logo

Genes within 1Mb (chr1:30852243:C:A):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD

Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000060688 SNRNP40 -444545 sc-eQTL 9.79e-01 -0.00342 0.129 0.109 B L1
ENSG00000121766 ZCCHC17 -444739 sc-eQTL 1.08e-01 0.165 0.102 0.109 B L1
ENSG00000134644 PUM1 -213748 sc-eQTL 1.93e-01 -0.112 0.0861 0.109 B L1
ENSG00000162510 MATN1 128658 sc-eQTL 7.47e-02 0.161 0.0902 0.109 B L1
ENSG00000162511 LAPTM5 94469 sc-eQTL 7.35e-01 0.0241 0.0711 0.109 B L1
ENSG00000162517 PEF1 -792653 sc-eQTL 8.66e-01 0.0181 0.107 0.109 B L1
ENSG00000186056 MATN1-AS1 133739 sc-eQTL 2.66e-01 0.0927 0.0831 0.109 B L1
ENSG00000287510 AL137857.1 120550 sc-eQTL 2.51e-01 0.113 0.0984 0.109 B L1
ENSG00000060688 SNRNP40 -444545 sc-eQTL 1.81e-01 0.146 0.108 0.109 CD4T L1
ENSG00000121766 ZCCHC17 -444739 sc-eQTL 5.59e-01 -0.0498 0.085 0.109 CD4T L1
ENSG00000134644 PUM1 -213748 sc-eQTL 3.38e-01 -0.0725 0.0756 0.109 CD4T L1
ENSG00000162511 LAPTM5 94469 sc-eQTL 4.68e-01 0.061 0.0838 0.109 CD4T L1
ENSG00000162517 PEF1 -792653 sc-eQTL 4.02e-01 0.0736 0.0876 0.109 CD4T L1
ENSG00000186056 MATN1-AS1 133739 sc-eQTL 3.88e-02 0.155 0.0743 0.109 CD4T L1
ENSG00000287510 AL137857.1 120550 sc-eQTL 8.84e-01 -0.0131 0.0899 0.109 CD4T L1
ENSG00000060688 SNRNP40 -444545 sc-eQTL 1.18e-01 0.224 0.142 0.109 CD8T L1
ENSG00000121766 ZCCHC17 -444739 sc-eQTL 5.16e-01 -0.062 0.0953 0.109 CD8T L1
ENSG00000134644 PUM1 -213748 sc-eQTL 1.47e-01 0.122 0.0836 0.109 CD8T L1
ENSG00000162511 LAPTM5 94469 sc-eQTL 6.05e-01 0.0422 0.0815 0.109 CD8T L1
ENSG00000162517 PEF1 -792653 sc-eQTL 6.19e-01 -0.0501 0.1 0.109 CD8T L1
ENSG00000186056 MATN1-AS1 133739 sc-eQTL 4.02e-01 0.0801 0.0954 0.109 CD8T L1
ENSG00000287510 AL137857.1 120550 sc-eQTL 8.21e-01 -0.0271 0.12 0.109 CD8T L1
ENSG00000060688 SNRNP40 -444545 sc-eQTL 8.55e-01 0.0238 0.13 0.108 DC L1
ENSG00000121766 ZCCHC17 -444739 sc-eQTL 2.33e-01 0.183 0.153 0.108 DC L1
ENSG00000134644 PUM1 -213748 sc-eQTL 4.84e-01 -0.0842 0.12 0.108 DC L1
ENSG00000162511 LAPTM5 94469 sc-eQTL 1.59e-01 -0.121 0.0856 0.108 DC L1
ENSG00000162517 PEF1 -792653 sc-eQTL 8.29e-01 0.0301 0.139 0.108 DC L1
ENSG00000168528 SERINC2 -557322 sc-eQTL 9.56e-01 -0.00778 0.142 0.108 DC L1
ENSG00000284543 LINC01226 -653983 sc-eQTL 8.80e-01 0.0142 0.0939 0.108 DC L1
ENSG00000287510 AL137857.1 120550 sc-eQTL 2.05e-01 0.172 0.135 0.108 DC L1
ENSG00000060688 SNRNP40 -444545 sc-eQTL 3.54e-01 0.0909 0.0978 0.109 Mono L1
ENSG00000121766 ZCCHC17 -444739 sc-eQTL 5.82e-02 -0.229 0.12 0.109 Mono L1
ENSG00000134644 PUM1 -213748 sc-eQTL 3.33e-01 -0.0755 0.0777 0.109 Mono L1
ENSG00000162511 LAPTM5 94469 sc-eQTL 9.73e-01 0.00244 0.0716 0.109 Mono L1
ENSG00000162512 SDC3 -56515 sc-eQTL 6.04e-01 0.0715 0.138 0.109 Mono L1
ENSG00000162517 PEF1 -792653 sc-eQTL 5.45e-01 0.0585 0.0965 0.109 Mono L1
ENSG00000168528 SERINC2 -557322 sc-eQTL 8.55e-01 -0.027 0.148 0.109 Mono L1
ENSG00000284543 LINC01226 -653983 sc-eQTL 8.17e-01 -0.0301 0.13 0.109 Mono L1
ENSG00000287510 AL137857.1 120550 sc-eQTL 8.53e-01 0.0211 0.114 0.109 Mono L1
ENSG00000060688 SNRNP40 -444545 sc-eQTL 3.01e-01 0.142 0.137 0.109 NK L1
ENSG00000121753 ADGRB2 -912650 sc-eQTL 3.32e-01 -0.115 0.118 0.109 NK L1
ENSG00000121766 ZCCHC17 -444739 sc-eQTL 9.40e-01 -0.00707 0.0939 0.109 NK L1
ENSG00000134644 PUM1 -213748 sc-eQTL 1.50e-01 0.141 0.098 0.109 NK L1
ENSG00000162511 LAPTM5 94469 sc-eQTL 1.42e-01 0.166 0.113 0.109 NK L1
ENSG00000162517 PEF1 -792653 sc-eQTL 6.70e-01 0.0353 0.0827 0.109 NK L1
ENSG00000186056 MATN1-AS1 133739 sc-eQTL 6.95e-01 0.05 0.127 0.109 NK L1
ENSG00000287510 AL137857.1 120550 sc-eQTL 7.90e-01 0.0314 0.118 0.109 NK L1
ENSG00000060688 SNRNP40 -444545 sc-eQTL 2.51e-01 0.118 0.102 0.109 Other_T L1
ENSG00000121766 ZCCHC17 -444739 sc-eQTL 5.37e-01 -0.0678 0.11 0.109 Other_T L1
ENSG00000134644 PUM1 -213748 sc-eQTL 3.21e-01 0.0979 0.0984 0.109 Other_T L1
ENSG00000162511 LAPTM5 94469 sc-eQTL 4.94e-01 0.0554 0.0808 0.109 Other_T L1
ENSG00000162517 PEF1 -792653 sc-eQTL 5.18e-02 -0.209 0.107 0.109 Other_T L1
ENSG00000186056 MATN1-AS1 133739 sc-eQTL 1.30e-01 0.2 0.132 0.109 Other_T L1
ENSG00000287510 AL137857.1 120550 sc-eQTL 6.30e-01 0.0665 0.138 0.109 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000060688 SNRNP40 -444545 sc-eQTL 7.65e-01 -0.0485 0.162 0.115 B_Activated L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -444739 sc-eQTL 6.38e-01 -0.0769 0.163 0.115 B_Activated L2
ENSG00000134644 PUM1 -213748 sc-eQTL 8.39e-01 -0.0308 0.152 0.115 B_Activated L2
ENSG00000162510 MATN1 128658 sc-eQTL 7.67e-01 -0.0393 0.133 0.115 B_Activated L2
ENSG00000162511 LAPTM5 94469 sc-eQTL 4.78e-01 -0.0658 0.0924 0.115 B_Activated L2
ENSG00000162517 PEF1 -792653 sc-eQTL 6.31e-02 0.292 0.156 0.115 B_Activated L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 133739 sc-eQTL 5.79e-01 -0.083 0.149 0.115 B_Activated L2
ENSG00000287510 AL137857.1 120550 sc-eQTL 8.86e-01 0.019 0.132 0.115 B_Activated L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -444545 sc-eQTL 3.90e-01 -0.133 0.155 0.109 B_Intermediate L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -444739 sc-eQTL 9.22e-01 0.0127 0.129 0.109 B_Intermediate L2
ENSG00000134644 PUM1 -213748 sc-eQTL 7.14e-01 -0.0448 0.122 0.109 B_Intermediate L2
ENSG00000162510 MATN1 128658 sc-eQTL 6.36e-01 0.0602 0.127 0.109 B_Intermediate L2
ENSG00000162511 LAPTM5 94469 sc-eQTL 9.11e-01 0.00877 0.0779 0.109 B_Intermediate L2
ENSG00000162517 PEF1 -792653 sc-eQTL 7.84e-01 -0.0396 0.145 0.109 B_Intermediate L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 133739 sc-eQTL 8.12e-01 0.026 0.109 0.109 B_Intermediate L2
ENSG00000287510 AL137857.1 120550 sc-eQTL 8.16e-01 -0.0285 0.122 0.109 B_Intermediate L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -444545 sc-eQTL 4.27e-01 0.118 0.148 0.11 B_Memory L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -444739 sc-eQTL 9.58e-01 -0.00724 0.136 0.11 B_Memory L2
ENSG00000134644 PUM1 -213748 sc-eQTL 1.15e-01 -0.186 0.118 0.11 B_Memory L2
ENSG00000162510 MATN1 128658 sc-eQTL 5.68e-01 0.0647 0.113 0.11 B_Memory L2
ENSG00000162511 LAPTM5 94469 sc-eQTL 1.56e-01 -0.143 0.1 0.11 B_Memory L2
ENSG00000162517 PEF1 -792653 sc-eQTL 3.42e-01 -0.127 0.134 0.11 B_Memory L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 133739 sc-eQTL 9.00e-01 0.0144 0.115 0.11 B_Memory L2
ENSG00000287510 AL137857.1 120550 sc-eQTL 2.30e-04 -0.489 0.13 0.11 B_Memory L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -444545 sc-eQTL 3.80e-01 0.123 0.14 0.109 B_Naive1 L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -444739 sc-eQTL 8.53e-01 0.0225 0.121 0.109 B_Naive1 L2
ENSG00000134644 PUM1 -213748 sc-eQTL 4.73e-01 -0.0766 0.107 0.109 B_Naive1 L2
ENSG00000162510 MATN1 128658 sc-eQTL 5.81e-02 0.205 0.107 0.109 B_Naive1 L2
ENSG00000162511 LAPTM5 94469 sc-eQTL 7.70e-01 0.0212 0.0723 0.109 B_Naive1 L2
ENSG00000162517 PEF1 -792653 sc-eQTL 9.80e-01 -0.00318 0.127 0.109 B_Naive1 L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 133739 sc-eQTL 1.66e-01 0.132 0.0945 0.109 B_Naive1 L2
ENSG00000287510 AL137857.1 120550 sc-eQTL 1.21e-01 0.182 0.117 0.109 B_Naive1 L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -444545 sc-eQTL 5.14e-01 0.096 0.147 0.109 B_Naive2 L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -444739 sc-eQTL 3.22e-03 0.354 0.119 0.109 B_Naive2 L2
ENSG00000134644 PUM1 -213748 sc-eQTL 9.89e-01 -0.00165 0.119 0.109 B_Naive2 L2
ENSG00000162510 MATN1 128658 sc-eQTL 6.83e-01 -0.0466 0.114 0.109 B_Naive2 L2
ENSG00000162511 LAPTM5 94469 sc-eQTL 8.90e-01 0.0107 0.0774 0.109 B_Naive2 L2
ENSG00000162517 PEF1 -792653 sc-eQTL 9.87e-01 -0.00234 0.141 0.109 B_Naive2 L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 133739 sc-eQTL 2.92e-01 0.119 0.112 0.109 B_Naive2 L2
ENSG00000287510 AL137857.1 120550 sc-eQTL 1.51e-01 0.174 0.121 0.109 B_Naive2 L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -444545 sc-eQTL 5.51e-01 0.0869 0.145 0.111 CD4_CTL L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -444739 sc-eQTL 2.69e-01 0.158 0.143 0.111 CD4_CTL L2
ENSG00000134644 PUM1 -213748 sc-eQTL 6.31e-01 0.0675 0.14 0.111 CD4_CTL L2
ENSG00000162511 LAPTM5 94469 sc-eQTL 8.62e-01 -0.0218 0.125 0.111 CD4_CTL L2
ENSG00000162517 PEF1 -792653 sc-eQTL 5.67e-01 -0.0735 0.128 0.111 CD4_CTL L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 133739 sc-eQTL 9.89e-01 0.00186 0.137 0.111 CD4_CTL L2
ENSG00000287510 AL137857.1 120550 sc-eQTL 2.95e-01 -0.127 0.12 0.111 CD4_CTL L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -444545 sc-eQTL 2.91e-01 0.12 0.113 0.109 CD4_Naive L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -444739 sc-eQTL 7.47e-01 -0.0325 0.101 0.109 CD4_Naive L2
ENSG00000134644 PUM1 -213748 sc-eQTL 6.50e-01 -0.0365 0.0803 0.109 CD4_Naive L2
ENSG00000162511 LAPTM5 94469 sc-eQTL 4.58e-01 0.0639 0.086 0.109 CD4_Naive L2
ENSG00000162517 PEF1 -792653 sc-eQTL 5.40e-01 0.0579 0.0944 0.109 CD4_Naive L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 133739 sc-eQTL 3.55e-02 0.183 0.0865 0.109 CD4_Naive L2
ENSG00000287510 AL137857.1 120550 sc-eQTL 2.15e-01 0.124 0.1 0.109 CD4_Naive L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -444545 sc-eQTL 3.26e-01 0.141 0.143 0.109 CD4_TCM L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -444739 sc-eQTL 1.79e-01 -0.155 0.115 0.109 CD4_TCM L2
ENSG00000134644 PUM1 -213748 sc-eQTL 3.83e-02 -0.211 0.101 0.109 CD4_TCM L2
ENSG00000162511 LAPTM5 94469 sc-eQTL 6.56e-01 0.0379 0.0848 0.109 CD4_TCM L2
ENSG00000162517 PEF1 -792653 sc-eQTL 5.95e-01 0.0604 0.114 0.109 CD4_TCM L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 133739 sc-eQTL 5.72e-02 0.204 0.107 0.109 CD4_TCM L2
ENSG00000287510 AL137857.1 120550 sc-eQTL 6.00e-01 -0.063 0.12 0.109 CD4_TCM L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -444545 sc-eQTL 1.05e-01 0.229 0.141 0.109 CD4_TEM L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -444739 sc-eQTL 7.90e-01 0.0359 0.135 0.109 CD4_TEM L2
ENSG00000134644 PUM1 -213748 sc-eQTL 4.75e-01 0.0802 0.112 0.109 CD4_TEM L2
ENSG00000162511 LAPTM5 94469 sc-eQTL 7.85e-01 0.031 0.114 0.109 CD4_TEM L2
ENSG00000162517 PEF1 -792653 sc-eQTL 1.11e-01 0.202 0.126 0.109 CD4_TEM L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 133739 sc-eQTL 6.74e-01 -0.056 0.133 0.109 CD4_TEM L2
ENSG00000287510 AL137857.1 120550 sc-eQTL 1.59e-01 -0.184 0.13 0.109 CD4_TEM L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -444545 sc-eQTL 3.50e-01 0.145 0.155 0.109 CD8_CTL L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -444739 sc-eQTL 2.26e-01 0.144 0.118 0.109 CD8_CTL L2
ENSG00000134644 PUM1 -213748 sc-eQTL 3.58e-01 0.106 0.115 0.109 CD8_CTL L2
ENSG00000162511 LAPTM5 94469 sc-eQTL 1.37e-01 0.19 0.127 0.109 CD8_CTL L2
ENSG00000162517 PEF1 -792653 sc-eQTL 2.08e-01 0.14 0.111 0.109 CD8_CTL L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 133739 sc-eQTL 9.71e-01 0.00486 0.134 0.109 CD8_CTL L2
ENSG00000287510 AL137857.1 120550 sc-eQTL 4.61e-01 -0.0932 0.126 0.109 CD8_CTL L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -444545 sc-eQTL 4.44e-01 0.107 0.14 0.109 CD8_Naive L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -444739 sc-eQTL 5.26e-01 -0.0768 0.121 0.109 CD8_Naive L2
ENSG00000134644 PUM1 -213748 sc-eQTL 1.71e-01 0.133 0.0969 0.109 CD8_Naive L2
ENSG00000162511 LAPTM5 94469 sc-eQTL 9.15e-01 0.01 0.0933 0.109 CD8_Naive L2
ENSG00000162517 PEF1 -792653 sc-eQTL 5.76e-01 -0.0725 0.13 0.109 CD8_Naive L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 133739 sc-eQTL 6.47e-01 0.0534 0.116 0.109 CD8_Naive L2
ENSG00000287510 AL137857.1 120550 sc-eQTL 5.80e-01 -0.0702 0.127 0.109 CD8_Naive L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -444545 sc-eQTL 1.45e-01 0.225 0.154 0.118 CD8_TCM L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -444739 sc-eQTL 3.31e-01 -0.138 0.141 0.118 CD8_TCM L2
ENSG00000134644 PUM1 -213748 sc-eQTL 3.88e-01 -0.115 0.133 0.118 CD8_TCM L2
ENSG00000162511 LAPTM5 94469 sc-eQTL 1.87e-01 -0.184 0.139 0.118 CD8_TCM L2
ENSG00000162517 PEF1 -792653 sc-eQTL 4.28e-01 0.113 0.142 0.118 CD8_TCM L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 133739 sc-eQTL 6.51e-01 0.0585 0.129 0.118 CD8_TCM L2
ENSG00000287510 AL137857.1 120550 sc-eQTL 7.88e-01 -0.0352 0.13 0.118 CD8_TCM L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -444545 sc-eQTL 1.42e-01 0.232 0.157 0.1 CD8_TEM L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -444739 sc-eQTL 9.75e-01 0.00474 0.151 0.1 CD8_TEM L2
ENSG00000134644 PUM1 -213748 sc-eQTL 1.51e-01 -0.222 0.154 0.1 CD8_TEM L2
ENSG00000162511 LAPTM5 94469 sc-eQTL 6.27e-01 0.0708 0.145 0.1 CD8_TEM L2
ENSG00000162517 PEF1 -792653 sc-eQTL 5.18e-02 -0.265 0.136 0.1 CD8_TEM L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 133739 sc-eQTL 1.43e-01 0.221 0.15 0.1 CD8_TEM L2
ENSG00000287510 AL137857.1 120550 sc-eQTL 5.06e-01 0.0909 0.136 0.1 CD8_TEM L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -444545 sc-eQTL 5.62e-01 0.0883 0.152 0.108 MAIT L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -444739 sc-eQTL 3.41e-01 0.129 0.135 0.108 MAIT L2
ENSG00000134644 PUM1 -213748 sc-eQTL 3.62e-01 0.118 0.129 0.108 MAIT L2
ENSG00000162511 LAPTM5 94469 sc-eQTL 9.51e-01 0.00743 0.122 0.108 MAIT L2
ENSG00000162517 PEF1 -792653 sc-eQTL 3.26e-01 -0.132 0.134 0.108 MAIT L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 133739 sc-eQTL 7.41e-01 0.0449 0.136 0.108 MAIT L2
ENSG00000287510 AL137857.1 120550 sc-eQTL 8.87e-01 -0.0199 0.14 0.108 MAIT L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -444545 sc-eQTL 5.17e-02 -0.299 0.153 0.109 NK_CD56bright L2
ENSG00000121753 ADGRB2 -912650 sc-eQTL 2.42e-01 -0.141 0.12 0.109 NK_CD56bright L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -444739 sc-eQTL 7.76e-01 -0.0371 0.13 0.109 NK_CD56bright L2
ENSG00000134644 PUM1 -213748 sc-eQTL 8.84e-01 0.02 0.137 0.109 NK_CD56bright L2
ENSG00000162511 LAPTM5 94469 sc-eQTL 7.17e-01 -0.0489 0.135 0.109 NK_CD56bright L2
ENSG00000162517 PEF1 -792653 sc-eQTL 8.78e-01 -0.0201 0.131 0.109 NK_CD56bright L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 133739 sc-eQTL 1.54e-01 0.193 0.135 0.109 NK_CD56bright L2
ENSG00000287510 AL137857.1 120550 sc-eQTL 5.32e-01 0.0835 0.133 0.109 NK_CD56bright L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -444545 sc-eQTL 9.02e-01 0.0179 0.146 0.11 NK_CD56dim L2
ENSG00000121753 ADGRB2 -912650 sc-eQTL 6.39e-01 0.0602 0.128 0.11 NK_CD56dim L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -444739 sc-eQTL 7.55e-01 0.0336 0.108 0.11 NK_CD56dim L2
ENSG00000134644 PUM1 -213748 sc-eQTL 5.92e-01 0.0593 0.11 0.11 NK_CD56dim L2
ENSG00000162511 LAPTM5 94469 sc-eQTL 1.96e-01 0.152 0.117 0.11 NK_CD56dim L2
ENSG00000162517 PEF1 -792653 sc-eQTL 6.73e-01 0.0443 0.105 0.11 NK_CD56dim L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 133739 sc-eQTL 5.28e-01 -0.0931 0.147 0.11 NK_CD56dim L2
ENSG00000287510 AL137857.1 120550 sc-eQTL 6.18e-01 -0.0608 0.122 0.11 NK_CD56dim L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -444545 sc-eQTL 7.29e-01 0.0527 0.152 0.11 NK_HLA L2
ENSG00000121753 ADGRB2 -912650 sc-eQTL 8.24e-01 0.0269 0.121 0.11 NK_HLA L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -444739 sc-eQTL 2.01e-03 -0.415 0.132 0.11 NK_HLA L2
ENSG00000134644 PUM1 -213748 sc-eQTL 2.00e-01 0.169 0.132 0.11 NK_HLA L2
ENSG00000162511 LAPTM5 94469 sc-eQTL 4.00e-01 0.106 0.126 0.11 NK_HLA L2
ENSG00000162517 PEF1 -792653 sc-eQTL 3.46e-01 0.134 0.142 0.11 NK_HLA L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 133739 sc-eQTL 3.61e-01 0.123 0.134 0.11 NK_HLA L2
ENSG00000287510 AL137857.1 120550 sc-eQTL 7.79e-01 -0.0365 0.13 0.11 NK_HLA L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -444545 sc-eQTL 3.01e-03 0.415 0.138 0.11 NK_cytokine L2
ENSG00000121753 ADGRB2 -912650 sc-eQTL 5.65e-03 -0.351 0.125 0.11 NK_cytokine L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -444739 sc-eQTL 4.37e-01 0.0858 0.11 0.11 NK_cytokine L2
ENSG00000134644 PUM1 -213748 sc-eQTL 2.93e-01 0.125 0.119 0.11 NK_cytokine L2
ENSG00000162511 LAPTM5 94469 sc-eQTL 3.20e-01 0.131 0.131 0.11 NK_cytokine L2
ENSG00000162517 PEF1 -792653 sc-eQTL 9.49e-01 0.00722 0.112 0.11 NK_cytokine L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 133739 sc-eQTL 8.99e-01 -0.0177 0.139 0.11 NK_cytokine L2
ENSG00000287510 AL137857.1 120550 sc-eQTL 4.99e-01 0.0876 0.129 0.11 NK_cytokine L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -444545 sc-eQTL 8.12e-01 -0.0409 0.171 0.093 PB L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -444739 sc-eQTL 7.31e-01 0.0685 0.198 0.093 PB L2
ENSG00000134644 PUM1 -213748 sc-eQTL 5.44e-01 0.105 0.172 0.093 PB L2
ENSG00000162510 MATN1 128658 sc-eQTL 6.71e-01 0.0685 0.161 0.093 PB L2
ENSG00000162511 LAPTM5 94469 sc-eQTL 8.78e-01 0.0177 0.115 0.093 PB L2
ENSG00000162517 PEF1 -792653 sc-eQTL 8.40e-01 -0.0357 0.177 0.093 PB L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 133739 sc-eQTL 7.58e-01 -0.0485 0.157 0.093 PB L2
ENSG00000287510 AL137857.1 120550 sc-eQTL 8.87e-01 -0.0238 0.167 0.093 PB L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -444545 sc-eQTL 1.12e-01 0.173 0.108 0.111 Pro_T L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -444739 sc-eQTL 7.19e-01 -0.0499 0.138 0.111 Pro_T L2
ENSG00000134644 PUM1 -213748 sc-eQTL 2.56e-01 0.147 0.129 0.111 Pro_T L2
ENSG00000162511 LAPTM5 94469 sc-eQTL 5.31e-02 0.179 0.0918 0.111 Pro_T L2
ENSG00000162517 PEF1 -792653 sc-eQTL 6.34e-01 0.0648 0.136 0.111 Pro_T L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 133739 sc-eQTL 7.78e-02 0.228 0.129 0.111 Pro_T L2
ENSG00000287510 AL137857.1 120550 sc-eQTL 5.49e-01 0.0715 0.119 0.111 Pro_T L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -444545 sc-eQTL 7.39e-01 0.0486 0.146 0.109 Treg L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -444739 sc-eQTL 5.94e-01 0.0752 0.141 0.109 Treg L2
ENSG00000134644 PUM1 -213748 sc-eQTL 3.24e-01 -0.111 0.113 0.109 Treg L2
ENSG00000162511 LAPTM5 94469 sc-eQTL 5.24e-01 0.0823 0.129 0.109 Treg L2
ENSG00000162517 PEF1 -792653 sc-eQTL 2.58e-01 -0.158 0.139 0.109 Treg L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 133739 sc-eQTL 9.70e-02 0.218 0.131 0.109 Treg L2
ENSG00000287510 AL137857.1 120550 sc-eQTL 7.24e-01 0.0465 0.131 0.109 Treg L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -444545 sc-eQTL 5.51e-01 0.0887 0.148 0.107 cDC L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -444739 sc-eQTL 9.31e-01 -0.0139 0.161 0.107 cDC L2
ENSG00000134644 PUM1 -213748 sc-eQTL 8.10e-01 -0.0333 0.138 0.107 cDC L2
ENSG00000162511 LAPTM5 94469 sc-eQTL 1.24e-01 -0.149 0.0961 0.107 cDC L2
ENSG00000162517 PEF1 -792653 sc-eQTL 8.42e-01 0.028 0.14 0.107 cDC L2
ENSG00000168528 SERINC2 -557322 sc-eQTL 4.51e-01 0.0937 0.124 0.107 cDC L2
ENSG00000284543 LINC01226 -653983 sc-eQTL 9.84e-01 0.0024 0.122 0.107 cDC L2
ENSG00000287510 AL137857.1 120550 sc-eQTL 5.54e-01 0.0778 0.131 0.107 cDC L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -444545 sc-eQTL 6.01e-01 -0.0617 0.118 0.109 cMono_IL1B L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -444739 sc-eQTL 1.50e-01 -0.189 0.131 0.109 cMono_IL1B L2
ENSG00000134644 PUM1 -213748 sc-eQTL 8.07e-01 -0.0217 0.0889 0.109 cMono_IL1B L2
ENSG00000162511 LAPTM5 94469 sc-eQTL 8.25e-01 -0.0173 0.0781 0.109 cMono_IL1B L2
ENSG00000162512 SDC3 -56515 sc-eQTL 3.56e-02 0.308 0.146 0.109 cMono_IL1B L2
ENSG00000162517 PEF1 -792653 sc-eQTL 9.67e-01 0.00501 0.12 0.109 cMono_IL1B L2
ENSG00000168528 SERINC2 -557322 sc-eQTL 7.22e-01 -0.053 0.149 0.109 cMono_IL1B L2
ENSG00000284543 LINC01226 -653983 sc-eQTL 6.79e-01 0.0544 0.132 0.109 cMono_IL1B L2
ENSG00000287510 AL137857.1 120550 sc-eQTL 8.99e-01 -0.0156 0.123 0.109 cMono_IL1B L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -444545 sc-eQTL 9.93e-01 0.00114 0.123 0.109 cMono_S100A L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -444739 sc-eQTL 9.51e-02 -0.242 0.144 0.109 cMono_S100A L2
ENSG00000134644 PUM1 -213748 sc-eQTL 3.32e-01 -0.102 0.105 0.109 cMono_S100A L2
ENSG00000162511 LAPTM5 94469 sc-eQTL 7.21e-01 -0.0288 0.0806 0.109 cMono_S100A L2
ENSG00000162512 SDC3 -56515 sc-eQTL 6.77e-01 0.0581 0.139 0.109 cMono_S100A L2
ENSG00000162517 PEF1 -792653 sc-eQTL 8.87e-01 0.0179 0.126 0.109 cMono_S100A L2
ENSG00000168528 SERINC2 -557322 sc-eQTL 4.53e-01 -0.111 0.147 0.109 cMono_S100A L2
ENSG00000284543 LINC01226 -653983 sc-eQTL 4.13e-01 -0.0981 0.12 0.109 cMono_S100A L2
ENSG00000287510 AL137857.1 120550 sc-eQTL 5.66e-01 0.069 0.12 0.109 cMono_S100A L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -444545 sc-eQTL 7.77e-01 -0.0521 0.184 0.109 gdT L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -444739 sc-eQTL 6.11e-02 -0.294 0.156 0.109 gdT L2
ENSG00000134644 PUM1 -213748 sc-eQTL 8.01e-01 0.0411 0.163 0.109 gdT L2
ENSG00000162511 LAPTM5 94469 sc-eQTL 3.08e-01 0.18 0.176 0.109 gdT L2
ENSG00000162517 PEF1 -792653 sc-eQTL 1.36e-02 -0.396 0.158 0.109 gdT L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 133739 sc-eQTL 9.29e-01 0.0146 0.163 0.109 gdT L2
ENSG00000287510 AL137857.1 120550 sc-eQTL 1.28e-01 0.24 0.157 0.109 gdT L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -444545 sc-eQTL 2.91e-01 0.145 0.137 0.109 intMono L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -444739 sc-eQTL 2.34e-01 -0.175 0.147 0.109 intMono L2
ENSG00000134644 PUM1 -213748 sc-eQTL 4.16e-01 -0.102 0.125 0.109 intMono L2
ENSG00000162511 LAPTM5 94469 sc-eQTL 3.99e-01 0.0828 0.0979 0.109 intMono L2
ENSG00000162512 SDC3 -56515 sc-eQTL 6.47e-01 -0.0616 0.134 0.109 intMono L2
ENSG00000162517 PEF1 -792653 sc-eQTL 8.35e-01 -0.0294 0.141 0.109 intMono L2
ENSG00000168528 SERINC2 -557322 sc-eQTL 9.63e-01 0.00648 0.141 0.109 intMono L2
ENSG00000284543 LINC01226 -653983 sc-eQTL 4.73e-01 -0.0958 0.133 0.109 intMono L2
ENSG00000287510 AL137857.1 120550 sc-eQTL 3.00e-01 0.138 0.133 0.109 intMono L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -444545 sc-eQTL 3.19e-01 0.131 0.131 0.106 ncMono L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -444739 sc-eQTL 6.24e-01 -0.0685 0.14 0.106 ncMono L2
ENSG00000134644 PUM1 -213748 sc-eQTL 3.98e-01 -0.0965 0.114 0.106 ncMono L2
ENSG00000162511 LAPTM5 94469 sc-eQTL 9.43e-01 0.00743 0.104 0.106 ncMono L2
ENSG00000162512 SDC3 -56515 sc-eQTL 8.97e-01 0.0151 0.116 0.106 ncMono L2
ENSG00000162517 PEF1 -792653 sc-eQTL 5.95e-01 0.0709 0.133 0.106 ncMono L2
ENSG00000168528 SERINC2 -557322 sc-eQTL 4.45e-01 0.097 0.127 0.106 ncMono L2
ENSG00000284543 LINC01226 -653983 sc-eQTL 6.02e-01 -0.0663 0.127 0.106 ncMono L2
ENSG00000287510 AL137857.1 120550 sc-eQTL 3.89e-01 0.113 0.131 0.106 ncMono L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -444545 sc-eQTL 4.01e-01 -0.124 0.148 0.105 pDC L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -444739 sc-eQTL 3.77e-02 0.336 0.16 0.105 pDC L2
ENSG00000134644 PUM1 -213748 sc-eQTL 6.77e-01 -0.0563 0.135 0.105 pDC L2
ENSG00000162511 LAPTM5 94469 sc-eQTL 5.39e-01 -0.0771 0.125 0.105 pDC L2
ENSG00000162517 PEF1 -792653 sc-eQTL 3.69e-01 0.146 0.162 0.105 pDC L2
ENSG00000168528 SERINC2 -557322 sc-eQTL 2.15e-02 -0.347 0.149 0.105 pDC L2
ENSG00000284543 LINC01226 -653983 sc-eQTL 2.51e-01 -0.135 0.117 0.105 pDC L2
ENSG00000287510 AL137857.1 120550 sc-eQTL 8.88e-02 -0.235 0.137 0.105 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000060688 SNRNP40 -444545 sc-eQTL 9.93e-01 -0.00129 0.147 0.109 B_Memory LOneK1K
ENSG00000121766 ZCCHC17 -444739 sc-eQTL 5.66e-01 -0.0704 0.122 0.109 B_Memory LOneK1K
ENSG00000134644 PUM1 -213748 sc-eQTL 1.33e-01 -0.163 0.108 0.109 B_Memory LOneK1K
ENSG00000162510 MATN1 128658 sc-eQTL 5.83e-01 0.0679 0.124 0.109 B_Memory LOneK1K
ENSG00000162511 LAPTM5 94469 sc-eQTL 1.24e-01 -0.119 0.0773 0.109 B_Memory LOneK1K
ENSG00000162517 PEF1 -792653 sc-eQTL 8.58e-01 -0.0231 0.129 0.109 B_Memory LOneK1K
ENSG00000186056 MATN1-AS1 133739 sc-eQTL 8.07e-01 -0.0251 0.103 0.109 B_Memory LOneK1K
ENSG00000287510 AL137857.1 120550 sc-eQTL 1.52e-02 -0.27 0.111 0.109 B_Memory LOneK1K
ENSG00000060688 SNRNP40 -444545 sc-eQTL 4.92e-01 0.0936 0.136 0.109 B_Naive LOneK1K
ENSG00000121766 ZCCHC17 -444739 sc-eQTL 3.09e-02 0.231 0.106 0.109 B_Naive LOneK1K
ENSG00000134644 PUM1 -213748 sc-eQTL 8.68e-01 -0.0169 0.102 0.109 B_Naive LOneK1K
ENSG00000162510 MATN1 128658 sc-eQTL 9.00e-02 0.166 0.0974 0.109 B_Naive LOneK1K
ENSG00000162511 LAPTM5 94469 sc-eQTL 9.21e-01 0.00686 0.069 0.109 B_Naive LOneK1K
ENSG00000162517 PEF1 -792653 sc-eQTL 7.97e-01 -0.0324 0.126 0.109 B_Naive LOneK1K
ENSG00000186056 MATN1-AS1 133739 sc-eQTL 1.57e-01 0.126 0.0887 0.109 B_Naive LOneK1K
ENSG00000287510 AL137857.1 120550 sc-eQTL 2.97e-02 0.229 0.105 0.109 B_Naive LOneK1K
ENSG00000060688 SNRNP40 -444545 sc-eQTL 7.43e-01 0.0365 0.111 0.109 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000121766 ZCCHC17 -444739 sc-eQTL 6.02e-02 -0.236 0.125 0.109 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000134644 PUM1 -213748 sc-eQTL 4.73e-01 -0.0577 0.0802 0.109 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000162511 LAPTM5 94469 sc-eQTL 9.02e-01 0.00874 0.0706 0.109 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000162512 SDC3 -56515 sc-eQTL 1.19e-01 0.224 0.143 0.109 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000162517 PEF1 -792653 sc-eQTL 9.53e-01 0.00592 0.101 0.109 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000168528 SERINC2 -557322 sc-eQTL 6.03e-01 -0.0771 0.148 0.109 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000284543 LINC01226 -653983 sc-eQTL 7.93e-01 0.0319 0.121 0.109 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000287510 AL137857.1 120550 sc-eQTL 9.69e-01 0.00441 0.114 0.109 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000060688 SNRNP40 -444545 sc-eQTL 1.30e-01 0.187 0.123 0.108 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000121766 ZCCHC17 -444739 sc-eQTL 1.19e-01 -0.21 0.134 0.108 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000134644 PUM1 -213748 sc-eQTL 2.47e-01 -0.128 0.11 0.108 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000162511 LAPTM5 94469 sc-eQTL 8.09e-01 -0.0214 0.0884 0.108 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000162512 SDC3 -56515 sc-eQTL 9.16e-01 -0.0136 0.129 0.108 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000162517 PEF1 -792653 sc-eQTL 6.91e-01 0.0467 0.117 0.108 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000168528 SERINC2 -557322 sc-eQTL 7.41e-01 0.0443 0.134 0.108 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000284543 LINC01226 -653983 sc-eQTL 6.10e-01 -0.0648 0.127 0.108 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000287510 AL137857.1 120550 sc-eQTL 3.84e-01 0.111 0.127 0.108 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000060688 SNRNP40 -444545 sc-eQTL 1.33e-01 0.207 0.137 0.11 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000121753 ADGRB2 -912650 sc-eQTL 4.90e-01 -0.0811 0.117 0.11 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000121766 ZCCHC17 -444739 sc-eQTL 8.91e-01 0.0129 0.0943 0.11 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000134644 PUM1 -213748 sc-eQTL 1.88e-01 0.136 0.103 0.11 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000162511 LAPTM5 94469 sc-eQTL 1.57e-01 0.163 0.115 0.11 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000162517 PEF1 -792653 sc-eQTL 7.00e-01 0.0338 0.0877 0.11 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000186056 MATN1-AS1 133739 sc-eQTL 9.43e-01 0.00958 0.133 0.11 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000287510 AL137857.1 120550 sc-eQTL 7.88e-01 0.0309 0.115 0.11 NK_CD56dim LOneK1K

Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF
ENSG00000162510 MATN1 128658 eQTL 0.0471 -0.0548 0.0276 0.0 0.0 0.139
ENSG00000284543 LINC01226 -654038 eQTL 0.0431 0.0901 0.0445 0.0 0.0 0.139

Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina