logo

Genes within 1Mb (chr1:30842777:G:A):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD

Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000060688 SNRNP40 -454011 sc-eQTL 9.83e-01 -0.00238 0.113 0.137 B L1
ENSG00000121766 ZCCHC17 -454205 sc-eQTL 5.49e-01 -0.0542 0.0903 0.137 B L1
ENSG00000134644 PUM1 -223214 sc-eQTL 2.86e-01 0.081 0.0756 0.137 B L1
ENSG00000162510 MATN1 119192 sc-eQTL 2.93e-01 0.0839 0.0795 0.137 B L1
ENSG00000162511 LAPTM5 85003 sc-eQTL 3.45e-01 -0.059 0.0623 0.137 B L1
ENSG00000162517 PEF1 -802119 sc-eQTL 9.85e-01 0.00175 0.0943 0.137 B L1
ENSG00000186056 MATN1-AS1 124273 sc-eQTL 4.27e-01 0.0582 0.0731 0.137 B L1
ENSG00000287510 AL137857.1 111084 sc-eQTL 1.44e-01 0.126 0.0862 0.137 B L1
ENSG00000060688 SNRNP40 -454011 sc-eQTL 7.40e-01 -0.0324 0.0975 0.137 CD4T L1
ENSG00000121766 ZCCHC17 -454205 sc-eQTL 2.67e-01 -0.0846 0.076 0.137 CD4T L1
ENSG00000134644 PUM1 -223214 sc-eQTL 6.04e-01 -0.0352 0.0678 0.137 CD4T L1
ENSG00000162511 LAPTM5 85003 sc-eQTL 2.48e-01 0.0868 0.0749 0.137 CD4T L1
ENSG00000162517 PEF1 -802119 sc-eQTL 9.52e-01 -0.00472 0.0786 0.137 CD4T L1
ENSG00000186056 MATN1-AS1 124273 sc-eQTL 8.83e-02 0.114 0.0668 0.137 CD4T L1
ENSG00000287510 AL137857.1 111084 sc-eQTL 7.74e-01 -0.0231 0.0805 0.137 CD4T L1
ENSG00000060688 SNRNP40 -454011 sc-eQTL 6.50e-01 -0.0588 0.129 0.137 CD8T L1
ENSG00000121766 ZCCHC17 -454205 sc-eQTL 4.82e-01 0.0606 0.0861 0.137 CD8T L1
ENSG00000134644 PUM1 -223214 sc-eQTL 7.32e-01 0.026 0.0759 0.137 CD8T L1
ENSG00000162511 LAPTM5 85003 sc-eQTL 9.95e-01 -0.000502 0.0737 0.137 CD8T L1
ENSG00000162517 PEF1 -802119 sc-eQTL 6.32e-01 0.0436 0.0907 0.137 CD8T L1
ENSG00000186056 MATN1-AS1 124273 sc-eQTL 8.58e-01 0.0155 0.0864 0.137 CD8T L1
ENSG00000287510 AL137857.1 111084 sc-eQTL 7.01e-01 -0.0417 0.108 0.137 CD8T L1
ENSG00000060688 SNRNP40 -454011 sc-eQTL 2.44e-01 0.134 0.115 0.142 DC L1
ENSG00000121766 ZCCHC17 -454205 sc-eQTL 3.07e-02 -0.293 0.134 0.142 DC L1
ENSG00000134644 PUM1 -223214 sc-eQTL 3.24e-01 -0.105 0.106 0.142 DC L1
ENSG00000162511 LAPTM5 85003 sc-eQTL 3.72e-01 -0.068 0.076 0.142 DC L1
ENSG00000162517 PEF1 -802119 sc-eQTL 9.20e-01 0.0123 0.123 0.142 DC L1
ENSG00000168528 SERINC2 -566788 sc-eQTL 3.00e-01 0.13 0.125 0.142 DC L1
ENSG00000284543 LINC01226 -663449 sc-eQTL 1.86e-01 -0.11 0.0828 0.142 DC L1
ENSG00000287510 AL137857.1 111084 sc-eQTL 1.24e-02 0.299 0.118 0.142 DC L1
ENSG00000060688 SNRNP40 -454011 sc-eQTL 7.07e-01 -0.0341 0.0906 0.137 Mono L1
ENSG00000121766 ZCCHC17 -454205 sc-eQTL 6.74e-02 -0.205 0.111 0.137 Mono L1
ENSG00000134644 PUM1 -223214 sc-eQTL 7.13e-01 -0.0266 0.072 0.137 Mono L1
ENSG00000162511 LAPTM5 85003 sc-eQTL 3.36e-01 0.0637 0.0661 0.137 Mono L1
ENSG00000162512 SDC3 -65981 sc-eQTL 2.34e-02 0.287 0.126 0.137 Mono L1
ENSG00000162517 PEF1 -802119 sc-eQTL 1.60e-02 -0.214 0.0881 0.137 Mono L1
ENSG00000168528 SERINC2 -566788 sc-eQTL 7.99e-01 0.0348 0.137 0.137 Mono L1
ENSG00000284543 LINC01226 -663449 sc-eQTL 9.46e-01 0.00814 0.12 0.137 Mono L1
ENSG00000287510 AL137857.1 111084 sc-eQTL 6.11e-01 0.0536 0.105 0.137 Mono L1
ENSG00000060688 SNRNP40 -454011 sc-eQTL 8.56e-01 -0.0225 0.124 0.137 NK L1
ENSG00000121753 ADGRB2 -922116 sc-eQTL 6.23e-01 0.0525 0.107 0.137 NK L1
ENSG00000121766 ZCCHC17 -454205 sc-eQTL 8.63e-01 -0.0147 0.0848 0.137 NK L1
ENSG00000134644 PUM1 -223214 sc-eQTL 5.43e-01 -0.0542 0.0889 0.137 NK L1
ENSG00000162511 LAPTM5 85003 sc-eQTL 5.65e-01 0.0589 0.102 0.137 NK L1
ENSG00000162517 PEF1 -802119 sc-eQTL 8.55e-01 -0.0137 0.0747 0.137 NK L1
ENSG00000186056 MATN1-AS1 124273 sc-eQTL 9.29e-02 0.193 0.114 0.137 NK L1
ENSG00000287510 AL137857.1 111084 sc-eQTL 6.55e-01 0.0476 0.106 0.137 NK L1
ENSG00000060688 SNRNP40 -454011 sc-eQTL 7.00e-01 0.0367 0.0951 0.137 Other_T L1
ENSG00000121766 ZCCHC17 -454205 sc-eQTL 7.17e-01 0.037 0.102 0.137 Other_T L1
ENSG00000134644 PUM1 -223214 sc-eQTL 2.70e-01 0.101 0.0912 0.137 Other_T L1
ENSG00000162511 LAPTM5 85003 sc-eQTL 8.21e-02 0.13 0.0744 0.137 Other_T L1
ENSG00000162517 PEF1 -802119 sc-eQTL 1.88e-01 -0.132 0.0997 0.137 Other_T L1
ENSG00000186056 MATN1-AS1 124273 sc-eQTL 9.27e-01 0.0112 0.123 0.137 Other_T L1
ENSG00000287510 AL137857.1 111084 sc-eQTL 7.08e-01 0.048 0.128 0.137 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000060688 SNRNP40 -454011 sc-eQTL 3.36e-01 -0.139 0.144 0.138 B_Activated L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -454205 sc-eQTL 4.51e-01 -0.11 0.145 0.138 B_Activated L2
ENSG00000134644 PUM1 -223214 sc-eQTL 4.38e-03 0.381 0.132 0.138 B_Activated L2
ENSG00000162510 MATN1 119192 sc-eQTL 6.15e-01 0.0595 0.118 0.138 B_Activated L2
ENSG00000162511 LAPTM5 85003 sc-eQTL 3.99e-03 0.234 0.0804 0.138 B_Activated L2
ENSG00000162517 PEF1 -802119 sc-eQTL 8.73e-01 0.0224 0.14 0.138 B_Activated L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 124273 sc-eQTL 6.97e-01 -0.0517 0.133 0.138 B_Activated L2
ENSG00000287510 AL137857.1 111084 sc-eQTL 9.91e-01 0.00126 0.118 0.138 B_Activated L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -454011 sc-eQTL 2.38e-01 0.166 0.141 0.133 B_Intermediate L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -454205 sc-eQTL 5.65e-01 -0.0677 0.117 0.133 B_Intermediate L2
ENSG00000134644 PUM1 -223214 sc-eQTL 3.02e-01 0.114 0.111 0.133 B_Intermediate L2
ENSG00000162510 MATN1 119192 sc-eQTL 9.62e-01 0.00544 0.115 0.133 B_Intermediate L2
ENSG00000162511 LAPTM5 85003 sc-eQTL 8.80e-01 -0.0107 0.0708 0.133 B_Intermediate L2
ENSG00000162517 PEF1 -802119 sc-eQTL 5.45e-01 -0.0795 0.131 0.133 B_Intermediate L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 124273 sc-eQTL 8.06e-01 0.0244 0.0993 0.133 B_Intermediate L2
ENSG00000287510 AL137857.1 111084 sc-eQTL 5.45e-01 0.0674 0.111 0.133 B_Intermediate L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -454011 sc-eQTL 2.05e-01 0.174 0.137 0.138 B_Memory L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -454205 sc-eQTL 4.87e-01 -0.0881 0.126 0.138 B_Memory L2
ENSG00000134644 PUM1 -223214 sc-eQTL 9.32e-01 -0.00947 0.11 0.138 B_Memory L2
ENSG00000162510 MATN1 119192 sc-eQTL 9.00e-01 0.0133 0.105 0.138 B_Memory L2
ENSG00000162511 LAPTM5 85003 sc-eQTL 8.29e-01 0.0202 0.0934 0.138 B_Memory L2
ENSG00000162517 PEF1 -802119 sc-eQTL 7.97e-02 -0.218 0.124 0.138 B_Memory L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 124273 sc-eQTL 8.64e-01 0.0184 0.107 0.138 B_Memory L2
ENSG00000287510 AL137857.1 111084 sc-eQTL 8.09e-01 0.0303 0.125 0.138 B_Memory L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -454011 sc-eQTL 7.59e-01 -0.0383 0.124 0.137 B_Naive1 L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -454205 sc-eQTL 7.27e-01 -0.0376 0.107 0.137 B_Naive1 L2
ENSG00000134644 PUM1 -223214 sc-eQTL 2.00e-01 0.121 0.0944 0.137 B_Naive1 L2
ENSG00000162510 MATN1 119192 sc-eQTL 4.79e-01 0.0681 0.096 0.137 B_Naive1 L2
ENSG00000162511 LAPTM5 85003 sc-eQTL 2.17e-01 -0.0792 0.064 0.137 B_Naive1 L2
ENSG00000162517 PEF1 -802119 sc-eQTL 8.59e-01 -0.0201 0.113 0.137 B_Naive1 L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 124273 sc-eQTL 7.94e-01 0.022 0.0843 0.137 B_Naive1 L2
ENSG00000287510 AL137857.1 111084 sc-eQTL 1.98e-01 0.134 0.104 0.137 B_Naive1 L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -454011 sc-eQTL 6.20e-01 0.0656 0.132 0.137 B_Naive2 L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -454205 sc-eQTL 2.23e-01 0.133 0.109 0.137 B_Naive2 L2
ENSG00000134644 PUM1 -223214 sc-eQTL 2.65e-01 -0.119 0.107 0.137 B_Naive2 L2
ENSG00000162510 MATN1 119192 sc-eQTL 6.48e-01 0.0469 0.103 0.137 B_Naive2 L2
ENSG00000162511 LAPTM5 85003 sc-eQTL 9.60e-01 0.00354 0.0697 0.137 B_Naive2 L2
ENSG00000162517 PEF1 -802119 sc-eQTL 3.59e-01 0.116 0.126 0.137 B_Naive2 L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 124273 sc-eQTL 4.58e-01 -0.0753 0.101 0.137 B_Naive2 L2
ENSG00000287510 AL137857.1 111084 sc-eQTL 5.28e-02 0.212 0.109 0.137 B_Naive2 L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -454011 sc-eQTL 9.88e-01 -0.00197 0.128 0.136 CD4_CTL L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -454205 sc-eQTL 7.71e-01 0.0368 0.126 0.136 CD4_CTL L2
ENSG00000134644 PUM1 -223214 sc-eQTL 5.13e-01 0.081 0.124 0.136 CD4_CTL L2
ENSG00000162511 LAPTM5 85003 sc-eQTL 4.99e-01 0.0746 0.11 0.136 CD4_CTL L2
ENSG00000162517 PEF1 -802119 sc-eQTL 4.30e-01 -0.0892 0.113 0.136 CD4_CTL L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 124273 sc-eQTL 4.01e-01 0.101 0.12 0.136 CD4_CTL L2
ENSG00000287510 AL137857.1 111084 sc-eQTL 3.33e-01 -0.103 0.106 0.136 CD4_CTL L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -454011 sc-eQTL 3.98e-01 0.0859 0.102 0.137 CD4_Naive L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -454205 sc-eQTL 2.86e-01 -0.0961 0.0899 0.137 CD4_Naive L2
ENSG00000134644 PUM1 -223214 sc-eQTL 5.62e-01 -0.0418 0.0719 0.137 CD4_Naive L2
ENSG00000162511 LAPTM5 85003 sc-eQTL 2.96e-01 0.0806 0.0769 0.137 CD4_Naive L2
ENSG00000162517 PEF1 -802119 sc-eQTL 7.15e-01 -0.0309 0.0845 0.137 CD4_Naive L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 124273 sc-eQTL 1.50e-01 0.112 0.0779 0.137 CD4_Naive L2
ENSG00000287510 AL137857.1 111084 sc-eQTL 4.02e-01 0.0754 0.0897 0.137 CD4_Naive L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -454011 sc-eQTL 7.14e-02 -0.23 0.127 0.137 CD4_TCM L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -454205 sc-eQTL 8.17e-01 -0.0239 0.103 0.137 CD4_TCM L2
ENSG00000134644 PUM1 -223214 sc-eQTL 8.75e-01 0.0144 0.0912 0.137 CD4_TCM L2
ENSG00000162511 LAPTM5 85003 sc-eQTL 3.10e-01 0.0769 0.0755 0.137 CD4_TCM L2
ENSG00000162517 PEF1 -802119 sc-eQTL 7.70e-01 0.0297 0.101 0.137 CD4_TCM L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 124273 sc-eQTL 3.01e-01 0.0993 0.0958 0.137 CD4_TCM L2
ENSG00000287510 AL137857.1 111084 sc-eQTL 3.79e-01 -0.094 0.107 0.137 CD4_TCM L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -454011 sc-eQTL 1.26e-01 -0.196 0.127 0.137 CD4_TEM L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -454205 sc-eQTL 2.73e-01 0.134 0.122 0.137 CD4_TEM L2
ENSG00000134644 PUM1 -223214 sc-eQTL 7.22e-02 -0.182 0.101 0.137 CD4_TEM L2
ENSG00000162511 LAPTM5 85003 sc-eQTL 1.10e-01 0.164 0.102 0.137 CD4_TEM L2
ENSG00000162517 PEF1 -802119 sc-eQTL 3.22e-01 -0.114 0.115 0.137 CD4_TEM L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 124273 sc-eQTL 4.70e-01 0.087 0.12 0.137 CD4_TEM L2
ENSG00000287510 AL137857.1 111084 sc-eQTL 8.32e-01 -0.0252 0.119 0.137 CD4_TEM L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -454011 sc-eQTL 9.85e-01 -0.00272 0.142 0.137 CD8_CTL L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -454205 sc-eQTL 2.66e-01 -0.121 0.108 0.137 CD8_CTL L2
ENSG00000134644 PUM1 -223214 sc-eQTL 4.36e-01 0.0822 0.105 0.137 CD8_CTL L2
ENSG00000162511 LAPTM5 85003 sc-eQTL 2.79e-01 -0.127 0.117 0.137 CD8_CTL L2
ENSG00000162517 PEF1 -802119 sc-eQTL 8.32e-01 0.0216 0.102 0.137 CD8_CTL L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 124273 sc-eQTL 2.18e-01 -0.151 0.122 0.137 CD8_CTL L2
ENSG00000287510 AL137857.1 111084 sc-eQTL 5.71e-01 -0.0655 0.116 0.137 CD8_CTL L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -454011 sc-eQTL 5.31e-01 -0.0814 0.13 0.137 CD8_Naive L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -454205 sc-eQTL 7.98e-01 0.0287 0.112 0.137 CD8_Naive L2
ENSG00000134644 PUM1 -223214 sc-eQTL 2.11e-01 0.113 0.0899 0.137 CD8_Naive L2
ENSG00000162511 LAPTM5 85003 sc-eQTL 3.95e-01 0.0736 0.0863 0.137 CD8_Naive L2
ENSG00000162517 PEF1 -802119 sc-eQTL 7.18e-01 0.0435 0.12 0.137 CD8_Naive L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 124273 sc-eQTL 4.51e-01 0.0814 0.108 0.137 CD8_Naive L2
ENSG00000287510 AL137857.1 111084 sc-eQTL 1.12e-01 -0.186 0.117 0.137 CD8_Naive L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -454011 sc-eQTL 6.81e-01 -0.0582 0.141 0.134 CD8_TCM L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -454205 sc-eQTL 4.96e-01 0.0884 0.13 0.134 CD8_TCM L2
ENSG00000134644 PUM1 -223214 sc-eQTL 3.43e-01 0.116 0.122 0.134 CD8_TCM L2
ENSG00000162511 LAPTM5 85003 sc-eQTL 4.65e-02 -0.253 0.126 0.134 CD8_TCM L2
ENSG00000162517 PEF1 -802119 sc-eQTL 9.07e-01 -0.0152 0.13 0.134 CD8_TCM L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 124273 sc-eQTL 8.32e-01 0.0251 0.118 0.134 CD8_TCM L2
ENSG00000287510 AL137857.1 111084 sc-eQTL 3.27e-01 0.117 0.119 0.134 CD8_TCM L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -454011 sc-eQTL 5.78e-01 -0.0762 0.137 0.135 CD8_TEM L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -454205 sc-eQTL 6.41e-01 0.0613 0.131 0.135 CD8_TEM L2
ENSG00000134644 PUM1 -223214 sc-eQTL 5.07e-01 0.0892 0.134 0.135 CD8_TEM L2
ENSG00000162511 LAPTM5 85003 sc-eQTL 6.87e-01 -0.0509 0.126 0.135 CD8_TEM L2
ENSG00000162517 PEF1 -802119 sc-eQTL 4.93e-01 0.0814 0.119 0.135 CD8_TEM L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 124273 sc-eQTL 6.03e-01 -0.0681 0.131 0.135 CD8_TEM L2
ENSG00000287510 AL137857.1 111084 sc-eQTL 2.33e-01 0.141 0.118 0.135 CD8_TEM L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -454011 sc-eQTL 3.65e-02 0.281 0.134 0.139 MAIT L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -454205 sc-eQTL 9.33e-01 0.01 0.12 0.139 MAIT L2
ENSG00000134644 PUM1 -223214 sc-eQTL 6.86e-02 0.208 0.114 0.139 MAIT L2
ENSG00000162511 LAPTM5 85003 sc-eQTL 9.10e-01 0.0122 0.108 0.139 MAIT L2
ENSG00000162517 PEF1 -802119 sc-eQTL 6.13e-02 -0.222 0.118 0.139 MAIT L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 124273 sc-eQTL 7.49e-01 -0.0386 0.12 0.139 MAIT L2
ENSG00000287510 AL137857.1 111084 sc-eQTL 4.74e-01 -0.0888 0.124 0.139 MAIT L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -454011 sc-eQTL 1.41e-01 -0.2 0.136 0.138 NK_CD56bright L2
ENSG00000121753 ADGRB2 -922116 sc-eQTL 5.10e-01 -0.0705 0.107 0.138 NK_CD56bright L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -454205 sc-eQTL 8.37e-01 0.0238 0.115 0.138 NK_CD56bright L2
ENSG00000134644 PUM1 -223214 sc-eQTL 8.99e-01 -0.0154 0.121 0.138 NK_CD56bright L2
ENSG00000162511 LAPTM5 85003 sc-eQTL 4.13e-01 0.0979 0.119 0.138 NK_CD56bright L2
ENSG00000162517 PEF1 -802119 sc-eQTL 9.27e-01 -0.0107 0.116 0.138 NK_CD56bright L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 124273 sc-eQTL 2.24e-01 0.146 0.12 0.138 NK_CD56bright L2
ENSG00000287510 AL137857.1 111084 sc-eQTL 7.29e-01 0.041 0.118 0.138 NK_CD56bright L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -454011 sc-eQTL 4.00e-01 -0.11 0.13 0.136 NK_CD56dim L2
ENSG00000121753 ADGRB2 -922116 sc-eQTL 8.98e-01 -0.0147 0.114 0.136 NK_CD56dim L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -454205 sc-eQTL 8.31e-01 -0.0206 0.0962 0.136 NK_CD56dim L2
ENSG00000134644 PUM1 -223214 sc-eQTL 6.71e-01 -0.0419 0.0987 0.136 NK_CD56dim L2
ENSG00000162511 LAPTM5 85003 sc-eQTL 3.15e-01 0.106 0.105 0.136 NK_CD56dim L2
ENSG00000162517 PEF1 -802119 sc-eQTL 4.68e-01 0.0681 0.0936 0.136 NK_CD56dim L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 124273 sc-eQTL 1.36e-01 0.196 0.131 0.136 NK_CD56dim L2
ENSG00000287510 AL137857.1 111084 sc-eQTL 6.76e-01 0.0455 0.109 0.136 NK_CD56dim L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -454011 sc-eQTL 5.20e-02 0.266 0.136 0.135 NK_HLA L2
ENSG00000121753 ADGRB2 -922116 sc-eQTL 9.56e-01 -0.006 0.109 0.135 NK_HLA L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -454205 sc-eQTL 7.89e-01 -0.0329 0.123 0.135 NK_HLA L2
ENSG00000134644 PUM1 -223214 sc-eQTL 2.83e-01 -0.128 0.119 0.135 NK_HLA L2
ENSG00000162511 LAPTM5 85003 sc-eQTL 1.74e-01 -0.155 0.113 0.135 NK_HLA L2
ENSG00000162517 PEF1 -802119 sc-eQTL 8.95e-01 -0.017 0.128 0.135 NK_HLA L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 124273 sc-eQTL 3.15e-01 0.122 0.121 0.135 NK_HLA L2
ENSG00000287510 AL137857.1 111084 sc-eQTL 5.57e-01 0.0689 0.117 0.135 NK_HLA L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -454011 sc-eQTL 4.24e-01 0.102 0.127 0.136 NK_cytokine L2
ENSG00000121753 ADGRB2 -922116 sc-eQTL 4.20e-01 0.0927 0.115 0.136 NK_cytokine L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -454205 sc-eQTL 9.80e-01 0.00243 0.0993 0.136 NK_cytokine L2
ENSG00000134644 PUM1 -223214 sc-eQTL 2.47e-01 -0.124 0.107 0.136 NK_cytokine L2
ENSG00000162511 LAPTM5 85003 sc-eQTL 6.18e-01 -0.059 0.118 0.136 NK_cytokine L2
ENSG00000162517 PEF1 -802119 sc-eQTL 6.39e-01 -0.0473 0.101 0.136 NK_cytokine L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 124273 sc-eQTL 9.85e-01 -0.0023 0.125 0.136 NK_cytokine L2
ENSG00000287510 AL137857.1 111084 sc-eQTL 3.25e-01 -0.115 0.116 0.136 NK_cytokine L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -454011 sc-eQTL 7.10e-01 0.0493 0.132 0.156 PB L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -454205 sc-eQTL 1.83e-01 -0.204 0.152 0.156 PB L2
ENSG00000134644 PUM1 -223214 sc-eQTL 7.35e-01 -0.0452 0.133 0.156 PB L2
ENSG00000162510 MATN1 119192 sc-eQTL 2.81e-01 0.134 0.124 0.156 PB L2
ENSG00000162511 LAPTM5 85003 sc-eQTL 2.70e-01 -0.0979 0.0883 0.156 PB L2
ENSG00000162517 PEF1 -802119 sc-eQTL 5.89e-01 -0.074 0.137 0.156 PB L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 124273 sc-eQTL 6.10e-01 -0.062 0.121 0.156 PB L2
ENSG00000287510 AL137857.1 111084 sc-eQTL 8.72e-03 0.335 0.125 0.156 PB L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -454011 sc-eQTL 7.73e-01 -0.0279 0.0966 0.139 Pro_T L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -454205 sc-eQTL 8.88e-01 0.0173 0.123 0.139 Pro_T L2
ENSG00000134644 PUM1 -223214 sc-eQTL 2.63e-02 -0.253 0.113 0.139 Pro_T L2
ENSG00000162511 LAPTM5 85003 sc-eQTL 1.03e-01 0.134 0.0815 0.139 Pro_T L2
ENSG00000162517 PEF1 -802119 sc-eQTL 5.78e-01 0.0671 0.12 0.139 Pro_T L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 124273 sc-eQTL 5.77e-01 0.064 0.115 0.139 Pro_T L2
ENSG00000287510 AL137857.1 111084 sc-eQTL 3.83e-01 0.092 0.105 0.139 Pro_T L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -454011 sc-eQTL 5.68e-01 -0.0767 0.134 0.137 Treg L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -454205 sc-eQTL 9.53e-01 0.00766 0.13 0.137 Treg L2
ENSG00000134644 PUM1 -223214 sc-eQTL 6.95e-01 0.0408 0.104 0.137 Treg L2
ENSG00000162511 LAPTM5 85003 sc-eQTL 8.13e-01 0.0281 0.119 0.137 Treg L2
ENSG00000162517 PEF1 -802119 sc-eQTL 4.16e-01 0.105 0.128 0.137 Treg L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 124273 sc-eQTL 7.50e-01 -0.0386 0.121 0.137 Treg L2
ENSG00000287510 AL137857.1 111084 sc-eQTL 2.31e-01 0.145 0.121 0.137 Treg L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -454011 sc-eQTL 3.60e-01 0.121 0.132 0.132 cDC L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -454205 sc-eQTL 2.10e-01 -0.18 0.143 0.132 cDC L2
ENSG00000134644 PUM1 -223214 sc-eQTL 6.08e-01 -0.0632 0.123 0.132 cDC L2
ENSG00000162511 LAPTM5 85003 sc-eQTL 6.54e-01 0.0387 0.0864 0.132 cDC L2
ENSG00000162517 PEF1 -802119 sc-eQTL 4.45e-01 0.0957 0.125 0.132 cDC L2
ENSG00000168528 SERINC2 -566788 sc-eQTL 9.98e-01 -0.000318 0.111 0.132 cDC L2
ENSG00000284543 LINC01226 -663449 sc-eQTL 4.60e-01 -0.0806 0.109 0.132 cDC L2
ENSG00000287510 AL137857.1 111084 sc-eQTL 1.32e-02 0.289 0.115 0.132 cDC L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -454011 sc-eQTL 8.82e-01 -0.016 0.108 0.137 cMono_IL1B L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -454205 sc-eQTL 5.26e-01 -0.0763 0.12 0.137 cMono_IL1B L2
ENSG00000134644 PUM1 -223214 sc-eQTL 3.19e-01 -0.0812 0.0813 0.137 cMono_IL1B L2
ENSG00000162511 LAPTM5 85003 sc-eQTL 9.73e-01 0.00241 0.0715 0.137 cMono_IL1B L2
ENSG00000162512 SDC3 -65981 sc-eQTL 3.79e-01 0.119 0.134 0.137 cMono_IL1B L2
ENSG00000162517 PEF1 -802119 sc-eQTL 8.70e-01 -0.0181 0.11 0.137 cMono_IL1B L2
ENSG00000168528 SERINC2 -566788 sc-eQTL 7.28e-01 0.0475 0.136 0.137 cMono_IL1B L2
ENSG00000284543 LINC01226 -663449 sc-eQTL 3.85e-01 0.105 0.12 0.137 cMono_IL1B L2
ENSG00000287510 AL137857.1 111084 sc-eQTL 4.91e-01 0.0774 0.112 0.137 cMono_IL1B L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -454011 sc-eQTL 9.55e-01 0.00633 0.112 0.137 cMono_S100A L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -454205 sc-eQTL 1.90e-02 -0.308 0.131 0.137 cMono_S100A L2
ENSG00000134644 PUM1 -223214 sc-eQTL 7.62e-01 -0.0289 0.0956 0.137 cMono_S100A L2
ENSG00000162511 LAPTM5 85003 sc-eQTL 1.72e-01 0.1 0.0731 0.137 cMono_S100A L2
ENSG00000162512 SDC3 -65981 sc-eQTL 3.49e-02 0.267 0.126 0.137 cMono_S100A L2
ENSG00000162517 PEF1 -802119 sc-eQTL 3.93e-01 -0.098 0.114 0.137 cMono_S100A L2
ENSG00000168528 SERINC2 -566788 sc-eQTL 3.97e-01 0.114 0.134 0.137 cMono_S100A L2
ENSG00000284543 LINC01226 -663449 sc-eQTL 3.25e-01 -0.107 0.109 0.137 cMono_S100A L2
ENSG00000287510 AL137857.1 111084 sc-eQTL 8.81e-01 0.0165 0.11 0.137 cMono_S100A L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -454011 sc-eQTL 9.05e-01 0.0205 0.171 0.121 gdT L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -454205 sc-eQTL 7.08e-01 0.0553 0.147 0.121 gdT L2
ENSG00000134644 PUM1 -223214 sc-eQTL 7.97e-01 -0.0392 0.152 0.121 gdT L2
ENSG00000162511 LAPTM5 85003 sc-eQTL 1.86e-01 0.218 0.164 0.121 gdT L2
ENSG00000162517 PEF1 -802119 sc-eQTL 6.70e-01 -0.0643 0.151 0.121 gdT L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 124273 sc-eQTL 7.93e-01 -0.04 0.152 0.121 gdT L2
ENSG00000287510 AL137857.1 111084 sc-eQTL 1.17e-01 0.23 0.146 0.121 gdT L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -454011 sc-eQTL 9.94e-01 -0.000915 0.126 0.138 intMono L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -454205 sc-eQTL 5.24e-01 -0.0862 0.135 0.138 intMono L2
ENSG00000134644 PUM1 -223214 sc-eQTL 8.38e-01 -0.0235 0.115 0.138 intMono L2
ENSG00000162511 LAPTM5 85003 sc-eQTL 5.94e-01 0.0481 0.09 0.138 intMono L2
ENSG00000162512 SDC3 -65981 sc-eQTL 5.54e-01 0.073 0.123 0.138 intMono L2
ENSG00000162517 PEF1 -802119 sc-eQTL 8.74e-02 -0.221 0.129 0.138 intMono L2
ENSG00000168528 SERINC2 -566788 sc-eQTL 1.84e-01 0.171 0.128 0.138 intMono L2
ENSG00000284543 LINC01226 -663449 sc-eQTL 6.95e-01 0.0481 0.122 0.138 intMono L2
ENSG00000287510 AL137857.1 111084 sc-eQTL 4.74e-01 -0.0876 0.122 0.138 intMono L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -454011 sc-eQTL 6.60e-01 -0.0509 0.115 0.143 ncMono L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -454205 sc-eQTL 9.31e-02 0.206 0.122 0.143 ncMono L2
ENSG00000134644 PUM1 -223214 sc-eQTL 5.22e-01 0.0645 0.101 0.143 ncMono L2
ENSG00000162511 LAPTM5 85003 sc-eQTL 5.60e-01 0.0533 0.0913 0.143 ncMono L2
ENSG00000162512 SDC3 -65981 sc-eQTL 2.94e-01 0.108 0.102 0.143 ncMono L2
ENSG00000162517 PEF1 -802119 sc-eQTL 9.60e-01 0.00596 0.117 0.143 ncMono L2
ENSG00000168528 SERINC2 -566788 sc-eQTL 2.99e-01 0.116 0.112 0.143 ncMono L2
ENSG00000284543 LINC01226 -663449 sc-eQTL 2.15e-01 0.138 0.111 0.143 ncMono L2
ENSG00000287510 AL137857.1 111084 sc-eQTL 6.08e-01 -0.0594 0.116 0.143 ncMono L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -454011 sc-eQTL 6.42e-01 0.0598 0.128 0.141 pDC L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -454205 sc-eQTL 1.12e-02 -0.354 0.138 0.141 pDC L2
ENSG00000134644 PUM1 -223214 sc-eQTL 1.47e-01 -0.169 0.116 0.141 pDC L2
ENSG00000162511 LAPTM5 85003 sc-eQTL 2.15e-01 -0.135 0.108 0.141 pDC L2
ENSG00000162517 PEF1 -802119 sc-eQTL 6.84e-01 0.0574 0.141 0.141 pDC L2
ENSG00000168528 SERINC2 -566788 sc-eQTL 2.81e-01 0.142 0.131 0.141 pDC L2
ENSG00000284543 LINC01226 -663449 sc-eQTL 4.68e-02 -0.202 0.101 0.141 pDC L2
ENSG00000287510 AL137857.1 111084 sc-eQTL 7.04e-01 0.0457 0.12 0.141 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000060688 SNRNP40 -454011 sc-eQTL 7.46e-02 0.242 0.135 0.137 B_Memory LOneK1K
ENSG00000121766 ZCCHC17 -454205 sc-eQTL 2.55e-01 -0.129 0.113 0.137 B_Memory LOneK1K
ENSG00000134644 PUM1 -223214 sc-eQTL 3.85e-01 0.0873 0.1 0.137 B_Memory LOneK1K
ENSG00000162510 MATN1 119192 sc-eQTL 5.93e-01 0.0612 0.115 0.137 B_Memory LOneK1K
ENSG00000162511 LAPTM5 85003 sc-eQTL 6.53e-01 0.0324 0.072 0.137 B_Memory LOneK1K
ENSG00000162517 PEF1 -802119 sc-eQTL 1.02e-01 -0.195 0.119 0.137 B_Memory LOneK1K
ENSG00000186056 MATN1-AS1 124273 sc-eQTL 7.68e-01 0.0281 0.0952 0.137 B_Memory LOneK1K
ENSG00000287510 AL137857.1 111084 sc-eQTL 8.72e-01 -0.0168 0.104 0.137 B_Memory LOneK1K
ENSG00000060688 SNRNP40 -454011 sc-eQTL 6.18e-01 0.0607 0.122 0.137 B_Naive LOneK1K
ENSG00000121766 ZCCHC17 -454205 sc-eQTL 8.90e-01 0.0133 0.0962 0.137 B_Naive LOneK1K
ENSG00000134644 PUM1 -223214 sc-eQTL 7.97e-01 0.0234 0.091 0.137 B_Naive LOneK1K
ENSG00000162510 MATN1 119192 sc-eQTL 3.32e-01 0.0851 0.0874 0.137 B_Naive LOneK1K
ENSG00000162511 LAPTM5 85003 sc-eQTL 1.35e-01 -0.092 0.0613 0.137 B_Naive LOneK1K
ENSG00000162517 PEF1 -802119 sc-eQTL 5.16e-01 0.0732 0.112 0.137 B_Naive LOneK1K
ENSG00000186056 MATN1-AS1 124273 sc-eQTL 6.74e-01 0.0335 0.0796 0.137 B_Naive LOneK1K
ENSG00000287510 AL137857.1 111084 sc-eQTL 3.16e-01 0.0949 0.0944 0.137 B_Naive LOneK1K
ENSG00000060688 SNRNP40 -454011 sc-eQTL 6.53e-01 -0.0462 0.103 0.137 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000121766 ZCCHC17 -454205 sc-eQTL 5.72e-02 -0.22 0.115 0.137 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000134644 PUM1 -223214 sc-eQTL 4.64e-01 -0.0543 0.0741 0.137 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000162511 LAPTM5 85003 sc-eQTL 3.45e-01 0.0615 0.0651 0.137 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000162512 SDC3 -65981 sc-eQTL 5.61e-02 0.253 0.132 0.137 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000162517 PEF1 -802119 sc-eQTL 1.93e-01 -0.122 0.0931 0.137 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000168528 SERINC2 -566788 sc-eQTL 6.47e-01 0.0628 0.137 0.137 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000284543 LINC01226 -663449 sc-eQTL 8.67e-01 -0.0189 0.112 0.137 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000287510 AL137857.1 111084 sc-eQTL 4.10e-01 0.0866 0.105 0.137 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000060688 SNRNP40 -454011 sc-eQTL 7.20e-01 0.0405 0.113 0.138 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000121766 ZCCHC17 -454205 sc-eQTL 8.48e-01 -0.0237 0.123 0.138 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000134644 PUM1 -223214 sc-eQTL 4.53e-01 0.0759 0.101 0.138 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000162511 LAPTM5 85003 sc-eQTL 4.99e-01 0.0547 0.0807 0.138 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000162512 SDC3 -65981 sc-eQTL 5.52e-01 0.0702 0.118 0.138 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000162517 PEF1 -802119 sc-eQTL 1.16e-01 -0.168 0.107 0.138 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000168528 SERINC2 -566788 sc-eQTL 2.24e-01 0.149 0.122 0.138 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000284543 LINC01226 -663449 sc-eQTL 6.73e-01 0.0491 0.116 0.138 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000287510 AL137857.1 111084 sc-eQTL 6.56e-01 -0.0519 0.116 0.138 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000060688 SNRNP40 -454011 sc-eQTL 9.61e-01 0.00606 0.124 0.136 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000121753 ADGRB2 -922116 sc-eQTL 5.52e-01 0.0631 0.106 0.136 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000121766 ZCCHC17 -454205 sc-eQTL 8.19e-01 -0.0195 0.0849 0.136 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000134644 PUM1 -223214 sc-eQTL 5.04e-01 -0.0623 0.0929 0.136 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000162511 LAPTM5 85003 sc-eQTL 5.47e-01 0.0627 0.104 0.136 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000162517 PEF1 -802119 sc-eQTL 9.12e-01 -0.00878 0.079 0.136 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000186056 MATN1-AS1 124273 sc-eQTL 2.87e-01 0.128 0.12 0.136 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000287510 AL137857.1 111084 sc-eQTL 5.54e-01 0.0612 0.103 0.136 NK_CD56dim LOneK1K

Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF
ENSG00000162511 LAPTM5 85003 eQTL 0.032 -0.0313 0.0146 0.0 0.0 0.129

Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina