logo

Genes within 1Mb (chr1:30838596:C:T):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD

Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000060688 SNRNP40 -458192 sc-eQTL 5.44e-01 0.0939 0.154 0.064 B L1
ENSG00000121766 ZCCHC17 -458386 sc-eQTL 3.74e-01 -0.11 0.124 0.064 B L1
ENSG00000134644 PUM1 -227395 sc-eQTL 3.78e-02 0.215 0.103 0.064 B L1
ENSG00000162510 MATN1 115011 sc-eQTL 3.83e-01 0.0953 0.109 0.064 B L1
ENSG00000162511 LAPTM5 80822 sc-eQTL 4.43e-01 -0.0656 0.0854 0.064 B L1
ENSG00000162517 PEF1 -806300 sc-eQTL 1.51e-01 0.185 0.128 0.064 B L1
ENSG00000186056 MATN1-AS1 120092 sc-eQTL 4.37e-01 -0.0779 0.1 0.064 B L1
ENSG00000287510 AL137857.1 106903 sc-eQTL 4.79e-01 0.0841 0.118 0.064 B L1
ENSG00000060688 SNRNP40 -458192 sc-eQTL 4.78e-01 0.0923 0.13 0.064 CD4T L1
ENSG00000121766 ZCCHC17 -458386 sc-eQTL 5.12e-01 -0.0667 0.102 0.064 CD4T L1
ENSG00000134644 PUM1 -227395 sc-eQTL 5.75e-01 0.0507 0.0904 0.064 CD4T L1
ENSG00000162511 LAPTM5 80822 sc-eQTL 5.23e-01 -0.0642 0.1 0.064 CD4T L1
ENSG00000162517 PEF1 -806300 sc-eQTL 2.92e-01 0.111 0.105 0.064 CD4T L1
ENSG00000186056 MATN1-AS1 120092 sc-eQTL 6.58e-01 0.0397 0.0897 0.064 CD4T L1
ENSG00000287510 AL137857.1 106903 sc-eQTL 8.08e-01 0.0262 0.107 0.064 CD4T L1
ENSG00000060688 SNRNP40 -458192 sc-eQTL 8.67e-01 -0.0287 0.171 0.064 CD8T L1
ENSG00000121766 ZCCHC17 -458386 sc-eQTL 5.52e-01 0.0678 0.114 0.064 CD8T L1
ENSG00000134644 PUM1 -227395 sc-eQTL 1.42e-01 -0.147 0.0998 0.064 CD8T L1
ENSG00000162511 LAPTM5 80822 sc-eQTL 7.27e-03 -0.26 0.0958 0.064 CD8T L1
ENSG00000162517 PEF1 -806300 sc-eQTL 6.20e-01 0.0595 0.12 0.064 CD8T L1
ENSG00000186056 MATN1-AS1 120092 sc-eQTL 7.62e-01 0.0346 0.114 0.064 CD8T L1
ENSG00000287510 AL137857.1 106903 sc-eQTL 6.61e-01 0.063 0.143 0.064 CD8T L1
ENSG00000060688 SNRNP40 -458192 sc-eQTL 1.01e-01 -0.246 0.149 0.065 DC L1
ENSG00000121766 ZCCHC17 -458386 sc-eQTL 9.02e-01 0.022 0.178 0.065 DC L1
ENSG00000134644 PUM1 -227395 sc-eQTL 9.80e-01 -0.00356 0.139 0.065 DC L1
ENSG00000162511 LAPTM5 80822 sc-eQTL 8.34e-01 0.0208 0.0995 0.065 DC L1
ENSG00000162517 PEF1 -806300 sc-eQTL 3.83e-01 -0.141 0.161 0.065 DC L1
ENSG00000168528 SERINC2 -570969 sc-eQTL 7.05e-01 0.0622 0.164 0.065 DC L1
ENSG00000284543 LINC01226 -667630 sc-eQTL 5.45e-01 -0.0659 0.109 0.065 DC L1
ENSG00000287510 AL137857.1 106903 sc-eQTL 9.14e-01 0.0171 0.157 0.065 DC L1
ENSG00000060688 SNRNP40 -458192 sc-eQTL 9.59e-01 -0.00595 0.117 0.064 Mono L1
ENSG00000121766 ZCCHC17 -458386 sc-eQTL 1.90e-01 0.19 0.144 0.064 Mono L1
ENSG00000134644 PUM1 -227395 sc-eQTL 9.22e-03 0.24 0.0915 0.064 Mono L1
ENSG00000162511 LAPTM5 80822 sc-eQTL 8.57e-01 0.0154 0.0855 0.064 Mono L1
ENSG00000162512 SDC3 -70162 sc-eQTL 9.02e-01 -0.0203 0.164 0.064 Mono L1
ENSG00000162517 PEF1 -806300 sc-eQTL 3.37e-01 0.111 0.115 0.064 Mono L1
ENSG00000168528 SERINC2 -570969 sc-eQTL 8.90e-02 0.299 0.175 0.064 Mono L1
ENSG00000284543 LINC01226 -667630 sc-eQTL 5.48e-01 -0.0934 0.155 0.064 Mono L1
ENSG00000287510 AL137857.1 106903 sc-eQTL 5.41e-01 0.083 0.136 0.064 Mono L1
ENSG00000060688 SNRNP40 -458192 sc-eQTL 1.46e-02 0.398 0.162 0.064 NK L1
ENSG00000121753 ADGRB2 -926297 sc-eQTL 8.61e-01 0.0248 0.141 0.064 NK L1
ENSG00000121766 ZCCHC17 -458386 sc-eQTL 9.73e-01 -0.00377 0.112 0.064 NK L1
ENSG00000134644 PUM1 -227395 sc-eQTL 4.16e-01 0.0957 0.118 0.064 NK L1
ENSG00000162511 LAPTM5 80822 sc-eQTL 2.92e-04 -0.484 0.131 0.064 NK L1
ENSG00000162517 PEF1 -806300 sc-eQTL 3.39e-01 0.0945 0.0987 0.064 NK L1
ENSG00000186056 MATN1-AS1 120092 sc-eQTL 2.06e-01 -0.192 0.152 0.064 NK L1
ENSG00000287510 AL137857.1 106903 sc-eQTL 2.61e-01 -0.158 0.14 0.064 NK L1
ENSG00000060688 SNRNP40 -458192 sc-eQTL 1.18e-01 0.193 0.123 0.064 Other_T L1
ENSG00000121766 ZCCHC17 -458386 sc-eQTL 1.07e-01 -0.213 0.131 0.064 Other_T L1
ENSG00000134644 PUM1 -227395 sc-eQTL 2.12e-02 -0.272 0.117 0.064 Other_T L1
ENSG00000162511 LAPTM5 80822 sc-eQTL 1.64e-01 -0.135 0.0969 0.064 Other_T L1
ENSG00000162517 PEF1 -806300 sc-eQTL 6.72e-01 0.0551 0.13 0.064 Other_T L1
ENSG00000186056 MATN1-AS1 120092 sc-eQTL 9.71e-02 0.264 0.158 0.064 Other_T L1
ENSG00000287510 AL137857.1 106903 sc-eQTL 4.68e-01 0.121 0.166 0.064 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000060688 SNRNP40 -458192 sc-eQTL 6.62e-01 -0.0872 0.199 0.069 B_Activated L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -458386 sc-eQTL 6.24e-01 -0.0986 0.201 0.069 B_Activated L2
ENSG00000134644 PUM1 -227395 sc-eQTL 4.30e-01 0.147 0.186 0.069 B_Activated L2
ENSG00000162510 MATN1 115011 sc-eQTL 5.89e-01 0.0883 0.163 0.069 B_Activated L2
ENSG00000162511 LAPTM5 80822 sc-eQTL 5.34e-01 0.0708 0.114 0.069 B_Activated L2
ENSG00000162517 PEF1 -806300 sc-eQTL 5.90e-01 0.104 0.193 0.069 B_Activated L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 120092 sc-eQTL 6.48e-01 0.0839 0.184 0.069 B_Activated L2
ENSG00000287510 AL137857.1 106903 sc-eQTL 5.68e-01 0.0928 0.162 0.069 B_Activated L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -458192 sc-eQTL 6.64e-01 0.0803 0.184 0.064 B_Intermediate L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -458386 sc-eQTL 2.78e-01 -0.167 0.153 0.064 B_Intermediate L2
ENSG00000134644 PUM1 -227395 sc-eQTL 7.34e-01 0.0493 0.145 0.064 B_Intermediate L2
ENSG00000162510 MATN1 115011 sc-eQTL 2.54e-01 0.172 0.15 0.064 B_Intermediate L2
ENSG00000162511 LAPTM5 80822 sc-eQTL 9.05e-01 -0.0111 0.0926 0.064 B_Intermediate L2
ENSG00000162517 PEF1 -806300 sc-eQTL 2.00e-02 0.398 0.17 0.064 B_Intermediate L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 120092 sc-eQTL 5.48e-02 -0.249 0.129 0.064 B_Intermediate L2
ENSG00000287510 AL137857.1 106903 sc-eQTL 7.60e-01 0.0445 0.145 0.064 B_Intermediate L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -458192 sc-eQTL 4.60e-01 0.135 0.182 0.065 B_Memory L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -458386 sc-eQTL 2.35e-01 -0.199 0.167 0.065 B_Memory L2
ENSG00000134644 PUM1 -227395 sc-eQTL 6.36e-01 0.0692 0.146 0.065 B_Memory L2
ENSG00000162510 MATN1 115011 sc-eQTL 2.56e-01 0.159 0.139 0.065 B_Memory L2
ENSG00000162511 LAPTM5 80822 sc-eQTL 5.64e-02 -0.236 0.123 0.065 B_Memory L2
ENSG00000162517 PEF1 -806300 sc-eQTL 3.78e-01 0.146 0.165 0.065 B_Memory L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 120092 sc-eQTL 2.37e-02 0.319 0.14 0.065 B_Memory L2
ENSG00000287510 AL137857.1 106903 sc-eQTL 7.52e-01 0.0526 0.166 0.065 B_Memory L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -458192 sc-eQTL 8.95e-01 -0.0218 0.165 0.064 B_Naive1 L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -458386 sc-eQTL 1.29e-01 -0.217 0.142 0.064 B_Naive1 L2
ENSG00000134644 PUM1 -227395 sc-eQTL 1.70e-01 0.173 0.125 0.064 B_Naive1 L2
ENSG00000162510 MATN1 115011 sc-eQTL 4.81e-01 0.0902 0.128 0.064 B_Naive1 L2
ENSG00000162511 LAPTM5 80822 sc-eQTL 8.76e-01 -0.0133 0.0854 0.064 B_Naive1 L2
ENSG00000162517 PEF1 -806300 sc-eQTL 5.22e-01 0.0965 0.15 0.064 B_Naive1 L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 120092 sc-eQTL 4.51e-01 -0.0846 0.112 0.064 B_Naive1 L2
ENSG00000287510 AL137857.1 106903 sc-eQTL 4.51e-01 0.104 0.138 0.064 B_Naive1 L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -458192 sc-eQTL 6.75e-01 0.0732 0.175 0.064 B_Naive2 L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -458386 sc-eQTL 9.97e-01 -0.000514 0.144 0.064 B_Naive2 L2
ENSG00000134644 PUM1 -227395 sc-eQTL 7.73e-02 0.249 0.14 0.064 B_Naive2 L2
ENSG00000162510 MATN1 115011 sc-eQTL 6.02e-01 0.0707 0.135 0.064 B_Naive2 L2
ENSG00000162511 LAPTM5 80822 sc-eQTL 9.33e-01 0.00779 0.092 0.064 B_Naive2 L2
ENSG00000162517 PEF1 -806300 sc-eQTL 9.97e-01 -0.000648 0.167 0.064 B_Naive2 L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 120092 sc-eQTL 4.10e-01 0.11 0.134 0.064 B_Naive2 L2
ENSG00000287510 AL137857.1 106903 sc-eQTL 9.72e-01 -0.00516 0.145 0.064 B_Naive2 L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -458192 sc-eQTL 7.99e-01 -0.0452 0.178 0.066 CD4_CTL L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -458386 sc-eQTL 7.17e-01 -0.0634 0.175 0.066 CD4_CTL L2
ENSG00000134644 PUM1 -227395 sc-eQTL 1.22e-01 -0.264 0.17 0.066 CD4_CTL L2
ENSG00000162511 LAPTM5 80822 sc-eQTL 7.85e-02 -0.268 0.151 0.066 CD4_CTL L2
ENSG00000162517 PEF1 -806300 sc-eQTL 7.53e-01 0.0493 0.156 0.066 CD4_CTL L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 120092 sc-eQTL 2.81e-01 0.18 0.167 0.066 CD4_CTL L2
ENSG00000287510 AL137857.1 106903 sc-eQTL 8.56e-01 0.0268 0.147 0.066 CD4_CTL L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -458192 sc-eQTL 9.60e-01 0.00688 0.136 0.064 CD4_Naive L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -458386 sc-eQTL 3.18e-01 -0.12 0.12 0.064 CD4_Naive L2
ENSG00000134644 PUM1 -227395 sc-eQTL 1.34e-01 0.144 0.0955 0.064 CD4_Naive L2
ENSG00000162511 LAPTM5 80822 sc-eQTL 8.64e-01 0.0177 0.103 0.064 CD4_Naive L2
ENSG00000162517 PEF1 -806300 sc-eQTL 1.77e-01 0.152 0.112 0.064 CD4_Naive L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 120092 sc-eQTL 4.84e-01 0.0731 0.104 0.064 CD4_Naive L2
ENSG00000287510 AL137857.1 106903 sc-eQTL 5.83e-01 -0.0659 0.12 0.064 CD4_Naive L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -458192 sc-eQTL 6.61e-01 0.0752 0.171 0.064 CD4_TCM L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -458386 sc-eQTL 9.68e-01 -0.00561 0.138 0.064 CD4_TCM L2
ENSG00000134644 PUM1 -227395 sc-eQTL 9.82e-01 -0.00278 0.122 0.064 CD4_TCM L2
ENSG00000162511 LAPTM5 80822 sc-eQTL 7.96e-02 -0.177 0.101 0.064 CD4_TCM L2
ENSG00000162517 PEF1 -806300 sc-eQTL 5.69e-01 0.0775 0.136 0.064 CD4_TCM L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 120092 sc-eQTL 8.27e-01 -0.0282 0.129 0.064 CD4_TCM L2
ENSG00000287510 AL137857.1 106903 sc-eQTL 4.81e-01 0.101 0.143 0.064 CD4_TCM L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -458192 sc-eQTL 7.96e-02 0.294 0.167 0.064 CD4_TEM L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -458386 sc-eQTL 1.58e-01 -0.226 0.159 0.064 CD4_TEM L2
ENSG00000134644 PUM1 -227395 sc-eQTL 2.20e-01 0.164 0.133 0.064 CD4_TEM L2
ENSG00000162511 LAPTM5 80822 sc-eQTL 1.25e-01 -0.207 0.134 0.064 CD4_TEM L2
ENSG00000162517 PEF1 -806300 sc-eQTL 5.26e-01 -0.0959 0.151 0.064 CD4_TEM L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 120092 sc-eQTL 9.73e-01 -0.00528 0.158 0.064 CD4_TEM L2
ENSG00000287510 AL137857.1 106903 sc-eQTL 6.49e-01 -0.071 0.156 0.064 CD4_TEM L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -458192 sc-eQTL 7.09e-01 0.0732 0.196 0.064 CD8_CTL L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -458386 sc-eQTL 2.50e-01 0.173 0.15 0.064 CD8_CTL L2
ENSG00000134644 PUM1 -227395 sc-eQTL 4.28e-01 0.116 0.146 0.064 CD8_CTL L2
ENSG00000162511 LAPTM5 80822 sc-eQTL 1.38e-03 -0.511 0.158 0.064 CD8_CTL L2
ENSG00000162517 PEF1 -806300 sc-eQTL 7.87e-02 -0.247 0.14 0.064 CD8_CTL L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 120092 sc-eQTL 7.78e-01 0.0479 0.17 0.064 CD8_CTL L2
ENSG00000287510 AL137857.1 106903 sc-eQTL 5.84e-01 -0.0875 0.16 0.064 CD8_CTL L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -458192 sc-eQTL 8.40e-01 0.0344 0.17 0.064 CD8_Naive L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -458386 sc-eQTL 5.07e-01 0.0973 0.146 0.064 CD8_Naive L2
ENSG00000134644 PUM1 -227395 sc-eQTL 7.72e-02 -0.208 0.117 0.064 CD8_Naive L2
ENSG00000162511 LAPTM5 80822 sc-eQTL 4.83e-01 -0.0793 0.113 0.064 CD8_Naive L2
ENSG00000162517 PEF1 -806300 sc-eQTL 8.06e-01 0.0387 0.157 0.064 CD8_Naive L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 120092 sc-eQTL 5.87e-01 -0.0766 0.141 0.064 CD8_Naive L2
ENSG00000287510 AL137857.1 106903 sc-eQTL 2.50e-01 0.176 0.153 0.064 CD8_Naive L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -458192 sc-eQTL 7.55e-01 -0.0592 0.189 0.062 CD8_TCM L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -458386 sc-eQTL 6.69e-01 0.0742 0.174 0.062 CD8_TCM L2
ENSG00000134644 PUM1 -227395 sc-eQTL 3.99e-01 -0.138 0.163 0.062 CD8_TCM L2
ENSG00000162511 LAPTM5 80822 sc-eQTL 8.68e-01 -0.0285 0.171 0.062 CD8_TCM L2
ENSG00000162517 PEF1 -806300 sc-eQTL 4.10e-01 0.144 0.174 0.062 CD8_TCM L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 120092 sc-eQTL 6.07e-02 0.296 0.157 0.062 CD8_TCM L2
ENSG00000287510 AL137857.1 106903 sc-eQTL 9.01e-01 -0.02 0.16 0.062 CD8_TCM L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -458192 sc-eQTL 2.95e-01 -0.196 0.186 0.066 CD8_TEM L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -458386 sc-eQTL 1.64e-01 -0.248 0.178 0.066 CD8_TEM L2
ENSG00000134644 PUM1 -227395 sc-eQTL 5.61e-01 -0.106 0.183 0.066 CD8_TEM L2
ENSG00000162511 LAPTM5 80822 sc-eQTL 3.10e-01 0.175 0.172 0.066 CD8_TEM L2
ENSG00000162517 PEF1 -806300 sc-eQTL 6.97e-01 0.0631 0.162 0.066 CD8_TEM L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 120092 sc-eQTL 7.63e-01 -0.0538 0.178 0.066 CD8_TEM L2
ENSG00000287510 AL137857.1 106903 sc-eQTL 7.17e-01 0.0587 0.161 0.066 CD8_TEM L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -458192 sc-eQTL 2.03e-01 0.229 0.179 0.065 MAIT L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -458386 sc-eQTL 2.32e-02 -0.36 0.157 0.065 MAIT L2
ENSG00000134644 PUM1 -227395 sc-eQTL 3.68e-02 -0.318 0.151 0.065 MAIT L2
ENSG00000162511 LAPTM5 80822 sc-eQTL 4.23e-01 -0.116 0.144 0.065 MAIT L2
ENSG00000162517 PEF1 -806300 sc-eQTL 9.28e-01 0.0143 0.158 0.065 MAIT L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 120092 sc-eQTL 3.17e-02 0.343 0.159 0.065 MAIT L2
ENSG00000287510 AL137857.1 106903 sc-eQTL 9.43e-01 0.0118 0.165 0.065 MAIT L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -458192 sc-eQTL 2.96e-01 0.193 0.184 0.062 NK_CD56bright L2
ENSG00000121753 ADGRB2 -926297 sc-eQTL 8.32e-01 -0.0308 0.145 0.062 NK_CD56bright L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -458386 sc-eQTL 7.09e-01 -0.0584 0.156 0.062 NK_CD56bright L2
ENSG00000134644 PUM1 -227395 sc-eQTL 7.43e-01 -0.0538 0.164 0.062 NK_CD56bright L2
ENSG00000162511 LAPTM5 80822 sc-eQTL 2.35e-02 -0.365 0.16 0.062 NK_CD56bright L2
ENSG00000162517 PEF1 -806300 sc-eQTL 2.90e-02 0.341 0.155 0.062 NK_CD56bright L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 120092 sc-eQTL 7.94e-01 0.0425 0.162 0.062 NK_CD56bright L2
ENSG00000287510 AL137857.1 106903 sc-eQTL 4.65e-01 0.117 0.16 0.062 NK_CD56bright L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -458192 sc-eQTL 6.30e-03 0.471 0.171 0.065 NK_CD56dim L2
ENSG00000121753 ADGRB2 -926297 sc-eQTL 8.98e-01 0.0197 0.153 0.065 NK_CD56dim L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -458386 sc-eQTL 9.28e-01 -0.0117 0.128 0.065 NK_CD56dim L2
ENSG00000134644 PUM1 -227395 sc-eQTL 6.84e-02 0.24 0.131 0.065 NK_CD56dim L2
ENSG00000162511 LAPTM5 80822 sc-eQTL 9.52e-04 -0.459 0.137 0.065 NK_CD56dim L2
ENSG00000162517 PEF1 -806300 sc-eQTL 2.95e-01 0.131 0.125 0.065 NK_CD56dim L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 120092 sc-eQTL 9.60e-01 -0.00884 0.176 0.065 NK_CD56dim L2
ENSG00000287510 AL137857.1 106903 sc-eQTL 6.50e-01 0.0659 0.145 0.065 NK_CD56dim L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -458192 sc-eQTL 4.69e-01 0.147 0.202 0.057 NK_HLA L2
ENSG00000121753 ADGRB2 -926297 sc-eQTL 8.51e-01 -0.0302 0.16 0.057 NK_HLA L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -458386 sc-eQTL 1.84e-01 0.239 0.18 0.057 NK_HLA L2
ENSG00000134644 PUM1 -227395 sc-eQTL 8.41e-01 -0.0354 0.176 0.057 NK_HLA L2
ENSG00000162511 LAPTM5 80822 sc-eQTL 1.47e-01 -0.243 0.167 0.057 NK_HLA L2
ENSG00000162517 PEF1 -806300 sc-eQTL 6.82e-01 0.0776 0.189 0.057 NK_HLA L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 120092 sc-eQTL 2.30e-01 -0.214 0.178 0.057 NK_HLA L2
ENSG00000287510 AL137857.1 106903 sc-eQTL 8.16e-01 0.0403 0.173 0.057 NK_HLA L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -458192 sc-eQTL 5.47e-01 0.105 0.173 0.065 NK_cytokine L2
ENSG00000121753 ADGRB2 -926297 sc-eQTL 8.26e-01 -0.0346 0.157 0.065 NK_cytokine L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -458386 sc-eQTL 8.59e-01 0.0242 0.135 0.065 NK_cytokine L2
ENSG00000134644 PUM1 -227395 sc-eQTL 5.16e-01 -0.0952 0.146 0.065 NK_cytokine L2
ENSG00000162511 LAPTM5 80822 sc-eQTL 9.10e-03 -0.418 0.159 0.065 NK_cytokine L2
ENSG00000162517 PEF1 -806300 sc-eQTL 8.89e-01 0.0192 0.137 0.065 NK_cytokine L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 120092 sc-eQTL 1.80e-01 -0.229 0.17 0.065 NK_cytokine L2
ENSG00000287510 AL137857.1 106903 sc-eQTL 1.52e-01 -0.228 0.158 0.065 NK_cytokine L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -458192 sc-eQTL 1.06e-01 0.316 0.194 0.074 PB L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -458386 sc-eQTL 7.62e-01 0.069 0.227 0.074 PB L2
ENSG00000134644 PUM1 -227395 sc-eQTL 3.54e-01 -0.183 0.197 0.074 PB L2
ENSG00000162510 MATN1 115011 sc-eQTL 5.48e-02 -0.351 0.181 0.074 PB L2
ENSG00000162511 LAPTM5 80822 sc-eQTL 9.23e-01 0.0127 0.131 0.074 PB L2
ENSG00000162517 PEF1 -806300 sc-eQTL 5.51e-01 0.121 0.202 0.074 PB L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 120092 sc-eQTL 4.14e-01 -0.147 0.179 0.074 PB L2
ENSG00000287510 AL137857.1 106903 sc-eQTL 2.07e-01 -0.241 0.19 0.074 PB L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -458192 sc-eQTL 5.43e-01 -0.0828 0.136 0.061 Pro_T L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -458386 sc-eQTL 8.12e-01 0.0412 0.173 0.061 Pro_T L2
ENSG00000134644 PUM1 -227395 sc-eQTL 7.59e-01 -0.0494 0.161 0.061 Pro_T L2
ENSG00000162511 LAPTM5 80822 sc-eQTL 6.80e-02 -0.21 0.115 0.061 Pro_T L2
ENSG00000162517 PEF1 -806300 sc-eQTL 9.67e-01 -0.00698 0.169 0.061 Pro_T L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 120092 sc-eQTL 4.40e-01 -0.125 0.161 0.061 Pro_T L2
ENSG00000287510 AL137857.1 106903 sc-eQTL 4.41e-01 0.114 0.148 0.061 Pro_T L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -458192 sc-eQTL 1.06e-01 0.282 0.174 0.064 Treg L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -458386 sc-eQTL 5.09e-01 -0.112 0.169 0.064 Treg L2
ENSG00000134644 PUM1 -227395 sc-eQTL 2.52e-01 -0.155 0.135 0.064 Treg L2
ENSG00000162511 LAPTM5 80822 sc-eQTL 5.64e-01 -0.0894 0.155 0.064 Treg L2
ENSG00000162517 PEF1 -806300 sc-eQTL 8.67e-01 -0.028 0.167 0.064 Treg L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 120092 sc-eQTL 9.06e-01 0.0186 0.158 0.064 Treg L2
ENSG00000287510 AL137857.1 106903 sc-eQTL 4.06e-01 0.131 0.157 0.064 Treg L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -458192 sc-eQTL 7.72e-02 -0.309 0.174 0.068 cDC L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -458386 sc-eQTL 6.41e-01 0.0887 0.19 0.068 cDC L2
ENSG00000134644 PUM1 -227395 sc-eQTL 7.95e-01 -0.0424 0.163 0.068 cDC L2
ENSG00000162511 LAPTM5 80822 sc-eQTL 5.28e-01 0.0723 0.114 0.068 cDC L2
ENSG00000162517 PEF1 -806300 sc-eQTL 2.22e-01 -0.202 0.165 0.068 cDC L2
ENSG00000168528 SERINC2 -570969 sc-eQTL 3.18e-01 0.147 0.147 0.068 cDC L2
ENSG00000284543 LINC01226 -667630 sc-eQTL 2.83e-01 -0.155 0.144 0.068 cDC L2
ENSG00000287510 AL137857.1 106903 sc-eQTL 8.78e-01 -0.0239 0.155 0.068 cDC L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -458192 sc-eQTL 8.57e-01 -0.0253 0.14 0.064 cMono_IL1B L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -458386 sc-eQTL 3.99e-01 0.132 0.156 0.064 cMono_IL1B L2
ENSG00000134644 PUM1 -227395 sc-eQTL 6.72e-03 0.285 0.104 0.064 cMono_IL1B L2
ENSG00000162511 LAPTM5 80822 sc-eQTL 6.16e-01 0.0467 0.093 0.064 cMono_IL1B L2
ENSG00000162512 SDC3 -70162 sc-eQTL 6.64e-01 -0.0762 0.175 0.064 cMono_IL1B L2
ENSG00000162517 PEF1 -806300 sc-eQTL 3.93e-01 0.122 0.143 0.064 cMono_IL1B L2
ENSG00000168528 SERINC2 -570969 sc-eQTL 1.07e-01 0.286 0.176 0.064 cMono_IL1B L2
ENSG00000284543 LINC01226 -667630 sc-eQTL 6.44e-01 -0.0726 0.157 0.064 cMono_IL1B L2
ENSG00000287510 AL137857.1 106903 sc-eQTL 3.51e-01 0.137 0.146 0.064 cMono_IL1B L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -458192 sc-eQTL 6.30e-01 0.0714 0.148 0.064 cMono_S100A L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -458386 sc-eQTL 1.35e-01 0.261 0.174 0.064 cMono_S100A L2
ENSG00000134644 PUM1 -227395 sc-eQTL 3.35e-03 0.367 0.124 0.064 cMono_S100A L2
ENSG00000162511 LAPTM5 80822 sc-eQTL 2.83e-01 0.104 0.0968 0.064 cMono_S100A L2
ENSG00000162512 SDC3 -70162 sc-eQTL 9.76e-01 -0.00502 0.168 0.064 cMono_S100A L2
ENSG00000162517 PEF1 -806300 sc-eQTL 2.10e-01 -0.19 0.151 0.064 cMono_S100A L2
ENSG00000168528 SERINC2 -570969 sc-eQTL 3.07e-02 0.382 0.176 0.064 cMono_S100A L2
ENSG00000284543 LINC01226 -667630 sc-eQTL 6.64e-01 0.0628 0.144 0.064 cMono_S100A L2
ENSG00000287510 AL137857.1 106903 sc-eQTL 8.34e-01 0.0304 0.145 0.064 cMono_S100A L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -458192 sc-eQTL 1.51e-01 0.322 0.223 0.061 gdT L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -458386 sc-eQTL 7.71e-01 0.0562 0.193 0.061 gdT L2
ENSG00000134644 PUM1 -227395 sc-eQTL 2.31e-01 -0.238 0.198 0.061 gdT L2
ENSG00000162511 LAPTM5 80822 sc-eQTL 8.56e-01 -0.0394 0.216 0.061 gdT L2
ENSG00000162517 PEF1 -806300 sc-eQTL 7.90e-01 0.0528 0.197 0.061 gdT L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 120092 sc-eQTL 8.92e-01 -0.027 0.199 0.061 gdT L2
ENSG00000287510 AL137857.1 106903 sc-eQTL 7.38e-01 -0.0647 0.193 0.061 gdT L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -458192 sc-eQTL 1.42e-01 0.245 0.166 0.062 intMono L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -458386 sc-eQTL 9.87e-01 0.00301 0.179 0.062 intMono L2
ENSG00000134644 PUM1 -227395 sc-eQTL 9.11e-01 0.017 0.152 0.062 intMono L2
ENSG00000162511 LAPTM5 80822 sc-eQTL 5.92e-01 -0.064 0.119 0.062 intMono L2
ENSG00000162512 SDC3 -70162 sc-eQTL 3.91e-01 -0.14 0.163 0.062 intMono L2
ENSG00000162517 PEF1 -806300 sc-eQTL 3.42e-01 0.163 0.171 0.062 intMono L2
ENSG00000168528 SERINC2 -570969 sc-eQTL 4.34e-01 0.134 0.171 0.062 intMono L2
ENSG00000284543 LINC01226 -667630 sc-eQTL 5.30e-01 -0.102 0.162 0.062 intMono L2
ENSG00000287510 AL137857.1 106903 sc-eQTL 7.31e-01 0.0559 0.162 0.062 intMono L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -458192 sc-eQTL 2.96e-01 -0.162 0.154 0.066 ncMono L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -458386 sc-eQTL 6.84e-01 0.0673 0.165 0.066 ncMono L2
ENSG00000134644 PUM1 -227395 sc-eQTL 4.56e-01 0.101 0.135 0.066 ncMono L2
ENSG00000162511 LAPTM5 80822 sc-eQTL 2.13e-01 -0.153 0.122 0.066 ncMono L2
ENSG00000162512 SDC3 -70162 sc-eQTL 9.99e-01 0.000213 0.137 0.066 ncMono L2
ENSG00000162517 PEF1 -806300 sc-eQTL 4.13e-01 0.129 0.157 0.066 ncMono L2
ENSG00000168528 SERINC2 -570969 sc-eQTL 8.24e-01 0.0335 0.15 0.066 ncMono L2
ENSG00000284543 LINC01226 -667630 sc-eQTL 4.18e-01 -0.121 0.15 0.066 ncMono L2
ENSG00000287510 AL137857.1 106903 sc-eQTL 9.16e-01 0.0164 0.155 0.066 ncMono L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -458192 sc-eQTL 5.13e-01 -0.118 0.18 0.068 pDC L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -458386 sc-eQTL 7.48e-01 -0.0636 0.197 0.068 pDC L2
ENSG00000134644 PUM1 -227395 sc-eQTL 9.48e-01 0.0107 0.164 0.068 pDC L2
ENSG00000162511 LAPTM5 80822 sc-eQTL 5.02e-01 -0.102 0.152 0.068 pDC L2
ENSG00000162517 PEF1 -806300 sc-eQTL 1.66e-01 -0.273 0.196 0.068 pDC L2
ENSG00000168528 SERINC2 -570969 sc-eQTL 8.83e-01 -0.0273 0.185 0.068 pDC L2
ENSG00000284543 LINC01226 -667630 sc-eQTL 5.77e-01 -0.08 0.143 0.068 pDC L2
ENSG00000287510 AL137857.1 106903 sc-eQTL 7.49e-01 0.0539 0.168 0.068 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000060688 SNRNP40 -458192 sc-eQTL 5.41e-01 0.11 0.18 0.064 B_Memory LOneK1K
ENSG00000121766 ZCCHC17 -458386 sc-eQTL 1.79e-01 -0.201 0.149 0.064 B_Memory LOneK1K
ENSG00000134644 PUM1 -227395 sc-eQTL 2.28e-01 0.16 0.133 0.064 B_Memory LOneK1K
ENSG00000162510 MATN1 115011 sc-eQTL 4.33e-01 0.119 0.151 0.064 B_Memory LOneK1K
ENSG00000162511 LAPTM5 80822 sc-eQTL 9.91e-01 0.00107 0.0953 0.064 B_Memory LOneK1K
ENSG00000162517 PEF1 -806300 sc-eQTL 3.96e-02 0.323 0.156 0.064 B_Memory LOneK1K
ENSG00000186056 MATN1-AS1 120092 sc-eQTL 7.66e-01 -0.0375 0.126 0.064 B_Memory LOneK1K
ENSG00000287510 AL137857.1 106903 sc-eQTL 3.90e-01 0.118 0.137 0.064 B_Memory LOneK1K
ENSG00000060688 SNRNP40 -458192 sc-eQTL 9.94e-01 -0.00118 0.161 0.064 B_Naive LOneK1K
ENSG00000121766 ZCCHC17 -458386 sc-eQTL 3.34e-01 -0.123 0.127 0.064 B_Naive LOneK1K
ENSG00000134644 PUM1 -227395 sc-eQTL 2.46e-02 0.269 0.119 0.064 B_Naive LOneK1K
ENSG00000162510 MATN1 115011 sc-eQTL 3.81e-01 0.102 0.116 0.064 B_Naive LOneK1K
ENSG00000162511 LAPTM5 80822 sc-eQTL 8.61e-01 0.0143 0.0817 0.064 B_Naive LOneK1K
ENSG00000162517 PEF1 -806300 sc-eQTL 7.03e-01 0.057 0.149 0.064 B_Naive LOneK1K
ENSG00000186056 MATN1-AS1 120092 sc-eQTL 8.33e-01 -0.0223 0.105 0.064 B_Naive LOneK1K
ENSG00000287510 AL137857.1 106903 sc-eQTL 3.93e-01 0.107 0.125 0.064 B_Naive LOneK1K
ENSG00000060688 SNRNP40 -458192 sc-eQTL 7.39e-01 0.0445 0.134 0.064 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000121766 ZCCHC17 -458386 sc-eQTL 2.07e-01 0.191 0.151 0.064 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000134644 PUM1 -227395 sc-eQTL 5.42e-04 0.33 0.0939 0.064 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000162511 LAPTM5 80822 sc-eQTL 5.53e-01 0.0505 0.0849 0.064 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000162512 SDC3 -70162 sc-eQTL 9.56e-01 -0.00956 0.173 0.064 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000162517 PEF1 -806300 sc-eQTL 8.87e-01 0.0174 0.122 0.064 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000168528 SERINC2 -570969 sc-eQTL 6.56e-02 0.327 0.177 0.064 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000284543 LINC01226 -667630 sc-eQTL 7.03e-01 -0.0557 0.146 0.064 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000287510 AL137857.1 106903 sc-eQTL 6.83e-01 0.056 0.137 0.064 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000060688 SNRNP40 -458192 sc-eQTL 5.32e-01 -0.0919 0.147 0.065 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000121766 ZCCHC17 -458386 sc-eQTL 2.94e-01 0.169 0.16 0.065 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000134644 PUM1 -227395 sc-eQTL 7.14e-01 0.0483 0.132 0.065 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000162511 LAPTM5 80822 sc-eQTL 4.83e-01 -0.074 0.105 0.065 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000162512 SDC3 -70162 sc-eQTL 7.69e-01 -0.0452 0.154 0.065 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000162517 PEF1 -806300 sc-eQTL 2.28e-01 0.168 0.139 0.065 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000168528 SERINC2 -570969 sc-eQTL 5.73e-01 0.0901 0.16 0.065 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000284543 LINC01226 -667630 sc-eQTL 4.57e-01 -0.113 0.151 0.065 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000287510 AL137857.1 106903 sc-eQTL 7.29e-01 0.0526 0.152 0.065 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000060688 SNRNP40 -458192 sc-eQTL 1.07e-02 0.417 0.162 0.065 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000121753 ADGRB2 -926297 sc-eQTL 8.19e-01 0.0321 0.14 0.065 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000121766 ZCCHC17 -458386 sc-eQTL 9.33e-01 0.00942 0.112 0.065 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000134644 PUM1 -227395 sc-eQTL 3.60e-01 0.113 0.123 0.065 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000162511 LAPTM5 80822 sc-eQTL 2.72e-04 -0.494 0.133 0.065 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000162517 PEF1 -806300 sc-eQTL 5.11e-01 0.0688 0.104 0.065 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000186056 MATN1-AS1 120092 sc-eQTL 1.81e-01 -0.212 0.158 0.065 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000287510 AL137857.1 106903 sc-eQTL 1.56e-01 -0.194 0.136 0.065 NK_CD56dim LOneK1K

Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF
ENSG00000121769 FABP3 -538254 pQTL 2.15e-02 0.0661 0.0287 0.0 0.0 0.0889
ENSG00000142910 TINAGL1 -737889 pQTL 0.0395 -0.0537 0.0261 0.00107 0.0 0.0889

Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina