logo

Genes within 1Mb (chr1:30842004:C:T):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD

Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000060688 SNRNP40 -454784 sc-eQTL 4.67e-01 0.114 0.157 0.062 B L1
ENSG00000121766 ZCCHC17 -454978 sc-eQTL 2.60e-01 -0.142 0.126 0.062 B L1
ENSG00000134644 PUM1 -223987 sc-eQTL 3.57e-02 0.221 0.105 0.062 B L1
ENSG00000162510 MATN1 118419 sc-eQTL 4.82e-01 0.0781 0.111 0.062 B L1
ENSG00000162511 LAPTM5 84230 sc-eQTL 4.66e-01 -0.0635 0.0869 0.062 B L1
ENSG00000162517 PEF1 -802892 sc-eQTL 1.51e-01 0.188 0.131 0.062 B L1
ENSG00000186056 MATN1-AS1 123500 sc-eQTL 7.97e-01 -0.0262 0.102 0.062 B L1
ENSG00000287510 AL137857.1 110311 sc-eQTL 4.26e-01 0.0961 0.12 0.062 B L1
ENSG00000060688 SNRNP40 -454784 sc-eQTL 5.27e-01 0.0837 0.132 0.062 CD4T L1
ENSG00000121766 ZCCHC17 -454978 sc-eQTL 4.15e-01 -0.0843 0.103 0.062 CD4T L1
ENSG00000134644 PUM1 -223987 sc-eQTL 6.24e-01 0.0452 0.092 0.062 CD4T L1
ENSG00000162511 LAPTM5 84230 sc-eQTL 5.06e-01 -0.0679 0.102 0.062 CD4T L1
ENSG00000162517 PEF1 -802892 sc-eQTL 2.10e-01 0.134 0.106 0.062 CD4T L1
ENSG00000186056 MATN1-AS1 123500 sc-eQTL 6.45e-01 0.0421 0.0912 0.062 CD4T L1
ENSG00000287510 AL137857.1 110311 sc-eQTL 8.19e-01 0.0251 0.109 0.062 CD4T L1
ENSG00000060688 SNRNP40 -454784 sc-eQTL 9.86e-01 -0.00296 0.174 0.062 CD8T L1
ENSG00000121766 ZCCHC17 -454978 sc-eQTL 5.81e-01 0.0638 0.116 0.062 CD8T L1
ENSG00000134644 PUM1 -223987 sc-eQTL 2.02e-01 -0.13 0.101 0.062 CD8T L1
ENSG00000162511 LAPTM5 84230 sc-eQTL 7.14e-03 -0.264 0.0972 0.062 CD8T L1
ENSG00000162517 PEF1 -802892 sc-eQTL 4.57e-01 0.0907 0.122 0.062 CD8T L1
ENSG00000186056 MATN1-AS1 123500 sc-eQTL 7.17e-01 0.0421 0.116 0.062 CD8T L1
ENSG00000287510 AL137857.1 110311 sc-eQTL 8.13e-01 0.0345 0.146 0.062 CD8T L1
ENSG00000060688 SNRNP40 -454784 sc-eQTL 5.60e-02 -0.29 0.151 0.063 DC L1
ENSG00000121766 ZCCHC17 -454978 sc-eQTL 8.08e-01 -0.0439 0.18 0.063 DC L1
ENSG00000134644 PUM1 -223987 sc-eQTL 9.83e-01 -0.003 0.141 0.063 DC L1
ENSG00000162511 LAPTM5 84230 sc-eQTL 8.55e-01 0.0185 0.101 0.063 DC L1
ENSG00000162517 PEF1 -802892 sc-eQTL 3.45e-01 -0.155 0.163 0.063 DC L1
ENSG00000168528 SERINC2 -567561 sc-eQTL 8.02e-01 0.0418 0.166 0.063 DC L1
ENSG00000284543 LINC01226 -664222 sc-eQTL 5.71e-01 -0.0625 0.11 0.063 DC L1
ENSG00000287510 AL137857.1 110311 sc-eQTL 9.80e-01 0.00392 0.16 0.063 DC L1
ENSG00000060688 SNRNP40 -454784 sc-eQTL 8.27e-01 -0.0259 0.119 0.062 Mono L1
ENSG00000121766 ZCCHC17 -454978 sc-eQTL 2.56e-01 0.167 0.147 0.062 Mono L1
ENSG00000134644 PUM1 -223987 sc-eQTL 5.75e-03 0.258 0.0925 0.062 Mono L1
ENSG00000162511 LAPTM5 84230 sc-eQTL 8.47e-01 0.0168 0.0867 0.062 Mono L1
ENSG00000162512 SDC3 -66754 sc-eQTL 7.23e-01 -0.0591 0.167 0.062 Mono L1
ENSG00000162517 PEF1 -802892 sc-eQTL 3.16e-01 0.117 0.117 0.062 Mono L1
ENSG00000168528 SERINC2 -567561 sc-eQTL 1.01e-01 0.293 0.178 0.062 Mono L1
ENSG00000284543 LINC01226 -664222 sc-eQTL 4.94e-01 -0.108 0.157 0.062 Mono L1
ENSG00000287510 AL137857.1 110311 sc-eQTL 5.34e-01 0.0856 0.137 0.062 Mono L1
ENSG00000060688 SNRNP40 -454784 sc-eQTL 2.19e-02 0.38 0.165 0.062 NK L1
ENSG00000121753 ADGRB2 -922889 sc-eQTL 7.64e-01 0.043 0.143 0.062 NK L1
ENSG00000121766 ZCCHC17 -454978 sc-eQTL 8.97e-01 -0.0149 0.114 0.062 NK L1
ENSG00000134644 PUM1 -223987 sc-eQTL 4.31e-01 0.0943 0.119 0.062 NK L1
ENSG00000162511 LAPTM5 84230 sc-eQTL 3.33e-04 -0.487 0.134 0.062 NK L1
ENSG00000162517 PEF1 -802892 sc-eQTL 2.84e-01 0.108 0.1 0.062 NK L1
ENSG00000186056 MATN1-AS1 123500 sc-eQTL 1.41e-01 -0.227 0.154 0.062 NK L1
ENSG00000287510 AL137857.1 110311 sc-eQTL 5.09e-01 -0.0945 0.143 0.062 NK L1
ENSG00000060688 SNRNP40 -454784 sc-eQTL 8.89e-02 0.213 0.125 0.062 Other_T L1
ENSG00000121766 ZCCHC17 -454978 sc-eQTL 1.02e-01 -0.219 0.133 0.062 Other_T L1
ENSG00000134644 PUM1 -223987 sc-eQTL 2.82e-02 -0.263 0.119 0.062 Other_T L1
ENSG00000162511 LAPTM5 84230 sc-eQTL 1.97e-01 -0.127 0.0984 0.062 Other_T L1
ENSG00000162517 PEF1 -802892 sc-eQTL 6.27e-01 0.0641 0.132 0.062 Other_T L1
ENSG00000186056 MATN1-AS1 123500 sc-eQTL 1.13e-01 0.256 0.161 0.062 Other_T L1
ENSG00000287510 AL137857.1 110311 sc-eQTL 4.82e-01 0.119 0.168 0.062 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000060688 SNRNP40 -454784 sc-eQTL 5.84e-01 -0.111 0.203 0.066 B_Activated L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -454978 sc-eQTL 4.85e-01 -0.143 0.204 0.066 B_Activated L2
ENSG00000134644 PUM1 -223987 sc-eQTL 4.31e-01 0.15 0.19 0.066 B_Activated L2
ENSG00000162510 MATN1 118419 sc-eQTL 6.84e-01 0.0677 0.166 0.066 B_Activated L2
ENSG00000162511 LAPTM5 84230 sc-eQTL 4.00e-01 0.0975 0.116 0.066 B_Activated L2
ENSG00000162517 PEF1 -802892 sc-eQTL 5.45e-01 0.119 0.197 0.066 B_Activated L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 123500 sc-eQTL 4.53e-01 0.14 0.187 0.066 B_Activated L2
ENSG00000287510 AL137857.1 110311 sc-eQTL 3.93e-01 0.141 0.165 0.066 B_Activated L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -454784 sc-eQTL 6.27e-01 0.091 0.187 0.062 B_Intermediate L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -454978 sc-eQTL 2.12e-01 -0.195 0.155 0.062 B_Intermediate L2
ENSG00000134644 PUM1 -223987 sc-eQTL 7.25e-01 0.0518 0.147 0.062 B_Intermediate L2
ENSG00000162510 MATN1 118419 sc-eQTL 3.55e-01 0.142 0.153 0.062 B_Intermediate L2
ENSG00000162511 LAPTM5 84230 sc-eQTL 8.73e-01 -0.015 0.0941 0.062 B_Intermediate L2
ENSG00000162517 PEF1 -802892 sc-eQTL 3.15e-02 0.374 0.173 0.062 B_Intermediate L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 123500 sc-eQTL 1.00e-01 -0.216 0.131 0.062 B_Intermediate L2
ENSG00000287510 AL137857.1 110311 sc-eQTL 8.10e-01 0.0356 0.148 0.062 B_Intermediate L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -454784 sc-eQTL 4.23e-01 0.148 0.184 0.062 B_Memory L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -454978 sc-eQTL 1.66e-01 -0.235 0.169 0.062 B_Memory L2
ENSG00000134644 PUM1 -223987 sc-eQTL 5.79e-01 0.082 0.148 0.062 B_Memory L2
ENSG00000162510 MATN1 118419 sc-eQTL 2.94e-01 0.148 0.141 0.062 B_Memory L2
ENSG00000162511 LAPTM5 84230 sc-eQTL 1.34e-01 -0.187 0.125 0.062 B_Memory L2
ENSG00000162517 PEF1 -802892 sc-eQTL 3.01e-01 0.173 0.167 0.062 B_Memory L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 123500 sc-eQTL 5.52e-02 0.274 0.142 0.062 B_Memory L2
ENSG00000287510 AL137857.1 110311 sc-eQTL 5.03e-01 0.113 0.168 0.062 B_Memory L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -454784 sc-eQTL 9.01e-01 0.0209 0.168 0.062 B_Naive1 L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -454978 sc-eQTL 1.42e-01 -0.213 0.144 0.062 B_Naive1 L2
ENSG00000134644 PUM1 -223987 sc-eQTL 2.59e-01 0.145 0.128 0.062 B_Naive1 L2
ENSG00000162510 MATN1 118419 sc-eQTL 4.22e-01 0.104 0.13 0.062 B_Naive1 L2
ENSG00000162511 LAPTM5 84230 sc-eQTL 8.62e-01 -0.0151 0.0868 0.062 B_Naive1 L2
ENSG00000162517 PEF1 -802892 sc-eQTL 4.94e-01 0.105 0.153 0.062 B_Naive1 L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 123500 sc-eQTL 7.35e-01 -0.0387 0.114 0.062 B_Naive1 L2
ENSG00000287510 AL137857.1 110311 sc-eQTL 5.40e-01 0.0865 0.141 0.062 B_Naive1 L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -454784 sc-eQTL 6.58e-01 0.0785 0.177 0.062 B_Naive2 L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -454978 sc-eQTL 9.31e-01 -0.0126 0.146 0.062 B_Naive2 L2
ENSG00000134644 PUM1 -223987 sc-eQTL 3.81e-02 0.296 0.142 0.062 B_Naive2 L2
ENSG00000162510 MATN1 118419 sc-eQTL 7.37e-01 0.0462 0.137 0.062 B_Naive2 L2
ENSG00000162511 LAPTM5 84230 sc-eQTL 9.54e-01 0.0054 0.0934 0.062 B_Naive2 L2
ENSG00000162517 PEF1 -802892 sc-eQTL 9.56e-01 0.00935 0.17 0.062 B_Naive2 L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 123500 sc-eQTL 2.08e-01 0.171 0.135 0.062 B_Naive2 L2
ENSG00000287510 AL137857.1 110311 sc-eQTL 9.38e-01 0.0115 0.147 0.062 B_Naive2 L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -454784 sc-eQTL 7.50e-01 -0.0575 0.181 0.064 CD4_CTL L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -454978 sc-eQTL 6.09e-01 -0.091 0.177 0.064 CD4_CTL L2
ENSG00000134644 PUM1 -223987 sc-eQTL 1.37e-01 -0.259 0.173 0.064 CD4_CTL L2
ENSG00000162511 LAPTM5 84230 sc-eQTL 8.89e-02 -0.263 0.154 0.064 CD4_CTL L2
ENSG00000162517 PEF1 -802892 sc-eQTL 7.22e-01 0.0568 0.159 0.064 CD4_CTL L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 123500 sc-eQTL 3.70e-01 0.152 0.169 0.064 CD4_CTL L2
ENSG00000287510 AL137857.1 110311 sc-eQTL 8.77e-01 0.0233 0.15 0.064 CD4_CTL L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -454784 sc-eQTL 9.57e-01 0.0075 0.138 0.062 CD4_Naive L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -454978 sc-eQTL 2.55e-01 -0.139 0.122 0.062 CD4_Naive L2
ENSG00000134644 PUM1 -223987 sc-eQTL 2.07e-01 0.123 0.0972 0.062 CD4_Naive L2
ENSG00000162511 LAPTM5 84230 sc-eQTL 8.63e-01 0.0181 0.105 0.062 CD4_Naive L2
ENSG00000162517 PEF1 -802892 sc-eQTL 1.31e-01 0.173 0.114 0.062 CD4_Naive L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 123500 sc-eQTL 5.55e-01 0.0627 0.106 0.062 CD4_Naive L2
ENSG00000287510 AL137857.1 110311 sc-eQTL 5.86e-01 -0.0665 0.122 0.062 CD4_Naive L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -454784 sc-eQTL 6.81e-01 0.0717 0.174 0.062 CD4_TCM L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -454978 sc-eQTL 9.38e-01 0.0109 0.14 0.062 CD4_TCM L2
ENSG00000134644 PUM1 -223987 sc-eQTL 9.69e-01 0.00476 0.124 0.062 CD4_TCM L2
ENSG00000162511 LAPTM5 84230 sc-eQTL 8.46e-02 -0.177 0.102 0.062 CD4_TCM L2
ENSG00000162517 PEF1 -802892 sc-eQTL 4.54e-01 0.103 0.138 0.062 CD4_TCM L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 123500 sc-eQTL 7.92e-01 -0.0346 0.131 0.062 CD4_TCM L2
ENSG00000287510 AL137857.1 110311 sc-eQTL 4.49e-01 0.11 0.145 0.062 CD4_TCM L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -454784 sc-eQTL 9.46e-02 0.284 0.169 0.062 CD4_TEM L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -454978 sc-eQTL 7.11e-02 -0.292 0.161 0.062 CD4_TEM L2
ENSG00000134644 PUM1 -223987 sc-eQTL 1.17e-01 0.212 0.134 0.062 CD4_TEM L2
ENSG00000162511 LAPTM5 84230 sc-eQTL 1.25e-01 -0.209 0.136 0.062 CD4_TEM L2
ENSG00000162517 PEF1 -802892 sc-eQTL 4.88e-01 -0.106 0.153 0.062 CD4_TEM L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 123500 sc-eQTL 7.95e-01 0.0417 0.16 0.062 CD4_TEM L2
ENSG00000287510 AL137857.1 110311 sc-eQTL 6.86e-01 -0.0639 0.158 0.062 CD4_TEM L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -454784 sc-eQTL 5.53e-01 0.119 0.2 0.062 CD8_CTL L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -454978 sc-eQTL 2.82e-01 0.165 0.153 0.062 CD8_CTL L2
ENSG00000134644 PUM1 -223987 sc-eQTL 5.06e-01 0.099 0.149 0.062 CD8_CTL L2
ENSG00000162511 LAPTM5 84230 sc-eQTL 1.02e-03 -0.535 0.161 0.062 CD8_CTL L2
ENSG00000162517 PEF1 -802892 sc-eQTL 9.73e-02 -0.237 0.143 0.062 CD8_CTL L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 123500 sc-eQTL 9.39e-01 0.0132 0.173 0.062 CD8_CTL L2
ENSG00000287510 AL137857.1 110311 sc-eQTL 4.45e-01 -0.125 0.163 0.062 CD8_CTL L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -454784 sc-eQTL 8.43e-01 0.0341 0.172 0.062 CD8_Naive L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -454978 sc-eQTL 6.11e-01 0.0756 0.149 0.062 CD8_Naive L2
ENSG00000134644 PUM1 -223987 sc-eQTL 1.62e-01 -0.167 0.119 0.062 CD8_Naive L2
ENSG00000162511 LAPTM5 84230 sc-eQTL 5.89e-01 -0.062 0.115 0.062 CD8_Naive L2
ENSG00000162517 PEF1 -802892 sc-eQTL 6.84e-01 0.0648 0.159 0.062 CD8_Naive L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 123500 sc-eQTL 8.00e-01 -0.0363 0.143 0.062 CD8_Naive L2
ENSG00000287510 AL137857.1 110311 sc-eQTL 3.55e-01 0.144 0.155 0.062 CD8_Naive L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -454784 sc-eQTL 8.35e-01 -0.04 0.192 0.06 CD8_TCM L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -454978 sc-eQTL 4.38e-01 0.137 0.176 0.06 CD8_TCM L2
ENSG00000134644 PUM1 -223987 sc-eQTL 3.46e-01 -0.156 0.165 0.06 CD8_TCM L2
ENSG00000162511 LAPTM5 84230 sc-eQTL 9.80e-01 0.00437 0.173 0.06 CD8_TCM L2
ENSG00000162517 PEF1 -802892 sc-eQTL 4.94e-01 0.121 0.177 0.06 CD8_TCM L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 123500 sc-eQTL 9.24e-02 0.27 0.159 0.06 CD8_TCM L2
ENSG00000287510 AL137857.1 110311 sc-eQTL 6.93e-01 -0.064 0.162 0.06 CD8_TCM L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -454784 sc-eQTL 4.39e-01 -0.147 0.19 0.064 CD8_TEM L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -454978 sc-eQTL 2.25e-01 -0.221 0.182 0.064 CD8_TEM L2
ENSG00000134644 PUM1 -223987 sc-eQTL 6.29e-01 -0.0901 0.186 0.064 CD8_TEM L2
ENSG00000162511 LAPTM5 84230 sc-eQTL 3.08e-01 0.179 0.175 0.064 CD8_TEM L2
ENSG00000162517 PEF1 -802892 sc-eQTL 6.29e-01 0.0798 0.165 0.064 CD8_TEM L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 123500 sc-eQTL 5.29e-01 -0.115 0.182 0.064 CD8_TEM L2
ENSG00000287510 AL137857.1 110311 sc-eQTL 5.53e-01 0.0979 0.164 0.064 CD8_TEM L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -454784 sc-eQTL 1.75e-01 0.247 0.181 0.063 MAIT L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -454978 sc-eQTL 4.97e-02 -0.316 0.16 0.063 MAIT L2
ENSG00000134644 PUM1 -223987 sc-eQTL 4.92e-02 -0.303 0.153 0.063 MAIT L2
ENSG00000162511 LAPTM5 84230 sc-eQTL 4.79e-01 -0.103 0.146 0.063 MAIT L2
ENSG00000162517 PEF1 -802892 sc-eQTL 8.31e-01 0.0343 0.16 0.063 MAIT L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 123500 sc-eQTL 3.60e-02 0.339 0.161 0.063 MAIT L2
ENSG00000287510 AL137857.1 110311 sc-eQTL 9.30e-01 0.0148 0.167 0.063 MAIT L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -454784 sc-eQTL 2.66e-01 0.209 0.187 0.06 NK_CD56bright L2
ENSG00000121753 ADGRB2 -922889 sc-eQTL 9.29e-01 -0.0131 0.147 0.06 NK_CD56bright L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -454978 sc-eQTL 8.30e-01 -0.034 0.159 0.06 NK_CD56bright L2
ENSG00000134644 PUM1 -223987 sc-eQTL 8.51e-01 -0.0314 0.167 0.06 NK_CD56bright L2
ENSG00000162511 LAPTM5 84230 sc-eQTL 2.91e-02 -0.357 0.162 0.06 NK_CD56bright L2
ENSG00000162517 PEF1 -802892 sc-eQTL 9.95e-02 0.262 0.159 0.06 NK_CD56bright L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 123500 sc-eQTL 5.86e-01 0.0899 0.165 0.06 NK_CD56bright L2
ENSG00000287510 AL137857.1 110311 sc-eQTL 3.45e-01 0.154 0.162 0.06 NK_CD56bright L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -454784 sc-eQTL 1.55e-02 0.424 0.174 0.062 NK_CD56dim L2
ENSG00000121753 ADGRB2 -922889 sc-eQTL 8.32e-01 0.033 0.155 0.062 NK_CD56dim L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -454978 sc-eQTL 8.72e-01 -0.0211 0.13 0.062 NK_CD56dim L2
ENSG00000134644 PUM1 -223987 sc-eQTL 1.02e-01 0.218 0.133 0.062 NK_CD56dim L2
ENSG00000162511 LAPTM5 84230 sc-eQTL 8.99e-04 -0.468 0.139 0.062 NK_CD56dim L2
ENSG00000162517 PEF1 -802892 sc-eQTL 2.17e-01 0.156 0.126 0.062 NK_CD56dim L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 123500 sc-eQTL 6.36e-01 -0.0846 0.179 0.062 NK_CD56dim L2
ENSG00000287510 AL137857.1 110311 sc-eQTL 4.62e-01 0.109 0.147 0.062 NK_CD56dim L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -454784 sc-eQTL 3.49e-01 0.193 0.205 0.055 NK_HLA L2
ENSG00000121753 ADGRB2 -922889 sc-eQTL 7.16e-01 -0.0595 0.163 0.055 NK_HLA L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -454978 sc-eQTL 2.31e-01 0.22 0.183 0.055 NK_HLA L2
ENSG00000134644 PUM1 -223987 sc-eQTL 7.13e-01 -0.0659 0.179 0.055 NK_HLA L2
ENSG00000162511 LAPTM5 84230 sc-eQTL 1.50e-01 -0.246 0.17 0.055 NK_HLA L2
ENSG00000162517 PEF1 -802892 sc-eQTL 4.86e-01 0.134 0.192 0.055 NK_HLA L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 123500 sc-eQTL 1.49e-01 -0.262 0.181 0.055 NK_HLA L2
ENSG00000287510 AL137857.1 110311 sc-eQTL 6.57e-01 0.0781 0.176 0.055 NK_HLA L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -454784 sc-eQTL 6.93e-01 0.0697 0.177 0.062 NK_cytokine L2
ENSG00000121753 ADGRB2 -922889 sc-eQTL 9.49e-01 0.0102 0.16 0.062 NK_cytokine L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -454978 sc-eQTL 8.58e-01 0.0247 0.138 0.062 NK_cytokine L2
ENSG00000134644 PUM1 -223987 sc-eQTL 6.23e-01 -0.0733 0.149 0.062 NK_cytokine L2
ENSG00000162511 LAPTM5 84230 sc-eQTL 1.23e-02 -0.408 0.162 0.062 NK_cytokine L2
ENSG00000162517 PEF1 -802892 sc-eQTL 7.33e-01 0.0477 0.14 0.062 NK_cytokine L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 123500 sc-eQTL 3.67e-01 -0.157 0.174 0.062 NK_cytokine L2
ENSG00000287510 AL137857.1 110311 sc-eQTL 2.62e-01 -0.182 0.161 0.062 NK_cytokine L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -454784 sc-eQTL 1.06e-01 0.316 0.194 0.074 PB L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -454978 sc-eQTL 7.62e-01 0.069 0.227 0.074 PB L2
ENSG00000134644 PUM1 -223987 sc-eQTL 3.54e-01 -0.183 0.197 0.074 PB L2
ENSG00000162510 MATN1 118419 sc-eQTL 5.48e-02 -0.351 0.181 0.074 PB L2
ENSG00000162511 LAPTM5 84230 sc-eQTL 9.23e-01 0.0127 0.131 0.074 PB L2
ENSG00000162517 PEF1 -802892 sc-eQTL 5.51e-01 0.121 0.202 0.074 PB L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 123500 sc-eQTL 4.14e-01 -0.147 0.179 0.074 PB L2
ENSG00000287510 AL137857.1 110311 sc-eQTL 2.07e-01 -0.241 0.19 0.074 PB L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -454784 sc-eQTL 7.25e-01 -0.049 0.139 0.059 Pro_T L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -454978 sc-eQTL 9.47e-01 0.0118 0.176 0.059 Pro_T L2
ENSG00000134644 PUM1 -223987 sc-eQTL 8.51e-01 -0.031 0.165 0.059 Pro_T L2
ENSG00000162511 LAPTM5 84230 sc-eQTL 4.59e-02 -0.235 0.117 0.059 Pro_T L2
ENSG00000162517 PEF1 -802892 sc-eQTL 7.72e-01 -0.0503 0.173 0.059 Pro_T L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 123500 sc-eQTL 4.95e-01 -0.113 0.165 0.059 Pro_T L2
ENSG00000287510 AL137857.1 110311 sc-eQTL 3.17e-01 0.152 0.151 0.059 Pro_T L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -454784 sc-eQTL 9.18e-02 0.298 0.176 0.062 Treg L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -454978 sc-eQTL 4.85e-01 -0.12 0.171 0.062 Treg L2
ENSG00000134644 PUM1 -223987 sc-eQTL 2.24e-01 -0.166 0.137 0.062 Treg L2
ENSG00000162511 LAPTM5 84230 sc-eQTL 5.30e-01 -0.0985 0.157 0.062 Treg L2
ENSG00000162517 PEF1 -802892 sc-eQTL 8.33e-01 -0.0358 0.169 0.062 Treg L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 123500 sc-eQTL 6.69e-01 0.0684 0.16 0.062 Treg L2
ENSG00000287510 AL137857.1 110311 sc-eQTL 4.90e-01 0.11 0.16 0.062 Treg L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -454784 sc-eQTL 3.26e-02 -0.379 0.176 0.066 cDC L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -454978 sc-eQTL 9.03e-01 0.0236 0.193 0.066 cDC L2
ENSG00000134644 PUM1 -223987 sc-eQTL 7.04e-01 -0.0631 0.166 0.066 cDC L2
ENSG00000162511 LAPTM5 84230 sc-eQTL 5.96e-01 0.0616 0.116 0.066 cDC L2
ENSG00000162517 PEF1 -802892 sc-eQTL 1.94e-01 -0.218 0.167 0.066 cDC L2
ENSG00000168528 SERINC2 -567561 sc-eQTL 4.56e-01 0.111 0.149 0.066 cDC L2
ENSG00000284543 LINC01226 -664222 sc-eQTL 3.47e-01 -0.138 0.146 0.066 cDC L2
ENSG00000287510 AL137857.1 110311 sc-eQTL 8.28e-01 -0.0343 0.158 0.066 cDC L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -454784 sc-eQTL 9.13e-01 -0.0156 0.142 0.062 cMono_IL1B L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -454978 sc-eQTL 4.13e-01 0.13 0.159 0.062 cMono_IL1B L2
ENSG00000134644 PUM1 -223987 sc-eQTL 5.06e-03 0.299 0.106 0.062 cMono_IL1B L2
ENSG00000162511 LAPTM5 84230 sc-eQTL 6.51e-01 0.0427 0.0943 0.062 cMono_IL1B L2
ENSG00000162512 SDC3 -66754 sc-eQTL 6.11e-01 -0.0904 0.178 0.062 cMono_IL1B L2
ENSG00000162517 PEF1 -802892 sc-eQTL 5.02e-01 0.0975 0.145 0.062 cMono_IL1B L2
ENSG00000168528 SERINC2 -567561 sc-eQTL 1.20e-01 0.279 0.179 0.062 cMono_IL1B L2
ENSG00000284543 LINC01226 -664222 sc-eQTL 6.69e-01 -0.068 0.159 0.062 cMono_IL1B L2
ENSG00000287510 AL137857.1 110311 sc-eQTL 3.23e-01 0.147 0.148 0.062 cMono_IL1B L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -454784 sc-eQTL 9.14e-01 0.0163 0.15 0.062 cMono_S100A L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -454978 sc-eQTL 1.74e-01 0.241 0.177 0.062 cMono_S100A L2
ENSG00000134644 PUM1 -223987 sc-eQTL 2.55e-03 0.383 0.126 0.062 cMono_S100A L2
ENSG00000162511 LAPTM5 84230 sc-eQTL 2.32e-01 0.118 0.0982 0.062 cMono_S100A L2
ENSG00000162512 SDC3 -66754 sc-eQTL 8.25e-01 -0.0377 0.17 0.062 cMono_S100A L2
ENSG00000162517 PEF1 -802892 sc-eQTL 2.69e-01 -0.17 0.153 0.062 cMono_S100A L2
ENSG00000168528 SERINC2 -567561 sc-eQTL 3.94e-02 0.37 0.178 0.062 cMono_S100A L2
ENSG00000284543 LINC01226 -664222 sc-eQTL 7.66e-01 0.0436 0.146 0.062 cMono_S100A L2
ENSG00000287510 AL137857.1 110311 sc-eQTL 7.30e-01 0.0508 0.147 0.062 cMono_S100A L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -454784 sc-eQTL 1.14e-01 0.361 0.227 0.058 gdT L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -454978 sc-eQTL 8.34e-01 0.0415 0.197 0.058 gdT L2
ENSG00000134644 PUM1 -223987 sc-eQTL 1.83e-01 -0.27 0.202 0.058 gdT L2
ENSG00000162511 LAPTM5 84230 sc-eQTL 9.28e-01 0.02 0.221 0.058 gdT L2
ENSG00000162517 PEF1 -802892 sc-eQTL 6.74e-01 0.0851 0.202 0.058 gdT L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 123500 sc-eQTL 8.52e-01 -0.038 0.204 0.058 gdT L2
ENSG00000287510 AL137857.1 110311 sc-eQTL 6.48e-01 -0.0901 0.197 0.058 gdT L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -454784 sc-eQTL 2.25e-01 0.205 0.168 0.06 intMono L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -454978 sc-eQTL 9.78e-01 -0.00499 0.182 0.06 intMono L2
ENSG00000134644 PUM1 -223987 sc-eQTL 6.09e-01 0.0789 0.154 0.06 intMono L2
ENSG00000162511 LAPTM5 84230 sc-eQTL 5.55e-01 -0.0715 0.121 0.06 intMono L2
ENSG00000162512 SDC3 -66754 sc-eQTL 2.64e-01 -0.185 0.165 0.06 intMono L2
ENSG00000162517 PEF1 -802892 sc-eQTL 3.32e-01 0.169 0.174 0.06 intMono L2
ENSG00000168528 SERINC2 -567561 sc-eQTL 3.33e-01 0.168 0.173 0.06 intMono L2
ENSG00000284543 LINC01226 -664222 sc-eQTL 3.44e-01 -0.156 0.164 0.06 intMono L2
ENSG00000287510 AL137857.1 110311 sc-eQTL 8.68e-01 0.0273 0.164 0.06 intMono L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -454784 sc-eQTL 2.86e-01 -0.167 0.157 0.063 ncMono L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -454978 sc-eQTL 8.41e-01 0.0336 0.167 0.063 ncMono L2
ENSG00000134644 PUM1 -223987 sc-eQTL 4.03e-01 0.115 0.137 0.063 ncMono L2
ENSG00000162511 LAPTM5 84230 sc-eQTL 2.59e-01 -0.14 0.124 0.063 ncMono L2
ENSG00000162512 SDC3 -66754 sc-eQTL 9.02e-01 -0.0171 0.139 0.063 ncMono L2
ENSG00000162517 PEF1 -802892 sc-eQTL 2.30e-01 0.192 0.159 0.063 ncMono L2
ENSG00000168528 SERINC2 -567561 sc-eQTL 8.22e-01 0.0343 0.152 0.063 ncMono L2
ENSG00000284543 LINC01226 -664222 sc-eQTL 5.14e-01 -0.0992 0.152 0.063 ncMono L2
ENSG00000287510 AL137857.1 110311 sc-eQTL 9.52e-01 0.0094 0.158 0.063 ncMono L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -454784 sc-eQTL 5.13e-01 -0.118 0.18 0.068 pDC L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -454978 sc-eQTL 7.48e-01 -0.0636 0.197 0.068 pDC L2
ENSG00000134644 PUM1 -223987 sc-eQTL 9.48e-01 0.0107 0.164 0.068 pDC L2
ENSG00000162511 LAPTM5 84230 sc-eQTL 5.02e-01 -0.102 0.152 0.068 pDC L2
ENSG00000162517 PEF1 -802892 sc-eQTL 1.66e-01 -0.273 0.196 0.068 pDC L2
ENSG00000168528 SERINC2 -567561 sc-eQTL 8.83e-01 -0.0273 0.185 0.068 pDC L2
ENSG00000284543 LINC01226 -664222 sc-eQTL 5.77e-01 -0.08 0.143 0.068 pDC L2
ENSG00000287510 AL137857.1 110311 sc-eQTL 7.49e-01 0.0539 0.168 0.068 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000060688 SNRNP40 -454784 sc-eQTL 5.00e-01 0.123 0.183 0.062 B_Memory LOneK1K
ENSG00000121766 ZCCHC17 -454978 sc-eQTL 1.15e-01 -0.24 0.151 0.062 B_Memory LOneK1K
ENSG00000134644 PUM1 -223987 sc-eQTL 2.45e-01 0.157 0.134 0.062 B_Memory LOneK1K
ENSG00000162510 MATN1 118419 sc-eQTL 6.06e-01 0.0793 0.154 0.062 B_Memory LOneK1K
ENSG00000162511 LAPTM5 84230 sc-eQTL 8.41e-01 0.0194 0.0966 0.062 B_Memory LOneK1K
ENSG00000162517 PEF1 -802892 sc-eQTL 5.10e-02 0.311 0.159 0.062 B_Memory LOneK1K
ENSG00000186056 MATN1-AS1 123500 sc-eQTL 8.56e-01 -0.0231 0.128 0.062 B_Memory LOneK1K
ENSG00000287510 AL137857.1 110311 sc-eQTL 2.78e-01 0.151 0.139 0.062 B_Memory LOneK1K
ENSG00000060688 SNRNP40 -454784 sc-eQTL 8.49e-01 0.0313 0.164 0.062 B_Naive LOneK1K
ENSG00000121766 ZCCHC17 -454978 sc-eQTL 3.39e-01 -0.124 0.129 0.062 B_Naive LOneK1K
ENSG00000134644 PUM1 -223987 sc-eQTL 2.91e-02 0.266 0.121 0.062 B_Naive LOneK1K
ENSG00000162510 MATN1 118419 sc-eQTL 3.80e-01 0.104 0.118 0.062 B_Naive LOneK1K
ENSG00000162511 LAPTM5 84230 sc-eQTL 8.69e-01 0.0137 0.083 0.062 B_Naive LOneK1K
ENSG00000162517 PEF1 -802892 sc-eQTL 6.59e-01 0.0671 0.152 0.062 B_Naive LOneK1K
ENSG00000186056 MATN1-AS1 123500 sc-eQTL 7.84e-01 0.0294 0.107 0.062 B_Naive LOneK1K
ENSG00000287510 AL137857.1 110311 sc-eQTL 4.21e-01 0.103 0.127 0.062 B_Naive LOneK1K
ENSG00000060688 SNRNP40 -454784 sc-eQTL 8.14e-01 0.0319 0.136 0.062 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000121766 ZCCHC17 -454978 sc-eQTL 2.48e-01 0.177 0.153 0.062 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000134644 PUM1 -223987 sc-eQTL 3.64e-04 0.344 0.095 0.062 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000162511 LAPTM5 84230 sc-eQTL 5.62e-01 0.0499 0.086 0.062 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000162512 SDC3 -66754 sc-eQTL 8.73e-01 -0.028 0.176 0.062 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000162517 PEF1 -802892 sc-eQTL 9.43e-01 0.00878 0.123 0.062 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000168528 SERINC2 -567561 sc-eQTL 7.83e-02 0.317 0.179 0.062 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000284543 LINC01226 -664222 sc-eQTL 6.85e-01 -0.0601 0.148 0.062 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000287510 AL137857.1 110311 sc-eQTL 6.12e-01 0.0704 0.139 0.062 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000060688 SNRNP40 -454784 sc-eQTL 4.46e-01 -0.113 0.148 0.062 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000121766 ZCCHC17 -454978 sc-eQTL 3.82e-01 0.142 0.162 0.062 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000134644 PUM1 -223987 sc-eQTL 5.58e-01 0.0782 0.133 0.062 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000162511 LAPTM5 84230 sc-eQTL 5.18e-01 -0.069 0.107 0.062 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000162512 SDC3 -66754 sc-eQTL 5.86e-01 -0.0848 0.156 0.062 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000162517 PEF1 -802892 sc-eQTL 1.38e-01 0.21 0.141 0.062 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000168528 SERINC2 -567561 sc-eQTL 4.93e-01 0.111 0.161 0.062 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000284543 LINC01226 -664222 sc-eQTL 3.30e-01 -0.149 0.153 0.062 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000287510 AL137857.1 110311 sc-eQTL 7.77e-01 0.0435 0.153 0.062 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000060688 SNRNP40 -454784 sc-eQTL 1.80e-02 0.393 0.165 0.062 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000121753 ADGRB2 -922889 sc-eQTL 7.35e-01 0.0483 0.142 0.062 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000121766 ZCCHC17 -454978 sc-eQTL 9.74e-01 -0.00366 0.114 0.062 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000134644 PUM1 -223987 sc-eQTL 4.05e-01 0.104 0.125 0.062 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000162511 LAPTM5 84230 sc-eQTL 2.89e-04 -0.5 0.136 0.062 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000162517 PEF1 -802892 sc-eQTL 3.16e-01 0.106 0.106 0.062 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000186056 MATN1-AS1 123500 sc-eQTL 1.07e-01 -0.259 0.16 0.062 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000287510 AL137857.1 110311 sc-eQTL 3.18e-01 -0.139 0.139 0.062 NK_CD56dim LOneK1K

Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF
ENSG00000121769 FABP3 -534846 pQTL 1.70e-02 0.0692 0.029 0.0 0.0 0.0878
ENSG00000142910 TINAGL1 -734481 pQTL 0.0412 -0.0538 0.0263 0.00105 0.0 0.0878

Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina