logo

Genes within 1Mb (chr1:30863484:A:T):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD

Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000060688 SNRNP40 -433304 sc-eQTL 4.11e-01 -0.135 0.164 0.058 B L1
ENSG00000121766 ZCCHC17 -433498 sc-eQTL 5.26e-01 0.0837 0.132 0.058 B L1
ENSG00000134644 PUM1 -202507 sc-eQTL 3.96e-01 0.0939 0.11 0.058 B L1
ENSG00000162510 MATN1 139899 sc-eQTL 5.85e-01 0.0636 0.116 0.058 B L1
ENSG00000162511 LAPTM5 105710 sc-eQTL 1.18e-01 -0.142 0.0905 0.058 B L1
ENSG00000162517 PEF1 -781412 sc-eQTL 6.42e-01 -0.064 0.137 0.058 B L1
ENSG00000186056 MATN1-AS1 144980 sc-eQTL 1.28e-01 -0.162 0.106 0.058 B L1
ENSG00000287510 AL137857.1 131791 sc-eQTL 5.31e-01 -0.0793 0.126 0.058 B L1
ENSG00000060688 SNRNP40 -433304 sc-eQTL 8.21e-01 0.0323 0.142 0.058 CD4T L1
ENSG00000121766 ZCCHC17 -433498 sc-eQTL 1.44e-01 0.162 0.11 0.058 CD4T L1
ENSG00000134644 PUM1 -202507 sc-eQTL 8.33e-01 -0.0208 0.0988 0.058 CD4T L1
ENSG00000162511 LAPTM5 105710 sc-eQTL 1.15e-01 -0.172 0.109 0.058 CD4T L1
ENSG00000162517 PEF1 -781412 sc-eQTL 6.33e-01 0.0547 0.114 0.058 CD4T L1
ENSG00000186056 MATN1-AS1 144980 sc-eQTL 3.47e-01 -0.0922 0.0977 0.058 CD4T L1
ENSG00000287510 AL137857.1 131791 sc-eQTL 5.21e-01 -0.0753 0.117 0.058 CD4T L1
ENSG00000060688 SNRNP40 -433304 sc-eQTL 1.30e-01 -0.28 0.185 0.058 CD8T L1
ENSG00000121766 ZCCHC17 -433498 sc-eQTL 1.49e-01 -0.178 0.123 0.058 CD8T L1
ENSG00000134644 PUM1 -202507 sc-eQTL 5.10e-01 -0.0717 0.109 0.058 CD8T L1
ENSG00000162511 LAPTM5 105710 sc-eQTL 1.45e-01 -0.154 0.105 0.058 CD8T L1
ENSG00000162517 PEF1 -781412 sc-eQTL 9.08e-01 -0.015 0.13 0.058 CD8T L1
ENSG00000186056 MATN1-AS1 144980 sc-eQTL 8.87e-01 0.0177 0.124 0.058 CD8T L1
ENSG00000287510 AL137857.1 131791 sc-eQTL 6.39e-01 -0.0731 0.156 0.058 CD8T L1
ENSG00000060688 SNRNP40 -433304 sc-eQTL 6.46e-01 -0.0781 0.17 0.054 DC L1
ENSG00000121766 ZCCHC17 -433498 sc-eQTL 1.17e-01 0.315 0.2 0.054 DC L1
ENSG00000134644 PUM1 -202507 sc-eQTL 7.16e-01 0.0574 0.157 0.054 DC L1
ENSG00000162511 LAPTM5 105710 sc-eQTL 2.05e-01 0.143 0.112 0.054 DC L1
ENSG00000162517 PEF1 -781412 sc-eQTL 6.61e-01 0.08 0.182 0.054 DC L1
ENSG00000168528 SERINC2 -546081 sc-eQTL 4.61e-01 -0.137 0.185 0.054 DC L1
ENSG00000284543 LINC01226 -642742 sc-eQTL 3.34e-01 0.119 0.123 0.054 DC L1
ENSG00000287510 AL137857.1 131791 sc-eQTL 3.14e-01 -0.179 0.177 0.054 DC L1
ENSG00000060688 SNRNP40 -433304 sc-eQTL 7.23e-01 -0.046 0.13 0.058 Mono L1
ENSG00000121766 ZCCHC17 -433498 sc-eQTL 2.87e-01 -0.171 0.16 0.058 Mono L1
ENSG00000134644 PUM1 -202507 sc-eQTL 5.07e-01 0.0684 0.103 0.058 Mono L1
ENSG00000162511 LAPTM5 105710 sc-eQTL 7.21e-01 -0.0339 0.0947 0.058 Mono L1
ENSG00000162512 SDC3 -45274 sc-eQTL 1.45e-01 -0.265 0.181 0.058 Mono L1
ENSG00000162517 PEF1 -781412 sc-eQTL 8.51e-01 0.024 0.128 0.058 Mono L1
ENSG00000168528 SERINC2 -546081 sc-eQTL 7.34e-01 -0.0665 0.195 0.058 Mono L1
ENSG00000284543 LINC01226 -642742 sc-eQTL 8.73e-01 0.0276 0.172 0.058 Mono L1
ENSG00000287510 AL137857.1 131791 sc-eQTL 8.21e-01 0.0341 0.15 0.058 Mono L1
ENSG00000060688 SNRNP40 -433304 sc-eQTL 2.80e-01 0.194 0.179 0.056 NK L1
ENSG00000121753 ADGRB2 -901409 sc-eQTL 6.20e-01 0.0769 0.155 0.056 NK L1
ENSG00000121766 ZCCHC17 -433498 sc-eQTL 7.68e-01 -0.0363 0.123 0.056 NK L1
ENSG00000134644 PUM1 -202507 sc-eQTL 7.25e-01 0.0456 0.129 0.056 NK L1
ENSG00000162511 LAPTM5 105710 sc-eQTL 6.67e-01 -0.0641 0.149 0.056 NK L1
ENSG00000162517 PEF1 -781412 sc-eQTL 8.53e-01 -0.0201 0.109 0.056 NK L1
ENSG00000186056 MATN1-AS1 144980 sc-eQTL 2.69e-01 -0.185 0.167 0.056 NK L1
ENSG00000287510 AL137857.1 131791 sc-eQTL 7.24e-01 -0.0545 0.154 0.056 NK L1
ENSG00000060688 SNRNP40 -433304 sc-eQTL 9.44e-01 -0.00939 0.134 0.058 Other_T L1
ENSG00000121766 ZCCHC17 -433498 sc-eQTL 6.91e-01 0.0569 0.143 0.058 Other_T L1
ENSG00000134644 PUM1 -202507 sc-eQTL 6.43e-01 0.0597 0.128 0.058 Other_T L1
ENSG00000162511 LAPTM5 105710 sc-eQTL 2.12e-01 -0.131 0.105 0.058 Other_T L1
ENSG00000162517 PEF1 -781412 sc-eQTL 5.12e-02 -0.273 0.139 0.058 Other_T L1
ENSG00000186056 MATN1-AS1 144980 sc-eQTL 5.17e-01 -0.112 0.172 0.058 Other_T L1
ENSG00000287510 AL137857.1 131791 sc-eQTL 3.80e-01 0.158 0.179 0.058 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000060688 SNRNP40 -433304 sc-eQTL 1.49e-01 -0.291 0.201 0.058 B_Intermediate L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -433498 sc-eQTL 9.72e-02 0.278 0.167 0.058 B_Intermediate L2
ENSG00000134644 PUM1 -202507 sc-eQTL 7.84e-01 0.0435 0.159 0.058 B_Intermediate L2
ENSG00000162510 MATN1 139899 sc-eQTL 9.91e-01 -0.00196 0.165 0.058 B_Intermediate L2
ENSG00000162511 LAPTM5 105710 sc-eQTL 8.56e-02 -0.174 0.101 0.058 B_Intermediate L2
ENSG00000162517 PEF1 -781412 sc-eQTL 9.73e-01 0.00637 0.188 0.058 B_Intermediate L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 144980 sc-eQTL 3.31e-01 -0.138 0.142 0.058 B_Intermediate L2
ENSG00000287510 AL137857.1 131791 sc-eQTL 2.62e-01 -0.178 0.159 0.058 B_Intermediate L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -433304 sc-eQTL 9.73e-01 0.00669 0.198 0.058 B_Memory L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -433498 sc-eQTL 8.98e-01 -0.0234 0.182 0.058 B_Memory L2
ENSG00000134644 PUM1 -202507 sc-eQTL 6.84e-02 0.288 0.157 0.058 B_Memory L2
ENSG00000162510 MATN1 139899 sc-eQTL 3.06e-01 -0.155 0.151 0.058 B_Memory L2
ENSG00000162511 LAPTM5 105710 sc-eQTL 3.39e-02 -0.284 0.133 0.058 B_Memory L2
ENSG00000162517 PEF1 -781412 sc-eQTL 7.80e-01 0.0502 0.179 0.058 B_Memory L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 144980 sc-eQTL 4.45e-01 -0.118 0.154 0.058 B_Memory L2
ENSG00000287510 AL137857.1 131791 sc-eQTL 7.26e-01 0.0633 0.18 0.058 B_Memory L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -433304 sc-eQTL 7.50e-01 -0.0573 0.179 0.058 B_Naive1 L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -433498 sc-eQTL 1.11e-01 0.246 0.154 0.058 B_Naive1 L2
ENSG00000134644 PUM1 -202507 sc-eQTL 6.06e-02 0.255 0.135 0.058 B_Naive1 L2
ENSG00000162510 MATN1 139899 sc-eQTL 5.38e-01 0.0853 0.138 0.058 B_Naive1 L2
ENSG00000162511 LAPTM5 105710 sc-eQTL 2.47e-01 -0.107 0.0922 0.058 B_Naive1 L2
ENSG00000162517 PEF1 -781412 sc-eQTL 4.36e-01 -0.127 0.163 0.058 B_Naive1 L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 144980 sc-eQTL 2.50e-01 -0.14 0.121 0.058 B_Naive1 L2
ENSG00000287510 AL137857.1 131791 sc-eQTL 6.78e-01 -0.0623 0.15 0.058 B_Naive1 L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -433304 sc-eQTL 8.08e-01 -0.0464 0.191 0.058 B_Naive2 L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -433498 sc-eQTL 1.16e-01 -0.247 0.157 0.058 B_Naive2 L2
ENSG00000134644 PUM1 -202507 sc-eQTL 6.21e-01 -0.0764 0.154 0.058 B_Naive2 L2
ENSG00000162510 MATN1 139899 sc-eQTL 7.23e-01 -0.0525 0.148 0.058 B_Naive2 L2
ENSG00000162511 LAPTM5 105710 sc-eQTL 1.97e-01 -0.13 0.1 0.058 B_Naive2 L2
ENSG00000162517 PEF1 -781412 sc-eQTL 8.75e-01 -0.0289 0.183 0.058 B_Naive2 L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 144980 sc-eQTL 5.41e-01 0.0897 0.146 0.058 B_Naive2 L2
ENSG00000287510 AL137857.1 131791 sc-eQTL 2.99e-01 -0.164 0.158 0.058 B_Naive2 L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -433304 sc-eQTL 6.76e-01 -0.0785 0.187 0.061 CD4_CTL L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -433498 sc-eQTL 3.54e-01 -0.171 0.184 0.061 CD4_CTL L2
ENSG00000134644 PUM1 -202507 sc-eQTL 5.32e-02 -0.348 0.179 0.061 CD4_CTL L2
ENSG00000162511 LAPTM5 105710 sc-eQTL 8.89e-01 -0.0225 0.161 0.061 CD4_CTL L2
ENSG00000162517 PEF1 -781412 sc-eQTL 6.85e-01 -0.0671 0.165 0.061 CD4_CTL L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 144980 sc-eQTL 7.06e-02 0.318 0.175 0.061 CD4_CTL L2
ENSG00000287510 AL137857.1 131791 sc-eQTL 5.15e-01 0.101 0.155 0.061 CD4_CTL L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -433304 sc-eQTL 8.43e-01 0.0292 0.147 0.058 CD4_Naive L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -433498 sc-eQTL 2.20e-01 0.16 0.13 0.058 CD4_Naive L2
ENSG00000134644 PUM1 -202507 sc-eQTL 7.00e-01 0.0402 0.104 0.058 CD4_Naive L2
ENSG00000162511 LAPTM5 105710 sc-eQTL 7.44e-02 -0.199 0.111 0.058 CD4_Naive L2
ENSG00000162517 PEF1 -781412 sc-eQTL 2.15e-01 0.152 0.122 0.058 CD4_Naive L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 144980 sc-eQTL 2.28e-01 -0.137 0.113 0.058 CD4_Naive L2
ENSG00000287510 AL137857.1 131791 sc-eQTL 9.33e-02 -0.218 0.129 0.058 CD4_Naive L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -433304 sc-eQTL 2.64e-01 0.208 0.185 0.058 CD4_TCM L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -433498 sc-eQTL 6.77e-01 0.0624 0.15 0.058 CD4_TCM L2
ENSG00000134644 PUM1 -202507 sc-eQTL 5.83e-01 -0.0728 0.132 0.058 CD4_TCM L2
ENSG00000162511 LAPTM5 105710 sc-eQTL 4.44e-01 -0.0842 0.11 0.058 CD4_TCM L2
ENSG00000162517 PEF1 -781412 sc-eQTL 7.15e-01 -0.0539 0.147 0.058 CD4_TCM L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 144980 sc-eQTL 3.23e-01 0.138 0.139 0.058 CD4_TCM L2
ENSG00000287510 AL137857.1 131791 sc-eQTL 8.46e-01 -0.0303 0.155 0.058 CD4_TCM L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -433304 sc-eQTL 5.67e-01 0.106 0.184 0.058 CD4_TEM L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -433498 sc-eQTL 5.95e-01 0.0936 0.176 0.058 CD4_TEM L2
ENSG00000134644 PUM1 -202507 sc-eQTL 9.34e-01 0.0122 0.147 0.058 CD4_TEM L2
ENSG00000162511 LAPTM5 105710 sc-eQTL 3.51e-01 -0.138 0.148 0.058 CD4_TEM L2
ENSG00000162517 PEF1 -781412 sc-eQTL 7.05e-01 -0.063 0.166 0.058 CD4_TEM L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 144980 sc-eQTL 7.47e-01 0.056 0.173 0.058 CD4_TEM L2
ENSG00000287510 AL137857.1 131791 sc-eQTL 5.66e-01 -0.0982 0.171 0.058 CD4_TEM L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -433304 sc-eQTL 7.52e-01 -0.064 0.202 0.058 CD8_CTL L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -433498 sc-eQTL 3.42e-02 -0.327 0.153 0.058 CD8_CTL L2
ENSG00000134644 PUM1 -202507 sc-eQTL 4.13e-01 0.123 0.15 0.058 CD8_CTL L2
ENSG00000162511 LAPTM5 105710 sc-eQTL 4.01e-01 -0.14 0.166 0.058 CD8_CTL L2
ENSG00000162517 PEF1 -781412 sc-eQTL 4.52e-01 0.109 0.145 0.058 CD8_CTL L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 144980 sc-eQTL 5.32e-01 0.11 0.175 0.058 CD8_CTL L2
ENSG00000287510 AL137857.1 131791 sc-eQTL 6.53e-01 0.0742 0.165 0.058 CD8_CTL L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -433304 sc-eQTL 1.73e-01 -0.251 0.184 0.058 CD8_Naive L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -433498 sc-eQTL 5.90e-01 -0.0859 0.159 0.058 CD8_Naive L2
ENSG00000134644 PUM1 -202507 sc-eQTL 8.90e-01 0.0178 0.128 0.058 CD8_Naive L2
ENSG00000162511 LAPTM5 105710 sc-eQTL 3.71e-02 -0.255 0.121 0.058 CD8_Naive L2
ENSG00000162517 PEF1 -781412 sc-eQTL 7.58e-01 0.0527 0.171 0.058 CD8_Naive L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 144980 sc-eQTL 7.27e-01 -0.0536 0.153 0.058 CD8_Naive L2
ENSG00000287510 AL137857.1 131791 sc-eQTL 8.96e-01 -0.0219 0.167 0.058 CD8_Naive L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -433304 sc-eQTL 1.65e-01 0.296 0.212 0.053 CD8_TCM L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -433498 sc-eQTL 5.00e-01 -0.132 0.195 0.053 CD8_TCM L2
ENSG00000134644 PUM1 -202507 sc-eQTL 2.03e-01 -0.234 0.183 0.053 CD8_TCM L2
ENSG00000162511 LAPTM5 105710 sc-eQTL 2.86e-02 -0.419 0.19 0.053 CD8_TCM L2
ENSG00000162517 PEF1 -781412 sc-eQTL 5.20e-01 0.126 0.196 0.053 CD8_TCM L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 144980 sc-eQTL 4.07e-01 0.148 0.178 0.053 CD8_TCM L2
ENSG00000287510 AL137857.1 131791 sc-eQTL 9.10e-02 -0.303 0.179 0.053 CD8_TCM L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -433304 sc-eQTL 5.90e-01 0.104 0.193 0.057 CD8_TEM L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -433498 sc-eQTL 8.41e-01 -0.0371 0.185 0.057 CD8_TEM L2
ENSG00000134644 PUM1 -202507 sc-eQTL 9.09e-01 0.0216 0.189 0.057 CD8_TEM L2
ENSG00000162511 LAPTM5 105710 sc-eQTL 3.66e-01 0.161 0.177 0.057 CD8_TEM L2
ENSG00000162517 PEF1 -781412 sc-eQTL 3.96e-01 -0.142 0.167 0.057 CD8_TEM L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 144980 sc-eQTL 9.75e-01 -0.00583 0.184 0.057 CD8_TEM L2
ENSG00000287510 AL137857.1 131791 sc-eQTL 7.26e-01 0.0584 0.167 0.057 CD8_TEM L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -433304 sc-eQTL 5.19e-01 0.127 0.197 0.058 MAIT L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -433498 sc-eQTL 6.12e-01 0.0885 0.174 0.058 MAIT L2
ENSG00000134644 PUM1 -202507 sc-eQTL 8.65e-02 0.286 0.166 0.058 MAIT L2
ENSG00000162511 LAPTM5 105710 sc-eQTL 6.52e-01 -0.0712 0.158 0.058 MAIT L2
ENSG00000162517 PEF1 -781412 sc-eQTL 3.08e-02 -0.373 0.172 0.058 MAIT L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 144980 sc-eQTL 2.37e-01 -0.208 0.175 0.058 MAIT L2
ENSG00000287510 AL137857.1 131791 sc-eQTL 4.09e-01 0.15 0.181 0.058 MAIT L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -433304 sc-eQTL 1.84e-01 -0.271 0.203 0.056 NK_CD56bright L2
ENSG00000121753 ADGRB2 -901409 sc-eQTL 7.83e-01 0.0442 0.16 0.056 NK_CD56bright L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -433498 sc-eQTL 6.34e-01 0.0822 0.173 0.056 NK_CD56bright L2
ENSG00000134644 PUM1 -202507 sc-eQTL 1.95e-01 -0.234 0.181 0.056 NK_CD56bright L2
ENSG00000162511 LAPTM5 105710 sc-eQTL 4.62e-01 -0.131 0.179 0.056 NK_CD56bright L2
ENSG00000162517 PEF1 -781412 sc-eQTL 9.52e-01 -0.0105 0.174 0.056 NK_CD56bright L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 144980 sc-eQTL 5.42e-01 -0.11 0.179 0.056 NK_CD56bright L2
ENSG00000287510 AL137857.1 131791 sc-eQTL 7.01e-01 0.068 0.177 0.056 NK_CD56bright L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -433304 sc-eQTL 6.74e-02 0.349 0.19 0.056 NK_CD56dim L2
ENSG00000121753 ADGRB2 -901409 sc-eQTL 8.51e-01 0.0317 0.168 0.056 NK_CD56dim L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -433498 sc-eQTL 8.54e-01 0.026 0.141 0.056 NK_CD56dim L2
ENSG00000134644 PUM1 -202507 sc-eQTL 6.06e-01 0.075 0.145 0.056 NK_CD56dim L2
ENSG00000162511 LAPTM5 105710 sc-eQTL 8.59e-01 -0.0275 0.155 0.056 NK_CD56dim L2
ENSG00000162517 PEF1 -781412 sc-eQTL 6.85e-01 -0.056 0.138 0.056 NK_CD56dim L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 144980 sc-eQTL 5.09e-01 -0.128 0.194 0.056 NK_CD56dim L2
ENSG00000287510 AL137857.1 131791 sc-eQTL 8.19e-01 0.0367 0.16 0.056 NK_CD56dim L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -433304 sc-eQTL 3.06e-01 0.202 0.197 0.059 NK_HLA L2
ENSG00000121753 ADGRB2 -901409 sc-eQTL 3.27e-01 0.154 0.157 0.059 NK_HLA L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -433498 sc-eQTL 7.85e-01 0.0482 0.177 0.059 NK_HLA L2
ENSG00000134644 PUM1 -202507 sc-eQTL 4.57e-01 -0.128 0.172 0.059 NK_HLA L2
ENSG00000162511 LAPTM5 105710 sc-eQTL 6.89e-01 0.0657 0.164 0.059 NK_HLA L2
ENSG00000162517 PEF1 -781412 sc-eQTL 8.14e-01 0.0436 0.185 0.059 NK_HLA L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 144980 sc-eQTL 5.57e-01 -0.103 0.175 0.059 NK_HLA L2
ENSG00000287510 AL137857.1 131791 sc-eQTL 7.01e-01 0.0649 0.169 0.059 NK_HLA L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -433304 sc-eQTL 7.20e-01 0.0667 0.186 0.056 NK_cytokine L2
ENSG00000121753 ADGRB2 -901409 sc-eQTL 5.41e-01 0.103 0.168 0.056 NK_cytokine L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -433498 sc-eQTL 7.08e-01 -0.0543 0.145 0.056 NK_cytokine L2
ENSG00000134644 PUM1 -202507 sc-eQTL 3.38e-01 0.15 0.157 0.056 NK_cytokine L2
ENSG00000162511 LAPTM5 105710 sc-eQTL 8.71e-01 0.0281 0.173 0.056 NK_cytokine L2
ENSG00000162517 PEF1 -781412 sc-eQTL 9.04e-01 0.0178 0.147 0.056 NK_cytokine L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 144980 sc-eQTL 4.89e-01 -0.127 0.183 0.056 NK_cytokine L2
ENSG00000287510 AL137857.1 131791 sc-eQTL 3.15e-01 -0.171 0.17 0.056 NK_cytokine L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -433304 sc-eQTL 2.95e-01 -0.265 0.251 0.052 PB L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -433498 sc-eQTL 5.11e-01 0.193 0.292 0.052 PB L2
ENSG00000134644 PUM1 -202507 sc-eQTL 3.60e-01 -0.233 0.253 0.052 PB L2
ENSG00000162510 MATN1 139899 sc-eQTL 4.81e-01 -0.167 0.237 0.052 PB L2
ENSG00000162511 LAPTM5 105710 sc-eQTL 4.56e-01 -0.126 0.169 0.052 PB L2
ENSG00000162517 PEF1 -781412 sc-eQTL 4.64e-01 0.191 0.26 0.052 PB L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 144980 sc-eQTL 7.43e-01 0.0763 0.232 0.052 PB L2
ENSG00000287510 AL137857.1 131791 sc-eQTL 7.81e-01 -0.0687 0.247 0.052 PB L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -433304 sc-eQTL 2.91e-01 -0.154 0.145 0.057 Pro_T L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -433498 sc-eQTL 4.23e-01 0.148 0.185 0.057 Pro_T L2
ENSG00000134644 PUM1 -202507 sc-eQTL 5.15e-01 -0.112 0.172 0.057 Pro_T L2
ENSG00000162511 LAPTM5 105710 sc-eQTL 7.03e-01 -0.0473 0.124 0.057 Pro_T L2
ENSG00000162517 PEF1 -781412 sc-eQTL 5.24e-01 0.116 0.181 0.057 Pro_T L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 144980 sc-eQTL 3.55e-01 0.16 0.173 0.057 Pro_T L2
ENSG00000287510 AL137857.1 131791 sc-eQTL 3.97e-02 0.326 0.157 0.057 Pro_T L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -433304 sc-eQTL 1.23e-01 -0.299 0.193 0.058 Treg L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -433498 sc-eQTL 4.22e-01 0.151 0.187 0.058 Treg L2
ENSG00000134644 PUM1 -202507 sc-eQTL 4.28e-01 -0.119 0.15 0.058 Treg L2
ENSG00000162511 LAPTM5 105710 sc-eQTL 2.86e-01 -0.183 0.171 0.058 Treg L2
ENSG00000162517 PEF1 -781412 sc-eQTL 5.50e-01 -0.111 0.185 0.058 Treg L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 144980 sc-eQTL 6.99e-01 0.0677 0.175 0.058 Treg L2
ENSG00000287510 AL137857.1 131791 sc-eQTL 9.43e-01 0.0125 0.175 0.058 Treg L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -433304 sc-eQTL 2.06e-01 -0.244 0.192 0.059 cDC L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -433498 sc-eQTL 2.96e-01 0.218 0.208 0.059 cDC L2
ENSG00000134644 PUM1 -202507 sc-eQTL 5.47e-01 -0.108 0.179 0.059 cDC L2
ENSG00000162511 LAPTM5 105710 sc-eQTL 4.34e-01 0.0984 0.126 0.059 cDC L2
ENSG00000162517 PEF1 -781412 sc-eQTL 8.51e-01 0.0343 0.182 0.059 cDC L2
ENSG00000168528 SERINC2 -546081 sc-eQTL 2.97e-01 -0.168 0.161 0.059 cDC L2
ENSG00000284543 LINC01226 -642742 sc-eQTL 8.45e-01 -0.031 0.159 0.059 cDC L2
ENSG00000287510 AL137857.1 131791 sc-eQTL 1.14e-01 -0.269 0.17 0.059 cDC L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -433304 sc-eQTL 7.71e-01 0.0459 0.157 0.058 cMono_IL1B L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -433498 sc-eQTL 3.90e-01 -0.151 0.175 0.058 cMono_IL1B L2
ENSG00000134644 PUM1 -202507 sc-eQTL 5.30e-01 0.0747 0.119 0.058 cMono_IL1B L2
ENSG00000162511 LAPTM5 105710 sc-eQTL 8.84e-01 -0.0153 0.104 0.058 cMono_IL1B L2
ENSG00000162512 SDC3 -45274 sc-eQTL 1.25e-01 -0.301 0.195 0.058 cMono_IL1B L2
ENSG00000162517 PEF1 -781412 sc-eQTL 5.66e-01 -0.0923 0.16 0.058 cMono_IL1B L2
ENSG00000168528 SERINC2 -546081 sc-eQTL 5.67e-01 -0.114 0.199 0.058 cMono_IL1B L2
ENSG00000284543 LINC01226 -642742 sc-eQTL 8.94e-01 0.0235 0.176 0.058 cMono_IL1B L2
ENSG00000287510 AL137857.1 131791 sc-eQTL 4.75e-01 -0.117 0.164 0.058 cMono_IL1B L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -433304 sc-eQTL 3.10e-01 -0.166 0.164 0.058 cMono_S100A L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -433498 sc-eQTL 3.99e-01 -0.164 0.193 0.058 cMono_S100A L2
ENSG00000134644 PUM1 -202507 sc-eQTL 2.62e-01 0.157 0.14 0.058 cMono_S100A L2
ENSG00000162511 LAPTM5 105710 sc-eQTL 6.49e-01 -0.049 0.108 0.058 cMono_S100A L2
ENSG00000162512 SDC3 -45274 sc-eQTL 3.95e-02 -0.381 0.184 0.058 cMono_S100A L2
ENSG00000162517 PEF1 -781412 sc-eQTL 3.95e-01 -0.143 0.168 0.058 cMono_S100A L2
ENSG00000168528 SERINC2 -546081 sc-eQTL 6.23e-01 -0.0968 0.197 0.058 cMono_S100A L2
ENSG00000284543 LINC01226 -642742 sc-eQTL 4.60e-01 0.118 0.16 0.058 cMono_S100A L2
ENSG00000287510 AL137857.1 131791 sc-eQTL 7.43e-01 -0.0526 0.161 0.058 cMono_S100A L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -433304 sc-eQTL 6.33e-01 0.118 0.247 0.052 gdT L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -433498 sc-eQTL 5.51e-02 -0.405 0.209 0.052 gdT L2
ENSG00000134644 PUM1 -202507 sc-eQTL 8.66e-02 -0.374 0.216 0.052 gdT L2
ENSG00000162511 LAPTM5 105710 sc-eQTL 2.38e-01 -0.281 0.237 0.052 gdT L2
ENSG00000162517 PEF1 -781412 sc-eQTL 1.13e-01 -0.344 0.216 0.052 gdT L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 144980 sc-eQTL 3.39e-01 0.21 0.219 0.052 gdT L2
ENSG00000287510 AL137857.1 131791 sc-eQTL 3.83e-01 -0.185 0.212 0.052 gdT L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -433304 sc-eQTL 6.21e-01 0.092 0.186 0.053 intMono L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -433498 sc-eQTL 5.28e-01 -0.126 0.199 0.053 intMono L2
ENSG00000134644 PUM1 -202507 sc-eQTL 5.58e-01 0.0992 0.169 0.053 intMono L2
ENSG00000162511 LAPTM5 105710 sc-eQTL 5.11e-01 -0.0873 0.133 0.053 intMono L2
ENSG00000162512 SDC3 -45274 sc-eQTL 7.19e-01 0.0656 0.182 0.053 intMono L2
ENSG00000162517 PEF1 -781412 sc-eQTL 2.93e-01 0.201 0.191 0.053 intMono L2
ENSG00000168528 SERINC2 -546081 sc-eQTL 2.72e-01 -0.209 0.19 0.053 intMono L2
ENSG00000284543 LINC01226 -642742 sc-eQTL 4.29e-01 -0.143 0.18 0.053 intMono L2
ENSG00000287510 AL137857.1 131791 sc-eQTL 9.56e-01 0.00986 0.181 0.053 intMono L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -433304 sc-eQTL 9.78e-01 -0.00483 0.171 0.057 ncMono L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -433498 sc-eQTL 4.67e-01 -0.133 0.182 0.057 ncMono L2
ENSG00000134644 PUM1 -202507 sc-eQTL 2.43e-02 -0.334 0.147 0.057 ncMono L2
ENSG00000162511 LAPTM5 105710 sc-eQTL 9.72e-01 0.00482 0.135 0.057 ncMono L2
ENSG00000162512 SDC3 -45274 sc-eQTL 4.69e-01 0.11 0.152 0.057 ncMono L2
ENSG00000162517 PEF1 -781412 sc-eQTL 8.01e-01 0.0439 0.174 0.057 ncMono L2
ENSG00000168528 SERINC2 -546081 sc-eQTL 6.63e-01 -0.0722 0.166 0.057 ncMono L2
ENSG00000284543 LINC01226 -642742 sc-eQTL 3.57e-01 -0.153 0.165 0.057 ncMono L2
ENSG00000287510 AL137857.1 131791 sc-eQTL 9.37e-02 0.287 0.17 0.057 ncMono L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -433304 sc-eQTL 8.52e-01 -0.0339 0.181 0.065 pDC L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -433498 sc-eQTL 3.61e-01 0.182 0.198 0.065 pDC L2
ENSG00000134644 PUM1 -202507 sc-eQTL 8.83e-02 0.28 0.163 0.065 pDC L2
ENSG00000162511 LAPTM5 105710 sc-eQTL 5.19e-01 0.0989 0.153 0.065 pDC L2
ENSG00000162517 PEF1 -781412 sc-eQTL 9.30e-01 0.0175 0.199 0.065 pDC L2
ENSG00000168528 SERINC2 -546081 sc-eQTL 7.58e-01 -0.0574 0.186 0.065 pDC L2
ENSG00000284543 LINC01226 -642742 sc-eQTL 2.99e-01 0.15 0.144 0.065 pDC L2
ENSG00000287510 AL137857.1 131791 sc-eQTL 8.70e-01 -0.0278 0.17 0.065 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000060688 SNRNP40 -433304 sc-eQTL 1.25e-01 -0.299 0.194 0.058 B_Memory LOneK1K
ENSG00000121766 ZCCHC17 -433498 sc-eQTL 4.26e-01 0.129 0.162 0.058 B_Memory LOneK1K
ENSG00000134644 PUM1 -202507 sc-eQTL 2.93e-01 0.151 0.144 0.058 B_Memory LOneK1K
ENSG00000162510 MATN1 139899 sc-eQTL 5.00e-01 -0.111 0.164 0.058 B_Memory LOneK1K
ENSG00000162511 LAPTM5 105710 sc-eQTL 8.34e-02 -0.178 0.102 0.058 B_Memory LOneK1K
ENSG00000162517 PEF1 -781412 sc-eQTL 8.70e-01 0.028 0.171 0.058 B_Memory LOneK1K
ENSG00000186056 MATN1-AS1 144980 sc-eQTL 5.39e-01 -0.0839 0.136 0.058 B_Memory LOneK1K
ENSG00000287510 AL137857.1 131791 sc-eQTL 9.67e-01 -0.00625 0.149 0.058 B_Memory LOneK1K
ENSG00000060688 SNRNP40 -433304 sc-eQTL 5.50e-01 -0.105 0.175 0.058 B_Naive LOneK1K
ENSG00000121766 ZCCHC17 -433498 sc-eQTL 7.30e-01 0.0479 0.138 0.058 B_Naive LOneK1K
ENSG00000134644 PUM1 -202507 sc-eQTL 1.58e-01 0.185 0.13 0.058 B_Naive LOneK1K
ENSG00000162510 MATN1 139899 sc-eQTL 3.55e-01 0.117 0.126 0.058 B_Naive LOneK1K
ENSG00000162511 LAPTM5 105710 sc-eQTL 1.18e-01 -0.139 0.0883 0.058 B_Naive LOneK1K
ENSG00000162517 PEF1 -781412 sc-eQTL 4.94e-01 -0.111 0.162 0.058 B_Naive LOneK1K
ENSG00000186056 MATN1-AS1 144980 sc-eQTL 6.06e-01 -0.0593 0.115 0.058 B_Naive LOneK1K
ENSG00000287510 AL137857.1 131791 sc-eQTL 3.40e-01 -0.13 0.136 0.058 B_Naive LOneK1K
ENSG00000060688 SNRNP40 -433304 sc-eQTL 4.78e-01 -0.105 0.148 0.058 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000121766 ZCCHC17 -433498 sc-eQTL 1.60e-01 -0.236 0.167 0.058 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000134644 PUM1 -202507 sc-eQTL 3.84e-01 0.0936 0.107 0.058 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000162511 LAPTM5 105710 sc-eQTL 4.34e-01 -0.0739 0.0942 0.058 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000162512 SDC3 -45274 sc-eQTL 1.94e-02 -0.448 0.19 0.058 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000162517 PEF1 -781412 sc-eQTL 6.80e-01 -0.0559 0.135 0.058 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000168528 SERINC2 -546081 sc-eQTL 5.94e-01 -0.106 0.198 0.058 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000284543 LINC01226 -642742 sc-eQTL 8.79e-01 0.0247 0.162 0.058 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000287510 AL137857.1 131791 sc-eQTL 6.05e-01 -0.0787 0.152 0.058 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000060688 SNRNP40 -433304 sc-eQTL 8.06e-01 0.0403 0.164 0.056 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000121766 ZCCHC17 -433498 sc-eQTL 5.68e-01 -0.103 0.18 0.056 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000134644 PUM1 -202507 sc-eQTL 2.86e-01 -0.157 0.147 0.056 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000162511 LAPTM5 105710 sc-eQTL 5.86e-01 0.0641 0.118 0.056 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000162512 SDC3 -45274 sc-eQTL 7.09e-01 0.0643 0.172 0.056 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000162517 PEF1 -781412 sc-eQTL 3.05e-01 0.16 0.156 0.056 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000168528 SERINC2 -546081 sc-eQTL 4.66e-01 -0.13 0.178 0.056 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000284543 LINC01226 -642742 sc-eQTL 2.97e-01 -0.177 0.169 0.056 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000287510 AL137857.1 131791 sc-eQTL 3.05e-02 0.365 0.168 0.056 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000060688 SNRNP40 -433304 sc-eQTL 1.28e-01 0.275 0.18 0.056 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000121753 ADGRB2 -901409 sc-eQTL 6.33e-01 0.0737 0.154 0.056 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000121766 ZCCHC17 -433498 sc-eQTL 6.60e-01 -0.0545 0.124 0.056 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000134644 PUM1 -202507 sc-eQTL 4.27e-01 0.108 0.135 0.056 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000162511 LAPTM5 105710 sc-eQTL 8.31e-01 -0.0323 0.152 0.056 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000162517 PEF1 -781412 sc-eQTL 9.13e-01 0.0126 0.115 0.056 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000186056 MATN1-AS1 144980 sc-eQTL 2.95e-01 -0.183 0.174 0.056 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000287510 AL137857.1 131791 sc-eQTL 7.42e-01 -0.0498 0.151 0.056 NK_CD56dim LOneK1K

Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF

Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina
ENSG00000168528 \N -546081 3.27e-07 2.5e-07 6.04e-08 2.61e-07 1.03e-07 8.4e-08 2.4e-07 5.78e-08 1.75e-07 9.35e-08 1.76e-07 1.31e-07 3.18e-07 8.54e-08 8.45e-08 9.01e-08 6.17e-08 1.8e-07 7.36e-08 6.29e-08 1.18e-07 1.76e-07 1.81e-07 4.17e-08 2.48e-07 1.43e-07 1.17e-07 1.36e-07 1.39e-07 1.46e-07 1.39e-07 3.72e-08 4.76e-08 9.98e-08 1.07e-07 2.74e-08 9.11e-08 7.1e-08 4.78e-08 8.09e-08 4.92e-08 1.79e-07 4.83e-08 1.88e-08 3.42e-08 6.68e-09 9.96e-08 2e-09 4.82e-08