logo

Genes within 1Mb (chr1:30799566:C:T):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD

Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000060688 SNRNP40 -497222 sc-eQTL 4.71e-01 -0.0698 0.0965 0.233 B L1
ENSG00000121766 ZCCHC17 -497416 sc-eQTL 5.47e-01 -0.0466 0.0773 0.233 B L1
ENSG00000134644 PUM1 -266425 sc-eQTL 3.07e-01 0.0663 0.0648 0.233 B L1
ENSG00000162510 MATN1 75981 sc-eQTL 5.17e-01 0.0442 0.0682 0.233 B L1
ENSG00000162511 LAPTM5 41792 sc-eQTL 8.44e-01 0.0105 0.0534 0.233 B L1
ENSG00000162517 PEF1 -845330 sc-eQTL 9.88e-01 -0.00126 0.0807 0.233 B L1
ENSG00000186056 MATN1-AS1 81062 sc-eQTL 5.28e-01 0.0396 0.0626 0.233 B L1
ENSG00000287510 AL137857.1 67873 sc-eQTL 7.32e-01 -0.0254 0.0741 0.233 B L1
ENSG00000060688 SNRNP40 -497222 sc-eQTL 1.77e-01 -0.113 0.0836 0.233 CD4T L1
ENSG00000121766 ZCCHC17 -497416 sc-eQTL 7.49e-01 -0.021 0.0656 0.233 CD4T L1
ENSG00000134644 PUM1 -266425 sc-eQTL 6.26e-02 0.108 0.0579 0.233 CD4T L1
ENSG00000162511 LAPTM5 41792 sc-eQTL 6.55e-01 0.029 0.0647 0.233 CD4T L1
ENSG00000162517 PEF1 -845330 sc-eQTL 3.79e-01 -0.0596 0.0676 0.233 CD4T L1
ENSG00000186056 MATN1-AS1 81062 sc-eQTL 4.63e-01 -0.0426 0.0578 0.233 CD4T L1
ENSG00000287510 AL137857.1 67873 sc-eQTL 5.68e-01 0.0396 0.0693 0.233 CD4T L1
ENSG00000060688 SNRNP40 -497222 sc-eQTL 7.24e-01 0.0391 0.111 0.233 CD8T L1
ENSG00000121766 ZCCHC17 -497416 sc-eQTL 1.22e-01 0.114 0.0733 0.233 CD8T L1
ENSG00000134644 PUM1 -266425 sc-eQTL 9.54e-01 0.00375 0.0649 0.233 CD8T L1
ENSG00000162511 LAPTM5 41792 sc-eQTL 5.33e-01 0.0394 0.063 0.233 CD8T L1
ENSG00000162517 PEF1 -845330 sc-eQTL 8.06e-01 -0.0191 0.0777 0.233 CD8T L1
ENSG00000186056 MATN1-AS1 81062 sc-eQTL 9.84e-01 0.00145 0.0739 0.233 CD8T L1
ENSG00000287510 AL137857.1 67873 sc-eQTL 3.84e-01 0.0808 0.0927 0.233 CD8T L1
ENSG00000060688 SNRNP40 -497222 sc-eQTL 9.68e-01 -0.00391 0.0981 0.234 DC L1
ENSG00000121766 ZCCHC17 -497416 sc-eQTL 5.58e-02 -0.221 0.115 0.234 DC L1
ENSG00000134644 PUM1 -266425 sc-eQTL 2.66e-01 0.101 0.0907 0.234 DC L1
ENSG00000162511 LAPTM5 41792 sc-eQTL 8.74e-01 -0.0103 0.0649 0.234 DC L1
ENSG00000162517 PEF1 -845330 sc-eQTL 7.94e-01 0.0275 0.105 0.234 DC L1
ENSG00000168528 SERINC2 -609999 sc-eQTL 8.20e-01 -0.0243 0.107 0.234 DC L1
ENSG00000284543 LINC01226 -706660 sc-eQTL 5.32e-01 -0.0443 0.0709 0.234 DC L1
ENSG00000287510 AL137857.1 67873 sc-eQTL 7.22e-01 0.0365 0.103 0.234 DC L1
ENSG00000060688 SNRNP40 -497222 sc-eQTL 2.69e-01 -0.0848 0.0765 0.233 Mono L1
ENSG00000121766 ZCCHC17 -497416 sc-eQTL 3.52e-01 -0.0885 0.0949 0.233 Mono L1
ENSG00000134644 PUM1 -266425 sc-eQTL 6.68e-01 -0.0262 0.0609 0.233 Mono L1
ENSG00000162511 LAPTM5 41792 sc-eQTL 2.62e-01 -0.0628 0.0559 0.233 Mono L1
ENSG00000162512 SDC3 -109192 sc-eQTL 7.45e-01 -0.0351 0.108 0.233 Mono L1
ENSG00000162517 PEF1 -845330 sc-eQTL 4.52e-01 -0.0569 0.0755 0.233 Mono L1
ENSG00000168528 SERINC2 -609999 sc-eQTL 8.69e-01 -0.0191 0.116 0.233 Mono L1
ENSG00000284543 LINC01226 -706660 sc-eQTL 9.59e-02 0.169 0.101 0.233 Mono L1
ENSG00000287510 AL137857.1 67873 sc-eQTL 3.28e-01 -0.0871 0.0888 0.233 Mono L1
ENSG00000060688 SNRNP40 -497222 sc-eQTL 8.72e-01 0.0171 0.106 0.232 NK L1
ENSG00000121753 ADGRB2 -965327 sc-eQTL 8.33e-01 -0.0192 0.0911 0.232 NK L1
ENSG00000121766 ZCCHC17 -497416 sc-eQTL 5.22e-01 0.0464 0.0723 0.232 NK L1
ENSG00000134644 PUM1 -266425 sc-eQTL 3.75e-01 0.0675 0.0758 0.232 NK L1
ENSG00000162511 LAPTM5 41792 sc-eQTL 2.85e-01 0.0935 0.0872 0.232 NK L1
ENSG00000162517 PEF1 -845330 sc-eQTL 6.29e-01 -0.0309 0.0638 0.232 NK L1
ENSG00000186056 MATN1-AS1 81062 sc-eQTL 1.65e-01 0.136 0.0978 0.232 NK L1
ENSG00000287510 AL137857.1 67873 sc-eQTL 1.72e-01 0.124 0.0903 0.232 NK L1
ENSG00000060688 SNRNP40 -497222 sc-eQTL 3.69e-02 0.166 0.0792 0.233 Other_T L1
ENSG00000121766 ZCCHC17 -497416 sc-eQTL 2.04e-01 -0.109 0.0852 0.233 Other_T L1
ENSG00000134644 PUM1 -266425 sc-eQTL 6.46e-01 0.0353 0.0768 0.233 Other_T L1
ENSG00000162511 LAPTM5 41792 sc-eQTL 2.40e-01 0.074 0.0628 0.233 Other_T L1
ENSG00000162517 PEF1 -845330 sc-eQTL 7.84e-01 -0.0231 0.0841 0.233 Other_T L1
ENSG00000186056 MATN1-AS1 81062 sc-eQTL 1.08e-01 -0.166 0.103 0.233 Other_T L1
ENSG00000287510 AL137857.1 67873 sc-eQTL 2.29e-01 -0.129 0.107 0.233 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000060688 SNRNP40 -497222 sc-eQTL 7.19e-01 0.0446 0.124 0.247 B_Activated L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -497416 sc-eQTL 7.87e-01 -0.0339 0.125 0.247 B_Activated L2
ENSG00000134644 PUM1 -266425 sc-eQTL 3.41e-01 0.111 0.116 0.247 B_Activated L2
ENSG00000162510 MATN1 75981 sc-eQTL 9.23e-01 0.00977 0.102 0.247 B_Activated L2
ENSG00000162511 LAPTM5 41792 sc-eQTL 5.14e-01 -0.0463 0.0707 0.247 B_Activated L2
ENSG00000162517 PEF1 -845330 sc-eQTL 5.23e-01 0.077 0.12 0.247 B_Activated L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 81062 sc-eQTL 4.56e-01 -0.0853 0.114 0.247 B_Activated L2
ENSG00000287510 AL137857.1 67873 sc-eQTL 3.69e-01 0.0908 0.101 0.247 B_Activated L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -497222 sc-eQTL 9.78e-01 -0.00323 0.119 0.234 B_Intermediate L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -497416 sc-eQTL 3.43e-01 -0.0938 0.0987 0.234 B_Intermediate L2
ENSG00000134644 PUM1 -266425 sc-eQTL 7.22e-01 -0.0332 0.0932 0.234 B_Intermediate L2
ENSG00000162510 MATN1 75981 sc-eQTL 7.90e-01 0.0258 0.0971 0.234 B_Intermediate L2
ENSG00000162511 LAPTM5 41792 sc-eQTL 9.10e-01 0.00675 0.0596 0.234 B_Intermediate L2
ENSG00000162517 PEF1 -845330 sc-eQTL 9.41e-01 0.00826 0.111 0.234 B_Intermediate L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 81062 sc-eQTL 7.27e-01 0.0292 0.0836 0.234 B_Intermediate L2
ENSG00000287510 AL137857.1 67873 sc-eQTL 7.14e-01 -0.0343 0.0935 0.234 B_Intermediate L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -497222 sc-eQTL 2.95e-01 -0.12 0.115 0.235 B_Memory L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -497416 sc-eQTL 8.53e-01 0.0196 0.106 0.235 B_Memory L2
ENSG00000134644 PUM1 -266425 sc-eQTL 6.34e-01 0.0439 0.0921 0.235 B_Memory L2
ENSG00000162510 MATN1 75981 sc-eQTL 3.38e-01 -0.0845 0.088 0.235 B_Memory L2
ENSG00000162511 LAPTM5 41792 sc-eQTL 3.16e-01 0.0783 0.078 0.235 B_Memory L2
ENSG00000162517 PEF1 -845330 sc-eQTL 4.65e-01 -0.0762 0.104 0.235 B_Memory L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 81062 sc-eQTL 2.75e-01 -0.0976 0.0892 0.235 B_Memory L2
ENSG00000287510 AL137857.1 67873 sc-eQTL 8.54e-01 0.0193 0.105 0.235 B_Memory L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -497222 sc-eQTL 3.43e-01 -0.101 0.106 0.233 B_Naive1 L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -497416 sc-eQTL 1.64e-01 0.128 0.0913 0.233 B_Naive1 L2
ENSG00000134644 PUM1 -266425 sc-eQTL 2.01e-01 0.103 0.0806 0.233 B_Naive1 L2
ENSG00000162510 MATN1 75981 sc-eQTL 7.89e-01 0.022 0.0821 0.233 B_Naive1 L2
ENSG00000162511 LAPTM5 41792 sc-eQTL 8.96e-01 -0.00717 0.0548 0.233 B_Naive1 L2
ENSG00000162517 PEF1 -845330 sc-eQTL 4.29e-01 -0.0765 0.0965 0.233 B_Naive1 L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 81062 sc-eQTL 4.20e-01 0.0581 0.0719 0.233 B_Naive1 L2
ENSG00000287510 AL137857.1 67873 sc-eQTL 8.21e-01 -0.0202 0.0889 0.233 B_Naive1 L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -497222 sc-eQTL 5.26e-01 0.0713 0.112 0.234 B_Naive2 L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -497416 sc-eQTL 2.56e-01 -0.105 0.0924 0.234 B_Naive2 L2
ENSG00000134644 PUM1 -266425 sc-eQTL 4.23e-01 0.0727 0.0906 0.234 B_Naive2 L2
ENSG00000162510 MATN1 75981 sc-eQTL 3.63e-01 0.0792 0.0869 0.234 B_Naive2 L2
ENSG00000162511 LAPTM5 41792 sc-eQTL 5.88e-01 0.0321 0.0591 0.234 B_Naive2 L2
ENSG00000162517 PEF1 -845330 sc-eQTL 8.32e-01 -0.0229 0.108 0.234 B_Naive2 L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 81062 sc-eQTL 7.08e-01 0.0323 0.0861 0.234 B_Naive2 L2
ENSG00000287510 AL137857.1 67873 sc-eQTL 3.34e-01 0.0898 0.0928 0.234 B_Naive2 L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -497222 sc-eQTL 6.87e-01 -0.0461 0.114 0.23 CD4_CTL L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -497416 sc-eQTL 2.25e-01 -0.136 0.112 0.23 CD4_CTL L2
ENSG00000134644 PUM1 -266425 sc-eQTL 1.18e-01 0.172 0.109 0.23 CD4_CTL L2
ENSG00000162511 LAPTM5 41792 sc-eQTL 5.17e-01 -0.0637 0.098 0.23 CD4_CTL L2
ENSG00000162517 PEF1 -845330 sc-eQTL 4.99e-01 -0.0681 0.1 0.23 CD4_CTL L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 81062 sc-eQTL 7.93e-01 -0.0281 0.107 0.23 CD4_CTL L2
ENSG00000287510 AL137857.1 67873 sc-eQTL 4.46e-01 0.0721 0.0945 0.23 CD4_CTL L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -497222 sc-eQTL 5.20e-01 -0.0565 0.0877 0.233 CD4_Naive L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -497416 sc-eQTL 9.98e-01 0.000162 0.0778 0.233 CD4_Naive L2
ENSG00000134644 PUM1 -266425 sc-eQTL 1.67e-01 0.0857 0.0619 0.233 CD4_Naive L2
ENSG00000162511 LAPTM5 41792 sc-eQTL 8.85e-01 0.00965 0.0666 0.233 CD4_Naive L2
ENSG00000162517 PEF1 -845330 sc-eQTL 3.36e-01 -0.0703 0.0728 0.233 CD4_Naive L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 81062 sc-eQTL 9.18e-02 -0.114 0.0671 0.233 CD4_Naive L2
ENSG00000287510 AL137857.1 67873 sc-eQTL 1.71e-01 0.106 0.0772 0.233 CD4_Naive L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -497222 sc-eQTL 1.69e-01 -0.151 0.11 0.233 CD4_TCM L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -497416 sc-eQTL 8.36e-02 -0.153 0.0881 0.233 CD4_TCM L2
ENSG00000134644 PUM1 -266425 sc-eQTL 1.21e-01 0.122 0.0781 0.233 CD4_TCM L2
ENSG00000162511 LAPTM5 41792 sc-eQTL 6.99e-02 0.118 0.0647 0.233 CD4_TCM L2
ENSG00000162517 PEF1 -845330 sc-eQTL 2.60e-01 -0.0984 0.0871 0.233 CD4_TCM L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 81062 sc-eQTL 4.16e-02 0.168 0.0819 0.233 CD4_TCM L2
ENSG00000287510 AL137857.1 67873 sc-eQTL 8.24e-01 -0.0205 0.0921 0.233 CD4_TCM L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -497222 sc-eQTL 4.04e-01 -0.0939 0.112 0.233 CD4_TEM L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -497416 sc-eQTL 7.14e-01 0.0393 0.107 0.233 CD4_TEM L2
ENSG00000134644 PUM1 -266425 sc-eQTL 5.91e-01 0.048 0.0892 0.233 CD4_TEM L2
ENSG00000162511 LAPTM5 41792 sc-eQTL 7.71e-02 0.159 0.0897 0.233 CD4_TEM L2
ENSG00000162517 PEF1 -845330 sc-eQTL 8.16e-01 0.0236 0.101 0.233 CD4_TEM L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 81062 sc-eQTL 6.05e-03 0.288 0.104 0.233 CD4_TEM L2
ENSG00000287510 AL137857.1 67873 sc-eQTL 3.87e-01 -0.0901 0.104 0.233 CD4_TEM L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -497222 sc-eQTL 8.58e-01 -0.0219 0.122 0.233 CD8_CTL L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -497416 sc-eQTL 5.82e-01 0.0517 0.0938 0.233 CD8_CTL L2
ENSG00000134644 PUM1 -266425 sc-eQTL 2.45e-01 0.106 0.0908 0.233 CD8_CTL L2
ENSG00000162511 LAPTM5 41792 sc-eQTL 7.94e-01 -0.0264 0.101 0.233 CD8_CTL L2
ENSG00000162517 PEF1 -845330 sc-eQTL 5.98e-01 0.0464 0.0878 0.233 CD8_CTL L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 81062 sc-eQTL 4.72e-01 -0.0763 0.106 0.233 CD8_CTL L2
ENSG00000287510 AL137857.1 67873 sc-eQTL 6.00e-02 0.187 0.0989 0.233 CD8_CTL L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -497222 sc-eQTL 4.67e-01 -0.0803 0.11 0.233 CD8_Naive L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -497416 sc-eQTL 8.88e-01 0.0134 0.0951 0.233 CD8_Naive L2
ENSG00000134644 PUM1 -266425 sc-eQTL 7.05e-01 -0.029 0.0765 0.233 CD8_Naive L2
ENSG00000162511 LAPTM5 41792 sc-eQTL 1.66e-01 0.101 0.073 0.233 CD8_Naive L2
ENSG00000162517 PEF1 -845330 sc-eQTL 6.05e-01 -0.0528 0.102 0.233 CD8_Naive L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 81062 sc-eQTL 3.83e-01 0.08 0.0914 0.233 CD8_Naive L2
ENSG00000287510 AL137857.1 67873 sc-eQTL 7.87e-01 0.027 0.0997 0.233 CD8_Naive L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -497222 sc-eQTL 8.50e-01 -0.0239 0.127 0.229 CD8_TCM L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -497416 sc-eQTL 2.70e-01 0.128 0.116 0.229 CD8_TCM L2
ENSG00000134644 PUM1 -266425 sc-eQTL 8.86e-01 0.0156 0.109 0.229 CD8_TCM L2
ENSG00000162511 LAPTM5 41792 sc-eQTL 2.99e-01 -0.119 0.114 0.229 CD8_TCM L2
ENSG00000162517 PEF1 -845330 sc-eQTL 2.53e-01 -0.134 0.116 0.229 CD8_TCM L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 81062 sc-eQTL 2.73e-01 -0.116 0.105 0.229 CD8_TCM L2
ENSG00000287510 AL137857.1 67873 sc-eQTL 6.49e-01 0.0488 0.107 0.229 CD8_TCM L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -497222 sc-eQTL 9.41e-03 0.298 0.113 0.235 CD8_TEM L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -497416 sc-eQTL 1.04e-02 0.281 0.109 0.235 CD8_TEM L2
ENSG00000134644 PUM1 -266425 sc-eQTL 5.86e-02 -0.213 0.112 0.235 CD8_TEM L2
ENSG00000162511 LAPTM5 41792 sc-eQTL 1.13e-01 0.168 0.106 0.235 CD8_TEM L2
ENSG00000162517 PEF1 -845330 sc-eQTL 8.14e-01 0.0236 0.1 0.235 CD8_TEM L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 81062 sc-eQTL 1.36e-01 -0.165 0.11 0.235 CD8_TEM L2
ENSG00000287510 AL137857.1 67873 sc-eQTL 6.21e-01 0.0495 0.0999 0.235 CD8_TEM L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -497222 sc-eQTL 1.41e-03 0.377 0.117 0.229 MAIT L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -497416 sc-eQTL 6.96e-01 -0.0414 0.106 0.229 MAIT L2
ENSG00000134644 PUM1 -266425 sc-eQTL 2.46e-01 0.118 0.101 0.229 MAIT L2
ENSG00000162511 LAPTM5 41792 sc-eQTL 3.04e-01 0.0983 0.0955 0.229 MAIT L2
ENSG00000162517 PEF1 -845330 sc-eQTL 3.31e-01 0.102 0.105 0.229 MAIT L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 81062 sc-eQTL 1.28e-01 -0.162 0.106 0.229 MAIT L2
ENSG00000287510 AL137857.1 67873 sc-eQTL 2.14e-01 -0.137 0.109 0.229 MAIT L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -497222 sc-eQTL 4.80e-01 0.0839 0.119 0.231 NK_CD56bright L2
ENSG00000121753 ADGRB2 -965327 sc-eQTL 6.50e-02 -0.171 0.0922 0.231 NK_CD56bright L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -497416 sc-eQTL 7.44e-01 0.0328 0.1 0.231 NK_CD56bright L2
ENSG00000134644 PUM1 -266425 sc-eQTL 9.04e-01 -0.0127 0.105 0.231 NK_CD56bright L2
ENSG00000162511 LAPTM5 41792 sc-eQTL 9.01e-01 0.0129 0.104 0.231 NK_CD56bright L2
ENSG00000162517 PEF1 -845330 sc-eQTL 8.97e-01 -0.0131 0.101 0.231 NK_CD56bright L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 81062 sc-eQTL 9.14e-01 -0.0113 0.104 0.231 NK_CD56bright L2
ENSG00000287510 AL137857.1 67873 sc-eQTL 6.54e-01 0.0462 0.103 0.231 NK_CD56bright L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -497222 sc-eQTL 9.70e-01 -0.00415 0.112 0.231 NK_CD56dim L2
ENSG00000121753 ADGRB2 -965327 sc-eQTL 6.21e-01 0.0487 0.0983 0.231 NK_CD56dim L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -497416 sc-eQTL 5.77e-01 -0.0461 0.0826 0.231 NK_CD56dim L2
ENSG00000134644 PUM1 -266425 sc-eQTL 3.70e-01 0.0761 0.0847 0.231 NK_CD56dim L2
ENSG00000162511 LAPTM5 41792 sc-eQTL 1.35e-01 0.135 0.09 0.231 NK_CD56dim L2
ENSG00000162517 PEF1 -845330 sc-eQTL 4.81e-01 -0.0567 0.0804 0.231 NK_CD56dim L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 81062 sc-eQTL 3.85e-01 0.0984 0.113 0.231 NK_CD56dim L2
ENSG00000287510 AL137857.1 67873 sc-eQTL 7.45e-02 0.166 0.0928 0.231 NK_CD56dim L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -497222 sc-eQTL 3.71e-01 0.108 0.12 0.226 NK_HLA L2
ENSG00000121753 ADGRB2 -965327 sc-eQTL 9.96e-01 0.000507 0.0954 0.226 NK_HLA L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -497416 sc-eQTL 2.09e-02 0.246 0.106 0.226 NK_HLA L2
ENSG00000134644 PUM1 -266425 sc-eQTL 7.65e-02 0.185 0.104 0.226 NK_HLA L2
ENSG00000162511 LAPTM5 41792 sc-eQTL 1.51e-01 0.143 0.0992 0.226 NK_HLA L2
ENSG00000162517 PEF1 -845330 sc-eQTL 4.19e-01 -0.0908 0.112 0.226 NK_HLA L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 81062 sc-eQTL 3.50e-01 0.0992 0.106 0.226 NK_HLA L2
ENSG00000287510 AL137857.1 67873 sc-eQTL 9.14e-01 0.0111 0.103 0.226 NK_HLA L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -497222 sc-eQTL 9.00e-01 -0.0137 0.109 0.231 NK_cytokine L2
ENSG00000121753 ADGRB2 -965327 sc-eQTL 9.31e-01 0.00851 0.0985 0.231 NK_cytokine L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -497416 sc-eQTL 1.24e-01 0.131 0.0846 0.231 NK_cytokine L2
ENSG00000134644 PUM1 -266425 sc-eQTL 6.29e-01 -0.0445 0.092 0.231 NK_cytokine L2
ENSG00000162511 LAPTM5 41792 sc-eQTL 8.83e-01 0.0149 0.101 0.231 NK_cytokine L2
ENSG00000162517 PEF1 -845330 sc-eQTL 1.91e-01 -0.113 0.086 0.231 NK_cytokine L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 81062 sc-eQTL 1.24e-01 0.165 0.107 0.231 NK_cytokine L2
ENSG00000287510 AL137857.1 67873 sc-eQTL 5.89e-01 0.054 0.0998 0.231 NK_cytokine L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -497222 sc-eQTL 9.95e-01 0.000716 0.121 0.241 PB L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -497416 sc-eQTL 6.30e-01 -0.0674 0.14 0.241 PB L2
ENSG00000134644 PUM1 -266425 sc-eQTL 4.35e-01 -0.0949 0.121 0.241 PB L2
ENSG00000162510 MATN1 75981 sc-eQTL 1.10e-01 0.18 0.112 0.241 PB L2
ENSG00000162511 LAPTM5 41792 sc-eQTL 1.38e-01 -0.12 0.0801 0.241 PB L2
ENSG00000162517 PEF1 -845330 sc-eQTL 6.92e-01 -0.0493 0.124 0.241 PB L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 81062 sc-eQTL 2.84e-01 0.119 0.11 0.241 PB L2
ENSG00000287510 AL137857.1 67873 sc-eQTL 8.77e-01 0.0183 0.118 0.241 PB L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -497222 sc-eQTL 8.87e-01 -0.0121 0.0849 0.235 Pro_T L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -497416 sc-eQTL 8.10e-02 -0.188 0.107 0.235 Pro_T L2
ENSG00000134644 PUM1 -266425 sc-eQTL 6.92e-01 -0.0398 0.1 0.235 Pro_T L2
ENSG00000162511 LAPTM5 41792 sc-eQTL 1.50e-01 0.104 0.0718 0.235 Pro_T L2
ENSG00000162517 PEF1 -845330 sc-eQTL 9.84e-02 -0.174 0.105 0.235 Pro_T L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 81062 sc-eQTL 8.48e-01 -0.0194 0.101 0.235 Pro_T L2
ENSG00000287510 AL137857.1 67873 sc-eQTL 1.21e-01 -0.143 0.0921 0.235 Pro_T L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -497222 sc-eQTL 7.85e-01 -0.0313 0.115 0.233 Treg L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -497416 sc-eQTL 1.82e-01 0.148 0.111 0.233 Treg L2
ENSG00000134644 PUM1 -266425 sc-eQTL 1.13e-02 0.224 0.0876 0.233 Treg L2
ENSG00000162511 LAPTM5 41792 sc-eQTL 2.32e-01 0.122 0.101 0.233 Treg L2
ENSG00000162517 PEF1 -845330 sc-eQTL 7.61e-01 -0.0335 0.11 0.233 Treg L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 81062 sc-eQTL 7.91e-02 -0.182 0.103 0.233 Treg L2
ENSG00000287510 AL137857.1 67873 sc-eQTL 6.75e-01 0.0435 0.104 0.233 Treg L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -497222 sc-eQTL 4.91e-01 0.0779 0.113 0.234 cDC L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -497416 sc-eQTL 6.55e-02 -0.225 0.121 0.234 cDC L2
ENSG00000134644 PUM1 -266425 sc-eQTL 1.75e-02 0.248 0.104 0.234 cDC L2
ENSG00000162511 LAPTM5 41792 sc-eQTL 3.34e-01 -0.0712 0.0735 0.234 cDC L2
ENSG00000162517 PEF1 -845330 sc-eQTL 3.52e-01 0.0993 0.106 0.234 cDC L2
ENSG00000168528 SERINC2 -609999 sc-eQTL 1.50e-01 -0.136 0.0941 0.234 cDC L2
ENSG00000284543 LINC01226 -706660 sc-eQTL 1.00e-01 -0.152 0.0923 0.234 cDC L2
ENSG00000287510 AL137857.1 67873 sc-eQTL 7.20e-01 0.036 0.1 0.234 cDC L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -497222 sc-eQTL 7.30e-01 0.0322 0.0931 0.233 cMono_IL1B L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -497416 sc-eQTL 2.42e-01 -0.122 0.104 0.233 cMono_IL1B L2
ENSG00000134644 PUM1 -266425 sc-eQTL 4.36e-01 -0.0548 0.0702 0.233 cMono_IL1B L2
ENSG00000162511 LAPTM5 41792 sc-eQTL 7.66e-02 -0.109 0.0612 0.233 cMono_IL1B L2
ENSG00000162512 SDC3 -109192 sc-eQTL 2.74e-01 -0.127 0.116 0.233 cMono_IL1B L2
ENSG00000162517 PEF1 -845330 sc-eQTL 6.93e-01 0.0376 0.0949 0.233 cMono_IL1B L2
ENSG00000168528 SERINC2 -609999 sc-eQTL 7.25e-01 0.0414 0.118 0.233 cMono_IL1B L2
ENSG00000284543 LINC01226 -706660 sc-eQTL 3.66e-02 0.217 0.103 0.233 cMono_IL1B L2
ENSG00000287510 AL137857.1 67873 sc-eQTL 2.41e-02 -0.218 0.0958 0.233 cMono_IL1B L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -497222 sc-eQTL 2.72e-01 -0.106 0.0964 0.233 cMono_S100A L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -497416 sc-eQTL 8.51e-02 -0.196 0.113 0.233 cMono_S100A L2
ENSG00000134644 PUM1 -266425 sc-eQTL 4.91e-01 -0.057 0.0825 0.233 cMono_S100A L2
ENSG00000162511 LAPTM5 41792 sc-eQTL 2.35e-01 -0.0753 0.0633 0.233 cMono_S100A L2
ENSG00000162512 SDC3 -109192 sc-eQTL 8.60e-01 0.0194 0.11 0.233 cMono_S100A L2
ENSG00000162517 PEF1 -845330 sc-eQTL 5.44e-01 -0.0601 0.0989 0.233 cMono_S100A L2
ENSG00000168528 SERINC2 -609999 sc-eQTL 8.69e-01 0.0191 0.116 0.233 cMono_S100A L2
ENSG00000284543 LINC01226 -706660 sc-eQTL 7.36e-01 0.0318 0.0943 0.233 cMono_S100A L2
ENSG00000287510 AL137857.1 67873 sc-eQTL 8.65e-01 -0.0161 0.0947 0.233 cMono_S100A L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -497222 sc-eQTL 3.93e-01 0.131 0.153 0.224 gdT L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -497416 sc-eQTL 3.17e-01 0.132 0.131 0.224 gdT L2
ENSG00000134644 PUM1 -266425 sc-eQTL 9.16e-01 -0.0144 0.136 0.224 gdT L2
ENSG00000162511 LAPTM5 41792 sc-eQTL 2.00e-01 0.189 0.147 0.224 gdT L2
ENSG00000162517 PEF1 -845330 sc-eQTL 6.88e-01 -0.0543 0.135 0.224 gdT L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 81062 sc-eQTL 1.26e-01 -0.208 0.135 0.224 gdT L2
ENSG00000287510 AL137857.1 67873 sc-eQTL 4.71e-01 -0.0953 0.132 0.224 gdT L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -497222 sc-eQTL 5.43e-01 -0.0654 0.107 0.236 intMono L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -497416 sc-eQTL 9.10e-01 0.0131 0.116 0.236 intMono L2
ENSG00000134644 PUM1 -266425 sc-eQTL 2.07e-01 0.124 0.0976 0.236 intMono L2
ENSG00000162511 LAPTM5 41792 sc-eQTL 6.78e-01 0.032 0.0769 0.236 intMono L2
ENSG00000162512 SDC3 -109192 sc-eQTL 9.70e-01 -0.00394 0.105 0.236 intMono L2
ENSG00000162517 PEF1 -845330 sc-eQTL 4.71e-01 0.0799 0.11 0.236 intMono L2
ENSG00000168528 SERINC2 -609999 sc-eQTL 3.76e-01 -0.0975 0.11 0.236 intMono L2
ENSG00000284543 LINC01226 -706660 sc-eQTL 4.45e-01 0.0798 0.104 0.236 intMono L2
ENSG00000287510 AL137857.1 67873 sc-eQTL 3.80e-01 0.0917 0.104 0.236 intMono L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -497222 sc-eQTL 2.02e-01 -0.128 0.1 0.235 ncMono L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -497416 sc-eQTL 3.14e-01 0.108 0.107 0.235 ncMono L2
ENSG00000134644 PUM1 -266425 sc-eQTL 2.33e-01 0.104 0.0872 0.235 ncMono L2
ENSG00000162511 LAPTM5 41792 sc-eQTL 6.40e-01 0.0372 0.0794 0.235 ncMono L2
ENSG00000162512 SDC3 -109192 sc-eQTL 6.35e-01 -0.0423 0.089 0.235 ncMono L2
ENSG00000162517 PEF1 -845330 sc-eQTL 6.39e-01 -0.048 0.102 0.235 ncMono L2
ENSG00000168528 SERINC2 -609999 sc-eQTL 7.81e-01 -0.0271 0.0972 0.235 ncMono L2
ENSG00000284543 LINC01226 -706660 sc-eQTL 9.71e-01 -0.00349 0.0971 0.235 ncMono L2
ENSG00000287510 AL137857.1 67873 sc-eQTL 4.41e-01 0.0777 0.101 0.235 ncMono L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -497222 sc-eQTL 1.08e-01 -0.185 0.115 0.232 pDC L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -497416 sc-eQTL 2.13e-01 -0.158 0.126 0.232 pDC L2
ENSG00000134644 PUM1 -266425 sc-eQTL 1.18e-01 -0.164 0.104 0.232 pDC L2
ENSG00000162511 LAPTM5 41792 sc-eQTL 5.72e-01 -0.0554 0.0978 0.232 pDC L2
ENSG00000162517 PEF1 -845330 sc-eQTL 7.79e-01 -0.0358 0.127 0.232 pDC L2
ENSG00000168528 SERINC2 -609999 sc-eQTL 4.71e-01 0.0857 0.118 0.232 pDC L2
ENSG00000284543 LINC01226 -706660 sc-eQTL 9.48e-01 0.00603 0.0921 0.232 pDC L2
ENSG00000287510 AL137857.1 67873 sc-eQTL 6.33e-01 -0.0518 0.108 0.232 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000060688 SNRNP40 -497222 sc-eQTL 5.38e-01 -0.0696 0.113 0.233 B_Memory LOneK1K
ENSG00000121766 ZCCHC17 -497416 sc-eQTL 1.23e-01 -0.144 0.0933 0.233 B_Memory LOneK1K
ENSG00000134644 PUM1 -266425 sc-eQTL 8.95e-01 0.011 0.0832 0.233 B_Memory LOneK1K
ENSG00000162510 MATN1 75981 sc-eQTL 6.49e-01 0.0432 0.0948 0.233 B_Memory LOneK1K
ENSG00000162511 LAPTM5 41792 sc-eQTL 2.66e-01 0.0662 0.0594 0.233 B_Memory LOneK1K
ENSG00000162517 PEF1 -845330 sc-eQTL 7.05e-01 -0.0373 0.0987 0.233 B_Memory LOneK1K
ENSG00000186056 MATN1-AS1 81062 sc-eQTL 9.99e-01 0.000122 0.0788 0.233 B_Memory LOneK1K
ENSG00000287510 AL137857.1 67873 sc-eQTL 3.08e-01 -0.0876 0.0857 0.233 B_Memory LOneK1K
ENSG00000060688 SNRNP40 -497222 sc-eQTL 5.28e-01 -0.0651 0.103 0.233 B_Naive LOneK1K
ENSG00000121766 ZCCHC17 -497416 sc-eQTL 8.72e-01 0.0131 0.0814 0.233 B_Naive LOneK1K
ENSG00000134644 PUM1 -266425 sc-eQTL 1.64e-01 0.107 0.0767 0.233 B_Naive LOneK1K
ENSG00000162510 MATN1 75981 sc-eQTL 5.45e-01 0.0449 0.0741 0.233 B_Naive LOneK1K
ENSG00000162511 LAPTM5 41792 sc-eQTL 9.67e-01 -0.00218 0.0522 0.233 B_Naive LOneK1K
ENSG00000162517 PEF1 -845330 sc-eQTL 4.47e-01 -0.0725 0.0952 0.233 B_Naive LOneK1K
ENSG00000186056 MATN1-AS1 81062 sc-eQTL 5.23e-01 0.0431 0.0674 0.233 B_Naive LOneK1K
ENSG00000287510 AL137857.1 67873 sc-eQTL 9.44e-01 -0.00568 0.0801 0.233 B_Naive LOneK1K
ENSG00000060688 SNRNP40 -497222 sc-eQTL 5.79e-01 -0.0491 0.0883 0.233 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000121766 ZCCHC17 -497416 sc-eQTL 1.15e-01 -0.158 0.0995 0.233 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000134644 PUM1 -266425 sc-eQTL 4.07e-01 -0.053 0.0638 0.233 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000162511 LAPTM5 41792 sc-eQTL 1.24e-01 -0.0861 0.0558 0.233 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000162512 SDC3 -109192 sc-eQTL 7.16e-01 -0.0417 0.114 0.233 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000162517 PEF1 -845330 sc-eQTL 6.63e-01 -0.0351 0.0805 0.233 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000168528 SERINC2 -609999 sc-eQTL 9.12e-01 0.0131 0.118 0.233 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000284543 LINC01226 -706660 sc-eQTL 6.00e-02 0.181 0.0958 0.233 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000287510 AL137857.1 67873 sc-eQTL 9.47e-02 -0.151 0.0898 0.233 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000060688 SNRNP40 -497222 sc-eQTL 2.49e-01 -0.109 0.0941 0.233 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000121766 ZCCHC17 -497416 sc-eQTL 6.20e-01 0.0513 0.103 0.233 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000134644 PUM1 -266425 sc-eQTL 2.38e-01 0.0997 0.0844 0.233 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000162511 LAPTM5 41792 sc-eQTL 7.75e-01 -0.0194 0.0677 0.233 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000162512 SDC3 -109192 sc-eQTL 7.00e-01 -0.0382 0.0989 0.233 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000162517 PEF1 -845330 sc-eQTL 6.50e-01 -0.0408 0.0898 0.233 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000168528 SERINC2 -609999 sc-eQTL 5.01e-01 -0.0691 0.102 0.233 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000284543 LINC01226 -706660 sc-eQTL 6.00e-01 0.0511 0.0973 0.233 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000287510 AL137857.1 67873 sc-eQTL 4.87e-01 0.0678 0.0973 0.233 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000060688 SNRNP40 -497222 sc-eQTL 9.26e-01 0.00984 0.107 0.231 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000121753 ADGRB2 -965327 sc-eQTL 8.77e-01 0.0141 0.0907 0.231 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000121766 ZCCHC17 -497416 sc-eQTL 3.08e-01 0.0742 0.0726 0.231 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000134644 PUM1 -266425 sc-eQTL 3.06e-01 0.0817 0.0795 0.231 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000162511 LAPTM5 41792 sc-eQTL 2.73e-01 0.0977 0.0888 0.231 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000162517 PEF1 -845330 sc-eQTL 4.54e-01 -0.0507 0.0676 0.231 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000186056 MATN1-AS1 81062 sc-eQTL 1.14e-01 0.162 0.102 0.231 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000287510 AL137857.1 67873 sc-eQTL 2.09e-01 0.111 0.0884 0.231 NK_CD56dim LOneK1K

Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF

Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina
ENSG00000121753 \N -965327 2.69e-07 1.19e-07 3.69e-08 1.8e-07 9.01e-08 9.65e-08 1.44e-07 5.19e-08 1.44e-07 4.74e-08 1.62e-07 8.36e-08 1.41e-07 6.56e-08 6e-08 7.17e-08 3.94e-08 1.21e-07 5.36e-08 4.42e-08 1.04e-07 1.23e-07 1.34e-07 3.68e-08 1.37e-07 1.16e-07 1.08e-07 9.36e-08 1.05e-07 1.07e-07 9.64e-08 4.09e-08 3.26e-08 8.55e-08 8.76e-08 3.76e-08 5.05e-08 9.22e-08 6.55e-08 3.37e-08 3.82e-08 1.33e-07 4.33e-08 1.57e-08 5.75e-08 1.83e-08 1.24e-07 3.95e-09 5.09e-08
ENSG00000162511 \N 41792 9.84e-06 9.99e-06 1.35e-06 5.17e-06 2.44e-06 4.24e-06 1.08e-05 1.71e-06 8.87e-06 5.06e-06 1.21e-05 5.15e-06 1.51e-05 3.79e-06 2.55e-06 6.25e-06 4.52e-06 7.17e-06 2.58e-06 2.85e-06 4.96e-06 8.99e-06 7.69e-06 3.35e-06 1.45e-05 3.35e-06 4.47e-06 3.34e-06 9.86e-06 1.02e-05 5.45e-06 8.89e-07 1.25e-06 3.1e-06 4.23e-06 2.7e-06 1.79e-06 1.89e-06 2.15e-06 1.04e-06 1.04e-06 1.3e-05 1.32e-06 1.73e-07 7.66e-07 1.57e-06 1.29e-06 6.96e-07 4.78e-07