logo

Genes within 1Mb (chr1:30847804:G:A):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD

Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000060688 SNRNP40 -448984 sc-eQTL 1.63e-01 -0.121 0.0865 0.288 B L1
ENSG00000121766 ZCCHC17 -449178 sc-eQTL 8.46e-01 0.0135 0.0696 0.288 B L1
ENSG00000134644 PUM1 -218187 sc-eQTL 1.86e-01 0.0771 0.0581 0.288 B L1
ENSG00000162510 MATN1 124219 sc-eQTL 9.32e-01 -0.00522 0.0614 0.288 B L1
ENSG00000162511 LAPTM5 90030 sc-eQTL 3.93e-02 0.0987 0.0476 0.288 B L1
ENSG00000162517 PEF1 -797092 sc-eQTL 1.97e-02 0.168 0.0716 0.288 B L1
ENSG00000186056 MATN1-AS1 129300 sc-eQTL 3.47e-01 0.053 0.0562 0.288 B L1
ENSG00000287510 AL137857.1 116111 sc-eQTL 9.22e-01 0.00654 0.0667 0.288 B L1
ENSG00000060688 SNRNP40 -448984 sc-eQTL 4.88e-01 -0.0519 0.0747 0.288 CD4T L1
ENSG00000121766 ZCCHC17 -449178 sc-eQTL 1.09e-01 -0.0936 0.0581 0.288 CD4T L1
ENSG00000134644 PUM1 -218187 sc-eQTL 3.19e-01 0.0519 0.0519 0.288 CD4T L1
ENSG00000162511 LAPTM5 90030 sc-eQTL 5.92e-01 -0.031 0.0576 0.288 CD4T L1
ENSG00000162517 PEF1 -797092 sc-eQTL 2.02e-01 0.0769 0.0601 0.288 CD4T L1
ENSG00000186056 MATN1-AS1 129300 sc-eQTL 8.34e-01 -0.0108 0.0516 0.288 CD4T L1
ENSG00000287510 AL137857.1 116111 sc-eQTL 9.63e-01 0.00287 0.0618 0.288 CD4T L1
ENSG00000060688 SNRNP40 -448984 sc-eQTL 1.28e-01 0.15 0.0984 0.288 CD8T L1
ENSG00000121766 ZCCHC17 -449178 sc-eQTL 5.53e-01 -0.0391 0.0658 0.288 CD8T L1
ENSG00000134644 PUM1 -218187 sc-eQTL 3.92e-03 0.166 0.0568 0.288 CD8T L1
ENSG00000162511 LAPTM5 90030 sc-eQTL 9.28e-01 0.00506 0.0563 0.288 CD8T L1
ENSG00000162517 PEF1 -797092 sc-eQTL 6.75e-01 0.0291 0.0693 0.288 CD8T L1
ENSG00000186056 MATN1-AS1 129300 sc-eQTL 8.31e-02 -0.114 0.0655 0.288 CD8T L1
ENSG00000287510 AL137857.1 116111 sc-eQTL 9.05e-01 -0.0099 0.0829 0.288 CD8T L1
ENSG00000060688 SNRNP40 -448984 sc-eQTL 1.13e-01 0.142 0.0893 0.295 DC L1
ENSG00000121766 ZCCHC17 -449178 sc-eQTL 7.11e-01 0.0394 0.106 0.295 DC L1
ENSG00000134644 PUM1 -218187 sc-eQTL 4.07e-01 0.0692 0.0832 0.295 DC L1
ENSG00000162511 LAPTM5 90030 sc-eQTL 2.36e-02 -0.134 0.0588 0.295 DC L1
ENSG00000162517 PEF1 -797092 sc-eQTL 9.86e-01 0.00175 0.0965 0.295 DC L1
ENSG00000168528 SERINC2 -561761 sc-eQTL 2.80e-01 0.106 0.0979 0.295 DC L1
ENSG00000284543 LINC01226 -658422 sc-eQTL 9.90e-02 -0.107 0.0646 0.295 DC L1
ENSG00000287510 AL137857.1 116111 sc-eQTL 5.03e-01 0.0631 0.094 0.295 DC L1
ENSG00000060688 SNRNP40 -448984 sc-eQTL 5.65e-01 0.039 0.0676 0.288 Mono L1
ENSG00000121766 ZCCHC17 -449178 sc-eQTL 1.10e-01 -0.134 0.0834 0.288 Mono L1
ENSG00000134644 PUM1 -218187 sc-eQTL 7.70e-02 -0.0949 0.0534 0.288 Mono L1
ENSG00000162511 LAPTM5 90030 sc-eQTL 9.77e-01 -0.00144 0.0495 0.288 Mono L1
ENSG00000162512 SDC3 -60954 sc-eQTL 6.89e-02 0.172 0.0943 0.288 Mono L1
ENSG00000162517 PEF1 -797092 sc-eQTL 7.46e-02 0.119 0.0662 0.288 Mono L1
ENSG00000168528 SERINC2 -561761 sc-eQTL 3.57e-01 0.0939 0.102 0.288 Mono L1
ENSG00000284543 LINC01226 -658422 sc-eQTL 9.20e-01 0.00903 0.0899 0.288 Mono L1
ENSG00000287510 AL137857.1 116111 sc-eQTL 4.92e-01 -0.054 0.0785 0.288 Mono L1
ENSG00000060688 SNRNP40 -448984 sc-eQTL 1.64e-01 -0.131 0.094 0.29 NK L1
ENSG00000121753 ADGRB2 -917089 sc-eQTL 8.83e-01 0.012 0.0813 0.29 NK L1
ENSG00000121766 ZCCHC17 -449178 sc-eQTL 7.09e-02 0.116 0.0642 0.29 NK L1
ENSG00000134644 PUM1 -218187 sc-eQTL 2.56e-02 0.151 0.067 0.29 NK L1
ENSG00000162511 LAPTM5 90030 sc-eQTL 9.55e-01 0.00444 0.078 0.29 NK L1
ENSG00000162517 PEF1 -797092 sc-eQTL 2.56e-01 -0.0647 0.0568 0.29 NK L1
ENSG00000186056 MATN1-AS1 129300 sc-eQTL 7.62e-01 -0.0265 0.0877 0.29 NK L1
ENSG00000287510 AL137857.1 116111 sc-eQTL 3.19e-01 -0.0806 0.0808 0.29 NK L1
ENSG00000060688 SNRNP40 -448984 sc-eQTL 2.58e-01 0.0818 0.072 0.288 Other_T L1
ENSG00000121766 ZCCHC17 -449178 sc-eQTL 3.22e-01 0.0764 0.077 0.288 Other_T L1
ENSG00000134644 PUM1 -218187 sc-eQTL 7.14e-01 -0.0254 0.0694 0.288 Other_T L1
ENSG00000162511 LAPTM5 90030 sc-eQTL 3.91e-01 0.0489 0.0568 0.288 Other_T L1
ENSG00000162517 PEF1 -797092 sc-eQTL 4.05e-01 0.0633 0.0759 0.288 Other_T L1
ENSG00000186056 MATN1-AS1 129300 sc-eQTL 6.09e-01 0.0477 0.0931 0.288 Other_T L1
ENSG00000287510 AL137857.1 116111 sc-eQTL 6.27e-01 0.0472 0.097 0.288 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000060688 SNRNP40 -448984 sc-eQTL 7.66e-01 0.0346 0.116 0.293 B_Activated L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -449178 sc-eQTL 1.45e-01 -0.17 0.116 0.293 B_Activated L2
ENSG00000134644 PUM1 -218187 sc-eQTL 1.33e-01 0.163 0.108 0.293 B_Activated L2
ENSG00000162510 MATN1 124219 sc-eQTL 4.71e-01 -0.0685 0.0949 0.293 B_Activated L2
ENSG00000162511 LAPTM5 90030 sc-eQTL 6.21e-01 0.0328 0.0662 0.293 B_Activated L2
ENSG00000162517 PEF1 -797092 sc-eQTL 4.50e-01 0.0853 0.113 0.293 B_Activated L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 129300 sc-eQTL 9.21e-01 -0.0106 0.107 0.293 B_Activated L2
ENSG00000287510 AL137857.1 116111 sc-eQTL 3.44e-01 0.0896 0.0944 0.293 B_Activated L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -448984 sc-eQTL 7.56e-01 -0.0334 0.108 0.288 B_Intermediate L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -449178 sc-eQTL 5.65e-01 0.0516 0.0896 0.288 B_Intermediate L2
ENSG00000134644 PUM1 -218187 sc-eQTL 5.06e-01 0.0562 0.0845 0.288 B_Intermediate L2
ENSG00000162510 MATN1 124219 sc-eQTL 9.44e-01 0.00622 0.088 0.288 B_Intermediate L2
ENSG00000162511 LAPTM5 90030 sc-eQTL 1.20e-02 0.135 0.0532 0.288 B_Intermediate L2
ENSG00000162517 PEF1 -797092 sc-eQTL 3.49e-01 0.094 0.1 0.288 B_Intermediate L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 129300 sc-eQTL 2.48e-01 0.0875 0.0756 0.288 B_Intermediate L2
ENSG00000287510 AL137857.1 116111 sc-eQTL 7.20e-01 0.0305 0.0848 0.288 B_Intermediate L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -448984 sc-eQTL 6.65e-01 -0.0456 0.105 0.291 B_Memory L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -449178 sc-eQTL 6.45e-01 -0.0447 0.0969 0.291 B_Memory L2
ENSG00000134644 PUM1 -218187 sc-eQTL 4.29e-01 -0.0668 0.0842 0.291 B_Memory L2
ENSG00000162510 MATN1 124219 sc-eQTL 6.80e-01 0.0334 0.0807 0.291 B_Memory L2
ENSG00000162511 LAPTM5 90030 sc-eQTL 1.90e-01 0.0936 0.0712 0.291 B_Memory L2
ENSG00000162517 PEF1 -797092 sc-eQTL 5.67e-01 0.0547 0.0954 0.291 B_Memory L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 129300 sc-eQTL 5.39e-01 0.0503 0.0818 0.291 B_Memory L2
ENSG00000287510 AL137857.1 116111 sc-eQTL 1.00e+00 -4.7e-05 0.0959 0.291 B_Memory L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -448984 sc-eQTL 7.26e-02 -0.17 0.0944 0.288 B_Naive1 L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -449178 sc-eQTL 6.75e-01 0.0345 0.0821 0.288 B_Naive1 L2
ENSG00000134644 PUM1 -218187 sc-eQTL 5.93e-01 0.0388 0.0724 0.288 B_Naive1 L2
ENSG00000162510 MATN1 124219 sc-eQTL 1.43e-01 -0.108 0.0731 0.288 B_Naive1 L2
ENSG00000162511 LAPTM5 90030 sc-eQTL 8.27e-02 0.085 0.0487 0.288 B_Naive1 L2
ENSG00000162517 PEF1 -797092 sc-eQTL 3.71e-01 -0.0774 0.0864 0.288 B_Naive1 L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 129300 sc-eQTL 9.23e-01 -0.00624 0.0645 0.288 B_Naive1 L2
ENSG00000287510 AL137857.1 116111 sc-eQTL 9.55e-01 0.00452 0.0796 0.288 B_Naive1 L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -448984 sc-eQTL 2.15e-01 0.128 0.103 0.29 B_Naive2 L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -449178 sc-eQTL 3.28e-01 0.0831 0.0848 0.29 B_Naive2 L2
ENSG00000134644 PUM1 -218187 sc-eQTL 5.01e-01 0.056 0.0831 0.29 B_Naive2 L2
ENSG00000162510 MATN1 124219 sc-eQTL 5.65e-01 0.046 0.0798 0.29 B_Naive2 L2
ENSG00000162511 LAPTM5 90030 sc-eQTL 1.08e-01 0.0869 0.0539 0.29 B_Naive2 L2
ENSG00000162517 PEF1 -797092 sc-eQTL 2.67e-02 0.218 0.0975 0.29 B_Naive2 L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 129300 sc-eQTL 5.79e-01 0.0439 0.0789 0.29 B_Naive2 L2
ENSG00000287510 AL137857.1 116111 sc-eQTL 6.27e-01 -0.0415 0.0853 0.29 B_Naive2 L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -448984 sc-eQTL 4.95e-01 0.0682 0.0998 0.289 CD4_CTL L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -449178 sc-eQTL 8.69e-01 0.0162 0.0983 0.289 CD4_CTL L2
ENSG00000134644 PUM1 -218187 sc-eQTL 4.95e-01 0.0658 0.0963 0.289 CD4_CTL L2
ENSG00000162511 LAPTM5 90030 sc-eQTL 8.51e-01 0.0162 0.0859 0.289 CD4_CTL L2
ENSG00000162517 PEF1 -797092 sc-eQTL 1.51e-01 0.126 0.0876 0.289 CD4_CTL L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 129300 sc-eQTL 3.35e-01 -0.0907 0.0938 0.289 CD4_CTL L2
ENSG00000287510 AL137857.1 116111 sc-eQTL 3.71e-01 -0.0742 0.0828 0.289 CD4_CTL L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -448984 sc-eQTL 6.23e-01 0.0383 0.0779 0.288 CD4_Naive L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -449178 sc-eQTL 5.99e-02 -0.13 0.0685 0.288 CD4_Naive L2
ENSG00000134644 PUM1 -218187 sc-eQTL 2.11e-01 0.0689 0.055 0.288 CD4_Naive L2
ENSG00000162511 LAPTM5 90030 sc-eQTL 5.10e-01 -0.039 0.059 0.288 CD4_Naive L2
ENSG00000162517 PEF1 -797092 sc-eQTL 4.84e-01 0.0454 0.0647 0.288 CD4_Naive L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 129300 sc-eQTL 9.04e-01 -0.00723 0.06 0.288 CD4_Naive L2
ENSG00000287510 AL137857.1 116111 sc-eQTL 6.80e-01 0.0284 0.0689 0.288 CD4_Naive L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -448984 sc-eQTL 1.04e-01 -0.159 0.0972 0.288 CD4_TCM L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -449178 sc-eQTL 1.89e-01 -0.104 0.0785 0.288 CD4_TCM L2
ENSG00000134644 PUM1 -218187 sc-eQTL 3.86e-01 -0.0605 0.0696 0.288 CD4_TCM L2
ENSG00000162511 LAPTM5 90030 sc-eQTL 4.48e-01 0.0439 0.0578 0.288 CD4_TCM L2
ENSG00000162517 PEF1 -797092 sc-eQTL 4.32e-01 0.0609 0.0775 0.288 CD4_TCM L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 129300 sc-eQTL 8.34e-01 0.0154 0.0734 0.288 CD4_TCM L2
ENSG00000287510 AL137857.1 116111 sc-eQTL 2.51e-01 -0.0938 0.0815 0.288 CD4_TCM L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -448984 sc-eQTL 9.16e-01 0.0105 0.0989 0.288 CD4_TEM L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -449178 sc-eQTL 2.65e-01 0.105 0.094 0.288 CD4_TEM L2
ENSG00000134644 PUM1 -218187 sc-eQTL 9.20e-01 0.00789 0.0785 0.288 CD4_TEM L2
ENSG00000162511 LAPTM5 90030 sc-eQTL 8.13e-01 0.0188 0.0794 0.288 CD4_TEM L2
ENSG00000162517 PEF1 -797092 sc-eQTL 7.53e-01 0.028 0.0889 0.288 CD4_TEM L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 129300 sc-eQTL 9.04e-01 0.0112 0.0929 0.288 CD4_TEM L2
ENSG00000287510 AL137857.1 116111 sc-eQTL 3.63e-01 -0.0832 0.0913 0.288 CD4_TEM L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -448984 sc-eQTL 5.42e-01 0.0655 0.107 0.288 CD8_CTL L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -449178 sc-eQTL 9.00e-01 -0.0104 0.0823 0.288 CD8_CTL L2
ENSG00000134644 PUM1 -218187 sc-eQTL 2.68e-01 0.0885 0.0797 0.288 CD8_CTL L2
ENSG00000162511 LAPTM5 90030 sc-eQTL 6.93e-01 -0.035 0.0885 0.288 CD8_CTL L2
ENSG00000162517 PEF1 -797092 sc-eQTL 7.23e-01 0.0274 0.077 0.288 CD8_CTL L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 129300 sc-eQTL 1.19e-01 -0.145 0.0925 0.288 CD8_CTL L2
ENSG00000287510 AL137857.1 116111 sc-eQTL 4.60e-01 -0.0647 0.0874 0.288 CD8_CTL L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -448984 sc-eQTL 3.89e-01 0.0851 0.0986 0.288 CD8_Naive L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -449178 sc-eQTL 7.08e-01 -0.032 0.0851 0.288 CD8_Naive L2
ENSG00000134644 PUM1 -218187 sc-eQTL 3.17e-02 0.147 0.0678 0.288 CD8_Naive L2
ENSG00000162511 LAPTM5 90030 sc-eQTL 3.49e-01 0.0615 0.0655 0.288 CD8_Naive L2
ENSG00000162517 PEF1 -797092 sc-eQTL 2.14e-01 -0.113 0.091 0.288 CD8_Naive L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 129300 sc-eQTL 8.98e-01 -0.0105 0.082 0.288 CD8_Naive L2
ENSG00000287510 AL137857.1 116111 sc-eQTL 3.28e-01 -0.0873 0.089 0.288 CD8_Naive L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -448984 sc-eQTL 8.55e-01 -0.0204 0.112 0.287 CD8_TCM L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -449178 sc-eQTL 6.31e-01 0.0493 0.102 0.287 CD8_TCM L2
ENSG00000134644 PUM1 -218187 sc-eQTL 6.04e-01 -0.05 0.0962 0.287 CD8_TCM L2
ENSG00000162511 LAPTM5 90030 sc-eQTL 5.71e-01 -0.0571 0.101 0.287 CD8_TCM L2
ENSG00000162517 PEF1 -797092 sc-eQTL 5.38e-01 0.0635 0.103 0.287 CD8_TCM L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 129300 sc-eQTL 7.68e-01 -0.0276 0.0933 0.287 CD8_TCM L2
ENSG00000287510 AL137857.1 116111 sc-eQTL 9.65e-01 0.00412 0.0943 0.287 CD8_TCM L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -448984 sc-eQTL 1.35e-01 0.152 0.102 0.285 CD8_TEM L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -449178 sc-eQTL 4.08e-02 0.199 0.0969 0.285 CD8_TEM L2
ENSG00000134644 PUM1 -218187 sc-eQTL 9.29e-01 -0.0089 0.1 0.285 CD8_TEM L2
ENSG00000162511 LAPTM5 90030 sc-eQTL 2.41e-01 0.11 0.0938 0.285 CD8_TEM L2
ENSG00000162517 PEF1 -797092 sc-eQTL 2.02e-01 0.113 0.0882 0.285 CD8_TEM L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 129300 sc-eQTL 6.32e-01 -0.0468 0.0976 0.285 CD8_TEM L2
ENSG00000287510 AL137857.1 116111 sc-eQTL 3.14e-01 0.089 0.0882 0.285 CD8_TEM L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -448984 sc-eQTL 1.38e-01 0.157 0.105 0.29 MAIT L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -449178 sc-eQTL 6.97e-01 -0.0365 0.0937 0.29 MAIT L2
ENSG00000134644 PUM1 -218187 sc-eQTL 8.96e-01 -0.0118 0.0898 0.29 MAIT L2
ENSG00000162511 LAPTM5 90030 sc-eQTL 8.43e-01 -0.0168 0.0847 0.29 MAIT L2
ENSG00000162517 PEF1 -797092 sc-eQTL 2.84e-01 0.0997 0.0929 0.29 MAIT L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 129300 sc-eQTL 2.83e-01 -0.101 0.0941 0.29 MAIT L2
ENSG00000287510 AL137857.1 116111 sc-eQTL 7.89e-01 -0.0261 0.0972 0.29 MAIT L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -448984 sc-eQTL 8.57e-01 -0.019 0.105 0.291 NK_CD56bright L2
ENSG00000121753 ADGRB2 -917089 sc-eQTL 1.41e-01 0.121 0.082 0.291 NK_CD56bright L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -449178 sc-eQTL 4.82e-02 0.175 0.0881 0.291 NK_CD56bright L2
ENSG00000134644 PUM1 -218187 sc-eQTL 8.38e-01 -0.0191 0.0934 0.291 NK_CD56bright L2
ENSG00000162511 LAPTM5 90030 sc-eQTL 4.42e-01 0.0708 0.092 0.291 NK_CD56bright L2
ENSG00000162517 PEF1 -797092 sc-eQTL 2.06e-01 -0.113 0.0891 0.291 NK_CD56bright L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 129300 sc-eQTL 1.40e-02 0.226 0.0912 0.291 NK_CD56bright L2
ENSG00000287510 AL137857.1 116111 sc-eQTL 1.87e-01 0.12 0.0908 0.291 NK_CD56bright L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -448984 sc-eQTL 5.47e-01 -0.06 0.0994 0.289 NK_CD56dim L2
ENSG00000121753 ADGRB2 -917089 sc-eQTL 6.07e-01 0.0451 0.0875 0.289 NK_CD56dim L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -449178 sc-eQTL 4.01e-01 0.0618 0.0735 0.289 NK_CD56dim L2
ENSG00000134644 PUM1 -218187 sc-eQTL 3.44e-01 0.0714 0.0753 0.289 NK_CD56dim L2
ENSG00000162511 LAPTM5 90030 sc-eQTL 9.49e-01 0.0052 0.0805 0.289 NK_CD56dim L2
ENSG00000162517 PEF1 -797092 sc-eQTL 2.40e-01 -0.0841 0.0714 0.289 NK_CD56dim L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 129300 sc-eQTL 6.50e-01 -0.0458 0.101 0.289 NK_CD56dim L2
ENSG00000287510 AL137857.1 116111 sc-eQTL 6.13e-02 -0.155 0.0825 0.289 NK_CD56dim L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -448984 sc-eQTL 4.74e-01 -0.0746 0.104 0.297 NK_HLA L2
ENSG00000121753 ADGRB2 -917089 sc-eQTL 2.88e-01 -0.0879 0.0824 0.297 NK_HLA L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -449178 sc-eQTL 4.49e-01 0.0704 0.0928 0.297 NK_HLA L2
ENSG00000134644 PUM1 -218187 sc-eQTL 6.57e-02 0.166 0.0898 0.297 NK_HLA L2
ENSG00000162511 LAPTM5 90030 sc-eQTL 9.19e-01 -0.00883 0.0864 0.297 NK_HLA L2
ENSG00000162517 PEF1 -797092 sc-eQTL 4.75e-01 0.0696 0.0973 0.297 NK_HLA L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 129300 sc-eQTL 2.84e-02 -0.201 0.0908 0.297 NK_HLA L2
ENSG00000287510 AL137857.1 116111 sc-eQTL 4.17e-03 -0.252 0.0871 0.297 NK_HLA L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -448984 sc-eQTL 3.40e-01 -0.0928 0.0972 0.289 NK_cytokine L2
ENSG00000121753 ADGRB2 -917089 sc-eQTL 4.62e-01 -0.0648 0.0879 0.289 NK_cytokine L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -449178 sc-eQTL 2.02e-01 0.0969 0.0757 0.289 NK_cytokine L2
ENSG00000134644 PUM1 -218187 sc-eQTL 3.27e-02 0.175 0.0813 0.289 NK_cytokine L2
ENSG00000162511 LAPTM5 90030 sc-eQTL 8.78e-01 0.0139 0.0905 0.289 NK_cytokine L2
ENSG00000162517 PEF1 -797092 sc-eQTL 5.41e-01 0.0472 0.077 0.289 NK_cytokine L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 129300 sc-eQTL 6.77e-01 0.0399 0.0959 0.289 NK_cytokine L2
ENSG00000287510 AL137857.1 116111 sc-eQTL 4.82e-01 -0.0628 0.0891 0.289 NK_cytokine L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -448984 sc-eQTL 5.90e-01 -0.0656 0.121 0.274 PB L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -449178 sc-eQTL 7.46e-01 -0.0457 0.141 0.274 PB L2
ENSG00000134644 PUM1 -218187 sc-eQTL 1.21e-01 0.189 0.121 0.274 PB L2
ENSG00000162510 MATN1 124219 sc-eQTL 8.51e-01 -0.0215 0.114 0.274 PB L2
ENSG00000162511 LAPTM5 90030 sc-eQTL 2.58e-01 0.092 0.081 0.274 PB L2
ENSG00000162517 PEF1 -797092 sc-eQTL 9.97e-01 0.000401 0.125 0.274 PB L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 129300 sc-eQTL 4.41e-01 -0.086 0.111 0.274 PB L2
ENSG00000287510 AL137857.1 116111 sc-eQTL 5.55e-01 -0.0702 0.119 0.274 PB L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -448984 sc-eQTL 6.12e-01 0.0391 0.0769 0.289 Pro_T L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -449178 sc-eQTL 3.19e-01 0.0975 0.0975 0.289 Pro_T L2
ENSG00000134644 PUM1 -218187 sc-eQTL 9.30e-01 0.00804 0.0912 0.289 Pro_T L2
ENSG00000162511 LAPTM5 90030 sc-eQTL 3.47e-01 0.0615 0.0653 0.289 Pro_T L2
ENSG00000162517 PEF1 -797092 sc-eQTL 9.22e-01 -0.00937 0.096 0.289 Pro_T L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 129300 sc-eQTL 1.26e-01 0.139 0.0909 0.289 Pro_T L2
ENSG00000287510 AL137857.1 116111 sc-eQTL 3.39e-01 -0.0804 0.0839 0.289 Pro_T L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -448984 sc-eQTL 9.96e-01 0.000471 0.102 0.288 Treg L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -449178 sc-eQTL 5.36e-01 0.0613 0.0989 0.288 Treg L2
ENSG00000134644 PUM1 -218187 sc-eQTL 1.64e-01 0.11 0.0788 0.288 Treg L2
ENSG00000162511 LAPTM5 90030 sc-eQTL 6.01e-01 0.0475 0.0906 0.288 Treg L2
ENSG00000162517 PEF1 -797092 sc-eQTL 2.76e-01 -0.107 0.0977 0.288 Treg L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 129300 sc-eQTL 8.86e-03 -0.24 0.0909 0.288 Treg L2
ENSG00000287510 AL137857.1 116111 sc-eQTL 4.08e-01 0.0763 0.0922 0.288 Treg L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -448984 sc-eQTL 4.70e-02 0.207 0.103 0.29 cDC L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -449178 sc-eQTL 6.01e-01 -0.0593 0.113 0.29 cDC L2
ENSG00000134644 PUM1 -218187 sc-eQTL 5.73e-01 0.0549 0.0972 0.29 cDC L2
ENSG00000162511 LAPTM5 90030 sc-eQTL 4.43e-01 -0.0523 0.0681 0.29 cDC L2
ENSG00000162517 PEF1 -797092 sc-eQTL 4.37e-01 0.0767 0.0985 0.29 cDC L2
ENSG00000168528 SERINC2 -561761 sc-eQTL 2.98e-01 0.0912 0.0873 0.29 cDC L2
ENSG00000284543 LINC01226 -658422 sc-eQTL 8.20e-01 0.0195 0.086 0.29 cDC L2
ENSG00000287510 AL137857.1 116111 sc-eQTL 9.73e-01 -0.00315 0.0926 0.29 cDC L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -448984 sc-eQTL 4.51e-01 -0.0614 0.0813 0.288 cMono_IL1B L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -449178 sc-eQTL 9.29e-01 0.00814 0.0908 0.288 cMono_IL1B L2
ENSG00000134644 PUM1 -218187 sc-eQTL 9.12e-02 -0.104 0.061 0.288 cMono_IL1B L2
ENSG00000162511 LAPTM5 90030 sc-eQTL 7.80e-01 0.0151 0.0539 0.288 cMono_IL1B L2
ENSG00000162512 SDC3 -60954 sc-eQTL 1.66e-02 0.242 0.1 0.288 cMono_IL1B L2
ENSG00000162517 PEF1 -797092 sc-eQTL 2.82e-01 0.0892 0.0828 0.288 cMono_IL1B L2
ENSG00000168528 SERINC2 -561761 sc-eQTL 3.94e-01 0.0877 0.103 0.288 cMono_IL1B L2
ENSG00000284543 LINC01226 -658422 sc-eQTL 4.66e-01 0.0663 0.0908 0.288 cMono_IL1B L2
ENSG00000287510 AL137857.1 116111 sc-eQTL 2.39e-01 -0.0998 0.0845 0.288 cMono_IL1B L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -448984 sc-eQTL 7.87e-01 0.0233 0.086 0.288 cMono_S100A L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -449178 sc-eQTL 5.41e-02 -0.195 0.101 0.288 cMono_S100A L2
ENSG00000134644 PUM1 -218187 sc-eQTL 8.77e-02 -0.125 0.0729 0.288 cMono_S100A L2
ENSG00000162511 LAPTM5 90030 sc-eQTL 4.95e-01 0.0386 0.0564 0.288 cMono_S100A L2
ENSG00000162512 SDC3 -60954 sc-eQTL 2.02e-01 0.124 0.0971 0.288 cMono_S100A L2
ENSG00000162517 PEF1 -797092 sc-eQTL 2.92e-03 0.26 0.0862 0.288 cMono_S100A L2
ENSG00000168528 SERINC2 -561761 sc-eQTL 6.61e-01 0.0452 0.103 0.288 cMono_S100A L2
ENSG00000284543 LINC01226 -658422 sc-eQTL 9.36e-01 -0.0067 0.0838 0.288 cMono_S100A L2
ENSG00000287510 AL137857.1 116111 sc-eQTL 2.82e-01 0.0905 0.084 0.288 cMono_S100A L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -448984 sc-eQTL 2.63e-01 0.142 0.126 0.285 gdT L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -449178 sc-eQTL 2.43e-01 0.127 0.108 0.285 gdT L2
ENSG00000134644 PUM1 -218187 sc-eQTL 3.86e-01 0.0974 0.112 0.285 gdT L2
ENSG00000162511 LAPTM5 90030 sc-eQTL 2.02e-01 0.156 0.121 0.285 gdT L2
ENSG00000162517 PEF1 -797092 sc-eQTL 4.19e-01 0.0902 0.111 0.285 gdT L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 129300 sc-eQTL 6.44e-01 0.0522 0.113 0.285 gdT L2
ENSG00000287510 AL137857.1 116111 sc-eQTL 3.93e-01 0.0932 0.109 0.285 gdT L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -448984 sc-eQTL 8.97e-01 0.0124 0.0953 0.289 intMono L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -449178 sc-eQTL 9.34e-02 -0.172 0.102 0.289 intMono L2
ENSG00000134644 PUM1 -218187 sc-eQTL 5.42e-01 -0.0531 0.0869 0.289 intMono L2
ENSG00000162511 LAPTM5 90030 sc-eQTL 3.20e-01 -0.0678 0.0681 0.289 intMono L2
ENSG00000162512 SDC3 -60954 sc-eQTL 8.40e-01 0.0189 0.0934 0.289 intMono L2
ENSG00000162517 PEF1 -797092 sc-eQTL 8.93e-02 -0.166 0.0974 0.289 intMono L2
ENSG00000168528 SERINC2 -561761 sc-eQTL 1.51e-01 0.14 0.0973 0.289 intMono L2
ENSG00000284543 LINC01226 -658422 sc-eQTL 4.85e-01 0.0647 0.0925 0.289 intMono L2
ENSG00000287510 AL137857.1 116111 sc-eQTL 1.71e-02 -0.22 0.0914 0.289 intMono L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -448984 sc-eQTL 7.53e-01 -0.0281 0.0894 0.29 ncMono L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -449178 sc-eQTL 4.10e-01 -0.0786 0.0951 0.29 ncMono L2
ENSG00000134644 PUM1 -218187 sc-eQTL 3.97e-01 0.066 0.0777 0.29 ncMono L2
ENSG00000162511 LAPTM5 90030 sc-eQTL 4.12e-01 -0.0581 0.0706 0.29 ncMono L2
ENSG00000162512 SDC3 -60954 sc-eQTL 7.69e-01 -0.0234 0.0793 0.29 ncMono L2
ENSG00000162517 PEF1 -797092 sc-eQTL 7.08e-01 -0.034 0.0909 0.29 ncMono L2
ENSG00000168528 SERINC2 -561761 sc-eQTL 2.95e-01 0.0906 0.0863 0.29 ncMono L2
ENSG00000284543 LINC01226 -658422 sc-eQTL 4.34e-01 -0.0676 0.0863 0.29 ncMono L2
ENSG00000287510 AL137857.1 116111 sc-eQTL 5.51e-01 0.0535 0.0896 0.29 ncMono L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -448984 sc-eQTL 4.87e-01 -0.0732 0.105 0.291 pDC L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -449178 sc-eQTL 6.55e-01 0.0517 0.115 0.291 pDC L2
ENSG00000134644 PUM1 -218187 sc-eQTL 6.42e-01 -0.0445 0.0956 0.291 pDC L2
ENSG00000162511 LAPTM5 90030 sc-eQTL 9.73e-01 -0.00299 0.0889 0.291 pDC L2
ENSG00000162517 PEF1 -797092 sc-eQTL 7.74e-01 -0.0331 0.115 0.291 pDC L2
ENSG00000168528 SERINC2 -561761 sc-eQTL 2.74e-01 0.118 0.107 0.291 pDC L2
ENSG00000284543 LINC01226 -658422 sc-eQTL 1.33e-01 -0.125 0.0831 0.291 pDC L2
ENSG00000287510 AL137857.1 116111 sc-eQTL 2.95e-01 -0.103 0.0981 0.291 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000060688 SNRNP40 -448984 sc-eQTL 9.41e-01 -0.00753 0.102 0.288 B_Memory LOneK1K
ENSG00000121766 ZCCHC17 -449178 sc-eQTL 7.63e-01 -0.0255 0.0846 0.288 B_Memory LOneK1K
ENSG00000134644 PUM1 -218187 sc-eQTL 7.53e-01 0.0236 0.0749 0.288 B_Memory LOneK1K
ENSG00000162510 MATN1 124219 sc-eQTL 5.07e-01 0.0567 0.0854 0.288 B_Memory LOneK1K
ENSG00000162511 LAPTM5 90030 sc-eQTL 3.99e-02 0.11 0.0532 0.288 B_Memory LOneK1K
ENSG00000162517 PEF1 -797092 sc-eQTL 1.38e-01 0.132 0.0885 0.288 B_Memory LOneK1K
ENSG00000186056 MATN1-AS1 129300 sc-eQTL 3.71e-01 0.0635 0.0709 0.288 B_Memory LOneK1K
ENSG00000287510 AL137857.1 116111 sc-eQTL 7.05e-01 0.0293 0.0774 0.288 B_Memory LOneK1K
ENSG00000060688 SNRNP40 -448984 sc-eQTL 3.16e-01 -0.0932 0.0927 0.288 B_Naive LOneK1K
ENSG00000121766 ZCCHC17 -449178 sc-eQTL 5.03e-01 0.0492 0.0734 0.288 B_Naive LOneK1K
ENSG00000134644 PUM1 -218187 sc-eQTL 4.41e-01 0.0535 0.0694 0.288 B_Naive LOneK1K
ENSG00000162510 MATN1 124219 sc-eQTL 4.37e-01 -0.052 0.0668 0.288 B_Naive LOneK1K
ENSG00000162511 LAPTM5 90030 sc-eQTL 1.76e-01 0.0637 0.0469 0.288 B_Naive LOneK1K
ENSG00000162517 PEF1 -797092 sc-eQTL 6.89e-01 0.0345 0.086 0.288 B_Naive LOneK1K
ENSG00000186056 MATN1-AS1 129300 sc-eQTL 9.41e-01 0.00452 0.0608 0.288 B_Naive LOneK1K
ENSG00000287510 AL137857.1 116111 sc-eQTL 8.21e-01 -0.0164 0.0723 0.288 B_Naive LOneK1K
ENSG00000060688 SNRNP40 -448984 sc-eQTL 8.73e-01 -0.0124 0.0775 0.288 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000121766 ZCCHC17 -449178 sc-eQTL 3.42e-01 -0.0833 0.0876 0.288 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000134644 PUM1 -218187 sc-eQTL 4.78e-02 -0.11 0.0555 0.288 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000162511 LAPTM5 90030 sc-eQTL 9.11e-01 0.00549 0.0492 0.288 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000162512 SDC3 -60954 sc-eQTL 4.14e-03 0.285 0.0985 0.288 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000162517 PEF1 -797092 sc-eQTL 6.40e-03 0.191 0.0694 0.288 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000168528 SERINC2 -561761 sc-eQTL 4.67e-01 0.0752 0.103 0.288 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000284543 LINC01226 -658422 sc-eQTL 8.00e-01 0.0215 0.0847 0.288 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000287510 AL137857.1 116111 sc-eQTL 5.14e-01 -0.0518 0.0792 0.288 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000060688 SNRNP40 -448984 sc-eQTL 5.53e-01 0.0502 0.0844 0.291 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000121766 ZCCHC17 -449178 sc-eQTL 3.06e-02 -0.199 0.0914 0.291 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000134644 PUM1 -218187 sc-eQTL 8.15e-01 0.0178 0.0757 0.291 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000162511 LAPTM5 90030 sc-eQTL 4.49e-01 -0.0458 0.0605 0.291 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000162512 SDC3 -60954 sc-eQTL 5.76e-01 0.0495 0.0884 0.291 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000162517 PEF1 -797092 sc-eQTL 2.29e-01 -0.0967 0.0801 0.291 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000168528 SERINC2 -561761 sc-eQTL 9.55e-02 0.153 0.0911 0.291 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000284543 LINC01226 -658422 sc-eQTL 8.03e-01 -0.0217 0.0871 0.291 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000287510 AL137857.1 116111 sc-eQTL 3.66e-01 -0.0789 0.087 0.291 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000060688 SNRNP40 -448984 sc-eQTL 2.46e-01 -0.11 0.0944 0.289 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000121753 ADGRB2 -917089 sc-eQTL 9.90e-01 -0.00106 0.0806 0.289 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000121766 ZCCHC17 -449178 sc-eQTL 2.30e-01 0.0775 0.0644 0.289 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000134644 PUM1 -218187 sc-eQTL 3.11e-02 0.152 0.0701 0.289 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000162511 LAPTM5 90030 sc-eQTL 9.94e-01 -0.000571 0.0792 0.289 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000162517 PEF1 -797092 sc-eQTL 5.36e-01 -0.0372 0.0601 0.289 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000186056 MATN1-AS1 129300 sc-eQTL 4.08e-01 -0.0756 0.0912 0.289 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000287510 AL137857.1 116111 sc-eQTL 6.96e-02 -0.143 0.0782 0.289 NK_CD56dim LOneK1K

Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF
ENSG00000168528 SERINC2 -561761 eQTL 0.0433 0.0878 0.0434 0.0 0.0 0.26
ENSG00000229447 AC114495.2 -415877 eQTL 0.0172 0.0919 0.0385 0.00169 0.0 0.26

Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina
ENSG00000168528 SERINC2 -561761 2.77e-07 2.4e-07 5.82e-08 3.48e-07 9.21e-08 8.33e-08 1.9e-07 5.53e-08 1.89e-07 5.67e-08 1.62e-07 1.37e-07 7.36e-07 8.66e-08 6.18e-08 7.37e-08 4.45e-08 1.33e-07 7.09e-08 8.87e-08 1.13e-07 1.25e-07 1.58e-07 3.58e-08 2.28e-07 1.21e-07 1.13e-07 1.17e-07 1.24e-07 1.06e-07 1.52e-07 3.99e-08 3.51e-08 1.16e-07 6.87e-08 2.68e-08 1.1e-07 8.63e-08 5.93e-08 2.5e-07 4.36e-08 1.46e-07 5.27e-08 1.35e-08 4.92e-08 9.49e-09 1.22e-07 1.88e-09 4.79e-08