logo

Genes within 1Mb (chr1:30862532:A:G):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD

Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000060688 SNRNP40 -434256 sc-eQTL 4.36e-01 0.0933 0.119 0.118 B L1
ENSG00000121766 ZCCHC17 -434450 sc-eQTL 5.74e-01 0.054 0.0957 0.118 B L1
ENSG00000134644 PUM1 -203459 sc-eQTL 8.27e-01 0.0176 0.0804 0.118 B L1
ENSG00000162510 MATN1 138947 sc-eQTL 7.57e-01 0.0261 0.0845 0.118 B L1
ENSG00000162511 LAPTM5 104758 sc-eQTL 4.30e-01 -0.0522 0.0661 0.118 B L1
ENSG00000162517 PEF1 -782364 sc-eQTL 7.53e-01 -0.0315 0.0999 0.118 B L1
ENSG00000186056 MATN1-AS1 144028 sc-eQTL 9.72e-01 -0.00274 0.0776 0.118 B L1
ENSG00000287510 AL137857.1 130839 sc-eQTL 9.10e-01 0.0104 0.0918 0.118 B L1
ENSG00000060688 SNRNP40 -434256 sc-eQTL 7.76e-01 0.0295 0.104 0.118 CD4T L1
ENSG00000121766 ZCCHC17 -434450 sc-eQTL 6.53e-01 -0.0364 0.0809 0.118 CD4T L1
ENSG00000134644 PUM1 -203459 sc-eQTL 2.32e-01 0.086 0.0718 0.118 CD4T L1
ENSG00000162511 LAPTM5 104758 sc-eQTL 6.56e-01 -0.0356 0.0798 0.118 CD4T L1
ENSG00000162517 PEF1 -782364 sc-eQTL 7.80e-01 0.0233 0.0835 0.118 CD4T L1
ENSG00000186056 MATN1-AS1 144028 sc-eQTL 7.71e-01 0.0208 0.0714 0.118 CD4T L1
ENSG00000287510 AL137857.1 130839 sc-eQTL 8.58e-01 -0.0153 0.0855 0.118 CD4T L1
ENSG00000060688 SNRNP40 -434256 sc-eQTL 4.17e-01 0.11 0.135 0.118 CD8T L1
ENSG00000121766 ZCCHC17 -434450 sc-eQTL 9.53e-01 -0.00535 0.0898 0.118 CD8T L1
ENSG00000134644 PUM1 -203459 sc-eQTL 3.78e-01 0.0698 0.0789 0.118 CD8T L1
ENSG00000162511 LAPTM5 104758 sc-eQTL 3.99e-01 -0.0648 0.0766 0.118 CD8T L1
ENSG00000162517 PEF1 -782364 sc-eQTL 8.26e-01 -0.0208 0.0945 0.118 CD8T L1
ENSG00000186056 MATN1-AS1 144028 sc-eQTL 8.62e-02 -0.154 0.0893 0.118 CD8T L1
ENSG00000287510 AL137857.1 130839 sc-eQTL 7.98e-01 0.0289 0.113 0.118 CD8T L1
ENSG00000060688 SNRNP40 -434256 sc-eQTL 8.31e-01 -0.0256 0.12 0.119 DC L1
ENSG00000121766 ZCCHC17 -434450 sc-eQTL 3.76e-01 -0.126 0.141 0.119 DC L1
ENSG00000134644 PUM1 -203459 sc-eQTL 2.52e-01 -0.127 0.111 0.119 DC L1
ENSG00000162511 LAPTM5 104758 sc-eQTL 4.12e-01 -0.065 0.0791 0.119 DC L1
ENSG00000162517 PEF1 -782364 sc-eQTL 4.64e-01 -0.0942 0.128 0.119 DC L1
ENSG00000168528 SERINC2 -547033 sc-eQTL 7.38e-01 0.0437 0.131 0.119 DC L1
ENSG00000284543 LINC01226 -643694 sc-eQTL 3.26e-01 -0.0849 0.0863 0.119 DC L1
ENSG00000287510 AL137857.1 130839 sc-eQTL 6.60e-01 -0.0552 0.125 0.119 DC L1
ENSG00000060688 SNRNP40 -434256 sc-eQTL 5.09e-01 -0.0614 0.0928 0.118 Mono L1
ENSG00000121766 ZCCHC17 -434450 sc-eQTL 1.59e-01 0.162 0.115 0.118 Mono L1
ENSG00000134644 PUM1 -203459 sc-eQTL 8.13e-01 0.0175 0.0738 0.118 Mono L1
ENSG00000162511 LAPTM5 104758 sc-eQTL 7.27e-01 -0.0237 0.0679 0.118 Mono L1
ENSG00000162512 SDC3 -46226 sc-eQTL 2.19e-03 0.396 0.128 0.118 Mono L1
ENSG00000162517 PEF1 -782364 sc-eQTL 5.33e-01 -0.0571 0.0914 0.118 Mono L1
ENSG00000168528 SERINC2 -547033 sc-eQTL 2.71e-01 -0.154 0.14 0.118 Mono L1
ENSG00000284543 LINC01226 -643694 sc-eQTL 8.10e-01 0.0297 0.123 0.118 Mono L1
ENSG00000287510 AL137857.1 130839 sc-eQTL 9.56e-01 0.00599 0.108 0.118 Mono L1
ENSG00000060688 SNRNP40 -434256 sc-eQTL 3.31e-01 -0.127 0.131 0.118 NK L1
ENSG00000121753 ADGRB2 -902361 sc-eQTL 1.39e-01 -0.167 0.112 0.118 NK L1
ENSG00000121766 ZCCHC17 -434450 sc-eQTL 9.99e-01 -0.000115 0.0896 0.118 NK L1
ENSG00000134644 PUM1 -203459 sc-eQTL 4.72e-01 0.0677 0.0939 0.118 NK L1
ENSG00000162511 LAPTM5 104758 sc-eQTL 3.85e-01 -0.0939 0.108 0.118 NK L1
ENSG00000162517 PEF1 -782364 sc-eQTL 3.95e-01 -0.0672 0.0788 0.118 NK L1
ENSG00000186056 MATN1-AS1 144028 sc-eQTL 3.28e-01 -0.119 0.121 0.118 NK L1
ENSG00000287510 AL137857.1 130839 sc-eQTL 6.78e-01 -0.0467 0.112 0.118 NK L1
ENSG00000060688 SNRNP40 -434256 sc-eQTL 3.85e-01 0.0845 0.0971 0.118 Other_T L1
ENSG00000121766 ZCCHC17 -434450 sc-eQTL 7.66e-01 0.0309 0.104 0.118 Other_T L1
ENSG00000134644 PUM1 -203459 sc-eQTL 9.61e-02 0.155 0.0929 0.118 Other_T L1
ENSG00000162511 LAPTM5 104758 sc-eQTL 4.35e-01 0.0598 0.0765 0.118 Other_T L1
ENSG00000162517 PEF1 -782364 sc-eQTL 6.21e-01 0.0507 0.102 0.118 Other_T L1
ENSG00000186056 MATN1-AS1 144028 sc-eQTL 6.57e-02 -0.23 0.125 0.118 Other_T L1
ENSG00000287510 AL137857.1 130839 sc-eQTL 6.13e-01 0.0661 0.131 0.118 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000060688 SNRNP40 -434256 sc-eQTL 5.27e-01 -0.094 0.148 0.13 B_Activated L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -434450 sc-eQTL 9.84e-01 -0.00299 0.15 0.13 B_Activated L2
ENSG00000134644 PUM1 -203459 sc-eQTL 4.76e-01 0.0993 0.139 0.13 B_Activated L2
ENSG00000162510 MATN1 138947 sc-eQTL 6.21e-01 0.0602 0.121 0.13 B_Activated L2
ENSG00000162511 LAPTM5 104758 sc-eQTL 4.47e-01 0.0645 0.0846 0.13 B_Activated L2
ENSG00000162517 PEF1 -782364 sc-eQTL 6.85e-01 -0.0587 0.144 0.13 B_Activated L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 144028 sc-eQTL 5.37e-01 -0.0845 0.137 0.13 B_Activated L2
ENSG00000287510 AL137857.1 130839 sc-eQTL 7.25e-01 -0.0427 0.121 0.13 B_Activated L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -434256 sc-eQTL 3.08e-02 0.317 0.146 0.118 B_Intermediate L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -434450 sc-eQTL 3.69e-01 -0.11 0.123 0.118 B_Intermediate L2
ENSG00000134644 PUM1 -203459 sc-eQTL 3.10e-02 -0.249 0.115 0.118 B_Intermediate L2
ENSG00000162510 MATN1 138947 sc-eQTL 9.47e-01 0.00806 0.121 0.118 B_Intermediate L2
ENSG00000162511 LAPTM5 104758 sc-eQTL 6.79e-01 -0.0307 0.0741 0.118 B_Intermediate L2
ENSG00000162517 PEF1 -782364 sc-eQTL 8.89e-01 -0.0193 0.138 0.118 B_Intermediate L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 144028 sc-eQTL 7.70e-01 0.0304 0.104 0.118 B_Intermediate L2
ENSG00000287510 AL137857.1 130839 sc-eQTL 3.39e-01 -0.111 0.116 0.118 B_Intermediate L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -434256 sc-eQTL 8.54e-01 0.0263 0.143 0.116 B_Memory L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -434450 sc-eQTL 7.69e-01 -0.0388 0.132 0.116 B_Memory L2
ENSG00000134644 PUM1 -203459 sc-eQTL 6.59e-01 0.0507 0.115 0.116 B_Memory L2
ENSG00000162510 MATN1 138947 sc-eQTL 8.87e-01 -0.0156 0.11 0.116 B_Memory L2
ENSG00000162511 LAPTM5 104758 sc-eQTL 6.73e-01 -0.0411 0.0973 0.116 B_Memory L2
ENSG00000162517 PEF1 -782364 sc-eQTL 2.78e-01 -0.141 0.13 0.116 B_Memory L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 144028 sc-eQTL 3.49e-01 -0.104 0.111 0.116 B_Memory L2
ENSG00000287510 AL137857.1 130839 sc-eQTL 3.63e-01 -0.119 0.13 0.116 B_Memory L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -434256 sc-eQTL 8.54e-01 0.024 0.13 0.118 B_Naive1 L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -434450 sc-eQTL 5.06e-01 -0.0747 0.112 0.118 B_Naive1 L2
ENSG00000134644 PUM1 -203459 sc-eQTL 9.62e-01 0.00472 0.0991 0.118 B_Naive1 L2
ENSG00000162510 MATN1 138947 sc-eQTL 3.42e-01 0.0956 0.1 0.118 B_Naive1 L2
ENSG00000162511 LAPTM5 104758 sc-eQTL 6.03e-01 -0.035 0.0671 0.118 B_Naive1 L2
ENSG00000162517 PEF1 -782364 sc-eQTL 5.38e-01 -0.073 0.118 0.118 B_Naive1 L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 144028 sc-eQTL 4.05e-01 0.0735 0.0881 0.118 B_Naive1 L2
ENSG00000287510 AL137857.1 130839 sc-eQTL 6.90e-02 0.198 0.108 0.118 B_Naive1 L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -434256 sc-eQTL 6.24e-01 -0.0684 0.139 0.116 B_Naive2 L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -434450 sc-eQTL 1.43e-01 0.169 0.115 0.116 B_Naive2 L2
ENSG00000134644 PUM1 -203459 sc-eQTL 7.95e-01 -0.0293 0.113 0.116 B_Naive2 L2
ENSG00000162510 MATN1 138947 sc-eQTL 5.48e-01 0.065 0.108 0.116 B_Naive2 L2
ENSG00000162511 LAPTM5 104758 sc-eQTL 6.45e-01 -0.0339 0.0734 0.116 B_Naive2 L2
ENSG00000162517 PEF1 -782364 sc-eQTL 7.66e-01 -0.0398 0.134 0.116 B_Naive2 L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 144028 sc-eQTL 2.81e-01 -0.115 0.107 0.116 B_Naive2 L2
ENSG00000287510 AL137857.1 130839 sc-eQTL 1.80e-01 0.155 0.115 0.116 B_Naive2 L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -434256 sc-eQTL 9.81e-01 0.0032 0.136 0.12 CD4_CTL L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -434450 sc-eQTL 1.66e-02 0.319 0.132 0.12 CD4_CTL L2
ENSG00000134644 PUM1 -203459 sc-eQTL 3.72e-01 -0.117 0.131 0.12 CD4_CTL L2
ENSG00000162511 LAPTM5 104758 sc-eQTL 6.71e-02 -0.214 0.116 0.12 CD4_CTL L2
ENSG00000162517 PEF1 -782364 sc-eQTL 8.16e-01 -0.028 0.12 0.12 CD4_CTL L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 144028 sc-eQTL 2.72e-01 -0.141 0.128 0.12 CD4_CTL L2
ENSG00000287510 AL137857.1 130839 sc-eQTL 5.22e-01 -0.0725 0.113 0.12 CD4_CTL L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -434256 sc-eQTL 5.71e-01 0.062 0.109 0.118 CD4_Naive L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -434450 sc-eQTL 6.51e-01 -0.0439 0.0969 0.118 CD4_Naive L2
ENSG00000134644 PUM1 -203459 sc-eQTL 7.78e-02 0.136 0.0769 0.118 CD4_Naive L2
ENSG00000162511 LAPTM5 104758 sc-eQTL 6.89e-01 0.0332 0.0829 0.118 CD4_Naive L2
ENSG00000162517 PEF1 -782364 sc-eQTL 6.10e-01 -0.0465 0.0909 0.118 CD4_Naive L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 144028 sc-eQTL 4.55e-01 0.063 0.0841 0.118 CD4_Naive L2
ENSG00000287510 AL137857.1 130839 sc-eQTL 6.15e-01 0.0487 0.0966 0.118 CD4_Naive L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -434256 sc-eQTL 9.57e-01 -0.00741 0.136 0.118 CD4_TCM L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -434450 sc-eQTL 3.11e-01 0.111 0.109 0.118 CD4_TCM L2
ENSG00000134644 PUM1 -203459 sc-eQTL 4.21e-01 -0.0781 0.0969 0.118 CD4_TCM L2
ENSG00000162511 LAPTM5 104758 sc-eQTL 3.62e-01 -0.0733 0.0803 0.118 CD4_TCM L2
ENSG00000162517 PEF1 -782364 sc-eQTL 9.86e-01 0.00185 0.108 0.118 CD4_TCM L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 144028 sc-eQTL 4.98e-01 -0.0693 0.102 0.118 CD4_TCM L2
ENSG00000287510 AL137857.1 130839 sc-eQTL 8.31e-01 -0.0242 0.114 0.118 CD4_TCM L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -434256 sc-eQTL 4.20e-01 -0.11 0.136 0.118 CD4_TEM L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -434450 sc-eQTL 3.37e-01 -0.124 0.129 0.118 CD4_TEM L2
ENSG00000134644 PUM1 -203459 sc-eQTL 9.87e-01 -0.00179 0.108 0.118 CD4_TEM L2
ENSG00000162511 LAPTM5 104758 sc-eQTL 4.18e-01 -0.0884 0.109 0.118 CD4_TEM L2
ENSG00000162517 PEF1 -782364 sc-eQTL 8.32e-01 0.026 0.122 0.118 CD4_TEM L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 144028 sc-eQTL 6.52e-01 -0.0577 0.128 0.118 CD4_TEM L2
ENSG00000287510 AL137857.1 130839 sc-eQTL 7.52e-01 0.0398 0.126 0.118 CD4_TEM L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -434256 sc-eQTL 8.09e-01 0.0352 0.145 0.118 CD8_CTL L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -434450 sc-eQTL 6.68e-01 0.0477 0.111 0.118 CD8_CTL L2
ENSG00000134644 PUM1 -203459 sc-eQTL 7.54e-01 0.0339 0.108 0.118 CD8_CTL L2
ENSG00000162511 LAPTM5 104758 sc-eQTL 7.83e-01 -0.0329 0.119 0.118 CD8_CTL L2
ENSG00000162517 PEF1 -782364 sc-eQTL 8.30e-01 0.0223 0.104 0.118 CD8_CTL L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 144028 sc-eQTL 1.07e-01 -0.202 0.125 0.118 CD8_CTL L2
ENSG00000287510 AL137857.1 130839 sc-eQTL 6.41e-01 -0.0552 0.118 0.118 CD8_CTL L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -434256 sc-eQTL 8.24e-01 0.0301 0.136 0.118 CD8_Naive L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -434450 sc-eQTL 5.86e-01 -0.0637 0.117 0.118 CD8_Naive L2
ENSG00000134644 PUM1 -203459 sc-eQTL 7.76e-01 -0.0267 0.094 0.118 CD8_Naive L2
ENSG00000162511 LAPTM5 104758 sc-eQTL 4.16e-01 0.0733 0.09 0.118 CD8_Naive L2
ENSG00000162517 PEF1 -782364 sc-eQTL 9.73e-01 -0.0043 0.125 0.118 CD8_Naive L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 144028 sc-eQTL 1.92e-01 -0.147 0.112 0.118 CD8_Naive L2
ENSG00000287510 AL137857.1 130839 sc-eQTL 4.23e-01 -0.0982 0.122 0.118 CD8_Naive L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -434256 sc-eQTL 5.12e-01 -0.0995 0.151 0.116 CD8_TCM L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -434450 sc-eQTL 8.42e-01 0.0277 0.139 0.116 CD8_TCM L2
ENSG00000134644 PUM1 -203459 sc-eQTL 1.55e-01 0.185 0.13 0.116 CD8_TCM L2
ENSG00000162511 LAPTM5 104758 sc-eQTL 4.25e-01 0.109 0.136 0.116 CD8_TCM L2
ENSG00000162517 PEF1 -782364 sc-eQTL 4.73e-01 -0.1 0.139 0.116 CD8_TCM L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 144028 sc-eQTL 2.89e-01 -0.134 0.126 0.116 CD8_TCM L2
ENSG00000287510 AL137857.1 130839 sc-eQTL 1.56e-01 0.181 0.127 0.116 CD8_TCM L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -434256 sc-eQTL 1.69e-02 -0.337 0.14 0.119 CD8_TEM L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -434450 sc-eQTL 9.62e-01 0.00657 0.136 0.119 CD8_TEM L2
ENSG00000134644 PUM1 -203459 sc-eQTL 5.81e-01 0.0769 0.139 0.119 CD8_TEM L2
ENSG00000162511 LAPTM5 104758 sc-eQTL 1.27e-01 -0.199 0.13 0.119 CD8_TEM L2
ENSG00000162517 PEF1 -782364 sc-eQTL 1.00e-01 -0.202 0.122 0.119 CD8_TEM L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 144028 sc-eQTL 4.19e-01 -0.11 0.136 0.119 CD8_TEM L2
ENSG00000287510 AL137857.1 130839 sc-eQTL 5.67e-01 0.0704 0.123 0.119 CD8_TEM L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -434256 sc-eQTL 2.96e-01 0.149 0.142 0.117 MAIT L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -434450 sc-eQTL 2.00e-01 0.162 0.126 0.117 MAIT L2
ENSG00000134644 PUM1 -203459 sc-eQTL 1.05e-01 0.196 0.12 0.117 MAIT L2
ENSG00000162511 LAPTM5 104758 sc-eQTL 9.50e-01 -0.00715 0.114 0.117 MAIT L2
ENSG00000162517 PEF1 -782364 sc-eQTL 9.97e-01 -0.000456 0.125 0.117 MAIT L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 144028 sc-eQTL 6.38e-02 -0.235 0.126 0.117 MAIT L2
ENSG00000287510 AL137857.1 130839 sc-eQTL 3.65e-01 0.119 0.131 0.117 MAIT L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -434256 sc-eQTL 9.07e-01 -0.0171 0.146 0.12 NK_CD56bright L2
ENSG00000121753 ADGRB2 -902361 sc-eQTL 1.56e-01 -0.162 0.114 0.12 NK_CD56bright L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -434450 sc-eQTL 8.97e-01 0.0159 0.123 0.12 NK_CD56bright L2
ENSG00000134644 PUM1 -203459 sc-eQTL 3.02e-01 0.133 0.129 0.12 NK_CD56bright L2
ENSG00000162511 LAPTM5 104758 sc-eQTL 6.74e-01 0.0537 0.128 0.12 NK_CD56bright L2
ENSG00000162517 PEF1 -782364 sc-eQTL 2.50e-01 -0.142 0.124 0.12 NK_CD56bright L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 144028 sc-eQTL 3.18e-01 0.128 0.128 0.12 NK_CD56bright L2
ENSG00000287510 AL137857.1 130839 sc-eQTL 5.63e-01 0.0731 0.126 0.12 NK_CD56bright L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -434256 sc-eQTL 4.65e-01 -0.101 0.138 0.119 NK_CD56dim L2
ENSG00000121753 ADGRB2 -902361 sc-eQTL 5.59e-01 -0.0714 0.122 0.119 NK_CD56dim L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -434450 sc-eQTL 9.02e-01 0.0126 0.103 0.119 NK_CD56dim L2
ENSG00000134644 PUM1 -203459 sc-eQTL 7.82e-01 0.0291 0.105 0.119 NK_CD56dim L2
ENSG00000162511 LAPTM5 104758 sc-eQTL 3.73e-01 -0.0999 0.112 0.119 NK_CD56dim L2
ENSG00000162517 PEF1 -782364 sc-eQTL 2.95e-01 -0.105 0.0995 0.119 NK_CD56dim L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 144028 sc-eQTL 2.59e-01 -0.159 0.14 0.119 NK_CD56dim L2
ENSG00000287510 AL137857.1 130839 sc-eQTL 1.81e-01 -0.155 0.115 0.119 NK_CD56dim L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -434256 sc-eQTL 6.80e-01 -0.0608 0.147 0.121 NK_HLA L2
ENSG00000121753 ADGRB2 -902361 sc-eQTL 7.80e-02 -0.206 0.116 0.121 NK_HLA L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -434450 sc-eQTL 3.68e-01 -0.119 0.131 0.121 NK_HLA L2
ENSG00000134644 PUM1 -203459 sc-eQTL 4.75e-01 0.0918 0.128 0.121 NK_HLA L2
ENSG00000162511 LAPTM5 104758 sc-eQTL 4.88e-01 -0.085 0.122 0.121 NK_HLA L2
ENSG00000162517 PEF1 -782364 sc-eQTL 8.03e-01 -0.0344 0.138 0.121 NK_HLA L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 144028 sc-eQTL 6.75e-01 0.0546 0.13 0.121 NK_HLA L2
ENSG00000287510 AL137857.1 130839 sc-eQTL 8.02e-01 0.0316 0.126 0.121 NK_HLA L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -434256 sc-eQTL 6.85e-01 -0.0548 0.135 0.119 NK_cytokine L2
ENSG00000121753 ADGRB2 -902361 sc-eQTL 1.29e-01 -0.184 0.121 0.119 NK_cytokine L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -434450 sc-eQTL 8.47e-01 0.0204 0.105 0.119 NK_cytokine L2
ENSG00000134644 PUM1 -203459 sc-eQTL 7.15e-01 0.0415 0.114 0.119 NK_cytokine L2
ENSG00000162511 LAPTM5 104758 sc-eQTL 5.96e-01 -0.0664 0.125 0.119 NK_cytokine L2
ENSG00000162517 PEF1 -782364 sc-eQTL 4.36e-01 0.083 0.106 0.119 NK_cytokine L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 144028 sc-eQTL 1.97e-01 -0.171 0.132 0.119 NK_cytokine L2
ENSG00000287510 AL137857.1 130839 sc-eQTL 8.82e-01 0.0183 0.123 0.119 NK_cytokine L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -434256 sc-eQTL 4.01e-02 -0.327 0.157 0.126 PB L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -434450 sc-eQTL 2.71e-01 0.204 0.185 0.126 PB L2
ENSG00000134644 PUM1 -203459 sc-eQTL 8.86e-01 0.0232 0.162 0.126 PB L2
ENSG00000162510 MATN1 138947 sc-eQTL 7.31e-01 0.052 0.151 0.126 PB L2
ENSG00000162511 LAPTM5 104758 sc-eQTL 6.65e-01 -0.0467 0.108 0.126 PB L2
ENSG00000162517 PEF1 -782364 sc-eQTL 1.18e-02 -0.412 0.161 0.126 PB L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 144028 sc-eQTL 1.85e-01 -0.195 0.146 0.126 PB L2
ENSG00000287510 AL137857.1 130839 sc-eQTL 7.74e-03 0.412 0.152 0.126 PB L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -434256 sc-eQTL 2.65e-01 0.116 0.104 0.117 Pro_T L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -434450 sc-eQTL 5.14e-01 -0.0863 0.132 0.117 Pro_T L2
ENSG00000134644 PUM1 -203459 sc-eQTL 4.80e-01 0.087 0.123 0.117 Pro_T L2
ENSG00000162511 LAPTM5 104758 sc-eQTL 5.05e-01 0.059 0.0884 0.117 Pro_T L2
ENSG00000162517 PEF1 -782364 sc-eQTL 5.95e-01 0.069 0.13 0.117 Pro_T L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 144028 sc-eQTL 3.31e-01 -0.12 0.123 0.117 Pro_T L2
ENSG00000287510 AL137857.1 130839 sc-eQTL 8.62e-01 0.0198 0.114 0.117 Pro_T L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -434256 sc-eQTL 4.03e-01 -0.117 0.14 0.118 Treg L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -434450 sc-eQTL 9.48e-01 -0.00875 0.135 0.118 Treg L2
ENSG00000134644 PUM1 -203459 sc-eQTL 8.45e-01 -0.0212 0.108 0.118 Treg L2
ENSG00000162511 LAPTM5 104758 sc-eQTL 8.72e-01 -0.02 0.124 0.118 Treg L2
ENSG00000162517 PEF1 -782364 sc-eQTL 1.45e-01 0.195 0.133 0.118 Treg L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 144028 sc-eQTL 9.92e-01 0.00124 0.126 0.118 Treg L2
ENSG00000287510 AL137857.1 130839 sc-eQTL 7.63e-01 0.0381 0.126 0.118 Treg L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -434256 sc-eQTL 4.06e-01 -0.119 0.143 0.122 cDC L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -434450 sc-eQTL 5.12e-01 -0.102 0.154 0.122 cDC L2
ENSG00000134644 PUM1 -203459 sc-eQTL 2.61e-01 -0.149 0.132 0.122 cDC L2
ENSG00000162511 LAPTM5 104758 sc-eQTL 1.37e-01 -0.138 0.0925 0.122 cDC L2
ENSG00000162517 PEF1 -782364 sc-eQTL 2.55e-01 -0.153 0.134 0.122 cDC L2
ENSG00000168528 SERINC2 -547033 sc-eQTL 7.76e-01 -0.034 0.12 0.122 cDC L2
ENSG00000284543 LINC01226 -643694 sc-eQTL 4.86e-01 0.0818 0.117 0.122 cDC L2
ENSG00000287510 AL137857.1 130839 sc-eQTL 2.78e-01 0.137 0.126 0.122 cDC L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -434256 sc-eQTL 7.09e-01 -0.0416 0.112 0.118 cMono_IL1B L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -434450 sc-eQTL 4.01e-01 0.105 0.124 0.118 cMono_IL1B L2
ENSG00000134644 PUM1 -203459 sc-eQTL 7.70e-01 -0.0247 0.0842 0.118 cMono_IL1B L2
ENSG00000162511 LAPTM5 104758 sc-eQTL 5.47e-01 -0.0445 0.0738 0.118 cMono_IL1B L2
ENSG00000162512 SDC3 -46226 sc-eQTL 6.53e-02 0.256 0.138 0.118 cMono_IL1B L2
ENSG00000162517 PEF1 -782364 sc-eQTL 8.03e-01 -0.0284 0.114 0.118 cMono_IL1B L2
ENSG00000168528 SERINC2 -547033 sc-eQTL 2.58e-01 -0.159 0.141 0.118 cMono_IL1B L2
ENSG00000284543 LINC01226 -643694 sc-eQTL 8.77e-01 0.0193 0.125 0.118 cMono_IL1B L2
ENSG00000287510 AL137857.1 130839 sc-eQTL 6.48e-01 -0.053 0.116 0.118 cMono_IL1B L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -434256 sc-eQTL 5.38e-01 -0.0728 0.118 0.118 cMono_S100A L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -434450 sc-eQTL 1.18e-01 0.218 0.139 0.118 cMono_S100A L2
ENSG00000134644 PUM1 -203459 sc-eQTL 3.17e-01 -0.101 0.101 0.118 cMono_S100A L2
ENSG00000162511 LAPTM5 104758 sc-eQTL 9.18e-01 0.008 0.0775 0.118 cMono_S100A L2
ENSG00000162512 SDC3 -46226 sc-eQTL 5.31e-01 0.084 0.134 0.118 cMono_S100A L2
ENSG00000162517 PEF1 -782364 sc-eQTL 7.51e-01 -0.0384 0.121 0.118 cMono_S100A L2
ENSG00000168528 SERINC2 -547033 sc-eQTL 4.55e-01 -0.106 0.142 0.118 cMono_S100A L2
ENSG00000284543 LINC01226 -643694 sc-eQTL 3.28e-01 -0.113 0.115 0.118 cMono_S100A L2
ENSG00000287510 AL137857.1 130839 sc-eQTL 6.36e-01 0.0548 0.116 0.118 cMono_S100A L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -434256 sc-eQTL 2.45e-01 -0.205 0.175 0.103 gdT L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -434450 sc-eQTL 5.27e-01 0.0959 0.151 0.103 gdT L2
ENSG00000134644 PUM1 -203459 sc-eQTL 8.62e-01 0.0271 0.156 0.103 gdT L2
ENSG00000162511 LAPTM5 104758 sc-eQTL 5.98e-01 -0.0895 0.169 0.103 gdT L2
ENSG00000162517 PEF1 -782364 sc-eQTL 6.34e-01 -0.0738 0.155 0.103 gdT L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 144028 sc-eQTL 8.48e-01 -0.0301 0.156 0.103 gdT L2
ENSG00000287510 AL137857.1 130839 sc-eQTL 9.12e-01 -0.0167 0.152 0.103 gdT L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -434256 sc-eQTL 5.00e-01 -0.0875 0.13 0.118 intMono L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -434450 sc-eQTL 8.79e-01 0.0213 0.14 0.118 intMono L2
ENSG00000134644 PUM1 -203459 sc-eQTL 4.41e-01 0.0912 0.118 0.118 intMono L2
ENSG00000162511 LAPTM5 104758 sc-eQTL 9.47e-01 -0.00614 0.0929 0.118 intMono L2
ENSG00000162512 SDC3 -46226 sc-eQTL 2.92e-02 0.276 0.126 0.118 intMono L2
ENSG00000162517 PEF1 -782364 sc-eQTL 3.71e-01 -0.12 0.133 0.118 intMono L2
ENSG00000168528 SERINC2 -547033 sc-eQTL 3.18e-01 -0.133 0.133 0.118 intMono L2
ENSG00000284543 LINC01226 -643694 sc-eQTL 3.61e-01 0.115 0.126 0.118 intMono L2
ENSG00000287510 AL137857.1 130839 sc-eQTL 5.64e-01 -0.0728 0.126 0.118 intMono L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -434256 sc-eQTL 5.21e-01 0.0781 0.122 0.12 ncMono L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -434450 sc-eQTL 8.82e-01 -0.0193 0.13 0.12 ncMono L2
ENSG00000134644 PUM1 -203459 sc-eQTL 1.65e-02 0.253 0.104 0.12 ncMono L2
ENSG00000162511 LAPTM5 104758 sc-eQTL 8.70e-01 0.0158 0.0963 0.12 ncMono L2
ENSG00000162512 SDC3 -46226 sc-eQTL 9.63e-03 0.277 0.106 0.12 ncMono L2
ENSG00000162517 PEF1 -782364 sc-eQTL 4.06e-01 -0.103 0.124 0.12 ncMono L2
ENSG00000168528 SERINC2 -547033 sc-eQTL 4.41e-01 -0.0908 0.118 0.12 ncMono L2
ENSG00000284543 LINC01226 -643694 sc-eQTL 8.97e-01 -0.0153 0.118 0.12 ncMono L2
ENSG00000287510 AL137857.1 130839 sc-eQTL 4.41e-01 0.0941 0.122 0.12 ncMono L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -434256 sc-eQTL 4.53e-01 0.102 0.135 0.124 pDC L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -434450 sc-eQTL 8.55e-01 0.0273 0.149 0.124 pDC L2
ENSG00000134644 PUM1 -203459 sc-eQTL 8.39e-01 0.0251 0.123 0.124 pDC L2
ENSG00000162511 LAPTM5 104758 sc-eQTL 3.50e-01 -0.107 0.114 0.124 pDC L2
ENSG00000162517 PEF1 -782364 sc-eQTL 3.93e-01 0.127 0.148 0.124 pDC L2
ENSG00000168528 SERINC2 -547033 sc-eQTL 6.34e-01 -0.0663 0.139 0.124 pDC L2
ENSG00000284543 LINC01226 -643694 sc-eQTL 1.48e-01 -0.156 0.107 0.124 pDC L2
ENSG00000287510 AL137857.1 130839 sc-eQTL 3.33e-02 -0.269 0.125 0.124 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000060688 SNRNP40 -434256 sc-eQTL 1.06e-01 0.225 0.139 0.118 B_Memory LOneK1K
ENSG00000121766 ZCCHC17 -434450 sc-eQTL 3.88e-01 -0.1 0.116 0.118 B_Memory LOneK1K
ENSG00000134644 PUM1 -203459 sc-eQTL 3.24e-01 -0.102 0.103 0.118 B_Memory LOneK1K
ENSG00000162510 MATN1 138947 sc-eQTL 7.23e-01 -0.0417 0.117 0.118 B_Memory LOneK1K
ENSG00000162511 LAPTM5 104758 sc-eQTL 4.16e-01 -0.06 0.0736 0.118 B_Memory LOneK1K
ENSG00000162517 PEF1 -782364 sc-eQTL 3.00e-01 -0.126 0.122 0.118 B_Memory LOneK1K
ENSG00000186056 MATN1-AS1 144028 sc-eQTL 7.47e-01 -0.0314 0.0974 0.118 B_Memory LOneK1K
ENSG00000287510 AL137857.1 130839 sc-eQTL 7.26e-02 -0.19 0.105 0.118 B_Memory LOneK1K
ENSG00000060688 SNRNP40 -434256 sc-eQTL 8.71e-01 0.0207 0.127 0.118 B_Naive LOneK1K
ENSG00000121766 ZCCHC17 -434450 sc-eQTL 7.29e-01 0.035 0.101 0.118 B_Naive LOneK1K
ENSG00000134644 PUM1 -203459 sc-eQTL 8.98e-01 0.0123 0.0952 0.118 B_Naive LOneK1K
ENSG00000162510 MATN1 138947 sc-eQTL 3.88e-01 0.0791 0.0915 0.118 B_Naive LOneK1K
ENSG00000162511 LAPTM5 104758 sc-eQTL 4.31e-01 -0.0508 0.0644 0.118 B_Naive LOneK1K
ENSG00000162517 PEF1 -782364 sc-eQTL 5.15e-01 -0.0767 0.118 0.118 B_Naive LOneK1K
ENSG00000186056 MATN1-AS1 144028 sc-eQTL 4.13e-01 0.0683 0.0832 0.118 B_Naive LOneK1K
ENSG00000287510 AL137857.1 130839 sc-eQTL 1.15e-01 0.156 0.0984 0.118 B_Naive LOneK1K
ENSG00000060688 SNRNP40 -434256 sc-eQTL 6.18e-01 -0.0531 0.106 0.118 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000121766 ZCCHC17 -434450 sc-eQTL 9.32e-02 0.202 0.12 0.118 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000134644 PUM1 -203459 sc-eQTL 5.15e-01 -0.0501 0.0768 0.118 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000162511 LAPTM5 104758 sc-eQTL 6.96e-01 -0.0265 0.0675 0.118 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000162512 SDC3 -46226 sc-eQTL 1.49e-01 0.199 0.137 0.118 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000162517 PEF1 -782364 sc-eQTL 7.96e-01 -0.0251 0.0969 0.118 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000168528 SERINC2 -547033 sc-eQTL 3.17e-01 -0.142 0.141 0.118 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000284543 LINC01226 -643694 sc-eQTL 9.89e-01 0.00157 0.116 0.118 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000287510 AL137857.1 130839 sc-eQTL 9.62e-01 -0.00521 0.109 0.118 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000060688 SNRNP40 -434256 sc-eQTL 3.53e-01 0.108 0.116 0.116 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000121766 ZCCHC17 -434450 sc-eQTL 8.12e-01 -0.0303 0.127 0.116 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000134644 PUM1 -203459 sc-eQTL 1.09e-01 0.166 0.103 0.116 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000162511 LAPTM5 104758 sc-eQTL 7.69e-01 -0.0245 0.0832 0.116 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000162512 SDC3 -46226 sc-eQTL 5.61e-03 0.334 0.119 0.116 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000162517 PEF1 -782364 sc-eQTL 4.91e-01 -0.0762 0.11 0.116 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000168528 SERINC2 -547033 sc-eQTL 7.62e-01 -0.0383 0.126 0.116 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000284543 LINC01226 -643694 sc-eQTL 9.59e-01 -0.00622 0.12 0.116 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000287510 AL137857.1 130839 sc-eQTL 6.97e-01 0.0467 0.12 0.116 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000060688 SNRNP40 -434256 sc-eQTL 3.03e-01 -0.136 0.131 0.119 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000121753 ADGRB2 -902361 sc-eQTL 1.53e-01 -0.16 0.112 0.119 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000121766 ZCCHC17 -434450 sc-eQTL 9.72e-01 0.00315 0.09 0.119 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000134644 PUM1 -203459 sc-eQTL 6.42e-01 0.0459 0.0985 0.119 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000162511 LAPTM5 104758 sc-eQTL 5.03e-01 -0.0739 0.11 0.119 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000162517 PEF1 -782364 sc-eQTL 8.46e-01 -0.0163 0.0837 0.119 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000186056 MATN1-AS1 144028 sc-eQTL 1.82e-01 -0.17 0.127 0.119 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000287510 AL137857.1 130839 sc-eQTL 3.69e-01 -0.0986 0.109 0.119 NK_CD56dim LOneK1K

Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF
ENSG00000121753 ADGRB2 -902361 eQTL 4.98e-02 0.0566 0.0288 0.00115 0.0 0.128
ENSG00000168528 SERINC2 -547033 eQTL 0.0484 -0.109 0.0554 0.0 0.0 0.128

Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina