logo

Genes within 1Mb (chr1:30790525:C:T):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD

Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000060688 SNRNP40 -506263 sc-eQTL 5.14e-01 0.0938 0.143 0.073 B L1
ENSG00000121766 ZCCHC17 -506457 sc-eQTL 8.17e-01 0.0267 0.115 0.073 B L1
ENSG00000134644 PUM1 -275466 sc-eQTL 8.67e-02 0.165 0.0958 0.073 B L1
ENSG00000162510 MATN1 66940 sc-eQTL 2.61e-01 0.114 0.101 0.073 B L1
ENSG00000162511 LAPTM5 32751 sc-eQTL 2.96e-01 -0.083 0.0792 0.073 B L1
ENSG00000162517 PEF1 -854371 sc-eQTL 5.70e-01 0.0682 0.12 0.073 B L1
ENSG00000186056 MATN1-AS1 72021 sc-eQTL 4.80e-02 -0.183 0.0922 0.073 B L1
ENSG00000287510 AL137857.1 58832 sc-eQTL 3.26e-01 0.108 0.11 0.073 B L1
ENSG00000060688 SNRNP40 -506263 sc-eQTL 3.08e-01 0.124 0.121 0.073 CD4T L1
ENSG00000121766 ZCCHC17 -506457 sc-eQTL 4.17e-01 -0.0771 0.095 0.073 CD4T L1
ENSG00000134644 PUM1 -275466 sc-eQTL 6.56e-01 0.0378 0.0846 0.073 CD4T L1
ENSG00000162511 LAPTM5 32751 sc-eQTL 9.68e-02 -0.155 0.0932 0.073 CD4T L1
ENSG00000162517 PEF1 -854371 sc-eQTL 3.98e-02 0.201 0.0971 0.073 CD4T L1
ENSG00000186056 MATN1-AS1 72021 sc-eQTL 9.40e-01 0.00634 0.0839 0.073 CD4T L1
ENSG00000287510 AL137857.1 58832 sc-eQTL 7.17e-01 -0.0365 0.101 0.073 CD4T L1
ENSG00000060688 SNRNP40 -506263 sc-eQTL 8.79e-01 0.0241 0.158 0.073 CD8T L1
ENSG00000121766 ZCCHC17 -506457 sc-eQTL 5.18e-01 -0.0682 0.105 0.073 CD8T L1
ENSG00000134644 PUM1 -275466 sc-eQTL 3.03e-01 -0.0956 0.0926 0.073 CD8T L1
ENSG00000162511 LAPTM5 32751 sc-eQTL 5.71e-02 -0.171 0.0894 0.073 CD8T L1
ENSG00000162517 PEF1 -854371 sc-eQTL 1.50e-01 0.16 0.11 0.073 CD8T L1
ENSG00000186056 MATN1-AS1 72021 sc-eQTL 4.59e-01 -0.0783 0.106 0.073 CD8T L1
ENSG00000287510 AL137857.1 58832 sc-eQTL 4.75e-01 0.0949 0.133 0.073 CD8T L1
ENSG00000060688 SNRNP40 -506263 sc-eQTL 4.87e-02 -0.274 0.138 0.074 DC L1
ENSG00000121766 ZCCHC17 -506457 sc-eQTL 8.52e-01 -0.0309 0.165 0.074 DC L1
ENSG00000134644 PUM1 -275466 sc-eQTL 8.20e-01 -0.0295 0.13 0.074 DC L1
ENSG00000162511 LAPTM5 32751 sc-eQTL 2.66e-01 0.103 0.0923 0.074 DC L1
ENSG00000162517 PEF1 -854371 sc-eQTL 7.67e-01 -0.0445 0.15 0.074 DC L1
ENSG00000168528 SERINC2 -619040 sc-eQTL 2.22e-01 0.186 0.152 0.074 DC L1
ENSG00000284543 LINC01226 -715701 sc-eQTL 8.15e-01 -0.0237 0.101 0.074 DC L1
ENSG00000287510 AL137857.1 58832 sc-eQTL 8.11e-01 0.035 0.146 0.074 DC L1
ENSG00000060688 SNRNP40 -506263 sc-eQTL 8.40e-01 0.0222 0.11 0.073 Mono L1
ENSG00000121766 ZCCHC17 -506457 sc-eQTL 3.49e-01 0.127 0.136 0.073 Mono L1
ENSG00000134644 PUM1 -275466 sc-eQTL 5.12e-02 0.169 0.0864 0.073 Mono L1
ENSG00000162511 LAPTM5 32751 sc-eQTL 5.46e-01 0.0485 0.0801 0.073 Mono L1
ENSG00000162512 SDC3 -118233 sc-eQTL 3.11e-01 0.156 0.154 0.073 Mono L1
ENSG00000162517 PEF1 -854371 sc-eQTL 5.06e-01 0.072 0.108 0.073 Mono L1
ENSG00000168528 SERINC2 -619040 sc-eQTL 4.69e-01 0.12 0.165 0.073 Mono L1
ENSG00000284543 LINC01226 -715701 sc-eQTL 4.32e-01 0.114 0.145 0.073 Mono L1
ENSG00000287510 AL137857.1 58832 sc-eQTL 2.36e-01 0.151 0.127 0.073 Mono L1
ENSG00000060688 SNRNP40 -506263 sc-eQTL 5.82e-02 0.292 0.153 0.073 NK L1
ENSG00000121753 ADGRB2 -974368 sc-eQTL 9.11e-01 0.0149 0.133 0.073 NK L1
ENSG00000121766 ZCCHC17 -506457 sc-eQTL 5.08e-01 -0.0701 0.106 0.073 NK L1
ENSG00000134644 PUM1 -275466 sc-eQTL 7.11e-01 0.0412 0.111 0.073 NK L1
ENSG00000162511 LAPTM5 32751 sc-eQTL 7.02e-03 -0.342 0.126 0.073 NK L1
ENSG00000162517 PEF1 -854371 sc-eQTL 4.49e-01 0.0708 0.0932 0.073 NK L1
ENSG00000186056 MATN1-AS1 72021 sc-eQTL 3.24e-01 -0.142 0.143 0.073 NK L1
ENSG00000287510 AL137857.1 58832 sc-eQTL 7.23e-01 0.047 0.133 0.073 NK L1
ENSG00000060688 SNRNP40 -506263 sc-eQTL 5.26e-01 0.0733 0.116 0.073 Other_T L1
ENSG00000121766 ZCCHC17 -506457 sc-eQTL 1.96e-01 -0.16 0.123 0.073 Other_T L1
ENSG00000134644 PUM1 -275466 sc-eQTL 5.98e-02 -0.209 0.11 0.073 Other_T L1
ENSG00000162511 LAPTM5 32751 sc-eQTL 6.67e-01 -0.0393 0.091 0.073 Other_T L1
ENSG00000162517 PEF1 -854371 sc-eQTL 8.70e-01 0.0199 0.122 0.073 Other_T L1
ENSG00000186056 MATN1-AS1 72021 sc-eQTL 3.03e-01 0.154 0.149 0.073 Other_T L1
ENSG00000287510 AL137857.1 58832 sc-eQTL 5.25e-01 0.0988 0.155 0.073 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000060688 SNRNP40 -506263 sc-eQTL 3.21e-02 -0.412 0.19 0.071 B_Activated L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -506457 sc-eQTL 4.68e-01 -0.141 0.194 0.071 B_Activated L2
ENSG00000134644 PUM1 -275466 sc-eQTL 5.23e-01 -0.116 0.181 0.071 B_Activated L2
ENSG00000162510 MATN1 66940 sc-eQTL 6.08e-01 0.0812 0.158 0.071 B_Activated L2
ENSG00000162511 LAPTM5 32751 sc-eQTL 8.70e-01 0.0181 0.11 0.071 B_Activated L2
ENSG00000162517 PEF1 -854371 sc-eQTL 6.64e-01 -0.0817 0.188 0.071 B_Activated L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 72021 sc-eQTL 6.53e-01 0.0802 0.178 0.071 B_Activated L2
ENSG00000287510 AL137857.1 58832 sc-eQTL 9.90e-01 0.00204 0.158 0.071 B_Activated L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -506263 sc-eQTL 1.93e-01 0.223 0.171 0.073 B_Intermediate L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -506457 sc-eQTL 2.92e-01 -0.151 0.143 0.073 B_Intermediate L2
ENSG00000134644 PUM1 -275466 sc-eQTL 6.65e-02 0.247 0.134 0.073 B_Intermediate L2
ENSG00000162510 MATN1 66940 sc-eQTL 1.01e-01 0.23 0.14 0.073 B_Intermediate L2
ENSG00000162511 LAPTM5 32751 sc-eQTL 9.65e-01 0.00378 0.0862 0.073 B_Intermediate L2
ENSG00000162517 PEF1 -854371 sc-eQTL 1.47e-01 0.232 0.159 0.073 B_Intermediate L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 72021 sc-eQTL 1.37e-01 -0.18 0.12 0.073 B_Intermediate L2
ENSG00000287510 AL137857.1 58832 sc-eQTL 7.18e-01 -0.049 0.135 0.073 B_Intermediate L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -506263 sc-eQTL 4.05e-01 0.14 0.168 0.073 B_Memory L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -506457 sc-eQTL 5.31e-01 -0.0971 0.155 0.073 B_Memory L2
ENSG00000134644 PUM1 -275466 sc-eQTL 2.75e-01 0.147 0.134 0.073 B_Memory L2
ENSG00000162510 MATN1 66940 sc-eQTL 6.71e-01 0.0548 0.129 0.073 B_Memory L2
ENSG00000162511 LAPTM5 32751 sc-eQTL 9.45e-03 -0.294 0.112 0.073 B_Memory L2
ENSG00000162517 PEF1 -854371 sc-eQTL 2.34e-01 0.181 0.152 0.073 B_Memory L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 72021 sc-eQTL 2.68e-01 0.145 0.13 0.073 B_Memory L2
ENSG00000287510 AL137857.1 58832 sc-eQTL 9.77e-01 -0.00439 0.153 0.073 B_Memory L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -506263 sc-eQTL 7.00e-01 0.0592 0.154 0.073 B_Naive1 L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -506457 sc-eQTL 2.97e-01 -0.138 0.132 0.073 B_Naive1 L2
ENSG00000134644 PUM1 -275466 sc-eQTL 3.20e-01 0.116 0.117 0.073 B_Naive1 L2
ENSG00000162510 MATN1 66940 sc-eQTL 3.98e-01 0.1 0.119 0.073 B_Naive1 L2
ENSG00000162511 LAPTM5 32751 sc-eQTL 5.58e-01 0.0466 0.0793 0.073 B_Naive1 L2
ENSG00000162517 PEF1 -854371 sc-eQTL 9.49e-01 -0.00895 0.14 0.073 B_Naive1 L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 72021 sc-eQTL 9.16e-02 -0.175 0.103 0.073 B_Naive1 L2
ENSG00000287510 AL137857.1 58832 sc-eQTL 3.20e-02 0.275 0.127 0.073 B_Naive1 L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -506263 sc-eQTL 5.74e-01 -0.0923 0.164 0.073 B_Naive2 L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -506457 sc-eQTL 3.11e-02 0.29 0.134 0.073 B_Naive2 L2
ENSG00000134644 PUM1 -275466 sc-eQTL 8.07e-01 0.0324 0.132 0.073 B_Naive2 L2
ENSG00000162510 MATN1 66940 sc-eQTL 3.94e-01 0.108 0.127 0.073 B_Naive2 L2
ENSG00000162511 LAPTM5 32751 sc-eQTL 7.83e-01 0.0238 0.0863 0.073 B_Naive2 L2
ENSG00000162517 PEF1 -854371 sc-eQTL 9.53e-01 0.00933 0.157 0.073 B_Naive2 L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 72021 sc-eQTL 9.60e-01 -0.00625 0.126 0.073 B_Naive2 L2
ENSG00000287510 AL137857.1 58832 sc-eQTL 6.48e-01 0.062 0.136 0.073 B_Naive2 L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -506263 sc-eQTL 3.38e-01 0.157 0.163 0.077 CD4_CTL L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -506457 sc-eQTL 2.24e-01 -0.195 0.16 0.077 CD4_CTL L2
ENSG00000134644 PUM1 -275466 sc-eQTL 1.40e-01 -0.232 0.157 0.077 CD4_CTL L2
ENSG00000162511 LAPTM5 32751 sc-eQTL 4.25e-01 -0.112 0.14 0.077 CD4_CTL L2
ENSG00000162517 PEF1 -854371 sc-eQTL 6.08e-01 -0.0739 0.144 0.077 CD4_CTL L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 72021 sc-eQTL 7.06e-01 0.0582 0.154 0.077 CD4_CTL L2
ENSG00000287510 AL137857.1 58832 sc-eQTL 7.29e-01 -0.047 0.136 0.077 CD4_CTL L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -506263 sc-eQTL 7.66e-01 0.0377 0.127 0.073 CD4_Naive L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -506457 sc-eQTL 6.58e-01 -0.0498 0.112 0.073 CD4_Naive L2
ENSG00000134644 PUM1 -275466 sc-eQTL 3.36e-01 0.0863 0.0895 0.073 CD4_Naive L2
ENSG00000162511 LAPTM5 32751 sc-eQTL 7.41e-01 -0.0318 0.0961 0.073 CD4_Naive L2
ENSG00000162517 PEF1 -854371 sc-eQTL 6.06e-02 0.197 0.105 0.073 CD4_Naive L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 72021 sc-eQTL 8.85e-01 0.0141 0.0976 0.073 CD4_Naive L2
ENSG00000287510 AL137857.1 58832 sc-eQTL 4.09e-01 -0.0925 0.112 0.073 CD4_Naive L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -506263 sc-eQTL 9.19e-01 0.0162 0.16 0.073 CD4_TCM L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -506457 sc-eQTL 9.04e-01 -0.0156 0.129 0.073 CD4_TCM L2
ENSG00000134644 PUM1 -275466 sc-eQTL 9.91e-01 -0.0013 0.114 0.073 CD4_TCM L2
ENSG00000162511 LAPTM5 32751 sc-eQTL 7.64e-03 -0.251 0.093 0.073 CD4_TCM L2
ENSG00000162517 PEF1 -854371 sc-eQTL 3.32e-01 0.123 0.127 0.073 CD4_TCM L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 72021 sc-eQTL 5.00e-01 -0.081 0.12 0.073 CD4_TCM L2
ENSG00000287510 AL137857.1 58832 sc-eQTL 4.03e-01 0.112 0.134 0.073 CD4_TCM L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -506263 sc-eQTL 6.59e-01 0.0694 0.157 0.073 CD4_TEM L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -506457 sc-eQTL 2.84e-01 -0.16 0.149 0.073 CD4_TEM L2
ENSG00000134644 PUM1 -275466 sc-eQTL 3.86e-01 0.108 0.124 0.073 CD4_TEM L2
ENSG00000162511 LAPTM5 32751 sc-eQTL 4.17e-02 -0.256 0.125 0.073 CD4_TEM L2
ENSG00000162517 PEF1 -854371 sc-eQTL 9.84e-01 0.0029 0.141 0.073 CD4_TEM L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 72021 sc-eQTL 3.64e-01 0.134 0.147 0.073 CD4_TEM L2
ENSG00000287510 AL137857.1 58832 sc-eQTL 3.68e-01 -0.131 0.145 0.073 CD4_TEM L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -506263 sc-eQTL 7.80e-01 -0.0502 0.18 0.073 CD8_CTL L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -506457 sc-eQTL 6.97e-01 0.0537 0.138 0.073 CD8_CTL L2
ENSG00000134644 PUM1 -275466 sc-eQTL 3.53e-01 0.124 0.134 0.073 CD8_CTL L2
ENSG00000162511 LAPTM5 32751 sc-eQTL 2.39e-01 -0.175 0.148 0.073 CD8_CTL L2
ENSG00000162517 PEF1 -854371 sc-eQTL 3.30e-01 -0.126 0.129 0.073 CD8_CTL L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 72021 sc-eQTL 7.96e-01 0.0403 0.156 0.073 CD8_CTL L2
ENSG00000287510 AL137857.1 58832 sc-eQTL 1.37e-01 0.218 0.146 0.073 CD8_CTL L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -506263 sc-eQTL 9.66e-01 0.00677 0.156 0.073 CD8_Naive L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -506457 sc-eQTL 8.32e-01 0.0286 0.135 0.073 CD8_Naive L2
ENSG00000134644 PUM1 -275466 sc-eQTL 1.40e-01 -0.16 0.108 0.073 CD8_Naive L2
ENSG00000162511 LAPTM5 32751 sc-eQTL 2.68e-01 -0.115 0.104 0.073 CD8_Naive L2
ENSG00000162517 PEF1 -854371 sc-eQTL 1.93e-01 0.188 0.144 0.073 CD8_Naive L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 72021 sc-eQTL 3.53e-02 -0.272 0.128 0.073 CD8_Naive L2
ENSG00000287510 AL137857.1 58832 sc-eQTL 7.12e-01 0.0523 0.141 0.073 CD8_Naive L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -506263 sc-eQTL 6.15e-01 -0.0868 0.172 0.074 CD8_TCM L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -506457 sc-eQTL 9.99e-01 0.000223 0.158 0.074 CD8_TCM L2
ENSG00000134644 PUM1 -275466 sc-eQTL 2.68e-01 -0.164 0.148 0.074 CD8_TCM L2
ENSG00000162511 LAPTM5 32751 sc-eQTL 6.11e-01 -0.0791 0.155 0.074 CD8_TCM L2
ENSG00000162517 PEF1 -854371 sc-eQTL 1.11e-01 0.252 0.158 0.074 CD8_TCM L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 72021 sc-eQTL 2.94e-01 0.151 0.143 0.074 CD8_TCM L2
ENSG00000287510 AL137857.1 58832 sc-eQTL 7.61e-01 -0.0442 0.145 0.074 CD8_TCM L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -506263 sc-eQTL 7.23e-01 -0.0624 0.176 0.073 CD8_TEM L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -506457 sc-eQTL 3.00e-01 -0.175 0.168 0.073 CD8_TEM L2
ENSG00000134644 PUM1 -275466 sc-eQTL 6.44e-01 0.0799 0.172 0.073 CD8_TEM L2
ENSG00000162511 LAPTM5 32751 sc-eQTL 8.07e-01 -0.0396 0.162 0.073 CD8_TEM L2
ENSG00000162517 PEF1 -854371 sc-eQTL 2.37e-01 0.18 0.152 0.073 CD8_TEM L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 72021 sc-eQTL 1.90e-01 -0.221 0.168 0.073 CD8_TEM L2
ENSG00000287510 AL137857.1 58832 sc-eQTL 1.96e-01 0.197 0.152 0.073 CD8_TEM L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -506263 sc-eQTL 8.27e-01 -0.0369 0.169 0.074 MAIT L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -506457 sc-eQTL 1.22e-01 -0.231 0.149 0.074 MAIT L2
ENSG00000134644 PUM1 -275466 sc-eQTL 6.86e-02 -0.26 0.142 0.074 MAIT L2
ENSG00000162511 LAPTM5 32751 sc-eQTL 8.48e-01 -0.0259 0.135 0.074 MAIT L2
ENSG00000162517 PEF1 -854371 sc-eQTL 8.55e-01 0.0271 0.149 0.074 MAIT L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 72021 sc-eQTL 1.23e-01 0.232 0.15 0.074 MAIT L2
ENSG00000287510 AL137857.1 58832 sc-eQTL 7.43e-01 0.0509 0.155 0.074 MAIT L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -506263 sc-eQTL 3.98e-01 -0.145 0.172 0.076 NK_CD56bright L2
ENSG00000121753 ADGRB2 -974368 sc-eQTL 4.52e-01 -0.101 0.134 0.076 NK_CD56bright L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -506457 sc-eQTL 7.87e-01 -0.0392 0.145 0.076 NK_CD56bright L2
ENSG00000134644 PUM1 -275466 sc-eQTL 1.20e-01 0.237 0.152 0.076 NK_CD56bright L2
ENSG00000162511 LAPTM5 32751 sc-eQTL 2.11e-01 -0.188 0.15 0.076 NK_CD56bright L2
ENSG00000162517 PEF1 -854371 sc-eQTL 2.98e-01 0.152 0.146 0.076 NK_CD56bright L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 72021 sc-eQTL 2.50e-01 0.174 0.151 0.076 NK_CD56bright L2
ENSG00000287510 AL137857.1 58832 sc-eQTL 7.53e-01 -0.0469 0.149 0.076 NK_CD56bright L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -506263 sc-eQTL 2.25e-01 0.199 0.163 0.073 NK_CD56dim L2
ENSG00000121753 ADGRB2 -974368 sc-eQTL 1.42e-01 0.211 0.143 0.073 NK_CD56dim L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -506457 sc-eQTL 8.46e-01 -0.0236 0.121 0.073 NK_CD56dim L2
ENSG00000134644 PUM1 -275466 sc-eQTL 5.91e-01 0.0669 0.124 0.073 NK_CD56dim L2
ENSG00000162511 LAPTM5 32751 sc-eQTL 2.64e-02 -0.293 0.131 0.073 NK_CD56dim L2
ENSG00000162517 PEF1 -854371 sc-eQTL 7.79e-01 0.0331 0.118 0.073 NK_CD56dim L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 72021 sc-eQTL 2.38e-01 -0.196 0.166 0.073 NK_CD56dim L2
ENSG00000287510 AL137857.1 58832 sc-eQTL 6.43e-01 0.0636 0.137 0.073 NK_CD56dim L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -506263 sc-eQTL 3.73e-01 0.165 0.185 0.062 NK_HLA L2
ENSG00000121753 ADGRB2 -974368 sc-eQTL 7.40e-01 -0.0488 0.147 0.062 NK_HLA L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -506457 sc-eQTL 2.87e-01 -0.176 0.165 0.062 NK_HLA L2
ENSG00000134644 PUM1 -275466 sc-eQTL 5.10e-01 -0.106 0.161 0.062 NK_HLA L2
ENSG00000162511 LAPTM5 32751 sc-eQTL 2.52e-02 -0.342 0.152 0.062 NK_HLA L2
ENSG00000162517 PEF1 -854371 sc-eQTL 9.46e-01 0.0117 0.173 0.062 NK_HLA L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 72021 sc-eQTL 5.12e-02 -0.318 0.162 0.062 NK_HLA L2
ENSG00000287510 AL137857.1 58832 sc-eQTL 3.32e-01 0.153 0.158 0.062 NK_HLA L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -506263 sc-eQTL 6.61e-02 0.293 0.158 0.073 NK_cytokine L2
ENSG00000121753 ADGRB2 -974368 sc-eQTL 6.79e-02 -0.263 0.143 0.073 NK_cytokine L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -506457 sc-eQTL 3.11e-01 -0.126 0.124 0.073 NK_cytokine L2
ENSG00000134644 PUM1 -275466 sc-eQTL 8.27e-01 -0.0295 0.135 0.073 NK_cytokine L2
ENSG00000162511 LAPTM5 32751 sc-eQTL 1.27e-01 -0.226 0.148 0.073 NK_cytokine L2
ENSG00000162517 PEF1 -854371 sc-eQTL 6.63e-01 0.0552 0.126 0.073 NK_cytokine L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 72021 sc-eQTL 9.10e-01 -0.0178 0.157 0.073 NK_cytokine L2
ENSG00000287510 AL137857.1 58832 sc-eQTL 4.97e-01 0.0994 0.146 0.073 NK_cytokine L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -506263 sc-eQTL 1.17e-01 0.312 0.198 0.074 PB L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -506457 sc-eQTL 2.83e-01 0.249 0.231 0.074 PB L2
ENSG00000134644 PUM1 -275466 sc-eQTL 1.85e-01 -0.267 0.2 0.074 PB L2
ENSG00000162510 MATN1 66940 sc-eQTL 5.18e-01 -0.122 0.188 0.074 PB L2
ENSG00000162511 LAPTM5 32751 sc-eQTL 7.64e-01 -0.0403 0.134 0.074 PB L2
ENSG00000162517 PEF1 -854371 sc-eQTL 7.98e-01 0.0531 0.207 0.074 PB L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 72021 sc-eQTL 3.52e-01 -0.171 0.183 0.074 PB L2
ENSG00000287510 AL137857.1 58832 sc-eQTL 7.77e-01 0.0555 0.196 0.074 PB L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -506263 sc-eQTL 7.96e-01 -0.0327 0.126 0.072 Pro_T L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -506457 sc-eQTL 8.21e-01 0.0363 0.16 0.072 Pro_T L2
ENSG00000134644 PUM1 -275466 sc-eQTL 4.10e-01 -0.123 0.149 0.072 Pro_T L2
ENSG00000162511 LAPTM5 32751 sc-eQTL 6.09e-02 -0.2 0.106 0.072 Pro_T L2
ENSG00000162517 PEF1 -854371 sc-eQTL 5.75e-01 0.0881 0.157 0.072 Pro_T L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 72021 sc-eQTL 8.59e-01 0.0267 0.15 0.072 Pro_T L2
ENSG00000287510 AL137857.1 58832 sc-eQTL 3.76e-01 0.122 0.137 0.072 Pro_T L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -506263 sc-eQTL 3.08e-01 0.165 0.162 0.073 Treg L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -506457 sc-eQTL 5.16e-01 -0.102 0.157 0.073 Treg L2
ENSG00000134644 PUM1 -275466 sc-eQTL 5.41e-01 0.0769 0.125 0.073 Treg L2
ENSG00000162511 LAPTM5 32751 sc-eQTL 1.80e-01 -0.193 0.143 0.073 Treg L2
ENSG00000162517 PEF1 -854371 sc-eQTL 1.82e-01 0.207 0.155 0.073 Treg L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 72021 sc-eQTL 3.84e-01 -0.128 0.146 0.073 Treg L2
ENSG00000287510 AL137857.1 58832 sc-eQTL 1.83e-01 0.195 0.146 0.073 Treg L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -506263 sc-eQTL 4.26e-02 -0.323 0.158 0.078 cDC L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -506457 sc-eQTL 5.22e-01 0.111 0.173 0.078 cDC L2
ENSG00000134644 PUM1 -275466 sc-eQTL 9.96e-01 0.000759 0.149 0.078 cDC L2
ENSG00000162511 LAPTM5 32751 sc-eQTL 7.50e-01 0.0333 0.104 0.078 cDC L2
ENSG00000162517 PEF1 -854371 sc-eQTL 8.49e-01 -0.0288 0.151 0.078 cDC L2
ENSG00000168528 SERINC2 -619040 sc-eQTL 2.64e-01 0.15 0.133 0.078 cDC L2
ENSG00000284543 LINC01226 -715701 sc-eQTL 5.77e-01 0.0734 0.131 0.078 cDC L2
ENSG00000287510 AL137857.1 58832 sc-eQTL 9.55e-01 0.00791 0.142 0.078 cDC L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -506263 sc-eQTL 4.46e-01 0.1 0.131 0.073 cMono_IL1B L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -506457 sc-eQTL 4.19e-01 0.118 0.146 0.073 cMono_IL1B L2
ENSG00000134644 PUM1 -275466 sc-eQTL 1.58e-02 0.238 0.0977 0.073 cMono_IL1B L2
ENSG00000162511 LAPTM5 32751 sc-eQTL 5.19e-01 0.0561 0.0869 0.073 cMono_IL1B L2
ENSG00000162512 SDC3 -118233 sc-eQTL 1.91e-01 0.214 0.163 0.073 cMono_IL1B L2
ENSG00000162517 PEF1 -854371 sc-eQTL 1.26e-01 0.204 0.133 0.073 cMono_IL1B L2
ENSG00000168528 SERINC2 -619040 sc-eQTL 4.96e-01 0.113 0.166 0.073 cMono_IL1B L2
ENSG00000284543 LINC01226 -715701 sc-eQTL 8.37e-01 0.0302 0.147 0.073 cMono_IL1B L2
ENSG00000287510 AL137857.1 58832 sc-eQTL 1.08e-01 0.22 0.136 0.073 cMono_IL1B L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -506263 sc-eQTL 7.71e-01 0.0402 0.138 0.073 cMono_S100A L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -506457 sc-eQTL 1.14e-01 0.258 0.163 0.073 cMono_S100A L2
ENSG00000134644 PUM1 -275466 sc-eQTL 7.95e-02 0.207 0.117 0.073 cMono_S100A L2
ENSG00000162511 LAPTM5 32751 sc-eQTL 3.07e-01 0.0928 0.0906 0.073 cMono_S100A L2
ENSG00000162512 SDC3 -118233 sc-eQTL 4.71e-01 -0.113 0.157 0.073 cMono_S100A L2
ENSG00000162517 PEF1 -854371 sc-eQTL 2.86e-02 -0.309 0.14 0.073 cMono_S100A L2
ENSG00000168528 SERINC2 -619040 sc-eQTL 2.58e-01 0.188 0.166 0.073 cMono_S100A L2
ENSG00000284543 LINC01226 -715701 sc-eQTL 2.40e-01 0.158 0.134 0.073 cMono_S100A L2
ENSG00000287510 AL137857.1 58832 sc-eQTL 1.77e-01 0.183 0.135 0.073 cMono_S100A L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -506263 sc-eQTL 4.26e-01 0.163 0.205 0.07 gdT L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -506457 sc-eQTL 9.12e-01 -0.0194 0.176 0.07 gdT L2
ENSG00000134644 PUM1 -275466 sc-eQTL 4.93e-01 -0.125 0.181 0.07 gdT L2
ENSG00000162511 LAPTM5 32751 sc-eQTL 8.88e-01 -0.0279 0.198 0.07 gdT L2
ENSG00000162517 PEF1 -854371 sc-eQTL 9.51e-01 0.0112 0.181 0.07 gdT L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 72021 sc-eQTL 7.19e-01 -0.0658 0.182 0.07 gdT L2
ENSG00000287510 AL137857.1 58832 sc-eQTL 5.43e-01 -0.108 0.176 0.07 gdT L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -506263 sc-eQTL 6.33e-01 0.0736 0.154 0.071 intMono L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -506457 sc-eQTL 5.15e-01 -0.108 0.165 0.071 intMono L2
ENSG00000134644 PUM1 -275466 sc-eQTL 6.84e-01 0.0571 0.14 0.071 intMono L2
ENSG00000162511 LAPTM5 32751 sc-eQTL 5.54e-01 -0.0653 0.11 0.071 intMono L2
ENSG00000162512 SDC3 -118233 sc-eQTL 7.11e-01 0.0559 0.151 0.071 intMono L2
ENSG00000162517 PEF1 -854371 sc-eQTL 6.54e-01 0.071 0.158 0.071 intMono L2
ENSG00000168528 SERINC2 -619040 sc-eQTL 8.60e-01 -0.0279 0.158 0.071 intMono L2
ENSG00000284543 LINC01226 -715701 sc-eQTL 2.16e-01 0.185 0.149 0.071 intMono L2
ENSG00000287510 AL137857.1 58832 sc-eQTL 5.30e-01 0.094 0.149 0.071 intMono L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -506263 sc-eQTL 8.62e-02 -0.247 0.143 0.075 ncMono L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -506457 sc-eQTL 9.75e-01 -0.00474 0.154 0.075 ncMono L2
ENSG00000134644 PUM1 -275466 sc-eQTL 4.91e-01 0.0867 0.126 0.075 ncMono L2
ENSG00000162511 LAPTM5 32751 sc-eQTL 1.27e-01 -0.174 0.114 0.075 ncMono L2
ENSG00000162512 SDC3 -118233 sc-eQTL 4.72e-01 -0.0922 0.128 0.075 ncMono L2
ENSG00000162517 PEF1 -854371 sc-eQTL 1.68e-01 0.202 0.146 0.075 ncMono L2
ENSG00000168528 SERINC2 -619040 sc-eQTL 7.21e-01 -0.05 0.14 0.075 ncMono L2
ENSG00000284543 LINC01226 -715701 sc-eQTL 4.60e-01 0.103 0.14 0.075 ncMono L2
ENSG00000287510 AL137857.1 58832 sc-eQTL 6.24e-01 -0.0711 0.145 0.075 ncMono L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -506263 sc-eQTL 3.97e-01 -0.138 0.162 0.082 pDC L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -506457 sc-eQTL 7.96e-01 -0.0463 0.179 0.082 pDC L2
ENSG00000134644 PUM1 -275466 sc-eQTL 4.69e-01 0.107 0.148 0.082 pDC L2
ENSG00000162511 LAPTM5 32751 sc-eQTL 9.57e-01 0.00738 0.138 0.082 pDC L2
ENSG00000162517 PEF1 -854371 sc-eQTL 9.35e-01 -0.0147 0.179 0.082 pDC L2
ENSG00000168528 SERINC2 -619040 sc-eQTL 8.87e-01 0.0237 0.167 0.082 pDC L2
ENSG00000284543 LINC01226 -715701 sc-eQTL 1.33e-01 -0.195 0.129 0.082 pDC L2
ENSG00000287510 AL137857.1 58832 sc-eQTL 9.58e-01 -0.00796 0.152 0.082 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000060688 SNRNP40 -506263 sc-eQTL 2.32e-01 0.2 0.167 0.073 B_Memory LOneK1K
ENSG00000121766 ZCCHC17 -506457 sc-eQTL 2.68e-01 -0.154 0.139 0.073 B_Memory LOneK1K
ENSG00000134644 PUM1 -275466 sc-eQTL 2.27e-02 0.28 0.122 0.073 B_Memory LOneK1K
ENSG00000162510 MATN1 66940 sc-eQTL 4.61e-01 0.104 0.141 0.073 B_Memory LOneK1K
ENSG00000162511 LAPTM5 32751 sc-eQTL 3.41e-01 -0.0841 0.0882 0.073 B_Memory LOneK1K
ENSG00000162517 PEF1 -854371 sc-eQTL 2.12e-01 0.183 0.146 0.073 B_Memory LOneK1K
ENSG00000186056 MATN1-AS1 72021 sc-eQTL 7.68e-01 -0.0345 0.117 0.073 B_Memory LOneK1K
ENSG00000287510 AL137857.1 58832 sc-eQTL 9.68e-01 0.00515 0.127 0.073 B_Memory LOneK1K
ENSG00000060688 SNRNP40 -506263 sc-eQTL 8.98e-01 0.0192 0.15 0.073 B_Naive LOneK1K
ENSG00000121766 ZCCHC17 -506457 sc-eQTL 5.43e-01 0.0723 0.119 0.073 B_Naive LOneK1K
ENSG00000134644 PUM1 -275466 sc-eQTL 2.87e-01 0.12 0.112 0.073 B_Naive LOneK1K
ENSG00000162510 MATN1 66940 sc-eQTL 2.65e-01 0.121 0.108 0.073 B_Naive LOneK1K
ENSG00000162511 LAPTM5 32751 sc-eQTL 4.37e-01 0.0593 0.0761 0.073 B_Naive LOneK1K
ENSG00000162517 PEF1 -854371 sc-eQTL 9.76e-01 0.00414 0.139 0.073 B_Naive LOneK1K
ENSG00000186056 MATN1-AS1 72021 sc-eQTL 1.24e-01 -0.151 0.0978 0.073 B_Naive LOneK1K
ENSG00000287510 AL137857.1 58832 sc-eQTL 1.32e-01 0.176 0.116 0.073 B_Naive LOneK1K
ENSG00000060688 SNRNP40 -506263 sc-eQTL 3.13e-01 0.126 0.125 0.073 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000121766 ZCCHC17 -506457 sc-eQTL 2.02e-01 0.181 0.141 0.073 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000134644 PUM1 -275466 sc-eQTL 9.15e-03 0.234 0.089 0.073 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000162511 LAPTM5 32751 sc-eQTL 3.01e-01 0.0822 0.0793 0.073 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000162512 SDC3 -118233 sc-eQTL 4.12e-01 0.133 0.162 0.073 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000162517 PEF1 -854371 sc-eQTL 8.86e-01 -0.0164 0.114 0.073 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000168528 SERINC2 -619040 sc-eQTL 3.97e-01 0.141 0.167 0.073 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000284543 LINC01226 -715701 sc-eQTL 5.99e-01 0.0721 0.137 0.073 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000287510 AL137857.1 58832 sc-eQTL 1.71e-01 0.175 0.127 0.073 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000060688 SNRNP40 -506263 sc-eQTL 6.06e-01 -0.0703 0.136 0.073 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000121766 ZCCHC17 -506457 sc-eQTL 6.62e-01 0.0653 0.149 0.073 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000134644 PUM1 -275466 sc-eQTL 8.59e-01 -0.0217 0.122 0.073 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000162511 LAPTM5 32751 sc-eQTL 1.63e-01 -0.136 0.0973 0.073 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000162512 SDC3 -118233 sc-eQTL 5.73e-01 0.0805 0.143 0.073 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000162517 PEF1 -854371 sc-eQTL 2.01e-01 0.166 0.129 0.073 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000168528 SERINC2 -619040 sc-eQTL 9.03e-01 -0.0181 0.148 0.073 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000284543 LINC01226 -715701 sc-eQTL 1.91e-01 0.184 0.14 0.073 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000287510 AL137857.1 58832 sc-eQTL 9.65e-01 -0.0062 0.141 0.073 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000060688 SNRNP40 -506263 sc-eQTL 2.22e-02 0.354 0.154 0.073 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000121753 ADGRB2 -974368 sc-eQTL 8.25e-01 0.0294 0.133 0.073 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000121766 ZCCHC17 -506457 sc-eQTL 5.83e-01 -0.0584 0.106 0.073 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000134644 PUM1 -275466 sc-eQTL 9.86e-01 0.002 0.117 0.073 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000162511 LAPTM5 32751 sc-eQTL 8.96e-03 -0.338 0.128 0.073 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000162517 PEF1 -854371 sc-eQTL 5.65e-01 0.0569 0.0988 0.073 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000186056 MATN1-AS1 72021 sc-eQTL 1.51e-01 -0.216 0.149 0.073 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000287510 AL137857.1 58832 sc-eQTL 6.60e-01 0.057 0.13 0.073 NK_CD56dim LOneK1K

Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF
ENSG00000142910 TINAGL1 -785960 pQTL 0.0403 -0.0547 0.0267 0.00103 0.0 0.091
ENSG00000162511 LAPTM5 32751 eQTL 0.0301 -0.0365 0.0168 0.0 0.0 0.0957

Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina
ENSG00000168528 \N -619040 4.89e-07 1.92e-07 6.57e-08 3.48e-07 1.01e-07 1.5e-07 3.25e-07 6.75e-08 1.75e-07 9.72e-08 2.07e-07 1.37e-07 3.95e-07 8.55e-08 9.12e-08 9.6e-08 8.42e-08 2.04e-07 9.71e-08 8.39e-08 1.24e-07 1.81e-07 1.73e-07 4.07e-08 3.98e-07 1.71e-07 1.37e-07 1.61e-07 1.4e-07 1.69e-07 1.26e-07 4.77e-08 4.34e-08 1.15e-07 3.08e-07 3.36e-08 9.77e-08 7.49e-08 5.54e-08 2.2e-08 8.75e-08 2.5e-07 3.99e-08 2.61e-08 3.34e-08 8.42e-09 7e-08 0.0 5.02e-08