logo

Genes within 1Mb (chr1:30817993:A:T):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD

Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000060688 SNRNP40 -478795 sc-eQTL 6.44e-01 -0.0604 0.131 0.088 B L1
ENSG00000121766 ZCCHC17 -478989 sc-eQTL 9.57e-01 0.00571 0.105 0.088 B L1
ENSG00000134644 PUM1 -247998 sc-eQTL 8.44e-01 0.0173 0.0879 0.088 B L1
ENSG00000162510 MATN1 94408 sc-eQTL 9.26e-01 0.0086 0.0924 0.088 B L1
ENSG00000162511 LAPTM5 60219 sc-eQTL 3.54e-01 -0.0671 0.0722 0.088 B L1
ENSG00000162517 PEF1 -826903 sc-eQTL 4.34e-01 0.0855 0.109 0.088 B L1
ENSG00000186056 MATN1-AS1 99489 sc-eQTL 5.61e-01 0.0494 0.0848 0.088 B L1
ENSG00000287510 AL137857.1 86300 sc-eQTL 4.95e-01 0.0686 0.1 0.088 B L1
ENSG00000060688 SNRNP40 -478795 sc-eQTL 2.36e-01 -0.134 0.113 0.088 CD4T L1
ENSG00000121766 ZCCHC17 -478989 sc-eQTL 5.61e-01 -0.0514 0.0882 0.088 CD4T L1
ENSG00000134644 PUM1 -247998 sc-eQTL 6.55e-01 -0.0351 0.0785 0.088 CD4T L1
ENSG00000162511 LAPTM5 60219 sc-eQTL 1.83e-01 0.116 0.0867 0.088 CD4T L1
ENSG00000162517 PEF1 -826903 sc-eQTL 2.17e-01 -0.112 0.0907 0.088 CD4T L1
ENSG00000186056 MATN1-AS1 99489 sc-eQTL 9.37e-01 0.00619 0.0779 0.088 CD4T L1
ENSG00000287510 AL137857.1 86300 sc-eQTL 9.30e-01 0.00818 0.0933 0.088 CD4T L1
ENSG00000060688 SNRNP40 -478795 sc-eQTL 3.67e-01 -0.133 0.148 0.088 CD8T L1
ENSG00000121766 ZCCHC17 -478989 sc-eQTL 3.43e-01 0.0933 0.0982 0.088 CD8T L1
ENSG00000134644 PUM1 -247998 sc-eQTL 7.55e-01 -0.027 0.0867 0.088 CD8T L1
ENSG00000162511 LAPTM5 60219 sc-eQTL 8.45e-01 0.0165 0.0842 0.088 CD8T L1
ENSG00000162517 PEF1 -826903 sc-eQTL 6.76e-01 -0.0434 0.104 0.088 CD8T L1
ENSG00000186056 MATN1-AS1 99489 sc-eQTL 7.56e-01 -0.0307 0.0986 0.088 CD8T L1
ENSG00000287510 AL137857.1 86300 sc-eQTL 9.06e-01 -0.0146 0.124 0.088 CD8T L1
ENSG00000060688 SNRNP40 -478795 sc-eQTL 1.76e-01 0.18 0.132 0.09 DC L1
ENSG00000121766 ZCCHC17 -478989 sc-eQTL 1.81e-01 -0.21 0.157 0.09 DC L1
ENSG00000134644 PUM1 -247998 sc-eQTL 3.59e-01 -0.113 0.123 0.09 DC L1
ENSG00000162511 LAPTM5 60219 sc-eQTL 5.64e-01 -0.0508 0.088 0.09 DC L1
ENSG00000162517 PEF1 -826903 sc-eQTL 5.46e-01 -0.0863 0.143 0.09 DC L1
ENSG00000168528 SERINC2 -591572 sc-eQTL 5.55e-01 0.0859 0.145 0.09 DC L1
ENSG00000284543 LINC01226 -688233 sc-eQTL 1.73e-02 -0.228 0.0948 0.09 DC L1
ENSG00000287510 AL137857.1 86300 sc-eQTL 3.12e-01 0.141 0.139 0.09 DC L1
ENSG00000060688 SNRNP40 -478795 sc-eQTL 9.91e-01 0.00123 0.103 0.088 Mono L1
ENSG00000121766 ZCCHC17 -478989 sc-eQTL 7.84e-01 -0.0352 0.128 0.088 Mono L1
ENSG00000134644 PUM1 -247998 sc-eQTL 7.59e-01 -0.0253 0.0822 0.088 Mono L1
ENSG00000162511 LAPTM5 60219 sc-eQTL 6.11e-01 -0.0385 0.0756 0.088 Mono L1
ENSG00000162512 SDC3 -90765 sc-eQTL 3.81e-02 0.3 0.144 0.088 Mono L1
ENSG00000162517 PEF1 -826903 sc-eQTL 2.00e-01 -0.131 0.102 0.088 Mono L1
ENSG00000168528 SERINC2 -591572 sc-eQTL 2.05e-01 0.198 0.155 0.088 Mono L1
ENSG00000284543 LINC01226 -688233 sc-eQTL 8.57e-01 -0.0247 0.137 0.088 Mono L1
ENSG00000287510 AL137857.1 86300 sc-eQTL 4.86e-01 0.0837 0.12 0.088 Mono L1
ENSG00000060688 SNRNP40 -478795 sc-eQTL 3.20e-01 0.142 0.143 0.088 NK L1
ENSG00000121753 ADGRB2 -946900 sc-eQTL 1.72e-01 0.168 0.123 0.088 NK L1
ENSG00000121766 ZCCHC17 -478989 sc-eQTL 8.88e-01 0.0139 0.098 0.088 NK L1
ENSG00000134644 PUM1 -247998 sc-eQTL 7.56e-01 -0.032 0.103 0.088 NK L1
ENSG00000162511 LAPTM5 60219 sc-eQTL 5.86e-01 -0.0645 0.118 0.088 NK L1
ENSG00000162517 PEF1 -826903 sc-eQTL 2.76e-01 -0.094 0.0861 0.088 NK L1
ENSG00000186056 MATN1-AS1 99489 sc-eQTL 1.16e-01 0.208 0.132 0.088 NK L1
ENSG00000287510 AL137857.1 86300 sc-eQTL 9.77e-01 0.00353 0.123 0.088 NK L1
ENSG00000060688 SNRNP40 -478795 sc-eQTL 8.65e-01 0.0187 0.11 0.088 Other_T L1
ENSG00000121766 ZCCHC17 -478989 sc-eQTL 8.59e-01 -0.0209 0.117 0.088 Other_T L1
ENSG00000134644 PUM1 -247998 sc-eQTL 4.39e-01 0.0817 0.105 0.088 Other_T L1
ENSG00000162511 LAPTM5 60219 sc-eQTL 6.26e-02 0.16 0.0857 0.088 Other_T L1
ENSG00000162517 PEF1 -826903 sc-eQTL 9.37e-01 -0.00911 0.115 0.088 Other_T L1
ENSG00000186056 MATN1-AS1 99489 sc-eQTL 2.30e-01 0.17 0.141 0.088 Other_T L1
ENSG00000287510 AL137857.1 86300 sc-eQTL 5.70e-01 0.0838 0.147 0.088 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000060688 SNRNP40 -478795 sc-eQTL 7.49e-01 0.0517 0.161 0.092 B_Activated L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -478989 sc-eQTL 8.34e-01 -0.0342 0.163 0.092 B_Activated L2
ENSG00000134644 PUM1 -247998 sc-eQTL 4.23e-02 0.305 0.149 0.092 B_Activated L2
ENSG00000162510 MATN1 94408 sc-eQTL 3.34e-01 0.128 0.132 0.092 B_Activated L2
ENSG00000162511 LAPTM5 60219 sc-eQTL 3.51e-02 0.193 0.0909 0.092 B_Activated L2
ENSG00000162517 PEF1 -826903 sc-eQTL 8.46e-01 0.0304 0.157 0.092 B_Activated L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 99489 sc-eQTL 3.28e-01 -0.145 0.148 0.092 B_Activated L2
ENSG00000287510 AL137857.1 86300 sc-eQTL 5.97e-01 0.0696 0.131 0.092 B_Activated L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -478795 sc-eQTL 5.52e-01 0.0948 0.159 0.088 B_Intermediate L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -478989 sc-eQTL 3.12e-01 0.134 0.132 0.088 B_Intermediate L2
ENSG00000134644 PUM1 -247998 sc-eQTL 2.98e-01 0.13 0.125 0.088 B_Intermediate L2
ENSG00000162510 MATN1 94408 sc-eQTL 8.08e-01 -0.0317 0.13 0.088 B_Intermediate L2
ENSG00000162511 LAPTM5 60219 sc-eQTL 5.77e-01 0.0447 0.08 0.088 B_Intermediate L2
ENSG00000162517 PEF1 -826903 sc-eQTL 6.02e-01 -0.0775 0.148 0.088 B_Intermediate L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 99489 sc-eQTL 9.08e-01 0.0131 0.112 0.088 B_Intermediate L2
ENSG00000287510 AL137857.1 86300 sc-eQTL 5.60e-01 0.0734 0.126 0.088 B_Intermediate L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -478795 sc-eQTL 4.92e-01 0.106 0.154 0.088 B_Memory L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -478989 sc-eQTL 7.50e-01 -0.0453 0.142 0.088 B_Memory L2
ENSG00000134644 PUM1 -247998 sc-eQTL 9.14e-01 -0.0133 0.124 0.088 B_Memory L2
ENSG00000162510 MATN1 94408 sc-eQTL 9.09e-01 -0.0135 0.118 0.088 B_Memory L2
ENSG00000162511 LAPTM5 60219 sc-eQTL 1.33e-01 0.157 0.104 0.088 B_Memory L2
ENSG00000162517 PEF1 -826903 sc-eQTL 1.08e-01 -0.225 0.139 0.088 B_Memory L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 99489 sc-eQTL 7.65e-01 0.0359 0.12 0.088 B_Memory L2
ENSG00000287510 AL137857.1 86300 sc-eQTL 9.18e-01 -0.0145 0.14 0.088 B_Memory L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -478795 sc-eQTL 4.53e-01 -0.106 0.142 0.088 B_Naive1 L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -478989 sc-eQTL 8.07e-01 0.0299 0.123 0.088 B_Naive1 L2
ENSG00000134644 PUM1 -247998 sc-eQTL 7.66e-01 0.0322 0.108 0.088 B_Naive1 L2
ENSG00000162510 MATN1 94408 sc-eQTL 8.61e-01 -0.0193 0.11 0.088 B_Naive1 L2
ENSG00000162511 LAPTM5 60219 sc-eQTL 2.05e-01 -0.0929 0.073 0.088 B_Naive1 L2
ENSG00000162517 PEF1 -826903 sc-eQTL 9.69e-01 -0.00503 0.129 0.088 B_Naive1 L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 99489 sc-eQTL 6.54e-01 0.0431 0.0962 0.088 B_Naive1 L2
ENSG00000287510 AL137857.1 86300 sc-eQTL 6.76e-01 0.0497 0.119 0.088 B_Naive1 L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -478795 sc-eQTL 8.54e-01 0.0276 0.15 0.088 B_Naive2 L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -478989 sc-eQTL 8.67e-01 0.0208 0.124 0.088 B_Naive2 L2
ENSG00000134644 PUM1 -247998 sc-eQTL 3.80e-01 -0.106 0.121 0.088 B_Naive2 L2
ENSG00000162510 MATN1 94408 sc-eQTL 6.64e-01 -0.0505 0.116 0.088 B_Naive2 L2
ENSG00000162511 LAPTM5 60219 sc-eQTL 8.28e-01 -0.0172 0.0789 0.088 B_Naive2 L2
ENSG00000162517 PEF1 -826903 sc-eQTL 1.05e-01 0.232 0.143 0.088 B_Naive2 L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 99489 sc-eQTL 6.66e-01 -0.0496 0.115 0.088 B_Naive2 L2
ENSG00000287510 AL137857.1 86300 sc-eQTL 2.22e-01 0.151 0.124 0.088 B_Naive2 L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -478795 sc-eQTL 7.97e-01 0.0381 0.148 0.089 CD4_CTL L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -478989 sc-eQTL 8.70e-01 -0.0238 0.145 0.089 CD4_CTL L2
ENSG00000134644 PUM1 -247998 sc-eQTL 2.22e-01 0.174 0.142 0.089 CD4_CTL L2
ENSG00000162511 LAPTM5 60219 sc-eQTL 9.14e-01 -0.0136 0.127 0.089 CD4_CTL L2
ENSG00000162517 PEF1 -826903 sc-eQTL 2.08e-01 -0.164 0.13 0.089 CD4_CTL L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 99489 sc-eQTL 8.96e-01 -0.0183 0.139 0.089 CD4_CTL L2
ENSG00000287510 AL137857.1 86300 sc-eQTL 9.57e-01 0.00663 0.123 0.089 CD4_CTL L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -478795 sc-eQTL 9.94e-01 0.000891 0.118 0.088 CD4_Naive L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -478989 sc-eQTL 4.98e-01 -0.0711 0.105 0.088 CD4_Naive L2
ENSG00000134644 PUM1 -247998 sc-eQTL 4.44e-01 -0.064 0.0835 0.088 CD4_Naive L2
ENSG00000162511 LAPTM5 60219 sc-eQTL 2.50e-01 0.103 0.0893 0.088 CD4_Naive L2
ENSG00000162517 PEF1 -826903 sc-eQTL 4.58e-01 -0.073 0.0982 0.088 CD4_Naive L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 99489 sc-eQTL 9.36e-01 -0.00731 0.0909 0.088 CD4_Naive L2
ENSG00000287510 AL137857.1 86300 sc-eQTL 3.88e-01 0.0903 0.104 0.088 CD4_Naive L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -478795 sc-eQTL 6.15e-03 -0.404 0.146 0.088 CD4_TCM L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -478989 sc-eQTL 2.58e-01 -0.135 0.119 0.088 CD4_TCM L2
ENSG00000134644 PUM1 -247998 sc-eQTL 7.29e-01 0.0367 0.106 0.088 CD4_TCM L2
ENSG00000162511 LAPTM5 60219 sc-eQTL 2.43e-01 0.103 0.0877 0.088 CD4_TCM L2
ENSG00000162517 PEF1 -826903 sc-eQTL 2.53e-01 -0.135 0.118 0.088 CD4_TCM L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 99489 sc-eQTL 9.94e-01 -0.000888 0.112 0.088 CD4_TCM L2
ENSG00000287510 AL137857.1 86300 sc-eQTL 9.39e-01 -0.00948 0.124 0.088 CD4_TCM L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -478795 sc-eQTL 2.98e-01 -0.153 0.147 0.088 CD4_TEM L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -478989 sc-eQTL 1.66e-01 0.194 0.14 0.088 CD4_TEM L2
ENSG00000134644 PUM1 -247998 sc-eQTL 1.59e-01 -0.164 0.116 0.088 CD4_TEM L2
ENSG00000162511 LAPTM5 60219 sc-eQTL 6.05e-01 0.0611 0.118 0.088 CD4_TEM L2
ENSG00000162517 PEF1 -826903 sc-eQTL 1.06e-01 -0.214 0.132 0.088 CD4_TEM L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 99489 sc-eQTL 2.47e-01 0.16 0.138 0.088 CD4_TEM L2
ENSG00000287510 AL137857.1 86300 sc-eQTL 1.82e-01 -0.182 0.136 0.088 CD4_TEM L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -478795 sc-eQTL 9.54e-01 -0.00932 0.163 0.088 CD8_CTL L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -478989 sc-eQTL 6.47e-01 -0.0573 0.125 0.088 CD8_CTL L2
ENSG00000134644 PUM1 -247998 sc-eQTL 7.96e-01 0.0314 0.121 0.088 CD8_CTL L2
ENSG00000162511 LAPTM5 60219 sc-eQTL 1.36e-01 -0.2 0.134 0.088 CD8_CTL L2
ENSG00000162517 PEF1 -826903 sc-eQTL 9.52e-01 0.0071 0.117 0.088 CD8_CTL L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 99489 sc-eQTL 3.65e-01 -0.128 0.141 0.088 CD8_CTL L2
ENSG00000287510 AL137857.1 86300 sc-eQTL 4.48e-01 -0.101 0.133 0.088 CD8_CTL L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -478795 sc-eQTL 4.58e-01 -0.11 0.148 0.088 CD8_Naive L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -478989 sc-eQTL 4.80e-01 0.0906 0.128 0.088 CD8_Naive L2
ENSG00000134644 PUM1 -247998 sc-eQTL 6.67e-01 0.0444 0.103 0.088 CD8_Naive L2
ENSG00000162511 LAPTM5 60219 sc-eQTL 1.80e-01 0.132 0.0984 0.088 CD8_Naive L2
ENSG00000162517 PEF1 -826903 sc-eQTL 3.91e-01 -0.118 0.137 0.088 CD8_Naive L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 99489 sc-eQTL 7.45e-01 0.0401 0.123 0.088 CD8_Naive L2
ENSG00000287510 AL137857.1 86300 sc-eQTL 4.39e-01 -0.104 0.134 0.088 CD8_Naive L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -478795 sc-eQTL 2.78e-01 -0.18 0.166 0.083 CD8_TCM L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -478989 sc-eQTL 2.05e-01 0.193 0.152 0.083 CD8_TCM L2
ENSG00000134644 PUM1 -247998 sc-eQTL 9.80e-01 -0.0036 0.143 0.083 CD8_TCM L2
ENSG00000162511 LAPTM5 60219 sc-eQTL 1.36e-01 -0.223 0.149 0.083 CD8_TCM L2
ENSG00000162517 PEF1 -826903 sc-eQTL 9.49e-01 -0.00984 0.153 0.083 CD8_TCM L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 99489 sc-eQTL 7.82e-01 -0.0385 0.139 0.083 CD8_TCM L2
ENSG00000287510 AL137857.1 86300 sc-eQTL 7.02e-01 -0.0538 0.14 0.083 CD8_TCM L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -478795 sc-eQTL 8.59e-01 0.0276 0.155 0.089 CD8_TEM L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -478989 sc-eQTL 2.63e-01 0.166 0.148 0.089 CD8_TEM L2
ENSG00000134644 PUM1 -247998 sc-eQTL 4.10e-01 -0.125 0.151 0.089 CD8_TEM L2
ENSG00000162511 LAPTM5 60219 sc-eQTL 6.76e-01 0.0597 0.143 0.089 CD8_TEM L2
ENSG00000162517 PEF1 -826903 sc-eQTL 7.21e-01 -0.048 0.134 0.089 CD8_TEM L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 99489 sc-eQTL 9.22e-01 -0.0146 0.148 0.089 CD8_TEM L2
ENSG00000287510 AL137857.1 86300 sc-eQTL 7.67e-02 0.236 0.133 0.089 CD8_TEM L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -478795 sc-eQTL 7.04e-02 0.279 0.153 0.089 MAIT L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -478989 sc-eQTL 1.73e-01 -0.186 0.136 0.089 MAIT L2
ENSG00000134644 PUM1 -247998 sc-eQTL 6.41e-01 0.0613 0.131 0.089 MAIT L2
ENSG00000162511 LAPTM5 60219 sc-eQTL 6.51e-01 0.0561 0.124 0.089 MAIT L2
ENSG00000162517 PEF1 -826903 sc-eQTL 9.29e-01 0.0121 0.136 0.089 MAIT L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 99489 sc-eQTL 6.74e-01 -0.0581 0.138 0.089 MAIT L2
ENSG00000287510 AL137857.1 86300 sc-eQTL 9.46e-01 0.00955 0.142 0.089 MAIT L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -478795 sc-eQTL 8.99e-01 -0.0199 0.156 0.089 NK_CD56bright L2
ENSG00000121753 ADGRB2 -946900 sc-eQTL 9.21e-01 0.0122 0.122 0.089 NK_CD56bright L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -478989 sc-eQTL 4.59e-01 -0.0979 0.132 0.089 NK_CD56bright L2
ENSG00000134644 PUM1 -247998 sc-eQTL 9.20e-01 -0.014 0.139 0.089 NK_CD56bright L2
ENSG00000162511 LAPTM5 60219 sc-eQTL 5.13e-01 -0.0895 0.137 0.089 NK_CD56bright L2
ENSG00000162517 PEF1 -826903 sc-eQTL 2.17e-01 -0.164 0.132 0.089 NK_CD56bright L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 99489 sc-eQTL 2.94e-01 0.144 0.137 0.089 NK_CD56bright L2
ENSG00000287510 AL137857.1 86300 sc-eQTL 3.78e-01 0.119 0.135 0.089 NK_CD56bright L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -478795 sc-eQTL 7.63e-01 0.0453 0.15 0.086 NK_CD56dim L2
ENSG00000121753 ADGRB2 -946900 sc-eQTL 9.79e-01 0.00347 0.132 0.086 NK_CD56dim L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -478989 sc-eQTL 5.68e-01 0.0634 0.111 0.086 NK_CD56dim L2
ENSG00000134644 PUM1 -247998 sc-eQTL 7.34e-01 -0.0387 0.114 0.086 NK_CD56dim L2
ENSG00000162511 LAPTM5 60219 sc-eQTL 8.42e-01 -0.0242 0.121 0.086 NK_CD56dim L2
ENSG00000162517 PEF1 -826903 sc-eQTL 8.46e-01 -0.021 0.108 0.086 NK_CD56dim L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 99489 sc-eQTL 1.45e-01 0.221 0.151 0.086 NK_CD56dim L2
ENSG00000287510 AL137857.1 86300 sc-eQTL 7.01e-01 -0.0482 0.125 0.086 NK_CD56dim L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -478795 sc-eQTL 1.56e-02 0.373 0.153 0.089 NK_HLA L2
ENSG00000121753 ADGRB2 -946900 sc-eQTL 8.55e-01 -0.0225 0.123 0.089 NK_HLA L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -478989 sc-eQTL 4.62e-01 0.102 0.138 0.089 NK_HLA L2
ENSG00000134644 PUM1 -247998 sc-eQTL 6.41e-01 -0.0631 0.135 0.089 NK_HLA L2
ENSG00000162511 LAPTM5 60219 sc-eQTL 4.47e-01 -0.0982 0.129 0.089 NK_HLA L2
ENSG00000162517 PEF1 -826903 sc-eQTL 6.26e-01 -0.0708 0.145 0.089 NK_HLA L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 99489 sc-eQTL 9.72e-03 0.352 0.135 0.089 NK_HLA L2
ENSG00000287510 AL137857.1 86300 sc-eQTL 5.43e-01 0.0807 0.132 0.089 NK_HLA L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -478795 sc-eQTL 3.90e-01 0.125 0.145 0.086 NK_cytokine L2
ENSG00000121753 ADGRB2 -946900 sc-eQTL 1.18e-02 0.328 0.129 0.086 NK_cytokine L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -478989 sc-eQTL 3.60e-01 -0.104 0.113 0.086 NK_cytokine L2
ENSG00000134644 PUM1 -247998 sc-eQTL 9.91e-01 -0.00134 0.122 0.086 NK_cytokine L2
ENSG00000162511 LAPTM5 60219 sc-eQTL 2.56e-01 -0.153 0.134 0.086 NK_cytokine L2
ENSG00000162517 PEF1 -826903 sc-eQTL 4.97e-01 -0.078 0.115 0.086 NK_cytokine L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 99489 sc-eQTL 8.45e-01 0.0279 0.143 0.086 NK_cytokine L2
ENSG00000287510 AL137857.1 86300 sc-eQTL 9.24e-01 -0.0127 0.133 0.086 NK_cytokine L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -478795 sc-eQTL 2.14e-01 0.197 0.158 0.1 PB L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -478989 sc-eQTL 4.22e-01 -0.148 0.183 0.1 PB L2
ENSG00000134644 PUM1 -247998 sc-eQTL 7.77e-01 -0.0453 0.16 0.1 PB L2
ENSG00000162510 MATN1 94408 sc-eQTL 9.70e-01 -0.00566 0.149 0.1 PB L2
ENSG00000162511 LAPTM5 60219 sc-eQTL 4.49e-01 -0.0807 0.106 0.1 PB L2
ENSG00000162517 PEF1 -826903 sc-eQTL 5.13e-01 -0.107 0.164 0.1 PB L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 99489 sc-eQTL 4.14e-01 -0.119 0.145 0.1 PB L2
ENSG00000287510 AL137857.1 86300 sc-eQTL 4.48e-02 0.309 0.152 0.1 PB L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -478795 sc-eQTL 7.52e-01 -0.0359 0.113 0.089 Pro_T L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -478989 sc-eQTL 6.87e-01 -0.058 0.144 0.089 Pro_T L2
ENSG00000134644 PUM1 -247998 sc-eQTL 3.97e-01 -0.114 0.134 0.089 Pro_T L2
ENSG00000162511 LAPTM5 60219 sc-eQTL 1.65e-01 0.133 0.0958 0.089 Pro_T L2
ENSG00000162517 PEF1 -826903 sc-eQTL 6.53e-01 0.0636 0.141 0.089 Pro_T L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 99489 sc-eQTL 5.17e-02 0.261 0.133 0.089 Pro_T L2
ENSG00000287510 AL137857.1 86300 sc-eQTL 2.31e-01 0.148 0.123 0.089 Pro_T L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -478795 sc-eQTL 6.74e-01 0.0634 0.151 0.088 Treg L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -478989 sc-eQTL 9.33e-01 -0.0123 0.146 0.088 Treg L2
ENSG00000134644 PUM1 -247998 sc-eQTL 2.53e-01 0.134 0.116 0.088 Treg L2
ENSG00000162511 LAPTM5 60219 sc-eQTL 3.83e-01 0.117 0.134 0.088 Treg L2
ENSG00000162517 PEF1 -826903 sc-eQTL 5.37e-01 0.0893 0.144 0.088 Treg L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 99489 sc-eQTL 3.57e-01 -0.125 0.136 0.088 Treg L2
ENSG00000287510 AL137857.1 86300 sc-eQTL 1.18e-01 0.212 0.135 0.088 Treg L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -478795 sc-eQTL 3.22e-01 0.157 0.158 0.08 cDC L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -478989 sc-eQTL 4.59e-01 -0.127 0.171 0.08 cDC L2
ENSG00000134644 PUM1 -247998 sc-eQTL 9.18e-01 0.0152 0.147 0.08 cDC L2
ENSG00000162511 LAPTM5 60219 sc-eQTL 3.37e-01 0.0992 0.103 0.08 cDC L2
ENSG00000162517 PEF1 -826903 sc-eQTL 9.07e-01 0.0175 0.149 0.08 cDC L2
ENSG00000168528 SERINC2 -591572 sc-eQTL 8.60e-01 -0.0234 0.133 0.08 cDC L2
ENSG00000284543 LINC01226 -688233 sc-eQTL 2.06e-01 -0.165 0.13 0.08 cDC L2
ENSG00000287510 AL137857.1 86300 sc-eQTL 2.89e-01 0.149 0.14 0.08 cDC L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -478795 sc-eQTL 6.87e-01 0.0494 0.123 0.088 cMono_IL1B L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -478989 sc-eQTL 8.22e-01 0.0309 0.137 0.088 cMono_IL1B L2
ENSG00000134644 PUM1 -247998 sc-eQTL 2.35e-01 -0.11 0.0923 0.088 cMono_IL1B L2
ENSG00000162511 LAPTM5 60219 sc-eQTL 6.11e-01 -0.0413 0.0812 0.088 cMono_IL1B L2
ENSG00000162512 SDC3 -90765 sc-eQTL 7.47e-01 0.0494 0.153 0.088 cMono_IL1B L2
ENSG00000162517 PEF1 -826903 sc-eQTL 7.85e-01 -0.0342 0.125 0.088 cMono_IL1B L2
ENSG00000168528 SERINC2 -591572 sc-eQTL 8.60e-02 0.265 0.154 0.088 cMono_IL1B L2
ENSG00000284543 LINC01226 -688233 sc-eQTL 8.58e-01 0.0246 0.137 0.088 cMono_IL1B L2
ENSG00000287510 AL137857.1 86300 sc-eQTL 8.15e-01 0.03 0.128 0.088 cMono_IL1B L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -478795 sc-eQTL 8.04e-01 0.0319 0.129 0.088 cMono_S100A L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -478989 sc-eQTL 8.31e-02 -0.263 0.151 0.088 cMono_S100A L2
ENSG00000134644 PUM1 -247998 sc-eQTL 7.18e-01 -0.0397 0.11 0.088 cMono_S100A L2
ENSG00000162511 LAPTM5 60219 sc-eQTL 7.78e-01 -0.0239 0.0844 0.088 cMono_S100A L2
ENSG00000162512 SDC3 -90765 sc-eQTL 1.52e-01 0.209 0.145 0.088 cMono_S100A L2
ENSG00000162517 PEF1 -826903 sc-eQTL 3.64e-01 0.12 0.131 0.088 cMono_S100A L2
ENSG00000168528 SERINC2 -591572 sc-eQTL 8.86e-02 0.262 0.153 0.088 cMono_S100A L2
ENSG00000284543 LINC01226 -688233 sc-eQTL 1.96e-01 -0.162 0.125 0.088 cMono_S100A L2
ENSG00000287510 AL137857.1 86300 sc-eQTL 8.14e-01 0.0297 0.126 0.088 cMono_S100A L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -478795 sc-eQTL 7.89e-01 -0.0499 0.186 0.094 gdT L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -478989 sc-eQTL 3.20e-01 0.159 0.159 0.094 gdT L2
ENSG00000134644 PUM1 -247998 sc-eQTL 7.99e-01 0.042 0.165 0.094 gdT L2
ENSG00000162511 LAPTM5 60219 sc-eQTL 3.19e-01 0.178 0.178 0.094 gdT L2
ENSG00000162517 PEF1 -826903 sc-eQTL 9.38e-01 0.0127 0.164 0.094 gdT L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 99489 sc-eQTL 5.63e-01 0.0957 0.165 0.094 gdT L2
ENSG00000287510 AL137857.1 86300 sc-eQTL 7.18e-02 0.287 0.158 0.094 gdT L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -478795 sc-eQTL 9.57e-01 -0.00813 0.15 0.084 intMono L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -478989 sc-eQTL 5.57e-01 0.0951 0.162 0.084 intMono L2
ENSG00000134644 PUM1 -247998 sc-eQTL 2.88e-01 0.146 0.137 0.084 intMono L2
ENSG00000162511 LAPTM5 60219 sc-eQTL 2.37e-01 -0.127 0.107 0.084 intMono L2
ENSG00000162512 SDC3 -90765 sc-eQTL 2.41e-01 0.173 0.147 0.084 intMono L2
ENSG00000162517 PEF1 -826903 sc-eQTL 7.79e-02 -0.272 0.154 0.084 intMono L2
ENSG00000168528 SERINC2 -591572 sc-eQTL 9.09e-02 0.26 0.153 0.084 intMono L2
ENSG00000284543 LINC01226 -688233 sc-eQTL 3.75e-01 0.13 0.146 0.084 intMono L2
ENSG00000287510 AL137857.1 86300 sc-eQTL 2.52e-01 -0.167 0.146 0.084 intMono L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -478795 sc-eQTL 9.83e-01 0.00275 0.13 0.093 ncMono L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -478989 sc-eQTL 5.53e-02 0.265 0.137 0.093 ncMono L2
ENSG00000134644 PUM1 -247998 sc-eQTL 5.19e-01 0.0731 0.113 0.093 ncMono L2
ENSG00000162511 LAPTM5 60219 sc-eQTL 7.73e-02 -0.181 0.102 0.093 ncMono L2
ENSG00000162512 SDC3 -90765 sc-eQTL 2.98e-01 0.12 0.115 0.093 ncMono L2
ENSG00000162517 PEF1 -826903 sc-eQTL 9.43e-01 -0.00943 0.132 0.093 ncMono L2
ENSG00000168528 SERINC2 -591572 sc-eQTL 1.47e-01 0.182 0.125 0.093 ncMono L2
ENSG00000284543 LINC01226 -688233 sc-eQTL 4.11e-01 0.103 0.125 0.093 ncMono L2
ENSG00000287510 AL137857.1 86300 sc-eQTL 6.26e-01 0.0635 0.13 0.093 ncMono L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -478795 sc-eQTL 3.84e-01 0.132 0.151 0.09 pDC L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -478989 sc-eQTL 1.52e-02 -0.4 0.163 0.09 pDC L2
ENSG00000134644 PUM1 -247998 sc-eQTL 1.02e-01 -0.225 0.137 0.09 pDC L2
ENSG00000162511 LAPTM5 60219 sc-eQTL 1.74e-01 -0.174 0.127 0.09 pDC L2
ENSG00000162517 PEF1 -826903 sc-eQTL 6.40e-01 0.0779 0.166 0.09 pDC L2
ENSG00000168528 SERINC2 -591572 sc-eQTL 2.78e-01 0.169 0.155 0.09 pDC L2
ENSG00000284543 LINC01226 -688233 sc-eQTL 2.92e-02 -0.261 0.119 0.09 pDC L2
ENSG00000287510 AL137857.1 86300 sc-eQTL 4.97e-01 0.0964 0.142 0.09 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000060688 SNRNP40 -478795 sc-eQTL 2.34e-01 0.181 0.152 0.088 B_Memory LOneK1K
ENSG00000121766 ZCCHC17 -478989 sc-eQTL 9.34e-01 -0.0105 0.127 0.088 B_Memory LOneK1K
ENSG00000134644 PUM1 -247998 sc-eQTL 3.41e-01 0.107 0.112 0.088 B_Memory LOneK1K
ENSG00000162510 MATN1 94408 sc-eQTL 6.52e-01 0.0579 0.128 0.088 B_Memory LOneK1K
ENSG00000162511 LAPTM5 60219 sc-eQTL 1.95e-01 0.104 0.0802 0.088 B_Memory LOneK1K
ENSG00000162517 PEF1 -826903 sc-eQTL 1.10e-01 -0.213 0.133 0.088 B_Memory LOneK1K
ENSG00000186056 MATN1-AS1 99489 sc-eQTL 8.09e-01 0.0258 0.106 0.088 B_Memory LOneK1K
ENSG00000287510 AL137857.1 86300 sc-eQTL 8.20e-01 -0.0264 0.116 0.088 B_Memory LOneK1K
ENSG00000060688 SNRNP40 -478795 sc-eQTL 7.81e-01 -0.0385 0.138 0.088 B_Naive LOneK1K
ENSG00000121766 ZCCHC17 -478989 sc-eQTL 9.09e-01 0.0125 0.109 0.088 B_Naive LOneK1K
ENSG00000134644 PUM1 -247998 sc-eQTL 7.25e-01 -0.0363 0.103 0.088 B_Naive LOneK1K
ENSG00000162510 MATN1 94408 sc-eQTL 9.17e-01 -0.0104 0.0993 0.088 B_Naive LOneK1K
ENSG00000162511 LAPTM5 60219 sc-eQTL 2.40e-01 -0.0821 0.0697 0.088 B_Naive LOneK1K
ENSG00000162517 PEF1 -826903 sc-eQTL 2.86e-01 0.136 0.127 0.088 B_Naive LOneK1K
ENSG00000186056 MATN1-AS1 99489 sc-eQTL 5.44e-01 0.0548 0.0902 0.088 B_Naive LOneK1K
ENSG00000287510 AL137857.1 86300 sc-eQTL 9.04e-01 -0.013 0.107 0.088 B_Naive LOneK1K
ENSG00000060688 SNRNP40 -478795 sc-eQTL 9.44e-01 -0.0083 0.117 0.088 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000121766 ZCCHC17 -478989 sc-eQTL 4.42e-01 -0.102 0.133 0.088 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000134644 PUM1 -247998 sc-eQTL 4.24e-01 -0.0678 0.0846 0.088 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000162511 LAPTM5 60219 sc-eQTL 6.63e-01 -0.0325 0.0744 0.088 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000162512 SDC3 -90765 sc-eQTL 2.03e-01 0.193 0.151 0.088 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000162517 PEF1 -826903 sc-eQTL 9.19e-01 0.0109 0.107 0.088 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000168528 SERINC2 -591572 sc-eQTL 1.21e-01 0.242 0.155 0.088 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000284543 LINC01226 -688233 sc-eQTL 4.38e-01 -0.0994 0.128 0.088 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000287510 AL137857.1 86300 sc-eQTL 6.38e-01 0.0565 0.12 0.088 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000060688 SNRNP40 -478795 sc-eQTL 8.51e-01 0.0238 0.127 0.088 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000121766 ZCCHC17 -478989 sc-eQTL 4.52e-01 0.105 0.139 0.088 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000134644 PUM1 -247998 sc-eQTL 1.79e-01 0.153 0.114 0.088 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000162511 LAPTM5 60219 sc-eQTL 1.41e-01 -0.134 0.0908 0.088 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000162512 SDC3 -90765 sc-eQTL 3.51e-01 0.124 0.133 0.088 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000162517 PEF1 -826903 sc-eQTL 5.41e-02 -0.232 0.12 0.088 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000168528 SERINC2 -591572 sc-eQTL 1.30e-01 0.209 0.137 0.088 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000284543 LINC01226 -688233 sc-eQTL 3.60e-01 0.12 0.131 0.088 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000287510 AL137857.1 86300 sc-eQTL 9.68e-01 0.00523 0.131 0.088 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000060688 SNRNP40 -478795 sc-eQTL 2.74e-01 0.157 0.143 0.086 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000121753 ADGRB2 -946900 sc-eQTL 1.72e-01 0.167 0.122 0.086 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000121766 ZCCHC17 -478989 sc-eQTL 9.38e-01 0.00764 0.098 0.086 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000134644 PUM1 -247998 sc-eQTL 5.68e-01 -0.0613 0.107 0.086 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000162511 LAPTM5 60219 sc-eQTL 6.96e-01 -0.047 0.12 0.086 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000162517 PEF1 -826903 sc-eQTL 3.43e-01 -0.0865 0.091 0.086 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000186056 MATN1-AS1 99489 sc-eQTL 1.99e-01 0.178 0.138 0.086 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000287510 AL137857.1 86300 sc-eQTL 9.01e-01 0.0149 0.119 0.086 NK_CD56dim LOneK1K

Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF
ENSG00000162511 LAPTM5 60219 eQTL 0.0151 -0.0402 0.0165 0.0 0.0 0.0942
ENSG00000168528 SERINC2 -591572 eQTL 0.000428 0.225 0.0635 0.0 0.0 0.0942

Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina
ENSG00000168528 SERINC2 -591572 3.62e-07 1.76e-07 6.57e-08 2.28e-07 1.08e-07 8.85e-08 2.63e-07 6.57e-08 1.94e-07 1.11e-07 2.04e-07 1.59e-07 2.94e-07 8.44e-08 6.6e-08 1.01e-07 5.57e-08 2.21e-07 7.27e-08 7.05e-08 1.27e-07 1.89e-07 1.73e-07 3.27e-08 2.48e-07 1.65e-07 1.25e-07 1.44e-07 1.34e-07 1.39e-07 1.27e-07 4.71e-08 4.16e-08 1.02e-07 6.25e-08 3.94e-08 6.14e-08 7.1e-08 5.78e-08 7.17e-08 4.79e-08 1.63e-07 3.4e-08 1.08e-08 4.36e-08 9.65e-09 7.66e-08 0.0 4.72e-08