logo

Genes within 1Mb (chr1:30842004:C:A):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD

Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000060688 SNRNP40 -454784 sc-eQTL 6.60e-01 -0.0416 0.0946 0.224 B L1
ENSG00000121766 ZCCHC17 -454978 sc-eQTL 6.71e-02 -0.138 0.0752 0.224 B L1
ENSG00000134644 PUM1 -223987 sc-eQTL 3.94e-01 -0.0542 0.0635 0.224 B L1
ENSG00000162510 MATN1 118419 sc-eQTL 4.31e-01 -0.0527 0.0667 0.224 B L1
ENSG00000162511 LAPTM5 84230 sc-eQTL 2.24e-01 0.0636 0.0522 0.224 B L1
ENSG00000162517 PEF1 -802892 sc-eQTL 7.32e-01 -0.0271 0.079 0.224 B L1
ENSG00000186056 MATN1-AS1 123500 sc-eQTL 2.12e-01 0.0765 0.0611 0.224 B L1
ENSG00000287510 AL137857.1 110311 sc-eQTL 8.05e-01 0.0179 0.0726 0.224 B L1
ENSG00000060688 SNRNP40 -454784 sc-eQTL 8.61e-01 0.0143 0.0818 0.224 CD4T L1
ENSG00000121766 ZCCHC17 -454978 sc-eQTL 8.59e-01 -0.0113 0.0639 0.224 CD4T L1
ENSG00000134644 PUM1 -223987 sc-eQTL 9.11e-01 -0.00638 0.0569 0.224 CD4T L1
ENSG00000162511 LAPTM5 84230 sc-eQTL 9.77e-01 0.00181 0.063 0.224 CD4T L1
ENSG00000162517 PEF1 -802892 sc-eQTL 5.58e-01 0.0387 0.0659 0.224 CD4T L1
ENSG00000186056 MATN1-AS1 123500 sc-eQTL 7.42e-01 -0.0186 0.0564 0.224 CD4T L1
ENSG00000287510 AL137857.1 110311 sc-eQTL 3.45e-01 0.0638 0.0674 0.224 CD4T L1
ENSG00000060688 SNRNP40 -454784 sc-eQTL 3.65e-01 -0.0985 0.109 0.224 CD8T L1
ENSG00000121766 ZCCHC17 -454978 sc-eQTL 3.37e-01 -0.0696 0.0722 0.224 CD8T L1
ENSG00000134644 PUM1 -223987 sc-eQTL 9.72e-01 -0.00227 0.0638 0.224 CD8T L1
ENSG00000162511 LAPTM5 84230 sc-eQTL 6.12e-01 0.0314 0.0619 0.224 CD8T L1
ENSG00000162517 PEF1 -802892 sc-eQTL 6.60e-01 -0.0335 0.0762 0.224 CD8T L1
ENSG00000186056 MATN1-AS1 123500 sc-eQTL 3.99e-01 0.0612 0.0724 0.224 CD8T L1
ENSG00000287510 AL137857.1 110311 sc-eQTL 6.49e-01 -0.0416 0.0911 0.224 CD8T L1
ENSG00000060688 SNRNP40 -454784 sc-eQTL 8.93e-01 0.013 0.0968 0.227 DC L1
ENSG00000121766 ZCCHC17 -454978 sc-eQTL 5.56e-01 -0.0675 0.115 0.227 DC L1
ENSG00000134644 PUM1 -223987 sc-eQTL 9.75e-01 0.00284 0.0898 0.227 DC L1
ENSG00000162511 LAPTM5 84230 sc-eQTL 9.97e-01 -0.000247 0.0641 0.227 DC L1
ENSG00000162517 PEF1 -802892 sc-eQTL 1.11e-01 0.165 0.103 0.227 DC L1
ENSG00000168528 SERINC2 -567561 sc-eQTL 5.31e-01 0.0663 0.106 0.227 DC L1
ENSG00000284543 LINC01226 -664222 sc-eQTL 6.61e-02 0.128 0.0695 0.227 DC L1
ENSG00000287510 AL137857.1 110311 sc-eQTL 1.26e-01 0.155 0.101 0.227 DC L1
ENSG00000060688 SNRNP40 -454784 sc-eQTL 7.81e-01 0.0211 0.0757 0.224 Mono L1
ENSG00000121766 ZCCHC17 -454978 sc-eQTL 1.10e-01 -0.15 0.0933 0.224 Mono L1
ENSG00000134644 PUM1 -223987 sc-eQTL 2.90e-01 0.0636 0.06 0.224 Mono L1
ENSG00000162511 LAPTM5 84230 sc-eQTL 2.59e-01 -0.0625 0.0552 0.224 Mono L1
ENSG00000162512 SDC3 -66754 sc-eQTL 4.87e-02 -0.209 0.105 0.224 Mono L1
ENSG00000162517 PEF1 -802892 sc-eQTL 2.82e-02 -0.163 0.0738 0.224 Mono L1
ENSG00000168528 SERINC2 -567561 sc-eQTL 3.08e-01 0.117 0.114 0.224 Mono L1
ENSG00000284543 LINC01226 -664222 sc-eQTL 9.29e-01 0.00892 0.101 0.224 Mono L1
ENSG00000287510 AL137857.1 110311 sc-eQTL 9.88e-01 -0.00134 0.0879 0.224 Mono L1
ENSG00000060688 SNRNP40 -454784 sc-eQTL 6.41e-01 -0.0481 0.103 0.223 NK L1
ENSG00000121753 ADGRB2 -922889 sc-eQTL 5.61e-01 0.0517 0.0887 0.223 NK L1
ENSG00000121766 ZCCHC17 -454978 sc-eQTL 1.04e-01 -0.115 0.0701 0.223 NK L1
ENSG00000134644 PUM1 -223987 sc-eQTL 6.59e-01 -0.0327 0.074 0.223 NK L1
ENSG00000162511 LAPTM5 84230 sc-eQTL 1.26e-01 0.13 0.0847 0.223 NK L1
ENSG00000162517 PEF1 -802892 sc-eQTL 9.15e-01 0.00666 0.0622 0.223 NK L1
ENSG00000186056 MATN1-AS1 123500 sc-eQTL 8.24e-01 -0.0214 0.0957 0.223 NK L1
ENSG00000287510 AL137857.1 110311 sc-eQTL 1.47e-01 0.128 0.0879 0.223 NK L1
ENSG00000060688 SNRNP40 -454784 sc-eQTL 8.37e-01 -0.0163 0.0792 0.224 Other_T L1
ENSG00000121766 ZCCHC17 -454978 sc-eQTL 8.28e-01 0.0185 0.0846 0.224 Other_T L1
ENSG00000134644 PUM1 -223987 sc-eQTL 5.50e-01 -0.0455 0.076 0.224 Other_T L1
ENSG00000162511 LAPTM5 84230 sc-eQTL 1.95e-01 -0.0808 0.0621 0.224 Other_T L1
ENSG00000162517 PEF1 -802892 sc-eQTL 7.58e-01 0.0257 0.0833 0.224 Other_T L1
ENSG00000186056 MATN1-AS1 123500 sc-eQTL 1.18e-01 -0.159 0.102 0.224 Other_T L1
ENSG00000287510 AL137857.1 110311 sc-eQTL 4.64e-01 -0.0779 0.106 0.224 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000060688 SNRNP40 -454784 sc-eQTL 6.59e-01 0.0552 0.125 0.224 B_Activated L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -454978 sc-eQTL 1.79e-01 0.169 0.125 0.224 B_Activated L2
ENSG00000134644 PUM1 -223987 sc-eQTL 7.27e-02 -0.21 0.116 0.224 B_Activated L2
ENSG00000162510 MATN1 118419 sc-eQTL 3.09e-01 0.104 0.102 0.224 B_Activated L2
ENSG00000162511 LAPTM5 84230 sc-eQTL 8.61e-01 -0.0125 0.0714 0.224 B_Activated L2
ENSG00000162517 PEF1 -802892 sc-eQTL 1.57e-01 -0.172 0.121 0.224 B_Activated L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 123500 sc-eQTL 3.61e-01 -0.105 0.115 0.224 B_Activated L2
ENSG00000287510 AL137857.1 110311 sc-eQTL 5.80e-01 -0.0566 0.102 0.224 B_Activated L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -454784 sc-eQTL 8.25e-01 -0.0257 0.116 0.225 B_Intermediate L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -454978 sc-eQTL 3.86e-01 -0.0841 0.0968 0.225 B_Intermediate L2
ENSG00000134644 PUM1 -223987 sc-eQTL 3.30e-01 -0.0891 0.0912 0.225 B_Intermediate L2
ENSG00000162510 MATN1 118419 sc-eQTL 4.64e-03 -0.267 0.0934 0.225 B_Intermediate L2
ENSG00000162511 LAPTM5 84230 sc-eQTL 9.44e-01 0.00411 0.0584 0.225 B_Intermediate L2
ENSG00000162517 PEF1 -802892 sc-eQTL 7.36e-01 0.0365 0.108 0.225 B_Intermediate L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 123500 sc-eQTL 5.49e-01 0.0492 0.0819 0.225 B_Intermediate L2
ENSG00000287510 AL137857.1 110311 sc-eQTL 3.26e-01 0.09 0.0915 0.225 B_Intermediate L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -454784 sc-eQTL 7.79e-01 0.0322 0.115 0.226 B_Memory L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -454978 sc-eQTL 7.89e-01 0.0283 0.106 0.226 B_Memory L2
ENSG00000134644 PUM1 -223987 sc-eQTL 8.59e-02 -0.157 0.0912 0.226 B_Memory L2
ENSG00000162510 MATN1 118419 sc-eQTL 9.60e-01 -0.00443 0.0879 0.226 B_Memory L2
ENSG00000162511 LAPTM5 84230 sc-eQTL 1.40e-01 0.115 0.0775 0.226 B_Memory L2
ENSG00000162517 PEF1 -802892 sc-eQTL 7.48e-01 0.0335 0.104 0.226 B_Memory L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 123500 sc-eQTL 9.83e-01 -0.00193 0.0891 0.226 B_Memory L2
ENSG00000287510 AL137857.1 110311 sc-eQTL 9.70e-01 0.00392 0.104 0.226 B_Memory L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -454784 sc-eQTL 5.95e-01 -0.0551 0.103 0.224 B_Naive1 L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -454978 sc-eQTL 6.12e-01 -0.0454 0.0893 0.224 B_Naive1 L2
ENSG00000134644 PUM1 -223987 sc-eQTL 6.65e-01 0.0341 0.0788 0.224 B_Naive1 L2
ENSG00000162510 MATN1 118419 sc-eQTL 7.92e-01 0.0212 0.08 0.224 B_Naive1 L2
ENSG00000162511 LAPTM5 84230 sc-eQTL 5.14e-02 0.104 0.053 0.224 B_Naive1 L2
ENSG00000162517 PEF1 -802892 sc-eQTL 3.77e-01 0.0833 0.094 0.224 B_Naive1 L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 123500 sc-eQTL 2.96e-01 0.0734 0.07 0.224 B_Naive1 L2
ENSG00000287510 AL137857.1 110311 sc-eQTL 7.56e-01 -0.027 0.0867 0.224 B_Naive1 L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -454784 sc-eQTL 4.93e-01 -0.0761 0.111 0.225 B_Naive2 L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -454978 sc-eQTL 4.42e-02 -0.183 0.0906 0.225 B_Naive2 L2
ENSG00000134644 PUM1 -223987 sc-eQTL 9.44e-01 -0.00634 0.0895 0.225 B_Naive2 L2
ENSG00000162510 MATN1 118419 sc-eQTL 7.55e-01 -0.0268 0.0859 0.225 B_Naive2 L2
ENSG00000162511 LAPTM5 84230 sc-eQTL 5.10e-01 0.0385 0.0583 0.225 B_Naive2 L2
ENSG00000162517 PEF1 -802892 sc-eQTL 8.31e-01 -0.0226 0.106 0.225 B_Naive2 L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 123500 sc-eQTL 7.89e-01 0.0228 0.0849 0.225 B_Naive2 L2
ENSG00000287510 AL137857.1 110311 sc-eQTL 5.98e-01 0.0485 0.0917 0.225 B_Naive2 L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -454784 sc-eQTL 7.25e-01 -0.0397 0.113 0.225 CD4_CTL L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -454978 sc-eQTL 4.85e-01 -0.0774 0.111 0.225 CD4_CTL L2
ENSG00000134644 PUM1 -223987 sc-eQTL 2.87e-01 -0.116 0.108 0.225 CD4_CTL L2
ENSG00000162511 LAPTM5 84230 sc-eQTL 5.28e-01 0.0612 0.0968 0.225 CD4_CTL L2
ENSG00000162517 PEF1 -802892 sc-eQTL 5.14e-01 0.0649 0.0993 0.225 CD4_CTL L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 123500 sc-eQTL 9.74e-01 -0.00349 0.106 0.225 CD4_CTL L2
ENSG00000287510 AL137857.1 110311 sc-eQTL 7.36e-01 -0.0316 0.0935 0.225 CD4_CTL L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -454784 sc-eQTL 4.43e-01 -0.0657 0.0854 0.224 CD4_Naive L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -454978 sc-eQTL 7.62e-01 -0.023 0.0758 0.224 CD4_Naive L2
ENSG00000134644 PUM1 -223987 sc-eQTL 9.28e-01 -0.0055 0.0606 0.224 CD4_Naive L2
ENSG00000162511 LAPTM5 84230 sc-eQTL 6.78e-01 -0.027 0.0649 0.224 CD4_Naive L2
ENSG00000162517 PEF1 -802892 sc-eQTL 7.55e-01 -0.0222 0.0711 0.224 CD4_Naive L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 123500 sc-eQTL 2.41e-01 -0.0771 0.0656 0.224 CD4_Naive L2
ENSG00000287510 AL137857.1 110311 sc-eQTL 3.78e-01 0.0667 0.0755 0.224 CD4_Naive L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -454784 sc-eQTL 8.98e-01 -0.0137 0.107 0.224 CD4_TCM L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -454978 sc-eQTL 3.96e-01 0.0733 0.0862 0.224 CD4_TCM L2
ENSG00000134644 PUM1 -223987 sc-eQTL 9.12e-01 0.00844 0.0765 0.224 CD4_TCM L2
ENSG00000162511 LAPTM5 84230 sc-eQTL 4.81e-01 0.0447 0.0634 0.224 CD4_TCM L2
ENSG00000162517 PEF1 -802892 sc-eQTL 4.33e-01 0.0668 0.0849 0.224 CD4_TCM L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 123500 sc-eQTL 5.05e-01 0.0537 0.0804 0.224 CD4_TCM L2
ENSG00000287510 AL137857.1 110311 sc-eQTL 4.05e-02 0.183 0.0888 0.224 CD4_TCM L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -454784 sc-eQTL 6.92e-01 0.0424 0.107 0.224 CD4_TEM L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -454978 sc-eQTL 5.70e-01 -0.058 0.102 0.224 CD4_TEM L2
ENSG00000134644 PUM1 -223987 sc-eQTL 5.99e-01 -0.0447 0.085 0.224 CD4_TEM L2
ENSG00000162511 LAPTM5 84230 sc-eQTL 8.02e-01 -0.0216 0.086 0.224 CD4_TEM L2
ENSG00000162517 PEF1 -802892 sc-eQTL 4.06e-02 0.197 0.0954 0.224 CD4_TEM L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 123500 sc-eQTL 8.44e-01 -0.0198 0.101 0.224 CD4_TEM L2
ENSG00000287510 AL137857.1 110311 sc-eQTL 7.11e-01 0.0368 0.0991 0.224 CD4_TEM L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -454784 sc-eQTL 5.92e-01 -0.0636 0.119 0.224 CD8_CTL L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -454978 sc-eQTL 1.85e-01 -0.121 0.0906 0.224 CD8_CTL L2
ENSG00000134644 PUM1 -223987 sc-eQTL 9.30e-01 0.0078 0.0883 0.224 CD8_CTL L2
ENSG00000162511 LAPTM5 84230 sc-eQTL 2.56e-01 0.111 0.0975 0.224 CD8_CTL L2
ENSG00000162517 PEF1 -802892 sc-eQTL 5.39e-01 0.0524 0.0851 0.224 CD8_CTL L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 123500 sc-eQTL 3.05e-01 0.105 0.103 0.224 CD8_CTL L2
ENSG00000287510 AL137857.1 110311 sc-eQTL 9.50e-01 -0.00609 0.0967 0.224 CD8_CTL L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -454784 sc-eQTL 7.33e-01 -0.0366 0.107 0.224 CD8_Naive L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -454978 sc-eQTL 2.76e-01 -0.1 0.0919 0.224 CD8_Naive L2
ENSG00000134644 PUM1 -223987 sc-eQTL 4.95e-01 -0.0506 0.0741 0.224 CD8_Naive L2
ENSG00000162511 LAPTM5 84230 sc-eQTL 6.92e-01 -0.0282 0.071 0.224 CD8_Naive L2
ENSG00000162517 PEF1 -802892 sc-eQTL 6.71e-01 -0.0421 0.0988 0.224 CD8_Naive L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 123500 sc-eQTL 7.34e-01 0.0302 0.0887 0.224 CD8_Naive L2
ENSG00000287510 AL137857.1 110311 sc-eQTL 8.68e-01 -0.016 0.0966 0.224 CD8_Naive L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -454784 sc-eQTL 8.45e-01 0.0229 0.117 0.227 CD8_TCM L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -454978 sc-eQTL 7.32e-01 -0.0368 0.107 0.227 CD8_TCM L2
ENSG00000134644 PUM1 -223987 sc-eQTL 1.54e-01 0.144 0.1 0.227 CD8_TCM L2
ENSG00000162511 LAPTM5 84230 sc-eQTL 7.48e-01 0.034 0.106 0.227 CD8_TCM L2
ENSG00000162517 PEF1 -802892 sc-eQTL 7.59e-01 0.0331 0.108 0.227 CD8_TCM L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 123500 sc-eQTL 9.41e-01 -0.00727 0.0978 0.227 CD8_TCM L2
ENSG00000287510 AL137857.1 110311 sc-eQTL 2.25e-01 0.12 0.0985 0.227 CD8_TCM L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -454784 sc-eQTL 4.76e-01 -0.0798 0.112 0.235 CD8_TEM L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -454978 sc-eQTL 3.69e-01 -0.0963 0.107 0.235 CD8_TEM L2
ENSG00000134644 PUM1 -223987 sc-eQTL 1.06e-01 0.177 0.109 0.235 CD8_TEM L2
ENSG00000162511 LAPTM5 84230 sc-eQTL 3.34e-01 -0.0996 0.103 0.235 CD8_TEM L2
ENSG00000162517 PEF1 -802892 sc-eQTL 3.68e-01 -0.0873 0.0968 0.235 CD8_TEM L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 123500 sc-eQTL 5.39e-01 -0.0658 0.107 0.235 CD8_TEM L2
ENSG00000287510 AL137857.1 110311 sc-eQTL 7.30e-01 0.0334 0.0968 0.235 CD8_TEM L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -454784 sc-eQTL 6.97e-02 -0.208 0.114 0.227 MAIT L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -454978 sc-eQTL 4.19e-01 -0.0826 0.102 0.227 MAIT L2
ENSG00000134644 PUM1 -223987 sc-eQTL 9.14e-01 -0.0106 0.0978 0.227 MAIT L2
ENSG00000162511 LAPTM5 84230 sc-eQTL 3.41e-01 -0.0878 0.0921 0.227 MAIT L2
ENSG00000162517 PEF1 -802892 sc-eQTL 2.73e-01 -0.111 0.101 0.227 MAIT L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 123500 sc-eQTL 9.95e-01 -0.000656 0.103 0.227 MAIT L2
ENSG00000287510 AL137857.1 110311 sc-eQTL 5.47e-01 0.0639 0.106 0.227 MAIT L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -454784 sc-eQTL 2.77e-01 0.129 0.118 0.227 NK_CD56bright L2
ENSG00000121753 ADGRB2 -922889 sc-eQTL 9.56e-01 -0.00507 0.0927 0.227 NK_CD56bright L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -454978 sc-eQTL 2.31e-01 -0.12 0.0997 0.227 NK_CD56bright L2
ENSG00000134644 PUM1 -223987 sc-eQTL 1.09e-01 -0.168 0.104 0.227 NK_CD56bright L2
ENSG00000162511 LAPTM5 84230 sc-eQTL 6.23e-01 0.051 0.104 0.227 NK_CD56bright L2
ENSG00000162517 PEF1 -802892 sc-eQTL 1.35e-01 0.15 0.1 0.227 NK_CD56bright L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 123500 sc-eQTL 1.39e-02 -0.255 0.103 0.227 NK_CD56bright L2
ENSG00000287510 AL137857.1 110311 sc-eQTL 1.41e-01 0.151 0.102 0.227 NK_CD56bright L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -454784 sc-eQTL 8.41e-01 0.0219 0.109 0.224 NK_CD56dim L2
ENSG00000121753 ADGRB2 -922889 sc-eQTL 3.72e-01 0.0857 0.0957 0.224 NK_CD56dim L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -454978 sc-eQTL 2.70e-01 -0.0889 0.0804 0.224 NK_CD56dim L2
ENSG00000134644 PUM1 -223987 sc-eQTL 8.50e-01 -0.0156 0.0827 0.224 NK_CD56dim L2
ENSG00000162511 LAPTM5 84230 sc-eQTL 1.72e-01 0.12 0.0878 0.224 NK_CD56dim L2
ENSG00000162517 PEF1 -802892 sc-eQTL 7.18e-01 0.0284 0.0785 0.224 NK_CD56dim L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 123500 sc-eQTL 9.14e-01 0.0119 0.11 0.224 NK_CD56dim L2
ENSG00000287510 AL137857.1 110311 sc-eQTL 2.84e-01 0.0977 0.0909 0.224 NK_CD56dim L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -454784 sc-eQTL 1.23e-01 -0.182 0.118 0.226 NK_HLA L2
ENSG00000121753 ADGRB2 -922889 sc-eQTL 7.05e-01 -0.0356 0.094 0.226 NK_HLA L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -454978 sc-eQTL 5.49e-01 0.0634 0.106 0.226 NK_HLA L2
ENSG00000134644 PUM1 -223987 sc-eQTL 2.32e-01 0.123 0.103 0.226 NK_HLA L2
ENSG00000162511 LAPTM5 84230 sc-eQTL 2.33e-01 0.117 0.098 0.226 NK_HLA L2
ENSG00000162517 PEF1 -802892 sc-eQTL 5.76e-01 -0.062 0.111 0.226 NK_HLA L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 123500 sc-eQTL 5.18e-01 0.0677 0.104 0.226 NK_HLA L2
ENSG00000287510 AL137857.1 110311 sc-eQTL 6.37e-01 0.0477 0.101 0.226 NK_HLA L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -454784 sc-eQTL 2.12e-01 -0.133 0.106 0.224 NK_cytokine L2
ENSG00000121753 ADGRB2 -922889 sc-eQTL 5.86e-01 0.0524 0.096 0.224 NK_cytokine L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -454978 sc-eQTL 4.66e-01 -0.0606 0.0829 0.224 NK_cytokine L2
ENSG00000134644 PUM1 -223987 sc-eQTL 2.54e-01 -0.102 0.0895 0.224 NK_cytokine L2
ENSG00000162511 LAPTM5 84230 sc-eQTL 6.93e-02 0.179 0.0981 0.224 NK_cytokine L2
ENSG00000162517 PEF1 -802892 sc-eQTL 5.19e-01 -0.0544 0.0841 0.224 NK_cytokine L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 123500 sc-eQTL 7.29e-01 0.0364 0.105 0.224 NK_cytokine L2
ENSG00000287510 AL137857.1 110311 sc-eQTL 5.08e-01 0.0645 0.0974 0.224 NK_cytokine L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -454784 sc-eQTL 5.83e-02 -0.257 0.134 0.193 PB L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -454978 sc-eQTL 6.04e-01 -0.0823 0.158 0.193 PB L2
ENSG00000134644 PUM1 -223987 sc-eQTL 7.49e-01 0.044 0.138 0.193 PB L2
ENSG00000162510 MATN1 118419 sc-eQTL 2.60e-01 -0.144 0.128 0.193 PB L2
ENSG00000162511 LAPTM5 84230 sc-eQTL 5.30e-01 0.0576 0.0915 0.193 PB L2
ENSG00000162517 PEF1 -802892 sc-eQTL 3.32e-01 -0.137 0.141 0.193 PB L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 123500 sc-eQTL 8.29e-01 0.0272 0.125 0.193 PB L2
ENSG00000287510 AL137857.1 110311 sc-eQTL 6.55e-01 0.0599 0.133 0.193 PB L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -454784 sc-eQTL 6.29e-01 -0.0404 0.0834 0.226 Pro_T L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -454978 sc-eQTL 1.44e-01 0.154 0.105 0.226 Pro_T L2
ENSG00000134644 PUM1 -223987 sc-eQTL 8.48e-01 -0.0189 0.0988 0.226 Pro_T L2
ENSG00000162511 LAPTM5 84230 sc-eQTL 8.48e-01 -0.0136 0.0709 0.226 Pro_T L2
ENSG00000162517 PEF1 -802892 sc-eQTL 2.86e-01 -0.111 0.104 0.226 Pro_T L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 123500 sc-eQTL 2.55e-01 -0.113 0.0987 0.226 Pro_T L2
ENSG00000287510 AL137857.1 110311 sc-eQTL 8.21e-01 0.0206 0.0911 0.226 Pro_T L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -454784 sc-eQTL 6.07e-01 0.0575 0.112 0.224 Treg L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -454978 sc-eQTL 3.98e-01 0.0916 0.108 0.224 Treg L2
ENSG00000134644 PUM1 -223987 sc-eQTL 9.78e-01 -0.00242 0.0866 0.224 Treg L2
ENSG00000162511 LAPTM5 84230 sc-eQTL 1.58e-01 0.14 0.0987 0.224 Treg L2
ENSG00000162517 PEF1 -802892 sc-eQTL 3.81e-01 0.0939 0.107 0.224 Treg L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 123500 sc-eQTL 9.68e-02 0.167 0.1 0.224 Treg L2
ENSG00000287510 AL137857.1 110311 sc-eQTL 7.71e-01 -0.0294 0.101 0.224 Treg L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -454784 sc-eQTL 7.19e-01 -0.0413 0.114 0.234 cDC L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -454978 sc-eQTL 6.06e-01 -0.0641 0.124 0.234 cDC L2
ENSG00000134644 PUM1 -223987 sc-eQTL 3.23e-01 0.105 0.106 0.234 cDC L2
ENSG00000162511 LAPTM5 84230 sc-eQTL 7.85e-01 -0.0204 0.0746 0.234 cDC L2
ENSG00000162517 PEF1 -802892 sc-eQTL 1.38e-01 0.16 0.107 0.234 cDC L2
ENSG00000168528 SERINC2 -567561 sc-eQTL 7.78e-01 0.027 0.0958 0.234 cDC L2
ENSG00000284543 LINC01226 -664222 sc-eQTL 5.03e-01 -0.0631 0.0941 0.234 cDC L2
ENSG00000287510 AL137857.1 110311 sc-eQTL 7.80e-01 0.0284 0.101 0.234 cDC L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -454784 sc-eQTL 9.36e-01 -0.00723 0.0906 0.224 cMono_IL1B L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -454978 sc-eQTL 2.66e-01 -0.112 0.101 0.224 cMono_IL1B L2
ENSG00000134644 PUM1 -223987 sc-eQTL 1.70e-01 0.0939 0.0681 0.224 cMono_IL1B L2
ENSG00000162511 LAPTM5 84230 sc-eQTL 4.05e-01 -0.0501 0.0599 0.224 cMono_IL1B L2
ENSG00000162512 SDC3 -66754 sc-eQTL 3.86e-02 -0.233 0.112 0.224 cMono_IL1B L2
ENSG00000162517 PEF1 -802892 sc-eQTL 4.34e-01 -0.0723 0.0923 0.224 cMono_IL1B L2
ENSG00000168528 SERINC2 -567561 sc-eQTL 2.87e-01 0.122 0.114 0.224 cMono_IL1B L2
ENSG00000284543 LINC01226 -664222 sc-eQTL 9.99e-01 0.000187 0.101 0.224 cMono_IL1B L2
ENSG00000287510 AL137857.1 110311 sc-eQTL 4.74e-01 -0.0676 0.0943 0.224 cMono_IL1B L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -454784 sc-eQTL 4.78e-01 0.0677 0.0951 0.224 cMono_S100A L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -454978 sc-eQTL 4.57e-01 -0.0837 0.112 0.224 cMono_S100A L2
ENSG00000134644 PUM1 -223987 sc-eQTL 5.69e-01 0.0464 0.0813 0.224 cMono_S100A L2
ENSG00000162511 LAPTM5 84230 sc-eQTL 3.26e-02 -0.133 0.0618 0.224 cMono_S100A L2
ENSG00000162512 SDC3 -66754 sc-eQTL 3.01e-01 -0.112 0.108 0.224 cMono_S100A L2
ENSG00000162517 PEF1 -802892 sc-eQTL 8.49e-03 -0.255 0.0959 0.224 cMono_S100A L2
ENSG00000168528 SERINC2 -567561 sc-eQTL 3.57e-01 0.105 0.114 0.224 cMono_S100A L2
ENSG00000284543 LINC01226 -664222 sc-eQTL 8.56e-01 0.0169 0.0929 0.224 cMono_S100A L2
ENSG00000287510 AL137857.1 110311 sc-eQTL 1.25e-01 -0.143 0.0928 0.224 cMono_S100A L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -454784 sc-eQTL 8.37e-01 0.0275 0.134 0.236 gdT L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -454978 sc-eQTL 2.59e-01 0.13 0.114 0.236 gdT L2
ENSG00000134644 PUM1 -223987 sc-eQTL 6.31e-01 -0.0569 0.118 0.236 gdT L2
ENSG00000162511 LAPTM5 84230 sc-eQTL 9.12e-01 0.0143 0.129 0.236 gdT L2
ENSG00000162517 PEF1 -802892 sc-eQTL 7.33e-01 0.0403 0.118 0.236 gdT L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 123500 sc-eQTL 1.06e-01 -0.191 0.118 0.236 gdT L2
ENSG00000287510 AL137857.1 110311 sc-eQTL 7.94e-02 -0.201 0.114 0.236 gdT L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -454784 sc-eQTL 5.50e-01 -0.0631 0.105 0.227 intMono L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -454978 sc-eQTL 4.31e-01 -0.0893 0.113 0.227 intMono L2
ENSG00000134644 PUM1 -223987 sc-eQTL 4.95e-01 0.0656 0.096 0.227 intMono L2
ENSG00000162511 LAPTM5 84230 sc-eQTL 8.15e-01 0.0176 0.0754 0.227 intMono L2
ENSG00000162512 SDC3 -66754 sc-eQTL 8.75e-01 -0.0162 0.103 0.227 intMono L2
ENSG00000162517 PEF1 -802892 sc-eQTL 6.37e-01 0.0512 0.108 0.227 intMono L2
ENSG00000168528 SERINC2 -567561 sc-eQTL 9.59e-01 -0.00556 0.108 0.227 intMono L2
ENSG00000284543 LINC01226 -664222 sc-eQTL 1.93e-01 -0.133 0.102 0.227 intMono L2
ENSG00000287510 AL137857.1 110311 sc-eQTL 4.42e-02 0.205 0.101 0.227 intMono L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -454784 sc-eQTL 5.97e-01 0.0529 0.0998 0.224 ncMono L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -454978 sc-eQTL 5.09e-01 -0.0704 0.106 0.224 ncMono L2
ENSG00000134644 PUM1 -223987 sc-eQTL 6.69e-01 -0.0372 0.087 0.224 ncMono L2
ENSG00000162511 LAPTM5 84230 sc-eQTL 6.42e-01 0.0368 0.079 0.224 ncMono L2
ENSG00000162512 SDC3 -66754 sc-eQTL 3.72e-01 -0.0791 0.0884 0.224 ncMono L2
ENSG00000162517 PEF1 -802892 sc-eQTL 9.40e-01 -0.00766 0.102 0.224 ncMono L2
ENSG00000168528 SERINC2 -567561 sc-eQTL 9.10e-01 -0.011 0.0967 0.224 ncMono L2
ENSG00000284543 LINC01226 -664222 sc-eQTL 5.70e-01 0.0549 0.0965 0.224 ncMono L2
ENSG00000287510 AL137857.1 110311 sc-eQTL 2.41e-01 0.117 0.0998 0.224 ncMono L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -454784 sc-eQTL 4.72e-01 0.0829 0.115 0.234 pDC L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -454978 sc-eQTL 6.19e-01 -0.0629 0.126 0.234 pDC L2
ENSG00000134644 PUM1 -223987 sc-eQTL 3.10e-01 0.106 0.105 0.234 pDC L2
ENSG00000162511 LAPTM5 84230 sc-eQTL 7.21e-01 -0.0349 0.0975 0.234 pDC L2
ENSG00000162517 PEF1 -802892 sc-eQTL 9.05e-01 0.0151 0.126 0.234 pDC L2
ENSG00000168528 SERINC2 -567561 sc-eQTL 7.58e-01 -0.0364 0.118 0.234 pDC L2
ENSG00000284543 LINC01226 -664222 sc-eQTL 1.56e-01 0.13 0.0912 0.234 pDC L2
ENSG00000287510 AL137857.1 110311 sc-eQTL 2.60e-01 0.122 0.108 0.234 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000060688 SNRNP40 -454784 sc-eQTL 8.55e-01 0.0204 0.112 0.224 B_Memory LOneK1K
ENSG00000121766 ZCCHC17 -454978 sc-eQTL 9.25e-01 0.00873 0.0928 0.224 B_Memory LOneK1K
ENSG00000134644 PUM1 -223987 sc-eQTL 3.75e-02 -0.17 0.0814 0.224 B_Memory LOneK1K
ENSG00000162510 MATN1 118419 sc-eQTL 4.27e-02 -0.189 0.0929 0.224 B_Memory LOneK1K
ENSG00000162511 LAPTM5 84230 sc-eQTL 6.56e-01 0.0263 0.0589 0.224 B_Memory LOneK1K
ENSG00000162517 PEF1 -802892 sc-eQTL 8.82e-01 0.0145 0.0976 0.224 B_Memory LOneK1K
ENSG00000186056 MATN1-AS1 123500 sc-eQTL 8.76e-01 0.0122 0.0779 0.224 B_Memory LOneK1K
ENSG00000287510 AL137857.1 110311 sc-eQTL 7.38e-01 0.0284 0.0849 0.224 B_Memory LOneK1K
ENSG00000060688 SNRNP40 -454784 sc-eQTL 4.74e-01 -0.072 0.1 0.224 B_Naive LOneK1K
ENSG00000121766 ZCCHC17 -454978 sc-eQTL 1.15e-01 -0.125 0.079 0.224 B_Naive LOneK1K
ENSG00000134644 PUM1 -223987 sc-eQTL 8.05e-01 0.0186 0.0752 0.224 B_Naive LOneK1K
ENSG00000162510 MATN1 118419 sc-eQTL 9.12e-01 0.00803 0.0724 0.224 B_Naive LOneK1K
ENSG00000162511 LAPTM5 84230 sc-eQTL 7.53e-02 0.0904 0.0506 0.224 B_Naive LOneK1K
ENSG00000162517 PEF1 -802892 sc-eQTL 6.61e-01 0.0408 0.093 0.224 B_Naive LOneK1K
ENSG00000186056 MATN1-AS1 123500 sc-eQTL 3.35e-01 0.0634 0.0657 0.224 B_Naive LOneK1K
ENSG00000287510 AL137857.1 110311 sc-eQTL 7.68e-01 0.0231 0.0782 0.224 B_Naive LOneK1K
ENSG00000060688 SNRNP40 -454784 sc-eQTL 9.52e-01 -0.00518 0.0864 0.224 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000121766 ZCCHC17 -454978 sc-eQTL 2.07e-01 -0.123 0.0974 0.224 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000134644 PUM1 -223987 sc-eQTL 2.46e-01 0.0723 0.0622 0.224 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000162511 LAPTM5 84230 sc-eQTL 2.15e-01 -0.068 0.0546 0.224 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000162512 SDC3 -66754 sc-eQTL 3.85e-02 -0.231 0.111 0.224 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000162517 PEF1 -802892 sc-eQTL 2.10e-02 -0.181 0.0777 0.224 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000168528 SERINC2 -567561 sc-eQTL 3.44e-01 0.109 0.115 0.224 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000284543 LINC01226 -664222 sc-eQTL 5.47e-01 0.0569 0.0943 0.224 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000287510 AL137857.1 110311 sc-eQTL 3.30e-01 -0.086 0.0881 0.224 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000060688 SNRNP40 -454784 sc-eQTL 9.77e-01 0.00266 0.0939 0.222 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000121766 ZCCHC17 -454978 sc-eQTL 1.91e-01 -0.134 0.102 0.222 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000134644 PUM1 -223987 sc-eQTL 6.86e-01 0.0341 0.0841 0.222 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000162511 LAPTM5 84230 sc-eQTL 8.19e-01 0.0154 0.0673 0.222 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000162512 SDC3 -66754 sc-eQTL 2.78e-01 -0.107 0.0981 0.222 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000162517 PEF1 -802892 sc-eQTL 4.92e-01 0.0615 0.0893 0.222 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000168528 SERINC2 -567561 sc-eQTL 8.79e-01 0.0156 0.102 0.222 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000284543 LINC01226 -664222 sc-eQTL 3.09e-01 -0.0984 0.0966 0.222 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000287510 AL137857.1 110311 sc-eQTL 6.45e-02 0.179 0.0961 0.222 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000060688 SNRNP40 -454784 sc-eQTL 2.88e-01 -0.11 0.104 0.224 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000121753 ADGRB2 -922889 sc-eQTL 5.83e-01 0.0486 0.0883 0.224 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000121766 ZCCHC17 -454978 sc-eQTL 1.43e-01 -0.104 0.0705 0.224 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000134644 PUM1 -223987 sc-eQTL 8.63e-01 -0.0134 0.0777 0.224 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000162511 LAPTM5 84230 sc-eQTL 1.28e-01 0.132 0.0863 0.224 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000162517 PEF1 -802892 sc-eQTL 9.48e-01 -0.00434 0.066 0.224 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000186056 MATN1-AS1 123500 sc-eQTL 4.84e-01 0.0702 0.1 0.224 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000287510 AL137857.1 110311 sc-eQTL 1.32e-01 0.13 0.086 0.224 NK_CD56dim LOneK1K

Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF
ENSG00000121766 ZCCHC17 -454978 eQTL 5.07e-07 0.105 0.0208 0.0 0.0 0.225

Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina