logo

Genes within 1Mb (chr1:30810517:A:G):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD

Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000060688 SNRNP40 -486271 sc-eQTL 7.49e-01 -0.0431 0.135 0.085 B L1
ENSG00000121766 ZCCHC17 -486465 sc-eQTL 7.53e-01 0.0339 0.108 0.085 B L1
ENSG00000134644 PUM1 -255474 sc-eQTL 8.29e-01 0.0196 0.0905 0.085 B L1
ENSG00000162510 MATN1 86932 sc-eQTL 8.22e-01 0.0214 0.0951 0.085 B L1
ENSG00000162511 LAPTM5 52743 sc-eQTL 5.44e-01 -0.0452 0.0744 0.085 B L1
ENSG00000162517 PEF1 -834379 sc-eQTL 4.80e-01 0.0796 0.112 0.085 B L1
ENSG00000186056 MATN1-AS1 92013 sc-eQTL 4.42e-01 0.0672 0.0872 0.085 B L1
ENSG00000287510 AL137857.1 78824 sc-eQTL 4.08e-01 0.0856 0.103 0.085 B L1
ENSG00000060688 SNRNP40 -486271 sc-eQTL 3.20e-01 -0.116 0.116 0.085 CD4T L1
ENSG00000121766 ZCCHC17 -486465 sc-eQTL 6.80e-01 -0.0376 0.0912 0.085 CD4T L1
ENSG00000134644 PUM1 -255474 sc-eQTL 5.23e-01 -0.0519 0.0811 0.085 CD4T L1
ENSG00000162511 LAPTM5 52743 sc-eQTL 1.79e-01 0.121 0.0896 0.085 CD4T L1
ENSG00000162517 PEF1 -834379 sc-eQTL 3.01e-01 -0.0973 0.0939 0.085 CD4T L1
ENSG00000186056 MATN1-AS1 92013 sc-eQTL 7.88e-01 -0.0216 0.0805 0.085 CD4T L1
ENSG00000287510 AL137857.1 78824 sc-eQTL 9.62e-01 0.0046 0.0964 0.085 CD4T L1
ENSG00000060688 SNRNP40 -486271 sc-eQTL 4.93e-01 -0.105 0.153 0.085 CD8T L1
ENSG00000121766 ZCCHC17 -486465 sc-eQTL 1.50e-01 0.146 0.101 0.085 CD8T L1
ENSG00000134644 PUM1 -255474 sc-eQTL 4.90e-01 -0.0618 0.0895 0.085 CD8T L1
ENSG00000162511 LAPTM5 52743 sc-eQTL 8.95e-01 0.0115 0.087 0.085 CD8T L1
ENSG00000162517 PEF1 -834379 sc-eQTL 9.01e-01 0.0134 0.107 0.085 CD8T L1
ENSG00000186056 MATN1-AS1 92013 sc-eQTL 5.70e-01 -0.0579 0.102 0.085 CD8T L1
ENSG00000287510 AL137857.1 78824 sc-eQTL 8.11e-01 -0.0307 0.128 0.085 CD8T L1
ENSG00000060688 SNRNP40 -486271 sc-eQTL 1.70e-01 0.189 0.137 0.088 DC L1
ENSG00000121766 ZCCHC17 -486465 sc-eQTL 2.23e-01 -0.198 0.162 0.088 DC L1
ENSG00000134644 PUM1 -255474 sc-eQTL 3.98e-01 -0.108 0.127 0.088 DC L1
ENSG00000162511 LAPTM5 52743 sc-eQTL 6.13e-01 -0.0462 0.0911 0.088 DC L1
ENSG00000162517 PEF1 -834379 sc-eQTL 5.87e-01 -0.0805 0.148 0.088 DC L1
ENSG00000168528 SERINC2 -599048 sc-eQTL 5.03e-01 0.101 0.15 0.088 DC L1
ENSG00000284543 LINC01226 -695709 sc-eQTL 1.25e-02 -0.247 0.0981 0.088 DC L1
ENSG00000287510 AL137857.1 78824 sc-eQTL 2.22e-01 0.176 0.144 0.088 DC L1
ENSG00000060688 SNRNP40 -486271 sc-eQTL 8.39e-01 -0.0217 0.107 0.085 Mono L1
ENSG00000121766 ZCCHC17 -486465 sc-eQTL 9.39e-01 -0.0101 0.132 0.085 Mono L1
ENSG00000134644 PUM1 -255474 sc-eQTL 8.39e-01 -0.0172 0.0848 0.085 Mono L1
ENSG00000162511 LAPTM5 52743 sc-eQTL 7.84e-01 -0.0214 0.0779 0.085 Mono L1
ENSG00000162512 SDC3 -98241 sc-eQTL 3.35e-02 0.317 0.148 0.085 Mono L1
ENSG00000162517 PEF1 -834379 sc-eQTL 1.91e-01 -0.137 0.105 0.085 Mono L1
ENSG00000168528 SERINC2 -599048 sc-eQTL 2.32e-01 0.192 0.16 0.085 Mono L1
ENSG00000284543 LINC01226 -695709 sc-eQTL 8.22e-01 -0.0318 0.142 0.085 Mono L1
ENSG00000287510 AL137857.1 78824 sc-eQTL 5.25e-01 0.0788 0.124 0.085 Mono L1
ENSG00000060688 SNRNP40 -486271 sc-eQTL 2.56e-01 0.168 0.148 0.086 NK L1
ENSG00000121753 ADGRB2 -954376 sc-eQTL 2.36e-01 0.151 0.127 0.086 NK L1
ENSG00000121766 ZCCHC17 -486465 sc-eQTL 8.62e-01 0.0176 0.101 0.086 NK L1
ENSG00000134644 PUM1 -255474 sc-eQTL 6.38e-01 -0.0501 0.106 0.086 NK L1
ENSG00000162511 LAPTM5 52743 sc-eQTL 4.87e-01 -0.0852 0.122 0.086 NK L1
ENSG00000162517 PEF1 -834379 sc-eQTL 3.26e-01 -0.0878 0.0891 0.086 NK L1
ENSG00000186056 MATN1-AS1 92013 sc-eQTL 5.35e-02 0.265 0.136 0.086 NK L1
ENSG00000287510 AL137857.1 78824 sc-eQTL 7.95e-01 0.033 0.127 0.086 NK L1
ENSG00000060688 SNRNP40 -486271 sc-eQTL 7.32e-01 0.0385 0.112 0.085 Other_T L1
ENSG00000121766 ZCCHC17 -486465 sc-eQTL 9.98e-01 0.000291 0.12 0.085 Other_T L1
ENSG00000134644 PUM1 -255474 sc-eQTL 4.27e-01 0.0858 0.108 0.085 Other_T L1
ENSG00000162511 LAPTM5 52743 sc-eQTL 6.62e-02 0.162 0.0878 0.085 Other_T L1
ENSG00000162517 PEF1 -834379 sc-eQTL 9.31e-01 -0.0102 0.118 0.085 Other_T L1
ENSG00000186056 MATN1-AS1 92013 sc-eQTL 2.15e-01 0.18 0.144 0.085 Other_T L1
ENSG00000287510 AL137857.1 78824 sc-eQTL 5.45e-01 0.0914 0.151 0.085 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000060688 SNRNP40 -486271 sc-eQTL 8.48e-01 0.032 0.167 0.089 B_Activated L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -486465 sc-eQTL 9.83e-01 0.00368 0.168 0.089 B_Activated L2
ENSG00000134644 PUM1 -255474 sc-eQTL 6.15e-02 0.292 0.155 0.089 B_Activated L2
ENSG00000162510 MATN1 86932 sc-eQTL 2.20e-01 0.168 0.136 0.089 B_Activated L2
ENSG00000162511 LAPTM5 52743 sc-eQTL 3.50e-02 0.2 0.0942 0.089 B_Activated L2
ENSG00000162517 PEF1 -834379 sc-eQTL 7.76e-01 0.0463 0.162 0.089 B_Activated L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 92013 sc-eQTL 5.87e-01 -0.0838 0.154 0.089 B_Activated L2
ENSG00000287510 AL137857.1 78824 sc-eQTL 4.58e-01 0.101 0.136 0.089 B_Activated L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -486271 sc-eQTL 6.75e-01 0.0691 0.165 0.086 B_Intermediate L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -486465 sc-eQTL 2.54e-01 0.157 0.137 0.086 B_Intermediate L2
ENSG00000134644 PUM1 -255474 sc-eQTL 2.39e-01 0.153 0.129 0.086 B_Intermediate L2
ENSG00000162510 MATN1 86932 sc-eQTL 6.42e-01 -0.0628 0.135 0.086 B_Intermediate L2
ENSG00000162511 LAPTM5 52743 sc-eQTL 5.36e-01 0.0513 0.0827 0.086 B_Intermediate L2
ENSG00000162517 PEF1 -834379 sc-eQTL 9.20e-01 -0.0154 0.154 0.086 B_Intermediate L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 92013 sc-eQTL 6.99e-01 0.0449 0.116 0.086 B_Intermediate L2
ENSG00000287510 AL137857.1 78824 sc-eQTL 3.14e-01 0.131 0.13 0.086 B_Intermediate L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -486271 sc-eQTL 5.87e-01 0.086 0.158 0.086 B_Memory L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -486465 sc-eQTL 9.79e-01 0.00376 0.146 0.086 B_Memory L2
ENSG00000134644 PUM1 -255474 sc-eQTL 9.99e-01 0.000134 0.127 0.086 B_Memory L2
ENSG00000162510 MATN1 86932 sc-eQTL 9.99e-01 0.000121 0.121 0.086 B_Memory L2
ENSG00000162511 LAPTM5 52743 sc-eQTL 1.31e-01 0.162 0.107 0.086 B_Memory L2
ENSG00000162517 PEF1 -834379 sc-eQTL 1.15e-01 -0.226 0.143 0.086 B_Memory L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 92013 sc-eQTL 6.93e-01 0.0488 0.123 0.086 B_Memory L2
ENSG00000287510 AL137857.1 78824 sc-eQTL 8.66e-01 0.0244 0.144 0.086 B_Memory L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -486271 sc-eQTL 3.53e-01 -0.137 0.147 0.085 B_Naive1 L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -486465 sc-eQTL 6.50e-01 0.0577 0.127 0.085 B_Naive1 L2
ENSG00000134644 PUM1 -255474 sc-eQTL 8.56e-01 0.0204 0.112 0.085 B_Naive1 L2
ENSG00000162510 MATN1 86932 sc-eQTL 9.40e-01 -0.00859 0.114 0.085 B_Naive1 L2
ENSG00000162511 LAPTM5 52743 sc-eQTL 2.61e-01 -0.0853 0.0757 0.085 B_Naive1 L2
ENSG00000162517 PEF1 -834379 sc-eQTL 8.10e-01 -0.0322 0.134 0.085 B_Naive1 L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 92013 sc-eQTL 5.66e-01 0.0572 0.0996 0.085 B_Naive1 L2
ENSG00000287510 AL137857.1 78824 sc-eQTL 5.91e-01 0.0662 0.123 0.085 B_Naive1 L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -486271 sc-eQTL 7.51e-01 0.0491 0.155 0.086 B_Naive2 L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -486465 sc-eQTL 8.53e-01 0.0236 0.128 0.086 B_Naive2 L2
ENSG00000134644 PUM1 -255474 sc-eQTL 3.97e-01 -0.106 0.125 0.086 B_Naive2 L2
ENSG00000162510 MATN1 86932 sc-eQTL 6.25e-01 -0.0588 0.12 0.086 B_Naive2 L2
ENSG00000162511 LAPTM5 52743 sc-eQTL 9.63e-01 0.00381 0.0816 0.086 B_Naive2 L2
ENSG00000162517 PEF1 -834379 sc-eQTL 6.72e-02 0.271 0.147 0.086 B_Naive2 L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 92013 sc-eQTL 9.51e-01 -0.00724 0.119 0.086 B_Naive2 L2
ENSG00000287510 AL137857.1 78824 sc-eQTL 2.93e-01 0.135 0.128 0.086 B_Naive2 L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -486271 sc-eQTL 8.95e-01 0.0202 0.153 0.086 CD4_CTL L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -486465 sc-eQTL 9.52e-01 -0.00896 0.15 0.086 CD4_CTL L2
ENSG00000134644 PUM1 -255474 sc-eQTL 2.01e-01 0.188 0.147 0.086 CD4_CTL L2
ENSG00000162511 LAPTM5 52743 sc-eQTL 9.55e-01 0.00738 0.131 0.086 CD4_CTL L2
ENSG00000162517 PEF1 -834379 sc-eQTL 2.84e-01 -0.144 0.134 0.086 CD4_CTL L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 92013 sc-eQTL 8.88e-01 -0.0203 0.144 0.086 CD4_CTL L2
ENSG00000287510 AL137857.1 78824 sc-eQTL 8.17e-01 0.0293 0.127 0.086 CD4_CTL L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -486271 sc-eQTL 8.35e-01 0.0255 0.122 0.085 CD4_Naive L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -486465 sc-eQTL 5.72e-01 -0.0614 0.108 0.085 CD4_Naive L2
ENSG00000134644 PUM1 -255474 sc-eQTL 4.22e-01 -0.0695 0.0865 0.085 CD4_Naive L2
ENSG00000162511 LAPTM5 52743 sc-eQTL 2.09e-01 0.117 0.0925 0.085 CD4_Naive L2
ENSG00000162517 PEF1 -834379 sc-eQTL 5.70e-01 -0.0579 0.102 0.085 CD4_Naive L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 92013 sc-eQTL 6.54e-01 -0.0422 0.0942 0.085 CD4_Naive L2
ENSG00000287510 AL137857.1 78824 sc-eQTL 5.23e-01 0.0692 0.108 0.085 CD4_Naive L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -486271 sc-eQTL 6.24e-03 -0.417 0.151 0.085 CD4_TCM L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -486465 sc-eQTL 2.32e-01 -0.148 0.123 0.085 CD4_TCM L2
ENSG00000134644 PUM1 -255474 sc-eQTL 8.92e-01 0.0149 0.11 0.085 CD4_TCM L2
ENSG00000162511 LAPTM5 52743 sc-eQTL 2.81e-01 0.098 0.0906 0.085 CD4_TCM L2
ENSG00000162517 PEF1 -834379 sc-eQTL 3.07e-01 -0.125 0.122 0.085 CD4_TCM L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 92013 sc-eQTL 8.25e-01 -0.0256 0.115 0.085 CD4_TCM L2
ENSG00000287510 AL137857.1 78824 sc-eQTL 9.83e-01 -0.00274 0.128 0.085 CD4_TCM L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -486271 sc-eQTL 3.38e-01 -0.146 0.152 0.085 CD4_TEM L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -486465 sc-eQTL 1.55e-01 0.206 0.145 0.085 CD4_TEM L2
ENSG00000134644 PUM1 -255474 sc-eQTL 9.72e-02 -0.2 0.12 0.085 CD4_TEM L2
ENSG00000162511 LAPTM5 52743 sc-eQTL 5.39e-01 0.0752 0.122 0.085 CD4_TEM L2
ENSG00000162517 PEF1 -834379 sc-eQTL 1.33e-01 -0.206 0.136 0.085 CD4_TEM L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 92013 sc-eQTL 2.13e-01 0.178 0.143 0.085 CD4_TEM L2
ENSG00000287510 AL137857.1 78824 sc-eQTL 2.01e-01 -0.18 0.141 0.085 CD4_TEM L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -486271 sc-eQTL 1.00e+00 -6.61e-06 0.169 0.085 CD8_CTL L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -486465 sc-eQTL 8.60e-01 -0.0229 0.13 0.085 CD8_CTL L2
ENSG00000134644 PUM1 -255474 sc-eQTL 9.24e-01 -0.012 0.126 0.085 CD8_CTL L2
ENSG00000162511 LAPTM5 52743 sc-eQTL 1.21e-01 -0.216 0.139 0.085 CD8_CTL L2
ENSG00000162517 PEF1 -834379 sc-eQTL 8.39e-01 0.0247 0.122 0.085 CD8_CTL L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 92013 sc-eQTL 2.95e-01 -0.153 0.146 0.085 CD8_CTL L2
ENSG00000287510 AL137857.1 78824 sc-eQTL 4.06e-01 -0.115 0.138 0.085 CD8_CTL L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -486271 sc-eQTL 5.58e-01 -0.0896 0.153 0.085 CD8_Naive L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -486465 sc-eQTL 2.89e-01 0.14 0.131 0.085 CD8_Naive L2
ENSG00000134644 PUM1 -255474 sc-eQTL 9.62e-01 0.00501 0.106 0.085 CD8_Naive L2
ENSG00000162511 LAPTM5 52743 sc-eQTL 1.92e-01 0.133 0.101 0.085 CD8_Naive L2
ENSG00000162517 PEF1 -834379 sc-eQTL 7.53e-01 -0.0445 0.141 0.085 CD8_Naive L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 92013 sc-eQTL 9.65e-01 0.00552 0.127 0.085 CD8_Naive L2
ENSG00000287510 AL137857.1 78824 sc-eQTL 3.61e-01 -0.126 0.138 0.085 CD8_Naive L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -486271 sc-eQTL 2.19e-01 -0.211 0.171 0.081 CD8_TCM L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -486465 sc-eQTL 1.13e-01 0.25 0.157 0.081 CD8_TCM L2
ENSG00000134644 PUM1 -255474 sc-eQTL 8.04e-01 -0.0368 0.148 0.081 CD8_TCM L2
ENSG00000162511 LAPTM5 52743 sc-eQTL 1.77e-01 -0.209 0.154 0.081 CD8_TCM L2
ENSG00000162517 PEF1 -834379 sc-eQTL 9.83e-01 0.00335 0.159 0.081 CD8_TCM L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 92013 sc-eQTL 7.38e-01 -0.0481 0.144 0.081 CD8_TCM L2
ENSG00000287510 AL137857.1 78824 sc-eQTL 6.54e-01 -0.0652 0.145 0.081 CD8_TCM L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -486271 sc-eQTL 6.64e-01 0.07 0.161 0.087 CD8_TEM L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -486465 sc-eQTL 1.36e-01 0.23 0.153 0.087 CD8_TEM L2
ENSG00000134644 PUM1 -255474 sc-eQTL 6.75e-01 -0.0662 0.158 0.087 CD8_TEM L2
ENSG00000162511 LAPTM5 52743 sc-eQTL 8.35e-01 0.0308 0.148 0.087 CD8_TEM L2
ENSG00000162517 PEF1 -834379 sc-eQTL 9.70e-01 0.00531 0.14 0.087 CD8_TEM L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 92013 sc-eQTL 8.64e-01 -0.0264 0.154 0.087 CD8_TEM L2
ENSG00000287510 AL137857.1 78824 sc-eQTL 9.32e-02 0.233 0.138 0.087 CD8_TEM L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -486271 sc-eQTL 4.21e-02 0.324 0.158 0.087 MAIT L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -486465 sc-eQTL 1.83e-01 -0.189 0.141 0.087 MAIT L2
ENSG00000134644 PUM1 -255474 sc-eQTL 6.01e-01 0.0711 0.136 0.087 MAIT L2
ENSG00000162511 LAPTM5 52743 sc-eQTL 6.37e-01 0.0606 0.128 0.087 MAIT L2
ENSG00000162517 PEF1 -834379 sc-eQTL 9.26e-01 0.0131 0.141 0.087 MAIT L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 92013 sc-eQTL 6.19e-01 -0.071 0.143 0.087 MAIT L2
ENSG00000287510 AL137857.1 78824 sc-eQTL 9.80e-01 0.00367 0.147 0.087 MAIT L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -486271 sc-eQTL 8.70e-01 -0.0264 0.161 0.087 NK_CD56bright L2
ENSG00000121753 ADGRB2 -954376 sc-eQTL 8.33e-01 0.0266 0.126 0.087 NK_CD56bright L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -486465 sc-eQTL 8.31e-01 -0.0292 0.136 0.087 NK_CD56bright L2
ENSG00000134644 PUM1 -255474 sc-eQTL 8.64e-01 -0.0246 0.143 0.087 NK_CD56bright L2
ENSG00000162511 LAPTM5 52743 sc-eQTL 3.02e-01 -0.146 0.141 0.087 NK_CD56bright L2
ENSG00000162517 PEF1 -834379 sc-eQTL 1.32e-01 -0.206 0.136 0.087 NK_CD56bright L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 92013 sc-eQTL 2.99e-01 0.147 0.141 0.087 NK_CD56bright L2
ENSG00000287510 AL137857.1 78824 sc-eQTL 4.69e-01 0.101 0.139 0.087 NK_CD56bright L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -486271 sc-eQTL 6.94e-01 0.061 0.155 0.084 NK_CD56dim L2
ENSG00000121753 ADGRB2 -954376 sc-eQTL 7.75e-01 -0.039 0.136 0.084 NK_CD56dim L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -486465 sc-eQTL 5.51e-01 0.0685 0.115 0.084 NK_CD56dim L2
ENSG00000134644 PUM1 -255474 sc-eQTL 6.56e-01 -0.0525 0.118 0.084 NK_CD56dim L2
ENSG00000162511 LAPTM5 52743 sc-eQTL 7.33e-01 -0.0429 0.125 0.084 NK_CD56dim L2
ENSG00000162517 PEF1 -834379 sc-eQTL 9.38e-01 -0.00871 0.112 0.084 NK_CD56dim L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 92013 sc-eQTL 8.88e-02 0.267 0.156 0.084 NK_CD56dim L2
ENSG00000287510 AL137857.1 78824 sc-eQTL 9.60e-01 -0.00643 0.13 0.084 NK_CD56dim L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -486271 sc-eQTL 3.05e-02 0.344 0.158 0.087 NK_HLA L2
ENSG00000121753 ADGRB2 -954376 sc-eQTL 8.82e-01 -0.0189 0.127 0.087 NK_HLA L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -486465 sc-eQTL 4.04e-01 0.119 0.142 0.087 NK_HLA L2
ENSG00000134644 PUM1 -255474 sc-eQTL 4.12e-01 -0.114 0.139 0.087 NK_HLA L2
ENSG00000162511 LAPTM5 52743 sc-eQTL 3.85e-01 -0.115 0.132 0.087 NK_HLA L2
ENSG00000162517 PEF1 -834379 sc-eQTL 4.22e-01 -0.12 0.149 0.087 NK_HLA L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 92013 sc-eQTL 1.78e-02 0.332 0.139 0.087 NK_HLA L2
ENSG00000287510 AL137857.1 78824 sc-eQTL 4.59e-01 0.101 0.136 0.087 NK_HLA L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -486271 sc-eQTL 3.39e-01 0.143 0.149 0.084 NK_cytokine L2
ENSG00000121753 ADGRB2 -954376 sc-eQTL 1.14e-02 0.34 0.133 0.084 NK_cytokine L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -486465 sc-eQTL 3.89e-01 -0.101 0.117 0.084 NK_cytokine L2
ENSG00000134644 PUM1 -255474 sc-eQTL 9.49e-01 -0.00813 0.126 0.084 NK_cytokine L2
ENSG00000162511 LAPTM5 52743 sc-eQTL 2.44e-01 -0.162 0.139 0.084 NK_cytokine L2
ENSG00000162517 PEF1 -834379 sc-eQTL 6.66e-01 -0.0512 0.119 0.084 NK_cytokine L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 92013 sc-eQTL 6.95e-01 0.0579 0.147 0.084 NK_cytokine L2
ENSG00000287510 AL137857.1 78824 sc-eQTL 9.70e-01 0.00525 0.137 0.084 NK_cytokine L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -486271 sc-eQTL 1.61e-01 0.235 0.166 0.096 PB L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -486465 sc-eQTL 4.24e-01 -0.156 0.194 0.096 PB L2
ENSG00000134644 PUM1 -255474 sc-eQTL 6.97e-01 -0.066 0.169 0.096 PB L2
ENSG00000162510 MATN1 86932 sc-eQTL 9.06e-01 -0.0187 0.158 0.096 PB L2
ENSG00000162511 LAPTM5 52743 sc-eQTL 4.14e-01 -0.0921 0.112 0.096 PB L2
ENSG00000162517 PEF1 -834379 sc-eQTL 4.71e-01 -0.125 0.173 0.096 PB L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 92013 sc-eQTL 4.04e-01 -0.129 0.154 0.096 PB L2
ENSG00000287510 AL137857.1 78824 sc-eQTL 4.19e-02 0.332 0.161 0.096 PB L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -486271 sc-eQTL 7.83e-01 -0.0321 0.116 0.087 Pro_T L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -486465 sc-eQTL 7.16e-01 -0.0537 0.148 0.087 Pro_T L2
ENSG00000134644 PUM1 -255474 sc-eQTL 4.01e-01 -0.116 0.137 0.087 Pro_T L2
ENSG00000162511 LAPTM5 52743 sc-eQTL 1.99e-01 0.127 0.0984 0.087 Pro_T L2
ENSG00000162517 PEF1 -834379 sc-eQTL 6.39e-01 0.0681 0.145 0.087 Pro_T L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 92013 sc-eQTL 3.86e-02 0.284 0.137 0.087 Pro_T L2
ENSG00000287510 AL137857.1 78824 sc-eQTL 1.95e-01 0.164 0.126 0.087 Pro_T L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -486271 sc-eQTL 6.84e-01 0.0634 0.155 0.085 Treg L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -486465 sc-eQTL 8.14e-01 0.0355 0.15 0.085 Treg L2
ENSG00000134644 PUM1 -255474 sc-eQTL 2.57e-01 0.136 0.12 0.085 Treg L2
ENSG00000162511 LAPTM5 52743 sc-eQTL 3.96e-01 0.117 0.138 0.085 Treg L2
ENSG00000162517 PEF1 -834379 sc-eQTL 4.00e-01 0.125 0.149 0.085 Treg L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 92013 sc-eQTL 1.91e-01 -0.184 0.14 0.085 Treg L2
ENSG00000287510 AL137857.1 78824 sc-eQTL 9.27e-02 0.235 0.139 0.085 Treg L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -486271 sc-eQTL 2.87e-01 0.175 0.164 0.078 cDC L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -486465 sc-eQTL 5.11e-01 -0.117 0.178 0.078 cDC L2
ENSG00000134644 PUM1 -255474 sc-eQTL 8.16e-01 0.0357 0.153 0.078 cDC L2
ENSG00000162511 LAPTM5 52743 sc-eQTL 2.52e-01 0.123 0.107 0.078 cDC L2
ENSG00000162517 PEF1 -834379 sc-eQTL 7.77e-01 0.044 0.155 0.078 cDC L2
ENSG00000168528 SERINC2 -599048 sc-eQTL 8.88e-01 -0.0195 0.138 0.078 cDC L2
ENSG00000284543 LINC01226 -695709 sc-eQTL 2.17e-01 -0.167 0.135 0.078 cDC L2
ENSG00000287510 AL137857.1 78824 sc-eQTL 2.03e-01 0.185 0.145 0.078 cDC L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -486271 sc-eQTL 8.31e-01 0.027 0.126 0.085 cMono_IL1B L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -486465 sc-eQTL 7.92e-01 0.0373 0.141 0.085 cMono_IL1B L2
ENSG00000134644 PUM1 -255474 sc-eQTL 3.78e-01 -0.0841 0.0952 0.085 cMono_IL1B L2
ENSG00000162511 LAPTM5 52743 sc-eQTL 6.69e-01 -0.0358 0.0837 0.085 cMono_IL1B L2
ENSG00000162512 SDC3 -98241 sc-eQTL 8.21e-01 0.0356 0.158 0.085 cMono_IL1B L2
ENSG00000162517 PEF1 -834379 sc-eQTL 6.83e-01 -0.0527 0.129 0.085 cMono_IL1B L2
ENSG00000168528 SERINC2 -599048 sc-eQTL 9.40e-02 0.267 0.159 0.085 cMono_IL1B L2
ENSG00000284543 LINC01226 -695709 sc-eQTL 9.88e-01 0.00215 0.141 0.085 cMono_IL1B L2
ENSG00000287510 AL137857.1 78824 sc-eQTL 8.71e-01 0.0214 0.132 0.085 cMono_IL1B L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -486271 sc-eQTL 9.86e-01 0.00227 0.133 0.085 cMono_S100A L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -486465 sc-eQTL 1.10e-01 -0.25 0.156 0.085 cMono_S100A L2
ENSG00000134644 PUM1 -255474 sc-eQTL 6.59e-01 -0.0501 0.113 0.085 cMono_S100A L2
ENSG00000162511 LAPTM5 52743 sc-eQTL 8.76e-01 -0.0136 0.0871 0.085 cMono_S100A L2
ENSG00000162512 SDC3 -98241 sc-eQTL 1.63e-01 0.21 0.15 0.085 cMono_S100A L2
ENSG00000162517 PEF1 -834379 sc-eQTL 3.64e-01 0.123 0.136 0.085 cMono_S100A L2
ENSG00000168528 SERINC2 -599048 sc-eQTL 9.96e-02 0.262 0.158 0.085 cMono_S100A L2
ENSG00000284543 LINC01226 -695709 sc-eQTL 2.65e-01 -0.144 0.129 0.085 cMono_S100A L2
ENSG00000287510 AL137857.1 78824 sc-eQTL 7.90e-01 0.0346 0.13 0.085 cMono_S100A L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -486271 sc-eQTL 5.92e-01 -0.101 0.189 0.091 gdT L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -486465 sc-eQTL 3.42e-01 0.154 0.162 0.091 gdT L2
ENSG00000134644 PUM1 -255474 sc-eQTL 6.86e-01 0.0675 0.167 0.091 gdT L2
ENSG00000162511 LAPTM5 52743 sc-eQTL 4.10e-01 0.15 0.181 0.091 gdT L2
ENSG00000162517 PEF1 -834379 sc-eQTL 7.73e-01 0.048 0.166 0.091 gdT L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 92013 sc-eQTL 7.85e-01 0.0459 0.168 0.091 gdT L2
ENSG00000287510 AL137857.1 78824 sc-eQTL 1.32e-01 0.244 0.161 0.091 gdT L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -486271 sc-eQTL 8.48e-01 -0.0297 0.155 0.082 intMono L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -486465 sc-eQTL 3.97e-01 0.141 0.167 0.082 intMono L2
ENSG00000134644 PUM1 -255474 sc-eQTL 4.37e-01 0.11 0.141 0.082 intMono L2
ENSG00000162511 LAPTM5 52743 sc-eQTL 4.45e-01 -0.0849 0.111 0.082 intMono L2
ENSG00000162512 SDC3 -98241 sc-eQTL 2.24e-01 0.185 0.152 0.082 intMono L2
ENSG00000162517 PEF1 -834379 sc-eQTL 1.52e-01 -0.229 0.159 0.082 intMono L2
ENSG00000168528 SERINC2 -599048 sc-eQTL 8.73e-02 0.272 0.158 0.082 intMono L2
ENSG00000284543 LINC01226 -695709 sc-eQTL 2.61e-01 0.17 0.15 0.082 intMono L2
ENSG00000287510 AL137857.1 78824 sc-eQTL 2.85e-01 -0.161 0.151 0.082 intMono L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -486271 sc-eQTL 9.03e-01 0.0163 0.133 0.09 ncMono L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -486465 sc-eQTL 6.12e-02 0.265 0.141 0.09 ncMono L2
ENSG00000134644 PUM1 -255474 sc-eQTL 3.56e-01 0.107 0.116 0.09 ncMono L2
ENSG00000162511 LAPTM5 52743 sc-eQTL 1.09e-01 -0.169 0.105 0.09 ncMono L2
ENSG00000162512 SDC3 -98241 sc-eQTL 2.54e-01 0.135 0.118 0.09 ncMono L2
ENSG00000162517 PEF1 -834379 sc-eQTL 8.82e-01 0.0202 0.136 0.09 ncMono L2
ENSG00000168528 SERINC2 -599048 sc-eQTL 2.22e-01 0.158 0.129 0.09 ncMono L2
ENSG00000284543 LINC01226 -695709 sc-eQTL 3.65e-01 0.117 0.129 0.09 ncMono L2
ENSG00000287510 AL137857.1 78824 sc-eQTL 4.89e-01 0.0926 0.134 0.09 ncMono L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -486271 sc-eQTL 3.82e-01 0.139 0.158 0.088 pDC L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -486465 sc-eQTL 1.93e-02 -0.404 0.171 0.088 pDC L2
ENSG00000134644 PUM1 -255474 sc-eQTL 9.03e-02 -0.244 0.143 0.088 pDC L2
ENSG00000162511 LAPTM5 52743 sc-eQTL 1.38e-01 -0.198 0.133 0.088 pDC L2
ENSG00000162517 PEF1 -834379 sc-eQTL 6.92e-01 0.069 0.174 0.088 pDC L2
ENSG00000168528 SERINC2 -599048 sc-eQTL 2.24e-01 0.198 0.162 0.088 pDC L2
ENSG00000284543 LINC01226 -695709 sc-eQTL 1.82e-02 -0.296 0.124 0.088 pDC L2
ENSG00000287510 AL137857.1 78824 sc-eQTL 4.53e-01 0.111 0.148 0.088 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000060688 SNRNP40 -486271 sc-eQTL 3.50e-01 0.147 0.157 0.085 B_Memory LOneK1K
ENSG00000121766 ZCCHC17 -486465 sc-eQTL 6.84e-01 0.0532 0.131 0.085 B_Memory LOneK1K
ENSG00000134644 PUM1 -255474 sc-eQTL 2.56e-01 0.132 0.116 0.085 B_Memory LOneK1K
ENSG00000162510 MATN1 86932 sc-eQTL 6.55e-01 0.0591 0.132 0.085 B_Memory LOneK1K
ENSG00000162511 LAPTM5 52743 sc-eQTL 1.66e-01 0.115 0.0827 0.085 B_Memory LOneK1K
ENSG00000162517 PEF1 -834379 sc-eQTL 2.28e-01 -0.166 0.137 0.085 B_Memory LOneK1K
ENSG00000186056 MATN1-AS1 92013 sc-eQTL 4.89e-01 0.0761 0.11 0.085 B_Memory LOneK1K
ENSG00000287510 AL137857.1 78824 sc-eQTL 6.97e-01 0.0467 0.12 0.085 B_Memory LOneK1K
ENSG00000060688 SNRNP40 -486271 sc-eQTL 7.04e-01 -0.0543 0.143 0.085 B_Naive LOneK1K
ENSG00000121766 ZCCHC17 -486465 sc-eQTL 7.86e-01 0.0307 0.113 0.085 B_Naive LOneK1K
ENSG00000134644 PUM1 -255474 sc-eQTL 6.21e-01 -0.0529 0.107 0.085 B_Naive LOneK1K
ENSG00000162510 MATN1 86932 sc-eQTL 9.91e-01 -0.00116 0.103 0.085 B_Naive LOneK1K
ENSG00000162511 LAPTM5 52743 sc-eQTL 3.31e-01 -0.0704 0.0723 0.085 B_Naive LOneK1K
ENSG00000162517 PEF1 -834379 sc-eQTL 3.42e-01 0.126 0.132 0.085 B_Naive LOneK1K
ENSG00000186056 MATN1-AS1 92013 sc-eQTL 4.43e-01 0.0718 0.0934 0.085 B_Naive LOneK1K
ENSG00000287510 AL137857.1 78824 sc-eQTL 9.23e-01 -0.0108 0.111 0.085 B_Naive LOneK1K
ENSG00000060688 SNRNP40 -486271 sc-eQTL 7.55e-01 -0.0377 0.121 0.085 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000121766 ZCCHC17 -486465 sc-eQTL 5.28e-01 -0.0864 0.137 0.085 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000134644 PUM1 -255474 sc-eQTL 5.25e-01 -0.0555 0.0872 0.085 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000162511 LAPTM5 52743 sc-eQTL 7.68e-01 -0.0227 0.0767 0.085 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000162512 SDC3 -98241 sc-eQTL 2.30e-01 0.188 0.156 0.085 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000162517 PEF1 -834379 sc-eQTL 9.89e-01 -0.00156 0.11 0.085 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000168528 SERINC2 -599048 sc-eQTL 1.31e-01 0.243 0.16 0.085 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000284543 LINC01226 -695709 sc-eQTL 3.84e-01 -0.115 0.132 0.085 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000287510 AL137857.1 78824 sc-eQTL 7.10e-01 0.0459 0.124 0.085 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000060688 SNRNP40 -486271 sc-eQTL 7.99e-01 0.0332 0.131 0.086 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000121766 ZCCHC17 -486465 sc-eQTL 3.39e-01 0.137 0.143 0.086 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000134644 PUM1 -255474 sc-eQTL 1.88e-01 0.154 0.117 0.086 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000162511 LAPTM5 52743 sc-eQTL 3.18e-01 -0.0935 0.0934 0.086 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000162512 SDC3 -98241 sc-eQTL 3.07e-01 0.14 0.136 0.086 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000162517 PEF1 -834379 sc-eQTL 9.53e-02 -0.207 0.123 0.086 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000168528 SERINC2 -599048 sc-eQTL 1.54e-01 0.202 0.141 0.086 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000284543 LINC01226 -695709 sc-eQTL 2.94e-01 0.141 0.134 0.086 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000287510 AL137857.1 78824 sc-eQTL 8.77e-01 0.021 0.135 0.086 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000060688 SNRNP40 -486271 sc-eQTL 2.12e-01 0.185 0.148 0.084 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000121753 ADGRB2 -954376 sc-eQTL 2.32e-01 0.151 0.126 0.084 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000121766 ZCCHC17 -486465 sc-eQTL 9.44e-01 0.0071 0.101 0.084 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000134644 PUM1 -255474 sc-eQTL 4.87e-01 -0.0773 0.111 0.084 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000162511 LAPTM5 52743 sc-eQTL 6.13e-01 -0.0628 0.124 0.084 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000162517 PEF1 -834379 sc-eQTL 4.42e-01 -0.0725 0.0942 0.084 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000186056 MATN1-AS1 92013 sc-eQTL 1.08e-01 0.23 0.142 0.084 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000287510 AL137857.1 78824 sc-eQTL 6.54e-01 0.0555 0.123 0.084 NK_CD56dim LOneK1K

Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF
ENSG00000162511 LAPTM5 52743 eQTL 0.015 -0.0401 0.0165 0.0 0.0 0.0932
ENSG00000168528 SERINC2 -599048 eQTL 0.000303 0.23 0.0633 0.0 0.0 0.0932

Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina
ENSG00000168528 SERINC2 -599048 2.91e-07 1.5e-07 4.69e-08 2.26e-07 9.25e-08 8.21e-08 1.81e-07 5.48e-08 1.45e-07 6.08e-08 1.62e-07 1.08e-07 1.79e-07 7.64e-08 6.12e-08 7.49e-08 4.18e-08 1.51e-07 6.92e-08 4.95e-08 1.27e-07 1.26e-07 1.58e-07 3.49e-08 1.85e-07 1.22e-07 1.1e-07 1.1e-07 1.24e-07 1.03e-07 1.07e-07 4.69e-08 3.56e-08 9.52e-08 2.97e-08 3.07e-08 5.96e-08 9.03e-08 6.76e-08 7.78e-08 5.1e-08 1.59e-07 4.87e-08 1.11e-08 3.29e-08 1.92e-08 1e-07 1.93e-09 4.91e-08