logo

Genes within 1Mb (chr1:30864856:A:T):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD

Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000060688 SNRNP40 -431932 sc-eQTL 5.07e-01 -0.106 0.16 0.062 B L1
ENSG00000121766 ZCCHC17 -432126 sc-eQTL 6.03e-01 0.0666 0.128 0.062 B L1
ENSG00000134644 PUM1 -201135 sc-eQTL 4.25e-01 0.0857 0.107 0.062 B L1
ENSG00000162510 MATN1 141271 sc-eQTL 3.62e-01 0.103 0.113 0.062 B L1
ENSG00000162511 LAPTM5 107082 sc-eQTL 2.23e-01 -0.108 0.0881 0.062 B L1
ENSG00000162517 PEF1 -780040 sc-eQTL 6.62e-01 -0.0584 0.133 0.062 B L1
ENSG00000186056 MATN1-AS1 146352 sc-eQTL 2.24e-01 -0.126 0.103 0.062 B L1
ENSG00000287510 AL137857.1 133163 sc-eQTL 5.93e-01 -0.0655 0.123 0.062 B L1
ENSG00000060688 SNRNP40 -431932 sc-eQTL 9.76e-01 -0.00408 0.138 0.062 CD4T L1
ENSG00000121766 ZCCHC17 -432126 sc-eQTL 1.24e-01 0.166 0.108 0.062 CD4T L1
ENSG00000134644 PUM1 -201135 sc-eQTL 7.27e-01 -0.0336 0.0962 0.062 CD4T L1
ENSG00000162511 LAPTM5 107082 sc-eQTL 7.78e-02 -0.188 0.106 0.062 CD4T L1
ENSG00000162517 PEF1 -780040 sc-eQTL 5.45e-01 0.0676 0.111 0.062 CD4T L1
ENSG00000186056 MATN1-AS1 146352 sc-eQTL 4.48e-01 -0.0724 0.0953 0.062 CD4T L1
ENSG00000287510 AL137857.1 133163 sc-eQTL 5.75e-01 -0.0641 0.114 0.062 CD4T L1
ENSG00000060688 SNRNP40 -431932 sc-eQTL 1.26e-01 -0.275 0.179 0.062 CD8T L1
ENSG00000121766 ZCCHC17 -432126 sc-eQTL 1.85e-01 -0.159 0.119 0.062 CD8T L1
ENSG00000134644 PUM1 -201135 sc-eQTL 5.44e-01 -0.0642 0.106 0.062 CD8T L1
ENSG00000162511 LAPTM5 107082 sc-eQTL 1.22e-01 -0.159 0.102 0.062 CD8T L1
ENSG00000162517 PEF1 -780040 sc-eQTL 8.92e-01 -0.0172 0.126 0.062 CD8T L1
ENSG00000186056 MATN1-AS1 146352 sc-eQTL 8.50e-01 -0.0228 0.12 0.062 CD8T L1
ENSG00000287510 AL137857.1 133163 sc-eQTL 6.68e-01 -0.0648 0.151 0.062 CD8T L1
ENSG00000060688 SNRNP40 -431932 sc-eQTL 4.98e-01 -0.111 0.164 0.059 DC L1
ENSG00000121766 ZCCHC17 -432126 sc-eQTL 7.15e-02 0.349 0.193 0.059 DC L1
ENSG00000134644 PUM1 -201135 sc-eQTL 8.68e-01 0.0254 0.152 0.059 DC L1
ENSG00000162511 LAPTM5 107082 sc-eQTL 2.46e-01 0.126 0.108 0.059 DC L1
ENSG00000162517 PEF1 -780040 sc-eQTL 4.76e-01 0.126 0.176 0.059 DC L1
ENSG00000168528 SERINC2 -544709 sc-eQTL 5.19e-01 -0.116 0.179 0.059 DC L1
ENSG00000284543 LINC01226 -641370 sc-eQTL 3.85e-01 0.103 0.119 0.059 DC L1
ENSG00000287510 AL137857.1 133163 sc-eQTL 5.56e-01 -0.101 0.172 0.059 DC L1
ENSG00000060688 SNRNP40 -431932 sc-eQTL 5.47e-01 -0.076 0.126 0.062 Mono L1
ENSG00000121766 ZCCHC17 -432126 sc-eQTL 3.11e-01 -0.158 0.156 0.062 Mono L1
ENSG00000134644 PUM1 -201135 sc-eQTL 5.57e-01 0.0589 0.1 0.062 Mono L1
ENSG00000162511 LAPTM5 107082 sc-eQTL 7.99e-01 -0.0235 0.0922 0.062 Mono L1
ENSG00000162512 SDC3 -43902 sc-eQTL 1.84e-01 -0.235 0.177 0.062 Mono L1
ENSG00000162517 PEF1 -780040 sc-eQTL 7.92e-01 0.0328 0.124 0.062 Mono L1
ENSG00000168528 SERINC2 -544709 sc-eQTL 7.08e-01 -0.0714 0.19 0.062 Mono L1
ENSG00000284543 LINC01226 -641370 sc-eQTL 6.00e-01 0.088 0.167 0.062 Mono L1
ENSG00000287510 AL137857.1 133163 sc-eQTL 6.79e-01 0.0607 0.146 0.062 Mono L1
ENSG00000060688 SNRNP40 -431932 sc-eQTL 3.65e-01 0.158 0.174 0.06 NK L1
ENSG00000121753 ADGRB2 -900037 sc-eQTL 7.02e-01 0.0576 0.15 0.06 NK L1
ENSG00000121766 ZCCHC17 -432126 sc-eQTL 8.55e-01 -0.0219 0.119 0.06 NK L1
ENSG00000134644 PUM1 -201135 sc-eQTL 5.87e-01 0.068 0.125 0.06 NK L1
ENSG00000162511 LAPTM5 107082 sc-eQTL 8.72e-01 -0.0232 0.144 0.06 NK L1
ENSG00000162517 PEF1 -780040 sc-eQTL 9.65e-01 0.00456 0.105 0.06 NK L1
ENSG00000186056 MATN1-AS1 146352 sc-eQTL 3.00e-01 -0.168 0.162 0.06 NK L1
ENSG00000287510 AL137857.1 133163 sc-eQTL 7.95e-01 -0.039 0.15 0.06 NK L1
ENSG00000060688 SNRNP40 -431932 sc-eQTL 5.97e-01 0.0685 0.129 0.062 Other_T L1
ENSG00000121766 ZCCHC17 -432126 sc-eQTL 3.91e-01 0.119 0.138 0.062 Other_T L1
ENSG00000134644 PUM1 -201135 sc-eQTL 7.21e-01 0.0445 0.124 0.062 Other_T L1
ENSG00000162511 LAPTM5 107082 sc-eQTL 1.79e-01 -0.137 0.102 0.062 Other_T L1
ENSG00000162517 PEF1 -780040 sc-eQTL 3.71e-02 -0.283 0.135 0.062 Other_T L1
ENSG00000186056 MATN1-AS1 146352 sc-eQTL 2.59e-01 -0.189 0.167 0.062 Other_T L1
ENSG00000287510 AL137857.1 133163 sc-eQTL 3.25e-01 0.171 0.174 0.062 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000060688 SNRNP40 -431932 sc-eQTL 1.86e-01 -0.307 0.231 0.054 B_Activated L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -432126 sc-eQTL 7.01e-01 0.0901 0.234 0.054 B_Activated L2
ENSG00000134644 PUM1 -201135 sc-eQTL 4.64e-01 -0.159 0.217 0.054 B_Activated L2
ENSG00000162510 MATN1 141271 sc-eQTL 8.31e-01 -0.0406 0.19 0.054 B_Activated L2
ENSG00000162511 LAPTM5 107082 sc-eQTL 2.58e-01 -0.15 0.132 0.054 B_Activated L2
ENSG00000162517 PEF1 -780040 sc-eQTL 8.41e-01 0.0454 0.226 0.054 B_Activated L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 146352 sc-eQTL 8.24e-01 -0.0477 0.214 0.054 B_Activated L2
ENSG00000287510 AL137857.1 133163 sc-eQTL 2.77e-01 0.206 0.189 0.054 B_Activated L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -431932 sc-eQTL 7.88e-02 -0.343 0.194 0.062 B_Intermediate L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -432126 sc-eQTL 1.19e-01 0.254 0.162 0.062 B_Intermediate L2
ENSG00000134644 PUM1 -201135 sc-eQTL 8.84e-01 -0.0224 0.154 0.062 B_Intermediate L2
ENSG00000162510 MATN1 141271 sc-eQTL 9.13e-01 0.0175 0.16 0.062 B_Intermediate L2
ENSG00000162511 LAPTM5 107082 sc-eQTL 5.82e-02 -0.186 0.0974 0.062 B_Intermediate L2
ENSG00000162517 PEF1 -780040 sc-eQTL 7.19e-01 0.0657 0.182 0.062 B_Intermediate L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 146352 sc-eQTL 3.92e-01 -0.118 0.138 0.062 B_Intermediate L2
ENSG00000287510 AL137857.1 133163 sc-eQTL 2.55e-01 -0.176 0.154 0.062 B_Intermediate L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -431932 sc-eQTL 7.63e-01 0.0579 0.191 0.062 B_Memory L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -432126 sc-eQTL 9.19e-01 -0.0179 0.176 0.062 B_Memory L2
ENSG00000134644 PUM1 -201135 sc-eQTL 8.55e-02 0.263 0.152 0.062 B_Memory L2
ENSG00000162510 MATN1 141271 sc-eQTL 2.36e-01 -0.174 0.146 0.062 B_Memory L2
ENSG00000162511 LAPTM5 107082 sc-eQTL 7.48e-02 -0.231 0.129 0.062 B_Memory L2
ENSG00000162517 PEF1 -780040 sc-eQTL 8.51e-01 -0.0327 0.174 0.062 B_Memory L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 146352 sc-eQTL 3.87e-01 -0.129 0.149 0.062 B_Memory L2
ENSG00000287510 AL137857.1 133163 sc-eQTL 3.93e-01 0.149 0.174 0.062 B_Memory L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -431932 sc-eQTL 8.21e-01 -0.0395 0.174 0.062 B_Naive1 L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -432126 sc-eQTL 1.27e-01 0.228 0.149 0.062 B_Naive1 L2
ENSG00000134644 PUM1 -201135 sc-eQTL 4.16e-02 0.269 0.131 0.062 B_Naive1 L2
ENSG00000162510 MATN1 141271 sc-eQTL 3.33e-01 0.13 0.134 0.062 B_Naive1 L2
ENSG00000162511 LAPTM5 107082 sc-eQTL 4.05e-01 -0.0747 0.0896 0.062 B_Naive1 L2
ENSG00000162517 PEF1 -780040 sc-eQTL 5.73e-01 -0.0894 0.158 0.062 B_Naive1 L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 146352 sc-eQTL 3.28e-01 -0.115 0.118 0.062 B_Naive1 L2
ENSG00000287510 AL137857.1 133163 sc-eQTL 7.77e-01 -0.0412 0.146 0.062 B_Naive1 L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -431932 sc-eQTL 8.50e-01 -0.0352 0.186 0.062 B_Naive2 L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -432126 sc-eQTL 1.00e-01 -0.251 0.152 0.062 B_Naive2 L2
ENSG00000134644 PUM1 -201135 sc-eQTL 5.27e-01 -0.0948 0.15 0.062 B_Naive2 L2
ENSG00000162510 MATN1 141271 sc-eQTL 6.52e-01 -0.065 0.144 0.062 B_Naive2 L2
ENSG00000162511 LAPTM5 107082 sc-eQTL 2.65e-01 -0.109 0.0974 0.062 B_Naive2 L2
ENSG00000162517 PEF1 -780040 sc-eQTL 7.49e-01 -0.0569 0.178 0.062 B_Naive2 L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 146352 sc-eQTL 5.04e-01 0.0952 0.142 0.062 B_Naive2 L2
ENSG00000287510 AL137857.1 133163 sc-eQTL 2.99e-01 -0.16 0.153 0.062 B_Naive2 L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -431932 sc-eQTL 7.09e-01 -0.0683 0.183 0.066 CD4_CTL L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -432126 sc-eQTL 2.27e-01 -0.217 0.179 0.066 CD4_CTL L2
ENSG00000134644 PUM1 -201135 sc-eQTL 3.83e-02 -0.364 0.175 0.066 CD4_CTL L2
ENSG00000162511 LAPTM5 107082 sc-eQTL 5.21e-01 -0.101 0.157 0.066 CD4_CTL L2
ENSG00000162517 PEF1 -780040 sc-eQTL 8.38e-01 -0.033 0.161 0.066 CD4_CTL L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 146352 sc-eQTL 3.21e-02 0.367 0.17 0.066 CD4_CTL L2
ENSG00000287510 AL137857.1 133163 sc-eQTL 3.07e-01 0.155 0.152 0.066 CD4_CTL L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -431932 sc-eQTL 9.94e-01 -0.00108 0.143 0.062 CD4_Naive L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -432126 sc-eQTL 1.64e-01 0.177 0.126 0.062 CD4_Naive L2
ENSG00000134644 PUM1 -201135 sc-eQTL 9.82e-01 0.00228 0.101 0.062 CD4_Naive L2
ENSG00000162511 LAPTM5 107082 sc-eQTL 4.81e-02 -0.214 0.108 0.062 CD4_Naive L2
ENSG00000162517 PEF1 -780040 sc-eQTL 1.80e-01 0.16 0.119 0.062 CD4_Naive L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 146352 sc-eQTL 3.39e-01 -0.105 0.11 0.062 CD4_Naive L2
ENSG00000287510 AL137857.1 133163 sc-eQTL 1.03e-01 -0.206 0.126 0.062 CD4_Naive L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -431932 sc-eQTL 3.27e-01 0.177 0.18 0.062 CD4_TCM L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -432126 sc-eQTL 7.79e-01 0.0408 0.145 0.062 CD4_TCM L2
ENSG00000134644 PUM1 -201135 sc-eQTL 7.42e-01 -0.0423 0.129 0.062 CD4_TCM L2
ENSG00000162511 LAPTM5 107082 sc-eQTL 3.83e-01 -0.0931 0.106 0.062 CD4_TCM L2
ENSG00000162517 PEF1 -780040 sc-eQTL 9.69e-01 -0.00555 0.143 0.062 CD4_TCM L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 146352 sc-eQTL 3.86e-01 0.117 0.135 0.062 CD4_TCM L2
ENSG00000287510 AL137857.1 133163 sc-eQTL 7.98e-01 -0.0387 0.151 0.062 CD4_TCM L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -431932 sc-eQTL 7.42e-01 0.0589 0.179 0.062 CD4_TEM L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -432126 sc-eQTL 4.55e-01 0.128 0.17 0.062 CD4_TEM L2
ENSG00000134644 PUM1 -201135 sc-eQTL 8.72e-01 -0.0229 0.142 0.062 CD4_TEM L2
ENSG00000162511 LAPTM5 107082 sc-eQTL 3.35e-01 -0.139 0.143 0.062 CD4_TEM L2
ENSG00000162517 PEF1 -780040 sc-eQTL 8.04e-01 -0.0399 0.161 0.062 CD4_TEM L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 146352 sc-eQTL 5.42e-01 0.102 0.168 0.062 CD4_TEM L2
ENSG00000287510 AL137857.1 133163 sc-eQTL 2.88e-01 -0.176 0.165 0.062 CD4_TEM L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -431932 sc-eQTL 6.33e-01 -0.0938 0.196 0.062 CD8_CTL L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -432126 sc-eQTL 5.02e-02 -0.294 0.149 0.062 CD8_CTL L2
ENSG00000134644 PUM1 -201135 sc-eQTL 3.54e-01 0.135 0.146 0.062 CD8_CTL L2
ENSG00000162511 LAPTM5 107082 sc-eQTL 5.44e-01 -0.0984 0.162 0.062 CD8_CTL L2
ENSG00000162517 PEF1 -780040 sc-eQTL 3.69e-01 0.127 0.141 0.062 CD8_CTL L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 146352 sc-eQTL 8.07e-01 0.0417 0.17 0.062 CD8_CTL L2
ENSG00000287510 AL137857.1 133163 sc-eQTL 7.14e-01 0.0587 0.16 0.062 CD8_CTL L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -431932 sc-eQTL 1.63e-01 -0.249 0.178 0.062 CD8_Naive L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -432126 sc-eQTL 6.63e-01 -0.0672 0.154 0.062 CD8_Naive L2
ENSG00000134644 PUM1 -201135 sc-eQTL 9.23e-01 0.012 0.124 0.062 CD8_Naive L2
ENSG00000162511 LAPTM5 107082 sc-eQTL 2.87e-02 -0.259 0.118 0.062 CD8_Naive L2
ENSG00000162517 PEF1 -780040 sc-eQTL 8.24e-01 0.0369 0.165 0.062 CD8_Naive L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 146352 sc-eQTL 4.50e-01 -0.112 0.148 0.062 CD8_Naive L2
ENSG00000287510 AL137857.1 133163 sc-eQTL 8.74e-01 0.0257 0.162 0.062 CD8_Naive L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -431932 sc-eQTL 1.50e-01 0.297 0.205 0.058 CD8_TCM L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -432126 sc-eQTL 3.73e-01 -0.169 0.189 0.058 CD8_TCM L2
ENSG00000134644 PUM1 -201135 sc-eQTL 3.02e-01 -0.184 0.177 0.058 CD8_TCM L2
ENSG00000162511 LAPTM5 107082 sc-eQTL 4.13e-02 -0.379 0.184 0.058 CD8_TCM L2
ENSG00000162517 PEF1 -780040 sc-eQTL 7.27e-01 0.0667 0.19 0.058 CD8_TCM L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 146352 sc-eQTL 3.31e-01 0.168 0.172 0.058 CD8_TCM L2
ENSG00000287510 AL137857.1 133163 sc-eQTL 2.02e-01 -0.222 0.174 0.058 CD8_TCM L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -431932 sc-eQTL 7.32e-01 0.0641 0.187 0.062 CD8_TEM L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -432126 sc-eQTL 8.60e-01 -0.0315 0.179 0.062 CD8_TEM L2
ENSG00000134644 PUM1 -201135 sc-eQTL 6.74e-01 0.0772 0.183 0.062 CD8_TEM L2
ENSG00000162511 LAPTM5 107082 sc-eQTL 5.26e-01 0.109 0.172 0.062 CD8_TEM L2
ENSG00000162517 PEF1 -780040 sc-eQTL 4.46e-01 -0.124 0.162 0.062 CD8_TEM L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 146352 sc-eQTL 9.48e-01 -0.0118 0.179 0.062 CD8_TEM L2
ENSG00000287510 AL137857.1 133163 sc-eQTL 7.16e-01 0.059 0.162 0.062 CD8_TEM L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -431932 sc-eQTL 2.55e-01 0.217 0.19 0.063 MAIT L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -432126 sc-eQTL 3.27e-01 0.165 0.169 0.063 MAIT L2
ENSG00000134644 PUM1 -201135 sc-eQTL 1.58e-01 0.228 0.161 0.063 MAIT L2
ENSG00000162511 LAPTM5 107082 sc-eQTL 4.23e-01 -0.122 0.153 0.063 MAIT L2
ENSG00000162517 PEF1 -780040 sc-eQTL 2.70e-02 -0.369 0.166 0.063 MAIT L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 146352 sc-eQTL 1.30e-01 -0.257 0.169 0.063 MAIT L2
ENSG00000287510 AL137857.1 133163 sc-eQTL 4.67e-01 0.128 0.175 0.063 MAIT L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -431932 sc-eQTL 2.03e-01 -0.252 0.197 0.06 NK_CD56bright L2
ENSG00000121753 ADGRB2 -900037 sc-eQTL 9.34e-01 0.0129 0.155 0.06 NK_CD56bright L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -432126 sc-eQTL 5.91e-01 0.0899 0.167 0.06 NK_CD56bright L2
ENSG00000134644 PUM1 -201135 sc-eQTL 2.61e-01 -0.197 0.175 0.06 NK_CD56bright L2
ENSG00000162511 LAPTM5 107082 sc-eQTL 5.48e-01 -0.104 0.173 0.06 NK_CD56bright L2
ENSG00000162517 PEF1 -780040 sc-eQTL 7.29e-01 0.0584 0.168 0.06 NK_CD56bright L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 146352 sc-eQTL 6.13e-01 -0.0882 0.174 0.06 NK_CD56bright L2
ENSG00000287510 AL137857.1 133163 sc-eQTL 7.55e-01 0.0536 0.172 0.06 NK_CD56bright L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -431932 sc-eQTL 6.61e-02 0.34 0.184 0.06 NK_CD56dim L2
ENSG00000121753 ADGRB2 -900037 sc-eQTL 8.65e-01 0.0277 0.163 0.06 NK_CD56dim L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -432126 sc-eQTL 9.19e-01 0.014 0.137 0.06 NK_CD56dim L2
ENSG00000134644 PUM1 -201135 sc-eQTL 4.86e-01 0.0979 0.14 0.06 NK_CD56dim L2
ENSG00000162511 LAPTM5 107082 sc-eQTL 9.23e-01 0.0145 0.15 0.06 NK_CD56dim L2
ENSG00000162517 PEF1 -780040 sc-eQTL 7.22e-01 -0.0475 0.133 0.06 NK_CD56dim L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 146352 sc-eQTL 5.90e-01 -0.101 0.188 0.06 NK_CD56dim L2
ENSG00000287510 AL137857.1 133163 sc-eQTL 6.31e-01 0.0744 0.155 0.06 NK_CD56dim L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -431932 sc-eQTL 2.97e-01 0.2 0.191 0.064 NK_HLA L2
ENSG00000121753 ADGRB2 -900037 sc-eQTL 2.33e-01 0.181 0.152 0.064 NK_HLA L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -432126 sc-eQTL 5.94e-01 0.0912 0.171 0.064 NK_HLA L2
ENSG00000134644 PUM1 -201135 sc-eQTL 5.72e-01 -0.0944 0.167 0.064 NK_HLA L2
ENSG00000162511 LAPTM5 107082 sc-eQTL 6.45e-01 0.0735 0.159 0.064 NK_HLA L2
ENSG00000162517 PEF1 -780040 sc-eQTL 9.68e-01 0.00722 0.179 0.064 NK_HLA L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 146352 sc-eQTL 3.33e-01 -0.164 0.169 0.064 NK_HLA L2
ENSG00000287510 AL137857.1 133163 sc-eQTL 6.89e-01 0.0656 0.164 0.064 NK_HLA L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -431932 sc-eQTL 9.89e-01 -0.0025 0.18 0.06 NK_cytokine L2
ENSG00000121753 ADGRB2 -900037 sc-eQTL 6.65e-01 0.0705 0.163 0.06 NK_cytokine L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -432126 sc-eQTL 8.41e-01 -0.0282 0.141 0.06 NK_cytokine L2
ENSG00000134644 PUM1 -201135 sc-eQTL 2.91e-01 0.16 0.152 0.06 NK_cytokine L2
ENSG00000162511 LAPTM5 107082 sc-eQTL 8.56e-01 0.0303 0.167 0.06 NK_cytokine L2
ENSG00000162517 PEF1 -780040 sc-eQTL 6.32e-01 0.0684 0.142 0.06 NK_cytokine L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 146352 sc-eQTL 4.60e-01 -0.131 0.177 0.06 NK_cytokine L2
ENSG00000287510 AL137857.1 133163 sc-eQTL 2.40e-01 -0.194 0.164 0.06 NK_cytokine L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -431932 sc-eQTL 2.95e-01 -0.265 0.251 0.052 PB L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -432126 sc-eQTL 5.11e-01 0.193 0.292 0.052 PB L2
ENSG00000134644 PUM1 -201135 sc-eQTL 3.60e-01 -0.233 0.253 0.052 PB L2
ENSG00000162510 MATN1 141271 sc-eQTL 4.81e-01 -0.167 0.237 0.052 PB L2
ENSG00000162511 LAPTM5 107082 sc-eQTL 4.56e-01 -0.126 0.169 0.052 PB L2
ENSG00000162517 PEF1 -780040 sc-eQTL 4.64e-01 0.191 0.26 0.052 PB L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 146352 sc-eQTL 7.43e-01 0.0763 0.232 0.052 PB L2
ENSG00000287510 AL137857.1 133163 sc-eQTL 7.81e-01 -0.0687 0.247 0.052 PB L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -431932 sc-eQTL 3.85e-01 -0.123 0.141 0.061 Pro_T L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -432126 sc-eQTL 3.92e-01 0.153 0.179 0.061 Pro_T L2
ENSG00000134644 PUM1 -201135 sc-eQTL 2.78e-01 -0.181 0.167 0.061 Pro_T L2
ENSG00000162511 LAPTM5 107082 sc-eQTL 7.75e-01 -0.0343 0.12 0.061 Pro_T L2
ENSG00000162517 PEF1 -780040 sc-eQTL 4.45e-01 0.134 0.176 0.061 Pro_T L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 146352 sc-eQTL 4.49e-01 0.127 0.167 0.061 Pro_T L2
ENSG00000287510 AL137857.1 133163 sc-eQTL 7.89e-02 0.27 0.153 0.061 Pro_T L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -431932 sc-eQTL 7.41e-02 -0.336 0.187 0.062 Treg L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -432126 sc-eQTL 4.10e-01 0.15 0.182 0.062 Treg L2
ENSG00000134644 PUM1 -201135 sc-eQTL 7.34e-01 -0.0496 0.146 0.062 Treg L2
ENSG00000162511 LAPTM5 107082 sc-eQTL 2.87e-01 -0.178 0.167 0.062 Treg L2
ENSG00000162517 PEF1 -780040 sc-eQTL 2.94e-01 -0.189 0.18 0.062 Treg L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 146352 sc-eQTL 9.68e-01 -0.00687 0.17 0.062 Treg L2
ENSG00000287510 AL137857.1 133163 sc-eQTL 7.59e-01 0.0522 0.17 0.062 Treg L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -431932 sc-eQTL 1.73e-01 -0.254 0.186 0.063 cDC L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -432126 sc-eQTL 1.42e-01 0.297 0.201 0.063 cDC L2
ENSG00000134644 PUM1 -201135 sc-eQTL 4.55e-01 -0.13 0.173 0.063 cDC L2
ENSG00000162511 LAPTM5 107082 sc-eQTL 6.27e-01 0.0593 0.122 0.063 cDC L2
ENSG00000162517 PEF1 -780040 sc-eQTL 5.63e-01 0.102 0.176 0.063 cDC L2
ENSG00000168528 SERINC2 -544709 sc-eQTL 2.70e-01 -0.172 0.156 0.063 cDC L2
ENSG00000284543 LINC01226 -641370 sc-eQTL 5.77e-01 -0.0858 0.153 0.063 cDC L2
ENSG00000287510 AL137857.1 133163 sc-eQTL 2.15e-01 -0.205 0.165 0.063 cDC L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -431932 sc-eQTL 7.49e-01 -0.0489 0.153 0.062 cMono_IL1B L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -432126 sc-eQTL 4.22e-01 -0.137 0.17 0.062 cMono_IL1B L2
ENSG00000134644 PUM1 -201135 sc-eQTL 6.18e-01 0.0575 0.115 0.062 cMono_IL1B L2
ENSG00000162511 LAPTM5 107082 sc-eQTL 9.07e-01 -0.0118 0.101 0.062 cMono_IL1B L2
ENSG00000162512 SDC3 -43902 sc-eQTL 1.66e-01 -0.264 0.19 0.062 cMono_IL1B L2
ENSG00000162517 PEF1 -780040 sc-eQTL 7.34e-01 -0.0529 0.156 0.062 cMono_IL1B L2
ENSG00000168528 SERINC2 -544709 sc-eQTL 5.34e-01 -0.12 0.193 0.062 cMono_IL1B L2
ENSG00000284543 LINC01226 -641370 sc-eQTL 6.53e-01 0.0768 0.171 0.062 cMono_IL1B L2
ENSG00000287510 AL137857.1 133163 sc-eQTL 6.86e-01 -0.0644 0.159 0.062 cMono_IL1B L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -431932 sc-eQTL 3.42e-01 -0.152 0.159 0.062 cMono_S100A L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -432126 sc-eQTL 3.73e-01 -0.168 0.188 0.062 cMono_S100A L2
ENSG00000134644 PUM1 -201135 sc-eQTL 3.94e-01 0.116 0.136 0.062 cMono_S100A L2
ENSG00000162511 LAPTM5 107082 sc-eQTL 9.52e-01 -0.00625 0.105 0.062 cMono_S100A L2
ENSG00000162512 SDC3 -43902 sc-eQTL 8.37e-02 -0.312 0.18 0.062 cMono_S100A L2
ENSG00000162517 PEF1 -780040 sc-eQTL 2.57e-01 -0.185 0.163 0.062 cMono_S100A L2
ENSG00000168528 SERINC2 -544709 sc-eQTL 5.24e-01 -0.122 0.191 0.062 cMono_S100A L2
ENSG00000284543 LINC01226 -641370 sc-eQTL 3.17e-01 0.156 0.155 0.062 cMono_S100A L2
ENSG00000287510 AL137857.1 133163 sc-eQTL 9.83e-01 0.00329 0.156 0.062 cMono_S100A L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -431932 sc-eQTL 3.86e-01 0.205 0.236 0.058 gdT L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -432126 sc-eQTL 1.37e-01 -0.301 0.201 0.058 gdT L2
ENSG00000134644 PUM1 -201135 sc-eQTL 1.95e-01 -0.271 0.208 0.058 gdT L2
ENSG00000162511 LAPTM5 107082 sc-eQTL 2.41e-01 -0.267 0.226 0.058 gdT L2
ENSG00000162517 PEF1 -780040 sc-eQTL 7.73e-02 -0.366 0.206 0.058 gdT L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 146352 sc-eQTL 6.38e-01 0.099 0.21 0.058 gdT L2
ENSG00000287510 AL137857.1 133163 sc-eQTL 7.00e-01 -0.0784 0.203 0.058 gdT L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -431932 sc-eQTL 7.53e-01 0.0565 0.179 0.058 intMono L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -432126 sc-eQTL 7.77e-01 -0.0546 0.193 0.058 intMono L2
ENSG00000134644 PUM1 -201135 sc-eQTL 4.70e-01 0.118 0.163 0.058 intMono L2
ENSG00000162511 LAPTM5 107082 sc-eQTL 6.10e-01 -0.0656 0.128 0.058 intMono L2
ENSG00000162512 SDC3 -43902 sc-eQTL 6.44e-01 0.0813 0.176 0.058 intMono L2
ENSG00000162517 PEF1 -780040 sc-eQTL 2.94e-01 0.194 0.184 0.058 intMono L2
ENSG00000168528 SERINC2 -544709 sc-eQTL 2.88e-01 -0.195 0.184 0.058 intMono L2
ENSG00000284543 LINC01226 -641370 sc-eQTL 3.55e-01 -0.161 0.174 0.058 intMono L2
ENSG00000287510 AL137857.1 133163 sc-eQTL 9.30e-01 0.0154 0.174 0.058 intMono L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -431932 sc-eQTL 7.22e-01 0.0589 0.165 0.061 ncMono L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -432126 sc-eQTL 4.16e-01 -0.144 0.176 0.061 ncMono L2
ENSG00000134644 PUM1 -201135 sc-eQTL 2.94e-02 -0.313 0.143 0.061 ncMono L2
ENSG00000162511 LAPTM5 107082 sc-eQTL 5.84e-01 0.0718 0.131 0.061 ncMono L2
ENSG00000162512 SDC3 -43902 sc-eQTL 7.27e-01 0.0512 0.147 0.061 ncMono L2
ENSG00000162517 PEF1 -780040 sc-eQTL 6.83e-01 0.0688 0.168 0.061 ncMono L2
ENSG00000168528 SERINC2 -544709 sc-eQTL 8.28e-01 -0.0349 0.16 0.061 ncMono L2
ENSG00000284543 LINC01226 -641370 sc-eQTL 2.17e-01 -0.198 0.16 0.061 ncMono L2
ENSG00000287510 AL137857.1 133163 sc-eQTL 1.64e-01 0.231 0.165 0.061 ncMono L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -431932 sc-eQTL 6.55e-01 -0.0783 0.175 0.071 pDC L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -432126 sc-eQTL 3.87e-01 0.166 0.192 0.071 pDC L2
ENSG00000134644 PUM1 -201135 sc-eQTL 1.51e-01 0.228 0.158 0.071 pDC L2
ENSG00000162511 LAPTM5 107082 sc-eQTL 5.11e-01 0.0974 0.148 0.071 pDC L2
ENSG00000162517 PEF1 -780040 sc-eQTL 8.94e-01 -0.0257 0.192 0.071 pDC L2
ENSG00000168528 SERINC2 -544709 sc-eQTL 8.72e-01 -0.029 0.179 0.071 pDC L2
ENSG00000284543 LINC01226 -641370 sc-eQTL 3.64e-01 0.126 0.139 0.071 pDC L2
ENSG00000287510 AL137857.1 133163 sc-eQTL 8.87e-01 -0.0234 0.164 0.071 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000060688 SNRNP40 -431932 sc-eQTL 1.15e-01 -0.297 0.187 0.062 B_Memory LOneK1K
ENSG00000121766 ZCCHC17 -432126 sc-eQTL 4.15e-01 0.128 0.157 0.062 B_Memory LOneK1K
ENSG00000134644 PUM1 -201135 sc-eQTL 5.14e-01 0.0907 0.139 0.062 B_Memory LOneK1K
ENSG00000162510 MATN1 141271 sc-eQTL 5.63e-01 -0.0919 0.158 0.062 B_Memory LOneK1K
ENSG00000162511 LAPTM5 107082 sc-eQTL 1.07e-01 -0.16 0.099 0.062 B_Memory LOneK1K
ENSG00000162517 PEF1 -780040 sc-eQTL 9.73e-01 0.0055 0.165 0.062 B_Memory LOneK1K
ENSG00000186056 MATN1-AS1 146352 sc-eQTL 5.45e-01 -0.0799 0.132 0.062 B_Memory LOneK1K
ENSG00000287510 AL137857.1 133163 sc-eQTL 9.27e-01 0.0132 0.144 0.062 B_Memory LOneK1K
ENSG00000060688 SNRNP40 -431932 sc-eQTL 6.68e-01 -0.0728 0.17 0.062 B_Naive LOneK1K
ENSG00000121766 ZCCHC17 -432126 sc-eQTL 7.72e-01 0.0389 0.134 0.062 B_Naive LOneK1K
ENSG00000134644 PUM1 -201135 sc-eQTL 1.31e-01 0.191 0.126 0.062 B_Naive LOneK1K
ENSG00000162510 MATN1 141271 sc-eQTL 2.21e-01 0.15 0.122 0.062 B_Naive LOneK1K
ENSG00000162511 LAPTM5 107082 sc-eQTL 1.88e-01 -0.113 0.0857 0.062 B_Naive LOneK1K
ENSG00000162517 PEF1 -780040 sc-eQTL 5.55e-01 -0.0928 0.157 0.062 B_Naive LOneK1K
ENSG00000186056 MATN1-AS1 146352 sc-eQTL 8.16e-01 -0.0258 0.111 0.062 B_Naive LOneK1K
ENSG00000287510 AL137857.1 133163 sc-eQTL 3.75e-01 -0.117 0.132 0.062 B_Naive LOneK1K
ENSG00000060688 SNRNP40 -431932 sc-eQTL 3.01e-01 -0.15 0.144 0.062 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000121766 ZCCHC17 -432126 sc-eQTL 1.62e-01 -0.229 0.163 0.062 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000134644 PUM1 -201135 sc-eQTL 4.94e-01 0.0716 0.104 0.062 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000162511 LAPTM5 107082 sc-eQTL 4.55e-01 -0.0687 0.0918 0.062 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000162512 SDC3 -43902 sc-eQTL 3.39e-02 -0.396 0.185 0.062 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000162517 PEF1 -780040 sc-eQTL 7.05e-01 -0.0499 0.132 0.062 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000168528 SERINC2 -544709 sc-eQTL 5.41e-01 -0.118 0.193 0.062 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000284543 LINC01226 -641370 sc-eQTL 5.28e-01 0.0999 0.158 0.062 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000287510 AL137857.1 133163 sc-eQTL 8.71e-01 -0.024 0.148 0.062 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000060688 SNRNP40 -431932 sc-eQTL 6.49e-01 0.0727 0.159 0.06 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000121766 ZCCHC17 -432126 sc-eQTL 6.35e-01 -0.0829 0.174 0.06 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000134644 PUM1 -201135 sc-eQTL 3.48e-01 -0.134 0.143 0.06 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000162511 LAPTM5 107082 sc-eQTL 3.87e-01 0.0989 0.114 0.06 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000162512 SDC3 -43902 sc-eQTL 6.70e-01 0.0713 0.167 0.06 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000162517 PEF1 -780040 sc-eQTL 2.68e-01 0.168 0.151 0.06 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000168528 SERINC2 -544709 sc-eQTL 5.41e-01 -0.106 0.173 0.06 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000284543 LINC01226 -641370 sc-eQTL 1.91e-01 -0.215 0.164 0.06 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000287510 AL137857.1 133163 sc-eQTL 5.81e-02 0.311 0.163 0.06 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000060688 SNRNP40 -431932 sc-eQTL 1.68e-01 0.242 0.174 0.06 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000121753 ADGRB2 -900037 sc-eQTL 6.98e-01 0.058 0.149 0.06 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000121766 ZCCHC17 -432126 sc-eQTL 7.29e-01 -0.0416 0.12 0.06 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000134644 PUM1 -201135 sc-eQTL 3.50e-01 0.123 0.131 0.06 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000162511 LAPTM5 107082 sc-eQTL 9.70e-01 0.00545 0.147 0.06 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000162517 PEF1 -780040 sc-eQTL 8.03e-01 0.0279 0.111 0.06 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000186056 MATN1-AS1 146352 sc-eQTL 2.96e-01 -0.177 0.169 0.06 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000287510 AL137857.1 133163 sc-eQTL 7.77e-01 -0.0414 0.146 0.06 NK_CD56dim LOneK1K

Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF

Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina
ENSG00000168528 \N -544709 3.14e-07 2.3e-07 1.24e-07 3.58e-07 1.07e-07 8.4e-08 2.5e-07 5.82e-08 1.71e-07 9.35e-08 1.96e-07 1.2e-07 2.45e-07 8.55e-08 1.26e-07 9.6e-08 6.17e-08 2.43e-07 2.51e-07 8.39e-08 1.39e-07 1.9e-07 1.69e-07 4.07e-08 2.09e-07 1.39e-07 1.48e-07 1.77e-07 1.36e-07 1.58e-07 1.35e-07 4.23e-08 3.13e-08 1.02e-07 6.25e-08 6.52e-08 6.77e-08 8.2e-08 6.62e-08 7.78e-08 4.63e-08 1.79e-07 2.88e-08 1.23e-08 1.34e-07 6.83e-09 9.29e-08 1.92e-09 4.83e-08