logo

Genes within 1Mb (chr1:30811749:C:T):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD

Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000060688 SNRNP40 -485039 sc-eQTL 6.88e-01 -0.04 0.0997 0.199 B L1
ENSG00000121766 ZCCHC17 -485233 sc-eQTL 9.61e-01 -0.00389 0.0798 0.199 B L1
ENSG00000134644 PUM1 -254242 sc-eQTL 7.28e-02 -0.12 0.0665 0.199 B L1
ENSG00000162510 MATN1 88164 sc-eQTL 6.04e-01 0.0366 0.0704 0.199 B L1
ENSG00000162511 LAPTM5 53975 sc-eQTL 1.39e-01 0.0815 0.0549 0.199 B L1
ENSG00000162517 PEF1 -833147 sc-eQTL 5.64e-01 -0.048 0.0832 0.199 B L1
ENSG00000186056 MATN1-AS1 93245 sc-eQTL 1.34e-01 0.0966 0.0643 0.199 B L1
ENSG00000287510 AL137857.1 80056 sc-eQTL 6.95e-01 -0.03 0.0765 0.199 B L1
ENSG00000060688 SNRNP40 -485039 sc-eQTL 7.31e-01 0.0296 0.0861 0.199 CD4T L1
ENSG00000121766 ZCCHC17 -485233 sc-eQTL 4.57e-01 0.05 0.0672 0.199 CD4T L1
ENSG00000134644 PUM1 -254242 sc-eQTL 6.35e-01 -0.0285 0.0599 0.199 CD4T L1
ENSG00000162511 LAPTM5 53975 sc-eQTL 4.63e-01 0.0488 0.0663 0.199 CD4T L1
ENSG00000162517 PEF1 -833147 sc-eQTL 4.97e-01 -0.0472 0.0693 0.199 CD4T L1
ENSG00000186056 MATN1-AS1 93245 sc-eQTL 8.22e-01 0.0134 0.0594 0.199 CD4T L1
ENSG00000287510 AL137857.1 80056 sc-eQTL 7.36e-01 -0.024 0.0711 0.199 CD4T L1
ENSG00000060688 SNRNP40 -485039 sc-eQTL 9.76e-01 -0.00335 0.113 0.199 CD8T L1
ENSG00000121766 ZCCHC17 -485233 sc-eQTL 3.22e-01 -0.0747 0.0753 0.199 CD8T L1
ENSG00000134644 PUM1 -254242 sc-eQTL 4.87e-01 -0.0463 0.0664 0.199 CD8T L1
ENSG00000162511 LAPTM5 53975 sc-eQTL 4.62e-02 0.128 0.0639 0.199 CD8T L1
ENSG00000162517 PEF1 -833147 sc-eQTL 8.53e-01 -0.0147 0.0795 0.199 CD8T L1
ENSG00000186056 MATN1-AS1 93245 sc-eQTL 9.65e-02 0.125 0.0752 0.199 CD8T L1
ENSG00000287510 AL137857.1 80056 sc-eQTL 5.81e-01 -0.0525 0.095 0.199 CD8T L1
ENSG00000060688 SNRNP40 -485039 sc-eQTL 4.99e-01 -0.0697 0.103 0.203 DC L1
ENSG00000121766 ZCCHC17 -485233 sc-eQTL 7.33e-01 -0.0417 0.122 0.203 DC L1
ENSG00000134644 PUM1 -254242 sc-eQTL 9.32e-01 -0.00819 0.0956 0.203 DC L1
ENSG00000162511 LAPTM5 53975 sc-eQTL 5.36e-01 -0.0423 0.0682 0.203 DC L1
ENSG00000162517 PEF1 -833147 sc-eQTL 1.37e-01 0.164 0.11 0.203 DC L1
ENSG00000168528 SERINC2 -597816 sc-eQTL 4.04e-01 -0.0939 0.112 0.203 DC L1
ENSG00000284543 LINC01226 -694477 sc-eQTL 3.94e-02 0.153 0.0738 0.203 DC L1
ENSG00000287510 AL137857.1 80056 sc-eQTL 1.27e-01 0.164 0.107 0.203 DC L1
ENSG00000060688 SNRNP40 -485039 sc-eQTL 2.67e-01 -0.0878 0.0788 0.199 Mono L1
ENSG00000121766 ZCCHC17 -485233 sc-eQTL 4.80e-02 -0.193 0.0971 0.199 Mono L1
ENSG00000134644 PUM1 -254242 sc-eQTL 6.63e-01 -0.0274 0.0628 0.199 Mono L1
ENSG00000162511 LAPTM5 53975 sc-eQTL 6.31e-01 -0.0278 0.0578 0.199 Mono L1
ENSG00000162512 SDC3 -97009 sc-eQTL 1.76e-01 -0.15 0.111 0.199 Mono L1
ENSG00000162517 PEF1 -833147 sc-eQTL 8.53e-02 -0.134 0.0774 0.199 Mono L1
ENSG00000168528 SERINC2 -597816 sc-eQTL 5.53e-01 0.0707 0.119 0.199 Mono L1
ENSG00000284543 LINC01226 -694477 sc-eQTL 7.66e-02 -0.185 0.104 0.199 Mono L1
ENSG00000287510 AL137857.1 80056 sc-eQTL 3.85e-01 -0.0798 0.0916 0.199 Mono L1
ENSG00000060688 SNRNP40 -485039 sc-eQTL 4.42e-01 -0.0831 0.108 0.2 NK L1
ENSG00000121753 ADGRB2 -953144 sc-eQTL 6.19e-01 0.0463 0.093 0.2 NK L1
ENSG00000121766 ZCCHC17 -485233 sc-eQTL 5.50e-01 -0.0442 0.0739 0.2 NK L1
ENSG00000134644 PUM1 -254242 sc-eQTL 1.83e-01 -0.103 0.0773 0.2 NK L1
ENSG00000162511 LAPTM5 53975 sc-eQTL 2.10e-01 0.112 0.089 0.2 NK L1
ENSG00000162517 PEF1 -833147 sc-eQTL 3.21e-01 0.0647 0.0651 0.2 NK L1
ENSG00000186056 MATN1-AS1 93245 sc-eQTL 4.16e-01 0.0817 0.1 0.2 NK L1
ENSG00000287510 AL137857.1 80056 sc-eQTL 7.67e-01 -0.0274 0.0927 0.2 NK L1
ENSG00000060688 SNRNP40 -485039 sc-eQTL 8.90e-01 0.0113 0.0817 0.199 Other_T L1
ENSG00000121766 ZCCHC17 -485233 sc-eQTL 2.41e-01 -0.102 0.0871 0.199 Other_T L1
ENSG00000134644 PUM1 -254242 sc-eQTL 9.01e-01 0.00974 0.0786 0.199 Other_T L1
ENSG00000162511 LAPTM5 53975 sc-eQTL 6.94e-01 -0.0253 0.0644 0.199 Other_T L1
ENSG00000162517 PEF1 -833147 sc-eQTL 3.81e-01 -0.0754 0.0858 0.199 Other_T L1
ENSG00000186056 MATN1-AS1 93245 sc-eQTL 8.93e-01 0.0142 0.105 0.199 Other_T L1
ENSG00000287510 AL137857.1 80056 sc-eQTL 7.67e-01 -0.0326 0.11 0.199 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000060688 SNRNP40 -485039 sc-eQTL 9.82e-01 -0.00292 0.127 0.199 B_Activated L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -485233 sc-eQTL 3.07e-01 0.131 0.128 0.199 B_Activated L2
ENSG00000134644 PUM1 -254242 sc-eQTL 5.57e-01 -0.0703 0.119 0.199 B_Activated L2
ENSG00000162510 MATN1 88164 sc-eQTL 6.25e-01 0.0512 0.104 0.199 B_Activated L2
ENSG00000162511 LAPTM5 53975 sc-eQTL 9.56e-01 -0.00405 0.0728 0.199 B_Activated L2
ENSG00000162517 PEF1 -833147 sc-eQTL 2.19e-01 -0.152 0.123 0.199 B_Activated L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 93245 sc-eQTL 4.34e-01 -0.092 0.117 0.199 B_Activated L2
ENSG00000287510 AL137857.1 80056 sc-eQTL 5.05e-01 -0.0693 0.104 0.199 B_Activated L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -485039 sc-eQTL 4.16e-01 0.0992 0.122 0.197 B_Intermediate L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -485233 sc-eQTL 8.66e-01 -0.0171 0.102 0.197 B_Intermediate L2
ENSG00000134644 PUM1 -254242 sc-eQTL 1.47e-01 -0.139 0.0954 0.197 B_Intermediate L2
ENSG00000162510 MATN1 88164 sc-eQTL 2.08e-01 -0.125 0.0994 0.197 B_Intermediate L2
ENSG00000162511 LAPTM5 53975 sc-eQTL 3.51e-01 0.0571 0.0611 0.197 B_Intermediate L2
ENSG00000162517 PEF1 -833147 sc-eQTL 9.07e-01 -0.0133 0.114 0.197 B_Intermediate L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 93245 sc-eQTL 7.14e-01 -0.0315 0.0859 0.197 B_Intermediate L2
ENSG00000287510 AL137857.1 80056 sc-eQTL 1.45e-01 0.14 0.0957 0.197 B_Intermediate L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -485039 sc-eQTL 6.53e-01 -0.0532 0.118 0.2 B_Memory L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -485233 sc-eQTL 6.89e-01 -0.0436 0.109 0.2 B_Memory L2
ENSG00000134644 PUM1 -254242 sc-eQTL 1.36e-01 -0.141 0.0943 0.2 B_Memory L2
ENSG00000162510 MATN1 88164 sc-eQTL 5.13e-01 -0.0594 0.0906 0.2 B_Memory L2
ENSG00000162511 LAPTM5 53975 sc-eQTL 6.12e-01 0.0409 0.0804 0.2 B_Memory L2
ENSG00000162517 PEF1 -833147 sc-eQTL 7.45e-01 0.035 0.107 0.2 B_Memory L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 93245 sc-eQTL 1.27e-01 0.14 0.0915 0.2 B_Memory L2
ENSG00000287510 AL137857.1 80056 sc-eQTL 1.40e-01 -0.159 0.107 0.2 B_Memory L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -485039 sc-eQTL 3.01e-02 -0.235 0.107 0.199 B_Naive1 L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -485233 sc-eQTL 5.43e-01 -0.0571 0.0938 0.199 B_Naive1 L2
ENSG00000134644 PUM1 -254242 sc-eQTL 8.63e-01 0.0144 0.0828 0.199 B_Naive1 L2
ENSG00000162510 MATN1 88164 sc-eQTL 2.51e-01 0.0964 0.0837 0.199 B_Naive1 L2
ENSG00000162511 LAPTM5 53975 sc-eQTL 1.29e-01 0.0849 0.0558 0.199 B_Naive1 L2
ENSG00000162517 PEF1 -833147 sc-eQTL 7.13e-01 0.0364 0.0989 0.199 B_Naive1 L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 93245 sc-eQTL 7.32e-02 0.132 0.0731 0.199 B_Naive1 L2
ENSG00000287510 AL137857.1 80056 sc-eQTL 3.38e-01 -0.0872 0.0908 0.199 B_Naive1 L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -485039 sc-eQTL 4.98e-01 0.0781 0.115 0.2 B_Naive2 L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -485233 sc-eQTL 2.88e-01 -0.101 0.0949 0.2 B_Naive2 L2
ENSG00000134644 PUM1 -254242 sc-eQTL 3.45e-01 -0.0878 0.0929 0.2 B_Naive2 L2
ENSG00000162510 MATN1 88164 sc-eQTL 6.89e-01 0.0358 0.0893 0.2 B_Naive2 L2
ENSG00000162511 LAPTM5 53975 sc-eQTL 2.50e-01 0.0698 0.0605 0.2 B_Naive2 L2
ENSG00000162517 PEF1 -833147 sc-eQTL 8.00e-01 -0.028 0.11 0.2 B_Naive2 L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 93245 sc-eQTL 9.77e-01 -0.00255 0.0884 0.2 B_Naive2 L2
ENSG00000287510 AL137857.1 80056 sc-eQTL 7.56e-01 0.0297 0.0954 0.2 B_Naive2 L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -485039 sc-eQTL 3.32e-01 -0.111 0.114 0.2 CD4_CTL L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -485233 sc-eQTL 9.29e-01 0.0101 0.113 0.2 CD4_CTL L2
ENSG00000134644 PUM1 -254242 sc-eQTL 3.63e-01 -0.101 0.11 0.2 CD4_CTL L2
ENSG00000162511 LAPTM5 53975 sc-eQTL 1.18e-01 0.154 0.098 0.2 CD4_CTL L2
ENSG00000162517 PEF1 -833147 sc-eQTL 1.44e-01 0.147 0.101 0.2 CD4_CTL L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 93245 sc-eQTL 9.26e-01 0.01 0.108 0.2 CD4_CTL L2
ENSG00000287510 AL137857.1 80056 sc-eQTL 2.72e-01 -0.104 0.0949 0.2 CD4_CTL L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -485039 sc-eQTL 6.97e-01 -0.0349 0.0897 0.199 CD4_Naive L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -485233 sc-eQTL 8.47e-01 -0.0154 0.0796 0.199 CD4_Naive L2
ENSG00000134644 PUM1 -254242 sc-eQTL 8.39e-01 -0.013 0.0636 0.199 CD4_Naive L2
ENSG00000162511 LAPTM5 53975 sc-eQTL 9.05e-01 -0.00815 0.0681 0.199 CD4_Naive L2
ENSG00000162517 PEF1 -833147 sc-eQTL 2.03e-01 -0.0951 0.0744 0.199 CD4_Naive L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 93245 sc-eQTL 9.20e-01 -0.00694 0.0691 0.199 CD4_Naive L2
ENSG00000287510 AL137857.1 80056 sc-eQTL 9.25e-01 -0.00745 0.0794 0.199 CD4_Naive L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -485039 sc-eQTL 7.41e-01 -0.0373 0.113 0.199 CD4_TCM L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -485233 sc-eQTL 4.57e-02 0.181 0.0899 0.199 CD4_TCM L2
ENSG00000134644 PUM1 -254242 sc-eQTL 9.38e-01 -0.00624 0.0804 0.199 CD4_TCM L2
ENSG00000162511 LAPTM5 53975 sc-eQTL 2.53e-01 0.0762 0.0665 0.199 CD4_TCM L2
ENSG00000162517 PEF1 -833147 sc-eQTL 8.09e-01 -0.0216 0.0894 0.199 CD4_TCM L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 93245 sc-eQTL 9.39e-01 0.00644 0.0846 0.199 CD4_TCM L2
ENSG00000287510 AL137857.1 80056 sc-eQTL 1.59e-01 0.132 0.0938 0.199 CD4_TCM L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -485039 sc-eQTL 4.25e-01 0.09 0.113 0.199 CD4_TEM L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -485233 sc-eQTL 8.91e-01 -0.0147 0.107 0.199 CD4_TEM L2
ENSG00000134644 PUM1 -254242 sc-eQTL 2.88e-01 -0.095 0.0893 0.199 CD4_TEM L2
ENSG00000162511 LAPTM5 53975 sc-eQTL 5.10e-02 0.176 0.0897 0.199 CD4_TEM L2
ENSG00000162517 PEF1 -833147 sc-eQTL 7.85e-01 0.0278 0.101 0.199 CD4_TEM L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 93245 sc-eQTL 1.79e-01 -0.142 0.105 0.199 CD4_TEM L2
ENSG00000287510 AL137857.1 80056 sc-eQTL 2.90e-01 0.111 0.104 0.199 CD4_TEM L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -485039 sc-eQTL 6.80e-01 0.0506 0.122 0.199 CD8_CTL L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -485233 sc-eQTL 5.21e-02 -0.182 0.0931 0.199 CD8_CTL L2
ENSG00000134644 PUM1 -254242 sc-eQTL 5.60e-01 -0.0532 0.0912 0.199 CD8_CTL L2
ENSG00000162511 LAPTM5 53975 sc-eQTL 7.68e-02 0.178 0.1 0.199 CD8_CTL L2
ENSG00000162517 PEF1 -833147 sc-eQTL 3.15e-01 0.0884 0.0878 0.199 CD8_CTL L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 93245 sc-eQTL 3.00e-01 0.11 0.106 0.199 CD8_CTL L2
ENSG00000287510 AL137857.1 80056 sc-eQTL 7.70e-01 -0.0293 0.0999 0.199 CD8_CTL L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -485039 sc-eQTL 5.94e-01 0.0604 0.113 0.199 CD8_Naive L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -485233 sc-eQTL 2.93e-01 -0.103 0.0973 0.199 CD8_Naive L2
ENSG00000134644 PUM1 -254242 sc-eQTL 7.83e-01 -0.0216 0.0785 0.199 CD8_Naive L2
ENSG00000162511 LAPTM5 53975 sc-eQTL 6.06e-01 -0.0388 0.0752 0.199 CD8_Naive L2
ENSG00000162517 PEF1 -833147 sc-eQTL 6.50e-01 -0.0474 0.104 0.199 CD8_Naive L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 93245 sc-eQTL 4.22e-01 0.0755 0.0937 0.199 CD8_Naive L2
ENSG00000287510 AL137857.1 80056 sc-eQTL 8.06e-01 -0.0251 0.102 0.199 CD8_Naive L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -485039 sc-eQTL 6.98e-01 0.0482 0.124 0.206 CD8_TCM L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -485233 sc-eQTL 7.75e-01 -0.0326 0.114 0.206 CD8_TCM L2
ENSG00000134644 PUM1 -254242 sc-eQTL 6.90e-01 -0.0428 0.107 0.206 CD8_TCM L2
ENSG00000162511 LAPTM5 53975 sc-eQTL 5.24e-01 0.0714 0.112 0.206 CD8_TCM L2
ENSG00000162517 PEF1 -833147 sc-eQTL 7.74e-01 0.0328 0.114 0.206 CD8_TCM L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 93245 sc-eQTL 6.34e-02 -0.192 0.103 0.206 CD8_TCM L2
ENSG00000287510 AL137857.1 80056 sc-eQTL 3.30e-01 0.102 0.105 0.206 CD8_TCM L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -485039 sc-eQTL 4.45e-01 -0.0895 0.117 0.205 CD8_TEM L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -485233 sc-eQTL 5.42e-01 -0.0685 0.112 0.205 CD8_TEM L2
ENSG00000134644 PUM1 -254242 sc-eQTL 4.53e-01 0.086 0.114 0.205 CD8_TEM L2
ENSG00000162511 LAPTM5 53975 sc-eQTL 9.31e-01 -0.00929 0.108 0.205 CD8_TEM L2
ENSG00000162517 PEF1 -833147 sc-eQTL 6.77e-02 -0.185 0.101 0.205 CD8_TEM L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 93245 sc-eQTL 7.45e-01 0.0364 0.112 0.205 CD8_TEM L2
ENSG00000287510 AL137857.1 80056 sc-eQTL 2.47e-01 -0.117 0.101 0.205 CD8_TEM L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -485039 sc-eQTL 1.80e-01 -0.159 0.118 0.201 MAIT L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -485233 sc-eQTL 1.15e-01 -0.165 0.105 0.201 MAIT L2
ENSG00000134644 PUM1 -254242 sc-eQTL 5.77e-01 0.0564 0.101 0.201 MAIT L2
ENSG00000162511 LAPTM5 53975 sc-eQTL 7.68e-01 -0.0281 0.0951 0.201 MAIT L2
ENSG00000162517 PEF1 -833147 sc-eQTL 3.45e-02 -0.22 0.103 0.201 MAIT L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 93245 sc-eQTL 2.14e-01 0.132 0.106 0.201 MAIT L2
ENSG00000287510 AL137857.1 80056 sc-eQTL 6.87e-01 -0.0441 0.109 0.201 MAIT L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -485039 sc-eQTL 7.54e-01 -0.0384 0.122 0.2 NK_CD56bright L2
ENSG00000121753 ADGRB2 -953144 sc-eQTL 6.31e-01 -0.0459 0.0956 0.2 NK_CD56bright L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -485233 sc-eQTL 7.71e-01 0.0301 0.103 0.2 NK_CD56bright L2
ENSG00000134644 PUM1 -254242 sc-eQTL 7.24e-02 -0.194 0.108 0.2 NK_CD56bright L2
ENSG00000162511 LAPTM5 53975 sc-eQTL 6.38e-01 -0.0504 0.107 0.2 NK_CD56bright L2
ENSG00000162517 PEF1 -833147 sc-eQTL 9.40e-02 0.174 0.103 0.2 NK_CD56bright L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 93245 sc-eQTL 1.81e-02 -0.253 0.106 0.2 NK_CD56bright L2
ENSG00000287510 AL137857.1 80056 sc-eQTL 1.87e-01 -0.14 0.105 0.2 NK_CD56bright L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -485039 sc-eQTL 7.93e-01 -0.0301 0.114 0.2 NK_CD56dim L2
ENSG00000121753 ADGRB2 -953144 sc-eQTL 5.82e-01 0.0554 0.101 0.2 NK_CD56dim L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -485233 sc-eQTL 5.54e-01 -0.0502 0.0846 0.2 NK_CD56dim L2
ENSG00000134644 PUM1 -254242 sc-eQTL 4.44e-01 -0.0665 0.0867 0.2 NK_CD56dim L2
ENSG00000162511 LAPTM5 53975 sc-eQTL 3.08e-01 0.0944 0.0924 0.2 NK_CD56dim L2
ENSG00000162517 PEF1 -833147 sc-eQTL 4.97e-01 0.056 0.0823 0.2 NK_CD56dim L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 93245 sc-eQTL 6.35e-01 0.0552 0.116 0.2 NK_CD56dim L2
ENSG00000287510 AL137857.1 80056 sc-eQTL 6.71e-01 -0.0408 0.0957 0.2 NK_CD56dim L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -485039 sc-eQTL 8.67e-01 -0.0203 0.122 0.205 NK_HLA L2
ENSG00000121753 ADGRB2 -953144 sc-eQTL 3.90e-01 0.083 0.0964 0.205 NK_HLA L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -485233 sc-eQTL 7.99e-01 -0.0276 0.109 0.205 NK_HLA L2
ENSG00000134644 PUM1 -254242 sc-eQTL 6.21e-01 -0.0524 0.106 0.205 NK_HLA L2
ENSG00000162511 LAPTM5 53975 sc-eQTL 1.90e-01 0.132 0.101 0.205 NK_HLA L2
ENSG00000162517 PEF1 -833147 sc-eQTL 8.55e-01 -0.0209 0.114 0.205 NK_HLA L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 93245 sc-eQTL 3.04e-01 0.11 0.107 0.205 NK_HLA L2
ENSG00000287510 AL137857.1 80056 sc-eQTL 9.70e-01 0.00387 0.104 0.205 NK_HLA L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -485039 sc-eQTL 2.81e-01 -0.119 0.11 0.2 NK_cytokine L2
ENSG00000121753 ADGRB2 -953144 sc-eQTL 3.83e-01 0.0874 0.0998 0.2 NK_cytokine L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -485233 sc-eQTL 9.75e-01 0.00266 0.0864 0.2 NK_cytokine L2
ENSG00000134644 PUM1 -254242 sc-eQTL 4.01e-01 -0.0785 0.0933 0.2 NK_cytokine L2
ENSG00000162511 LAPTM5 53975 sc-eQTL 3.84e-01 0.0896 0.103 0.2 NK_cytokine L2
ENSG00000162517 PEF1 -833147 sc-eQTL 3.13e-01 0.0884 0.0875 0.2 NK_cytokine L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 93245 sc-eQTL 7.51e-01 0.0347 0.109 0.2 NK_cytokine L2
ENSG00000287510 AL137857.1 80056 sc-eQTL 8.91e-01 -0.0139 0.101 0.2 NK_cytokine L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -485039 sc-eQTL 6.14e-02 -0.255 0.135 0.181 PB L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -485233 sc-eQTL 4.29e-01 0.126 0.159 0.181 PB L2
ENSG00000134644 PUM1 -254242 sc-eQTL 9.71e-01 0.00498 0.138 0.181 PB L2
ENSG00000162510 MATN1 88164 sc-eQTL 6.61e-01 -0.0567 0.129 0.181 PB L2
ENSG00000162511 LAPTM5 53975 sc-eQTL 5.18e-01 -0.0597 0.092 0.181 PB L2
ENSG00000162517 PEF1 -833147 sc-eQTL 3.42e-01 -0.135 0.141 0.181 PB L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 93245 sc-eQTL 6.60e-01 -0.0556 0.126 0.181 PB L2
ENSG00000287510 AL137857.1 80056 sc-eQTL 6.06e-01 -0.0693 0.134 0.181 PB L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -485039 sc-eQTL 5.39e-01 -0.054 0.0876 0.198 Pro_T L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -485233 sc-eQTL 6.01e-01 0.0582 0.111 0.198 Pro_T L2
ENSG00000134644 PUM1 -254242 sc-eQTL 1.87e-01 0.137 0.103 0.198 Pro_T L2
ENSG00000162511 LAPTM5 53975 sc-eQTL 8.73e-01 -0.0119 0.0745 0.198 Pro_T L2
ENSG00000162517 PEF1 -833147 sc-eQTL 6.95e-01 -0.043 0.109 0.198 Pro_T L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 93245 sc-eQTL 5.27e-01 0.0659 0.104 0.198 Pro_T L2
ENSG00000287510 AL137857.1 80056 sc-eQTL 8.82e-01 -0.0143 0.0958 0.198 Pro_T L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -485039 sc-eQTL 1.44e-01 0.168 0.115 0.199 Treg L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -485233 sc-eQTL 1.39e-01 0.165 0.111 0.199 Treg L2
ENSG00000134644 PUM1 -254242 sc-eQTL 1.32e-01 -0.134 0.0888 0.199 Treg L2
ENSG00000162511 LAPTM5 53975 sc-eQTL 5.09e-01 0.0676 0.102 0.199 Treg L2
ENSG00000162517 PEF1 -833147 sc-eQTL 9.59e-01 0.00562 0.11 0.199 Treg L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 93245 sc-eQTL 2.91e-03 0.307 0.102 0.199 Treg L2
ENSG00000287510 AL137857.1 80056 sc-eQTL 8.33e-02 -0.18 0.103 0.199 Treg L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -485039 sc-eQTL 8.82e-01 -0.0181 0.121 0.202 cDC L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -485233 sc-eQTL 9.26e-01 0.0122 0.131 0.202 cDC L2
ENSG00000134644 PUM1 -254242 sc-eQTL 6.48e-01 -0.0515 0.113 0.202 cDC L2
ENSG00000162511 LAPTM5 53975 sc-eQTL 5.87e-01 -0.0429 0.0789 0.202 cDC L2
ENSG00000162517 PEF1 -833147 sc-eQTL 2.27e-01 0.138 0.114 0.202 cDC L2
ENSG00000168528 SERINC2 -597816 sc-eQTL 9.43e-01 0.00723 0.101 0.202 cDC L2
ENSG00000284543 LINC01226 -694477 sc-eQTL 6.86e-01 -0.0403 0.0996 0.202 cDC L2
ENSG00000287510 AL137857.1 80056 sc-eQTL 7.33e-01 0.0366 0.107 0.202 cDC L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -485039 sc-eQTL 1.42e-01 -0.138 0.0939 0.199 cMono_IL1B L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -485233 sc-eQTL 2.36e-01 -0.125 0.105 0.199 cMono_IL1B L2
ENSG00000134644 PUM1 -254242 sc-eQTL 7.18e-01 0.0258 0.0713 0.199 cMono_IL1B L2
ENSG00000162511 LAPTM5 53975 sc-eQTL 3.12e-01 -0.0633 0.0624 0.199 cMono_IL1B L2
ENSG00000162512 SDC3 -97009 sc-eQTL 2.08e-01 -0.148 0.117 0.199 cMono_IL1B L2
ENSG00000162517 PEF1 -833147 sc-eQTL 3.45e-01 -0.091 0.0961 0.199 cMono_IL1B L2
ENSG00000168528 SERINC2 -597816 sc-eQTL 4.74e-01 0.0855 0.119 0.199 cMono_IL1B L2
ENSG00000284543 LINC01226 -694477 sc-eQTL 9.69e-02 -0.175 0.105 0.199 cMono_IL1B L2
ENSG00000287510 AL137857.1 80056 sc-eQTL 7.31e-02 -0.176 0.0976 0.199 cMono_IL1B L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -485039 sc-eQTL 7.81e-01 0.0279 0.1 0.199 cMono_S100A L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -485233 sc-eQTL 1.32e-01 -0.178 0.118 0.199 cMono_S100A L2
ENSG00000134644 PUM1 -254242 sc-eQTL 7.88e-01 0.023 0.0855 0.199 cMono_S100A L2
ENSG00000162511 LAPTM5 53975 sc-eQTL 2.12e-01 -0.082 0.0655 0.199 cMono_S100A L2
ENSG00000162512 SDC3 -97009 sc-eQTL 5.78e-01 -0.0632 0.113 0.199 cMono_S100A L2
ENSG00000162517 PEF1 -833147 sc-eQTL 2.61e-01 -0.115 0.102 0.199 cMono_S100A L2
ENSG00000168528 SERINC2 -597816 sc-eQTL 8.63e-01 0.0208 0.12 0.199 cMono_S100A L2
ENSG00000284543 LINC01226 -694477 sc-eQTL 4.00e-01 -0.0823 0.0974 0.199 cMono_S100A L2
ENSG00000287510 AL137857.1 80056 sc-eQTL 5.31e-02 -0.189 0.0971 0.199 cMono_S100A L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -485039 sc-eQTL 5.11e-01 0.0938 0.142 0.218 gdT L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -485233 sc-eQTL 8.51e-01 -0.023 0.122 0.218 gdT L2
ENSG00000134644 PUM1 -254242 sc-eQTL 7.43e-01 -0.0414 0.126 0.218 gdT L2
ENSG00000162511 LAPTM5 53975 sc-eQTL 5.08e-01 0.091 0.137 0.218 gdT L2
ENSG00000162517 PEF1 -833147 sc-eQTL 5.45e-01 -0.0761 0.125 0.218 gdT L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 93245 sc-eQTL 5.37e-01 -0.0783 0.126 0.218 gdT L2
ENSG00000287510 AL137857.1 80056 sc-eQTL 6.39e-01 -0.0577 0.123 0.218 gdT L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -485039 sc-eQTL 6.55e-01 0.0495 0.111 0.202 intMono L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -485233 sc-eQTL 7.29e-01 0.0413 0.119 0.202 intMono L2
ENSG00000134644 PUM1 -254242 sc-eQTL 2.13e-02 -0.231 0.0997 0.202 intMono L2
ENSG00000162511 LAPTM5 53975 sc-eQTL 1.90e-01 0.104 0.0789 0.202 intMono L2
ENSG00000162512 SDC3 -97009 sc-eQTL 4.31e-01 -0.0855 0.108 0.202 intMono L2
ENSG00000162517 PEF1 -833147 sc-eQTL 5.02e-01 0.0766 0.114 0.202 intMono L2
ENSG00000168528 SERINC2 -597816 sc-eQTL 4.89e-01 0.0786 0.113 0.202 intMono L2
ENSG00000284543 LINC01226 -694477 sc-eQTL 1.59e-01 -0.152 0.107 0.202 intMono L2
ENSG00000287510 AL137857.1 80056 sc-eQTL 4.83e-01 0.0755 0.108 0.202 intMono L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -485039 sc-eQTL 4.90e-01 0.0724 0.105 0.197 ncMono L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -485233 sc-eQTL 5.48e-01 -0.0672 0.112 0.197 ncMono L2
ENSG00000134644 PUM1 -254242 sc-eQTL 3.50e-01 -0.0853 0.0911 0.197 ncMono L2
ENSG00000162511 LAPTM5 53975 sc-eQTL 7.40e-01 0.0275 0.0829 0.197 ncMono L2
ENSG00000162512 SDC3 -97009 sc-eQTL 7.24e-01 0.0329 0.0929 0.197 ncMono L2
ENSG00000162517 PEF1 -833147 sc-eQTL 9.34e-01 -0.00884 0.107 0.197 ncMono L2
ENSG00000168528 SERINC2 -597816 sc-eQTL 4.28e-01 0.0805 0.101 0.197 ncMono L2
ENSG00000284543 LINC01226 -694477 sc-eQTL 3.25e-01 0.0997 0.101 0.197 ncMono L2
ENSG00000287510 AL137857.1 80056 sc-eQTL 2.35e-01 0.125 0.105 0.197 ncMono L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -485039 sc-eQTL 7.83e-01 0.0335 0.121 0.201 pDC L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -485233 sc-eQTL 9.80e-01 0.00334 0.133 0.201 pDC L2
ENSG00000134644 PUM1 -254242 sc-eQTL 1.37e-01 0.164 0.11 0.201 pDC L2
ENSG00000162511 LAPTM5 53975 sc-eQTL 5.34e-01 0.0639 0.103 0.201 pDC L2
ENSG00000162517 PEF1 -833147 sc-eQTL 6.12e-01 0.0677 0.133 0.201 pDC L2
ENSG00000168528 SERINC2 -597816 sc-eQTL 8.33e-02 -0.215 0.123 0.201 pDC L2
ENSG00000284543 LINC01226 -694477 sc-eQTL 2.54e-01 0.11 0.0963 0.201 pDC L2
ENSG00000287510 AL137857.1 80056 sc-eQTL 7.01e-01 0.0438 0.114 0.201 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000060688 SNRNP40 -485039 sc-eQTL 8.25e-01 0.0258 0.117 0.199 B_Memory LOneK1K
ENSG00000121766 ZCCHC17 -485233 sc-eQTL 5.98e-01 0.0513 0.0969 0.199 B_Memory LOneK1K
ENSG00000134644 PUM1 -254242 sc-eQTL 2.46e-02 -0.192 0.0849 0.199 B_Memory LOneK1K
ENSG00000162510 MATN1 88164 sc-eQTL 3.37e-01 -0.0941 0.0978 0.199 B_Memory LOneK1K
ENSG00000162511 LAPTM5 53975 sc-eQTL 9.39e-01 0.00475 0.0616 0.199 B_Memory LOneK1K
ENSG00000162517 PEF1 -833147 sc-eQTL 8.34e-01 -0.0214 0.102 0.199 B_Memory LOneK1K
ENSG00000186056 MATN1-AS1 93245 sc-eQTL 8.48e-01 -0.0157 0.0814 0.199 B_Memory LOneK1K
ENSG00000287510 AL137857.1 80056 sc-eQTL 8.94e-01 0.0119 0.0888 0.199 B_Memory LOneK1K
ENSG00000060688 SNRNP40 -485039 sc-eQTL 4.17e-01 -0.0859 0.106 0.199 B_Naive LOneK1K
ENSG00000121766 ZCCHC17 -485233 sc-eQTL 3.84e-01 -0.0728 0.0835 0.199 B_Naive LOneK1K
ENSG00000134644 PUM1 -254242 sc-eQTL 7.58e-01 -0.0244 0.0791 0.199 B_Naive LOneK1K
ENSG00000162510 MATN1 88164 sc-eQTL 2.65e-01 0.0848 0.0759 0.199 B_Naive LOneK1K
ENSG00000162511 LAPTM5 53975 sc-eQTL 1.99e-01 0.0689 0.0534 0.199 B_Naive LOneK1K
ENSG00000162517 PEF1 -833147 sc-eQTL 9.70e-01 -0.00368 0.0979 0.199 B_Naive LOneK1K
ENSG00000186056 MATN1-AS1 93245 sc-eQTL 1.52e-01 0.0992 0.0689 0.199 B_Naive LOneK1K
ENSG00000287510 AL137857.1 80056 sc-eQTL 7.25e-01 -0.0289 0.0822 0.199 B_Naive LOneK1K
ENSG00000060688 SNRNP40 -485039 sc-eQTL 6.53e-02 -0.166 0.0895 0.199 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000121766 ZCCHC17 -485233 sc-eQTL 4.05e-02 -0.209 0.101 0.199 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000134644 PUM1 -254242 sc-eQTL 8.80e-01 0.00982 0.0652 0.199 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000162511 LAPTM5 53975 sc-eQTL 4.10e-01 -0.0472 0.0572 0.199 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000162512 SDC3 -97009 sc-eQTL 1.91e-01 -0.153 0.116 0.199 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000162517 PEF1 -833147 sc-eQTL 8.52e-02 -0.141 0.0816 0.199 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000168528 SERINC2 -597816 sc-eQTL 6.95e-01 0.0472 0.12 0.199 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000284543 LINC01226 -694477 sc-eQTL 1.23e-01 -0.152 0.098 0.199 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000287510 AL137857.1 80056 sc-eQTL 8.35e-02 -0.159 0.0916 0.199 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000060688 SNRNP40 -485039 sc-eQTL 4.57e-01 0.0735 0.0987 0.198 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000121766 ZCCHC17 -485233 sc-eQTL 7.73e-01 -0.0313 0.108 0.198 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000134644 PUM1 -254242 sc-eQTL 8.27e-02 -0.153 0.088 0.198 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000162511 LAPTM5 53975 sc-eQTL 2.24e-01 0.0861 0.0706 0.198 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000162512 SDC3 -97009 sc-eQTL 2.03e-01 -0.132 0.103 0.198 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000162517 PEF1 -833147 sc-eQTL 5.20e-01 0.0606 0.094 0.198 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000168528 SERINC2 -597816 sc-eQTL 2.68e-01 0.119 0.107 0.198 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000284543 LINC01226 -694477 sc-eQTL 3.72e-01 -0.091 0.102 0.198 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000287510 AL137857.1 80056 sc-eQTL 1.91e-01 0.133 0.102 0.198 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000060688 SNRNP40 -485039 sc-eQTL 4.08e-01 -0.0899 0.108 0.2 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000121753 ADGRB2 -953144 sc-eQTL 5.45e-01 0.0561 0.0924 0.2 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000121766 ZCCHC17 -485233 sc-eQTL 5.10e-01 -0.049 0.0741 0.2 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000134644 PUM1 -254242 sc-eQTL 3.57e-01 -0.0749 0.0811 0.2 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000162511 LAPTM5 53975 sc-eQTL 1.93e-01 0.118 0.0905 0.2 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000162517 PEF1 -833147 sc-eQTL 5.00e-01 0.0466 0.069 0.2 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000186056 MATN1-AS1 93245 sc-eQTL 1.46e-01 0.152 0.104 0.2 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000287510 AL137857.1 80056 sc-eQTL 8.43e-01 0.0179 0.0904 0.2 NK_CD56dim LOneK1K

Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF
ENSG00000121766 ZCCHC17 -485233 eQTL 1.14e-05 0.0968 0.022 0.0 0.0 0.215

Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina
ENSG00000121766 ZCCHC17 -485233 5.37e-07 2.5e-07 6.28e-08 4.37e-07 1.05e-07 1.26e-07 3.42e-07 5.82e-08 2.38e-07 1.05e-07 2.18e-07 1.23e-07 9.57e-07 1.1e-07 6.53e-08 9.11e-08 4.35e-08 2.33e-07 1.51e-07 1.39e-07 1.26e-07 1.76e-07 2.04e-07 7.94e-08 4.27e-07 1.26e-07 1.29e-07 1.68e-07 1.47e-07 2.01e-07 2.6e-07 6.56e-08 4.86e-08 2.12e-07 3.05e-07 5.14e-08 4.21e-07 6.78e-08 1.51e-07 8.93e-08 1.8e-07 2.6e-07 3.65e-08 1.21e-08 5.84e-08 1.35e-08 1.2e-07 2.16e-09 4.69e-08