logo

Genes within 1Mb (chr1:30820093:C:G):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD

Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000060688 SNRNP40 -476695 sc-eQTL 6.42e-01 -0.0718 0.154 0.062 B L1
ENSG00000121766 ZCCHC17 -476889 sc-eQTL 6.70e-01 0.0526 0.124 0.062 B L1
ENSG00000134644 PUM1 -245898 sc-eQTL 3.05e-01 0.106 0.103 0.062 B L1
ENSG00000162510 MATN1 96508 sc-eQTL 7.58e-01 0.0336 0.109 0.062 B L1
ENSG00000162511 LAPTM5 62319 sc-eQTL 1.60e-01 -0.12 0.085 0.062 B L1
ENSG00000162517 PEF1 -824803 sc-eQTL 6.95e-01 0.0506 0.129 0.062 B L1
ENSG00000186056 MATN1-AS1 101589 sc-eQTL 8.84e-01 0.0147 0.1 0.062 B L1
ENSG00000287510 AL137857.1 88400 sc-eQTL 8.19e-01 -0.027 0.118 0.062 B L1
ENSG00000060688 SNRNP40 -476695 sc-eQTL 5.63e-01 -0.0761 0.131 0.062 CD4T L1
ENSG00000121766 ZCCHC17 -476889 sc-eQTL 9.80e-01 0.00251 0.103 0.062 CD4T L1
ENSG00000134644 PUM1 -245898 sc-eQTL 5.74e-01 -0.0514 0.0913 0.062 CD4T L1
ENSG00000162511 LAPTM5 62319 sc-eQTL 2.84e-01 0.108 0.101 0.062 CD4T L1
ENSG00000162517 PEF1 -824803 sc-eQTL 4.83e-01 -0.0743 0.106 0.062 CD4T L1
ENSG00000186056 MATN1-AS1 101589 sc-eQTL 5.69e-01 -0.0517 0.0905 0.062 CD4T L1
ENSG00000287510 AL137857.1 88400 sc-eQTL 3.23e-01 -0.107 0.108 0.062 CD4T L1
ENSG00000060688 SNRNP40 -476695 sc-eQTL 2.85e-01 -0.186 0.173 0.062 CD8T L1
ENSG00000121766 ZCCHC17 -476889 sc-eQTL 2.37e-01 0.137 0.115 0.062 CD8T L1
ENSG00000134644 PUM1 -245898 sc-eQTL 7.92e-01 -0.0269 0.102 0.062 CD8T L1
ENSG00000162511 LAPTM5 62319 sc-eQTL 8.61e-01 0.0173 0.0988 0.062 CD8T L1
ENSG00000162517 PEF1 -824803 sc-eQTL 8.33e-01 -0.0257 0.122 0.062 CD8T L1
ENSG00000186056 MATN1-AS1 101589 sc-eQTL 8.17e-01 -0.0269 0.116 0.062 CD8T L1
ENSG00000287510 AL137857.1 88400 sc-eQTL 3.49e-01 -0.136 0.145 0.062 CD8T L1
ENSG00000060688 SNRNP40 -476695 sc-eQTL 4.22e-01 0.126 0.156 0.063 DC L1
ENSG00000121766 ZCCHC17 -476889 sc-eQTL 2.65e-01 -0.207 0.185 0.063 DC L1
ENSG00000134644 PUM1 -245898 sc-eQTL 7.18e-01 -0.0525 0.145 0.063 DC L1
ENSG00000162511 LAPTM5 62319 sc-eQTL 4.83e-01 -0.0727 0.104 0.063 DC L1
ENSG00000162517 PEF1 -824803 sc-eQTL 5.45e-01 -0.102 0.168 0.063 DC L1
ENSG00000168528 SERINC2 -589472 sc-eQTL 1.93e-01 0.223 0.17 0.063 DC L1
ENSG00000284543 LINC01226 -686133 sc-eQTL 1.58e-02 -0.272 0.112 0.063 DC L1
ENSG00000287510 AL137857.1 88400 sc-eQTL 4.31e-01 0.129 0.164 0.063 DC L1
ENSG00000060688 SNRNP40 -476695 sc-eQTL 3.58e-01 -0.111 0.121 0.062 Mono L1
ENSG00000121766 ZCCHC17 -476889 sc-eQTL 9.48e-01 -0.00989 0.15 0.062 Mono L1
ENSG00000134644 PUM1 -245898 sc-eQTL 9.40e-01 0.00722 0.0962 0.062 Mono L1
ENSG00000162511 LAPTM5 62319 sc-eQTL 7.33e-01 0.0303 0.0885 0.062 Mono L1
ENSG00000162512 SDC3 -88665 sc-eQTL 1.03e-02 0.434 0.167 0.062 Mono L1
ENSG00000162517 PEF1 -824803 sc-eQTL 2.78e-01 -0.129 0.119 0.062 Mono L1
ENSG00000168528 SERINC2 -589472 sc-eQTL 3.35e-01 0.176 0.182 0.062 Mono L1
ENSG00000284543 LINC01226 -686133 sc-eQTL 6.85e-01 0.0653 0.161 0.062 Mono L1
ENSG00000287510 AL137857.1 88400 sc-eQTL 8.09e-01 0.034 0.141 0.062 Mono L1
ENSG00000060688 SNRNP40 -476695 sc-eQTL 3.74e-01 0.151 0.169 0.062 NK L1
ENSG00000121753 ADGRB2 -944800 sc-eQTL 3.29e-01 0.142 0.145 0.062 NK L1
ENSG00000121766 ZCCHC17 -476889 sc-eQTL 9.31e-01 0.0101 0.116 0.062 NK L1
ENSG00000134644 PUM1 -245898 sc-eQTL 8.58e-01 0.0218 0.122 0.062 NK L1
ENSG00000162511 LAPTM5 62319 sc-eQTL 3.55e-01 -0.129 0.14 0.062 NK L1
ENSG00000162517 PEF1 -824803 sc-eQTL 6.08e-02 -0.191 0.101 0.062 NK L1
ENSG00000186056 MATN1-AS1 101589 sc-eQTL 1.00e-01 0.258 0.156 0.062 NK L1
ENSG00000287510 AL137857.1 88400 sc-eQTL 3.09e-01 -0.148 0.145 0.062 NK L1
ENSG00000060688 SNRNP40 -476695 sc-eQTL 8.45e-01 0.0252 0.128 0.062 Other_T L1
ENSG00000121766 ZCCHC17 -476889 sc-eQTL 5.90e-01 0.074 0.137 0.062 Other_T L1
ENSG00000134644 PUM1 -245898 sc-eQTL 6.71e-02 0.225 0.122 0.062 Other_T L1
ENSG00000162511 LAPTM5 62319 sc-eQTL 5.31e-02 0.195 0.1 0.062 Other_T L1
ENSG00000162517 PEF1 -824803 sc-eQTL 4.98e-01 -0.0915 0.135 0.062 Other_T L1
ENSG00000186056 MATN1-AS1 101589 sc-eQTL 2.60e-01 0.186 0.165 0.062 Other_T L1
ENSG00000287510 AL137857.1 88400 sc-eQTL 4.33e-01 0.135 0.172 0.062 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000060688 SNRNP40 -476695 sc-eQTL 7.44e-01 -0.0627 0.192 0.064 B_Activated L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -476889 sc-eQTL 8.73e-01 0.0311 0.194 0.064 B_Activated L2
ENSG00000134644 PUM1 -245898 sc-eQTL 2.32e-02 0.406 0.177 0.064 B_Activated L2
ENSG00000162510 MATN1 96508 sc-eQTL 1.16e-01 0.247 0.156 0.064 B_Activated L2
ENSG00000162511 LAPTM5 62319 sc-eQTL 4.19e-02 0.222 0.108 0.064 B_Activated L2
ENSG00000162517 PEF1 -824803 sc-eQTL 7.74e-01 0.0537 0.187 0.064 B_Activated L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 101589 sc-eQTL 9.80e-01 0.00435 0.177 0.064 B_Activated L2
ENSG00000287510 AL137857.1 88400 sc-eQTL 4.74e-01 0.112 0.157 0.064 B_Activated L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -476695 sc-eQTL 3.12e-01 0.189 0.186 0.062 B_Intermediate L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -476889 sc-eQTL 9.56e-01 0.00859 0.156 0.062 B_Intermediate L2
ENSG00000134644 PUM1 -245898 sc-eQTL 2.69e-01 0.162 0.146 0.062 B_Intermediate L2
ENSG00000162510 MATN1 96508 sc-eQTL 4.94e-01 -0.105 0.153 0.062 B_Intermediate L2
ENSG00000162511 LAPTM5 62319 sc-eQTL 9.21e-01 -0.00926 0.0938 0.062 B_Intermediate L2
ENSG00000162517 PEF1 -824803 sc-eQTL 1.71e-01 -0.238 0.173 0.062 B_Intermediate L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 101589 sc-eQTL 8.49e-01 -0.025 0.132 0.062 B_Intermediate L2
ENSG00000287510 AL137857.1 88400 sc-eQTL 9.38e-01 0.0114 0.147 0.062 B_Intermediate L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -476695 sc-eQTL 3.25e-01 0.18 0.182 0.062 B_Memory L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -476889 sc-eQTL 4.00e-01 -0.141 0.168 0.062 B_Memory L2
ENSG00000134644 PUM1 -245898 sc-eQTL 6.73e-01 -0.0617 0.146 0.062 B_Memory L2
ENSG00000162510 MATN1 96508 sc-eQTL 5.61e-01 0.0814 0.14 0.062 B_Memory L2
ENSG00000162511 LAPTM5 62319 sc-eQTL 1.93e-01 0.161 0.123 0.062 B_Memory L2
ENSG00000162517 PEF1 -824803 sc-eQTL 8.72e-02 -0.283 0.164 0.062 B_Memory L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 101589 sc-eQTL 9.73e-01 0.00476 0.142 0.062 B_Memory L2
ENSG00000287510 AL137857.1 88400 sc-eQTL 2.75e-01 -0.181 0.166 0.062 B_Memory L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -476695 sc-eQTL 3.62e-01 -0.153 0.168 0.062 B_Naive1 L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -476889 sc-eQTL 3.23e-01 0.144 0.145 0.062 B_Naive1 L2
ENSG00000134644 PUM1 -245898 sc-eQTL 1.91e-01 0.167 0.128 0.062 B_Naive1 L2
ENSG00000162510 MATN1 96508 sc-eQTL 8.84e-01 0.019 0.13 0.062 B_Naive1 L2
ENSG00000162511 LAPTM5 62319 sc-eQTL 4.53e-02 -0.173 0.0861 0.062 B_Naive1 L2
ENSG00000162517 PEF1 -824803 sc-eQTL 8.87e-01 -0.0218 0.153 0.062 B_Naive1 L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 101589 sc-eQTL 8.64e-01 0.0196 0.114 0.062 B_Naive1 L2
ENSG00000287510 AL137857.1 88400 sc-eQTL 9.68e-01 0.0056 0.141 0.062 B_Naive1 L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -476695 sc-eQTL 7.84e-01 -0.0489 0.179 0.062 B_Naive2 L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -476889 sc-eQTL 3.86e-01 0.128 0.147 0.062 B_Naive2 L2
ENSG00000134644 PUM1 -245898 sc-eQTL 9.73e-01 -0.00498 0.144 0.062 B_Naive2 L2
ENSG00000162510 MATN1 96508 sc-eQTL 6.09e-01 -0.071 0.138 0.062 B_Naive2 L2
ENSG00000162511 LAPTM5 62319 sc-eQTL 5.33e-01 -0.0587 0.094 0.062 B_Naive2 L2
ENSG00000162517 PEF1 -824803 sc-eQTL 1.27e-01 0.261 0.17 0.062 B_Naive2 L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 101589 sc-eQTL 8.28e-01 -0.0297 0.137 0.062 B_Naive2 L2
ENSG00000287510 AL137857.1 88400 sc-eQTL 2.34e-01 0.176 0.147 0.062 B_Naive2 L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -476695 sc-eQTL 8.68e-01 0.0291 0.176 0.061 CD4_CTL L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -476889 sc-eQTL 6.97e-01 0.0673 0.173 0.061 CD4_CTL L2
ENSG00000134644 PUM1 -245898 sc-eQTL 6.31e-01 0.0814 0.169 0.061 CD4_CTL L2
ENSG00000162511 LAPTM5 62319 sc-eQTL 9.33e-01 0.0126 0.151 0.061 CD4_CTL L2
ENSG00000162517 PEF1 -824803 sc-eQTL 2.83e-01 -0.166 0.154 0.061 CD4_CTL L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 101589 sc-eQTL 8.71e-01 0.0269 0.165 0.061 CD4_CTL L2
ENSG00000287510 AL137857.1 88400 sc-eQTL 8.86e-01 -0.0209 0.146 0.061 CD4_CTL L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -476695 sc-eQTL 6.52e-01 0.0621 0.137 0.062 CD4_Naive L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -476889 sc-eQTL 5.86e-01 -0.0664 0.122 0.062 CD4_Naive L2
ENSG00000134644 PUM1 -245898 sc-eQTL 3.88e-01 -0.084 0.0972 0.062 CD4_Naive L2
ENSG00000162511 LAPTM5 62319 sc-eQTL 2.40e-01 0.122 0.104 0.062 CD4_Naive L2
ENSG00000162517 PEF1 -824803 sc-eQTL 6.80e-01 -0.0472 0.114 0.062 CD4_Naive L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 101589 sc-eQTL 5.38e-01 -0.0652 0.106 0.062 CD4_Naive L2
ENSG00000287510 AL137857.1 88400 sc-eQTL 8.14e-01 -0.0286 0.122 0.062 CD4_Naive L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -476695 sc-eQTL 1.04e-02 -0.441 0.17 0.062 CD4_TCM L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -476889 sc-eQTL 7.88e-01 -0.0376 0.14 0.062 CD4_TCM L2
ENSG00000134644 PUM1 -245898 sc-eQTL 7.06e-01 0.0466 0.124 0.062 CD4_TCM L2
ENSG00000162511 LAPTM5 62319 sc-eQTL 5.31e-01 0.0643 0.102 0.062 CD4_TCM L2
ENSG00000162517 PEF1 -824803 sc-eQTL 3.04e-01 -0.141 0.137 0.062 CD4_TCM L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 101589 sc-eQTL 5.84e-01 -0.0712 0.13 0.062 CD4_TCM L2
ENSG00000287510 AL137857.1 88400 sc-eQTL 3.55e-01 -0.134 0.145 0.062 CD4_TCM L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -476695 sc-eQTL 8.61e-01 0.0306 0.175 0.062 CD4_TEM L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -476889 sc-eQTL 2.18e-01 0.205 0.166 0.062 CD4_TEM L2
ENSG00000134644 PUM1 -245898 sc-eQTL 9.50e-02 -0.232 0.138 0.062 CD4_TEM L2
ENSG00000162511 LAPTM5 62319 sc-eQTL 6.40e-01 0.0659 0.141 0.062 CD4_TEM L2
ENSG00000162517 PEF1 -824803 sc-eQTL 9.97e-02 -0.259 0.157 0.062 CD4_TEM L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 101589 sc-eQTL 9.48e-01 0.0107 0.165 0.062 CD4_TEM L2
ENSG00000287510 AL137857.1 88400 sc-eQTL 1.28e-01 -0.246 0.161 0.062 CD4_TEM L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -476695 sc-eQTL 6.35e-01 -0.0923 0.194 0.062 CD8_CTL L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -476889 sc-eQTL 7.06e-01 -0.0562 0.149 0.062 CD8_CTL L2
ENSG00000134644 PUM1 -245898 sc-eQTL 7.93e-01 0.038 0.145 0.062 CD8_CTL L2
ENSG00000162511 LAPTM5 62319 sc-eQTL 3.58e-01 -0.147 0.16 0.062 CD8_CTL L2
ENSG00000162517 PEF1 -824803 sc-eQTL 9.06e-01 0.0166 0.139 0.062 CD8_CTL L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 101589 sc-eQTL 2.53e-01 -0.192 0.168 0.062 CD8_CTL L2
ENSG00000287510 AL137857.1 88400 sc-eQTL 2.85e-01 -0.169 0.158 0.062 CD8_CTL L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -476695 sc-eQTL 5.49e-01 -0.105 0.174 0.062 CD8_Naive L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -476889 sc-eQTL 2.93e-01 0.158 0.15 0.062 CD8_Naive L2
ENSG00000134644 PUM1 -245898 sc-eQTL 4.56e-01 0.0903 0.121 0.062 CD8_Naive L2
ENSG00000162511 LAPTM5 62319 sc-eQTL 4.45e-01 0.0887 0.116 0.062 CD8_Naive L2
ENSG00000162517 PEF1 -824803 sc-eQTL 3.91e-01 -0.138 0.161 0.062 CD8_Naive L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 101589 sc-eQTL 5.26e-01 0.0919 0.145 0.062 CD8_Naive L2
ENSG00000287510 AL137857.1 88400 sc-eQTL 3.84e-02 -0.325 0.156 0.062 CD8_Naive L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -476695 sc-eQTL 2.22e-01 -0.24 0.195 0.058 CD8_TCM L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -476889 sc-eQTL 7.85e-01 0.0491 0.18 0.058 CD8_TCM L2
ENSG00000134644 PUM1 -245898 sc-eQTL 8.79e-01 0.0258 0.169 0.058 CD8_TCM L2
ENSG00000162511 LAPTM5 62319 sc-eQTL 3.26e-01 -0.174 0.177 0.058 CD8_TCM L2
ENSG00000162517 PEF1 -824803 sc-eQTL 9.85e-01 0.0034 0.181 0.058 CD8_TCM L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 101589 sc-eQTL 8.79e-01 0.0251 0.164 0.058 CD8_TCM L2
ENSG00000287510 AL137857.1 88400 sc-eQTL 3.34e-01 -0.16 0.165 0.058 CD8_TCM L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -476695 sc-eQTL 9.64e-01 0.00821 0.182 0.062 CD8_TEM L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -476889 sc-eQTL 5.96e-01 0.0926 0.175 0.062 CD8_TEM L2
ENSG00000134644 PUM1 -245898 sc-eQTL 8.59e-01 -0.0317 0.179 0.062 CD8_TEM L2
ENSG00000162511 LAPTM5 62319 sc-eQTL 6.85e-01 -0.0683 0.168 0.062 CD8_TEM L2
ENSG00000162517 PEF1 -824803 sc-eQTL 8.90e-01 -0.0218 0.158 0.062 CD8_TEM L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 101589 sc-eQTL 9.80e-01 0.00446 0.174 0.062 CD8_TEM L2
ENSG00000287510 AL137857.1 88400 sc-eQTL 1.90e-01 0.206 0.157 0.062 CD8_TEM L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -476695 sc-eQTL 1.02e-01 0.297 0.181 0.063 MAIT L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -476889 sc-eQTL 6.72e-01 -0.0682 0.161 0.063 MAIT L2
ENSG00000134644 PUM1 -245898 sc-eQTL 2.48e-01 0.178 0.154 0.063 MAIT L2
ENSG00000162511 LAPTM5 62319 sc-eQTL 6.04e-01 0.0756 0.145 0.063 MAIT L2
ENSG00000162517 PEF1 -824803 sc-eQTL 3.80e-01 -0.14 0.16 0.063 MAIT L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 101589 sc-eQTL 7.43e-01 -0.0533 0.162 0.063 MAIT L2
ENSG00000287510 AL137857.1 88400 sc-eQTL 5.16e-01 0.109 0.167 0.063 MAIT L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -476695 sc-eQTL 7.74e-01 0.0534 0.186 0.062 NK_CD56bright L2
ENSG00000121753 ADGRB2 -944800 sc-eQTL 9.61e-01 0.00703 0.145 0.062 NK_CD56bright L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -476889 sc-eQTL 6.36e-01 -0.0742 0.157 0.062 NK_CD56bright L2
ENSG00000134644 PUM1 -245898 sc-eQTL 7.88e-01 -0.0443 0.165 0.062 NK_CD56bright L2
ENSG00000162511 LAPTM5 62319 sc-eQTL 2.90e-01 -0.172 0.162 0.062 NK_CD56bright L2
ENSG00000162517 PEF1 -824803 sc-eQTL 3.45e-01 -0.149 0.157 0.062 NK_CD56bright L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 101589 sc-eQTL 3.50e-01 0.153 0.163 0.062 NK_CD56bright L2
ENSG00000287510 AL137857.1 88400 sc-eQTL 7.77e-01 0.0456 0.161 0.062 NK_CD56bright L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -476695 sc-eQTL 9.50e-01 0.0111 0.178 0.06 NK_CD56dim L2
ENSG00000121753 ADGRB2 -944800 sc-eQTL 8.81e-01 -0.0235 0.156 0.06 NK_CD56dim L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -476889 sc-eQTL 9.60e-01 0.00665 0.132 0.06 NK_CD56dim L2
ENSG00000134644 PUM1 -245898 sc-eQTL 9.03e-01 0.0165 0.135 0.06 NK_CD56dim L2
ENSG00000162511 LAPTM5 62319 sc-eQTL 5.60e-01 -0.084 0.144 0.06 NK_CD56dim L2
ENSG00000162517 PEF1 -824803 sc-eQTL 3.51e-01 -0.119 0.128 0.06 NK_CD56dim L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 101589 sc-eQTL 7.11e-02 0.324 0.179 0.06 NK_CD56dim L2
ENSG00000287510 AL137857.1 88400 sc-eQTL 1.81e-01 -0.199 0.148 0.06 NK_CD56dim L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -476695 sc-eQTL 6.89e-02 0.334 0.183 0.062 NK_HLA L2
ENSG00000121753 ADGRB2 -944800 sc-eQTL 5.17e-01 0.095 0.146 0.062 NK_HLA L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -476889 sc-eQTL 9.13e-01 0.0179 0.165 0.062 NK_HLA L2
ENSG00000134644 PUM1 -245898 sc-eQTL 6.99e-01 -0.0621 0.16 0.062 NK_HLA L2
ENSG00000162511 LAPTM5 62319 sc-eQTL 1.89e-01 -0.201 0.152 0.062 NK_HLA L2
ENSG00000162517 PEF1 -824803 sc-eQTL 1.51e-01 -0.247 0.172 0.062 NK_HLA L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 101589 sc-eQTL 1.32e-02 0.401 0.16 0.062 NK_HLA L2
ENSG00000287510 AL137857.1 88400 sc-eQTL 6.18e-01 0.0785 0.157 0.062 NK_HLA L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -476695 sc-eQTL 3.48e-01 0.162 0.172 0.06 NK_cytokine L2
ENSG00000121753 ADGRB2 -944800 sc-eQTL 7.50e-02 0.276 0.154 0.06 NK_cytokine L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -476889 sc-eQTL 9.96e-01 -0.000729 0.134 0.06 NK_cytokine L2
ENSG00000134644 PUM1 -245898 sc-eQTL 7.77e-01 0.0413 0.145 0.06 NK_cytokine L2
ENSG00000162511 LAPTM5 62319 sc-eQTL 3.21e-01 -0.159 0.16 0.06 NK_cytokine L2
ENSG00000162517 PEF1 -824803 sc-eQTL 2.81e-01 -0.147 0.136 0.06 NK_cytokine L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 101589 sc-eQTL 7.52e-01 -0.0537 0.17 0.06 NK_cytokine L2
ENSG00000287510 AL137857.1 88400 sc-eQTL 4.70e-01 -0.114 0.158 0.06 NK_cytokine L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -476695 sc-eQTL 7.24e-02 0.337 0.186 0.07 PB L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -476889 sc-eQTL 6.32e-01 -0.105 0.218 0.07 PB L2
ENSG00000134644 PUM1 -245898 sc-eQTL 9.70e-01 -0.00722 0.19 0.07 PB L2
ENSG00000162510 MATN1 96508 sc-eQTL 7.11e-01 0.0658 0.177 0.07 PB L2
ENSG00000162511 LAPTM5 62319 sc-eQTL 9.80e-01 0.00325 0.127 0.07 PB L2
ENSG00000162517 PEF1 -824803 sc-eQTL 1.93e-01 -0.253 0.193 0.07 PB L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 101589 sc-eQTL 6.00e-01 -0.0909 0.173 0.07 PB L2
ENSG00000287510 AL137857.1 88400 sc-eQTL 3.85e-02 0.379 0.181 0.07 PB L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -476695 sc-eQTL 6.31e-01 -0.064 0.133 0.063 Pro_T L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -476889 sc-eQTL 5.11e-01 -0.111 0.169 0.063 Pro_T L2
ENSG00000134644 PUM1 -245898 sc-eQTL 7.90e-01 -0.0421 0.158 0.063 Pro_T L2
ENSG00000162511 LAPTM5 62319 sc-eQTL 1.23e-01 0.175 0.113 0.063 Pro_T L2
ENSG00000162517 PEF1 -824803 sc-eQTL 6.36e-01 0.0787 0.166 0.063 Pro_T L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 101589 sc-eQTL 5.85e-03 0.433 0.155 0.063 Pro_T L2
ENSG00000287510 AL137857.1 88400 sc-eQTL 2.23e-01 0.177 0.145 0.063 Pro_T L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -476695 sc-eQTL 7.87e-01 0.0478 0.177 0.062 Treg L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -476889 sc-eQTL 8.45e-01 -0.0335 0.171 0.062 Treg L2
ENSG00000134644 PUM1 -245898 sc-eQTL 8.31e-02 0.236 0.136 0.062 Treg L2
ENSG00000162511 LAPTM5 62319 sc-eQTL 4.57e-01 0.116 0.156 0.062 Treg L2
ENSG00000162517 PEF1 -824803 sc-eQTL 3.79e-01 0.149 0.169 0.062 Treg L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 101589 sc-eQTL 8.13e-01 -0.0377 0.159 0.062 Treg L2
ENSG00000287510 AL137857.1 88400 sc-eQTL 5.83e-01 0.0876 0.159 0.062 Treg L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -476695 sc-eQTL 7.70e-01 -0.0547 0.186 0.056 cDC L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -476889 sc-eQTL 5.39e-01 -0.124 0.202 0.056 cDC L2
ENSG00000134644 PUM1 -245898 sc-eQTL 3.16e-01 0.174 0.173 0.056 cDC L2
ENSG00000162511 LAPTM5 62319 sc-eQTL 3.22e-01 0.12 0.121 0.056 cDC L2
ENSG00000162517 PEF1 -824803 sc-eQTL 7.28e-01 0.0613 0.176 0.056 cDC L2
ENSG00000168528 SERINC2 -589472 sc-eQTL 7.38e-01 -0.0523 0.156 0.056 cDC L2
ENSG00000284543 LINC01226 -686133 sc-eQTL 8.00e-02 -0.268 0.152 0.056 cDC L2
ENSG00000287510 AL137857.1 88400 sc-eQTL 2.71e-01 0.182 0.165 0.056 cDC L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -476695 sc-eQTL 5.37e-01 -0.0897 0.145 0.062 cMono_IL1B L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -476889 sc-eQTL 9.17e-01 -0.017 0.162 0.062 cMono_IL1B L2
ENSG00000134644 PUM1 -245898 sc-eQTL 8.08e-01 -0.0266 0.11 0.062 cMono_IL1B L2
ENSG00000162511 LAPTM5 62319 sc-eQTL 8.55e-01 0.0176 0.0962 0.062 cMono_IL1B L2
ENSG00000162512 SDC3 -88665 sc-eQTL 1.68e-01 0.25 0.18 0.062 cMono_IL1B L2
ENSG00000162517 PEF1 -824803 sc-eQTL 5.44e-01 -0.0899 0.148 0.062 cMono_IL1B L2
ENSG00000168528 SERINC2 -589472 sc-eQTL 2.14e-01 0.228 0.183 0.062 cMono_IL1B L2
ENSG00000284543 LINC01226 -686133 sc-eQTL 9.32e-01 0.0138 0.162 0.062 cMono_IL1B L2
ENSG00000287510 AL137857.1 88400 sc-eQTL 8.44e-01 -0.0297 0.151 0.062 cMono_IL1B L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -476695 sc-eQTL 7.73e-01 0.0444 0.154 0.062 cMono_S100A L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -476889 sc-eQTL 1.98e-01 -0.233 0.181 0.062 cMono_S100A L2
ENSG00000134644 PUM1 -245898 sc-eQTL 3.70e-01 -0.118 0.131 0.062 cMono_S100A L2
ENSG00000162511 LAPTM5 62319 sc-eQTL 6.45e-01 0.0465 0.101 0.062 cMono_S100A L2
ENSG00000162512 SDC3 -88665 sc-eQTL 8.81e-02 0.296 0.173 0.062 cMono_S100A L2
ENSG00000162517 PEF1 -824803 sc-eQTL 6.34e-01 0.0748 0.157 0.062 cMono_S100A L2
ENSG00000168528 SERINC2 -589472 sc-eQTL 1.27e-01 0.281 0.183 0.062 cMono_S100A L2
ENSG00000284543 LINC01226 -686133 sc-eQTL 8.25e-01 -0.0331 0.15 0.062 cMono_S100A L2
ENSG00000287510 AL137857.1 88400 sc-eQTL 5.24e-01 0.0959 0.15 0.062 cMono_S100A L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -476695 sc-eQTL 6.49e-01 -0.0997 0.219 0.067 gdT L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -476889 sc-eQTL 3.09e-01 0.191 0.187 0.067 gdT L2
ENSG00000134644 PUM1 -245898 sc-eQTL 5.86e-01 0.106 0.193 0.067 gdT L2
ENSG00000162511 LAPTM5 62319 sc-eQTL 1.06e-01 0.339 0.209 0.067 gdT L2
ENSG00000162517 PEF1 -824803 sc-eQTL 9.67e-01 -0.00794 0.193 0.067 gdT L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 101589 sc-eQTL 9.57e-01 0.0105 0.194 0.067 gdT L2
ENSG00000287510 AL137857.1 88400 sc-eQTL 2.02e-01 0.24 0.187 0.067 gdT L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -476695 sc-eQTL 1.65e-01 -0.239 0.171 0.06 intMono L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -476889 sc-eQTL 4.68e-01 0.134 0.185 0.06 intMono L2
ENSG00000134644 PUM1 -245898 sc-eQTL 3.92e-01 0.134 0.157 0.06 intMono L2
ENSG00000162511 LAPTM5 62319 sc-eQTL 9.50e-01 0.00777 0.123 0.06 intMono L2
ENSG00000162512 SDC3 -88665 sc-eQTL 2.50e-01 0.194 0.168 0.06 intMono L2
ENSG00000162517 PEF1 -824803 sc-eQTL 1.18e-01 -0.276 0.176 0.06 intMono L2
ENSG00000168528 SERINC2 -589472 sc-eQTL 5.08e-02 0.344 0.175 0.06 intMono L2
ENSG00000284543 LINC01226 -686133 sc-eQTL 1.10e-01 0.266 0.166 0.06 intMono L2
ENSG00000287510 AL137857.1 88400 sc-eQTL 1.55e-01 -0.238 0.166 0.06 intMono L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -476695 sc-eQTL 9.51e-01 -0.00954 0.154 0.066 ncMono L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -476889 sc-eQTL 1.57e-01 0.233 0.164 0.066 ncMono L2
ENSG00000134644 PUM1 -245898 sc-eQTL 2.76e-01 0.147 0.134 0.066 ncMono L2
ENSG00000162511 LAPTM5 62319 sc-eQTL 4.71e-01 -0.0881 0.122 0.066 ncMono L2
ENSG00000162512 SDC3 -88665 sc-eQTL 1.69e-01 0.188 0.136 0.066 ncMono L2
ENSG00000162517 PEF1 -824803 sc-eQTL 9.61e-01 0.00764 0.157 0.066 ncMono L2
ENSG00000168528 SERINC2 -589472 sc-eQTL 3.03e-01 0.154 0.149 0.066 ncMono L2
ENSG00000284543 LINC01226 -686133 sc-eQTL 7.42e-01 0.0493 0.149 0.066 ncMono L2
ENSG00000287510 AL137857.1 88400 sc-eQTL 9.31e-01 0.0134 0.155 0.066 ncMono L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -476695 sc-eQTL 3.12e-01 0.185 0.183 0.059 pDC L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -476889 sc-eQTL 2.53e-01 -0.23 0.2 0.059 pDC L2
ENSG00000134644 PUM1 -245898 sc-eQTL 2.83e-01 -0.179 0.166 0.059 pDC L2
ENSG00000162511 LAPTM5 62319 sc-eQTL 8.63e-02 -0.265 0.153 0.059 pDC L2
ENSG00000162517 PEF1 -824803 sc-eQTL 6.55e-01 0.09 0.201 0.059 pDC L2
ENSG00000168528 SERINC2 -589472 sc-eQTL 1.25e-01 0.288 0.186 0.059 pDC L2
ENSG00000284543 LINC01226 -686133 sc-eQTL 4.24e-02 -0.295 0.144 0.059 pDC L2
ENSG00000287510 AL137857.1 88400 sc-eQTL 9.95e-01 0.00115 0.172 0.059 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000060688 SNRNP40 -476695 sc-eQTL 1.27e-01 0.274 0.179 0.062 B_Memory LOneK1K
ENSG00000121766 ZCCHC17 -476889 sc-eQTL 5.30e-01 -0.0941 0.149 0.062 B_Memory LOneK1K
ENSG00000134644 PUM1 -245898 sc-eQTL 3.36e-01 0.127 0.132 0.062 B_Memory LOneK1K
ENSG00000162510 MATN1 96508 sc-eQTL 5.95e-01 0.0805 0.151 0.062 B_Memory LOneK1K
ENSG00000162511 LAPTM5 62319 sc-eQTL 4.79e-01 0.0673 0.0949 0.062 B_Memory LOneK1K
ENSG00000162517 PEF1 -824803 sc-eQTL 5.77e-02 -0.298 0.156 0.062 B_Memory LOneK1K
ENSG00000186056 MATN1-AS1 101589 sc-eQTL 9.10e-01 0.0142 0.126 0.062 B_Memory LOneK1K
ENSG00000287510 AL137857.1 88400 sc-eQTL 5.03e-01 -0.0917 0.137 0.062 B_Memory LOneK1K
ENSG00000060688 SNRNP40 -476695 sc-eQTL 5.64e-01 -0.0945 0.164 0.062 B_Naive LOneK1K
ENSG00000121766 ZCCHC17 -476889 sc-eQTL 3.10e-01 0.131 0.129 0.062 B_Naive LOneK1K
ENSG00000134644 PUM1 -245898 sc-eQTL 4.63e-01 0.0899 0.122 0.062 B_Naive LOneK1K
ENSG00000162510 MATN1 96508 sc-eQTL 7.25e-01 0.0415 0.118 0.062 B_Naive LOneK1K
ENSG00000162511 LAPTM5 62319 sc-eQTL 8.03e-02 -0.145 0.0824 0.062 B_Naive LOneK1K
ENSG00000162517 PEF1 -824803 sc-eQTL 5.01e-01 0.102 0.151 0.062 B_Naive LOneK1K
ENSG00000186056 MATN1-AS1 101589 sc-eQTL 6.51e-01 0.0485 0.107 0.062 B_Naive LOneK1K
ENSG00000287510 AL137857.1 88400 sc-eQTL 7.09e-01 -0.0476 0.127 0.062 B_Naive LOneK1K
ENSG00000060688 SNRNP40 -476695 sc-eQTL 6.71e-01 -0.0589 0.138 0.062 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000121766 ZCCHC17 -476889 sc-eQTL 5.15e-01 -0.102 0.157 0.062 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000134644 PUM1 -245898 sc-eQTL 6.05e-01 -0.0518 0.1 0.062 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000162511 LAPTM5 62319 sc-eQTL 8.02e-01 0.0221 0.0879 0.062 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000162512 SDC3 -88665 sc-eQTL 5.05e-02 0.35 0.178 0.062 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000162517 PEF1 -824803 sc-eQTL 8.14e-01 -0.0297 0.126 0.062 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000168528 SERINC2 -589472 sc-eQTL 2.04e-01 0.235 0.184 0.062 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000284543 LINC01226 -686133 sc-eQTL 6.93e-01 -0.0598 0.151 0.062 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000287510 AL137857.1 88400 sc-eQTL 8.08e-01 0.0345 0.142 0.062 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000060688 SNRNP40 -476695 sc-eQTL 5.28e-01 -0.0947 0.15 0.062 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000121766 ZCCHC17 -476889 sc-eQTL 3.00e-01 0.17 0.164 0.062 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000134644 PUM1 -245898 sc-eQTL 2.14e-01 0.167 0.134 0.062 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000162511 LAPTM5 62319 sc-eQTL 9.84e-01 -0.00221 0.107 0.062 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000162512 SDC3 -88665 sc-eQTL 2.01e-01 0.2 0.156 0.062 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000162517 PEF1 -824803 sc-eQTL 1.49e-01 -0.206 0.142 0.062 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000168528 SERINC2 -589472 sc-eQTL 1.12e-01 0.258 0.162 0.062 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000284543 LINC01226 -686133 sc-eQTL 2.70e-01 0.17 0.154 0.062 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000287510 AL137857.1 88400 sc-eQTL 9.00e-01 -0.0195 0.155 0.062 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000060688 SNRNP40 -476695 sc-eQTL 4.02e-01 0.142 0.169 0.06 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000121753 ADGRB2 -944800 sc-eQTL 3.31e-01 0.141 0.144 0.06 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000121766 ZCCHC17 -476889 sc-eQTL 9.99e-01 0.000105 0.116 0.06 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000134644 PUM1 -245898 sc-eQTL 9.98e-01 0.000271 0.127 0.06 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000162511 LAPTM5 62319 sc-eQTL 5.38e-01 -0.0874 0.142 0.06 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000162517 PEF1 -824803 sc-eQTL 9.29e-02 -0.181 0.107 0.06 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000186056 MATN1-AS1 101589 sc-eQTL 1.86e-01 0.216 0.163 0.06 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000287510 AL137857.1 88400 sc-eQTL 3.13e-01 -0.142 0.141 0.06 NK_CD56dim LOneK1K

Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF
ENSG00000121753 ADGRB2 -944800 eQTL 3.31e-02 0.0779 0.0365 0.00143 0.0 0.0751
ENSG00000168528 SERINC2 -589472 eQTL 0.0158 0.169 0.0701 0.0 0.0 0.0751

Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina
ENSG00000186056 \N 101589 5.03e-06 5.24e-06 7.63e-07 2.96e-06 1.33e-06 1.6e-06 4.62e-06 9.96e-07 4.95e-06 2.44e-06 5.32e-06 3.45e-06 7.26e-06 2.24e-06 1.35e-06 3.34e-06 1.92e-06 3.53e-06 1.39e-06 9.5e-07 2.69e-06 4.73e-06 4.24e-06 1.36e-06 7.48e-06 1.74e-06 2.57e-06 1.84e-06 4.17e-06 4.19e-06 2.83e-06 5.93e-07 7.34e-07 1.44e-06 2.05e-06 9.97e-07 9.88e-07 5.28e-07 1.04e-06 3.8e-07 3.48e-07 5.64e-06 3.65e-07 1.8e-07 3.75e-07 5.34e-07 9.63e-07 2.11e-07 1.63e-07