logo

Genes within 1Mb (chr1:30834169:T:C):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD

Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000060688 SNRNP40 -462619 sc-eQTL 7.63e-01 0.0416 0.138 0.088 B L1
ENSG00000121766 ZCCHC17 -462813 sc-eQTL 8.65e-01 -0.0188 0.11 0.088 B L1
ENSG00000134644 PUM1 -231822 sc-eQTL 2.73e-01 0.101 0.0923 0.088 B L1
ENSG00000162510 MATN1 110584 sc-eQTL 9.66e-01 -0.00415 0.0973 0.088 B L1
ENSG00000162511 LAPTM5 76395 sc-eQTL 1.20e-01 0.118 0.0758 0.088 B L1
ENSG00000162517 PEF1 -810727 sc-eQTL 2.88e-01 0.122 0.115 0.088 B L1
ENSG00000186056 MATN1-AS1 115665 sc-eQTL 5.60e-01 -0.0521 0.0892 0.088 B L1
ENSG00000287510 AL137857.1 102476 sc-eQTL 8.32e-01 0.0225 0.106 0.088 B L1
ENSG00000060688 SNRNP40 -462619 sc-eQTL 9.86e-01 0.00202 0.118 0.088 CD4T L1
ENSG00000121766 ZCCHC17 -462813 sc-eQTL 7.78e-01 -0.026 0.092 0.088 CD4T L1
ENSG00000134644 PUM1 -231822 sc-eQTL 8.52e-02 0.141 0.0814 0.088 CD4T L1
ENSG00000162511 LAPTM5 76395 sc-eQTL 5.95e-02 0.171 0.0901 0.088 CD4T L1
ENSG00000162517 PEF1 -810727 sc-eQTL 5.21e-01 0.0611 0.0949 0.088 CD4T L1
ENSG00000186056 MATN1-AS1 115665 sc-eQTL 1.57e-01 -0.115 0.0809 0.088 CD4T L1
ENSG00000287510 AL137857.1 102476 sc-eQTL 4.06e-01 0.0808 0.0972 0.088 CD4T L1
ENSG00000060688 SNRNP40 -462619 sc-eQTL 3.28e-01 0.152 0.155 0.088 CD8T L1
ENSG00000121766 ZCCHC17 -462813 sc-eQTL 2.47e-01 -0.119 0.103 0.088 CD8T L1
ENSG00000134644 PUM1 -231822 sc-eQTL 6.99e-01 0.0352 0.0909 0.088 CD8T L1
ENSG00000162511 LAPTM5 76395 sc-eQTL 2.82e-01 0.095 0.088 0.088 CD8T L1
ENSG00000162517 PEF1 -810727 sc-eQTL 9.82e-01 0.00252 0.109 0.088 CD8T L1
ENSG00000186056 MATN1-AS1 115665 sc-eQTL 3.63e-01 0.0942 0.103 0.088 CD8T L1
ENSG00000287510 AL137857.1 102476 sc-eQTL 5.42e-01 0.0794 0.13 0.088 CD8T L1
ENSG00000060688 SNRNP40 -462619 sc-eQTL 7.32e-01 0.0464 0.135 0.092 DC L1
ENSG00000121766 ZCCHC17 -462813 sc-eQTL 9.01e-01 -0.0199 0.16 0.092 DC L1
ENSG00000134644 PUM1 -231822 sc-eQTL 7.51e-01 0.0399 0.125 0.092 DC L1
ENSG00000162511 LAPTM5 76395 sc-eQTL 9.71e-01 -0.00325 0.0896 0.092 DC L1
ENSG00000162517 PEF1 -810727 sc-eQTL 2.55e-01 -0.165 0.145 0.092 DC L1
ENSG00000168528 SERINC2 -575396 sc-eQTL 3.26e-01 -0.145 0.147 0.092 DC L1
ENSG00000284543 LINC01226 -672057 sc-eQTL 3.58e-02 -0.205 0.0968 0.092 DC L1
ENSG00000287510 AL137857.1 102476 sc-eQTL 1.07e-01 -0.228 0.141 0.092 DC L1
ENSG00000060688 SNRNP40 -462619 sc-eQTL 1.67e-01 0.148 0.107 0.088 Mono L1
ENSG00000121766 ZCCHC17 -462813 sc-eQTL 3.73e-01 -0.119 0.133 0.088 Mono L1
ENSG00000134644 PUM1 -231822 sc-eQTL 4.02e-01 0.0716 0.0852 0.088 Mono L1
ENSG00000162511 LAPTM5 76395 sc-eQTL 9.57e-01 0.00419 0.0785 0.088 Mono L1
ENSG00000162512 SDC3 -74589 sc-eQTL 5.08e-01 -0.1 0.151 0.088 Mono L1
ENSG00000162517 PEF1 -810727 sc-eQTL 4.96e-02 0.207 0.105 0.088 Mono L1
ENSG00000168528 SERINC2 -575396 sc-eQTL 7.66e-01 0.0482 0.162 0.088 Mono L1
ENSG00000284543 LINC01226 -672057 sc-eQTL 7.98e-01 0.0366 0.143 0.088 Mono L1
ENSG00000287510 AL137857.1 102476 sc-eQTL 3.18e-01 0.125 0.124 0.088 Mono L1
ENSG00000060688 SNRNP40 -462619 sc-eQTL 3.17e-01 0.149 0.148 0.088 NK L1
ENSG00000121753 ADGRB2 -930724 sc-eQTL 6.44e-01 -0.0593 0.128 0.088 NK L1
ENSG00000121766 ZCCHC17 -462813 sc-eQTL 5.86e-01 0.0554 0.102 0.088 NK L1
ENSG00000134644 PUM1 -231822 sc-eQTL 5.38e-01 0.0658 0.107 0.088 NK L1
ENSG00000162511 LAPTM5 76395 sc-eQTL 8.03e-01 -0.0307 0.123 0.088 NK L1
ENSG00000162517 PEF1 -810727 sc-eQTL 2.31e-01 0.107 0.0894 0.088 NK L1
ENSG00000186056 MATN1-AS1 115665 sc-eQTL 2.66e-01 0.153 0.138 0.088 NK L1
ENSG00000287510 AL137857.1 102476 sc-eQTL 8.98e-01 -0.0163 0.127 0.088 NK L1
ENSG00000060688 SNRNP40 -462619 sc-eQTL 2.78e-01 0.122 0.112 0.088 Other_T L1
ENSG00000121766 ZCCHC17 -462813 sc-eQTL 3.55e-01 -0.111 0.12 0.088 Other_T L1
ENSG00000134644 PUM1 -231822 sc-eQTL 4.73e-01 0.0778 0.108 0.088 Other_T L1
ENSG00000162511 LAPTM5 76395 sc-eQTL 5.47e-01 0.0536 0.0887 0.088 Other_T L1
ENSG00000162517 PEF1 -810727 sc-eQTL 2.22e-01 0.145 0.118 0.088 Other_T L1
ENSG00000186056 MATN1-AS1 115665 sc-eQTL 8.30e-01 -0.0313 0.145 0.088 Other_T L1
ENSG00000287510 AL137857.1 102476 sc-eQTL 7.35e-01 -0.0514 0.151 0.088 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000060688 SNRNP40 -462619 sc-eQTL 7.84e-01 0.0464 0.169 0.094 B_Activated L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -462813 sc-eQTL 6.39e-01 0.0801 0.17 0.094 B_Activated L2
ENSG00000134644 PUM1 -231822 sc-eQTL 7.98e-01 0.0407 0.158 0.094 B_Activated L2
ENSG00000162510 MATN1 110584 sc-eQTL 3.18e-01 -0.138 0.138 0.094 B_Activated L2
ENSG00000162511 LAPTM5 76395 sc-eQTL 2.23e-01 -0.118 0.0962 0.094 B_Activated L2
ENSG00000162517 PEF1 -810727 sc-eQTL 8.34e-01 0.0346 0.164 0.094 B_Activated L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 115665 sc-eQTL 9.25e-01 0.0148 0.156 0.094 B_Activated L2
ENSG00000287510 AL137857.1 102476 sc-eQTL 9.48e-01 -0.00899 0.138 0.094 B_Activated L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -462619 sc-eQTL 6.09e-01 -0.088 0.172 0.088 B_Intermediate L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -462813 sc-eQTL 7.74e-01 0.0411 0.143 0.088 B_Intermediate L2
ENSG00000134644 PUM1 -231822 sc-eQTL 9.60e-01 -0.00686 0.135 0.088 B_Intermediate L2
ENSG00000162510 MATN1 110584 sc-eQTL 7.02e-01 0.054 0.141 0.088 B_Intermediate L2
ENSG00000162511 LAPTM5 76395 sc-eQTL 1.19e-01 0.134 0.0859 0.088 B_Intermediate L2
ENSG00000162517 PEF1 -810727 sc-eQTL 3.04e-01 0.165 0.16 0.088 B_Intermediate L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 115665 sc-eQTL 6.99e-01 0.047 0.121 0.088 B_Intermediate L2
ENSG00000287510 AL137857.1 102476 sc-eQTL 1.54e-01 0.193 0.135 0.088 B_Intermediate L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -462619 sc-eQTL 2.19e-01 -0.202 0.164 0.088 B_Memory L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -462813 sc-eQTL 6.81e-01 0.0626 0.152 0.088 B_Memory L2
ENSG00000134644 PUM1 -231822 sc-eQTL 3.13e-01 -0.133 0.132 0.088 B_Memory L2
ENSG00000162510 MATN1 110584 sc-eQTL 8.00e-01 0.0321 0.126 0.088 B_Memory L2
ENSG00000162511 LAPTM5 76395 sc-eQTL 7.75e-01 0.0321 0.112 0.088 B_Memory L2
ENSG00000162517 PEF1 -810727 sc-eQTL 5.78e-01 0.0832 0.15 0.088 B_Memory L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 115665 sc-eQTL 9.04e-01 -0.0156 0.128 0.088 B_Memory L2
ENSG00000287510 AL137857.1 102476 sc-eQTL 3.02e-01 0.155 0.15 0.088 B_Memory L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -462619 sc-eQTL 6.64e-01 0.0646 0.149 0.088 B_Naive1 L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -462813 sc-eQTL 7.29e-01 0.0444 0.128 0.088 B_Naive1 L2
ENSG00000134644 PUM1 -231822 sc-eQTL 4.44e-01 -0.0867 0.113 0.088 B_Naive1 L2
ENSG00000162510 MATN1 110584 sc-eQTL 7.75e-01 -0.0329 0.115 0.088 B_Naive1 L2
ENSG00000162511 LAPTM5 76395 sc-eQTL 3.45e-01 0.0724 0.0766 0.088 B_Naive1 L2
ENSG00000162517 PEF1 -810727 sc-eQTL 3.89e-01 -0.117 0.135 0.088 B_Naive1 L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 115665 sc-eQTL 8.17e-01 0.0234 0.101 0.088 B_Naive1 L2
ENSG00000287510 AL137857.1 102476 sc-eQTL 7.95e-01 -0.0324 0.124 0.088 B_Naive1 L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -462619 sc-eQTL 5.99e-01 0.0844 0.16 0.088 B_Naive2 L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -462813 sc-eQTL 3.49e-01 -0.124 0.132 0.088 B_Naive2 L2
ENSG00000134644 PUM1 -231822 sc-eQTL 7.40e-01 0.0429 0.129 0.088 B_Naive2 L2
ENSG00000162510 MATN1 110584 sc-eQTL 9.47e-01 -0.00824 0.124 0.088 B_Naive2 L2
ENSG00000162511 LAPTM5 76395 sc-eQTL 4.01e-01 0.0708 0.0842 0.088 B_Naive2 L2
ENSG00000162517 PEF1 -810727 sc-eQTL 6.50e-01 -0.0697 0.153 0.088 B_Naive2 L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 115665 sc-eQTL 9.51e-01 0.00761 0.123 0.088 B_Naive2 L2
ENSG00000287510 AL137857.1 102476 sc-eQTL 6.53e-01 0.0597 0.133 0.088 B_Naive2 L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -462619 sc-eQTL 6.27e-01 0.0768 0.158 0.091 CD4_CTL L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -462813 sc-eQTL 4.86e-01 -0.108 0.155 0.091 CD4_CTL L2
ENSG00000134644 PUM1 -231822 sc-eQTL 6.06e-01 -0.0787 0.152 0.091 CD4_CTL L2
ENSG00000162511 LAPTM5 76395 sc-eQTL 9.96e-01 0.000746 0.136 0.091 CD4_CTL L2
ENSG00000162517 PEF1 -810727 sc-eQTL 3.98e-01 0.118 0.139 0.091 CD4_CTL L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 115665 sc-eQTL 4.55e-01 -0.111 0.148 0.091 CD4_CTL L2
ENSG00000287510 AL137857.1 102476 sc-eQTL 2.91e-01 0.138 0.131 0.091 CD4_CTL L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -462619 sc-eQTL 3.21e-01 0.122 0.123 0.088 CD4_Naive L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -462813 sc-eQTL 6.44e-01 -0.0506 0.109 0.088 CD4_Naive L2
ENSG00000134644 PUM1 -231822 sc-eQTL 1.24e-01 0.134 0.0868 0.088 CD4_Naive L2
ENSG00000162511 LAPTM5 76395 sc-eQTL 1.78e-02 0.22 0.0923 0.088 CD4_Naive L2
ENSG00000162517 PEF1 -810727 sc-eQTL 6.21e-01 0.0508 0.103 0.088 CD4_Naive L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 115665 sc-eQTL 1.25e-01 -0.145 0.0944 0.088 CD4_Naive L2
ENSG00000287510 AL137857.1 102476 sc-eQTL 4.97e-01 0.0741 0.109 0.088 CD4_Naive L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -462619 sc-eQTL 3.76e-01 -0.137 0.154 0.088 CD4_TCM L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -462813 sc-eQTL 4.00e-01 0.105 0.124 0.088 CD4_TCM L2
ENSG00000134644 PUM1 -231822 sc-eQTL 1.60e-01 0.154 0.11 0.088 CD4_TCM L2
ENSG00000162511 LAPTM5 76395 sc-eQTL 5.56e-01 0.0538 0.0912 0.088 CD4_TCM L2
ENSG00000162517 PEF1 -810727 sc-eQTL 8.74e-01 0.0194 0.122 0.088 CD4_TCM L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 115665 sc-eQTL 4.13e-01 -0.0948 0.116 0.088 CD4_TCM L2
ENSG00000287510 AL137857.1 102476 sc-eQTL 8.06e-01 -0.0317 0.129 0.088 CD4_TCM L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -462619 sc-eQTL 9.53e-01 -0.00903 0.153 0.088 CD4_TEM L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -462813 sc-eQTL 7.83e-01 -0.0404 0.146 0.088 CD4_TEM L2
ENSG00000134644 PUM1 -231822 sc-eQTL 4.69e-01 0.0882 0.122 0.088 CD4_TEM L2
ENSG00000162511 LAPTM5 76395 sc-eQTL 4.97e-01 0.0838 0.123 0.088 CD4_TEM L2
ENSG00000162517 PEF1 -810727 sc-eQTL 4.40e-01 0.107 0.138 0.088 CD4_TEM L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 115665 sc-eQTL 2.85e-01 0.154 0.144 0.088 CD4_TEM L2
ENSG00000287510 AL137857.1 102476 sc-eQTL 5.50e-01 0.085 0.142 0.088 CD4_TEM L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -462619 sc-eQTL 3.41e-01 0.161 0.169 0.088 CD8_CTL L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -462813 sc-eQTL 4.62e-01 -0.0955 0.13 0.088 CD8_CTL L2
ENSG00000134644 PUM1 -231822 sc-eQTL 7.54e-01 0.0395 0.126 0.088 CD8_CTL L2
ENSG00000162511 LAPTM5 76395 sc-eQTL 5.18e-01 -0.0904 0.139 0.088 CD8_CTL L2
ENSG00000162517 PEF1 -810727 sc-eQTL 9.47e-02 -0.203 0.121 0.088 CD8_CTL L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 115665 sc-eQTL 3.93e-01 0.125 0.147 0.088 CD8_CTL L2
ENSG00000287510 AL137857.1 102476 sc-eQTL 6.58e-01 0.0611 0.138 0.088 CD8_CTL L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -462619 sc-eQTL 3.17e-01 0.153 0.153 0.088 CD8_Naive L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -462813 sc-eQTL 6.49e-01 0.0602 0.132 0.088 CD8_Naive L2
ENSG00000134644 PUM1 -231822 sc-eQTL 3.90e-01 0.0914 0.106 0.088 CD8_Naive L2
ENSG00000162511 LAPTM5 76395 sc-eQTL 1.00e-02 0.261 0.1 0.088 CD8_Naive L2
ENSG00000162517 PEF1 -810727 sc-eQTL 4.89e-01 -0.098 0.142 0.088 CD8_Naive L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 115665 sc-eQTL 8.77e-01 0.0197 0.127 0.088 CD8_Naive L2
ENSG00000287510 AL137857.1 102476 sc-eQTL 9.56e-01 -0.00761 0.139 0.088 CD8_Naive L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -462619 sc-eQTL 7.96e-01 0.0441 0.171 0.086 CD8_TCM L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -462813 sc-eQTL 4.30e-01 -0.124 0.156 0.086 CD8_TCM L2
ENSG00000134644 PUM1 -231822 sc-eQTL 2.91e-01 -0.155 0.147 0.086 CD8_TCM L2
ENSG00000162511 LAPTM5 76395 sc-eQTL 5.23e-01 0.0982 0.154 0.086 CD8_TCM L2
ENSG00000162517 PEF1 -810727 sc-eQTL 4.77e-01 0.112 0.157 0.086 CD8_TCM L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 115665 sc-eQTL 1.62e-02 0.34 0.14 0.086 CD8_TCM L2
ENSG00000287510 AL137857.1 102476 sc-eQTL 5.33e-01 -0.0899 0.144 0.086 CD8_TCM L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -462619 sc-eQTL 4.49e-01 0.124 0.163 0.087 CD8_TEM L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -462813 sc-eQTL 9.28e-01 -0.0142 0.156 0.087 CD8_TEM L2
ENSG00000134644 PUM1 -231822 sc-eQTL 9.88e-01 0.00237 0.16 0.087 CD8_TEM L2
ENSG00000162511 LAPTM5 76395 sc-eQTL 5.40e-01 0.0921 0.15 0.087 CD8_TEM L2
ENSG00000162517 PEF1 -810727 sc-eQTL 2.86e-03 0.418 0.138 0.087 CD8_TEM L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 115665 sc-eQTL 2.90e-01 -0.165 0.156 0.087 CD8_TEM L2
ENSG00000287510 AL137857.1 102476 sc-eQTL 5.72e-01 -0.0799 0.141 0.087 CD8_TEM L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -462619 sc-eQTL 2.48e-01 0.187 0.161 0.089 MAIT L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -462813 sc-eQTL 9.47e-02 -0.239 0.142 0.089 MAIT L2
ENSG00000134644 PUM1 -231822 sc-eQTL 6.77e-01 0.0572 0.137 0.089 MAIT L2
ENSG00000162511 LAPTM5 76395 sc-eQTL 7.10e-01 -0.0483 0.129 0.089 MAIT L2
ENSG00000162517 PEF1 -810727 sc-eQTL 1.96e-02 0.33 0.14 0.089 MAIT L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 115665 sc-eQTL 2.87e-01 -0.154 0.144 0.089 MAIT L2
ENSG00000287510 AL137857.1 102476 sc-eQTL 2.78e-01 -0.161 0.148 0.089 MAIT L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -462619 sc-eQTL 9.76e-01 0.00505 0.165 0.089 NK_CD56bright L2
ENSG00000121753 ADGRB2 -930724 sc-eQTL 7.71e-01 0.0377 0.129 0.089 NK_CD56bright L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -462813 sc-eQTL 4.68e-01 0.101 0.139 0.089 NK_CD56bright L2
ENSG00000134644 PUM1 -231822 sc-eQTL 4.26e-01 0.117 0.146 0.089 NK_CD56bright L2
ENSG00000162511 LAPTM5 76395 sc-eQTL 7.31e-01 0.0498 0.144 0.089 NK_CD56bright L2
ENSG00000162517 PEF1 -810727 sc-eQTL 9.35e-01 0.0114 0.14 0.089 NK_CD56bright L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 115665 sc-eQTL 6.38e-02 0.268 0.144 0.089 NK_CD56bright L2
ENSG00000287510 AL137857.1 102476 sc-eQTL 9.28e-01 0.0129 0.143 0.089 NK_CD56bright L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -462619 sc-eQTL 9.48e-02 0.261 0.156 0.088 NK_CD56dim L2
ENSG00000121753 ADGRB2 -930724 sc-eQTL 5.95e-01 -0.0733 0.138 0.088 NK_CD56dim L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -462813 sc-eQTL 2.30e-01 -0.139 0.115 0.088 NK_CD56dim L2
ENSG00000134644 PUM1 -231822 sc-eQTL 5.77e-01 0.0663 0.119 0.088 NK_CD56dim L2
ENSG00000162511 LAPTM5 76395 sc-eQTL 8.94e-01 -0.0169 0.127 0.088 NK_CD56dim L2
ENSG00000162517 PEF1 -810727 sc-eQTL 4.75e-01 0.0806 0.113 0.088 NK_CD56dim L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 115665 sc-eQTL 7.24e-01 -0.0561 0.159 0.088 NK_CD56dim L2
ENSG00000287510 AL137857.1 102476 sc-eQTL 8.50e-01 -0.0249 0.131 0.088 NK_CD56dim L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -462619 sc-eQTL 3.65e-01 -0.149 0.164 0.089 NK_HLA L2
ENSG00000121753 ADGRB2 -930724 sc-eQTL 4.80e-01 0.0921 0.13 0.089 NK_HLA L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -462813 sc-eQTL 2.06e-01 0.185 0.146 0.089 NK_HLA L2
ENSG00000134644 PUM1 -231822 sc-eQTL 1.32e-01 0.215 0.142 0.089 NK_HLA L2
ENSG00000162511 LAPTM5 76395 sc-eQTL 9.98e-01 -0.000378 0.136 0.089 NK_HLA L2
ENSG00000162517 PEF1 -810727 sc-eQTL 4.31e-02 0.309 0.152 0.089 NK_HLA L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 115665 sc-eQTL 7.94e-02 -0.254 0.144 0.089 NK_HLA L2
ENSG00000287510 AL137857.1 102476 sc-eQTL 7.89e-01 -0.0375 0.14 0.089 NK_HLA L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -462619 sc-eQTL 8.28e-01 0.0334 0.154 0.088 NK_cytokine L2
ENSG00000121753 ADGRB2 -930724 sc-eQTL 9.39e-01 -0.0107 0.139 0.088 NK_cytokine L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -462813 sc-eQTL 5.24e-01 0.0763 0.12 0.088 NK_cytokine L2
ENSG00000134644 PUM1 -231822 sc-eQTL 9.54e-01 0.00756 0.13 0.088 NK_cytokine L2
ENSG00000162511 LAPTM5 76395 sc-eQTL 4.27e-01 -0.113 0.142 0.088 NK_cytokine L2
ENSG00000162517 PEF1 -810727 sc-eQTL 3.08e-01 0.124 0.121 0.088 NK_cytokine L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 115665 sc-eQTL 2.82e-02 0.33 0.149 0.088 NK_cytokine L2
ENSG00000287510 AL137857.1 102476 sc-eQTL 6.38e-01 0.0662 0.141 0.088 NK_cytokine L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -462619 sc-eQTL 4.60e-01 -0.135 0.182 0.104 PB L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -462813 sc-eQTL 2.39e-01 -0.249 0.21 0.104 PB L2
ENSG00000134644 PUM1 -231822 sc-eQTL 4.17e-01 0.149 0.183 0.104 PB L2
ENSG00000162510 MATN1 110584 sc-eQTL 7.91e-01 0.0454 0.171 0.104 PB L2
ENSG00000162511 LAPTM5 76395 sc-eQTL 4.07e-01 0.101 0.122 0.104 PB L2
ENSG00000162517 PEF1 -810727 sc-eQTL 2.16e-01 0.233 0.187 0.104 PB L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 115665 sc-eQTL 2.43e-01 -0.195 0.166 0.104 PB L2
ENSG00000287510 AL137857.1 102476 sc-eQTL 4.75e-01 -0.128 0.178 0.104 PB L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -462619 sc-eQTL 5.75e-01 -0.0679 0.121 0.089 Pro_T L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -462813 sc-eQTL 7.99e-01 -0.0391 0.153 0.089 Pro_T L2
ENSG00000134644 PUM1 -231822 sc-eQTL 7.36e-01 -0.0484 0.143 0.089 Pro_T L2
ENSG00000162511 LAPTM5 76395 sc-eQTL 5.25e-01 0.0653 0.103 0.089 Pro_T L2
ENSG00000162517 PEF1 -810727 sc-eQTL 4.89e-01 -0.104 0.151 0.089 Pro_T L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 115665 sc-eQTL 5.63e-01 -0.0831 0.143 0.089 Pro_T L2
ENSG00000287510 AL137857.1 102476 sc-eQTL 9.84e-01 0.00268 0.132 0.089 Pro_T L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -462619 sc-eQTL 8.73e-01 0.0253 0.158 0.088 Treg L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -462813 sc-eQTL 1.35e-01 -0.228 0.152 0.088 Treg L2
ENSG00000134644 PUM1 -231822 sc-eQTL 2.30e-01 0.147 0.122 0.088 Treg L2
ENSG00000162511 LAPTM5 76395 sc-eQTL 5.24e-01 0.0894 0.14 0.088 Treg L2
ENSG00000162517 PEF1 -810727 sc-eQTL 5.42e-01 -0.0924 0.151 0.088 Treg L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 115665 sc-eQTL 1.04e-01 -0.232 0.142 0.088 Treg L2
ENSG00000287510 AL137857.1 102476 sc-eQTL 9.68e-01 -0.00573 0.143 0.088 Treg L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -462619 sc-eQTL 5.77e-01 -0.0879 0.157 0.095 cDC L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -462813 sc-eQTL 8.39e-01 -0.0347 0.17 0.095 cDC L2
ENSG00000134644 PUM1 -231822 sc-eQTL 8.21e-01 -0.0331 0.146 0.095 cDC L2
ENSG00000162511 LAPTM5 76395 sc-eQTL 5.00e-01 0.0693 0.103 0.095 cDC L2
ENSG00000162517 PEF1 -810727 sc-eQTL 2.37e-01 -0.176 0.148 0.095 cDC L2
ENSG00000168528 SERINC2 -575396 sc-eQTL 3.37e-01 0.126 0.131 0.095 cDC L2
ENSG00000284543 LINC01226 -672057 sc-eQTL 5.31e-01 -0.0813 0.129 0.095 cDC L2
ENSG00000287510 AL137857.1 102476 sc-eQTL 1.41e-01 -0.205 0.139 0.095 cDC L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -462619 sc-eQTL 8.33e-02 0.223 0.128 0.088 cMono_IL1B L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -462813 sc-eQTL 5.83e-01 -0.0793 0.144 0.088 cMono_IL1B L2
ENSG00000134644 PUM1 -231822 sc-eQTL 9.91e-01 -0.00107 0.0976 0.088 cMono_IL1B L2
ENSG00000162511 LAPTM5 76395 sc-eQTL 7.04e-01 -0.0325 0.0856 0.088 cMono_IL1B L2
ENSG00000162512 SDC3 -74589 sc-eQTL 9.10e-01 -0.0183 0.161 0.088 cMono_IL1B L2
ENSG00000162517 PEF1 -810727 sc-eQTL 3.96e-02 0.27 0.13 0.088 cMono_IL1B L2
ENSG00000168528 SERINC2 -575396 sc-eQTL 5.14e-01 0.107 0.163 0.088 cMono_IL1B L2
ENSG00000284543 LINC01226 -672057 sc-eQTL 9.72e-01 -0.00503 0.144 0.088 cMono_IL1B L2
ENSG00000287510 AL137857.1 102476 sc-eQTL 6.60e-01 0.0594 0.135 0.088 cMono_IL1B L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -462619 sc-eQTL 6.56e-01 0.0606 0.136 0.088 cMono_S100A L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -462813 sc-eQTL 6.40e-01 -0.0754 0.161 0.088 cMono_S100A L2
ENSG00000134644 PUM1 -231822 sc-eQTL 1.91e-01 0.152 0.116 0.088 cMono_S100A L2
ENSG00000162511 LAPTM5 76395 sc-eQTL 4.96e-01 0.0609 0.0892 0.088 cMono_S100A L2
ENSG00000162512 SDC3 -74589 sc-eQTL 4.74e-01 -0.111 0.154 0.088 cMono_S100A L2
ENSG00000162517 PEF1 -810727 sc-eQTL 1.72e-01 0.19 0.139 0.088 cMono_S100A L2
ENSG00000168528 SERINC2 -575396 sc-eQTL 5.25e-01 0.104 0.163 0.088 cMono_S100A L2
ENSG00000284543 LINC01226 -672057 sc-eQTL 6.10e-01 -0.0677 0.133 0.088 cMono_S100A L2
ENSG00000287510 AL137857.1 102476 sc-eQTL 9.93e-02 0.219 0.132 0.088 cMono_S100A L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -462619 sc-eQTL 6.22e-01 0.0963 0.195 0.085 gdT L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -462813 sc-eQTL 9.53e-01 0.00988 0.168 0.085 gdT L2
ENSG00000134644 PUM1 -231822 sc-eQTL 2.59e-01 0.195 0.172 0.085 gdT L2
ENSG00000162511 LAPTM5 76395 sc-eQTL 7.20e-02 0.337 0.186 0.085 gdT L2
ENSG00000162517 PEF1 -810727 sc-eQTL 4.74e-01 -0.123 0.171 0.085 gdT L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 115665 sc-eQTL 3.54e-01 0.161 0.173 0.085 gdT L2
ENSG00000287510 AL137857.1 102476 sc-eQTL 9.05e-01 0.02 0.168 0.085 gdT L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -462619 sc-eQTL 5.90e-01 0.0805 0.149 0.087 intMono L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -462813 sc-eQTL 5.95e-01 -0.0854 0.16 0.087 intMono L2
ENSG00000134644 PUM1 -231822 sc-eQTL 8.78e-01 -0.0209 0.136 0.087 intMono L2
ENSG00000162511 LAPTM5 76395 sc-eQTL 1.05e-01 -0.173 0.106 0.087 intMono L2
ENSG00000162512 SDC3 -74589 sc-eQTL 6.44e-02 -0.27 0.145 0.087 intMono L2
ENSG00000162517 PEF1 -810727 sc-eQTL 8.92e-01 0.021 0.154 0.087 intMono L2
ENSG00000168528 SERINC2 -575396 sc-eQTL 6.11e-01 0.0779 0.153 0.087 intMono L2
ENSG00000284543 LINC01226 -672057 sc-eQTL 4.72e-01 0.105 0.145 0.087 intMono L2
ENSG00000287510 AL137857.1 102476 sc-eQTL 2.43e-01 -0.17 0.145 0.087 intMono L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -462619 sc-eQTL 8.47e-01 0.0271 0.141 0.09 ncMono L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -462813 sc-eQTL 1.17e-01 -0.234 0.149 0.09 ncMono L2
ENSG00000134644 PUM1 -231822 sc-eQTL 2.20e-01 0.15 0.122 0.09 ncMono L2
ENSG00000162511 LAPTM5 76395 sc-eQTL 3.54e-01 -0.103 0.111 0.09 ncMono L2
ENSG00000162512 SDC3 -74589 sc-eQTL 8.65e-01 -0.0212 0.125 0.09 ncMono L2
ENSG00000162517 PEF1 -810727 sc-eQTL 4.15e-01 -0.117 0.143 0.09 ncMono L2
ENSG00000168528 SERINC2 -575396 sc-eQTL 2.52e-01 -0.156 0.136 0.09 ncMono L2
ENSG00000284543 LINC01226 -672057 sc-eQTL 6.63e-01 0.0593 0.136 0.09 ncMono L2
ENSG00000287510 AL137857.1 102476 sc-eQTL 2.78e-01 0.153 0.141 0.09 ncMono L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -462619 sc-eQTL 6.61e-01 -0.0717 0.163 0.088 pDC L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -462813 sc-eQTL 6.92e-01 -0.0709 0.179 0.088 pDC L2
ENSG00000134644 PUM1 -231822 sc-eQTL 3.03e-01 -0.153 0.148 0.088 pDC L2
ENSG00000162511 LAPTM5 76395 sc-eQTL 3.55e-01 0.128 0.138 0.088 pDC L2
ENSG00000162517 PEF1 -810727 sc-eQTL 2.98e-01 -0.186 0.178 0.088 pDC L2
ENSG00000168528 SERINC2 -575396 sc-eQTL 4.46e-01 -0.128 0.167 0.088 pDC L2
ENSG00000284543 LINC01226 -672057 sc-eQTL 2.16e-01 -0.161 0.129 0.088 pDC L2
ENSG00000287510 AL137857.1 102476 sc-eQTL 7.01e-01 -0.0587 0.153 0.088 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000060688 SNRNP40 -462619 sc-eQTL 4.18e-01 -0.132 0.162 0.088 B_Memory LOneK1K
ENSG00000121766 ZCCHC17 -462813 sc-eQTL 5.82e-01 0.0745 0.135 0.088 B_Memory LOneK1K
ENSG00000134644 PUM1 -231822 sc-eQTL 9.61e-01 -0.00583 0.12 0.088 B_Memory LOneK1K
ENSG00000162510 MATN1 110584 sc-eQTL 6.24e-01 0.0669 0.136 0.088 B_Memory LOneK1K
ENSG00000162511 LAPTM5 76395 sc-eQTL 7.37e-02 0.153 0.0851 0.088 B_Memory LOneK1K
ENSG00000162517 PEF1 -810727 sc-eQTL 2.51e-01 0.163 0.142 0.088 B_Memory LOneK1K
ENSG00000186056 MATN1-AS1 115665 sc-eQTL 4.61e-01 0.0837 0.113 0.088 B_Memory LOneK1K
ENSG00000287510 AL137857.1 102476 sc-eQTL 7.18e-02 0.222 0.123 0.088 B_Memory LOneK1K
ENSG00000060688 SNRNP40 -462619 sc-eQTL 4.99e-01 0.0984 0.145 0.088 B_Naive LOneK1K
ENSG00000121766 ZCCHC17 -462813 sc-eQTL 7.98e-01 -0.0295 0.115 0.088 B_Naive LOneK1K
ENSG00000134644 PUM1 -231822 sc-eQTL 8.15e-01 0.0255 0.109 0.088 B_Naive LOneK1K
ENSG00000162510 MATN1 110584 sc-eQTL 7.06e-01 -0.0396 0.105 0.088 B_Naive LOneK1K
ENSG00000162511 LAPTM5 76395 sc-eQTL 4.77e-01 0.0526 0.0737 0.088 B_Naive LOneK1K
ENSG00000162517 PEF1 -810727 sc-eQTL 3.67e-01 -0.122 0.135 0.088 B_Naive LOneK1K
ENSG00000186056 MATN1-AS1 115665 sc-eQTL 9.00e-01 -0.012 0.0953 0.088 B_Naive LOneK1K
ENSG00000287510 AL137857.1 102476 sc-eQTL 9.23e-01 0.0109 0.113 0.088 B_Naive LOneK1K
ENSG00000060688 SNRNP40 -462619 sc-eQTL 2.12e-01 0.154 0.123 0.088 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000121766 ZCCHC17 -462813 sc-eQTL 5.65e-01 -0.0806 0.14 0.088 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000134644 PUM1 -231822 sc-eQTL 5.06e-01 0.0594 0.0891 0.088 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000162511 LAPTM5 76395 sc-eQTL 9.26e-01 0.00728 0.0784 0.088 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000162512 SDC3 -74589 sc-eQTL 9.50e-01 -0.0101 0.16 0.088 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000162517 PEF1 -810727 sc-eQTL 1.14e-02 0.283 0.111 0.088 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000168528 SERINC2 -575396 sc-eQTL 5.95e-01 0.0876 0.164 0.088 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000284543 LINC01226 -672057 sc-eQTL 7.09e-01 -0.0504 0.135 0.088 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000287510 AL137857.1 102476 sc-eQTL 2.69e-01 0.14 0.126 0.088 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000060688 SNRNP40 -462619 sc-eQTL 6.97e-01 0.0526 0.135 0.088 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000121766 ZCCHC17 -462813 sc-eQTL 6.38e-02 -0.273 0.146 0.088 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000134644 PUM1 -231822 sc-eQTL 3.40e-01 0.115 0.121 0.088 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000162511 LAPTM5 76395 sc-eQTL 2.67e-01 -0.107 0.0964 0.088 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000162512 SDC3 -74589 sc-eQTL 6.71e-01 -0.0601 0.141 0.088 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000162517 PEF1 -810727 sc-eQTL 2.20e-01 -0.157 0.128 0.088 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000168528 SERINC2 -575396 sc-eQTL 9.28e-01 -0.0132 0.146 0.088 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000284543 LINC01226 -672057 sc-eQTL 6.35e-01 0.066 0.139 0.088 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000287510 AL137857.1 102476 sc-eQTL 9.87e-01 -0.0022 0.139 0.088 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000060688 SNRNP40 -462619 sc-eQTL 1.44e-01 0.218 0.149 0.088 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000121753 ADGRB2 -930724 sc-eQTL 5.79e-01 -0.0708 0.127 0.088 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000121766 ZCCHC17 -462813 sc-eQTL 7.99e-01 0.026 0.102 0.088 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000134644 PUM1 -231822 sc-eQTL 6.78e-01 0.0465 0.112 0.088 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000162511 LAPTM5 76395 sc-eQTL 7.01e-01 -0.0481 0.125 0.088 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000162517 PEF1 -810727 sc-eQTL 2.38e-01 0.112 0.0946 0.088 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000186056 MATN1-AS1 115665 sc-eQTL 5.70e-01 0.0819 0.144 0.088 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000287510 AL137857.1 102476 sc-eQTL 8.05e-01 -0.0307 0.124 0.088 NK_CD56dim LOneK1K

Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF
ENSG00000134668 SPOCD1 -981882 eQTL 0.00319 -0.138 0.0468 0.0 0.00294 0.078
ENSG00000162510 MATN1 110584 eQTL 0.0411 -0.0759 0.0371 0.0 0.0 0.078

Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina
ENSG00000134668 SPOCD1 -981882 2.6e-07 1.08e-07 3.41e-08 1.7e-07 1.03e-07 9.14e-08 1.36e-07 5.29e-08 1.37e-07 3.99e-08 1.61e-07 7.6e-08 1.21e-07 6.21e-08 4.77e-08 7.87e-08 5.15e-08 1.06e-07 5.12e-08 2.93e-08 1.03e-07 1.31e-07 1.31e-07 5.23e-08 1.33e-07 1.03e-07 1.11e-07 8.49e-08 1.04e-07 1.1e-07 9.75e-08 3.29e-08 2.6e-08 8e-08 9.69e-08 4.23e-08 3.84e-08 8e-08 8.44e-08 3.87e-08 2.6e-08 1.42e-07 4.51e-08 0.0 1.15e-07 1.8e-08 1.5e-07 4.96e-09 4.72e-08