logo

Genes within 1Mb (chr1:30838837:C:G):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD

Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000060688 SNRNP40 -457951 sc-eQTL 5.17e-01 -0.0657 0.101 0.186 B L1
ENSG00000121766 ZCCHC17 -458145 sc-eQTL 4.40e-01 -0.0627 0.081 0.186 B L1
ENSG00000134644 PUM1 -227154 sc-eQTL 9.86e-02 -0.112 0.0676 0.186 B L1
ENSG00000162510 MATN1 115252 sc-eQTL 2.87e-01 0.0761 0.0714 0.186 B L1
ENSG00000162511 LAPTM5 81063 sc-eQTL 1.53e-01 0.0801 0.0558 0.186 B L1
ENSG00000162517 PEF1 -806059 sc-eQTL 3.37e-01 -0.0812 0.0844 0.186 B L1
ENSG00000186056 MATN1-AS1 120333 sc-eQTL 1.22e-01 0.101 0.0653 0.186 B L1
ENSG00000287510 AL137857.1 107144 sc-eQTL 8.65e-01 0.0132 0.0777 0.186 B L1
ENSG00000060688 SNRNP40 -457951 sc-eQTL 8.39e-01 0.0178 0.0873 0.186 CD4T L1
ENSG00000121766 ZCCHC17 -458145 sc-eQTL 7.53e-01 -0.0215 0.0682 0.186 CD4T L1
ENSG00000134644 PUM1 -227154 sc-eQTL 6.16e-01 -0.0305 0.0607 0.186 CD4T L1
ENSG00000162511 LAPTM5 81063 sc-eQTL 5.81e-01 0.0372 0.0673 0.186 CD4T L1
ENSG00000162517 PEF1 -806059 sc-eQTL 8.85e-01 -0.0102 0.0704 0.186 CD4T L1
ENSG00000186056 MATN1-AS1 120333 sc-eQTL 3.46e-01 0.0568 0.0601 0.186 CD4T L1
ENSG00000287510 AL137857.1 107144 sc-eQTL 9.67e-01 -0.00297 0.0721 0.186 CD4T L1
ENSG00000060688 SNRNP40 -457951 sc-eQTL 8.27e-01 -0.0252 0.116 0.186 CD8T L1
ENSG00000121766 ZCCHC17 -458145 sc-eQTL 3.54e-01 -0.0713 0.0767 0.186 CD8T L1
ENSG00000134644 PUM1 -227154 sc-eQTL 3.89e-01 -0.0583 0.0676 0.186 CD8T L1
ENSG00000162511 LAPTM5 81063 sc-eQTL 4.50e-01 0.0497 0.0657 0.186 CD8T L1
ENSG00000162517 PEF1 -806059 sc-eQTL 7.92e-01 -0.0214 0.081 0.186 CD8T L1
ENSG00000186056 MATN1-AS1 120333 sc-eQTL 5.36e-02 0.148 0.0764 0.186 CD8T L1
ENSG00000287510 AL137857.1 107144 sc-eQTL 9.36e-01 0.00772 0.0968 0.186 CD8T L1
ENSG00000060688 SNRNP40 -457951 sc-eQTL 9.52e-01 -0.0063 0.105 0.191 DC L1
ENSG00000121766 ZCCHC17 -458145 sc-eQTL 7.66e-01 -0.0369 0.124 0.191 DC L1
ENSG00000134644 PUM1 -227154 sc-eQTL 7.89e-01 0.026 0.0972 0.191 DC L1
ENSG00000162511 LAPTM5 81063 sc-eQTL 6.55e-01 -0.031 0.0694 0.191 DC L1
ENSG00000162517 PEF1 -806059 sc-eQTL 5.47e-02 0.216 0.112 0.191 DC L1
ENSG00000168528 SERINC2 -570728 sc-eQTL 6.09e-01 -0.0587 0.114 0.191 DC L1
ENSG00000284543 LINC01226 -667389 sc-eQTL 7.78e-02 0.133 0.0752 0.191 DC L1
ENSG00000287510 AL137857.1 107144 sc-eQTL 6.08e-01 0.0564 0.11 0.191 DC L1
ENSG00000060688 SNRNP40 -457951 sc-eQTL 7.68e-01 -0.0237 0.0803 0.186 Mono L1
ENSG00000121766 ZCCHC17 -458145 sc-eQTL 9.82e-03 -0.256 0.0981 0.186 Mono L1
ENSG00000134644 PUM1 -227154 sc-eQTL 5.84e-01 0.035 0.0638 0.186 Mono L1
ENSG00000162511 LAPTM5 81063 sc-eQTL 7.18e-01 -0.0212 0.0587 0.186 Mono L1
ENSG00000162512 SDC3 -69921 sc-eQTL 1.04e-01 -0.183 0.112 0.186 Mono L1
ENSG00000162517 PEF1 -806059 sc-eQTL 9.49e-02 -0.132 0.0787 0.186 Mono L1
ENSG00000168528 SERINC2 -570728 sc-eQTL 1.57e-01 0.171 0.121 0.186 Mono L1
ENSG00000284543 LINC01226 -667389 sc-eQTL 1.90e-01 -0.14 0.106 0.186 Mono L1
ENSG00000287510 AL137857.1 107144 sc-eQTL 3.37e-01 -0.0896 0.0931 0.186 Mono L1
ENSG00000060688 SNRNP40 -457951 sc-eQTL 1.47e-01 -0.16 0.11 0.187 NK L1
ENSG00000121753 ADGRB2 -926056 sc-eQTL 3.64e-01 0.0863 0.0949 0.187 NK L1
ENSG00000121766 ZCCHC17 -458145 sc-eQTL 4.05e-01 -0.063 0.0755 0.187 NK L1
ENSG00000134644 PUM1 -227154 sc-eQTL 8.24e-02 -0.137 0.0787 0.187 NK L1
ENSG00000162511 LAPTM5 81063 sc-eQTL 2.10e-01 0.114 0.0909 0.187 NK L1
ENSG00000162517 PEF1 -806059 sc-eQTL 8.15e-01 0.0156 0.0666 0.187 NK L1
ENSG00000186056 MATN1-AS1 120333 sc-eQTL 3.21e-01 0.102 0.102 0.187 NK L1
ENSG00000287510 AL137857.1 107144 sc-eQTL 9.18e-01 0.00982 0.0947 0.187 NK L1
ENSG00000060688 SNRNP40 -457951 sc-eQTL 4.16e-01 -0.0681 0.0836 0.186 Other_T L1
ENSG00000121766 ZCCHC17 -458145 sc-eQTL 5.50e-01 -0.0535 0.0894 0.186 Other_T L1
ENSG00000134644 PUM1 -227154 sc-eQTL 9.67e-01 -0.00335 0.0805 0.186 Other_T L1
ENSG00000162511 LAPTM5 81063 sc-eQTL 1.26e-01 -0.101 0.0656 0.186 Other_T L1
ENSG00000162517 PEF1 -806059 sc-eQTL 7.77e-01 -0.0249 0.0881 0.186 Other_T L1
ENSG00000186056 MATN1-AS1 120333 sc-eQTL 8.58e-01 -0.0194 0.108 0.186 Other_T L1
ENSG00000287510 AL137857.1 107144 sc-eQTL 8.98e-01 -0.0144 0.112 0.186 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000060688 SNRNP40 -457951 sc-eQTL 7.08e-01 0.0491 0.131 0.184 B_Activated L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -458145 sc-eQTL 1.47e-01 0.192 0.131 0.184 B_Activated L2
ENSG00000134644 PUM1 -227154 sc-eQTL 6.44e-01 -0.057 0.123 0.184 B_Activated L2
ENSG00000162510 MATN1 115252 sc-eQTL 3.97e-01 0.0911 0.107 0.184 B_Activated L2
ENSG00000162511 LAPTM5 81063 sc-eQTL 9.47e-01 0.00497 0.0749 0.184 B_Activated L2
ENSG00000162517 PEF1 -806059 sc-eQTL 2.33e-01 -0.152 0.127 0.184 B_Activated L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 120333 sc-eQTL 5.87e-01 -0.0657 0.121 0.184 B_Activated L2
ENSG00000287510 AL137857.1 107144 sc-eQTL 4.28e-01 -0.0848 0.107 0.184 B_Activated L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -457951 sc-eQTL 5.79e-01 0.0693 0.125 0.185 B_Intermediate L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -458145 sc-eQTL 6.78e-01 -0.0433 0.104 0.185 B_Intermediate L2
ENSG00000134644 PUM1 -227154 sc-eQTL 7.08e-01 -0.0368 0.0981 0.185 B_Intermediate L2
ENSG00000162510 MATN1 115252 sc-eQTL 3.48e-01 -0.0958 0.102 0.185 B_Intermediate L2
ENSG00000162511 LAPTM5 81063 sc-eQTL 6.82e-01 0.0257 0.0627 0.185 B_Intermediate L2
ENSG00000162517 PEF1 -806059 sc-eQTL 3.87e-01 -0.101 0.116 0.185 B_Intermediate L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 120333 sc-eQTL 7.08e-01 -0.033 0.0879 0.185 B_Intermediate L2
ENSG00000287510 AL137857.1 107144 sc-eQTL 2.23e-01 0.12 0.0981 0.185 B_Intermediate L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -457951 sc-eQTL 9.43e-01 0.00874 0.123 0.188 B_Memory L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -458145 sc-eQTL 6.44e-01 -0.0525 0.113 0.188 B_Memory L2
ENSG00000134644 PUM1 -227154 sc-eQTL 7.40e-02 -0.176 0.0979 0.188 B_Memory L2
ENSG00000162510 MATN1 115252 sc-eQTL 9.55e-01 -0.00534 0.0943 0.188 B_Memory L2
ENSG00000162511 LAPTM5 81063 sc-eQTL 4.73e-01 0.06 0.0835 0.188 B_Memory L2
ENSG00000162517 PEF1 -806059 sc-eQTL 9.48e-01 0.0073 0.112 0.188 B_Memory L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 120333 sc-eQTL 3.74e-02 0.198 0.0947 0.188 B_Memory L2
ENSG00000287510 AL137857.1 107144 sc-eQTL 1.67e-01 -0.155 0.112 0.188 B_Memory L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -457951 sc-eQTL 1.51e-01 -0.16 0.111 0.186 B_Naive1 L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -458145 sc-eQTL 7.43e-01 -0.0316 0.0963 0.186 B_Naive1 L2
ENSG00000134644 PUM1 -227154 sc-eQTL 6.66e-01 -0.0367 0.0849 0.186 B_Naive1 L2
ENSG00000162510 MATN1 115252 sc-eQTL 1.54e-01 0.123 0.0858 0.186 B_Naive1 L2
ENSG00000162511 LAPTM5 81063 sc-eQTL 1.02e-01 0.094 0.0572 0.186 B_Naive1 L2
ENSG00000162517 PEF1 -806059 sc-eQTL 6.60e-01 0.0448 0.101 0.186 B_Naive1 L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 120333 sc-eQTL 1.94e-01 0.0981 0.0753 0.186 B_Naive1 L2
ENSG00000287510 AL137857.1 107144 sc-eQTL 5.71e-01 -0.053 0.0934 0.186 B_Naive1 L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -457951 sc-eQTL 4.35e-01 0.0922 0.118 0.187 B_Naive2 L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -458145 sc-eQTL 6.22e-02 -0.181 0.0966 0.187 B_Naive2 L2
ENSG00000134644 PUM1 -227154 sc-eQTL 5.24e-01 -0.0608 0.0952 0.187 B_Naive2 L2
ENSG00000162510 MATN1 115252 sc-eQTL 5.97e-01 0.0485 0.0915 0.187 B_Naive2 L2
ENSG00000162511 LAPTM5 81063 sc-eQTL 1.92e-01 0.081 0.0619 0.187 B_Naive2 L2
ENSG00000162517 PEF1 -806059 sc-eQTL 8.16e-01 -0.0263 0.113 0.187 B_Naive2 L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 120333 sc-eQTL 8.82e-01 0.0134 0.0905 0.187 B_Naive2 L2
ENSG00000287510 AL137857.1 107144 sc-eQTL 7.16e-01 0.0356 0.0977 0.187 B_Naive2 L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -457951 sc-eQTL 3.67e-01 -0.106 0.117 0.186 CD4_CTL L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -458145 sc-eQTL 8.80e-01 -0.0175 0.116 0.186 CD4_CTL L2
ENSG00000134644 PUM1 -227154 sc-eQTL 3.78e-01 -0.1 0.113 0.186 CD4_CTL L2
ENSG00000162511 LAPTM5 81063 sc-eQTL 7.10e-01 0.0376 0.101 0.186 CD4_CTL L2
ENSG00000162517 PEF1 -806059 sc-eQTL 2.18e-01 0.127 0.103 0.186 CD4_CTL L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 120333 sc-eQTL 9.05e-01 0.0132 0.111 0.186 CD4_CTL L2
ENSG00000287510 AL137857.1 107144 sc-eQTL 1.79e-01 -0.131 0.0971 0.186 CD4_CTL L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -457951 sc-eQTL 5.86e-01 -0.0498 0.0912 0.186 CD4_Naive L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -458145 sc-eQTL 3.47e-01 -0.0761 0.0808 0.186 CD4_Naive L2
ENSG00000134644 PUM1 -227154 sc-eQTL 8.05e-01 -0.016 0.0646 0.186 CD4_Naive L2
ENSG00000162511 LAPTM5 81063 sc-eQTL 8.54e-01 -0.0128 0.0692 0.186 CD4_Naive L2
ENSG00000162517 PEF1 -806059 sc-eQTL 3.30e-01 -0.0739 0.0758 0.186 CD4_Naive L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 120333 sc-eQTL 5.28e-01 0.0443 0.0702 0.186 CD4_Naive L2
ENSG00000287510 AL137857.1 107144 sc-eQTL 9.06e-01 -0.00952 0.0807 0.186 CD4_Naive L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -457951 sc-eQTL 9.88e-01 -0.00179 0.115 0.186 CD4_TCM L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -458145 sc-eQTL 6.35e-02 0.171 0.0916 0.186 CD4_TCM L2
ENSG00000134644 PUM1 -227154 sc-eQTL 6.67e-01 -0.0352 0.0817 0.186 CD4_TCM L2
ENSG00000162511 LAPTM5 81063 sc-eQTL 3.01e-01 0.0702 0.0676 0.186 CD4_TCM L2
ENSG00000162517 PEF1 -806059 sc-eQTL 9.68e-01 0.00361 0.0909 0.186 CD4_TCM L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 120333 sc-eQTL 5.63e-01 0.0498 0.086 0.186 CD4_TCM L2
ENSG00000287510 AL137857.1 107144 sc-eQTL 1.10e-01 0.153 0.0953 0.186 CD4_TCM L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -457951 sc-eQTL 7.74e-01 -0.0331 0.115 0.186 CD4_TEM L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -458145 sc-eQTL 5.68e-01 -0.0629 0.11 0.186 CD4_TEM L2
ENSG00000134644 PUM1 -227154 sc-eQTL 7.55e-01 -0.0287 0.0916 0.186 CD4_TEM L2
ENSG00000162511 LAPTM5 81063 sc-eQTL 6.36e-01 0.0439 0.0926 0.186 CD4_TEM L2
ENSG00000162517 PEF1 -806059 sc-eQTL 3.89e-01 0.0894 0.104 0.186 CD4_TEM L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 120333 sc-eQTL 6.91e-02 -0.196 0.108 0.186 CD4_TEM L2
ENSG00000287510 AL137857.1 107144 sc-eQTL 5.89e-01 0.0578 0.107 0.186 CD4_TEM L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -457951 sc-eQTL 8.62e-01 0.0219 0.125 0.186 CD8_CTL L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -458145 sc-eQTL 2.19e-02 -0.219 0.0949 0.186 CD8_CTL L2
ENSG00000134644 PUM1 -227154 sc-eQTL 9.18e-01 -0.00967 0.0934 0.186 CD8_CTL L2
ENSG00000162511 LAPTM5 81063 sc-eQTL 1.67e-01 0.143 0.103 0.186 CD8_CTL L2
ENSG00000162517 PEF1 -806059 sc-eQTL 4.14e-01 0.0735 0.0899 0.186 CD8_CTL L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 120333 sc-eQTL 4.37e-01 0.0845 0.109 0.186 CD8_CTL L2
ENSG00000287510 AL137857.1 107144 sc-eQTL 1.00e+00 1.49e-05 0.102 0.186 CD8_CTL L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -457951 sc-eQTL 4.69e-01 0.0832 0.115 0.186 CD8_Naive L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -458145 sc-eQTL 7.51e-01 -0.0315 0.099 0.186 CD8_Naive L2
ENSG00000134644 PUM1 -227154 sc-eQTL 3.18e-01 -0.0796 0.0795 0.186 CD8_Naive L2
ENSG00000162511 LAPTM5 81063 sc-eQTL 2.35e-01 -0.0905 0.0761 0.186 CD8_Naive L2
ENSG00000162517 PEF1 -806059 sc-eQTL 7.81e-01 0.0295 0.106 0.186 CD8_Naive L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 120333 sc-eQTL 1.39e-01 0.141 0.0948 0.186 CD8_Naive L2
ENSG00000287510 AL137857.1 107144 sc-eQTL 9.76e-01 0.00311 0.104 0.186 CD8_Naive L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -457951 sc-eQTL 6.88e-01 0.0509 0.127 0.188 CD8_TCM L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -458145 sc-eQTL 8.06e-01 -0.0286 0.116 0.188 CD8_TCM L2
ENSG00000134644 PUM1 -227154 sc-eQTL 6.40e-01 0.0511 0.109 0.188 CD8_TCM L2
ENSG00000162511 LAPTM5 81063 sc-eQTL 8.76e-01 -0.0179 0.114 0.188 CD8_TCM L2
ENSG00000162517 PEF1 -806059 sc-eQTL 3.73e-01 0.104 0.117 0.188 CD8_TCM L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 120333 sc-eQTL 1.25e-01 -0.162 0.105 0.188 CD8_TCM L2
ENSG00000287510 AL137857.1 107144 sc-eQTL 6.75e-01 0.0449 0.107 0.188 CD8_TCM L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -457951 sc-eQTL 6.03e-01 -0.0629 0.121 0.192 CD8_TEM L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -458145 sc-eQTL 3.34e-01 -0.112 0.115 0.192 CD8_TEM L2
ENSG00000134644 PUM1 -227154 sc-eQTL 6.80e-02 0.215 0.117 0.192 CD8_TEM L2
ENSG00000162511 LAPTM5 81063 sc-eQTL 1.76e-01 -0.15 0.111 0.192 CD8_TEM L2
ENSG00000162517 PEF1 -806059 sc-eQTL 7.78e-02 -0.184 0.104 0.192 CD8_TEM L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 120333 sc-eQTL 5.04e-01 0.0773 0.115 0.192 CD8_TEM L2
ENSG00000287510 AL137857.1 107144 sc-eQTL 3.54e-01 -0.097 0.104 0.192 CD8_TEM L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -457951 sc-eQTL 3.56e-02 -0.256 0.121 0.188 MAIT L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -458145 sc-eQTL 3.72e-01 -0.0968 0.108 0.188 MAIT L2
ENSG00000134644 PUM1 -227154 sc-eQTL 7.25e-01 0.0366 0.104 0.188 MAIT L2
ENSG00000162511 LAPTM5 81063 sc-eQTL 2.03e-01 -0.125 0.0976 0.188 MAIT L2
ENSG00000162517 PEF1 -806059 sc-eQTL 1.20e-01 -0.167 0.107 0.188 MAIT L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 120333 sc-eQTL 3.12e-01 0.11 0.109 0.188 MAIT L2
ENSG00000287510 AL137857.1 107144 sc-eQTL 9.56e-01 -0.00616 0.112 0.188 MAIT L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -457951 sc-eQTL 7.11e-01 -0.0469 0.126 0.189 NK_CD56bright L2
ENSG00000121753 ADGRB2 -926056 sc-eQTL 5.80e-01 -0.0549 0.099 0.189 NK_CD56bright L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -458145 sc-eQTL 8.70e-01 -0.0175 0.107 0.189 NK_CD56bright L2
ENSG00000134644 PUM1 -227154 sc-eQTL 3.11e-02 -0.241 0.111 0.189 NK_CD56bright L2
ENSG00000162511 LAPTM5 81063 sc-eQTL 6.91e-01 -0.044 0.111 0.189 NK_CD56bright L2
ENSG00000162517 PEF1 -806059 sc-eQTL 3.99e-02 0.22 0.106 0.189 NK_CD56bright L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 120333 sc-eQTL 2.50e-02 -0.248 0.11 0.189 NK_CD56bright L2
ENSG00000287510 AL137857.1 107144 sc-eQTL 6.18e-01 -0.0547 0.11 0.189 NK_CD56bright L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -457951 sc-eQTL 5.15e-01 -0.0764 0.117 0.188 NK_CD56dim L2
ENSG00000121753 ADGRB2 -926056 sc-eQTL 5.12e-01 0.0677 0.103 0.188 NK_CD56dim L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -458145 sc-eQTL 4.14e-01 -0.0709 0.0866 0.188 NK_CD56dim L2
ENSG00000134644 PUM1 -227154 sc-eQTL 2.99e-01 -0.0924 0.0888 0.188 NK_CD56dim L2
ENSG00000162511 LAPTM5 81063 sc-eQTL 3.56e-01 0.0876 0.0947 0.188 NK_CD56dim L2
ENSG00000162517 PEF1 -806059 sc-eQTL 8.77e-01 0.0131 0.0844 0.188 NK_CD56dim L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 120333 sc-eQTL 2.64e-01 0.133 0.119 0.188 NK_CD56dim L2
ENSG00000287510 AL137857.1 107144 sc-eQTL 5.07e-01 -0.0652 0.098 0.188 NK_CD56dim L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -457951 sc-eQTL 2.16e-01 -0.155 0.125 0.194 NK_HLA L2
ENSG00000121753 ADGRB2 -926056 sc-eQTL 6.33e-01 0.0476 0.0994 0.194 NK_HLA L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -458145 sc-eQTL 7.28e-01 0.0389 0.112 0.194 NK_HLA L2
ENSG00000134644 PUM1 -227154 sc-eQTL 8.13e-01 0.0259 0.109 0.194 NK_HLA L2
ENSG00000162511 LAPTM5 81063 sc-eQTL 1.60e-01 0.146 0.103 0.194 NK_HLA L2
ENSG00000162517 PEF1 -806059 sc-eQTL 1.75e-01 -0.159 0.117 0.194 NK_HLA L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 120333 sc-eQTL 3.43e-01 0.105 0.11 0.194 NK_HLA L2
ENSG00000287510 AL137857.1 107144 sc-eQTL 4.62e-01 0.0788 0.107 0.194 NK_HLA L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -457951 sc-eQTL 7.33e-02 -0.204 0.113 0.188 NK_cytokine L2
ENSG00000121753 ADGRB2 -926056 sc-eQTL 1.61e-01 0.144 0.102 0.188 NK_cytokine L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -458145 sc-eQTL 7.91e-01 -0.0236 0.0889 0.188 NK_cytokine L2
ENSG00000134644 PUM1 -227154 sc-eQTL 3.27e-01 -0.0942 0.0959 0.188 NK_cytokine L2
ENSG00000162511 LAPTM5 81063 sc-eQTL 2.52e-01 0.121 0.106 0.188 NK_cytokine L2
ENSG00000162517 PEF1 -806059 sc-eQTL 6.81e-01 -0.0372 0.0902 0.188 NK_cytokine L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 120333 sc-eQTL 8.96e-01 0.0146 0.112 0.188 NK_cytokine L2
ENSG00000287510 AL137857.1 107144 sc-eQTL 5.66e-01 -0.06 0.104 0.188 NK_cytokine L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -457951 sc-eQTL 1.00e-01 -0.239 0.144 0.163 PB L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -458145 sc-eQTL 6.76e-01 0.0709 0.169 0.163 PB L2
ENSG00000134644 PUM1 -227154 sc-eQTL 9.72e-01 -0.00521 0.147 0.163 PB L2
ENSG00000162510 MATN1 115252 sc-eQTL 5.99e-01 -0.0721 0.137 0.163 PB L2
ENSG00000162511 LAPTM5 81063 sc-eQTL 6.48e-01 -0.0447 0.0979 0.163 PB L2
ENSG00000162517 PEF1 -806059 sc-eQTL 2.81e-01 -0.162 0.15 0.163 PB L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 120333 sc-eQTL 5.88e-01 -0.0727 0.134 0.163 PB L2
ENSG00000287510 AL137857.1 107144 sc-eQTL 3.75e-01 -0.127 0.142 0.163 PB L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -457951 sc-eQTL 6.74e-01 -0.0376 0.0891 0.185 Pro_T L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -458145 sc-eQTL 1.64e-01 0.157 0.113 0.185 Pro_T L2
ENSG00000134644 PUM1 -227154 sc-eQTL 6.37e-01 0.0499 0.106 0.185 Pro_T L2
ENSG00000162511 LAPTM5 81063 sc-eQTL 9.39e-01 0.00585 0.0757 0.185 Pro_T L2
ENSG00000162517 PEF1 -806059 sc-eQTL 5.19e-01 -0.0718 0.111 0.185 Pro_T L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 120333 sc-eQTL 9.79e-01 0.00273 0.106 0.185 Pro_T L2
ENSG00000287510 AL137857.1 107144 sc-eQTL 7.27e-01 -0.0341 0.0973 0.185 Pro_T L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -457951 sc-eQTL 1.53e-01 0.168 0.117 0.186 Treg L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -458145 sc-eQTL 9.56e-01 0.00634 0.114 0.186 Treg L2
ENSG00000134644 PUM1 -227154 sc-eQTL 1.20e-01 -0.142 0.0908 0.186 Treg L2
ENSG00000162511 LAPTM5 81063 sc-eQTL 8.14e-01 0.0246 0.105 0.186 Treg L2
ENSG00000162517 PEF1 -806059 sc-eQTL 2.71e-01 0.124 0.113 0.186 Treg L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 120333 sc-eQTL 4.52e-04 0.369 0.103 0.186 Treg L2
ENSG00000287510 AL137857.1 107144 sc-eQTL 1.21e-01 -0.164 0.106 0.186 Treg L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -457951 sc-eQTL 7.42e-01 -0.0409 0.124 0.19 cDC L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -458145 sc-eQTL 6.60e-01 -0.0592 0.134 0.19 cDC L2
ENSG00000134644 PUM1 -227154 sc-eQTL 5.41e-01 -0.0706 0.115 0.19 cDC L2
ENSG00000162511 LAPTM5 81063 sc-eQTL 6.76e-01 0.0339 0.0809 0.19 cDC L2
ENSG00000162517 PEF1 -806059 sc-eQTL 1.83e-01 0.156 0.117 0.19 cDC L2
ENSG00000168528 SERINC2 -570728 sc-eQTL 7.53e-01 0.0328 0.104 0.19 cDC L2
ENSG00000284543 LINC01226 -667389 sc-eQTL 7.53e-01 -0.0322 0.102 0.19 cDC L2
ENSG00000287510 AL137857.1 107144 sc-eQTL 4.03e-01 -0.0921 0.11 0.19 cDC L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -457951 sc-eQTL 6.21e-01 -0.0473 0.0956 0.186 cMono_IL1B L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -458145 sc-eQTL 5.49e-02 -0.204 0.106 0.186 cMono_IL1B L2
ENSG00000134644 PUM1 -227154 sc-eQTL 1.75e-01 0.0978 0.0719 0.186 cMono_IL1B L2
ENSG00000162511 LAPTM5 81063 sc-eQTL 6.67e-01 -0.0273 0.0634 0.186 cMono_IL1B L2
ENSG00000162512 SDC3 -69921 sc-eQTL 3.17e-02 -0.255 0.118 0.186 cMono_IL1B L2
ENSG00000162517 PEF1 -806059 sc-eQTL 2.01e-01 -0.125 0.0972 0.186 cMono_IL1B L2
ENSG00000168528 SERINC2 -570728 sc-eQTL 1.28e-01 0.184 0.12 0.186 cMono_IL1B L2
ENSG00000284543 LINC01226 -667389 sc-eQTL 1.57e-01 -0.151 0.106 0.186 cMono_IL1B L2
ENSG00000287510 AL137857.1 107144 sc-eQTL 6.00e-02 -0.187 0.0988 0.186 cMono_IL1B L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -457951 sc-eQTL 6.56e-01 0.0452 0.101 0.186 cMono_S100A L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -458145 sc-eQTL 5.05e-02 -0.234 0.119 0.186 cMono_S100A L2
ENSG00000134644 PUM1 -227154 sc-eQTL 6.69e-01 -0.0371 0.0866 0.186 cMono_S100A L2
ENSG00000162511 LAPTM5 81063 sc-eQTL 6.39e-02 -0.123 0.066 0.186 cMono_S100A L2
ENSG00000162512 SDC3 -69921 sc-eQTL 2.86e-01 -0.123 0.115 0.186 cMono_S100A L2
ENSG00000162517 PEF1 -806059 sc-eQTL 3.90e-01 -0.0894 0.104 0.186 cMono_S100A L2
ENSG00000168528 SERINC2 -570728 sc-eQTL 2.73e-01 0.133 0.121 0.186 cMono_S100A L2
ENSG00000284543 LINC01226 -667389 sc-eQTL 9.82e-01 0.00226 0.0989 0.186 cMono_S100A L2
ENSG00000287510 AL137857.1 107144 sc-eQTL 8.53e-03 -0.259 0.0977 0.186 cMono_S100A L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -457951 sc-eQTL 3.44e-01 0.142 0.15 0.194 gdT L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -458145 sc-eQTL 8.57e-01 0.0233 0.129 0.194 gdT L2
ENSG00000134644 PUM1 -227154 sc-eQTL 8.07e-01 -0.0325 0.133 0.194 gdT L2
ENSG00000162511 LAPTM5 81063 sc-eQTL 9.63e-01 -0.00674 0.144 0.194 gdT L2
ENSG00000162517 PEF1 -806059 sc-eQTL 7.14e-01 -0.0486 0.132 0.194 gdT L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 120333 sc-eQTL 8.87e-01 -0.019 0.133 0.194 gdT L2
ENSG00000287510 AL137857.1 107144 sc-eQTL 8.26e-01 -0.0285 0.129 0.194 gdT L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -457951 sc-eQTL 7.78e-01 0.0317 0.112 0.189 intMono L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -458145 sc-eQTL 8.93e-01 0.0162 0.121 0.189 intMono L2
ENSG00000134644 PUM1 -227154 sc-eQTL 2.84e-01 -0.11 0.102 0.189 intMono L2
ENSG00000162511 LAPTM5 81063 sc-eQTL 3.32e-01 0.078 0.0802 0.189 intMono L2
ENSG00000162512 SDC3 -69921 sc-eQTL 8.00e-01 -0.028 0.11 0.189 intMono L2
ENSG00000162517 PEF1 -806059 sc-eQTL 3.84e-01 0.101 0.115 0.189 intMono L2
ENSG00000168528 SERINC2 -570728 sc-eQTL 5.19e-01 0.0744 0.115 0.189 intMono L2
ENSG00000284543 LINC01226 -667389 sc-eQTL 8.43e-02 -0.188 0.108 0.189 intMono L2
ENSG00000287510 AL137857.1 107144 sc-eQTL 3.06e-01 0.112 0.109 0.189 intMono L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -457951 sc-eQTL 5.76e-01 0.0604 0.108 0.183 ncMono L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -458145 sc-eQTL 4.39e-01 -0.089 0.115 0.183 ncMono L2
ENSG00000134644 PUM1 -227154 sc-eQTL 6.19e-01 0.0467 0.0938 0.183 ncMono L2
ENSG00000162511 LAPTM5 81063 sc-eQTL 3.80e-01 0.0749 0.0851 0.183 ncMono L2
ENSG00000162512 SDC3 -69921 sc-eQTL 8.54e-01 0.0176 0.0956 0.183 ncMono L2
ENSG00000162517 PEF1 -806059 sc-eQTL 7.96e-01 -0.0284 0.11 0.183 ncMono L2
ENSG00000168528 SERINC2 -570728 sc-eQTL 6.22e-01 0.0514 0.104 0.183 ncMono L2
ENSG00000284543 LINC01226 -667389 sc-eQTL 5.59e-01 0.061 0.104 0.183 ncMono L2
ENSG00000287510 AL137857.1 107144 sc-eQTL 4.46e-01 0.0823 0.108 0.183 ncMono L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -457951 sc-eQTL 2.71e-01 0.134 0.121 0.192 pDC L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -458145 sc-eQTL 4.98e-01 -0.0907 0.133 0.192 pDC L2
ENSG00000134644 PUM1 -227154 sc-eQTL 9.15e-02 0.186 0.11 0.192 pDC L2
ENSG00000162511 LAPTM5 81063 sc-eQTL 8.30e-01 0.0221 0.103 0.192 pDC L2
ENSG00000162517 PEF1 -806059 sc-eQTL 6.11e-01 0.0681 0.134 0.192 pDC L2
ENSG00000168528 SERINC2 -570728 sc-eQTL 4.27e-01 -0.0993 0.125 0.192 pDC L2
ENSG00000284543 LINC01226 -667389 sc-eQTL 2.86e-01 0.103 0.0966 0.192 pDC L2
ENSG00000287510 AL137857.1 107144 sc-eQTL 5.05e-01 0.0761 0.114 0.192 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000060688 SNRNP40 -457951 sc-eQTL 7.41e-01 0.0396 0.119 0.186 B_Memory LOneK1K
ENSG00000121766 ZCCHC17 -458145 sc-eQTL 9.66e-01 0.00422 0.0994 0.186 B_Memory LOneK1K
ENSG00000134644 PUM1 -227154 sc-eQTL 1.20e-01 -0.137 0.0876 0.186 B_Memory LOneK1K
ENSG00000162510 MATN1 115252 sc-eQTL 8.53e-01 -0.0186 0.1 0.186 B_Memory LOneK1K
ENSG00000162511 LAPTM5 81063 sc-eQTL 7.28e-01 0.022 0.0631 0.186 B_Memory LOneK1K
ENSG00000162517 PEF1 -806059 sc-eQTL 3.90e-01 -0.09 0.104 0.186 B_Memory LOneK1K
ENSG00000186056 MATN1-AS1 120333 sc-eQTL 5.30e-01 0.0524 0.0834 0.186 B_Memory LOneK1K
ENSG00000287510 AL137857.1 107144 sc-eQTL 7.52e-01 0.0288 0.091 0.186 B_Memory LOneK1K
ENSG00000060688 SNRNP40 -457951 sc-eQTL 7.29e-01 -0.0377 0.109 0.186 B_Naive LOneK1K
ENSG00000121766 ZCCHC17 -458145 sc-eQTL 2.68e-01 -0.0952 0.0858 0.186 B_Naive LOneK1K
ENSG00000134644 PUM1 -227154 sc-eQTL 4.42e-01 -0.0625 0.0813 0.186 B_Naive LOneK1K
ENSG00000162510 MATN1 115252 sc-eQTL 1.30e-01 0.119 0.0779 0.186 B_Naive LOneK1K
ENSG00000162511 LAPTM5 81063 sc-eQTL 1.86e-01 0.0729 0.0549 0.186 B_Naive LOneK1K
ENSG00000162517 PEF1 -806059 sc-eQTL 9.84e-01 -0.00198 0.101 0.186 B_Naive LOneK1K
ENSG00000186056 MATN1-AS1 120333 sc-eQTL 2.41e-01 0.0836 0.071 0.186 B_Naive LOneK1K
ENSG00000287510 AL137857.1 107144 sc-eQTL 9.29e-01 0.00753 0.0846 0.186 B_Naive LOneK1K
ENSG00000060688 SNRNP40 -457951 sc-eQTL 3.81e-01 -0.0802 0.0913 0.186 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000121766 ZCCHC17 -458145 sc-eQTL 5.30e-03 -0.286 0.102 0.186 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000134644 PUM1 -227154 sc-eQTL 5.40e-01 0.0405 0.066 0.186 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000162511 LAPTM5 81063 sc-eQTL 4.77e-01 -0.0414 0.058 0.186 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000162512 SDC3 -69921 sc-eQTL 2.52e-02 -0.264 0.117 0.186 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000162517 PEF1 -806059 sc-eQTL 8.46e-02 -0.143 0.0827 0.186 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000168528 SERINC2 -570728 sc-eQTL 2.00e-01 0.156 0.121 0.186 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000284543 LINC01226 -667389 sc-eQTL 3.36e-01 -0.0961 0.0997 0.186 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000287510 AL137857.1 107144 sc-eQTL 3.19e-02 -0.2 0.0925 0.186 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000060688 SNRNP40 -457951 sc-eQTL 6.00e-01 0.0524 0.0998 0.185 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000121766 ZCCHC17 -458145 sc-eQTL 5.72e-01 -0.0617 0.109 0.185 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000134644 PUM1 -227154 sc-eQTL 9.27e-01 -0.00822 0.0895 0.185 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000162511 LAPTM5 81063 sc-eQTL 1.24e-01 0.11 0.0712 0.185 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000162512 SDC3 -69921 sc-eQTL 5.25e-01 -0.0665 0.104 0.185 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000162517 PEF1 -806059 sc-eQTL 7.30e-01 0.0328 0.095 0.185 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000168528 SERINC2 -570728 sc-eQTL 3.88e-01 0.0937 0.108 0.185 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000284543 LINC01226 -667389 sc-eQTL 1.89e-01 -0.135 0.102 0.185 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000287510 AL137857.1 107144 sc-eQTL 1.01e-01 0.169 0.102 0.185 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000060688 SNRNP40 -457951 sc-eQTL 9.74e-02 -0.184 0.11 0.188 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000121753 ADGRB2 -926056 sc-eQTL 4.17e-01 0.0768 0.0944 0.188 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000121766 ZCCHC17 -458145 sc-eQTL 4.18e-01 -0.0615 0.0757 0.188 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000134644 PUM1 -227154 sc-eQTL 2.19e-01 -0.102 0.0828 0.188 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000162511 LAPTM5 81063 sc-eQTL 1.99e-01 0.119 0.0925 0.188 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000162517 PEF1 -806059 sc-eQTL 7.50e-01 -0.0225 0.0705 0.188 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000186056 MATN1-AS1 120333 sc-eQTL 7.78e-02 0.188 0.106 0.188 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000287510 AL137857.1 107144 sc-eQTL 9.22e-01 0.0091 0.0925 0.188 NK_CD56dim LOneK1K

Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF
ENSG00000121766 ZCCHC17 -458145 eQTL 2.08e-06 0.103 0.0217 0.0 0.0 0.207

Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina
ENSG00000121766 ZCCHC17 -458145 7.23e-07 4.93e-07 9.16e-08 3.19e-07 9.86e-08 1.71e-07 4.25e-07 1.01e-07 2.75e-07 2.12e-07 4.74e-07 3.11e-07 5.54e-07 1.07e-07 1.45e-07 1.76e-07 2.11e-07 3.3e-07 1.7e-07 8.41e-08 1.76e-07 2.99e-07 3.02e-07 1.15e-07 4.88e-07 2.01e-07 2.57e-07 1.77e-07 2.57e-07 4.27e-07 1.93e-07 6.84e-08 5.86e-08 1.15e-07 1.33e-07 9.51e-08 1.1e-07 6.89e-08 4.17e-08 5.25e-08 6.21e-08 4.16e-07 7.72e-08 4.23e-08 1.34e-07 1.27e-08 1.05e-07 2.28e-08 6.03e-08