logo

Genes within 1Mb (chr1:30862963:C:T):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD

Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000060688 SNRNP40 -433825 sc-eQTL 1.52e-01 -0.138 0.096 0.231 B L1
ENSG00000121766 ZCCHC17 -434019 sc-eQTL 8.12e-01 -0.0183 0.0772 0.231 B L1
ENSG00000134644 PUM1 -203028 sc-eQTL 4.56e-02 0.129 0.0642 0.231 B L1
ENSG00000162510 MATN1 139378 sc-eQTL 3.82e-01 -0.0596 0.068 0.231 B L1
ENSG00000162511 LAPTM5 105189 sc-eQTL 2.18e-01 0.0658 0.0532 0.231 B L1
ENSG00000162517 PEF1 -781933 sc-eQTL 7.76e-02 0.142 0.0799 0.231 B L1
ENSG00000186056 MATN1-AS1 144459 sc-eQTL 9.12e-01 0.00689 0.0625 0.231 B L1
ENSG00000287510 AL137857.1 131270 sc-eQTL 1.46e-01 -0.107 0.0736 0.231 B L1
ENSG00000060688 SNRNP40 -433825 sc-eQTL 4.03e-01 -0.0692 0.0826 0.231 CD4T L1
ENSG00000121766 ZCCHC17 -434019 sc-eQTL 5.06e-01 -0.043 0.0646 0.231 CD4T L1
ENSG00000134644 PUM1 -203028 sc-eQTL 5.56e-01 0.0339 0.0575 0.231 CD4T L1
ENSG00000162511 LAPTM5 105189 sc-eQTL 8.82e-01 -0.00944 0.0638 0.231 CD4T L1
ENSG00000162517 PEF1 -781933 sc-eQTL 3.50e-01 0.0624 0.0666 0.231 CD4T L1
ENSG00000186056 MATN1-AS1 144459 sc-eQTL 6.57e-01 -0.0254 0.057 0.231 CD4T L1
ENSG00000287510 AL137857.1 131270 sc-eQTL 4.04e-01 -0.057 0.0682 0.231 CD4T L1
ENSG00000060688 SNRNP40 -433825 sc-eQTL 6.20e-01 -0.0549 0.111 0.231 CD8T L1
ENSG00000121766 ZCCHC17 -434019 sc-eQTL 8.31e-01 -0.0157 0.0736 0.231 CD8T L1
ENSG00000134644 PUM1 -203028 sc-eQTL 4.04e-03 0.185 0.0636 0.231 CD8T L1
ENSG00000162511 LAPTM5 105189 sc-eQTL 6.28e-01 -0.0305 0.0629 0.231 CD8T L1
ENSG00000162517 PEF1 -781933 sc-eQTL 8.93e-01 0.0104 0.0775 0.231 CD8T L1
ENSG00000186056 MATN1-AS1 144459 sc-eQTL 2.60e-01 -0.083 0.0736 0.231 CD8T L1
ENSG00000287510 AL137857.1 131270 sc-eQTL 5.57e-01 -0.0545 0.0926 0.231 CD8T L1
ENSG00000060688 SNRNP40 -433825 sc-eQTL 2.39e-01 0.117 0.0989 0.234 DC L1
ENSG00000121766 ZCCHC17 -434019 sc-eQTL 3.08e-01 0.12 0.117 0.234 DC L1
ENSG00000134644 PUM1 -203028 sc-eQTL 1.49e-01 0.133 0.0916 0.234 DC L1
ENSG00000162511 LAPTM5 105189 sc-eQTL 3.55e-02 -0.138 0.065 0.234 DC L1
ENSG00000162517 PEF1 -781933 sc-eQTL 8.83e-01 -0.0157 0.107 0.234 DC L1
ENSG00000168528 SERINC2 -546602 sc-eQTL 7.21e-01 0.0388 0.108 0.234 DC L1
ENSG00000284543 LINC01226 -643263 sc-eQTL 2.87e-01 -0.0764 0.0716 0.234 DC L1
ENSG00000287510 AL137857.1 131270 sc-eQTL 5.11e-01 -0.0683 0.104 0.234 DC L1
ENSG00000060688 SNRNP40 -433825 sc-eQTL 7.99e-01 0.0189 0.0743 0.231 Mono L1
ENSG00000121766 ZCCHC17 -434019 sc-eQTL 2.25e-01 -0.112 0.0918 0.231 Mono L1
ENSG00000134644 PUM1 -203028 sc-eQTL 7.18e-02 -0.106 0.0586 0.231 Mono L1
ENSG00000162511 LAPTM5 105189 sc-eQTL 9.25e-01 -0.00515 0.0543 0.231 Mono L1
ENSG00000162512 SDC3 -45795 sc-eQTL 3.03e-01 0.108 0.104 0.231 Mono L1
ENSG00000162517 PEF1 -781933 sc-eQTL 7.43e-01 0.0241 0.0733 0.231 Mono L1
ENSG00000168528 SERINC2 -546602 sc-eQTL 7.66e-01 -0.0333 0.112 0.231 Mono L1
ENSG00000284543 LINC01226 -643263 sc-eQTL 9.11e-01 -0.011 0.0987 0.231 Mono L1
ENSG00000287510 AL137857.1 131270 sc-eQTL 4.12e-01 -0.0708 0.0861 0.231 Mono L1
ENSG00000060688 SNRNP40 -433825 sc-eQTL 2.43e-01 -0.122 0.104 0.232 NK L1
ENSG00000121753 ADGRB2 -901930 sc-eQTL 9.13e-01 -0.00983 0.0901 0.232 NK L1
ENSG00000121766 ZCCHC17 -434019 sc-eQTL 3.69e-02 0.149 0.0709 0.232 NK L1
ENSG00000134644 PUM1 -203028 sc-eQTL 8.12e-02 0.131 0.0746 0.232 NK L1
ENSG00000162511 LAPTM5 105189 sc-eQTL 4.38e-01 -0.0671 0.0863 0.232 NK L1
ENSG00000162517 PEF1 -781933 sc-eQTL 2.03e-01 -0.0803 0.0629 0.232 NK L1
ENSG00000186056 MATN1-AS1 144459 sc-eQTL 3.51e-01 0.0906 0.0969 0.232 NK L1
ENSG00000287510 AL137857.1 131270 sc-eQTL 1.37e-02 -0.22 0.0884 0.232 NK L1
ENSG00000060688 SNRNP40 -433825 sc-eQTL 7.84e-01 -0.0221 0.0802 0.231 Other_T L1
ENSG00000121766 ZCCHC17 -434019 sc-eQTL 1.77e-01 0.116 0.0854 0.231 Other_T L1
ENSG00000134644 PUM1 -203028 sc-eQTL 4.63e-01 -0.0567 0.077 0.231 Other_T L1
ENSG00000162511 LAPTM5 105189 sc-eQTL 6.22e-01 0.0312 0.0632 0.231 Other_T L1
ENSG00000162517 PEF1 -781933 sc-eQTL 6.04e-01 0.0438 0.0844 0.231 Other_T L1
ENSG00000186056 MATN1-AS1 144459 sc-eQTL 6.65e-01 0.0448 0.103 0.231 Other_T L1
ENSG00000287510 AL137857.1 131270 sc-eQTL 6.84e-01 0.0439 0.108 0.231 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000060688 SNRNP40 -433825 sc-eQTL 3.70e-01 0.112 0.124 0.235 B_Activated L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -434019 sc-eQTL 3.28e-01 -0.123 0.125 0.235 B_Activated L2
ENSG00000134644 PUM1 -203028 sc-eQTL 7.09e-03 0.311 0.114 0.235 B_Activated L2
ENSG00000162510 MATN1 139378 sc-eQTL 8.95e-01 0.0134 0.102 0.235 B_Activated L2
ENSG00000162511 LAPTM5 105189 sc-eQTL 5.92e-01 0.0381 0.0709 0.235 B_Activated L2
ENSG00000162517 PEF1 -781933 sc-eQTL 2.16e-01 0.15 0.12 0.235 B_Activated L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 144459 sc-eQTL 5.28e-01 0.0723 0.114 0.235 B_Activated L2
ENSG00000287510 AL137857.1 131270 sc-eQTL 7.02e-01 0.0389 0.101 0.235 B_Activated L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -433825 sc-eQTL 9.30e-01 -0.0104 0.118 0.23 B_Intermediate L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -434019 sc-eQTL 6.40e-01 0.0462 0.0986 0.23 B_Intermediate L2
ENSG00000134644 PUM1 -203028 sc-eQTL 4.66e-02 0.185 0.0922 0.23 B_Intermediate L2
ENSG00000162510 MATN1 139378 sc-eQTL 9.06e-01 -0.0114 0.0969 0.23 B_Intermediate L2
ENSG00000162511 LAPTM5 105189 sc-eQTL 4.94e-02 0.117 0.0589 0.23 B_Intermediate L2
ENSG00000162517 PEF1 -781933 sc-eQTL 8.88e-01 0.0156 0.11 0.23 B_Intermediate L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 144459 sc-eQTL 5.34e-01 0.0519 0.0834 0.23 B_Intermediate L2
ENSG00000287510 AL137857.1 131270 sc-eQTL 4.58e-01 -0.0694 0.0933 0.23 B_Intermediate L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -433825 sc-eQTL 8.81e-01 -0.0175 0.117 0.233 B_Memory L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -434019 sc-eQTL 5.66e-01 -0.0619 0.108 0.233 B_Memory L2
ENSG00000134644 PUM1 -203028 sc-eQTL 3.26e-01 -0.0921 0.0935 0.233 B_Memory L2
ENSG00000162510 MATN1 139378 sc-eQTL 3.49e-01 0.084 0.0895 0.233 B_Memory L2
ENSG00000162511 LAPTM5 105189 sc-eQTL 4.79e-02 0.157 0.0788 0.233 B_Memory L2
ENSG00000162517 PEF1 -781933 sc-eQTL 7.92e-01 0.028 0.106 0.233 B_Memory L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 144459 sc-eQTL 3.55e-01 0.0842 0.0908 0.233 B_Memory L2
ENSG00000287510 AL137857.1 131270 sc-eQTL 8.96e-01 -0.0139 0.107 0.233 B_Memory L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -433825 sc-eQTL 2.75e-02 -0.231 0.104 0.231 B_Naive1 L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -434019 sc-eQTL 9.06e-01 -0.0108 0.0911 0.231 B_Naive1 L2
ENSG00000134644 PUM1 -203028 sc-eQTL 3.68e-01 0.0723 0.0802 0.231 B_Naive1 L2
ENSG00000162510 MATN1 139378 sc-eQTL 1.80e-02 -0.192 0.0804 0.231 B_Naive1 L2
ENSG00000162511 LAPTM5 105189 sc-eQTL 5.24e-01 0.0347 0.0544 0.231 B_Naive1 L2
ENSG00000162517 PEF1 -781933 sc-eQTL 6.44e-01 -0.0443 0.0959 0.231 B_Naive1 L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 144459 sc-eQTL 4.79e-01 -0.0507 0.0714 0.231 B_Naive1 L2
ENSG00000287510 AL137857.1 131270 sc-eQTL 1.27e-01 -0.135 0.0878 0.231 B_Naive1 L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -433825 sc-eQTL 7.64e-01 0.0343 0.114 0.232 B_Naive2 L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -434019 sc-eQTL 7.88e-01 0.0253 0.094 0.232 B_Naive2 L2
ENSG00000134644 PUM1 -203028 sc-eQTL 2.48e-01 0.106 0.0918 0.232 B_Naive2 L2
ENSG00000162510 MATN1 139378 sc-eQTL 9.34e-01 0.00734 0.0884 0.232 B_Naive2 L2
ENSG00000162511 LAPTM5 105189 sc-eQTL 2.77e-01 0.0652 0.0598 0.232 B_Naive2 L2
ENSG00000162517 PEF1 -781933 sc-eQTL 7.50e-02 0.194 0.108 0.232 B_Naive2 L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 144459 sc-eQTL 8.77e-01 -0.0135 0.0874 0.232 B_Naive2 L2
ENSG00000287510 AL137857.1 131270 sc-eQTL 1.46e-01 -0.137 0.0939 0.232 B_Naive2 L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -433825 sc-eQTL 4.32e-01 0.0886 0.113 0.225 CD4_CTL L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -434019 sc-eQTL 5.31e-01 0.0696 0.111 0.225 CD4_CTL L2
ENSG00000134644 PUM1 -203028 sc-eQTL 2.59e-01 0.123 0.108 0.225 CD4_CTL L2
ENSG00000162511 LAPTM5 105189 sc-eQTL 7.56e-01 0.0302 0.0969 0.225 CD4_CTL L2
ENSG00000162517 PEF1 -781933 sc-eQTL 2.33e-01 0.118 0.099 0.225 CD4_CTL L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 144459 sc-eQTL 8.64e-01 0.0182 0.106 0.225 CD4_CTL L2
ENSG00000287510 AL137857.1 131270 sc-eQTL 1.36e-01 -0.139 0.0931 0.225 CD4_CTL L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -433825 sc-eQTL 7.84e-01 0.0237 0.0865 0.231 CD4_Naive L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -434019 sc-eQTL 2.33e-01 -0.0915 0.0765 0.231 CD4_Naive L2
ENSG00000134644 PUM1 -203028 sc-eQTL 4.86e-01 0.0427 0.0612 0.231 CD4_Naive L2
ENSG00000162511 LAPTM5 105189 sc-eQTL 6.19e-01 -0.0327 0.0656 0.231 CD4_Naive L2
ENSG00000162517 PEF1 -781933 sc-eQTL 3.67e-01 0.065 0.0719 0.231 CD4_Naive L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 144459 sc-eQTL 9.84e-01 -0.0013 0.0666 0.231 CD4_Naive L2
ENSG00000287510 AL137857.1 131270 sc-eQTL 6.74e-01 -0.0322 0.0765 0.231 CD4_Naive L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -433825 sc-eQTL 4.57e-02 -0.217 0.108 0.231 CD4_TCM L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -434019 sc-eQTL 7.67e-01 -0.0261 0.0878 0.231 CD4_TCM L2
ENSG00000134644 PUM1 -203028 sc-eQTL 5.93e-01 -0.0416 0.0777 0.231 CD4_TCM L2
ENSG00000162511 LAPTM5 105189 sc-eQTL 4.07e-01 0.0536 0.0644 0.231 CD4_TCM L2
ENSG00000162517 PEF1 -781933 sc-eQTL 7.27e-01 -0.0302 0.0865 0.231 CD4_TCM L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 144459 sc-eQTL 4.30e-01 -0.0647 0.0818 0.231 CD4_TCM L2
ENSG00000287510 AL137857.1 131270 sc-eQTL 1.28e-01 -0.139 0.0907 0.231 CD4_TCM L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -433825 sc-eQTL 9.91e-01 -0.0013 0.11 0.231 CD4_TEM L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -434019 sc-eQTL 1.06e-01 0.169 0.104 0.231 CD4_TEM L2
ENSG00000134644 PUM1 -203028 sc-eQTL 7.76e-01 -0.0248 0.0871 0.231 CD4_TEM L2
ENSG00000162511 LAPTM5 105189 sc-eQTL 9.72e-01 0.00305 0.0881 0.231 CD4_TEM L2
ENSG00000162517 PEF1 -781933 sc-eQTL 8.81e-01 -0.0148 0.0987 0.231 CD4_TEM L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 144459 sc-eQTL 6.87e-01 -0.0415 0.103 0.231 CD4_TEM L2
ENSG00000287510 AL137857.1 131270 sc-eQTL 9.30e-01 -0.0089 0.102 0.231 CD4_TEM L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -433825 sc-eQTL 5.66e-01 -0.0683 0.119 0.231 CD8_CTL L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -434019 sc-eQTL 9.90e-01 0.00112 0.0912 0.231 CD8_CTL L2
ENSG00000134644 PUM1 -203028 sc-eQTL 6.27e-01 0.0431 0.0885 0.231 CD8_CTL L2
ENSG00000162511 LAPTM5 105189 sc-eQTL 4.34e-01 -0.0768 0.098 0.231 CD8_CTL L2
ENSG00000162517 PEF1 -781933 sc-eQTL 5.87e-01 0.0465 0.0854 0.231 CD8_CTL L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 144459 sc-eQTL 3.39e-01 -0.0987 0.103 0.231 CD8_CTL L2
ENSG00000287510 AL137857.1 131270 sc-eQTL 6.39e-01 -0.0456 0.097 0.231 CD8_CTL L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -433825 sc-eQTL 8.64e-01 -0.0187 0.109 0.231 CD8_Naive L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -434019 sc-eQTL 7.19e-01 0.0339 0.0941 0.231 CD8_Naive L2
ENSG00000134644 PUM1 -203028 sc-eQTL 9.04e-03 0.196 0.0746 0.231 CD8_Naive L2
ENSG00000162511 LAPTM5 105189 sc-eQTL 6.13e-01 0.0367 0.0726 0.231 CD8_Naive L2
ENSG00000162517 PEF1 -781933 sc-eQTL 2.60e-01 -0.114 0.101 0.231 CD8_Naive L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 144459 sc-eQTL 7.55e-01 0.0283 0.0906 0.231 CD8_Naive L2
ENSG00000287510 AL137857.1 131270 sc-eQTL 3.84e-01 -0.0859 0.0985 0.231 CD8_Naive L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -433825 sc-eQTL 2.55e-01 -0.143 0.125 0.227 CD8_TCM L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -434019 sc-eQTL 9.79e-01 -0.00305 0.115 0.227 CD8_TCM L2
ENSG00000134644 PUM1 -203028 sc-eQTL 2.32e-01 -0.129 0.108 0.227 CD8_TCM L2
ENSG00000162511 LAPTM5 105189 sc-eQTL 2.22e-01 -0.138 0.113 0.227 CD8_TCM L2
ENSG00000162517 PEF1 -781933 sc-eQTL 7.49e-01 0.037 0.116 0.227 CD8_TCM L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 144459 sc-eQTL 8.89e-01 0.0146 0.105 0.227 CD8_TCM L2
ENSG00000287510 AL137857.1 131270 sc-eQTL 3.54e-01 -0.098 0.106 0.227 CD8_TCM L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -433825 sc-eQTL 2.89e-01 0.12 0.113 0.228 CD8_TEM L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -434019 sc-eQTL 1.44e-01 0.158 0.108 0.228 CD8_TEM L2
ENSG00000134644 PUM1 -203028 sc-eQTL 4.59e-01 -0.0819 0.111 0.228 CD8_TEM L2
ENSG00000162511 LAPTM5 105189 sc-eQTL 7.21e-01 0.0373 0.104 0.228 CD8_TEM L2
ENSG00000162517 PEF1 -781933 sc-eQTL 1.04e-01 0.159 0.0973 0.228 CD8_TEM L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 144459 sc-eQTL 8.33e-01 -0.0228 0.108 0.228 CD8_TEM L2
ENSG00000287510 AL137857.1 131270 sc-eQTL 8.38e-01 0.02 0.0977 0.228 CD8_TEM L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -433825 sc-eQTL 5.17e-01 0.0767 0.118 0.232 MAIT L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -434019 sc-eQTL 7.13e-01 -0.0385 0.105 0.232 MAIT L2
ENSG00000134644 PUM1 -203028 sc-eQTL 8.66e-01 -0.017 0.1 0.232 MAIT L2
ENSG00000162511 LAPTM5 105189 sc-eQTL 6.17e-01 -0.0475 0.0947 0.232 MAIT L2
ENSG00000162517 PEF1 -781933 sc-eQTL 2.40e-01 0.122 0.104 0.232 MAIT L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 144459 sc-eQTL 2.05e-01 -0.134 0.105 0.232 MAIT L2
ENSG00000287510 AL137857.1 131270 sc-eQTL 9.77e-01 -0.00308 0.109 0.232 MAIT L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -433825 sc-eQTL 6.11e-01 0.0594 0.116 0.229 NK_CD56bright L2
ENSG00000121753 ADGRB2 -901930 sc-eQTL 2.06e-01 0.115 0.0908 0.229 NK_CD56bright L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -434019 sc-eQTL 1.01e-01 0.161 0.0978 0.229 NK_CD56bright L2
ENSG00000134644 PUM1 -203028 sc-eQTL 2.60e-01 -0.116 0.103 0.229 NK_CD56bright L2
ENSG00000162511 LAPTM5 105189 sc-eQTL 9.67e-01 -0.00423 0.102 0.229 NK_CD56bright L2
ENSG00000162517 PEF1 -781933 sc-eQTL 2.40e-01 -0.116 0.0987 0.229 NK_CD56bright L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 144459 sc-eQTL 8.51e-02 0.176 0.102 0.229 NK_CD56bright L2
ENSG00000287510 AL137857.1 131270 sc-eQTL 9.20e-01 -0.0102 0.101 0.229 NK_CD56bright L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -433825 sc-eQTL 4.18e-01 -0.0894 0.11 0.231 NK_CD56dim L2
ENSG00000121753 ADGRB2 -901930 sc-eQTL 9.56e-01 0.00533 0.0971 0.231 NK_CD56dim L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -434019 sc-eQTL 1.94e-01 0.106 0.0813 0.231 NK_CD56dim L2
ENSG00000134644 PUM1 -203028 sc-eQTL 7.79e-01 0.0236 0.0837 0.231 NK_CD56dim L2
ENSG00000162511 LAPTM5 105189 sc-eQTL 5.21e-01 -0.0573 0.0892 0.231 NK_CD56dim L2
ENSG00000162517 PEF1 -781933 sc-eQTL 2.72e-01 -0.0872 0.0792 0.231 NK_CD56dim L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 144459 sc-eQTL 6.35e-01 0.0532 0.112 0.231 NK_CD56dim L2
ENSG00000287510 AL137857.1 131270 sc-eQTL 2.34e-02 -0.208 0.0912 0.231 NK_CD56dim L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -433825 sc-eQTL 3.28e-01 -0.113 0.115 0.237 NK_HLA L2
ENSG00000121753 ADGRB2 -901930 sc-eQTL 9.96e-01 -0.000498 0.0918 0.237 NK_HLA L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -434019 sc-eQTL 6.81e-01 0.0424 0.103 0.237 NK_HLA L2
ENSG00000134644 PUM1 -203028 sc-eQTL 1.94e-01 0.13 0.1 0.237 NK_HLA L2
ENSG00000162511 LAPTM5 105189 sc-eQTL 5.95e-01 -0.0511 0.096 0.237 NK_HLA L2
ENSG00000162517 PEF1 -781933 sc-eQTL 2.76e-01 0.118 0.108 0.237 NK_HLA L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 144459 sc-eQTL 1.70e-01 -0.14 0.102 0.237 NK_HLA L2
ENSG00000287510 AL137857.1 131270 sc-eQTL 1.45e-04 -0.369 0.0952 0.237 NK_HLA L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -433825 sc-eQTL 4.23e-01 -0.0861 0.107 0.231 NK_cytokine L2
ENSG00000121753 ADGRB2 -901930 sc-eQTL 6.99e-01 -0.0376 0.097 0.231 NK_cytokine L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -434019 sc-eQTL 2.72e-01 0.0921 0.0836 0.231 NK_cytokine L2
ENSG00000134644 PUM1 -203028 sc-eQTL 7.10e-03 0.242 0.0891 0.231 NK_cytokine L2
ENSG00000162511 LAPTM5 105189 sc-eQTL 7.02e-01 -0.0382 0.0998 0.231 NK_cytokine L2
ENSG00000162517 PEF1 -781933 sc-eQTL 5.53e-01 -0.0505 0.085 0.231 NK_cytokine L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 144459 sc-eQTL 2.59e-01 0.119 0.105 0.231 NK_cytokine L2
ENSG00000287510 AL137857.1 131270 sc-eQTL 2.86e-01 -0.105 0.0982 0.231 NK_cytokine L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -433825 sc-eQTL 3.68e-01 0.114 0.126 0.222 PB L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -434019 sc-eQTL 9.56e-01 -0.00817 0.147 0.222 PB L2
ENSG00000134644 PUM1 -203028 sc-eQTL 1.75e-01 0.173 0.127 0.222 PB L2
ENSG00000162510 MATN1 139378 sc-eQTL 8.12e-01 0.0283 0.119 0.222 PB L2
ENSG00000162511 LAPTM5 105189 sc-eQTL 5.78e-01 0.0474 0.0849 0.222 PB L2
ENSG00000162517 PEF1 -781933 sc-eQTL 9.88e-01 -0.00202 0.131 0.222 PB L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 144459 sc-eQTL 6.39e-01 0.0546 0.116 0.222 PB L2
ENSG00000287510 AL137857.1 131270 sc-eQTL 7.55e-01 -0.0387 0.124 0.222 PB L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -433825 sc-eQTL 3.35e-01 -0.0817 0.0846 0.23 Pro_T L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -434019 sc-eQTL 6.02e-01 0.0562 0.108 0.23 Pro_T L2
ENSG00000134644 PUM1 -203028 sc-eQTL 7.23e-01 -0.0356 0.1 0.23 Pro_T L2
ENSG00000162511 LAPTM5 105189 sc-eQTL 5.79e-01 0.04 0.072 0.23 Pro_T L2
ENSG00000162517 PEF1 -781933 sc-eQTL 7.85e-01 0.0289 0.106 0.23 Pro_T L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 144459 sc-eQTL 1.31e-01 0.152 0.1 0.23 Pro_T L2
ENSG00000287510 AL137857.1 131270 sc-eQTL 6.67e-01 -0.0399 0.0925 0.23 Pro_T L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -433825 sc-eQTL 5.19e-01 0.0726 0.112 0.231 Treg L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -434019 sc-eQTL 9.61e-01 0.00536 0.109 0.231 Treg L2
ENSG00000134644 PUM1 -203028 sc-eQTL 2.07e-01 0.11 0.0868 0.231 Treg L2
ENSG00000162511 LAPTM5 105189 sc-eQTL 9.57e-01 0.00541 0.0998 0.231 Treg L2
ENSG00000162517 PEF1 -781933 sc-eQTL 3.92e-01 -0.0923 0.108 0.231 Treg L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 144459 sc-eQTL 4.53e-02 -0.203 0.101 0.231 Treg L2
ENSG00000287510 AL137857.1 131270 sc-eQTL 6.12e-01 -0.0516 0.102 0.231 Treg L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -433825 sc-eQTL 1.84e-01 0.154 0.116 0.227 cDC L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -434019 sc-eQTL 6.81e-01 -0.0518 0.126 0.227 cDC L2
ENSG00000134644 PUM1 -203028 sc-eQTL 7.01e-01 0.0416 0.108 0.227 cDC L2
ENSG00000162511 LAPTM5 105189 sc-eQTL 6.25e-01 -0.0371 0.0758 0.227 cDC L2
ENSG00000162517 PEF1 -781933 sc-eQTL 5.71e-01 0.0624 0.11 0.227 cDC L2
ENSG00000168528 SERINC2 -546602 sc-eQTL 9.98e-01 -0.000273 0.0974 0.227 cDC L2
ENSG00000284543 LINC01226 -643263 sc-eQTL 9.53e-01 -0.00571 0.0957 0.227 cDC L2
ENSG00000287510 AL137857.1 131270 sc-eQTL 1.35e-01 -0.154 0.102 0.227 cDC L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -433825 sc-eQTL 3.95e-01 -0.076 0.0891 0.231 cMono_IL1B L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -434019 sc-eQTL 9.74e-01 0.00331 0.0996 0.231 cMono_IL1B L2
ENSG00000134644 PUM1 -203028 sc-eQTL 3.09e-02 -0.145 0.0666 0.231 cMono_IL1B L2
ENSG00000162511 LAPTM5 105189 sc-eQTL 7.03e-01 -0.0226 0.0591 0.231 cMono_IL1B L2
ENSG00000162512 SDC3 -45795 sc-eQTL 1.11e-01 0.177 0.111 0.231 cMono_IL1B L2
ENSG00000162517 PEF1 -781933 sc-eQTL 6.74e-01 0.0384 0.091 0.231 cMono_IL1B L2
ENSG00000168528 SERINC2 -546602 sc-eQTL 7.21e-01 -0.0404 0.113 0.231 cMono_IL1B L2
ENSG00000284543 LINC01226 -643263 sc-eQTL 9.39e-01 0.00765 0.0997 0.231 cMono_IL1B L2
ENSG00000287510 AL137857.1 131270 sc-eQTL 1.26e-01 -0.142 0.0925 0.231 cMono_IL1B L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -433825 sc-eQTL 5.60e-01 0.0554 0.0948 0.231 cMono_S100A L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -434019 sc-eQTL 2.63e-01 -0.126 0.112 0.231 cMono_S100A L2
ENSG00000134644 PUM1 -203028 sc-eQTL 8.12e-02 -0.141 0.0805 0.231 cMono_S100A L2
ENSG00000162511 LAPTM5 105189 sc-eQTL 8.55e-01 0.0114 0.0623 0.231 cMono_S100A L2
ENSG00000162512 SDC3 -45795 sc-eQTL 1.57e-01 0.152 0.107 0.231 cMono_S100A L2
ENSG00000162517 PEF1 -781933 sc-eQTL 7.38e-02 0.173 0.0964 0.231 cMono_S100A L2
ENSG00000168528 SERINC2 -546602 sc-eQTL 6.07e-01 -0.0587 0.114 0.231 cMono_S100A L2
ENSG00000284543 LINC01226 -643263 sc-eQTL 5.13e-01 0.0606 0.0925 0.231 cMono_S100A L2
ENSG00000287510 AL137857.1 131270 sc-eQTL 5.68e-01 0.0532 0.0929 0.231 cMono_S100A L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -433825 sc-eQTL 3.19e-01 0.146 0.146 0.215 gdT L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -434019 sc-eQTL 4.65e-01 0.0921 0.126 0.215 gdT L2
ENSG00000134644 PUM1 -203028 sc-eQTL 6.13e-01 0.0658 0.13 0.215 gdT L2
ENSG00000162511 LAPTM5 105189 sc-eQTL 3.76e-01 0.125 0.141 0.215 gdT L2
ENSG00000162517 PEF1 -781933 sc-eQTL 4.98e-01 0.0875 0.129 0.215 gdT L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 144459 sc-eQTL 4.14e-01 0.106 0.13 0.215 gdT L2
ENSG00000287510 AL137857.1 131270 sc-eQTL 5.53e-01 0.0749 0.126 0.215 gdT L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -433825 sc-eQTL 9.69e-01 0.00415 0.107 0.229 intMono L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -434019 sc-eQTL 1.44e-01 -0.168 0.114 0.229 intMono L2
ENSG00000134644 PUM1 -203028 sc-eQTL 7.85e-01 -0.0266 0.0973 0.229 intMono L2
ENSG00000162511 LAPTM5 105189 sc-eQTL 8.31e-01 -0.0163 0.0764 0.229 intMono L2
ENSG00000162512 SDC3 -45795 sc-eQTL 2.60e-01 -0.118 0.104 0.229 intMono L2
ENSG00000162517 PEF1 -781933 sc-eQTL 1.16e-02 -0.276 0.108 0.229 intMono L2
ENSG00000168528 SERINC2 -546602 sc-eQTL 7.89e-01 -0.0293 0.109 0.229 intMono L2
ENSG00000284543 LINC01226 -643263 sc-eQTL 2.66e-01 0.115 0.103 0.229 intMono L2
ENSG00000287510 AL137857.1 131270 sc-eQTL 9.21e-02 -0.174 0.103 0.229 intMono L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -433825 sc-eQTL 8.03e-01 -0.0246 0.0984 0.231 ncMono L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -434019 sc-eQTL 4.97e-01 -0.0713 0.105 0.231 ncMono L2
ENSG00000134644 PUM1 -203028 sc-eQTL 3.75e-01 0.076 0.0855 0.231 ncMono L2
ENSG00000162511 LAPTM5 105189 sc-eQTL 3.65e-01 -0.0706 0.0777 0.231 ncMono L2
ENSG00000162512 SDC3 -45795 sc-eQTL 9.05e-01 -0.0105 0.0873 0.231 ncMono L2
ENSG00000162517 PEF1 -781933 sc-eQTL 9.43e-01 -0.00712 0.1 0.231 ncMono L2
ENSG00000168528 SERINC2 -546602 sc-eQTL 8.18e-01 0.0219 0.0952 0.231 ncMono L2
ENSG00000284543 LINC01226 -643263 sc-eQTL 6.88e-01 -0.0382 0.0951 0.231 ncMono L2
ENSG00000287510 AL137857.1 131270 sc-eQTL 3.96e-01 -0.0838 0.0985 0.231 ncMono L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -433825 sc-eQTL 6.03e-01 0.0623 0.119 0.22 pDC L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -434019 sc-eQTL 8.51e-01 0.0247 0.131 0.22 pDC L2
ENSG00000134644 PUM1 -203028 sc-eQTL 9.70e-01 -0.00411 0.109 0.22 pDC L2
ENSG00000162511 LAPTM5 105189 sc-eQTL 8.64e-01 -0.0174 0.101 0.22 pDC L2
ENSG00000162517 PEF1 -781933 sc-eQTL 8.44e-01 0.0258 0.131 0.22 pDC L2
ENSG00000168528 SERINC2 -546602 sc-eQTL 2.37e-01 0.145 0.122 0.22 pDC L2
ENSG00000284543 LINC01226 -643263 sc-eQTL 9.98e-01 0.00025 0.0952 0.22 pDC L2
ENSG00000287510 AL137857.1 131270 sc-eQTL 3.42e-01 -0.106 0.112 0.22 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000060688 SNRNP40 -433825 sc-eQTL 8.92e-01 0.0155 0.114 0.231 B_Memory LOneK1K
ENSG00000121766 ZCCHC17 -434019 sc-eQTL 9.37e-01 0.00754 0.0947 0.231 B_Memory LOneK1K
ENSG00000134644 PUM1 -203028 sc-eQTL 6.24e-02 0.156 0.0832 0.231 B_Memory LOneK1K
ENSG00000162510 MATN1 139378 sc-eQTL 2.94e-01 0.1 0.0954 0.231 B_Memory LOneK1K
ENSG00000162511 LAPTM5 105189 sc-eQTL 4.96e-02 0.118 0.0595 0.231 B_Memory LOneK1K
ENSG00000162517 PEF1 -781933 sc-eQTL 2.28e-01 0.12 0.0992 0.231 B_Memory LOneK1K
ENSG00000186056 MATN1-AS1 144459 sc-eQTL 5.97e-01 0.042 0.0794 0.231 B_Memory LOneK1K
ENSG00000287510 AL137857.1 131270 sc-eQTL 7.89e-01 -0.0232 0.0866 0.231 B_Memory LOneK1K
ENSG00000060688 SNRNP40 -433825 sc-eQTL 7.71e-02 -0.182 0.102 0.231 B_Naive LOneK1K
ENSG00000121766 ZCCHC17 -434019 sc-eQTL 8.27e-01 -0.0178 0.0814 0.231 B_Naive LOneK1K
ENSG00000134644 PUM1 -203028 sc-eQTL 2.46e-01 0.0894 0.0767 0.231 B_Naive LOneK1K
ENSG00000162510 MATN1 139378 sc-eQTL 6.97e-02 -0.134 0.0735 0.231 B_Naive LOneK1K
ENSG00000162511 LAPTM5 105189 sc-eQTL 5.57e-01 0.0307 0.0521 0.231 B_Naive LOneK1K
ENSG00000162517 PEF1 -781933 sc-eQTL 5.98e-01 0.0503 0.0952 0.231 B_Naive LOneK1K
ENSG00000186056 MATN1-AS1 144459 sc-eQTL 4.18e-01 -0.0545 0.0673 0.231 B_Naive LOneK1K
ENSG00000287510 AL137857.1 131270 sc-eQTL 8.98e-02 -0.136 0.0795 0.231 B_Naive LOneK1K
ENSG00000060688 SNRNP40 -433825 sc-eQTL 7.61e-01 -0.0258 0.085 0.231 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000121766 ZCCHC17 -434019 sc-eQTL 4.85e-01 -0.0673 0.0961 0.231 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000134644 PUM1 -203028 sc-eQTL 2.22e-02 -0.14 0.0606 0.231 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000162511 LAPTM5 105189 sc-eQTL 8.96e-01 -0.00708 0.054 0.231 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000162512 SDC3 -45795 sc-eQTL 1.71e-02 0.261 0.109 0.231 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000162517 PEF1 -781933 sc-eQTL 1.72e-01 0.106 0.0771 0.231 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000168528 SERINC2 -546602 sc-eQTL 7.17e-01 -0.0411 0.113 0.231 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000284543 LINC01226 -643263 sc-eQTL 8.99e-01 -0.0118 0.0928 0.231 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000287510 AL137857.1 131270 sc-eQTL 3.91e-01 -0.0745 0.0868 0.231 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000060688 SNRNP40 -433825 sc-eQTL 8.25e-01 -0.0206 0.093 0.233 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000121766 ZCCHC17 -434019 sc-eQTL 8.65e-02 -0.174 0.101 0.233 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000134644 PUM1 -203028 sc-eQTL 4.01e-01 0.07 0.0832 0.233 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000162511 LAPTM5 105189 sc-eQTL 8.28e-01 -0.0145 0.0667 0.233 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000162512 SDC3 -45795 sc-eQTL 6.98e-01 -0.0378 0.0973 0.233 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000162517 PEF1 -781933 sc-eQTL 8.88e-02 -0.15 0.0879 0.233 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000168528 SERINC2 -546602 sc-eQTL 8.30e-01 0.0217 0.101 0.233 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000284543 LINC01226 -643263 sc-eQTL 9.15e-01 0.0102 0.0958 0.233 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000287510 AL137857.1 131270 sc-eQTL 2.97e-01 -0.1 0.0957 0.233 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000060688 SNRNP40 -433825 sc-eQTL 2.20e-01 -0.129 0.105 0.231 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000121753 ADGRB2 -901930 sc-eQTL 7.92e-01 -0.0236 0.0895 0.231 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000121766 ZCCHC17 -434019 sc-eQTL 1.40e-01 0.106 0.0714 0.231 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000134644 PUM1 -203028 sc-eQTL 6.57e-02 0.144 0.078 0.231 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000162511 LAPTM5 105189 sc-eQTL 4.86e-01 -0.0612 0.0878 0.231 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000162517 PEF1 -781933 sc-eQTL 3.19e-01 -0.0665 0.0666 0.231 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000186056 MATN1-AS1 144459 sc-eQTL 6.42e-01 0.0471 0.101 0.231 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000287510 AL137857.1 131270 sc-eQTL 9.19e-03 -0.226 0.0861 0.231 NK_CD56dim LOneK1K

Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF
ENSG00000162512 SDC3 -45795 eQTL 0.0432 0.0585 0.0289 0.0 0.0 0.228
ENSG00000168528 SERINC2 -546602 eQTL 0.00379 0.131 0.0452 0.0 0.0 0.228

Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina
ENSG00000121753 \N -901930 2.66e-07 1.08e-07 3.44e-08 1.7e-07 1.02e-07 9.13e-08 1.42e-07 5.24e-08 1.36e-07 3.99e-08 1.61e-07 7.49e-08 1.23e-07 6.07e-08 4.84e-08 7.76e-08 5.1e-08 1.06e-07 5.22e-08 3.15e-08 1.06e-07 1.31e-07 1.29e-07 5.01e-08 1.33e-07 1.09e-07 1.13e-07 8.49e-08 1.03e-07 1.1e-07 9.5e-08 3.59e-08 2.74e-08 8.26e-08 9.51e-08 4.12e-08 5.26e-08 8.75e-08 8.14e-08 3.59e-08 4.02e-08 1.37e-07 4.1e-08 3.48e-08 9.21e-08 1.8e-08 1.44e-07 4.82e-09 4.72e-08
ENSG00000168528 SERINC2 -546602 2.74e-07 1.19e-07 3.72e-08 1.81e-07 9.02e-08 1e-07 1.6e-07 5.33e-08 1.4e-07 4.24e-08 1.56e-07 8.02e-08 1.41e-07 6.38e-08 6.17e-08 7.5e-08 3.98e-08 1.18e-07 5.82e-08 4.03e-08 1.13e-07 1.27e-07 1.39e-07 4.54e-08 1.33e-07 1.14e-07 1.11e-07 9.15e-08 1.09e-07 1.12e-07 9.73e-08 3.95e-08 2.92e-08 8.82e-08 8.96e-08 3.96e-08 4.84e-08 9.13e-08 7.92e-08 3.98e-08 3.51e-08 1.4e-07 3.99e-08 1.13e-08 5.59e-08 1.68e-08 1.26e-07 4.5e-09 4.74e-08