logo

Genes within 1Mb (chr1:30797599:C:T):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD

Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000060688 SNRNP40 -499189 sc-eQTL 4.09e-01 0.119 0.144 0.071 B L1
ENSG00000121766 ZCCHC17 -499383 sc-eQTL 6.12e-01 0.0588 0.116 0.071 B L1
ENSG00000134644 PUM1 -268392 sc-eQTL 7.55e-02 0.172 0.0964 0.071 B L1
ENSG00000162510 MATN1 74014 sc-eQTL 3.40e-01 0.0974 0.102 0.071 B L1
ENSG00000162511 LAPTM5 39825 sc-eQTL 3.06e-01 -0.0819 0.0798 0.071 B L1
ENSG00000162517 PEF1 -847297 sc-eQTL 4.98e-01 0.0818 0.121 0.071 B L1
ENSG00000186056 MATN1-AS1 79095 sc-eQTL 3.95e-02 -0.192 0.0928 0.071 B L1
ENSG00000287510 AL137857.1 65906 sc-eQTL 3.44e-01 0.105 0.111 0.071 B L1
ENSG00000060688 SNRNP40 -499189 sc-eQTL 1.98e-01 0.158 0.122 0.071 CD4T L1
ENSG00000121766 ZCCHC17 -499383 sc-eQTL 4.06e-01 -0.0795 0.0956 0.071 CD4T L1
ENSG00000134644 PUM1 -268392 sc-eQTL 6.45e-01 0.0393 0.0852 0.071 CD4T L1
ENSG00000162511 LAPTM5 39825 sc-eQTL 1.51e-01 -0.135 0.094 0.071 CD4T L1
ENSG00000162517 PEF1 -847297 sc-eQTL 2.18e-02 0.225 0.0975 0.071 CD4T L1
ENSG00000186056 MATN1-AS1 79095 sc-eQTL 9.14e-01 0.00911 0.0845 0.071 CD4T L1
ENSG00000287510 AL137857.1 65906 sc-eQTL 6.82e-01 -0.0416 0.101 0.071 CD4T L1
ENSG00000060688 SNRNP40 -499189 sc-eQTL 8.22e-01 0.036 0.16 0.071 CD8T L1
ENSG00000121766 ZCCHC17 -499383 sc-eQTL 4.11e-01 -0.0875 0.106 0.071 CD8T L1
ENSG00000134644 PUM1 -268392 sc-eQTL 2.97e-01 -0.0976 0.0933 0.071 CD8T L1
ENSG00000162511 LAPTM5 39825 sc-eQTL 9.84e-02 -0.15 0.0903 0.071 CD8T L1
ENSG00000162517 PEF1 -847297 sc-eQTL 1.29e-01 0.17 0.111 0.071 CD8T L1
ENSG00000186056 MATN1-AS1 79095 sc-eQTL 4.71e-01 -0.0768 0.106 0.071 CD8T L1
ENSG00000287510 AL137857.1 65906 sc-eQTL 4.63e-01 0.0982 0.134 0.071 CD8T L1
ENSG00000060688 SNRNP40 -499189 sc-eQTL 4.02e-02 -0.287 0.139 0.072 DC L1
ENSG00000121766 ZCCHC17 -499383 sc-eQTL 9.75e-01 0.00521 0.166 0.072 DC L1
ENSG00000134644 PUM1 -268392 sc-eQTL 7.36e-01 -0.044 0.13 0.072 DC L1
ENSG00000162511 LAPTM5 39825 sc-eQTL 4.93e-01 0.0639 0.0929 0.072 DC L1
ENSG00000162517 PEF1 -847297 sc-eQTL 6.94e-01 -0.0595 0.151 0.072 DC L1
ENSG00000168528 SERINC2 -611966 sc-eQTL 2.38e-01 0.181 0.153 0.072 DC L1
ENSG00000284543 LINC01226 -708627 sc-eQTL 7.27e-01 -0.0355 0.102 0.072 DC L1
ENSG00000287510 AL137857.1 65906 sc-eQTL 7.45e-01 0.048 0.147 0.072 DC L1
ENSG00000060688 SNRNP40 -499189 sc-eQTL 9.35e-01 -0.00899 0.111 0.071 Mono L1
ENSG00000121766 ZCCHC17 -499383 sc-eQTL 4.89e-01 0.0949 0.137 0.071 Mono L1
ENSG00000134644 PUM1 -268392 sc-eQTL 6.64e-02 0.161 0.0873 0.071 Mono L1
ENSG00000162511 LAPTM5 39825 sc-eQTL 5.97e-01 0.0429 0.0808 0.071 Mono L1
ENSG00000162512 SDC3 -111159 sc-eQTL 1.70e-01 0.213 0.155 0.071 Mono L1
ENSG00000162517 PEF1 -847297 sc-eQTL 6.70e-01 0.0465 0.109 0.071 Mono L1
ENSG00000168528 SERINC2 -611966 sc-eQTL 4.42e-01 0.128 0.167 0.071 Mono L1
ENSG00000284543 LINC01226 -708627 sc-eQTL 5.71e-01 0.0833 0.147 0.071 Mono L1
ENSG00000287510 AL137857.1 65906 sc-eQTL 2.71e-01 0.141 0.128 0.071 Mono L1
ENSG00000060688 SNRNP40 -499189 sc-eQTL 5.82e-02 0.295 0.155 0.071 NK L1
ENSG00000121753 ADGRB2 -967294 sc-eQTL 8.19e-01 0.0308 0.134 0.071 NK L1
ENSG00000121766 ZCCHC17 -499383 sc-eQTL 4.42e-01 -0.0822 0.107 0.071 NK L1
ENSG00000134644 PUM1 -268392 sc-eQTL 8.20e-01 0.0256 0.112 0.071 NK L1
ENSG00000162511 LAPTM5 39825 sc-eQTL 5.75e-03 -0.354 0.127 0.071 NK L1
ENSG00000162517 PEF1 -847297 sc-eQTL 4.01e-01 0.0792 0.0941 0.071 NK L1
ENSG00000186056 MATN1-AS1 79095 sc-eQTL 2.32e-01 -0.173 0.145 0.071 NK L1
ENSG00000287510 AL137857.1 65906 sc-eQTL 7.40e-01 0.0446 0.134 0.071 NK L1
ENSG00000060688 SNRNP40 -499189 sc-eQTL 4.33e-01 0.0914 0.116 0.071 Other_T L1
ENSG00000121766 ZCCHC17 -499383 sc-eQTL 2.31e-01 -0.149 0.124 0.071 Other_T L1
ENSG00000134644 PUM1 -268392 sc-eQTL 7.65e-02 -0.198 0.111 0.071 Other_T L1
ENSG00000162511 LAPTM5 39825 sc-eQTL 7.74e-01 -0.0264 0.0919 0.071 Other_T L1
ENSG00000162517 PEF1 -847297 sc-eQTL 9.15e-01 0.0131 0.123 0.071 Other_T L1
ENSG00000186056 MATN1-AS1 79095 sc-eQTL 2.60e-01 0.17 0.15 0.071 Other_T L1
ENSG00000287510 AL137857.1 65906 sc-eQTL 4.70e-01 0.113 0.157 0.071 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000060688 SNRNP40 -499189 sc-eQTL 4.13e-02 -0.397 0.193 0.069 B_Activated L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -499383 sc-eQTL 4.60e-01 -0.146 0.197 0.069 B_Activated L2
ENSG00000134644 PUM1 -268392 sc-eQTL 5.27e-01 -0.116 0.183 0.069 B_Activated L2
ENSG00000162510 MATN1 74014 sc-eQTL 5.62e-01 0.093 0.16 0.069 B_Activated L2
ENSG00000162511 LAPTM5 39825 sc-eQTL 6.60e-01 0.0492 0.112 0.069 B_Activated L2
ENSG00000162517 PEF1 -847297 sc-eQTL 7.29e-01 -0.0658 0.19 0.069 B_Activated L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 79095 sc-eQTL 7.16e-01 0.0657 0.18 0.069 B_Activated L2
ENSG00000287510 AL137857.1 65906 sc-eQTL 8.74e-01 -0.0253 0.16 0.069 B_Activated L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -499189 sc-eQTL 2.47e-01 0.201 0.173 0.071 B_Intermediate L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -499383 sc-eQTL 4.05e-01 -0.121 0.145 0.071 B_Intermediate L2
ENSG00000134644 PUM1 -268392 sc-eQTL 6.77e-02 0.249 0.135 0.071 B_Intermediate L2
ENSG00000162510 MATN1 74014 sc-eQTL 1.32e-01 0.214 0.141 0.071 B_Intermediate L2
ENSG00000162511 LAPTM5 39825 sc-eQTL 9.48e-01 0.00566 0.0873 0.071 B_Intermediate L2
ENSG00000162517 PEF1 -847297 sc-eQTL 1.56e-01 0.23 0.161 0.071 B_Intermediate L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 79095 sc-eQTL 1.56e-01 -0.174 0.122 0.071 B_Intermediate L2
ENSG00000287510 AL137857.1 65906 sc-eQTL 7.09e-01 -0.0512 0.137 0.071 B_Intermediate L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -499189 sc-eQTL 3.45e-01 0.16 0.169 0.071 B_Memory L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -499383 sc-eQTL 5.71e-01 -0.0887 0.156 0.071 B_Memory L2
ENSG00000134644 PUM1 -268392 sc-eQTL 2.79e-01 0.147 0.136 0.071 B_Memory L2
ENSG00000162510 MATN1 74014 sc-eQTL 6.39e-01 0.0611 0.13 0.071 B_Memory L2
ENSG00000162511 LAPTM5 39825 sc-eQTL 1.26e-02 -0.286 0.114 0.071 B_Memory L2
ENSG00000162517 PEF1 -847297 sc-eQTL 1.70e-01 0.211 0.153 0.071 B_Memory L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 79095 sc-eQTL 2.60e-01 0.148 0.132 0.071 B_Memory L2
ENSG00000287510 AL137857.1 65906 sc-eQTL 9.31e-01 0.0135 0.155 0.071 B_Memory L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -499189 sc-eQTL 5.71e-01 0.0881 0.155 0.071 B_Naive1 L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -499383 sc-eQTL 2.92e-01 -0.141 0.134 0.071 B_Naive1 L2
ENSG00000134644 PUM1 -268392 sc-eQTL 3.01e-01 0.122 0.118 0.071 B_Naive1 L2
ENSG00000162510 MATN1 74014 sc-eQTL 3.96e-01 0.102 0.12 0.071 B_Naive1 L2
ENSG00000162511 LAPTM5 39825 sc-eQTL 6.28e-01 0.0389 0.0801 0.071 B_Naive1 L2
ENSG00000162517 PEF1 -847297 sc-eQTL 9.96e-01 -0.000737 0.141 0.071 B_Naive1 L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 79095 sc-eQTL 4.99e-02 -0.206 0.104 0.071 B_Naive1 L2
ENSG00000287510 AL137857.1 65906 sc-eQTL 3.22e-02 0.277 0.129 0.071 B_Naive1 L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -499189 sc-eQTL 7.09e-01 -0.062 0.166 0.071 B_Naive2 L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -499383 sc-eQTL 1.90e-02 0.319 0.135 0.071 B_Naive2 L2
ENSG00000134644 PUM1 -268392 sc-eQTL 8.85e-01 0.0195 0.134 0.071 B_Naive2 L2
ENSG00000162510 MATN1 74014 sc-eQTL 5.18e-01 0.0832 0.128 0.071 B_Naive2 L2
ENSG00000162511 LAPTM5 39825 sc-eQTL 8.02e-01 0.022 0.0873 0.071 B_Naive2 L2
ENSG00000162517 PEF1 -847297 sc-eQTL 9.80e-01 0.00392 0.159 0.071 B_Naive2 L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 79095 sc-eQTL 9.67e-01 -0.00533 0.127 0.071 B_Naive2 L2
ENSG00000287510 AL137857.1 65906 sc-eQTL 6.84e-01 0.0559 0.137 0.071 B_Naive2 L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -499189 sc-eQTL 2.49e-01 0.19 0.164 0.075 CD4_CTL L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -499383 sc-eQTL 4.27e-01 -0.129 0.162 0.075 CD4_CTL L2
ENSG00000134644 PUM1 -268392 sc-eQTL 1.37e-01 -0.236 0.158 0.075 CD4_CTL L2
ENSG00000162511 LAPTM5 39825 sc-eQTL 4.13e-01 -0.116 0.142 0.075 CD4_CTL L2
ENSG00000162517 PEF1 -847297 sc-eQTL 9.23e-01 -0.014 0.145 0.075 CD4_CTL L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 79095 sc-eQTL 5.62e-01 0.09 0.155 0.075 CD4_CTL L2
ENSG00000287510 AL137857.1 65906 sc-eQTL 7.28e-01 -0.0477 0.137 0.075 CD4_CTL L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -499189 sc-eQTL 5.31e-01 0.08 0.128 0.071 CD4_Naive L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -499383 sc-eQTL 6.25e-01 -0.0553 0.113 0.071 CD4_Naive L2
ENSG00000134644 PUM1 -268392 sc-eQTL 3.26e-01 0.0887 0.0902 0.071 CD4_Naive L2
ENSG00000162511 LAPTM5 39825 sc-eQTL 9.15e-01 -0.0103 0.0968 0.071 CD4_Naive L2
ENSG00000162517 PEF1 -847297 sc-eQTL 2.41e-02 0.238 0.105 0.071 CD4_Naive L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 79095 sc-eQTL 9.89e-01 0.00133 0.0982 0.071 CD4_Naive L2
ENSG00000287510 AL137857.1 65906 sc-eQTL 3.86e-01 -0.0979 0.113 0.071 CD4_Naive L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -499189 sc-eQTL 7.67e-01 0.0478 0.161 0.071 CD4_TCM L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -499383 sc-eQTL 9.62e-01 -0.00622 0.13 0.071 CD4_TCM L2
ENSG00000134644 PUM1 -268392 sc-eQTL 8.67e-01 -0.0192 0.115 0.071 CD4_TCM L2
ENSG00000162511 LAPTM5 39825 sc-eQTL 1.50e-02 -0.231 0.094 0.071 CD4_TCM L2
ENSG00000162517 PEF1 -847297 sc-eQTL 2.97e-01 0.133 0.127 0.071 CD4_TCM L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 79095 sc-eQTL 5.14e-01 -0.0791 0.121 0.071 CD4_TCM L2
ENSG00000287510 AL137857.1 65906 sc-eQTL 4.79e-01 0.0954 0.135 0.071 CD4_TCM L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -499189 sc-eQTL 5.54e-01 0.0937 0.158 0.071 CD4_TEM L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -499383 sc-eQTL 3.20e-01 -0.15 0.151 0.071 CD4_TEM L2
ENSG00000134644 PUM1 -268392 sc-eQTL 4.34e-01 0.0986 0.126 0.071 CD4_TEM L2
ENSG00000162511 LAPTM5 39825 sc-eQTL 3.87e-02 -0.262 0.126 0.071 CD4_TEM L2
ENSG00000162517 PEF1 -847297 sc-eQTL 8.35e-01 -0.0297 0.143 0.071 CD4_TEM L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 79095 sc-eQTL 2.83e-01 0.16 0.148 0.071 CD4_TEM L2
ENSG00000287510 AL137857.1 65906 sc-eQTL 4.15e-01 -0.12 0.146 0.071 CD4_TEM L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -499189 sc-eQTL 8.99e-01 -0.0232 0.182 0.071 CD8_CTL L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -499383 sc-eQTL 9.10e-01 0.0158 0.14 0.071 CD8_CTL L2
ENSG00000134644 PUM1 -268392 sc-eQTL 5.69e-01 0.0774 0.136 0.071 CD8_CTL L2
ENSG00000162511 LAPTM5 39825 sc-eQTL 3.44e-01 -0.142 0.15 0.071 CD8_CTL L2
ENSG00000162517 PEF1 -847297 sc-eQTL 3.12e-01 -0.132 0.131 0.071 CD8_CTL L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 79095 sc-eQTL 8.43e-01 0.0314 0.158 0.071 CD8_CTL L2
ENSG00000287510 AL137857.1 65906 sc-eQTL 9.79e-02 0.245 0.148 0.071 CD8_CTL L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -499189 sc-eQTL 9.80e-01 -0.00399 0.158 0.071 CD8_Naive L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -499383 sc-eQTL 7.60e-01 0.0415 0.136 0.071 CD8_Naive L2
ENSG00000134644 PUM1 -268392 sc-eQTL 1.52e-01 -0.157 0.109 0.071 CD8_Naive L2
ENSG00000162511 LAPTM5 39825 sc-eQTL 3.58e-01 -0.0965 0.105 0.071 CD8_Naive L2
ENSG00000162517 PEF1 -847297 sc-eQTL 1.40e-01 0.215 0.145 0.071 CD8_Naive L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 79095 sc-eQTL 3.65e-02 -0.273 0.13 0.071 CD8_Naive L2
ENSG00000287510 AL137857.1 65906 sc-eQTL 7.12e-01 0.0527 0.143 0.071 CD8_Naive L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -499189 sc-eQTL 7.67e-01 -0.0518 0.174 0.072 CD8_TCM L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -499383 sc-eQTL 7.06e-01 -0.0604 0.16 0.072 CD8_TCM L2
ENSG00000134644 PUM1 -268392 sc-eQTL 2.67e-01 -0.167 0.15 0.072 CD8_TCM L2
ENSG00000162511 LAPTM5 39825 sc-eQTL 7.36e-01 -0.0532 0.157 0.072 CD8_TCM L2
ENSG00000162517 PEF1 -847297 sc-eQTL 1.14e-01 0.254 0.16 0.072 CD8_TCM L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 79095 sc-eQTL 3.05e-01 0.149 0.145 0.072 CD8_TCM L2
ENSG00000287510 AL137857.1 65906 sc-eQTL 6.55e-01 -0.0658 0.147 0.072 CD8_TCM L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -499189 sc-eQTL 7.98e-01 -0.0454 0.177 0.071 CD8_TEM L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -499383 sc-eQTL 2.63e-01 -0.19 0.169 0.071 CD8_TEM L2
ENSG00000134644 PUM1 -268392 sc-eQTL 6.49e-01 0.0788 0.173 0.071 CD8_TEM L2
ENSG00000162511 LAPTM5 39825 sc-eQTL 7.81e-01 -0.0453 0.163 0.071 CD8_TEM L2
ENSG00000162517 PEF1 -847297 sc-eQTL 2.12e-01 0.191 0.153 0.071 CD8_TEM L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 79095 sc-eQTL 2.50e-01 -0.194 0.168 0.071 CD8_TEM L2
ENSG00000287510 AL137857.1 65906 sc-eQTL 1.73e-01 0.208 0.152 0.071 CD8_TEM L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -499189 sc-eQTL 8.79e-01 -0.026 0.17 0.071 MAIT L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -499383 sc-eQTL 1.05e-01 -0.244 0.15 0.071 MAIT L2
ENSG00000134644 PUM1 -268392 sc-eQTL 7.37e-02 -0.258 0.144 0.071 MAIT L2
ENSG00000162511 LAPTM5 39825 sc-eQTL 9.87e-01 0.00227 0.137 0.071 MAIT L2
ENSG00000162517 PEF1 -847297 sc-eQTL 9.71e-01 0.00542 0.15 0.071 MAIT L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 79095 sc-eQTL 9.64e-02 0.252 0.151 0.071 MAIT L2
ENSG00000287510 AL137857.1 65906 sc-eQTL 7.49e-01 0.0503 0.157 0.071 MAIT L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -499189 sc-eQTL 3.70e-01 -0.156 0.173 0.073 NK_CD56bright L2
ENSG00000121753 ADGRB2 -967294 sc-eQTL 5.12e-01 -0.0892 0.136 0.073 NK_CD56bright L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -499383 sc-eQTL 7.75e-01 -0.042 0.147 0.073 NK_CD56bright L2
ENSG00000134644 PUM1 -268392 sc-eQTL 2.30e-01 0.185 0.154 0.073 NK_CD56bright L2
ENSG00000162511 LAPTM5 39825 sc-eQTL 2.22e-01 -0.186 0.151 0.073 NK_CD56bright L2
ENSG00000162517 PEF1 -847297 sc-eQTL 2.89e-01 0.157 0.147 0.073 NK_CD56bright L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 79095 sc-eQTL 3.14e-01 0.154 0.152 0.073 NK_CD56bright L2
ENSG00000287510 AL137857.1 65906 sc-eQTL 8.58e-01 -0.027 0.151 0.073 NK_CD56bright L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -499189 sc-eQTL 1.56e-01 0.234 0.164 0.071 NK_CD56dim L2
ENSG00000121753 ADGRB2 -967294 sc-eQTL 1.44e-01 0.212 0.145 0.071 NK_CD56dim L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -499383 sc-eQTL 7.09e-01 -0.0456 0.122 0.071 NK_CD56dim L2
ENSG00000134644 PUM1 -268392 sc-eQTL 6.12e-01 0.0637 0.125 0.071 NK_CD56dim L2
ENSG00000162511 LAPTM5 39825 sc-eQTL 2.14e-02 -0.306 0.132 0.071 NK_CD56dim L2
ENSG00000162517 PEF1 -847297 sc-eQTL 7.09e-01 0.0444 0.119 0.071 NK_CD56dim L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 79095 sc-eQTL 1.69e-01 -0.23 0.167 0.071 NK_CD56dim L2
ENSG00000287510 AL137857.1 65906 sc-eQTL 7.01e-01 0.0531 0.138 0.071 NK_CD56dim L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -499189 sc-eQTL 4.82e-01 0.132 0.187 0.059 NK_HLA L2
ENSG00000121753 ADGRB2 -967294 sc-eQTL 7.94e-01 -0.039 0.149 0.059 NK_HLA L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -499383 sc-eQTL 1.59e-01 -0.236 0.167 0.059 NK_HLA L2
ENSG00000134644 PUM1 -268392 sc-eQTL 5.15e-01 -0.106 0.163 0.059 NK_HLA L2
ENSG00000162511 LAPTM5 39825 sc-eQTL 2.01e-02 -0.36 0.154 0.059 NK_HLA L2
ENSG00000162517 PEF1 -847297 sc-eQTL 8.32e-01 0.0373 0.176 0.059 NK_HLA L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 79095 sc-eQTL 6.80e-02 -0.302 0.164 0.059 NK_HLA L2
ENSG00000287510 AL137857.1 65906 sc-eQTL 3.26e-01 0.157 0.16 0.059 NK_HLA L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -499189 sc-eQTL 1.28e-01 0.246 0.161 0.071 NK_cytokine L2
ENSG00000121753 ADGRB2 -967294 sc-eQTL 1.06e-01 -0.235 0.145 0.071 NK_cytokine L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -499383 sc-eQTL 3.96e-01 -0.107 0.126 0.071 NK_cytokine L2
ENSG00000134644 PUM1 -268392 sc-eQTL 6.51e-01 -0.0619 0.136 0.071 NK_cytokine L2
ENSG00000162511 LAPTM5 39825 sc-eQTL 1.41e-01 -0.221 0.149 0.071 NK_cytokine L2
ENSG00000162517 PEF1 -847297 sc-eQTL 5.73e-01 0.0721 0.128 0.071 NK_cytokine L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 79095 sc-eQTL 9.18e-01 -0.0164 0.159 0.071 NK_cytokine L2
ENSG00000287510 AL137857.1 65906 sc-eQTL 4.76e-01 0.106 0.148 0.071 NK_cytokine L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -499189 sc-eQTL 2.23e-01 0.247 0.202 0.07 PB L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -499383 sc-eQTL 2.88e-01 0.25 0.234 0.07 PB L2
ENSG00000134644 PUM1 -268392 sc-eQTL 8.78e-02 -0.348 0.202 0.07 PB L2
ENSG00000162510 MATN1 74014 sc-eQTL 5.80e-01 -0.106 0.191 0.07 PB L2
ENSG00000162511 LAPTM5 39825 sc-eQTL 8.32e-01 -0.0289 0.136 0.07 PB L2
ENSG00000162517 PEF1 -847297 sc-eQTL 6.13e-01 0.106 0.21 0.07 PB L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 79095 sc-eQTL 3.12e-01 -0.189 0.186 0.07 PB L2
ENSG00000287510 AL137857.1 65906 sc-eQTL 7.33e-01 0.0678 0.198 0.07 PB L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -499189 sc-eQTL 7.46e-01 -0.041 0.126 0.07 Pro_T L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -499383 sc-eQTL 7.69e-01 0.0471 0.161 0.07 Pro_T L2
ENSG00000134644 PUM1 -268392 sc-eQTL 2.91e-01 -0.158 0.149 0.07 Pro_T L2
ENSG00000162511 LAPTM5 39825 sc-eQTL 9.22e-02 -0.181 0.107 0.07 Pro_T L2
ENSG00000162517 PEF1 -847297 sc-eQTL 3.98e-01 0.133 0.157 0.07 Pro_T L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 79095 sc-eQTL 7.36e-01 0.0508 0.15 0.07 Pro_T L2
ENSG00000287510 AL137857.1 65906 sc-eQTL 3.98e-01 0.117 0.138 0.07 Pro_T L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -499189 sc-eQTL 4.07e-01 0.136 0.163 0.071 Treg L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -499383 sc-eQTL 5.48e-01 -0.0951 0.158 0.071 Treg L2
ENSG00000134644 PUM1 -268392 sc-eQTL 4.66e-01 0.0923 0.126 0.071 Treg L2
ENSG00000162511 LAPTM5 39825 sc-eQTL 2.51e-01 -0.166 0.145 0.071 Treg L2
ENSG00000162517 PEF1 -847297 sc-eQTL 2.34e-01 0.186 0.156 0.071 Treg L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 79095 sc-eQTL 4.96e-01 -0.101 0.148 0.071 Treg L2
ENSG00000287510 AL137857.1 65906 sc-eQTL 1.61e-01 0.207 0.147 0.071 Treg L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -499189 sc-eQTL 1.51e-02 -0.388 0.158 0.076 cDC L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -499383 sc-eQTL 3.89e-01 0.15 0.173 0.076 cDC L2
ENSG00000134644 PUM1 -268392 sc-eQTL 8.95e-01 -0.0198 0.149 0.076 cDC L2
ENSG00000162511 LAPTM5 39825 sc-eQTL 9.13e-01 0.0114 0.105 0.076 cDC L2
ENSG00000162517 PEF1 -847297 sc-eQTL 7.91e-01 -0.0402 0.152 0.076 cDC L2
ENSG00000168528 SERINC2 -611966 sc-eQTL 2.37e-01 0.159 0.134 0.076 cDC L2
ENSG00000284543 LINC01226 -708627 sc-eQTL 5.49e-01 0.0792 0.132 0.076 cDC L2
ENSG00000287510 AL137857.1 65906 sc-eQTL 9.71e-01 0.00524 0.142 0.076 cDC L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -499189 sc-eQTL 7.41e-01 0.0439 0.132 0.071 cMono_IL1B L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -499383 sc-eQTL 3.65e-01 0.134 0.147 0.071 cMono_IL1B L2
ENSG00000134644 PUM1 -268392 sc-eQTL 2.03e-02 0.231 0.0987 0.071 cMono_IL1B L2
ENSG00000162511 LAPTM5 39825 sc-eQTL 6.14e-01 0.0443 0.0877 0.071 cMono_IL1B L2
ENSG00000162512 SDC3 -111159 sc-eQTL 1.38e-01 0.245 0.164 0.071 cMono_IL1B L2
ENSG00000162517 PEF1 -847297 sc-eQTL 1.41e-01 0.199 0.134 0.071 cMono_IL1B L2
ENSG00000168528 SERINC2 -611966 sc-eQTL 5.38e-01 0.103 0.167 0.071 cMono_IL1B L2
ENSG00000284543 LINC01226 -708627 sc-eQTL 9.03e-01 0.0181 0.148 0.071 cMono_IL1B L2
ENSG00000287510 AL137857.1 65906 sc-eQTL 1.23e-01 0.212 0.137 0.071 cMono_IL1B L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -499189 sc-eQTL 7.31e-01 0.048 0.14 0.071 cMono_S100A L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -499383 sc-eQTL 1.86e-01 0.218 0.164 0.071 cMono_S100A L2
ENSG00000134644 PUM1 -268392 sc-eQTL 9.14e-02 0.201 0.118 0.071 cMono_S100A L2
ENSG00000162511 LAPTM5 39825 sc-eQTL 2.98e-01 0.0953 0.0914 0.071 cMono_S100A L2
ENSG00000162512 SDC3 -111159 sc-eQTL 5.87e-01 -0.086 0.158 0.071 cMono_S100A L2
ENSG00000162517 PEF1 -847297 sc-eQTL 2.91e-02 -0.31 0.141 0.071 cMono_S100A L2
ENSG00000168528 SERINC2 -611966 sc-eQTL 2.14e-01 0.208 0.167 0.071 cMono_S100A L2
ENSG00000284543 LINC01226 -708627 sc-eQTL 2.32e-01 0.162 0.136 0.071 cMono_S100A L2
ENSG00000287510 AL137857.1 65906 sc-eQTL 2.05e-01 0.173 0.136 0.071 cMono_S100A L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -499189 sc-eQTL 3.36e-01 0.201 0.208 0.067 gdT L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -499383 sc-eQTL 8.97e-01 0.0233 0.179 0.067 gdT L2
ENSG00000134644 PUM1 -268392 sc-eQTL 5.37e-01 -0.114 0.184 0.067 gdT L2
ENSG00000162511 LAPTM5 39825 sc-eQTL 9.31e-01 -0.0175 0.201 0.067 gdT L2
ENSG00000162517 PEF1 -847297 sc-eQTL 9.89e-01 -0.00244 0.184 0.067 gdT L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 79095 sc-eQTL 5.72e-01 -0.105 0.185 0.067 gdT L2
ENSG00000287510 AL137857.1 65906 sc-eQTL 6.52e-01 -0.081 0.179 0.067 gdT L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -499189 sc-eQTL 4.24e-01 0.124 0.155 0.069 intMono L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -499383 sc-eQTL 4.10e-01 -0.137 0.166 0.069 intMono L2
ENSG00000134644 PUM1 -268392 sc-eQTL 8.69e-01 0.0234 0.141 0.069 intMono L2
ENSG00000162511 LAPTM5 39825 sc-eQTL 3.16e-01 -0.111 0.111 0.069 intMono L2
ENSG00000162512 SDC3 -111159 sc-eQTL 5.09e-01 0.1 0.152 0.069 intMono L2
ENSG00000162517 PEF1 -847297 sc-eQTL 9.78e-01 0.00443 0.16 0.069 intMono L2
ENSG00000168528 SERINC2 -611966 sc-eQTL 9.75e-01 -0.00506 0.159 0.069 intMono L2
ENSG00000284543 LINC01226 -708627 sc-eQTL 3.73e-01 0.134 0.15 0.069 intMono L2
ENSG00000287510 AL137857.1 65906 sc-eQTL 5.08e-01 0.0999 0.151 0.069 intMono L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -499189 sc-eQTL 7.64e-02 -0.257 0.144 0.072 ncMono L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -499383 sc-eQTL 7.70e-01 -0.0454 0.155 0.072 ncMono L2
ENSG00000134644 PUM1 -268392 sc-eQTL 4.45e-01 0.097 0.127 0.072 ncMono L2
ENSG00000162511 LAPTM5 39825 sc-eQTL 1.32e-01 -0.173 0.115 0.072 ncMono L2
ENSG00000162512 SDC3 -111159 sc-eQTL 6.89e-01 -0.0517 0.129 0.072 ncMono L2
ENSG00000162517 PEF1 -847297 sc-eQTL 2.55e-01 0.168 0.148 0.072 ncMono L2
ENSG00000168528 SERINC2 -611966 sc-eQTL 7.93e-01 -0.037 0.141 0.072 ncMono L2
ENSG00000284543 LINC01226 -708627 sc-eQTL 6.60e-01 0.0621 0.141 0.072 ncMono L2
ENSG00000287510 AL137857.1 65906 sc-eQTL 6.72e-01 -0.0618 0.146 0.072 ncMono L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -499189 sc-eQTL 4.63e-01 -0.121 0.164 0.079 pDC L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -499383 sc-eQTL 7.92e-01 -0.0476 0.18 0.079 pDC L2
ENSG00000134644 PUM1 -268392 sc-eQTL 5.79e-01 0.0831 0.15 0.079 pDC L2
ENSG00000162511 LAPTM5 39825 sc-eQTL 6.32e-01 -0.0667 0.139 0.079 pDC L2
ENSG00000162517 PEF1 -847297 sc-eQTL 7.99e-01 -0.0461 0.181 0.079 pDC L2
ENSG00000168528 SERINC2 -611966 sc-eQTL 9.14e-01 0.0182 0.169 0.079 pDC L2
ENSG00000284543 LINC01226 -708627 sc-eQTL 1.22e-01 -0.202 0.13 0.079 pDC L2
ENSG00000287510 AL137857.1 65906 sc-eQTL 9.92e-01 -0.00148 0.154 0.079 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000060688 SNRNP40 -499189 sc-eQTL 2.66e-01 0.188 0.169 0.071 B_Memory LOneK1K
ENSG00000121766 ZCCHC17 -499383 sc-eQTL 3.87e-01 -0.122 0.14 0.071 B_Memory LOneK1K
ENSG00000134644 PUM1 -268392 sc-eQTL 2.02e-02 0.288 0.123 0.071 B_Memory LOneK1K
ENSG00000162510 MATN1 74014 sc-eQTL 5.14e-01 0.0928 0.142 0.071 B_Memory LOneK1K
ENSG00000162511 LAPTM5 39825 sc-eQTL 3.70e-01 -0.08 0.0891 0.071 B_Memory LOneK1K
ENSG00000162517 PEF1 -847297 sc-eQTL 1.72e-01 0.202 0.147 0.071 B_Memory LOneK1K
ENSG00000186056 MATN1-AS1 79095 sc-eQTL 7.78e-01 -0.0334 0.118 0.071 B_Memory LOneK1K
ENSG00000287510 AL137857.1 65906 sc-eQTL 9.30e-01 0.0113 0.129 0.071 B_Memory LOneK1K
ENSG00000060688 SNRNP40 -499189 sc-eQTL 6.96e-01 0.0594 0.152 0.071 B_Naive LOneK1K
ENSG00000121766 ZCCHC17 -499383 sc-eQTL 4.68e-01 0.0871 0.12 0.071 B_Naive LOneK1K
ENSG00000134644 PUM1 -268392 sc-eQTL 2.67e-01 0.126 0.113 0.071 B_Naive LOneK1K
ENSG00000162510 MATN1 74014 sc-eQTL 3.29e-01 0.107 0.109 0.071 B_Naive LOneK1K
ENSG00000162511 LAPTM5 39825 sc-eQTL 4.97e-01 0.0523 0.0769 0.071 B_Naive LOneK1K
ENSG00000162517 PEF1 -847297 sc-eQTL 9.80e-01 0.00359 0.141 0.071 B_Naive LOneK1K
ENSG00000186056 MATN1-AS1 79095 sc-eQTL 9.12e-02 -0.167 0.0987 0.071 B_Naive LOneK1K
ENSG00000287510 AL137857.1 65906 sc-eQTL 1.44e-01 0.172 0.117 0.071 B_Naive LOneK1K
ENSG00000060688 SNRNP40 -499189 sc-eQTL 5.09e-01 0.0834 0.126 0.071 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000121766 ZCCHC17 -499383 sc-eQTL 2.39e-01 0.168 0.143 0.071 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000134644 PUM1 -268392 sc-eQTL 1.35e-02 0.224 0.09 0.071 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000162511 LAPTM5 39825 sc-eQTL 3.38e-01 0.0769 0.08 0.071 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000162512 SDC3 -111159 sc-eQTL 2.94e-01 0.172 0.163 0.071 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000162517 PEF1 -847297 sc-eQTL 8.45e-01 -0.0226 0.115 0.071 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000168528 SERINC2 -611966 sc-eQTL 3.85e-01 0.146 0.168 0.071 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000284543 LINC01226 -708627 sc-eQTL 6.51e-01 0.0625 0.138 0.071 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000287510 AL137857.1 65906 sc-eQTL 1.97e-01 0.167 0.129 0.071 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000060688 SNRNP40 -499189 sc-eQTL 7.01e-01 -0.0527 0.137 0.071 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000121766 ZCCHC17 -499383 sc-eQTL 8.95e-01 0.0199 0.15 0.071 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000134644 PUM1 -268392 sc-eQTL 8.31e-01 -0.0263 0.123 0.071 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000162511 LAPTM5 39825 sc-eQTL 1.35e-01 -0.147 0.0979 0.071 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000162512 SDC3 -111159 sc-eQTL 3.81e-01 0.126 0.144 0.071 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000162517 PEF1 -847297 sc-eQTL 3.48e-01 0.123 0.13 0.071 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000168528 SERINC2 -611966 sc-eQTL 9.61e-01 0.00736 0.149 0.071 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000284543 LINC01226 -708627 sc-eQTL 3.54e-01 0.131 0.141 0.071 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000287510 AL137857.1 65906 sc-eQTL 9.60e-01 0.00717 0.142 0.071 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000060688 SNRNP40 -499189 sc-eQTL 2.20e-02 0.358 0.155 0.071 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000121753 ADGRB2 -967294 sc-eQTL 7.36e-01 0.0452 0.134 0.071 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000121766 ZCCHC17 -499383 sc-eQTL 4.90e-01 -0.0741 0.107 0.071 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000134644 PUM1 -268392 sc-eQTL 9.50e-01 -0.00738 0.118 0.071 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000162511 LAPTM5 39825 sc-eQTL 7.68e-03 -0.348 0.129 0.071 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000162517 PEF1 -847297 sc-eQTL 4.94e-01 0.0683 0.0997 0.071 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000186056 MATN1-AS1 79095 sc-eQTL 1.04e-01 -0.246 0.151 0.071 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000287510 AL137857.1 65906 sc-eQTL 7.02e-01 0.05 0.131 0.071 NK_CD56dim LOneK1K

Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF
ENSG00000162511 LAPTM5 39825 eQTL 0.0185 -0.0391 0.0166 0.0 0.0 0.0947

Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina
ENSG00000168528 \N -611966 1.21e-06 9.37e-07 2.84e-07 4.39e-07 1.1e-07 3.32e-07 6.19e-07 1.54e-07 6.62e-07 2.98e-07 9.47e-07 5.4e-07 1.34e-06 2.57e-07 4.05e-07 2.85e-07 4.3e-07 4.25e-07 3.48e-07 1.53e-07 2.35e-07 5.36e-07 4e-07 1.27e-07 1.49e-06 2.68e-07 3.26e-07 3.51e-07 5.43e-07 6.35e-07 3.79e-07 5.32e-08 5.75e-08 3.79e-07 3e-07 1.49e-07 2.94e-07 6.97e-08 4e-08 5.88e-08 4.78e-08 7.04e-07 5.58e-08 8.1e-08 8.59e-08 2.71e-08 9.73e-08 3.21e-08 4.74e-08