logo

Genes within 1Mb (chr1:30799603:C:T):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD

Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000060688 SNRNP40 -497185 sc-eQTL 8.74e-01 -0.0201 0.127 0.103 B L1
ENSG00000121766 ZCCHC17 -497379 sc-eQTL 8.53e-02 -0.174 0.101 0.103 B L1
ENSG00000134644 PUM1 -266388 sc-eQTL 4.44e-02 0.171 0.0844 0.103 B L1
ENSG00000162510 MATN1 76018 sc-eQTL 3.90e-01 0.077 0.0894 0.103 B L1
ENSG00000162511 LAPTM5 41829 sc-eQTL 3.91e-01 0.0603 0.07 0.103 B L1
ENSG00000162517 PEF1 -845293 sc-eQTL 7.46e-01 -0.0343 0.106 0.103 B L1
ENSG00000186056 MATN1-AS1 81099 sc-eQTL 9.70e-01 -0.00306 0.0822 0.103 B L1
ENSG00000287510 AL137857.1 67910 sc-eQTL 9.81e-01 -0.00227 0.0973 0.103 B L1
ENSG00000060688 SNRNP40 -497185 sc-eQTL 8.39e-01 0.0218 0.108 0.103 CD4T L1
ENSG00000121766 ZCCHC17 -497379 sc-eQTL 9.53e-01 -0.00492 0.084 0.103 CD4T L1
ENSG00000134644 PUM1 -266388 sc-eQTL 9.68e-01 0.00303 0.0748 0.103 CD4T L1
ENSG00000162511 LAPTM5 41829 sc-eQTL 1.55e-02 0.2 0.0818 0.103 CD4T L1
ENSG00000162517 PEF1 -845293 sc-eQTL 8.29e-01 0.0188 0.0867 0.103 CD4T L1
ENSG00000186056 MATN1-AS1 81099 sc-eQTL 7.47e-02 -0.132 0.0736 0.103 CD4T L1
ENSG00000287510 AL137857.1 67910 sc-eQTL 4.75e-01 -0.0635 0.0887 0.103 CD4T L1
ENSG00000060688 SNRNP40 -497185 sc-eQTL 2.46e-01 -0.164 0.141 0.103 CD8T L1
ENSG00000121766 ZCCHC17 -497379 sc-eQTL 2.18e-01 -0.116 0.0935 0.103 CD8T L1
ENSG00000134644 PUM1 -266388 sc-eQTL 6.99e-01 0.032 0.0826 0.103 CD8T L1
ENSG00000162511 LAPTM5 41829 sc-eQTL 4.39e-02 0.161 0.0795 0.103 CD8T L1
ENSG00000162517 PEF1 -845293 sc-eQTL 3.05e-01 0.101 0.0986 0.103 CD8T L1
ENSG00000186056 MATN1-AS1 81099 sc-eQTL 4.27e-01 0.0748 0.0939 0.103 CD8T L1
ENSG00000287510 AL137857.1 67910 sc-eQTL 5.91e-01 -0.0635 0.118 0.103 CD8T L1
ENSG00000060688 SNRNP40 -497185 sc-eQTL 1.31e-01 0.189 0.125 0.106 DC L1
ENSG00000121766 ZCCHC17 -497379 sc-eQTL 6.24e-01 -0.073 0.149 0.106 DC L1
ENSG00000134644 PUM1 -266388 sc-eQTL 9.43e-01 -0.00834 0.116 0.106 DC L1
ENSG00000162511 LAPTM5 41829 sc-eQTL 6.37e-01 0.0393 0.0831 0.106 DC L1
ENSG00000162517 PEF1 -845293 sc-eQTL 4.15e-02 -0.274 0.133 0.106 DC L1
ENSG00000168528 SERINC2 -609962 sc-eQTL 1.59e-01 0.193 0.136 0.106 DC L1
ENSG00000284543 LINC01226 -706623 sc-eQTL 1.72e-01 -0.124 0.0904 0.106 DC L1
ENSG00000287510 AL137857.1 67910 sc-eQTL 6.71e-01 0.056 0.131 0.106 DC L1
ENSG00000060688 SNRNP40 -497185 sc-eQTL 8.57e-02 0.168 0.0973 0.103 Mono L1
ENSG00000121766 ZCCHC17 -497379 sc-eQTL 8.95e-01 -0.016 0.122 0.103 Mono L1
ENSG00000134644 PUM1 -266388 sc-eQTL 5.30e-01 0.049 0.0778 0.103 Mono L1
ENSG00000162511 LAPTM5 41829 sc-eQTL 8.03e-01 0.0179 0.0716 0.103 Mono L1
ENSG00000162512 SDC3 -109155 sc-eQTL 1.43e-01 -0.201 0.137 0.103 Mono L1
ENSG00000162517 PEF1 -845293 sc-eQTL 7.59e-01 0.0297 0.0966 0.103 Mono L1
ENSG00000168528 SERINC2 -609962 sc-eQTL 3.14e-01 0.149 0.147 0.103 Mono L1
ENSG00000284543 LINC01226 -706623 sc-eQTL 8.52e-01 -0.0243 0.13 0.103 Mono L1
ENSG00000287510 AL137857.1 67910 sc-eQTL 7.43e-01 0.0374 0.114 0.103 Mono L1
ENSG00000060688 SNRNP40 -497185 sc-eQTL 2.20e-01 0.168 0.136 0.103 NK L1
ENSG00000121753 ADGRB2 -965290 sc-eQTL 8.54e-01 -0.0217 0.118 0.103 NK L1
ENSG00000121766 ZCCHC17 -497379 sc-eQTL 8.42e-01 0.0187 0.0937 0.103 NK L1
ENSG00000134644 PUM1 -266388 sc-eQTL 5.69e-01 0.056 0.0982 0.103 NK L1
ENSG00000162511 LAPTM5 41829 sc-eQTL 7.34e-01 0.0384 0.113 0.103 NK L1
ENSG00000162517 PEF1 -845293 sc-eQTL 7.14e-01 -0.0303 0.0825 0.103 NK L1
ENSG00000186056 MATN1-AS1 81099 sc-eQTL 4.37e-04 0.441 0.123 0.103 NK L1
ENSG00000287510 AL137857.1 67910 sc-eQTL 4.19e-01 -0.0948 0.117 0.103 NK L1
ENSG00000060688 SNRNP40 -497185 sc-eQTL 8.10e-01 -0.0252 0.104 0.103 Other_T L1
ENSG00000121766 ZCCHC17 -497379 sc-eQTL 9.55e-01 0.00635 0.112 0.103 Other_T L1
ENSG00000134644 PUM1 -266388 sc-eQTL 9.16e-02 0.169 0.0997 0.103 Other_T L1
ENSG00000162511 LAPTM5 41829 sc-eQTL 4.22e-02 0.167 0.0815 0.103 Other_T L1
ENSG00000162517 PEF1 -845293 sc-eQTL 3.23e-01 0.109 0.11 0.103 Other_T L1
ENSG00000186056 MATN1-AS1 81099 sc-eQTL 9.92e-01 0.00141 0.135 0.103 Other_T L1
ENSG00000287510 AL137857.1 67910 sc-eQTL 4.29e-01 0.111 0.14 0.103 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000060688 SNRNP40 -497185 sc-eQTL 7.80e-01 0.0433 0.155 0.112 B_Activated L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -497379 sc-eQTL 9.29e-01 -0.0139 0.156 0.112 B_Activated L2
ENSG00000134644 PUM1 -266388 sc-eQTL 5.19e-01 0.0938 0.145 0.112 B_Activated L2
ENSG00000162510 MATN1 76018 sc-eQTL 4.67e-01 0.0923 0.127 0.112 B_Activated L2
ENSG00000162511 LAPTM5 41829 sc-eQTL 8.36e-01 0.0184 0.0885 0.112 B_Activated L2
ENSG00000162517 PEF1 -845293 sc-eQTL 3.27e-01 -0.148 0.15 0.112 B_Activated L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 81099 sc-eQTL 4.53e-01 -0.107 0.143 0.112 B_Activated L2
ENSG00000287510 AL137857.1 67910 sc-eQTL 7.82e-01 -0.0351 0.126 0.112 B_Activated L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -497185 sc-eQTL 7.15e-01 -0.0564 0.154 0.103 B_Intermediate L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -497379 sc-eQTL 4.45e-01 -0.0983 0.128 0.103 B_Intermediate L2
ENSG00000134644 PUM1 -266388 sc-eQTL 4.37e-01 0.0943 0.121 0.103 B_Intermediate L2
ENSG00000162510 MATN1 76018 sc-eQTL 1.61e-01 -0.177 0.126 0.103 B_Intermediate L2
ENSG00000162511 LAPTM5 41829 sc-eQTL 2.02e-01 0.0989 0.0772 0.103 B_Intermediate L2
ENSG00000162517 PEF1 -845293 sc-eQTL 6.16e-01 0.0723 0.144 0.103 B_Intermediate L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 81099 sc-eQTL 6.29e-01 0.0526 0.109 0.103 B_Intermediate L2
ENSG00000287510 AL137857.1 67910 sc-eQTL 6.50e-01 0.0553 0.122 0.103 B_Intermediate L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -497185 sc-eQTL 5.86e-01 -0.0824 0.151 0.101 B_Memory L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -497379 sc-eQTL 6.39e-01 0.0654 0.139 0.101 B_Memory L2
ENSG00000134644 PUM1 -266388 sc-eQTL 8.75e-01 0.019 0.121 0.101 B_Memory L2
ENSG00000162510 MATN1 76018 sc-eQTL 1.56e-01 0.164 0.115 0.101 B_Memory L2
ENSG00000162511 LAPTM5 41829 sc-eQTL 3.20e-01 0.102 0.103 0.101 B_Memory L2
ENSG00000162517 PEF1 -845293 sc-eQTL 2.62e-01 -0.154 0.137 0.101 B_Memory L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 81099 sc-eQTL 7.29e-01 -0.0408 0.118 0.101 B_Memory L2
ENSG00000287510 AL137857.1 67910 sc-eQTL 6.85e-01 0.0559 0.138 0.101 B_Memory L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -497185 sc-eQTL 6.29e-01 0.0657 0.136 0.103 B_Naive1 L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -497379 sc-eQTL 3.64e-01 -0.107 0.117 0.103 B_Naive1 L2
ENSG00000134644 PUM1 -266388 sc-eQTL 8.08e-01 -0.0252 0.103 0.103 B_Naive1 L2
ENSG00000162510 MATN1 76018 sc-eQTL 3.18e-01 0.105 0.105 0.103 B_Naive1 L2
ENSG00000162511 LAPTM5 41829 sc-eQTL 3.55e-01 0.0649 0.0699 0.103 B_Naive1 L2
ENSG00000162517 PEF1 -845293 sc-eQTL 1.99e-01 -0.159 0.123 0.103 B_Naive1 L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 81099 sc-eQTL 8.97e-01 0.0119 0.092 0.103 B_Naive1 L2
ENSG00000287510 AL137857.1 67910 sc-eQTL 8.93e-01 -0.0153 0.114 0.103 B_Naive1 L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -497185 sc-eQTL 9.41e-01 -0.0108 0.145 0.103 B_Naive2 L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -497379 sc-eQTL 4.30e-01 -0.0945 0.119 0.103 B_Naive2 L2
ENSG00000134644 PUM1 -266388 sc-eQTL 7.06e-01 0.0442 0.117 0.103 B_Naive2 L2
ENSG00000162510 MATN1 76018 sc-eQTL 4.83e-01 -0.0789 0.112 0.103 B_Naive2 L2
ENSG00000162511 LAPTM5 41829 sc-eQTL 3.13e-01 0.0769 0.0761 0.103 B_Naive2 L2
ENSG00000162517 PEF1 -845293 sc-eQTL 6.78e-01 -0.0577 0.139 0.103 B_Naive2 L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 81099 sc-eQTL 5.65e-01 0.064 0.111 0.103 B_Naive2 L2
ENSG00000287510 AL137857.1 67910 sc-eQTL 3.92e-01 0.103 0.12 0.103 B_Naive2 L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -497185 sc-eQTL 1.59e-01 0.201 0.142 0.107 CD4_CTL L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -497379 sc-eQTL 3.79e-01 0.124 0.14 0.107 CD4_CTL L2
ENSG00000134644 PUM1 -266388 sc-eQTL 4.99e-01 -0.0932 0.138 0.107 CD4_CTL L2
ENSG00000162511 LAPTM5 41829 sc-eQTL 9.93e-01 0.00101 0.123 0.107 CD4_CTL L2
ENSG00000162517 PEF1 -845293 sc-eQTL 5.31e-01 -0.0789 0.126 0.107 CD4_CTL L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 81099 sc-eQTL 7.48e-01 -0.0432 0.134 0.107 CD4_CTL L2
ENSG00000287510 AL137857.1 67910 sc-eQTL 4.96e-01 0.0807 0.118 0.107 CD4_CTL L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -497185 sc-eQTL 1.23e-01 0.172 0.111 0.103 CD4_Naive L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -497379 sc-eQTL 7.02e-01 -0.0379 0.099 0.103 CD4_Naive L2
ENSG00000134644 PUM1 -266388 sc-eQTL 5.41e-01 -0.0483 0.079 0.103 CD4_Naive L2
ENSG00000162511 LAPTM5 41829 sc-eQTL 3.63e-02 0.177 0.0838 0.103 CD4_Naive L2
ENSG00000162517 PEF1 -845293 sc-eQTL 6.70e-01 0.0396 0.0928 0.103 CD4_Naive L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 81099 sc-eQTL 1.26e-01 -0.131 0.0855 0.103 CD4_Naive L2
ENSG00000287510 AL137857.1 67910 sc-eQTL 3.85e-01 -0.0858 0.0985 0.103 CD4_Naive L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -497185 sc-eQTL 3.79e-01 -0.124 0.141 0.103 CD4_TCM L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -497379 sc-eQTL 4.56e-01 0.085 0.114 0.103 CD4_TCM L2
ENSG00000134644 PUM1 -266388 sc-eQTL 9.37e-02 0.169 0.1 0.103 CD4_TCM L2
ENSG00000162511 LAPTM5 41829 sc-eQTL 1.05e-01 0.135 0.0832 0.103 CD4_TCM L2
ENSG00000162517 PEF1 -845293 sc-eQTL 9.65e-01 0.0049 0.112 0.103 CD4_TCM L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 81099 sc-eQTL 1.06e-01 -0.171 0.106 0.103 CD4_TCM L2
ENSG00000287510 AL137857.1 67910 sc-eQTL 2.48e-01 -0.137 0.118 0.103 CD4_TCM L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -497185 sc-eQTL 5.86e-01 -0.0772 0.142 0.103 CD4_TEM L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -497379 sc-eQTL 9.30e-01 0.0119 0.135 0.103 CD4_TEM L2
ENSG00000134644 PUM1 -266388 sc-eQTL 7.32e-01 0.0385 0.112 0.103 CD4_TEM L2
ENSG00000162511 LAPTM5 41829 sc-eQTL 8.78e-02 0.194 0.113 0.103 CD4_TEM L2
ENSG00000162517 PEF1 -845293 sc-eQTL 3.34e-01 0.123 0.127 0.103 CD4_TEM L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 81099 sc-eQTL 5.19e-01 -0.0859 0.133 0.103 CD4_TEM L2
ENSG00000287510 AL137857.1 67910 sc-eQTL 7.14e-01 0.0481 0.131 0.103 CD4_TEM L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -497185 sc-eQTL 6.29e-01 -0.0738 0.153 0.103 CD8_CTL L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -497379 sc-eQTL 6.72e-01 -0.0496 0.117 0.103 CD8_CTL L2
ENSG00000134644 PUM1 -266388 sc-eQTL 5.85e-01 0.0622 0.114 0.103 CD8_CTL L2
ENSG00000162511 LAPTM5 41829 sc-eQTL 8.51e-01 0.0236 0.126 0.103 CD8_CTL L2
ENSG00000162517 PEF1 -845293 sc-eQTL 7.67e-01 -0.0326 0.11 0.103 CD8_CTL L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 81099 sc-eQTL 7.33e-01 -0.0452 0.132 0.103 CD8_CTL L2
ENSG00000287510 AL137857.1 67910 sc-eQTL 3.77e-01 -0.11 0.124 0.103 CD8_CTL L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -497185 sc-eQTL 6.91e-01 -0.0551 0.139 0.103 CD8_Naive L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -497379 sc-eQTL 4.64e-01 -0.0876 0.119 0.103 CD8_Naive L2
ENSG00000134644 PUM1 -266388 sc-eQTL 9.97e-02 0.158 0.0956 0.103 CD8_Naive L2
ENSG00000162511 LAPTM5 41829 sc-eQTL 8.08e-03 0.242 0.0907 0.103 CD8_Naive L2
ENSG00000162517 PEF1 -845293 sc-eQTL 6.60e-01 0.0564 0.128 0.103 CD8_Naive L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 81099 sc-eQTL 2.20e-01 0.141 0.115 0.103 CD8_Naive L2
ENSG00000287510 AL137857.1 67910 sc-eQTL 2.30e-01 -0.15 0.125 0.103 CD8_Naive L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -497185 sc-eQTL 3.75e-01 -0.139 0.156 0.097 CD8_TCM L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -497379 sc-eQTL 6.36e-01 -0.0677 0.143 0.097 CD8_TCM L2
ENSG00000134644 PUM1 -266388 sc-eQTL 8.27e-01 -0.0295 0.135 0.097 CD8_TCM L2
ENSG00000162511 LAPTM5 41829 sc-eQTL 2.29e-01 0.169 0.14 0.097 CD8_TCM L2
ENSG00000162517 PEF1 -845293 sc-eQTL 3.89e-01 0.124 0.144 0.097 CD8_TCM L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 81099 sc-eQTL 7.58e-02 0.231 0.129 0.097 CD8_TCM L2
ENSG00000287510 AL137857.1 67910 sc-eQTL 7.27e-01 -0.0461 0.132 0.097 CD8_TCM L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -497185 sc-eQTL 9.31e-01 0.0124 0.144 0.105 CD8_TEM L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -497379 sc-eQTL 4.14e-01 -0.113 0.138 0.105 CD8_TEM L2
ENSG00000134644 PUM1 -266388 sc-eQTL 8.42e-01 0.0282 0.141 0.105 CD8_TEM L2
ENSG00000162511 LAPTM5 41829 sc-eQTL 4.51e-01 0.0998 0.132 0.105 CD8_TEM L2
ENSG00000162517 PEF1 -845293 sc-eQTL 1.36e-01 0.186 0.124 0.105 CD8_TEM L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 81099 sc-eQTL 6.76e-01 0.0575 0.137 0.105 CD8_TEM L2
ENSG00000287510 AL137857.1 67910 sc-eQTL 9.25e-01 -0.0117 0.124 0.105 CD8_TEM L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -497185 sc-eQTL 6.12e-01 0.0762 0.15 0.104 MAIT L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -497379 sc-eQTL 1.85e-01 -0.176 0.132 0.104 MAIT L2
ENSG00000134644 PUM1 -266388 sc-eQTL 5.66e-01 0.0732 0.127 0.104 MAIT L2
ENSG00000162511 LAPTM5 41829 sc-eQTL 4.32e-01 0.0945 0.12 0.104 MAIT L2
ENSG00000162517 PEF1 -845293 sc-eQTL 5.88e-01 0.0716 0.132 0.104 MAIT L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 81099 sc-eQTL 4.41e-01 -0.103 0.134 0.104 MAIT L2
ENSG00000287510 AL137857.1 67910 sc-eQTL 7.18e-01 -0.0499 0.138 0.104 MAIT L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -497185 sc-eQTL 6.47e-01 0.0689 0.15 0.104 NK_CD56bright L2
ENSG00000121753 ADGRB2 -965290 sc-eQTL 9.83e-01 -0.00257 0.118 0.104 NK_CD56bright L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -497379 sc-eQTL 8.20e-01 0.029 0.127 0.104 NK_CD56bright L2
ENSG00000134644 PUM1 -266388 sc-eQTL 1.24e-01 0.204 0.132 0.104 NK_CD56bright L2
ENSG00000162511 LAPTM5 41829 sc-eQTL 7.21e-01 0.0469 0.131 0.104 NK_CD56bright L2
ENSG00000162517 PEF1 -845293 sc-eQTL 3.93e-01 -0.109 0.127 0.104 NK_CD56bright L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 81099 sc-eQTL 1.07e-02 0.335 0.13 0.104 NK_CD56bright L2
ENSG00000287510 AL137857.1 67910 sc-eQTL 7.40e-01 0.0432 0.13 0.104 NK_CD56bright L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -497185 sc-eQTL 1.38e-01 0.215 0.144 0.103 NK_CD56dim L2
ENSG00000121753 ADGRB2 -965290 sc-eQTL 9.92e-01 0.00122 0.127 0.103 NK_CD56dim L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -497379 sc-eQTL 6.93e-01 -0.0424 0.107 0.103 NK_CD56dim L2
ENSG00000134644 PUM1 -266388 sc-eQTL 9.16e-01 0.0116 0.11 0.103 NK_CD56dim L2
ENSG00000162511 LAPTM5 41829 sc-eQTL 8.68e-01 0.0195 0.117 0.103 NK_CD56dim L2
ENSG00000162517 PEF1 -845293 sc-eQTL 4.95e-01 0.0713 0.104 0.103 NK_CD56dim L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 81099 sc-eQTL 2.67e-02 0.324 0.145 0.103 NK_CD56dim L2
ENSG00000287510 AL137857.1 67910 sc-eQTL 6.53e-02 -0.223 0.12 0.103 NK_CD56dim L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -497185 sc-eQTL 9.47e-01 -0.01 0.149 0.105 NK_HLA L2
ENSG00000121753 ADGRB2 -965290 sc-eQTL 2.08e-01 0.149 0.118 0.105 NK_HLA L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -497379 sc-eQTL 5.94e-01 -0.0712 0.133 0.105 NK_HLA L2
ENSG00000134644 PUM1 -266388 sc-eQTL 8.56e-01 -0.0237 0.13 0.105 NK_HLA L2
ENSG00000162511 LAPTM5 41829 sc-eQTL 8.29e-01 -0.0268 0.124 0.105 NK_HLA L2
ENSG00000162517 PEF1 -845293 sc-eQTL 8.76e-01 -0.0217 0.14 0.105 NK_HLA L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 81099 sc-eQTL 6.57e-01 0.0586 0.132 0.105 NK_HLA L2
ENSG00000287510 AL137857.1 67910 sc-eQTL 4.04e-01 0.107 0.127 0.105 NK_HLA L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -497185 sc-eQTL 3.83e-01 0.123 0.141 0.103 NK_cytokine L2
ENSG00000121753 ADGRB2 -965290 sc-eQTL 7.29e-01 -0.0442 0.127 0.103 NK_cytokine L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -497379 sc-eQTL 7.55e-01 0.0344 0.11 0.103 NK_cytokine L2
ENSG00000134644 PUM1 -266388 sc-eQTL 6.27e-01 0.058 0.119 0.103 NK_cytokine L2
ENSG00000162511 LAPTM5 41829 sc-eQTL 9.63e-01 0.00602 0.131 0.103 NK_cytokine L2
ENSG00000162517 PEF1 -845293 sc-eQTL 8.07e-01 0.0273 0.112 0.103 NK_cytokine L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 81099 sc-eQTL 1.06e-01 0.224 0.138 0.103 NK_cytokine L2
ENSG00000287510 AL137857.1 67910 sc-eQTL 5.68e-01 0.0738 0.129 0.103 NK_cytokine L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -497185 sc-eQTL 3.04e-01 -0.181 0.176 0.107 PB L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -497379 sc-eQTL 3.81e-01 -0.18 0.204 0.107 PB L2
ENSG00000134644 PUM1 -266388 sc-eQTL 2.90e-01 0.188 0.177 0.107 PB L2
ENSG00000162510 MATN1 76018 sc-eQTL 4.73e-01 -0.119 0.165 0.107 PB L2
ENSG00000162511 LAPTM5 41829 sc-eQTL 9.26e-01 0.011 0.118 0.107 PB L2
ENSG00000162517 PEF1 -845293 sc-eQTL 5.61e-01 -0.106 0.182 0.107 PB L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 81099 sc-eQTL 5.25e-03 -0.446 0.157 0.107 PB L2
ENSG00000287510 AL137857.1 67910 sc-eQTL 3.55e-01 0.16 0.172 0.107 PB L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -497185 sc-eQTL 2.01e-01 -0.142 0.111 0.104 Pro_T L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -497379 sc-eQTL 3.10e-01 -0.143 0.141 0.104 Pro_T L2
ENSG00000134644 PUM1 -266388 sc-eQTL 7.22e-01 0.0469 0.132 0.104 Pro_T L2
ENSG00000162511 LAPTM5 41829 sc-eQTL 9.83e-01 -0.00202 0.0944 0.104 Pro_T L2
ENSG00000162517 PEF1 -845293 sc-eQTL 5.36e-01 -0.0858 0.138 0.104 Pro_T L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 81099 sc-eQTL 8.48e-01 0.0253 0.132 0.104 Pro_T L2
ENSG00000287510 AL137857.1 67910 sc-eQTL 1.83e-01 0.162 0.121 0.104 Pro_T L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -497185 sc-eQTL 7.50e-01 -0.0458 0.143 0.103 Treg L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -497379 sc-eQTL 1.87e-01 -0.183 0.138 0.103 Treg L2
ENSG00000134644 PUM1 -266388 sc-eQTL 6.91e-01 -0.0441 0.111 0.103 Treg L2
ENSG00000162511 LAPTM5 41829 sc-eQTL 5.18e-01 0.0822 0.127 0.103 Treg L2
ENSG00000162517 PEF1 -845293 sc-eQTL 4.53e-01 -0.103 0.137 0.103 Treg L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 81099 sc-eQTL 6.99e-02 -0.234 0.128 0.103 Treg L2
ENSG00000287510 AL137857.1 67910 sc-eQTL 9.72e-01 -0.00459 0.129 0.103 Treg L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -497185 sc-eQTL 8.10e-01 0.0346 0.143 0.107 cDC L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -497379 sc-eQTL 2.49e-01 -0.179 0.154 0.107 cDC L2
ENSG00000134644 PUM1 -266388 sc-eQTL 7.10e-01 -0.0495 0.133 0.107 cDC L2
ENSG00000162511 LAPTM5 41829 sc-eQTL 1.49e-01 0.135 0.0928 0.107 cDC L2
ENSG00000162517 PEF1 -845293 sc-eQTL 2.30e-01 -0.162 0.135 0.107 cDC L2
ENSG00000168528 SERINC2 -609962 sc-eQTL 1.95e-01 0.155 0.119 0.107 cDC L2
ENSG00000284543 LINC01226 -706623 sc-eQTL 4.53e-01 -0.0883 0.118 0.107 cDC L2
ENSG00000287510 AL137857.1 67910 sc-eQTL 7.51e-01 0.0403 0.127 0.107 cDC L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -497185 sc-eQTL 2.36e-01 0.139 0.117 0.103 cMono_IL1B L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -497379 sc-eQTL 5.26e-01 0.0829 0.13 0.103 cMono_IL1B L2
ENSG00000134644 PUM1 -266388 sc-eQTL 7.86e-01 -0.024 0.0883 0.103 cMono_IL1B L2
ENSG00000162511 LAPTM5 41829 sc-eQTL 5.31e-01 0.0487 0.0775 0.103 cMono_IL1B L2
ENSG00000162512 SDC3 -109155 sc-eQTL 4.30e-01 -0.115 0.146 0.103 cMono_IL1B L2
ENSG00000162517 PEF1 -845293 sc-eQTL 9.22e-01 0.0116 0.119 0.103 cMono_IL1B L2
ENSG00000168528 SERINC2 -609962 sc-eQTL 1.72e-01 0.202 0.147 0.103 cMono_IL1B L2
ENSG00000284543 LINC01226 -706623 sc-eQTL 7.87e-01 -0.0354 0.131 0.103 cMono_IL1B L2
ENSG00000287510 AL137857.1 67910 sc-eQTL 4.33e-01 0.0957 0.122 0.103 cMono_IL1B L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -497185 sc-eQTL 3.77e-01 0.111 0.125 0.103 cMono_S100A L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -497379 sc-eQTL 6.89e-01 -0.0594 0.148 0.103 cMono_S100A L2
ENSG00000134644 PUM1 -266388 sc-eQTL 6.64e-01 0.0465 0.107 0.103 cMono_S100A L2
ENSG00000162511 LAPTM5 41829 sc-eQTL 6.36e-01 0.039 0.0823 0.103 cMono_S100A L2
ENSG00000162512 SDC3 -109155 sc-eQTL 2.53e-01 -0.162 0.142 0.103 cMono_S100A L2
ENSG00000162517 PEF1 -845293 sc-eQTL 3.21e-01 0.127 0.128 0.103 cMono_S100A L2
ENSG00000168528 SERINC2 -609962 sc-eQTL 1.84e-01 0.2 0.15 0.103 cMono_S100A L2
ENSG00000284543 LINC01226 -706623 sc-eQTL 4.91e-01 -0.0843 0.122 0.103 cMono_S100A L2
ENSG00000287510 AL137857.1 67910 sc-eQTL 3.20e-01 0.122 0.123 0.103 cMono_S100A L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -497185 sc-eQTL 6.75e-01 -0.0739 0.176 0.103 gdT L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -497379 sc-eQTL 9.18e-01 0.0156 0.151 0.103 gdT L2
ENSG00000134644 PUM1 -266388 sc-eQTL 2.18e-01 0.192 0.155 0.103 gdT L2
ENSG00000162511 LAPTM5 41829 sc-eQTL 7.43e-02 0.301 0.168 0.103 gdT L2
ENSG00000162517 PEF1 -845293 sc-eQTL 7.22e-01 0.0552 0.155 0.103 gdT L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 81099 sc-eQTL 6.84e-01 0.0637 0.156 0.103 gdT L2
ENSG00000287510 AL137857.1 67910 sc-eQTL 7.36e-01 0.0511 0.151 0.103 gdT L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -497185 sc-eQTL 4.23e-01 0.111 0.139 0.098 intMono L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -497379 sc-eQTL 5.80e-01 0.0827 0.149 0.098 intMono L2
ENSG00000134644 PUM1 -266388 sc-eQTL 7.33e-01 0.0433 0.127 0.098 intMono L2
ENSG00000162511 LAPTM5 41829 sc-eQTL 4.68e-01 -0.0722 0.0992 0.098 intMono L2
ENSG00000162512 SDC3 -109155 sc-eQTL 4.81e-02 -0.268 0.135 0.098 intMono L2
ENSG00000162517 PEF1 -845293 sc-eQTL 8.80e-01 -0.0216 0.143 0.098 intMono L2
ENSG00000168528 SERINC2 -609962 sc-eQTL 4.08e-01 0.118 0.142 0.098 intMono L2
ENSG00000284543 LINC01226 -706623 sc-eQTL 8.40e-01 0.0273 0.135 0.098 intMono L2
ENSG00000287510 AL137857.1 67910 sc-eQTL 1.39e-01 -0.199 0.134 0.098 intMono L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -497185 sc-eQTL 2.50e-01 0.148 0.128 0.106 ncMono L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -497379 sc-eQTL 7.69e-01 -0.0402 0.137 0.106 ncMono L2
ENSG00000134644 PUM1 -266388 sc-eQTL 1.70e-01 0.153 0.111 0.106 ncMono L2
ENSG00000162511 LAPTM5 41829 sc-eQTL 8.83e-01 -0.015 0.102 0.106 ncMono L2
ENSG00000162512 SDC3 -109155 sc-eQTL 9.11e-01 0.0127 0.114 0.106 ncMono L2
ENSG00000162517 PEF1 -845293 sc-eQTL 3.39e-01 -0.125 0.13 0.106 ncMono L2
ENSG00000168528 SERINC2 -609962 sc-eQTL 5.66e-01 -0.0715 0.124 0.106 ncMono L2
ENSG00000284543 LINC01226 -706623 sc-eQTL 1.84e-01 0.165 0.124 0.106 ncMono L2
ENSG00000287510 AL137857.1 67910 sc-eQTL 8.41e-01 -0.0259 0.129 0.106 ncMono L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -497185 sc-eQTL 3.59e-01 0.131 0.142 0.107 pDC L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -497379 sc-eQTL 9.89e-01 -0.0021 0.156 0.107 pDC L2
ENSG00000134644 PUM1 -266388 sc-eQTL 8.44e-01 -0.0255 0.13 0.107 pDC L2
ENSG00000162511 LAPTM5 41829 sc-eQTL 8.87e-01 0.0172 0.121 0.107 pDC L2
ENSG00000162517 PEF1 -845293 sc-eQTL 8.33e-01 -0.0331 0.156 0.107 pDC L2
ENSG00000168528 SERINC2 -609962 sc-eQTL 2.14e-01 0.182 0.145 0.107 pDC L2
ENSG00000284543 LINC01226 -706623 sc-eQTL 2.86e-01 -0.121 0.113 0.107 pDC L2
ENSG00000287510 AL137857.1 67910 sc-eQTL 7.39e-01 0.0445 0.133 0.107 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000060688 SNRNP40 -497185 sc-eQTL 6.44e-01 -0.0687 0.149 0.103 B_Memory LOneK1K
ENSG00000121766 ZCCHC17 -497379 sc-eQTL 8.09e-01 -0.0299 0.124 0.103 B_Memory LOneK1K
ENSG00000134644 PUM1 -266388 sc-eQTL 2.21e-01 0.134 0.109 0.103 B_Memory LOneK1K
ENSG00000162510 MATN1 76018 sc-eQTL 7.83e-01 0.0344 0.125 0.103 B_Memory LOneK1K
ENSG00000162511 LAPTM5 41829 sc-eQTL 2.45e-01 0.0913 0.0783 0.103 B_Memory LOneK1K
ENSG00000162517 PEF1 -845293 sc-eQTL 9.87e-01 -0.00205 0.13 0.103 B_Memory LOneK1K
ENSG00000186056 MATN1-AS1 81099 sc-eQTL 9.05e-01 0.0125 0.104 0.103 B_Memory LOneK1K
ENSG00000287510 AL137857.1 67910 sc-eQTL 3.47e-01 0.107 0.113 0.103 B_Memory LOneK1K
ENSG00000060688 SNRNP40 -497185 sc-eQTL 5.85e-01 0.0725 0.133 0.103 B_Naive LOneK1K
ENSG00000121766 ZCCHC17 -497379 sc-eQTL 2.38e-01 -0.124 0.105 0.103 B_Naive LOneK1K
ENSG00000134644 PUM1 -266388 sc-eQTL 5.29e-01 0.0625 0.0993 0.103 B_Naive LOneK1K
ENSG00000162510 MATN1 76018 sc-eQTL 4.45e-01 0.0731 0.0955 0.103 B_Naive LOneK1K
ENSG00000162511 LAPTM5 41829 sc-eQTL 3.92e-01 0.0576 0.0672 0.103 B_Naive LOneK1K
ENSG00000162517 PEF1 -845293 sc-eQTL 2.90e-01 -0.13 0.123 0.103 B_Naive LOneK1K
ENSG00000186056 MATN1-AS1 81099 sc-eQTL 8.96e-01 0.0113 0.087 0.103 B_Naive LOneK1K
ENSG00000287510 AL137857.1 67910 sc-eQTL 9.81e-01 -0.00249 0.103 0.103 B_Naive LOneK1K
ENSG00000060688 SNRNP40 -497185 sc-eQTL 2.26e-01 0.136 0.112 0.103 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000121766 ZCCHC17 -497379 sc-eQTL 8.36e-01 0.0262 0.127 0.103 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000134644 PUM1 -266388 sc-eQTL 7.07e-01 0.0304 0.0809 0.103 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000162511 LAPTM5 41829 sc-eQTL 7.83e-01 0.0196 0.0711 0.103 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000162512 SDC3 -109155 sc-eQTL 2.27e-01 -0.175 0.145 0.103 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000162517 PEF1 -845293 sc-eQTL 3.13e-01 0.103 0.102 0.103 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000168528 SERINC2 -609962 sc-eQTL 1.82e-01 0.199 0.149 0.103 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000284543 LINC01226 -706623 sc-eQTL 4.45e-01 -0.0936 0.122 0.103 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000287510 AL137857.1 67910 sc-eQTL 4.94e-01 0.0785 0.114 0.103 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000060688 SNRNP40 -497185 sc-eQTL 9.69e-02 0.205 0.123 0.103 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000121766 ZCCHC17 -497379 sc-eQTL 5.61e-01 -0.0787 0.135 0.103 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000134644 PUM1 -266388 sc-eQTL 3.02e-01 0.114 0.111 0.103 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000162511 LAPTM5 41829 sc-eQTL 9.50e-01 -0.00562 0.0887 0.103 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000162512 SDC3 -109155 sc-eQTL 3.18e-01 -0.129 0.129 0.103 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000162517 PEF1 -845293 sc-eQTL 2.60e-01 -0.133 0.117 0.103 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000168528 SERINC2 -609962 sc-eQTL 6.53e-01 0.0605 0.134 0.103 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000284543 LINC01226 -706623 sc-eQTL 3.58e-01 0.117 0.127 0.103 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000287510 AL137857.1 67910 sc-eQTL 4.33e-01 -0.1 0.127 0.103 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000060688 SNRNP40 -497185 sc-eQTL 1.50e-01 0.198 0.137 0.103 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000121753 ADGRB2 -965290 sc-eQTL 9.88e-01 -0.00177 0.117 0.103 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000121766 ZCCHC17 -497379 sc-eQTL 9.80e-01 -0.00238 0.0941 0.103 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000134644 PUM1 -266388 sc-eQTL 8.97e-01 0.0133 0.103 0.103 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000162511 LAPTM5 41829 sc-eQTL 7.48e-01 0.037 0.115 0.103 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000162517 PEF1 -845293 sc-eQTL 8.75e-01 -0.0138 0.0875 0.103 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000186056 MATN1-AS1 81099 sc-eQTL 2.95e-03 0.391 0.13 0.103 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000287510 AL137857.1 67910 sc-eQTL 4.18e-01 -0.093 0.115 0.103 NK_CD56dim LOneK1K

Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF
ENSG00000162511 LAPTM5 41829 eQTL 0.0267 -0.0395 0.0178 0.0 0.0 0.0873
ENSG00000162512 SDC3 -109155 eQTL 0.00845 -0.116 0.0438 0.00488 0.0 0.0873

Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina
ENSG00000162512 SDC3 -109155 4.12e-06 3.99e-06 5.75e-07 2.02e-06 8.72e-07 8.28e-07 2.39e-06 9.96e-07 2.61e-06 1.47e-06 3.62e-06 1.98e-06 6.39e-06 1.42e-06 9.75e-07 2e-06 1.61e-06 2.12e-06 1.42e-06 1.2e-06 1.8e-06 3.51e-06 3.3e-06 1.81e-06 4.77e-06 1.17e-06 1.57e-06 1.69e-06 3.88e-06 3.77e-06 2e-06 4.51e-07 7.09e-07 1.8e-06 1.8e-06 9.61e-07 9.88e-07 4.53e-07 1.32e-06 3.64e-07 3.06e-07 4.72e-06 5.05e-07 1.86e-07 4.32e-07 3.51e-07 8.67e-07 2.23e-07 1.59e-07