logo

Genes within 1Mb (chr1:30918806:G:A):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD

Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000060688 SNRNP40 -377982 sc-eQTL 5.74e-01 -0.0524 0.0931 0.222 B L1
ENSG00000121766 ZCCHC17 -378176 sc-eQTL 9.38e-01 -0.00583 0.0746 0.222 B L1
ENSG00000134644 PUM1 -147185 sc-eQTL 5.55e-01 0.0369 0.0625 0.222 B L1
ENSG00000162510 MATN1 195221 sc-eQTL 5.84e-01 -0.036 0.0657 0.222 B L1
ENSG00000162511 LAPTM5 161032 sc-eQTL 4.49e-01 -0.039 0.0514 0.222 B L1
ENSG00000162517 PEF1 -726090 sc-eQTL 6.49e-01 0.0354 0.0777 0.222 B L1
ENSG00000186056 MATN1-AS1 200302 sc-eQTL 4.31e-01 -0.0475 0.0603 0.222 B L1
ENSG00000287510 AL137857.1 187113 sc-eQTL 6.07e-01 0.0368 0.0714 0.222 B L1
ENSG00000060688 SNRNP40 -377982 sc-eQTL 1.67e-01 0.114 0.0818 0.222 CD4T L1
ENSG00000121766 ZCCHC17 -378176 sc-eQTL 7.50e-01 -0.0205 0.0642 0.222 CD4T L1
ENSG00000134644 PUM1 -147185 sc-eQTL 2.12e-01 0.0713 0.057 0.222 CD4T L1
ENSG00000162511 LAPTM5 161032 sc-eQTL 5.61e-01 -0.0369 0.0633 0.222 CD4T L1
ENSG00000162517 PEF1 -726090 sc-eQTL 9.62e-02 0.11 0.0658 0.222 CD4T L1
ENSG00000186056 MATN1-AS1 200302 sc-eQTL 4.65e-02 -0.112 0.0561 0.222 CD4T L1
ENSG00000287510 AL137857.1 187113 sc-eQTL 8.26e-01 -0.0149 0.0679 0.222 CD4T L1
ENSG00000060688 SNRNP40 -377982 sc-eQTL 6.00e-01 -0.0556 0.106 0.222 CD8T L1
ENSG00000121766 ZCCHC17 -378176 sc-eQTL 3.66e-01 -0.0637 0.0704 0.222 CD8T L1
ENSG00000134644 PUM1 -147185 sc-eQTL 6.20e-03 0.169 0.061 0.222 CD8T L1
ENSG00000162511 LAPTM5 161032 sc-eQTL 9.30e-02 0.101 0.0599 0.222 CD8T L1
ENSG00000162517 PEF1 -726090 sc-eQTL 8.85e-01 0.0108 0.0743 0.222 CD8T L1
ENSG00000186056 MATN1-AS1 200302 sc-eQTL 5.43e-01 0.043 0.0706 0.222 CD8T L1
ENSG00000287510 AL137857.1 187113 sc-eQTL 1.12e-01 -0.141 0.0883 0.222 CD8T L1
ENSG00000060688 SNRNP40 -377982 sc-eQTL 9.50e-01 -0.00601 0.0952 0.221 DC L1
ENSG00000121766 ZCCHC17 -378176 sc-eQTL 8.30e-01 -0.0242 0.113 0.221 DC L1
ENSG00000134644 PUM1 -147185 sc-eQTL 9.28e-01 -0.008 0.0883 0.221 DC L1
ENSG00000162511 LAPTM5 161032 sc-eQTL 3.54e-01 -0.0584 0.0629 0.221 DC L1
ENSG00000162517 PEF1 -726090 sc-eQTL 5.05e-01 0.0682 0.102 0.221 DC L1
ENSG00000168528 SERINC2 -490759 sc-eQTL 2.17e-01 0.128 0.104 0.221 DC L1
ENSG00000284543 LINC01226 -587420 sc-eQTL 9.32e-01 0.00589 0.0689 0.221 DC L1
ENSG00000287510 AL137857.1 187113 sc-eQTL 1.24e-01 0.153 0.0992 0.221 DC L1
ENSG00000060688 SNRNP40 -377982 sc-eQTL 4.38e-01 0.0564 0.0726 0.222 Mono L1
ENSG00000121766 ZCCHC17 -378176 sc-eQTL 4.09e-01 -0.0744 0.09 0.222 Mono L1
ENSG00000134644 PUM1 -147185 sc-eQTL 9.95e-01 -0.000373 0.0578 0.222 Mono L1
ENSG00000162511 LAPTM5 161032 sc-eQTL 3.43e-01 -0.0504 0.053 0.222 Mono L1
ENSG00000162512 SDC3 10048 sc-eQTL 1.51e-02 -0.247 0.101 0.222 Mono L1
ENSG00000162517 PEF1 -726090 sc-eQTL 4.06e-01 0.0596 0.0716 0.222 Mono L1
ENSG00000168528 SERINC2 -490759 sc-eQTL 5.13e-01 0.0717 0.11 0.222 Mono L1
ENSG00000284543 LINC01226 -587420 sc-eQTL 9.24e-01 -0.00923 0.0965 0.222 Mono L1
ENSG00000287510 AL137857.1 187113 sc-eQTL 9.28e-01 -0.00765 0.0844 0.222 Mono L1
ENSG00000060688 SNRNP40 -377982 sc-eQTL 4.71e-01 0.074 0.102 0.221 NK L1
ENSG00000121753 ADGRB2 -846087 sc-eQTL 6.70e-01 -0.0376 0.0882 0.221 NK L1
ENSG00000121766 ZCCHC17 -378176 sc-eQTL 1.19e-02 -0.175 0.0691 0.221 NK L1
ENSG00000134644 PUM1 -147185 sc-eQTL 8.01e-02 0.129 0.0731 0.221 NK L1
ENSG00000162511 LAPTM5 161032 sc-eQTL 1.67e-01 0.117 0.0843 0.221 NK L1
ENSG00000162517 PEF1 -726090 sc-eQTL 6.89e-01 -0.0248 0.0618 0.221 NK L1
ENSG00000186056 MATN1-AS1 200302 sc-eQTL 4.71e-01 -0.0686 0.0951 0.221 NK L1
ENSG00000287510 AL137857.1 187113 sc-eQTL 7.94e-01 -0.0229 0.0879 0.221 NK L1
ENSG00000060688 SNRNP40 -377982 sc-eQTL 8.67e-01 0.0129 0.0769 0.222 Other_T L1
ENSG00000121766 ZCCHC17 -378176 sc-eQTL 4.66e-01 -0.06 0.0821 0.222 Other_T L1
ENSG00000134644 PUM1 -147185 sc-eQTL 1.39e-01 0.109 0.0735 0.222 Other_T L1
ENSG00000162511 LAPTM5 161032 sc-eQTL 8.59e-01 0.0108 0.0606 0.222 Other_T L1
ENSG00000162517 PEF1 -726090 sc-eQTL 9.36e-01 -0.00647 0.0809 0.222 Other_T L1
ENSG00000186056 MATN1-AS1 200302 sc-eQTL 5.88e-01 -0.0537 0.0992 0.222 Other_T L1
ENSG00000287510 AL137857.1 187113 sc-eQTL 2.16e-01 -0.128 0.103 0.222 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000060688 SNRNP40 -377982 sc-eQTL 9.88e-01 -0.00181 0.12 0.23 B_Activated L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -378176 sc-eQTL 8.80e-01 -0.0184 0.121 0.23 B_Activated L2
ENSG00000134644 PUM1 -147185 sc-eQTL 6.88e-01 0.0453 0.113 0.23 B_Activated L2
ENSG00000162510 MATN1 195221 sc-eQTL 7.27e-01 -0.0344 0.0984 0.23 B_Activated L2
ENSG00000162511 LAPTM5 161032 sc-eQTL 9.41e-01 0.00507 0.0687 0.23 B_Activated L2
ENSG00000162517 PEF1 -726090 sc-eQTL 7.88e-01 0.0314 0.117 0.23 B_Activated L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 200302 sc-eQTL 4.33e-01 -0.0871 0.111 0.23 B_Activated L2
ENSG00000287510 AL137857.1 187113 sc-eQTL 3.25e-01 -0.0966 0.0978 0.23 B_Activated L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -377982 sc-eQTL 1.93e-01 -0.149 0.114 0.223 B_Intermediate L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -378176 sc-eQTL 9.71e-01 0.00347 0.0958 0.223 B_Intermediate L2
ENSG00000134644 PUM1 -147185 sc-eQTL 7.54e-01 -0.0284 0.0903 0.223 B_Intermediate L2
ENSG00000162510 MATN1 195221 sc-eQTL 4.01e-01 -0.079 0.0939 0.223 B_Intermediate L2
ENSG00000162511 LAPTM5 161032 sc-eQTL 8.01e-01 -0.0146 0.0577 0.223 B_Intermediate L2
ENSG00000162517 PEF1 -726090 sc-eQTL 1.26e-01 -0.164 0.107 0.223 B_Intermediate L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 200302 sc-eQTL 9.46e-01 0.00551 0.081 0.223 B_Intermediate L2
ENSG00000287510 AL137857.1 187113 sc-eQTL 9.46e-01 0.00613 0.0906 0.223 B_Intermediate L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -377982 sc-eQTL 7.74e-01 0.0318 0.111 0.222 B_Memory L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -378176 sc-eQTL 3.64e-01 -0.0926 0.102 0.222 B_Memory L2
ENSG00000134644 PUM1 -147185 sc-eQTL 8.06e-01 -0.0218 0.0888 0.222 B_Memory L2
ENSG00000162510 MATN1 195221 sc-eQTL 7.59e-01 -0.0261 0.0849 0.222 B_Memory L2
ENSG00000162511 LAPTM5 161032 sc-eQTL 6.00e-01 0.0395 0.0752 0.222 B_Memory L2
ENSG00000162517 PEF1 -726090 sc-eQTL 5.21e-01 0.0646 0.1 0.222 B_Memory L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 200302 sc-eQTL 6.43e-01 -0.04 0.0861 0.222 B_Memory L2
ENSG00000287510 AL137857.1 187113 sc-eQTL 4.28e-01 -0.0801 0.101 0.222 B_Memory L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -377982 sc-eQTL 4.57e-01 0.0761 0.102 0.222 B_Naive1 L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -378176 sc-eQTL 7.61e-01 0.0269 0.0883 0.222 B_Naive1 L2
ENSG00000134644 PUM1 -147185 sc-eQTL 3.75e-01 0.0692 0.0778 0.222 B_Naive1 L2
ENSG00000162510 MATN1 195221 sc-eQTL 5.85e-01 -0.0432 0.079 0.222 B_Naive1 L2
ENSG00000162511 LAPTM5 161032 sc-eQTL 3.62e-01 -0.0481 0.0527 0.222 B_Naive1 L2
ENSG00000162517 PEF1 -726090 sc-eQTL 2.97e-01 0.0971 0.0929 0.222 B_Naive1 L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 200302 sc-eQTL 3.25e-01 -0.0682 0.0692 0.222 B_Naive1 L2
ENSG00000287510 AL137857.1 187113 sc-eQTL 9.92e-01 0.000912 0.0857 0.222 B_Naive1 L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -377982 sc-eQTL 9.70e-02 -0.179 0.108 0.223 B_Naive2 L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -378176 sc-eQTL 6.14e-01 0.0451 0.0893 0.223 B_Naive2 L2
ENSG00000134644 PUM1 -147185 sc-eQTL 5.66e-01 0.0503 0.0874 0.223 B_Naive2 L2
ENSG00000162510 MATN1 195221 sc-eQTL 7.89e-01 -0.0225 0.0839 0.223 B_Naive2 L2
ENSG00000162511 LAPTM5 161032 sc-eQTL 2.47e-01 -0.066 0.0568 0.223 B_Naive2 L2
ENSG00000162517 PEF1 -726090 sc-eQTL 5.48e-01 -0.0623 0.104 0.223 B_Naive2 L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 200302 sc-eQTL 5.34e-01 0.0517 0.0829 0.223 B_Naive2 L2
ENSG00000287510 AL137857.1 187113 sc-eQTL 3.05e-01 0.0921 0.0894 0.223 B_Naive2 L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -377982 sc-eQTL 6.02e-01 -0.0555 0.106 0.225 CD4_CTL L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -378176 sc-eQTL 9.90e-01 0.00134 0.105 0.225 CD4_CTL L2
ENSG00000134644 PUM1 -147185 sc-eQTL 7.83e-01 -0.0283 0.103 0.225 CD4_CTL L2
ENSG00000162511 LAPTM5 161032 sc-eQTL 2.78e-01 -0.0992 0.0911 0.225 CD4_CTL L2
ENSG00000162517 PEF1 -726090 sc-eQTL 6.34e-01 0.0447 0.0937 0.225 CD4_CTL L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 200302 sc-eQTL 3.89e-01 -0.0862 0.0998 0.225 CD4_CTL L2
ENSG00000287510 AL137857.1 187113 sc-eQTL 9.85e-01 0.00162 0.0882 0.225 CD4_CTL L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -377982 sc-eQTL 4.56e-02 0.17 0.0844 0.222 CD4_Naive L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -378176 sc-eQTL 2.90e-01 -0.08 0.0754 0.222 CD4_Naive L2
ENSG00000134644 PUM1 -147185 sc-eQTL 3.29e-01 0.0589 0.0602 0.222 CD4_Naive L2
ENSG00000162511 LAPTM5 161032 sc-eQTL 6.09e-01 -0.0331 0.0646 0.222 CD4_Naive L2
ENSG00000162517 PEF1 -726090 sc-eQTL 9.88e-02 0.117 0.0704 0.222 CD4_Naive L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 200302 sc-eQTL 3.15e-03 -0.192 0.0643 0.222 CD4_Naive L2
ENSG00000287510 AL137857.1 187113 sc-eQTL 3.92e-01 -0.0645 0.0752 0.222 CD4_Naive L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -377982 sc-eQTL 7.18e-01 0.0388 0.107 0.222 CD4_TCM L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -378176 sc-eQTL 6.51e-01 0.0392 0.0864 0.222 CD4_TCM L2
ENSG00000134644 PUM1 -147185 sc-eQTL 3.65e-01 0.0693 0.0764 0.222 CD4_TCM L2
ENSG00000162511 LAPTM5 161032 sc-eQTL 9.56e-01 0.00351 0.0635 0.222 CD4_TCM L2
ENSG00000162517 PEF1 -726090 sc-eQTL 4.45e-01 0.065 0.085 0.222 CD4_TCM L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 200302 sc-eQTL 4.64e-01 0.059 0.0805 0.222 CD4_TCM L2
ENSG00000287510 AL137857.1 187113 sc-eQTL 8.99e-01 0.0114 0.0897 0.222 CD4_TCM L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -377982 sc-eQTL 7.24e-01 0.0377 0.106 0.222 CD4_TEM L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -378176 sc-eQTL 3.57e-01 0.0936 0.101 0.222 CD4_TEM L2
ENSG00000134644 PUM1 -147185 sc-eQTL 5.01e-01 0.0569 0.0844 0.222 CD4_TEM L2
ENSG00000162511 LAPTM5 161032 sc-eQTL 7.42e-01 0.0282 0.0855 0.222 CD4_TEM L2
ENSG00000162517 PEF1 -726090 sc-eQTL 2.86e-01 0.102 0.0955 0.222 CD4_TEM L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 200302 sc-eQTL 9.18e-01 0.0103 0.1 0.222 CD4_TEM L2
ENSG00000287510 AL137857.1 187113 sc-eQTL 7.03e-01 0.0376 0.0985 0.222 CD4_TEM L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -377982 sc-eQTL 5.38e-01 0.0721 0.117 0.222 CD8_CTL L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -378176 sc-eQTL 5.78e-01 0.05 0.0897 0.222 CD8_CTL L2
ENSG00000134644 PUM1 -147185 sc-eQTL 1.50e-01 0.125 0.0867 0.222 CD8_CTL L2
ENSG00000162511 LAPTM5 161032 sc-eQTL 1.72e-03 0.299 0.0943 0.222 CD8_CTL L2
ENSG00000162517 PEF1 -726090 sc-eQTL 1.99e-01 0.108 0.0837 0.222 CD8_CTL L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 200302 sc-eQTL 5.34e-01 -0.0631 0.101 0.222 CD8_CTL L2
ENSG00000287510 AL137857.1 187113 sc-eQTL 4.40e-02 -0.191 0.0945 0.222 CD8_CTL L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -377982 sc-eQTL 4.27e-01 -0.0839 0.105 0.222 CD8_Naive L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -378176 sc-eQTL 6.40e-01 -0.0426 0.0909 0.222 CD8_Naive L2
ENSG00000134644 PUM1 -147185 sc-eQTL 8.29e-02 0.127 0.0727 0.222 CD8_Naive L2
ENSG00000162511 LAPTM5 161032 sc-eQTL 2.42e-01 0.082 0.0699 0.222 CD8_Naive L2
ENSG00000162517 PEF1 -726090 sc-eQTL 6.44e-01 -0.0451 0.0974 0.222 CD8_Naive L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 200302 sc-eQTL 7.97e-01 0.0226 0.0875 0.222 CD8_Naive L2
ENSG00000287510 AL137857.1 187113 sc-eQTL 8.66e-01 0.0161 0.0953 0.222 CD8_Naive L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -377982 sc-eQTL 5.67e-01 0.0678 0.118 0.222 CD8_TCM L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -378176 sc-eQTL 1.72e-01 -0.148 0.108 0.222 CD8_TCM L2
ENSG00000134644 PUM1 -147185 sc-eQTL 9.26e-03 0.264 0.1 0.222 CD8_TCM L2
ENSG00000162511 LAPTM5 161032 sc-eQTL 8.82e-01 -0.0158 0.107 0.222 CD8_TCM L2
ENSG00000162517 PEF1 -726090 sc-eQTL 6.13e-01 0.0553 0.109 0.222 CD8_TCM L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 200302 sc-eQTL 4.47e-01 0.0752 0.0987 0.222 CD8_TCM L2
ENSG00000287510 AL137857.1 187113 sc-eQTL 5.81e-01 0.0552 0.0998 0.222 CD8_TCM L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -377982 sc-eQTL 8.19e-01 0.0256 0.112 0.215 CD8_TEM L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -378176 sc-eQTL 3.17e-01 -0.107 0.107 0.215 CD8_TEM L2
ENSG00000134644 PUM1 -147185 sc-eQTL 6.48e-01 0.05 0.109 0.215 CD8_TEM L2
ENSG00000162511 LAPTM5 161032 sc-eQTL 2.67e-01 0.114 0.103 0.215 CD8_TEM L2
ENSG00000162517 PEF1 -726090 sc-eQTL 6.68e-01 0.0416 0.0968 0.215 CD8_TEM L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 200302 sc-eQTL 7.06e-01 -0.0402 0.107 0.215 CD8_TEM L2
ENSG00000287510 AL137857.1 187113 sc-eQTL 6.53e-01 -0.0435 0.0966 0.215 CD8_TEM L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -377982 sc-eQTL 3.96e-01 -0.095 0.112 0.221 MAIT L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -378176 sc-eQTL 6.42e-01 -0.0462 0.0991 0.221 MAIT L2
ENSG00000134644 PUM1 -147185 sc-eQTL 1.21e-01 0.147 0.0945 0.221 MAIT L2
ENSG00000162511 LAPTM5 161032 sc-eQTL 3.82e-01 0.0784 0.0895 0.221 MAIT L2
ENSG00000162517 PEF1 -726090 sc-eQTL 2.47e-01 -0.114 0.0982 0.221 MAIT L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 200302 sc-eQTL 4.80e-01 -0.0706 0.0997 0.221 MAIT L2
ENSG00000287510 AL137857.1 187113 sc-eQTL 7.36e-01 -0.0348 0.103 0.221 MAIT L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -377982 sc-eQTL 2.56e-01 0.13 0.114 0.222 NK_CD56bright L2
ENSG00000121753 ADGRB2 -846087 sc-eQTL 1.54e-01 -0.128 0.0895 0.222 NK_CD56bright L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -378176 sc-eQTL 5.80e-01 -0.0537 0.097 0.222 NK_CD56bright L2
ENSG00000134644 PUM1 -147185 sc-eQTL 8.09e-01 0.0246 0.102 0.222 NK_CD56bright L2
ENSG00000162511 LAPTM5 161032 sc-eQTL 1.98e-01 0.129 0.1 0.222 NK_CD56bright L2
ENSG00000162517 PEF1 -726090 sc-eQTL 6.01e-01 -0.0512 0.0976 0.222 NK_CD56bright L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 200302 sc-eQTL 4.22e-01 -0.0811 0.101 0.222 NK_CD56bright L2
ENSG00000287510 AL137857.1 187113 sc-eQTL 6.48e-01 -0.0455 0.0995 0.222 NK_CD56bright L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -377982 sc-eQTL 3.94e-01 0.0917 0.107 0.222 NK_CD56dim L2
ENSG00000121753 ADGRB2 -846087 sc-eQTL 6.75e-01 0.0397 0.0946 0.222 NK_CD56dim L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -378176 sc-eQTL 1.84e-02 -0.186 0.0785 0.222 NK_CD56dim L2
ENSG00000134644 PUM1 -147185 sc-eQTL 8.16e-02 0.142 0.081 0.222 NK_CD56dim L2
ENSG00000162511 LAPTM5 161032 sc-eQTL 2.59e-01 0.0981 0.0868 0.222 NK_CD56dim L2
ENSG00000162517 PEF1 -726090 sc-eQTL 5.41e-01 0.0474 0.0774 0.222 NK_CD56dim L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 200302 sc-eQTL 5.54e-01 -0.0645 0.109 0.222 NK_CD56dim L2
ENSG00000287510 AL137857.1 187113 sc-eQTL 9.93e-01 -0.000753 0.0899 0.222 NK_CD56dim L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -377982 sc-eQTL 7.45e-01 -0.0381 0.117 0.224 NK_HLA L2
ENSG00000121753 ADGRB2 -846087 sc-eQTL 4.92e-01 -0.0636 0.0925 0.224 NK_HLA L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -378176 sc-eQTL 6.65e-01 -0.0452 0.104 0.224 NK_HLA L2
ENSG00000134644 PUM1 -147185 sc-eQTL 1.89e-01 0.133 0.101 0.224 NK_HLA L2
ENSG00000162511 LAPTM5 161032 sc-eQTL 7.64e-01 0.0291 0.0969 0.224 NK_HLA L2
ENSG00000162517 PEF1 -726090 sc-eQTL 2.63e-01 -0.122 0.109 0.224 NK_HLA L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 200302 sc-eQTL 9.60e-01 0.00517 0.103 0.224 NK_HLA L2
ENSG00000287510 AL137857.1 187113 sc-eQTL 7.35e-01 0.0337 0.0996 0.224 NK_HLA L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -377982 sc-eQTL 8.74e-01 -0.0167 0.106 0.222 NK_cytokine L2
ENSG00000121753 ADGRB2 -846087 sc-eQTL 2.31e-01 -0.114 0.0951 0.222 NK_cytokine L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -378176 sc-eQTL 3.58e-01 -0.0758 0.0823 0.222 NK_cytokine L2
ENSG00000134644 PUM1 -147185 sc-eQTL 8.01e-01 0.0225 0.0891 0.222 NK_cytokine L2
ENSG00000162511 LAPTM5 161032 sc-eQTL 3.08e-02 0.211 0.0971 0.222 NK_cytokine L2
ENSG00000162517 PEF1 -726090 sc-eQTL 8.18e-01 -0.0193 0.0836 0.222 NK_cytokine L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 200302 sc-eQTL 9.20e-01 -0.0105 0.104 0.222 NK_cytokine L2
ENSG00000287510 AL137857.1 187113 sc-eQTL 7.59e-02 0.171 0.0961 0.222 NK_cytokine L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -377982 sc-eQTL 5.82e-01 0.0749 0.136 0.193 PB L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -378176 sc-eQTL 6.25e-01 0.0771 0.158 0.193 PB L2
ENSG00000134644 PUM1 -147185 sc-eQTL 1.35e-02 0.335 0.133 0.193 PB L2
ENSG00000162510 MATN1 195221 sc-eQTL 8.15e-01 -0.0299 0.128 0.193 PB L2
ENSG00000162511 LAPTM5 161032 sc-eQTL 9.26e-01 -0.00847 0.0912 0.193 PB L2
ENSG00000162517 PEF1 -726090 sc-eQTL 7.35e-01 0.0476 0.14 0.193 PB L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 200302 sc-eQTL 8.02e-01 -0.0313 0.125 0.193 PB L2
ENSG00000287510 AL137857.1 187113 sc-eQTL 7.96e-02 -0.232 0.131 0.193 PB L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -377982 sc-eQTL 5.89e-01 -0.0451 0.0833 0.224 Pro_T L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -378176 sc-eQTL 2.96e-02 -0.229 0.105 0.224 Pro_T L2
ENSG00000134644 PUM1 -147185 sc-eQTL 3.11e-01 0.1 0.0985 0.224 Pro_T L2
ENSG00000162511 LAPTM5 161032 sc-eQTL 8.77e-01 -0.011 0.0708 0.224 Pro_T L2
ENSG00000162517 PEF1 -726090 sc-eQTL 8.06e-02 -0.181 0.103 0.224 Pro_T L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 200302 sc-eQTL 6.06e-01 -0.051 0.0989 0.224 Pro_T L2
ENSG00000287510 AL137857.1 187113 sc-eQTL 1.96e-02 -0.211 0.0899 0.224 Pro_T L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -377982 sc-eQTL 7.15e-01 -0.0398 0.109 0.222 Treg L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -378176 sc-eQTL 5.44e-02 0.202 0.104 0.222 Treg L2
ENSG00000134644 PUM1 -147185 sc-eQTL 7.83e-01 -0.0233 0.0843 0.222 Treg L2
ENSG00000162511 LAPTM5 161032 sc-eQTL 4.18e-01 0.0783 0.0963 0.222 Treg L2
ENSG00000162517 PEF1 -726090 sc-eQTL 4.39e-01 -0.0807 0.104 0.222 Treg L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 200302 sc-eQTL 7.89e-01 0.0264 0.0983 0.222 Treg L2
ENSG00000287510 AL137857.1 187113 sc-eQTL 7.45e-01 0.0319 0.0982 0.222 Treg L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -377982 sc-eQTL 9.46e-01 -0.00725 0.108 0.232 cDC L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -378176 sc-eQTL 1.15e-01 -0.184 0.116 0.232 cDC L2
ENSG00000134644 PUM1 -147185 sc-eQTL 2.80e-01 0.108 0.0999 0.232 cDC L2
ENSG00000162511 LAPTM5 161032 sc-eQTL 1.55e-01 -0.0998 0.0699 0.232 cDC L2
ENSG00000162517 PEF1 -726090 sc-eQTL 1.66e-01 0.141 0.101 0.232 cDC L2
ENSG00000168528 SERINC2 -490759 sc-eQTL 7.48e-01 0.029 0.0902 0.232 cDC L2
ENSG00000284543 LINC01226 -587420 sc-eQTL 9.41e-02 -0.148 0.0879 0.232 cDC L2
ENSG00000287510 AL137857.1 187113 sc-eQTL 3.87e-01 0.0825 0.0952 0.232 cDC L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -377982 sc-eQTL 4.32e-01 -0.0688 0.0874 0.222 cMono_IL1B L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -378176 sc-eQTL 9.06e-01 -0.0115 0.0977 0.222 cMono_IL1B L2
ENSG00000134644 PUM1 -147185 sc-eQTL 5.21e-01 -0.0425 0.066 0.222 cMono_IL1B L2
ENSG00000162511 LAPTM5 161032 sc-eQTL 9.83e-01 0.00126 0.058 0.222 cMono_IL1B L2
ENSG00000162512 SDC3 10048 sc-eQTL 3.32e-01 -0.106 0.109 0.222 cMono_IL1B L2
ENSG00000162517 PEF1 -726090 sc-eQTL 5.83e-01 0.0491 0.0892 0.222 cMono_IL1B L2
ENSG00000168528 SERINC2 -490759 sc-eQTL 5.17e-01 0.0717 0.111 0.222 cMono_IL1B L2
ENSG00000284543 LINC01226 -587420 sc-eQTL 5.49e-01 0.0586 0.0977 0.222 cMono_IL1B L2
ENSG00000287510 AL137857.1 187113 sc-eQTL 9.75e-01 0.00289 0.0912 0.222 cMono_IL1B L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -377982 sc-eQTL 1.21e-01 0.142 0.0911 0.222 cMono_S100A L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -378176 sc-eQTL 8.40e-01 0.0219 0.108 0.222 cMono_S100A L2
ENSG00000134644 PUM1 -147185 sc-eQTL 4.79e-01 0.0555 0.0782 0.222 cMono_S100A L2
ENSG00000162511 LAPTM5 161032 sc-eQTL 3.06e-01 -0.0616 0.06 0.222 cMono_S100A L2
ENSG00000162512 SDC3 10048 sc-eQTL 1.45e-01 -0.151 0.103 0.222 cMono_S100A L2
ENSG00000162517 PEF1 -726090 sc-eQTL 6.72e-01 -0.0397 0.0938 0.222 cMono_S100A L2
ENSG00000168528 SERINC2 -490759 sc-eQTL 4.78e-01 0.078 0.11 0.222 cMono_S100A L2
ENSG00000284543 LINC01226 -587420 sc-eQTL 3.01e-01 -0.0925 0.0892 0.222 cMono_S100A L2
ENSG00000287510 AL137857.1 187113 sc-eQTL 1.07e-01 -0.145 0.0892 0.222 cMono_S100A L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -377982 sc-eQTL 9.51e-01 0.00823 0.134 0.224 gdT L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -378176 sc-eQTL 1.61e-01 0.161 0.114 0.224 gdT L2
ENSG00000134644 PUM1 -147185 sc-eQTL 6.19e-01 -0.0592 0.119 0.224 gdT L2
ENSG00000162511 LAPTM5 161032 sc-eQTL 9.67e-01 -0.00535 0.129 0.224 gdT L2
ENSG00000162517 PEF1 -726090 sc-eQTL 9.14e-02 0.199 0.117 0.224 gdT L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 200302 sc-eQTL 5.83e-01 -0.0655 0.119 0.224 gdT L2
ENSG00000287510 AL137857.1 187113 sc-eQTL 3.16e-01 -0.116 0.115 0.224 gdT L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -377982 sc-eQTL 6.80e-01 0.0425 0.103 0.224 intMono L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -378176 sc-eQTL 1.77e-01 -0.149 0.11 0.224 intMono L2
ENSG00000134644 PUM1 -147185 sc-eQTL 1.47e-02 0.228 0.0926 0.224 intMono L2
ENSG00000162511 LAPTM5 161032 sc-eQTL 1.67e-01 -0.102 0.0734 0.224 intMono L2
ENSG00000162512 SDC3 10048 sc-eQTL 2.01e-01 -0.129 0.101 0.224 intMono L2
ENSG00000162517 PEF1 -726090 sc-eQTL 3.97e-01 0.0899 0.106 0.224 intMono L2
ENSG00000168528 SERINC2 -490759 sc-eQTL 5.34e-01 0.0657 0.106 0.224 intMono L2
ENSG00000284543 LINC01226 -587420 sc-eQTL 5.66e-01 -0.0575 0.1 0.224 intMono L2
ENSG00000287510 AL137857.1 187113 sc-eQTL 7.00e-01 0.0386 0.1 0.224 intMono L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -377982 sc-eQTL 6.66e-01 0.0414 0.0957 0.222 ncMono L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -378176 sc-eQTL 2.63e-01 -0.114 0.102 0.222 ncMono L2
ENSG00000134644 PUM1 -147185 sc-eQTL 3.23e-01 -0.0824 0.0832 0.222 ncMono L2
ENSG00000162511 LAPTM5 161032 sc-eQTL 2.94e-01 0.0795 0.0756 0.222 ncMono L2
ENSG00000162512 SDC3 10048 sc-eQTL 2.46e-02 -0.19 0.0839 0.222 ncMono L2
ENSG00000162517 PEF1 -726090 sc-eQTL 8.20e-01 0.0222 0.0974 0.222 ncMono L2
ENSG00000168528 SERINC2 -490759 sc-eQTL 7.18e-01 0.0336 0.0927 0.222 ncMono L2
ENSG00000284543 LINC01226 -587420 sc-eQTL 6.53e-01 -0.0417 0.0926 0.222 ncMono L2
ENSG00000287510 AL137857.1 187113 sc-eQTL 6.81e-01 0.0395 0.096 0.222 ncMono L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -377982 sc-eQTL 3.38e-01 -0.105 0.109 0.226 pDC L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -378176 sc-eQTL 4.36e-01 0.0934 0.12 0.226 pDC L2
ENSG00000134644 PUM1 -147185 sc-eQTL 8.17e-01 0.0231 0.0993 0.226 pDC L2
ENSG00000162511 LAPTM5 161032 sc-eQTL 6.61e-01 0.0405 0.0923 0.226 pDC L2
ENSG00000162517 PEF1 -726090 sc-eQTL 7.61e-01 -0.0365 0.12 0.226 pDC L2
ENSG00000168528 SERINC2 -490759 sc-eQTL 7.49e-01 0.0358 0.112 0.226 pDC L2
ENSG00000284543 LINC01226 -587420 sc-eQTL 7.57e-01 0.0269 0.0869 0.226 pDC L2
ENSG00000287510 AL137857.1 187113 sc-eQTL 6.26e-02 0.19 0.101 0.226 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000060688 SNRNP40 -377982 sc-eQTL 5.03e-01 -0.0733 0.109 0.222 B_Memory LOneK1K
ENSG00000121766 ZCCHC17 -378176 sc-eQTL 4.14e-01 -0.0744 0.0909 0.222 B_Memory LOneK1K
ENSG00000134644 PUM1 -147185 sc-eQTL 9.95e-01 0.000531 0.0807 0.222 B_Memory LOneK1K
ENSG00000162510 MATN1 195221 sc-eQTL 9.70e-01 -0.00341 0.092 0.222 B_Memory LOneK1K
ENSG00000162511 LAPTM5 161032 sc-eQTL 8.50e-01 -0.011 0.0578 0.222 B_Memory LOneK1K
ENSG00000162517 PEF1 -726090 sc-eQTL 9.51e-01 -0.00587 0.0957 0.222 B_Memory LOneK1K
ENSG00000186056 MATN1-AS1 200302 sc-eQTL 3.20e-01 -0.0759 0.0762 0.222 B_Memory LOneK1K
ENSG00000287510 AL137857.1 187113 sc-eQTL 7.60e-01 -0.0254 0.0833 0.222 B_Memory LOneK1K
ENSG00000060688 SNRNP40 -377982 sc-eQTL 6.35e-01 -0.0471 0.0992 0.222 B_Naive LOneK1K
ENSG00000121766 ZCCHC17 -378176 sc-eQTL 4.59e-01 0.0582 0.0784 0.222 B_Naive LOneK1K
ENSG00000134644 PUM1 -147185 sc-eQTL 1.95e-01 0.0962 0.074 0.222 B_Naive LOneK1K
ENSG00000162510 MATN1 195221 sc-eQTL 6.82e-01 -0.0293 0.0715 0.222 B_Naive LOneK1K
ENSG00000162511 LAPTM5 161032 sc-eQTL 3.42e-01 -0.0479 0.0502 0.222 B_Naive LOneK1K
ENSG00000162517 PEF1 -726090 sc-eQTL 5.77e-01 0.0513 0.0919 0.222 B_Naive LOneK1K
ENSG00000186056 MATN1-AS1 200302 sc-eQTL 4.41e-01 -0.0501 0.0649 0.222 B_Naive LOneK1K
ENSG00000287510 AL137857.1 187113 sc-eQTL 4.16e-01 0.0629 0.0771 0.222 B_Naive LOneK1K
ENSG00000060688 SNRNP40 -377982 sc-eQTL 6.08e-01 0.0428 0.0833 0.222 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000121766 ZCCHC17 -378176 sc-eQTL 9.64e-01 0.00422 0.0944 0.222 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000134644 PUM1 -147185 sc-eQTL 9.69e-01 -0.00236 0.0602 0.222 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000162511 LAPTM5 161032 sc-eQTL 4.44e-01 -0.0405 0.0528 0.222 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000162512 SDC3 10048 sc-eQTL 1.09e-01 -0.173 0.107 0.222 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000162517 PEF1 -726090 sc-eQTL 6.69e-01 0.0325 0.0759 0.222 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000168528 SERINC2 -490759 sc-eQTL 4.70e-01 0.0803 0.111 0.222 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000284543 LINC01226 -587420 sc-eQTL 6.60e-01 0.04 0.091 0.222 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000287510 AL137857.1 187113 sc-eQTL 5.51e-01 -0.0509 0.0852 0.222 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000060688 SNRNP40 -377982 sc-eQTL 3.57e-01 0.084 0.0911 0.22 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000121766 ZCCHC17 -378176 sc-eQTL 2.87e-02 -0.217 0.0987 0.22 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000134644 PUM1 -147185 sc-eQTL 6.13e-01 0.0414 0.0818 0.22 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000162511 LAPTM5 161032 sc-eQTL 4.43e-01 -0.0502 0.0654 0.22 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000162512 SDC3 10048 sc-eQTL 9.27e-02 -0.16 0.0949 0.22 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000162517 PEF1 -726090 sc-eQTL 4.13e-01 0.0711 0.0867 0.22 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000168528 SERINC2 -490759 sc-eQTL 4.26e-01 0.0789 0.099 0.22 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000284543 LINC01226 -587420 sc-eQTL 6.20e-01 -0.0467 0.094 0.22 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000287510 AL137857.1 187113 sc-eQTL 4.77e-01 0.067 0.0941 0.22 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000060688 SNRNP40 -377982 sc-eQTL 8.06e-01 0.0254 0.103 0.222 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000121753 ADGRB2 -846087 sc-eQTL 7.12e-01 -0.0326 0.088 0.222 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000121766 ZCCHC17 -378176 sc-eQTL 1.05e-02 -0.18 0.0695 0.222 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000134644 PUM1 -147185 sc-eQTL 1.16e-01 0.121 0.0769 0.222 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000162511 LAPTM5 161032 sc-eQTL 2.30e-01 0.104 0.0861 0.222 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000162517 PEF1 -726090 sc-eQTL 9.59e-01 -0.00338 0.0657 0.222 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000186056 MATN1-AS1 200302 sc-eQTL 8.06e-01 -0.0245 0.0997 0.222 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000287510 AL137857.1 187113 sc-eQTL 7.60e-01 0.0264 0.086 0.222 NK_CD56dim LOneK1K

Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF
ENSG00000121766 ZCCHC17 -378176 eQTL 1.16e-03 0.0687 0.0211 0.0 0.0 0.251
ENSG00000162512 SDC3 10048 eQTL 0.000313 -0.106 0.0292 0.0 0.0 0.251
ENSG00000168528 SERINC2 -490759 eQTL 2.32e-06 0.217 0.0456 0.0 0.0 0.251

Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina
ENSG00000162510 \N 195221 1.36e-06 2.1e-06 2.29e-07 1.28e-06 3.96e-07 5.09e-07 1.52e-06 4.39e-07 1.74e-06 6.69e-07 2.01e-06 9.31e-07 2.62e-06 2.82e-07 4.98e-07 1.02e-06 1.01e-06 1.06e-06 8.04e-07 5.05e-07 8.13e-07 1.96e-06 1.19e-06 5.58e-07 2.39e-06 6.68e-07 1.03e-06 9.09e-07 1.62e-06 1.31e-06 8.51e-07 2.85e-07 2.16e-07 6.58e-07 5.28e-07 5.26e-07 7.49e-07 1.92e-07 4.63e-07 3.12e-07 1.45e-07 2.12e-06 4.02e-07 1.3e-07 2.84e-07 2.32e-07 2.37e-07 6.02e-08 1.63e-07
ENSG00000162512 SDC3 10048 2.22e-05 2.79e-05 4.28e-06 1.31e-05 3.32e-06 9.14e-06 3.18e-05 3.59e-06 2.08e-05 1.11e-05 2.93e-05 1.05e-05 3.85e-05 1e-05 5.59e-06 1.29e-05 1.12e-05 1.75e-05 6.06e-06 4.92e-06 9.78e-06 2.28e-05 2.34e-05 6.36e-06 3.29e-05 5.57e-06 9.71e-06 9e-06 2.36e-05 1.95e-05 1.5e-05 1.38e-06 1.93e-06 5.09e-06 8.54e-06 4.51e-06 2.05e-06 2.81e-06 3.44e-06 2.6e-06 1.21e-06 3.06e-05 2.66e-06 1.96e-07 1.91e-06 2.96e-06 3.37e-06 1.34e-06 1.32e-06
ENSG00000168528 SERINC2 -490759 3.92e-07 2.89e-07 6.41e-08 2.53e-07 1.06e-07 8.89e-08 2.95e-07 6.72e-08 1.96e-07 1.21e-07 2.62e-07 1.59e-07 3.6e-07 8.66e-08 6.93e-08 1.13e-07 6.81e-08 2.33e-07 8e-08 6.58e-08 1.39e-07 2.06e-07 2e-07 4.25e-08 2.74e-07 1.51e-07 1.48e-07 1.42e-07 1.4e-07 1.85e-07 1.52e-07 6.04e-08 3.46e-08 1.01e-07 4.78e-08 5.23e-08 6.48e-08 7.63e-08 4.99e-08 8.2e-08 5.24e-08 2.43e-07 2.8e-08 1.78e-08 8.59e-08 8.07e-09 7e-08 0.0 4.54e-08
ENSG00000237329 \N -117928 3.99e-06 4.67e-06 4.85e-07 2.02e-06 6.12e-07 8.4e-07 2.41e-06 9.87e-07 2.78e-06 1.67e-06 4.17e-06 2.28e-06 5.9e-06 1.42e-06 8.93e-07 2.11e-06 1.56e-06 2.13e-06 1.38e-06 1.23e-06 1.45e-06 3.51e-06 3.21e-06 1.22e-06 4.62e-06 1.22e-06 1.88e-06 1.79e-06 3.12e-06 2.75e-06 2e-06 3.41e-07 6.41e-07 1.25e-06 1.35e-06 9.62e-07 7.48e-07 4.12e-07 1.35e-06 3.75e-07 2.59e-07 4.54e-06 3.98e-07 2.06e-07 3.13e-07 3.6e-07 6.75e-07 1.83e-07 2.02e-07