logo

Genes within 1Mb (chr1:30798256:T:C):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD

Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000060688 SNRNP40 -498532 sc-eQTL 8.74e-01 -0.0201 0.127 0.103 B L1
ENSG00000121766 ZCCHC17 -498726 sc-eQTL 8.53e-02 -0.174 0.101 0.103 B L1
ENSG00000134644 PUM1 -267735 sc-eQTL 4.44e-02 0.171 0.0844 0.103 B L1
ENSG00000162510 MATN1 74671 sc-eQTL 3.90e-01 0.077 0.0894 0.103 B L1
ENSG00000162511 LAPTM5 40482 sc-eQTL 3.91e-01 0.0603 0.07 0.103 B L1
ENSG00000162517 PEF1 -846640 sc-eQTL 7.46e-01 -0.0343 0.106 0.103 B L1
ENSG00000186056 MATN1-AS1 79752 sc-eQTL 9.70e-01 -0.00306 0.0822 0.103 B L1
ENSG00000287510 AL137857.1 66563 sc-eQTL 9.81e-01 -0.00227 0.0973 0.103 B L1
ENSG00000060688 SNRNP40 -498532 sc-eQTL 8.39e-01 0.0218 0.108 0.103 CD4T L1
ENSG00000121766 ZCCHC17 -498726 sc-eQTL 9.53e-01 -0.00492 0.084 0.103 CD4T L1
ENSG00000134644 PUM1 -267735 sc-eQTL 9.68e-01 0.00303 0.0748 0.103 CD4T L1
ENSG00000162511 LAPTM5 40482 sc-eQTL 1.55e-02 0.2 0.0818 0.103 CD4T L1
ENSG00000162517 PEF1 -846640 sc-eQTL 8.29e-01 0.0188 0.0867 0.103 CD4T L1
ENSG00000186056 MATN1-AS1 79752 sc-eQTL 7.47e-02 -0.132 0.0736 0.103 CD4T L1
ENSG00000287510 AL137857.1 66563 sc-eQTL 4.75e-01 -0.0635 0.0887 0.103 CD4T L1
ENSG00000060688 SNRNP40 -498532 sc-eQTL 2.46e-01 -0.164 0.141 0.103 CD8T L1
ENSG00000121766 ZCCHC17 -498726 sc-eQTL 2.18e-01 -0.116 0.0935 0.103 CD8T L1
ENSG00000134644 PUM1 -267735 sc-eQTL 6.99e-01 0.032 0.0826 0.103 CD8T L1
ENSG00000162511 LAPTM5 40482 sc-eQTL 4.39e-02 0.161 0.0795 0.103 CD8T L1
ENSG00000162517 PEF1 -846640 sc-eQTL 3.05e-01 0.101 0.0986 0.103 CD8T L1
ENSG00000186056 MATN1-AS1 79752 sc-eQTL 4.27e-01 0.0748 0.0939 0.103 CD8T L1
ENSG00000287510 AL137857.1 66563 sc-eQTL 5.91e-01 -0.0635 0.118 0.103 CD8T L1
ENSG00000060688 SNRNP40 -498532 sc-eQTL 1.31e-01 0.189 0.125 0.106 DC L1
ENSG00000121766 ZCCHC17 -498726 sc-eQTL 6.24e-01 -0.073 0.149 0.106 DC L1
ENSG00000134644 PUM1 -267735 sc-eQTL 9.43e-01 -0.00834 0.116 0.106 DC L1
ENSG00000162511 LAPTM5 40482 sc-eQTL 6.37e-01 0.0393 0.0831 0.106 DC L1
ENSG00000162517 PEF1 -846640 sc-eQTL 4.15e-02 -0.274 0.133 0.106 DC L1
ENSG00000168528 SERINC2 -611309 sc-eQTL 1.59e-01 0.193 0.136 0.106 DC L1
ENSG00000284543 LINC01226 -707970 sc-eQTL 1.72e-01 -0.124 0.0904 0.106 DC L1
ENSG00000287510 AL137857.1 66563 sc-eQTL 6.71e-01 0.056 0.131 0.106 DC L1
ENSG00000060688 SNRNP40 -498532 sc-eQTL 8.57e-02 0.168 0.0973 0.103 Mono L1
ENSG00000121766 ZCCHC17 -498726 sc-eQTL 8.95e-01 -0.016 0.122 0.103 Mono L1
ENSG00000134644 PUM1 -267735 sc-eQTL 5.30e-01 0.049 0.0778 0.103 Mono L1
ENSG00000162511 LAPTM5 40482 sc-eQTL 8.03e-01 0.0179 0.0716 0.103 Mono L1
ENSG00000162512 SDC3 -110502 sc-eQTL 1.43e-01 -0.201 0.137 0.103 Mono L1
ENSG00000162517 PEF1 -846640 sc-eQTL 7.59e-01 0.0297 0.0966 0.103 Mono L1
ENSG00000168528 SERINC2 -611309 sc-eQTL 3.14e-01 0.149 0.147 0.103 Mono L1
ENSG00000284543 LINC01226 -707970 sc-eQTL 8.52e-01 -0.0243 0.13 0.103 Mono L1
ENSG00000287510 AL137857.1 66563 sc-eQTL 7.43e-01 0.0374 0.114 0.103 Mono L1
ENSG00000060688 SNRNP40 -498532 sc-eQTL 2.20e-01 0.168 0.136 0.103 NK L1
ENSG00000121753 ADGRB2 -966637 sc-eQTL 8.54e-01 -0.0217 0.118 0.103 NK L1
ENSG00000121766 ZCCHC17 -498726 sc-eQTL 8.42e-01 0.0187 0.0937 0.103 NK L1
ENSG00000134644 PUM1 -267735 sc-eQTL 5.69e-01 0.056 0.0982 0.103 NK L1
ENSG00000162511 LAPTM5 40482 sc-eQTL 7.34e-01 0.0384 0.113 0.103 NK L1
ENSG00000162517 PEF1 -846640 sc-eQTL 7.14e-01 -0.0303 0.0825 0.103 NK L1
ENSG00000186056 MATN1-AS1 79752 sc-eQTL 4.37e-04 0.441 0.123 0.103 NK L1
ENSG00000287510 AL137857.1 66563 sc-eQTL 4.19e-01 -0.0948 0.117 0.103 NK L1
ENSG00000060688 SNRNP40 -498532 sc-eQTL 8.10e-01 -0.0252 0.104 0.103 Other_T L1
ENSG00000121766 ZCCHC17 -498726 sc-eQTL 9.55e-01 0.00635 0.112 0.103 Other_T L1
ENSG00000134644 PUM1 -267735 sc-eQTL 9.16e-02 0.169 0.0997 0.103 Other_T L1
ENSG00000162511 LAPTM5 40482 sc-eQTL 4.22e-02 0.167 0.0815 0.103 Other_T L1
ENSG00000162517 PEF1 -846640 sc-eQTL 3.23e-01 0.109 0.11 0.103 Other_T L1
ENSG00000186056 MATN1-AS1 79752 sc-eQTL 9.92e-01 0.00141 0.135 0.103 Other_T L1
ENSG00000287510 AL137857.1 66563 sc-eQTL 4.29e-01 0.111 0.14 0.103 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000060688 SNRNP40 -498532 sc-eQTL 7.80e-01 0.0433 0.155 0.112 B_Activated L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -498726 sc-eQTL 9.29e-01 -0.0139 0.156 0.112 B_Activated L2
ENSG00000134644 PUM1 -267735 sc-eQTL 5.19e-01 0.0938 0.145 0.112 B_Activated L2
ENSG00000162510 MATN1 74671 sc-eQTL 4.67e-01 0.0923 0.127 0.112 B_Activated L2
ENSG00000162511 LAPTM5 40482 sc-eQTL 8.36e-01 0.0184 0.0885 0.112 B_Activated L2
ENSG00000162517 PEF1 -846640 sc-eQTL 3.27e-01 -0.148 0.15 0.112 B_Activated L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 79752 sc-eQTL 4.53e-01 -0.107 0.143 0.112 B_Activated L2
ENSG00000287510 AL137857.1 66563 sc-eQTL 7.82e-01 -0.0351 0.126 0.112 B_Activated L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -498532 sc-eQTL 7.15e-01 -0.0564 0.154 0.103 B_Intermediate L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -498726 sc-eQTL 4.45e-01 -0.0983 0.128 0.103 B_Intermediate L2
ENSG00000134644 PUM1 -267735 sc-eQTL 4.37e-01 0.0943 0.121 0.103 B_Intermediate L2
ENSG00000162510 MATN1 74671 sc-eQTL 1.61e-01 -0.177 0.126 0.103 B_Intermediate L2
ENSG00000162511 LAPTM5 40482 sc-eQTL 2.02e-01 0.0989 0.0772 0.103 B_Intermediate L2
ENSG00000162517 PEF1 -846640 sc-eQTL 6.16e-01 0.0723 0.144 0.103 B_Intermediate L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 79752 sc-eQTL 6.29e-01 0.0526 0.109 0.103 B_Intermediate L2
ENSG00000287510 AL137857.1 66563 sc-eQTL 6.50e-01 0.0553 0.122 0.103 B_Intermediate L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -498532 sc-eQTL 5.86e-01 -0.0824 0.151 0.101 B_Memory L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -498726 sc-eQTL 6.39e-01 0.0654 0.139 0.101 B_Memory L2
ENSG00000134644 PUM1 -267735 sc-eQTL 8.75e-01 0.019 0.121 0.101 B_Memory L2
ENSG00000162510 MATN1 74671 sc-eQTL 1.56e-01 0.164 0.115 0.101 B_Memory L2
ENSG00000162511 LAPTM5 40482 sc-eQTL 3.20e-01 0.102 0.103 0.101 B_Memory L2
ENSG00000162517 PEF1 -846640 sc-eQTL 2.62e-01 -0.154 0.137 0.101 B_Memory L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 79752 sc-eQTL 7.29e-01 -0.0408 0.118 0.101 B_Memory L2
ENSG00000287510 AL137857.1 66563 sc-eQTL 6.85e-01 0.0559 0.138 0.101 B_Memory L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -498532 sc-eQTL 6.29e-01 0.0657 0.136 0.103 B_Naive1 L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -498726 sc-eQTL 3.64e-01 -0.107 0.117 0.103 B_Naive1 L2
ENSG00000134644 PUM1 -267735 sc-eQTL 8.08e-01 -0.0252 0.103 0.103 B_Naive1 L2
ENSG00000162510 MATN1 74671 sc-eQTL 3.18e-01 0.105 0.105 0.103 B_Naive1 L2
ENSG00000162511 LAPTM5 40482 sc-eQTL 3.55e-01 0.0649 0.0699 0.103 B_Naive1 L2
ENSG00000162517 PEF1 -846640 sc-eQTL 1.99e-01 -0.159 0.123 0.103 B_Naive1 L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 79752 sc-eQTL 8.97e-01 0.0119 0.092 0.103 B_Naive1 L2
ENSG00000287510 AL137857.1 66563 sc-eQTL 8.93e-01 -0.0153 0.114 0.103 B_Naive1 L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -498532 sc-eQTL 9.41e-01 -0.0108 0.145 0.103 B_Naive2 L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -498726 sc-eQTL 4.30e-01 -0.0945 0.119 0.103 B_Naive2 L2
ENSG00000134644 PUM1 -267735 sc-eQTL 7.06e-01 0.0442 0.117 0.103 B_Naive2 L2
ENSG00000162510 MATN1 74671 sc-eQTL 4.83e-01 -0.0789 0.112 0.103 B_Naive2 L2
ENSG00000162511 LAPTM5 40482 sc-eQTL 3.13e-01 0.0769 0.0761 0.103 B_Naive2 L2
ENSG00000162517 PEF1 -846640 sc-eQTL 6.78e-01 -0.0577 0.139 0.103 B_Naive2 L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 79752 sc-eQTL 5.65e-01 0.064 0.111 0.103 B_Naive2 L2
ENSG00000287510 AL137857.1 66563 sc-eQTL 3.92e-01 0.103 0.12 0.103 B_Naive2 L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -498532 sc-eQTL 1.59e-01 0.201 0.142 0.107 CD4_CTL L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -498726 sc-eQTL 3.79e-01 0.124 0.14 0.107 CD4_CTL L2
ENSG00000134644 PUM1 -267735 sc-eQTL 4.99e-01 -0.0932 0.138 0.107 CD4_CTL L2
ENSG00000162511 LAPTM5 40482 sc-eQTL 9.93e-01 0.00101 0.123 0.107 CD4_CTL L2
ENSG00000162517 PEF1 -846640 sc-eQTL 5.31e-01 -0.0789 0.126 0.107 CD4_CTL L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 79752 sc-eQTL 7.48e-01 -0.0432 0.134 0.107 CD4_CTL L2
ENSG00000287510 AL137857.1 66563 sc-eQTL 4.96e-01 0.0807 0.118 0.107 CD4_CTL L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -498532 sc-eQTL 1.23e-01 0.172 0.111 0.103 CD4_Naive L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -498726 sc-eQTL 7.02e-01 -0.0379 0.099 0.103 CD4_Naive L2
ENSG00000134644 PUM1 -267735 sc-eQTL 5.41e-01 -0.0483 0.079 0.103 CD4_Naive L2
ENSG00000162511 LAPTM5 40482 sc-eQTL 3.63e-02 0.177 0.0838 0.103 CD4_Naive L2
ENSG00000162517 PEF1 -846640 sc-eQTL 6.70e-01 0.0396 0.0928 0.103 CD4_Naive L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 79752 sc-eQTL 1.26e-01 -0.131 0.0855 0.103 CD4_Naive L2
ENSG00000287510 AL137857.1 66563 sc-eQTL 3.85e-01 -0.0858 0.0985 0.103 CD4_Naive L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -498532 sc-eQTL 3.79e-01 -0.124 0.141 0.103 CD4_TCM L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -498726 sc-eQTL 4.56e-01 0.085 0.114 0.103 CD4_TCM L2
ENSG00000134644 PUM1 -267735 sc-eQTL 9.37e-02 0.169 0.1 0.103 CD4_TCM L2
ENSG00000162511 LAPTM5 40482 sc-eQTL 1.05e-01 0.135 0.0832 0.103 CD4_TCM L2
ENSG00000162517 PEF1 -846640 sc-eQTL 9.65e-01 0.0049 0.112 0.103 CD4_TCM L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 79752 sc-eQTL 1.06e-01 -0.171 0.106 0.103 CD4_TCM L2
ENSG00000287510 AL137857.1 66563 sc-eQTL 2.48e-01 -0.137 0.118 0.103 CD4_TCM L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -498532 sc-eQTL 5.86e-01 -0.0772 0.142 0.103 CD4_TEM L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -498726 sc-eQTL 9.30e-01 0.0119 0.135 0.103 CD4_TEM L2
ENSG00000134644 PUM1 -267735 sc-eQTL 7.32e-01 0.0385 0.112 0.103 CD4_TEM L2
ENSG00000162511 LAPTM5 40482 sc-eQTL 8.78e-02 0.194 0.113 0.103 CD4_TEM L2
ENSG00000162517 PEF1 -846640 sc-eQTL 3.34e-01 0.123 0.127 0.103 CD4_TEM L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 79752 sc-eQTL 5.19e-01 -0.0859 0.133 0.103 CD4_TEM L2
ENSG00000287510 AL137857.1 66563 sc-eQTL 7.14e-01 0.0481 0.131 0.103 CD4_TEM L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -498532 sc-eQTL 6.29e-01 -0.0738 0.153 0.103 CD8_CTL L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -498726 sc-eQTL 6.72e-01 -0.0496 0.117 0.103 CD8_CTL L2
ENSG00000134644 PUM1 -267735 sc-eQTL 5.85e-01 0.0622 0.114 0.103 CD8_CTL L2
ENSG00000162511 LAPTM5 40482 sc-eQTL 8.51e-01 0.0236 0.126 0.103 CD8_CTL L2
ENSG00000162517 PEF1 -846640 sc-eQTL 7.67e-01 -0.0326 0.11 0.103 CD8_CTL L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 79752 sc-eQTL 7.33e-01 -0.0452 0.132 0.103 CD8_CTL L2
ENSG00000287510 AL137857.1 66563 sc-eQTL 3.77e-01 -0.11 0.124 0.103 CD8_CTL L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -498532 sc-eQTL 6.91e-01 -0.0551 0.139 0.103 CD8_Naive L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -498726 sc-eQTL 4.64e-01 -0.0876 0.119 0.103 CD8_Naive L2
ENSG00000134644 PUM1 -267735 sc-eQTL 9.97e-02 0.158 0.0956 0.103 CD8_Naive L2
ENSG00000162511 LAPTM5 40482 sc-eQTL 8.08e-03 0.242 0.0907 0.103 CD8_Naive L2
ENSG00000162517 PEF1 -846640 sc-eQTL 6.60e-01 0.0564 0.128 0.103 CD8_Naive L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 79752 sc-eQTL 2.20e-01 0.141 0.115 0.103 CD8_Naive L2
ENSG00000287510 AL137857.1 66563 sc-eQTL 2.30e-01 -0.15 0.125 0.103 CD8_Naive L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -498532 sc-eQTL 3.75e-01 -0.139 0.156 0.097 CD8_TCM L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -498726 sc-eQTL 6.36e-01 -0.0677 0.143 0.097 CD8_TCM L2
ENSG00000134644 PUM1 -267735 sc-eQTL 8.27e-01 -0.0295 0.135 0.097 CD8_TCM L2
ENSG00000162511 LAPTM5 40482 sc-eQTL 2.29e-01 0.169 0.14 0.097 CD8_TCM L2
ENSG00000162517 PEF1 -846640 sc-eQTL 3.89e-01 0.124 0.144 0.097 CD8_TCM L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 79752 sc-eQTL 7.58e-02 0.231 0.129 0.097 CD8_TCM L2
ENSG00000287510 AL137857.1 66563 sc-eQTL 7.27e-01 -0.0461 0.132 0.097 CD8_TCM L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -498532 sc-eQTL 9.31e-01 0.0124 0.144 0.105 CD8_TEM L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -498726 sc-eQTL 4.14e-01 -0.113 0.138 0.105 CD8_TEM L2
ENSG00000134644 PUM1 -267735 sc-eQTL 8.42e-01 0.0282 0.141 0.105 CD8_TEM L2
ENSG00000162511 LAPTM5 40482 sc-eQTL 4.51e-01 0.0998 0.132 0.105 CD8_TEM L2
ENSG00000162517 PEF1 -846640 sc-eQTL 1.36e-01 0.186 0.124 0.105 CD8_TEM L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 79752 sc-eQTL 6.76e-01 0.0575 0.137 0.105 CD8_TEM L2
ENSG00000287510 AL137857.1 66563 sc-eQTL 9.25e-01 -0.0117 0.124 0.105 CD8_TEM L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -498532 sc-eQTL 6.12e-01 0.0762 0.15 0.104 MAIT L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -498726 sc-eQTL 1.85e-01 -0.176 0.132 0.104 MAIT L2
ENSG00000134644 PUM1 -267735 sc-eQTL 5.66e-01 0.0732 0.127 0.104 MAIT L2
ENSG00000162511 LAPTM5 40482 sc-eQTL 4.32e-01 0.0945 0.12 0.104 MAIT L2
ENSG00000162517 PEF1 -846640 sc-eQTL 5.88e-01 0.0716 0.132 0.104 MAIT L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 79752 sc-eQTL 4.41e-01 -0.103 0.134 0.104 MAIT L2
ENSG00000287510 AL137857.1 66563 sc-eQTL 7.18e-01 -0.0499 0.138 0.104 MAIT L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -498532 sc-eQTL 6.47e-01 0.0689 0.15 0.104 NK_CD56bright L2
ENSG00000121753 ADGRB2 -966637 sc-eQTL 9.83e-01 -0.00257 0.118 0.104 NK_CD56bright L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -498726 sc-eQTL 8.20e-01 0.029 0.127 0.104 NK_CD56bright L2
ENSG00000134644 PUM1 -267735 sc-eQTL 1.24e-01 0.204 0.132 0.104 NK_CD56bright L2
ENSG00000162511 LAPTM5 40482 sc-eQTL 7.21e-01 0.0469 0.131 0.104 NK_CD56bright L2
ENSG00000162517 PEF1 -846640 sc-eQTL 3.93e-01 -0.109 0.127 0.104 NK_CD56bright L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 79752 sc-eQTL 1.07e-02 0.335 0.13 0.104 NK_CD56bright L2
ENSG00000287510 AL137857.1 66563 sc-eQTL 7.40e-01 0.0432 0.13 0.104 NK_CD56bright L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -498532 sc-eQTL 1.38e-01 0.215 0.144 0.103 NK_CD56dim L2
ENSG00000121753 ADGRB2 -966637 sc-eQTL 9.92e-01 0.00122 0.127 0.103 NK_CD56dim L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -498726 sc-eQTL 6.93e-01 -0.0424 0.107 0.103 NK_CD56dim L2
ENSG00000134644 PUM1 -267735 sc-eQTL 9.16e-01 0.0116 0.11 0.103 NK_CD56dim L2
ENSG00000162511 LAPTM5 40482 sc-eQTL 8.68e-01 0.0195 0.117 0.103 NK_CD56dim L2
ENSG00000162517 PEF1 -846640 sc-eQTL 4.95e-01 0.0713 0.104 0.103 NK_CD56dim L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 79752 sc-eQTL 2.67e-02 0.324 0.145 0.103 NK_CD56dim L2
ENSG00000287510 AL137857.1 66563 sc-eQTL 6.53e-02 -0.223 0.12 0.103 NK_CD56dim L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -498532 sc-eQTL 9.47e-01 -0.01 0.149 0.105 NK_HLA L2
ENSG00000121753 ADGRB2 -966637 sc-eQTL 2.08e-01 0.149 0.118 0.105 NK_HLA L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -498726 sc-eQTL 5.94e-01 -0.0712 0.133 0.105 NK_HLA L2
ENSG00000134644 PUM1 -267735 sc-eQTL 8.56e-01 -0.0237 0.13 0.105 NK_HLA L2
ENSG00000162511 LAPTM5 40482 sc-eQTL 8.29e-01 -0.0268 0.124 0.105 NK_HLA L2
ENSG00000162517 PEF1 -846640 sc-eQTL 8.76e-01 -0.0217 0.14 0.105 NK_HLA L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 79752 sc-eQTL 6.57e-01 0.0586 0.132 0.105 NK_HLA L2
ENSG00000287510 AL137857.1 66563 sc-eQTL 4.04e-01 0.107 0.127 0.105 NK_HLA L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -498532 sc-eQTL 3.83e-01 0.123 0.141 0.103 NK_cytokine L2
ENSG00000121753 ADGRB2 -966637 sc-eQTL 7.29e-01 -0.0442 0.127 0.103 NK_cytokine L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -498726 sc-eQTL 7.55e-01 0.0344 0.11 0.103 NK_cytokine L2
ENSG00000134644 PUM1 -267735 sc-eQTL 6.27e-01 0.058 0.119 0.103 NK_cytokine L2
ENSG00000162511 LAPTM5 40482 sc-eQTL 9.63e-01 0.00602 0.131 0.103 NK_cytokine L2
ENSG00000162517 PEF1 -846640 sc-eQTL 8.07e-01 0.0273 0.112 0.103 NK_cytokine L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 79752 sc-eQTL 1.06e-01 0.224 0.138 0.103 NK_cytokine L2
ENSG00000287510 AL137857.1 66563 sc-eQTL 5.68e-01 0.0738 0.129 0.103 NK_cytokine L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -498532 sc-eQTL 3.04e-01 -0.181 0.176 0.107 PB L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -498726 sc-eQTL 3.81e-01 -0.18 0.204 0.107 PB L2
ENSG00000134644 PUM1 -267735 sc-eQTL 2.90e-01 0.188 0.177 0.107 PB L2
ENSG00000162510 MATN1 74671 sc-eQTL 4.73e-01 -0.119 0.165 0.107 PB L2
ENSG00000162511 LAPTM5 40482 sc-eQTL 9.26e-01 0.011 0.118 0.107 PB L2
ENSG00000162517 PEF1 -846640 sc-eQTL 5.61e-01 -0.106 0.182 0.107 PB L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 79752 sc-eQTL 5.25e-03 -0.446 0.157 0.107 PB L2
ENSG00000287510 AL137857.1 66563 sc-eQTL 3.55e-01 0.16 0.172 0.107 PB L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -498532 sc-eQTL 2.01e-01 -0.142 0.111 0.104 Pro_T L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -498726 sc-eQTL 3.10e-01 -0.143 0.141 0.104 Pro_T L2
ENSG00000134644 PUM1 -267735 sc-eQTL 7.22e-01 0.0469 0.132 0.104 Pro_T L2
ENSG00000162511 LAPTM5 40482 sc-eQTL 9.83e-01 -0.00202 0.0944 0.104 Pro_T L2
ENSG00000162517 PEF1 -846640 sc-eQTL 5.36e-01 -0.0858 0.138 0.104 Pro_T L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 79752 sc-eQTL 8.48e-01 0.0253 0.132 0.104 Pro_T L2
ENSG00000287510 AL137857.1 66563 sc-eQTL 1.83e-01 0.162 0.121 0.104 Pro_T L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -498532 sc-eQTL 7.50e-01 -0.0458 0.143 0.103 Treg L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -498726 sc-eQTL 1.87e-01 -0.183 0.138 0.103 Treg L2
ENSG00000134644 PUM1 -267735 sc-eQTL 6.91e-01 -0.0441 0.111 0.103 Treg L2
ENSG00000162511 LAPTM5 40482 sc-eQTL 5.18e-01 0.0822 0.127 0.103 Treg L2
ENSG00000162517 PEF1 -846640 sc-eQTL 4.53e-01 -0.103 0.137 0.103 Treg L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 79752 sc-eQTL 6.99e-02 -0.234 0.128 0.103 Treg L2
ENSG00000287510 AL137857.1 66563 sc-eQTL 9.72e-01 -0.00459 0.129 0.103 Treg L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -498532 sc-eQTL 8.10e-01 0.0346 0.143 0.107 cDC L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -498726 sc-eQTL 2.49e-01 -0.179 0.154 0.107 cDC L2
ENSG00000134644 PUM1 -267735 sc-eQTL 7.10e-01 -0.0495 0.133 0.107 cDC L2
ENSG00000162511 LAPTM5 40482 sc-eQTL 1.49e-01 0.135 0.0928 0.107 cDC L2
ENSG00000162517 PEF1 -846640 sc-eQTL 2.30e-01 -0.162 0.135 0.107 cDC L2
ENSG00000168528 SERINC2 -611309 sc-eQTL 1.95e-01 0.155 0.119 0.107 cDC L2
ENSG00000284543 LINC01226 -707970 sc-eQTL 4.53e-01 -0.0883 0.118 0.107 cDC L2
ENSG00000287510 AL137857.1 66563 sc-eQTL 7.51e-01 0.0403 0.127 0.107 cDC L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -498532 sc-eQTL 2.36e-01 0.139 0.117 0.103 cMono_IL1B L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -498726 sc-eQTL 5.26e-01 0.0829 0.13 0.103 cMono_IL1B L2
ENSG00000134644 PUM1 -267735 sc-eQTL 7.86e-01 -0.024 0.0883 0.103 cMono_IL1B L2
ENSG00000162511 LAPTM5 40482 sc-eQTL 5.31e-01 0.0487 0.0775 0.103 cMono_IL1B L2
ENSG00000162512 SDC3 -110502 sc-eQTL 4.30e-01 -0.115 0.146 0.103 cMono_IL1B L2
ENSG00000162517 PEF1 -846640 sc-eQTL 9.22e-01 0.0116 0.119 0.103 cMono_IL1B L2
ENSG00000168528 SERINC2 -611309 sc-eQTL 1.72e-01 0.202 0.147 0.103 cMono_IL1B L2
ENSG00000284543 LINC01226 -707970 sc-eQTL 7.87e-01 -0.0354 0.131 0.103 cMono_IL1B L2
ENSG00000287510 AL137857.1 66563 sc-eQTL 4.33e-01 0.0957 0.122 0.103 cMono_IL1B L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -498532 sc-eQTL 3.77e-01 0.111 0.125 0.103 cMono_S100A L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -498726 sc-eQTL 6.89e-01 -0.0594 0.148 0.103 cMono_S100A L2
ENSG00000134644 PUM1 -267735 sc-eQTL 6.64e-01 0.0465 0.107 0.103 cMono_S100A L2
ENSG00000162511 LAPTM5 40482 sc-eQTL 6.36e-01 0.039 0.0823 0.103 cMono_S100A L2
ENSG00000162512 SDC3 -110502 sc-eQTL 2.53e-01 -0.162 0.142 0.103 cMono_S100A L2
ENSG00000162517 PEF1 -846640 sc-eQTL 3.21e-01 0.127 0.128 0.103 cMono_S100A L2
ENSG00000168528 SERINC2 -611309 sc-eQTL 1.84e-01 0.2 0.15 0.103 cMono_S100A L2
ENSG00000284543 LINC01226 -707970 sc-eQTL 4.91e-01 -0.0843 0.122 0.103 cMono_S100A L2
ENSG00000287510 AL137857.1 66563 sc-eQTL 3.20e-01 0.122 0.123 0.103 cMono_S100A L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -498532 sc-eQTL 6.75e-01 -0.0739 0.176 0.103 gdT L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -498726 sc-eQTL 9.18e-01 0.0156 0.151 0.103 gdT L2
ENSG00000134644 PUM1 -267735 sc-eQTL 2.18e-01 0.192 0.155 0.103 gdT L2
ENSG00000162511 LAPTM5 40482 sc-eQTL 7.43e-02 0.301 0.168 0.103 gdT L2
ENSG00000162517 PEF1 -846640 sc-eQTL 7.22e-01 0.0552 0.155 0.103 gdT L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 79752 sc-eQTL 6.84e-01 0.0637 0.156 0.103 gdT L2
ENSG00000287510 AL137857.1 66563 sc-eQTL 7.36e-01 0.0511 0.151 0.103 gdT L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -498532 sc-eQTL 4.23e-01 0.111 0.139 0.098 intMono L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -498726 sc-eQTL 5.80e-01 0.0827 0.149 0.098 intMono L2
ENSG00000134644 PUM1 -267735 sc-eQTL 7.33e-01 0.0433 0.127 0.098 intMono L2
ENSG00000162511 LAPTM5 40482 sc-eQTL 4.68e-01 -0.0722 0.0992 0.098 intMono L2
ENSG00000162512 SDC3 -110502 sc-eQTL 4.81e-02 -0.268 0.135 0.098 intMono L2
ENSG00000162517 PEF1 -846640 sc-eQTL 8.80e-01 -0.0216 0.143 0.098 intMono L2
ENSG00000168528 SERINC2 -611309 sc-eQTL 4.08e-01 0.118 0.142 0.098 intMono L2
ENSG00000284543 LINC01226 -707970 sc-eQTL 8.40e-01 0.0273 0.135 0.098 intMono L2
ENSG00000287510 AL137857.1 66563 sc-eQTL 1.39e-01 -0.199 0.134 0.098 intMono L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -498532 sc-eQTL 2.50e-01 0.148 0.128 0.106 ncMono L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -498726 sc-eQTL 7.69e-01 -0.0402 0.137 0.106 ncMono L2
ENSG00000134644 PUM1 -267735 sc-eQTL 1.70e-01 0.153 0.111 0.106 ncMono L2
ENSG00000162511 LAPTM5 40482 sc-eQTL 8.83e-01 -0.015 0.102 0.106 ncMono L2
ENSG00000162512 SDC3 -110502 sc-eQTL 9.11e-01 0.0127 0.114 0.106 ncMono L2
ENSG00000162517 PEF1 -846640 sc-eQTL 3.39e-01 -0.125 0.13 0.106 ncMono L2
ENSG00000168528 SERINC2 -611309 sc-eQTL 5.66e-01 -0.0715 0.124 0.106 ncMono L2
ENSG00000284543 LINC01226 -707970 sc-eQTL 1.84e-01 0.165 0.124 0.106 ncMono L2
ENSG00000287510 AL137857.1 66563 sc-eQTL 8.41e-01 -0.0259 0.129 0.106 ncMono L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -498532 sc-eQTL 3.59e-01 0.131 0.142 0.107 pDC L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -498726 sc-eQTL 9.89e-01 -0.0021 0.156 0.107 pDC L2
ENSG00000134644 PUM1 -267735 sc-eQTL 8.44e-01 -0.0255 0.13 0.107 pDC L2
ENSG00000162511 LAPTM5 40482 sc-eQTL 8.87e-01 0.0172 0.121 0.107 pDC L2
ENSG00000162517 PEF1 -846640 sc-eQTL 8.33e-01 -0.0331 0.156 0.107 pDC L2
ENSG00000168528 SERINC2 -611309 sc-eQTL 2.14e-01 0.182 0.145 0.107 pDC L2
ENSG00000284543 LINC01226 -707970 sc-eQTL 2.86e-01 -0.121 0.113 0.107 pDC L2
ENSG00000287510 AL137857.1 66563 sc-eQTL 7.39e-01 0.0445 0.133 0.107 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000060688 SNRNP40 -498532 sc-eQTL 6.44e-01 -0.0687 0.149 0.103 B_Memory LOneK1K
ENSG00000121766 ZCCHC17 -498726 sc-eQTL 8.09e-01 -0.0299 0.124 0.103 B_Memory LOneK1K
ENSG00000134644 PUM1 -267735 sc-eQTL 2.21e-01 0.134 0.109 0.103 B_Memory LOneK1K
ENSG00000162510 MATN1 74671 sc-eQTL 7.83e-01 0.0344 0.125 0.103 B_Memory LOneK1K
ENSG00000162511 LAPTM5 40482 sc-eQTL 2.45e-01 0.0913 0.0783 0.103 B_Memory LOneK1K
ENSG00000162517 PEF1 -846640 sc-eQTL 9.87e-01 -0.00205 0.13 0.103 B_Memory LOneK1K
ENSG00000186056 MATN1-AS1 79752 sc-eQTL 9.05e-01 0.0125 0.104 0.103 B_Memory LOneK1K
ENSG00000287510 AL137857.1 66563 sc-eQTL 3.47e-01 0.107 0.113 0.103 B_Memory LOneK1K
ENSG00000060688 SNRNP40 -498532 sc-eQTL 5.85e-01 0.0725 0.133 0.103 B_Naive LOneK1K
ENSG00000121766 ZCCHC17 -498726 sc-eQTL 2.38e-01 -0.124 0.105 0.103 B_Naive LOneK1K
ENSG00000134644 PUM1 -267735 sc-eQTL 5.29e-01 0.0625 0.0993 0.103 B_Naive LOneK1K
ENSG00000162510 MATN1 74671 sc-eQTL 4.45e-01 0.0731 0.0955 0.103 B_Naive LOneK1K
ENSG00000162511 LAPTM5 40482 sc-eQTL 3.92e-01 0.0576 0.0672 0.103 B_Naive LOneK1K
ENSG00000162517 PEF1 -846640 sc-eQTL 2.90e-01 -0.13 0.123 0.103 B_Naive LOneK1K
ENSG00000186056 MATN1-AS1 79752 sc-eQTL 8.96e-01 0.0113 0.087 0.103 B_Naive LOneK1K
ENSG00000287510 AL137857.1 66563 sc-eQTL 9.81e-01 -0.00249 0.103 0.103 B_Naive LOneK1K
ENSG00000060688 SNRNP40 -498532 sc-eQTL 2.26e-01 0.136 0.112 0.103 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000121766 ZCCHC17 -498726 sc-eQTL 8.36e-01 0.0262 0.127 0.103 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000134644 PUM1 -267735 sc-eQTL 7.07e-01 0.0304 0.0809 0.103 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000162511 LAPTM5 40482 sc-eQTL 7.83e-01 0.0196 0.0711 0.103 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000162512 SDC3 -110502 sc-eQTL 2.27e-01 -0.175 0.145 0.103 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000162517 PEF1 -846640 sc-eQTL 3.13e-01 0.103 0.102 0.103 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000168528 SERINC2 -611309 sc-eQTL 1.82e-01 0.199 0.149 0.103 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000284543 LINC01226 -707970 sc-eQTL 4.45e-01 -0.0936 0.122 0.103 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000287510 AL137857.1 66563 sc-eQTL 4.94e-01 0.0785 0.114 0.103 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000060688 SNRNP40 -498532 sc-eQTL 9.69e-02 0.205 0.123 0.103 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000121766 ZCCHC17 -498726 sc-eQTL 5.61e-01 -0.0787 0.135 0.103 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000134644 PUM1 -267735 sc-eQTL 3.02e-01 0.114 0.111 0.103 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000162511 LAPTM5 40482 sc-eQTL 9.50e-01 -0.00562 0.0887 0.103 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000162512 SDC3 -110502 sc-eQTL 3.18e-01 -0.129 0.129 0.103 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000162517 PEF1 -846640 sc-eQTL 2.60e-01 -0.133 0.117 0.103 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000168528 SERINC2 -611309 sc-eQTL 6.53e-01 0.0605 0.134 0.103 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000284543 LINC01226 -707970 sc-eQTL 3.58e-01 0.117 0.127 0.103 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000287510 AL137857.1 66563 sc-eQTL 4.33e-01 -0.1 0.127 0.103 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000060688 SNRNP40 -498532 sc-eQTL 1.50e-01 0.198 0.137 0.103 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000121753 ADGRB2 -966637 sc-eQTL 9.88e-01 -0.00177 0.117 0.103 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000121766 ZCCHC17 -498726 sc-eQTL 9.80e-01 -0.00238 0.0941 0.103 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000134644 PUM1 -267735 sc-eQTL 8.97e-01 0.0133 0.103 0.103 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000162511 LAPTM5 40482 sc-eQTL 7.48e-01 0.037 0.115 0.103 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000162517 PEF1 -846640 sc-eQTL 8.75e-01 -0.0138 0.0875 0.103 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000186056 MATN1-AS1 79752 sc-eQTL 2.95e-03 0.391 0.13 0.103 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000287510 AL137857.1 66563 sc-eQTL 4.18e-01 -0.093 0.115 0.103 NK_CD56dim LOneK1K

Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF
ENSG00000162511 LAPTM5 40482 eQTL 0.0268 -0.0395 0.0178 0.0 0.0 0.0873
ENSG00000162512 SDC3 -110502 eQTL 0.0083 -0.116 0.0439 0.00497 0.0 0.0873

Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina
ENSG00000162512 SDC3 -110502 4.57e-06 5.06e-06 5.55e-07 2.56e-06 8.52e-07 1.49e-06 4.29e-06 9.98e-07 4.13e-06 1.94e-06 4.96e-06 3.29e-06 7.38e-06 2.4e-06 1.3e-06 2.35e-06 2.06e-06 2.75e-06 1.44e-06 1.05e-06 1.81e-06 3.91e-06 3.42e-06 1.78e-06 5.75e-06 1.29e-06 2.15e-06 1.49e-06 4.38e-06 3.8e-06 2.53e-06 4.51e-07 6.09e-07 1.83e-06 2.15e-06 9.06e-07 8.74e-07 4.68e-07 1.32e-06 3.64e-07 3.05e-07 5.71e-06 3.82e-07 1.81e-07 3.44e-07 3.21e-07 8.94e-07 2.62e-07 2.41e-07