logo

Genes within 1Mb (chr1:30835647:C:T):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD

Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000060688 SNRNP40 -461141 sc-eQTL 5.20e-01 -0.062 0.0962 0.212 B L1
ENSG00000121766 ZCCHC17 -461335 sc-eQTL 5.79e-01 -0.0429 0.0771 0.212 B L1
ENSG00000134644 PUM1 -230344 sc-eQTL 1.33e-01 -0.097 0.0643 0.212 B L1
ENSG00000162510 MATN1 112062 sc-eQTL 6.37e-01 0.0321 0.068 0.212 B L1
ENSG00000162511 LAPTM5 77873 sc-eQTL 5.58e-02 0.102 0.0528 0.212 B L1
ENSG00000162517 PEF1 -809249 sc-eQTL 4.17e-01 -0.0652 0.0803 0.212 B L1
ENSG00000186056 MATN1-AS1 117143 sc-eQTL 9.94e-02 0.103 0.062 0.212 B L1
ENSG00000287510 AL137857.1 103954 sc-eQTL 9.15e-01 0.00792 0.0739 0.212 B L1
ENSG00000060688 SNRNP40 -461141 sc-eQTL 6.91e-01 0.033 0.0828 0.212 CD4T L1
ENSG00000121766 ZCCHC17 -461335 sc-eQTL 7.80e-01 0.0181 0.0647 0.212 CD4T L1
ENSG00000134644 PUM1 -230344 sc-eQTL 5.15e-01 -0.0376 0.0576 0.212 CD4T L1
ENSG00000162511 LAPTM5 77873 sc-eQTL 3.03e-01 0.0658 0.0637 0.212 CD4T L1
ENSG00000162517 PEF1 -809249 sc-eQTL 7.94e-01 -0.0174 0.0668 0.212 CD4T L1
ENSG00000186056 MATN1-AS1 117143 sc-eQTL 8.11e-01 0.0137 0.0571 0.212 CD4T L1
ENSG00000287510 AL137857.1 103954 sc-eQTL 7.70e-01 -0.02 0.0684 0.212 CD4T L1
ENSG00000060688 SNRNP40 -461141 sc-eQTL 7.61e-01 -0.0333 0.109 0.212 CD8T L1
ENSG00000121766 ZCCHC17 -461335 sc-eQTL 1.17e-01 -0.114 0.0723 0.212 CD8T L1
ENSG00000134644 PUM1 -230344 sc-eQTL 9.27e-01 -0.00584 0.064 0.212 CD8T L1
ENSG00000162511 LAPTM5 77873 sc-eQTL 2.77e-02 0.136 0.0615 0.212 CD8T L1
ENSG00000162517 PEF1 -809249 sc-eQTL 7.70e-01 -0.0225 0.0766 0.212 CD8T L1
ENSG00000186056 MATN1-AS1 117143 sc-eQTL 6.39e-02 0.135 0.0723 0.212 CD8T L1
ENSG00000287510 AL137857.1 103954 sc-eQTL 8.17e-01 -0.0212 0.0916 0.212 CD8T L1
ENSG00000060688 SNRNP40 -461141 sc-eQTL 7.95e-01 -0.0259 0.0994 0.216 DC L1
ENSG00000121766 ZCCHC17 -461335 sc-eQTL 6.21e-01 -0.0583 0.118 0.216 DC L1
ENSG00000134644 PUM1 -230344 sc-eQTL 9.81e-01 0.00219 0.0923 0.216 DC L1
ENSG00000162511 LAPTM5 77873 sc-eQTL 5.23e-01 -0.0422 0.0658 0.216 DC L1
ENSG00000162517 PEF1 -809249 sc-eQTL 1.22e-01 0.165 0.106 0.216 DC L1
ENSG00000168528 SERINC2 -573918 sc-eQTL 5.03e-01 -0.0728 0.109 0.216 DC L1
ENSG00000284543 LINC01226 -670579 sc-eQTL 5.18e-02 0.139 0.0713 0.216 DC L1
ENSG00000287510 AL137857.1 103954 sc-eQTL 1.45e-01 0.152 0.104 0.216 DC L1
ENSG00000060688 SNRNP40 -461141 sc-eQTL 5.34e-01 -0.0472 0.0757 0.212 Mono L1
ENSG00000121766 ZCCHC17 -461335 sc-eQTL 4.50e-02 -0.188 0.093 0.212 Mono L1
ENSG00000134644 PUM1 -230344 sc-eQTL 9.57e-01 -0.00327 0.0602 0.212 Mono L1
ENSG00000162511 LAPTM5 77873 sc-eQTL 8.93e-01 -0.00747 0.0554 0.212 Mono L1
ENSG00000162512 SDC3 -73111 sc-eQTL 4.12e-02 -0.216 0.105 0.212 Mono L1
ENSG00000162517 PEF1 -809249 sc-eQTL 6.23e-02 -0.139 0.0741 0.212 Mono L1
ENSG00000168528 SERINC2 -573918 sc-eQTL 3.52e-01 0.106 0.114 0.212 Mono L1
ENSG00000284543 LINC01226 -670579 sc-eQTL 9.53e-02 -0.167 0.0999 0.212 Mono L1
ENSG00000287510 AL137857.1 103954 sc-eQTL 4.22e-01 -0.0706 0.0878 0.212 Mono L1
ENSG00000060688 SNRNP40 -461141 sc-eQTL 3.47e-01 -0.0983 0.104 0.212 NK L1
ENSG00000121753 ADGRB2 -929246 sc-eQTL 5.64e-01 0.0519 0.0899 0.212 NK L1
ENSG00000121766 ZCCHC17 -461335 sc-eQTL 3.93e-01 -0.0612 0.0714 0.212 NK L1
ENSG00000134644 PUM1 -230344 sc-eQTL 2.61e-01 -0.0843 0.0748 0.212 NK L1
ENSG00000162511 LAPTM5 77873 sc-eQTL 1.70e-01 0.118 0.086 0.212 NK L1
ENSG00000162517 PEF1 -809249 sc-eQTL 5.08e-01 0.0417 0.063 0.212 NK L1
ENSG00000186056 MATN1-AS1 117143 sc-eQTL 3.39e-01 0.0927 0.0968 0.212 NK L1
ENSG00000287510 AL137857.1 103954 sc-eQTL 9.17e-01 0.00939 0.0896 0.212 NK L1
ENSG00000060688 SNRNP40 -461141 sc-eQTL 6.58e-01 -0.0351 0.0792 0.212 Other_T L1
ENSG00000121766 ZCCHC17 -461335 sc-eQTL 2.43e-01 -0.0988 0.0844 0.212 Other_T L1
ENSG00000134644 PUM1 -230344 sc-eQTL 7.60e-01 0.0232 0.0761 0.212 Other_T L1
ENSG00000162511 LAPTM5 77873 sc-eQTL 8.19e-01 -0.0143 0.0624 0.212 Other_T L1
ENSG00000162517 PEF1 -809249 sc-eQTL 4.24e-01 -0.0666 0.0832 0.212 Other_T L1
ENSG00000186056 MATN1-AS1 117143 sc-eQTL 9.84e-01 0.0021 0.102 0.212 Other_T L1
ENSG00000287510 AL137857.1 103954 sc-eQTL 8.86e-01 -0.0153 0.106 0.212 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000060688 SNRNP40 -461141 sc-eQTL 9.61e-01 0.00594 0.122 0.212 B_Activated L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -461335 sc-eQTL 4.54e-01 0.0926 0.123 0.212 B_Activated L2
ENSG00000134644 PUM1 -230344 sc-eQTL 7.04e-01 -0.0436 0.115 0.212 B_Activated L2
ENSG00000162510 MATN1 112062 sc-eQTL 6.30e-01 0.0483 0.1 0.212 B_Activated L2
ENSG00000162511 LAPTM5 77873 sc-eQTL 9.56e-01 -0.00386 0.0699 0.212 B_Activated L2
ENSG00000162517 PEF1 -809249 sc-eQTL 3.02e-01 -0.123 0.119 0.212 B_Activated L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 117143 sc-eQTL 3.03e-01 -0.116 0.113 0.212 B_Activated L2
ENSG00000287510 AL137857.1 103954 sc-eQTL 4.71e-01 -0.0721 0.0998 0.212 B_Activated L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -461141 sc-eQTL 5.02e-01 0.079 0.117 0.21 B_Intermediate L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -461335 sc-eQTL 8.16e-01 -0.0228 0.0979 0.21 B_Intermediate L2
ENSG00000134644 PUM1 -230344 sc-eQTL 4.27e-01 -0.0734 0.0923 0.21 B_Intermediate L2
ENSG00000162510 MATN1 112062 sc-eQTL 2.33e-01 -0.115 0.0958 0.21 B_Intermediate L2
ENSG00000162511 LAPTM5 77873 sc-eQTL 2.63e-01 0.0661 0.0589 0.21 B_Intermediate L2
ENSG00000162517 PEF1 -809249 sc-eQTL 8.00e-01 -0.0278 0.11 0.21 B_Intermediate L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 117143 sc-eQTL 8.58e-01 -0.0148 0.0828 0.21 B_Intermediate L2
ENSG00000287510 AL137857.1 103954 sc-eQTL 1.78e-01 0.125 0.0923 0.21 B_Intermediate L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -461141 sc-eQTL 5.76e-01 -0.0644 0.115 0.213 B_Memory L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -461335 sc-eQTL 9.73e-01 -0.00355 0.106 0.213 B_Memory L2
ENSG00000134644 PUM1 -230344 sc-eQTL 7.24e-02 -0.165 0.0916 0.213 B_Memory L2
ENSG00000162510 MATN1 112062 sc-eQTL 7.19e-01 -0.0318 0.0882 0.213 B_Memory L2
ENSG00000162511 LAPTM5 77873 sc-eQTL 4.17e-01 0.0635 0.0781 0.213 B_Memory L2
ENSG00000162517 PEF1 -809249 sc-eQTL 9.08e-01 0.0121 0.104 0.213 B_Memory L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 117143 sc-eQTL 6.79e-02 0.163 0.0888 0.213 B_Memory L2
ENSG00000287510 AL137857.1 103954 sc-eQTL 1.32e-01 -0.158 0.104 0.213 B_Memory L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -461141 sc-eQTL 6.33e-02 -0.195 0.104 0.212 B_Naive1 L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -461335 sc-eQTL 4.85e-01 -0.0634 0.0908 0.212 B_Naive1 L2
ENSG00000134644 PUM1 -230344 sc-eQTL 8.93e-01 -0.0108 0.0801 0.212 B_Naive1 L2
ENSG00000162510 MATN1 112062 sc-eQTL 2.62e-01 0.0912 0.0811 0.212 B_Naive1 L2
ENSG00000162511 LAPTM5 77873 sc-eQTL 3.20e-02 0.116 0.0537 0.212 B_Naive1 L2
ENSG00000162517 PEF1 -809249 sc-eQTL 8.33e-01 0.0202 0.0958 0.212 B_Naive1 L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 117143 sc-eQTL 1.13e-01 0.113 0.0709 0.212 B_Naive1 L2
ENSG00000287510 AL137857.1 103954 sc-eQTL 5.41e-01 -0.0539 0.088 0.212 B_Naive1 L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -461141 sc-eQTL 4.51e-01 0.0839 0.111 0.212 B_Naive2 L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -461335 sc-eQTL 7.98e-02 -0.161 0.0912 0.212 B_Naive2 L2
ENSG00000134644 PUM1 -230344 sc-eQTL 5.40e-01 -0.0552 0.0899 0.212 B_Naive2 L2
ENSG00000162510 MATN1 112062 sc-eQTL 8.83e-01 0.0127 0.0863 0.212 B_Naive2 L2
ENSG00000162511 LAPTM5 77873 sc-eQTL 9.84e-02 0.0967 0.0582 0.212 B_Naive2 L2
ENSG00000162517 PEF1 -809249 sc-eQTL 7.67e-01 -0.0317 0.107 0.212 B_Naive2 L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 117143 sc-eQTL 7.55e-01 0.0267 0.0854 0.212 B_Naive2 L2
ENSG00000287510 AL137857.1 103954 sc-eQTL 6.01e-01 0.0483 0.0922 0.212 B_Naive2 L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -461141 sc-eQTL 5.83e-01 -0.0607 0.11 0.211 CD4_CTL L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -461335 sc-eQTL 9.43e-01 -0.00774 0.109 0.211 CD4_CTL L2
ENSG00000134644 PUM1 -230344 sc-eQTL 2.50e-01 -0.122 0.106 0.211 CD4_CTL L2
ENSG00000162511 LAPTM5 77873 sc-eQTL 1.08e-01 0.152 0.0943 0.211 CD4_CTL L2
ENSG00000162517 PEF1 -809249 sc-eQTL 2.50e-01 0.112 0.097 0.211 CD4_CTL L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 117143 sc-eQTL 8.81e-01 0.0155 0.104 0.211 CD4_CTL L2
ENSG00000287510 AL137857.1 103954 sc-eQTL 2.24e-01 -0.111 0.0913 0.211 CD4_CTL L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -461141 sc-eQTL 6.97e-01 -0.0337 0.0866 0.212 CD4_Naive L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -461335 sc-eQTL 6.10e-01 -0.0392 0.0767 0.212 CD4_Naive L2
ENSG00000134644 PUM1 -230344 sc-eQTL 7.13e-01 -0.0226 0.0613 0.212 CD4_Naive L2
ENSG00000162511 LAPTM5 77873 sc-eQTL 9.74e-01 0.00214 0.0657 0.212 CD4_Naive L2
ENSG00000162517 PEF1 -809249 sc-eQTL 3.16e-01 -0.0723 0.0718 0.212 CD4_Naive L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 117143 sc-eQTL 9.26e-01 -0.00617 0.0666 0.212 CD4_Naive L2
ENSG00000287510 AL137857.1 103954 sc-eQTL 8.55e-01 -0.014 0.0765 0.212 CD4_Naive L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -461141 sc-eQTL 8.93e-01 -0.0147 0.109 0.212 CD4_TCM L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -461335 sc-eQTL 7.37e-02 0.156 0.0868 0.212 CD4_TCM L2
ENSG00000134644 PUM1 -230344 sc-eQTL 8.88e-01 -0.011 0.0774 0.212 CD4_TCM L2
ENSG00000162511 LAPTM5 77873 sc-eQTL 2.20e-01 0.0787 0.064 0.212 CD4_TCM L2
ENSG00000162517 PEF1 -809249 sc-eQTL 8.27e-01 0.0189 0.0861 0.212 CD4_TCM L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 117143 sc-eQTL 9.53e-01 -0.00484 0.0815 0.212 CD4_TCM L2
ENSG00000287510 AL137857.1 103954 sc-eQTL 1.68e-01 0.125 0.0904 0.212 CD4_TCM L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -461141 sc-eQTL 6.14e-01 0.0549 0.108 0.212 CD4_TEM L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -461335 sc-eQTL 9.62e-01 -0.00496 0.103 0.212 CD4_TEM L2
ENSG00000134644 PUM1 -230344 sc-eQTL 3.96e-01 -0.0732 0.086 0.212 CD4_TEM L2
ENSG00000162511 LAPTM5 77873 sc-eQTL 7.68e-02 0.154 0.0865 0.212 CD4_TEM L2
ENSG00000162517 PEF1 -809249 sc-eQTL 8.65e-01 0.0166 0.0976 0.212 CD4_TEM L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 117143 sc-eQTL 9.51e-02 -0.17 0.101 0.212 CD4_TEM L2
ENSG00000287510 AL137857.1 103954 sc-eQTL 5.07e-01 0.0666 0.1 0.212 CD4_TEM L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -461141 sc-eQTL 8.27e-01 0.026 0.118 0.212 CD8_CTL L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -461335 sc-eQTL 1.60e-02 -0.218 0.0895 0.212 CD8_CTL L2
ENSG00000134644 PUM1 -230344 sc-eQTL 6.90e-01 0.0353 0.0881 0.212 CD8_CTL L2
ENSG00000162511 LAPTM5 77873 sc-eQTL 5.27e-02 0.189 0.0968 0.212 CD8_CTL L2
ENSG00000162517 PEF1 -809249 sc-eQTL 2.80e-01 0.0919 0.0848 0.212 CD8_CTL L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 117143 sc-eQTL 4.67e-01 0.0748 0.103 0.212 CD8_CTL L2
ENSG00000287510 AL137857.1 103954 sc-eQTL 6.14e-01 -0.0488 0.0965 0.212 CD8_CTL L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -461141 sc-eQTL 7.07e-01 0.0407 0.108 0.212 CD8_Naive L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -461335 sc-eQTL 1.85e-01 -0.124 0.093 0.212 CD8_Naive L2
ENSG00000134644 PUM1 -230344 sc-eQTL 8.86e-01 -0.0108 0.0752 0.212 CD8_Naive L2
ENSG00000162511 LAPTM5 77873 sc-eQTL 8.58e-01 -0.0129 0.072 0.212 CD8_Naive L2
ENSG00000162517 PEF1 -809249 sc-eQTL 5.59e-01 -0.0586 0.1 0.212 CD8_Naive L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 117143 sc-eQTL 2.82e-01 0.0966 0.0897 0.212 CD8_Naive L2
ENSG00000287510 AL137857.1 103954 sc-eQTL 8.85e-01 -0.0142 0.0979 0.212 CD8_Naive L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -461141 sc-eQTL 7.70e-01 0.0349 0.119 0.215 CD8_TCM L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -461335 sc-eQTL 7.12e-01 -0.0404 0.109 0.215 CD8_TCM L2
ENSG00000134644 PUM1 -230344 sc-eQTL 5.74e-01 -0.058 0.103 0.215 CD8_TCM L2
ENSG00000162511 LAPTM5 77873 sc-eQTL 6.00e-01 0.0565 0.108 0.215 CD8_TCM L2
ENSG00000162517 PEF1 -809249 sc-eQTL 4.58e-01 0.0817 0.11 0.215 CD8_TCM L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 117143 sc-eQTL 7.80e-02 -0.175 0.0989 0.215 CD8_TCM L2
ENSG00000287510 AL137857.1 103954 sc-eQTL 3.14e-01 0.101 0.1 0.215 CD8_TCM L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -461141 sc-eQTL 4.45e-01 -0.0864 0.113 0.219 CD8_TEM L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -461335 sc-eQTL 2.96e-01 -0.113 0.108 0.219 CD8_TEM L2
ENSG00000134644 PUM1 -230344 sc-eQTL 1.19e-01 0.173 0.11 0.219 CD8_TEM L2
ENSG00000162511 LAPTM5 77873 sc-eQTL 9.96e-01 -0.000574 0.104 0.219 CD8_TEM L2
ENSG00000162517 PEF1 -809249 sc-eQTL 5.58e-02 -0.187 0.0971 0.219 CD8_TEM L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 117143 sc-eQTL 5.07e-01 0.0717 0.108 0.219 CD8_TEM L2
ENSG00000287510 AL137857.1 103954 sc-eQTL 3.75e-01 -0.0868 0.0976 0.219 CD8_TEM L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -461141 sc-eQTL 4.09e-02 -0.234 0.114 0.214 MAIT L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -461335 sc-eQTL 1.26e-01 -0.155 0.101 0.214 MAIT L2
ENSG00000134644 PUM1 -230344 sc-eQTL 4.92e-01 0.067 0.0973 0.214 MAIT L2
ENSG00000162511 LAPTM5 77873 sc-eQTL 9.45e-01 -0.0063 0.0919 0.214 MAIT L2
ENSG00000162517 PEF1 -809249 sc-eQTL 7.21e-02 -0.181 0.1 0.214 MAIT L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 117143 sc-eQTL 2.72e-01 0.112 0.102 0.214 MAIT L2
ENSG00000287510 AL137857.1 103954 sc-eQTL 7.96e-01 -0.0273 0.105 0.214 MAIT L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -461141 sc-eQTL 9.14e-01 -0.0128 0.119 0.213 NK_CD56bright L2
ENSG00000121753 ADGRB2 -929246 sc-eQTL 6.92e-01 -0.0369 0.0928 0.213 NK_CD56bright L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -461335 sc-eQTL 7.22e-01 0.0357 0.1 0.213 NK_CD56bright L2
ENSG00000134644 PUM1 -230344 sc-eQTL 4.90e-02 -0.206 0.104 0.213 NK_CD56bright L2
ENSG00000162511 LAPTM5 77873 sc-eQTL 7.81e-01 -0.0289 0.104 0.213 NK_CD56bright L2
ENSG00000162517 PEF1 -809249 sc-eQTL 7.88e-02 0.177 0.1 0.213 NK_CD56bright L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 117143 sc-eQTL 1.43e-02 -0.254 0.103 0.213 NK_CD56bright L2
ENSG00000287510 AL137857.1 103954 sc-eQTL 4.12e-01 -0.0844 0.103 0.213 NK_CD56bright L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -461141 sc-eQTL 6.39e-01 -0.052 0.111 0.213 NK_CD56dim L2
ENSG00000121753 ADGRB2 -929246 sc-eQTL 4.38e-01 0.0756 0.0973 0.213 NK_CD56dim L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -461335 sc-eQTL 4.54e-01 -0.0613 0.0818 0.213 NK_CD56dim L2
ENSG00000134644 PUM1 -230344 sc-eQTL 4.64e-01 -0.0615 0.0839 0.213 NK_CD56dim L2
ENSG00000162511 LAPTM5 77873 sc-eQTL 2.85e-01 0.0958 0.0894 0.213 NK_CD56dim L2
ENSG00000162517 PEF1 -809249 sc-eQTL 6.74e-01 0.0335 0.0797 0.213 NK_CD56dim L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 117143 sc-eQTL 5.49e-01 0.0674 0.112 0.213 NK_CD56dim L2
ENSG00000287510 AL137857.1 103954 sc-eQTL 6.62e-01 -0.0406 0.0926 0.213 NK_CD56dim L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -461141 sc-eQTL 5.42e-01 -0.0716 0.117 0.219 NK_HLA L2
ENSG00000121753 ADGRB2 -929246 sc-eQTL 4.61e-01 0.0686 0.093 0.219 NK_HLA L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -461335 sc-eQTL 6.28e-01 -0.0507 0.105 0.219 NK_HLA L2
ENSG00000134644 PUM1 -230344 sc-eQTL 9.25e-01 0.00961 0.102 0.219 NK_HLA L2
ENSG00000162511 LAPTM5 77873 sc-eQTL 9.31e-02 0.163 0.0967 0.219 NK_HLA L2
ENSG00000162517 PEF1 -809249 sc-eQTL 3.89e-01 -0.0945 0.109 0.219 NK_HLA L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 117143 sc-eQTL 2.51e-01 0.119 0.103 0.219 NK_HLA L2
ENSG00000287510 AL137857.1 103954 sc-eQTL 9.85e-01 -0.00194 0.1 0.219 NK_HLA L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -461141 sc-eQTL 3.02e-01 -0.111 0.107 0.213 NK_cytokine L2
ENSG00000121753 ADGRB2 -929246 sc-eQTL 5.30e-01 0.061 0.0969 0.213 NK_cytokine L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -461335 sc-eQTL 8.22e-01 -0.0188 0.0837 0.213 NK_cytokine L2
ENSG00000134644 PUM1 -230344 sc-eQTL 4.91e-01 -0.0624 0.0905 0.213 NK_cytokine L2
ENSG00000162511 LAPTM5 77873 sc-eQTL 2.73e-01 0.109 0.0994 0.213 NK_cytokine L2
ENSG00000162517 PEF1 -809249 sc-eQTL 4.23e-01 0.0681 0.0848 0.213 NK_cytokine L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 117143 sc-eQTL 7.51e-01 0.0335 0.106 0.213 NK_cytokine L2
ENSG00000287510 AL137857.1 103954 sc-eQTL 6.84e-01 0.0401 0.0983 0.213 NK_cytokine L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -461141 sc-eQTL 9.33e-02 -0.222 0.131 0.193 PB L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -461335 sc-eQTL 4.12e-01 0.126 0.154 0.193 PB L2
ENSG00000134644 PUM1 -230344 sc-eQTL 8.12e-01 0.0319 0.134 0.193 PB L2
ENSG00000162510 MATN1 112062 sc-eQTL 3.06e-01 -0.128 0.124 0.193 PB L2
ENSG00000162511 LAPTM5 77873 sc-eQTL 5.74e-01 -0.0502 0.089 0.193 PB L2
ENSG00000162517 PEF1 -809249 sc-eQTL 1.76e-01 -0.186 0.136 0.193 PB L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 117143 sc-eQTL 5.13e-01 -0.08 0.122 0.193 PB L2
ENSG00000287510 AL137857.1 103954 sc-eQTL 4.28e-01 -0.103 0.13 0.193 PB L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -461141 sc-eQTL 4.45e-01 -0.0645 0.0843 0.211 Pro_T L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -461335 sc-eQTL 4.62e-01 0.0788 0.107 0.211 Pro_T L2
ENSG00000134644 PUM1 -230344 sc-eQTL 2.80e-01 0.108 0.0996 0.211 Pro_T L2
ENSG00000162511 LAPTM5 77873 sc-eQTL 9.81e-01 -0.00173 0.0717 0.211 Pro_T L2
ENSG00000162517 PEF1 -809249 sc-eQTL 3.57e-01 -0.0968 0.105 0.211 Pro_T L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 117143 sc-eQTL 7.82e-01 0.0278 0.1 0.211 Pro_T L2
ENSG00000287510 AL137857.1 103954 sc-eQTL 8.32e-01 0.0196 0.0921 0.211 Pro_T L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -461141 sc-eQTL 1.39e-01 0.164 0.111 0.212 Treg L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -461335 sc-eQTL 2.93e-01 0.113 0.107 0.212 Treg L2
ENSG00000134644 PUM1 -230344 sc-eQTL 8.57e-02 -0.148 0.0854 0.212 Treg L2
ENSG00000162511 LAPTM5 77873 sc-eQTL 5.67e-01 0.0564 0.0984 0.212 Treg L2
ENSG00000162517 PEF1 -809249 sc-eQTL 7.83e-01 0.0293 0.106 0.212 Treg L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 117143 sc-eQTL 2.13e-03 0.305 0.0982 0.212 Treg L2
ENSG00000287510 AL137857.1 103954 sc-eQTL 5.54e-02 -0.191 0.0994 0.212 Treg L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -461141 sc-eQTL 9.93e-01 -0.00104 0.118 0.215 cDC L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -461335 sc-eQTL 8.15e-01 -0.0299 0.128 0.215 cDC L2
ENSG00000134644 PUM1 -230344 sc-eQTL 7.22e-01 -0.0391 0.11 0.215 cDC L2
ENSG00000162511 LAPTM5 77873 sc-eQTL 9.27e-01 0.00704 0.077 0.215 cDC L2
ENSG00000162517 PEF1 -809249 sc-eQTL 1.99e-01 0.143 0.111 0.215 cDC L2
ENSG00000168528 SERINC2 -573918 sc-eQTL 8.44e-01 0.0195 0.0989 0.215 cDC L2
ENSG00000284543 LINC01226 -670579 sc-eQTL 8.45e-01 -0.019 0.0972 0.215 cDC L2
ENSG00000287510 AL137857.1 103954 sc-eQTL 7.96e-01 0.0271 0.105 0.215 cDC L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -461141 sc-eQTL 2.80e-01 -0.0979 0.0903 0.212 cMono_IL1B L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -461335 sc-eQTL 1.73e-01 -0.137 0.101 0.212 cMono_IL1B L2
ENSG00000134644 PUM1 -230344 sc-eQTL 4.20e-01 0.0551 0.0683 0.212 cMono_IL1B L2
ENSG00000162511 LAPTM5 77873 sc-eQTL 6.63e-01 -0.0261 0.06 0.212 cMono_IL1B L2
ENSG00000162512 SDC3 -73111 sc-eQTL 3.55e-02 -0.237 0.112 0.212 cMono_IL1B L2
ENSG00000162517 PEF1 -809249 sc-eQTL 3.58e-01 -0.085 0.0922 0.212 cMono_IL1B L2
ENSG00000168528 SERINC2 -573918 sc-eQTL 3.07e-01 0.117 0.114 0.212 cMono_IL1B L2
ENSG00000284543 LINC01226 -670579 sc-eQTL 1.40e-01 -0.149 0.101 0.212 cMono_IL1B L2
ENSG00000287510 AL137857.1 103954 sc-eQTL 8.18e-02 -0.164 0.0937 0.212 cMono_IL1B L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -461141 sc-eQTL 4.45e-01 0.0733 0.0958 0.212 cMono_S100A L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -461335 sc-eQTL 1.69e-01 -0.156 0.113 0.212 cMono_S100A L2
ENSG00000134644 PUM1 -230344 sc-eQTL 9.28e-01 -0.00739 0.082 0.212 cMono_S100A L2
ENSG00000162511 LAPTM5 77873 sc-eQTL 1.72e-01 -0.086 0.0627 0.212 cMono_S100A L2
ENSG00000162512 SDC3 -73111 sc-eQTL 4.70e-01 -0.0787 0.109 0.212 cMono_S100A L2
ENSG00000162517 PEF1 -809249 sc-eQTL 1.88e-01 -0.129 0.0978 0.212 cMono_S100A L2
ENSG00000168528 SERINC2 -573918 sc-eQTL 5.35e-01 0.0715 0.115 0.212 cMono_S100A L2
ENSG00000284543 LINC01226 -670579 sc-eQTL 6.42e-01 -0.0436 0.0935 0.212 cMono_S100A L2
ENSG00000287510 AL137857.1 103954 sc-eQTL 4.15e-02 -0.191 0.0931 0.212 cMono_S100A L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -461141 sc-eQTL 5.43e-01 0.0847 0.139 0.227 gdT L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -461335 sc-eQTL 7.16e-01 -0.0435 0.119 0.227 gdT L2
ENSG00000134644 PUM1 -230344 sc-eQTL 9.31e-01 -0.0106 0.123 0.227 gdT L2
ENSG00000162511 LAPTM5 77873 sc-eQTL 4.55e-01 0.1 0.134 0.227 gdT L2
ENSG00000162517 PEF1 -809249 sc-eQTL 4.57e-01 -0.0911 0.122 0.227 gdT L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 117143 sc-eQTL 5.23e-01 -0.079 0.123 0.227 gdT L2
ENSG00000287510 AL137857.1 103954 sc-eQTL 6.34e-01 -0.0571 0.12 0.227 gdT L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -461141 sc-eQTL 9.80e-01 0.00274 0.107 0.216 intMono L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -461335 sc-eQTL 5.63e-01 0.0663 0.115 0.216 intMono L2
ENSG00000134644 PUM1 -230344 sc-eQTL 7.37e-02 -0.173 0.0965 0.216 intMono L2
ENSG00000162511 LAPTM5 77873 sc-eQTL 1.08e-01 0.123 0.0758 0.216 intMono L2
ENSG00000162512 SDC3 -73111 sc-eQTL 2.25e-01 -0.127 0.104 0.216 intMono L2
ENSG00000162517 PEF1 -809249 sc-eQTL 3.78e-01 0.0968 0.11 0.216 intMono L2
ENSG00000168528 SERINC2 -573918 sc-eQTL 4.56e-01 0.0815 0.109 0.216 intMono L2
ENSG00000284543 LINC01226 -670579 sc-eQTL 1.26e-01 -0.158 0.103 0.216 intMono L2
ENSG00000287510 AL137857.1 103954 sc-eQTL 2.72e-01 0.114 0.103 0.216 intMono L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -461141 sc-eQTL 5.15e-01 0.0665 0.102 0.208 ncMono L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -461335 sc-eQTL 5.46e-01 -0.0658 0.109 0.208 ncMono L2
ENSG00000134644 PUM1 -230344 sc-eQTL 8.52e-01 -0.0166 0.089 0.208 ncMono L2
ENSG00000162511 LAPTM5 77873 sc-eQTL 4.71e-01 0.0583 0.0808 0.208 ncMono L2
ENSG00000162512 SDC3 -73111 sc-eQTL 9.68e-01 0.00361 0.0907 0.208 ncMono L2
ENSG00000162517 PEF1 -809249 sc-eQTL 8.02e-01 -0.0261 0.104 0.208 ncMono L2
ENSG00000168528 SERINC2 -573918 sc-eQTL 4.98e-01 0.0672 0.0988 0.208 ncMono L2
ENSG00000284543 LINC01226 -670579 sc-eQTL 5.08e-01 0.0655 0.0987 0.208 ncMono L2
ENSG00000287510 AL137857.1 103954 sc-eQTL 3.35e-01 0.0988 0.102 0.208 ncMono L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -461141 sc-eQTL 6.12e-01 0.0598 0.118 0.212 pDC L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -461335 sc-eQTL 5.77e-01 -0.0723 0.129 0.212 pDC L2
ENSG00000134644 PUM1 -230344 sc-eQTL 1.10e-01 0.171 0.106 0.212 pDC L2
ENSG00000162511 LAPTM5 77873 sc-eQTL 7.17e-01 0.0362 0.0996 0.212 pDC L2
ENSG00000162517 PEF1 -809249 sc-eQTL 5.77e-01 0.0722 0.129 0.212 pDC L2
ENSG00000168528 SERINC2 -573918 sc-eQTL 1.41e-01 -0.178 0.12 0.212 pDC L2
ENSG00000284543 LINC01226 -670579 sc-eQTL 3.28e-01 0.0918 0.0935 0.212 pDC L2
ENSG00000287510 AL137857.1 103954 sc-eQTL 4.61e-01 0.0815 0.11 0.212 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000060688 SNRNP40 -461141 sc-eQTL 9.23e-01 0.0109 0.113 0.212 B_Memory LOneK1K
ENSG00000121766 ZCCHC17 -461335 sc-eQTL 6.04e-01 0.0486 0.0936 0.212 B_Memory LOneK1K
ENSG00000134644 PUM1 -230344 sc-eQTL 8.79e-02 -0.141 0.0824 0.212 B_Memory LOneK1K
ENSG00000162510 MATN1 112062 sc-eQTL 5.13e-01 -0.0619 0.0946 0.212 B_Memory LOneK1K
ENSG00000162511 LAPTM5 77873 sc-eQTL 6.49e-01 0.0271 0.0594 0.212 B_Memory LOneK1K
ENSG00000162517 PEF1 -809249 sc-eQTL 8.07e-01 -0.0241 0.0985 0.212 B_Memory LOneK1K
ENSG00000186056 MATN1-AS1 117143 sc-eQTL 8.72e-01 0.0127 0.0787 0.212 B_Memory LOneK1K
ENSG00000287510 AL137857.1 103954 sc-eQTL 7.72e-01 0.0249 0.0857 0.212 B_Memory LOneK1K
ENSG00000060688 SNRNP40 -461141 sc-eQTL 5.51e-01 -0.0612 0.102 0.212 B_Naive LOneK1K
ENSG00000121766 ZCCHC17 -461335 sc-eQTL 1.68e-01 -0.111 0.0807 0.212 B_Naive LOneK1K
ENSG00000134644 PUM1 -230344 sc-eQTL 7.48e-01 -0.0247 0.0766 0.212 B_Naive LOneK1K
ENSG00000162510 MATN1 112062 sc-eQTL 2.88e-01 0.0785 0.0736 0.212 B_Naive LOneK1K
ENSG00000162511 LAPTM5 77873 sc-eQTL 6.44e-02 0.0958 0.0515 0.212 B_Naive LOneK1K
ENSG00000162517 PEF1 -809249 sc-eQTL 8.78e-01 -0.0146 0.0949 0.212 B_Naive LOneK1K
ENSG00000186056 MATN1-AS1 117143 sc-eQTL 1.56e-01 0.0951 0.0668 0.212 B_Naive LOneK1K
ENSG00000287510 AL137857.1 103954 sc-eQTL 9.50e-01 0.00496 0.0797 0.212 B_Naive LOneK1K
ENSG00000060688 SNRNP40 -461141 sc-eQTL 2.39e-01 -0.102 0.0862 0.212 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000121766 ZCCHC17 -461335 sc-eQTL 3.98e-02 -0.201 0.097 0.212 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000134644 PUM1 -230344 sc-eQTL 7.57e-01 0.0194 0.0625 0.212 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000162511 LAPTM5 77873 sc-eQTL 6.15e-01 -0.0277 0.0549 0.212 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000162512 SDC3 -73111 sc-eQTL 4.13e-02 -0.228 0.111 0.212 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000162517 PEF1 -809249 sc-eQTL 6.94e-02 -0.143 0.0782 0.212 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000168528 SERINC2 -573918 sc-eQTL 4.47e-01 0.0877 0.115 0.212 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000284543 LINC01226 -670579 sc-eQTL 1.82e-01 -0.126 0.0941 0.212 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000287510 AL137857.1 103954 sc-eQTL 7.52e-02 -0.157 0.0878 0.212 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000060688 SNRNP40 -461141 sc-eQTL 6.62e-01 0.0414 0.0947 0.211 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000121766 ZCCHC17 -461335 sc-eQTL 8.06e-01 -0.0255 0.104 0.211 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000134644 PUM1 -230344 sc-eQTL 3.50e-01 -0.0793 0.0847 0.211 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000162511 LAPTM5 77873 sc-eQTL 9.21e-02 0.114 0.0675 0.211 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000162512 SDC3 -73111 sc-eQTL 1.01e-01 -0.163 0.0986 0.211 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000162517 PEF1 -809249 sc-eQTL 4.46e-01 0.0688 0.09 0.211 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000168528 SERINC2 -573918 sc-eQTL 3.26e-01 0.101 0.103 0.211 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000284543 LINC01226 -670579 sc-eQTL 2.43e-01 -0.114 0.0973 0.211 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000287510 AL137857.1 103954 sc-eQTL 1.21e-01 0.151 0.0972 0.211 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000060688 SNRNP40 -461141 sc-eQTL 2.82e-01 -0.113 0.105 0.213 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000121753 ADGRB2 -929246 sc-eQTL 5.58e-01 0.0524 0.0894 0.213 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000121766 ZCCHC17 -461335 sc-eQTL 3.47e-01 -0.0675 0.0716 0.213 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000134644 PUM1 -230344 sc-eQTL 4.70e-01 -0.0569 0.0785 0.213 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000162511 LAPTM5 77873 sc-eQTL 1.66e-01 0.121 0.0874 0.213 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000162517 PEF1 -809249 sc-eQTL 7.31e-01 0.023 0.0667 0.213 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000186056 MATN1-AS1 117143 sc-eQTL 9.94e-02 0.167 0.101 0.213 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000287510 AL137857.1 103954 sc-eQTL 5.45e-01 0.0529 0.0874 0.213 NK_CD56dim LOneK1K

Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF

Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina
ENSG00000121766 \N -461335 5.37e-07 2.88e-07 6.45e-08 3.48e-07 1.1e-07 9.31e-08 2.74e-07 5.89e-08 2.38e-07 1.5e-07 2.47e-07 1.52e-07 6.08e-07 8.85e-08 1.18e-07 1.06e-07 5.27e-08 2.04e-07 8e-08 7.05e-08 1.18e-07 2.07e-07 1.86e-07 3.41e-08 3.14e-07 1.31e-07 1.33e-07 1.69e-07 1.34e-07 1.58e-07 2.11e-07 5.22e-08 4.23e-08 1.17e-07 1.95e-07 3.5e-08 1e-07 7.25e-08 5.98e-08 2.53e-08 2.84e-08 2.6e-07 3.55e-08 7.28e-09 3.48e-08 8.76e-09 1e-07 0.0 4.69e-08