logo

Genes within 1Mb (chr1:30814984:C:T):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD

Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000060688 SNRNP40 -481804 sc-eQTL 5.86e-01 -0.0535 0.0981 0.207 B L1
ENSG00000121766 ZCCHC17 -481998 sc-eQTL 6.62e-01 -0.0344 0.0786 0.207 B L1
ENSG00000134644 PUM1 -251007 sc-eQTL 1.14e-01 -0.104 0.0656 0.207 B L1
ENSG00000162510 MATN1 91399 sc-eQTL 6.79e-01 0.0287 0.0693 0.207 B L1
ENSG00000162511 LAPTM5 57210 sc-eQTL 7.66e-02 0.0959 0.0539 0.207 B L1
ENSG00000162517 PEF1 -829912 sc-eQTL 4.05e-01 -0.0683 0.0818 0.207 B L1
ENSG00000186056 MATN1-AS1 96480 sc-eQTL 1.18e-01 0.0992 0.0633 0.207 B L1
ENSG00000287510 AL137857.1 83291 sc-eQTL 7.85e-01 0.0206 0.0753 0.207 B L1
ENSG00000060688 SNRNP40 -481804 sc-eQTL 6.26e-01 0.0412 0.0844 0.207 CD4T L1
ENSG00000121766 ZCCHC17 -481998 sc-eQTL 5.23e-01 0.0422 0.0659 0.207 CD4T L1
ENSG00000134644 PUM1 -251007 sc-eQTL 5.38e-01 -0.0362 0.0587 0.207 CD4T L1
ENSG00000162511 LAPTM5 57210 sc-eQTL 3.43e-01 0.0618 0.065 0.207 CD4T L1
ENSG00000162517 PEF1 -829912 sc-eQTL 7.70e-01 -0.0199 0.0681 0.207 CD4T L1
ENSG00000186056 MATN1-AS1 96480 sc-eQTL 7.25e-01 0.0206 0.0582 0.207 CD4T L1
ENSG00000287510 AL137857.1 83291 sc-eQTL 7.79e-01 -0.0196 0.0698 0.207 CD4T L1
ENSG00000060688 SNRNP40 -481804 sc-eQTL 6.71e-01 -0.0474 0.111 0.207 CD8T L1
ENSG00000121766 ZCCHC17 -481998 sc-eQTL 1.54e-01 -0.106 0.0738 0.207 CD8T L1
ENSG00000134644 PUM1 -251007 sc-eQTL 6.53e-01 -0.0294 0.0653 0.207 CD8T L1
ENSG00000162511 LAPTM5 57210 sc-eQTL 1.66e-02 0.151 0.0626 0.207 CD8T L1
ENSG00000162517 PEF1 -829912 sc-eQTL 8.23e-01 -0.0175 0.0781 0.207 CD8T L1
ENSG00000186056 MATN1-AS1 96480 sc-eQTL 8.23e-02 0.129 0.0738 0.207 CD8T L1
ENSG00000287510 AL137857.1 83291 sc-eQTL 6.95e-01 -0.0367 0.0934 0.207 CD8T L1
ENSG00000060688 SNRNP40 -481804 sc-eQTL 9.15e-01 0.0108 0.1 0.212 DC L1
ENSG00000121766 ZCCHC17 -481998 sc-eQTL 5.59e-01 -0.0695 0.119 0.212 DC L1
ENSG00000134644 PUM1 -251007 sc-eQTL 8.15e-01 -0.0219 0.0932 0.212 DC L1
ENSG00000162511 LAPTM5 57210 sc-eQTL 5.15e-01 -0.0433 0.0665 0.212 DC L1
ENSG00000162517 PEF1 -829912 sc-eQTL 8.07e-02 0.188 0.107 0.212 DC L1
ENSG00000168528 SERINC2 -594581 sc-eQTL 5.98e-01 -0.0579 0.11 0.212 DC L1
ENSG00000284543 LINC01226 -691242 sc-eQTL 4.48e-02 0.145 0.072 0.212 DC L1
ENSG00000287510 AL137857.1 83291 sc-eQTL 2.21e-01 0.129 0.105 0.212 DC L1
ENSG00000060688 SNRNP40 -481804 sc-eQTL 3.38e-01 -0.074 0.0772 0.207 Mono L1
ENSG00000121766 ZCCHC17 -481998 sc-eQTL 9.20e-02 -0.161 0.0952 0.207 Mono L1
ENSG00000134644 PUM1 -251007 sc-eQTL 6.91e-01 -0.0245 0.0614 0.207 Mono L1
ENSG00000162511 LAPTM5 57210 sc-eQTL 9.55e-01 -0.00323 0.0565 0.207 Mono L1
ENSG00000162512 SDC3 -93774 sc-eQTL 8.46e-02 -0.187 0.108 0.207 Mono L1
ENSG00000162517 PEF1 -829912 sc-eQTL 1.10e-01 -0.122 0.0758 0.207 Mono L1
ENSG00000168528 SERINC2 -594581 sc-eQTL 3.17e-01 0.117 0.116 0.207 Mono L1
ENSG00000284543 LINC01226 -691242 sc-eQTL 6.97e-02 -0.186 0.102 0.207 Mono L1
ENSG00000287510 AL137857.1 83291 sc-eQTL 3.58e-01 -0.0825 0.0896 0.207 Mono L1
ENSG00000060688 SNRNP40 -481804 sc-eQTL 5.31e-01 -0.0667 0.106 0.208 NK L1
ENSG00000121753 ADGRB2 -949909 sc-eQTL 6.16e-01 0.046 0.0915 0.208 NK L1
ENSG00000121766 ZCCHC17 -481998 sc-eQTL 4.49e-01 -0.0552 0.0727 0.208 NK L1
ENSG00000134644 PUM1 -251007 sc-eQTL 2.20e-01 -0.0936 0.0761 0.208 NK L1
ENSG00000162511 LAPTM5 57210 sc-eQTL 1.25e-01 0.135 0.0874 0.208 NK L1
ENSG00000162517 PEF1 -829912 sc-eQTL 2.53e-01 0.0733 0.064 0.208 NK L1
ENSG00000186056 MATN1-AS1 96480 sc-eQTL 4.32e-01 0.0777 0.0986 0.208 NK L1
ENSG00000287510 AL137857.1 83291 sc-eQTL 6.24e-01 -0.0447 0.0911 0.208 NK L1
ENSG00000060688 SNRNP40 -481804 sc-eQTL 8.95e-01 -0.0106 0.0804 0.207 Other_T L1
ENSG00000121766 ZCCHC17 -481998 sc-eQTL 2.57e-01 -0.0973 0.0856 0.207 Other_T L1
ENSG00000134644 PUM1 -251007 sc-eQTL 6.87e-01 0.0312 0.0772 0.207 Other_T L1
ENSG00000162511 LAPTM5 57210 sc-eQTL 8.97e-01 -0.00819 0.0633 0.207 Other_T L1
ENSG00000162517 PEF1 -829912 sc-eQTL 4.67e-01 -0.0615 0.0844 0.207 Other_T L1
ENSG00000186056 MATN1-AS1 96480 sc-eQTL 8.92e-01 -0.0141 0.104 0.207 Other_T L1
ENSG00000287510 AL137857.1 83291 sc-eQTL 6.02e-01 -0.0563 0.108 0.207 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000060688 SNRNP40 -481804 sc-eQTL 9.97e-01 0.000459 0.125 0.209 B_Activated L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -481998 sc-eQTL 3.94e-01 0.108 0.126 0.209 B_Activated L2
ENSG00000134644 PUM1 -251007 sc-eQTL 7.63e-01 -0.0355 0.117 0.209 B_Activated L2
ENSG00000162510 MATN1 91399 sc-eQTL 5.55e-01 0.0605 0.102 0.209 B_Activated L2
ENSG00000162511 LAPTM5 57210 sc-eQTL 7.59e-01 -0.022 0.0715 0.209 B_Activated L2
ENSG00000162517 PEF1 -829912 sc-eQTL 2.32e-01 -0.145 0.121 0.209 B_Activated L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 96480 sc-eQTL 3.52e-01 -0.107 0.115 0.209 B_Activated L2
ENSG00000287510 AL137857.1 83291 sc-eQTL 4.59e-01 -0.0757 0.102 0.209 B_Activated L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -481804 sc-eQTL 6.04e-01 0.062 0.119 0.206 B_Intermediate L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -481998 sc-eQTL 7.78e-01 -0.0281 0.0996 0.206 B_Intermediate L2
ENSG00000134644 PUM1 -251007 sc-eQTL 2.71e-01 -0.104 0.0937 0.206 B_Intermediate L2
ENSG00000162510 MATN1 91399 sc-eQTL 1.85e-01 -0.129 0.0974 0.206 B_Intermediate L2
ENSG00000162511 LAPTM5 57210 sc-eQTL 3.75e-01 0.0533 0.0599 0.206 B_Intermediate L2
ENSG00000162517 PEF1 -829912 sc-eQTL 7.31e-01 -0.0383 0.111 0.206 B_Intermediate L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 96480 sc-eQTL 8.33e-01 -0.0178 0.0842 0.206 B_Intermediate L2
ENSG00000287510 AL137857.1 83291 sc-eQTL 1.52e-01 0.135 0.0938 0.206 B_Intermediate L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -481804 sc-eQTL 6.91e-01 -0.0465 0.117 0.209 B_Memory L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -481998 sc-eQTL 7.51e-01 -0.0341 0.107 0.209 B_Memory L2
ENSG00000134644 PUM1 -251007 sc-eQTL 1.34e-01 -0.14 0.093 0.209 B_Memory L2
ENSG00000162510 MATN1 91399 sc-eQTL 7.36e-01 -0.0302 0.0894 0.209 B_Memory L2
ENSG00000162511 LAPTM5 57210 sc-eQTL 5.80e-01 0.0439 0.0792 0.209 B_Memory L2
ENSG00000162517 PEF1 -829912 sc-eQTL 8.57e-01 -0.0191 0.106 0.209 B_Memory L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 96480 sc-eQTL 6.13e-02 0.169 0.09 0.209 B_Memory L2
ENSG00000287510 AL137857.1 83291 sc-eQTL 1.74e-01 -0.144 0.106 0.209 B_Memory L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -481804 sc-eQTL 5.54e-02 -0.204 0.106 0.207 B_Naive1 L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -481998 sc-eQTL 6.51e-01 -0.0419 0.0923 0.207 B_Naive1 L2
ENSG00000134644 PUM1 -251007 sc-eQTL 9.48e-01 -0.0053 0.0815 0.207 B_Naive1 L2
ENSG00000162510 MATN1 91399 sc-eQTL 2.82e-01 0.0889 0.0825 0.207 B_Naive1 L2
ENSG00000162511 LAPTM5 57210 sc-eQTL 6.57e-02 0.101 0.0548 0.207 B_Naive1 L2
ENSG00000162517 PEF1 -829912 sc-eQTL 8.14e-01 0.023 0.0974 0.207 B_Naive1 L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 96480 sc-eQTL 1.28e-01 0.11 0.0722 0.207 B_Naive1 L2
ENSG00000287510 AL137857.1 83291 sc-eQTL 5.76e-01 -0.0501 0.0895 0.207 B_Naive1 L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -481804 sc-eQTL 3.13e-01 0.114 0.113 0.208 B_Naive2 L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -481998 sc-eQTL 1.25e-01 -0.143 0.093 0.208 B_Naive2 L2
ENSG00000134644 PUM1 -251007 sc-eQTL 4.31e-01 -0.0721 0.0914 0.208 B_Naive2 L2
ENSG00000162510 MATN1 91399 sc-eQTL 9.11e-01 0.00981 0.0878 0.208 B_Naive2 L2
ENSG00000162511 LAPTM5 57210 sc-eQTL 1.10e-01 0.0952 0.0593 0.208 B_Naive2 L2
ENSG00000162517 PEF1 -829912 sc-eQTL 9.17e-01 -0.0113 0.109 0.208 B_Naive2 L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 96480 sc-eQTL 8.66e-01 0.0147 0.0868 0.208 B_Naive2 L2
ENSG00000287510 AL137857.1 83291 sc-eQTL 5.23e-01 0.06 0.0937 0.208 B_Naive2 L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -481804 sc-eQTL 4.20e-01 -0.0908 0.112 0.207 CD4_CTL L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -481998 sc-eQTL 9.00e-01 0.0139 0.111 0.207 CD4_CTL L2
ENSG00000134644 PUM1 -251007 sc-eQTL 3.56e-01 -0.1 0.108 0.207 CD4_CTL L2
ENSG00000162511 LAPTM5 57210 sc-eQTL 8.18e-02 0.168 0.096 0.207 CD4_CTL L2
ENSG00000162517 PEF1 -829912 sc-eQTL 2.17e-01 0.122 0.0987 0.207 CD4_CTL L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 96480 sc-eQTL 8.83e-01 0.0156 0.106 0.207 CD4_CTL L2
ENSG00000287510 AL137857.1 83291 sc-eQTL 3.56e-01 -0.0861 0.0931 0.207 CD4_CTL L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -481804 sc-eQTL 8.15e-01 -0.0206 0.0882 0.207 CD4_Naive L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -481998 sc-eQTL 7.36e-01 -0.0264 0.0782 0.207 CD4_Naive L2
ENSG00000134644 PUM1 -251007 sc-eQTL 6.96e-01 -0.0244 0.0624 0.207 CD4_Naive L2
ENSG00000162511 LAPTM5 57210 sc-eQTL 8.37e-01 -0.0138 0.0669 0.207 CD4_Naive L2
ENSG00000162517 PEF1 -829912 sc-eQTL 3.71e-01 -0.0657 0.0732 0.207 CD4_Naive L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 96480 sc-eQTL 9.27e-01 0.00621 0.0679 0.207 CD4_Naive L2
ENSG00000287510 AL137857.1 83291 sc-eQTL 8.23e-01 -0.0175 0.078 0.207 CD4_Naive L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -481804 sc-eQTL 9.52e-01 -0.00669 0.111 0.207 CD4_TCM L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -481998 sc-eQTL 6.60e-02 0.164 0.0885 0.207 CD4_TCM L2
ENSG00000134644 PUM1 -251007 sc-eQTL 8.98e-01 -0.0101 0.079 0.207 CD4_TCM L2
ENSG00000162511 LAPTM5 57210 sc-eQTL 2.77e-01 0.0712 0.0653 0.207 CD4_TCM L2
ENSG00000162517 PEF1 -829912 sc-eQTL 8.51e-01 0.0165 0.0878 0.207 CD4_TCM L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 96480 sc-eQTL 7.62e-01 -0.0252 0.0831 0.207 CD4_TCM L2
ENSG00000287510 AL137857.1 83291 sc-eQTL 1.95e-01 0.12 0.0922 0.207 CD4_TCM L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -481804 sc-eQTL 5.90e-01 0.0598 0.111 0.207 CD4_TEM L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -481998 sc-eQTL 9.32e-01 -0.00904 0.106 0.207 CD4_TEM L2
ENSG00000134644 PUM1 -251007 sc-eQTL 4.13e-01 -0.0721 0.0878 0.207 CD4_TEM L2
ENSG00000162511 LAPTM5 57210 sc-eQTL 5.79e-02 0.168 0.0882 0.207 CD4_TEM L2
ENSG00000162517 PEF1 -829912 sc-eQTL 6.56e-01 0.0444 0.0996 0.207 CD4_TEM L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 96480 sc-eQTL 1.30e-01 -0.157 0.104 0.207 CD4_TEM L2
ENSG00000287510 AL137857.1 83291 sc-eQTL 3.74e-01 0.0912 0.102 0.207 CD4_TEM L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -481804 sc-eQTL 8.47e-01 0.0232 0.121 0.207 CD8_CTL L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -481998 sc-eQTL 4.81e-02 -0.182 0.0916 0.207 CD8_CTL L2
ENSG00000134644 PUM1 -251007 sc-eQTL 9.28e-01 -0.00818 0.0898 0.207 CD8_CTL L2
ENSG00000162511 LAPTM5 57210 sc-eQTL 6.30e-02 0.184 0.0986 0.207 CD8_CTL L2
ENSG00000162517 PEF1 -829912 sc-eQTL 2.88e-01 0.0919 0.0864 0.207 CD8_CTL L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 96480 sc-eQTL 6.17e-01 0.0524 0.104 0.207 CD8_CTL L2
ENSG00000287510 AL137857.1 83291 sc-eQTL 5.48e-01 -0.0592 0.0982 0.207 CD8_CTL L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -481804 sc-eQTL 7.03e-01 0.0421 0.11 0.207 CD8_Naive L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -481998 sc-eQTL 1.31e-01 -0.144 0.0948 0.207 CD8_Naive L2
ENSG00000134644 PUM1 -251007 sc-eQTL 8.21e-01 -0.0174 0.0767 0.207 CD8_Naive L2
ENSG00000162511 LAPTM5 57210 sc-eQTL 9.62e-01 -0.00355 0.0735 0.207 CD8_Naive L2
ENSG00000162517 PEF1 -829912 sc-eQTL 6.34e-01 -0.0487 0.102 0.207 CD8_Naive L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 96480 sc-eQTL 3.93e-01 0.0783 0.0916 0.207 CD8_Naive L2
ENSG00000287510 AL137857.1 83291 sc-eQTL 7.63e-01 -0.0301 0.0998 0.207 CD8_Naive L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -481804 sc-eQTL 7.45e-01 0.0396 0.122 0.211 CD8_TCM L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -481998 sc-eQTL 5.75e-01 -0.0627 0.112 0.211 CD8_TCM L2
ENSG00000134644 PUM1 -251007 sc-eQTL 7.14e-01 -0.0385 0.105 0.211 CD8_TCM L2
ENSG00000162511 LAPTM5 57210 sc-eQTL 4.92e-01 0.0756 0.11 0.211 CD8_TCM L2
ENSG00000162517 PEF1 -829912 sc-eQTL 7.54e-01 0.0352 0.112 0.211 CD8_TCM L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 96480 sc-eQTL 8.94e-02 -0.172 0.101 0.211 CD8_TCM L2
ENSG00000287510 AL137857.1 83291 sc-eQTL 2.98e-01 0.107 0.103 0.211 CD8_TCM L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -481804 sc-eQTL 4.14e-01 -0.0941 0.115 0.215 CD8_TEM L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -481998 sc-eQTL 4.28e-01 -0.0874 0.11 0.215 CD8_TEM L2
ENSG00000134644 PUM1 -251007 sc-eQTL 2.73e-01 0.124 0.112 0.215 CD8_TEM L2
ENSG00000162511 LAPTM5 57210 sc-eQTL 7.37e-01 0.0356 0.106 0.215 CD8_TEM L2
ENSG00000162517 PEF1 -829912 sc-eQTL 8.63e-02 -0.171 0.0991 0.215 CD8_TEM L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 96480 sc-eQTL 3.60e-01 0.101 0.11 0.215 CD8_TEM L2
ENSG00000287510 AL137857.1 83291 sc-eQTL 3.26e-01 -0.0979 0.0994 0.215 CD8_TEM L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -481804 sc-eQTL 5.84e-02 -0.221 0.116 0.21 MAIT L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -481998 sc-eQTL 7.82e-02 -0.182 0.103 0.21 MAIT L2
ENSG00000134644 PUM1 -251007 sc-eQTL 3.76e-01 0.0879 0.0991 0.21 MAIT L2
ENSG00000162511 LAPTM5 57210 sc-eQTL 9.60e-01 0.00469 0.0936 0.21 MAIT L2
ENSG00000162517 PEF1 -829912 sc-eQTL 7.26e-02 -0.184 0.102 0.21 MAIT L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 96480 sc-eQTL 3.46e-01 0.0983 0.104 0.21 MAIT L2
ENSG00000287510 AL137857.1 83291 sc-eQTL 5.76e-01 -0.0602 0.107 0.21 MAIT L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -481804 sc-eQTL 8.66e-01 0.0203 0.12 0.209 NK_CD56bright L2
ENSG00000121753 ADGRB2 -949909 sc-eQTL 4.53e-01 -0.0704 0.0936 0.209 NK_CD56bright L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -481998 sc-eQTL 6.33e-01 0.0484 0.101 0.209 NK_CD56bright L2
ENSG00000134644 PUM1 -251007 sc-eQTL 5.56e-02 -0.203 0.105 0.209 NK_CD56bright L2
ENSG00000162511 LAPTM5 57210 sc-eQTL 7.53e-01 -0.033 0.105 0.209 NK_CD56bright L2
ENSG00000162517 PEF1 -829912 sc-eQTL 7.80e-02 0.179 0.101 0.209 NK_CD56bright L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 96480 sc-eQTL 1.40e-02 -0.257 0.104 0.209 NK_CD56bright L2
ENSG00000287510 AL137857.1 83291 sc-eQTL 2.99e-01 -0.108 0.103 0.209 NK_CD56bright L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -481804 sc-eQTL 9.69e-01 -0.00436 0.113 0.209 NK_CD56dim L2
ENSG00000121753 ADGRB2 -949909 sc-eQTL 6.60e-01 0.0436 0.099 0.209 NK_CD56dim L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -481998 sc-eQTL 4.36e-01 -0.0648 0.0831 0.209 NK_CD56dim L2
ENSG00000134644 PUM1 -251007 sc-eQTL 5.25e-01 -0.0543 0.0853 0.209 NK_CD56dim L2
ENSG00000162511 LAPTM5 57210 sc-eQTL 2.04e-01 0.116 0.0907 0.209 NK_CD56dim L2
ENSG00000162517 PEF1 -829912 sc-eQTL 4.47e-01 0.0616 0.0809 0.209 NK_CD56dim L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 96480 sc-eQTL 4.86e-01 0.0796 0.114 0.209 NK_CD56dim L2
ENSG00000287510 AL137857.1 83291 sc-eQTL 4.39e-01 -0.0728 0.094 0.209 NK_CD56dim L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -481804 sc-eQTL 6.46e-01 -0.0551 0.12 0.215 NK_HLA L2
ENSG00000121753 ADGRB2 -949909 sc-eQTL 3.33e-01 0.092 0.0948 0.215 NK_HLA L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -481998 sc-eQTL 8.94e-01 -0.0142 0.107 0.215 NK_HLA L2
ENSG00000134644 PUM1 -251007 sc-eQTL 8.55e-01 -0.019 0.104 0.215 NK_HLA L2
ENSG00000162511 LAPTM5 57210 sc-eQTL 1.17e-01 0.156 0.0988 0.215 NK_HLA L2
ENSG00000162517 PEF1 -829912 sc-eQTL 6.87e-01 -0.0452 0.112 0.215 NK_HLA L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 96480 sc-eQTL 3.19e-01 0.105 0.105 0.215 NK_HLA L2
ENSG00000287510 AL137857.1 83291 sc-eQTL 9.73e-01 -0.00341 0.102 0.215 NK_HLA L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -481804 sc-eQTL 2.35e-01 -0.13 0.109 0.209 NK_cytokine L2
ENSG00000121753 ADGRB2 -949909 sc-eQTL 3.26e-01 0.0969 0.0985 0.209 NK_cytokine L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -481998 sc-eQTL 8.21e-01 -0.0193 0.0853 0.209 NK_cytokine L2
ENSG00000134644 PUM1 -251007 sc-eQTL 3.78e-01 -0.0814 0.092 0.209 NK_cytokine L2
ENSG00000162511 LAPTM5 57210 sc-eQTL 2.18e-01 0.125 0.101 0.209 NK_cytokine L2
ENSG00000162517 PEF1 -829912 sc-eQTL 2.36e-01 0.103 0.0862 0.209 NK_cytokine L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 96480 sc-eQTL 8.98e-01 0.0139 0.108 0.209 NK_cytokine L2
ENSG00000287510 AL137857.1 83291 sc-eQTL 8.92e-01 -0.0136 0.1 0.209 NK_cytokine L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -481804 sc-eQTL 9.50e-02 -0.224 0.133 0.193 PB L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -481998 sc-eQTL 4.73e-01 0.112 0.156 0.193 PB L2
ENSG00000134644 PUM1 -251007 sc-eQTL 6.50e-01 0.0616 0.136 0.193 PB L2
ENSG00000162510 MATN1 91399 sc-eQTL 3.88e-01 -0.109 0.126 0.193 PB L2
ENSG00000162511 LAPTM5 57210 sc-eQTL 3.99e-01 -0.0762 0.0901 0.193 PB L2
ENSG00000162517 PEF1 -829912 sc-eQTL 2.04e-01 -0.176 0.138 0.193 PB L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 96480 sc-eQTL 4.18e-01 -0.1 0.123 0.193 PB L2
ENSG00000287510 AL137857.1 83291 sc-eQTL 5.30e-01 -0.0828 0.131 0.193 PB L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -481804 sc-eQTL 5.91e-01 -0.0462 0.0857 0.207 Pro_T L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -481998 sc-eQTL 4.84e-01 0.0762 0.109 0.207 Pro_T L2
ENSG00000134644 PUM1 -251007 sc-eQTL 2.51e-01 0.117 0.101 0.207 Pro_T L2
ENSG00000162511 LAPTM5 57210 sc-eQTL 9.09e-01 0.00837 0.0728 0.207 Pro_T L2
ENSG00000162517 PEF1 -829912 sc-eQTL 7.08e-01 -0.0401 0.107 0.207 Pro_T L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 96480 sc-eQTL 6.08e-01 0.0522 0.102 0.207 Pro_T L2
ENSG00000287510 AL137857.1 83291 sc-eQTL 8.68e-01 -0.0156 0.0936 0.207 Pro_T L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -481804 sc-eQTL 1.74e-01 0.154 0.113 0.207 Treg L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -481998 sc-eQTL 2.00e-01 0.14 0.109 0.207 Treg L2
ENSG00000134644 PUM1 -251007 sc-eQTL 1.13e-01 -0.139 0.0872 0.207 Treg L2
ENSG00000162511 LAPTM5 57210 sc-eQTL 3.14e-01 0.101 0.1 0.207 Treg L2
ENSG00000162517 PEF1 -829912 sc-eQTL 7.18e-01 0.0393 0.109 0.207 Treg L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 96480 sc-eQTL 3.87e-03 0.293 0.1 0.207 Treg L2
ENSG00000287510 AL137857.1 83291 sc-eQTL 7.27e-02 -0.183 0.101 0.207 Treg L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -481804 sc-eQTL 7.53e-01 0.0374 0.119 0.212 cDC L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -481998 sc-eQTL 7.77e-01 -0.0364 0.128 0.212 cDC L2
ENSG00000134644 PUM1 -251007 sc-eQTL 5.85e-01 -0.0603 0.11 0.212 cDC L2
ENSG00000162511 LAPTM5 57210 sc-eQTL 9.28e-01 0.00704 0.0774 0.212 cDC L2
ENSG00000162517 PEF1 -829912 sc-eQTL 1.59e-01 0.158 0.111 0.212 cDC L2
ENSG00000168528 SERINC2 -594581 sc-eQTL 7.97e-01 0.0256 0.0993 0.212 cDC L2
ENSG00000284543 LINC01226 -691242 sc-eQTL 6.64e-01 -0.0425 0.0976 0.212 cDC L2
ENSG00000287510 AL137857.1 83291 sc-eQTL 8.87e-01 0.015 0.105 0.212 cDC L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -481804 sc-eQTL 3.54e-01 -0.0855 0.0921 0.207 cMono_IL1B L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -481998 sc-eQTL 2.56e-01 -0.117 0.103 0.207 cMono_IL1B L2
ENSG00000134644 PUM1 -251007 sc-eQTL 6.65e-01 0.0302 0.0697 0.207 cMono_IL1B L2
ENSG00000162511 LAPTM5 57210 sc-eQTL 5.98e-01 -0.0323 0.0611 0.207 cMono_IL1B L2
ENSG00000162512 SDC3 -93774 sc-eQTL 9.72e-02 -0.191 0.114 0.207 cMono_IL1B L2
ENSG00000162517 PEF1 -829912 sc-eQTL 3.34e-01 -0.091 0.0939 0.207 cMono_IL1B L2
ENSG00000168528 SERINC2 -594581 sc-eQTL 2.57e-01 0.132 0.116 0.207 cMono_IL1B L2
ENSG00000284543 LINC01226 -691242 sc-eQTL 1.04e-01 -0.167 0.102 0.207 cMono_IL1B L2
ENSG00000287510 AL137857.1 83291 sc-eQTL 6.24e-02 -0.179 0.0954 0.207 cMono_IL1B L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -481804 sc-eQTL 8.81e-01 -0.0147 0.0979 0.207 cMono_S100A L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -481998 sc-eQTL 1.69e-01 -0.159 0.115 0.207 cMono_S100A L2
ENSG00000134644 PUM1 -251007 sc-eQTL 9.07e-01 -0.00976 0.0836 0.207 cMono_S100A L2
ENSG00000162511 LAPTM5 57210 sc-eQTL 2.84e-01 -0.0688 0.0641 0.207 cMono_S100A L2
ENSG00000162512 SDC3 -93774 sc-eQTL 6.87e-01 -0.0447 0.111 0.207 cMono_S100A L2
ENSG00000162517 PEF1 -829912 sc-eQTL 2.62e-01 -0.112 0.0999 0.207 cMono_S100A L2
ENSG00000168528 SERINC2 -594581 sc-eQTL 6.25e-01 0.0576 0.117 0.207 cMono_S100A L2
ENSG00000284543 LINC01226 -691242 sc-eQTL 4.53e-01 -0.0716 0.0953 0.207 cMono_S100A L2
ENSG00000287510 AL137857.1 83291 sc-eQTL 3.39e-02 -0.203 0.0949 0.207 cMono_S100A L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -481804 sc-eQTL 5.82e-01 0.0769 0.139 0.224 gdT L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -481998 sc-eQTL 8.52e-01 -0.0224 0.12 0.224 gdT L2
ENSG00000134644 PUM1 -251007 sc-eQTL 7.96e-01 -0.032 0.124 0.224 gdT L2
ENSG00000162511 LAPTM5 57210 sc-eQTL 4.44e-01 0.103 0.134 0.224 gdT L2
ENSG00000162517 PEF1 -829912 sc-eQTL 5.82e-01 -0.0677 0.123 0.224 gdT L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 96480 sc-eQTL 4.54e-01 -0.0928 0.124 0.224 gdT L2
ENSG00000287510 AL137857.1 83291 sc-eQTL 5.53e-01 -0.0713 0.12 0.224 gdT L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -481804 sc-eQTL 9.51e-01 0.00665 0.109 0.211 intMono L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -481998 sc-eQTL 6.01e-01 0.0613 0.117 0.211 intMono L2
ENSG00000134644 PUM1 -251007 sc-eQTL 4.24e-02 -0.201 0.0984 0.211 intMono L2
ENSG00000162511 LAPTM5 57210 sc-eQTL 1.60e-01 0.11 0.0776 0.211 intMono L2
ENSG00000162512 SDC3 -93774 sc-eQTL 4.11e-01 -0.0879 0.107 0.211 intMono L2
ENSG00000162517 PEF1 -829912 sc-eQTL 2.33e-01 0.134 0.112 0.211 intMono L2
ENSG00000168528 SERINC2 -594581 sc-eQTL 3.57e-01 0.103 0.112 0.211 intMono L2
ENSG00000284543 LINC01226 -691242 sc-eQTL 8.11e-02 -0.184 0.105 0.211 intMono L2
ENSG00000287510 AL137857.1 83291 sc-eQTL 2.88e-01 0.113 0.106 0.211 intMono L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -481804 sc-eQTL 4.12e-01 0.0839 0.102 0.206 ncMono L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -481998 sc-eQTL 8.13e-01 -0.0258 0.109 0.206 ncMono L2
ENSG00000134644 PUM1 -251007 sc-eQTL 6.36e-01 -0.0422 0.0891 0.206 ncMono L2
ENSG00000162511 LAPTM5 57210 sc-eQTL 5.76e-01 0.0454 0.0809 0.206 ncMono L2
ENSG00000162512 SDC3 -93774 sc-eQTL 9.57e-01 0.00495 0.0908 0.206 ncMono L2
ENSG00000162517 PEF1 -829912 sc-eQTL 9.78e-01 -0.00292 0.104 0.206 ncMono L2
ENSG00000168528 SERINC2 -594581 sc-eQTL 2.80e-01 0.107 0.0988 0.206 ncMono L2
ENSG00000284543 LINC01226 -691242 sc-eQTL 4.54e-01 0.0741 0.0988 0.206 ncMono L2
ENSG00000287510 AL137857.1 83291 sc-eQTL 4.23e-01 0.0823 0.102 0.206 ncMono L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -481804 sc-eQTL 6.80e-01 0.0489 0.118 0.209 pDC L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -481998 sc-eQTL 8.12e-01 -0.0309 0.13 0.209 pDC L2
ENSG00000134644 PUM1 -251007 sc-eQTL 1.42e-01 0.157 0.107 0.209 pDC L2
ENSG00000162511 LAPTM5 57210 sc-eQTL 7.75e-01 0.0286 0.1 0.209 pDC L2
ENSG00000162517 PEF1 -829912 sc-eQTL 2.92e-01 0.137 0.129 0.209 pDC L2
ENSG00000168528 SERINC2 -594581 sc-eQTL 1.86e-01 -0.16 0.121 0.209 pDC L2
ENSG00000284543 LINC01226 -691242 sc-eQTL 2.87e-01 0.1 0.0938 0.209 pDC L2
ENSG00000287510 AL137857.1 83291 sc-eQTL 7.77e-01 0.0315 0.111 0.209 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000060688 SNRNP40 -481804 sc-eQTL 9.50e-01 0.00717 0.114 0.207 B_Memory LOneK1K
ENSG00000121766 ZCCHC17 -481998 sc-eQTL 7.88e-01 0.0256 0.0951 0.207 B_Memory LOneK1K
ENSG00000134644 PUM1 -251007 sc-eQTL 8.08e-02 -0.147 0.0837 0.207 B_Memory LOneK1K
ENSG00000162510 MATN1 91399 sc-eQTL 4.29e-01 -0.0761 0.096 0.207 B_Memory LOneK1K
ENSG00000162511 LAPTM5 57210 sc-eQTL 8.55e-01 0.011 0.0604 0.207 B_Memory LOneK1K
ENSG00000162517 PEF1 -829912 sc-eQTL 5.78e-01 -0.0557 0.0999 0.207 B_Memory LOneK1K
ENSG00000186056 MATN1-AS1 96480 sc-eQTL 8.63e-01 0.0138 0.0799 0.207 B_Memory LOneK1K
ENSG00000287510 AL137857.1 83291 sc-eQTL 6.67e-01 0.0375 0.087 0.207 B_Memory LOneK1K
ENSG00000060688 SNRNP40 -481804 sc-eQTL 5.85e-01 -0.0571 0.104 0.207 B_Naive LOneK1K
ENSG00000121766 ZCCHC17 -481998 sc-eQTL 3.03e-01 -0.085 0.0823 0.207 B_Naive LOneK1K
ENSG00000134644 PUM1 -251007 sc-eQTL 7.04e-01 -0.0297 0.078 0.207 B_Naive LOneK1K
ENSG00000162510 MATN1 91399 sc-eQTL 3.08e-01 0.0766 0.075 0.207 B_Naive LOneK1K
ENSG00000162511 LAPTM5 57210 sc-eQTL 1.07e-01 0.0852 0.0526 0.207 B_Naive LOneK1K
ENSG00000162517 PEF1 -829912 sc-eQTL 9.79e-01 -0.00255 0.0966 0.207 B_Naive LOneK1K
ENSG00000186056 MATN1-AS1 96480 sc-eQTL 2.11e-01 0.0855 0.0681 0.207 B_Naive LOneK1K
ENSG00000287510 AL137857.1 83291 sc-eQTL 8.80e-01 0.0122 0.0812 0.207 B_Naive LOneK1K
ENSG00000060688 SNRNP40 -481804 sc-eQTL 1.09e-01 -0.141 0.0877 0.207 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000121766 ZCCHC17 -481998 sc-eQTL 5.86e-02 -0.188 0.0991 0.207 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000134644 PUM1 -251007 sc-eQTL 9.85e-01 0.00119 0.0637 0.207 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000162511 LAPTM5 57210 sc-eQTL 6.89e-01 -0.0225 0.056 0.207 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000162512 SDC3 -93774 sc-eQTL 1.22e-01 -0.176 0.114 0.207 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000162517 PEF1 -829912 sc-eQTL 8.31e-02 -0.139 0.0798 0.207 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000168528 SERINC2 -594581 sc-eQTL 4.23e-01 0.0942 0.117 0.207 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000284543 LINC01226 -691242 sc-eQTL 1.36e-01 -0.144 0.0959 0.207 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000287510 AL137857.1 83291 sc-eQTL 6.01e-02 -0.169 0.0895 0.207 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000060688 SNRNP40 -481804 sc-eQTL 5.50e-01 0.0577 0.0964 0.207 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000121766 ZCCHC17 -481998 sc-eQTL 9.65e-01 0.00468 0.106 0.207 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000134644 PUM1 -251007 sc-eQTL 1.90e-01 -0.113 0.0861 0.207 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000162511 LAPTM5 57210 sc-eQTL 1.39e-01 0.102 0.0688 0.207 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000162512 SDC3 -93774 sc-eQTL 1.14e-01 -0.16 0.1 0.207 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000162517 PEF1 -829912 sc-eQTL 3.42e-01 0.0873 0.0916 0.207 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000168528 SERINC2 -594581 sc-eQTL 2.15e-01 0.13 0.104 0.207 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000284543 LINC01226 -691242 sc-eQTL 2.24e-01 -0.121 0.0991 0.207 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000287510 AL137857.1 83291 sc-eQTL 1.66e-01 0.138 0.0991 0.207 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000060688 SNRNP40 -481804 sc-eQTL 4.15e-01 -0.0871 0.107 0.209 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000121753 ADGRB2 -949909 sc-eQTL 5.24e-01 0.0581 0.0909 0.209 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000121766 ZCCHC17 -481998 sc-eQTL 3.82e-01 -0.0639 0.0729 0.209 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000134644 PUM1 -251007 sc-eQTL 3.94e-01 -0.0682 0.0798 0.209 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000162511 LAPTM5 57210 sc-eQTL 1.06e-01 0.144 0.0888 0.209 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000162517 PEF1 -829912 sc-eQTL 4.33e-01 0.0532 0.0678 0.209 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000186056 MATN1-AS1 96480 sc-eQTL 1.51e-01 0.148 0.103 0.209 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000287510 AL137857.1 83291 sc-eQTL 9.81e-01 0.00217 0.089 0.209 NK_CD56dim LOneK1K

Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF
ENSG00000121766 ZCCHC17 -481998 eQTL 8.54e-06 0.0985 0.022 0.0 0.0 0.216

Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina
ENSG00000121766 ZCCHC17 -481998 8.7e-07 6.78e-07 9.49e-08 4.37e-07 9.26e-08 3.08e-07 5.9e-07 1.42e-07 4.3e-07 2.43e-07 8.28e-07 3.62e-07 9.57e-07 1.6e-07 2.81e-07 2.14e-07 3.63e-07 3.95e-07 2.12e-07 1.43e-07 2.09e-07 4.14e-07 3.69e-07 1.61e-07 8.99e-07 2.42e-07 2.58e-07 2.63e-07 3.58e-07 6.42e-07 3.38e-07 6.37e-08 4.42e-08 1.38e-07 3.34e-07 1.09e-07 1.13e-07 7.98e-08 6.81e-08 2.2e-08 5.38e-08 7.36e-07 1.65e-08 5.61e-09 1.19e-07 1.25e-08 7.89e-08 1.77e-08 6.46e-08