logo

Genes within 1Mb (chr1:30847327:C:T):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD

Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000060688 SNRNP40 -449461 sc-eQTL 2.31e-01 -0.112 0.0929 0.231 B L1
ENSG00000121766 ZCCHC17 -449655 sc-eQTL 4.76e-01 -0.0533 0.0746 0.231 B L1
ENSG00000134644 PUM1 -218664 sc-eQTL 2.67e-02 0.138 0.0619 0.231 B L1
ENSG00000162510 MATN1 123742 sc-eQTL 7.02e-01 -0.0252 0.0658 0.231 B L1
ENSG00000162511 LAPTM5 89553 sc-eQTL 7.43e-02 0.0918 0.0512 0.231 B L1
ENSG00000162517 PEF1 -797569 sc-eQTL 3.70e-02 0.162 0.0771 0.231 B L1
ENSG00000186056 MATN1-AS1 128823 sc-eQTL 9.83e-01 0.00126 0.0604 0.231 B L1
ENSG00000287510 AL137857.1 115634 sc-eQTL 5.80e-01 -0.0396 0.0715 0.231 B L1
ENSG00000060688 SNRNP40 -449461 sc-eQTL 2.17e-01 -0.0997 0.0806 0.231 CD4T L1
ENSG00000121766 ZCCHC17 -449655 sc-eQTL 1.39e-01 -0.0934 0.0628 0.231 CD4T L1
ENSG00000134644 PUM1 -218664 sc-eQTL 1.08e-01 0.0902 0.0559 0.231 CD4T L1
ENSG00000162511 LAPTM5 89553 sc-eQTL 7.26e-01 -0.0219 0.0623 0.231 CD4T L1
ENSG00000162517 PEF1 -797569 sc-eQTL 6.39e-01 0.0306 0.0651 0.231 CD4T L1
ENSG00000186056 MATN1-AS1 128823 sc-eQTL 2.89e-01 -0.059 0.0556 0.231 CD4T L1
ENSG00000287510 AL137857.1 115634 sc-eQTL 6.54e-01 -0.0299 0.0667 0.231 CD4T L1
ENSG00000060688 SNRNP40 -449461 sc-eQTL 2.49e-01 0.123 0.106 0.231 CD8T L1
ENSG00000121766 ZCCHC17 -449655 sc-eQTL 9.35e-01 -0.0058 0.0708 0.231 CD8T L1
ENSG00000134644 PUM1 -218664 sc-eQTL 7.67e-02 0.11 0.0619 0.231 CD8T L1
ENSG00000162511 LAPTM5 89553 sc-eQTL 6.73e-01 -0.0256 0.0605 0.231 CD8T L1
ENSG00000162517 PEF1 -797569 sc-eQTL 7.51e-01 0.0237 0.0746 0.231 CD8T L1
ENSG00000186056 MATN1-AS1 128823 sc-eQTL 7.69e-02 -0.125 0.0704 0.231 CD8T L1
ENSG00000287510 AL137857.1 115634 sc-eQTL 4.17e-01 -0.0725 0.089 0.231 CD8T L1
ENSG00000060688 SNRNP40 -449461 sc-eQTL 2.58e-01 0.109 0.0959 0.239 DC L1
ENSG00000121766 ZCCHC17 -449655 sc-eQTL 6.94e-01 -0.0448 0.114 0.239 DC L1
ENSG00000134644 PUM1 -218664 sc-eQTL 5.23e-02 0.173 0.0884 0.239 DC L1
ENSG00000162511 LAPTM5 89553 sc-eQTL 1.97e-01 -0.0821 0.0635 0.239 DC L1
ENSG00000162517 PEF1 -797569 sc-eQTL 8.84e-01 0.0151 0.103 0.239 DC L1
ENSG00000168528 SERINC2 -562238 sc-eQTL 5.86e-01 0.0572 0.105 0.239 DC L1
ENSG00000284543 LINC01226 -658899 sc-eQTL 5.02e-02 -0.136 0.0689 0.239 DC L1
ENSG00000287510 AL137857.1 115634 sc-eQTL 8.06e-01 -0.0248 0.101 0.239 DC L1
ENSG00000060688 SNRNP40 -449461 sc-eQTL 4.71e-01 0.0527 0.0729 0.231 Mono L1
ENSG00000121766 ZCCHC17 -449655 sc-eQTL 3.89e-01 -0.078 0.0904 0.231 Mono L1
ENSG00000134644 PUM1 -218664 sc-eQTL 1.84e-01 -0.077 0.0578 0.231 Mono L1
ENSG00000162511 LAPTM5 89553 sc-eQTL 6.51e-01 -0.0242 0.0533 0.231 Mono L1
ENSG00000162512 SDC3 -61431 sc-eQTL 1.98e-01 0.132 0.102 0.231 Mono L1
ENSG00000162517 PEF1 -797569 sc-eQTL 9.29e-02 0.121 0.0715 0.231 Mono L1
ENSG00000168528 SERINC2 -562238 sc-eQTL 5.89e-01 0.0595 0.11 0.231 Mono L1
ENSG00000284543 LINC01226 -658899 sc-eQTL 9.69e-01 0.00371 0.097 0.231 Mono L1
ENSG00000287510 AL137857.1 115634 sc-eQTL 4.82e-01 -0.0596 0.0846 0.231 Mono L1
ENSG00000060688 SNRNP40 -449461 sc-eQTL 1.57e-01 -0.143 0.101 0.232 NK L1
ENSG00000121753 ADGRB2 -917566 sc-eQTL 5.37e-01 0.0539 0.0872 0.232 NK L1
ENSG00000121766 ZCCHC17 -449655 sc-eQTL 2.48e-02 0.155 0.0685 0.232 NK L1
ENSG00000134644 PUM1 -218664 sc-eQTL 9.23e-02 0.122 0.0723 0.232 NK L1
ENSG00000162511 LAPTM5 89553 sc-eQTL 6.10e-01 -0.0428 0.0837 0.232 NK L1
ENSG00000162517 PEF1 -797569 sc-eQTL 3.62e-01 -0.0558 0.061 0.232 NK L1
ENSG00000186056 MATN1-AS1 128823 sc-eQTL 8.70e-01 -0.0154 0.0941 0.232 NK L1
ENSG00000287510 AL137857.1 115634 sc-eQTL 3.82e-01 -0.076 0.0867 0.232 NK L1
ENSG00000060688 SNRNP40 -449461 sc-eQTL 4.99e-01 0.0523 0.0773 0.231 Other_T L1
ENSG00000121766 ZCCHC17 -449655 sc-eQTL 3.32e-01 0.0803 0.0825 0.231 Other_T L1
ENSG00000134644 PUM1 -218664 sc-eQTL 2.75e-01 -0.0811 0.0741 0.231 Other_T L1
ENSG00000162511 LAPTM5 89553 sc-eQTL 7.29e-01 0.0211 0.0609 0.231 Other_T L1
ENSG00000162517 PEF1 -797569 sc-eQTL 3.77e-02 0.168 0.0806 0.231 Other_T L1
ENSG00000186056 MATN1-AS1 128823 sc-eQTL 1.00e+00 3.36e-05 0.0998 0.231 Other_T L1
ENSG00000287510 AL137857.1 115634 sc-eQTL 1.00e+00 3.62e-05 0.104 0.231 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000060688 SNRNP40 -449461 sc-eQTL 3.78e-01 0.109 0.123 0.232 B_Activated L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -449655 sc-eQTL 2.29e-01 -0.15 0.124 0.232 B_Activated L2
ENSG00000134644 PUM1 -218664 sc-eQTL 1.31e-01 0.175 0.115 0.232 B_Activated L2
ENSG00000162510 MATN1 123742 sc-eQTL 5.23e-01 -0.0647 0.101 0.232 B_Activated L2
ENSG00000162511 LAPTM5 89553 sc-eQTL 5.00e-01 0.0476 0.0705 0.232 B_Activated L2
ENSG00000162517 PEF1 -797569 sc-eQTL 7.79e-01 -0.0337 0.12 0.232 B_Activated L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 128823 sc-eQTL 9.24e-01 0.0109 0.114 0.232 B_Activated L2
ENSG00000287510 AL137857.1 115634 sc-eQTL 3.55e-01 0.0933 0.101 0.232 B_Activated L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -449461 sc-eQTL 7.42e-01 0.0384 0.116 0.23 B_Intermediate L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -449655 sc-eQTL 7.49e-01 0.031 0.0969 0.23 B_Intermediate L2
ENSG00000134644 PUM1 -218664 sc-eQTL 2.16e-01 0.113 0.0911 0.23 B_Intermediate L2
ENSG00000162510 MATN1 123742 sc-eQTL 8.27e-01 -0.0209 0.0951 0.23 B_Intermediate L2
ENSG00000162511 LAPTM5 89553 sc-eQTL 4.38e-02 0.117 0.0578 0.23 B_Intermediate L2
ENSG00000162517 PEF1 -797569 sc-eQTL 2.12e-01 0.135 0.108 0.23 B_Intermediate L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 128823 sc-eQTL 7.08e-01 0.0307 0.0819 0.23 B_Intermediate L2
ENSG00000287510 AL137857.1 115634 sc-eQTL 6.15e-01 0.0462 0.0916 0.23 B_Intermediate L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -449461 sc-eQTL 5.72e-01 -0.0653 0.115 0.233 B_Memory L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -449655 sc-eQTL 7.67e-01 -0.0315 0.106 0.233 B_Memory L2
ENSG00000134644 PUM1 -218664 sc-eQTL 5.43e-01 -0.0563 0.0924 0.233 B_Memory L2
ENSG00000162510 MATN1 123742 sc-eQTL 7.33e-01 -0.0302 0.0885 0.233 B_Memory L2
ENSG00000162511 LAPTM5 89553 sc-eQTL 1.67e-01 0.108 0.0781 0.233 B_Memory L2
ENSG00000162517 PEF1 -797569 sc-eQTL 5.68e-01 0.0598 0.105 0.233 B_Memory L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 128823 sc-eQTL 9.12e-01 0.00995 0.0897 0.233 B_Memory L2
ENSG00000287510 AL137857.1 115634 sc-eQTL 4.09e-01 0.0869 0.105 0.233 B_Memory L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -449461 sc-eQTL 2.85e-02 -0.224 0.102 0.231 B_Naive1 L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -449655 sc-eQTL 8.79e-01 0.0136 0.0889 0.231 B_Naive1 L2
ENSG00000134644 PUM1 -218664 sc-eQTL 3.92e-01 0.0671 0.0783 0.231 B_Naive1 L2
ENSG00000162510 MATN1 123742 sc-eQTL 1.20e-01 -0.123 0.0791 0.231 B_Naive1 L2
ENSG00000162511 LAPTM5 89553 sc-eQTL 1.22e-01 0.0821 0.0528 0.231 B_Naive1 L2
ENSG00000162517 PEF1 -797569 sc-eQTL 5.65e-01 -0.054 0.0936 0.231 B_Naive1 L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 128823 sc-eQTL 5.76e-01 -0.039 0.0697 0.231 B_Naive1 L2
ENSG00000287510 AL137857.1 115634 sc-eQTL 3.60e-01 -0.0789 0.086 0.231 B_Naive1 L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -449461 sc-eQTL 3.39e-01 0.105 0.11 0.232 B_Naive2 L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -449655 sc-eQTL 8.06e-01 -0.0223 0.091 0.232 B_Naive2 L2
ENSG00000134644 PUM1 -218664 sc-eQTL 1.89e-01 0.117 0.0887 0.232 B_Naive2 L2
ENSG00000162510 MATN1 123742 sc-eQTL 7.85e-01 0.0233 0.0855 0.232 B_Naive2 L2
ENSG00000162511 LAPTM5 89553 sc-eQTL 2.48e-01 0.067 0.0579 0.232 B_Naive2 L2
ENSG00000162517 PEF1 -797569 sc-eQTL 8.10e-02 0.184 0.105 0.232 B_Naive2 L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 128823 sc-eQTL 7.30e-01 -0.0292 0.0845 0.232 B_Naive2 L2
ENSG00000287510 AL137857.1 115634 sc-eQTL 4.02e-01 -0.0765 0.0912 0.232 B_Naive2 L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -449461 sc-eQTL 5.89e-01 0.059 0.109 0.23 CD4_CTL L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -449655 sc-eQTL 5.76e-01 -0.0601 0.107 0.23 CD4_CTL L2
ENSG00000134644 PUM1 -218664 sc-eQTL 8.47e-01 0.0204 0.105 0.23 CD4_CTL L2
ENSG00000162511 LAPTM5 89553 sc-eQTL 8.11e-01 0.0225 0.0937 0.23 CD4_CTL L2
ENSG00000162517 PEF1 -797569 sc-eQTL 2.17e-01 0.119 0.0957 0.23 CD4_CTL L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 128823 sc-eQTL 3.39e-01 -0.0981 0.102 0.23 CD4_CTL L2
ENSG00000287510 AL137857.1 115634 sc-eQTL 4.96e-01 -0.0617 0.0904 0.23 CD4_CTL L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -449461 sc-eQTL 9.00e-01 0.0106 0.0839 0.231 CD4_Naive L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -449655 sc-eQTL 1.06e-01 -0.12 0.0739 0.231 CD4_Naive L2
ENSG00000134644 PUM1 -218664 sc-eQTL 1.66e-01 0.0822 0.0591 0.231 CD4_Naive L2
ENSG00000162511 LAPTM5 89553 sc-eQTL 6.06e-01 -0.0328 0.0636 0.231 CD4_Naive L2
ENSG00000162517 PEF1 -797569 sc-eQTL 9.03e-01 0.00855 0.0698 0.231 CD4_Naive L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 128823 sc-eQTL 2.78e-01 -0.07 0.0644 0.231 CD4_Naive L2
ENSG00000287510 AL137857.1 115634 sc-eQTL 5.17e-01 -0.0481 0.0741 0.231 CD4_Naive L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -449461 sc-eQTL 5.50e-02 -0.203 0.105 0.231 CD4_TCM L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -449655 sc-eQTL 3.05e-01 -0.0876 0.0852 0.231 CD4_TCM L2
ENSG00000134644 PUM1 -218664 sc-eQTL 8.11e-01 0.0181 0.0756 0.231 CD4_TCM L2
ENSG00000162511 LAPTM5 89553 sc-eQTL 3.71e-01 0.0562 0.0626 0.231 CD4_TCM L2
ENSG00000162517 PEF1 -797569 sc-eQTL 9.44e-01 0.00589 0.084 0.231 CD4_TCM L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 128823 sc-eQTL 5.88e-01 -0.0431 0.0795 0.231 CD4_TCM L2
ENSG00000287510 AL137857.1 115634 sc-eQTL 3.59e-01 -0.0813 0.0884 0.231 CD4_TCM L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -449461 sc-eQTL 6.31e-01 -0.0511 0.106 0.231 CD4_TEM L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -449655 sc-eQTL 5.06e-01 0.0673 0.101 0.231 CD4_TEM L2
ENSG00000134644 PUM1 -218664 sc-eQTL 5.28e-01 0.0532 0.0841 0.231 CD4_TEM L2
ENSG00000162511 LAPTM5 89553 sc-eQTL 9.78e-01 -0.00236 0.0852 0.231 CD4_TEM L2
ENSG00000162517 PEF1 -797569 sc-eQTL 7.53e-01 -0.0301 0.0954 0.231 CD4_TEM L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 128823 sc-eQTL 4.93e-01 0.0683 0.0995 0.231 CD4_TEM L2
ENSG00000287510 AL137857.1 115634 sc-eQTL 8.22e-01 -0.0221 0.0982 0.231 CD4_TEM L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -449461 sc-eQTL 5.88e-01 0.0625 0.115 0.231 CD8_CTL L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -449655 sc-eQTL 7.58e-01 -0.0273 0.0885 0.231 CD8_CTL L2
ENSG00000134644 PUM1 -218664 sc-eQTL 6.68e-01 0.0369 0.0859 0.231 CD8_CTL L2
ENSG00000162511 LAPTM5 89553 sc-eQTL 2.88e-01 -0.101 0.0949 0.231 CD8_CTL L2
ENSG00000162517 PEF1 -797569 sc-eQTL 5.34e-01 -0.0515 0.0828 0.231 CD8_CTL L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 128823 sc-eQTL 1.50e-01 -0.144 0.0995 0.231 CD8_CTL L2
ENSG00000287510 AL137857.1 115634 sc-eQTL 4.31e-01 -0.0741 0.0939 0.231 CD8_CTL L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -449461 sc-eQTL 4.05e-01 0.0882 0.106 0.231 CD8_Naive L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -449655 sc-eQTL 9.28e-01 0.00829 0.0912 0.231 CD8_Naive L2
ENSG00000134644 PUM1 -218664 sc-eQTL 1.21e-01 0.114 0.073 0.231 CD8_Naive L2
ENSG00000162511 LAPTM5 89553 sc-eQTL 3.90e-01 0.0605 0.0702 0.231 CD8_Naive L2
ENSG00000162517 PEF1 -797569 sc-eQTL 1.74e-01 -0.133 0.0974 0.231 CD8_Naive L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 128823 sc-eQTL 7.37e-01 -0.0296 0.0878 0.231 CD8_Naive L2
ENSG00000287510 AL137857.1 115634 sc-eQTL 1.89e-01 -0.126 0.0952 0.231 CD8_Naive L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -449461 sc-eQTL 5.41e-01 -0.074 0.121 0.225 CD8_TCM L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -449655 sc-eQTL 4.36e-01 0.0865 0.111 0.225 CD8_TCM L2
ENSG00000134644 PUM1 -218664 sc-eQTL 2.90e-01 -0.11 0.104 0.225 CD8_TCM L2
ENSG00000162511 LAPTM5 89553 sc-eQTL 9.10e-01 -0.0124 0.109 0.225 CD8_TCM L2
ENSG00000162517 PEF1 -797569 sc-eQTL 9.03e-01 0.0137 0.112 0.225 CD8_TCM L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 128823 sc-eQTL 5.21e-01 -0.0649 0.101 0.225 CD8_TCM L2
ENSG00000287510 AL137857.1 115634 sc-eQTL 7.03e-01 -0.039 0.102 0.225 CD8_TCM L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -449461 sc-eQTL 2.02e-01 0.141 0.11 0.231 CD8_TEM L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -449655 sc-eQTL 4.69e-02 0.21 0.105 0.231 CD8_TEM L2
ENSG00000134644 PUM1 -218664 sc-eQTL 9.75e-01 -0.00336 0.108 0.231 CD8_TEM L2
ENSG00000162511 LAPTM5 89553 sc-eQTL 1.23e-01 0.157 0.101 0.231 CD8_TEM L2
ENSG00000162517 PEF1 -797569 sc-eQTL 3.40e-02 0.203 0.0949 0.231 CD8_TEM L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 128823 sc-eQTL 4.88e-01 -0.0734 0.106 0.231 CD8_TEM L2
ENSG00000287510 AL137857.1 115634 sc-eQTL 2.32e-01 0.114 0.0954 0.231 CD8_TEM L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -449461 sc-eQTL 1.25e-01 0.173 0.113 0.232 MAIT L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -449655 sc-eQTL 3.11e-01 -0.102 0.1 0.232 MAIT L2
ENSG00000134644 PUM1 -218664 sc-eQTL 6.58e-01 -0.0426 0.0963 0.232 MAIT L2
ENSG00000162511 LAPTM5 89553 sc-eQTL 9.86e-01 0.00158 0.0908 0.232 MAIT L2
ENSG00000162517 PEF1 -797569 sc-eQTL 2.45e-02 0.223 0.0986 0.232 MAIT L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 128823 sc-eQTL 1.90e-01 -0.132 0.101 0.232 MAIT L2
ENSG00000287510 AL137857.1 115634 sc-eQTL 7.19e-01 -0.0375 0.104 0.232 MAIT L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -449461 sc-eQTL 6.45e-01 0.0522 0.113 0.233 NK_CD56bright L2
ENSG00000121753 ADGRB2 -917566 sc-eQTL 5.44e-02 0.17 0.0878 0.233 NK_CD56bright L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -449655 sc-eQTL 1.09e-01 0.153 0.0951 0.233 NK_CD56bright L2
ENSG00000134644 PUM1 -218664 sc-eQTL 7.91e-01 0.0267 0.1 0.233 NK_CD56bright L2
ENSG00000162511 LAPTM5 89553 sc-eQTL 4.95e-01 0.0676 0.099 0.233 NK_CD56bright L2
ENSG00000162517 PEF1 -797569 sc-eQTL 1.15e-01 -0.151 0.0957 0.233 NK_CD56bright L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 128823 sc-eQTL 7.93e-02 0.174 0.0988 0.233 NK_CD56bright L2
ENSG00000287510 AL137857.1 115634 sc-eQTL 2.24e-01 0.119 0.0978 0.233 NK_CD56bright L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -449461 sc-eQTL 7.09e-01 -0.0398 0.107 0.231 NK_CD56dim L2
ENSG00000121753 ADGRB2 -917566 sc-eQTL 3.54e-01 0.087 0.0936 0.231 NK_CD56dim L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -449655 sc-eQTL 4.09e-01 0.0651 0.0788 0.231 NK_CD56dim L2
ENSG00000134644 PUM1 -218664 sc-eQTL 5.30e-01 0.0508 0.0809 0.231 NK_CD56dim L2
ENSG00000162511 LAPTM5 89553 sc-eQTL 6.21e-01 -0.0427 0.0863 0.231 NK_CD56dim L2
ENSG00000162517 PEF1 -797569 sc-eQTL 2.04e-01 -0.0974 0.0765 0.231 NK_CD56dim L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 128823 sc-eQTL 9.66e-01 -0.00459 0.108 0.231 NK_CD56dim L2
ENSG00000287510 AL137857.1 115634 sc-eQTL 6.77e-02 -0.162 0.0885 0.231 NK_CD56dim L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -449461 sc-eQTL 3.56e-01 -0.103 0.111 0.237 NK_HLA L2
ENSG00000121753 ADGRB2 -917566 sc-eQTL 4.93e-01 -0.0607 0.0884 0.237 NK_HLA L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -449655 sc-eQTL 1.81e-02 0.234 0.0981 0.237 NK_HLA L2
ENSG00000134644 PUM1 -218664 sc-eQTL 9.70e-02 0.161 0.0963 0.237 NK_HLA L2
ENSG00000162511 LAPTM5 89553 sc-eQTL 8.56e-01 -0.0169 0.0926 0.237 NK_HLA L2
ENSG00000162517 PEF1 -797569 sc-eQTL 9.22e-01 -0.0102 0.104 0.237 NK_HLA L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 128823 sc-eQTL 1.02e-01 -0.161 0.0978 0.237 NK_HLA L2
ENSG00000287510 AL137857.1 115634 sc-eQTL 3.72e-03 -0.274 0.0932 0.237 NK_HLA L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -449461 sc-eQTL 1.28e-01 -0.158 0.103 0.231 NK_cytokine L2
ENSG00000121753 ADGRB2 -917566 sc-eQTL 8.79e-01 -0.0143 0.0937 0.231 NK_cytokine L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -449655 sc-eQTL 2.09e-01 0.102 0.0806 0.231 NK_cytokine L2
ENSG00000134644 PUM1 -218664 sc-eQTL 5.40e-02 0.168 0.0867 0.231 NK_cytokine L2
ENSG00000162511 LAPTM5 89553 sc-eQTL 6.84e-01 -0.0393 0.0963 0.231 NK_cytokine L2
ENSG00000162517 PEF1 -797569 sc-eQTL 4.82e-01 0.0577 0.082 0.231 NK_cytokine L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 128823 sc-eQTL 5.66e-01 0.0586 0.102 0.231 NK_cytokine L2
ENSG00000287510 AL137857.1 115634 sc-eQTL 6.64e-01 -0.0413 0.095 0.231 NK_cytokine L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -449461 sc-eQTL 5.23e-01 -0.0799 0.125 0.237 PB L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -449655 sc-eQTL 4.30e-01 -0.114 0.144 0.237 PB L2
ENSG00000134644 PUM1 -218664 sc-eQTL 1.56e-01 0.178 0.125 0.237 PB L2
ENSG00000162510 MATN1 123742 sc-eQTL 8.78e-01 -0.0181 0.117 0.237 PB L2
ENSG00000162511 LAPTM5 89553 sc-eQTL 2.39e-01 0.0985 0.0832 0.237 PB L2
ENSG00000162517 PEF1 -797569 sc-eQTL 7.85e-01 -0.0352 0.129 0.237 PB L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 128823 sc-eQTL 6.19e-01 -0.0572 0.114 0.237 PB L2
ENSG00000287510 AL137857.1 115634 sc-eQTL 2.91e-01 -0.129 0.121 0.237 PB L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -449461 sc-eQTL 6.67e-01 -0.0356 0.0826 0.23 Pro_T L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -449655 sc-eQTL 7.01e-01 0.0404 0.105 0.23 Pro_T L2
ENSG00000134644 PUM1 -218664 sc-eQTL 8.53e-01 -0.0182 0.0979 0.23 Pro_T L2
ENSG00000162511 LAPTM5 89553 sc-eQTL 7.73e-01 -0.0202 0.0702 0.23 Pro_T L2
ENSG00000162517 PEF1 -797569 sc-eQTL 6.68e-01 -0.0443 0.103 0.23 Pro_T L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 128823 sc-eQTL 3.55e-01 0.0907 0.0979 0.23 Pro_T L2
ENSG00000287510 AL137857.1 115634 sc-eQTL 1.70e-01 -0.124 0.0899 0.23 Pro_T L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -449461 sc-eQTL 6.63e-01 0.0476 0.109 0.231 Treg L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -449655 sc-eQTL 9.93e-01 0.000968 0.106 0.231 Treg L2
ENSG00000134644 PUM1 -218664 sc-eQTL 5.92e-02 0.159 0.0838 0.231 Treg L2
ENSG00000162511 LAPTM5 89553 sc-eQTL 9.96e-01 0.000451 0.0967 0.231 Treg L2
ENSG00000162517 PEF1 -797569 sc-eQTL 2.92e-01 -0.11 0.104 0.231 Treg L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 128823 sc-eQTL 2.22e-03 -0.298 0.0964 0.231 Treg L2
ENSG00000287510 AL137857.1 115634 sc-eQTL 9.79e-01 -0.00255 0.0984 0.231 Treg L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -449461 sc-eQTL 1.34e-01 0.166 0.11 0.232 cDC L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -449655 sc-eQTL 3.45e-01 -0.113 0.12 0.232 cDC L2
ENSG00000134644 PUM1 -218664 sc-eQTL 1.79e-01 0.139 0.103 0.232 cDC L2
ENSG00000162511 LAPTM5 89553 sc-eQTL 8.85e-01 -0.0105 0.0723 0.232 cDC L2
ENSG00000162517 PEF1 -797569 sc-eQTL 4.07e-01 0.0868 0.105 0.232 cDC L2
ENSG00000168528 SERINC2 -562238 sc-eQTL 6.01e-01 0.0486 0.0928 0.232 cDC L2
ENSG00000284543 LINC01226 -658899 sc-eQTL 8.75e-01 -0.0144 0.0912 0.232 cDC L2
ENSG00000287510 AL137857.1 115634 sc-eQTL 4.41e-01 -0.0757 0.098 0.232 cDC L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -449461 sc-eQTL 8.54e-01 0.0162 0.0875 0.231 cMono_IL1B L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -449655 sc-eQTL 5.23e-01 0.0624 0.0975 0.231 cMono_IL1B L2
ENSG00000134644 PUM1 -218664 sc-eQTL 1.98e-01 -0.0849 0.0658 0.231 cMono_IL1B L2
ENSG00000162511 LAPTM5 89553 sc-eQTL 9.47e-01 -0.00387 0.058 0.231 cMono_IL1B L2
ENSG00000162512 SDC3 -61431 sc-eQTL 2.19e-01 0.134 0.109 0.231 cMono_IL1B L2
ENSG00000162517 PEF1 -797569 sc-eQTL 1.12e-01 0.141 0.0887 0.231 cMono_IL1B L2
ENSG00000168528 SERINC2 -562238 sc-eQTL 4.51e-01 0.0833 0.11 0.231 cMono_IL1B L2
ENSG00000284543 LINC01226 -658899 sc-eQTL 6.24e-01 0.048 0.0977 0.231 cMono_IL1B L2
ENSG00000287510 AL137857.1 115634 sc-eQTL 1.18e-01 -0.142 0.0906 0.231 cMono_IL1B L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -449461 sc-eQTL 6.64e-01 0.0402 0.0924 0.231 cMono_S100A L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -449655 sc-eQTL 1.17e-01 -0.171 0.109 0.231 cMono_S100A L2
ENSG00000134644 PUM1 -218664 sc-eQTL 2.10e-01 -0.099 0.0786 0.231 cMono_S100A L2
ENSG00000162511 LAPTM5 89553 sc-eQTL 6.61e-01 0.0266 0.0606 0.231 cMono_S100A L2
ENSG00000162512 SDC3 -61431 sc-eQTL 2.30e-01 0.126 0.104 0.231 cMono_S100A L2
ENSG00000162517 PEF1 -797569 sc-eQTL 2.87e-03 0.28 0.0927 0.231 cMono_S100A L2
ENSG00000168528 SERINC2 -562238 sc-eQTL 8.56e-01 0.0202 0.111 0.231 cMono_S100A L2
ENSG00000284543 LINC01226 -658899 sc-eQTL 9.18e-01 0.00925 0.0901 0.231 cMono_S100A L2
ENSG00000287510 AL137857.1 115634 sc-eQTL 2.65e-01 0.101 0.0903 0.231 cMono_S100A L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -449461 sc-eQTL 4.39e-01 0.106 0.136 0.227 gdT L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -449655 sc-eQTL 6.21e-02 0.218 0.116 0.227 gdT L2
ENSG00000134644 PUM1 -218664 sc-eQTL 8.33e-01 0.0255 0.121 0.227 gdT L2
ENSG00000162511 LAPTM5 89553 sc-eQTL 2.00e-01 0.168 0.131 0.227 gdT L2
ENSG00000162517 PEF1 -797569 sc-eQTL 1.44e-01 0.175 0.119 0.227 gdT L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 128823 sc-eQTL 7.41e-01 0.0401 0.121 0.227 gdT L2
ENSG00000287510 AL137857.1 115634 sc-eQTL 4.76e-01 0.0837 0.117 0.227 gdT L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -449461 sc-eQTL 8.63e-01 -0.0178 0.103 0.231 intMono L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -449655 sc-eQTL 2.82e-01 -0.118 0.11 0.231 intMono L2
ENSG00000134644 PUM1 -218664 sc-eQTL 9.11e-01 -0.0105 0.0935 0.231 intMono L2
ENSG00000162511 LAPTM5 89553 sc-eQTL 1.17e-01 -0.115 0.0729 0.231 intMono L2
ENSG00000162512 SDC3 -61431 sc-eQTL 9.03e-01 -0.0123 0.1 0.231 intMono L2
ENSG00000162517 PEF1 -797569 sc-eQTL 6.62e-02 -0.193 0.105 0.231 intMono L2
ENSG00000168528 SERINC2 -562238 sc-eQTL 2.95e-01 0.11 0.105 0.231 intMono L2
ENSG00000284543 LINC01226 -658899 sc-eQTL 3.97e-01 0.0845 0.0995 0.231 intMono L2
ENSG00000287510 AL137857.1 115634 sc-eQTL 5.21e-03 -0.276 0.0978 0.231 intMono L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -449461 sc-eQTL 8.27e-01 -0.0209 0.0952 0.233 ncMono L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -449655 sc-eQTL 9.99e-01 0.000187 0.101 0.233 ncMono L2
ENSG00000134644 PUM1 -218664 sc-eQTL 5.02e-01 0.0557 0.0828 0.233 ncMono L2
ENSG00000162511 LAPTM5 89553 sc-eQTL 3.40e-01 -0.0719 0.0751 0.233 ncMono L2
ENSG00000162512 SDC3 -61431 sc-eQTL 4.61e-01 -0.0623 0.0843 0.233 ncMono L2
ENSG00000162517 PEF1 -797569 sc-eQTL 6.62e-01 -0.0423 0.0968 0.233 ncMono L2
ENSG00000168528 SERINC2 -562238 sc-eQTL 5.08e-01 0.0611 0.0921 0.233 ncMono L2
ENSG00000284543 LINC01226 -658899 sc-eQTL 6.66e-01 -0.0398 0.092 0.233 ncMono L2
ENSG00000287510 AL137857.1 115634 sc-eQTL 8.90e-01 0.0132 0.0955 0.233 ncMono L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -449461 sc-eQTL 5.13e-01 -0.0745 0.114 0.237 pDC L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -449655 sc-eQTL 5.93e-01 -0.0669 0.125 0.237 pDC L2
ENSG00000134644 PUM1 -218664 sc-eQTL 8.08e-01 -0.0252 0.104 0.237 pDC L2
ENSG00000162511 LAPTM5 89553 sc-eQTL 5.64e-01 0.0556 0.0963 0.237 pDC L2
ENSG00000162517 PEF1 -797569 sc-eQTL 7.00e-01 -0.0483 0.125 0.237 pDC L2
ENSG00000168528 SERINC2 -562238 sc-eQTL 9.08e-02 0.197 0.116 0.237 pDC L2
ENSG00000284543 LINC01226 -658899 sc-eQTL 2.18e-01 -0.112 0.0903 0.237 pDC L2
ENSG00000287510 AL137857.1 115634 sc-eQTL 8.17e-01 -0.0247 0.107 0.237 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000060688 SNRNP40 -449461 sc-eQTL 8.04e-01 0.0273 0.11 0.231 B_Memory LOneK1K
ENSG00000121766 ZCCHC17 -449655 sc-eQTL 7.46e-01 -0.0297 0.0917 0.231 B_Memory LOneK1K
ENSG00000134644 PUM1 -218664 sc-eQTL 3.82e-01 0.071 0.0811 0.231 B_Memory LOneK1K
ENSG00000162510 MATN1 123742 sc-eQTL 7.20e-01 0.0332 0.0926 0.231 B_Memory LOneK1K
ENSG00000162511 LAPTM5 89553 sc-eQTL 2.10e-02 0.134 0.0575 0.231 B_Memory LOneK1K
ENSG00000162517 PEF1 -797569 sc-eQTL 1.52e-01 0.138 0.0959 0.231 B_Memory LOneK1K
ENSG00000186056 MATN1-AS1 128823 sc-eQTL 8.02e-01 0.0193 0.077 0.231 B_Memory LOneK1K
ENSG00000287510 AL137857.1 115634 sc-eQTL 4.36e-01 0.0653 0.0838 0.231 B_Memory LOneK1K
ENSG00000060688 SNRNP40 -449461 sc-eQTL 2.17e-01 -0.124 0.1 0.231 B_Naive LOneK1K
ENSG00000121766 ZCCHC17 -449655 sc-eQTL 8.12e-01 -0.0189 0.0796 0.231 B_Naive LOneK1K
ENSG00000134644 PUM1 -218664 sc-eQTL 1.84e-01 0.0999 0.075 0.231 B_Naive LOneK1K
ENSG00000162510 MATN1 123742 sc-eQTL 3.49e-01 -0.0679 0.0723 0.231 B_Naive LOneK1K
ENSG00000162511 LAPTM5 89553 sc-eQTL 2.51e-01 0.0585 0.0509 0.231 B_Naive LOneK1K
ENSG00000162517 PEF1 -797569 sc-eQTL 6.84e-01 0.038 0.0931 0.231 B_Naive LOneK1K
ENSG00000186056 MATN1-AS1 128823 sc-eQTL 4.29e-01 -0.0521 0.0658 0.231 B_Naive LOneK1K
ENSG00000287510 AL137857.1 115634 sc-eQTL 2.26e-01 -0.0947 0.078 0.231 B_Naive LOneK1K
ENSG00000060688 SNRNP40 -449461 sc-eQTL 9.54e-01 0.00482 0.0835 0.231 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000121766 ZCCHC17 -449655 sc-eQTL 6.07e-01 -0.0487 0.0945 0.231 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000134644 PUM1 -218664 sc-eQTL 1.44e-01 -0.088 0.06 0.231 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000162511 LAPTM5 89553 sc-eQTL 7.13e-01 -0.0195 0.053 0.231 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000162512 SDC3 -61431 sc-eQTL 4.40e-02 0.217 0.107 0.231 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000162517 PEF1 -797569 sc-eQTL 2.08e-03 0.232 0.0743 0.231 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000168528 SERINC2 -562238 sc-eQTL 6.01e-01 0.0582 0.111 0.231 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000284543 LINC01226 -658899 sc-eQTL 9.24e-01 0.00876 0.0912 0.231 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000287510 AL137857.1 115634 sc-eQTL 4.63e-01 -0.0627 0.0853 0.231 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000060688 SNRNP40 -449461 sc-eQTL 8.27e-01 0.0198 0.0904 0.233 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000121766 ZCCHC17 -449655 sc-eQTL 3.95e-01 -0.0842 0.0988 0.233 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000134644 PUM1 -218664 sc-eQTL 5.38e-01 0.05 0.081 0.233 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000162511 LAPTM5 89553 sc-eQTL 4.26e-01 -0.0516 0.0648 0.233 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000162512 SDC3 -61431 sc-eQTL 7.49e-01 0.0304 0.0947 0.233 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000162517 PEF1 -797569 sc-eQTL 1.74e-01 -0.117 0.0857 0.233 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000168528 SERINC2 -562238 sc-eQTL 2.35e-01 0.117 0.0979 0.233 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000284543 LINC01226 -658899 sc-eQTL 8.18e-01 0.0215 0.0932 0.233 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000287510 AL137857.1 115634 sc-eQTL 2.71e-01 -0.103 0.0931 0.233 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000060688 SNRNP40 -449461 sc-eQTL 2.15e-01 -0.126 0.101 0.231 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000121753 ADGRB2 -917566 sc-eQTL 7.10e-01 0.0322 0.0865 0.231 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000121766 ZCCHC17 -449655 sc-eQTL 8.40e-02 0.12 0.0689 0.231 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000134644 PUM1 -218664 sc-eQTL 1.07e-01 0.122 0.0756 0.231 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000162511 LAPTM5 89553 sc-eQTL 5.06e-01 -0.0565 0.0849 0.231 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000162517 PEF1 -797569 sc-eQTL 5.70e-01 -0.0368 0.0645 0.231 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000186056 MATN1-AS1 128823 sc-eQTL 6.57e-01 -0.0436 0.098 0.231 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000287510 AL137857.1 115634 sc-eQTL 1.11e-01 -0.135 0.0841 0.231 NK_CD56dim LOneK1K

Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF

Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina
ENSG00000060688 \N -449461 1.28e-06 2.51e-06 3.31e-07 2.03e-06 2.79e-07 6.38e-07 1.36e-06 3.02e-07 1.71e-06 3.78e-07 1.99e-06 9.31e-07 3.54e-06 1.11e-06 4.61e-07 6e-07 9.26e-07 7e-07 7.02e-07 4.74e-07 2.93e-07 1.75e-06 1.64e-06 5.39e-07 2.65e-06 4.32e-07 7.97e-07 8.92e-07 1.74e-06 1.27e-06 1.81e-06 7.12e-08 1.27e-07 7.03e-07 7.08e-07 2.04e-07 7.36e-07 2.54e-07 4.82e-07 3.21e-07 3.05e-07 2.52e-06 1.7e-08 1.83e-07 1.81e-07 1.28e-07 1.46e-07 2.85e-09 4.47e-08
ENSG00000168528 \N -562238 1.29e-06 1.22e-06 1.59e-07 1.28e-06 9.77e-08 4.69e-07 1.47e-06 1.42e-07 1.49e-06 2.98e-07 1.63e-06 5.64e-07 2.61e-06 2.82e-07 3.27e-07 2.89e-07 6.98e-07 5.27e-07 3.26e-07 5.57e-07 2.01e-07 9.46e-07 8.53e-07 1.78e-07 2.24e-06 2.37e-07 5.04e-07 6.23e-07 1.28e-06 1.1e-06 8.49e-07 4.93e-08 5.42e-08 2.33e-07 5.39e-07 6.94e-08 4.68e-07 1.32e-07 1.41e-07 7.66e-08 2.44e-07 1.55e-06 3.99e-08 1.95e-07 1.25e-07 4.43e-08 7.89e-08 1.98e-09 4.99e-08