logo

Genes within 1Mb (chr1:30842439:C:A):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD

Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000060688 SNRNP40 -454349 sc-eQTL 7.55e-01 -0.0318 0.102 0.175 B L1
ENSG00000121766 ZCCHC17 -454543 sc-eQTL 8.78e-01 -0.0126 0.0815 0.175 B L1
ENSG00000134644 PUM1 -223552 sc-eQTL 1.19e-01 0.107 0.068 0.175 B L1
ENSG00000162510 MATN1 118854 sc-eQTL 8.85e-01 -0.0104 0.0719 0.175 B L1
ENSG00000162511 LAPTM5 84665 sc-eQTL 2.08e-01 0.0709 0.0561 0.175 B L1
ENSG00000162517 PEF1 -802457 sc-eQTL 3.52e-02 0.178 0.0841 0.175 B L1
ENSG00000186056 MATN1-AS1 123935 sc-eQTL 4.58e-01 -0.049 0.0659 0.175 B L1
ENSG00000287510 AL137857.1 110746 sc-eQTL 7.39e-01 0.0261 0.0781 0.175 B L1
ENSG00000060688 SNRNP40 -454349 sc-eQTL 7.95e-02 0.149 0.0845 0.175 CD4T L1
ENSG00000121766 ZCCHC17 -454543 sc-eQTL 7.22e-01 -0.0237 0.0665 0.175 CD4T L1
ENSG00000134644 PUM1 -223552 sc-eQTL 1.81e-01 0.0792 0.059 0.175 CD4T L1
ENSG00000162511 LAPTM5 84665 sc-eQTL 5.69e-01 0.0374 0.0656 0.175 CD4T L1
ENSG00000162517 PEF1 -802457 sc-eQTL 4.30e-01 0.0542 0.0685 0.175 CD4T L1
ENSG00000186056 MATN1-AS1 123935 sc-eQTL 5.34e-01 -0.0365 0.0587 0.175 CD4T L1
ENSG00000287510 AL137857.1 110746 sc-eQTL 8.89e-01 0.00983 0.0703 0.175 CD4T L1
ENSG00000060688 SNRNP40 -454349 sc-eQTL 9.87e-02 0.184 0.111 0.175 CD8T L1
ENSG00000121766 ZCCHC17 -454543 sc-eQTL 4.50e-01 -0.0561 0.0741 0.175 CD8T L1
ENSG00000134644 PUM1 -223552 sc-eQTL 8.54e-01 -0.012 0.0653 0.175 CD8T L1
ENSG00000162511 LAPTM5 84665 sc-eQTL 8.08e-01 -0.0154 0.0635 0.175 CD8T L1
ENSG00000162517 PEF1 -802457 sc-eQTL 2.33e-01 0.0931 0.0779 0.175 CD8T L1
ENSG00000186056 MATN1-AS1 123935 sc-eQTL 6.25e-01 -0.0364 0.0743 0.175 CD8T L1
ENSG00000287510 AL137857.1 110746 sc-eQTL 9.66e-01 -0.00403 0.0935 0.175 CD8T L1
ENSG00000060688 SNRNP40 -454349 sc-eQTL 4.67e-02 -0.194 0.0967 0.18 DC L1
ENSG00000121766 ZCCHC17 -454543 sc-eQTL 7.65e-01 -0.0346 0.116 0.18 DC L1
ENSG00000134644 PUM1 -223552 sc-eQTL 6.06e-01 0.0467 0.0906 0.18 DC L1
ENSG00000162511 LAPTM5 84665 sc-eQTL 5.32e-01 -0.0405 0.0646 0.18 DC L1
ENSG00000162517 PEF1 -802457 sc-eQTL 4.78e-01 -0.0745 0.105 0.18 DC L1
ENSG00000168528 SERINC2 -567126 sc-eQTL 9.20e-01 0.0107 0.107 0.18 DC L1
ENSG00000284543 LINC01226 -663787 sc-eQTL 3.89e-02 -0.145 0.0699 0.18 DC L1
ENSG00000287510 AL137857.1 110746 sc-eQTL 6.46e-01 -0.0471 0.102 0.18 DC L1
ENSG00000060688 SNRNP40 -454349 sc-eQTL 9.72e-01 0.00277 0.0776 0.175 Mono L1
ENSG00000121766 ZCCHC17 -454543 sc-eQTL 8.07e-01 0.0235 0.0962 0.175 Mono L1
ENSG00000134644 PUM1 -223552 sc-eQTL 2.28e-01 0.0743 0.0615 0.175 Mono L1
ENSG00000162511 LAPTM5 84665 sc-eQTL 3.24e-01 0.0559 0.0566 0.175 Mono L1
ENSG00000162512 SDC3 -66319 sc-eQTL 9.02e-01 -0.0135 0.109 0.175 Mono L1
ENSG00000162517 PEF1 -802457 sc-eQTL 5.66e-03 0.21 0.0751 0.175 Mono L1
ENSG00000168528 SERINC2 -567126 sc-eQTL 4.83e-01 0.0821 0.117 0.175 Mono L1
ENSG00000284543 LINC01226 -663787 sc-eQTL 3.40e-01 0.0983 0.103 0.175 Mono L1
ENSG00000287510 AL137857.1 110746 sc-eQTL 2.61e-02 0.199 0.089 0.175 Mono L1
ENSG00000060688 SNRNP40 -454349 sc-eQTL 1.88e-02 0.251 0.106 0.176 NK L1
ENSG00000121753 ADGRB2 -922454 sc-eQTL 4.04e-01 0.0771 0.0922 0.176 NK L1
ENSG00000121766 ZCCHC17 -454543 sc-eQTL 3.93e-01 0.0627 0.0733 0.176 NK L1
ENSG00000134644 PUM1 -223552 sc-eQTL 3.04e-01 0.0791 0.0768 0.176 NK L1
ENSG00000162511 LAPTM5 84665 sc-eQTL 7.94e-02 -0.155 0.088 0.176 NK L1
ENSG00000162517 PEF1 -802457 sc-eQTL 3.40e-01 0.0618 0.0646 0.176 NK L1
ENSG00000186056 MATN1-AS1 123935 sc-eQTL 7.18e-01 -0.036 0.0996 0.176 NK L1
ENSG00000287510 AL137857.1 110746 sc-eQTL 4.96e-01 -0.0627 0.0919 0.176 NK L1
ENSG00000060688 SNRNP40 -454349 sc-eQTL 1.51e-01 0.116 0.0805 0.175 Other_T L1
ENSG00000121766 ZCCHC17 -454543 sc-eQTL 9.61e-02 -0.144 0.0859 0.175 Other_T L1
ENSG00000134644 PUM1 -223552 sc-eQTL 2.56e-01 -0.0883 0.0775 0.175 Other_T L1
ENSG00000162511 LAPTM5 84665 sc-eQTL 3.74e-01 0.0566 0.0636 0.175 Other_T L1
ENSG00000162517 PEF1 -802457 sc-eQTL 7.02e-01 0.0326 0.0851 0.175 Other_T L1
ENSG00000186056 MATN1-AS1 123935 sc-eQTL 1.45e-01 0.152 0.104 0.175 Other_T L1
ENSG00000287510 AL137857.1 110746 sc-eQTL 4.19e-01 0.0878 0.109 0.175 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000060688 SNRNP40 -454349 sc-eQTL 3.71e-01 -0.114 0.127 0.184 B_Activated L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -454543 sc-eQTL 1.91e-01 -0.168 0.128 0.184 B_Activated L2
ENSG00000134644 PUM1 -223552 sc-eQTL 2.10e-01 0.15 0.119 0.184 B_Activated L2
ENSG00000162510 MATN1 118854 sc-eQTL 2.17e-01 -0.129 0.104 0.184 B_Activated L2
ENSG00000162511 LAPTM5 84665 sc-eQTL 9.25e-01 -0.00685 0.0729 0.184 B_Activated L2
ENSG00000162517 PEF1 -802457 sc-eQTL 7.34e-01 -0.0422 0.124 0.184 B_Activated L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 123935 sc-eQTL 7.50e-01 0.0375 0.118 0.184 B_Activated L2
ENSG00000287510 AL137857.1 110746 sc-eQTL 1.13e-01 0.165 0.103 0.184 B_Activated L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -454349 sc-eQTL 9.77e-01 -0.00353 0.124 0.176 B_Intermediate L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -454543 sc-eQTL 3.65e-01 0.0934 0.103 0.176 B_Intermediate L2
ENSG00000134644 PUM1 -223552 sc-eQTL 9.03e-01 -0.0118 0.0972 0.176 B_Intermediate L2
ENSG00000162510 MATN1 118854 sc-eQTL 7.31e-01 -0.0348 0.101 0.176 B_Intermediate L2
ENSG00000162511 LAPTM5 84665 sc-eQTL 9.69e-02 0.103 0.0617 0.176 B_Intermediate L2
ENSG00000162517 PEF1 -802457 sc-eQTL 5.12e-03 0.32 0.113 0.176 B_Intermediate L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 123935 sc-eQTL 2.15e-01 -0.108 0.0868 0.176 B_Intermediate L2
ENSG00000287510 AL137857.1 110746 sc-eQTL 8.41e-01 0.0196 0.0975 0.176 B_Intermediate L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -454349 sc-eQTL 4.79e-01 -0.0866 0.122 0.177 B_Memory L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -454543 sc-eQTL 6.07e-01 -0.058 0.113 0.177 B_Memory L2
ENSG00000134644 PUM1 -223552 sc-eQTL 5.70e-01 0.0557 0.0979 0.177 B_Memory L2
ENSG00000162510 MATN1 118854 sc-eQTL 3.25e-01 0.0923 0.0935 0.177 B_Memory L2
ENSG00000162511 LAPTM5 84665 sc-eQTL 3.75e-01 0.0738 0.0829 0.177 B_Memory L2
ENSG00000162517 PEF1 -802457 sc-eQTL 3.61e-01 0.101 0.111 0.177 B_Memory L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 123935 sc-eQTL 1.11e-01 0.151 0.0945 0.177 B_Memory L2
ENSG00000287510 AL137857.1 110746 sc-eQTL 9.38e-01 -0.00866 0.111 0.177 B_Memory L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -454349 sc-eQTL 2.93e-01 -0.114 0.108 0.175 B_Naive1 L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -454543 sc-eQTL 2.60e-01 -0.105 0.0931 0.175 B_Naive1 L2
ENSG00000134644 PUM1 -223552 sc-eQTL 6.87e-01 -0.0332 0.0824 0.175 B_Naive1 L2
ENSG00000162510 MATN1 118854 sc-eQTL 9.44e-01 -0.00583 0.0836 0.175 B_Naive1 L2
ENSG00000162511 LAPTM5 84665 sc-eQTL 2.20e-01 0.0684 0.0556 0.175 B_Naive1 L2
ENSG00000162517 PEF1 -802457 sc-eQTL 6.25e-01 -0.0482 0.0984 0.175 B_Naive1 L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 123935 sc-eQTL 5.79e-01 -0.0407 0.0733 0.175 B_Naive1 L2
ENSG00000287510 AL137857.1 110746 sc-eQTL 4.99e-01 0.0613 0.0905 0.175 B_Naive1 L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -454349 sc-eQTL 4.23e-01 0.0913 0.114 0.176 B_Naive2 L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -454543 sc-eQTL 8.97e-01 -0.0123 0.0941 0.176 B_Naive2 L2
ENSG00000134644 PUM1 -223552 sc-eQTL 2.60e-01 0.104 0.0918 0.176 B_Naive2 L2
ENSG00000162510 MATN1 118854 sc-eQTL 9.71e-01 0.00318 0.0884 0.176 B_Naive2 L2
ENSG00000162511 LAPTM5 84665 sc-eQTL 1.16e-01 0.0942 0.0597 0.176 B_Naive2 L2
ENSG00000162517 PEF1 -802457 sc-eQTL 5.00e-01 0.0737 0.109 0.176 B_Naive2 L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 123935 sc-eQTL 5.16e-01 0.0569 0.0874 0.176 B_Naive2 L2
ENSG00000287510 AL137857.1 110746 sc-eQTL 7.93e-01 0.0249 0.0944 0.176 B_Naive2 L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -454349 sc-eQTL 6.72e-01 -0.049 0.115 0.182 CD4_CTL L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -454543 sc-eQTL 4.52e-01 0.0855 0.113 0.182 CD4_CTL L2
ENSG00000134644 PUM1 -223552 sc-eQTL 4.25e-01 -0.089 0.111 0.182 CD4_CTL L2
ENSG00000162511 LAPTM5 84665 sc-eQTL 6.02e-01 0.0519 0.0993 0.182 CD4_CTL L2
ENSG00000162517 PEF1 -802457 sc-eQTL 4.91e-01 0.0701 0.102 0.182 CD4_CTL L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 123935 sc-eQTL 4.17e-01 -0.0881 0.108 0.182 CD4_CTL L2
ENSG00000287510 AL137857.1 110746 sc-eQTL 5.99e-01 0.0505 0.0958 0.182 CD4_CTL L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -454349 sc-eQTL 6.60e-02 0.163 0.0883 0.175 CD4_Naive L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -454543 sc-eQTL 1.93e-01 -0.103 0.0786 0.175 CD4_Naive L2
ENSG00000134644 PUM1 -223552 sc-eQTL 8.80e-02 0.107 0.0626 0.175 CD4_Naive L2
ENSG00000162511 LAPTM5 84665 sc-eQTL 2.65e-01 0.0752 0.0673 0.175 CD4_Naive L2
ENSG00000162517 PEF1 -802457 sc-eQTL 1.70e-01 0.102 0.0737 0.175 CD4_Naive L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 123935 sc-eQTL 4.49e-01 -0.0519 0.0684 0.175 CD4_Naive L2
ENSG00000287510 AL137857.1 110746 sc-eQTL 5.69e-01 0.0449 0.0786 0.175 CD4_Naive L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -454349 sc-eQTL 4.30e-01 0.0883 0.112 0.175 CD4_TCM L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -454543 sc-eQTL 3.62e-01 0.0822 0.09 0.175 CD4_TCM L2
ENSG00000134644 PUM1 -223552 sc-eQTL 4.63e-01 0.0586 0.0797 0.175 CD4_TCM L2
ENSG00000162511 LAPTM5 84665 sc-eQTL 6.69e-01 -0.0283 0.0662 0.175 CD4_TCM L2
ENSG00000162517 PEF1 -802457 sc-eQTL 8.34e-01 0.0186 0.0887 0.175 CD4_TCM L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 123935 sc-eQTL 3.97e-01 -0.0712 0.0838 0.175 CD4_TCM L2
ENSG00000287510 AL137857.1 110746 sc-eQTL 4.61e-01 -0.0689 0.0934 0.175 CD4_TCM L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -454349 sc-eQTL 4.65e-01 0.0808 0.11 0.175 CD4_TEM L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -454543 sc-eQTL 4.05e-01 -0.0877 0.105 0.175 CD4_TEM L2
ENSG00000134644 PUM1 -223552 sc-eQTL 2.65e-01 0.0978 0.0875 0.175 CD4_TEM L2
ENSG00000162511 LAPTM5 84665 sc-eQTL 9.59e-01 -0.00456 0.0887 0.175 CD4_TEM L2
ENSG00000162517 PEF1 -802457 sc-eQTL 5.63e-01 -0.0575 0.0993 0.175 CD4_TEM L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 123935 sc-eQTL 9.48e-01 -0.00676 0.104 0.175 CD4_TEM L2
ENSG00000287510 AL137857.1 110746 sc-eQTL 3.53e-01 -0.0949 0.102 0.175 CD4_TEM L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -454349 sc-eQTL 4.96e-01 0.0841 0.123 0.175 CD8_CTL L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -454543 sc-eQTL 9.60e-01 0.0048 0.0946 0.175 CD8_CTL L2
ENSG00000134644 PUM1 -223552 sc-eQTL 9.53e-01 0.00544 0.0919 0.175 CD8_CTL L2
ENSG00000162511 LAPTM5 84665 sc-eQTL 2.43e-01 -0.119 0.101 0.175 CD8_CTL L2
ENSG00000162517 PEF1 -802457 sc-eQTL 2.63e-01 -0.0991 0.0884 0.175 CD8_CTL L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 123935 sc-eQTL 2.68e-01 -0.118 0.107 0.175 CD8_CTL L2
ENSG00000287510 AL137857.1 110746 sc-eQTL 8.30e-01 -0.0216 0.101 0.175 CD8_CTL L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -454349 sc-eQTL 8.16e-02 0.192 0.11 0.175 CD8_Naive L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -454543 sc-eQTL 8.20e-01 -0.0218 0.0954 0.175 CD8_Naive L2
ENSG00000134644 PUM1 -223552 sc-eQTL 7.22e-01 0.0273 0.0768 0.175 CD8_Naive L2
ENSG00000162511 LAPTM5 84665 sc-eQTL 1.07e-01 0.119 0.0732 0.175 CD8_Naive L2
ENSG00000162517 PEF1 -802457 sc-eQTL 8.00e-01 -0.0259 0.102 0.175 CD8_Naive L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 123935 sc-eQTL 8.90e-01 0.0128 0.0919 0.175 CD8_Naive L2
ENSG00000287510 AL137857.1 110746 sc-eQTL 9.71e-01 0.00365 0.1 0.175 CD8_Naive L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -454349 sc-eQTL 7.15e-01 0.0448 0.123 0.174 CD8_TCM L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -454543 sc-eQTL 9.78e-01 -0.00313 0.112 0.174 CD8_TCM L2
ENSG00000134644 PUM1 -223552 sc-eQTL 3.41e-01 -0.101 0.105 0.174 CD8_TCM L2
ENSG00000162511 LAPTM5 84665 sc-eQTL 3.35e-01 0.107 0.11 0.174 CD8_TCM L2
ENSG00000162517 PEF1 -802457 sc-eQTL 5.22e-01 0.0724 0.113 0.174 CD8_TCM L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 123935 sc-eQTL 1.70e-01 0.14 0.102 0.174 CD8_TCM L2
ENSG00000287510 AL137857.1 110746 sc-eQTL 1.53e-01 -0.148 0.103 0.174 CD8_TCM L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -454349 sc-eQTL 9.30e-01 0.0106 0.121 0.174 CD8_TEM L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -454543 sc-eQTL 4.50e-01 -0.0877 0.116 0.174 CD8_TEM L2
ENSG00000134644 PUM1 -223552 sc-eQTL 6.92e-01 -0.047 0.119 0.174 CD8_TEM L2
ENSG00000162511 LAPTM5 84665 sc-eQTL 5.00e-02 0.218 0.11 0.174 CD8_TEM L2
ENSG00000162517 PEF1 -802457 sc-eQTL 5.26e-02 0.203 0.104 0.174 CD8_TEM L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 123935 sc-eQTL 6.99e-01 -0.0448 0.116 0.174 CD8_TEM L2
ENSG00000287510 AL137857.1 110746 sc-eQTL 9.86e-01 0.00187 0.105 0.174 CD8_TEM L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -454349 sc-eQTL 4.28e-01 0.0921 0.116 0.177 MAIT L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -454543 sc-eQTL 5.35e-02 -0.198 0.102 0.177 MAIT L2
ENSG00000134644 PUM1 -223552 sc-eQTL 1.14e-01 -0.156 0.0981 0.177 MAIT L2
ENSG00000162511 LAPTM5 84665 sc-eQTL 4.25e-01 0.0742 0.0929 0.177 MAIT L2
ENSG00000162517 PEF1 -802457 sc-eQTL 9.88e-01 -0.00158 0.102 0.177 MAIT L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 123935 sc-eQTL 5.94e-01 0.0553 0.104 0.177 MAIT L2
ENSG00000287510 AL137857.1 110746 sc-eQTL 9.56e-01 0.00594 0.107 0.177 MAIT L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -454349 sc-eQTL 2.15e-01 0.147 0.118 0.18 NK_CD56bright L2
ENSG00000121753 ADGRB2 -922454 sc-eQTL 5.01e-01 0.0623 0.0926 0.18 NK_CD56bright L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -454543 sc-eQTL 9.56e-01 -0.00553 0.1 0.18 NK_CD56bright L2
ENSG00000134644 PUM1 -223552 sc-eQTL 3.43e-01 0.0995 0.105 0.18 NK_CD56bright L2
ENSG00000162511 LAPTM5 84665 sc-eQTL 9.27e-01 -0.0095 0.104 0.18 NK_CD56bright L2
ENSG00000162517 PEF1 -802457 sc-eQTL 4.35e-01 0.0786 0.1 0.18 NK_CD56bright L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 123935 sc-eQTL 2.89e-01 0.11 0.104 0.18 NK_CD56bright L2
ENSG00000287510 AL137857.1 110746 sc-eQTL 8.64e-01 0.0176 0.103 0.18 NK_CD56bright L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -454349 sc-eQTL 9.79e-03 0.292 0.112 0.177 NK_CD56dim L2
ENSG00000121753 ADGRB2 -922454 sc-eQTL 6.64e-01 0.0436 0.1 0.177 NK_CD56dim L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -454543 sc-eQTL 9.85e-01 -0.00154 0.0842 0.177 NK_CD56dim L2
ENSG00000134644 PUM1 -223552 sc-eQTL 6.67e-01 0.0372 0.0864 0.177 NK_CD56dim L2
ENSG00000162511 LAPTM5 84665 sc-eQTL 8.74e-02 -0.157 0.0915 0.177 NK_CD56dim L2
ENSG00000162517 PEF1 -802457 sc-eQTL 3.27e-01 0.0804 0.0818 0.177 NK_CD56dim L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 123935 sc-eQTL 3.13e-01 -0.116 0.115 0.177 NK_CD56dim L2
ENSG00000287510 AL137857.1 110746 sc-eQTL 5.55e-01 -0.0563 0.0952 0.177 NK_CD56dim L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -454349 sc-eQTL 8.53e-01 0.0231 0.125 0.176 NK_HLA L2
ENSG00000121753 ADGRB2 -922454 sc-eQTL 7.49e-01 0.0319 0.0994 0.176 NK_HLA L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -454543 sc-eQTL 3.61e-01 0.102 0.112 0.176 NK_HLA L2
ENSG00000134644 PUM1 -223552 sc-eQTL 7.66e-01 0.0325 0.109 0.176 NK_HLA L2
ENSG00000162511 LAPTM5 84665 sc-eQTL 8.76e-01 -0.0162 0.104 0.176 NK_HLA L2
ENSG00000162517 PEF1 -802457 sc-eQTL 3.02e-01 0.121 0.117 0.176 NK_HLA L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 123935 sc-eQTL 2.57e-03 -0.33 0.108 0.176 NK_HLA L2
ENSG00000287510 AL137857.1 110746 sc-eQTL 3.24e-01 -0.105 0.107 0.176 NK_HLA L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -454349 sc-eQTL 7.27e-01 0.0391 0.112 0.177 NK_cytokine L2
ENSG00000121753 ADGRB2 -922454 sc-eQTL 6.83e-01 0.0413 0.101 0.177 NK_cytokine L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -454543 sc-eQTL 1.71e-01 0.12 0.087 0.177 NK_cytokine L2
ENSG00000134644 PUM1 -223552 sc-eQTL 4.57e-01 0.0703 0.0944 0.177 NK_cytokine L2
ENSG00000162511 LAPTM5 84665 sc-eQTL 2.37e-01 -0.123 0.104 0.177 NK_cytokine L2
ENSG00000162517 PEF1 -802457 sc-eQTL 3.38e-01 0.085 0.0885 0.177 NK_cytokine L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 123935 sc-eQTL 5.35e-02 0.212 0.109 0.177 NK_cytokine L2
ENSG00000287510 AL137857.1 110746 sc-eQTL 9.53e-01 0.00599 0.103 0.177 NK_cytokine L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -454349 sc-eQTL 6.85e-01 -0.0555 0.136 0.185 PB L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -454543 sc-eQTL 7.14e-01 0.0581 0.158 0.185 PB L2
ENSG00000134644 PUM1 -223552 sc-eQTL 6.97e-01 0.0536 0.137 0.185 PB L2
ENSG00000162510 MATN1 118854 sc-eQTL 7.58e-01 -0.0396 0.128 0.185 PB L2
ENSG00000162511 LAPTM5 84665 sc-eQTL 1.82e-01 0.122 0.0908 0.185 PB L2
ENSG00000162517 PEF1 -802457 sc-eQTL 7.13e-01 0.0519 0.141 0.185 PB L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 123935 sc-eQTL 5.46e-04 -0.423 0.119 0.185 PB L2
ENSG00000287510 AL137857.1 110746 sc-eQTL 4.24e-01 -0.107 0.133 0.185 PB L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -454349 sc-eQTL 4.58e-01 -0.0644 0.0866 0.174 Pro_T L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -454543 sc-eQTL 8.65e-01 -0.0187 0.11 0.174 Pro_T L2
ENSG00000134644 PUM1 -223552 sc-eQTL 7.64e-01 0.0309 0.103 0.174 Pro_T L2
ENSG00000162511 LAPTM5 84665 sc-eQTL 1.32e-01 -0.111 0.0733 0.174 Pro_T L2
ENSG00000162517 PEF1 -802457 sc-eQTL 8.43e-01 -0.0214 0.108 0.174 Pro_T L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 123935 sc-eQTL 7.37e-02 0.184 0.102 0.174 Pro_T L2
ENSG00000287510 AL137857.1 110746 sc-eQTL 3.72e-01 0.0846 0.0945 0.174 Pro_T L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -454349 sc-eQTL 3.96e-02 0.233 0.113 0.175 Treg L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -454543 sc-eQTL 7.39e-01 -0.0367 0.11 0.175 Treg L2
ENSG00000134644 PUM1 -223552 sc-eQTL 7.97e-01 -0.0227 0.0881 0.175 Treg L2
ENSG00000162511 LAPTM5 84665 sc-eQTL 3.97e-01 0.0854 0.101 0.175 Treg L2
ENSG00000162517 PEF1 -802457 sc-eQTL 2.67e-01 -0.121 0.109 0.175 Treg L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 123935 sc-eQTL 2.34e-01 -0.122 0.102 0.175 Treg L2
ENSG00000287510 AL137857.1 110746 sc-eQTL 2.66e-01 0.114 0.102 0.175 Treg L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -454349 sc-eQTL 6.93e-02 -0.208 0.114 0.18 cDC L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -454543 sc-eQTL 7.72e-01 -0.0361 0.124 0.18 cDC L2
ENSG00000134644 PUM1 -223552 sc-eQTL 7.59e-01 -0.0328 0.107 0.18 cDC L2
ENSG00000162511 LAPTM5 84665 sc-eQTL 6.41e-01 0.0349 0.0748 0.18 cDC L2
ENSG00000162517 PEF1 -802457 sc-eQTL 4.90e-01 -0.0748 0.108 0.18 cDC L2
ENSG00000168528 SERINC2 -567126 sc-eQTL 1.85e-01 0.127 0.0956 0.18 cDC L2
ENSG00000284543 LINC01226 -663787 sc-eQTL 9.32e-01 -0.00805 0.0944 0.18 cDC L2
ENSG00000287510 AL137857.1 110746 sc-eQTL 4.88e-01 -0.0704 0.101 0.18 cDC L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -454349 sc-eQTL 3.16e-01 0.0935 0.093 0.175 cMono_IL1B L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -454543 sc-eQTL 4.71e-01 0.075 0.104 0.175 cMono_IL1B L2
ENSG00000134644 PUM1 -223552 sc-eQTL 4.45e-01 0.0539 0.0703 0.175 cMono_IL1B L2
ENSG00000162511 LAPTM5 84665 sc-eQTL 4.72e-01 0.0444 0.0617 0.175 cMono_IL1B L2
ENSG00000162512 SDC3 -66319 sc-eQTL 6.03e-01 0.0607 0.116 0.175 cMono_IL1B L2
ENSG00000162517 PEF1 -802457 sc-eQTL 3.02e-02 0.205 0.094 0.175 cMono_IL1B L2
ENSG00000168528 SERINC2 -567126 sc-eQTL 3.87e-01 0.102 0.118 0.175 cMono_IL1B L2
ENSG00000284543 LINC01226 -663787 sc-eQTL 4.89e-01 0.072 0.104 0.175 cMono_IL1B L2
ENSG00000287510 AL137857.1 110746 sc-eQTL 1.87e-01 0.128 0.0967 0.175 cMono_IL1B L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -454349 sc-eQTL 4.56e-01 -0.0741 0.0993 0.175 cMono_S100A L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -454543 sc-eQTL 6.45e-01 0.0542 0.117 0.175 cMono_S100A L2
ENSG00000134644 PUM1 -223552 sc-eQTL 1.50e-02 0.205 0.0837 0.175 cMono_S100A L2
ENSG00000162511 LAPTM5 84665 sc-eQTL 6.31e-02 0.121 0.0647 0.175 cMono_S100A L2
ENSG00000162512 SDC3 -66319 sc-eQTL 6.96e-01 -0.0441 0.113 0.175 cMono_S100A L2
ENSG00000162517 PEF1 -802457 sc-eQTL 7.23e-02 0.182 0.101 0.175 cMono_S100A L2
ENSG00000168528 SERINC2 -567126 sc-eQTL 3.62e-01 0.109 0.119 0.175 cMono_S100A L2
ENSG00000284543 LINC01226 -663787 sc-eQTL 5.36e-01 0.06 0.0968 0.175 cMono_S100A L2
ENSG00000287510 AL137857.1 110746 sc-eQTL 2.25e-03 0.294 0.0952 0.175 cMono_S100A L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -454349 sc-eQTL 4.76e-01 0.107 0.15 0.176 gdT L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -454543 sc-eQTL 7.00e-01 0.0497 0.129 0.176 gdT L2
ENSG00000134644 PUM1 -223552 sc-eQTL 8.55e-01 0.0243 0.133 0.176 gdT L2
ENSG00000162511 LAPTM5 84665 sc-eQTL 7.87e-02 0.253 0.143 0.176 gdT L2
ENSG00000162517 PEF1 -802457 sc-eQTL 7.97e-01 -0.034 0.132 0.176 gdT L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 123935 sc-eQTL 5.95e-01 0.0708 0.133 0.176 gdT L2
ENSG00000287510 AL137857.1 110746 sc-eQTL 7.80e-01 -0.0361 0.129 0.176 gdT L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -454349 sc-eQTL 3.18e-01 0.112 0.112 0.169 intMono L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -454543 sc-eQTL 1.15e-01 -0.19 0.12 0.169 intMono L2
ENSG00000134644 PUM1 -223552 sc-eQTL 3.42e-01 -0.0972 0.102 0.169 intMono L2
ENSG00000162511 LAPTM5 84665 sc-eQTL 1.75e-01 -0.109 0.0798 0.169 intMono L2
ENSG00000162512 SDC3 -66319 sc-eQTL 2.70e-02 -0.242 0.108 0.169 intMono L2
ENSG00000162517 PEF1 -802457 sc-eQTL 8.72e-01 0.0186 0.115 0.169 intMono L2
ENSG00000168528 SERINC2 -567126 sc-eQTL 1.30e-01 0.174 0.114 0.169 intMono L2
ENSG00000284543 LINC01226 -663787 sc-eQTL 4.90e-01 0.0753 0.109 0.169 intMono L2
ENSG00000287510 AL137857.1 110746 sc-eQTL 1.75e-01 -0.148 0.108 0.169 intMono L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -454349 sc-eQTL 4.12e-01 -0.0829 0.101 0.176 ncMono L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -454543 sc-eQTL 4.13e-01 -0.0881 0.107 0.176 ncMono L2
ENSG00000134644 PUM1 -223552 sc-eQTL 3.03e-01 0.0906 0.0877 0.176 ncMono L2
ENSG00000162511 LAPTM5 84665 sc-eQTL 3.19e-02 -0.171 0.0789 0.176 ncMono L2
ENSG00000162512 SDC3 -66319 sc-eQTL 4.53e-01 0.0672 0.0894 0.176 ncMono L2
ENSG00000162517 PEF1 -802457 sc-eQTL 5.72e-01 0.0581 0.103 0.176 ncMono L2
ENSG00000168528 SERINC2 -567126 sc-eQTL 6.57e-01 -0.0434 0.0977 0.176 ncMono L2
ENSG00000284543 LINC01226 -663787 sc-eQTL 4.08e-01 -0.0809 0.0975 0.176 ncMono L2
ENSG00000287510 AL137857.1 110746 sc-eQTL 1.80e-01 0.136 0.101 0.176 ncMono L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -454349 sc-eQTL 9.66e-02 -0.194 0.116 0.186 pDC L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -454543 sc-eQTL 8.57e-01 -0.0232 0.129 0.186 pDC L2
ENSG00000134644 PUM1 -223552 sc-eQTL 7.20e-01 0.0383 0.107 0.186 pDC L2
ENSG00000162511 LAPTM5 84665 sc-eQTL 9.64e-01 -0.00449 0.0992 0.186 pDC L2
ENSG00000162517 PEF1 -802457 sc-eQTL 5.93e-01 -0.0689 0.129 0.186 pDC L2
ENSG00000168528 SERINC2 -567126 sc-eQTL 7.38e-01 0.0403 0.12 0.186 pDC L2
ENSG00000284543 LINC01226 -663787 sc-eQTL 1.22e-01 -0.144 0.0927 0.186 pDC L2
ENSG00000287510 AL137857.1 110746 sc-eQTL 6.94e-01 -0.0433 0.11 0.186 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000060688 SNRNP40 -454349 sc-eQTL 7.53e-01 -0.0372 0.118 0.175 B_Memory LOneK1K
ENSG00000121766 ZCCHC17 -454543 sc-eQTL 8.41e-01 0.0197 0.0983 0.175 B_Memory LOneK1K
ENSG00000134644 PUM1 -223552 sc-eQTL 3.68e-01 0.0784 0.087 0.175 B_Memory LOneK1K
ENSG00000162510 MATN1 118854 sc-eQTL 6.92e-01 -0.0394 0.0993 0.175 B_Memory LOneK1K
ENSG00000162511 LAPTM5 84665 sc-eQTL 4.18e-02 0.127 0.0618 0.175 B_Memory LOneK1K
ENSG00000162517 PEF1 -802457 sc-eQTL 2.07e-02 0.238 0.102 0.175 B_Memory LOneK1K
ENSG00000186056 MATN1-AS1 123935 sc-eQTL 9.91e-01 -0.000967 0.0826 0.175 B_Memory LOneK1K
ENSG00000287510 AL137857.1 110746 sc-eQTL 2.48e-01 0.104 0.0897 0.175 B_Memory LOneK1K
ENSG00000060688 SNRNP40 -454349 sc-eQTL 7.23e-01 -0.0374 0.105 0.175 B_Naive LOneK1K
ENSG00000121766 ZCCHC17 -454543 sc-eQTL 4.06e-01 -0.0691 0.083 0.175 B_Naive LOneK1K
ENSG00000134644 PUM1 -223552 sc-eQTL 4.63e-01 0.0578 0.0786 0.175 B_Naive LOneK1K
ENSG00000162510 MATN1 118854 sc-eQTL 9.38e-01 0.00592 0.0758 0.175 B_Naive LOneK1K
ENSG00000162511 LAPTM5 84665 sc-eQTL 1.82e-01 0.0711 0.0531 0.175 B_Naive LOneK1K
ENSG00000162517 PEF1 -802457 sc-eQTL 9.23e-01 0.00948 0.0974 0.175 B_Naive LOneK1K
ENSG00000186056 MATN1-AS1 123935 sc-eQTL 8.80e-01 -0.0104 0.0689 0.175 B_Naive LOneK1K
ENSG00000287510 AL137857.1 110746 sc-eQTL 5.60e-01 0.0478 0.0818 0.175 B_Naive LOneK1K
ENSG00000060688 SNRNP40 -454349 sc-eQTL 9.67e-01 -0.00371 0.0887 0.175 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000121766 ZCCHC17 -454543 sc-eQTL 5.13e-01 0.0658 0.1 0.175 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000134644 PUM1 -223552 sc-eQTL 1.30e-01 0.0969 0.0637 0.175 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000162511 LAPTM5 84665 sc-eQTL 3.65e-01 0.051 0.0562 0.175 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000162512 SDC3 -66319 sc-eQTL 5.52e-01 0.0683 0.115 0.175 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000162517 PEF1 -802457 sc-eQTL 3.16e-03 0.236 0.0791 0.175 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000168528 SERINC2 -567126 sc-eQTL 4.26e-01 0.0942 0.118 0.175 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000284543 LINC01226 -663787 sc-eQTL 5.96e-01 0.0514 0.0968 0.175 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000287510 AL137857.1 110746 sc-eQTL 2.83e-02 0.198 0.0897 0.175 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000060688 SNRNP40 -454349 sc-eQTL 7.86e-01 0.0267 0.0982 0.177 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000121766 ZCCHC17 -454543 sc-eQTL 2.49e-01 -0.124 0.107 0.177 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000134644 PUM1 -223552 sc-eQTL 8.44e-01 0.0174 0.088 0.177 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000162511 LAPTM5 84665 sc-eQTL 1.86e-01 -0.0931 0.0701 0.177 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000162512 SDC3 -66319 sc-eQTL 6.65e-01 -0.0446 0.103 0.177 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000162517 PEF1 -802457 sc-eQTL 6.17e-01 0.0468 0.0934 0.177 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000168528 SERINC2 -567126 sc-eQTL 4.33e-01 0.0836 0.107 0.177 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000284543 LINC01226 -663787 sc-eQTL 8.74e-01 0.0161 0.101 0.177 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000287510 AL137857.1 110746 sc-eQTL 7.46e-01 0.0329 0.101 0.177 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000060688 SNRNP40 -454349 sc-eQTL 1.25e-02 0.268 0.106 0.177 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000121753 ADGRB2 -922454 sc-eQTL 4.61e-01 0.0678 0.0918 0.177 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000121766 ZCCHC17 -454543 sc-eQTL 4.25e-01 0.0589 0.0736 0.177 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000134644 PUM1 -223552 sc-eQTL 4.27e-01 0.0642 0.0806 0.177 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000162511 LAPTM5 84665 sc-eQTL 5.25e-02 -0.174 0.0894 0.177 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000162517 PEF1 -802457 sc-eQTL 2.95e-01 0.0718 0.0684 0.177 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000186056 MATN1-AS1 123935 sc-eQTL 4.84e-01 -0.073 0.104 0.177 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000287510 AL137857.1 110746 sc-eQTL 3.53e-01 -0.0835 0.0897 0.177 NK_CD56dim LOneK1K

Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF
ENSG00000168528 SERINC2 -567126 eQTL 0.0422 -0.0974 0.0479 0.0 0.0 0.199

Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina
ENSG00000121766 \N -454543 7.23e-07 3.35e-07 8.9e-08 3.19e-07 1.07e-07 1.71e-07 4.09e-07 9.69e-08 2.78e-07 2.01e-07 3.97e-07 2.98e-07 5.39e-07 1.01e-07 1.32e-07 1.75e-07 1.85e-07 3.3e-07 1.5e-07 1.08e-07 1.8e-07 2.7e-07 2.63e-07 1.13e-07 4.88e-07 2.2e-07 2.22e-07 1.88e-07 2.13e-07 3.71e-07 1.93e-07 5.62e-08 5.86e-08 1.19e-07 2.35e-07 6.18e-08 9.77e-08 7.66e-08 5.54e-08 7.5e-08 3.31e-08 3.06e-07 2.71e-08 2.05e-08 9.95e-08 1.81e-08 8.01e-08 1.24e-08 5.15e-08