logo

Genes within 1Mb (chr1:30913116:C:T):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD

Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000060688 SNRNP40 -383672 sc-eQTL 2.02e-01 0.186 0.145 0.075 B L1
ENSG00000121766 ZCCHC17 -383866 sc-eQTL 1.52e-01 -0.167 0.116 0.075 B L1
ENSG00000134644 PUM1 -152875 sc-eQTL 3.59e-01 -0.0899 0.0977 0.075 B L1
ENSG00000162510 MATN1 189531 sc-eQTL 9.68e-01 0.00413 0.103 0.075 B L1
ENSG00000162511 LAPTM5 155342 sc-eQTL 3.94e-01 -0.0688 0.0805 0.075 B L1
ENSG00000162517 PEF1 -731780 sc-eQTL 8.59e-01 -0.0217 0.122 0.075 B L1
ENSG00000186056 MATN1-AS1 194612 sc-eQTL 1.95e-01 -0.122 0.0941 0.075 B L1
ENSG00000287510 AL137857.1 181423 sc-eQTL 9.74e-01 0.0036 0.112 0.075 B L1
ENSG00000060688 SNRNP40 -383672 sc-eQTL 2.18e-01 -0.155 0.125 0.075 CD4T L1
ENSG00000121766 ZCCHC17 -383866 sc-eQTL 4.36e-01 0.0766 0.098 0.075 CD4T L1
ENSG00000134644 PUM1 -152875 sc-eQTL 5.66e-01 0.0502 0.0873 0.075 CD4T L1
ENSG00000162511 LAPTM5 155342 sc-eQTL 9.42e-01 0.00706 0.0968 0.075 CD4T L1
ENSG00000162517 PEF1 -731780 sc-eQTL 9.15e-01 -0.0109 0.101 0.075 CD4T L1
ENSG00000186056 MATN1-AS1 194612 sc-eQTL 5.83e-01 -0.0476 0.0866 0.075 CD4T L1
ENSG00000287510 AL137857.1 181423 sc-eQTL 7.11e-01 -0.0384 0.104 0.075 CD4T L1
ENSG00000060688 SNRNP40 -383672 sc-eQTL 1.41e-01 -0.244 0.165 0.075 CD8T L1
ENSG00000121766 ZCCHC17 -383866 sc-eQTL 7.50e-01 0.0352 0.11 0.075 CD8T L1
ENSG00000134644 PUM1 -152875 sc-eQTL 2.70e-01 -0.107 0.0969 0.075 CD8T L1
ENSG00000162511 LAPTM5 155342 sc-eQTL 8.26e-01 -0.0208 0.0944 0.075 CD8T L1
ENSG00000162517 PEF1 -731780 sc-eQTL 4.08e-01 -0.0962 0.116 0.075 CD8T L1
ENSG00000186056 MATN1-AS1 194612 sc-eQTL 7.19e-01 -0.0398 0.111 0.075 CD8T L1
ENSG00000287510 AL137857.1 181423 sc-eQTL 7.33e-01 -0.0475 0.139 0.075 CD8T L1
ENSG00000060688 SNRNP40 -383672 sc-eQTL 5.47e-01 -0.0884 0.147 0.077 DC L1
ENSG00000121766 ZCCHC17 -383866 sc-eQTL 6.63e-01 0.0758 0.174 0.077 DC L1
ENSG00000134644 PUM1 -152875 sc-eQTL 5.69e-01 0.0776 0.136 0.077 DC L1
ENSG00000162511 LAPTM5 155342 sc-eQTL 4.13e-02 0.198 0.0962 0.077 DC L1
ENSG00000162517 PEF1 -731780 sc-eQTL 3.20e-01 0.157 0.157 0.077 DC L1
ENSG00000168528 SERINC2 -496449 sc-eQTL 2.19e-01 -0.197 0.16 0.077 DC L1
ENSG00000284543 LINC01226 -593110 sc-eQTL 2.00e-01 0.136 0.106 0.077 DC L1
ENSG00000287510 AL137857.1 181423 sc-eQTL 4.82e-01 -0.108 0.154 0.077 DC L1
ENSG00000060688 SNRNP40 -383672 sc-eQTL 8.27e-01 0.0251 0.114 0.075 Mono L1
ENSG00000121766 ZCCHC17 -383866 sc-eQTL 2.26e-01 0.171 0.141 0.075 Mono L1
ENSG00000134644 PUM1 -152875 sc-eQTL 4.42e-01 0.0699 0.0907 0.075 Mono L1
ENSG00000162511 LAPTM5 155342 sc-eQTL 1.41e-01 0.123 0.0831 0.075 Mono L1
ENSG00000162512 SDC3 4358 sc-eQTL 5.19e-06 -0.715 0.153 0.075 Mono L1
ENSG00000162517 PEF1 -731780 sc-eQTL 6.70e-01 -0.0481 0.113 0.075 Mono L1
ENSG00000168528 SERINC2 -496449 sc-eQTL 7.75e-01 0.0494 0.172 0.075 Mono L1
ENSG00000284543 LINC01226 -593110 sc-eQTL 7.37e-01 -0.051 0.152 0.075 Mono L1
ENSG00000287510 AL137857.1 181423 sc-eQTL 3.75e-01 -0.118 0.132 0.075 Mono L1
ENSG00000060688 SNRNP40 -383672 sc-eQTL 6.03e-02 -0.297 0.157 0.075 NK L1
ENSG00000121753 ADGRB2 -851777 sc-eQTL 7.54e-01 0.0428 0.136 0.075 NK L1
ENSG00000121766 ZCCHC17 -383866 sc-eQTL 8.16e-01 -0.0252 0.108 0.075 NK L1
ENSG00000134644 PUM1 -152875 sc-eQTL 2.25e-02 -0.258 0.112 0.075 NK L1
ENSG00000162511 LAPTM5 155342 sc-eQTL 6.12e-01 0.0665 0.131 0.075 NK L1
ENSG00000162517 PEF1 -731780 sc-eQTL 6.90e-01 -0.0381 0.0956 0.075 NK L1
ENSG00000186056 MATN1-AS1 194612 sc-eQTL 6.62e-01 0.0644 0.147 0.075 NK L1
ENSG00000287510 AL137857.1 181423 sc-eQTL 8.85e-01 -0.0196 0.136 0.075 NK L1
ENSG00000060688 SNRNP40 -383672 sc-eQTL 7.13e-01 0.0447 0.121 0.075 Other_T L1
ENSG00000121766 ZCCHC17 -383866 sc-eQTL 2.14e-02 -0.296 0.128 0.075 Other_T L1
ENSG00000134644 PUM1 -152875 sc-eQTL 6.87e-01 -0.047 0.116 0.075 Other_T L1
ENSG00000162511 LAPTM5 155342 sc-eQTL 3.18e-01 -0.0953 0.0952 0.075 Other_T L1
ENSG00000162517 PEF1 -731780 sc-eQTL 1.53e-01 0.182 0.127 0.075 Other_T L1
ENSG00000186056 MATN1-AS1 194612 sc-eQTL 8.68e-01 -0.0261 0.156 0.075 Other_T L1
ENSG00000287510 AL137857.1 181423 sc-eQTL 2.75e-01 0.178 0.162 0.075 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000060688 SNRNP40 -383672 sc-eQTL 1.42e-01 0.278 0.189 0.074 B_Activated L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -383866 sc-eQTL 3.01e-01 0.198 0.191 0.074 B_Activated L2
ENSG00000134644 PUM1 -152875 sc-eQTL 5.56e-01 -0.105 0.178 0.074 B_Activated L2
ENSG00000162510 MATN1 189531 sc-eQTL 6.70e-01 0.0664 0.155 0.074 B_Activated L2
ENSG00000162511 LAPTM5 155342 sc-eQTL 2.57e-01 -0.123 0.108 0.074 B_Activated L2
ENSG00000162517 PEF1 -731780 sc-eQTL 3.79e-01 -0.162 0.184 0.074 B_Activated L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 194612 sc-eQTL 5.12e-01 0.115 0.175 0.074 B_Activated L2
ENSG00000287510 AL137857.1 181423 sc-eQTL 5.90e-01 0.0836 0.155 0.074 B_Activated L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -383672 sc-eQTL 4.31e-01 0.141 0.179 0.075 B_Intermediate L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -383866 sc-eQTL 9.90e-02 -0.245 0.148 0.075 B_Intermediate L2
ENSG00000134644 PUM1 -152875 sc-eQTL 2.02e-01 0.179 0.14 0.075 B_Intermediate L2
ENSG00000162510 MATN1 189531 sc-eQTL 2.49e-01 0.169 0.146 0.075 B_Intermediate L2
ENSG00000162511 LAPTM5 155342 sc-eQTL 2.87e-01 -0.0956 0.0896 0.075 B_Intermediate L2
ENSG00000162517 PEF1 -731780 sc-eQTL 3.87e-01 -0.144 0.166 0.075 B_Intermediate L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 194612 sc-eQTL 7.40e-01 -0.0418 0.126 0.075 B_Intermediate L2
ENSG00000287510 AL137857.1 181423 sc-eQTL 9.97e-01 0.000582 0.141 0.075 B_Intermediate L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -383672 sc-eQTL 8.76e-01 -0.0271 0.174 0.075 B_Memory L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -383866 sc-eQTL 8.94e-01 0.0214 0.16 0.075 B_Memory L2
ENSG00000134644 PUM1 -152875 sc-eQTL 2.90e-01 0.148 0.139 0.075 B_Memory L2
ENSG00000162510 MATN1 189531 sc-eQTL 4.30e-01 -0.105 0.133 0.075 B_Memory L2
ENSG00000162511 LAPTM5 155342 sc-eQTL 4.16e-01 -0.0963 0.118 0.075 B_Memory L2
ENSG00000162517 PEF1 -731780 sc-eQTL 5.57e-02 0.301 0.157 0.075 B_Memory L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 194612 sc-eQTL 8.86e-01 -0.0194 0.135 0.075 B_Memory L2
ENSG00000287510 AL137857.1 181423 sc-eQTL 7.65e-01 0.0475 0.158 0.075 B_Memory L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -383672 sc-eQTL 7.54e-01 0.0508 0.162 0.075 B_Naive1 L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -383866 sc-eQTL 2.57e-01 -0.159 0.14 0.075 B_Naive1 L2
ENSG00000134644 PUM1 -152875 sc-eQTL 8.79e-01 -0.0188 0.123 0.075 B_Naive1 L2
ENSG00000162510 MATN1 189531 sc-eQTL 8.05e-01 0.0309 0.125 0.075 B_Naive1 L2
ENSG00000162511 LAPTM5 155342 sc-eQTL 4.23e-01 0.067 0.0836 0.075 B_Naive1 L2
ENSG00000162517 PEF1 -731780 sc-eQTL 5.54e-01 0.0875 0.147 0.075 B_Naive1 L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 194612 sc-eQTL 9.37e-01 -0.00869 0.11 0.075 B_Naive1 L2
ENSG00000287510 AL137857.1 181423 sc-eQTL 8.00e-01 -0.0345 0.136 0.075 B_Naive1 L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -383672 sc-eQTL 1.84e-01 0.225 0.169 0.075 B_Naive2 L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -383866 sc-eQTL 4.57e-01 -0.104 0.14 0.075 B_Naive2 L2
ENSG00000134644 PUM1 -152875 sc-eQTL 1.88e-01 -0.18 0.136 0.075 B_Naive2 L2
ENSG00000162510 MATN1 189531 sc-eQTL 4.20e-01 -0.106 0.131 0.075 B_Naive2 L2
ENSG00000162511 LAPTM5 155342 sc-eQTL 9.20e-01 0.00892 0.0892 0.075 B_Naive2 L2
ENSG00000162517 PEF1 -731780 sc-eQTL 6.76e-03 -0.436 0.16 0.075 B_Naive2 L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 194612 sc-eQTL 5.62e-01 -0.0754 0.13 0.075 B_Naive2 L2
ENSG00000287510 AL137857.1 181423 sc-eQTL 8.14e-01 -0.033 0.14 0.075 B_Naive2 L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -383672 sc-eQTL 6.43e-01 -0.0803 0.173 0.073 CD4_CTL L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -383866 sc-eQTL 3.59e-01 -0.156 0.17 0.073 CD4_CTL L2
ENSG00000134644 PUM1 -152875 sc-eQTL 6.07e-01 -0.0857 0.167 0.073 CD4_CTL L2
ENSG00000162511 LAPTM5 155342 sc-eQTL 2.86e-01 0.159 0.148 0.073 CD4_CTL L2
ENSG00000162517 PEF1 -731780 sc-eQTL 5.51e-01 0.0908 0.152 0.073 CD4_CTL L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 194612 sc-eQTL 2.52e-01 -0.186 0.162 0.073 CD4_CTL L2
ENSG00000287510 AL137857.1 181423 sc-eQTL 7.53e-01 -0.0451 0.143 0.073 CD4_CTL L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -383672 sc-eQTL 1.28e-01 -0.2 0.131 0.075 CD4_Naive L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -383866 sc-eQTL 4.48e-01 0.0885 0.116 0.075 CD4_Naive L2
ENSG00000134644 PUM1 -152875 sc-eQTL 3.05e-01 0.0955 0.0928 0.075 CD4_Naive L2
ENSG00000162511 LAPTM5 155342 sc-eQTL 6.51e-01 -0.0451 0.0997 0.075 CD4_Naive L2
ENSG00000162517 PEF1 -731780 sc-eQTL 5.64e-01 -0.0632 0.109 0.075 CD4_Naive L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 194612 sc-eQTL 9.54e-01 0.00581 0.101 0.075 CD4_Naive L2
ENSG00000287510 AL137857.1 181423 sc-eQTL 6.59e-01 -0.0513 0.116 0.075 CD4_Naive L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -383672 sc-eQTL 2.19e-01 -0.202 0.164 0.075 CD4_TCM L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -383866 sc-eQTL 1.01e-01 0.217 0.132 0.075 CD4_TCM L2
ENSG00000134644 PUM1 -152875 sc-eQTL 4.43e-01 0.0901 0.117 0.075 CD4_TCM L2
ENSG00000162511 LAPTM5 155342 sc-eQTL 4.95e-01 0.0665 0.0972 0.075 CD4_TCM L2
ENSG00000162517 PEF1 -731780 sc-eQTL 6.83e-01 0.0534 0.13 0.075 CD4_TCM L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 194612 sc-eQTL 7.32e-01 -0.0424 0.123 0.075 CD4_TCM L2
ENSG00000287510 AL137857.1 181423 sc-eQTL 6.07e-01 0.0708 0.137 0.075 CD4_TCM L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -383672 sc-eQTL 8.70e-02 0.28 0.163 0.075 CD4_TEM L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -383866 sc-eQTL 5.31e-01 -0.098 0.156 0.075 CD4_TEM L2
ENSG00000134644 PUM1 -152875 sc-eQTL 6.12e-01 0.0661 0.13 0.075 CD4_TEM L2
ENSG00000162511 LAPTM5 155342 sc-eQTL 8.47e-01 0.0253 0.132 0.075 CD4_TEM L2
ENSG00000162517 PEF1 -731780 sc-eQTL 7.23e-01 0.0522 0.147 0.075 CD4_TEM L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 194612 sc-eQTL 1.70e-01 -0.211 0.153 0.075 CD4_TEM L2
ENSG00000287510 AL137857.1 181423 sc-eQTL 1.32e-01 -0.228 0.151 0.075 CD4_TEM L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -383672 sc-eQTL 5.85e-03 -0.493 0.177 0.075 CD8_CTL L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -383866 sc-eQTL 8.57e-01 0.025 0.138 0.075 CD8_CTL L2
ENSG00000134644 PUM1 -152875 sc-eQTL 6.73e-01 0.0568 0.134 0.075 CD8_CTL L2
ENSG00000162511 LAPTM5 155342 sc-eQTL 4.00e-01 0.125 0.148 0.075 CD8_CTL L2
ENSG00000162517 PEF1 -731780 sc-eQTL 6.35e-01 -0.0615 0.129 0.075 CD8_CTL L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 194612 sc-eQTL 7.69e-01 -0.0459 0.156 0.075 CD8_CTL L2
ENSG00000287510 AL137857.1 181423 sc-eQTL 5.69e-01 0.0838 0.147 0.075 CD8_CTL L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -383672 sc-eQTL 8.04e-01 0.0413 0.166 0.075 CD8_Naive L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -383866 sc-eQTL 9.03e-01 -0.0174 0.143 0.075 CD8_Naive L2
ENSG00000134644 PUM1 -152875 sc-eQTL 8.01e-01 -0.0291 0.115 0.075 CD8_Naive L2
ENSG00000162511 LAPTM5 155342 sc-eQTL 7.27e-01 -0.0386 0.11 0.075 CD8_Naive L2
ENSG00000162517 PEF1 -731780 sc-eQTL 4.83e-01 -0.108 0.153 0.075 CD8_Naive L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 194612 sc-eQTL 6.81e-01 -0.0569 0.138 0.075 CD8_Naive L2
ENSG00000287510 AL137857.1 181423 sc-eQTL 7.18e-01 0.0543 0.15 0.075 CD8_Naive L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -383672 sc-eQTL 7.31e-01 -0.0688 0.2 0.069 CD8_TCM L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -383866 sc-eQTL 2.30e-01 0.219 0.182 0.069 CD8_TCM L2
ENSG00000134644 PUM1 -152875 sc-eQTL 1.35e-01 -0.257 0.171 0.069 CD8_TCM L2
ENSG00000162511 LAPTM5 155342 sc-eQTL 4.41e-01 -0.139 0.18 0.069 CD8_TCM L2
ENSG00000162517 PEF1 -731780 sc-eQTL 8.23e-02 0.319 0.183 0.069 CD8_TCM L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 194612 sc-eQTL 9.61e-01 0.00808 0.167 0.069 CD8_TCM L2
ENSG00000287510 AL137857.1 181423 sc-eQTL 8.23e-01 -0.0377 0.168 0.069 CD8_TCM L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -383672 sc-eQTL 3.57e-01 0.166 0.18 0.078 CD8_TEM L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -383866 sc-eQTL 3.74e-01 -0.154 0.173 0.078 CD8_TEM L2
ENSG00000134644 PUM1 -152875 sc-eQTL 5.85e-01 -0.0966 0.177 0.078 CD8_TEM L2
ENSG00000162511 LAPTM5 155342 sc-eQTL 3.01e-01 0.172 0.166 0.078 CD8_TEM L2
ENSG00000162517 PEF1 -731780 sc-eQTL 8.05e-02 -0.273 0.155 0.078 CD8_TEM L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 194612 sc-eQTL 7.67e-02 -0.305 0.171 0.078 CD8_TEM L2
ENSG00000287510 AL137857.1 181423 sc-eQTL 6.05e-03 -0.425 0.153 0.078 CD8_TEM L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -383672 sc-eQTL 8.66e-01 -0.03 0.178 0.074 MAIT L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -383866 sc-eQTL 2.25e-02 -0.358 0.156 0.074 MAIT L2
ENSG00000134644 PUM1 -152875 sc-eQTL 9.60e-01 0.00749 0.151 0.074 MAIT L2
ENSG00000162511 LAPTM5 155342 sc-eQTL 3.95e-01 -0.121 0.142 0.074 MAIT L2
ENSG00000162517 PEF1 -731780 sc-eQTL 6.90e-02 0.284 0.155 0.074 MAIT L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 194612 sc-eQTL 7.80e-01 0.0444 0.159 0.074 MAIT L2
ENSG00000287510 AL137857.1 181423 sc-eQTL 3.26e-01 0.161 0.163 0.074 MAIT L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -383672 sc-eQTL 3.97e-01 -0.151 0.178 0.076 NK_CD56bright L2
ENSG00000121753 ADGRB2 -851777 sc-eQTL 3.01e-01 0.144 0.139 0.076 NK_CD56bright L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -383866 sc-eQTL 5.63e-01 -0.087 0.15 0.076 NK_CD56bright L2
ENSG00000134644 PUM1 -152875 sc-eQTL 7.31e-01 -0.0545 0.158 0.076 NK_CD56bright L2
ENSG00000162511 LAPTM5 155342 sc-eQTL 5.17e-01 -0.101 0.156 0.076 NK_CD56bright L2
ENSG00000162517 PEF1 -731780 sc-eQTL 1.02e-01 0.247 0.15 0.076 NK_CD56bright L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 194612 sc-eQTL 7.88e-01 0.0422 0.157 0.076 NK_CD56bright L2
ENSG00000287510 AL137857.1 181423 sc-eQTL 2.32e-01 -0.184 0.154 0.076 NK_CD56bright L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -383672 sc-eQTL 3.81e-01 -0.147 0.168 0.075 NK_CD56dim L2
ENSG00000121753 ADGRB2 -851777 sc-eQTL 9.20e-01 0.0149 0.148 0.075 NK_CD56dim L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -383866 sc-eQTL 6.52e-01 -0.056 0.124 0.075 NK_CD56dim L2
ENSG00000134644 PUM1 -152875 sc-eQTL 2.87e-02 -0.277 0.126 0.075 NK_CD56dim L2
ENSG00000162511 LAPTM5 155342 sc-eQTL 9.37e-01 0.0107 0.136 0.075 NK_CD56dim L2
ENSG00000162517 PEF1 -731780 sc-eQTL 7.15e-02 -0.217 0.12 0.075 NK_CD56dim L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 194612 sc-eQTL 9.36e-01 0.0137 0.17 0.075 NK_CD56dim L2
ENSG00000287510 AL137857.1 181423 sc-eQTL 9.50e-01 0.00884 0.14 0.075 NK_CD56dim L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -383672 sc-eQTL 1.73e-01 0.244 0.179 0.073 NK_HLA L2
ENSG00000121753 ADGRB2 -851777 sc-eQTL 8.49e-01 0.0271 0.142 0.073 NK_HLA L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -383866 sc-eQTL 2.23e-01 0.195 0.16 0.073 NK_HLA L2
ENSG00000134644 PUM1 -152875 sc-eQTL 2.76e-01 -0.17 0.156 0.073 NK_HLA L2
ENSG00000162511 LAPTM5 155342 sc-eQTL 3.15e-01 0.15 0.149 0.073 NK_HLA L2
ENSG00000162517 PEF1 -731780 sc-eQTL 9.68e-01 -0.00673 0.168 0.073 NK_HLA L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 194612 sc-eQTL 1.46e-01 -0.23 0.158 0.073 NK_HLA L2
ENSG00000287510 AL137857.1 181423 sc-eQTL 9.26e-01 0.0143 0.153 0.073 NK_HLA L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -383672 sc-eQTL 3.46e-02 -0.346 0.163 0.075 NK_cytokine L2
ENSG00000121753 ADGRB2 -851777 sc-eQTL 4.12e-01 0.122 0.148 0.075 NK_cytokine L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -383866 sc-eQTL 4.72e-01 -0.0923 0.128 0.075 NK_cytokine L2
ENSG00000134644 PUM1 -152875 sc-eQTL 6.15e-01 -0.0698 0.139 0.075 NK_cytokine L2
ENSG00000162511 LAPTM5 155342 sc-eQTL 6.57e-01 0.0678 0.153 0.075 NK_cytokine L2
ENSG00000162517 PEF1 -731780 sc-eQTL 3.51e-01 0.121 0.13 0.075 NK_cytokine L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 194612 sc-eQTL 4.04e-01 0.135 0.162 0.075 NK_cytokine L2
ENSG00000287510 AL137857.1 181423 sc-eQTL 2.65e-01 -0.168 0.15 0.075 NK_cytokine L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -383672 sc-eQTL 9.49e-01 0.0111 0.173 0.089 PB L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -383866 sc-eQTL 7.39e-01 -0.0669 0.2 0.089 PB L2
ENSG00000134644 PUM1 -152875 sc-eQTL 3.33e-01 -0.168 0.173 0.089 PB L2
ENSG00000162510 MATN1 189531 sc-eQTL 4.27e-01 -0.129 0.162 0.089 PB L2
ENSG00000162511 LAPTM5 155342 sc-eQTL 1.01e-01 0.189 0.114 0.089 PB L2
ENSG00000162517 PEF1 -731780 sc-eQTL 1.36e-01 -0.265 0.177 0.089 PB L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 194612 sc-eQTL 6.48e-01 -0.0724 0.158 0.089 PB L2
ENSG00000287510 AL137857.1 181423 sc-eQTL 1.08e-01 -0.27 0.167 0.089 PB L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -383672 sc-eQTL 9.44e-01 0.00936 0.134 0.072 Pro_T L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -383866 sc-eQTL 9.43e-01 0.0121 0.17 0.072 Pro_T L2
ENSG00000134644 PUM1 -152875 sc-eQTL 7.18e-01 -0.0574 0.159 0.072 Pro_T L2
ENSG00000162511 LAPTM5 155342 sc-eQTL 7.30e-01 0.0395 0.114 0.072 Pro_T L2
ENSG00000162517 PEF1 -731780 sc-eQTL 6.71e-01 -0.0711 0.167 0.072 Pro_T L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 194612 sc-eQTL 8.31e-01 -0.0341 0.159 0.072 Pro_T L2
ENSG00000287510 AL137857.1 181423 sc-eQTL 4.78e-01 0.104 0.146 0.072 Pro_T L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -383672 sc-eQTL 4.13e-01 -0.139 0.17 0.075 Treg L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -383866 sc-eQTL 3.57e-01 -0.151 0.164 0.075 Treg L2
ENSG00000134644 PUM1 -152875 sc-eQTL 1.44e-01 -0.192 0.131 0.075 Treg L2
ENSG00000162511 LAPTM5 155342 sc-eQTL 3.35e-01 -0.145 0.15 0.075 Treg L2
ENSG00000162517 PEF1 -731780 sc-eQTL 3.24e-01 0.16 0.162 0.075 Treg L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 194612 sc-eQTL 7.19e-01 0.0552 0.153 0.075 Treg L2
ENSG00000287510 AL137857.1 181423 sc-eQTL 8.91e-02 -0.26 0.152 0.075 Treg L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -383672 sc-eQTL 1.97e-01 -0.216 0.167 0.078 cDC L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -383866 sc-eQTL 6.41e-01 0.0849 0.182 0.078 cDC L2
ENSG00000134644 PUM1 -152875 sc-eQTL 5.49e-01 -0.0938 0.156 0.078 cDC L2
ENSG00000162511 LAPTM5 155342 sc-eQTL 9.37e-01 -0.00863 0.11 0.078 cDC L2
ENSG00000162517 PEF1 -731780 sc-eQTL 5.30e-01 -0.0998 0.158 0.078 cDC L2
ENSG00000168528 SERINC2 -496449 sc-eQTL 3.13e-01 -0.142 0.14 0.078 cDC L2
ENSG00000284543 LINC01226 -593110 sc-eQTL 7.89e-01 -0.037 0.138 0.078 cDC L2
ENSG00000287510 AL137857.1 181423 sc-eQTL 8.60e-01 -0.0262 0.149 0.078 cDC L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -383672 sc-eQTL 8.54e-01 -0.0252 0.137 0.075 cMono_IL1B L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -383866 sc-eQTL 5.01e-01 0.103 0.153 0.075 cMono_IL1B L2
ENSG00000134644 PUM1 -152875 sc-eQTL 1.53e-01 0.148 0.103 0.075 cMono_IL1B L2
ENSG00000162511 LAPTM5 155342 sc-eQTL 9.25e-02 0.152 0.0902 0.075 cMono_IL1B L2
ENSG00000162512 SDC3 4358 sc-eQTL 4.21e-04 -0.595 0.166 0.075 cMono_IL1B L2
ENSG00000162517 PEF1 -731780 sc-eQTL 1.72e-02 -0.331 0.138 0.075 cMono_IL1B L2
ENSG00000168528 SERINC2 -496449 sc-eQTL 7.32e-01 0.0593 0.173 0.075 cMono_IL1B L2
ENSG00000284543 LINC01226 -593110 sc-eQTL 6.62e-01 -0.067 0.153 0.075 cMono_IL1B L2
ENSG00000287510 AL137857.1 181423 sc-eQTL 3.86e-01 -0.124 0.143 0.075 cMono_IL1B L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -383672 sc-eQTL 4.94e-01 0.0981 0.143 0.075 cMono_S100A L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -383866 sc-eQTL 6.45e-01 0.0782 0.169 0.075 cMono_S100A L2
ENSG00000134644 PUM1 -152875 sc-eQTL 3.80e-01 -0.107 0.122 0.075 cMono_S100A L2
ENSG00000162511 LAPTM5 155342 sc-eQTL 8.84e-01 0.0137 0.0941 0.075 cMono_S100A L2
ENSG00000162512 SDC3 4358 sc-eQTL 7.94e-03 -0.428 0.16 0.075 cMono_S100A L2
ENSG00000162517 PEF1 -731780 sc-eQTL 4.79e-01 0.104 0.147 0.075 cMono_S100A L2
ENSG00000168528 SERINC2 -496449 sc-eQTL 8.99e-01 0.0218 0.172 0.075 cMono_S100A L2
ENSG00000284543 LINC01226 -593110 sc-eQTL 3.70e-01 -0.125 0.139 0.075 cMono_S100A L2
ENSG00000287510 AL137857.1 181423 sc-eQTL 6.64e-01 -0.061 0.14 0.075 cMono_S100A L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -383672 sc-eQTL 1.18e-01 0.354 0.226 0.067 gdT L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -383866 sc-eQTL 4.67e-01 -0.142 0.195 0.067 gdT L2
ENSG00000134644 PUM1 -152875 sc-eQTL 3.51e-01 -0.188 0.201 0.067 gdT L2
ENSG00000162511 LAPTM5 155342 sc-eQTL 9.01e-01 0.0273 0.219 0.067 gdT L2
ENSG00000162517 PEF1 -731780 sc-eQTL 8.87e-01 -0.0285 0.2 0.067 gdT L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 194612 sc-eQTL 2.65e-01 -0.225 0.201 0.067 gdT L2
ENSG00000287510 AL137857.1 181423 sc-eQTL 7.08e-01 0.0735 0.196 0.067 gdT L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -383672 sc-eQTL 4.16e-01 -0.129 0.158 0.076 intMono L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -383866 sc-eQTL 2.46e-01 0.197 0.169 0.076 intMono L2
ENSG00000134644 PUM1 -152875 sc-eQTL 6.05e-01 -0.0747 0.144 0.076 intMono L2
ENSG00000162511 LAPTM5 155342 sc-eQTL 3.39e-03 0.329 0.111 0.076 intMono L2
ENSG00000162512 SDC3 4358 sc-eQTL 1.01e-02 -0.396 0.152 0.076 intMono L2
ENSG00000162517 PEF1 -731780 sc-eQTL 2.55e-01 0.185 0.162 0.076 intMono L2
ENSG00000168528 SERINC2 -496449 sc-eQTL 2.58e-01 -0.183 0.162 0.076 intMono L2
ENSG00000284543 LINC01226 -593110 sc-eQTL 6.81e-01 0.0633 0.154 0.076 intMono L2
ENSG00000287510 AL137857.1 181423 sc-eQTL 9.88e-01 -0.00229 0.154 0.076 intMono L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -383672 sc-eQTL 8.56e-01 0.0272 0.15 0.072 ncMono L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -383866 sc-eQTL 3.21e-01 0.159 0.159 0.072 ncMono L2
ENSG00000134644 PUM1 -152875 sc-eQTL 6.47e-01 0.0599 0.13 0.072 ncMono L2
ENSG00000162511 LAPTM5 155342 sc-eQTL 1.54e-02 0.285 0.117 0.072 ncMono L2
ENSG00000162512 SDC3 4358 sc-eQTL 1.61e-02 -0.318 0.131 0.072 ncMono L2
ENSG00000162517 PEF1 -731780 sc-eQTL 9.47e-01 -0.0102 0.152 0.072 ncMono L2
ENSG00000168528 SERINC2 -496449 sc-eQTL 5.49e-01 -0.087 0.145 0.072 ncMono L2
ENSG00000284543 LINC01226 -593110 sc-eQTL 9.10e-01 0.0165 0.145 0.072 ncMono L2
ENSG00000287510 AL137857.1 181423 sc-eQTL 2.58e-01 -0.17 0.15 0.072 ncMono L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -383672 sc-eQTL 9.26e-01 0.0151 0.162 0.082 pDC L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -383866 sc-eQTL 9.89e-01 0.00255 0.178 0.082 pDC L2
ENSG00000134644 PUM1 -152875 sc-eQTL 2.14e-01 0.183 0.147 0.082 pDC L2
ENSG00000162511 LAPTM5 155342 sc-eQTL 3.02e-04 0.486 0.131 0.082 pDC L2
ENSG00000162517 PEF1 -731780 sc-eQTL 4.09e-01 0.147 0.177 0.082 pDC L2
ENSG00000168528 SERINC2 -496449 sc-eQTL 9.31e-01 -0.0144 0.166 0.082 pDC L2
ENSG00000284543 LINC01226 -593110 sc-eQTL 4.12e-01 0.106 0.129 0.082 pDC L2
ENSG00000287510 AL137857.1 181423 sc-eQTL 2.57e-01 -0.172 0.151 0.082 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000060688 SNRNP40 -383672 sc-eQTL 4.48e-01 0.13 0.171 0.075 B_Memory LOneK1K
ENSG00000121766 ZCCHC17 -383866 sc-eQTL 4.59e-01 -0.106 0.143 0.075 B_Memory LOneK1K
ENSG00000134644 PUM1 -152875 sc-eQTL 3.00e-01 0.131 0.126 0.075 B_Memory LOneK1K
ENSG00000162510 MATN1 189531 sc-eQTL 1.09e-01 0.231 0.143 0.075 B_Memory LOneK1K
ENSG00000162511 LAPTM5 155342 sc-eQTL 1.20e-01 -0.141 0.0901 0.075 B_Memory LOneK1K
ENSG00000162517 PEF1 -731780 sc-eQTL 5.71e-01 0.085 0.15 0.075 B_Memory LOneK1K
ENSG00000186056 MATN1-AS1 194612 sc-eQTL 7.52e-01 -0.0379 0.12 0.075 B_Memory LOneK1K
ENSG00000287510 AL137857.1 181423 sc-eQTL 8.51e-01 0.0245 0.131 0.075 B_Memory LOneK1K
ENSG00000060688 SNRNP40 -383672 sc-eQTL 3.44e-01 0.148 0.156 0.075 B_Naive LOneK1K
ENSG00000121766 ZCCHC17 -383866 sc-eQTL 8.92e-02 -0.21 0.123 0.075 B_Naive LOneK1K
ENSG00000134644 PUM1 -152875 sc-eQTL 3.22e-01 -0.116 0.117 0.075 B_Naive LOneK1K
ENSG00000162510 MATN1 189531 sc-eQTL 8.24e-01 -0.025 0.113 0.075 B_Naive LOneK1K
ENSG00000162511 LAPTM5 155342 sc-eQTL 5.62e-01 0.046 0.0792 0.075 B_Naive LOneK1K
ENSG00000162517 PEF1 -731780 sc-eQTL 6.47e-01 -0.0663 0.145 0.075 B_Naive LOneK1K
ENSG00000186056 MATN1-AS1 194612 sc-eQTL 7.49e-01 -0.0328 0.102 0.075 B_Naive LOneK1K
ENSG00000287510 AL137857.1 181423 sc-eQTL 8.98e-01 0.0156 0.122 0.075 B_Naive LOneK1K
ENSG00000060688 SNRNP40 -383672 sc-eQTL 6.03e-01 0.0678 0.13 0.075 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000121766 ZCCHC17 -383866 sc-eQTL 5.37e-01 0.0912 0.147 0.075 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000134644 PUM1 -152875 sc-eQTL 5.51e-01 0.0562 0.094 0.075 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000162511 LAPTM5 155342 sc-eQTL 4.15e-01 0.0675 0.0826 0.075 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000162512 SDC3 4358 sc-eQTL 1.59e-05 -0.713 0.161 0.075 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000162517 PEF1 -731780 sc-eQTL 3.80e-01 -0.104 0.118 0.075 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000168528 SERINC2 -496449 sc-eQTL 7.51e-01 0.0552 0.174 0.075 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000284543 LINC01226 -593110 sc-eQTL 4.67e-01 -0.104 0.142 0.075 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000287510 AL137857.1 181423 sc-eQTL 2.55e-01 -0.152 0.133 0.075 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000060688 SNRNP40 -383672 sc-eQTL 8.37e-01 -0.0291 0.141 0.075 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000121766 ZCCHC17 -383866 sc-eQTL 1.20e-01 0.24 0.154 0.075 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000134644 PUM1 -152875 sc-eQTL 8.98e-01 0.0163 0.127 0.075 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000162511 LAPTM5 155342 sc-eQTL 4.19e-03 0.288 0.0995 0.075 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000162512 SDC3 4358 sc-eQTL 1.03e-02 -0.378 0.146 0.075 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000162517 PEF1 -731780 sc-eQTL 9.57e-01 0.0073 0.135 0.075 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000168528 SERINC2 -496449 sc-eQTL 3.34e-01 -0.148 0.153 0.075 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000284543 LINC01226 -593110 sc-eQTL 7.06e-01 0.0552 0.146 0.075 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000287510 AL137857.1 181423 sc-eQTL 7.70e-01 -0.0427 0.146 0.075 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000060688 SNRNP40 -383672 sc-eQTL 1.16e-01 -0.251 0.159 0.075 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000121753 ADGRB2 -851777 sc-eQTL 8.87e-01 0.0193 0.136 0.075 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000121766 ZCCHC17 -383866 sc-eQTL 9.49e-01 -0.00693 0.109 0.075 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000134644 PUM1 -152875 sc-eQTL 5.11e-02 -0.232 0.118 0.075 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000162511 LAPTM5 155342 sc-eQTL 5.44e-01 0.0811 0.133 0.075 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000162517 PEF1 -731780 sc-eQTL 4.95e-01 -0.0694 0.101 0.075 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000186056 MATN1-AS1 194612 sc-eQTL 8.83e-01 0.0227 0.154 0.075 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000287510 AL137857.1 181423 sc-eQTL 7.21e-01 -0.0475 0.133 0.075 NK_CD56dim LOneK1K

Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF
ENSG00000142910 TINAGL1 -663369 pQTL 0.042 0.0696 0.0342 0.0 0.0 0.0542
ENSG00000162510 MATN1 189531 eQTL 0.0362 -0.0915 0.0436 0.0 0.0 0.054
ENSG00000162512 SDC3 4358 eQTL 4.54e-16 -0.437 0.0529 0.0852 0.0835 0.054
ENSG00000162517 PEF1 -731780 eQTL 0.038 0.0686 0.033 0.0 0.0 0.054

Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina
ENSG00000162512 SDC3 4358 5.89e-05 4.06e-05 5.99e-06 1.55e-05 5.25e-06 1.77e-05 5.2e-05 4.07e-06 3.43e-05 1.33e-05 4.41e-05 1.72e-05 5.71e-05 1.61e-05 6.2e-06 1.84e-05 1.98e-05 2.69e-05 7.46e-06 6.05e-06 1.52e-05 3.3e-05 3.65e-05 7.77e-06 4.2e-05 7.23e-06 1.44e-05 1.22e-05 3.72e-05 2.73e-05 1.98e-05 1.65e-06 2.24e-06 6.27e-06 1.23e-05 5.16e-06 2.76e-06 2.88e-06 3.99e-06 3.08e-06 1.64e-06 4.84e-05 4.99e-06 2.36e-07 2.27e-06 3.36e-06 3.77e-06 1.44e-06 1.53e-06