTL 1.75e-02 0.218 0.0911 0.239 NK_cytokine L2
ENSG00000162517 PEF1 -725883 sc-eQTL 6.84e-01 -0.0321 0.0787 0.239 NK_cytokine L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 200509 sc-eQTL 9.64e-01 -0.0044 0.0979 0.239 NK_cytokine L2
ENSG00000287510 AL137857.1 187320 sc-eQTL 6.09e-02 0.17 0.0903 0.239 NK_cytokine L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -377775 sc-eQTL 5.03e-01 0.0858 0.128 0.2 PB L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -377969 sc-eQTL 4.94e-01 0.102 0.148 0.2 PB L2
ENSG00000134644 PUM1 -146978 sc-eQTL 1.54e-02 0.309 0.126 0.2 PB L2
ENSG00000162510 MATN1 195428 sc-eQTL 7.02e-01 -0.046 0.12 0.2 PB L2
ENSG00000162511 LAPTM5 161239 sc-eQTL 6.08e-01 -0.0441 0.0857 0.2 PB L2
ENSG00000162517 PEF1 -725883 sc-eQTL 9.16e-01 0.014 0.132 0.2 PB L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 200509 sc-eQTL 9.23e-01 -0.0114 0.117 0.2 PB L2
ENSG00000287510 AL137857.1 187320 sc-eQTL 6.90e-02 -0.226 0.123 0.2 PB L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -377775 sc-eQTL 4.55e-01 -0.0584 0.078 0.241 Pro_T L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -377969 sc-eQTL 5.72e-02 -0.188 0.0983 0.241 Pro_T L2
ENSG00000134644 PUM1 -146978 sc-eQTL 2.56e-01 0.105 0.0922 0.241 Pro_T L2
ENSG00000162511 LAPTM5 161239 sc-eQTL 9.66e-01 -0.00284 0.0664 0.241 Pro_T L2
ENSG00000162517 PEF1 -725883 sc-eQTL 3.61e-02 -0.203 0.0964 0.241 Pro_T L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 200509 sc-eQTL 5.77e-01 -0.0518 0.0927 0.241 Pro_T L2
ENSG00000287510 AL137857.1 187320 sc-eQTL 2.12e-02 -0.196 0.0842 0.241 Pro_T L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -377775 sc-eQTL 6.95e-01 -0.0399 0.102 0.239 Treg L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -377969 sc-eQTL 8.40e-02 0.169 0.0975 0.239 Treg L2
ENSG00000134644 PUM1 -146978 sc-eQTL 9.75e-01 -0.00246 0.0786 0.239 Treg L2
ENSG00000162511 LAPTM5 161239 sc-eQTL 2.85e-01 0.0963 0.0898 0.239 Treg L2
ENSG00000162517 PEF1 -725883 sc-eQTL 4.43e-01 -0.0747 0.0971 0.239 Treg L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 200509 sc-eQTL 7.04e-01 0.0348 0.0917 0.239 Treg L2
ENSG00000287510 AL137857.1 187320 sc-eQTL 9.21e-01 0.00915 0.0916 0.239 Treg L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -377775 sc-eQTL 7.19e-01 0.0365 0.101 0.251 cDC L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -377969 sc-eQTL 1.03e-01 -0.178 0.109 0.251 cDC L2
ENSG00000134644 PUM1 -146978 sc-eQTL 4.19e-01 0.0759 0.0938 0.251 cDC L2
ENSG00000162511 LAPTM5 161239 sc-eQTL 3.31e-01 -0.064 0.0657 0.251 cDC L2
ENSG00000162517 PEF1 -725883 sc-eQTL 2.53e-01 0.109 0.095 0.251 cDC L2
ENSG00000168528 SERINC2 -490552 sc-eQTL 7.99e-01 -0.0216 0.0846 0.251 cDC L2
ENSG00000284543 LINC01226 -587213 sc-eQTL 1.40e-01 -0.122 0.0826 0.251 cDC L2
ENSG00000287510 AL137857.1 187320 sc-eQTL 2.82e-01 0.0963 0.0892 0.251 cDC L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -377775 sc-eQTL 4.05e-01 -0.069 0.0827 0.239 cMono_IL1B L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -377969 sc-eQTL 9.78e-01 -0.00252 0.0924 0.239 cMono_IL1B L2
ENSG00000134644 PUM1 -146978 sc-eQTL 3.89e-01 -0.0539 0.0624 0.239 cMono_IL1B L2
ENSG00000162511 LAPTM5 161239 sc-eQTL 6.56e-01 0.0245 0.0548 0.239 cMono_IL1B L2
ENSG00000162512 SDC3 10255 sc-eQTL 2.11e-01 -0.129 0.103 0.239 cMono_IL1B L2
ENSG00000162517 PEF1 -725883 sc-eQTL 5.56e-01 0.0497 0.0844 0.239 cMono_IL1B L2
ENSG00000168528 SERINC2 -490552 sc-eQTL 6.27e-01 0.051 0.105 0.239 cMono_IL1B L2
ENSG00000284543 LINC01226 -587213 sc-eQTL 3.88e-01 0.0799 0.0923 0.239 cMono_IL1B L2
ENSG00000287510 AL137857.1 187320 sc-eQTL 8.76e-01 0.0135 0.0863 0.239 cMono_IL1B L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -377775 sc-eQTL 1.21e-01 0.135 0.0867 0.239 cMono_S100A L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -377969 sc-eQTL 7.21e-01 0.0368 0.103 0.239 cMono_S100A L2
ENSG00000134644 PUM1 -146978 sc-eQTL 7.63e-01 0.0225 0.0745 0.239 cMono_S100A L2
ENSG00000162511 LAPTM5 161239 sc-eQTL 3.03e-01 -0.059 0.0571 0.239 cMono_S100A L2
ENSG00000162512 SDC3 10255 sc-eQTL 6.90e-02 -0.179 0.0981 0.239 cMono_S100A L2
ENSG00000162517 PEF1 -725883 sc-eQTL 6.44e-01 -0.0412 0.0892 0.239 cMono_S100A L2
ENSG00000168528 SERINC2 -490552 sc-eQTL 5.54e-01 0.0621 0.105 0.239 cMono_S100A L2
ENSG00000284543 LINC01226 -587213 sc-eQTL 4.39e-01 -0.0658 0.0849 0.239 cMono_S100A L2
ENSG00000287510 AL137857.1 187320 sc-eQTL 2.15e-01 -0.106 0.0851 0.239 cMono_S100A L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -377775 sc-eQTL 9.08e-01 0.0146 0.127 0.242 gdT L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -377969 sc-eQTL 1.89e-01 0.143 0.108 0.242 gdT L2
ENSG00000134644 PUM1 -146978 sc-eQTL 7.41e-01 -0.0371 0.112 0.242 gdT L2
ENSG00000162511 LAPTM5 161239 sc-eQTL 6.61e-01 0.0535 0.122 0.242 gdT L2
ENSG00000162517 PEF1 -725883 sc-eQTL 1.12e-01 0.177 0.11 0.242 gdT L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 200509 sc-eQTL 3.94e-01 -0.0959 0.112 0.242 gdT L2
ENSG00000287510 AL137857.1 187320 sc-eQTL 2.67e-01 -0.121 0.108 0.242 gdT L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -377775 sc-eQTL 6.62e-01 0.0428 0.0978 0.24 intMono L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -377969 sc-eQTL 3.51e-01 -0.098 0.105 0.24 intMono L2
ENSG00000134644 PUM1 -146978 sc-eQTL 6.63e-03 0.24 0.0876 0.24 intMono L2
ENSG00000162511 LAPTM5 161239 sc-eQTL 2.85e-01 -0.0748 0.0698 0.24 intMono L2
ENSG00000162512 SDC3 10255 sc-eQTL 6.57e-02 -0.176 0.095 0.24 intMono L2
ENSG00000162517 PEF1 -725883 sc-eQTL 4.13e-01 0.0824 0.101 0.24 intMono L2
ENSG00000168528 SERINC2 -490552 sc-eQTL 7.72e-01 0.0291 0.1 0.24 intMono L2
ENSG00000284543 LINC01226 -587213 sc-eQTL 7.12e-01 -0.0351 0.095 0.24 intMono L2
ENSG00000287510 AL137857.1 187320 sc-eQTL 3.98e-01 0.0803 0.0949 0.24 intMono L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -377775 sc-eQTL 7.69e-01 0.0268 0.0912 0.238 ncMono L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -377969 sc-eQTL 3.24e-01 -0.096 0.097 0.238 ncMono L2
ENSG00000134644 PUM1 -146978 sc-eQTL 3.98e-01 -0.0672 0.0793 0.238 ncMono L2
ENSG00000162511 LAPTM5 161239 sc-eQTL 1.69e-01 0.0991 0.0718 0.238 ncMono L2
ENSG00000162512 SDC3 10255 sc-eQTL 1.61e-02 -0.194 0.0797 0.238 ncMono L2
ENSG00000162517 PEF1 -725883 sc-eQTL 6.89e-01 0.0372 0.0928 0.238 ncMono L2
ENSG00000168528 SERINC2 -490552 sc-eQTL 8.42e-01 0.0177 0.0883 0.238 ncMono L2
ENSG00000284543 LINC01226 -587213 sc-eQTL 7.21e-01 -0.0315 0.0882 0.238 ncMono L2
ENSG00000287510 AL137857.1 187320 sc-eQTL 6.46e-01 0.0421 0.0914 0.238 ncMono L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -377775 sc-eQTL 2.37e-01 -0.121 0.102 0.246 pDC L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -377969 sc-eQTL 4.34e-01 0.0876 0.112 0.246 pDC L2
ENSG00000134644 PUM1 -146978 sc-eQTL 9.86e-01 -0.00158 0.0929 0.246 pDC L2
ENSG00000162511 LAPTM5 161239 sc-eQTL 4.59e-01 0.064 0.0862 0.246 pDC L2
ENSG00000162517 PEF1 -725883 sc-eQTL 3.94e-01 -0.0954 0.112 0.246 pDC L2
ENSG00000168528 SERINC2 -490552 sc-eQTL 4.67e-01 0.0763 0.105 0.246 pDC L2
ENSG00000284543 LINC01226 -587213 sc-eQTL 6.22e-01 0.0401 0.0812 0.246 pDC L2
ENSG00000287510 AL137857.1 187320 sc-eQTL 2.01e-01 0.122 0.0951 0.246 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000060688 SNRNP40 -377775 sc-eQTL 2.08e-01 -0.129 0.102 0.239 B_Memory LOneK1K
ENSG00000121766 ZCCHC17 -377969 sc-eQTL 2.33e-01 -0.102 0.0849 0.239 B_Memory LOneK1K
ENSG00000134644 PUM1 -146978 sc-eQTL 7.22e-01 0.0269 0.0754 0.239 B_Memory LOneK1K
ENSG00000162510 MATN1 195428 sc-eQTL 9.35e-01 0.00704 0.086 0.239 B_Memory LOneK1K
ENSG00000162511 LAPTM5 161239 sc-eQTL 9.19e-01 -0.00551 0.0541 0.239 B_Memory LOneK1K
ENSG00000162517 PEF1 -725883 sc-eQTL 9.24e-01 -0.00851 0.0895 0.239 B_Memory LOneK1K
ENSG00000186056 MATN1-AS1 200509 sc-eQTL 3.44e-01 -0.0677 0.0713 0.239 B_Memory LOneK1K
ENSG00000287510 AL137857.1 187320 sc-eQTL 9.51e-01 -0.00481 0.0779 0.239 B_Memory LOneK1K
ENSG00000060688 SNRNP40 -377775 sc-eQTL 7.39e-01 -0.0311 0.0931 0.239 B_Naive LOneK1K
ENSG00000121766 ZCCHC17 -377969 sc-eQTL 4.74e-01 0.0527 0.0735 0.239 B_Naive LOneK1K
ENSG00000134644 PUM1 -146978 sc-eQTL 5.51e-02 0.133 0.069 0.239 B_Naive LOneK1K
ENSG00000162510 MATN1 195428 sc-eQTL 8.65e-01 -0.0114 0.0671 0.239 B_Naive LOneK1K
ENSG00000162511 LAPTM5 161239 sc-eQTL 3.87e-01 -0.0408 0.0471 0.239 B_Naive LOneK1K
ENSG00000162517 PEF1 -725883 sc-eQTL 8.29e-01 0.0187 0.0862 0.239 B_Naive LOneK1K
ENSG00000186056 MATN1-AS1 200509 sc-eQTL 4.31e-01 -0.048 0.0609 0.239 B_Naive LOneK1K
ENSG00000287510 AL137857.1 187320 sc-eQTL 8.62e-01 0.0126 0.0724 0.239 B_Naive LOneK1K
ENSG00000060688 SNRNP40 -377775 sc-eQTL 5.08e-01 0.0524 0.079 0.239 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000121766 ZCCHC17 -377969 sc-eQTL 8.87e-01 0.0127 0.0896 0.239 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000134644 PUM1 -146978 sc-eQTL 7.30e-01 -0.0197 0.0571 0.239 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000162511 LAPTM5 161239 sc-eQTL 4.94e-01 -0.0344 0.0502 0.239 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000162512 SDC3 10255 sc-eQTL 3.73e-02 -0.212 0.101 0.239 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000162517 PEF1 -725883 sc-eQTL 5.88e-01 0.0391 0.072 0.239 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000168528 SERINC2 -490552 sc-eQTL 5.14e-01 0.0689 0.105 0.239 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000284543 LINC01226 -587213 sc-eQTL 5.17e-01 0.0561 0.0863 0.239 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000287510 AL137857.1 187320 sc-eQTL 6.14e-01 -0.0409 0.0808 0.239 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000060688 SNRNP40 -377775 sc-eQTL 4.34e-01 0.0674 0.0861 0.237 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000121766 ZCCHC17 -377969 sc-eQTL 5.56e-02 -0.18 0.0935 0.237 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000134644 PUM1 -146978 sc-eQTL 4.40e-01 0.0597 0.0772 0.237 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000162511 LAPTM5 161239 sc-eQTL 5.71e-01 -0.035 0.0618 0.237 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000162512 SDC3 10255 sc-eQTL 2.35e-02 -0.203 0.0892 0.237 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000162517 PEF1 -725883 sc-eQTL 3.81e-01 0.0719 0.0819 0.237 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000168528 SERINC2 -490552 sc-eQTL 5.64e-01 0.0541 0.0936 0.237 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000284543 LINC01226 -587213 sc-eQTL 8.21e-01 -0.0202 0.0889 0.237 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000287510 AL137857.1 187320 sc-eQTL 3.07e-01 0.0908 0.0888 0.237 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000060688 SNRNP40 -377775 sc-eQTL 9.16e-01 0.0102 0.0962 0.239 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000121753 ADGRB2 -845880 sc-eQTL 8.91e-01 -0.0113 0.0819 0.239 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000121766 ZCCHC17 -377969 sc-eQTL 1.34e-03 -0.208 0.0641 0.239 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000134644 PUM1 -146978 sc-eQTL 1.91e-01 0.0942 0.0717 0.239 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000162511 LAPTM5 161239 sc-eQTL 1.79e-01 0.108 0.0801 0.239 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000162517 PEF1 -725883 sc-eQTL 6.21e-01 -0.0302 0.0611 0.239 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000186056 MATN1-AS1 200509 sc-eQTL 7.88e-01 0.0249 0.0928 0.239 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000287510 AL137857.1 187320 sc-eQTL 9.29e-01 0.00714 0.0801 0.239 NK_CD56dim LOneK1K

Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF
ENSG00000121766 ZCCHC17 -377969 eQTL 1.24e-03 0.0671 0.0207 0.0 0.0 0.259
ENSG00000162512 SDC3 10255 eQTL 0.000498 -0.1 0.0287 0.0 0.0 0.259
ENSG00000168528 SERINC2 -490552 eQTL 8.43e-07 0.222 0.0447 0.0 0.0 0.259

Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina
ENSG00000162510 \N 195428 2.48e-06 3.64e-06 2.88e-07 1.56e-06 4.65e-07 7.89e-07 1.41e-06 4.75e-07 1.72e-06 7.04e-07 2.41e-06 1.53e-06 3.35e-06 1.38e-06 6.59e-07 1.06e-06 1.57e-06 1.44e-06 5.54e-07 8.75e-07 6.58e-07 2.43e-06 2.02e-06 7.61e-07 4.03e-06 1.05e-06 1.22e-06 1.4e-06 1.64e-06 1.53e-06 1.49e-06 2.83e-07 3.97e-07 6.11e-07 1.29e-06 5.06e-07 7.34e-07 3.58e-07 5.09e-07 2.1e-07 3.03e-07 3.42e-06 3.32e-07 1.6e-07 1.73e-07 3.29e-07 3.02e-07 5.98e-08 8.83e-08
ENSG00000162512 SDC3 10255 3.44e-05 3.42e-05 6.54e-06 1.62e-05 6.33e-06 1.63e-05 4.74e-05 5.86e-06 3.53e-05 1.69e-05 4.29e-05 2.06e-05 5.31e-05 1.5e-05 7.89e-06 2.14e-05 1.92e-05 2.79e-05 8.86e-06 7.97e-06 1.82e-05 3.5e-05 3.42e-05 1.05e-05 5.06e-05 9.2e-06 1.63e-05 1.4e-05 3.42e-05 3.16e-05 2.34e-05 2.13e-06 3.57e-06 8.1e-06 1.34e-05 7.17e-06 3.82e-06 3.71e-06 5.9e-06 3.88e-06 1.86e-06 4e-05 3.64e-06 4.64e-07 2.73e-06 4.98e-06 4.55e-06 2.11e-06 1.46e-06
ENSG00000168528 SERINC2 -490552 4.21e-07 4.24e-07 6.15e-08 2.62e-07 1.07e-07 1.19e-07 3.44e-07 7.56e-08 2.53e-07 1.11e-07 3.32e-07 2.98e-07 3.95e-07 1.07e-07 1.18e-07 1.06e-07 2.25e-07 2.33e-07 7.76e-08 8.39e-08 1.27e-07 2.3e-07 2.2e-07 4.27e-08 6.02e-07 1.82e-07 1.78e-07 1.67e-07 1.36e-07 1.8e-07 1.76e-07 4.85e-08 5.2e-08 1.02e-07 2.82e-07 3.24e-08 6.77e-08 7.1e-08 6.29e-08 5.45e-08 4.36e-08 2.8e-07 4.7e-08 1.76e-08 2.82e-08 1.01e-08 8.67e-08 2.02e-09 4.79e-08
ENSG00000237329 \N -117721 4.8e-06 6.84e-06 6.04e-07 2.59e-06 1.06e-06 1.55e-06 4.31e-06 1.04e-06 4.98e-06 1.83e-06 5.68e-06 3.03e-06 7.2e-06 1.94e-06 1.31e-06 2.68e-06 1.99e-06 3.09e-06 1.41e-06 1.02e-06 1.95e-06 4.72e-06 4.22e-06 1.81e-06 8.28e-06 1.33e-06 2.62e-06 1.75e-06 4.38e-06 3.75e-06 2.77e-06 5.93e-07 8.14e-07 1.75e-06 2.06e-06 8.95e-07 9.08e-07 4.71e-07 1.31e-06 3.47e-07 1.98e-07 6.04e-06 4.81e-07 1.61e-07 3.98e-07 7.61e-07 6.81e-07 2.33e-07 2.68e-07