logo

Genes within 1Mb (chr1:30864570:C:A):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD

Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000060688 SNRNP40 -432218 sc-eQTL 1.67e-01 -0.132 0.0954 0.235 B L1
ENSG00000121766 ZCCHC17 -432412 sc-eQTL 7.21e-01 -0.0274 0.0767 0.235 B L1
ENSG00000134644 PUM1 -201421 sc-eQTL 9.76e-02 0.106 0.064 0.235 B L1
ENSG00000162510 MATN1 140985 sc-eQTL 4.64e-01 -0.0496 0.0676 0.235 B L1
ENSG00000162511 LAPTM5 106796 sc-eQTL 1.63e-01 0.074 0.0528 0.235 B L1
ENSG00000162517 PEF1 -780326 sc-eQTL 9.24e-02 0.134 0.0795 0.235 B L1
ENSG00000186056 MATN1-AS1 146066 sc-eQTL 9.01e-01 0.00774 0.0621 0.235 B L1
ENSG00000287510 AL137857.1 132877 sc-eQTL 3.12e-01 -0.0744 0.0734 0.235 B L1
ENSG00000060688 SNRNP40 -432218 sc-eQTL 2.67e-01 -0.0914 0.0821 0.235 CD4T L1
ENSG00000121766 ZCCHC17 -432412 sc-eQTL 4.85e-01 -0.0449 0.0643 0.235 CD4T L1
ENSG00000134644 PUM1 -201421 sc-eQTL 6.21e-01 0.0283 0.0573 0.235 CD4T L1
ENSG00000162511 LAPTM5 106796 sc-eQTL 8.22e-01 0.0143 0.0635 0.235 CD4T L1
ENSG00000162517 PEF1 -780326 sc-eQTL 4.32e-01 0.0522 0.0663 0.235 CD4T L1
ENSG00000186056 MATN1-AS1 146066 sc-eQTL 6.54e-01 -0.0255 0.0568 0.235 CD4T L1
ENSG00000287510 AL137857.1 132877 sc-eQTL 6.65e-01 -0.0295 0.068 0.235 CD4T L1
ENSG00000060688 SNRNP40 -432218 sc-eQTL 5.14e-01 -0.0721 0.11 0.235 CD8T L1
ENSG00000121766 ZCCHC17 -432412 sc-eQTL 7.69e-01 -0.0216 0.0734 0.235 CD8T L1
ENSG00000134644 PUM1 -201421 sc-eQTL 8.38e-03 0.169 0.0635 0.235 CD8T L1
ENSG00000162511 LAPTM5 106796 sc-eQTL 8.46e-01 -0.0122 0.0627 0.235 CD8T L1
ENSG00000162517 PEF1 -780326 sc-eQTL 8.17e-01 0.0179 0.0773 0.235 CD8T L1
ENSG00000186056 MATN1-AS1 146066 sc-eQTL 2.90e-01 -0.0778 0.0733 0.235 CD8T L1
ENSG00000287510 AL137857.1 132877 sc-eQTL 7.96e-01 -0.0239 0.0924 0.235 CD8T L1
ENSG00000060688 SNRNP40 -432218 sc-eQTL 2.04e-01 0.126 0.0987 0.239 DC L1
ENSG00000121766 ZCCHC17 -432412 sc-eQTL 3.19e-01 0.117 0.117 0.239 DC L1
ENSG00000134644 PUM1 -201421 sc-eQTL 1.84e-01 0.122 0.0915 0.239 DC L1
ENSG00000162511 LAPTM5 106796 sc-eQTL 7.04e-02 -0.118 0.0651 0.239 DC L1
ENSG00000162517 PEF1 -780326 sc-eQTL 9.41e-01 -0.00787 0.106 0.239 DC L1
ENSG00000168528 SERINC2 -544995 sc-eQTL 8.22e-01 0.0244 0.108 0.239 DC L1
ENSG00000284543 LINC01226 -641656 sc-eQTL 3.28e-01 -0.0701 0.0715 0.239 DC L1
ENSG00000287510 AL137857.1 132877 sc-eQTL 7.95e-01 -0.027 0.104 0.239 DC L1
ENSG00000060688 SNRNP40 -432218 sc-eQTL 7.80e-01 0.0207 0.0743 0.235 Mono L1
ENSG00000121766 ZCCHC17 -432412 sc-eQTL 2.42e-01 -0.108 0.0919 0.235 Mono L1
ENSG00000134644 PUM1 -201421 sc-eQTL 5.11e-02 -0.115 0.0586 0.235 Mono L1
ENSG00000162511 LAPTM5 106796 sc-eQTL 9.02e-01 -0.00673 0.0543 0.235 Mono L1
ENSG00000162512 SDC3 -44188 sc-eQTL 4.46e-01 0.0796 0.104 0.235 Mono L1
ENSG00000162517 PEF1 -780326 sc-eQTL 7.06e-01 0.0276 0.0733 0.235 Mono L1
ENSG00000168528 SERINC2 -544995 sc-eQTL 7.52e-01 -0.0354 0.112 0.235 Mono L1
ENSG00000284543 LINC01226 -641656 sc-eQTL 9.18e-01 -0.0102 0.0987 0.235 Mono L1
ENSG00000287510 AL137857.1 132877 sc-eQTL 5.61e-01 -0.0503 0.0862 0.235 Mono L1
ENSG00000060688 SNRNP40 -432218 sc-eQTL 2.17e-01 -0.129 0.104 0.236 NK L1
ENSG00000121753 ADGRB2 -900323 sc-eQTL 8.10e-01 -0.0216 0.0897 0.236 NK L1
ENSG00000121766 ZCCHC17 -432412 sc-eQTL 6.05e-02 0.134 0.0707 0.236 NK L1
ENSG00000134644 PUM1 -201421 sc-eQTL 1.23e-01 0.115 0.0744 0.236 NK L1
ENSG00000162511 LAPTM5 106796 sc-eQTL 6.33e-01 -0.0412 0.0861 0.236 NK L1
ENSG00000162517 PEF1 -780326 sc-eQTL 2.32e-01 -0.0751 0.0626 0.236 NK L1
ENSG00000186056 MATN1-AS1 146066 sc-eQTL 4.62e-01 0.0712 0.0966 0.236 NK L1
ENSG00000287510 AL137857.1 132877 sc-eQTL 4.51e-02 -0.178 0.0885 0.236 NK L1
ENSG00000060688 SNRNP40 -432218 sc-eQTL 6.92e-01 -0.0317 0.08 0.235 Other_T L1
ENSG00000121766 ZCCHC17 -432412 sc-eQTL 2.66e-01 0.0951 0.0853 0.235 Other_T L1
ENSG00000134644 PUM1 -201421 sc-eQTL 4.23e-01 -0.0617 0.0768 0.235 Other_T L1
ENSG00000162511 LAPTM5 106796 sc-eQTL 5.84e-01 0.0346 0.063 0.235 Other_T L1
ENSG00000162517 PEF1 -780326 sc-eQTL 6.42e-01 0.0391 0.0841 0.235 Other_T L1
ENSG00000186056 MATN1-AS1 146066 sc-eQTL 7.88e-01 0.0278 0.103 0.235 Other_T L1
ENSG00000287510 AL137857.1 132877 sc-eQTL 5.43e-01 0.0655 0.107 0.235 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000060688 SNRNP40 -432218 sc-eQTL 4.58e-01 0.0918 0.123 0.24 B_Activated L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -432412 sc-eQTL 1.99e-01 -0.16 0.124 0.24 B_Activated L2
ENSG00000134644 PUM1 -201421 sc-eQTL 7.42e-03 0.307 0.113 0.24 B_Activated L2
ENSG00000162510 MATN1 140985 sc-eQTL 9.07e-01 -0.0119 0.101 0.24 B_Activated L2
ENSG00000162511 LAPTM5 106796 sc-eQTL 7.11e-01 0.0262 0.0705 0.24 B_Activated L2
ENSG00000162517 PEF1 -780326 sc-eQTL 2.56e-01 0.136 0.12 0.24 B_Activated L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 146066 sc-eQTL 5.56e-01 0.0672 0.114 0.24 B_Activated L2
ENSG00000287510 AL137857.1 132877 sc-eQTL 7.98e-01 0.0258 0.101 0.24 B_Activated L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -432218 sc-eQTL 5.72e-01 -0.0668 0.118 0.234 B_Intermediate L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -432412 sc-eQTL 4.05e-01 0.0819 0.0981 0.234 B_Intermediate L2
ENSG00000134644 PUM1 -201421 sc-eQTL 2.82e-02 0.202 0.0916 0.234 B_Intermediate L2
ENSG00000162510 MATN1 140985 sc-eQTL 9.19e-01 -0.00984 0.0965 0.234 B_Intermediate L2
ENSG00000162511 LAPTM5 106796 sc-eQTL 4.50e-02 0.118 0.0587 0.234 B_Intermediate L2
ENSG00000162517 PEF1 -780326 sc-eQTL 7.57e-01 0.034 0.11 0.234 B_Intermediate L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 146066 sc-eQTL 7.07e-01 0.0313 0.0831 0.234 B_Intermediate L2
ENSG00000287510 AL137857.1 132877 sc-eQTL 4.77e-01 -0.0662 0.0929 0.234 B_Intermediate L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -432218 sc-eQTL 9.27e-01 -0.0107 0.117 0.237 B_Memory L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -432412 sc-eQTL 7.57e-01 -0.0333 0.107 0.237 B_Memory L2
ENSG00000134644 PUM1 -201421 sc-eQTL 3.37e-01 -0.0897 0.0932 0.237 B_Memory L2
ENSG00000162510 MATN1 140985 sc-eQTL 3.69e-01 0.0804 0.0892 0.237 B_Memory L2
ENSG00000162511 LAPTM5 106796 sc-eQTL 3.46e-02 0.167 0.0784 0.237 B_Memory L2
ENSG00000162517 PEF1 -780326 sc-eQTL 7.15e-01 0.0387 0.106 0.237 B_Memory L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 146066 sc-eQTL 4.28e-01 0.072 0.0906 0.237 B_Memory L2
ENSG00000287510 AL137857.1 132877 sc-eQTL 7.99e-01 0.027 0.106 0.237 B_Memory L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -432218 sc-eQTL 3.24e-02 -0.223 0.104 0.235 B_Naive1 L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -432412 sc-eQTL 6.56e-01 -0.0403 0.0904 0.235 B_Naive1 L2
ENSG00000134644 PUM1 -201421 sc-eQTL 5.57e-01 0.0469 0.0797 0.235 B_Naive1 L2
ENSG00000162510 MATN1 140985 sc-eQTL 3.20e-02 -0.173 0.0801 0.235 B_Naive1 L2
ENSG00000162511 LAPTM5 106796 sc-eQTL 4.55e-01 0.0404 0.054 0.235 B_Naive1 L2
ENSG00000162517 PEF1 -780326 sc-eQTL 5.79e-01 -0.0529 0.0953 0.235 B_Naive1 L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 146066 sc-eQTL 4.95e-01 -0.0485 0.071 0.235 B_Naive1 L2
ENSG00000287510 AL137857.1 132877 sc-eQTL 2.33e-01 -0.105 0.0874 0.235 B_Naive1 L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -432218 sc-eQTL 6.55e-01 0.0508 0.113 0.236 B_Naive2 L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -432412 sc-eQTL 7.14e-01 0.0343 0.0937 0.236 B_Naive2 L2
ENSG00000134644 PUM1 -201421 sc-eQTL 3.81e-01 0.0804 0.0915 0.236 B_Naive2 L2
ENSG00000162510 MATN1 140985 sc-eQTL 9.32e-01 0.00755 0.088 0.236 B_Naive2 L2
ENSG00000162511 LAPTM5 106796 sc-eQTL 2.26e-01 0.0723 0.0596 0.236 B_Naive2 L2
ENSG00000162517 PEF1 -780326 sc-eQTL 6.29e-02 0.202 0.108 0.236 B_Naive2 L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 146066 sc-eQTL 9.25e-01 -0.00823 0.087 0.236 B_Naive2 L2
ENSG00000287510 AL137857.1 132877 sc-eQTL 2.15e-01 -0.117 0.0937 0.236 B_Naive2 L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -432218 sc-eQTL 4.68e-01 0.0818 0.112 0.23 CD4_CTL L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -432412 sc-eQTL 4.32e-01 0.0871 0.111 0.23 CD4_CTL L2
ENSG00000134644 PUM1 -201421 sc-eQTL 1.48e-01 0.157 0.108 0.23 CD4_CTL L2
ENSG00000162511 LAPTM5 106796 sc-eQTL 8.04e-01 0.024 0.0968 0.23 CD4_CTL L2
ENSG00000162517 PEF1 -780326 sc-eQTL 2.74e-01 0.108 0.099 0.23 CD4_CTL L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 146066 sc-eQTL 9.18e-01 0.0109 0.106 0.23 CD4_CTL L2
ENSG00000287510 AL137857.1 132877 sc-eQTL 2.47e-01 -0.108 0.0931 0.23 CD4_CTL L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -432218 sc-eQTL 9.55e-01 -0.0049 0.0861 0.235 CD4_Naive L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -432412 sc-eQTL 2.24e-01 -0.0928 0.0761 0.235 CD4_Naive L2
ENSG00000134644 PUM1 -201421 sc-eQTL 4.96e-01 0.0416 0.0609 0.235 CD4_Naive L2
ENSG00000162511 LAPTM5 106796 sc-eQTL 8.75e-01 -0.0103 0.0653 0.235 CD4_Naive L2
ENSG00000162517 PEF1 -780326 sc-eQTL 4.34e-01 0.0561 0.0715 0.235 CD4_Naive L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 146066 sc-eQTL 9.91e-01 -0.000766 0.0663 0.235 CD4_Naive L2
ENSG00000287510 AL137857.1 132877 sc-eQTL 9.23e-01 0.00736 0.0761 0.235 CD4_Naive L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -432218 sc-eQTL 3.89e-02 -0.223 0.107 0.235 CD4_TCM L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -432412 sc-eQTL 6.29e-01 -0.0422 0.0872 0.235 CD4_TCM L2
ENSG00000134644 PUM1 -201421 sc-eQTL 4.91e-01 -0.0532 0.0771 0.235 CD4_TCM L2
ENSG00000162511 LAPTM5 106796 sc-eQTL 2.44e-01 0.0746 0.0639 0.235 CD4_TCM L2
ENSG00000162517 PEF1 -780326 sc-eQTL 6.27e-01 -0.0418 0.0858 0.235 CD4_TCM L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 146066 sc-eQTL 3.70e-01 -0.0729 0.0811 0.235 CD4_TCM L2
ENSG00000287510 AL137857.1 132877 sc-eQTL 2.21e-01 -0.111 0.0902 0.235 CD4_TCM L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -432218 sc-eQTL 8.34e-01 -0.0229 0.109 0.235 CD4_TEM L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -432412 sc-eQTL 5.99e-02 0.195 0.103 0.235 CD4_TEM L2
ENSG00000134644 PUM1 -201421 sc-eQTL 8.07e-01 -0.0212 0.0867 0.235 CD4_TEM L2
ENSG00000162511 LAPTM5 106796 sc-eQTL 6.93e-01 0.0347 0.0877 0.235 CD4_TEM L2
ENSG00000162517 PEF1 -780326 sc-eQTL 9.56e-01 -0.0054 0.0982 0.235 CD4_TEM L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 146066 sc-eQTL 7.92e-01 -0.0271 0.103 0.235 CD4_TEM L2
ENSG00000287510 AL137857.1 132877 sc-eQTL 7.57e-01 0.0314 0.101 0.235 CD4_TEM L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -432218 sc-eQTL 4.78e-01 -0.0844 0.119 0.235 CD8_CTL L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -432412 sc-eQTL 8.93e-01 -0.0123 0.0912 0.235 CD8_CTL L2
ENSG00000134644 PUM1 -201421 sc-eQTL 8.56e-01 0.0161 0.0885 0.235 CD8_CTL L2
ENSG00000162511 LAPTM5 106796 sc-eQTL 4.51e-01 -0.0739 0.0979 0.235 CD8_CTL L2
ENSG00000162517 PEF1 -780326 sc-eQTL 7.21e-01 0.0305 0.0854 0.235 CD8_CTL L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 146066 sc-eQTL 4.39e-01 -0.0799 0.103 0.235 CD8_CTL L2
ENSG00000287510 AL137857.1 132877 sc-eQTL 8.33e-01 -0.0205 0.0969 0.235 CD8_CTL L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -432218 sc-eQTL 8.41e-01 -0.0218 0.109 0.235 CD8_Naive L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -432412 sc-eQTL 7.44e-01 0.0307 0.0938 0.235 CD8_Naive L2
ENSG00000134644 PUM1 -201421 sc-eQTL 9.85e-03 0.194 0.0743 0.235 CD8_Naive L2
ENSG00000162511 LAPTM5 106796 sc-eQTL 3.42e-01 0.0687 0.0722 0.235 CD8_Naive L2
ENSG00000162517 PEF1 -780326 sc-eQTL 3.49e-01 -0.0941 0.1 0.235 CD8_Naive L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 146066 sc-eQTL 7.30e-01 0.0312 0.0903 0.235 CD8_Naive L2
ENSG00000287510 AL137857.1 132877 sc-eQTL 5.65e-01 -0.0567 0.0982 0.235 CD8_Naive L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -432218 sc-eQTL 2.18e-01 -0.154 0.125 0.231 CD8_TCM L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -432412 sc-eQTL 9.95e-01 0.000731 0.115 0.231 CD8_TCM L2
ENSG00000134644 PUM1 -201421 sc-eQTL 2.35e-01 -0.128 0.108 0.231 CD8_TCM L2
ENSG00000162511 LAPTM5 106796 sc-eQTL 2.35e-01 -0.134 0.113 0.231 CD8_TCM L2
ENSG00000162517 PEF1 -780326 sc-eQTL 7.08e-01 0.0433 0.115 0.231 CD8_TCM L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 146066 sc-eQTL 9.86e-01 -0.00185 0.105 0.231 CD8_TCM L2
ENSG00000287510 AL137857.1 132877 sc-eQTL 4.87e-01 -0.0735 0.106 0.231 CD8_TCM L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -432218 sc-eQTL 3.09e-01 0.115 0.113 0.233 CD8_TEM L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -432412 sc-eQTL 2.06e-01 0.137 0.108 0.233 CD8_TEM L2
ENSG00000134644 PUM1 -201421 sc-eQTL 4.00e-01 -0.0932 0.11 0.233 CD8_TEM L2
ENSG00000162511 LAPTM5 106796 sc-eQTL 6.67e-01 0.0448 0.104 0.233 CD8_TEM L2
ENSG00000162517 PEF1 -780326 sc-eQTL 7.71e-02 0.173 0.0972 0.233 CD8_TEM L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 146066 sc-eQTL 7.61e-01 -0.0329 0.108 0.233 CD8_TEM L2
ENSG00000287510 AL137857.1 132877 sc-eQTL 6.26e-01 0.0477 0.0977 0.233 CD8_TEM L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -432218 sc-eQTL 7.11e-01 0.0437 0.118 0.236 MAIT L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -432412 sc-eQTL 4.79e-01 -0.074 0.104 0.236 MAIT L2
ENSG00000134644 PUM1 -201421 sc-eQTL 6.65e-01 -0.0434 0.1 0.236 MAIT L2
ENSG00000162511 LAPTM5 106796 sc-eQTL 7.27e-01 -0.033 0.0944 0.236 MAIT L2
ENSG00000162517 PEF1 -780326 sc-eQTL 3.38e-01 0.0995 0.104 0.236 MAIT L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 146066 sc-eQTL 1.48e-01 -0.152 0.105 0.236 MAIT L2
ENSG00000287510 AL137857.1 132877 sc-eQTL 8.86e-01 0.0156 0.108 0.236 MAIT L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -432218 sc-eQTL 7.03e-01 0.0444 0.116 0.233 NK_CD56bright L2
ENSG00000121753 ADGRB2 -900323 sc-eQTL 2.57e-01 0.103 0.0906 0.233 NK_CD56bright L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -432412 sc-eQTL 1.24e-01 0.151 0.0976 0.233 NK_CD56bright L2
ENSG00000134644 PUM1 -201421 sc-eQTL 2.63e-01 -0.115 0.103 0.233 NK_CD56bright L2
ENSG00000162511 LAPTM5 106796 sc-eQTL 8.48e-01 -0.0195 0.102 0.233 NK_CD56bright L2
ENSG00000162517 PEF1 -780326 sc-eQTL 2.08e-01 -0.124 0.0984 0.233 NK_CD56bright L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 146066 sc-eQTL 1.09e-01 0.164 0.101 0.233 NK_CD56bright L2
ENSG00000287510 AL137857.1 132877 sc-eQTL 7.86e-01 0.0274 0.101 0.233 NK_CD56bright L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -432218 sc-eQTL 2.82e-01 -0.118 0.11 0.235 NK_CD56dim L2
ENSG00000121753 ADGRB2 -900323 sc-eQTL 8.81e-01 -0.0145 0.0967 0.235 NK_CD56dim L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -432412 sc-eQTL 1.79e-01 0.109 0.081 0.235 NK_CD56dim L2
ENSG00000134644 PUM1 -201421 sc-eQTL 9.43e-01 -0.00597 0.0834 0.235 NK_CD56dim L2
ENSG00000162511 LAPTM5 106796 sc-eQTL 8.09e-01 -0.0216 0.0889 0.235 NK_CD56dim L2
ENSG00000162517 PEF1 -780326 sc-eQTL 3.62e-01 -0.0721 0.079 0.235 NK_CD56dim L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 146066 sc-eQTL 7.48e-01 0.0358 0.111 0.235 NK_CD56dim L2
ENSG00000287510 AL137857.1 132877 sc-eQTL 7.63e-02 -0.163 0.0913 0.235 NK_CD56dim L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -432218 sc-eQTL 3.62e-01 -0.106 0.116 0.242 NK_HLA L2
ENSG00000121753 ADGRB2 -900323 sc-eQTL 9.07e-01 -0.0107 0.0919 0.242 NK_HLA L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -432412 sc-eQTL 7.98e-01 0.0264 0.103 0.242 NK_HLA L2
ENSG00000134644 PUM1 -201421 sc-eQTL 2.53e-01 0.115 0.1 0.242 NK_HLA L2
ENSG00000162511 LAPTM5 106796 sc-eQTL 6.33e-01 -0.046 0.0961 0.242 NK_HLA L2
ENSG00000162517 PEF1 -780326 sc-eQTL 2.01e-01 0.138 0.108 0.242 NK_HLA L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 146066 sc-eQTL 1.79e-01 -0.137 0.102 0.242 NK_HLA L2
ENSG00000287510 AL137857.1 132877 sc-eQTL 5.89e-04 -0.335 0.0959 0.242 NK_HLA L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -432218 sc-eQTL 5.42e-01 -0.0654 0.107 0.235 NK_cytokine L2
ENSG00000121753 ADGRB2 -900323 sc-eQTL 7.01e-01 -0.0372 0.0968 0.235 NK_cytokine L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -432412 sc-eQTL 4.36e-01 0.0653 0.0836 0.235 NK_cytokine L2
ENSG00000134644 PUM1 -201421 sc-eQTL 1.13e-02 0.228 0.0891 0.235 NK_cytokine L2
ENSG00000162511 LAPTM5 106796 sc-eQTL 7.75e-01 -0.0285 0.0996 0.235 NK_cytokine L2
ENSG00000162517 PEF1 -780326 sc-eQTL 5.77e-01 -0.0474 0.0848 0.235 NK_cytokine L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 146066 sc-eQTL 3.30e-01 0.103 0.105 0.235 NK_cytokine L2
ENSG00000287510 AL137857.1 132877 sc-eQTL 4.52e-01 -0.0739 0.0981 0.235 NK_cytokine L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -432218 sc-eQTL 5.40e-01 0.0772 0.126 0.23 PB L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -432412 sc-eQTL 8.35e-01 -0.0306 0.146 0.23 PB L2
ENSG00000134644 PUM1 -201421 sc-eQTL 3.14e-01 0.128 0.126 0.23 PB L2
ENSG00000162510 MATN1 140985 sc-eQTL 7.29e-01 0.0411 0.118 0.23 PB L2
ENSG00000162511 LAPTM5 106796 sc-eQTL 5.30e-01 0.0532 0.0844 0.23 PB L2
ENSG00000162517 PEF1 -780326 sc-eQTL 9.95e-01 0.000859 0.13 0.23 PB L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 146066 sc-eQTL 6.99e-01 0.0449 0.116 0.23 PB L2
ENSG00000287510 AL137857.1 132877 sc-eQTL 8.96e-01 0.0161 0.123 0.23 PB L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -432218 sc-eQTL 2.69e-01 -0.0935 0.0844 0.235 Pro_T L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -432412 sc-eQTL 5.88e-01 0.0583 0.107 0.235 Pro_T L2
ENSG00000134644 PUM1 -201421 sc-eQTL 7.61e-01 -0.0306 0.1 0.235 Pro_T L2
ENSG00000162511 LAPTM5 106796 sc-eQTL 6.13e-01 0.0364 0.0718 0.235 Pro_T L2
ENSG00000162517 PEF1 -780326 sc-eQTL 7.00e-01 0.0407 0.105 0.235 Pro_T L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 146066 sc-eQTL 1.17e-01 0.157 0.0998 0.235 Pro_T L2
ENSG00000287510 AL137857.1 132877 sc-eQTL 9.32e-01 -0.00795 0.0924 0.235 Pro_T L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -432218 sc-eQTL 7.00e-01 0.0433 0.112 0.235 Treg L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -432412 sc-eQTL 9.73e-01 -0.00365 0.109 0.235 Treg L2
ENSG00000134644 PUM1 -201421 sc-eQTL 2.45e-01 0.101 0.0868 0.235 Treg L2
ENSG00000162511 LAPTM5 106796 sc-eQTL 7.54e-01 0.0312 0.0996 0.235 Treg L2
ENSG00000162517 PEF1 -780326 sc-eQTL 5.17e-01 -0.0698 0.108 0.235 Treg L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 146066 sc-eQTL 3.25e-02 -0.216 0.1 0.235 Treg L2
ENSG00000287510 AL137857.1 132877 sc-eQTL 8.57e-01 -0.0184 0.101 0.235 Treg L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -432218 sc-eQTL 1.68e-01 0.159 0.115 0.232 cDC L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -432412 sc-eQTL 8.12e-01 -0.0299 0.125 0.232 cDC L2
ENSG00000134644 PUM1 -201421 sc-eQTL 6.08e-01 0.0552 0.107 0.232 cDC L2
ENSG00000162511 LAPTM5 106796 sc-eQTL 7.85e-01 -0.0206 0.0754 0.232 cDC L2
ENSG00000162517 PEF1 -780326 sc-eQTL 4.42e-01 0.0839 0.109 0.232 cDC L2
ENSG00000168528 SERINC2 -544995 sc-eQTL 9.91e-01 0.00111 0.0968 0.232 cDC L2
ENSG00000284543 LINC01226 -641656 sc-eQTL 8.55e-01 -0.0174 0.0951 0.232 cDC L2
ENSG00000287510 AL137857.1 132877 sc-eQTL 3.10e-01 -0.104 0.102 0.232 cDC L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -432218 sc-eQTL 4.44e-01 -0.0682 0.089 0.235 cMono_IL1B L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -432412 sc-eQTL 9.06e-01 0.0117 0.0994 0.235 cMono_IL1B L2
ENSG00000134644 PUM1 -201421 sc-eQTL 2.15e-02 -0.154 0.0664 0.235 cMono_IL1B L2
ENSG00000162511 LAPTM5 106796 sc-eQTL 7.31e-01 -0.0203 0.059 0.235 cMono_IL1B L2
ENSG00000162512 SDC3 -44188 sc-eQTL 1.59e-01 0.156 0.111 0.235 cMono_IL1B L2
ENSG00000162517 PEF1 -780326 sc-eQTL 5.47e-01 0.0547 0.0908 0.235 cMono_IL1B L2
ENSG00000168528 SERINC2 -544995 sc-eQTL 7.67e-01 -0.0333 0.113 0.235 cMono_IL1B L2
ENSG00000284543 LINC01226 -641656 sc-eQTL 9.62e-01 0.00471 0.0995 0.235 cMono_IL1B L2
ENSG00000287510 AL137857.1 132877 sc-eQTL 2.05e-01 -0.118 0.0925 0.235 cMono_IL1B L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -432218 sc-eQTL 6.85e-01 0.0386 0.0948 0.235 cMono_S100A L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -432412 sc-eQTL 2.48e-01 -0.129 0.112 0.235 cMono_S100A L2
ENSG00000134644 PUM1 -201421 sc-eQTL 8.58e-02 -0.139 0.0804 0.235 cMono_S100A L2
ENSG00000162511 LAPTM5 106796 sc-eQTL 9.89e-01 0.000863 0.0623 0.235 cMono_S100A L2
ENSG00000162512 SDC3 -44188 sc-eQTL 2.15e-01 0.133 0.107 0.235 cMono_S100A L2
ENSG00000162517 PEF1 -780326 sc-eQTL 5.34e-02 0.187 0.0962 0.235 cMono_S100A L2
ENSG00000168528 SERINC2 -544995 sc-eQTL 6.08e-01 -0.0584 0.114 0.235 cMono_S100A L2
ENSG00000284543 LINC01226 -641656 sc-eQTL 5.32e-01 0.0578 0.0924 0.235 cMono_S100A L2
ENSG00000287510 AL137857.1 132877 sc-eQTL 4.40e-01 0.0717 0.0927 0.235 cMono_S100A L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -432218 sc-eQTL 3.69e-01 0.133 0.147 0.221 gdT L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -432412 sc-eQTL 4.95e-01 0.0866 0.127 0.221 gdT L2
ENSG00000134644 PUM1 -201421 sc-eQTL 6.26e-01 0.0639 0.131 0.221 gdT L2
ENSG00000162511 LAPTM5 106796 sc-eQTL 4.32e-01 0.112 0.142 0.221 gdT L2
ENSG00000162517 PEF1 -780326 sc-eQTL 3.16e-01 0.13 0.13 0.221 gdT L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 146066 sc-eQTL 4.93e-01 0.09 0.131 0.221 gdT L2
ENSG00000287510 AL137857.1 132877 sc-eQTL 3.95e-01 0.108 0.127 0.221 gdT L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -432218 sc-eQTL 6.99e-01 0.0412 0.106 0.233 intMono L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -432412 sc-eQTL 1.43e-01 -0.167 0.114 0.233 intMono L2
ENSG00000134644 PUM1 -201421 sc-eQTL 6.86e-01 -0.0393 0.097 0.233 intMono L2
ENSG00000162511 LAPTM5 106796 sc-eQTL 6.51e-01 -0.0345 0.0761 0.233 intMono L2
ENSG00000162512 SDC3 -44188 sc-eQTL 2.37e-01 -0.123 0.104 0.233 intMono L2
ENSG00000162517 PEF1 -780326 sc-eQTL 1.39e-02 -0.268 0.108 0.233 intMono L2
ENSG00000168528 SERINC2 -544995 sc-eQTL 8.07e-01 -0.0267 0.109 0.233 intMono L2
ENSG00000284543 LINC01226 -641656 sc-eQTL 1.99e-01 0.133 0.103 0.233 intMono L2
ENSG00000287510 AL137857.1 132877 sc-eQTL 1.20e-01 -0.16 0.103 0.233 intMono L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -432218 sc-eQTL 7.11e-01 -0.0363 0.0979 0.235 ncMono L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -432412 sc-eQTL 5.88e-01 -0.0566 0.104 0.235 ncMono L2
ENSG00000134644 PUM1 -201421 sc-eQTL 4.18e-01 0.0691 0.0852 0.235 ncMono L2
ENSG00000162511 LAPTM5 106796 sc-eQTL 3.76e-01 -0.0686 0.0773 0.235 ncMono L2
ENSG00000162512 SDC3 -44188 sc-eQTL 7.74e-01 -0.025 0.0869 0.235 ncMono L2
ENSG00000162517 PEF1 -780326 sc-eQTL 8.08e-01 -0.0243 0.0996 0.235 ncMono L2
ENSG00000168528 SERINC2 -544995 sc-eQTL 7.66e-01 0.0283 0.0948 0.235 ncMono L2
ENSG00000284543 LINC01226 -641656 sc-eQTL 9.09e-01 -0.0108 0.0947 0.235 ncMono L2
ENSG00000287510 AL137857.1 132877 sc-eQTL 5.21e-01 -0.0631 0.0981 0.235 ncMono L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -432218 sc-eQTL 6.17e-01 0.0597 0.119 0.226 pDC L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -432412 sc-eQTL 9.88e-01 -0.00198 0.131 0.226 pDC L2
ENSG00000134644 PUM1 -201421 sc-eQTL 8.59e-01 -0.0192 0.108 0.226 pDC L2
ENSG00000162511 LAPTM5 106796 sc-eQTL 9.78e-01 0.00274 0.101 0.226 pDC L2
ENSG00000162517 PEF1 -780326 sc-eQTL 9.84e-01 0.00262 0.131 0.226 pDC L2
ENSG00000168528 SERINC2 -544995 sc-eQTL 3.10e-01 0.124 0.122 0.226 pDC L2
ENSG00000284543 LINC01226 -641656 sc-eQTL 9.68e-01 0.00383 0.0949 0.226 pDC L2
ENSG00000287510 AL137857.1 132877 sc-eQTL 7.22e-01 -0.0398 0.112 0.226 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000060688 SNRNP40 -432218 sc-eQTL 8.32e-01 -0.0239 0.113 0.235 B_Memory LOneK1K
ENSG00000121766 ZCCHC17 -432412 sc-eQTL 6.91e-01 0.0374 0.0939 0.235 B_Memory LOneK1K
ENSG00000134644 PUM1 -201421 sc-eQTL 4.62e-02 0.165 0.0825 0.235 B_Memory LOneK1K
ENSG00000162510 MATN1 140985 sc-eQTL 4.11e-01 0.0781 0.0948 0.235 B_Memory LOneK1K
ENSG00000162511 LAPTM5 106796 sc-eQTL 3.70e-02 0.124 0.059 0.235 B_Memory LOneK1K
ENSG00000162517 PEF1 -780326 sc-eQTL 2.12e-01 0.123 0.0985 0.235 B_Memory LOneK1K
ENSG00000186056 MATN1-AS1 146066 sc-eQTL 7.27e-01 0.0275 0.0789 0.235 B_Memory LOneK1K
ENSG00000287510 AL137857.1 132877 sc-eQTL 9.14e-01 -0.00934 0.086 0.235 B_Memory LOneK1K
ENSG00000060688 SNRNP40 -432218 sc-eQTL 1.12e-01 -0.162 0.102 0.235 B_Naive LOneK1K
ENSG00000121766 ZCCHC17 -432412 sc-eQTL 6.76e-01 -0.0338 0.0808 0.235 B_Naive LOneK1K
ENSG00000134644 PUM1 -201421 sc-eQTL 4.02e-01 0.0642 0.0764 0.235 B_Naive LOneK1K
ENSG00000162510 MATN1 140985 sc-eQTL 9.90e-02 -0.121 0.0732 0.235 B_Naive LOneK1K
ENSG00000162511 LAPTM5 106796 sc-eQTL 4.31e-01 0.0409 0.0518 0.235 B_Naive LOneK1K
ENSG00000162517 PEF1 -780326 sc-eQTL 6.03e-01 0.0493 0.0946 0.235 B_Naive LOneK1K
ENSG00000186056 MATN1-AS1 146066 sc-eQTL 4.61e-01 -0.0494 0.0669 0.235 B_Naive LOneK1K
ENSG00000287510 AL137857.1 132877 sc-eQTL 1.79e-01 -0.107 0.0792 0.235 B_Naive LOneK1K
ENSG00000060688 SNRNP40 -432218 sc-eQTL 7.27e-01 -0.0297 0.0849 0.235 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000121766 ZCCHC17 -432412 sc-eQTL 5.31e-01 -0.0603 0.0961 0.235 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000134644 PUM1 -201421 sc-eQTL 1.63e-02 -0.147 0.0605 0.235 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000162511 LAPTM5 106796 sc-eQTL 9.21e-01 -0.00536 0.054 0.235 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000162512 SDC3 -44188 sc-eQTL 2.96e-02 0.238 0.109 0.235 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000162517 PEF1 -780326 sc-eQTL 1.24e-01 0.119 0.077 0.235 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000168528 SERINC2 -544995 sc-eQTL 7.15e-01 -0.0414 0.113 0.235 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000284543 LINC01226 -641656 sc-eQTL 8.58e-01 -0.0166 0.0928 0.235 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000287510 AL137857.1 132877 sc-eQTL 5.66e-01 -0.0499 0.0868 0.235 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000060688 SNRNP40 -432218 sc-eQTL 9.31e-01 -0.0081 0.0929 0.237 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000121766 ZCCHC17 -432412 sc-eQTL 1.03e-01 -0.166 0.101 0.237 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000134644 PUM1 -201421 sc-eQTL 4.48e-01 0.0632 0.0832 0.237 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000162511 LAPTM5 106796 sc-eQTL 7.09e-01 -0.0249 0.0666 0.237 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000162512 SDC3 -44188 sc-eQTL 5.27e-01 -0.0616 0.0973 0.237 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000162517 PEF1 -780326 sc-eQTL 5.66e-02 -0.168 0.0877 0.237 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000168528 SERINC2 -544995 sc-eQTL 8.22e-01 0.0227 0.101 0.237 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000284543 LINC01226 -641656 sc-eQTL 7.37e-01 0.0322 0.0958 0.237 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000287510 AL137857.1 132877 sc-eQTL 3.39e-01 -0.0918 0.0957 0.237 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000060688 SNRNP40 -432218 sc-eQTL 1.99e-01 -0.134 0.104 0.235 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000121753 ADGRB2 -900323 sc-eQTL 7.08e-01 -0.0335 0.0891 0.235 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000121766 ZCCHC17 -432412 sc-eQTL 1.88e-01 0.094 0.0712 0.235 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000134644 PUM1 -201421 sc-eQTL 1.08e-01 0.126 0.0778 0.235 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000162511 LAPTM5 106796 sc-eQTL 7.10e-01 -0.0326 0.0875 0.235 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000162517 PEF1 -780326 sc-eQTL 3.52e-01 -0.0619 0.0663 0.235 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000186056 MATN1-AS1 146066 sc-eQTL 7.38e-01 0.0338 0.101 0.235 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000287510 AL137857.1 132877 sc-eQTL 3.65e-02 -0.181 0.0862 0.235 NK_CD56dim LOneK1K

Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF
ENSG00000168528 SERINC2 -544995 eQTL 0.00304 0.134 0.045 0.0 0.0 0.231

Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina
ENSG00000121753 \N -900323 2.67e-07 1.16e-07 3.54e-08 1.82e-07 8.92e-08 9.71e-08 1.42e-07 5.33e-08 1.41e-07 4.74e-08 1.6e-07 8.36e-08 1.41e-07 6.38e-08 5.84e-08 7.17e-08 3.88e-08 1.18e-07 5.36e-08 4.21e-08 1.04e-07 1.26e-07 1.34e-07 3.79e-08 1.37e-07 1.14e-07 1.08e-07 9.57e-08 1.05e-07 1.1e-07 9.64e-08 3.87e-08 3.16e-08 8.49e-08 8.82e-08 3.94e-08 5.02e-08 9.62e-08 6.55e-08 3.87e-08 5.42e-08 1.33e-07 4.04e-08 3.33e-08 5.75e-08 1.99e-08 1.23e-07 3.83e-09 4.79e-08
ENSG00000168528 SERINC2 -544995 3.27e-07 1.76e-07 6.41e-08 2.44e-07 1.03e-07 8.89e-08 2.5e-07 5.62e-08 1.89e-07 1.11e-07 2.07e-07 1.52e-07 2.55e-07 8.66e-08 6.12e-08 9.6e-08 4.25e-08 1.91e-07 7.42e-08 6.03e-08 1.27e-07 1.76e-07 1.89e-07 4.37e-08 2.74e-07 1.31e-07 1.31e-07 1.47e-07 1.34e-07 1.58e-07 1.43e-07 4.58e-08 4.27e-08 9.72e-08 5.16e-08 3.57e-08 6.24e-08 7.51e-08 5.27e-08 8.06e-08 3.27e-08 2.6e-07 4.83e-08 1.09e-08 3.34e-08 9.65e-09 7.97e-08 0.0 4.47e-08