logo

Genes within 1Mb (chr1:30787446:C:T):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD

Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000060688 SNRNP40 -509342 sc-eQTL 8.81e-01 0.0126 0.0844 0.276 B L1
ENSG00000121766 ZCCHC17 -509536 sc-eQTL 4.67e-01 0.0492 0.0675 0.276 B L1
ENSG00000134644 PUM1 -278545 sc-eQTL 9.33e-02 -0.095 0.0563 0.276 B L1
ENSG00000162510 MATN1 63861 sc-eQTL 1.07e-01 -0.096 0.0592 0.276 B L1
ENSG00000162511 LAPTM5 29672 sc-eQTL 1.99e-02 -0.108 0.0461 0.276 B L1
ENSG00000162517 PEF1 -857450 sc-eQTL 6.02e-01 -0.0368 0.0704 0.276 B L1
ENSG00000186056 MATN1-AS1 68942 sc-eQTL 7.42e-02 -0.0974 0.0543 0.276 B L1
ENSG00000287510 AL137857.1 55753 sc-eQTL 5.34e-01 0.0403 0.0647 0.276 B L1
ENSG00000060688 SNRNP40 -509342 sc-eQTL 8.53e-01 0.0135 0.0729 0.276 CD4T L1
ENSG00000121766 ZCCHC17 -509536 sc-eQTL 5.17e-01 0.037 0.0569 0.276 CD4T L1
ENSG00000134644 PUM1 -278545 sc-eQTL 1.78e-01 -0.0683 0.0505 0.276 CD4T L1
ENSG00000162511 LAPTM5 29672 sc-eQTL 5.15e-01 -0.0367 0.0562 0.276 CD4T L1
ENSG00000162517 PEF1 -857450 sc-eQTL 7.16e-01 0.0214 0.0588 0.276 CD4T L1
ENSG00000186056 MATN1-AS1 68942 sc-eQTL 4.77e-01 0.0358 0.0502 0.276 CD4T L1
ENSG00000287510 AL137857.1 55753 sc-eQTL 5.29e-01 0.0379 0.0602 0.276 CD4T L1
ENSG00000060688 SNRNP40 -509342 sc-eQTL 1.07e-01 0.154 0.0952 0.276 CD8T L1
ENSG00000121766 ZCCHC17 -509536 sc-eQTL 6.47e-01 0.0292 0.0637 0.276 CD8T L1
ENSG00000134644 PUM1 -278545 sc-eQTL 5.21e-01 0.036 0.0561 0.276 CD8T L1
ENSG00000162511 LAPTM5 29672 sc-eQTL 9.73e-01 0.00183 0.0545 0.276 CD8T L1
ENSG00000162517 PEF1 -857450 sc-eQTL 4.47e-01 -0.051 0.067 0.276 CD8T L1
ENSG00000186056 MATN1-AS1 68942 sc-eQTL 1.92e-01 -0.0833 0.0636 0.276 CD8T L1
ENSG00000287510 AL137857.1 55753 sc-eQTL 5.48e-01 -0.0483 0.0802 0.276 CD8T L1
ENSG00000060688 SNRNP40 -509342 sc-eQTL 7.40e-01 0.0288 0.0868 0.268 DC L1
ENSG00000121766 ZCCHC17 -509536 sc-eQTL 3.09e-02 0.221 0.102 0.268 DC L1
ENSG00000134644 PUM1 -278545 sc-eQTL 2.35e-01 -0.0955 0.0802 0.268 DC L1
ENSG00000162511 LAPTM5 29672 sc-eQTL 8.39e-01 -0.0117 0.0575 0.268 DC L1
ENSG00000162517 PEF1 -857450 sc-eQTL 6.55e-01 0.0416 0.0932 0.268 DC L1
ENSG00000168528 SERINC2 -622119 sc-eQTL 4.83e-01 -0.0666 0.0947 0.268 DC L1
ENSG00000284543 LINC01226 -718780 sc-eQTL 8.72e-01 -0.0101 0.0628 0.268 DC L1
ENSG00000287510 AL137857.1 55753 sc-eQTL 1.62e-02 -0.217 0.0896 0.268 DC L1
ENSG00000060688 SNRNP40 -509342 sc-eQTL 4.77e-01 0.0474 0.0665 0.276 Mono L1
ENSG00000121766 ZCCHC17 -509536 sc-eQTL 3.02e-01 0.0852 0.0824 0.276 Mono L1
ENSG00000134644 PUM1 -278545 sc-eQTL 1.80e-02 -0.125 0.0522 0.276 Mono L1
ENSG00000162511 LAPTM5 29672 sc-eQTL 9.72e-01 0.00171 0.0487 0.276 Mono L1
ENSG00000162512 SDC3 -121312 sc-eQTL 8.86e-01 0.0134 0.0936 0.276 Mono L1
ENSG00000162517 PEF1 -857450 sc-eQTL 3.84e-01 0.0571 0.0655 0.276 Mono L1
ENSG00000168528 SERINC2 -622119 sc-eQTL 7.88e-01 -0.0271 0.1 0.276 Mono L1
ENSG00000284543 LINC01226 -718780 sc-eQTL 4.57e-01 0.0658 0.0883 0.276 Mono L1
ENSG00000287510 AL137857.1 55753 sc-eQTL 8.47e-01 0.015 0.0773 0.276 Mono L1
ENSG00000060688 SNRNP40 -509342 sc-eQTL 1.34e-01 -0.139 0.0924 0.275 NK L1
ENSG00000121753 ADGRB2 -977447 sc-eQTL 3.58e-01 -0.0735 0.0798 0.275 NK L1
ENSG00000121766 ZCCHC17 -509536 sc-eQTL 8.16e-01 -0.0148 0.0636 0.275 NK L1
ENSG00000134644 PUM1 -278545 sc-eQTL 2.81e-01 -0.0719 0.0665 0.275 NK L1
ENSG00000162511 LAPTM5 29672 sc-eQTL 6.31e-01 0.037 0.0767 0.275 NK L1
ENSG00000162517 PEF1 -857450 sc-eQTL 7.56e-01 0.0174 0.056 0.275 NK L1
ENSG00000186056 MATN1-AS1 68942 sc-eQTL 1.74e-02 -0.204 0.0851 0.275 NK L1
ENSG00000287510 AL137857.1 55753 sc-eQTL 8.27e-01 0.0174 0.0796 0.275 NK L1
ENSG00000060688 SNRNP40 -509342 sc-eQTL 4.62e-01 -0.0509 0.069 0.276 Other_T L1
ENSG00000121766 ZCCHC17 -509536 sc-eQTL 5.33e-01 0.0461 0.0738 0.276 Other_T L1
ENSG00000134644 PUM1 -278545 sc-eQTL 5.17e-01 -0.0431 0.0664 0.276 Other_T L1
ENSG00000162511 LAPTM5 29672 sc-eQTL 2.23e-01 -0.0662 0.0543 0.276 Other_T L1
ENSG00000162517 PEF1 -857450 sc-eQTL 5.27e-01 0.0461 0.0727 0.276 Other_T L1
ENSG00000186056 MATN1-AS1 68942 sc-eQTL 5.60e-01 0.052 0.0891 0.276 Other_T L1
ENSG00000287510 AL137857.1 55753 sc-eQTL 4.55e-01 0.0694 0.0928 0.276 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000060688 SNRNP40 -509342 sc-eQTL 4.87e-01 0.0779 0.112 0.25 B_Activated L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -509536 sc-eQTL 8.87e-01 0.0161 0.113 0.25 B_Activated L2
ENSG00000134644 PUM1 -278545 sc-eQTL 2.15e-01 -0.13 0.104 0.25 B_Activated L2
ENSG00000162510 MATN1 63861 sc-eQTL 2.32e-01 -0.109 0.0912 0.25 B_Activated L2
ENSG00000162511 LAPTM5 29672 sc-eQTL 3.57e-01 -0.0589 0.0637 0.25 B_Activated L2
ENSG00000162517 PEF1 -857450 sc-eQTL 7.47e-01 0.0352 0.109 0.25 B_Activated L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 68942 sc-eQTL 8.57e-02 0.177 0.102 0.25 B_Activated L2
ENSG00000287510 AL137857.1 55753 sc-eQTL 9.97e-01 0.00039 0.0913 0.25 B_Activated L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -509342 sc-eQTL 3.97e-01 0.0886 0.104 0.277 B_Intermediate L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -509536 sc-eQTL 3.64e-02 0.182 0.0862 0.277 B_Intermediate L2
ENSG00000134644 PUM1 -278545 sc-eQTL 2.87e-01 -0.0876 0.082 0.277 B_Intermediate L2
ENSG00000162510 MATN1 63861 sc-eQTL 4.05e-01 0.0713 0.0854 0.277 B_Intermediate L2
ENSG00000162511 LAPTM5 29672 sc-eQTL 7.10e-02 -0.0945 0.0521 0.277 B_Intermediate L2
ENSG00000162517 PEF1 -857450 sc-eQTL 1.98e-01 -0.125 0.0971 0.277 B_Intermediate L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 68942 sc-eQTL 6.57e-01 0.0327 0.0737 0.277 B_Intermediate L2
ENSG00000287510 AL137857.1 55753 sc-eQTL 5.31e-01 -0.0517 0.0824 0.277 B_Intermediate L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -509342 sc-eQTL 3.09e-01 0.103 0.101 0.276 B_Memory L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -509536 sc-eQTL 4.79e-01 -0.0657 0.0927 0.276 B_Memory L2
ENSG00000134644 PUM1 -278545 sc-eQTL 2.56e-01 0.0917 0.0806 0.276 B_Memory L2
ENSG00000162510 MATN1 63861 sc-eQTL 7.30e-01 -0.0267 0.0773 0.276 B_Memory L2
ENSG00000162511 LAPTM5 29672 sc-eQTL 1.84e-01 -0.0909 0.0682 0.276 B_Memory L2
ENSG00000162517 PEF1 -857450 sc-eQTL 6.62e-01 -0.04 0.0915 0.276 B_Memory L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 68942 sc-eQTL 4.75e-02 -0.155 0.0777 0.276 B_Memory L2
ENSG00000287510 AL137857.1 55753 sc-eQTL 7.24e-01 -0.0325 0.0918 0.276 B_Memory L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -509342 sc-eQTL 2.90e-01 0.0983 0.0928 0.276 B_Naive1 L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -509536 sc-eQTL 6.10e-01 -0.0411 0.0803 0.276 B_Naive1 L2
ENSG00000134644 PUM1 -278545 sc-eQTL 1.41e-01 -0.104 0.0705 0.276 B_Naive1 L2
ENSG00000162510 MATN1 63861 sc-eQTL 2.64e-01 -0.0803 0.0717 0.276 B_Naive1 L2
ENSG00000162511 LAPTM5 29672 sc-eQTL 5.47e-02 -0.092 0.0476 0.276 B_Naive1 L2
ENSG00000162517 PEF1 -857450 sc-eQTL 1.69e-01 0.116 0.0843 0.276 B_Naive1 L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 68942 sc-eQTL 4.94e-02 -0.124 0.0625 0.276 B_Naive1 L2
ENSG00000287510 AL137857.1 55753 sc-eQTL 7.86e-01 -0.0212 0.0779 0.276 B_Naive1 L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -509342 sc-eQTL 2.99e-01 -0.102 0.0976 0.275 B_Naive2 L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -509536 sc-eQTL 5.86e-01 0.0441 0.0807 0.275 B_Naive2 L2
ENSG00000134644 PUM1 -278545 sc-eQTL 8.04e-01 -0.0196 0.079 0.275 B_Naive2 L2
ENSG00000162510 MATN1 63861 sc-eQTL 1.30e-01 -0.115 0.0755 0.275 B_Naive2 L2
ENSG00000162511 LAPTM5 29672 sc-eQTL 1.15e-01 -0.0811 0.0512 0.275 B_Naive2 L2
ENSG00000162517 PEF1 -857450 sc-eQTL 6.26e-01 0.0457 0.0937 0.275 B_Naive2 L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 68942 sc-eQTL 5.04e-02 -0.146 0.0743 0.275 B_Naive2 L2
ENSG00000287510 AL137857.1 55753 sc-eQTL 4.73e-01 -0.0582 0.0809 0.275 B_Naive2 L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -509342 sc-eQTL 5.30e-01 -0.0619 0.0982 0.268 CD4_CTL L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -509536 sc-eQTL 3.52e-01 0.09 0.0965 0.268 CD4_CTL L2
ENSG00000134644 PUM1 -278545 sc-eQTL 4.95e-01 0.0648 0.0947 0.268 CD4_CTL L2
ENSG00000162511 LAPTM5 29672 sc-eQTL 8.90e-01 -0.0117 0.0845 0.268 CD4_CTL L2
ENSG00000162517 PEF1 -857450 sc-eQTL 1.16e-01 0.136 0.0861 0.268 CD4_CTL L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 68942 sc-eQTL 4.78e-01 -0.0657 0.0923 0.268 CD4_CTL L2
ENSG00000287510 AL137857.1 55753 sc-eQTL 7.43e-01 0.0268 0.0816 0.268 CD4_CTL L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -509342 sc-eQTL 4.71e-01 -0.0552 0.0764 0.276 CD4_Naive L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -509536 sc-eQTL 2.59e-01 0.0766 0.0676 0.276 CD4_Naive L2
ENSG00000134644 PUM1 -278545 sc-eQTL 2.66e-01 -0.0602 0.054 0.276 CD4_Naive L2
ENSG00000162511 LAPTM5 29672 sc-eQTL 7.63e-01 -0.0175 0.058 0.276 CD4_Naive L2
ENSG00000162517 PEF1 -857450 sc-eQTL 8.12e-01 -0.0151 0.0636 0.276 CD4_Naive L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 68942 sc-eQTL 2.19e-01 0.0724 0.0587 0.276 CD4_Naive L2
ENSG00000287510 AL137857.1 55753 sc-eQTL 9.43e-01 -0.00484 0.0676 0.276 CD4_Naive L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -509342 sc-eQTL 3.75e-02 0.198 0.0947 0.276 CD4_TCM L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -509536 sc-eQTL 4.83e-01 -0.0542 0.0771 0.276 CD4_TCM L2
ENSG00000134644 PUM1 -278545 sc-eQTL 1.11e-01 -0.109 0.0679 0.276 CD4_TCM L2
ENSG00000162511 LAPTM5 29672 sc-eQTL 3.73e-01 -0.0505 0.0565 0.276 CD4_TCM L2
ENSG00000162517 PEF1 -857450 sc-eQTL 1.03e-02 0.194 0.0748 0.276 CD4_TCM L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 68942 sc-eQTL 6.23e-01 -0.0353 0.0718 0.276 CD4_TCM L2
ENSG00000287510 AL137857.1 55753 sc-eQTL 7.36e-01 -0.027 0.0801 0.276 CD4_TCM L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -509342 sc-eQTL 7.84e-01 0.0261 0.0953 0.276 CD4_TEM L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -509536 sc-eQTL 9.91e-01 -0.000993 0.0909 0.276 CD4_TEM L2
ENSG00000134644 PUM1 -278545 sc-eQTL 9.29e-01 -0.00675 0.0757 0.276 CD4_TEM L2
ENSG00000162511 LAPTM5 29672 sc-eQTL 4.28e-02 -0.154 0.0758 0.276 CD4_TEM L2
ENSG00000162517 PEF1 -857450 sc-eQTL 7.03e-01 -0.0327 0.0857 0.276 CD4_TEM L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 68942 sc-eQTL 2.18e-01 -0.11 0.0892 0.276 CD4_TEM L2
ENSG00000287510 AL137857.1 55753 sc-eQTL 7.81e-01 0.0245 0.0882 0.276 CD4_TEM L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -509342 sc-eQTL 2.10e-01 0.132 0.105 0.276 CD8_CTL L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -509536 sc-eQTL 3.79e-01 0.0713 0.0808 0.276 CD8_CTL L2
ENSG00000134644 PUM1 -278545 sc-eQTL 4.37e-01 -0.0612 0.0785 0.276 CD8_CTL L2
ENSG00000162511 LAPTM5 29672 sc-eQTL 1.91e-01 0.114 0.0867 0.276 CD8_CTL L2
ENSG00000162517 PEF1 -857450 sc-eQTL 1.50e-01 0.109 0.0754 0.276 CD8_CTL L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 68942 sc-eQTL 3.72e-01 -0.0818 0.0913 0.276 CD8_CTL L2
ENSG00000287510 AL137857.1 55753 sc-eQTL 6.35e-01 -0.0409 0.086 0.276 CD8_CTL L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -509342 sc-eQTL 5.41e-01 0.0584 0.0955 0.276 CD8_Naive L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -509536 sc-eQTL 9.71e-01 -0.00295 0.0825 0.276 CD8_Naive L2
ENSG00000134644 PUM1 -278545 sc-eQTL 9.67e-01 0.00279 0.0664 0.276 CD8_Naive L2
ENSG00000162511 LAPTM5 29672 sc-eQTL 3.54e-01 -0.059 0.0635 0.276 CD8_Naive L2
ENSG00000162517 PEF1 -857450 sc-eQTL 2.55e-01 -0.101 0.0881 0.276 CD8_Naive L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 68942 sc-eQTL 7.78e-01 -0.0224 0.0794 0.276 CD8_Naive L2
ENSG00000287510 AL137857.1 55753 sc-eQTL 8.28e-01 -0.0188 0.0864 0.276 CD8_Naive L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -509342 sc-eQTL 1.37e-01 0.157 0.105 0.28 CD8_TCM L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -509536 sc-eQTL 4.17e-01 -0.0788 0.0968 0.28 CD8_TCM L2
ENSG00000134644 PUM1 -278545 sc-eQTL 7.21e-01 -0.0326 0.0912 0.28 CD8_TCM L2
ENSG00000162511 LAPTM5 29672 sc-eQTL 7.17e-01 0.0347 0.0954 0.28 CD8_TCM L2
ENSG00000162517 PEF1 -857450 sc-eQTL 8.54e-02 -0.167 0.0968 0.28 CD8_TCM L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 68942 sc-eQTL 1.14e-01 0.14 0.0878 0.28 CD8_TCM L2
ENSG00000287510 AL137857.1 55753 sc-eQTL 1.56e-01 -0.126 0.0888 0.28 CD8_TCM L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -509342 sc-eQTL 5.55e-01 -0.0603 0.102 0.272 CD8_TEM L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -509536 sc-eQTL 5.78e-01 0.0544 0.0976 0.272 CD8_TEM L2
ENSG00000134644 PUM1 -278545 sc-eQTL 7.33e-01 0.0341 0.0998 0.272 CD8_TEM L2
ENSG00000162511 LAPTM5 29672 sc-eQTL 7.96e-01 0.0243 0.0939 0.272 CD8_TEM L2
ENSG00000162517 PEF1 -857450 sc-eQTL 8.84e-01 0.0129 0.0884 0.272 CD8_TEM L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 68942 sc-eQTL 4.79e-01 0.069 0.0973 0.272 CD8_TEM L2
ENSG00000287510 AL137857.1 55753 sc-eQTL 1.55e-01 -0.125 0.0877 0.272 CD8_TEM L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -509342 sc-eQTL 6.50e-02 -0.186 0.1 0.275 MAIT L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -509536 sc-eQTL 1.92e-02 0.208 0.0883 0.275 MAIT L2
ENSG00000134644 PUM1 -278545 sc-eQTL 5.44e-01 -0.052 0.0857 0.275 MAIT L2
ENSG00000162511 LAPTM5 29672 sc-eQTL 8.98e-01 -0.0104 0.0809 0.275 MAIT L2
ENSG00000162517 PEF1 -857450 sc-eQTL 6.40e-01 0.0416 0.0889 0.275 MAIT L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 68942 sc-eQTL 5.68e-01 0.0516 0.09 0.275 MAIT L2
ENSG00000287510 AL137857.1 55753 sc-eQTL 4.99e-01 0.0628 0.0928 0.275 MAIT L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -509342 sc-eQTL 8.14e-01 0.0247 0.105 0.276 NK_CD56bright L2
ENSG00000121753 ADGRB2 -977447 sc-eQTL 3.33e-01 0.0795 0.0819 0.276 NK_CD56bright L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -509536 sc-eQTL 5.19e-01 -0.0572 0.0885 0.276 NK_CD56bright L2
ENSG00000134644 PUM1 -278545 sc-eQTL 5.47e-01 -0.056 0.0929 0.276 NK_CD56bright L2
ENSG00000162511 LAPTM5 29672 sc-eQTL 1.19e-01 0.143 0.0912 0.276 NK_CD56bright L2
ENSG00000162517 PEF1 -857450 sc-eQTL 9.88e-01 -0.00137 0.0891 0.276 NK_CD56bright L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 68942 sc-eQTL 9.53e-01 -0.00548 0.0922 0.276 NK_CD56bright L2
ENSG00000287510 AL137857.1 55753 sc-eQTL 8.70e-01 0.0148 0.0908 0.276 NK_CD56bright L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -509342 sc-eQTL 4.42e-01 -0.0751 0.0976 0.274 NK_CD56dim L2
ENSG00000121753 ADGRB2 -977447 sc-eQTL 1.03e-01 -0.14 0.0854 0.274 NK_CD56dim L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -509536 sc-eQTL 7.13e-01 0.0266 0.0722 0.274 NK_CD56dim L2
ENSG00000134644 PUM1 -278545 sc-eQTL 4.97e-01 -0.0504 0.074 0.274 NK_CD56dim L2
ENSG00000162511 LAPTM5 29672 sc-eQTL 7.13e-01 -0.0291 0.079 0.274 NK_CD56dim L2
ENSG00000162517 PEF1 -857450 sc-eQTL 9.00e-01 -0.00886 0.0703 0.274 NK_CD56dim L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 68942 sc-eQTL 9.70e-02 -0.164 0.0984 0.274 NK_CD56dim L2
ENSG00000287510 AL137857.1 55753 sc-eQTL 9.35e-01 0.00662 0.0817 0.274 NK_CD56dim L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -509342 sc-eQTL 3.68e-01 -0.0952 0.105 0.279 NK_HLA L2
ENSG00000121753 ADGRB2 -977447 sc-eQTL 1.78e-01 -0.113 0.0835 0.279 NK_HLA L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -509536 sc-eQTL 7.64e-01 -0.0283 0.0943 0.279 NK_HLA L2
ENSG00000134644 PUM1 -278545 sc-eQTL 2.65e-01 -0.102 0.0916 0.279 NK_HLA L2
ENSG00000162511 LAPTM5 29672 sc-eQTL 9.09e-01 -0.01 0.0877 0.279 NK_HLA L2
ENSG00000162517 PEF1 -857450 sc-eQTL 4.50e-01 0.0748 0.0987 0.279 NK_HLA L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 68942 sc-eQTL 1.61e-01 -0.131 0.0928 0.279 NK_HLA L2
ENSG00000287510 AL137857.1 55753 sc-eQTL 2.81e-01 -0.0971 0.09 0.279 NK_HLA L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -509342 sc-eQTL 5.12e-01 -0.0625 0.095 0.274 NK_cytokine L2
ENSG00000121753 ADGRB2 -977447 sc-eQTL 8.34e-01 0.018 0.0859 0.274 NK_cytokine L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -509536 sc-eQTL 4.52e-01 -0.0559 0.0741 0.274 NK_cytokine L2
ENSG00000134644 PUM1 -278545 sc-eQTL 6.27e-01 0.0391 0.0802 0.274 NK_cytokine L2
ENSG00000162511 LAPTM5 29672 sc-eQTL 5.15e-01 0.0576 0.0883 0.274 NK_cytokine L2
ENSG00000162517 PEF1 -857450 sc-eQTL 8.29e-01 0.0163 0.0753 0.274 NK_cytokine L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 68942 sc-eQTL 2.74e-01 -0.102 0.0934 0.274 NK_cytokine L2
ENSG00000287510 AL137857.1 55753 sc-eQTL 4.92e-01 -0.0599 0.0871 0.274 NK_cytokine L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -509342 sc-eQTL 6.49e-01 0.0503 0.11 0.252 PB L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -509536 sc-eQTL 9.24e-01 -0.0122 0.128 0.252 PB L2
ENSG00000134644 PUM1 -278545 sc-eQTL 4.97e-02 0.216 0.109 0.252 PB L2
ENSG00000162510 MATN1 63861 sc-eQTL 9.57e-01 0.0056 0.103 0.252 PB L2
ENSG00000162511 LAPTM5 29672 sc-eQTL 5.02e-01 0.0497 0.0737 0.252 PB L2
ENSG00000162517 PEF1 -857450 sc-eQTL 1.37e-01 0.169 0.113 0.252 PB L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 68942 sc-eQTL 8.05e-01 0.025 0.101 0.252 PB L2
ENSG00000287510 AL137857.1 55753 sc-eQTL 7.47e-01 0.0349 0.108 0.252 PB L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -509342 sc-eQTL 1.48e-01 0.11 0.0754 0.274 Pro_T L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -509536 sc-eQTL 6.18e-01 -0.048 0.0961 0.274 Pro_T L2
ENSG00000134644 PUM1 -278545 sc-eQTL 6.15e-01 -0.0451 0.0897 0.274 Pro_T L2
ENSG00000162511 LAPTM5 29672 sc-eQTL 6.95e-01 0.0252 0.0643 0.274 Pro_T L2
ENSG00000162517 PEF1 -857450 sc-eQTL 8.74e-03 0.246 0.0929 0.274 Pro_T L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 68942 sc-eQTL 5.72e-01 -0.0509 0.0899 0.274 Pro_T L2
ENSG00000287510 AL137857.1 55753 sc-eQTL 9.63e-01 0.00389 0.0827 0.274 Pro_T L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -509342 sc-eQTL 8.68e-01 0.0163 0.0977 0.276 Treg L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -509536 sc-eQTL 8.05e-01 0.0234 0.0946 0.276 Treg L2
ENSG00000134644 PUM1 -278545 sc-eQTL 3.81e-02 -0.156 0.0749 0.276 Treg L2
ENSG00000162511 LAPTM5 29672 sc-eQTL 4.99e-01 -0.0586 0.0866 0.276 Treg L2
ENSG00000162517 PEF1 -857450 sc-eQTL 9.22e-01 -0.00919 0.0936 0.276 Treg L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 68942 sc-eQTL 3.62e-01 0.0805 0.0881 0.276 Treg L2
ENSG00000287510 AL137857.1 55753 sc-eQTL 9.88e-01 -0.00138 0.0882 0.276 Treg L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -509342 sc-eQTL 5.69e-01 -0.0574 0.101 0.268 cDC L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -509536 sc-eQTL 1.58e-01 0.154 0.108 0.268 cDC L2
ENSG00000134644 PUM1 -278545 sc-eQTL 1.77e-01 -0.126 0.0932 0.268 cDC L2
ENSG00000162511 LAPTM5 29672 sc-eQTL 8.53e-01 -0.0122 0.0656 0.268 cDC L2
ENSG00000162517 PEF1 -857450 sc-eQTL 9.13e-01 0.0105 0.0951 0.268 cDC L2
ENSG00000168528 SERINC2 -622119 sc-eQTL 6.98e-01 -0.0328 0.0843 0.268 cDC L2
ENSG00000284543 LINC01226 -718780 sc-eQTL 2.58e-01 0.0936 0.0825 0.268 cDC L2
ENSG00000287510 AL137857.1 55753 sc-eQTL 2.94e-02 -0.193 0.088 0.268 cDC L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -509342 sc-eQTL 6.51e-01 0.0366 0.0807 0.276 cMono_IL1B L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -509536 sc-eQTL 8.20e-01 0.0205 0.0901 0.276 cMono_IL1B L2
ENSG00000134644 PUM1 -278545 sc-eQTL 1.91e-02 -0.142 0.0602 0.276 cMono_IL1B L2
ENSG00000162511 LAPTM5 29672 sc-eQTL 4.58e-01 0.0397 0.0534 0.276 cMono_IL1B L2
ENSG00000162512 SDC3 -121312 sc-eQTL 7.86e-01 0.0275 0.101 0.276 cMono_IL1B L2
ENSG00000162517 PEF1 -857450 sc-eQTL 9.87e-01 -0.00135 0.0824 0.276 cMono_IL1B L2
ENSG00000168528 SERINC2 -622119 sc-eQTL 5.23e-01 -0.0652 0.102 0.276 cMono_IL1B L2
ENSG00000284543 LINC01226 -718780 sc-eQTL 6.79e-01 0.0374 0.0902 0.276 cMono_IL1B L2
ENSG00000287510 AL137857.1 55753 sc-eQTL 1.23e-01 0.13 0.0837 0.276 cMono_IL1B L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -509342 sc-eQTL 8.45e-01 -0.0166 0.0849 0.276 cMono_S100A L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -509536 sc-eQTL 4.26e-01 0.0798 0.1 0.276 cMono_S100A L2
ENSG00000134644 PUM1 -278545 sc-eQTL 3.18e-01 -0.0724 0.0723 0.276 cMono_S100A L2
ENSG00000162511 LAPTM5 29672 sc-eQTL 7.59e-01 -0.0171 0.0557 0.276 cMono_S100A L2
ENSG00000162512 SDC3 -121312 sc-eQTL 9.69e-01 0.00371 0.0962 0.276 cMono_S100A L2
ENSG00000162517 PEF1 -857450 sc-eQTL 2.89e-01 0.092 0.0866 0.276 cMono_S100A L2
ENSG00000168528 SERINC2 -622119 sc-eQTL 3.99e-01 -0.086 0.102 0.276 cMono_S100A L2
ENSG00000284543 LINC01226 -718780 sc-eQTL 5.03e-01 0.0554 0.0827 0.276 cMono_S100A L2
ENSG00000287510 AL137857.1 55753 sc-eQTL 8.18e-01 -0.0192 0.0831 0.276 cMono_S100A L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -509342 sc-eQTL 5.59e-01 0.0729 0.124 0.288 gdT L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -509536 sc-eQTL 5.25e-01 -0.0682 0.107 0.288 gdT L2
ENSG00000134644 PUM1 -278545 sc-eQTL 8.47e-01 0.0214 0.11 0.288 gdT L2
ENSG00000162511 LAPTM5 29672 sc-eQTL 3.97e-02 -0.245 0.118 0.288 gdT L2
ENSG00000162517 PEF1 -857450 sc-eQTL 5.73e-01 -0.0619 0.11 0.288 gdT L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 68942 sc-eQTL 1.10e-01 0.176 0.11 0.288 gdT L2
ENSG00000287510 AL137857.1 55753 sc-eQTL 6.16e-01 0.0539 0.107 0.288 gdT L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -509342 sc-eQTL 4.18e-01 0.0752 0.0926 0.273 intMono L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -509536 sc-eQTL 7.64e-01 0.03 0.0997 0.273 intMono L2
ENSG00000134644 PUM1 -278545 sc-eQTL 3.96e-01 -0.0719 0.0845 0.273 intMono L2
ENSG00000162511 LAPTM5 29672 sc-eQTL 7.13e-01 -0.0245 0.0664 0.273 intMono L2
ENSG00000162512 SDC3 -121312 sc-eQTL 3.12e-01 0.0919 0.0907 0.273 intMono L2
ENSG00000162517 PEF1 -857450 sc-eQTL 7.23e-01 -0.0339 0.0955 0.273 intMono L2
ENSG00000168528 SERINC2 -622119 sc-eQTL 8.58e-01 -0.017 0.0951 0.273 intMono L2
ENSG00000284543 LINC01226 -718780 sc-eQTL 6.56e-01 0.0402 0.0901 0.273 intMono L2
ENSG00000287510 AL137857.1 55753 sc-eQTL 7.97e-01 -0.0232 0.0902 0.273 intMono L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -509342 sc-eQTL 1.57e-01 0.124 0.087 0.267 ncMono L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -509536 sc-eQTL 8.45e-01 -0.0183 0.0932 0.267 ncMono L2
ENSG00000134644 PUM1 -278545 sc-eQTL 7.12e-02 -0.137 0.0756 0.267 ncMono L2
ENSG00000162511 LAPTM5 29672 sc-eQTL 9.47e-01 -0.0046 0.0692 0.267 ncMono L2
ENSG00000162512 SDC3 -121312 sc-eQTL 7.08e-01 0.0291 0.0775 0.267 ncMono L2
ENSG00000162517 PEF1 -857450 sc-eQTL 8.75e-01 0.014 0.0889 0.267 ncMono L2
ENSG00000168528 SERINC2 -622119 sc-eQTL 6.73e-01 -0.0358 0.0846 0.267 ncMono L2
ENSG00000284543 LINC01226 -718780 sc-eQTL 4.08e-02 -0.172 0.0837 0.267 ncMono L2
ENSG00000287510 AL137857.1 55753 sc-eQTL 4.81e-03 -0.245 0.0859 0.267 ncMono L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -509342 sc-eQTL 2.30e-01 0.127 0.105 0.266 pDC L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -509536 sc-eQTL 2.37e-02 0.261 0.114 0.266 pDC L2
ENSG00000134644 PUM1 -278545 sc-eQTL 7.13e-01 0.0354 0.0963 0.266 pDC L2
ENSG00000162511 LAPTM5 29672 sc-eQTL 8.84e-01 0.0131 0.0896 0.266 pDC L2
ENSG00000162517 PEF1 -857450 sc-eQTL 6.35e-01 0.0553 0.116 0.266 pDC L2
ENSG00000168528 SERINC2 -622119 sc-eQTL 7.57e-01 0.0337 0.109 0.266 pDC L2
ENSG00000284543 LINC01226 -718780 sc-eQTL 8.01e-01 0.0213 0.0843 0.266 pDC L2
ENSG00000287510 AL137857.1 55753 sc-eQTL 6.97e-01 0.0386 0.0991 0.266 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000060688 SNRNP40 -509342 sc-eQTL 2.85e-01 0.106 0.0987 0.276 B_Memory LOneK1K
ENSG00000121766 ZCCHC17 -509536 sc-eQTL 1.49e-01 0.119 0.0819 0.276 B_Memory LOneK1K
ENSG00000134644 PUM1 -278545 sc-eQTL 8.29e-01 -0.0158 0.073 0.276 B_Memory LOneK1K
ENSG00000162510 MATN1 63861 sc-eQTL 7.73e-01 -0.0241 0.0832 0.276 B_Memory LOneK1K
ENSG00000162511 LAPTM5 29672 sc-eQTL 5.54e-02 -0.0998 0.0518 0.276 B_Memory LOneK1K
ENSG00000162517 PEF1 -857450 sc-eQTL 1.93e-01 -0.113 0.0862 0.276 B_Memory LOneK1K
ENSG00000186056 MATN1-AS1 68942 sc-eQTL 8.40e-01 -0.014 0.0691 0.276 B_Memory LOneK1K
ENSG00000287510 AL137857.1 55753 sc-eQTL 9.08e-01 0.00869 0.0754 0.276 B_Memory LOneK1K
ENSG00000060688 SNRNP40 -509342 sc-eQTL 7.38e-01 -0.0301 0.0899 0.276 B_Naive LOneK1K
ENSG00000121766 ZCCHC17 -509536 sc-eQTL 9.23e-01 -0.00685 0.0711 0.276 B_Naive LOneK1K
ENSG00000134644 PUM1 -278545 sc-eQTL 7.82e-02 -0.118 0.0667 0.276 B_Naive LOneK1K
ENSG00000162510 MATN1 63861 sc-eQTL 5.74e-02 -0.123 0.0642 0.276 B_Naive LOneK1K
ENSG00000162511 LAPTM5 29672 sc-eQTL 7.89e-02 -0.0799 0.0452 0.276 B_Naive LOneK1K
ENSG00000162517 PEF1 -857450 sc-eQTL 2.13e-01 0.104 0.0829 0.276 B_Naive LOneK1K
ENSG00000186056 MATN1-AS1 68942 sc-eQTL 2.48e-02 -0.131 0.0582 0.276 B_Naive LOneK1K
ENSG00000287510 AL137857.1 55753 sc-eQTL 9.84e-01 0.00137 0.0699 0.276 B_Naive LOneK1K
ENSG00000060688 SNRNP40 -509342 sc-eQTL 5.98e-01 0.0405 0.0768 0.276 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000121766 ZCCHC17 -509536 sc-eQTL 4.50e-01 0.0657 0.0869 0.276 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000134644 PUM1 -278545 sc-eQTL 1.33e-02 -0.137 0.0547 0.276 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000162511 LAPTM5 29672 sc-eQTL 7.76e-01 0.0139 0.0488 0.276 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000162512 SDC3 -121312 sc-eQTL 7.74e-01 -0.0286 0.0995 0.276 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000162517 PEF1 -857450 sc-eQTL 4.18e-01 0.0567 0.0699 0.276 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000168528 SERINC2 -622119 sc-eQTL 5.96e-01 -0.0544 0.102 0.276 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000284543 LINC01226 -718780 sc-eQTL 3.38e-01 0.0805 0.0838 0.276 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000287510 AL137857.1 55753 sc-eQTL 2.52e-01 0.09 0.0783 0.276 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000060688 SNRNP40 -509342 sc-eQTL 2.68e-01 0.0911 0.082 0.274 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000121766 ZCCHC17 -509536 sc-eQTL 8.08e-01 0.0219 0.0899 0.274 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000134644 PUM1 -278545 sc-eQTL 9.45e-02 -0.123 0.0732 0.274 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000162511 LAPTM5 29672 sc-eQTL 8.53e-01 -0.0109 0.0589 0.274 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000162512 SDC3 -121312 sc-eQTL 3.15e-01 0.0864 0.0859 0.274 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000162517 PEF1 -857450 sc-eQTL 5.42e-01 -0.0477 0.0782 0.274 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000168528 SERINC2 -622119 sc-eQTL 7.15e-01 -0.0326 0.0893 0.274 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000284543 LINC01226 -718780 sc-eQTL 9.97e-01 0.000319 0.0847 0.274 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000287510 AL137857.1 55753 sc-eQTL 7.52e-02 -0.151 0.0842 0.274 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000060688 SNRNP40 -509342 sc-eQTL 1.64e-01 -0.13 0.093 0.274 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000121753 ADGRB2 -977447 sc-eQTL 3.09e-01 -0.081 0.0794 0.274 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000121766 ZCCHC17 -509536 sc-eQTL 9.45e-01 -0.00439 0.0638 0.274 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000134644 PUM1 -278545 sc-eQTL 3.95e-01 -0.0595 0.0698 0.274 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000162511 LAPTM5 29672 sc-eQTL 8.29e-01 0.0169 0.0781 0.274 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000162517 PEF1 -857450 sc-eQTL 6.70e-01 0.0253 0.0593 0.274 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000186056 MATN1-AS1 68942 sc-eQTL 1.30e-02 -0.222 0.0888 0.274 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000287510 AL137857.1 55753 sc-eQTL 8.68e-01 -0.013 0.0778 0.274 NK_CD56dim LOneK1K

Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF
ENSG00000162511 LAPTM5 29672 eQTL 0.0147 0.0285 0.0117 0.0 0.0 0.264
ENSG00000162512 SDC3 -121312 eQTL 0.0474 0.0571 0.0288 0.0 0.0 0.264
ENSG00000168528 SERINC2 -622119 eQTL 0.0231 -0.103 0.0451 0.0 0.0 0.264

Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina