logo

Genes within 1Mb (chr1:30857997:G:A):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD

Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000060688 SNRNP40 -438791 sc-eQTL 1.39e-01 -0.138 0.0931 0.259 B L1
ENSG00000121766 ZCCHC17 -438985 sc-eQTL 5.54e-01 -0.0444 0.0749 0.259 B L1
ENSG00000134644 PUM1 -207994 sc-eQTL 9.82e-02 0.104 0.0625 0.259 B L1
ENSG00000162510 MATN1 134412 sc-eQTL 9.67e-01 -0.00273 0.0661 0.259 B L1
ENSG00000162511 LAPTM5 100223 sc-eQTL 3.55e-01 0.0479 0.0517 0.259 B L1
ENSG00000162517 PEF1 -786899 sc-eQTL 1.03e-01 0.127 0.0777 0.259 B L1
ENSG00000186056 MATN1-AS1 139493 sc-eQTL 9.06e-01 -0.00719 0.0607 0.259 B L1
ENSG00000287510 AL137857.1 126304 sc-eQTL 2.70e-01 -0.0792 0.0716 0.259 B L1
ENSG00000060688 SNRNP40 -438791 sc-eQTL 8.25e-01 -0.0177 0.0802 0.259 CD4T L1
ENSG00000121766 ZCCHC17 -438985 sc-eQTL 1.82e-01 -0.0836 0.0624 0.259 CD4T L1
ENSG00000134644 PUM1 -207994 sc-eQTL 5.22e-01 0.0358 0.0558 0.259 CD4T L1
ENSG00000162511 LAPTM5 100223 sc-eQTL 7.94e-01 -0.0161 0.0618 0.259 CD4T L1
ENSG00000162517 PEF1 -786899 sc-eQTL 3.94e-02 0.133 0.064 0.259 CD4T L1
ENSG00000186056 MATN1-AS1 139493 sc-eQTL 8.47e-01 -0.0107 0.0553 0.259 CD4T L1
ENSG00000287510 AL137857.1 126304 sc-eQTL 6.27e-01 -0.0323 0.0662 0.259 CD4T L1
ENSG00000060688 SNRNP40 -438791 sc-eQTL 9.07e-01 0.0124 0.105 0.259 CD8T L1
ENSG00000121766 ZCCHC17 -438985 sc-eQTL 2.77e-01 -0.0763 0.07 0.259 CD8T L1
ENSG00000134644 PUM1 -207994 sc-eQTL 3.59e-03 0.178 0.0606 0.259 CD8T L1
ENSG00000162511 LAPTM5 100223 sc-eQTL 8.59e-01 -0.0107 0.06 0.259 CD8T L1
ENSG00000162517 PEF1 -786899 sc-eQTL 6.71e-01 0.0314 0.0739 0.259 CD8T L1
ENSG00000186056 MATN1-AS1 139493 sc-eQTL 3.40e-01 -0.0671 0.0702 0.259 CD8T L1
ENSG00000287510 AL137857.1 126304 sc-eQTL 3.46e-01 -0.0834 0.0882 0.259 CD8T L1
ENSG00000060688 SNRNP40 -438791 sc-eQTL 2.94e-01 0.1 0.0954 0.264 DC L1
ENSG00000121766 ZCCHC17 -438985 sc-eQTL 4.50e-01 0.0856 0.113 0.264 DC L1
ENSG00000134644 PUM1 -207994 sc-eQTL 4.31e-01 0.0698 0.0886 0.264 DC L1
ENSG00000162511 LAPTM5 100223 sc-eQTL 4.56e-02 -0.126 0.0627 0.264 DC L1
ENSG00000162517 PEF1 -786899 sc-eQTL 6.35e-01 0.0488 0.103 0.264 DC L1
ENSG00000168528 SERINC2 -551568 sc-eQTL 6.90e-01 0.0417 0.104 0.264 DC L1
ENSG00000284543 LINC01226 -648229 sc-eQTL 1.17e-01 -0.108 0.0688 0.264 DC L1
ENSG00000287510 AL137857.1 126304 sc-eQTL 6.36e-01 -0.0475 0.1 0.264 DC L1
ENSG00000060688 SNRNP40 -438791 sc-eQTL 4.91e-01 0.0494 0.0717 0.259 Mono L1
ENSG00000121766 ZCCHC17 -438985 sc-eQTL 7.40e-02 -0.159 0.0883 0.259 Mono L1
ENSG00000134644 PUM1 -207994 sc-eQTL 9.62e-02 -0.0947 0.0567 0.259 Mono L1
ENSG00000162511 LAPTM5 100223 sc-eQTL 7.82e-01 -0.0145 0.0524 0.259 Mono L1
ENSG00000162512 SDC3 -50761 sc-eQTL 1.33e-01 0.151 0.1 0.259 Mono L1
ENSG00000162517 PEF1 -786899 sc-eQTL 7.64e-01 0.0212 0.0707 0.259 Mono L1
ENSG00000168528 SERINC2 -551568 sc-eQTL 6.25e-01 -0.0529 0.108 0.259 Mono L1
ENSG00000284543 LINC01226 -648229 sc-eQTL 9.67e-01 0.004 0.0953 0.259 Mono L1
ENSG00000287510 AL137857.1 126304 sc-eQTL 2.68e-01 -0.0922 0.083 0.259 Mono L1
ENSG00000060688 SNRNP40 -438791 sc-eQTL 2.33e-01 -0.12 0.1 0.26 NK L1
ENSG00000121753 ADGRB2 -906896 sc-eQTL 7.55e-01 -0.0271 0.0868 0.26 NK L1
ENSG00000121766 ZCCHC17 -438985 sc-eQTL 3.44e-01 0.0654 0.0689 0.26 NK L1
ENSG00000134644 PUM1 -207994 sc-eQTL 4.76e-02 0.143 0.0717 0.26 NK L1
ENSG00000162511 LAPTM5 100223 sc-eQTL 8.46e-01 -0.0162 0.0833 0.26 NK L1
ENSG00000162517 PEF1 -786899 sc-eQTL 1.19e-01 -0.0946 0.0605 0.26 NK L1
ENSG00000186056 MATN1-AS1 139493 sc-eQTL 9.65e-01 0.00413 0.0936 0.26 NK L1
ENSG00000287510 AL137857.1 126304 sc-eQTL 8.30e-02 -0.15 0.0858 0.26 NK L1
ENSG00000060688 SNRNP40 -438791 sc-eQTL 6.76e-01 0.0324 0.0774 0.259 Other_T L1
ENSG00000121766 ZCCHC17 -438985 sc-eQTL 5.86e-01 0.0451 0.0827 0.259 Other_T L1
ENSG00000134644 PUM1 -207994 sc-eQTL 4.20e-01 -0.0601 0.0743 0.259 Other_T L1
ENSG00000162511 LAPTM5 100223 sc-eQTL 5.37e-01 0.0377 0.0609 0.259 Other_T L1
ENSG00000162517 PEF1 -786899 sc-eQTL 4.53e-01 0.0612 0.0814 0.259 Other_T L1
ENSG00000186056 MATN1-AS1 139493 sc-eQTL 9.51e-01 0.00615 0.0999 0.259 Other_T L1
ENSG00000287510 AL137857.1 126304 sc-eQTL 8.17e-01 0.024 0.104 0.259 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000060688 SNRNP40 -438791 sc-eQTL 7.34e-01 0.0423 0.124 0.263 B_Activated L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -438985 sc-eQTL 3.16e-01 -0.126 0.125 0.263 B_Activated L2
ENSG00000134644 PUM1 -207994 sc-eQTL 8.92e-03 0.302 0.114 0.263 B_Activated L2
ENSG00000162510 MATN1 134412 sc-eQTL 7.71e-01 -0.0297 0.102 0.263 B_Activated L2
ENSG00000162511 LAPTM5 100223 sc-eQTL 7.74e-01 0.0204 0.0711 0.263 B_Activated L2
ENSG00000162517 PEF1 -786899 sc-eQTL 1.36e-01 0.18 0.12 0.263 B_Activated L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 139493 sc-eQTL 4.98e-01 0.0779 0.115 0.263 B_Activated L2
ENSG00000287510 AL137857.1 126304 sc-eQTL 9.95e-01 0.000645 0.102 0.263 B_Activated L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -438791 sc-eQTL 4.65e-01 0.0843 0.115 0.258 B_Intermediate L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -438985 sc-eQTL 8.66e-01 0.0162 0.096 0.258 B_Intermediate L2
ENSG00000134644 PUM1 -207994 sc-eQTL 3.73e-01 0.0808 0.0904 0.258 B_Intermediate L2
ENSG00000162510 MATN1 134412 sc-eQTL 4.69e-01 0.0684 0.0942 0.258 B_Intermediate L2
ENSG00000162511 LAPTM5 100223 sc-eQTL 1.68e-01 0.0796 0.0576 0.258 B_Intermediate L2
ENSG00000162517 PEF1 -786899 sc-eQTL 6.38e-01 -0.0507 0.107 0.258 B_Intermediate L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 139493 sc-eQTL 8.40e-01 0.0164 0.0812 0.258 B_Intermediate L2
ENSG00000287510 AL137857.1 126304 sc-eQTL 1.04e-01 -0.147 0.0903 0.258 B_Intermediate L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -438791 sc-eQTL 5.91e-01 0.0603 0.112 0.261 B_Memory L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -438985 sc-eQTL 5.40e-01 -0.0633 0.103 0.261 B_Memory L2
ENSG00000134644 PUM1 -207994 sc-eQTL 2.62e-01 -0.101 0.0896 0.261 B_Memory L2
ENSG00000162510 MATN1 134412 sc-eQTL 4.64e-01 0.063 0.0858 0.261 B_Memory L2
ENSG00000162511 LAPTM5 100223 sc-eQTL 2.73e-01 0.0834 0.076 0.261 B_Memory L2
ENSG00000162517 PEF1 -786899 sc-eQTL 5.82e-01 -0.056 0.102 0.261 B_Memory L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 139493 sc-eQTL 3.26e-01 0.0856 0.087 0.261 B_Memory L2
ENSG00000287510 AL137857.1 126304 sc-eQTL 4.25e-01 -0.0815 0.102 0.261 B_Memory L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -438791 sc-eQTL 9.96e-02 -0.167 0.101 0.259 B_Naive1 L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -438985 sc-eQTL 2.93e-01 -0.0925 0.0877 0.259 B_Naive1 L2
ENSG00000134644 PUM1 -207994 sc-eQTL 2.39e-01 0.0913 0.0773 0.259 B_Naive1 L2
ENSG00000162510 MATN1 134412 sc-eQTL 1.60e-01 -0.111 0.0784 0.259 B_Naive1 L2
ENSG00000162511 LAPTM5 100223 sc-eQTL 4.85e-01 0.0367 0.0525 0.259 B_Naive1 L2
ENSG00000162517 PEF1 -786899 sc-eQTL 8.36e-01 -0.0193 0.0927 0.259 B_Naive1 L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 139493 sc-eQTL 4.27e-01 -0.0549 0.069 0.259 B_Naive1 L2
ENSG00000287510 AL137857.1 126304 sc-eQTL 5.65e-01 -0.0491 0.0853 0.259 B_Naive1 L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -438791 sc-eQTL 4.90e-01 0.0761 0.11 0.26 B_Naive2 L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -438985 sc-eQTL 1.04e-01 0.148 0.0904 0.26 B_Naive2 L2
ENSG00000134644 PUM1 -207994 sc-eQTL 6.65e-01 0.0386 0.089 0.26 B_Naive2 L2
ENSG00000162510 MATN1 134412 sc-eQTL 6.99e-01 0.0331 0.0854 0.26 B_Naive2 L2
ENSG00000162511 LAPTM5 100223 sc-eQTL 5.37e-01 0.0359 0.058 0.26 B_Naive2 L2
ENSG00000162517 PEF1 -786899 sc-eQTL 1.42e-01 0.155 0.105 0.26 B_Naive2 L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 139493 sc-eQTL 7.17e-01 -0.0307 0.0845 0.26 B_Naive2 L2
ENSG00000287510 AL137857.1 126304 sc-eQTL 2.48e-01 -0.105 0.091 0.26 B_Naive2 L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -438791 sc-eQTL 2.52e-01 0.124 0.108 0.257 CD4_CTL L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -438985 sc-eQTL 5.12e-01 0.07 0.107 0.257 CD4_CTL L2
ENSG00000134644 PUM1 -207994 sc-eQTL 8.26e-01 0.023 0.105 0.257 CD4_CTL L2
ENSG00000162511 LAPTM5 100223 sc-eQTL 5.82e-01 -0.0514 0.0932 0.257 CD4_CTL L2
ENSG00000162517 PEF1 -786899 sc-eQTL 2.35e-01 0.113 0.0952 0.257 CD4_CTL L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 139493 sc-eQTL 7.31e-01 -0.0351 0.102 0.257 CD4_CTL L2
ENSG00000287510 AL137857.1 126304 sc-eQTL 3.25e-02 -0.192 0.089 0.257 CD4_CTL L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -438791 sc-eQTL 3.58e-01 0.0771 0.0837 0.259 CD4_Naive L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -438985 sc-eQTL 9.84e-02 -0.123 0.0739 0.259 CD4_Naive L2
ENSG00000134644 PUM1 -207994 sc-eQTL 3.55e-01 0.0549 0.0593 0.259 CD4_Naive L2
ENSG00000162511 LAPTM5 100223 sc-eQTL 6.65e-01 -0.0276 0.0636 0.259 CD4_Naive L2
ENSG00000162517 PEF1 -786899 sc-eQTL 2.07e-01 0.0879 0.0695 0.259 CD4_Naive L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 139493 sc-eQTL 7.85e-01 0.0176 0.0646 0.259 CD4_Naive L2
ENSG00000287510 AL137857.1 126304 sc-eQTL 7.63e-01 0.0224 0.0741 0.259 CD4_Naive L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -438791 sc-eQTL 2.17e-01 -0.13 0.105 0.259 CD4_TCM L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -438985 sc-eQTL 6.94e-01 -0.0336 0.0851 0.259 CD4_TCM L2
ENSG00000134644 PUM1 -207994 sc-eQTL 1.70e-01 -0.103 0.075 0.259 CD4_TCM L2
ENSG00000162511 LAPTM5 100223 sc-eQTL 4.22e-01 0.0502 0.0624 0.259 CD4_TCM L2
ENSG00000162517 PEF1 -786899 sc-eQTL 4.16e-01 0.0682 0.0837 0.259 CD4_TCM L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 139493 sc-eQTL 4.42e-01 -0.061 0.0792 0.259 CD4_TCM L2
ENSG00000287510 AL137857.1 126304 sc-eQTL 1.49e-01 -0.127 0.0879 0.259 CD4_TCM L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -438791 sc-eQTL 9.11e-01 -0.0119 0.106 0.259 CD4_TEM L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -438985 sc-eQTL 3.23e-01 0.0999 0.101 0.259 CD4_TEM L2
ENSG00000134644 PUM1 -207994 sc-eQTL 7.14e-01 0.0309 0.0841 0.259 CD4_TEM L2
ENSG00000162511 LAPTM5 100223 sc-eQTL 5.89e-01 -0.046 0.0851 0.259 CD4_TEM L2
ENSG00000162517 PEF1 -786899 sc-eQTL 4.28e-01 0.0756 0.0952 0.259 CD4_TEM L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 139493 sc-eQTL 8.89e-01 -0.0139 0.0996 0.259 CD4_TEM L2
ENSG00000287510 AL137857.1 126304 sc-eQTL 2.45e-01 -0.114 0.0978 0.259 CD4_TEM L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -438791 sc-eQTL 9.83e-01 0.00242 0.115 0.259 CD8_CTL L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -438985 sc-eQTL 8.28e-01 -0.0192 0.0881 0.259 CD8_CTL L2
ENSG00000134644 PUM1 -207994 sc-eQTL 3.63e-01 0.0778 0.0854 0.259 CD8_CTL L2
ENSG00000162511 LAPTM5 100223 sc-eQTL 8.20e-01 -0.0216 0.0948 0.259 CD8_CTL L2
ENSG00000162517 PEF1 -786899 sc-eQTL 2.81e-01 0.0889 0.0823 0.259 CD8_CTL L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 139493 sc-eQTL 2.69e-01 -0.11 0.0993 0.259 CD8_CTL L2
ENSG00000287510 AL137857.1 126304 sc-eQTL 4.49e-01 -0.071 0.0936 0.259 CD8_CTL L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -438791 sc-eQTL 6.50e-01 -0.048 0.106 0.259 CD8_Naive L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -438985 sc-eQTL 9.33e-01 -0.00767 0.0912 0.259 CD8_Naive L2
ENSG00000134644 PUM1 -207994 sc-eQTL 3.14e-02 0.157 0.0726 0.259 CD8_Naive L2
ENSG00000162511 LAPTM5 100223 sc-eQTL 5.44e-01 0.0427 0.0703 0.259 CD8_Naive L2
ENSG00000162517 PEF1 -786899 sc-eQTL 8.22e-01 -0.022 0.0977 0.259 CD8_Naive L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 139493 sc-eQTL 4.51e-01 0.0662 0.0877 0.259 CD8_Naive L2
ENSG00000287510 AL137857.1 126304 sc-eQTL 1.06e-01 -0.154 0.095 0.259 CD8_Naive L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -438791 sc-eQTL 4.94e-01 -0.0806 0.118 0.259 CD8_TCM L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -438985 sc-eQTL 8.36e-01 -0.0224 0.108 0.259 CD8_TCM L2
ENSG00000134644 PUM1 -207994 sc-eQTL 5.26e-01 -0.0644 0.101 0.259 CD8_TCM L2
ENSG00000162511 LAPTM5 100223 sc-eQTL 2.70e-01 -0.117 0.106 0.259 CD8_TCM L2
ENSG00000162517 PEF1 -786899 sc-eQTL 9.21e-01 0.0107 0.109 0.259 CD8_TCM L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 139493 sc-eQTL 7.47e-01 0.0318 0.0984 0.259 CD8_TCM L2
ENSG00000287510 AL137857.1 126304 sc-eQTL 6.89e-01 -0.0399 0.0994 0.259 CD8_TCM L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -438791 sc-eQTL 5.66e-01 0.0641 0.112 0.251 CD8_TEM L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -438985 sc-eQTL 4.59e-01 0.0793 0.107 0.251 CD8_TEM L2
ENSG00000134644 PUM1 -207994 sc-eQTL 6.75e-01 -0.0459 0.109 0.251 CD8_TEM L2
ENSG00000162511 LAPTM5 100223 sc-eQTL 7.55e-01 0.0321 0.103 0.251 CD8_TEM L2
ENSG00000162517 PEF1 -786899 sc-eQTL 5.19e-01 0.0624 0.0967 0.251 CD8_TEM L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 139493 sc-eQTL 7.06e-01 -0.0403 0.107 0.251 CD8_TEM L2
ENSG00000287510 AL137857.1 126304 sc-eQTL 6.09e-01 0.0494 0.0965 0.251 CD8_TEM L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -438791 sc-eQTL 6.50e-01 0.0518 0.114 0.26 MAIT L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -438985 sc-eQTL 8.28e-01 -0.0221 0.101 0.26 MAIT L2
ENSG00000134644 PUM1 -207994 sc-eQTL 5.93e-01 -0.0519 0.0969 0.26 MAIT L2
ENSG00000162511 LAPTM5 100223 sc-eQTL 9.03e-01 -0.0111 0.0915 0.26 MAIT L2
ENSG00000162517 PEF1 -786899 sc-eQTL 4.46e-01 0.0766 0.1 0.26 MAIT L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 139493 sc-eQTL 1.59e-01 -0.143 0.101 0.26 MAIT L2
ENSG00000287510 AL137857.1 126304 sc-eQTL 9.73e-01 0.00354 0.105 0.26 MAIT L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -438791 sc-eQTL 9.92e-01 -0.00117 0.113 0.26 NK_CD56bright L2
ENSG00000121753 ADGRB2 -906896 sc-eQTL 6.57e-01 0.0393 0.0884 0.26 NK_CD56bright L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -438985 sc-eQTL 4.76e-01 0.0681 0.0953 0.26 NK_CD56bright L2
ENSG00000134644 PUM1 -207994 sc-eQTL 6.86e-01 -0.0405 0.1 0.26 NK_CD56bright L2
ENSG00000162511 LAPTM5 100223 sc-eQTL 5.91e-01 0.0531 0.0987 0.26 NK_CD56bright L2
ENSG00000162517 PEF1 -786899 sc-eQTL 3.79e-01 -0.0845 0.0958 0.26 NK_CD56bright L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 139493 sc-eQTL 1.11e-01 0.158 0.0987 0.26 NK_CD56bright L2
ENSG00000287510 AL137857.1 126304 sc-eQTL 8.73e-01 0.0156 0.0978 0.26 NK_CD56bright L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -438791 sc-eQTL 5.79e-01 -0.0591 0.106 0.259 NK_CD56dim L2
ENSG00000121753 ADGRB2 -906896 sc-eQTL 8.57e-01 0.0169 0.0937 0.259 NK_CD56dim L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -438985 sc-eQTL 5.08e-01 0.0521 0.0787 0.259 NK_CD56dim L2
ENSG00000134644 PUM1 -207994 sc-eQTL 8.32e-01 0.0171 0.0808 0.259 NK_CD56dim L2
ENSG00000162511 LAPTM5 100223 sc-eQTL 8.56e-01 -0.0157 0.0862 0.259 NK_CD56dim L2
ENSG00000162517 PEF1 -786899 sc-eQTL 1.26e-01 -0.117 0.0763 0.259 NK_CD56dim L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 139493 sc-eQTL 7.14e-01 -0.0397 0.108 0.259 NK_CD56dim L2
ENSG00000287510 AL137857.1 126304 sc-eQTL 7.53e-03 -0.236 0.0876 0.259 NK_CD56dim L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -438791 sc-eQTL 4.57e-01 -0.0835 0.112 0.267 NK_HLA L2
ENSG00000121753 ADGRB2 -906896 sc-eQTL 3.27e-01 -0.0873 0.0888 0.267 NK_HLA L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -438985 sc-eQTL 6.35e-01 -0.0475 0.1 0.267 NK_HLA L2
ENSG00000134644 PUM1 -207994 sc-eQTL 6.69e-02 0.178 0.0967 0.267 NK_HLA L2
ENSG00000162511 LAPTM5 100223 sc-eQTL 5.65e-01 -0.0536 0.093 0.267 NK_HLA L2
ENSG00000162517 PEF1 -786899 sc-eQTL 3.12e-01 0.106 0.105 0.267 NK_HLA L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 139493 sc-eQTL 3.13e-01 -0.0998 0.0988 0.267 NK_HLA L2
ENSG00000287510 AL137857.1 126304 sc-eQTL 2.28e-04 -0.347 0.0925 0.267 NK_HLA L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -438791 sc-eQTL 7.37e-01 -0.035 0.104 0.259 NK_cytokine L2
ENSG00000121753 ADGRB2 -906896 sc-eQTL 3.35e-01 -0.0907 0.0939 0.259 NK_cytokine L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -438985 sc-eQTL 7.31e-01 0.028 0.0813 0.259 NK_cytokine L2
ENSG00000134644 PUM1 -207994 sc-eQTL 3.87e-03 0.252 0.0862 0.259 NK_cytokine L2
ENSG00000162511 LAPTM5 100223 sc-eQTL 7.94e-01 -0.0253 0.0968 0.259 NK_cytokine L2
ENSG00000162517 PEF1 -786899 sc-eQTL 9.70e-01 -0.0031 0.0825 0.259 NK_cytokine L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 139493 sc-eQTL 4.02e-01 0.086 0.102 0.259 NK_cytokine L2
ENSG00000287510 AL137857.1 126304 sc-eQTL 4.60e-01 -0.0706 0.0953 0.259 NK_cytokine L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -438791 sc-eQTL 9.46e-01 0.00873 0.128 0.244 PB L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -438985 sc-eQTL 6.99e-01 -0.0577 0.149 0.244 PB L2
ENSG00000134644 PUM1 -207994 sc-eQTL 1.01e-01 0.211 0.128 0.244 PB L2
ENSG00000162510 MATN1 134412 sc-eQTL 3.92e-01 0.103 0.12 0.244 PB L2
ENSG00000162511 LAPTM5 100223 sc-eQTL 5.65e-01 0.0497 0.086 0.244 PB L2
ENSG00000162517 PEF1 -786899 sc-eQTL 8.31e-01 -0.0284 0.133 0.244 PB L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 139493 sc-eQTL 8.40e-01 0.0239 0.118 0.244 PB L2
ENSG00000287510 AL137857.1 126304 sc-eQTL 9.24e-01 -0.0119 0.126 0.244 PB L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -438791 sc-eQTL 9.63e-01 0.00379 0.0823 0.259 Pro_T L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -438985 sc-eQTL 4.07e-01 0.0865 0.104 0.259 Pro_T L2
ENSG00000134644 PUM1 -207994 sc-eQTL 5.55e-01 -0.0575 0.0973 0.259 Pro_T L2
ENSG00000162511 LAPTM5 100223 sc-eQTL 2.79e-01 0.0756 0.0697 0.259 Pro_T L2
ENSG00000162517 PEF1 -786899 sc-eQTL 6.27e-01 0.0499 0.102 0.259 Pro_T L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 139493 sc-eQTL 3.77e-01 0.0864 0.0975 0.259 Pro_T L2
ENSG00000287510 AL137857.1 126304 sc-eQTL 6.13e-01 -0.0455 0.0898 0.259 Pro_T L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -438791 sc-eQTL 4.16e-01 0.0885 0.109 0.259 Treg L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -438985 sc-eQTL 8.15e-01 -0.0246 0.105 0.259 Treg L2
ENSG00000134644 PUM1 -207994 sc-eQTL 3.10e-01 0.0855 0.0839 0.259 Treg L2
ENSG00000162511 LAPTM5 100223 sc-eQTL 5.33e-01 0.0601 0.0963 0.259 Treg L2
ENSG00000162517 PEF1 -786899 sc-eQTL 7.05e-01 -0.0394 0.104 0.259 Treg L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 139493 sc-eQTL 3.09e-01 -0.0999 0.0979 0.259 Treg L2
ENSG00000287510 AL137857.1 126304 sc-eQTL 8.98e-01 -0.0126 0.098 0.259 Treg L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -438791 sc-eQTL 2.25e-01 0.134 0.11 0.256 cDC L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -438985 sc-eQTL 3.13e-01 -0.121 0.119 0.256 cDC L2
ENSG00000134644 PUM1 -207994 sc-eQTL 8.46e-01 -0.0199 0.103 0.256 cDC L2
ENSG00000162511 LAPTM5 100223 sc-eQTL 2.59e-01 -0.0813 0.0718 0.256 cDC L2
ENSG00000162517 PEF1 -786899 sc-eQTL 2.69e-01 0.115 0.104 0.256 cDC L2
ENSG00000168528 SERINC2 -551568 sc-eQTL 8.15e-01 0.0217 0.0925 0.256 cDC L2
ENSG00000284543 LINC01226 -648229 sc-eQTL 8.45e-01 -0.0178 0.0909 0.256 cDC L2
ENSG00000287510 AL137857.1 126304 sc-eQTL 3.32e-01 -0.0949 0.0976 0.256 cDC L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -438791 sc-eQTL 7.81e-01 -0.024 0.0862 0.259 cMono_IL1B L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -438985 sc-eQTL 7.37e-01 -0.0324 0.0961 0.259 cMono_IL1B L2
ENSG00000134644 PUM1 -207994 sc-eQTL 6.34e-02 -0.12 0.0645 0.259 cMono_IL1B L2
ENSG00000162511 LAPTM5 100223 sc-eQTL 7.30e-01 -0.0197 0.0571 0.259 cMono_IL1B L2
ENSG00000162512 SDC3 -50761 sc-eQTL 1.69e-02 0.256 0.106 0.259 cMono_IL1B L2
ENSG00000162517 PEF1 -786899 sc-eQTL 8.32e-01 0.0186 0.0879 0.259 cMono_IL1B L2
ENSG00000168528 SERINC2 -551568 sc-eQTL 6.09e-01 -0.0557 0.109 0.259 cMono_IL1B L2
ENSG00000284543 LINC01226 -648229 sc-eQTL 7.03e-01 0.0367 0.0962 0.259 cMono_IL1B L2
ENSG00000287510 AL137857.1 126304 sc-eQTL 8.41e-02 -0.155 0.0892 0.259 cMono_IL1B L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -438791 sc-eQTL 5.66e-01 0.0525 0.0915 0.259 cMono_S100A L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -438985 sc-eQTL 1.37e-01 -0.161 0.108 0.259 cMono_S100A L2
ENSG00000134644 PUM1 -207994 sc-eQTL 3.77e-02 -0.162 0.0774 0.259 cMono_S100A L2
ENSG00000162511 LAPTM5 100223 sc-eQTL 9.81e-01 0.00143 0.0601 0.259 cMono_S100A L2
ENSG00000162512 SDC3 -50761 sc-eQTL 1.43e-01 0.152 0.103 0.259 cMono_S100A L2
ENSG00000162517 PEF1 -786899 sc-eQTL 5.90e-02 0.176 0.093 0.259 cMono_S100A L2
ENSG00000168528 SERINC2 -551568 sc-eQTL 4.37e-01 -0.0855 0.11 0.259 cMono_S100A L2
ENSG00000284543 LINC01226 -648229 sc-eQTL 7.70e-01 0.0262 0.0893 0.259 cMono_S100A L2
ENSG00000287510 AL137857.1 126304 sc-eQTL 7.12e-01 0.0331 0.0896 0.259 cMono_S100A L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -438791 sc-eQTL 1.47e-01 0.198 0.136 0.245 gdT L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -438985 sc-eQTL 6.16e-01 0.059 0.117 0.245 gdT L2
ENSG00000134644 PUM1 -207994 sc-eQTL 5.78e-01 0.0676 0.121 0.245 gdT L2
ENSG00000162511 LAPTM5 100223 sc-eQTL 4.43e-01 0.101 0.131 0.245 gdT L2
ENSG00000162517 PEF1 -786899 sc-eQTL 7.73e-01 0.0348 0.12 0.245 gdT L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 139493 sc-eQTL 5.81e-01 0.0672 0.121 0.245 gdT L2
ENSG00000287510 AL137857.1 126304 sc-eQTL 6.21e-01 0.0584 0.118 0.245 gdT L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -438791 sc-eQTL 9.65e-01 0.00453 0.103 0.256 intMono L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -438985 sc-eQTL 2.67e-02 -0.243 0.109 0.256 intMono L2
ENSG00000134644 PUM1 -207994 sc-eQTL 8.23e-01 0.021 0.0935 0.256 intMono L2
ENSG00000162511 LAPTM5 100223 sc-eQTL 4.08e-01 -0.0607 0.0733 0.256 intMono L2
ENSG00000162512 SDC3 -50761 sc-eQTL 2.50e-01 -0.116 0.1 0.256 intMono L2
ENSG00000162517 PEF1 -786899 sc-eQTL 8.43e-03 -0.276 0.104 0.256 intMono L2
ENSG00000168528 SERINC2 -551568 sc-eQTL 6.63e-01 -0.0459 0.105 0.256 intMono L2
ENSG00000284543 LINC01226 -648229 sc-eQTL 2.09e-01 0.125 0.0993 0.256 intMono L2
ENSG00000287510 AL137857.1 126304 sc-eQTL 5.89e-02 -0.188 0.0988 0.256 intMono L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -438791 sc-eQTL 9.20e-01 -0.00967 0.0963 0.256 ncMono L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -438985 sc-eQTL 2.06e-01 -0.13 0.102 0.256 ncMono L2
ENSG00000134644 PUM1 -207994 sc-eQTL 2.50e-01 0.0964 0.0836 0.256 ncMono L2
ENSG00000162511 LAPTM5 100223 sc-eQTL 3.37e-01 -0.0732 0.076 0.256 ncMono L2
ENSG00000162512 SDC3 -50761 sc-eQTL 9.37e-01 0.00678 0.0854 0.256 ncMono L2
ENSG00000162517 PEF1 -786899 sc-eQTL 8.90e-01 -0.0136 0.0979 0.256 ncMono L2
ENSG00000168528 SERINC2 -551568 sc-eQTL 9.39e-01 -0.0072 0.0932 0.256 ncMono L2
ENSG00000284543 LINC01226 -648229 sc-eQTL 5.45e-01 -0.0565 0.093 0.256 ncMono L2
ENSG00000287510 AL137857.1 126304 sc-eQTL 4.19e-01 -0.0781 0.0964 0.256 ncMono L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -438791 sc-eQTL 9.50e-01 0.007 0.113 0.251 pDC L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -438985 sc-eQTL 4.93e-01 0.0847 0.123 0.251 pDC L2
ENSG00000134644 PUM1 -207994 sc-eQTL 8.38e-01 -0.0209 0.102 0.251 pDC L2
ENSG00000162511 LAPTM5 100223 sc-eQTL 8.87e-01 0.0136 0.0952 0.251 pDC L2
ENSG00000162517 PEF1 -786899 sc-eQTL 5.13e-01 0.0809 0.123 0.251 pDC L2
ENSG00000168528 SERINC2 -551568 sc-eQTL 5.37e-01 0.0714 0.115 0.251 pDC L2
ENSG00000284543 LINC01226 -648229 sc-eQTL 2.81e-01 -0.0967 0.0893 0.251 pDC L2
ENSG00000287510 AL137857.1 126304 sc-eQTL 2.22e-01 -0.129 0.105 0.251 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000060688 SNRNP40 -438791 sc-eQTL 3.55e-01 0.101 0.109 0.259 B_Memory LOneK1K
ENSG00000121766 ZCCHC17 -438985 sc-eQTL 5.65e-01 -0.0523 0.0906 0.259 B_Memory LOneK1K
ENSG00000134644 PUM1 -207994 sc-eQTL 2.75e-01 0.0877 0.0802 0.259 B_Memory LOneK1K
ENSG00000162510 MATN1 134412 sc-eQTL 1.15e-01 0.144 0.0911 0.259 B_Memory LOneK1K
ENSG00000162511 LAPTM5 100223 sc-eQTL 3.43e-01 0.0546 0.0575 0.259 B_Memory LOneK1K
ENSG00000162517 PEF1 -786899 sc-eQTL 7.89e-01 0.0256 0.0954 0.259 B_Memory LOneK1K
ENSG00000186056 MATN1-AS1 139493 sc-eQTL 5.99e-01 0.0401 0.0761 0.259 B_Memory LOneK1K
ENSG00000287510 AL137857.1 126304 sc-eQTL 1.41e-01 -0.122 0.0826 0.259 B_Memory LOneK1K
ENSG00000060688 SNRNP40 -438791 sc-eQTL 2.32e-01 -0.119 0.099 0.259 B_Naive LOneK1K
ENSG00000121766 ZCCHC17 -438985 sc-eQTL 9.39e-01 0.00605 0.0785 0.259 B_Naive LOneK1K
ENSG00000134644 PUM1 -207994 sc-eQTL 2.55e-01 0.0845 0.0741 0.259 B_Naive LOneK1K
ENSG00000162510 MATN1 134412 sc-eQTL 4.25e-01 -0.0571 0.0714 0.259 B_Naive LOneK1K
ENSG00000162511 LAPTM5 100223 sc-eQTL 6.66e-01 0.0218 0.0503 0.259 B_Naive LOneK1K
ENSG00000162517 PEF1 -786899 sc-eQTL 6.10e-01 0.0469 0.0919 0.259 B_Naive LOneK1K
ENSG00000186056 MATN1-AS1 139493 sc-eQTL 3.52e-01 -0.0606 0.0649 0.259 B_Naive LOneK1K
ENSG00000287510 AL137857.1 126304 sc-eQTL 3.65e-01 -0.07 0.0771 0.259 B_Naive LOneK1K
ENSG00000060688 SNRNP40 -438791 sc-eQTL 8.60e-01 0.0144 0.082 0.259 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000121766 ZCCHC17 -438985 sc-eQTL 3.07e-01 -0.0949 0.0927 0.259 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000134644 PUM1 -207994 sc-eQTL 2.61e-02 -0.131 0.0586 0.259 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000162511 LAPTM5 100223 sc-eQTL 9.07e-01 -0.00608 0.0521 0.259 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000162512 SDC3 -50761 sc-eQTL 3.23e-03 0.31 0.104 0.259 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000162517 PEF1 -786899 sc-eQTL 1.79e-01 0.1 0.0744 0.259 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000168528 SERINC2 -551568 sc-eQTL 5.64e-01 -0.063 0.109 0.259 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000284543 LINC01226 -648229 sc-eQTL 8.96e-01 0.0118 0.0896 0.259 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000287510 AL137857.1 126304 sc-eQTL 2.56e-01 -0.0954 0.0836 0.259 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000060688 SNRNP40 -438791 sc-eQTL 8.03e-01 0.0225 0.0902 0.259 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000121766 ZCCHC17 -438985 sc-eQTL 6.88e-03 -0.265 0.097 0.259 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000134644 PUM1 -207994 sc-eQTL 2.14e-01 0.1 0.0805 0.259 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000162511 LAPTM5 100223 sc-eQTL 3.29e-01 -0.0632 0.0645 0.259 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000162512 SDC3 -50761 sc-eQTL 9.15e-01 -0.01 0.0944 0.259 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000162517 PEF1 -786899 sc-eQTL 7.44e-02 -0.153 0.0852 0.259 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000168528 SERINC2 -551568 sc-eQTL 9.67e-01 0.0041 0.0979 0.259 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000284543 LINC01226 -648229 sc-eQTL 9.45e-01 0.00645 0.093 0.259 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000287510 AL137857.1 126304 sc-eQTL 2.92e-01 -0.0981 0.0928 0.259 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000060688 SNRNP40 -438791 sc-eQTL 2.90e-01 -0.107 0.101 0.259 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000121753 ADGRB2 -906896 sc-eQTL 6.77e-01 -0.0359 0.0862 0.259 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000121766 ZCCHC17 -438985 sc-eQTL 6.16e-01 0.0347 0.0691 0.259 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000134644 PUM1 -207994 sc-eQTL 6.31e-02 0.14 0.0752 0.259 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000162511 LAPTM5 100223 sc-eQTL 8.58e-01 -0.0151 0.0847 0.259 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000162517 PEF1 -786899 sc-eQTL 2.49e-01 -0.0741 0.0641 0.259 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000186056 MATN1-AS1 139493 sc-eQTL 7.42e-01 -0.0322 0.0977 0.259 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000287510 AL137857.1 126304 sc-eQTL 1.72e-02 -0.2 0.0832 0.259 NK_CD56dim LOneK1K

Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF
ENSG00000168528 SERINC2 -551568 eQTL 0.0271 0.0966 0.0436 0.0 0.0 0.268

Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina
ENSG00000060688 \N -438791 4.89e-07 4e-07 7.45e-08 3.81e-07 1.1e-07 1.25e-07 2.95e-07 5.78e-08 2.04e-07 1.11e-07 2.47e-07 1.48e-07 4.88e-07 1.1e-07 6.93e-08 1.1e-07 5.73e-08 2.43e-07 8.93e-08 8.52e-08 1.33e-07 2.3e-07 2e-07 4.15e-08 4.67e-07 1.31e-07 1.83e-07 1.44e-07 1.4e-07 1.8e-07 1.71e-07 8.25e-08 5.09e-08 1.38e-07 2.58e-07 5.14e-08 1.06e-07 6.97e-08 5.77e-08 6.92e-08 3.2e-08 3.26e-07 1.6e-08 1.55e-08 3.32e-08 1.46e-08 8.67e-08 2.99e-09 4.68e-08
ENSG00000168528 SERINC2 -551568 3.02e-07 1.76e-07 5.91e-08 2.54e-07 9.87e-08 8.45e-08 1.73e-07 5.48e-08 1.5e-07 6.4e-08 1.59e-07 1.05e-07 2.38e-07 8.54e-08 5.72e-08 7.97e-08 4.24e-08 1.56e-07 7.18e-08 4.95e-08 1.25e-07 1.47e-07 1.58e-07 2.87e-08 2.28e-07 1.21e-07 1.22e-07 1.04e-07 1.24e-07 1.03e-07 1.09e-07 4.69e-08 3.38e-08 1.01e-07 5.5e-08 2.74e-08 5.76e-08 7.68e-08 6.29e-08 3.75e-08 6e-08 1.6e-07 3.02e-08 2.06e-08 4.25e-08 9.49e-09 1.19e-07 2.23e-09 4.69e-08