logo

Genes within 1Mb (chr1:30827869:C:T):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD

Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000060688 SNRNP40 -468919 sc-eQTL 6.75e-01 -0.054 0.129 0.092 B L1
ENSG00000121766 ZCCHC17 -469113 sc-eQTL 9.77e-01 0.00299 0.103 0.092 B L1
ENSG00000134644 PUM1 -238122 sc-eQTL 9.83e-01 -0.0019 0.0866 0.092 B L1
ENSG00000162510 MATN1 104284 sc-eQTL 9.96e-01 -0.000485 0.091 0.092 B L1
ENSG00000162511 LAPTM5 70095 sc-eQTL 5.04e-01 -0.0476 0.0712 0.092 B L1
ENSG00000162517 PEF1 -817027 sc-eQTL 3.44e-01 0.102 0.107 0.092 B L1
ENSG00000186056 MATN1-AS1 109365 sc-eQTL 5.48e-01 0.0503 0.0834 0.092 B L1
ENSG00000287510 AL137857.1 96176 sc-eQTL 3.66e-01 0.0894 0.0987 0.092 B L1
ENSG00000060688 SNRNP40 -468919 sc-eQTL 2.07e-01 -0.14 0.111 0.092 CD4T L1
ENSG00000121766 ZCCHC17 -469113 sc-eQTL 6.09e-01 -0.0445 0.0869 0.092 CD4T L1
ENSG00000134644 PUM1 -238122 sc-eQTL 6.66e-01 -0.0334 0.0773 0.092 CD4T L1
ENSG00000162511 LAPTM5 70095 sc-eQTL 2.48e-01 0.099 0.0855 0.092 CD4T L1
ENSG00000162517 PEF1 -817027 sc-eQTL 3.98e-01 -0.0759 0.0895 0.092 CD4T L1
ENSG00000186056 MATN1-AS1 109365 sc-eQTL 6.52e-01 0.0346 0.0767 0.092 CD4T L1
ENSG00000287510 AL137857.1 96176 sc-eQTL 8.41e-01 0.0185 0.0919 0.092 CD4T L1
ENSG00000060688 SNRNP40 -468919 sc-eQTL 3.72e-01 -0.13 0.145 0.092 CD8T L1
ENSG00000121766 ZCCHC17 -469113 sc-eQTL 2.31e-01 0.116 0.0965 0.092 CD8T L1
ENSG00000134644 PUM1 -238122 sc-eQTL 8.95e-01 0.0113 0.0852 0.092 CD8T L1
ENSG00000162511 LAPTM5 70095 sc-eQTL 7.88e-01 0.0223 0.0828 0.092 CD8T L1
ENSG00000162517 PEF1 -817027 sc-eQTL 8.60e-01 -0.0179 0.102 0.092 CD8T L1
ENSG00000186056 MATN1-AS1 109365 sc-eQTL 9.96e-01 0.00044 0.097 0.092 CD8T L1
ENSG00000287510 AL137857.1 96176 sc-eQTL 9.06e-01 -0.0144 0.122 0.092 CD8T L1
ENSG00000060688 SNRNP40 -468919 sc-eQTL 1.58e-01 0.184 0.13 0.095 DC L1
ENSG00000121766 ZCCHC17 -469113 sc-eQTL 2.26e-01 -0.187 0.154 0.095 DC L1
ENSG00000134644 PUM1 -238122 sc-eQTL 4.29e-01 -0.0956 0.121 0.095 DC L1
ENSG00000162511 LAPTM5 70095 sc-eQTL 7.52e-01 -0.0273 0.0863 0.095 DC L1
ENSG00000162517 PEF1 -817027 sc-eQTL 6.61e-01 -0.0615 0.14 0.095 DC L1
ENSG00000168528 SERINC2 -581696 sc-eQTL 4.53e-01 0.107 0.142 0.095 DC L1
ENSG00000284543 LINC01226 -678357 sc-eQTL 4.66e-02 -0.187 0.0934 0.095 DC L1
ENSG00000287510 AL137857.1 96176 sc-eQTL 2.09e-01 0.171 0.136 0.095 DC L1
ENSG00000060688 SNRNP40 -468919 sc-eQTL 8.72e-01 -0.0165 0.102 0.092 Mono L1
ENSG00000121766 ZCCHC17 -469113 sc-eQTL 8.09e-01 -0.0308 0.127 0.092 Mono L1
ENSG00000134644 PUM1 -238122 sc-eQTL 9.63e-01 -0.00378 0.0814 0.092 Mono L1
ENSG00000162511 LAPTM5 70095 sc-eQTL 9.04e-01 0.00909 0.0749 0.092 Mono L1
ENSG00000162512 SDC3 -80889 sc-eQTL 3.60e-02 0.3 0.142 0.092 Mono L1
ENSG00000162517 PEF1 -817027 sc-eQTL 1.77e-01 -0.136 0.101 0.092 Mono L1
ENSG00000168528 SERINC2 -581696 sc-eQTL 2.01e-01 0.197 0.154 0.092 Mono L1
ENSG00000284543 LINC01226 -678357 sc-eQTL 7.36e-01 -0.046 0.136 0.092 Mono L1
ENSG00000287510 AL137857.1 96176 sc-eQTL 3.91e-01 0.102 0.119 0.092 Mono L1
ENSG00000060688 SNRNP40 -468919 sc-eQTL 3.19e-01 0.141 0.141 0.092 NK L1
ENSG00000121753 ADGRB2 -937024 sc-eQTL 1.45e-01 0.177 0.121 0.092 NK L1
ENSG00000121766 ZCCHC17 -469113 sc-eQTL 8.54e-01 -0.0178 0.0966 0.092 NK L1
ENSG00000134644 PUM1 -238122 sc-eQTL 8.77e-01 -0.0157 0.101 0.092 NK L1
ENSG00000162511 LAPTM5 70095 sc-eQTL 8.91e-01 0.016 0.117 0.092 NK L1
ENSG00000162517 PEF1 -817027 sc-eQTL 4.62e-01 -0.0626 0.085 0.092 NK L1
ENSG00000186056 MATN1-AS1 109365 sc-eQTL 9.76e-02 0.217 0.13 0.092 NK L1
ENSG00000287510 AL137857.1 96176 sc-eQTL 9.54e-01 0.00704 0.121 0.092 NK L1
ENSG00000060688 SNRNP40 -468919 sc-eQTL 8.08e-01 0.0263 0.108 0.092 Other_T L1
ENSG00000121766 ZCCHC17 -469113 sc-eQTL 8.40e-01 0.0233 0.115 0.092 Other_T L1
ENSG00000134644 PUM1 -238122 sc-eQTL 3.06e-01 0.106 0.103 0.092 Other_T L1
ENSG00000162511 LAPTM5 70095 sc-eQTL 8.80e-02 0.145 0.0843 0.092 Other_T L1
ENSG00000162517 PEF1 -817027 sc-eQTL 9.78e-01 -0.00308 0.113 0.092 Other_T L1
ENSG00000186056 MATN1-AS1 109365 sc-eQTL 3.95e-01 0.118 0.139 0.092 Other_T L1
ENSG00000287510 AL137857.1 96176 sc-eQTL 6.63e-01 0.0632 0.145 0.092 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000060688 SNRNP40 -468919 sc-eQTL 7.69e-01 0.0467 0.159 0.097 B_Activated L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -469113 sc-eQTL 9.47e-01 -0.0106 0.16 0.097 B_Activated L2
ENSG00000134644 PUM1 -238122 sc-eQTL 3.09e-02 0.319 0.147 0.097 B_Activated L2
ENSG00000162510 MATN1 104284 sc-eQTL 5.91e-01 0.0699 0.13 0.097 B_Activated L2
ENSG00000162511 LAPTM5 70095 sc-eQTL 2.11e-02 0.208 0.0892 0.097 B_Activated L2
ENSG00000162517 PEF1 -817027 sc-eQTL 9.19e-01 0.0157 0.154 0.097 B_Activated L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 109365 sc-eQTL 3.26e-01 -0.144 0.146 0.097 B_Activated L2
ENSG00000287510 AL137857.1 96176 sc-eQTL 7.21e-01 0.0462 0.129 0.097 B_Activated L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -468919 sc-eQTL 5.62e-01 0.0909 0.156 0.092 B_Intermediate L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -469113 sc-eQTL 4.44e-01 0.1 0.13 0.092 B_Intermediate L2
ENSG00000134644 PUM1 -238122 sc-eQTL 3.64e-01 0.112 0.123 0.092 B_Intermediate L2
ENSG00000162510 MATN1 104284 sc-eQTL 7.92e-01 -0.0338 0.128 0.092 B_Intermediate L2
ENSG00000162511 LAPTM5 70095 sc-eQTL 4.80e-01 0.0555 0.0785 0.092 B_Intermediate L2
ENSG00000162517 PEF1 -817027 sc-eQTL 5.34e-01 -0.0909 0.146 0.092 B_Intermediate L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 109365 sc-eQTL 6.00e-01 0.0578 0.11 0.092 B_Intermediate L2
ENSG00000287510 AL137857.1 96176 sc-eQTL 6.22e-01 0.061 0.123 0.092 B_Intermediate L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -468919 sc-eQTL 5.08e-01 0.1 0.152 0.093 B_Memory L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -469113 sc-eQTL 7.75e-01 -0.0399 0.14 0.093 B_Memory L2
ENSG00000134644 PUM1 -238122 sc-eQTL 9.35e-01 0.00996 0.122 0.093 B_Memory L2
ENSG00000162510 MATN1 104284 sc-eQTL 9.73e-01 -0.00388 0.116 0.093 B_Memory L2
ENSG00000162511 LAPTM5 70095 sc-eQTL 2.21e-01 0.126 0.103 0.093 B_Memory L2
ENSG00000162517 PEF1 -817027 sc-eQTL 1.77e-01 -0.186 0.137 0.093 B_Memory L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 109365 sc-eQTL 8.11e-01 0.0283 0.118 0.093 B_Memory L2
ENSG00000287510 AL137857.1 96176 sc-eQTL 7.52e-01 -0.0437 0.138 0.093 B_Memory L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -468919 sc-eQTL 5.20e-01 -0.0897 0.139 0.092 B_Naive1 L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -469113 sc-eQTL 9.10e-01 0.0136 0.12 0.092 B_Naive1 L2
ENSG00000134644 PUM1 -238122 sc-eQTL 9.67e-01 0.00438 0.106 0.092 B_Naive1 L2
ENSG00000162510 MATN1 104284 sc-eQTL 8.34e-01 -0.0226 0.108 0.092 B_Naive1 L2
ENSG00000162511 LAPTM5 70095 sc-eQTL 2.76e-01 -0.0783 0.0718 0.092 B_Naive1 L2
ENSG00000162517 PEF1 -817027 sc-eQTL 9.95e-01 -0.000791 0.127 0.092 B_Naive1 L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 109365 sc-eQTL 7.34e-01 0.0321 0.0945 0.092 B_Naive1 L2
ENSG00000287510 AL137857.1 96176 sc-eQTL 5.94e-01 0.0623 0.117 0.092 B_Naive1 L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -468919 sc-eQTL 8.67e-01 0.0245 0.147 0.092 B_Naive2 L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -469113 sc-eQTL 7.84e-01 0.0333 0.121 0.092 B_Naive2 L2
ENSG00000134644 PUM1 -238122 sc-eQTL 3.10e-01 -0.12 0.118 0.092 B_Naive2 L2
ENSG00000162510 MATN1 104284 sc-eQTL 5.60e-01 -0.0664 0.114 0.092 B_Naive2 L2
ENSG00000162511 LAPTM5 70095 sc-eQTL 8.60e-01 -0.0136 0.0772 0.092 B_Naive2 L2
ENSG00000162517 PEF1 -817027 sc-eQTL 6.50e-02 0.258 0.139 0.092 B_Naive2 L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 109365 sc-eQTL 7.64e-01 -0.0337 0.112 0.092 B_Naive2 L2
ENSG00000287510 AL137857.1 96176 sc-eQTL 1.10e-01 0.194 0.121 0.092 B_Naive2 L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -468919 sc-eQTL 8.40e-01 0.0295 0.146 0.093 CD4_CTL L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -469113 sc-eQTL 8.85e-01 -0.0208 0.143 0.093 CD4_CTL L2
ENSG00000134644 PUM1 -238122 sc-eQTL 2.25e-01 0.17 0.14 0.093 CD4_CTL L2
ENSG00000162511 LAPTM5 70095 sc-eQTL 9.46e-01 -0.00846 0.125 0.093 CD4_CTL L2
ENSG00000162517 PEF1 -817027 sc-eQTL 1.89e-01 -0.169 0.128 0.093 CD4_CTL L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 109365 sc-eQTL 7.77e-01 -0.0389 0.137 0.093 CD4_CTL L2
ENSG00000287510 AL137857.1 96176 sc-eQTL 9.32e-01 0.0104 0.121 0.093 CD4_CTL L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -468919 sc-eQTL 8.91e-01 -0.016 0.117 0.092 CD4_Naive L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -469113 sc-eQTL 5.58e-01 -0.0605 0.103 0.092 CD4_Naive L2
ENSG00000134644 PUM1 -238122 sc-eQTL 5.26e-01 -0.0524 0.0824 0.092 CD4_Naive L2
ENSG00000162511 LAPTM5 70095 sc-eQTL 2.89e-01 0.0936 0.0882 0.092 CD4_Naive L2
ENSG00000162517 PEF1 -817027 sc-eQTL 7.00e-01 -0.0374 0.0969 0.092 CD4_Naive L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 109365 sc-eQTL 7.65e-01 0.0269 0.0897 0.092 CD4_Naive L2
ENSG00000287510 AL137857.1 96176 sc-eQTL 3.49e-01 0.0965 0.103 0.092 CD4_Naive L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -468919 sc-eQTL 5.69e-03 -0.401 0.143 0.092 CD4_TCM L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -469113 sc-eQTL 3.04e-01 -0.121 0.117 0.092 CD4_TCM L2
ENSG00000134644 PUM1 -238122 sc-eQTL 7.55e-01 0.0325 0.104 0.092 CD4_TCM L2
ENSG00000162511 LAPTM5 70095 sc-eQTL 2.43e-01 0.101 0.0862 0.092 CD4_TCM L2
ENSG00000162517 PEF1 -817027 sc-eQTL 3.78e-01 -0.102 0.116 0.092 CD4_TCM L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 109365 sc-eQTL 8.60e-01 0.0194 0.11 0.092 CD4_TCM L2
ENSG00000287510 AL137857.1 96176 sc-eQTL 9.88e-01 -0.0019 0.122 0.092 CD4_TCM L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -468919 sc-eQTL 4.30e-01 -0.114 0.145 0.092 CD4_TEM L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -469113 sc-eQTL 2.72e-01 0.152 0.138 0.092 CD4_TEM L2
ENSG00000134644 PUM1 -238122 sc-eQTL 9.23e-02 -0.193 0.114 0.092 CD4_TEM L2
ENSG00000162511 LAPTM5 70095 sc-eQTL 5.58e-01 0.0683 0.116 0.092 CD4_TEM L2
ENSG00000162517 PEF1 -817027 sc-eQTL 2.19e-01 -0.16 0.13 0.092 CD4_TEM L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 109365 sc-eQTL 1.72e-01 0.186 0.135 0.092 CD4_TEM L2
ENSG00000287510 AL137857.1 96176 sc-eQTL 2.68e-01 -0.149 0.134 0.092 CD4_TEM L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -468919 sc-eQTL 6.38e-01 -0.0758 0.161 0.092 CD8_CTL L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -469113 sc-eQTL 8.82e-01 -0.0184 0.123 0.092 CD8_CTL L2
ENSG00000134644 PUM1 -238122 sc-eQTL 9.38e-01 0.00926 0.12 0.092 CD8_CTL L2
ENSG00000162511 LAPTM5 70095 sc-eQTL 4.83e-01 -0.093 0.132 0.092 CD8_CTL L2
ENSG00000162517 PEF1 -817027 sc-eQTL 9.09e-01 0.0133 0.115 0.092 CD8_CTL L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 109365 sc-eQTL 3.82e-01 -0.122 0.139 0.092 CD8_CTL L2
ENSG00000287510 AL137857.1 96176 sc-eQTL 3.71e-01 -0.117 0.131 0.092 CD8_CTL L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -468919 sc-eQTL 5.41e-01 -0.0892 0.146 0.092 CD8_Naive L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -469113 sc-eQTL 4.10e-01 0.104 0.126 0.092 CD8_Naive L2
ENSG00000134644 PUM1 -238122 sc-eQTL 3.69e-01 0.091 0.101 0.092 CD8_Naive L2
ENSG00000162511 LAPTM5 70095 sc-eQTL 2.66e-01 0.108 0.0967 0.092 CD8_Naive L2
ENSG00000162517 PEF1 -817027 sc-eQTL 2.95e-01 -0.141 0.135 0.092 CD8_Naive L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 109365 sc-eQTL 6.07e-01 0.0624 0.121 0.092 CD8_Naive L2
ENSG00000287510 AL137857.1 96176 sc-eQTL 5.76e-01 -0.0738 0.132 0.092 CD8_Naive L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -468919 sc-eQTL 3.09e-01 -0.166 0.163 0.088 CD8_TCM L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -469113 sc-eQTL 3.39e-01 0.143 0.149 0.088 CD8_TCM L2
ENSG00000134644 PUM1 -238122 sc-eQTL 6.89e-01 0.0564 0.141 0.088 CD8_TCM L2
ENSG00000162511 LAPTM5 70095 sc-eQTL 7.75e-02 -0.259 0.146 0.088 CD8_TCM L2
ENSG00000162517 PEF1 -817027 sc-eQTL 6.24e-01 0.0739 0.15 0.088 CD8_TCM L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 109365 sc-eQTL 8.04e-01 0.0339 0.136 0.088 CD8_TCM L2
ENSG00000287510 AL137857.1 96176 sc-eQTL 6.72e-01 -0.0585 0.138 0.088 CD8_TCM L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -468919 sc-eQTL 7.76e-01 0.0431 0.151 0.094 CD8_TEM L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -469113 sc-eQTL 2.64e-01 0.162 0.145 0.094 CD8_TEM L2
ENSG00000134644 PUM1 -238122 sc-eQTL 2.66e-01 -0.165 0.148 0.094 CD8_TEM L2
ENSG00000162511 LAPTM5 70095 sc-eQTL 7.40e-01 0.0463 0.139 0.094 CD8_TEM L2
ENSG00000162517 PEF1 -817027 sc-eQTL 9.82e-01 0.00297 0.131 0.094 CD8_TEM L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 109365 sc-eQTL 9.50e-01 0.00913 0.145 0.094 CD8_TEM L2
ENSG00000287510 AL137857.1 96176 sc-eQTL 7.26e-02 0.235 0.13 0.094 CD8_TEM L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -468919 sc-eQTL 5.44e-02 0.291 0.151 0.093 MAIT L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -469113 sc-eQTL 2.57e-01 -0.152 0.134 0.093 MAIT L2
ENSG00000134644 PUM1 -238122 sc-eQTL 5.33e-01 0.0805 0.129 0.093 MAIT L2
ENSG00000162511 LAPTM5 70095 sc-eQTL 6.94e-01 0.0479 0.122 0.093 MAIT L2
ENSG00000162517 PEF1 -817027 sc-eQTL 8.69e-01 0.022 0.134 0.093 MAIT L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 109365 sc-eQTL 4.27e-01 -0.108 0.135 0.093 MAIT L2
ENSG00000287510 AL137857.1 96176 sc-eQTL 9.32e-01 0.0119 0.14 0.093 MAIT L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -468919 sc-eQTL 6.99e-01 -0.0594 0.154 0.093 NK_CD56bright L2
ENSG00000121753 ADGRB2 -937024 sc-eQTL 6.80e-01 0.0496 0.12 0.093 NK_CD56bright L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -469113 sc-eQTL 2.77e-01 -0.141 0.129 0.093 NK_CD56bright L2
ENSG00000134644 PUM1 -238122 sc-eQTL 9.54e-01 -0.00794 0.136 0.093 NK_CD56bright L2
ENSG00000162511 LAPTM5 70095 sc-eQTL 9.36e-01 0.0108 0.134 0.093 NK_CD56bright L2
ENSG00000162517 PEF1 -817027 sc-eQTL 3.03e-01 -0.135 0.13 0.093 NK_CD56bright L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 109365 sc-eQTL 2.21e-01 0.165 0.135 0.093 NK_CD56bright L2
ENSG00000287510 AL137857.1 96176 sc-eQTL 4.70e-01 0.0962 0.133 0.093 NK_CD56bright L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -468919 sc-eQTL 7.34e-01 0.0504 0.148 0.091 NK_CD56dim L2
ENSG00000121753 ADGRB2 -937024 sc-eQTL 8.83e-01 0.0191 0.13 0.091 NK_CD56dim L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -469113 sc-eQTL 6.53e-01 0.0493 0.109 0.091 NK_CD56dim L2
ENSG00000134644 PUM1 -238122 sc-eQTL 8.84e-01 -0.0164 0.112 0.091 NK_CD56dim L2
ENSG00000162511 LAPTM5 70095 sc-eQTL 8.29e-01 0.0258 0.12 0.091 NK_CD56dim L2
ENSG00000162517 PEF1 -817027 sc-eQTL 6.22e-01 0.0526 0.106 0.091 NK_CD56dim L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 109365 sc-eQTL 1.32e-01 0.226 0.149 0.091 NK_CD56dim L2
ENSG00000287510 AL137857.1 96176 sc-eQTL 7.70e-01 -0.0361 0.124 0.091 NK_CD56dim L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -468919 sc-eQTL 1.50e-02 0.371 0.151 0.091 NK_HLA L2
ENSG00000121753 ADGRB2 -937024 sc-eQTL 8.84e-01 0.0178 0.122 0.091 NK_HLA L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -469113 sc-eQTL 5.42e-01 0.0838 0.137 0.091 NK_HLA L2
ENSG00000134644 PUM1 -238122 sc-eQTL 6.23e-01 -0.0658 0.134 0.091 NK_HLA L2
ENSG00000162511 LAPTM5 70095 sc-eQTL 7.56e-01 -0.0396 0.128 0.091 NK_HLA L2
ENSG00000162517 PEF1 -817027 sc-eQTL 8.05e-01 -0.0355 0.144 0.091 NK_HLA L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 109365 sc-eQTL 2.06e-02 0.313 0.134 0.091 NK_HLA L2
ENSG00000287510 AL137857.1 96176 sc-eQTL 3.55e-01 0.121 0.131 0.091 NK_HLA L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -468919 sc-eQTL 3.47e-01 0.134 0.142 0.091 NK_cytokine L2
ENSG00000121753 ADGRB2 -937024 sc-eQTL 2.51e-02 0.287 0.127 0.091 NK_cytokine L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -469113 sc-eQTL 2.81e-01 -0.12 0.111 0.091 NK_cytokine L2
ENSG00000134644 PUM1 -238122 sc-eQTL 8.61e-01 -0.0211 0.12 0.091 NK_cytokine L2
ENSG00000162511 LAPTM5 70095 sc-eQTL 5.45e-01 -0.0804 0.132 0.091 NK_cytokine L2
ENSG00000162517 PEF1 -817027 sc-eQTL 5.35e-01 -0.0701 0.113 0.091 NK_cytokine L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 109365 sc-eQTL 7.45e-01 0.0457 0.14 0.091 NK_cytokine L2
ENSG00000287510 AL137857.1 96176 sc-eQTL 8.11e-01 -0.0312 0.131 0.091 NK_cytokine L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -468919 sc-eQTL 2.06e-01 0.196 0.154 0.107 PB L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -469113 sc-eQTL 3.60e-01 -0.165 0.179 0.107 PB L2
ENSG00000134644 PUM1 -238122 sc-eQTL 6.10e-01 -0.08 0.156 0.107 PB L2
ENSG00000162510 MATN1 104284 sc-eQTL 7.02e-01 0.0559 0.146 0.107 PB L2
ENSG00000162511 LAPTM5 70095 sc-eQTL 6.81e-01 -0.043 0.104 0.107 PB L2
ENSG00000162517 PEF1 -817027 sc-eQTL 6.52e-01 -0.0725 0.16 0.107 PB L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 109365 sc-eQTL 5.34e-01 -0.0888 0.142 0.107 PB L2
ENSG00000287510 AL137857.1 96176 sc-eQTL 5.56e-02 0.289 0.149 0.107 PB L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -468919 sc-eQTL 8.30e-01 -0.024 0.112 0.093 Pro_T L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -469113 sc-eQTL 7.19e-01 -0.0513 0.142 0.093 Pro_T L2
ENSG00000134644 PUM1 -238122 sc-eQTL 4.77e-01 -0.0944 0.133 0.093 Pro_T L2
ENSG00000162511 LAPTM5 70095 sc-eQTL 7.45e-02 0.169 0.0945 0.093 Pro_T L2
ENSG00000162517 PEF1 -817027 sc-eQTL 7.29e-01 0.0485 0.14 0.093 Pro_T L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 109365 sc-eQTL 5.76e-02 0.252 0.132 0.093 Pro_T L2
ENSG00000287510 AL137857.1 96176 sc-eQTL 2.51e-01 0.14 0.122 0.093 Pro_T L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -468919 sc-eQTL 8.72e-01 0.024 0.148 0.092 Treg L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -469113 sc-eQTL 8.66e-01 -0.0242 0.144 0.092 Treg L2
ENSG00000134644 PUM1 -238122 sc-eQTL 4.05e-01 0.0957 0.115 0.092 Treg L2
ENSG00000162511 LAPTM5 70095 sc-eQTL 5.51e-01 0.0785 0.131 0.092 Treg L2
ENSG00000162517 PEF1 -817027 sc-eQTL 5.51e-01 0.0848 0.142 0.092 Treg L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 109365 sc-eQTL 2.94e-01 -0.141 0.134 0.092 Treg L2
ENSG00000287510 AL137857.1 96176 sc-eQTL 8.84e-02 0.228 0.133 0.092 Treg L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -468919 sc-eQTL 4.06e-01 0.129 0.155 0.085 cDC L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -469113 sc-eQTL 6.43e-01 -0.0778 0.168 0.085 cDC L2
ENSG00000134644 PUM1 -238122 sc-eQTL 8.29e-01 0.0312 0.144 0.085 cDC L2
ENSG00000162511 LAPTM5 70095 sc-eQTL 1.82e-01 0.135 0.101 0.085 cDC L2
ENSG00000162517 PEF1 -817027 sc-eQTL 8.51e-01 0.0274 0.146 0.085 cDC L2
ENSG00000168528 SERINC2 -581696 sc-eQTL 8.41e-01 -0.026 0.13 0.085 cDC L2
ENSG00000284543 LINC01226 -678357 sc-eQTL 3.23e-01 -0.126 0.127 0.085 cDC L2
ENSG00000287510 AL137857.1 96176 sc-eQTL 5.37e-01 0.0848 0.137 0.085 cDC L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -468919 sc-eQTL 8.11e-01 0.029 0.121 0.092 cMono_IL1B L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -469113 sc-eQTL 6.05e-01 0.0698 0.135 0.092 cMono_IL1B L2
ENSG00000134644 PUM1 -238122 sc-eQTL 2.51e-01 -0.105 0.0909 0.092 cMono_IL1B L2
ENSG00000162511 LAPTM5 70095 sc-eQTL 9.42e-01 -0.0058 0.08 0.092 cMono_IL1B L2
ENSG00000162512 SDC3 -80889 sc-eQTL 7.91e-01 0.0401 0.151 0.092 cMono_IL1B L2
ENSG00000162517 PEF1 -817027 sc-eQTL 7.89e-01 -0.0331 0.123 0.092 cMono_IL1B L2
ENSG00000168528 SERINC2 -581696 sc-eQTL 1.03e-01 0.249 0.152 0.092 cMono_IL1B L2
ENSG00000284543 LINC01226 -678357 sc-eQTL 7.86e-01 0.0368 0.135 0.092 cMono_IL1B L2
ENSG00000287510 AL137857.1 96176 sc-eQTL 6.02e-01 0.0658 0.126 0.092 cMono_IL1B L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -468919 sc-eQTL 8.22e-01 0.0284 0.127 0.092 cMono_S100A L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -469113 sc-eQTL 8.12e-02 -0.26 0.148 0.092 cMono_S100A L2
ENSG00000134644 PUM1 -238122 sc-eQTL 9.89e-01 0.00143 0.108 0.092 cMono_S100A L2
ENSG00000162511 LAPTM5 70095 sc-eQTL 7.28e-01 0.0289 0.083 0.092 cMono_S100A L2
ENSG00000162512 SDC3 -80889 sc-eQTL 1.38e-01 0.213 0.143 0.092 cMono_S100A L2
ENSG00000162517 PEF1 -817027 sc-eQTL 3.40e-01 0.124 0.129 0.092 cMono_S100A L2
ENSG00000168528 SERINC2 -581696 sc-eQTL 6.92e-02 0.275 0.151 0.092 cMono_S100A L2
ENSG00000284543 LINC01226 -678357 sc-eQTL 9.66e-02 -0.205 0.123 0.092 cMono_S100A L2
ENSG00000287510 AL137857.1 96176 sc-eQTL 6.46e-01 0.057 0.124 0.092 cMono_S100A L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -468919 sc-eQTL 7.89e-01 -0.0499 0.186 0.094 gdT L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -469113 sc-eQTL 3.20e-01 0.159 0.159 0.094 gdT L2
ENSG00000134644 PUM1 -238122 sc-eQTL 7.99e-01 0.042 0.165 0.094 gdT L2
ENSG00000162511 LAPTM5 70095 sc-eQTL 3.19e-01 0.178 0.178 0.094 gdT L2
ENSG00000162517 PEF1 -817027 sc-eQTL 9.38e-01 0.0127 0.164 0.094 gdT L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 109365 sc-eQTL 5.63e-01 0.0957 0.165 0.094 gdT L2
ENSG00000287510 AL137857.1 96176 sc-eQTL 7.18e-02 0.287 0.158 0.094 gdT L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -468919 sc-eQTL 9.20e-01 -0.015 0.149 0.089 intMono L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -469113 sc-eQTL 6.47e-01 0.0732 0.16 0.089 intMono L2
ENSG00000134644 PUM1 -238122 sc-eQTL 1.67e-01 0.187 0.135 0.089 intMono L2
ENSG00000162511 LAPTM5 70095 sc-eQTL 5.21e-01 -0.0684 0.106 0.089 intMono L2
ENSG00000162512 SDC3 -80889 sc-eQTL 2.11e-01 0.182 0.145 0.089 intMono L2
ENSG00000162517 PEF1 -817027 sc-eQTL 7.41e-02 -0.273 0.152 0.089 intMono L2
ENSG00000168528 SERINC2 -581696 sc-eQTL 1.09e-01 0.244 0.152 0.089 intMono L2
ENSG00000284543 LINC01226 -678357 sc-eQTL 4.53e-01 0.109 0.144 0.089 intMono L2
ENSG00000287510 AL137857.1 96176 sc-eQTL 3.33e-01 -0.14 0.144 0.089 intMono L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -468919 sc-eQTL 9.95e-01 -0.000842 0.129 0.097 ncMono L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -469113 sc-eQTL 9.75e-02 0.227 0.136 0.097 ncMono L2
ENSG00000134644 PUM1 -238122 sc-eQTL 5.73e-01 0.0632 0.112 0.097 ncMono L2
ENSG00000162511 LAPTM5 70095 sc-eQTL 2.00e-01 -0.13 0.101 0.097 ncMono L2
ENSG00000162512 SDC3 -80889 sc-eQTL 6.33e-01 0.0545 0.114 0.097 ncMono L2
ENSG00000162517 PEF1 -817027 sc-eQTL 9.51e-01 0.00797 0.131 0.097 ncMono L2
ENSG00000168528 SERINC2 -581696 sc-eQTL 1.24e-01 0.191 0.124 0.097 ncMono L2
ENSG00000284543 LINC01226 -678357 sc-eQTL 6.11e-01 0.0633 0.124 0.097 ncMono L2
ENSG00000287510 AL137857.1 96176 sc-eQTL 6.76e-01 0.054 0.129 0.097 ncMono L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -468919 sc-eQTL 3.88e-01 0.128 0.148 0.096 pDC L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -469113 sc-eQTL 1.72e-02 -0.384 0.16 0.096 pDC L2
ENSG00000134644 PUM1 -238122 sc-eQTL 9.97e-02 -0.221 0.134 0.096 pDC L2
ENSG00000162511 LAPTM5 70095 sc-eQTL 2.22e-01 -0.153 0.125 0.096 pDC L2
ENSG00000162517 PEF1 -817027 sc-eQTL 7.18e-01 0.0588 0.163 0.096 pDC L2
ENSG00000168528 SERINC2 -581696 sc-eQTL 1.54e-01 0.216 0.151 0.096 pDC L2
ENSG00000284543 LINC01226 -678357 sc-eQTL 7.14e-02 -0.212 0.117 0.096 pDC L2
ENSG00000287510 AL137857.1 96176 sc-eQTL 3.87e-01 0.12 0.138 0.096 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000060688 SNRNP40 -468919 sc-eQTL 2.49e-01 0.172 0.149 0.092 B_Memory LOneK1K
ENSG00000121766 ZCCHC17 -469113 sc-eQTL 9.41e-01 -0.00915 0.124 0.092 B_Memory LOneK1K
ENSG00000134644 PUM1 -238122 sc-eQTL 3.36e-01 0.106 0.11 0.092 B_Memory LOneK1K
ENSG00000162510 MATN1 104284 sc-eQTL 6.80e-01 0.052 0.126 0.092 B_Memory LOneK1K
ENSG00000162511 LAPTM5 70095 sc-eQTL 1.75e-01 0.107 0.0786 0.092 B_Memory LOneK1K
ENSG00000162517 PEF1 -817027 sc-eQTL 1.32e-01 -0.197 0.13 0.092 B_Memory LOneK1K
ENSG00000186056 MATN1-AS1 109365 sc-eQTL 6.60e-01 0.046 0.104 0.092 B_Memory LOneK1K
ENSG00000287510 AL137857.1 96176 sc-eQTL 7.87e-01 -0.0308 0.114 0.092 B_Memory LOneK1K
ENSG00000060688 SNRNP40 -468919 sc-eQTL 8.48e-01 -0.026 0.136 0.092 B_Naive LOneK1K
ENSG00000121766 ZCCHC17 -469113 sc-eQTL 9.55e-01 0.006 0.107 0.092 B_Naive LOneK1K
ENSG00000134644 PUM1 -238122 sc-eQTL 5.09e-01 -0.0671 0.101 0.092 B_Naive LOneK1K
ENSG00000162510 MATN1 104284 sc-eQTL 8.40e-01 -0.0198 0.0977 0.092 B_Naive LOneK1K
ENSG00000162511 LAPTM5 70095 sc-eQTL 2.86e-01 -0.0733 0.0686 0.092 B_Naive LOneK1K
ENSG00000162517 PEF1 -817027 sc-eQTL 2.40e-01 0.148 0.125 0.092 B_Naive LOneK1K
ENSG00000186056 MATN1-AS1 109365 sc-eQTL 5.94e-01 0.0474 0.0887 0.092 B_Naive LOneK1K
ENSG00000287510 AL137857.1 96176 sc-eQTL 9.24e-01 0.0101 0.105 0.092 B_Naive LOneK1K
ENSG00000060688 SNRNP40 -468919 sc-eQTL 8.15e-01 -0.0271 0.115 0.092 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000121766 ZCCHC17 -469113 sc-eQTL 5.72e-01 -0.0739 0.13 0.092 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000134644 PUM1 -238122 sc-eQTL 5.88e-01 -0.0452 0.0832 0.092 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000162511 LAPTM5 70095 sc-eQTL 8.29e-01 0.0159 0.0732 0.092 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000162512 SDC3 -80889 sc-eQTL 2.15e-01 0.185 0.149 0.092 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000162517 PEF1 -817027 sc-eQTL 9.41e-01 0.00778 0.105 0.092 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000168528 SERINC2 -581696 sc-eQTL 1.21e-01 0.238 0.153 0.092 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000284543 LINC01226 -678357 sc-eQTL 4.18e-01 -0.102 0.126 0.092 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000287510 AL137857.1 96176 sc-eQTL 4.66e-01 0.0861 0.118 0.092 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000060688 SNRNP40 -468919 sc-eQTL 8.45e-01 0.0247 0.126 0.093 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000121766 ZCCHC17 -469113 sc-eQTL 5.80e-01 0.0763 0.138 0.093 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000134644 PUM1 -238122 sc-eQTL 1.17e-01 0.177 0.112 0.093 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000162511 LAPTM5 70095 sc-eQTL 3.59e-01 -0.0829 0.0901 0.093 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000162512 SDC3 -80889 sc-eQTL 4.09e-01 0.109 0.132 0.093 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000162517 PEF1 -817027 sc-eQTL 6.25e-02 -0.223 0.119 0.093 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000168528 SERINC2 -581696 sc-eQTL 1.28e-01 0.208 0.136 0.093 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000284543 LINC01226 -678357 sc-eQTL 5.13e-01 0.085 0.13 0.093 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000287510 AL137857.1 96176 sc-eQTL 8.41e-01 0.0262 0.13 0.093 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000060688 SNRNP40 -468919 sc-eQTL 2.69e-01 0.157 0.141 0.091 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000121753 ADGRB2 -937024 sc-eQTL 1.54e-01 0.172 0.12 0.091 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000121766 ZCCHC17 -469113 sc-eQTL 8.11e-01 -0.0232 0.0967 0.091 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000134644 PUM1 -238122 sc-eQTL 6.97e-01 -0.0414 0.106 0.091 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000162511 LAPTM5 70095 sc-eQTL 8.63e-01 0.0205 0.118 0.091 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000162517 PEF1 -817027 sc-eQTL 5.66e-01 -0.0517 0.0899 0.091 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000186056 MATN1-AS1 109365 sc-eQTL 2.15e-01 0.169 0.136 0.091 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000287510 AL137857.1 96176 sc-eQTL 7.69e-01 0.0347 0.118 0.091 NK_CD56dim LOneK1K

Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF
ENSG00000162511 LAPTM5 70095 eQTL 0.0218 -0.0373 0.0162 0.0 0.0 0.0976
ENSG00000168528 SERINC2 -581696 eQTL 0.00267 0.188 0.0625 0.0 0.0 0.0976

Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina
ENSG00000168528 SERINC2 -581696 5.14e-07 2.89e-07 7.16e-08 2.62e-07 1.02e-07 1.26e-07 3.57e-07 7.65e-08 2.53e-07 1.46e-07 3.25e-07 2.04e-07 4.34e-07 8.55e-08 1.01e-07 1.17e-07 8.53e-08 2.83e-07 9.19e-08 8.87e-08 1.39e-07 2.3e-07 2.26e-07 5.11e-08 3.98e-07 2e-07 1.48e-07 1.68e-07 1.98e-07 2.1e-07 1.86e-07 5.24e-08 5.09e-08 1.01e-07 1.22e-07 5.04e-08 6.77e-08 5.8e-08 4.82e-08 7.92e-08 4.73e-08 2.9e-07 3.59e-08 1.72e-08 5.84e-08 8.42e-09 9.1e-08 0.0 4.61e-08