logo

Genes within 1Mb (chr1:30906454:C:T):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD

Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000060688 SNRNP40 -390334 sc-eQTL 5.60e-01 -0.0508 0.087 0.224 B L1
ENSG00000121766 ZCCHC17 -390528 sc-eQTL 6.91e-01 -0.0277 0.0697 0.224 B L1
ENSG00000134644 PUM1 -159537 sc-eQTL 2.31e-01 0.07 0.0583 0.224 B L1
ENSG00000162510 MATN1 182869 sc-eQTL 9.93e-01 0.000528 0.0615 0.224 B L1
ENSG00000162511 LAPTM5 148680 sc-eQTL 7.51e-01 -0.0153 0.0482 0.224 B L1
ENSG00000162517 PEF1 -738442 sc-eQTL 8.92e-01 -0.00988 0.0727 0.224 B L1
ENSG00000186056 MATN1-AS1 187950 sc-eQTL 4.87e-01 -0.0393 0.0564 0.224 B L1
ENSG00000287510 AL137857.1 174761 sc-eQTL 9.27e-01 0.00612 0.0668 0.224 B L1
ENSG00000060688 SNRNP40 -390334 sc-eQTL 6.12e-02 0.142 0.0754 0.224 CD4T L1
ENSG00000121766 ZCCHC17 -390528 sc-eQTL 6.48e-01 -0.0271 0.0594 0.224 CD4T L1
ENSG00000134644 PUM1 -159537 sc-eQTL 2.75e-01 0.0578 0.0527 0.224 CD4T L1
ENSG00000162511 LAPTM5 148680 sc-eQTL 8.67e-01 -0.00983 0.0586 0.224 CD4T L1
ENSG00000162517 PEF1 -738442 sc-eQTL 6.78e-01 0.0254 0.0613 0.224 CD4T L1
ENSG00000186056 MATN1-AS1 187950 sc-eQTL 3.62e-02 -0.109 0.0519 0.224 CD4T L1
ENSG00000287510 AL137857.1 174761 sc-eQTL 8.73e-01 0.0101 0.0628 0.224 CD4T L1
ENSG00000060688 SNRNP40 -390334 sc-eQTL 7.52e-01 -0.0314 0.0994 0.224 CD8T L1
ENSG00000121766 ZCCHC17 -390528 sc-eQTL 3.89e-01 -0.057 0.066 0.224 CD8T L1
ENSG00000134644 PUM1 -159537 sc-eQTL 1.28e-02 0.144 0.0574 0.224 CD8T L1
ENSG00000162511 LAPTM5 148680 sc-eQTL 1.32e-01 0.0851 0.0563 0.224 CD8T L1
ENSG00000162517 PEF1 -738442 sc-eQTL 5.74e-01 0.0392 0.0696 0.224 CD8T L1
ENSG00000186056 MATN1-AS1 187950 sc-eQTL 1.51e-01 0.0951 0.066 0.224 CD8T L1
ENSG00000287510 AL137857.1 174761 sc-eQTL 9.24e-02 -0.14 0.0828 0.224 CD8T L1
ENSG00000060688 SNRNP40 -390334 sc-eQTL 7.64e-01 0.0268 0.0891 0.223 DC L1
ENSG00000121766 ZCCHC17 -390528 sc-eQTL 9.95e-01 -0.000704 0.106 0.223 DC L1
ENSG00000134644 PUM1 -159537 sc-eQTL 6.52e-01 0.0373 0.0826 0.223 DC L1
ENSG00000162511 LAPTM5 148680 sc-eQTL 5.58e-01 -0.0346 0.059 0.223 DC L1
ENSG00000162517 PEF1 -738442 sc-eQTL 6.41e-01 -0.0447 0.0957 0.223 DC L1
ENSG00000168528 SERINC2 -503111 sc-eQTL 3.84e-01 0.0847 0.0972 0.223 DC L1
ENSG00000284543 LINC01226 -599772 sc-eQTL 5.05e-01 0.043 0.0644 0.223 DC L1
ENSG00000287510 AL137857.1 174761 sc-eQTL 2.62e-01 0.105 0.0931 0.223 DC L1
ENSG00000060688 SNRNP40 -390334 sc-eQTL 4.69e-01 0.0501 0.069 0.224 Mono L1
ENSG00000121766 ZCCHC17 -390528 sc-eQTL 5.70e-01 -0.0487 0.0856 0.224 Mono L1
ENSG00000134644 PUM1 -159537 sc-eQTL 6.98e-01 -0.0214 0.0549 0.224 Mono L1
ENSG00000162511 LAPTM5 148680 sc-eQTL 3.79e-01 -0.0445 0.0504 0.224 Mono L1
ENSG00000162512 SDC3 -2304 sc-eQTL 4.34e-03 -0.275 0.0953 0.224 Mono L1
ENSG00000162517 PEF1 -738442 sc-eQTL 7.82e-01 0.0189 0.0681 0.224 Mono L1
ENSG00000168528 SERINC2 -503111 sc-eQTL 9.87e-01 -0.00172 0.104 0.224 Mono L1
ENSG00000284543 LINC01226 -599772 sc-eQTL 6.82e-01 0.0377 0.0918 0.224 Mono L1
ENSG00000287510 AL137857.1 174761 sc-eQTL 5.26e-01 0.0509 0.0802 0.224 Mono L1
ENSG00000060688 SNRNP40 -390334 sc-eQTL 8.18e-01 0.022 0.0956 0.223 NK L1
ENSG00000121753 ADGRB2 -858439 sc-eQTL 8.86e-01 -0.0118 0.0823 0.223 NK L1
ENSG00000121766 ZCCHC17 -390528 sc-eQTL 4.95e-03 -0.182 0.0642 0.223 NK L1
ENSG00000134644 PUM1 -159537 sc-eQTL 2.42e-01 0.0802 0.0684 0.223 NK L1
ENSG00000162511 LAPTM5 148680 sc-eQTL 1.40e-01 0.116 0.0786 0.223 NK L1
ENSG00000162517 PEF1 -738442 sc-eQTL 6.26e-01 -0.0282 0.0576 0.223 NK L1
ENSG00000186056 MATN1-AS1 187950 sc-eQTL 4.02e-01 0.0744 0.0886 0.223 NK L1
ENSG00000287510 AL137857.1 174761 sc-eQTL 7.02e-01 -0.0314 0.0819 0.223 NK L1
ENSG00000060688 SNRNP40 -390334 sc-eQTL 7.83e-01 -0.0198 0.072 0.224 Other_T L1
ENSG00000121766 ZCCHC17 -390528 sc-eQTL 7.73e-01 -0.0223 0.0769 0.224 Other_T L1
ENSG00000134644 PUM1 -159537 sc-eQTL 5.54e-02 0.132 0.0686 0.224 Other_T L1
ENSG00000162511 LAPTM5 148680 sc-eQTL 6.06e-01 0.0293 0.0567 0.224 Other_T L1
ENSG00000162517 PEF1 -738442 sc-eQTL 9.76e-01 -0.00224 0.0757 0.224 Other_T L1
ENSG00000186056 MATN1-AS1 187950 sc-eQTL 1.22e-01 -0.144 0.0923 0.224 Other_T L1
ENSG00000287510 AL137857.1 174761 sc-eQTL 2.21e-01 -0.118 0.0964 0.224 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000060688 SNRNP40 -390334 sc-eQTL 3.98e-01 0.0959 0.113 0.232 B_Activated L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -390528 sc-eQTL 8.27e-01 0.025 0.114 0.232 B_Activated L2
ENSG00000134644 PUM1 -159537 sc-eQTL 7.05e-01 0.0403 0.106 0.232 B_Activated L2
ENSG00000162510 MATN1 182869 sc-eQTL 9.60e-01 -0.00463 0.0929 0.232 B_Activated L2
ENSG00000162511 LAPTM5 148680 sc-eQTL 9.96e-01 -0.000365 0.0648 0.232 B_Activated L2
ENSG00000162517 PEF1 -738442 sc-eQTL 7.10e-01 -0.0411 0.11 0.232 B_Activated L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 187950 sc-eQTL 2.71e-01 -0.115 0.104 0.232 B_Activated L2
ENSG00000287510 AL137857.1 174761 sc-eQTL 2.29e-01 -0.111 0.0922 0.232 B_Activated L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -390334 sc-eQTL 1.67e-01 -0.149 0.107 0.225 B_Intermediate L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -390528 sc-eQTL 8.46e-01 -0.0175 0.09 0.225 B_Intermediate L2
ENSG00000134644 PUM1 -159537 sc-eQTL 9.49e-01 -0.00545 0.0849 0.225 B_Intermediate L2
ENSG00000162510 MATN1 182869 sc-eQTL 5.34e-01 -0.055 0.0882 0.225 B_Intermediate L2
ENSG00000162511 LAPTM5 148680 sc-eQTL 8.95e-01 -0.00719 0.0542 0.225 B_Intermediate L2
ENSG00000162517 PEF1 -738442 sc-eQTL 2.43e-01 -0.117 0.1 0.225 B_Intermediate L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 187950 sc-eQTL 8.71e-01 0.0124 0.0761 0.225 B_Intermediate L2
ENSG00000287510 AL137857.1 174761 sc-eQTL 7.44e-01 0.0278 0.0851 0.225 B_Intermediate L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -390334 sc-eQTL 9.21e-01 -0.0103 0.104 0.224 B_Memory L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -390528 sc-eQTL 7.38e-01 -0.0322 0.096 0.224 B_Memory L2
ENSG00000134644 PUM1 -159537 sc-eQTL 5.21e-01 -0.0537 0.0835 0.224 B_Memory L2
ENSG00000162510 MATN1 182869 sc-eQTL 6.03e-01 -0.0417 0.0799 0.224 B_Memory L2
ENSG00000162511 LAPTM5 148680 sc-eQTL 3.58e-01 0.0652 0.0708 0.224 B_Memory L2
ENSG00000162517 PEF1 -738442 sc-eQTL 5.21e-01 0.0609 0.0946 0.224 B_Memory L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 187950 sc-eQTL 7.83e-01 -0.0223 0.0811 0.224 B_Memory L2
ENSG00000287510 AL137857.1 174761 sc-eQTL 9.22e-01 0.00932 0.095 0.224 B_Memory L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -390334 sc-eQTL 4.03e-01 0.0801 0.0957 0.224 B_Naive1 L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -390528 sc-eQTL 7.34e-01 0.0282 0.0828 0.224 B_Naive1 L2
ENSG00000134644 PUM1 -159537 sc-eQTL 4.10e-01 0.0601 0.0729 0.224 B_Naive1 L2
ENSG00000162510 MATN1 182869 sc-eQTL 9.86e-01 0.00133 0.0741 0.224 B_Naive1 L2
ENSG00000162511 LAPTM5 148680 sc-eQTL 4.30e-01 -0.0391 0.0494 0.224 B_Naive1 L2
ENSG00000162517 PEF1 -738442 sc-eQTL 7.50e-01 0.0278 0.0872 0.224 B_Naive1 L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 187950 sc-eQTL 3.72e-01 -0.058 0.0649 0.224 B_Naive1 L2
ENSG00000287510 AL137857.1 174761 sc-eQTL 3.02e-01 -0.0828 0.0801 0.224 B_Naive1 L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -390334 sc-eQTL 7.41e-02 -0.182 0.101 0.225 B_Naive2 L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -390528 sc-eQTL 9.01e-01 -0.0105 0.0841 0.225 B_Naive2 L2
ENSG00000134644 PUM1 -159537 sc-eQTL 6.47e-02 0.152 0.0816 0.225 B_Naive2 L2
ENSG00000162510 MATN1 182869 sc-eQTL 8.35e-01 0.0165 0.079 0.225 B_Naive2 L2
ENSG00000162511 LAPTM5 148680 sc-eQTL 1.43e-01 -0.0786 0.0534 0.225 B_Naive2 L2
ENSG00000162517 PEF1 -738442 sc-eQTL 5.28e-01 -0.0616 0.0975 0.225 B_Naive2 L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 187950 sc-eQTL 5.89e-01 0.0422 0.0781 0.225 B_Naive2 L2
ENSG00000287510 AL137857.1 174761 sc-eQTL 3.22e-01 0.0836 0.0842 0.225 B_Naive2 L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -390334 sc-eQTL 8.70e-01 -0.0163 0.0993 0.227 CD4_CTL L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -390528 sc-eQTL 7.25e-01 0.0344 0.0976 0.227 CD4_CTL L2
ENSG00000134644 PUM1 -159537 sc-eQTL 9.43e-01 -0.00683 0.0957 0.227 CD4_CTL L2
ENSG00000162511 LAPTM5 148680 sc-eQTL 3.11e-01 -0.0864 0.0851 0.227 CD4_CTL L2
ENSG00000162517 PEF1 -738442 sc-eQTL 5.29e-01 0.0552 0.0874 0.227 CD4_CTL L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 187950 sc-eQTL 7.23e-01 -0.0332 0.0933 0.227 CD4_CTL L2
ENSG00000287510 AL137857.1 174761 sc-eQTL 9.69e-01 0.00321 0.0824 0.227 CD4_CTL L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -390334 sc-eQTL 3.19e-02 0.169 0.0784 0.224 CD4_Naive L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -390528 sc-eQTL 3.50e-01 -0.0657 0.0701 0.224 CD4_Naive L2
ENSG00000134644 PUM1 -159537 sc-eQTL 4.33e-01 0.044 0.056 0.224 CD4_Naive L2
ENSG00000162511 LAPTM5 148680 sc-eQTL 6.70e-01 -0.0257 0.0601 0.224 CD4_Naive L2
ENSG00000162517 PEF1 -738442 sc-eQTL 9.12e-01 0.00733 0.0659 0.224 CD4_Naive L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 187950 sc-eQTL 3.52e-03 -0.176 0.0598 0.224 CD4_Naive L2
ENSG00000287510 AL137857.1 174761 sc-eQTL 8.90e-01 -0.00966 0.0701 0.224 CD4_Naive L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -390334 sc-eQTL 6.06e-01 0.0515 0.0997 0.224 CD4_TCM L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -390528 sc-eQTL 4.76e-01 0.0573 0.0803 0.224 CD4_TCM L2
ENSG00000134644 PUM1 -159537 sc-eQTL 1.82e-01 0.0949 0.0709 0.224 CD4_TCM L2
ENSG00000162511 LAPTM5 148680 sc-eQTL 4.42e-01 0.0454 0.059 0.224 CD4_TCM L2
ENSG00000162517 PEF1 -738442 sc-eQTL 5.95e-01 0.0422 0.0791 0.224 CD4_TCM L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 187950 sc-eQTL 5.93e-01 0.0401 0.0749 0.224 CD4_TCM L2
ENSG00000287510 AL137857.1 174761 sc-eQTL 7.07e-01 0.0314 0.0834 0.224 CD4_TCM L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -390334 sc-eQTL 5.30e-01 0.0623 0.099 0.224 CD4_TEM L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -390528 sc-eQTL 3.93e-01 0.0807 0.0943 0.224 CD4_TEM L2
ENSG00000134644 PUM1 -159537 sc-eQTL 7.73e-01 0.0227 0.0787 0.224 CD4_TEM L2
ENSG00000162511 LAPTM5 148680 sc-eQTL 4.59e-01 0.059 0.0795 0.224 CD4_TEM L2
ENSG00000162517 PEF1 -738442 sc-eQTL 1.28e-01 0.135 0.0887 0.224 CD4_TEM L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 187950 sc-eQTL 5.49e-01 -0.0558 0.093 0.224 CD4_TEM L2
ENSG00000287510 AL137857.1 174761 sc-eQTL 8.48e-01 -0.0176 0.0917 0.224 CD4_TEM L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -390334 sc-eQTL 4.03e-01 0.0908 0.108 0.224 CD8_CTL L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -390528 sc-eQTL 6.28e-01 0.0404 0.0832 0.224 CD8_CTL L2
ENSG00000134644 PUM1 -159537 sc-eQTL 5.99e-02 0.152 0.0802 0.224 CD8_CTL L2
ENSG00000162511 LAPTM5 148680 sc-eQTL 8.20e-03 0.235 0.0881 0.224 CD8_CTL L2
ENSG00000162517 PEF1 -738442 sc-eQTL 2.95e-01 0.0817 0.0778 0.224 CD8_CTL L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 187950 sc-eQTL 9.29e-01 0.00834 0.0941 0.224 CD8_CTL L2
ENSG00000287510 AL137857.1 174761 sc-eQTL 9.12e-02 -0.149 0.0879 0.224 CD8_CTL L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -390334 sc-eQTL 5.36e-01 -0.0611 0.0986 0.224 CD8_Naive L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -390528 sc-eQTL 7.71e-01 -0.0248 0.0851 0.224 CD8_Naive L2
ENSG00000134644 PUM1 -159537 sc-eQTL 3.63e-01 0.0623 0.0684 0.224 CD8_Naive L2
ENSG00000162511 LAPTM5 148680 sc-eQTL 3.31e-01 0.0638 0.0655 0.224 CD8_Naive L2
ENSG00000162517 PEF1 -738442 sc-eQTL 6.54e-01 -0.041 0.0912 0.224 CD8_Naive L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 187950 sc-eQTL 5.98e-01 0.0432 0.0819 0.224 CD8_Naive L2
ENSG00000287510 AL137857.1 174761 sc-eQTL 7.76e-01 0.0254 0.0892 0.224 CD8_Naive L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -390334 sc-eQTL 4.94e-01 0.0763 0.111 0.222 CD8_TCM L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -390528 sc-eQTL 4.46e-02 -0.205 0.101 0.222 CD8_TCM L2
ENSG00000134644 PUM1 -159537 sc-eQTL 7.67e-03 0.254 0.0944 0.222 CD8_TCM L2
ENSG00000162511 LAPTM5 148680 sc-eQTL 9.78e-01 -0.00272 0.101 0.222 CD8_TCM L2
ENSG00000162517 PEF1 -738442 sc-eQTL 5.11e-01 0.0676 0.103 0.222 CD8_TCM L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 187950 sc-eQTL 1.47e-01 0.135 0.0926 0.222 CD8_TCM L2
ENSG00000287510 AL137857.1 174761 sc-eQTL 2.50e-01 0.108 0.0938 0.222 CD8_TCM L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -390334 sc-eQTL 7.93e-01 0.0274 0.104 0.219 CD8_TEM L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -390528 sc-eQTL 2.00e-01 -0.128 0.0994 0.219 CD8_TEM L2
ENSG00000134644 PUM1 -159537 sc-eQTL 3.39e-01 0.0976 0.102 0.219 CD8_TEM L2
ENSG00000162511 LAPTM5 148680 sc-eQTL 4.68e-01 0.0698 0.0959 0.219 CD8_TEM L2
ENSG00000162517 PEF1 -738442 sc-eQTL 2.14e-01 0.112 0.09 0.219 CD8_TEM L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 187950 sc-eQTL 3.04e-01 -0.102 0.0994 0.219 CD8_TEM L2
ENSG00000287510 AL137857.1 174761 sc-eQTL 6.91e-01 -0.0359 0.0901 0.219 CD8_TEM L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -390334 sc-eQTL 3.02e-01 -0.108 0.105 0.223 MAIT L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -390528 sc-eQTL 6.73e-01 -0.0392 0.0928 0.223 MAIT L2
ENSG00000134644 PUM1 -159537 sc-eQTL 9.73e-02 0.147 0.0885 0.223 MAIT L2
ENSG00000162511 LAPTM5 148680 sc-eQTL 7.46e-01 0.0272 0.084 0.223 MAIT L2
ENSG00000162517 PEF1 -738442 sc-eQTL 7.92e-01 -0.0243 0.0923 0.223 MAIT L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 187950 sc-eQTL 1.06e-01 -0.151 0.093 0.223 MAIT L2
ENSG00000287510 AL137857.1 174761 sc-eQTL 8.39e-01 -0.0196 0.0964 0.223 MAIT L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -390334 sc-eQTL 5.34e-01 0.0671 0.108 0.222 NK_CD56bright L2
ENSG00000121753 ADGRB2 -858439 sc-eQTL 1.60e-01 -0.118 0.084 0.222 NK_CD56bright L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -390528 sc-eQTL 3.56e-01 -0.0841 0.0909 0.222 NK_CD56bright L2
ENSG00000134644 PUM1 -159537 sc-eQTL 8.19e-01 0.0219 0.0956 0.222 NK_CD56bright L2
ENSG00000162511 LAPTM5 148680 sc-eQTL 2.01e-01 0.121 0.094 0.222 NK_CD56bright L2
ENSG00000162517 PEF1 -738442 sc-eQTL 7.31e-01 -0.0315 0.0916 0.222 NK_CD56bright L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 187950 sc-eQTL 9.23e-01 -0.00913 0.0948 0.222 NK_CD56bright L2
ENSG00000287510 AL137857.1 174761 sc-eQTL 6.91e-01 -0.0372 0.0934 0.222 NK_CD56bright L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -390334 sc-eQTL 3.52e-01 0.0939 0.101 0.224 NK_CD56dim L2
ENSG00000121753 ADGRB2 -858439 sc-eQTL 2.18e-01 0.109 0.0886 0.224 NK_CD56dim L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -390528 sc-eQTL 2.93e-02 -0.162 0.0739 0.224 NK_CD56dim L2
ENSG00000134644 PUM1 -159537 sc-eQTL 2.39e-01 0.0903 0.0764 0.224 NK_CD56dim L2
ENSG00000162511 LAPTM5 148680 sc-eQTL 1.79e-01 0.11 0.0814 0.224 NK_CD56dim L2
ENSG00000162517 PEF1 -738442 sc-eQTL 4.87e-01 0.0506 0.0726 0.224 NK_CD56dim L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 187950 sc-eQTL 4.16e-01 0.0833 0.102 0.224 NK_CD56dim L2
ENSG00000287510 AL137857.1 174761 sc-eQTL 8.68e-01 -0.014 0.0845 0.224 NK_CD56dim L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -390334 sc-eQTL 8.10e-01 -0.0264 0.11 0.221 NK_HLA L2
ENSG00000121753 ADGRB2 -858439 sc-eQTL 7.47e-01 0.0281 0.0873 0.221 NK_HLA L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -390528 sc-eQTL 9.59e-01 -0.00502 0.0981 0.221 NK_HLA L2
ENSG00000134644 PUM1 -159537 sc-eQTL 5.01e-01 0.0644 0.0955 0.221 NK_HLA L2
ENSG00000162511 LAPTM5 148680 sc-eQTL 4.80e-01 0.0646 0.0912 0.221 NK_HLA L2
ENSG00000162517 PEF1 -738442 sc-eQTL 7.79e-02 -0.181 0.102 0.221 NK_HLA L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 187950 sc-eQTL 6.02e-01 0.0507 0.097 0.221 NK_HLA L2
ENSG00000287510 AL137857.1 174761 sc-eQTL 6.80e-01 0.0388 0.0939 0.221 NK_HLA L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -390334 sc-eQTL 6.65e-01 -0.043 0.0993 0.224 NK_cytokine L2
ENSG00000121753 ADGRB2 -858439 sc-eQTL 1.52e-01 -0.128 0.0893 0.224 NK_cytokine L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -390528 sc-eQTL 1.80e-01 -0.104 0.0772 0.224 NK_cytokine L2
ENSG00000134644 PUM1 -159537 sc-eQTL 8.87e-01 0.0119 0.0838 0.224 NK_cytokine L2
ENSG00000162511 LAPTM5 148680 sc-eQTL 2.98e-02 0.2 0.0912 0.224 NK_cytokine L2
ENSG00000162517 PEF1 -738442 sc-eQTL 6.93e-01 -0.0311 0.0786 0.224 NK_cytokine L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 187950 sc-eQTL 7.85e-01 0.0267 0.0978 0.224 NK_cytokine L2
ENSG00000287510 AL137857.1 174761 sc-eQTL 4.81e-02 0.179 0.0901 0.224 NK_cytokine L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -390334 sc-eQTL 6.17e-01 0.0645 0.128 0.196 PB L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -390528 sc-eQTL 5.55e-01 0.0881 0.149 0.196 PB L2
ENSG00000134644 PUM1 -159537 sc-eQTL 2.06e-02 0.297 0.126 0.196 PB L2
ENSG00000162510 MATN1 182869 sc-eQTL 9.46e-01 -0.00825 0.121 0.196 PB L2
ENSG00000162511 LAPTM5 148680 sc-eQTL 7.12e-01 -0.0319 0.0862 0.196 PB L2
ENSG00000162517 PEF1 -738442 sc-eQTL 9.43e-01 0.00959 0.133 0.196 PB L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 187950 sc-eQTL 9.05e-01 0.0141 0.118 0.196 PB L2
ENSG00000287510 AL137857.1 174761 sc-eQTL 1.30e-01 -0.19 0.124 0.196 PB L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -390334 sc-eQTL 1.64e-01 -0.109 0.078 0.226 Pro_T L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -390528 sc-eQTL 2.65e-02 -0.22 0.0983 0.226 Pro_T L2
ENSG00000134644 PUM1 -159537 sc-eQTL 3.22e-01 0.0919 0.0926 0.226 Pro_T L2
ENSG00000162511 LAPTM5 148680 sc-eQTL 8.24e-01 -0.0148 0.0666 0.226 Pro_T L2
ENSG00000162517 PEF1 -738442 sc-eQTL 6.71e-02 -0.178 0.0969 0.226 Pro_T L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 187950 sc-eQTL 4.81e-01 -0.0656 0.0929 0.226 Pro_T L2
ENSG00000287510 AL137857.1 174761 sc-eQTL 1.10e-01 -0.136 0.085 0.226 Pro_T L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -390334 sc-eQTL 6.69e-01 -0.0435 0.102 0.224 Treg L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -390528 sc-eQTL 3.81e-01 0.0861 0.0981 0.224 Treg L2
ENSG00000134644 PUM1 -159537 sc-eQTL 8.54e-01 -0.0145 0.0786 0.224 Treg L2
ENSG00000162511 LAPTM5 148680 sc-eQTL 3.75e-01 0.08 0.0899 0.224 Treg L2
ENSG00000162517 PEF1 -738442 sc-eQTL 4.87e-01 -0.0677 0.0972 0.224 Treg L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 187950 sc-eQTL 6.34e-01 0.0438 0.0917 0.224 Treg L2
ENSG00000287510 AL137857.1 174761 sc-eQTL 7.59e-01 0.0281 0.0916 0.224 Treg L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -390334 sc-eQTL 5.99e-01 0.0529 0.101 0.237 cDC L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -390528 sc-eQTL 2.02e-01 -0.139 0.108 0.237 cDC L2
ENSG00000134644 PUM1 -159537 sc-eQTL 3.32e-01 0.0907 0.0934 0.237 cDC L2
ENSG00000162511 LAPTM5 148680 sc-eQTL 2.92e-01 -0.069 0.0654 0.237 cDC L2
ENSG00000162517 PEF1 -738442 sc-eQTL 3.62e-01 0.0866 0.0948 0.237 cDC L2
ENSG00000168528 SERINC2 -503111 sc-eQTL 5.47e-01 -0.0508 0.0841 0.237 cDC L2
ENSG00000284543 LINC01226 -599772 sc-eQTL 3.28e-01 -0.0809 0.0825 0.237 cDC L2
ENSG00000287510 AL137857.1 174761 sc-eQTL 3.44e-01 0.0843 0.0889 0.237 cDC L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -390334 sc-eQTL 2.98e-01 -0.0863 0.0827 0.224 cMono_IL1B L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -390528 sc-eQTL 9.47e-01 0.00611 0.0925 0.224 cMono_IL1B L2
ENSG00000134644 PUM1 -159537 sc-eQTL 2.67e-01 -0.0695 0.0624 0.224 cMono_IL1B L2
ENSG00000162511 LAPTM5 148680 sc-eQTL 9.13e-01 0.006 0.0549 0.224 cMono_IL1B L2
ENSG00000162512 SDC3 -2304 sc-eQTL 2.04e-01 -0.131 0.103 0.224 cMono_IL1B L2
ENSG00000162517 PEF1 -738442 sc-eQTL 6.09e-01 0.0433 0.0845 0.224 cMono_IL1B L2
ENSG00000168528 SERINC2 -503111 sc-eQTL 9.39e-01 -0.00806 0.105 0.224 cMono_IL1B L2
ENSG00000284543 LINC01226 -599772 sc-eQTL 3.03e-01 0.0954 0.0923 0.224 cMono_IL1B L2
ENSG00000287510 AL137857.1 174761 sc-eQTL 5.82e-01 0.0476 0.0863 0.224 cMono_IL1B L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -390334 sc-eQTL 1.38e-01 0.129 0.0869 0.224 cMono_S100A L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -390528 sc-eQTL 8.53e-01 0.0191 0.103 0.224 cMono_S100A L2
ENSG00000134644 PUM1 -159537 sc-eQTL 9.08e-01 0.00859 0.0746 0.224 cMono_S100A L2
ENSG00000162511 LAPTM5 148680 sc-eQTL 3.65e-01 -0.052 0.0572 0.224 cMono_S100A L2
ENSG00000162512 SDC3 -2304 sc-eQTL 1.07e-01 -0.159 0.0984 0.224 cMono_S100A L2
ENSG00000162517 PEF1 -738442 sc-eQTL 2.39e-01 -0.105 0.0891 0.224 cMono_S100A L2
ENSG00000168528 SERINC2 -503111 sc-eQTL 9.74e-01 0.00345 0.105 0.224 cMono_S100A L2
ENSG00000284543 LINC01226 -599772 sc-eQTL 7.03e-01 -0.0325 0.0851 0.224 cMono_S100A L2
ENSG00000287510 AL137857.1 174761 sc-eQTL 4.58e-01 -0.0635 0.0854 0.224 cMono_S100A L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -390334 sc-eQTL 9.78e-01 0.00352 0.127 0.221 gdT L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -390528 sc-eQTL 2.41e-01 0.128 0.108 0.221 gdT L2
ENSG00000134644 PUM1 -159537 sc-eQTL 9.71e-01 -0.00414 0.112 0.221 gdT L2
ENSG00000162511 LAPTM5 148680 sc-eQTL 5.15e-01 0.0795 0.122 0.221 gdT L2
ENSG00000162517 PEF1 -738442 sc-eQTL 1.19e-01 0.174 0.111 0.221 gdT L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 187950 sc-eQTL 2.04e-01 -0.143 0.112 0.221 gdT L2
ENSG00000287510 AL137857.1 174761 sc-eQTL 3.99e-01 -0.092 0.109 0.221 gdT L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -390334 sc-eQTL 4.25e-01 0.0776 0.097 0.224 intMono L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -390528 sc-eQTL 7.96e-01 -0.0271 0.104 0.224 intMono L2
ENSG00000134644 PUM1 -159537 sc-eQTL 9.48e-04 0.289 0.0862 0.224 intMono L2
ENSG00000162511 LAPTM5 148680 sc-eQTL 3.30e-01 -0.0677 0.0694 0.224 intMono L2
ENSG00000162512 SDC3 -2304 sc-eQTL 5.01e-02 -0.186 0.0943 0.224 intMono L2
ENSG00000162517 PEF1 -738442 sc-eQTL 6.00e-01 0.0526 0.1 0.224 intMono L2
ENSG00000168528 SERINC2 -503111 sc-eQTL 7.44e-01 -0.0326 0.0996 0.224 intMono L2
ENSG00000284543 LINC01226 -599772 sc-eQTL 6.71e-01 -0.0401 0.0944 0.224 intMono L2
ENSG00000287510 AL137857.1 174761 sc-eQTL 2.65e-01 0.105 0.0942 0.224 intMono L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -390334 sc-eQTL 4.77e-01 0.065 0.0912 0.224 ncMono L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -390528 sc-eQTL 8.62e-01 -0.0169 0.0974 0.224 ncMono L2
ENSG00000134644 PUM1 -159537 sc-eQTL 2.31e-01 -0.0953 0.0793 0.224 ncMono L2
ENSG00000162511 LAPTM5 148680 sc-eQTL 2.79e-01 0.0782 0.0721 0.224 ncMono L2
ENSG00000162512 SDC3 -2304 sc-eQTL 1.93e-02 -0.189 0.0799 0.224 ncMono L2
ENSG00000162517 PEF1 -738442 sc-eQTL 7.02e-01 0.0356 0.0929 0.224 ncMono L2
ENSG00000168528 SERINC2 -503111 sc-eQTL 8.78e-01 0.0136 0.0885 0.224 ncMono L2
ENSG00000284543 LINC01226 -599772 sc-eQTL 8.64e-01 -0.0152 0.0884 0.224 ncMono L2
ENSG00000287510 AL137857.1 174761 sc-eQTL 5.52e-01 0.0545 0.0915 0.224 ncMono L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -390334 sc-eQTL 5.56e-01 -0.0602 0.102 0.232 pDC L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -390528 sc-eQTL 4.39e-01 0.087 0.112 0.232 pDC L2
ENSG00000134644 PUM1 -159537 sc-eQTL 9.12e-01 -0.0103 0.093 0.232 pDC L2
ENSG00000162511 LAPTM5 148680 sc-eQTL 9.89e-01 -0.00124 0.0865 0.232 pDC L2
ENSG00000162517 PEF1 -738442 sc-eQTL 1.19e-01 -0.175 0.111 0.232 pDC L2
ENSG00000168528 SERINC2 -503111 sc-eQTL 5.21e-01 0.0675 0.105 0.232 pDC L2
ENSG00000284543 LINC01226 -599772 sc-eQTL 4.64e-01 0.0597 0.0813 0.232 pDC L2
ENSG00000287510 AL137857.1 174761 sc-eQTL 1.51e-01 0.137 0.0952 0.232 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000060688 SNRNP40 -390334 sc-eQTL 3.57e-01 -0.0946 0.102 0.224 B_Memory LOneK1K
ENSG00000121766 ZCCHC17 -390528 sc-eQTL 6.23e-01 -0.0421 0.0854 0.224 B_Memory LOneK1K
ENSG00000134644 PUM1 -159537 sc-eQTL 9.04e-01 0.00917 0.0757 0.224 B_Memory LOneK1K
ENSG00000162510 MATN1 182869 sc-eQTL 9.57e-01 -0.00468 0.0863 0.224 B_Memory LOneK1K
ENSG00000162511 LAPTM5 148680 sc-eQTL 7.71e-01 0.0158 0.0542 0.224 B_Memory LOneK1K
ENSG00000162517 PEF1 -738442 sc-eQTL 9.48e-01 0.00586 0.0898 0.224 B_Memory LOneK1K
ENSG00000186056 MATN1-AS1 187950 sc-eQTL 3.81e-01 -0.0628 0.0716 0.224 B_Memory LOneK1K
ENSG00000287510 AL137857.1 174761 sc-eQTL 7.44e-01 0.0255 0.0782 0.224 B_Memory LOneK1K
ENSG00000060688 SNRNP40 -390334 sc-eQTL 6.95e-01 -0.0366 0.0932 0.224 B_Naive LOneK1K
ENSG00000121766 ZCCHC17 -390528 sc-eQTL 7.91e-01 0.0196 0.0737 0.224 B_Naive LOneK1K
ENSG00000134644 PUM1 -159537 sc-eQTL 3.97e-02 0.143 0.069 0.224 B_Naive LOneK1K
ENSG00000162510 MATN1 182869 sc-eQTL 8.53e-01 0.0124 0.0671 0.224 B_Naive LOneK1K
ENSG00000162511 LAPTM5 148680 sc-eQTL 3.80e-01 -0.0414 0.0472 0.224 B_Naive LOneK1K
ENSG00000162517 PEF1 -738442 sc-eQTL 8.27e-01 -0.0188 0.0863 0.224 B_Naive LOneK1K
ENSG00000186056 MATN1-AS1 187950 sc-eQTL 5.58e-01 -0.0357 0.061 0.224 B_Naive LOneK1K
ENSG00000287510 AL137857.1 174761 sc-eQTL 9.98e-01 0.000142 0.0725 0.224 B_Naive LOneK1K
ENSG00000060688 SNRNP40 -390334 sc-eQTL 6.68e-01 0.034 0.0791 0.224 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000121766 ZCCHC17 -390528 sc-eQTL 9.54e-01 -0.00522 0.0896 0.224 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000134644 PUM1 -159537 sc-eQTL 5.44e-01 -0.0347 0.0571 0.224 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000162511 LAPTM5 148680 sc-eQTL 4.23e-01 -0.0403 0.0502 0.224 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000162512 SDC3 -2304 sc-eQTL 5.05e-02 -0.2 0.102 0.224 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000162517 PEF1 -738442 sc-eQTL 9.83e-01 -0.00154 0.0721 0.224 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000168528 SERINC2 -503111 sc-eQTL 9.51e-01 0.00653 0.105 0.224 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000284543 LINC01226 -599772 sc-eQTL 3.43e-01 0.0821 0.0863 0.224 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000287510 AL137857.1 174761 sc-eQTL 9.99e-01 -0.00011 0.081 0.224 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000060688 SNRNP40 -390334 sc-eQTL 3.84e-01 0.0748 0.0857 0.222 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000121766 ZCCHC17 -390528 sc-eQTL 4.29e-01 -0.0742 0.0938 0.222 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000134644 PUM1 -159537 sc-eQTL 2.64e-01 0.0859 0.0767 0.222 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000162511 LAPTM5 148680 sc-eQTL 5.74e-01 -0.0347 0.0615 0.222 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000162512 SDC3 -2304 sc-eQTL 3.39e-02 -0.19 0.0889 0.222 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000162517 PEF1 -738442 sc-eQTL 4.93e-01 0.0561 0.0816 0.222 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000168528 SERINC2 -503111 sc-eQTL 9.37e-01 0.00738 0.0932 0.222 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000284543 LINC01226 -599772 sc-eQTL 9.87e-01 0.00142 0.0885 0.222 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000287510 AL137857.1 174761 sc-eQTL 2.83e-01 0.0952 0.0884 0.222 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000060688 SNRNP40 -390334 sc-eQTL 9.54e-01 -0.00555 0.0963 0.224 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000121753 ADGRB2 -858439 sc-eQTL 9.89e-01 -0.00108 0.082 0.224 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000121766 ZCCHC17 -390528 sc-eQTL 6.56e-03 -0.177 0.0646 0.224 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000134644 PUM1 -159537 sc-eQTL 3.07e-01 0.0736 0.0719 0.224 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000162511 LAPTM5 148680 sc-eQTL 1.75e-01 0.109 0.0802 0.224 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000162517 PEF1 -738442 sc-eQTL 7.20e-01 -0.022 0.0612 0.224 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000186056 MATN1-AS1 187950 sc-eQTL 2.58e-01 0.105 0.0926 0.224 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000287510 AL137857.1 174761 sc-eQTL 8.64e-01 0.0138 0.0801 0.224 NK_CD56dim LOneK1K

Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF
ENSG00000121766 ZCCHC17 -390528 eQTL 6.17e-04 0.0721 0.021 0.0 0.0 0.249
ENSG00000162512 SDC3 -2304 eQTL 0.000438 -0.103 0.0291 0.0 0.0 0.249
ENSG00000168528 SERINC2 -503111 eQTL 2.19e-07 0.236 0.0453 0.0 0.0 0.249

Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina
ENSG00000162512 SDC3 -2304 2.78e-05 2.85e-05 6.44e-06 1.6e-05 6.08e-06 1.45e-05 4.55e-05 4.59e-06 2.93e-05 1.42e-05 3.47e-05 1.67e-05 4.7e-05 1.33e-05 6.98e-06 1.81e-05 1.69e-05 2.46e-05 8.86e-06 8.56e-06 1.64e-05 3.06e-05 2.96e-05 1.18e-05 4.44e-05 7.99e-06 1.35e-05 1.19e-05 3.14e-05 4.12e-05 1.83e-05 2.34e-06 3.8e-06 8.31e-06 1.27e-05 7.7e-06 3.99e-06 3.83e-06 6.15e-06 4.14e-06 1.92e-06 3.42e-05 3.64e-06 5.03e-07 2.81e-06 4.43e-06 4.14e-06 1.8e-06 1.47e-06
ENSG00000168528 SERINC2 -503111 3.62e-07 2.67e-07 6.55e-08 2.92e-07 1.01e-07 1.25e-07 2.95e-07 5.84e-08 1.98e-07 1.05e-07 2.47e-07 1.52e-07 3.95e-07 8.85e-08 6.93e-08 1.01e-07 6.17e-08 2.21e-07 8e-08 8.52e-08 1.23e-07 1.81e-07 1.89e-07 3.67e-08 3.98e-07 1.43e-07 1.29e-07 1.48e-07 1.4e-07 2e-07 1.71e-07 5.08e-08 4.97e-08 9.9e-08 1.31e-07 3.36e-08 6.2e-08 7.63e-08 4.82e-08 8.3e-08 4.89e-08 2.6e-07 4.7e-08 2.02e-08 3.61e-08 9.44e-09 7.66e-08 0.0 4.55e-08