logo

Genes within 1Mb (chr1:30849988:C:T):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD

Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000060688 SNRNP40 -446800 sc-eQTL 4.96e-01 0.0836 0.123 0.105 B L1
ENSG00000121766 ZCCHC17 -446994 sc-eQTL 3.76e-01 -0.0872 0.0982 0.105 B L1
ENSG00000134644 PUM1 -216003 sc-eQTL 4.74e-01 -0.0592 0.0825 0.105 B L1
ENSG00000162510 MATN1 126403 sc-eQTL 4.98e-01 -0.0589 0.0867 0.105 B L1
ENSG00000162511 LAPTM5 92214 sc-eQTL 5.01e-01 -0.0457 0.0679 0.105 B L1
ENSG00000162517 PEF1 -794908 sc-eQTL 8.32e-01 -0.0218 0.103 0.105 B L1
ENSG00000186056 MATN1-AS1 131484 sc-eQTL 4.17e-01 0.0647 0.0795 0.105 B L1
ENSG00000287510 AL137857.1 118295 sc-eQTL 8.12e-01 0.0225 0.0943 0.105 B L1
ENSG00000060688 SNRNP40 -446800 sc-eQTL 7.98e-01 0.0267 0.104 0.105 CD4T L1
ENSG00000121766 ZCCHC17 -446994 sc-eQTL 4.68e-01 -0.0591 0.0813 0.105 CD4T L1
ENSG00000134644 PUM1 -216003 sc-eQTL 8.80e-01 -0.011 0.0725 0.105 CD4T L1
ENSG00000162511 LAPTM5 92214 sc-eQTL 8.58e-01 -0.0144 0.0803 0.105 CD4T L1
ENSG00000162517 PEF1 -794908 sc-eQTL 2.13e-01 -0.105 0.0837 0.105 CD4T L1
ENSG00000186056 MATN1-AS1 131484 sc-eQTL 4.81e-01 -0.0506 0.0718 0.105 CD4T L1
ENSG00000287510 AL137857.1 118295 sc-eQTL 5.22e-02 -0.167 0.0853 0.105 CD4T L1
ENSG00000060688 SNRNP40 -446800 sc-eQTL 2.29e-01 0.165 0.136 0.105 CD8T L1
ENSG00000121766 ZCCHC17 -446994 sc-eQTL 1.74e-01 0.124 0.0907 0.105 CD8T L1
ENSG00000134644 PUM1 -216003 sc-eQTL 1.21e-01 -0.124 0.0797 0.105 CD8T L1
ENSG00000162511 LAPTM5 92214 sc-eQTL 7.64e-01 -0.0234 0.0779 0.105 CD8T L1
ENSG00000162517 PEF1 -794908 sc-eQTL 6.42e-01 0.0446 0.0959 0.105 CD8T L1
ENSG00000186056 MATN1-AS1 131484 sc-eQTL 4.05e-01 -0.076 0.0911 0.105 CD8T L1
ENSG00000287510 AL137857.1 118295 sc-eQTL 5.42e-01 -0.07 0.115 0.105 CD8T L1
ENSG00000060688 SNRNP40 -446800 sc-eQTL 8.15e-01 0.0287 0.122 0.104 DC L1
ENSG00000121766 ZCCHC17 -446994 sc-eQTL 5.73e-01 -0.0818 0.145 0.104 DC L1
ENSG00000134644 PUM1 -216003 sc-eQTL 1.35e-01 -0.17 0.113 0.104 DC L1
ENSG00000162511 LAPTM5 92214 sc-eQTL 9.85e-01 0.00156 0.0811 0.104 DC L1
ENSG00000162517 PEF1 -794908 sc-eQTL 1.42e-02 -0.32 0.13 0.104 DC L1
ENSG00000168528 SERINC2 -559577 sc-eQTL 8.36e-01 0.0277 0.134 0.104 DC L1
ENSG00000284543 LINC01226 -656238 sc-eQTL 2.20e-01 0.109 0.0883 0.104 DC L1
ENSG00000287510 AL137857.1 118295 sc-eQTL 2.15e-02 -0.293 0.127 0.104 DC L1
ENSG00000060688 SNRNP40 -446800 sc-eQTL 3.82e-01 -0.0838 0.0956 0.105 Mono L1
ENSG00000121766 ZCCHC17 -446994 sc-eQTL 3.30e-02 0.252 0.117 0.105 Mono L1
ENSG00000134644 PUM1 -216003 sc-eQTL 7.85e-01 0.0208 0.0761 0.105 Mono L1
ENSG00000162511 LAPTM5 92214 sc-eQTL 6.62e-02 0.128 0.0695 0.105 Mono L1
ENSG00000162512 SDC3 -58770 sc-eQTL 1.21e-02 0.336 0.133 0.105 Mono L1
ENSG00000162517 PEF1 -794908 sc-eQTL 9.70e-01 -0.00358 0.0944 0.105 Mono L1
ENSG00000168528 SERINC2 -559577 sc-eQTL 3.45e-02 -0.304 0.143 0.105 Mono L1
ENSG00000284543 LINC01226 -656238 sc-eQTL 3.07e-01 0.13 0.127 0.105 Mono L1
ENSG00000287510 AL137857.1 118295 sc-eQTL 5.18e-01 0.0718 0.111 0.105 Mono L1
ENSG00000060688 SNRNP40 -446800 sc-eQTL 9.79e-01 -0.00341 0.132 0.105 NK L1
ENSG00000121753 ADGRB2 -914905 sc-eQTL 2.68e-01 -0.126 0.113 0.105 NK L1
ENSG00000121766 ZCCHC17 -446994 sc-eQTL 5.12e-01 -0.0592 0.0901 0.105 NK L1
ENSG00000134644 PUM1 -216003 sc-eQTL 2.04e-01 -0.12 0.0942 0.105 NK L1
ENSG00000162511 LAPTM5 92214 sc-eQTL 8.30e-02 -0.188 0.108 0.105 NK L1
ENSG00000162517 PEF1 -794908 sc-eQTL 3.82e-01 -0.0695 0.0793 0.105 NK L1
ENSG00000186056 MATN1-AS1 131484 sc-eQTL 8.23e-01 -0.0273 0.122 0.105 NK L1
ENSG00000287510 AL137857.1 118295 sc-eQTL 2.77e-01 -0.123 0.113 0.105 NK L1
ENSG00000060688 SNRNP40 -446800 sc-eQTL 2.55e-01 0.113 0.0986 0.105 Other_T L1
ENSG00000121766 ZCCHC17 -446994 sc-eQTL 5.00e-01 0.0714 0.106 0.105 Other_T L1
ENSG00000134644 PUM1 -216003 sc-eQTL 5.85e-02 0.179 0.0943 0.105 Other_T L1
ENSG00000162511 LAPTM5 92214 sc-eQTL 2.52e-01 0.0892 0.0777 0.105 Other_T L1
ENSG00000162517 PEF1 -794908 sc-eQTL 1.12e-01 0.165 0.103 0.105 Other_T L1
ENSG00000186056 MATN1-AS1 131484 sc-eQTL 7.26e-01 -0.0447 0.128 0.105 Other_T L1
ENSG00000287510 AL137857.1 118295 sc-eQTL 9.05e-01 -0.0159 0.133 0.105 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000060688 SNRNP40 -446800 sc-eQTL 6.86e-01 0.0629 0.155 0.11 B_Activated L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -446994 sc-eQTL 6.96e-01 -0.0612 0.157 0.11 B_Activated L2
ENSG00000134644 PUM1 -216003 sc-eQTL 2.96e-01 0.152 0.145 0.11 B_Activated L2
ENSG00000162510 MATN1 126403 sc-eQTL 8.43e-01 -0.0252 0.127 0.11 B_Activated L2
ENSG00000162511 LAPTM5 92214 sc-eQTL 7.62e-01 0.0269 0.0887 0.11 B_Activated L2
ENSG00000162517 PEF1 -794908 sc-eQTL 3.71e-01 -0.135 0.151 0.11 B_Activated L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 131484 sc-eQTL 8.51e-01 0.027 0.143 0.11 B_Activated L2
ENSG00000287510 AL137857.1 118295 sc-eQTL 1.84e-01 -0.168 0.126 0.11 B_Activated L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -446800 sc-eQTL 9.77e-01 0.00435 0.153 0.105 B_Intermediate L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -446994 sc-eQTL 3.25e-01 -0.126 0.127 0.105 B_Intermediate L2
ENSG00000134644 PUM1 -216003 sc-eQTL 2.71e-01 -0.133 0.12 0.105 B_Intermediate L2
ENSG00000162510 MATN1 126403 sc-eQTL 9.18e-01 -0.0129 0.125 0.105 B_Intermediate L2
ENSG00000162511 LAPTM5 92214 sc-eQTL 9.79e-01 0.00206 0.077 0.105 B_Intermediate L2
ENSG00000162517 PEF1 -794908 sc-eQTL 3.72e-01 0.128 0.143 0.105 B_Intermediate L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 131484 sc-eQTL 8.89e-01 -0.0151 0.108 0.105 B_Intermediate L2
ENSG00000287510 AL137857.1 118295 sc-eQTL 9.75e-01 0.00384 0.121 0.105 B_Intermediate L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -446800 sc-eQTL 5.22e-01 0.0939 0.147 0.103 B_Memory L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -446994 sc-eQTL 2.87e-01 -0.144 0.135 0.103 B_Memory L2
ENSG00000134644 PUM1 -216003 sc-eQTL 9.88e-02 0.194 0.117 0.103 B_Memory L2
ENSG00000162510 MATN1 126403 sc-eQTL 2.58e-01 0.127 0.112 0.103 B_Memory L2
ENSG00000162511 LAPTM5 92214 sc-eQTL 9.89e-01 -0.00137 0.0997 0.103 B_Memory L2
ENSG00000162517 PEF1 -794908 sc-eQTL 8.72e-01 -0.0215 0.133 0.103 B_Memory L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 131484 sc-eQTL 6.20e-01 0.0567 0.114 0.103 B_Memory L2
ENSG00000287510 AL137857.1 118295 sc-eQTL 8.12e-01 0.0319 0.134 0.103 B_Memory L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -446800 sc-eQTL 8.59e-01 0.0241 0.135 0.105 B_Naive1 L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -446994 sc-eQTL 1.24e-01 -0.179 0.116 0.105 B_Naive1 L2
ENSG00000134644 PUM1 -216003 sc-eQTL 3.60e-01 -0.094 0.103 0.105 B_Naive1 L2
ENSG00000162510 MATN1 126403 sc-eQTL 8.75e-01 0.0164 0.104 0.105 B_Naive1 L2
ENSG00000162511 LAPTM5 92214 sc-eQTL 3.25e-01 -0.0686 0.0695 0.105 B_Naive1 L2
ENSG00000162517 PEF1 -794908 sc-eQTL 9.52e-01 -0.00736 0.123 0.105 B_Naive1 L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 131484 sc-eQTL 1.34e-01 0.137 0.091 0.105 B_Naive1 L2
ENSG00000287510 AL137857.1 118295 sc-eQTL 8.26e-01 0.0249 0.113 0.105 B_Naive1 L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -446800 sc-eQTL 5.07e-01 -0.094 0.142 0.103 B_Naive2 L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -446994 sc-eQTL 6.47e-01 0.0537 0.117 0.103 B_Naive2 L2
ENSG00000134644 PUM1 -216003 sc-eQTL 9.60e-01 -0.00582 0.114 0.103 B_Naive2 L2
ENSG00000162510 MATN1 126403 sc-eQTL 5.41e-01 -0.0672 0.11 0.103 B_Naive2 L2
ENSG00000162511 LAPTM5 92214 sc-eQTL 9.30e-01 -0.00661 0.0746 0.103 B_Naive2 L2
ENSG00000162517 PEF1 -794908 sc-eQTL 8.58e-01 0.0243 0.136 0.103 B_Naive2 L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 131484 sc-eQTL 7.78e-01 0.0307 0.109 0.103 B_Naive2 L2
ENSG00000287510 AL137857.1 118295 sc-eQTL 1.07e-01 0.189 0.117 0.103 B_Naive2 L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -446800 sc-eQTL 2.89e-01 -0.15 0.141 0.102 CD4_CTL L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -446994 sc-eQTL 9.28e-01 0.0127 0.139 0.102 CD4_CTL L2
ENSG00000134644 PUM1 -216003 sc-eQTL 2.79e-01 -0.147 0.136 0.102 CD4_CTL L2
ENSG00000162511 LAPTM5 92214 sc-eQTL 6.83e-01 -0.0497 0.122 0.102 CD4_CTL L2
ENSG00000162517 PEF1 -794908 sc-eQTL 4.46e-01 -0.095 0.124 0.102 CD4_CTL L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 131484 sc-eQTL 5.29e-01 -0.0838 0.133 0.102 CD4_CTL L2
ENSG00000287510 AL137857.1 118295 sc-eQTL 8.23e-01 0.0263 0.117 0.102 CD4_CTL L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -446800 sc-eQTL 7.33e-01 0.0371 0.109 0.105 CD4_Naive L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -446994 sc-eQTL 9.05e-01 0.0115 0.0964 0.105 CD4_Naive L2
ENSG00000134644 PUM1 -216003 sc-eQTL 7.01e-01 -0.0296 0.0769 0.105 CD4_Naive L2
ENSG00000162511 LAPTM5 92214 sc-eQTL 7.65e-01 0.0247 0.0824 0.105 CD4_Naive L2
ENSG00000162517 PEF1 -794908 sc-eQTL 2.85e-01 -0.0966 0.0902 0.105 CD4_Naive L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 131484 sc-eQTL 6.81e-01 -0.0344 0.0836 0.105 CD4_Naive L2
ENSG00000287510 AL137857.1 118295 sc-eQTL 5.07e-01 -0.0638 0.096 0.105 CD4_Naive L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -446800 sc-eQTL 6.26e-01 0.0673 0.138 0.105 CD4_TCM L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -446994 sc-eQTL 9.68e-01 0.00453 0.111 0.105 CD4_TCM L2
ENSG00000134644 PUM1 -216003 sc-eQTL 4.43e-01 0.0755 0.0982 0.105 CD4_TCM L2
ENSG00000162511 LAPTM5 92214 sc-eQTL 2.33e-01 -0.0973 0.0813 0.105 CD4_TCM L2
ENSG00000162517 PEF1 -794908 sc-eQTL 5.14e-01 -0.0715 0.109 0.105 CD4_TCM L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 131484 sc-eQTL 5.26e-01 -0.0657 0.103 0.105 CD4_TCM L2
ENSG00000287510 AL137857.1 118295 sc-eQTL 1.80e-01 -0.154 0.115 0.105 CD4_TCM L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -446800 sc-eQTL 5.38e-01 -0.085 0.138 0.105 CD4_TEM L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -446994 sc-eQTL 9.05e-01 -0.0157 0.131 0.105 CD4_TEM L2
ENSG00000134644 PUM1 -216003 sc-eQTL 6.54e-01 -0.0491 0.109 0.105 CD4_TEM L2
ENSG00000162511 LAPTM5 92214 sc-eQTL 7.47e-01 -0.0358 0.111 0.105 CD4_TEM L2
ENSG00000162517 PEF1 -794908 sc-eQTL 1.12e-01 -0.197 0.123 0.105 CD4_TEM L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 131484 sc-eQTL 5.31e-01 -0.0812 0.129 0.105 CD4_TEM L2
ENSG00000287510 AL137857.1 118295 sc-eQTL 2.57e-01 0.145 0.127 0.105 CD4_TEM L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -446800 sc-eQTL 9.69e-01 -0.00591 0.15 0.105 CD8_CTL L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -446994 sc-eQTL 2.59e-01 0.13 0.115 0.105 CD8_CTL L2
ENSG00000134644 PUM1 -216003 sc-eQTL 2.52e-01 -0.128 0.112 0.105 CD8_CTL L2
ENSG00000162511 LAPTM5 92214 sc-eQTL 9.24e-01 0.0119 0.124 0.105 CD8_CTL L2
ENSG00000162517 PEF1 -794908 sc-eQTL 5.39e-01 -0.0664 0.108 0.105 CD8_CTL L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 131484 sc-eQTL 5.48e-01 -0.0784 0.13 0.105 CD8_CTL L2
ENSG00000287510 AL137857.1 118295 sc-eQTL 4.15e-01 -0.0999 0.122 0.105 CD8_CTL L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -446800 sc-eQTL 3.52e-02 0.29 0.137 0.105 CD8_Naive L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -446994 sc-eQTL 9.64e-01 0.00537 0.119 0.105 CD8_Naive L2
ENSG00000134644 PUM1 -216003 sc-eQTL 7.74e-02 -0.169 0.0952 0.105 CD8_Naive L2
ENSG00000162511 LAPTM5 92214 sc-eQTL 5.36e-01 0.0569 0.0918 0.105 CD8_Naive L2
ENSG00000162517 PEF1 -794908 sc-eQTL 4.83e-01 0.0897 0.128 0.105 CD8_Naive L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 131484 sc-eQTL 7.59e-01 -0.0352 0.115 0.105 CD8_Naive L2
ENSG00000287510 AL137857.1 118295 sc-eQTL 1.21e-01 -0.193 0.124 0.105 CD8_Naive L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -446800 sc-eQTL 5.78e-01 -0.0873 0.157 0.1 CD8_TCM L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -446994 sc-eQTL 2.24e-01 0.175 0.143 0.1 CD8_TCM L2
ENSG00000134644 PUM1 -216003 sc-eQTL 8.98e-01 -0.0173 0.135 0.1 CD8_TCM L2
ENSG00000162511 LAPTM5 92214 sc-eQTL 1.92e-01 0.185 0.141 0.1 CD8_TCM L2
ENSG00000162517 PEF1 -794908 sc-eQTL 5.86e-01 0.0789 0.145 0.1 CD8_TCM L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 131484 sc-eQTL 9.80e-01 -0.00328 0.131 0.1 CD8_TCM L2
ENSG00000287510 AL137857.1 118295 sc-eQTL 5.28e-01 0.0837 0.132 0.1 CD8_TCM L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -446800 sc-eQTL 7.03e-02 -0.259 0.143 0.107 CD8_TEM L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -446994 sc-eQTL 9.08e-01 0.0159 0.138 0.107 CD8_TEM L2
ENSG00000134644 PUM1 -216003 sc-eQTL 8.69e-01 0.0232 0.141 0.107 CD8_TEM L2
ENSG00000162511 LAPTM5 92214 sc-eQTL 1.10e-01 -0.211 0.132 0.107 CD8_TEM L2
ENSG00000162517 PEF1 -794908 sc-eQTL 9.86e-01 0.00218 0.125 0.107 CD8_TEM L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 131484 sc-eQTL 3.38e-01 0.132 0.137 0.107 CD8_TEM L2
ENSG00000287510 AL137857.1 118295 sc-eQTL 2.37e-01 -0.147 0.124 0.107 CD8_TEM L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -446800 sc-eQTL 2.21e-01 0.18 0.147 0.104 MAIT L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -446994 sc-eQTL 1.84e-01 0.173 0.13 0.104 MAIT L2
ENSG00000134644 PUM1 -216003 sc-eQTL 2.55e-01 0.142 0.125 0.104 MAIT L2
ENSG00000162511 LAPTM5 92214 sc-eQTL 3.67e-01 0.106 0.118 0.104 MAIT L2
ENSG00000162517 PEF1 -794908 sc-eQTL 4.52e-01 0.0974 0.129 0.104 MAIT L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 131484 sc-eQTL 4.23e-01 -0.105 0.131 0.104 MAIT L2
ENSG00000287510 AL137857.1 118295 sc-eQTL 8.38e-01 -0.0277 0.135 0.104 MAIT L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -446800 sc-eQTL 9.13e-01 -0.016 0.147 0.107 NK_CD56bright L2
ENSG00000121753 ADGRB2 -914905 sc-eQTL 2.44e-01 -0.134 0.115 0.107 NK_CD56bright L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -446994 sc-eQTL 4.32e-01 0.0978 0.124 0.107 NK_CD56bright L2
ENSG00000134644 PUM1 -216003 sc-eQTL 5.77e-01 0.073 0.131 0.107 NK_CD56bright L2
ENSG00000162511 LAPTM5 92214 sc-eQTL 2.66e-01 -0.143 0.128 0.107 NK_CD56bright L2
ENSG00000162517 PEF1 -794908 sc-eQTL 6.63e-01 -0.0547 0.125 0.107 NK_CD56bright L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 131484 sc-eQTL 5.28e-01 0.0819 0.129 0.107 NK_CD56bright L2
ENSG00000287510 AL137857.1 118295 sc-eQTL 4.80e-02 -0.251 0.126 0.107 NK_CD56bright L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -446800 sc-eQTL 8.86e-01 0.0199 0.139 0.103 NK_CD56dim L2
ENSG00000121753 ADGRB2 -914905 sc-eQTL 4.38e-02 -0.246 0.121 0.103 NK_CD56dim L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -446994 sc-eQTL 7.30e-01 -0.0356 0.103 0.103 NK_CD56dim L2
ENSG00000134644 PUM1 -216003 sc-eQTL 3.08e-01 -0.108 0.105 0.103 NK_CD56dim L2
ENSG00000162511 LAPTM5 92214 sc-eQTL 7.24e-02 -0.202 0.112 0.103 NK_CD56dim L2
ENSG00000162517 PEF1 -794908 sc-eQTL 5.43e-01 -0.061 0.1 0.103 NK_CD56dim L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 131484 sc-eQTL 8.41e-01 0.0284 0.141 0.103 NK_CD56dim L2
ENSG00000287510 AL137857.1 118295 sc-eQTL 2.90e-01 -0.123 0.116 0.103 NK_CD56dim L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -446800 sc-eQTL 4.69e-01 0.106 0.146 0.103 NK_HLA L2
ENSG00000121753 ADGRB2 -914905 sc-eQTL 7.55e-01 -0.0364 0.116 0.103 NK_HLA L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -446994 sc-eQTL 6.94e-01 0.0516 0.131 0.103 NK_HLA L2
ENSG00000134644 PUM1 -216003 sc-eQTL 6.58e-01 0.0564 0.127 0.103 NK_HLA L2
ENSG00000162511 LAPTM5 92214 sc-eQTL 4.13e-02 -0.247 0.12 0.103 NK_HLA L2
ENSG00000162517 PEF1 -794908 sc-eQTL 4.03e-01 0.115 0.137 0.103 NK_HLA L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 131484 sc-eQTL 7.17e-01 -0.047 0.129 0.103 NK_HLA L2
ENSG00000287510 AL137857.1 118295 sc-eQTL 5.79e-01 -0.0695 0.125 0.103 NK_HLA L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -446800 sc-eQTL 9.19e-01 -0.0137 0.135 0.103 NK_cytokine L2
ENSG00000121753 ADGRB2 -914905 sc-eQTL 9.78e-01 -0.00342 0.122 0.103 NK_cytokine L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -446994 sc-eQTL 1.05e-01 -0.17 0.105 0.103 NK_cytokine L2
ENSG00000134644 PUM1 -216003 sc-eQTL 8.87e-01 -0.0162 0.114 0.103 NK_cytokine L2
ENSG00000162511 LAPTM5 92214 sc-eQTL 2.79e-01 -0.136 0.125 0.103 NK_cytokine L2
ENSG00000162517 PEF1 -794908 sc-eQTL 5.79e-01 0.0595 0.107 0.103 NK_cytokine L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 131484 sc-eQTL 4.04e-01 -0.111 0.133 0.103 NK_cytokine L2
ENSG00000287510 AL137857.1 118295 sc-eQTL 3.13e-01 -0.125 0.124 0.103 NK_cytokine L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -446800 sc-eQTL 6.34e-01 -0.0661 0.138 0.137 PB L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -446994 sc-eQTL 8.51e-02 0.275 0.159 0.137 PB L2
ENSG00000134644 PUM1 -216003 sc-eQTL 1.30e-01 -0.211 0.138 0.137 PB L2
ENSG00000162510 MATN1 126403 sc-eQTL 6.30e-01 -0.0628 0.13 0.137 PB L2
ENSG00000162511 LAPTM5 92214 sc-eQTL 3.26e-01 -0.0913 0.0925 0.137 PB L2
ENSG00000162517 PEF1 -794908 sc-eQTL 5.34e-01 0.0892 0.143 0.137 PB L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 131484 sc-eQTL 1.43e-01 -0.186 0.126 0.137 PB L2
ENSG00000287510 AL137857.1 118295 sc-eQTL 4.65e-02 0.268 0.133 0.137 PB L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -446800 sc-eQTL 5.82e-02 0.204 0.107 0.107 Pro_T L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -446994 sc-eQTL 6.85e-01 -0.0558 0.137 0.107 Pro_T L2
ENSG00000134644 PUM1 -216003 sc-eQTL 4.75e-01 0.0916 0.128 0.107 Pro_T L2
ENSG00000162511 LAPTM5 92214 sc-eQTL 3.49e-01 -0.0861 0.0917 0.107 Pro_T L2
ENSG00000162517 PEF1 -794908 sc-eQTL 5.13e-01 -0.0884 0.135 0.107 Pro_T L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 131484 sc-eQTL 9.71e-01 -0.00468 0.128 0.107 Pro_T L2
ENSG00000287510 AL137857.1 118295 sc-eQTL 7.99e-01 -0.0301 0.118 0.107 Pro_T L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -446800 sc-eQTL 6.04e-01 -0.0741 0.143 0.105 Treg L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -446994 sc-eQTL 9.69e-02 -0.229 0.137 0.105 Treg L2
ENSG00000134644 PUM1 -216003 sc-eQTL 5.47e-01 -0.0668 0.111 0.105 Treg L2
ENSG00000162511 LAPTM5 92214 sc-eQTL 2.30e-01 -0.152 0.126 0.105 Treg L2
ENSG00000162517 PEF1 -794908 sc-eQTL 8.25e-01 0.0303 0.137 0.105 Treg L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 131484 sc-eQTL 7.83e-01 -0.0356 0.129 0.105 Treg L2
ENSG00000287510 AL137857.1 118295 sc-eQTL 1.72e-01 -0.176 0.128 0.105 Treg L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -446800 sc-eQTL 4.00e-01 -0.123 0.146 0.105 cDC L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -446994 sc-eQTL 4.50e-01 0.12 0.158 0.105 cDC L2
ENSG00000134644 PUM1 -216003 sc-eQTL 2.51e-01 -0.156 0.135 0.105 cDC L2
ENSG00000162511 LAPTM5 92214 sc-eQTL 5.58e-01 0.0559 0.0952 0.105 cDC L2
ENSG00000162517 PEF1 -794908 sc-eQTL 2.70e-02 -0.303 0.136 0.105 cDC L2
ENSG00000168528 SERINC2 -559577 sc-eQTL 3.18e-01 -0.122 0.122 0.105 cDC L2
ENSG00000284543 LINC01226 -656238 sc-eQTL 7.86e-02 0.211 0.119 0.105 cDC L2
ENSG00000287510 AL137857.1 118295 sc-eQTL 1.51e-01 -0.186 0.129 0.105 cDC L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -446800 sc-eQTL 1.51e-01 -0.163 0.113 0.105 cMono_IL1B L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -446994 sc-eQTL 6.27e-01 -0.0616 0.127 0.105 cMono_IL1B L2
ENSG00000134644 PUM1 -216003 sc-eQTL 5.86e-01 0.0468 0.0857 0.105 cMono_IL1B L2
ENSG00000162511 LAPTM5 92214 sc-eQTL 9.20e-02 0.127 0.0748 0.105 cMono_IL1B L2
ENSG00000162512 SDC3 -58770 sc-eQTL 9.02e-01 0.0175 0.142 0.105 cMono_IL1B L2
ENSG00000162517 PEF1 -794908 sc-eQTL 9.81e-01 -0.00273 0.116 0.105 cMono_IL1B L2
ENSG00000168528 SERINC2 -559577 sc-eQTL 3.55e-02 -0.301 0.142 0.105 cMono_IL1B L2
ENSG00000284543 LINC01226 -656238 sc-eQTL 4.28e-01 0.101 0.127 0.105 cMono_IL1B L2
ENSG00000287510 AL137857.1 118295 sc-eQTL 2.72e-01 0.13 0.118 0.105 cMono_IL1B L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -446800 sc-eQTL 8.76e-01 -0.0188 0.121 0.105 cMono_S100A L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -446994 sc-eQTL 9.60e-04 0.465 0.139 0.105 cMono_S100A L2
ENSG00000134644 PUM1 -216003 sc-eQTL 5.05e-01 -0.0687 0.103 0.105 cMono_S100A L2
ENSG00000162511 LAPTM5 92214 sc-eQTL 9.34e-02 0.133 0.0787 0.105 cMono_S100A L2
ENSG00000162512 SDC3 -58770 sc-eQTL 5.18e-01 0.0885 0.137 0.105 cMono_S100A L2
ENSG00000162517 PEF1 -794908 sc-eQTL 9.90e-01 -0.00157 0.124 0.105 cMono_S100A L2
ENSG00000168528 SERINC2 -559577 sc-eQTL 2.31e-01 -0.174 0.144 0.105 cMono_S100A L2
ENSG00000284543 LINC01226 -656238 sc-eQTL 2.97e-01 -0.123 0.117 0.105 cMono_S100A L2
ENSG00000287510 AL137857.1 118295 sc-eQTL 3.78e-01 0.104 0.118 0.105 cMono_S100A L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -446800 sc-eQTL 1.81e-01 -0.253 0.188 0.097 gdT L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -446994 sc-eQTL 7.46e-01 0.0527 0.162 0.097 gdT L2
ENSG00000134644 PUM1 -216003 sc-eQTL 3.60e-01 0.153 0.167 0.097 gdT L2
ENSG00000162511 LAPTM5 92214 sc-eQTL 2.34e-01 -0.217 0.181 0.097 gdT L2
ENSG00000162517 PEF1 -794908 sc-eQTL 2.04e-01 0.211 0.166 0.097 gdT L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 131484 sc-eQTL 6.82e-01 -0.069 0.168 0.097 gdT L2
ENSG00000287510 AL137857.1 118295 sc-eQTL 1.58e-01 -0.229 0.162 0.097 gdT L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -446800 sc-eQTL 6.10e-01 -0.0682 0.133 0.107 intMono L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -446994 sc-eQTL 2.78e-01 0.156 0.143 0.107 intMono L2
ENSG00000134644 PUM1 -216003 sc-eQTL 8.87e-01 0.0173 0.122 0.107 intMono L2
ENSG00000162511 LAPTM5 92214 sc-eQTL 1.70e-01 0.131 0.0951 0.107 intMono L2
ENSG00000162512 SDC3 -58770 sc-eQTL 8.95e-03 0.339 0.129 0.107 intMono L2
ENSG00000162517 PEF1 -794908 sc-eQTL 7.06e-01 -0.0518 0.137 0.107 intMono L2
ENSG00000168528 SERINC2 -559577 sc-eQTL 3.26e-01 -0.134 0.137 0.107 intMono L2
ENSG00000284543 LINC01226 -656238 sc-eQTL 2.72e-01 0.143 0.129 0.107 intMono L2
ENSG00000287510 AL137857.1 118295 sc-eQTL 8.08e-02 -0.226 0.129 0.107 intMono L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -446800 sc-eQTL 3.25e-01 0.121 0.123 0.106 ncMono L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -446994 sc-eQTL 2.65e-01 0.146 0.131 0.106 ncMono L2
ENSG00000134644 PUM1 -216003 sc-eQTL 5.32e-01 0.067 0.107 0.106 ncMono L2
ENSG00000162511 LAPTM5 92214 sc-eQTL 2.41e-01 0.114 0.097 0.106 ncMono L2
ENSG00000162512 SDC3 -58770 sc-eQTL 2.45e-01 0.127 0.109 0.106 ncMono L2
ENSG00000162517 PEF1 -794908 sc-eQTL 6.73e-01 -0.0529 0.125 0.106 ncMono L2
ENSG00000168528 SERINC2 -559577 sc-eQTL 1.06e-01 -0.192 0.118 0.106 ncMono L2
ENSG00000284543 LINC01226 -656238 sc-eQTL 7.18e-01 0.043 0.119 0.106 ncMono L2
ENSG00000287510 AL137857.1 118295 sc-eQTL 4.41e-01 -0.0951 0.123 0.106 ncMono L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -446800 sc-eQTL 5.92e-02 0.288 0.151 0.093 pDC L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -446994 sc-eQTL 3.83e-01 -0.147 0.168 0.093 pDC L2
ENSG00000134644 PUM1 -216003 sc-eQTL 8.13e-01 -0.033 0.139 0.093 pDC L2
ENSG00000162511 LAPTM5 92214 sc-eQTL 4.43e-01 -0.0995 0.129 0.093 pDC L2
ENSG00000162517 PEF1 -794908 sc-eQTL 5.79e-01 -0.0933 0.168 0.093 pDC L2
ENSG00000168528 SERINC2 -559577 sc-eQTL 4.94e-01 0.108 0.157 0.093 pDC L2
ENSG00000284543 LINC01226 -656238 sc-eQTL 8.52e-01 0.0229 0.122 0.093 pDC L2
ENSG00000287510 AL137857.1 118295 sc-eQTL 3.76e-02 -0.297 0.142 0.093 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000060688 SNRNP40 -446800 sc-eQTL 2.00e-01 0.187 0.145 0.105 B_Memory LOneK1K
ENSG00000121766 ZCCHC17 -446994 sc-eQTL 2.37e-01 -0.143 0.121 0.105 B_Memory LOneK1K
ENSG00000134644 PUM1 -216003 sc-eQTL 5.59e-01 0.0629 0.107 0.105 B_Memory LOneK1K
ENSG00000162510 MATN1 126403 sc-eQTL 9.15e-01 0.0131 0.122 0.105 B_Memory LOneK1K
ENSG00000162511 LAPTM5 92214 sc-eQTL 8.65e-01 -0.0131 0.077 0.105 B_Memory LOneK1K
ENSG00000162517 PEF1 -794908 sc-eQTL 8.18e-01 0.0294 0.127 0.105 B_Memory LOneK1K
ENSG00000186056 MATN1-AS1 131484 sc-eQTL 7.55e-01 -0.0318 0.102 0.105 B_Memory LOneK1K
ENSG00000287510 AL137857.1 118295 sc-eQTL 5.33e-01 -0.0692 0.111 0.105 B_Memory LOneK1K
ENSG00000060688 SNRNP40 -446800 sc-eQTL 8.82e-01 -0.0194 0.131 0.105 B_Naive LOneK1K
ENSG00000121766 ZCCHC17 -446994 sc-eQTL 3.57e-01 -0.0953 0.103 0.105 B_Naive LOneK1K
ENSG00000134644 PUM1 -216003 sc-eQTL 3.25e-01 -0.0963 0.0977 0.105 B_Naive LOneK1K
ENSG00000162510 MATN1 126403 sc-eQTL 3.85e-01 -0.0819 0.0941 0.105 B_Naive LOneK1K
ENSG00000162511 LAPTM5 92214 sc-eQTL 4.47e-01 -0.0505 0.0663 0.105 B_Naive LOneK1K
ENSG00000162517 PEF1 -794908 sc-eQTL 7.17e-01 0.0441 0.121 0.105 B_Naive LOneK1K
ENSG00000186056 MATN1-AS1 131484 sc-eQTL 8.38e-02 0.148 0.0851 0.105 B_Naive LOneK1K
ENSG00000287510 AL137857.1 118295 sc-eQTL 4.65e-01 0.0745 0.102 0.105 B_Naive LOneK1K
ENSG00000060688 SNRNP40 -446800 sc-eQTL 2.87e-01 -0.116 0.108 0.105 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000121766 ZCCHC17 -446994 sc-eQTL 6.63e-02 0.225 0.122 0.105 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000134644 PUM1 -216003 sc-eQTL 8.80e-01 0.0119 0.0783 0.105 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000162511 LAPTM5 92214 sc-eQTL 5.90e-02 0.13 0.0683 0.105 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000162512 SDC3 -58770 sc-eQTL 8.73e-01 0.0225 0.14 0.105 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000162517 PEF1 -794908 sc-eQTL 8.97e-01 0.0128 0.0988 0.105 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000168528 SERINC2 -559577 sc-eQTL 6.59e-02 -0.265 0.143 0.105 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000284543 LINC01226 -656238 sc-eQTL 5.70e-01 0.0673 0.118 0.105 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000287510 AL137857.1 118295 sc-eQTL 2.46e-01 0.129 0.111 0.105 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000060688 SNRNP40 -446800 sc-eQTL 7.60e-01 0.036 0.118 0.106 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000121766 ZCCHC17 -446994 sc-eQTL 1.03e-01 0.21 0.128 0.106 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000134644 PUM1 -216003 sc-eQTL 9.30e-01 0.00923 0.106 0.106 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000162511 LAPTM5 92214 sc-eQTL 1.99e-01 0.108 0.0841 0.106 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000162512 SDC3 -58770 sc-eQTL 2.00e-03 0.377 0.121 0.106 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000162517 PEF1 -794908 sc-eQTL 5.76e-01 -0.0628 0.112 0.106 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000168528 SERINC2 -559577 sc-eQTL 2.17e-01 -0.158 0.127 0.106 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000284543 LINC01226 -656238 sc-eQTL 3.57e-01 0.112 0.121 0.106 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000287510 AL137857.1 118295 sc-eQTL 2.22e-01 -0.149 0.121 0.106 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000060688 SNRNP40 -446800 sc-eQTL 9.54e-01 0.00761 0.132 0.103 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000121753 ADGRB2 -914905 sc-eQTL 2.46e-01 -0.131 0.112 0.103 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000121766 ZCCHC17 -446994 sc-eQTL 4.72e-01 -0.0651 0.0903 0.103 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000134644 PUM1 -216003 sc-eQTL 3.48e-01 -0.0929 0.0988 0.103 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000162511 LAPTM5 92214 sc-eQTL 1.62e-01 -0.155 0.11 0.103 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000162517 PEF1 -794908 sc-eQTL 7.90e-01 -0.0224 0.0841 0.103 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000186056 MATN1-AS1 131484 sc-eQTL 6.46e-01 -0.0587 0.128 0.103 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000287510 AL137857.1 118295 sc-eQTL 1.73e-01 -0.15 0.11 0.103 NK_CD56dim LOneK1K

Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF
ENSG00000121766 ZCCHC17 -446994 eQTL 2.51e-02 -0.0599 0.0267 0.0 0.0 0.118
ENSG00000168528 SERINC2 -559577 eQTL 8.09e-05 -0.228 0.0577 0.0 0.0 0.118

Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina
ENSG00000162517 \N -794908 2.67e-07 1.27e-07 5.14e-08 1.82e-07 9.16e-08 9.76e-08 1.61e-07 5.33e-08 1.45e-07 4.94e-08 1.57e-07 9e-08 1.52e-07 7.13e-08 6.04e-08 7.53e-08 4.17e-08 1.33e-07 6.07e-08 4.1e-08 1.13e-07 1.28e-07 1.44e-07 2.95e-08 1.46e-07 1.14e-07 1.07e-07 9.65e-08 1.12e-07 1.05e-07 9.92e-08 2.96e-08 3.73e-08 8.34e-08 8.21e-08 3.53e-08 5.59e-08 9.3e-08 6.71e-08 3.86e-08 5.34e-08 1.36e-07 5.21e-08 1.71e-08 3.42e-08 1.99e-08 1.22e-07 1.89e-09 4.99e-08
ENSG00000168528 SERINC2 -559577 3.77e-07 1.83e-07 6.72e-08 2.24e-07 1.01e-07 8.85e-08 2.63e-07 5.66e-08 1.75e-07 1.03e-07 1.76e-07 1.52e-07 3.04e-07 8.66e-08 6.2e-08 9.6e-08 5.57e-08 2.21e-07 7.76e-08 6.03e-08 1.18e-07 1.65e-07 1.75e-07 4.17e-08 2.37e-07 1.39e-07 1.23e-07 1.26e-07 1.37e-07 1.81e-07 1.27e-07 5.32e-08 4.87e-08 9.52e-08 4.04e-08 3.5e-08 5.96e-08 7.63e-08 4.83e-08 6.79e-08 4.89e-08 1.63e-07 3.65e-08 1.1e-08 4.99e-08 1.19e-08 7.12e-08 0.0 4.61e-08