logo

Genes within 1Mb (chr1:30828283:CTG:C):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD

Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000060688 SNRNP40 -468505 sc-eQTL 7.63e-01 0.0416 0.138 0.088 B L1
ENSG00000121766 ZCCHC17 -468699 sc-eQTL 8.65e-01 -0.0188 0.11 0.088 B L1
ENSG00000134644 PUM1 -237708 sc-eQTL 2.73e-01 0.101 0.0923 0.088 B L1
ENSG00000162510 MATN1 104698 sc-eQTL 9.66e-01 -0.00415 0.0973 0.088 B L1
ENSG00000162511 LAPTM5 70509 sc-eQTL 1.20e-01 0.118 0.0758 0.088 B L1
ENSG00000162517 PEF1 -816613 sc-eQTL 2.88e-01 0.122 0.115 0.088 B L1
ENSG00000186056 MATN1-AS1 109779 sc-eQTL 5.60e-01 -0.0521 0.0892 0.088 B L1
ENSG00000287510 AL137857.1 96590 sc-eQTL 8.32e-01 0.0225 0.106 0.088 B L1
ENSG00000060688 SNRNP40 -468505 sc-eQTL 9.86e-01 0.00202 0.118 0.088 CD4T L1
ENSG00000121766 ZCCHC17 -468699 sc-eQTL 7.78e-01 -0.026 0.092 0.088 CD4T L1
ENSG00000134644 PUM1 -237708 sc-eQTL 8.52e-02 0.141 0.0814 0.088 CD4T L1
ENSG00000162511 LAPTM5 70509 sc-eQTL 5.95e-02 0.171 0.0901 0.088 CD4T L1
ENSG00000162517 PEF1 -816613 sc-eQTL 5.21e-01 0.0611 0.0949 0.088 CD4T L1
ENSG00000186056 MATN1-AS1 109779 sc-eQTL 1.57e-01 -0.115 0.0809 0.088 CD4T L1
ENSG00000287510 AL137857.1 96590 sc-eQTL 4.06e-01 0.0808 0.0972 0.088 CD4T L1
ENSG00000060688 SNRNP40 -468505 sc-eQTL 3.28e-01 0.152 0.155 0.088 CD8T L1
ENSG00000121766 ZCCHC17 -468699 sc-eQTL 2.47e-01 -0.119 0.103 0.088 CD8T L1
ENSG00000134644 PUM1 -237708 sc-eQTL 6.99e-01 0.0352 0.0909 0.088 CD8T L1
ENSG00000162511 LAPTM5 70509 sc-eQTL 2.82e-01 0.095 0.088 0.088 CD8T L1
ENSG00000162517 PEF1 -816613 sc-eQTL 9.82e-01 0.00252 0.109 0.088 CD8T L1
ENSG00000186056 MATN1-AS1 109779 sc-eQTL 3.63e-01 0.0942 0.103 0.088 CD8T L1
ENSG00000287510 AL137857.1 96590 sc-eQTL 5.42e-01 0.0794 0.13 0.088 CD8T L1
ENSG00000060688 SNRNP40 -468505 sc-eQTL 7.32e-01 0.0464 0.135 0.092 DC L1
ENSG00000121766 ZCCHC17 -468699 sc-eQTL 9.01e-01 -0.0199 0.16 0.092 DC L1
ENSG00000134644 PUM1 -237708 sc-eQTL 7.51e-01 0.0399 0.125 0.092 DC L1
ENSG00000162511 LAPTM5 70509 sc-eQTL 9.71e-01 -0.00325 0.0896 0.092 DC L1
ENSG00000162517 PEF1 -816613 sc-eQTL 2.55e-01 -0.165 0.145 0.092 DC L1
ENSG00000168528 SERINC2 -581282 sc-eQTL 3.26e-01 -0.145 0.147 0.092 DC L1
ENSG00000284543 LINC01226 -677943 sc-eQTL 3.58e-02 -0.205 0.0968 0.092 DC L1
ENSG00000287510 AL137857.1 96590 sc-eQTL 1.07e-01 -0.228 0.141 0.092 DC L1
ENSG00000060688 SNRNP40 -468505 sc-eQTL 1.67e-01 0.148 0.107 0.088 Mono L1
ENSG00000121766 ZCCHC17 -468699 sc-eQTL 3.73e-01 -0.119 0.133 0.088 Mono L1
ENSG00000134644 PUM1 -237708 sc-eQTL 4.02e-01 0.0716 0.0852 0.088 Mono L1
ENSG00000162511 LAPTM5 70509 sc-eQTL 9.57e-01 0.00419 0.0785 0.088 Mono L1
ENSG00000162512 SDC3 -80475 sc-eQTL 5.08e-01 -0.1 0.151 0.088 Mono L1
ENSG00000162517 PEF1 -816613 sc-eQTL 4.96e-02 0.207 0.105 0.088 Mono L1
ENSG00000168528 SERINC2 -581282 sc-eQTL 7.66e-01 0.0482 0.162 0.088 Mono L1
ENSG00000284543 LINC01226 -677943 sc-eQTL 7.98e-01 0.0366 0.143 0.088 Mono L1
ENSG00000287510 AL137857.1 96590 sc-eQTL 3.18e-01 0.125 0.124 0.088 Mono L1
ENSG00000060688 SNRNP40 -468505 sc-eQTL 3.17e-01 0.149 0.148 0.088 NK L1
ENSG00000121753 ADGRB2 -936610 sc-eQTL 6.44e-01 -0.0593 0.128 0.088 NK L1
ENSG00000121766 ZCCHC17 -468699 sc-eQTL 5.86e-01 0.0554 0.102 0.088 NK L1
ENSG00000134644 PUM1 -237708 sc-eQTL 5.38e-01 0.0658 0.107 0.088 NK L1
ENSG00000162511 LAPTM5 70509 sc-eQTL 8.03e-01 -0.0307 0.123 0.088 NK L1
ENSG00000162517 PEF1 -816613 sc-eQTL 2.31e-01 0.107 0.0894 0.088 NK L1
ENSG00000186056 MATN1-AS1 109779 sc-eQTL 2.66e-01 0.153 0.138 0.088 NK L1
ENSG00000287510 AL137857.1 96590 sc-eQTL 8.98e-01 -0.0163 0.127 0.088 NK L1
ENSG00000060688 SNRNP40 -468505 sc-eQTL 2.78e-01 0.122 0.112 0.088 Other_T L1
ENSG00000121766 ZCCHC17 -468699 sc-eQTL 3.55e-01 -0.111 0.12 0.088 Other_T L1
ENSG00000134644 PUM1 -237708 sc-eQTL 4.73e-01 0.0778 0.108 0.088 Other_T L1
ENSG00000162511 LAPTM5 70509 sc-eQTL 5.47e-01 0.0536 0.0887 0.088 Other_T L1
ENSG00000162517 PEF1 -816613 sc-eQTL 2.22e-01 0.145 0.118 0.088 Other_T L1
ENSG00000186056 MATN1-AS1 109779 sc-eQTL 8.30e-01 -0.0313 0.145 0.088 Other_T L1
ENSG00000287510 AL137857.1 96590 sc-eQTL 7.35e-01 -0.0514 0.151 0.088 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000060688 SNRNP40 -468505 sc-eQTL 7.84e-01 0.0464 0.169 0.094 B_Activated L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -468699 sc-eQTL 6.39e-01 0.0801 0.17 0.094 B_Activated L2
ENSG00000134644 PUM1 -237708 sc-eQTL 7.98e-01 0.0407 0.158 0.094 B_Activated L2
ENSG00000162510 MATN1 104698 sc-eQTL 3.18e-01 -0.138 0.138 0.094 B_Activated L2
ENSG00000162511 LAPTM5 70509 sc-eQTL 2.23e-01 -0.118 0.0962 0.094 B_Activated L2
ENSG00000162517 PEF1 -816613 sc-eQTL 8.34e-01 0.0346 0.164 0.094 B_Activated L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 109779 sc-eQTL 9.25e-01 0.0148 0.156 0.094 B_Activated L2
ENSG00000287510 AL137857.1 96590 sc-eQTL 9.48e-01 -0.00899 0.138 0.094 B_Activated L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -468505 sc-eQTL 6.09e-01 -0.088 0.172 0.088 B_Intermediate L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -468699 sc-eQTL 7.74e-01 0.0411 0.143 0.088 B_Intermediate L2
ENSG00000134644 PUM1 -237708 sc-eQTL 9.60e-01 -0.00686 0.135 0.088 B_Intermediate L2
ENSG00000162510 MATN1 104698 sc-eQTL 7.02e-01 0.054 0.141 0.088 B_Intermediate L2
ENSG00000162511 LAPTM5 70509 sc-eQTL 1.19e-01 0.134 0.0859 0.088 B_Intermediate L2
ENSG00000162517 PEF1 -816613 sc-eQTL 3.04e-01 0.165 0.16 0.088 B_Intermediate L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 109779 sc-eQTL 6.99e-01 0.047 0.121 0.088 B_Intermediate L2
ENSG00000287510 AL137857.1 96590 sc-eQTL 1.54e-01 0.193 0.135 0.088 B_Intermediate L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -468505 sc-eQTL 2.19e-01 -0.202 0.164 0.088 B_Memory L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -468699 sc-eQTL 6.81e-01 0.0626 0.152 0.088 B_Memory L2
ENSG00000134644 PUM1 -237708 sc-eQTL 3.13e-01 -0.133 0.132 0.088 B_Memory L2
ENSG00000162510 MATN1 104698 sc-eQTL 8.00e-01 0.0321 0.126 0.088 B_Memory L2
ENSG00000162511 LAPTM5 70509 sc-eQTL 7.75e-01 0.0321 0.112 0.088 B_Memory L2
ENSG00000162517 PEF1 -816613 sc-eQTL 5.78e-01 0.0832 0.15 0.088 B_Memory L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 109779 sc-eQTL 9.04e-01 -0.0156 0.128 0.088 B_Memory L2
ENSG00000287510 AL137857.1 96590 sc-eQTL 3.02e-01 0.155 0.15 0.088 B_Memory L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -468505 sc-eQTL 6.64e-01 0.0646 0.149 0.088 B_Naive1 L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -468699 sc-eQTL 7.29e-01 0.0444 0.128 0.088 B_Naive1 L2
ENSG00000134644 PUM1 -237708 sc-eQTL 4.44e-01 -0.0867 0.113 0.088 B_Naive1 L2
ENSG00000162510 MATN1 104698 sc-eQTL 7.75e-01 -0.0329 0.115 0.088 B_Naive1 L2
ENSG00000162511 LAPTM5 70509 sc-eQTL 3.45e-01 0.0724 0.0766 0.088 B_Naive1 L2
ENSG00000162517 PEF1 -816613 sc-eQTL 3.89e-01 -0.117 0.135 0.088 B_Naive1 L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 109779 sc-eQTL 8.17e-01 0.0234 0.101 0.088 B_Naive1 L2
ENSG00000287510 AL137857.1 96590 sc-eQTL 7.95e-01 -0.0324 0.124 0.088 B_Naive1 L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -468505 sc-eQTL 5.99e-01 0.0844 0.16 0.088 B_Naive2 L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -468699 sc-eQTL 3.49e-01 -0.124 0.132 0.088 B_Naive2 L2
ENSG00000134644 PUM1 -237708 sc-eQTL 7.40e-01 0.0429 0.129 0.088 B_Naive2 L2
ENSG00000162510 MATN1 104698 sc-eQTL 9.47e-01 -0.00824 0.124 0.088 B_Naive2 L2
ENSG00000162511 LAPTM5 70509 sc-eQTL 4.01e-01 0.0708 0.0842 0.088 B_Naive2 L2
ENSG00000162517 PEF1 -816613 sc-eQTL 6.50e-01 -0.0697 0.153 0.088 B_Naive2 L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 109779 sc-eQTL 9.51e-01 0.00761 0.123 0.088 B_Naive2 L2
ENSG00000287510 AL137857.1 96590 sc-eQTL 6.53e-01 0.0597 0.133 0.088 B_Naive2 L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -468505 sc-eQTL 6.27e-01 0.0768 0.158 0.091 CD4_CTL L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -468699 sc-eQTL 4.86e-01 -0.108 0.155 0.091 CD4_CTL L2
ENSG00000134644 PUM1 -237708 sc-eQTL 6.06e-01 -0.0787 0.152 0.091 CD4_CTL L2
ENSG00000162511 LAPTM5 70509 sc-eQTL 9.96e-01 0.000746 0.136 0.091 CD4_CTL L2
ENSG00000162517 PEF1 -816613 sc-eQTL 3.98e-01 0.118 0.139 0.091 CD4_CTL L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 109779 sc-eQTL 4.55e-01 -0.111 0.148 0.091 CD4_CTL L2
ENSG00000287510 AL137857.1 96590 sc-eQTL 2.91e-01 0.138 0.131 0.091 CD4_CTL L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -468505 sc-eQTL 3.21e-01 0.122 0.123 0.088 CD4_Naive L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -468699 sc-eQTL 6.44e-01 -0.0506 0.109 0.088 CD4_Naive L2
ENSG00000134644 PUM1 -237708 sc-eQTL 1.24e-01 0.134 0.0868 0.088 CD4_Naive L2
ENSG00000162511 LAPTM5 70509 sc-eQTL 1.78e-02 0.22 0.0923 0.088 CD4_Naive L2
ENSG00000162517 PEF1 -816613 sc-eQTL 6.21e-01 0.0508 0.103 0.088 CD4_Naive L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 109779 sc-eQTL 1.25e-01 -0.145 0.0944 0.088 CD4_Naive L2
ENSG00000287510 AL137857.1 96590 sc-eQTL 4.97e-01 0.0741 0.109 0.088 CD4_Naive L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -468505 sc-eQTL 3.76e-01 -0.137 0.154 0.088 CD4_TCM L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -468699 sc-eQTL 4.00e-01 0.105 0.124 0.088 CD4_TCM L2
ENSG00000134644 PUM1 -237708 sc-eQTL 1.60e-01 0.154 0.11 0.088 CD4_TCM L2
ENSG00000162511 LAPTM5 70509 sc-eQTL 5.56e-01 0.0538 0.0912 0.088 CD4_TCM L2
ENSG00000162517 PEF1 -816613 sc-eQTL 8.74e-01 0.0194 0.122 0.088 CD4_TCM L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 109779 sc-eQTL 4.13e-01 -0.0948 0.116 0.088 CD4_TCM L2
ENSG00000287510 AL137857.1 96590 sc-eQTL 8.06e-01 -0.0317 0.129 0.088 CD4_TCM L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -468505 sc-eQTL 9.53e-01 -0.00903 0.153 0.088 CD4_TEM L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -468699 sc-eQTL 7.83e-01 -0.0404 0.146 0.088 CD4_TEM L2
ENSG00000134644 PUM1 -237708 sc-eQTL 4.69e-01 0.0882 0.122 0.088 CD4_TEM L2
ENSG00000162511 LAPTM5 70509 sc-eQTL 4.97e-01 0.0838 0.123 0.088 CD4_TEM L2
ENSG00000162517 PEF1 -816613 sc-eQTL 4.40e-01 0.107 0.138 0.088 CD4_TEM L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 109779 sc-eQTL 2.85e-01 0.154 0.144 0.088 CD4_TEM L2
ENSG00000287510 AL137857.1 96590 sc-eQTL 5.50e-01 0.085 0.142 0.088 CD4_TEM L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -468505 sc-eQTL 3.41e-01 0.161 0.169 0.088 CD8_CTL L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -468699 sc-eQTL 4.62e-01 -0.0955 0.13 0.088 CD8_CTL L2
ENSG00000134644 PUM1 -237708 sc-eQTL 7.54e-01 0.0395 0.126 0.088 CD8_CTL L2
ENSG00000162511 LAPTM5 70509 sc-eQTL 5.18e-01 -0.0904 0.139 0.088 CD8_CTL L2
ENSG00000162517 PEF1 -816613 sc-eQTL 9.47e-02 -0.203 0.121 0.088 CD8_CTL L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 109779 sc-eQTL 3.93e-01 0.125 0.147 0.088 CD8_CTL L2
ENSG00000287510 AL137857.1 96590 sc-eQTL 6.58e-01 0.0611 0.138 0.088 CD8_CTL L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -468505 sc-eQTL 3.17e-01 0.153 0.153 0.088 CD8_Naive L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -468699 sc-eQTL 6.49e-01 0.0602 0.132 0.088 CD8_Naive L2
ENSG00000134644 PUM1 -237708 sc-eQTL 3.90e-01 0.0914 0.106 0.088 CD8_Naive L2
ENSG00000162511 LAPTM5 70509 sc-eQTL 1.00e-02 0.261 0.1 0.088 CD8_Naive L2
ENSG00000162517 PEF1 -816613 sc-eQTL 4.89e-01 -0.098 0.142 0.088 CD8_Naive L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 109779 sc-eQTL 8.77e-01 0.0197 0.127 0.088 CD8_Naive L2
ENSG00000287510 AL137857.1 96590 sc-eQTL 9.56e-01 -0.00761 0.139 0.088 CD8_Naive L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -468505 sc-eQTL 7.96e-01 0.0441 0.171 0.086 CD8_TCM L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -468699 sc-eQTL 4.30e-01 -0.124 0.156 0.086 CD8_TCM L2
ENSG00000134644 PUM1 -237708 sc-eQTL 2.91e-01 -0.155 0.147 0.086 CD8_TCM L2
ENSG00000162511 LAPTM5 70509 sc-eQTL 5.23e-01 0.0982 0.154 0.086 CD8_TCM L2
ENSG00000162517 PEF1 -816613 sc-eQTL 4.77e-01 0.112 0.157 0.086 CD8_TCM L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 109779 sc-eQTL 1.62e-02 0.34 0.14 0.086 CD8_TCM L2
ENSG00000287510 AL137857.1 96590 sc-eQTL 5.33e-01 -0.0899 0.144 0.086 CD8_TCM L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -468505 sc-eQTL 4.49e-01 0.124 0.163 0.087 CD8_TEM L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -468699 sc-eQTL 9.28e-01 -0.0142 0.156 0.087 CD8_TEM L2
ENSG00000134644 PUM1 -237708 sc-eQTL 9.88e-01 0.00237 0.16 0.087 CD8_TEM L2
ENSG00000162511 LAPTM5 70509 sc-eQTL 5.40e-01 0.0921 0.15 0.087 CD8_TEM L2
ENSG00000162517 PEF1 -816613 sc-eQTL 2.86e-03 0.418 0.138 0.087 CD8_TEM L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 109779 sc-eQTL 2.90e-01 -0.165 0.156 0.087 CD8_TEM L2
ENSG00000287510 AL137857.1 96590 sc-eQTL 5.72e-01 -0.0799 0.141 0.087 CD8_TEM L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -468505 sc-eQTL 2.48e-01 0.187 0.161 0.089 MAIT L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -468699 sc-eQTL 9.47e-02 -0.239 0.142 0.089 MAIT L2
ENSG00000134644 PUM1 -237708 sc-eQTL 6.77e-01 0.0572 0.137 0.089 MAIT L2
ENSG00000162511 LAPTM5 70509 sc-eQTL 7.10e-01 -0.0483 0.129 0.089 MAIT L2
ENSG00000162517 PEF1 -816613 sc-eQTL 1.96e-02 0.33 0.14 0.089 MAIT L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 109779 sc-eQTL 2.87e-01 -0.154 0.144 0.089 MAIT L2
ENSG00000287510 AL137857.1 96590 sc-eQTL 2.78e-01 -0.161 0.148 0.089 MAIT L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -468505 sc-eQTL 9.76e-01 0.00505 0.165 0.089 NK_CD56bright L2
ENSG00000121753 ADGRB2 -936610 sc-eQTL 7.71e-01 0.0377 0.129 0.089 NK_CD56bright L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -468699 sc-eQTL 4.68e-01 0.101 0.139 0.089 NK_CD56bright L2
ENSG00000134644 PUM1 -237708 sc-eQTL 4.26e-01 0.117 0.146 0.089 NK_CD56bright L2
ENSG00000162511 LAPTM5 70509 sc-eQTL 7.31e-01 0.0498 0.144 0.089 NK_CD56bright L2
ENSG00000162517 PEF1 -816613 sc-eQTL 9.35e-01 0.0114 0.14 0.089 NK_CD56bright L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 109779 sc-eQTL 6.38e-02 0.268 0.144 0.089 NK_CD56bright L2
ENSG00000287510 AL137857.1 96590 sc-eQTL 9.28e-01 0.0129 0.143 0.089 NK_CD56bright L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -468505 sc-eQTL 9.48e-02 0.261 0.156 0.088 NK_CD56dim L2
ENSG00000121753 ADGRB2 -936610 sc-eQTL 5.95e-01 -0.0733 0.138 0.088 NK_CD56dim L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -468699 sc-eQTL 2.30e-01 -0.139 0.115 0.088 NK_CD56dim L2
ENSG00000134644 PUM1 -237708 sc-eQTL 5.77e-01 0.0663 0.119 0.088 NK_CD56dim L2
ENSG00000162511 LAPTM5 70509 sc-eQTL 8.94e-01 -0.0169 0.127 0.088 NK_CD56dim L2
ENSG00000162517 PEF1 -816613 sc-eQTL 4.75e-01 0.0806 0.113 0.088 NK_CD56dim L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 109779 sc-eQTL 7.24e-01 -0.0561 0.159 0.088 NK_CD56dim L2
ENSG00000287510 AL137857.1 96590 sc-eQTL 8.50e-01 -0.0249 0.131 0.088 NK_CD56dim L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -468505 sc-eQTL 3.65e-01 -0.149 0.164 0.089 NK_HLA L2
ENSG00000121753 ADGRB2 -936610 sc-eQTL 4.80e-01 0.0921 0.13 0.089 NK_HLA L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -468699 sc-eQTL 2.06e-01 0.185 0.146 0.089 NK_HLA L2
ENSG00000134644 PUM1 -237708 sc-eQTL 1.32e-01 0.215 0.142 0.089 NK_HLA L2
ENSG00000162511 LAPTM5 70509 sc-eQTL 9.98e-01 -0.000378 0.136 0.089 NK_HLA L2
ENSG00000162517 PEF1 -816613 sc-eQTL 4.31e-02 0.309 0.152 0.089 NK_HLA L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 109779 sc-eQTL 7.94e-02 -0.254 0.144 0.089 NK_HLA L2
ENSG00000287510 AL137857.1 96590 sc-eQTL 7.89e-01 -0.0375 0.14 0.089 NK_HLA L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -468505 sc-eQTL 8.28e-01 0.0334 0.154 0.088 NK_cytokine L2
ENSG00000121753 ADGRB2 -936610 sc-eQTL 9.39e-01 -0.0107 0.139 0.088 NK_cytokine L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -468699 sc-eQTL 5.24e-01 0.0763 0.12 0.088 NK_cytokine L2
ENSG00000134644 PUM1 -237708 sc-eQTL 9.54e-01 0.00756 0.13 0.088 NK_cytokine L2
ENSG00000162511 LAPTM5 70509 sc-eQTL 4.27e-01 -0.113 0.142 0.088 NK_cytokine L2
ENSG00000162517 PEF1 -816613 sc-eQTL 3.08e-01 0.124 0.121 0.088 NK_cytokine L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 109779 sc-eQTL 2.82e-02 0.33 0.149 0.088 NK_cytokine L2
ENSG00000287510 AL137857.1 96590 sc-eQTL 6.38e-01 0.0662 0.141 0.088 NK_cytokine L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -468505 sc-eQTL 4.60e-01 -0.135 0.182 0.104 PB L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -468699 sc-eQTL 2.39e-01 -0.249 0.21 0.104 PB L2
ENSG00000134644 PUM1 -237708 sc-eQTL 4.17e-01 0.149 0.183 0.104 PB L2
ENSG00000162510 MATN1 104698 sc-eQTL 7.91e-01 0.0454 0.171 0.104 PB L2
ENSG00000162511 LAPTM5 70509 sc-eQTL 4.07e-01 0.101 0.122 0.104 PB L2
ENSG00000162517 PEF1 -816613 sc-eQTL 2.16e-01 0.233 0.187 0.104 PB L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 109779 sc-eQTL 2.43e-01 -0.195 0.166 0.104 PB L2
ENSG00000287510 AL137857.1 96590 sc-eQTL 4.75e-01 -0.128 0.178 0.104 PB L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -468505 sc-eQTL 5.75e-01 -0.0679 0.121 0.089 Pro_T L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -468699 sc-eQTL 7.99e-01 -0.0391 0.153 0.089 Pro_T L2
ENSG00000134644 PUM1 -237708 sc-eQTL 7.36e-01 -0.0484 0.143 0.089 Pro_T L2
ENSG00000162511 LAPTM5 70509 sc-eQTL 5.25e-01 0.0653 0.103 0.089 Pro_T L2
ENSG00000162517 PEF1 -816613 sc-eQTL 4.89e-01 -0.104 0.151 0.089 Pro_T L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 109779 sc-eQTL 5.63e-01 -0.0831 0.143 0.089 Pro_T L2
ENSG00000287510 AL137857.1 96590 sc-eQTL 9.84e-01 0.00268 0.132 0.089 Pro_T L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -468505 sc-eQTL 8.73e-01 0.0253 0.158 0.088 Treg L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -468699 sc-eQTL 1.35e-01 -0.228 0.152 0.088 Treg L2
ENSG00000134644 PUM1 -237708 sc-eQTL 2.30e-01 0.147 0.122 0.088 Treg L2
ENSG00000162511 LAPTM5 70509 sc-eQTL 5.24e-01 0.0894 0.14 0.088 Treg L2
ENSG00000162517 PEF1 -816613 sc-eQTL 5.42e-01 -0.0924 0.151 0.088 Treg L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 109779 sc-eQTL 1.04e-01 -0.232 0.142 0.088 Treg L2
ENSG00000287510 AL137857.1 96590 sc-eQTL 9.68e-01 -0.00573 0.143 0.088 Treg L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -468505 sc-eQTL 5.77e-01 -0.0879 0.157 0.095 cDC L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -468699 sc-eQTL 8.39e-01 -0.0347 0.17 0.095 cDC L2
ENSG00000134644 PUM1 -237708 sc-eQTL 8.21e-01 -0.0331 0.146 0.095 cDC L2
ENSG00000162511 LAPTM5 70509 sc-eQTL 5.00e-01 0.0693 0.103 0.095 cDC L2
ENSG00000162517 PEF1 -816613 sc-eQTL 2.37e-01 -0.176 0.148 0.095 cDC L2
ENSG00000168528 SERINC2 -581282 sc-eQTL 3.37e-01 0.126 0.131 0.095 cDC L2
ENSG00000284543 LINC01226 -677943 sc-eQTL 5.31e-01 -0.0813 0.129 0.095 cDC L2
ENSG00000287510 AL137857.1 96590 sc-eQTL 1.41e-01 -0.205 0.139 0.095 cDC L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -468505 sc-eQTL 8.33e-02 0.223 0.128 0.088 cMono_IL1B L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -468699 sc-eQTL 5.83e-01 -0.0793 0.144 0.088 cMono_IL1B L2
ENSG00000134644 PUM1 -237708 sc-eQTL 9.91e-01 -0.00107 0.0976 0.088 cMono_IL1B L2
ENSG00000162511 LAPTM5 70509 sc-eQTL 7.04e-01 -0.0325 0.0856 0.088 cMono_IL1B L2
ENSG00000162512 SDC3 -80475 sc-eQTL 9.10e-01 -0.0183 0.161 0.088 cMono_IL1B L2
ENSG00000162517 PEF1 -816613 sc-eQTL 3.96e-02 0.27 0.13 0.088 cMono_IL1B L2
ENSG00000168528 SERINC2 -581282 sc-eQTL 5.14e-01 0.107 0.163 0.088 cMono_IL1B L2
ENSG00000284543 LINC01226 -677943 sc-eQTL 9.72e-01 -0.00503 0.144 0.088 cMono_IL1B L2
ENSG00000287510 AL137857.1 96590 sc-eQTL 6.60e-01 0.0594 0.135 0.088 cMono_IL1B L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -468505 sc-eQTL 6.56e-01 0.0606 0.136 0.088 cMono_S100A L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -468699 sc-eQTL 6.40e-01 -0.0754 0.161 0.088 cMono_S100A L2
ENSG00000134644 PUM1 -237708 sc-eQTL 1.91e-01 0.152 0.116 0.088 cMono_S100A L2
ENSG00000162511 LAPTM5 70509 sc-eQTL 4.96e-01 0.0609 0.0892 0.088 cMono_S100A L2
ENSG00000162512 SDC3 -80475 sc-eQTL 4.74e-01 -0.111 0.154 0.088 cMono_S100A L2
ENSG00000162517 PEF1 -816613 sc-eQTL 1.72e-01 0.19 0.139 0.088 cMono_S100A L2
ENSG00000168528 SERINC2 -581282 sc-eQTL 5.25e-01 0.104 0.163 0.088 cMono_S100A L2
ENSG00000284543 LINC01226 -677943 sc-eQTL 6.10e-01 -0.0677 0.133 0.088 cMono_S100A L2
ENSG00000287510 AL137857.1 96590 sc-eQTL 9.93e-02 0.219 0.132 0.088 cMono_S100A L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -468505 sc-eQTL 6.22e-01 0.0963 0.195 0.085 gdT L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -468699 sc-eQTL 9.53e-01 0.00988 0.168 0.085 gdT L2
ENSG00000134644 PUM1 -237708 sc-eQTL 2.59e-01 0.195 0.172 0.085 gdT L2
ENSG00000162511 LAPTM5 70509 sc-eQTL 7.20e-02 0.337 0.186 0.085 gdT L2
ENSG00000162517 PEF1 -816613 sc-eQTL 4.74e-01 -0.123 0.171 0.085 gdT L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 109779 sc-eQTL 3.54e-01 0.161 0.173 0.085 gdT L2
ENSG00000287510 AL137857.1 96590 sc-eQTL 9.05e-01 0.02 0.168 0.085 gdT L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -468505 sc-eQTL 5.90e-01 0.0805 0.149 0.087 intMono L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -468699 sc-eQTL 5.95e-01 -0.0854 0.16 0.087 intMono L2
ENSG00000134644 PUM1 -237708 sc-eQTL 8.78e-01 -0.0209 0.136 0.087 intMono L2
ENSG00000162511 LAPTM5 70509 sc-eQTL 1.05e-01 -0.173 0.106 0.087 intMono L2
ENSG00000162512 SDC3 -80475 sc-eQTL 6.44e-02 -0.27 0.145 0.087 intMono L2
ENSG00000162517 PEF1 -816613 sc-eQTL 8.92e-01 0.021 0.154 0.087 intMono L2
ENSG00000168528 SERINC2 -581282 sc-eQTL 6.11e-01 0.0779 0.153 0.087 intMono L2
ENSG00000284543 LINC01226 -677943 sc-eQTL 4.72e-01 0.105 0.145 0.087 intMono L2
ENSG00000287510 AL137857.1 96590 sc-eQTL 2.43e-01 -0.17 0.145 0.087 intMono L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -468505 sc-eQTL 8.47e-01 0.0271 0.141 0.09 ncMono L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -468699 sc-eQTL 1.17e-01 -0.234 0.149 0.09 ncMono L2
ENSG00000134644 PUM1 -237708 sc-eQTL 2.20e-01 0.15 0.122 0.09 ncMono L2
ENSG00000162511 LAPTM5 70509 sc-eQTL 3.54e-01 -0.103 0.111 0.09 ncMono L2
ENSG00000162512 SDC3 -80475 sc-eQTL 8.65e-01 -0.0212 0.125 0.09 ncMono L2
ENSG00000162517 PEF1 -816613 sc-eQTL 4.15e-01 -0.117 0.143 0.09 ncMono L2
ENSG00000168528 SERINC2 -581282 sc-eQTL 2.52e-01 -0.156 0.136 0.09 ncMono L2
ENSG00000284543 LINC01226 -677943 sc-eQTL 6.63e-01 0.0593 0.136 0.09 ncMono L2
ENSG00000287510 AL137857.1 96590 sc-eQTL 2.78e-01 0.153 0.141 0.09 ncMono L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -468505 sc-eQTL 6.61e-01 -0.0717 0.163 0.088 pDC L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -468699 sc-eQTL 6.92e-01 -0.0709 0.179 0.088 pDC L2
ENSG00000134644 PUM1 -237708 sc-eQTL 3.03e-01 -0.153 0.148 0.088 pDC L2
ENSG00000162511 LAPTM5 70509 sc-eQTL 3.55e-01 0.128 0.138 0.088 pDC L2
ENSG00000162517 PEF1 -816613 sc-eQTL 2.98e-01 -0.186 0.178 0.088 pDC L2
ENSG00000168528 SERINC2 -581282 sc-eQTL 4.46e-01 -0.128 0.167 0.088 pDC L2
ENSG00000284543 LINC01226 -677943 sc-eQTL 2.16e-01 -0.161 0.129 0.088 pDC L2
ENSG00000287510 AL137857.1 96590 sc-eQTL 7.01e-01 -0.0587 0.153 0.088 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000060688 SNRNP40 -468505 sc-eQTL 4.18e-01 -0.132 0.162 0.088 B_Memory LOneK1K
ENSG00000121766 ZCCHC17 -468699 sc-eQTL 5.82e-01 0.0745 0.135 0.088 B_Memory LOneK1K
ENSG00000134644 PUM1 -237708 sc-eQTL 9.61e-01 -0.00583 0.12 0.088 B_Memory LOneK1K
ENSG00000162510 MATN1 104698 sc-eQTL 6.24e-01 0.0669 0.136 0.088 B_Memory LOneK1K
ENSG00000162511 LAPTM5 70509 sc-eQTL 7.37e-02 0.153 0.0851 0.088 B_Memory LOneK1K
ENSG00000162517 PEF1 -816613 sc-eQTL 2.51e-01 0.163 0.142 0.088 B_Memory LOneK1K
ENSG00000186056 MATN1-AS1 109779 sc-eQTL 4.61e-01 0.0837 0.113 0.088 B_Memory LOneK1K
ENSG00000287510 AL137857.1 96590 sc-eQTL 7.18e-02 0.222 0.123 0.088 B_Memory LOneK1K
ENSG00000060688 SNRNP40 -468505 sc-eQTL 4.99e-01 0.0984 0.145 0.088 B_Naive LOneK1K
ENSG00000121766 ZCCHC17 -468699 sc-eQTL 7.98e-01 -0.0295 0.115 0.088 B_Naive LOneK1K
ENSG00000134644 PUM1 -237708 sc-eQTL 8.15e-01 0.0255 0.109 0.088 B_Naive LOneK1K
ENSG00000162510 MATN1 104698 sc-eQTL 7.06e-01 -0.0396 0.105 0.088 B_Naive LOneK1K
ENSG00000162511 LAPTM5 70509 sc-eQTL 4.77e-01 0.0526 0.0737 0.088 B_Naive LOneK1K
ENSG00000162517 PEF1 -816613 sc-eQTL 3.67e-01 -0.122 0.135 0.088 B_Naive LOneK1K
ENSG00000186056 MATN1-AS1 109779 sc-eQTL 9.00e-01 -0.012 0.0953 0.088 B_Naive LOneK1K
ENSG00000287510 AL137857.1 96590 sc-eQTL 9.23e-01 0.0109 0.113 0.088 B_Naive LOneK1K
ENSG00000060688 SNRNP40 -468505 sc-eQTL 2.12e-01 0.154 0.123 0.088 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000121766 ZCCHC17 -468699 sc-eQTL 5.65e-01 -0.0806 0.14 0.088 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000134644 PUM1 -237708 sc-eQTL 5.06e-01 0.0594 0.0891 0.088 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000162511 LAPTM5 70509 sc-eQTL 9.26e-01 0.00728 0.0784 0.088 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000162512 SDC3 -80475 sc-eQTL 9.50e-01 -0.0101 0.16 0.088 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000162517 PEF1 -816613 sc-eQTL 1.14e-02 0.283 0.111 0.088 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000168528 SERINC2 -581282 sc-eQTL 5.95e-01 0.0876 0.164 0.088 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000284543 LINC01226 -677943 sc-eQTL 7.09e-01 -0.0504 0.135 0.088 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000287510 AL137857.1 96590 sc-eQTL 2.69e-01 0.14 0.126 0.088 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000060688 SNRNP40 -468505 sc-eQTL 6.97e-01 0.0526 0.135 0.088 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000121766 ZCCHC17 -468699 sc-eQTL 6.38e-02 -0.273 0.146 0.088 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000134644 PUM1 -237708 sc-eQTL 3.40e-01 0.115 0.121 0.088 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000162511 LAPTM5 70509 sc-eQTL 2.67e-01 -0.107 0.0964 0.088 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000162512 SDC3 -80475 sc-eQTL 6.71e-01 -0.0601 0.141 0.088 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000162517 PEF1 -816613 sc-eQTL 2.20e-01 -0.157 0.128 0.088 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000168528 SERINC2 -581282 sc-eQTL 9.28e-01 -0.0132 0.146 0.088 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000284543 LINC01226 -677943 sc-eQTL 6.35e-01 0.066 0.139 0.088 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000287510 AL137857.1 96590 sc-eQTL 9.87e-01 -0.0022 0.139 0.088 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000060688 SNRNP40 -468505 sc-eQTL 1.44e-01 0.218 0.149 0.088 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000121753 ADGRB2 -936610 sc-eQTL 5.79e-01 -0.0708 0.127 0.088 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000121766 ZCCHC17 -468699 sc-eQTL 7.99e-01 0.026 0.102 0.088 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000134644 PUM1 -237708 sc-eQTL 6.78e-01 0.0465 0.112 0.088 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000162511 LAPTM5 70509 sc-eQTL 7.01e-01 -0.0481 0.125 0.088 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000162517 PEF1 -816613 sc-eQTL 2.38e-01 0.112 0.0946 0.088 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000186056 MATN1-AS1 109779 sc-eQTL 5.70e-01 0.0819 0.144 0.088 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000287510 AL137857.1 96590 sc-eQTL 8.05e-01 -0.0307 0.124 0.088 NK_CD56dim LOneK1K

Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF
ENSG00000134668 SPOCD1 -987768 eQTL 0.003 -0.141 0.0475 0.0 0.00316 0.078
ENSG00000162510 MATN1 104698 eQTL 0.0456 -0.0755 0.0377 0.0 0.0 0.078

Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina
ENSG00000134668 SPOCD1 -987768 7.6e-06 9.95e-06 2.41e-06 7.6e-06 1.6e-06 4.1e-06 9.71e-06 1.29e-06 7.13e-06 4.05e-06 9.18e-06 3.63e-06 1.16e-05 3.83e-06 2.6e-06 5.77e-06 5.45e-06 6.85e-06 2.2e-06 2.23e-06 4.96e-06 7.71e-06 7.37e-06 1.96e-06 1.24e-05 3.77e-06 2.69e-06 3.37e-06 8.97e-06 7.22e-06 4.49e-06 4.15e-07 9.22e-07 2.98e-06 3.7e-06 2.04e-06 1.71e-06 1.84e-06 1.41e-06 5.77e-07 2.92e-07 1.3e-05 8.89e-07 1.82e-07 3.58e-07 1.83e-06 1.25e-06 6.29e-07 3.26e-07