logo

Genes within 1Mb (chr1:30853322:G:A):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD

Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000060688 SNRNP40 -443466 sc-eQTL 4.96e-01 0.0836 0.123 0.105 B L1
ENSG00000121766 ZCCHC17 -443660 sc-eQTL 3.76e-01 -0.0872 0.0982 0.105 B L1
ENSG00000134644 PUM1 -212669 sc-eQTL 4.74e-01 -0.0592 0.0825 0.105 B L1
ENSG00000162510 MATN1 129737 sc-eQTL 4.98e-01 -0.0589 0.0867 0.105 B L1
ENSG00000162511 LAPTM5 95548 sc-eQTL 5.01e-01 -0.0457 0.0679 0.105 B L1
ENSG00000162517 PEF1 -791574 sc-eQTL 8.32e-01 -0.0218 0.103 0.105 B L1
ENSG00000186056 MATN1-AS1 134818 sc-eQTL 4.17e-01 0.0647 0.0795 0.105 B L1
ENSG00000287510 AL137857.1 121629 sc-eQTL 8.12e-01 0.0225 0.0943 0.105 B L1
ENSG00000060688 SNRNP40 -443466 sc-eQTL 7.98e-01 0.0267 0.104 0.105 CD4T L1
ENSG00000121766 ZCCHC17 -443660 sc-eQTL 4.68e-01 -0.0591 0.0813 0.105 CD4T L1
ENSG00000134644 PUM1 -212669 sc-eQTL 8.80e-01 -0.011 0.0725 0.105 CD4T L1
ENSG00000162511 LAPTM5 95548 sc-eQTL 8.58e-01 -0.0144 0.0803 0.105 CD4T L1
ENSG00000162517 PEF1 -791574 sc-eQTL 2.13e-01 -0.105 0.0837 0.105 CD4T L1
ENSG00000186056 MATN1-AS1 134818 sc-eQTL 4.81e-01 -0.0506 0.0718 0.105 CD4T L1
ENSG00000287510 AL137857.1 121629 sc-eQTL 5.22e-02 -0.167 0.0853 0.105 CD4T L1
ENSG00000060688 SNRNP40 -443466 sc-eQTL 2.29e-01 0.165 0.136 0.105 CD8T L1
ENSG00000121766 ZCCHC17 -443660 sc-eQTL 1.74e-01 0.124 0.0907 0.105 CD8T L1
ENSG00000134644 PUM1 -212669 sc-eQTL 1.21e-01 -0.124 0.0797 0.105 CD8T L1
ENSG00000162511 LAPTM5 95548 sc-eQTL 7.64e-01 -0.0234 0.0779 0.105 CD8T L1
ENSG00000162517 PEF1 -791574 sc-eQTL 6.42e-01 0.0446 0.0959 0.105 CD8T L1
ENSG00000186056 MATN1-AS1 134818 sc-eQTL 4.05e-01 -0.076 0.0911 0.105 CD8T L1
ENSG00000287510 AL137857.1 121629 sc-eQTL 5.42e-01 -0.07 0.115 0.105 CD8T L1
ENSG00000060688 SNRNP40 -443466 sc-eQTL 8.15e-01 0.0287 0.122 0.104 DC L1
ENSG00000121766 ZCCHC17 -443660 sc-eQTL 5.73e-01 -0.0818 0.145 0.104 DC L1
ENSG00000134644 PUM1 -212669 sc-eQTL 1.35e-01 -0.17 0.113 0.104 DC L1
ENSG00000162511 LAPTM5 95548 sc-eQTL 9.85e-01 0.00156 0.0811 0.104 DC L1
ENSG00000162517 PEF1 -791574 sc-eQTL 1.42e-02 -0.32 0.13 0.104 DC L1
ENSG00000168528 SERINC2 -556243 sc-eQTL 8.36e-01 0.0277 0.134 0.104 DC L1
ENSG00000284543 LINC01226 -652904 sc-eQTL 2.20e-01 0.109 0.0883 0.104 DC L1
ENSG00000287510 AL137857.1 121629 sc-eQTL 2.15e-02 -0.293 0.127 0.104 DC L1
ENSG00000060688 SNRNP40 -443466 sc-eQTL 3.82e-01 -0.0838 0.0956 0.105 Mono L1
ENSG00000121766 ZCCHC17 -443660 sc-eQTL 3.30e-02 0.252 0.117 0.105 Mono L1
ENSG00000134644 PUM1 -212669 sc-eQTL 7.85e-01 0.0208 0.0761 0.105 Mono L1
ENSG00000162511 LAPTM5 95548 sc-eQTL 6.62e-02 0.128 0.0695 0.105 Mono L1
ENSG00000162512 SDC3 -55436 sc-eQTL 1.21e-02 0.336 0.133 0.105 Mono L1
ENSG00000162517 PEF1 -791574 sc-eQTL 9.70e-01 -0.00358 0.0944 0.105 Mono L1
ENSG00000168528 SERINC2 -556243 sc-eQTL 3.45e-02 -0.304 0.143 0.105 Mono L1
ENSG00000284543 LINC01226 -652904 sc-eQTL 3.07e-01 0.13 0.127 0.105 Mono L1
ENSG00000287510 AL137857.1 121629 sc-eQTL 5.18e-01 0.0718 0.111 0.105 Mono L1
ENSG00000060688 SNRNP40 -443466 sc-eQTL 9.79e-01 -0.00341 0.132 0.105 NK L1
ENSG00000121753 ADGRB2 -911571 sc-eQTL 2.68e-01 -0.126 0.113 0.105 NK L1
ENSG00000121766 ZCCHC17 -443660 sc-eQTL 5.12e-01 -0.0592 0.0901 0.105 NK L1
ENSG00000134644 PUM1 -212669 sc-eQTL 2.04e-01 -0.12 0.0942 0.105 NK L1
ENSG00000162511 LAPTM5 95548 sc-eQTL 8.30e-02 -0.188 0.108 0.105 NK L1
ENSG00000162517 PEF1 -791574 sc-eQTL 3.82e-01 -0.0695 0.0793 0.105 NK L1
ENSG00000186056 MATN1-AS1 134818 sc-eQTL 8.23e-01 -0.0273 0.122 0.105 NK L1
ENSG00000287510 AL137857.1 121629 sc-eQTL 2.77e-01 -0.123 0.113 0.105 NK L1
ENSG00000060688 SNRNP40 -443466 sc-eQTL 2.55e-01 0.113 0.0986 0.105 Other_T L1
ENSG00000121766 ZCCHC17 -443660 sc-eQTL 5.00e-01 0.0714 0.106 0.105 Other_T L1
ENSG00000134644 PUM1 -212669 sc-eQTL 5.85e-02 0.179 0.0943 0.105 Other_T L1
ENSG00000162511 LAPTM5 95548 sc-eQTL 2.52e-01 0.0892 0.0777 0.105 Other_T L1
ENSG00000162517 PEF1 -791574 sc-eQTL 1.12e-01 0.165 0.103 0.105 Other_T L1
ENSG00000186056 MATN1-AS1 134818 sc-eQTL 7.26e-01 -0.0447 0.128 0.105 Other_T L1
ENSG00000287510 AL137857.1 121629 sc-eQTL 9.05e-01 -0.0159 0.133 0.105 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000060688 SNRNP40 -443466 sc-eQTL 6.86e-01 0.0629 0.155 0.11 B_Activated L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -443660 sc-eQTL 6.96e-01 -0.0612 0.157 0.11 B_Activated L2
ENSG00000134644 PUM1 -212669 sc-eQTL 2.96e-01 0.152 0.145 0.11 B_Activated L2
ENSG00000162510 MATN1 129737 sc-eQTL 8.43e-01 -0.0252 0.127 0.11 B_Activated L2
ENSG00000162511 LAPTM5 95548 sc-eQTL 7.62e-01 0.0269 0.0887 0.11 B_Activated L2
ENSG00000162517 PEF1 -791574 sc-eQTL 3.71e-01 -0.135 0.151 0.11 B_Activated L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 134818 sc-eQTL 8.51e-01 0.027 0.143 0.11 B_Activated L2
ENSG00000287510 AL137857.1 121629 sc-eQTL 1.84e-01 -0.168 0.126 0.11 B_Activated L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -443466 sc-eQTL 9.77e-01 0.00435 0.153 0.105 B_Intermediate L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -443660 sc-eQTL 3.25e-01 -0.126 0.127 0.105 B_Intermediate L2
ENSG00000134644 PUM1 -212669 sc-eQTL 2.71e-01 -0.133 0.12 0.105 B_Intermediate L2
ENSG00000162510 MATN1 129737 sc-eQTL 9.18e-01 -0.0129 0.125 0.105 B_Intermediate L2
ENSG00000162511 LAPTM5 95548 sc-eQTL 9.79e-01 0.00206 0.077 0.105 B_Intermediate L2
ENSG00000162517 PEF1 -791574 sc-eQTL 3.72e-01 0.128 0.143 0.105 B_Intermediate L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 134818 sc-eQTL 8.89e-01 -0.0151 0.108 0.105 B_Intermediate L2
ENSG00000287510 AL137857.1 121629 sc-eQTL 9.75e-01 0.00384 0.121 0.105 B_Intermediate L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -443466 sc-eQTL 5.22e-01 0.0939 0.147 0.103 B_Memory L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -443660 sc-eQTL 2.87e-01 -0.144 0.135 0.103 B_Memory L2
ENSG00000134644 PUM1 -212669 sc-eQTL 9.88e-02 0.194 0.117 0.103 B_Memory L2
ENSG00000162510 MATN1 129737 sc-eQTL 2.58e-01 0.127 0.112 0.103 B_Memory L2
ENSG00000162511 LAPTM5 95548 sc-eQTL 9.89e-01 -0.00137 0.0997 0.103 B_Memory L2
ENSG00000162517 PEF1 -791574 sc-eQTL 8.72e-01 -0.0215 0.133 0.103 B_Memory L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 134818 sc-eQTL 6.20e-01 0.0567 0.114 0.103 B_Memory L2
ENSG00000287510 AL137857.1 121629 sc-eQTL 8.12e-01 0.0319 0.134 0.103 B_Memory L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -443466 sc-eQTL 8.59e-01 0.0241 0.135 0.105 B_Naive1 L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -443660 sc-eQTL 1.24e-01 -0.179 0.116 0.105 B_Naive1 L2
ENSG00000134644 PUM1 -212669 sc-eQTL 3.60e-01 -0.094 0.103 0.105 B_Naive1 L2
ENSG00000162510 MATN1 129737 sc-eQTL 8.75e-01 0.0164 0.104 0.105 B_Naive1 L2
ENSG00000162511 LAPTM5 95548 sc-eQTL 3.25e-01 -0.0686 0.0695 0.105 B_Naive1 L2
ENSG00000162517 PEF1 -791574 sc-eQTL 9.52e-01 -0.00736 0.123 0.105 B_Naive1 L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 134818 sc-eQTL 1.34e-01 0.137 0.091 0.105 B_Naive1 L2
ENSG00000287510 AL137857.1 121629 sc-eQTL 8.26e-01 0.0249 0.113 0.105 B_Naive1 L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -443466 sc-eQTL 5.07e-01 -0.094 0.142 0.103 B_Naive2 L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -443660 sc-eQTL 6.47e-01 0.0537 0.117 0.103 B_Naive2 L2
ENSG00000134644 PUM1 -212669 sc-eQTL 9.60e-01 -0.00582 0.114 0.103 B_Naive2 L2
ENSG00000162510 MATN1 129737 sc-eQTL 5.41e-01 -0.0672 0.11 0.103 B_Naive2 L2
ENSG00000162511 LAPTM5 95548 sc-eQTL 9.30e-01 -0.00661 0.0746 0.103 B_Naive2 L2
ENSG00000162517 PEF1 -791574 sc-eQTL 8.58e-01 0.0243 0.136 0.103 B_Naive2 L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 134818 sc-eQTL 7.78e-01 0.0307 0.109 0.103 B_Naive2 L2
ENSG00000287510 AL137857.1 121629 sc-eQTL 1.07e-01 0.189 0.117 0.103 B_Naive2 L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -443466 sc-eQTL 2.89e-01 -0.15 0.141 0.102 CD4_CTL L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -443660 sc-eQTL 9.28e-01 0.0127 0.139 0.102 CD4_CTL L2
ENSG00000134644 PUM1 -212669 sc-eQTL 2.79e-01 -0.147 0.136 0.102 CD4_CTL L2
ENSG00000162511 LAPTM5 95548 sc-eQTL 6.83e-01 -0.0497 0.122 0.102 CD4_CTL L2
ENSG00000162517 PEF1 -791574 sc-eQTL 4.46e-01 -0.095 0.124 0.102 CD4_CTL L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 134818 sc-eQTL 5.29e-01 -0.0838 0.133 0.102 CD4_CTL L2
ENSG00000287510 AL137857.1 121629 sc-eQTL 8.23e-01 0.0263 0.117 0.102 CD4_CTL L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -443466 sc-eQTL 7.33e-01 0.0371 0.109 0.105 CD4_Naive L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -443660 sc-eQTL 9.05e-01 0.0115 0.0964 0.105 CD4_Naive L2
ENSG00000134644 PUM1 -212669 sc-eQTL 7.01e-01 -0.0296 0.0769 0.105 CD4_Naive L2
ENSG00000162511 LAPTM5 95548 sc-eQTL 7.65e-01 0.0247 0.0824 0.105 CD4_Naive L2
ENSG00000162517 PEF1 -791574 sc-eQTL 2.85e-01 -0.0966 0.0902 0.105 CD4_Naive L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 134818 sc-eQTL 6.81e-01 -0.0344 0.0836 0.105 CD4_Naive L2
ENSG00000287510 AL137857.1 121629 sc-eQTL 5.07e-01 -0.0638 0.096 0.105 CD4_Naive L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -443466 sc-eQTL 6.26e-01 0.0673 0.138 0.105 CD4_TCM L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -443660 sc-eQTL 9.68e-01 0.00453 0.111 0.105 CD4_TCM L2
ENSG00000134644 PUM1 -212669 sc-eQTL 4.43e-01 0.0755 0.0982 0.105 CD4_TCM L2
ENSG00000162511 LAPTM5 95548 sc-eQTL 2.33e-01 -0.0973 0.0813 0.105 CD4_TCM L2
ENSG00000162517 PEF1 -791574 sc-eQTL 5.14e-01 -0.0715 0.109 0.105 CD4_TCM L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 134818 sc-eQTL 5.26e-01 -0.0657 0.103 0.105 CD4_TCM L2
ENSG00000287510 AL137857.1 121629 sc-eQTL 1.80e-01 -0.154 0.115 0.105 CD4_TCM L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -443466 sc-eQTL 5.38e-01 -0.085 0.138 0.105 CD4_TEM L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -443660 sc-eQTL 9.05e-01 -0.0157 0.131 0.105 CD4_TEM L2
ENSG00000134644 PUM1 -212669 sc-eQTL 6.54e-01 -0.0491 0.109 0.105 CD4_TEM L2
ENSG00000162511 LAPTM5 95548 sc-eQTL 7.47e-01 -0.0358 0.111 0.105 CD4_TEM L2
ENSG00000162517 PEF1 -791574 sc-eQTL 1.12e-01 -0.197 0.123 0.105 CD4_TEM L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 134818 sc-eQTL 5.31e-01 -0.0812 0.129 0.105 CD4_TEM L2
ENSG00000287510 AL137857.1 121629 sc-eQTL 2.57e-01 0.145 0.127 0.105 CD4_TEM L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -443466 sc-eQTL 9.69e-01 -0.00591 0.15 0.105 CD8_CTL L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -443660 sc-eQTL 2.59e-01 0.13 0.115 0.105 CD8_CTL L2
ENSG00000134644 PUM1 -212669 sc-eQTL 2.52e-01 -0.128 0.112 0.105 CD8_CTL L2
ENSG00000162511 LAPTM5 95548 sc-eQTL 9.24e-01 0.0119 0.124 0.105 CD8_CTL L2
ENSG00000162517 PEF1 -791574 sc-eQTL 5.39e-01 -0.0664 0.108 0.105 CD8_CTL L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 134818 sc-eQTL 5.48e-01 -0.0784 0.13 0.105 CD8_CTL L2
ENSG00000287510 AL137857.1 121629 sc-eQTL 4.15e-01 -0.0999 0.122 0.105 CD8_CTL L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -443466 sc-eQTL 3.52e-02 0.29 0.137 0.105 CD8_Naive L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -443660 sc-eQTL 9.64e-01 0.00537 0.119 0.105 CD8_Naive L2
ENSG00000134644 PUM1 -212669 sc-eQTL 7.74e-02 -0.169 0.0952 0.105 CD8_Naive L2
ENSG00000162511 LAPTM5 95548 sc-eQTL 5.36e-01 0.0569 0.0918 0.105 CD8_Naive L2
ENSG00000162517 PEF1 -791574 sc-eQTL 4.83e-01 0.0897 0.128 0.105 CD8_Naive L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 134818 sc-eQTL 7.59e-01 -0.0352 0.115 0.105 CD8_Naive L2
ENSG00000287510 AL137857.1 121629 sc-eQTL 1.21e-01 -0.193 0.124 0.105 CD8_Naive L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -443466 sc-eQTL 5.78e-01 -0.0873 0.157 0.1 CD8_TCM L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -443660 sc-eQTL 2.24e-01 0.175 0.143 0.1 CD8_TCM L2
ENSG00000134644 PUM1 -212669 sc-eQTL 8.98e-01 -0.0173 0.135 0.1 CD8_TCM L2
ENSG00000162511 LAPTM5 95548 sc-eQTL 1.92e-01 0.185 0.141 0.1 CD8_TCM L2
ENSG00000162517 PEF1 -791574 sc-eQTL 5.86e-01 0.0789 0.145 0.1 CD8_TCM L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 134818 sc-eQTL 9.80e-01 -0.00328 0.131 0.1 CD8_TCM L2
ENSG00000287510 AL137857.1 121629 sc-eQTL 5.28e-01 0.0837 0.132 0.1 CD8_TCM L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -443466 sc-eQTL 7.03e-02 -0.259 0.143 0.107 CD8_TEM L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -443660 sc-eQTL 9.08e-01 0.0159 0.138 0.107 CD8_TEM L2
ENSG00000134644 PUM1 -212669 sc-eQTL 8.69e-01 0.0232 0.141 0.107 CD8_TEM L2
ENSG00000162511 LAPTM5 95548 sc-eQTL 1.10e-01 -0.211 0.132 0.107 CD8_TEM L2
ENSG00000162517 PEF1 -791574 sc-eQTL 9.86e-01 0.00218 0.125 0.107 CD8_TEM L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 134818 sc-eQTL 3.38e-01 0.132 0.137 0.107 CD8_TEM L2
ENSG00000287510 AL137857.1 121629 sc-eQTL 2.37e-01 -0.147 0.124 0.107 CD8_TEM L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -443466 sc-eQTL 2.21e-01 0.18 0.147 0.104 MAIT L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -443660 sc-eQTL 1.84e-01 0.173 0.13 0.104 MAIT L2
ENSG00000134644 PUM1 -212669 sc-eQTL 2.55e-01 0.142 0.125 0.104 MAIT L2
ENSG00000162511 LAPTM5 95548 sc-eQTL 3.67e-01 0.106 0.118 0.104 MAIT L2
ENSG00000162517 PEF1 -791574 sc-eQTL 4.52e-01 0.0974 0.129 0.104 MAIT L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 134818 sc-eQTL 4.23e-01 -0.105 0.131 0.104 MAIT L2
ENSG00000287510 AL137857.1 121629 sc-eQTL 8.38e-01 -0.0277 0.135 0.104 MAIT L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -443466 sc-eQTL 9.13e-01 -0.016 0.147 0.107 NK_CD56bright L2
ENSG00000121753 ADGRB2 -911571 sc-eQTL 2.44e-01 -0.134 0.115 0.107 NK_CD56bright L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -443660 sc-eQTL 4.32e-01 0.0978 0.124 0.107 NK_CD56bright L2
ENSG00000134644 PUM1 -212669 sc-eQTL 5.77e-01 0.073 0.131 0.107 NK_CD56bright L2
ENSG00000162511 LAPTM5 95548 sc-eQTL 2.66e-01 -0.143 0.128 0.107 NK_CD56bright L2
ENSG00000162517 PEF1 -791574 sc-eQTL 6.63e-01 -0.0547 0.125 0.107 NK_CD56bright L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 134818 sc-eQTL 5.28e-01 0.0819 0.129 0.107 NK_CD56bright L2
ENSG00000287510 AL137857.1 121629 sc-eQTL 4.80e-02 -0.251 0.126 0.107 NK_CD56bright L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -443466 sc-eQTL 8.86e-01 0.0199 0.139 0.103 NK_CD56dim L2
ENSG00000121753 ADGRB2 -911571 sc-eQTL 4.38e-02 -0.246 0.121 0.103 NK_CD56dim L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -443660 sc-eQTL 7.30e-01 -0.0356 0.103 0.103 NK_CD56dim L2
ENSG00000134644 PUM1 -212669 sc-eQTL 3.08e-01 -0.108 0.105 0.103 NK_CD56dim L2
ENSG00000162511 LAPTM5 95548 sc-eQTL 7.24e-02 -0.202 0.112 0.103 NK_CD56dim L2
ENSG00000162517 PEF1 -791574 sc-eQTL 5.43e-01 -0.061 0.1 0.103 NK_CD56dim L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 134818 sc-eQTL 8.41e-01 0.0284 0.141 0.103 NK_CD56dim L2
ENSG00000287510 AL137857.1 121629 sc-eQTL 2.90e-01 -0.123 0.116 0.103 NK_CD56dim L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -443466 sc-eQTL 4.69e-01 0.106 0.146 0.103 NK_HLA L2
ENSG00000121753 ADGRB2 -911571 sc-eQTL 7.55e-01 -0.0364 0.116 0.103 NK_HLA L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -443660 sc-eQTL 6.94e-01 0.0516 0.131 0.103 NK_HLA L2
ENSG00000134644 PUM1 -212669 sc-eQTL 6.58e-01 0.0564 0.127 0.103 NK_HLA L2
ENSG00000162511 LAPTM5 95548 sc-eQTL 4.13e-02 -0.247 0.12 0.103 NK_HLA L2
ENSG00000162517 PEF1 -791574 sc-eQTL 4.03e-01 0.115 0.137 0.103 NK_HLA L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 134818 sc-eQTL 7.17e-01 -0.047 0.129 0.103 NK_HLA L2
ENSG00000287510 AL137857.1 121629 sc-eQTL 5.79e-01 -0.0695 0.125 0.103 NK_HLA L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -443466 sc-eQTL 9.19e-01 -0.0137 0.135 0.103 NK_cytokine L2
ENSG00000121753 ADGRB2 -911571 sc-eQTL 9.78e-01 -0.00342 0.122 0.103 NK_cytokine L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -443660 sc-eQTL 1.05e-01 -0.17 0.105 0.103 NK_cytokine L2
ENSG00000134644 PUM1 -212669 sc-eQTL 8.87e-01 -0.0162 0.114 0.103 NK_cytokine L2
ENSG00000162511 LAPTM5 95548 sc-eQTL 2.79e-01 -0.136 0.125 0.103 NK_cytokine L2
ENSG00000162517 PEF1 -791574 sc-eQTL 5.79e-01 0.0595 0.107 0.103 NK_cytokine L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 134818 sc-eQTL 4.04e-01 -0.111 0.133 0.103 NK_cytokine L2
ENSG00000287510 AL137857.1 121629 sc-eQTL 3.13e-01 -0.125 0.124 0.103 NK_cytokine L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -443466 sc-eQTL 6.34e-01 -0.0661 0.138 0.137 PB L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -443660 sc-eQTL 8.51e-02 0.275 0.159 0.137 PB L2
ENSG00000134644 PUM1 -212669 sc-eQTL 1.30e-01 -0.211 0.138 0.137 PB L2
ENSG00000162510 MATN1 129737 sc-eQTL 6.30e-01 -0.0628 0.13 0.137 PB L2
ENSG00000162511 LAPTM5 95548 sc-eQTL 3.26e-01 -0.0913 0.0925 0.137 PB L2
ENSG00000162517 PEF1 -791574 sc-eQTL 5.34e-01 0.0892 0.143 0.137 PB L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 134818 sc-eQTL 1.43e-01 -0.186 0.126 0.137 PB L2
ENSG00000287510 AL137857.1 121629 sc-eQTL 4.65e-02 0.268 0.133 0.137 PB L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -443466 sc-eQTL 5.82e-02 0.204 0.107 0.107 Pro_T L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -443660 sc-eQTL 6.85e-01 -0.0558 0.137 0.107 Pro_T L2
ENSG00000134644 PUM1 -212669 sc-eQTL 4.75e-01 0.0916 0.128 0.107 Pro_T L2
ENSG00000162511 LAPTM5 95548 sc-eQTL 3.49e-01 -0.0861 0.0917 0.107 Pro_T L2
ENSG00000162517 PEF1 -791574 sc-eQTL 5.13e-01 -0.0884 0.135 0.107 Pro_T L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 134818 sc-eQTL 9.71e-01 -0.00468 0.128 0.107 Pro_T L2
ENSG00000287510 AL137857.1 121629 sc-eQTL 7.99e-01 -0.0301 0.118 0.107 Pro_T L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -443466 sc-eQTL 6.04e-01 -0.0741 0.143 0.105 Treg L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -443660 sc-eQTL 9.69e-02 -0.229 0.137 0.105 Treg L2
ENSG00000134644 PUM1 -212669 sc-eQTL 5.47e-01 -0.0668 0.111 0.105 Treg L2
ENSG00000162511 LAPTM5 95548 sc-eQTL 2.30e-01 -0.152 0.126 0.105 Treg L2
ENSG00000162517 PEF1 -791574 sc-eQTL 8.25e-01 0.0303 0.137 0.105 Treg L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 134818 sc-eQTL 7.83e-01 -0.0356 0.129 0.105 Treg L2
ENSG00000287510 AL137857.1 121629 sc-eQTL 1.72e-01 -0.176 0.128 0.105 Treg L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -443466 sc-eQTL 4.00e-01 -0.123 0.146 0.105 cDC L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -443660 sc-eQTL 4.50e-01 0.12 0.158 0.105 cDC L2
ENSG00000134644 PUM1 -212669 sc-eQTL 2.51e-01 -0.156 0.135 0.105 cDC L2
ENSG00000162511 LAPTM5 95548 sc-eQTL 5.58e-01 0.0559 0.0952 0.105 cDC L2
ENSG00000162517 PEF1 -791574 sc-eQTL 2.70e-02 -0.303 0.136 0.105 cDC L2
ENSG00000168528 SERINC2 -556243 sc-eQTL 3.18e-01 -0.122 0.122 0.105 cDC L2
ENSG00000284543 LINC01226 -652904 sc-eQTL 7.86e-02 0.211 0.119 0.105 cDC L2
ENSG00000287510 AL137857.1 121629 sc-eQTL 1.51e-01 -0.186 0.129 0.105 cDC L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -443466 sc-eQTL 1.51e-01 -0.163 0.113 0.105 cMono_IL1B L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -443660 sc-eQTL 6.27e-01 -0.0616 0.127 0.105 cMono_IL1B L2
ENSG00000134644 PUM1 -212669 sc-eQTL 5.86e-01 0.0468 0.0857 0.105 cMono_IL1B L2
ENSG00000162511 LAPTM5 95548 sc-eQTL 9.20e-02 0.127 0.0748 0.105 cMono_IL1B L2
ENSG00000162512 SDC3 -55436 sc-eQTL 9.02e-01 0.0175 0.142 0.105 cMono_IL1B L2
ENSG00000162517 PEF1 -791574 sc-eQTL 9.81e-01 -0.00273 0.116 0.105 cMono_IL1B L2
ENSG00000168528 SERINC2 -556243 sc-eQTL 3.55e-02 -0.301 0.142 0.105 cMono_IL1B L2
ENSG00000284543 LINC01226 -652904 sc-eQTL 4.28e-01 0.101 0.127 0.105 cMono_IL1B L2
ENSG00000287510 AL137857.1 121629 sc-eQTL 2.72e-01 0.13 0.118 0.105 cMono_IL1B L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -443466 sc-eQTL 8.76e-01 -0.0188 0.121 0.105 cMono_S100A L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -443660 sc-eQTL 9.60e-04 0.465 0.139 0.105 cMono_S100A L2
ENSG00000134644 PUM1 -212669 sc-eQTL 5.05e-01 -0.0687 0.103 0.105 cMono_S100A L2
ENSG00000162511 LAPTM5 95548 sc-eQTL 9.34e-02 0.133 0.0787 0.105 cMono_S100A L2
ENSG00000162512 SDC3 -55436 sc-eQTL 5.18e-01 0.0885 0.137 0.105 cMono_S100A L2
ENSG00000162517 PEF1 -791574 sc-eQTL 9.90e-01 -0.00157 0.124 0.105 cMono_S100A L2
ENSG00000168528 SERINC2 -556243 sc-eQTL 2.31e-01 -0.174 0.144 0.105 cMono_S100A L2
ENSG00000284543 LINC01226 -652904 sc-eQTL 2.97e-01 -0.123 0.117 0.105 cMono_S100A L2
ENSG00000287510 AL137857.1 121629 sc-eQTL 3.78e-01 0.104 0.118 0.105 cMono_S100A L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -443466 sc-eQTL 1.81e-01 -0.253 0.188 0.097 gdT L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -443660 sc-eQTL 7.46e-01 0.0527 0.162 0.097 gdT L2
ENSG00000134644 PUM1 -212669 sc-eQTL 3.60e-01 0.153 0.167 0.097 gdT L2
ENSG00000162511 LAPTM5 95548 sc-eQTL 2.34e-01 -0.217 0.181 0.097 gdT L2
ENSG00000162517 PEF1 -791574 sc-eQTL 2.04e-01 0.211 0.166 0.097 gdT L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 134818 sc-eQTL 6.82e-01 -0.069 0.168 0.097 gdT L2
ENSG00000287510 AL137857.1 121629 sc-eQTL 1.58e-01 -0.229 0.162 0.097 gdT L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -443466 sc-eQTL 6.10e-01 -0.0682 0.133 0.107 intMono L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -443660 sc-eQTL 2.78e-01 0.156 0.143 0.107 intMono L2
ENSG00000134644 PUM1 -212669 sc-eQTL 8.87e-01 0.0173 0.122 0.107 intMono L2
ENSG00000162511 LAPTM5 95548 sc-eQTL 1.70e-01 0.131 0.0951 0.107 intMono L2
ENSG00000162512 SDC3 -55436 sc-eQTL 8.95e-03 0.339 0.129 0.107 intMono L2
ENSG00000162517 PEF1 -791574 sc-eQTL 7.06e-01 -0.0518 0.137 0.107 intMono L2
ENSG00000168528 SERINC2 -556243 sc-eQTL 3.26e-01 -0.134 0.137 0.107 intMono L2
ENSG00000284543 LINC01226 -652904 sc-eQTL 2.72e-01 0.143 0.129 0.107 intMono L2
ENSG00000287510 AL137857.1 121629 sc-eQTL 8.08e-02 -0.226 0.129 0.107 intMono L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -443466 sc-eQTL 3.25e-01 0.121 0.123 0.106 ncMono L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -443660 sc-eQTL 2.65e-01 0.146 0.131 0.106 ncMono L2
ENSG00000134644 PUM1 -212669 sc-eQTL 5.32e-01 0.067 0.107 0.106 ncMono L2
ENSG00000162511 LAPTM5 95548 sc-eQTL 2.41e-01 0.114 0.097 0.106 ncMono L2
ENSG00000162512 SDC3 -55436 sc-eQTL 2.45e-01 0.127 0.109 0.106 ncMono L2
ENSG00000162517 PEF1 -791574 sc-eQTL 6.73e-01 -0.0529 0.125 0.106 ncMono L2
ENSG00000168528 SERINC2 -556243 sc-eQTL 1.06e-01 -0.192 0.118 0.106 ncMono L2
ENSG00000284543 LINC01226 -652904 sc-eQTL 7.18e-01 0.043 0.119 0.106 ncMono L2
ENSG00000287510 AL137857.1 121629 sc-eQTL 4.41e-01 -0.0951 0.123 0.106 ncMono L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -443466 sc-eQTL 5.92e-02 0.288 0.151 0.093 pDC L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -443660 sc-eQTL 3.83e-01 -0.147 0.168 0.093 pDC L2
ENSG00000134644 PUM1 -212669 sc-eQTL 8.13e-01 -0.033 0.139 0.093 pDC L2
ENSG00000162511 LAPTM5 95548 sc-eQTL 4.43e-01 -0.0995 0.129 0.093 pDC L2
ENSG00000162517 PEF1 -791574 sc-eQTL 5.79e-01 -0.0933 0.168 0.093 pDC L2
ENSG00000168528 SERINC2 -556243 sc-eQTL 4.94e-01 0.108 0.157 0.093 pDC L2
ENSG00000284543 LINC01226 -652904 sc-eQTL 8.52e-01 0.0229 0.122 0.093 pDC L2
ENSG00000287510 AL137857.1 121629 sc-eQTL 3.76e-02 -0.297 0.142 0.093 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000060688 SNRNP40 -443466 sc-eQTL 2.00e-01 0.187 0.145 0.105 B_Memory LOneK1K
ENSG00000121766 ZCCHC17 -443660 sc-eQTL 2.37e-01 -0.143 0.121 0.105 B_Memory LOneK1K
ENSG00000134644 PUM1 -212669 sc-eQTL 5.59e-01 0.0629 0.107 0.105 B_Memory LOneK1K
ENSG00000162510 MATN1 129737 sc-eQTL 9.15e-01 0.0131 0.122 0.105 B_Memory LOneK1K
ENSG00000162511 LAPTM5 95548 sc-eQTL 8.65e-01 -0.0131 0.077 0.105 B_Memory LOneK1K
ENSG00000162517 PEF1 -791574 sc-eQTL 8.18e-01 0.0294 0.127 0.105 B_Memory LOneK1K
ENSG00000186056 MATN1-AS1 134818 sc-eQTL 7.55e-01 -0.0318 0.102 0.105 B_Memory LOneK1K
ENSG00000287510 AL137857.1 121629 sc-eQTL 5.33e-01 -0.0692 0.111 0.105 B_Memory LOneK1K
ENSG00000060688 SNRNP40 -443466 sc-eQTL 8.82e-01 -0.0194 0.131 0.105 B_Naive LOneK1K
ENSG00000121766 ZCCHC17 -443660 sc-eQTL 3.57e-01 -0.0953 0.103 0.105 B_Naive LOneK1K
ENSG00000134644 PUM1 -212669 sc-eQTL 3.25e-01 -0.0963 0.0977 0.105 B_Naive LOneK1K
ENSG00000162510 MATN1 129737 sc-eQTL 3.85e-01 -0.0819 0.0941 0.105 B_Naive LOneK1K
ENSG00000162511 LAPTM5 95548 sc-eQTL 4.47e-01 -0.0505 0.0663 0.105 B_Naive LOneK1K
ENSG00000162517 PEF1 -791574 sc-eQTL 7.17e-01 0.0441 0.121 0.105 B_Naive LOneK1K
ENSG00000186056 MATN1-AS1 134818 sc-eQTL 8.38e-02 0.148 0.0851 0.105 B_Naive LOneK1K
ENSG00000287510 AL137857.1 121629 sc-eQTL 4.65e-01 0.0745 0.102 0.105 B_Naive LOneK1K
ENSG00000060688 SNRNP40 -443466 sc-eQTL 2.87e-01 -0.116 0.108 0.105 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000121766 ZCCHC17 -443660 sc-eQTL 6.63e-02 0.225 0.122 0.105 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000134644 PUM1 -212669 sc-eQTL 8.80e-01 0.0119 0.0783 0.105 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000162511 LAPTM5 95548 sc-eQTL 5.90e-02 0.13 0.0683 0.105 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000162512 SDC3 -55436 sc-eQTL 8.73e-01 0.0225 0.14 0.105 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000162517 PEF1 -791574 sc-eQTL 8.97e-01 0.0128 0.0988 0.105 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000168528 SERINC2 -556243 sc-eQTL 6.59e-02 -0.265 0.143 0.105 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000284543 LINC01226 -652904 sc-eQTL 5.70e-01 0.0673 0.118 0.105 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000287510 AL137857.1 121629 sc-eQTL 2.46e-01 0.129 0.111 0.105 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000060688 SNRNP40 -443466 sc-eQTL 7.60e-01 0.036 0.118 0.106 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000121766 ZCCHC17 -443660 sc-eQTL 1.03e-01 0.21 0.128 0.106 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000134644 PUM1 -212669 sc-eQTL 9.30e-01 0.00923 0.106 0.106 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000162511 LAPTM5 95548 sc-eQTL 1.99e-01 0.108 0.0841 0.106 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000162512 SDC3 -55436 sc-eQTL 2.00e-03 0.377 0.121 0.106 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000162517 PEF1 -791574 sc-eQTL 5.76e-01 -0.0628 0.112 0.106 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000168528 SERINC2 -556243 sc-eQTL 2.17e-01 -0.158 0.127 0.106 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000284543 LINC01226 -652904 sc-eQTL 3.57e-01 0.112 0.121 0.106 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000287510 AL137857.1 121629 sc-eQTL 2.22e-01 -0.149 0.121 0.106 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000060688 SNRNP40 -443466 sc-eQTL 9.54e-01 0.00761 0.132 0.103 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000121753 ADGRB2 -911571 sc-eQTL 2.46e-01 -0.131 0.112 0.103 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000121766 ZCCHC17 -443660 sc-eQTL 4.72e-01 -0.0651 0.0903 0.103 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000134644 PUM1 -212669 sc-eQTL 3.48e-01 -0.0929 0.0988 0.103 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000162511 LAPTM5 95548 sc-eQTL 1.62e-01 -0.155 0.11 0.103 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000162517 PEF1 -791574 sc-eQTL 7.90e-01 -0.0224 0.0841 0.103 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000186056 MATN1-AS1 134818 sc-eQTL 6.46e-01 -0.0587 0.128 0.103 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000287510 AL137857.1 121629 sc-eQTL 1.73e-01 -0.15 0.11 0.103 NK_CD56dim LOneK1K

Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF
ENSG00000121766 ZCCHC17 -443660 eQTL 2.91e-02 -0.0583 0.0267 0.0 0.0 0.118
ENSG00000168528 SERINC2 -556243 eQTL 9.71e-05 -0.226 0.0577 0.0 0.0 0.118

Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina
ENSG00000162517 \N -791574 2.76e-07 1.34e-07 3.88e-08 2.05e-07 9.87e-08 8.45e-08 1.6e-07 5.53e-08 1.45e-07 5.42e-08 1.52e-07 9e-08 1.52e-07 7.37e-08 6.18e-08 7.36e-08 4.17e-08 1.27e-07 6.75e-08 4.78e-08 1.26e-07 1.24e-07 1.45e-07 2.91e-08 1.63e-07 1.21e-07 1.07e-07 9.74e-08 1.16e-07 1.07e-07 9.92e-08 3.08e-08 3.73e-08 8.7e-08 3.63e-08 3.28e-08 4.62e-08 8.72e-08 6.58e-08 5.35e-08 5.24e-08 1.46e-07 5.12e-08 1.57e-08 3.84e-08 1.89e-08 1.19e-07 1.88e-09 4.94e-08
ENSG00000168528 SERINC2 -556243 4.68e-07 2.5e-07 6.41e-08 2.87e-07 1.05e-07 1.32e-07 3.33e-07 7.12e-08 1.98e-07 1.11e-07 2.47e-07 1.57e-07 3.48e-07 8.26e-08 8.45e-08 1.01e-07 5.73e-08 2.33e-07 9.71e-08 8.1e-08 1.35e-07 1.98e-07 1.89e-07 4.81e-08 3.27e-07 1.65e-07 1.33e-07 1.52e-07 1.48e-07 1.85e-07 1.35e-07 4.29e-08 5.09e-08 1.23e-07 1.31e-07 4.86e-08 8.75e-08 5.25e-08 5.7e-08 5.61e-08 3.68e-08 2.6e-07 2.94e-08 5.58e-09 4.91e-08 8.07e-09 8.98e-08 0.0 4.98e-08