logo

Genes within 1Mb (chr1:30800897:C:T):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD

Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000060688 SNRNP40 -495891 sc-eQTL 9.13e-01 0.0136 0.124 0.109 B L1
ENSG00000121766 ZCCHC17 -496085 sc-eQTL 6.65e-01 -0.0432 0.0996 0.109 B L1
ENSG00000134644 PUM1 -265094 sc-eQTL 6.47e-01 0.0384 0.0836 0.109 B L1
ENSG00000162510 MATN1 77312 sc-eQTL 1.61e-01 0.123 0.0875 0.109 B L1
ENSG00000162511 LAPTM5 43123 sc-eQTL 3.34e-01 0.0665 0.0687 0.109 B L1
ENSG00000162517 PEF1 -843999 sc-eQTL 8.50e-01 0.0197 0.104 0.109 B L1
ENSG00000186056 MATN1-AS1 82393 sc-eQTL 9.42e-02 0.135 0.0801 0.109 B L1
ENSG00000287510 AL137857.1 69204 sc-eQTL 9.76e-01 -0.00288 0.0955 0.109 B L1
ENSG00000060688 SNRNP40 -495891 sc-eQTL 1.21e-01 -0.167 0.107 0.109 CD4T L1
ENSG00000121766 ZCCHC17 -496085 sc-eQTL 6.74e-01 -0.0355 0.0841 0.109 CD4T L1
ENSG00000134644 PUM1 -265094 sc-eQTL 3.72e-01 0.0669 0.0748 0.109 CD4T L1
ENSG00000162511 LAPTM5 43123 sc-eQTL 7.67e-02 0.147 0.0824 0.109 CD4T L1
ENSG00000162517 PEF1 -843999 sc-eQTL 6.10e-02 -0.162 0.0861 0.109 CD4T L1
ENSG00000186056 MATN1-AS1 82393 sc-eQTL 6.80e-01 0.0307 0.0743 0.109 CD4T L1
ENSG00000287510 AL137857.1 69204 sc-eQTL 8.09e-01 0.0216 0.089 0.109 CD4T L1
ENSG00000060688 SNRNP40 -495891 sc-eQTL 8.33e-01 0.0299 0.141 0.109 CD8T L1
ENSG00000121766 ZCCHC17 -496085 sc-eQTL 6.17e-03 0.256 0.0925 0.109 CD8T L1
ENSG00000134644 PUM1 -265094 sc-eQTL 7.99e-01 -0.0211 0.0829 0.109 CD8T L1
ENSG00000162511 LAPTM5 43123 sc-eQTL 4.04e-01 0.0672 0.0804 0.109 CD8T L1
ENSG00000162517 PEF1 -843999 sc-eQTL 8.99e-01 0.0126 0.0992 0.109 CD8T L1
ENSG00000186056 MATN1-AS1 82393 sc-eQTL 9.43e-01 -0.00673 0.0944 0.109 CD8T L1
ENSG00000287510 AL137857.1 69204 sc-eQTL 9.73e-01 -0.00398 0.119 0.109 CD8T L1
ENSG00000060688 SNRNP40 -495891 sc-eQTL 3.93e-01 0.109 0.128 0.11 DC L1
ENSG00000121766 ZCCHC17 -496085 sc-eQTL 6.68e-01 -0.0649 0.151 0.11 DC L1
ENSG00000134644 PUM1 -265094 sc-eQTL 4.16e-01 0.0965 0.118 0.11 DC L1
ENSG00000162511 LAPTM5 43123 sc-eQTL 4.35e-01 -0.0661 0.0845 0.11 DC L1
ENSG00000162517 PEF1 -843999 sc-eQTL 4.63e-01 0.101 0.137 0.11 DC L1
ENSG00000168528 SERINC2 -608668 sc-eQTL 6.57e-01 -0.062 0.139 0.11 DC L1
ENSG00000284543 LINC01226 -705329 sc-eQTL 8.33e-02 -0.16 0.0917 0.11 DC L1
ENSG00000287510 AL137857.1 69204 sc-eQTL 6.92e-01 0.053 0.134 0.11 DC L1
ENSG00000060688 SNRNP40 -495891 sc-eQTL 2.40e-01 -0.114 0.097 0.109 Mono L1
ENSG00000121766 ZCCHC17 -496085 sc-eQTL 7.11e-01 0.0447 0.121 0.109 Mono L1
ENSG00000134644 PUM1 -265094 sc-eQTL 3.01e-01 -0.0801 0.0772 0.109 Mono L1
ENSG00000162511 LAPTM5 43123 sc-eQTL 4.98e-01 -0.0483 0.0711 0.109 Mono L1
ENSG00000162512 SDC3 -107861 sc-eQTL 1.75e-01 0.185 0.136 0.109 Mono L1
ENSG00000162517 PEF1 -843999 sc-eQTL 4.05e-01 -0.0799 0.0958 0.109 Mono L1
ENSG00000168528 SERINC2 -608668 sc-eQTL 3.56e-01 0.135 0.146 0.109 Mono L1
ENSG00000284543 LINC01226 -705329 sc-eQTL 4.07e-01 0.107 0.129 0.109 Mono L1
ENSG00000287510 AL137857.1 69204 sc-eQTL 5.98e-01 -0.0596 0.113 0.109 Mono L1
ENSG00000060688 SNRNP40 -495891 sc-eQTL 1.68e-01 0.189 0.136 0.109 NK L1
ENSG00000121753 ADGRB2 -963996 sc-eQTL 4.91e-01 0.0813 0.118 0.109 NK L1
ENSG00000121766 ZCCHC17 -496085 sc-eQTL 2.41e-02 0.21 0.0926 0.109 NK L1
ENSG00000134644 PUM1 -265094 sc-eQTL 9.32e-01 -0.00841 0.0984 0.109 NK L1
ENSG00000162511 LAPTM5 43123 sc-eQTL 8.08e-01 -0.0276 0.113 0.109 NK L1
ENSG00000162517 PEF1 -843999 sc-eQTL 3.90e-01 -0.0711 0.0825 0.109 NK L1
ENSG00000186056 MATN1-AS1 82393 sc-eQTL 1.17e-01 0.199 0.126 0.109 NK L1
ENSG00000287510 AL137857.1 69204 sc-eQTL 9.63e-01 0.00544 0.117 0.109 NK L1
ENSG00000060688 SNRNP40 -495891 sc-eQTL 1.96e-01 0.133 0.103 0.109 Other_T L1
ENSG00000121766 ZCCHC17 -496085 sc-eQTL 6.24e-01 -0.0541 0.11 0.109 Other_T L1
ENSG00000134644 PUM1 -265094 sc-eQTL 5.44e-01 -0.0603 0.0991 0.109 Other_T L1
ENSG00000162511 LAPTM5 43123 sc-eQTL 1.36e-01 0.121 0.0809 0.109 Other_T L1
ENSG00000162517 PEF1 -843999 sc-eQTL 8.22e-01 -0.0244 0.109 0.109 Other_T L1
ENSG00000186056 MATN1-AS1 82393 sc-eQTL 5.52e-01 0.0793 0.133 0.109 Other_T L1
ENSG00000287510 AL137857.1 69204 sc-eQTL 4.63e-01 -0.102 0.139 0.109 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000060688 SNRNP40 -495891 sc-eQTL 6.41e-01 0.0725 0.155 0.115 B_Activated L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -496085 sc-eQTL 6.04e-01 -0.0815 0.157 0.115 B_Activated L2
ENSG00000134644 PUM1 -265094 sc-eQTL 2.64e-01 0.163 0.145 0.115 B_Activated L2
ENSG00000162510 MATN1 77312 sc-eQTL 9.38e-01 0.00986 0.127 0.115 B_Activated L2
ENSG00000162511 LAPTM5 43123 sc-eQTL 6.35e-01 0.0422 0.0887 0.115 B_Activated L2
ENSG00000162517 PEF1 -843999 sc-eQTL 3.93e-01 0.129 0.151 0.115 B_Activated L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 82393 sc-eQTL 7.18e-01 -0.0519 0.143 0.115 B_Activated L2
ENSG00000287510 AL137857.1 69204 sc-eQTL 4.16e-01 0.103 0.127 0.115 B_Activated L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -495891 sc-eQTL 8.69e-01 0.0251 0.152 0.109 B_Intermediate L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -496085 sc-eQTL 2.93e-01 0.134 0.127 0.109 B_Intermediate L2
ENSG00000134644 PUM1 -265094 sc-eQTL 2.88e-01 0.127 0.119 0.109 B_Intermediate L2
ENSG00000162510 MATN1 77312 sc-eQTL 5.87e-01 0.0678 0.125 0.109 B_Intermediate L2
ENSG00000162511 LAPTM5 43123 sc-eQTL 2.14e-01 0.0951 0.0763 0.109 B_Intermediate L2
ENSG00000162517 PEF1 -843999 sc-eQTL 4.30e-01 0.112 0.142 0.109 B_Intermediate L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 82393 sc-eQTL 5.39e-01 0.0661 0.107 0.109 B_Intermediate L2
ENSG00000287510 AL137857.1 69204 sc-eQTL 7.76e-01 0.0342 0.12 0.109 B_Intermediate L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -495891 sc-eQTL 7.45e-01 -0.0472 0.145 0.11 B_Memory L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -496085 sc-eQTL 5.45e-01 -0.0808 0.133 0.11 B_Memory L2
ENSG00000134644 PUM1 -265094 sc-eQTL 7.99e-01 -0.0297 0.116 0.11 B_Memory L2
ENSG00000162510 MATN1 77312 sc-eQTL 7.09e-01 -0.0416 0.111 0.11 B_Memory L2
ENSG00000162511 LAPTM5 43123 sc-eQTL 5.89e-01 0.0534 0.0985 0.11 B_Memory L2
ENSG00000162517 PEF1 -843999 sc-eQTL 1.59e-01 -0.185 0.131 0.11 B_Memory L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 82393 sc-eQTL 4.80e-01 0.0797 0.113 0.11 B_Memory L2
ENSG00000287510 AL137857.1 69204 sc-eQTL 1.06e-01 -0.213 0.131 0.11 B_Memory L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -495891 sc-eQTL 2.05e-01 -0.172 0.135 0.109 B_Naive1 L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -496085 sc-eQTL 8.14e-01 0.0276 0.117 0.109 B_Naive1 L2
ENSG00000134644 PUM1 -265094 sc-eQTL 7.01e-01 0.0398 0.104 0.109 B_Naive1 L2
ENSG00000162510 MATN1 77312 sc-eQTL 6.24e-01 0.0515 0.105 0.109 B_Naive1 L2
ENSG00000162511 LAPTM5 43123 sc-eQTL 9.54e-01 0.00406 0.0702 0.109 B_Naive1 L2
ENSG00000162517 PEF1 -843999 sc-eQTL 9.10e-01 -0.0141 0.124 0.109 B_Naive1 L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 82393 sc-eQTL 2.54e-01 0.105 0.0919 0.109 B_Naive1 L2
ENSG00000287510 AL137857.1 69204 sc-eQTL 9.74e-01 -0.00369 0.114 0.109 B_Naive1 L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -495891 sc-eQTL 1.42e-02 0.352 0.142 0.109 B_Naive2 L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -496085 sc-eQTL 3.66e-01 -0.108 0.119 0.109 B_Naive2 L2
ENSG00000134644 PUM1 -265094 sc-eQTL 1.02e-01 0.191 0.116 0.109 B_Naive2 L2
ENSG00000162510 MATN1 77312 sc-eQTL 1.26e-01 0.171 0.111 0.109 B_Naive2 L2
ENSG00000162511 LAPTM5 43123 sc-eQTL 8.30e-02 0.132 0.0755 0.109 B_Naive2 L2
ENSG00000162517 PEF1 -843999 sc-eQTL 5.50e-01 0.0829 0.138 0.109 B_Naive2 L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 82393 sc-eQTL 8.40e-01 0.0224 0.111 0.109 B_Naive2 L2
ENSG00000287510 AL137857.1 69204 sc-eQTL 3.86e-01 0.104 0.119 0.109 B_Naive2 L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -495891 sc-eQTL 8.73e-01 -0.0229 0.144 0.107 CD4_CTL L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -496085 sc-eQTL 6.32e-01 -0.0678 0.141 0.107 CD4_CTL L2
ENSG00000134644 PUM1 -265094 sc-eQTL 1.59e-02 0.332 0.136 0.107 CD4_CTL L2
ENSG00000162511 LAPTM5 43123 sc-eQTL 9.00e-02 -0.209 0.123 0.107 CD4_CTL L2
ENSG00000162517 PEF1 -843999 sc-eQTL 2.56e-01 -0.144 0.126 0.107 CD4_CTL L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 82393 sc-eQTL 6.15e-01 -0.068 0.135 0.107 CD4_CTL L2
ENSG00000287510 AL137857.1 69204 sc-eQTL 4.84e-01 0.0834 0.119 0.107 CD4_CTL L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -495891 sc-eQTL 3.63e-01 -0.103 0.113 0.109 CD4_Naive L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -496085 sc-eQTL 6.46e-01 -0.046 0.0999 0.109 CD4_Naive L2
ENSG00000134644 PUM1 -265094 sc-eQTL 5.00e-01 0.0539 0.0798 0.109 CD4_Naive L2
ENSG00000162511 LAPTM5 43123 sc-eQTL 1.43e-01 0.125 0.0851 0.109 CD4_Naive L2
ENSG00000162517 PEF1 -843999 sc-eQTL 1.80e-01 -0.126 0.0934 0.109 CD4_Naive L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 82393 sc-eQTL 9.49e-01 -0.00551 0.0868 0.109 CD4_Naive L2
ENSG00000287510 AL137857.1 69204 sc-eQTL 3.30e-01 0.0972 0.0995 0.109 CD4_Naive L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -495891 sc-eQTL 5.88e-02 -0.267 0.141 0.109 CD4_TCM L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -496085 sc-eQTL 6.54e-02 -0.21 0.113 0.109 CD4_TCM L2
ENSG00000134644 PUM1 -265094 sc-eQTL 8.39e-01 0.0206 0.101 0.109 CD4_TCM L2
ENSG00000162511 LAPTM5 43123 sc-eQTL 9.56e-03 0.216 0.0826 0.109 CD4_TCM L2
ENSG00000162517 PEF1 -843999 sc-eQTL 4.86e-02 -0.221 0.112 0.109 CD4_TCM L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 82393 sc-eQTL 1.97e-01 0.137 0.106 0.109 CD4_TCM L2
ENSG00000287510 AL137857.1 69204 sc-eQTL 7.86e-01 0.0323 0.119 0.109 CD4_TCM L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -495891 sc-eQTL 4.50e-01 -0.107 0.141 0.109 CD4_TEM L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -496085 sc-eQTL 1.71e-01 0.184 0.134 0.109 CD4_TEM L2
ENSG00000134644 PUM1 -265094 sc-eQTL 3.28e-01 0.11 0.112 0.109 CD4_TEM L2
ENSG00000162511 LAPTM5 43123 sc-eQTL 6.10e-02 0.212 0.113 0.109 CD4_TEM L2
ENSG00000162517 PEF1 -843999 sc-eQTL 6.46e-01 -0.0585 0.127 0.109 CD4_TEM L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 82393 sc-eQTL 3.38e-02 0.281 0.132 0.109 CD4_TEM L2
ENSG00000287510 AL137857.1 69204 sc-eQTL 1.78e-01 -0.176 0.13 0.109 CD4_TEM L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -495891 sc-eQTL 7.42e-01 -0.0513 0.156 0.109 CD8_CTL L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -496085 sc-eQTL 5.07e-02 0.233 0.118 0.109 CD8_CTL L2
ENSG00000134644 PUM1 -265094 sc-eQTL 9.68e-01 0.00459 0.116 0.109 CD8_CTL L2
ENSG00000162511 LAPTM5 43123 sc-eQTL 5.67e-01 0.0736 0.128 0.109 CD8_CTL L2
ENSG00000162517 PEF1 -843999 sc-eQTL 5.13e-01 0.0733 0.112 0.109 CD8_CTL L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 82393 sc-eQTL 5.88e-01 -0.0733 0.135 0.109 CD8_CTL L2
ENSG00000287510 AL137857.1 69204 sc-eQTL 7.80e-01 0.0355 0.127 0.109 CD8_CTL L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -495891 sc-eQTL 8.95e-01 -0.0186 0.14 0.109 CD8_Naive L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -496085 sc-eQTL 3.28e-01 0.118 0.121 0.109 CD8_Naive L2
ENSG00000134644 PUM1 -265094 sc-eQTL 5.75e-01 -0.0548 0.0974 0.109 CD8_Naive L2
ENSG00000162511 LAPTM5 43123 sc-eQTL 9.54e-02 0.155 0.0928 0.109 CD8_Naive L2
ENSG00000162517 PEF1 -843999 sc-eQTL 5.34e-01 -0.0808 0.13 0.109 CD8_Naive L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 82393 sc-eQTL 7.11e-01 0.0432 0.117 0.109 CD8_Naive L2
ENSG00000287510 AL137857.1 69204 sc-eQTL 9.02e-01 -0.0156 0.127 0.109 CD8_Naive L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -495891 sc-eQTL 6.80e-02 -0.286 0.156 0.104 CD8_TCM L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -496085 sc-eQTL 1.41e-01 0.212 0.143 0.104 CD8_TCM L2
ENSG00000134644 PUM1 -265094 sc-eQTL 3.50e-01 -0.127 0.135 0.104 CD8_TCM L2
ENSG00000162511 LAPTM5 43123 sc-eQTL 1.64e-01 -0.198 0.141 0.104 CD8_TCM L2
ENSG00000162517 PEF1 -843999 sc-eQTL 5.49e-01 0.087 0.145 0.104 CD8_TCM L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 82393 sc-eQTL 4.03e-01 -0.11 0.131 0.104 CD8_TCM L2
ENSG00000287510 AL137857.1 69204 sc-eQTL 2.83e-01 -0.142 0.132 0.104 CD8_TCM L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -495891 sc-eQTL 1.78e-02 0.355 0.149 0.103 CD8_TEM L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -496085 sc-eQTL 8.22e-02 0.25 0.143 0.103 CD8_TEM L2
ENSG00000134644 PUM1 -265094 sc-eQTL 7.90e-03 -0.389 0.145 0.103 CD8_TEM L2
ENSG00000162511 LAPTM5 43123 sc-eQTL 4.47e-01 0.106 0.139 0.103 CD8_TEM L2
ENSG00000162517 PEF1 -843999 sc-eQTL 5.10e-01 -0.0862 0.131 0.103 CD8_TEM L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 82393 sc-eQTL 9.34e-01 0.0119 0.144 0.103 CD8_TEM L2
ENSG00000287510 AL137857.1 69204 sc-eQTL 3.40e-01 0.125 0.13 0.103 CD8_TEM L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -495891 sc-eQTL 2.90e-02 0.326 0.148 0.106 MAIT L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -496085 sc-eQTL 9.25e-01 0.0126 0.133 0.106 MAIT L2
ENSG00000134644 PUM1 -265094 sc-eQTL 7.58e-01 -0.0393 0.127 0.106 MAIT L2
ENSG00000162511 LAPTM5 43123 sc-eQTL 1.88e-01 0.158 0.12 0.106 MAIT L2
ENSG00000162517 PEF1 -843999 sc-eQTL 1.14e-01 0.208 0.131 0.106 MAIT L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 82393 sc-eQTL 7.56e-01 -0.0416 0.134 0.106 MAIT L2
ENSG00000287510 AL137857.1 69204 sc-eQTL 8.20e-01 -0.0314 0.138 0.106 MAIT L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -495891 sc-eQTL 8.05e-01 0.0376 0.152 0.109 NK_CD56bright L2
ENSG00000121753 ADGRB2 -963996 sc-eQTL 9.90e-01 -0.00143 0.119 0.109 NK_CD56bright L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -496085 sc-eQTL 4.62e-01 0.0943 0.128 0.109 NK_CD56bright L2
ENSG00000134644 PUM1 -265094 sc-eQTL 4.17e-01 0.109 0.134 0.109 NK_CD56bright L2
ENSG00000162511 LAPTM5 43123 sc-eQTL 2.37e-01 -0.157 0.132 0.109 NK_CD56bright L2
ENSG00000162517 PEF1 -843999 sc-eQTL 2.55e-01 -0.147 0.128 0.109 NK_CD56bright L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 82393 sc-eQTL 7.85e-01 -0.0364 0.133 0.109 NK_CD56bright L2
ENSG00000287510 AL137857.1 69204 sc-eQTL 8.38e-01 0.0268 0.131 0.109 NK_CD56bright L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -495891 sc-eQTL 5.85e-01 0.0789 0.144 0.108 NK_CD56dim L2
ENSG00000121753 ADGRB2 -963996 sc-eQTL 4.28e-01 0.101 0.127 0.108 NK_CD56dim L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -496085 sc-eQTL 1.17e-01 0.167 0.106 0.108 NK_CD56dim L2
ENSG00000134644 PUM1 -265094 sc-eQTL 8.78e-01 -0.0168 0.11 0.108 NK_CD56dim L2
ENSG00000162511 LAPTM5 43123 sc-eQTL 8.92e-01 0.0158 0.117 0.108 NK_CD56dim L2
ENSG00000162517 PEF1 -843999 sc-eQTL 4.74e-01 -0.0745 0.104 0.108 NK_CD56dim L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 82393 sc-eQTL 1.23e-01 0.225 0.146 0.108 NK_CD56dim L2
ENSG00000287510 AL137857.1 69204 sc-eQTL 8.62e-01 -0.0211 0.121 0.108 NK_CD56dim L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -495891 sc-eQTL 4.56e-02 0.314 0.156 0.105 NK_HLA L2
ENSG00000121753 ADGRB2 -963996 sc-eQTL 4.37e-01 -0.0974 0.125 0.105 NK_HLA L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -496085 sc-eQTL 1.09e-01 0.226 0.14 0.105 NK_HLA L2
ENSG00000134644 PUM1 -265094 sc-eQTL 5.24e-01 0.0875 0.137 0.105 NK_HLA L2
ENSG00000162511 LAPTM5 43123 sc-eQTL 3.99e-01 0.111 0.131 0.105 NK_HLA L2
ENSG00000162517 PEF1 -843999 sc-eQTL 1.86e-01 -0.195 0.147 0.105 NK_HLA L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 82393 sc-eQTL 9.74e-02 0.231 0.138 0.105 NK_HLA L2
ENSG00000287510 AL137857.1 69204 sc-eQTL 9.55e-01 -0.00766 0.135 0.105 NK_HLA L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -495891 sc-eQTL 4.68e-01 0.101 0.139 0.108 NK_cytokine L2
ENSG00000121753 ADGRB2 -963996 sc-eQTL 4.05e-01 0.105 0.125 0.108 NK_cytokine L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -496085 sc-eQTL 2.15e-01 0.134 0.108 0.108 NK_cytokine L2
ENSG00000134644 PUM1 -265094 sc-eQTL 8.09e-01 0.0283 0.117 0.108 NK_cytokine L2
ENSG00000162511 LAPTM5 43123 sc-eQTL 5.56e-01 -0.0762 0.129 0.108 NK_cytokine L2
ENSG00000162517 PEF1 -843999 sc-eQTL 1.24e-01 -0.169 0.109 0.108 NK_cytokine L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 82393 sc-eQTL 3.30e-01 0.133 0.137 0.108 NK_cytokine L2
ENSG00000287510 AL137857.1 69204 sc-eQTL 8.68e-01 0.0212 0.127 0.108 NK_cytokine L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -495891 sc-eQTL 5.08e-02 0.301 0.153 0.133 PB L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -496085 sc-eQTL 2.68e-01 -0.199 0.179 0.133 PB L2
ENSG00000134644 PUM1 -265094 sc-eQTL 3.23e-01 -0.154 0.156 0.133 PB L2
ENSG00000162510 MATN1 77312 sc-eQTL 2.99e-01 0.151 0.145 0.133 PB L2
ENSG00000162511 LAPTM5 43123 sc-eQTL 1.05e-01 -0.168 0.103 0.133 PB L2
ENSG00000162517 PEF1 -843999 sc-eQTL 3.48e-01 -0.15 0.16 0.133 PB L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 82393 sc-eQTL 5.57e-01 0.0837 0.142 0.133 PB L2
ENSG00000287510 AL137857.1 69204 sc-eQTL 4.32e-01 -0.119 0.151 0.133 PB L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -495891 sc-eQTL 6.47e-01 0.0499 0.109 0.111 Pro_T L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -496085 sc-eQTL 2.74e-01 -0.151 0.138 0.111 Pro_T L2
ENSG00000134644 PUM1 -265094 sc-eQTL 3.73e-01 -0.115 0.128 0.111 Pro_T L2
ENSG00000162511 LAPTM5 43123 sc-eQTL 2.33e-01 0.11 0.092 0.111 Pro_T L2
ENSG00000162517 PEF1 -843999 sc-eQTL 7.42e-01 -0.0446 0.135 0.111 Pro_T L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 82393 sc-eQTL 9.50e-02 0.215 0.128 0.111 Pro_T L2
ENSG00000287510 AL137857.1 69204 sc-eQTL 3.74e-01 -0.106 0.118 0.111 Pro_T L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -495891 sc-eQTL 5.48e-01 0.088 0.146 0.109 Treg L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -496085 sc-eQTL 4.65e-01 0.104 0.141 0.109 Treg L2
ENSG00000134644 PUM1 -265094 sc-eQTL 2.01e-01 0.145 0.113 0.109 Treg L2
ENSG00000162511 LAPTM5 43123 sc-eQTL 8.73e-01 0.0209 0.13 0.109 Treg L2
ENSG00000162517 PEF1 -843999 sc-eQTL 8.83e-01 -0.0207 0.14 0.109 Treg L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 82393 sc-eQTL 1.55e-01 -0.188 0.132 0.109 Treg L2
ENSG00000287510 AL137857.1 69204 sc-eQTL 9.36e-01 0.0106 0.132 0.109 Treg L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -495891 sc-eQTL 1.80e-01 0.202 0.15 0.1 cDC L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -496085 sc-eQTL 9.02e-01 -0.0202 0.163 0.1 cDC L2
ENSG00000134644 PUM1 -265094 sc-eQTL 1.09e-01 0.223 0.139 0.1 cDC L2
ENSG00000162511 LAPTM5 43123 sc-eQTL 7.62e-01 -0.0297 0.098 0.1 cDC L2
ENSG00000162517 PEF1 -843999 sc-eQTL 1.83e-01 0.189 0.141 0.1 cDC L2
ENSG00000168528 SERINC2 -608668 sc-eQTL 8.59e-01 -0.0224 0.126 0.1 cDC L2
ENSG00000284543 LINC01226 -705329 sc-eQTL 3.71e-01 -0.111 0.123 0.1 cDC L2
ENSG00000287510 AL137857.1 69204 sc-eQTL 7.31e-01 0.0457 0.133 0.1 cDC L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -495891 sc-eQTL 8.49e-01 0.0224 0.117 0.109 cMono_IL1B L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -496085 sc-eQTL 6.26e-01 -0.0635 0.13 0.109 cMono_IL1B L2
ENSG00000134644 PUM1 -265094 sc-eQTL 1.96e-01 -0.114 0.0879 0.109 cMono_IL1B L2
ENSG00000162511 LAPTM5 43123 sc-eQTL 2.16e-01 -0.0958 0.0772 0.109 cMono_IL1B L2
ENSG00000162512 SDC3 -107861 sc-eQTL 7.58e-01 -0.045 0.146 0.109 cMono_IL1B L2
ENSG00000162517 PEF1 -843999 sc-eQTL 9.06e-01 0.0141 0.119 0.109 cMono_IL1B L2
ENSG00000168528 SERINC2 -608668 sc-eQTL 1.56e-01 0.209 0.147 0.109 cMono_IL1B L2
ENSG00000284543 LINC01226 -705329 sc-eQTL 5.23e-01 0.0834 0.13 0.109 cMono_IL1B L2
ENSG00000287510 AL137857.1 69204 sc-eQTL 1.66e-01 -0.168 0.121 0.109 cMono_IL1B L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -495891 sc-eQTL 5.81e-01 -0.0677 0.122 0.109 cMono_S100A L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -496085 sc-eQTL 1.85e-01 -0.192 0.144 0.109 cMono_S100A L2
ENSG00000134644 PUM1 -265094 sc-eQTL 6.13e-02 -0.195 0.104 0.109 cMono_S100A L2
ENSG00000162511 LAPTM5 43123 sc-eQTL 3.08e-01 -0.082 0.0803 0.109 cMono_S100A L2
ENSG00000162512 SDC3 -107861 sc-eQTL 3.39e-01 0.133 0.139 0.109 cMono_S100A L2
ENSG00000162517 PEF1 -843999 sc-eQTL 7.81e-01 0.035 0.125 0.109 cMono_S100A L2
ENSG00000168528 SERINC2 -608668 sc-eQTL 2.16e-01 0.182 0.147 0.109 cMono_S100A L2
ENSG00000284543 LINC01226 -705329 sc-eQTL 9.87e-01 -0.0019 0.12 0.109 cMono_S100A L2
ENSG00000287510 AL137857.1 69204 sc-eQTL 3.91e-01 -0.103 0.12 0.109 cMono_S100A L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -495891 sc-eQTL 7.36e-01 0.065 0.193 0.106 gdT L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -496085 sc-eQTL 6.94e-01 0.0652 0.165 0.106 gdT L2
ENSG00000134644 PUM1 -265094 sc-eQTL 9.17e-01 -0.0178 0.171 0.106 gdT L2
ENSG00000162511 LAPTM5 43123 sc-eQTL 9.10e-01 0.021 0.185 0.106 gdT L2
ENSG00000162517 PEF1 -843999 sc-eQTL 6.92e-01 0.0674 0.169 0.106 gdT L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 82393 sc-eQTL 8.49e-01 0.0327 0.171 0.106 gdT L2
ENSG00000287510 AL137857.1 69204 sc-eQTL 2.80e-01 0.179 0.165 0.106 gdT L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -495891 sc-eQTL 3.26e-01 -0.133 0.135 0.109 intMono L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -496085 sc-eQTL 4.95e-01 0.0993 0.145 0.109 intMono L2
ENSG00000134644 PUM1 -265094 sc-eQTL 2.76e-01 0.135 0.123 0.109 intMono L2
ENSG00000162511 LAPTM5 43123 sc-eQTL 5.90e-01 -0.0523 0.0968 0.109 intMono L2
ENSG00000162512 SDC3 -107861 sc-eQTL 6.24e-01 0.065 0.133 0.109 intMono L2
ENSG00000162517 PEF1 -843999 sc-eQTL 6.57e-01 -0.062 0.139 0.109 intMono L2
ENSG00000168528 SERINC2 -608668 sc-eQTL 7.55e-01 0.0434 0.139 0.109 intMono L2
ENSG00000284543 LINC01226 -705329 sc-eQTL 2.06e-01 0.166 0.131 0.109 intMono L2
ENSG00000287510 AL137857.1 69204 sc-eQTL 7.72e-01 -0.0381 0.132 0.109 intMono L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -495891 sc-eQTL 6.53e-01 -0.0576 0.128 0.113 ncMono L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -496085 sc-eQTL 3.57e-02 0.285 0.135 0.113 ncMono L2
ENSG00000134644 PUM1 -265094 sc-eQTL 2.86e-01 0.119 0.111 0.113 ncMono L2
ENSG00000162511 LAPTM5 43123 sc-eQTL 3.44e-01 -0.0956 0.101 0.113 ncMono L2
ENSG00000162512 SDC3 -107861 sc-eQTL 9.98e-01 -0.000245 0.113 0.113 ncMono L2
ENSG00000162517 PEF1 -843999 sc-eQTL 8.01e-01 0.0328 0.13 0.113 ncMono L2
ENSG00000168528 SERINC2 -608668 sc-eQTL 2.08e-01 0.156 0.123 0.113 ncMono L2
ENSG00000284543 LINC01226 -705329 sc-eQTL 8.85e-01 -0.0179 0.124 0.113 ncMono L2
ENSG00000287510 AL137857.1 69204 sc-eQTL 8.64e-01 0.022 0.128 0.113 ncMono L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -495891 sc-eQTL 4.39e-01 0.117 0.151 0.11 pDC L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -496085 sc-eQTL 1.96e-01 -0.214 0.165 0.11 pDC L2
ENSG00000134644 PUM1 -265094 sc-eQTL 1.25e-01 -0.21 0.136 0.11 pDC L2
ENSG00000162511 LAPTM5 43123 sc-eQTL 3.58e-01 -0.117 0.127 0.11 pDC L2
ENSG00000162517 PEF1 -843999 sc-eQTL 6.05e-01 0.0857 0.165 0.11 pDC L2
ENSG00000168528 SERINC2 -608668 sc-eQTL 6.22e-01 0.0764 0.155 0.11 pDC L2
ENSG00000284543 LINC01226 -705329 sc-eQTL 1.80e-01 -0.161 0.119 0.11 pDC L2
ENSG00000287510 AL137857.1 69204 sc-eQTL 6.15e-01 0.0712 0.141 0.11 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000060688 SNRNP40 -495891 sc-eQTL 7.31e-01 0.0495 0.144 0.109 B_Memory LOneK1K
ENSG00000121766 ZCCHC17 -496085 sc-eQTL 6.07e-01 -0.0617 0.12 0.109 B_Memory LOneK1K
ENSG00000134644 PUM1 -265094 sc-eQTL 7.61e-01 0.0323 0.106 0.109 B_Memory LOneK1K
ENSG00000162510 MATN1 77312 sc-eQTL 3.20e-01 0.12 0.121 0.109 B_Memory LOneK1K
ENSG00000162511 LAPTM5 43123 sc-eQTL 1.70e-01 0.104 0.0757 0.109 B_Memory LOneK1K
ENSG00000162517 PEF1 -843999 sc-eQTL 5.88e-01 -0.0683 0.126 0.109 B_Memory LOneK1K
ENSG00000186056 MATN1-AS1 82393 sc-eQTL 3.59e-01 0.0924 0.1 0.109 B_Memory LOneK1K
ENSG00000287510 AL137857.1 69204 sc-eQTL 2.11e-01 -0.137 0.109 0.109 B_Memory LOneK1K
ENSG00000060688 SNRNP40 -495891 sc-eQTL 8.94e-01 0.0176 0.132 0.109 B_Naive LOneK1K
ENSG00000121766 ZCCHC17 -496085 sc-eQTL 6.34e-01 -0.0498 0.105 0.109 B_Naive LOneK1K
ENSG00000134644 PUM1 -265094 sc-eQTL 3.73e-01 0.0882 0.0988 0.109 B_Naive LOneK1K
ENSG00000162510 MATN1 77312 sc-eQTL 2.54e-01 0.109 0.095 0.109 B_Naive LOneK1K
ENSG00000162511 LAPTM5 43123 sc-eQTL 5.75e-01 0.0376 0.067 0.109 B_Naive LOneK1K
ENSG00000162517 PEF1 -843999 sc-eQTL 7.74e-01 0.0352 0.122 0.109 B_Naive LOneK1K
ENSG00000186056 MATN1-AS1 82393 sc-eQTL 4.25e-01 0.0691 0.0865 0.109 B_Naive LOneK1K
ENSG00000287510 AL137857.1 69204 sc-eQTL 8.09e-01 -0.0248 0.103 0.109 B_Naive LOneK1K
ENSG00000060688 SNRNP40 -495891 sc-eQTL 4.83e-01 -0.0787 0.112 0.109 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000121766 ZCCHC17 -496085 sc-eQTL 4.11e-01 -0.104 0.127 0.109 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000134644 PUM1 -265094 sc-eQTL 5.16e-02 -0.157 0.0802 0.109 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000162511 LAPTM5 43123 sc-eQTL 2.94e-01 -0.0746 0.071 0.109 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000162512 SDC3 -107861 sc-eQTL 3.92e-01 0.124 0.145 0.109 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000162517 PEF1 -843999 sc-eQTL 6.03e-01 -0.0532 0.102 0.109 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000168528 SERINC2 -608668 sc-eQTL 2.67e-01 0.166 0.149 0.109 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000284543 LINC01226 -705329 sc-eQTL 7.46e-01 0.0398 0.122 0.109 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000287510 AL137857.1 69204 sc-eQTL 1.95e-01 -0.149 0.114 0.109 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000060688 SNRNP40 -495891 sc-eQTL 2.66e-01 -0.133 0.119 0.11 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000121766 ZCCHC17 -496085 sc-eQTL 7.87e-02 0.229 0.13 0.11 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000134644 PUM1 -265094 sc-eQTL 1.24e-01 0.165 0.107 0.11 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000162511 LAPTM5 43123 sc-eQTL 3.19e-01 -0.0854 0.0855 0.11 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000162512 SDC3 -107861 sc-eQTL 6.95e-01 0.0492 0.125 0.11 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000162517 PEF1 -843999 sc-eQTL 5.03e-01 -0.0764 0.114 0.11 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000168528 SERINC2 -608668 sc-eQTL 5.84e-01 0.0711 0.13 0.11 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000284543 LINC01226 -705329 sc-eQTL 3.23e-01 0.122 0.123 0.11 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000287510 AL137857.1 69204 sc-eQTL 9.97e-01 -0.00052 0.123 0.11 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000060688 SNRNP40 -495891 sc-eQTL 1.75e-01 0.187 0.137 0.108 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000121753 ADGRB2 -963996 sc-eQTL 4.91e-01 0.081 0.117 0.108 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000121766 ZCCHC17 -496085 sc-eQTL 1.82e-02 0.221 0.093 0.108 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000134644 PUM1 -265094 sc-eQTL 9.73e-01 -0.00353 0.103 0.108 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000162511 LAPTM5 43123 sc-eQTL 7.78e-01 -0.0325 0.115 0.108 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000162517 PEF1 -843999 sc-eQTL 2.21e-01 -0.107 0.0873 0.108 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000186056 MATN1-AS1 82393 sc-eQTL 5.65e-02 0.253 0.132 0.108 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000287510 AL137857.1 69204 sc-eQTL 9.94e-01 -0.00087 0.115 0.108 NK_CD56dim LOneK1K

Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF
ENSG00000121766 ZCCHC17 -496085 eQTL 4.60e-03 -0.0791 0.0278 0.0 0.0 0.105
ENSG00000168528 SERINC2 -608668 eQTL 0.00115 0.197 0.0604 0.0 0.0 0.105

Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina
ENSG00000168528 SERINC2 -608668 4.21e-07 2.17e-07 7.45e-08 2.35e-07 1.05e-07 1.28e-07 2.86e-07 7.12e-08 2.01e-07 1.28e-07 2.18e-07 1.91e-07 3.18e-07 8.54e-08 8.45e-08 1.13e-07 6.81e-08 2.56e-07 8.68e-08 8.1e-08 1.34e-07 2.09e-07 1.86e-07 4.25e-08 2.86e-07 1.76e-07 1.39e-07 1.52e-07 1.44e-07 1.89e-07 1.43e-07 6.78e-08 5.09e-08 1.03e-07 9.25e-08 4.68e-08 6.24e-08 5.36e-08 4.9e-08 8.06e-08 4.84e-08 1.64e-07 3.31e-08 1.07e-08 5.49e-08 8.94e-09 9.12e-08 2.8e-09 4.59e-08
ENSG00000186056 \N 82393 5.62e-06 6.19e-06 7.05e-07 3.36e-06 1.74e-06 1.81e-06 8.03e-06 1.22e-06 4.65e-06 3.08e-06 7.6e-06 3.03e-06 1e-05 2.24e-06 9.95e-07 4.12e-06 2.92e-06 3.74e-06 1.62e-06 1.72e-06 2.55e-06 6.37e-06 4.87e-06 1.91e-06 8.97e-06 2.34e-06 2.89e-06 1.8e-06 6.12e-06 6.65e-06 3.09e-06 4.97e-07 7.42e-07 2.53e-06 2.1e-06 1.6e-06 1.12e-06 5.07e-07 1.42e-06 7.17e-07 8.22e-07 7.87e-06 6.61e-07 1.59e-07 7.94e-07 7.62e-07 1.04e-06 6.26e-07 5.78e-07