logo

Genes within 1Mb (chr1:30913637:C:A):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD

Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000060688 SNRNP40 -383151 sc-eQTL 9.27e-01 -0.00771 0.0844 0.269 B L1
ENSG00000121766 ZCCHC17 -383345 sc-eQTL 7.59e-01 0.0207 0.0676 0.269 B L1
ENSG00000134644 PUM1 -152354 sc-eQTL 1.18e-01 -0.0886 0.0564 0.269 B L1
ENSG00000162510 MATN1 190052 sc-eQTL 4.50e-01 0.045 0.0596 0.269 B L1
ENSG00000162511 LAPTM5 155863 sc-eQTL 9.51e-01 0.0029 0.0467 0.269 B L1
ENSG00000162517 PEF1 -731259 sc-eQTL 4.36e-01 0.0549 0.0704 0.269 B L1
ENSG00000186056 MATN1-AS1 195133 sc-eQTL 8.72e-02 0.0934 0.0543 0.269 B L1
ENSG00000287510 AL137857.1 181944 sc-eQTL 2.34e-01 -0.0771 0.0646 0.269 B L1
ENSG00000060688 SNRNP40 -383151 sc-eQTL 5.33e-01 -0.0453 0.0725 0.269 CD4T L1
ENSG00000121766 ZCCHC17 -383345 sc-eQTL 2.90e-01 0.0599 0.0565 0.269 CD4T L1
ENSG00000134644 PUM1 -152354 sc-eQTL 4.49e-01 -0.0382 0.0504 0.269 CD4T L1
ENSG00000162511 LAPTM5 155863 sc-eQTL 1.33e-01 -0.0839 0.0556 0.269 CD4T L1
ENSG00000162517 PEF1 -731259 sc-eQTL 4.40e-01 -0.0451 0.0584 0.269 CD4T L1
ENSG00000186056 MATN1-AS1 195133 sc-eQTL 3.92e-02 0.103 0.0495 0.269 CD4T L1
ENSG00000287510 AL137857.1 181944 sc-eQTL 6.94e-01 -0.0236 0.0599 0.269 CD4T L1
ENSG00000060688 SNRNP40 -383151 sc-eQTL 9.59e-01 0.0049 0.0951 0.269 CD8T L1
ENSG00000121766 ZCCHC17 -383345 sc-eQTL 7.97e-01 0.0163 0.0633 0.269 CD8T L1
ENSG00000134644 PUM1 -152354 sc-eQTL 3.06e-01 -0.057 0.0556 0.269 CD8T L1
ENSG00000162511 LAPTM5 155863 sc-eQTL 4.21e-02 -0.11 0.0536 0.269 CD8T L1
ENSG00000162517 PEF1 -731259 sc-eQTL 1.18e-01 -0.104 0.0663 0.269 CD8T L1
ENSG00000186056 MATN1-AS1 195133 sc-eQTL 5.44e-01 -0.0385 0.0634 0.269 CD8T L1
ENSG00000287510 AL137857.1 181944 sc-eQTL 6.55e-02 0.146 0.0791 0.269 CD8T L1
ENSG00000060688 SNRNP40 -383151 sc-eQTL 2.82e-01 0.0922 0.0855 0.259 DC L1
ENSG00000121766 ZCCHC17 -383345 sc-eQTL 7.04e-01 0.0386 0.102 0.259 DC L1
ENSG00000134644 PUM1 -152354 sc-eQTL 7.58e-01 -0.0245 0.0795 0.259 DC L1
ENSG00000162511 LAPTM5 155863 sc-eQTL 2.81e-01 -0.0612 0.0566 0.259 DC L1
ENSG00000162517 PEF1 -731259 sc-eQTL 7.79e-01 0.0258 0.0921 0.259 DC L1
ENSG00000168528 SERINC2 -495928 sc-eQTL 8.95e-01 -0.0124 0.0937 0.259 DC L1
ENSG00000284543 LINC01226 -592589 sc-eQTL 8.34e-01 0.013 0.062 0.259 DC L1
ENSG00000287510 AL137857.1 181944 sc-eQTL 8.20e-01 0.0205 0.0898 0.259 DC L1
ENSG00000060688 SNRNP40 -383151 sc-eQTL 4.92e-01 0.0457 0.0663 0.269 Mono L1
ENSG00000121766 ZCCHC17 -383345 sc-eQTL 8.40e-01 -0.0166 0.0823 0.269 Mono L1
ENSG00000134644 PUM1 -152354 sc-eQTL 4.37e-01 -0.041 0.0527 0.269 Mono L1
ENSG00000162511 LAPTM5 155863 sc-eQTL 3.95e-01 -0.0413 0.0484 0.269 Mono L1
ENSG00000162512 SDC3 4879 sc-eQTL 2.18e-03 0.283 0.0912 0.269 Mono L1
ENSG00000162517 PEF1 -731259 sc-eQTL 8.34e-01 0.0138 0.0654 0.269 Mono L1
ENSG00000168528 SERINC2 -495928 sc-eQTL 5.01e-01 -0.0674 0.0999 0.269 Mono L1
ENSG00000284543 LINC01226 -592589 sc-eQTL 9.03e-02 -0.149 0.0875 0.269 Mono L1
ENSG00000287510 AL137857.1 181944 sc-eQTL 1.47e-01 -0.111 0.0766 0.269 Mono L1
ENSG00000060688 SNRNP40 -383151 sc-eQTL 5.01e-02 -0.181 0.0916 0.268 NK L1
ENSG00000121753 ADGRB2 -851256 sc-eQTL 4.59e-01 -0.0589 0.0795 0.268 NK L1
ENSG00000121766 ZCCHC17 -383345 sc-eQTL 1.42e-02 0.154 0.0624 0.268 NK L1
ENSG00000134644 PUM1 -152354 sc-eQTL 2.62e-01 -0.0744 0.0662 0.268 NK L1
ENSG00000162511 LAPTM5 155863 sc-eQTL 6.61e-01 -0.0336 0.0764 0.268 NK L1
ENSG00000162517 PEF1 -731259 sc-eQTL 7.35e-01 -0.0189 0.0558 0.268 NK L1
ENSG00000186056 MATN1-AS1 195133 sc-eQTL 7.31e-01 0.0295 0.0858 0.268 NK L1
ENSG00000287510 AL137857.1 181944 sc-eQTL 3.43e-01 -0.0752 0.0791 0.268 NK L1
ENSG00000060688 SNRNP40 -383151 sc-eQTL 6.01e-01 -0.0362 0.0691 0.269 Other_T L1
ENSG00000121766 ZCCHC17 -383345 sc-eQTL 8.34e-02 0.128 0.0734 0.269 Other_T L1
ENSG00000134644 PUM1 -152354 sc-eQTL 2.19e-01 -0.0817 0.0662 0.269 Other_T L1
ENSG00000162511 LAPTM5 155863 sc-eQTL 2.93e-01 -0.0573 0.0543 0.269 Other_T L1
ENSG00000162517 PEF1 -731259 sc-eQTL 3.86e-01 -0.0631 0.0726 0.269 Other_T L1
ENSG00000186056 MATN1-AS1 195133 sc-eQTL 6.04e-01 0.0464 0.0891 0.269 Other_T L1
ENSG00000287510 AL137857.1 181944 sc-eQTL 8.49e-01 -0.0177 0.0929 0.269 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000060688 SNRNP40 -383151 sc-eQTL 1.29e-01 -0.174 0.114 0.273 B_Activated L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -383345 sc-eQTL 4.39e-01 0.0893 0.115 0.273 B_Activated L2
ENSG00000134644 PUM1 -152354 sc-eQTL 3.19e-01 0.107 0.107 0.273 B_Activated L2
ENSG00000162510 MATN1 190052 sc-eQTL 5.87e-01 -0.051 0.0936 0.273 B_Activated L2
ENSG00000162511 LAPTM5 155863 sc-eQTL 3.12e-01 -0.0661 0.0652 0.273 B_Activated L2
ENSG00000162517 PEF1 -731259 sc-eQTL 2.13e-01 0.138 0.111 0.273 B_Activated L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 195133 sc-eQTL 9.66e-01 0.00449 0.106 0.273 B_Activated L2
ENSG00000287510 AL137857.1 181944 sc-eQTL 4.38e-01 -0.0725 0.0932 0.273 B_Activated L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -383151 sc-eQTL 6.77e-01 -0.045 0.108 0.266 B_Intermediate L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -383345 sc-eQTL 3.60e-01 0.0823 0.0897 0.266 B_Intermediate L2
ENSG00000134644 PUM1 -152354 sc-eQTL 7.52e-01 -0.0269 0.0847 0.266 B_Intermediate L2
ENSG00000162510 MATN1 190052 sc-eQTL 6.24e-02 0.164 0.0875 0.266 B_Intermediate L2
ENSG00000162511 LAPTM5 155863 sc-eQTL 6.36e-01 0.0256 0.0541 0.266 B_Intermediate L2
ENSG00000162517 PEF1 -731259 sc-eQTL 6.11e-01 -0.0512 0.1 0.266 B_Intermediate L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 195133 sc-eQTL 9.25e-01 -0.00715 0.076 0.266 B_Intermediate L2
ENSG00000287510 AL137857.1 181944 sc-eQTL 7.99e-01 -0.0217 0.085 0.266 B_Intermediate L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -383151 sc-eQTL 8.96e-01 0.0135 0.103 0.267 B_Memory L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -383345 sc-eQTL 4.70e-01 0.0684 0.0945 0.267 B_Memory L2
ENSG00000134644 PUM1 -152354 sc-eQTL 1.03e-01 -0.134 0.0818 0.267 B_Memory L2
ENSG00000162510 MATN1 190052 sc-eQTL 9.93e-01 0.000648 0.0788 0.267 B_Memory L2
ENSG00000162511 LAPTM5 155863 sc-eQTL 1.92e-01 0.0911 0.0696 0.267 B_Memory L2
ENSG00000162517 PEF1 -731259 sc-eQTL 8.49e-01 -0.0178 0.0933 0.267 B_Memory L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 195133 sc-eQTL 2.78e-01 -0.0866 0.0797 0.267 B_Memory L2
ENSG00000287510 AL137857.1 181944 sc-eQTL 5.67e-01 -0.0536 0.0935 0.267 B_Memory L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -383151 sc-eQTL 3.89e-01 -0.08 0.0926 0.269 B_Naive1 L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -383345 sc-eQTL 6.60e-01 0.0352 0.08 0.269 B_Naive1 L2
ENSG00000134644 PUM1 -152354 sc-eQTL 4.79e-02 -0.139 0.07 0.269 B_Naive1 L2
ENSG00000162510 MATN1 190052 sc-eQTL 8.34e-01 0.015 0.0717 0.269 B_Naive1 L2
ENSG00000162511 LAPTM5 155863 sc-eQTL 2.77e-01 -0.052 0.0477 0.269 B_Naive1 L2
ENSG00000162517 PEF1 -731259 sc-eQTL 9.25e-01 -0.00793 0.0844 0.269 B_Naive1 L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 195133 sc-eQTL 1.56e-01 0.089 0.0626 0.269 B_Naive1 L2
ENSG00000287510 AL137857.1 181944 sc-eQTL 7.93e-01 -0.0204 0.0777 0.269 B_Naive1 L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -383151 sc-eQTL 5.04e-02 0.194 0.0986 0.268 B_Naive2 L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -383345 sc-eQTL 7.29e-01 0.0285 0.0821 0.268 B_Naive2 L2
ENSG00000134644 PUM1 -152354 sc-eQTL 9.69e-01 -0.0031 0.0804 0.268 B_Naive2 L2
ENSG00000162510 MATN1 190052 sc-eQTL 4.72e-01 -0.0555 0.0771 0.268 B_Naive2 L2
ENSG00000162511 LAPTM5 155863 sc-eQTL 5.45e-01 -0.0317 0.0524 0.268 B_Naive2 L2
ENSG00000162517 PEF1 -731259 sc-eQTL 3.52e-02 0.2 0.0943 0.268 B_Naive2 L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 195133 sc-eQTL 8.91e-01 -0.0104 0.0763 0.268 B_Naive2 L2
ENSG00000287510 AL137857.1 181944 sc-eQTL 3.20e-02 -0.176 0.0815 0.268 B_Naive2 L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -383151 sc-eQTL 8.20e-01 -0.0221 0.097 0.275 CD4_CTL L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -383345 sc-eQTL 6.25e-01 -0.0466 0.0953 0.275 CD4_CTL L2
ENSG00000134644 PUM1 -152354 sc-eQTL 9.90e-01 -0.00121 0.0935 0.275 CD4_CTL L2
ENSG00000162511 LAPTM5 155863 sc-eQTL 4.40e-01 -0.0644 0.0833 0.275 CD4_CTL L2
ENSG00000162517 PEF1 -731259 sc-eQTL 7.85e-01 0.0233 0.0855 0.275 CD4_CTL L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 195133 sc-eQTL 1.34e-03 0.289 0.0888 0.275 CD4_CTL L2
ENSG00000287510 AL137857.1 181944 sc-eQTL 5.73e-01 -0.0454 0.0804 0.275 CD4_CTL L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -383151 sc-eQTL 6.27e-01 -0.037 0.0761 0.269 CD4_Naive L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -383345 sc-eQTL 3.20e-01 0.0671 0.0673 0.269 CD4_Naive L2
ENSG00000134644 PUM1 -152354 sc-eQTL 8.24e-01 0.012 0.0539 0.269 CD4_Naive L2
ENSG00000162511 LAPTM5 155863 sc-eQTL 9.61e-02 -0.0959 0.0574 0.269 CD4_Naive L2
ENSG00000162517 PEF1 -731259 sc-eQTL 5.15e-01 -0.0412 0.0633 0.269 CD4_Naive L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 195133 sc-eQTL 3.88e-02 0.121 0.058 0.269 CD4_Naive L2
ENSG00000287510 AL137857.1 181944 sc-eQTL 7.76e-01 -0.0192 0.0673 0.269 CD4_Naive L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -383151 sc-eQTL 8.65e-01 0.0161 0.0944 0.269 CD4_TCM L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -383345 sc-eQTL 4.46e-01 -0.058 0.076 0.269 CD4_TCM L2
ENSG00000134644 PUM1 -152354 sc-eQTL 1.84e-02 -0.158 0.0665 0.269 CD4_TCM L2
ENSG00000162511 LAPTM5 155863 sc-eQTL 3.64e-01 -0.0507 0.0558 0.269 CD4_TCM L2
ENSG00000162517 PEF1 -731259 sc-eQTL 3.56e-01 -0.0691 0.0747 0.269 CD4_TCM L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 195133 sc-eQTL 1.60e-01 0.0995 0.0706 0.269 CD4_TCM L2
ENSG00000287510 AL137857.1 181944 sc-eQTL 1.52e-01 -0.113 0.0786 0.269 CD4_TCM L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -383151 sc-eQTL 6.15e-02 -0.175 0.0932 0.269 CD4_TEM L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -383345 sc-eQTL 2.74e-01 0.0979 0.0893 0.269 CD4_TEM L2
ENSG00000134644 PUM1 -152354 sc-eQTL 4.20e-02 -0.151 0.0739 0.269 CD4_TEM L2
ENSG00000162511 LAPTM5 155863 sc-eQTL 1.69e-01 -0.104 0.0751 0.269 CD4_TEM L2
ENSG00000162517 PEF1 -731259 sc-eQTL 6.60e-01 0.0372 0.0845 0.269 CD4_TEM L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 195133 sc-eQTL 8.58e-01 -0.0158 0.0883 0.269 CD4_TEM L2
ENSG00000287510 AL137857.1 181944 sc-eQTL 8.54e-01 0.016 0.087 0.269 CD4_TEM L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -383151 sc-eQTL 8.77e-01 -0.016 0.104 0.269 CD8_CTL L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -383345 sc-eQTL 5.31e-02 -0.153 0.0788 0.269 CD8_CTL L2
ENSG00000134644 PUM1 -152354 sc-eQTL 4.90e-01 -0.0534 0.0772 0.269 CD8_CTL L2
ENSG00000162511 LAPTM5 155863 sc-eQTL 4.03e-03 -0.244 0.0839 0.269 CD8_CTL L2
ENSG00000162517 PEF1 -731259 sc-eQTL 7.71e-01 -0.0217 0.0745 0.269 CD8_CTL L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 195133 sc-eQTL 2.28e-01 0.108 0.0896 0.269 CD8_CTL L2
ENSG00000287510 AL137857.1 181944 sc-eQTL 3.68e-01 0.0762 0.0844 0.269 CD8_CTL L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -383151 sc-eQTL 8.13e-01 0.0225 0.0946 0.269 CD8_Naive L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -383345 sc-eQTL 3.48e-01 0.0765 0.0814 0.269 CD8_Naive L2
ENSG00000134644 PUM1 -152354 sc-eQTL 9.52e-01 0.00393 0.0656 0.269 CD8_Naive L2
ENSG00000162511 LAPTM5 155863 sc-eQTL 1.87e-02 -0.147 0.0621 0.269 CD8_Naive L2
ENSG00000162517 PEF1 -731259 sc-eQTL 1.28e-01 -0.133 0.087 0.269 CD8_Naive L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 195133 sc-eQTL 4.76e-01 -0.056 0.0784 0.269 CD8_Naive L2
ENSG00000287510 AL137857.1 181944 sc-eQTL 6.24e-01 0.0419 0.0854 0.269 CD8_Naive L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -383151 sc-eQTL 3.06e-01 0.113 0.11 0.269 CD8_TCM L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -383345 sc-eQTL 4.21e-01 0.0815 0.101 0.269 CD8_TCM L2
ENSG00000134644 PUM1 -152354 sc-eQTL 9.61e-01 -0.0046 0.0951 0.269 CD8_TCM L2
ENSG00000162511 LAPTM5 155863 sc-eQTL 2.64e-01 -0.111 0.0992 0.269 CD8_TCM L2
ENSG00000162517 PEF1 -731259 sc-eQTL 4.33e-02 -0.205 0.101 0.269 CD8_TCM L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 195133 sc-eQTL 8.05e-01 -0.0228 0.0921 0.269 CD8_TCM L2
ENSG00000287510 AL137857.1 181944 sc-eQTL 6.54e-01 0.0417 0.093 0.269 CD8_TCM L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -383151 sc-eQTL 2.75e-01 -0.11 0.101 0.274 CD8_TEM L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -383345 sc-eQTL 4.90e-01 0.0669 0.0968 0.274 CD8_TEM L2
ENSG00000134644 PUM1 -152354 sc-eQTL 1.36e-01 -0.147 0.0985 0.274 CD8_TEM L2
ENSG00000162511 LAPTM5 155863 sc-eQTL 1.86e-02 -0.218 0.0918 0.274 CD8_TEM L2
ENSG00000162517 PEF1 -731259 sc-eQTL 5.57e-01 -0.0516 0.0876 0.274 CD8_TEM L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 195133 sc-eQTL 5.13e-01 0.0633 0.0966 0.274 CD8_TEM L2
ENSG00000287510 AL137857.1 181944 sc-eQTL 1.41e-01 0.129 0.087 0.274 CD8_TEM L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -383151 sc-eQTL 7.76e-01 0.0289 0.101 0.273 MAIT L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -383345 sc-eQTL 3.64e-01 0.0815 0.0895 0.273 MAIT L2
ENSG00000134644 PUM1 -152354 sc-eQTL 1.59e-01 -0.121 0.0856 0.273 MAIT L2
ENSG00000162511 LAPTM5 155863 sc-eQTL 1.08e-01 -0.13 0.0806 0.273 MAIT L2
ENSG00000162517 PEF1 -731259 sc-eQTL 4.63e-01 -0.0654 0.089 0.273 MAIT L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 195133 sc-eQTL 4.99e-01 0.0611 0.0902 0.273 MAIT L2
ENSG00000287510 AL137857.1 181944 sc-eQTL 8.46e-01 -0.0181 0.0931 0.273 MAIT L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -383151 sc-eQTL 3.08e-01 -0.105 0.103 0.267 NK_CD56bright L2
ENSG00000121753 ADGRB2 -851256 sc-eQTL 7.67e-01 -0.024 0.0808 0.267 NK_CD56bright L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -383345 sc-eQTL 1.23e-01 0.134 0.0867 0.267 NK_CD56bright L2
ENSG00000134644 PUM1 -152354 sc-eQTL 3.98e-01 -0.0774 0.0914 0.267 NK_CD56bright L2
ENSG00000162511 LAPTM5 155863 sc-eQTL 3.85e-01 -0.0786 0.0902 0.267 NK_CD56bright L2
ENSG00000162517 PEF1 -731259 sc-eQTL 7.32e-01 -0.0301 0.0877 0.267 NK_CD56bright L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 195133 sc-eQTL 2.77e-01 0.0987 0.0905 0.267 NK_CD56bright L2
ENSG00000287510 AL137857.1 181944 sc-eQTL 3.86e-01 0.0775 0.0893 0.267 NK_CD56bright L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -383151 sc-eQTL 9.76e-03 -0.25 0.096 0.267 NK_CD56dim L2
ENSG00000121753 ADGRB2 -851256 sc-eQTL 1.43e-01 -0.126 0.0853 0.267 NK_CD56dim L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -383345 sc-eQTL 4.02e-02 0.147 0.0714 0.267 NK_CD56dim L2
ENSG00000134644 PUM1 -152354 sc-eQTL 3.74e-01 -0.0657 0.0738 0.267 NK_CD56dim L2
ENSG00000162511 LAPTM5 155863 sc-eQTL 9.71e-01 0.00286 0.0789 0.267 NK_CD56dim L2
ENSG00000162517 PEF1 -731259 sc-eQTL 6.46e-01 -0.0323 0.0702 0.267 NK_CD56dim L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 195133 sc-eQTL 9.39e-01 0.00753 0.0988 0.267 NK_CD56dim L2
ENSG00000287510 AL137857.1 181944 sc-eQTL 6.04e-01 -0.0423 0.0815 0.267 NK_CD56dim L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -383151 sc-eQTL 3.95e-02 -0.21 0.102 0.279 NK_HLA L2
ENSG00000121753 ADGRB2 -851256 sc-eQTL 6.22e-01 -0.0402 0.0814 0.279 NK_HLA L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -383345 sc-eQTL 9.18e-01 -0.00941 0.0916 0.279 NK_HLA L2
ENSG00000134644 PUM1 -152354 sc-eQTL 2.93e-01 -0.0939 0.089 0.279 NK_HLA L2
ENSG00000162511 LAPTM5 155863 sc-eQTL 4.07e-01 -0.0707 0.0851 0.279 NK_HLA L2
ENSG00000162517 PEF1 -731259 sc-eQTL 2.19e-02 0.219 0.0947 0.279 NK_HLA L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 195133 sc-eQTL 3.20e-01 -0.0901 0.0904 0.279 NK_HLA L2
ENSG00000287510 AL137857.1 181944 sc-eQTL 1.53e-01 -0.125 0.0872 0.279 NK_HLA L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -383151 sc-eQTL 4.97e-01 0.0645 0.0949 0.267 NK_cytokine L2
ENSG00000121753 ADGRB2 -851256 sc-eQTL 8.19e-01 0.0196 0.0858 0.267 NK_cytokine L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -383345 sc-eQTL 2.46e-01 0.086 0.0739 0.267 NK_cytokine L2
ENSG00000134644 PUM1 -152354 sc-eQTL 5.28e-01 -0.0506 0.0801 0.267 NK_cytokine L2
ENSG00000162511 LAPTM5 155863 sc-eQTL 5.13e-02 -0.171 0.0874 0.267 NK_cytokine L2
ENSG00000162517 PEF1 -731259 sc-eQTL 4.30e-01 -0.0594 0.0751 0.267 NK_cytokine L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 195133 sc-eQTL 6.86e-01 -0.0378 0.0935 0.267 NK_cytokine L2
ENSG00000287510 AL137857.1 181944 sc-eQTL 3.65e-02 -0.181 0.0861 0.267 NK_cytokine L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -383151 sc-eQTL 6.97e-01 0.0423 0.108 0.281 PB L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -383345 sc-eQTL 9.99e-01 -9.41e-05 0.126 0.281 PB L2
ENSG00000134644 PUM1 -152354 sc-eQTL 7.24e-01 -0.0386 0.109 0.281 PB L2
ENSG00000162510 MATN1 190052 sc-eQTL 4.38e-01 0.079 0.102 0.281 PB L2
ENSG00000162511 LAPTM5 155863 sc-eQTL 4.69e-01 -0.0528 0.0726 0.281 PB L2
ENSG00000162517 PEF1 -731259 sc-eQTL 7.06e-01 0.0423 0.112 0.281 PB L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 195133 sc-eQTL 4.77e-01 0.0709 0.0994 0.281 PB L2
ENSG00000287510 AL137857.1 181944 sc-eQTL 4.30e-02 0.213 0.104 0.281 PB L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -383151 sc-eQTL 1.26e-01 -0.115 0.0748 0.27 Pro_T L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -383345 sc-eQTL 3.62e-03 0.275 0.0935 0.27 Pro_T L2
ENSG00000134644 PUM1 -152354 sc-eQTL 9.98e-01 0.000229 0.089 0.27 Pro_T L2
ENSG00000162511 LAPTM5 155863 sc-eQTL 8.24e-01 -0.0142 0.0639 0.27 Pro_T L2
ENSG00000162517 PEF1 -731259 sc-eQTL 2.25e-01 0.114 0.0934 0.27 Pro_T L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 195133 sc-eQTL 7.24e-01 0.0316 0.0892 0.27 Pro_T L2
ENSG00000287510 AL137857.1 181944 sc-eQTL 9.53e-01 -0.00485 0.0821 0.27 Pro_T L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -383151 sc-eQTL 4.88e-01 0.0678 0.0975 0.269 Treg L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -383345 sc-eQTL 6.58e-01 0.0418 0.0944 0.269 Treg L2
ENSG00000134644 PUM1 -152354 sc-eQTL 2.86e-01 0.0806 0.0754 0.269 Treg L2
ENSG00000162511 LAPTM5 155863 sc-eQTL 4.69e-02 -0.171 0.0857 0.269 Treg L2
ENSG00000162517 PEF1 -731259 sc-eQTL 3.71e-01 -0.0836 0.0933 0.269 Treg L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 195133 sc-eQTL 5.80e-01 -0.0488 0.0881 0.269 Treg L2
ENSG00000287510 AL137857.1 181944 sc-eQTL 2.55e-01 0.1 0.0878 0.269 Treg L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -383151 sc-eQTL 6.15e-02 0.19 0.101 0.259 cDC L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -383345 sc-eQTL 5.39e-01 0.0678 0.11 0.259 cDC L2
ENSG00000134644 PUM1 -152354 sc-eQTL 4.72e-01 -0.0681 0.0946 0.259 cDC L2
ENSG00000162511 LAPTM5 155863 sc-eQTL 7.19e-01 0.0239 0.0664 0.259 cDC L2
ENSG00000162517 PEF1 -731259 sc-eQTL 9.40e-01 -0.00729 0.0962 0.259 cDC L2
ENSG00000168528 SERINC2 -495928 sc-eQTL 6.36e-01 0.0404 0.0852 0.259 cDC L2
ENSG00000284543 LINC01226 -592589 sc-eQTL 1.16e-01 0.131 0.0832 0.259 cDC L2
ENSG00000287510 AL137857.1 181944 sc-eQTL 3.06e-01 -0.0923 0.0899 0.259 cDC L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -383151 sc-eQTL 9.97e-01 -0.000308 0.0798 0.269 cMono_IL1B L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -383345 sc-eQTL 1.00e-01 0.146 0.0885 0.269 cMono_IL1B L2
ENSG00000134644 PUM1 -152354 sc-eQTL 6.20e-01 -0.0299 0.0603 0.269 cMono_IL1B L2
ENSG00000162511 LAPTM5 155863 sc-eQTL 1.94e-01 -0.0687 0.0527 0.269 cMono_IL1B L2
ENSG00000162512 SDC3 4879 sc-eQTL 1.58e-02 0.239 0.0983 0.269 cMono_IL1B L2
ENSG00000162517 PEF1 -731259 sc-eQTL 7.64e-01 0.0245 0.0814 0.269 cMono_IL1B L2
ENSG00000168528 SERINC2 -495928 sc-eQTL 5.85e-01 -0.0551 0.101 0.269 cMono_IL1B L2
ENSG00000284543 LINC01226 -592589 sc-eQTL 1.11e-01 -0.142 0.0887 0.269 cMono_IL1B L2
ENSG00000287510 AL137857.1 181944 sc-eQTL 2.32e-01 -0.0994 0.0829 0.269 cMono_IL1B L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -383151 sc-eQTL 4.73e-01 -0.0606 0.0842 0.269 cMono_S100A L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -383345 sc-eQTL 2.65e-02 -0.22 0.0985 0.269 cMono_S100A L2
ENSG00000134644 PUM1 -152354 sc-eQTL 9.14e-01 0.00782 0.072 0.269 cMono_S100A L2
ENSG00000162511 LAPTM5 155863 sc-eQTL 9.38e-01 0.0043 0.0553 0.269 cMono_S100A L2
ENSG00000162512 SDC3 4879 sc-eQTL 8.13e-02 0.166 0.0949 0.269 cMono_S100A L2
ENSG00000162517 PEF1 -731259 sc-eQTL 3.78e-01 0.076 0.0862 0.269 cMono_S100A L2
ENSG00000168528 SERINC2 -495928 sc-eQTL 3.12e-01 -0.102 0.101 0.269 cMono_S100A L2
ENSG00000284543 LINC01226 -592589 sc-eQTL 2.68e-01 -0.0911 0.082 0.269 cMono_S100A L2
ENSG00000287510 AL137857.1 181944 sc-eQTL 7.11e-01 -0.0306 0.0825 0.269 cMono_S100A L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -383151 sc-eQTL 5.34e-01 0.0783 0.126 0.264 gdT L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -383345 sc-eQTL 2.40e-01 -0.127 0.107 0.264 gdT L2
ENSG00000134644 PUM1 -152354 sc-eQTL 5.15e-01 0.0725 0.111 0.264 gdT L2
ENSG00000162511 LAPTM5 155863 sc-eQTL 1.53e-01 -0.173 0.12 0.264 gdT L2
ENSG00000162517 PEF1 -731259 sc-eQTL 2.39e-01 -0.13 0.11 0.264 gdT L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 195133 sc-eQTL 1.62e-01 0.156 0.111 0.264 gdT L2
ENSG00000287510 AL137857.1 181944 sc-eQTL 2.42e-02 0.242 0.106 0.264 gdT L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -383151 sc-eQTL 4.65e-01 0.0683 0.0933 0.267 intMono L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -383345 sc-eQTL 1.03e-01 -0.163 0.0998 0.267 intMono L2
ENSG00000134644 PUM1 -152354 sc-eQTL 2.10e-01 -0.107 0.0849 0.267 intMono L2
ENSG00000162511 LAPTM5 155863 sc-eQTL 2.50e-01 -0.0769 0.0666 0.267 intMono L2
ENSG00000162512 SDC3 4879 sc-eQTL 7.18e-02 0.164 0.0908 0.267 intMono L2
ENSG00000162517 PEF1 -731259 sc-eQTL 5.93e-01 -0.0515 0.0961 0.267 intMono L2
ENSG00000168528 SERINC2 -495928 sc-eQTL 6.05e-01 -0.0496 0.0958 0.267 intMono L2
ENSG00000284543 LINC01226 -592589 sc-eQTL 3.52e-01 0.0846 0.0906 0.267 intMono L2
ENSG00000287510 AL137857.1 181944 sc-eQTL 9.02e-01 0.0112 0.0908 0.267 intMono L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -383151 sc-eQTL 6.73e-01 -0.0373 0.0884 0.271 ncMono L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -383345 sc-eQTL 9.33e-01 -0.00795 0.0943 0.271 ncMono L2
ENSG00000134644 PUM1 -152354 sc-eQTL 2.10e-01 -0.0965 0.0767 0.271 ncMono L2
ENSG00000162511 LAPTM5 155863 sc-eQTL 1.52e-02 -0.169 0.0689 0.271 ncMono L2
ENSG00000162512 SDC3 4879 sc-eQTL 9.64e-03 0.202 0.0771 0.271 ncMono L2
ENSG00000162517 PEF1 -731259 sc-eQTL 6.82e-01 -0.0369 0.0899 0.271 ncMono L2
ENSG00000168528 SERINC2 -495928 sc-eQTL 9.37e-01 -0.00676 0.0856 0.271 ncMono L2
ENSG00000284543 LINC01226 -592589 sc-eQTL 5.47e-01 -0.0516 0.0855 0.271 ncMono L2
ENSG00000287510 AL137857.1 181944 sc-eQTL 5.12e-01 -0.0581 0.0886 0.271 ncMono L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -383151 sc-eQTL 9.55e-01 0.00583 0.104 0.254 pDC L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -383345 sc-eQTL 8.74e-01 -0.0182 0.114 0.254 pDC L2
ENSG00000134644 PUM1 -152354 sc-eQTL 7.34e-01 -0.0322 0.0947 0.254 pDC L2
ENSG00000162511 LAPTM5 155863 sc-eQTL 5.41e-01 -0.0539 0.0879 0.254 pDC L2
ENSG00000162517 PEF1 -731259 sc-eQTL 1.19e-01 0.178 0.113 0.254 pDC L2
ENSG00000168528 SERINC2 -495928 sc-eQTL 4.69e-01 -0.0774 0.107 0.254 pDC L2
ENSG00000284543 LINC01226 -592589 sc-eQTL 2.53e-01 0.0947 0.0825 0.254 pDC L2
ENSG00000287510 AL137857.1 181944 sc-eQTL 9.66e-01 -0.00418 0.0975 0.254 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000060688 SNRNP40 -383151 sc-eQTL 4.46e-01 -0.0777 0.102 0.269 B_Memory LOneK1K
ENSG00000121766 ZCCHC17 -383345 sc-eQTL 1.91e-01 0.111 0.0845 0.269 B_Memory LOneK1K
ENSG00000134644 PUM1 -152354 sc-eQTL 2.11e-01 -0.094 0.0749 0.269 B_Memory LOneK1K
ENSG00000162510 MATN1 190052 sc-eQTL 3.54e-01 0.0795 0.0856 0.269 B_Memory LOneK1K
ENSG00000162511 LAPTM5 155863 sc-eQTL 2.19e-01 0.0662 0.0537 0.269 B_Memory LOneK1K
ENSG00000162517 PEF1 -731259 sc-eQTL 7.08e-01 -0.0334 0.0892 0.269 B_Memory LOneK1K
ENSG00000186056 MATN1-AS1 195133 sc-eQTL 8.65e-01 -0.0121 0.0713 0.269 B_Memory LOneK1K
ENSG00000287510 AL137857.1 181944 sc-eQTL 3.23e-01 -0.0768 0.0775 0.269 B_Memory LOneK1K
ENSG00000060688 SNRNP40 -383151 sc-eQTL 4.74e-01 0.0647 0.0901 0.269 B_Naive LOneK1K
ENSG00000121766 ZCCHC17 -383345 sc-eQTL 8.69e-01 0.0118 0.0714 0.269 B_Naive LOneK1K
ENSG00000134644 PUM1 -152354 sc-eQTL 6.54e-02 -0.124 0.067 0.269 B_Naive LOneK1K
ENSG00000162510 MATN1 190052 sc-eQTL 9.98e-01 0.000146 0.065 0.269 B_Naive LOneK1K
ENSG00000162511 LAPTM5 155863 sc-eQTL 1.92e-01 -0.0596 0.0456 0.269 B_Naive LOneK1K
ENSG00000162517 PEF1 -731259 sc-eQTL 2.95e-01 0.0874 0.0833 0.269 B_Naive LOneK1K
ENSG00000186056 MATN1-AS1 195133 sc-eQTL 1.98e-01 0.0761 0.0589 0.269 B_Naive LOneK1K
ENSG00000287510 AL137857.1 181944 sc-eQTL 2.12e-01 -0.0876 0.0699 0.269 B_Naive LOneK1K
ENSG00000060688 SNRNP40 -383151 sc-eQTL 7.58e-01 -0.0234 0.0759 0.269 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000121766 ZCCHC17 -383345 sc-eQTL 9.63e-01 0.004 0.086 0.269 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000134644 PUM1 -152354 sc-eQTL 8.51e-01 -0.0103 0.0548 0.269 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000162511 LAPTM5 155863 sc-eQTL 8.92e-01 -0.00655 0.0482 0.269 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000162512 SDC3 4879 sc-eQTL 3.08e-03 0.288 0.0963 0.269 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000162517 PEF1 -731259 sc-eQTL 5.51e-01 0.0413 0.0691 0.269 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000168528 SERINC2 -495928 sc-eQTL 4.54e-01 -0.0758 0.101 0.269 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000284543 LINC01226 -592589 sc-eQTL 7.90e-02 -0.145 0.0823 0.269 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000287510 AL137857.1 181944 sc-eQTL 3.81e-01 -0.068 0.0775 0.269 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000060688 SNRNP40 -383151 sc-eQTL 5.90e-01 0.0446 0.0826 0.267 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000121766 ZCCHC17 -383345 sc-eQTL 5.55e-01 -0.0534 0.0903 0.267 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000134644 PUM1 -152354 sc-eQTL 2.40e-01 -0.0869 0.0738 0.267 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000162511 LAPTM5 155863 sc-eQTL 7.64e-02 -0.105 0.0588 0.267 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000162512 SDC3 4879 sc-eQTL 6.65e-02 0.158 0.0858 0.267 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000162517 PEF1 -731259 sc-eQTL 6.57e-01 -0.0349 0.0786 0.267 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000168528 SERINC2 -495928 sc-eQTL 9.26e-01 -0.00832 0.0897 0.267 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000284543 LINC01226 -592589 sc-eQTL 8.56e-01 -0.0155 0.0852 0.267 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000287510 AL137857.1 181944 sc-eQTL 3.47e-01 -0.0802 0.0851 0.267 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000060688 SNRNP40 -383151 sc-eQTL 7.59e-02 -0.163 0.0916 0.267 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000121753 ADGRB2 -851256 sc-eQTL 4.36e-01 -0.0613 0.0785 0.267 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000121766 ZCCHC17 -383345 sc-eQTL 5.25e-02 0.122 0.0625 0.267 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000134644 PUM1 -152354 sc-eQTL 3.13e-01 -0.0697 0.0689 0.267 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000162511 LAPTM5 155863 sc-eQTL 8.55e-01 -0.0141 0.0772 0.267 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000162517 PEF1 -731259 sc-eQTL 5.28e-01 -0.037 0.0586 0.267 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000186056 MATN1-AS1 195133 sc-eQTL 9.81e-01 -0.00216 0.089 0.267 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000287510 AL137857.1 181944 sc-eQTL 1.48e-01 -0.111 0.0764 0.267 NK_CD56dim LOneK1K

Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF
ENSG00000162512 SDC3 4879 eQTL 1.29e-09 0.159 0.026 0.0 0.0 0.296

Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina
ENSG00000162512 SDC3 4879 3.39e-05 3.29e-05 6e-06 1.55e-05 5.58e-06 1.37e-05 4.36e-05 4.46e-06 2.95e-05 1.52e-05 3.76e-05 1.63e-05 4.8e-05 1.38e-05 6.98e-06 1.81e-05 1.63e-05 2.39e-05 7.62e-06 6.6e-06 1.43e-05 3.17e-05 3.09e-05 8.66e-06 4.24e-05 7.48e-06 1.38e-05 1.26e-05 3.14e-05 2.47e-05 1.96e-05 1.63e-06 2.53e-06 6.95e-06 1.12e-05 5.51e-06 2.93e-06 3.18e-06 4.48e-06 3.3e-06 1.7e-06 3.81e-05 3.43e-06 3.33e-07 2.27e-06 3.84e-06 4.13e-06 1.53e-06 1.53e-06