logo

Genes within 1Mb (chr1:30814037:G:A):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD

Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000060688 SNRNP40 -482751 sc-eQTL 6.10e-01 -0.0508 0.0995 0.205 B L1
ENSG00000121766 ZCCHC17 -482945 sc-eQTL 6.76e-01 -0.0334 0.0797 0.205 B L1
ENSG00000134644 PUM1 -251954 sc-eQTL 1.19e-01 -0.104 0.0665 0.205 B L1
ENSG00000162510 MATN1 90452 sc-eQTL 7.24e-01 0.0249 0.0703 0.205 B L1
ENSG00000162511 LAPTM5 56263 sc-eQTL 8.46e-02 0.0947 0.0547 0.205 B L1
ENSG00000162517 PEF1 -830859 sc-eQTL 3.85e-01 -0.0722 0.083 0.205 B L1
ENSG00000186056 MATN1-AS1 95533 sc-eQTL 1.22e-01 0.0997 0.0642 0.205 B L1
ENSG00000287510 AL137857.1 82344 sc-eQTL 9.20e-01 0.00765 0.0764 0.205 B L1
ENSG00000060688 SNRNP40 -482751 sc-eQTL 6.44e-01 0.0395 0.0855 0.205 CD4T L1
ENSG00000121766 ZCCHC17 -482945 sc-eQTL 6.13e-01 0.0338 0.0668 0.205 CD4T L1
ENSG00000134644 PUM1 -251954 sc-eQTL 5.41e-01 -0.0364 0.0595 0.205 CD4T L1
ENSG00000162511 LAPTM5 56263 sc-eQTL 3.72e-01 0.0589 0.0658 0.205 CD4T L1
ENSG00000162517 PEF1 -830859 sc-eQTL 6.28e-01 -0.0335 0.0689 0.205 CD4T L1
ENSG00000186056 MATN1-AS1 95533 sc-eQTL 7.45e-01 0.0192 0.059 0.205 CD4T L1
ENSG00000287510 AL137857.1 82344 sc-eQTL 7.56e-01 -0.022 0.0707 0.205 CD4T L1
ENSG00000060688 SNRNP40 -482751 sc-eQTL 7.66e-01 -0.0337 0.113 0.205 CD8T L1
ENSG00000121766 ZCCHC17 -482945 sc-eQTL 1.17e-01 -0.118 0.0748 0.205 CD8T L1
ENSG00000134644 PUM1 -251954 sc-eQTL 6.35e-01 -0.0315 0.0663 0.205 CD8T L1
ENSG00000162511 LAPTM5 56263 sc-eQTL 2.84e-02 0.14 0.0636 0.205 CD8T L1
ENSG00000162517 PEF1 -830859 sc-eQTL 7.39e-01 -0.0264 0.0793 0.205 CD8T L1
ENSG00000186056 MATN1-AS1 95533 sc-eQTL 4.64e-02 0.15 0.0747 0.205 CD8T L1
ENSG00000287510 AL137857.1 82344 sc-eQTL 6.21e-01 -0.0469 0.0947 0.205 CD8T L1
ENSG00000060688 SNRNP40 -482751 sc-eQTL 9.82e-01 0.00234 0.102 0.209 DC L1
ENSG00000121766 ZCCHC17 -482945 sc-eQTL 6.18e-01 -0.0603 0.121 0.209 DC L1
ENSG00000134644 PUM1 -251954 sc-eQTL 8.37e-01 -0.0195 0.0947 0.209 DC L1
ENSG00000162511 LAPTM5 56263 sc-eQTL 5.05e-01 -0.0451 0.0675 0.209 DC L1
ENSG00000162517 PEF1 -830859 sc-eQTL 1.28e-01 0.167 0.109 0.209 DC L1
ENSG00000168528 SERINC2 -595528 sc-eQTL 6.13e-01 -0.0564 0.111 0.209 DC L1
ENSG00000284543 LINC01226 -692189 sc-eQTL 5.99e-02 0.139 0.0732 0.209 DC L1
ENSG00000287510 AL137857.1 82344 sc-eQTL 1.60e-01 0.15 0.106 0.209 DC L1
ENSG00000060688 SNRNP40 -482751 sc-eQTL 3.04e-01 -0.0806 0.0782 0.205 Mono L1
ENSG00000121766 ZCCHC17 -482945 sc-eQTL 5.33e-02 -0.187 0.0964 0.205 Mono L1
ENSG00000134644 PUM1 -251954 sc-eQTL 8.92e-01 -0.00846 0.0623 0.205 Mono L1
ENSG00000162511 LAPTM5 56263 sc-eQTL 9.43e-01 -0.00411 0.0573 0.205 Mono L1
ENSG00000162512 SDC3 -94721 sc-eQTL 8.56e-02 -0.189 0.109 0.205 Mono L1
ENSG00000162517 PEF1 -830859 sc-eQTL 7.69e-02 -0.136 0.0767 0.205 Mono L1
ENSG00000168528 SERINC2 -595528 sc-eQTL 3.69e-01 0.106 0.118 0.205 Mono L1
ENSG00000284543 LINC01226 -692189 sc-eQTL 5.99e-02 -0.195 0.103 0.205 Mono L1
ENSG00000287510 AL137857.1 82344 sc-eQTL 3.78e-01 -0.0802 0.0909 0.205 Mono L1
ENSG00000060688 SNRNP40 -482751 sc-eQTL 5.38e-01 -0.0664 0.108 0.206 NK L1
ENSG00000121753 ADGRB2 -950856 sc-eQTL 6.55e-01 0.0415 0.0929 0.206 NK L1
ENSG00000121766 ZCCHC17 -482945 sc-eQTL 4.70e-01 -0.0534 0.0738 0.206 NK L1
ENSG00000134644 PUM1 -251954 sc-eQTL 2.74e-01 -0.0848 0.0773 0.206 NK L1
ENSG00000162511 LAPTM5 56263 sc-eQTL 1.61e-01 0.125 0.0887 0.206 NK L1
ENSG00000162517 PEF1 -830859 sc-eQTL 3.54e-01 0.0604 0.065 0.206 NK L1
ENSG00000186056 MATN1-AS1 95533 sc-eQTL 2.73e-01 0.11 0.0999 0.206 NK L1
ENSG00000287510 AL137857.1 82344 sc-eQTL 6.73e-01 -0.0391 0.0925 0.206 NK L1
ENSG00000060688 SNRNP40 -482751 sc-eQTL 9.82e-01 -0.00188 0.0816 0.205 Other_T L1
ENSG00000121766 ZCCHC17 -482945 sc-eQTL 2.54e-01 -0.0995 0.0869 0.205 Other_T L1
ENSG00000134644 PUM1 -251954 sc-eQTL 7.97e-01 0.0201 0.0784 0.205 Other_T L1
ENSG00000162511 LAPTM5 56263 sc-eQTL 7.21e-01 -0.023 0.0642 0.205 Other_T L1
ENSG00000162517 PEF1 -830859 sc-eQTL 3.83e-01 -0.0748 0.0856 0.205 Other_T L1
ENSG00000186056 MATN1-AS1 95533 sc-eQTL 9.54e-01 -0.00605 0.105 0.205 Other_T L1
ENSG00000287510 AL137857.1 82344 sc-eQTL 6.74e-01 -0.0462 0.11 0.205 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000060688 SNRNP40 -482751 sc-eQTL 9.42e-01 0.00931 0.127 0.207 B_Activated L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -482945 sc-eQTL 3.90e-01 0.11 0.128 0.207 B_Activated L2
ENSG00000134644 PUM1 -251954 sc-eQTL 7.54e-01 -0.0374 0.119 0.207 B_Activated L2
ENSG00000162510 MATN1 90452 sc-eQTL 5.87e-01 0.0566 0.104 0.207 B_Activated L2
ENSG00000162511 LAPTM5 56263 sc-eQTL 8.31e-01 -0.0155 0.0727 0.207 B_Activated L2
ENSG00000162517 PEF1 -830859 sc-eQTL 2.30e-01 -0.148 0.123 0.207 B_Activated L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 95533 sc-eQTL 3.90e-01 -0.101 0.117 0.207 B_Activated L2
ENSG00000287510 AL137857.1 82344 sc-eQTL 4.04e-01 -0.0866 0.104 0.207 B_Activated L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -482751 sc-eQTL 5.03e-01 0.0813 0.121 0.204 B_Intermediate L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -482945 sc-eQTL 7.88e-01 -0.0272 0.101 0.204 B_Intermediate L2
ENSG00000134644 PUM1 -251954 sc-eQTL 2.65e-01 -0.106 0.0951 0.204 B_Intermediate L2
ENSG00000162510 MATN1 90452 sc-eQTL 2.16e-01 -0.123 0.0989 0.204 B_Intermediate L2
ENSG00000162511 LAPTM5 56263 sc-eQTL 3.37e-01 0.0585 0.0608 0.204 B_Intermediate L2
ENSG00000162517 PEF1 -830859 sc-eQTL 7.46e-01 -0.0367 0.113 0.204 B_Intermediate L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 95533 sc-eQTL 8.14e-01 -0.0201 0.0855 0.204 B_Intermediate L2
ENSG00000287510 AL137857.1 82344 sc-eQTL 1.59e-01 0.135 0.0952 0.204 B_Intermediate L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -482751 sc-eQTL 6.70e-01 -0.0505 0.118 0.207 B_Memory L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -482945 sc-eQTL 7.30e-01 -0.0377 0.109 0.207 B_Memory L2
ENSG00000134644 PUM1 -251954 sc-eQTL 1.59e-01 -0.134 0.0946 0.207 B_Memory L2
ENSG00000162510 MATN1 90452 sc-eQTL 6.83e-01 -0.0371 0.0909 0.207 B_Memory L2
ENSG00000162511 LAPTM5 56263 sc-eQTL 4.77e-01 0.0574 0.0805 0.207 B_Memory L2
ENSG00000162517 PEF1 -830859 sc-eQTL 9.25e-01 -0.0102 0.108 0.207 B_Memory L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 95533 sc-eQTL 6.31e-02 0.171 0.0914 0.207 B_Memory L2
ENSG00000287510 AL137857.1 82344 sc-eQTL 1.15e-01 -0.17 0.107 0.207 B_Memory L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -482751 sc-eQTL 4.77e-02 -0.214 0.108 0.205 B_Naive1 L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -482945 sc-eQTL 6.08e-01 -0.0481 0.0937 0.205 B_Naive1 L2
ENSG00000134644 PUM1 -251954 sc-eQTL 9.37e-01 -0.0065 0.0827 0.205 B_Naive1 L2
ENSG00000162510 MATN1 90452 sc-eQTL 3.08e-01 0.0855 0.0837 0.205 B_Naive1 L2
ENSG00000162511 LAPTM5 56263 sc-eQTL 7.41e-02 0.0998 0.0556 0.205 B_Naive1 L2
ENSG00000162517 PEF1 -830859 sc-eQTL 8.61e-01 0.0173 0.0988 0.205 B_Naive1 L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 95533 sc-eQTL 1.46e-01 0.107 0.0733 0.205 B_Naive1 L2
ENSG00000287510 AL137857.1 82344 sc-eQTL 4.95e-01 -0.062 0.0908 0.205 B_Naive1 L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -482751 sc-eQTL 2.96e-01 0.12 0.115 0.206 B_Naive2 L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -482945 sc-eQTL 1.44e-01 -0.138 0.0943 0.206 B_Naive2 L2
ENSG00000134644 PUM1 -251954 sc-eQTL 4.90e-01 -0.0641 0.0927 0.206 B_Naive2 L2
ENSG00000162510 MATN1 90452 sc-eQTL 9.79e-01 0.0024 0.0891 0.206 B_Naive2 L2
ENSG00000162511 LAPTM5 56263 sc-eQTL 1.19e-01 0.094 0.0601 0.206 B_Naive2 L2
ENSG00000162517 PEF1 -830859 sc-eQTL 9.14e-01 -0.012 0.11 0.206 B_Naive2 L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 95533 sc-eQTL 8.69e-01 0.0146 0.0881 0.206 B_Naive2 L2
ENSG00000287510 AL137857.1 82344 sc-eQTL 6.43e-01 0.0441 0.0951 0.206 B_Naive2 L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -482751 sc-eQTL 3.86e-01 -0.099 0.114 0.205 CD4_CTL L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -482945 sc-eQTL 9.62e-01 0.0053 0.112 0.205 CD4_CTL L2
ENSG00000134644 PUM1 -251954 sc-eQTL 3.60e-01 -0.101 0.11 0.205 CD4_CTL L2
ENSG00000162511 LAPTM5 56263 sc-eQTL 1.19e-01 0.153 0.0975 0.205 CD4_CTL L2
ENSG00000162517 PEF1 -830859 sc-eQTL 2.50e-01 0.116 0.1 0.205 CD4_CTL L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 95533 sc-eQTL 8.78e-01 0.0165 0.107 0.205 CD4_CTL L2
ENSG00000287510 AL137857.1 82344 sc-eQTL 3.55e-01 -0.0875 0.0945 0.205 CD4_CTL L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -482751 sc-eQTL 8.84e-01 -0.013 0.0893 0.205 CD4_Naive L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -482945 sc-eQTL 6.37e-01 -0.0374 0.0792 0.205 CD4_Naive L2
ENSG00000134644 PUM1 -251954 sc-eQTL 7.29e-01 -0.022 0.0632 0.205 CD4_Naive L2
ENSG00000162511 LAPTM5 56263 sc-eQTL 8.50e-01 -0.0128 0.0678 0.205 CD4_Naive L2
ENSG00000162517 PEF1 -830859 sc-eQTL 3.24e-01 -0.0734 0.0741 0.205 CD4_Naive L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 95533 sc-eQTL 9.64e-01 0.00313 0.0688 0.205 CD4_Naive L2
ENSG00000287510 AL137857.1 82344 sc-eQTL 7.41e-01 -0.0262 0.079 0.205 CD4_Naive L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -482751 sc-eQTL 7.90e-01 -0.0299 0.112 0.205 CD4_TCM L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -482945 sc-eQTL 5.99e-02 0.169 0.0896 0.205 CD4_TCM L2
ENSG00000134644 PUM1 -251954 sc-eQTL 9.85e-01 0.00146 0.08 0.205 CD4_TCM L2
ENSG00000162511 LAPTM5 56263 sc-eQTL 3.05e-01 0.0681 0.0662 0.205 CD4_TCM L2
ENSG00000162517 PEF1 -830859 sc-eQTL 9.75e-01 0.00281 0.0889 0.205 CD4_TCM L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 95533 sc-eQTL 8.46e-01 -0.0164 0.0842 0.205 CD4_TCM L2
ENSG00000287510 AL137857.1 82344 sc-eQTL 1.84e-01 0.125 0.0934 0.205 CD4_TCM L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -482751 sc-eQTL 5.57e-01 0.066 0.112 0.205 CD4_TEM L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -482945 sc-eQTL 9.26e-01 -0.01 0.107 0.205 CD4_TEM L2
ENSG00000134644 PUM1 -251954 sc-eQTL 3.59e-01 -0.0818 0.089 0.205 CD4_TEM L2
ENSG00000162511 LAPTM5 56263 sc-eQTL 7.20e-02 0.162 0.0895 0.205 CD4_TEM L2
ENSG00000162517 PEF1 -830859 sc-eQTL 8.99e-01 0.0129 0.101 0.205 CD4_TEM L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 95533 sc-eQTL 1.12e-01 -0.167 0.105 0.205 CD4_TEM L2
ENSG00000287510 AL137857.1 82344 sc-eQTL 4.04e-01 0.0868 0.104 0.205 CD4_TEM L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -482751 sc-eQTL 6.78e-01 0.0508 0.122 0.205 CD8_CTL L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -482945 sc-eQTL 3.47e-02 -0.197 0.0928 0.205 CD8_CTL L2
ENSG00000134644 PUM1 -251954 sc-eQTL 9.79e-01 -0.00242 0.0911 0.205 CD8_CTL L2
ENSG00000162511 LAPTM5 56263 sc-eQTL 6.37e-02 0.186 0.1 0.205 CD8_CTL L2
ENSG00000162517 PEF1 -830859 sc-eQTL 2.52e-01 0.101 0.0875 0.205 CD8_CTL L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 95533 sc-eQTL 4.93e-01 0.0727 0.106 0.205 CD8_CTL L2
ENSG00000287510 AL137857.1 82344 sc-eQTL 5.57e-01 -0.0586 0.0996 0.205 CD8_CTL L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -482751 sc-eQTL 7.18e-01 0.0405 0.112 0.205 CD8_Naive L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -482945 sc-eQTL 1.28e-01 -0.147 0.096 0.205 CD8_Naive L2
ENSG00000134644 PUM1 -251954 sc-eQTL 7.93e-01 -0.0204 0.0777 0.205 CD8_Naive L2
ENSG00000162511 LAPTM5 56263 sc-eQTL 8.20e-01 -0.0169 0.0744 0.205 CD8_Naive L2
ENSG00000162517 PEF1 -830859 sc-eQTL 5.21e-01 -0.0665 0.103 0.205 CD8_Naive L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 95533 sc-eQTL 2.69e-01 0.103 0.0927 0.205 CD8_Naive L2
ENSG00000287510 AL137857.1 82344 sc-eQTL 6.50e-01 -0.046 0.101 0.205 CD8_Naive L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -482751 sc-eQTL 7.59e-01 0.0381 0.124 0.208 CD8_TCM L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -482945 sc-eQTL 6.20e-01 -0.0562 0.113 0.208 CD8_TCM L2
ENSG00000134644 PUM1 -251954 sc-eQTL 6.98e-01 -0.0415 0.107 0.208 CD8_TCM L2
ENSG00000162511 LAPTM5 56263 sc-eQTL 5.58e-01 0.0655 0.112 0.208 CD8_TCM L2
ENSG00000162517 PEF1 -830859 sc-eQTL 7.54e-01 0.0358 0.114 0.208 CD8_TCM L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 95533 sc-eQTL 8.76e-02 -0.176 0.103 0.208 CD8_TCM L2
ENSG00000287510 AL137857.1 82344 sc-eQTL 2.56e-01 0.119 0.104 0.208 CD8_TCM L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -482751 sc-eQTL 4.69e-01 -0.0846 0.117 0.212 CD8_TEM L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -482945 sc-eQTL 3.19e-01 -0.112 0.112 0.212 CD8_TEM L2
ENSG00000134644 PUM1 -251954 sc-eQTL 2.61e-01 0.129 0.114 0.212 CD8_TEM L2
ENSG00000162511 LAPTM5 56263 sc-eQTL 8.51e-01 0.0203 0.108 0.212 CD8_TEM L2
ENSG00000162517 PEF1 -830859 sc-eQTL 6.85e-02 -0.184 0.101 0.212 CD8_TEM L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 95533 sc-eQTL 3.67e-01 0.101 0.112 0.212 CD8_TEM L2
ENSG00000287510 AL137857.1 82344 sc-eQTL 2.54e-01 -0.115 0.101 0.212 CD8_TEM L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -482751 sc-eQTL 7.68e-02 -0.209 0.118 0.208 MAIT L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -482945 sc-eQTL 7.12e-02 -0.189 0.104 0.208 MAIT L2
ENSG00000134644 PUM1 -251954 sc-eQTL 4.26e-01 0.0802 0.101 0.208 MAIT L2
ENSG00000162511 LAPTM5 56263 sc-eQTL 9.62e-01 -0.00458 0.0951 0.208 MAIT L2
ENSG00000162517 PEF1 -830859 sc-eQTL 5.79e-02 -0.197 0.104 0.208 MAIT L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 95533 sc-eQTL 3.53e-01 0.0983 0.106 0.208 MAIT L2
ENSG00000287510 AL137857.1 82344 sc-eQTL 6.35e-01 -0.0519 0.109 0.208 MAIT L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -482751 sc-eQTL 9.69e-01 0.00477 0.122 0.207 NK_CD56bright L2
ENSG00000121753 ADGRB2 -950856 sc-eQTL 4.88e-01 -0.066 0.095 0.207 NK_CD56bright L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -482945 sc-eQTL 6.37e-01 0.0485 0.103 0.207 NK_CD56bright L2
ENSG00000134644 PUM1 -251954 sc-eQTL 4.90e-02 -0.212 0.107 0.207 NK_CD56bright L2
ENSG00000162511 LAPTM5 56263 sc-eQTL 8.25e-01 -0.0235 0.106 0.207 NK_CD56bright L2
ENSG00000162517 PEF1 -830859 sc-eQTL 1.02e-01 0.169 0.103 0.207 NK_CD56bright L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 95533 sc-eQTL 2.01e-02 -0.247 0.105 0.207 NK_CD56bright L2
ENSG00000287510 AL137857.1 82344 sc-eQTL 3.48e-01 -0.0989 0.105 0.207 NK_CD56bright L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -482751 sc-eQTL 9.60e-01 -0.00578 0.114 0.207 NK_CD56dim L2
ENSG00000121753 ADGRB2 -950856 sc-eQTL 6.14e-01 0.0508 0.1 0.207 NK_CD56dim L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -482945 sc-eQTL 4.49e-01 -0.064 0.0844 0.207 NK_CD56dim L2
ENSG00000134644 PUM1 -251954 sc-eQTL 5.05e-01 -0.0579 0.0866 0.207 NK_CD56dim L2
ENSG00000162511 LAPTM5 56263 sc-eQTL 2.52e-01 0.106 0.0922 0.207 NK_CD56dim L2
ENSG00000162517 PEF1 -830859 sc-eQTL 5.21e-01 0.0528 0.0822 0.207 NK_CD56dim L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 95533 sc-eQTL 3.99e-01 0.0977 0.116 0.207 NK_CD56dim L2
ENSG00000287510 AL137857.1 82344 sc-eQTL 4.70e-01 -0.0691 0.0954 0.207 NK_CD56dim L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -482751 sc-eQTL 6.99e-01 -0.047 0.121 0.212 NK_HLA L2
ENSG00000121753 ADGRB2 -950856 sc-eQTL 4.02e-01 0.0808 0.0963 0.212 NK_HLA L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -482945 sc-eQTL 8.10e-01 -0.0261 0.108 0.212 NK_HLA L2
ENSG00000134644 PUM1 -251954 sc-eQTL 8.96e-01 -0.0139 0.106 0.212 NK_HLA L2
ENSG00000162511 LAPTM5 56263 sc-eQTL 1.15e-01 0.158 0.1 0.212 NK_HLA L2
ENSG00000162517 PEF1 -830859 sc-eQTL 6.08e-01 -0.0584 0.114 0.212 NK_HLA L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 95533 sc-eQTL 3.36e-01 0.103 0.107 0.212 NK_HLA L2
ENSG00000287510 AL137857.1 82344 sc-eQTL 8.95e-01 -0.0137 0.104 0.212 NK_HLA L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -482751 sc-eQTL 2.76e-01 -0.121 0.11 0.207 NK_cytokine L2
ENSG00000121753 ADGRB2 -950856 sc-eQTL 3.85e-01 0.087 0.0999 0.207 NK_cytokine L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -482945 sc-eQTL 9.46e-01 -0.00584 0.0864 0.207 NK_cytokine L2
ENSG00000134644 PUM1 -251954 sc-eQTL 4.98e-01 -0.0634 0.0934 0.207 NK_cytokine L2
ENSG00000162511 LAPTM5 56263 sc-eQTL 2.76e-01 0.112 0.103 0.207 NK_cytokine L2
ENSG00000162517 PEF1 -830859 sc-eQTL 3.25e-01 0.0863 0.0875 0.207 NK_cytokine L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 95533 sc-eQTL 6.92e-01 0.0432 0.109 0.207 NK_cytokine L2
ENSG00000287510 AL137857.1 82344 sc-eQTL 9.29e-01 -0.00904 0.101 0.207 NK_cytokine L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -482751 sc-eQTL 1.13e-01 -0.216 0.135 0.189 PB L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -482945 sc-eQTL 4.84e-01 0.111 0.158 0.189 PB L2
ENSG00000134644 PUM1 -251954 sc-eQTL 7.50e-01 0.0441 0.138 0.189 PB L2
ENSG00000162510 MATN1 90452 sc-eQTL 4.23e-01 -0.103 0.128 0.189 PB L2
ENSG00000162511 LAPTM5 56263 sc-eQTL 4.70e-01 -0.0665 0.0916 0.189 PB L2
ENSG00000162517 PEF1 -830859 sc-eQTL 1.90e-01 -0.185 0.14 0.189 PB L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 95533 sc-eQTL 5.33e-01 -0.0785 0.126 0.189 PB L2
ENSG00000287510 AL137857.1 82344 sc-eQTL 5.49e-01 -0.0804 0.134 0.189 PB L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -482751 sc-eQTL 5.47e-01 -0.0525 0.087 0.204 Pro_T L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -482945 sc-eQTL 4.63e-01 0.0811 0.11 0.204 Pro_T L2
ENSG00000134644 PUM1 -251954 sc-eQTL 3.12e-01 0.104 0.103 0.204 Pro_T L2
ENSG00000162511 LAPTM5 56263 sc-eQTL 9.91e-01 -0.00079 0.0739 0.204 Pro_T L2
ENSG00000162517 PEF1 -830859 sc-eQTL 5.30e-01 -0.0682 0.108 0.204 Pro_T L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 95533 sc-eQTL 6.95e-01 0.0405 0.103 0.204 Pro_T L2
ENSG00000287510 AL137857.1 82344 sc-eQTL 9.32e-01 -0.00807 0.095 0.204 Pro_T L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -482751 sc-eQTL 1.69e-01 0.158 0.114 0.205 Treg L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -482945 sc-eQTL 1.76e-01 0.15 0.111 0.205 Treg L2
ENSG00000134644 PUM1 -251954 sc-eQTL 6.08e-02 -0.166 0.0883 0.205 Treg L2
ENSG00000162511 LAPTM5 56263 sc-eQTL 4.14e-01 0.0833 0.102 0.205 Treg L2
ENSG00000162517 PEF1 -830859 sc-eQTL 8.34e-01 0.0232 0.11 0.205 Treg L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 95533 sc-eQTL 3.94e-03 0.297 0.102 0.205 Treg L2
ENSG00000287510 AL137857.1 82344 sc-eQTL 6.77e-02 -0.189 0.103 0.205 Treg L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -482751 sc-eQTL 8.13e-01 0.0286 0.121 0.21 cDC L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -482945 sc-eQTL 8.75e-01 -0.0206 0.131 0.21 cDC L2
ENSG00000134644 PUM1 -251954 sc-eQTL 5.45e-01 -0.0679 0.112 0.21 cDC L2
ENSG00000162511 LAPTM5 56263 sc-eQTL 8.39e-01 -0.016 0.0786 0.21 cDC L2
ENSG00000162517 PEF1 -830859 sc-eQTL 2.30e-01 0.137 0.113 0.21 cDC L2
ENSG00000168528 SERINC2 -595528 sc-eQTL 6.88e-01 0.0405 0.101 0.21 cDC L2
ENSG00000284543 LINC01226 -692189 sc-eQTL 7.22e-01 -0.0353 0.0991 0.21 cDC L2
ENSG00000287510 AL137857.1 82344 sc-eQTL 8.27e-01 0.0233 0.107 0.21 cDC L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -482751 sc-eQTL 1.96e-01 -0.121 0.0933 0.205 cMono_IL1B L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -482945 sc-eQTL 1.81e-01 -0.14 0.104 0.205 cMono_IL1B L2
ENSG00000134644 PUM1 -251954 sc-eQTL 5.51e-01 0.0422 0.0706 0.205 cMono_IL1B L2
ENSG00000162511 LAPTM5 56263 sc-eQTL 5.79e-01 -0.0345 0.062 0.205 cMono_IL1B L2
ENSG00000162512 SDC3 -94721 sc-eQTL 9.42e-02 -0.195 0.116 0.205 cMono_IL1B L2
ENSG00000162517 PEF1 -830859 sc-eQTL 3.00e-01 -0.0989 0.0952 0.205 cMono_IL1B L2
ENSG00000168528 SERINC2 -595528 sc-eQTL 2.97e-01 0.123 0.118 0.205 cMono_IL1B L2
ENSG00000284543 LINC01226 -692189 sc-eQTL 7.81e-02 -0.184 0.104 0.205 cMono_IL1B L2
ENSG00000287510 AL137857.1 82344 sc-eQTL 6.47e-02 -0.18 0.0968 0.205 cMono_IL1B L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -482751 sc-eQTL 9.41e-01 0.00739 0.0993 0.205 cMono_S100A L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -482945 sc-eQTL 1.69e-01 -0.161 0.117 0.205 cMono_S100A L2
ENSG00000134644 PUM1 -251954 sc-eQTL 8.95e-01 0.0112 0.0848 0.205 cMono_S100A L2
ENSG00000162511 LAPTM5 56263 sc-eQTL 3.04e-01 -0.067 0.065 0.205 cMono_S100A L2
ENSG00000162512 SDC3 -94721 sc-eQTL 6.65e-01 -0.0489 0.113 0.205 cMono_S100A L2
ENSG00000162517 PEF1 -830859 sc-eQTL 2.49e-01 -0.117 0.101 0.205 cMono_S100A L2
ENSG00000168528 SERINC2 -595528 sc-eQTL 6.74e-01 0.0503 0.119 0.205 cMono_S100A L2
ENSG00000284543 LINC01226 -692189 sc-eQTL 5.35e-01 -0.0601 0.0967 0.205 cMono_S100A L2
ENSG00000287510 AL137857.1 82344 sc-eQTL 5.40e-02 -0.187 0.0964 0.205 cMono_S100A L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -482751 sc-eQTL 5.16e-01 0.0926 0.142 0.221 gdT L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -482945 sc-eQTL 8.10e-01 -0.0294 0.122 0.221 gdT L2
ENSG00000134644 PUM1 -251954 sc-eQTL 7.11e-01 -0.0468 0.126 0.221 gdT L2
ENSG00000162511 LAPTM5 56263 sc-eQTL 5.05e-01 0.0916 0.137 0.221 gdT L2
ENSG00000162517 PEF1 -830859 sc-eQTL 4.99e-01 -0.085 0.125 0.221 gdT L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 95533 sc-eQTL 5.70e-01 -0.072 0.126 0.221 gdT L2
ENSG00000287510 AL137857.1 82344 sc-eQTL 5.53e-01 -0.0728 0.122 0.221 gdT L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -482751 sc-eQTL 7.63e-01 0.0334 0.111 0.209 intMono L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -482945 sc-eQTL 5.88e-01 0.0644 0.119 0.209 intMono L2
ENSG00000134644 PUM1 -251954 sc-eQTL 7.11e-02 -0.182 0.1 0.209 intMono L2
ENSG00000162511 LAPTM5 56263 sc-eQTL 1.40e-01 0.117 0.0788 0.209 intMono L2
ENSG00000162512 SDC3 -94721 sc-eQTL 3.99e-01 -0.0916 0.108 0.209 intMono L2
ENSG00000162517 PEF1 -830859 sc-eQTL 2.77e-01 0.124 0.114 0.209 intMono L2
ENSG00000168528 SERINC2 -595528 sc-eQTL 4.12e-01 0.0931 0.113 0.209 intMono L2
ENSG00000284543 LINC01226 -692189 sc-eQTL 8.70e-02 -0.184 0.107 0.209 intMono L2
ENSG00000287510 AL137857.1 82344 sc-eQTL 3.42e-01 0.102 0.107 0.209 intMono L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -482751 sc-eQTL 4.06e-01 0.0866 0.104 0.204 ncMono L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -482945 sc-eQTL 5.97e-01 -0.0588 0.111 0.204 ncMono L2
ENSG00000134644 PUM1 -251954 sc-eQTL 7.22e-01 -0.0323 0.0907 0.204 ncMono L2
ENSG00000162511 LAPTM5 56263 sc-eQTL 6.12e-01 0.0418 0.0823 0.204 ncMono L2
ENSG00000162512 SDC3 -94721 sc-eQTL 9.55e-01 0.0052 0.0924 0.204 ncMono L2
ENSG00000162517 PEF1 -830859 sc-eQTL 8.68e-01 -0.0176 0.106 0.204 ncMono L2
ENSG00000168528 SERINC2 -595528 sc-eQTL 4.25e-01 0.0804 0.101 0.204 ncMono L2
ENSG00000284543 LINC01226 -692189 sc-eQTL 3.84e-01 0.0877 0.101 0.204 ncMono L2
ENSG00000287510 AL137857.1 82344 sc-eQTL 4.27e-01 0.0829 0.104 0.204 ncMono L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -482751 sc-eQTL 6.66e-01 0.0521 0.12 0.206 pDC L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -482945 sc-eQTL 8.11e-01 -0.0317 0.132 0.206 pDC L2
ENSG00000134644 PUM1 -251954 sc-eQTL 1.19e-01 0.17 0.109 0.206 pDC L2
ENSG00000162511 LAPTM5 56263 sc-eQTL 5.93e-01 0.0546 0.102 0.206 pDC L2
ENSG00000162517 PEF1 -830859 sc-eQTL 3.80e-01 0.116 0.132 0.206 pDC L2
ENSG00000168528 SERINC2 -595528 sc-eQTL 1.95e-01 -0.16 0.123 0.206 pDC L2
ENSG00000284543 LINC01226 -692189 sc-eQTL 3.29e-01 0.0937 0.0957 0.206 pDC L2
ENSG00000287510 AL137857.1 82344 sc-eQTL 6.24e-01 0.0555 0.113 0.206 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000060688 SNRNP40 -482751 sc-eQTL 8.67e-01 0.0195 0.116 0.205 B_Memory LOneK1K
ENSG00000121766 ZCCHC17 -482945 sc-eQTL 7.71e-01 0.0281 0.0965 0.205 B_Memory LOneK1K
ENSG00000134644 PUM1 -251954 sc-eQTL 8.78e-02 -0.146 0.085 0.205 B_Memory LOneK1K
ENSG00000162510 MATN1 90452 sc-eQTL 4.57e-01 -0.0726 0.0974 0.205 B_Memory LOneK1K
ENSG00000162511 LAPTM5 56263 sc-eQTL 7.78e-01 0.0173 0.0613 0.205 B_Memory LOneK1K
ENSG00000162517 PEF1 -830859 sc-eQTL 6.32e-01 -0.0487 0.101 0.205 B_Memory LOneK1K
ENSG00000186056 MATN1-AS1 95533 sc-eQTL 8.48e-01 0.0155 0.0811 0.205 B_Memory LOneK1K
ENSG00000287510 AL137857.1 82344 sc-eQTL 7.74e-01 0.0253 0.0883 0.205 B_Memory LOneK1K
ENSG00000060688 SNRNP40 -482751 sc-eQTL 5.58e-01 -0.0621 0.106 0.205 B_Naive LOneK1K
ENSG00000121766 ZCCHC17 -482945 sc-eQTL 3.03e-01 -0.0863 0.0835 0.205 B_Naive LOneK1K
ENSG00000134644 PUM1 -251954 sc-eQTL 7.34e-01 -0.0269 0.0792 0.205 B_Naive LOneK1K
ENSG00000162510 MATN1 90452 sc-eQTL 3.47e-01 0.0718 0.0761 0.205 B_Naive LOneK1K
ENSG00000162511 LAPTM5 56263 sc-eQTL 1.20e-01 0.0832 0.0534 0.205 B_Naive LOneK1K
ENSG00000162517 PEF1 -830859 sc-eQTL 9.32e-01 -0.00841 0.098 0.205 B_Naive LOneK1K
ENSG00000186056 MATN1-AS1 95533 sc-eQTL 2.32e-01 0.0828 0.0691 0.205 B_Naive LOneK1K
ENSG00000287510 AL137857.1 82344 sc-eQTL 9.89e-01 0.00111 0.0824 0.205 B_Naive LOneK1K
ENSG00000060688 SNRNP40 -482751 sc-eQTL 7.44e-02 -0.159 0.0888 0.205 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000121766 ZCCHC17 -482945 sc-eQTL 3.97e-02 -0.208 0.1 0.205 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000134644 PUM1 -251954 sc-eQTL 8.07e-01 0.0158 0.0647 0.205 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000162511 LAPTM5 56263 sc-eQTL 6.81e-01 -0.0234 0.0568 0.205 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000162512 SDC3 -94721 sc-eQTL 1.23e-01 -0.179 0.115 0.205 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000162517 PEF1 -830859 sc-eQTL 6.77e-02 -0.149 0.0809 0.205 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000168528 SERINC2 -595528 sc-eQTL 4.81e-01 0.0841 0.119 0.205 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000284543 LINC01226 -692189 sc-eQTL 1.07e-01 -0.157 0.0972 0.205 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000287510 AL137857.1 82344 sc-eQTL 7.89e-02 -0.16 0.0909 0.205 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000060688 SNRNP40 -482751 sc-eQTL 4.68e-01 0.0711 0.0978 0.205 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000121766 ZCCHC17 -482945 sc-eQTL 8.39e-01 -0.0218 0.107 0.205 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000134644 PUM1 -251954 sc-eQTL 2.59e-01 -0.0991 0.0875 0.205 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000162511 LAPTM5 56263 sc-eQTL 1.40e-01 0.104 0.0699 0.205 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000162512 SDC3 -94721 sc-eQTL 1.07e-01 -0.165 0.102 0.205 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000162517 PEF1 -830859 sc-eQTL 4.27e-01 0.0741 0.093 0.205 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000168528 SERINC2 -595528 sc-eQTL 2.92e-01 0.112 0.106 0.205 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000284543 LINC01226 -692189 sc-eQTL 2.61e-01 -0.113 0.101 0.205 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000287510 AL137857.1 82344 sc-eQTL 1.80e-01 0.135 0.101 0.205 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000060688 SNRNP40 -482751 sc-eQTL 4.38e-01 -0.0843 0.108 0.207 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000121753 ADGRB2 -950856 sc-eQTL 5.74e-01 0.052 0.0924 0.207 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000121766 ZCCHC17 -482945 sc-eQTL 3.91e-01 -0.0636 0.074 0.207 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000134644 PUM1 -251954 sc-eQTL 4.93e-01 -0.0557 0.0811 0.207 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000162511 LAPTM5 56263 sc-eQTL 1.56e-01 0.129 0.0903 0.207 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000162517 PEF1 -830859 sc-eQTL 5.43e-01 0.042 0.0689 0.207 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000186056 MATN1-AS1 95533 sc-eQTL 8.63e-02 0.179 0.104 0.207 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000287510 AL137857.1 82344 sc-eQTL 9.19e-01 0.00916 0.0903 0.207 NK_CD56dim LOneK1K

Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF
ENSG00000121766 ZCCHC17 -482945 eQTL 8.36e-06 0.0986 0.022 0.0 0.0 0.216

Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina
ENSG00000121766 ZCCHC17 -482945 5.85e-07 4.78e-07 7.76e-08 3.58e-07 1.07e-07 1.26e-07 3.7e-07 8.37e-08 2.78e-07 1.78e-07 4.39e-07 3.11e-07 5.39e-07 1.07e-07 1.24e-07 1.33e-07 8.74e-08 2.87e-07 9.69e-08 8.1e-08 1.39e-07 2.48e-07 2.26e-07 7.22e-08 4.67e-07 1.94e-07 1.74e-07 1.88e-07 1.87e-07 2.1e-07 2.11e-07 6.68e-08 4.86e-08 1.17e-07 1.97e-07 5.32e-08 6.77e-08 6.78e-08 4.9e-08 7.77e-08 4.51e-08 3.06e-07 3.18e-08 1.43e-08 5.84e-08 9.12e-09 8.94e-08 0.0 4.61e-08