logo

Genes within 1Mb (chr1:30787116:G:C):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD

Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000060688 SNRNP40 -509672 sc-eQTL 8.64e-01 0.028 0.163 0.051 B L1
ENSG00000121766 ZCCHC17 -509866 sc-eQTL 1.14e-01 0.206 0.13 0.051 B L1
ENSG00000134644 PUM1 -278875 sc-eQTL 2.87e-01 -0.117 0.109 0.051 B L1
ENSG00000162510 MATN1 63531 sc-eQTL 3.73e-01 0.103 0.115 0.051 B L1
ENSG00000162511 LAPTM5 29342 sc-eQTL 6.33e-01 -0.0432 0.0903 0.051 B L1
ENSG00000162517 PEF1 -857780 sc-eQTL 9.93e-01 0.00119 0.136 0.051 B L1
ENSG00000186056 MATN1-AS1 68612 sc-eQTL 7.16e-01 -0.0385 0.106 0.051 B L1
ENSG00000287510 AL137857.1 55423 sc-eQTL 2.54e-01 0.143 0.125 0.051 B L1
ENSG00000060688 SNRNP40 -509672 sc-eQTL 5.86e-01 0.0775 0.142 0.051 CD4T L1
ENSG00000121766 ZCCHC17 -509866 sc-eQTL 7.09e-01 0.0415 0.111 0.051 CD4T L1
ENSG00000134644 PUM1 -278875 sc-eQTL 7.47e-01 0.0319 0.099 0.051 CD4T L1
ENSG00000162511 LAPTM5 29342 sc-eQTL 2.78e-01 -0.119 0.109 0.051 CD4T L1
ENSG00000162517 PEF1 -857780 sc-eQTL 4.88e-01 -0.0797 0.115 0.051 CD4T L1
ENSG00000186056 MATN1-AS1 68612 sc-eQTL 1.44e-01 -0.143 0.0976 0.051 CD4T L1
ENSG00000287510 AL137857.1 55423 sc-eQTL 2.47e-01 0.136 0.117 0.051 CD4T L1
ENSG00000060688 SNRNP40 -509672 sc-eQTL 4.85e-01 -0.129 0.184 0.051 CD8T L1
ENSG00000121766 ZCCHC17 -509866 sc-eQTL 8.94e-01 -0.0164 0.123 0.051 CD8T L1
ENSG00000134644 PUM1 -278875 sc-eQTL 3.14e-01 -0.109 0.108 0.051 CD8T L1
ENSG00000162511 LAPTM5 29342 sc-eQTL 9.06e-01 0.0125 0.105 0.051 CD8T L1
ENSG00000162517 PEF1 -857780 sc-eQTL 8.58e-01 -0.0231 0.129 0.051 CD8T L1
ENSG00000186056 MATN1-AS1 68612 sc-eQTL 9.33e-01 -0.0104 0.123 0.051 CD8T L1
ENSG00000287510 AL137857.1 55423 sc-eQTL 1.56e-01 0.219 0.154 0.051 CD8T L1
ENSG00000060688 SNRNP40 -509672 sc-eQTL 8.41e-02 0.222 0.128 0.051 Mono L1
ENSG00000121766 ZCCHC17 -509866 sc-eQTL 8.92e-02 0.271 0.159 0.051 Mono L1
ENSG00000134644 PUM1 -278875 sc-eQTL 5.69e-01 -0.0584 0.102 0.051 Mono L1
ENSG00000162511 LAPTM5 29342 sc-eQTL 1.86e-01 0.125 0.094 0.051 Mono L1
ENSG00000162512 SDC3 -121642 sc-eQTL 8.26e-01 -0.0399 0.181 0.051 Mono L1
ENSG00000162517 PEF1 -857780 sc-eQTL 9.26e-01 -0.0119 0.127 0.051 Mono L1
ENSG00000168528 SERINC2 -622449 sc-eQTL 6.67e-01 0.0837 0.195 0.051 Mono L1
ENSG00000284543 LINC01226 -719110 sc-eQTL 9.12e-01 -0.019 0.171 0.051 Mono L1
ENSG00000287510 AL137857.1 55423 sc-eQTL 7.32e-01 -0.0514 0.15 0.051 Mono L1
ENSG00000060688 SNRNP40 -509672 sc-eQTL 6.62e-01 0.078 0.178 0.052 NK L1
ENSG00000121753 ADGRB2 -977777 sc-eQTL 5.25e-01 0.0976 0.153 0.052 NK L1
ENSG00000121766 ZCCHC17 -509866 sc-eQTL 9.68e-01 0.00495 0.122 0.052 NK L1
ENSG00000134644 PUM1 -278875 sc-eQTL 2.88e-01 -0.136 0.128 0.052 NK L1
ENSG00000162511 LAPTM5 29342 sc-eQTL 4.71e-01 -0.106 0.147 0.052 NK L1
ENSG00000162517 PEF1 -857780 sc-eQTL 8.50e-01 0.0203 0.107 0.052 NK L1
ENSG00000186056 MATN1-AS1 68612 sc-eQTL 8.02e-01 0.0415 0.165 0.052 NK L1
ENSG00000287510 AL137857.1 55423 sc-eQTL 7.97e-01 -0.0393 0.153 0.052 NK L1
ENSG00000060688 SNRNP40 -509672 sc-eQTL 7.46e-01 -0.0433 0.134 0.051 Other_T L1
ENSG00000121766 ZCCHC17 -509866 sc-eQTL 5.67e-01 0.0819 0.143 0.051 Other_T L1
ENSG00000134644 PUM1 -278875 sc-eQTL 3.07e-01 -0.131 0.128 0.051 Other_T L1
ENSG00000162511 LAPTM5 29342 sc-eQTL 3.16e-01 -0.106 0.105 0.051 Other_T L1
ENSG00000162517 PEF1 -857780 sc-eQTL 1.22e-01 0.217 0.14 0.051 Other_T L1
ENSG00000186056 MATN1-AS1 68612 sc-eQTL 7.83e-01 -0.0476 0.172 0.051 Other_T L1
ENSG00000287510 AL137857.1 55423 sc-eQTL 3.12e-01 -0.182 0.179 0.051 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000060688 SNRNP40 -509672 sc-eQTL 8.29e-01 -0.0461 0.214 0.051 B_Activated L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -509866 sc-eQTL 7.73e-01 -0.0622 0.215 0.051 B_Activated L2
ENSG00000134644 PUM1 -278875 sc-eQTL 8.96e-01 0.0262 0.2 0.051 B_Activated L2
ENSG00000162510 MATN1 63531 sc-eQTL 6.37e-01 0.0827 0.175 0.051 B_Activated L2
ENSG00000162511 LAPTM5 29342 sc-eQTL 5.70e-01 -0.0693 0.122 0.051 B_Activated L2
ENSG00000162517 PEF1 -857780 sc-eQTL 7.81e-01 0.0578 0.208 0.051 B_Activated L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 68612 sc-eQTL 4.69e-01 0.143 0.197 0.051 B_Activated L2
ENSG00000287510 AL137857.1 55423 sc-eQTL 3.88e-01 -0.151 0.174 0.051 B_Activated L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -509672 sc-eQTL 6.12e-01 0.101 0.2 0.052 B_Intermediate L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -509866 sc-eQTL 8.85e-01 0.024 0.166 0.052 B_Intermediate L2
ENSG00000134644 PUM1 -278875 sc-eQTL 2.85e-01 -0.168 0.157 0.052 B_Intermediate L2
ENSG00000162510 MATN1 63531 sc-eQTL 4.53e-02 0.326 0.162 0.052 B_Intermediate L2
ENSG00000162511 LAPTM5 29342 sc-eQTL 3.22e-01 -0.0994 0.1 0.052 B_Intermediate L2
ENSG00000162517 PEF1 -857780 sc-eQTL 7.65e-01 -0.0557 0.186 0.052 B_Intermediate L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 68612 sc-eQTL 3.81e-01 -0.123 0.14 0.052 B_Intermediate L2
ENSG00000287510 AL137857.1 55423 sc-eQTL 8.80e-01 -0.0238 0.157 0.052 B_Intermediate L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -509672 sc-eQTL 8.65e-01 -0.0328 0.193 0.052 B_Memory L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -509866 sc-eQTL 4.40e-01 0.137 0.177 0.052 B_Memory L2
ENSG00000134644 PUM1 -278875 sc-eQTL 2.92e-01 0.163 0.154 0.052 B_Memory L2
ENSG00000162510 MATN1 63531 sc-eQTL 3.38e-01 -0.142 0.147 0.052 B_Memory L2
ENSG00000162511 LAPTM5 29342 sc-eQTL 1.70e-01 0.18 0.13 0.052 B_Memory L2
ENSG00000162517 PEF1 -857780 sc-eQTL 1.86e-01 0.231 0.174 0.052 B_Memory L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 68612 sc-eQTL 5.56e-01 0.0883 0.15 0.052 B_Memory L2
ENSG00000287510 AL137857.1 55423 sc-eQTL 4.39e-01 0.136 0.175 0.052 B_Memory L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -509672 sc-eQTL 8.07e-01 0.044 0.18 0.051 B_Naive1 L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -509866 sc-eQTL 2.86e-02 0.338 0.153 0.051 B_Naive1 L2
ENSG00000134644 PUM1 -278875 sc-eQTL 8.90e-01 0.019 0.137 0.051 B_Naive1 L2
ENSG00000162510 MATN1 63531 sc-eQTL 7.62e-01 0.042 0.139 0.051 B_Naive1 L2
ENSG00000162511 LAPTM5 29342 sc-eQTL 6.46e-01 -0.0427 0.0927 0.051 B_Naive1 L2
ENSG00000162517 PEF1 -857780 sc-eQTL 5.79e-01 -0.0907 0.163 0.051 B_Naive1 L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 68612 sc-eQTL 4.19e-01 -0.0985 0.122 0.051 B_Naive1 L2
ENSG00000287510 AL137857.1 55423 sc-eQTL 3.08e-01 0.153 0.15 0.051 B_Naive1 L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -509672 sc-eQTL 7.87e-01 0.0508 0.188 0.052 B_Naive2 L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -509866 sc-eQTL 2.65e-01 -0.173 0.155 0.052 B_Naive2 L2
ENSG00000134644 PUM1 -278875 sc-eQTL 2.12e-02 -0.348 0.15 0.052 B_Naive2 L2
ENSG00000162510 MATN1 63531 sc-eQTL 2.82e-01 -0.157 0.145 0.052 B_Naive2 L2
ENSG00000162511 LAPTM5 29342 sc-eQTL 9.35e-01 -0.00807 0.0989 0.052 B_Naive2 L2
ENSG00000162517 PEF1 -857780 sc-eQTL 9.25e-01 0.017 0.18 0.052 B_Naive2 L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 68612 sc-eQTL 9.25e-01 -0.0135 0.144 0.052 B_Naive2 L2
ENSG00000287510 AL137857.1 55423 sc-eQTL 8.85e-01 -0.0225 0.156 0.052 B_Naive2 L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -509672 sc-eQTL 4.78e-01 0.129 0.182 0.055 CD4_CTL L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -509866 sc-eQTL 8.73e-01 -0.0286 0.179 0.055 CD4_CTL L2
ENSG00000134644 PUM1 -278875 sc-eQTL 4.37e-01 -0.137 0.176 0.055 CD4_CTL L2
ENSG00000162511 LAPTM5 29342 sc-eQTL 9.21e-01 0.0156 0.157 0.055 CD4_CTL L2
ENSG00000162517 PEF1 -857780 sc-eQTL 5.42e-01 -0.0981 0.161 0.055 CD4_CTL L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 68612 sc-eQTL 4.76e-01 0.122 0.171 0.055 CD4_CTL L2
ENSG00000287510 AL137857.1 55423 sc-eQTL 2.61e-01 0.17 0.151 0.055 CD4_CTL L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -509672 sc-eQTL 3.47e-01 0.14 0.148 0.051 CD4_Naive L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -509866 sc-eQTL 8.86e-01 0.0189 0.132 0.051 CD4_Naive L2
ENSG00000134644 PUM1 -278875 sc-eQTL 3.25e-01 0.103 0.105 0.051 CD4_Naive L2
ENSG00000162511 LAPTM5 29342 sc-eQTL 3.07e-01 -0.115 0.112 0.051 CD4_Naive L2
ENSG00000162517 PEF1 -857780 sc-eQTL 8.92e-01 0.0167 0.123 0.051 CD4_Naive L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 68612 sc-eQTL 1.68e-01 -0.157 0.114 0.051 CD4_Naive L2
ENSG00000287510 AL137857.1 55423 sc-eQTL 2.20e-01 0.161 0.131 0.051 CD4_Naive L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -509672 sc-eQTL 9.12e-01 0.0206 0.187 0.051 CD4_TCM L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -509866 sc-eQTL 8.70e-01 0.0246 0.151 0.051 CD4_TCM L2
ENSG00000134644 PUM1 -278875 sc-eQTL 8.35e-01 0.0278 0.133 0.051 CD4_TCM L2
ENSG00000162511 LAPTM5 29342 sc-eQTL 4.13e-01 -0.0907 0.11 0.051 CD4_TCM L2
ENSG00000162517 PEF1 -857780 sc-eQTL 4.15e-01 -0.121 0.148 0.051 CD4_TCM L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 68612 sc-eQTL 4.38e-01 -0.109 0.14 0.051 CD4_TCM L2
ENSG00000287510 AL137857.1 55423 sc-eQTL 2.83e-01 -0.168 0.156 0.051 CD4_TCM L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -509672 sc-eQTL 5.86e-01 -0.101 0.185 0.051 CD4_TEM L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -509866 sc-eQTL 1.86e-01 0.233 0.176 0.051 CD4_TEM L2
ENSG00000134644 PUM1 -278875 sc-eQTL 7.79e-01 -0.0412 0.147 0.051 CD4_TEM L2
ENSG00000162511 LAPTM5 29342 sc-eQTL 9.81e-01 0.0035 0.148 0.051 CD4_TEM L2
ENSG00000162517 PEF1 -857780 sc-eQTL 2.44e-01 -0.193 0.166 0.051 CD4_TEM L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 68612 sc-eQTL 1.31e-01 -0.262 0.173 0.051 CD4_TEM L2
ENSG00000287510 AL137857.1 55423 sc-eQTL 8.66e-01 -0.0289 0.171 0.051 CD4_TEM L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -509672 sc-eQTL 4.66e-02 -0.397 0.198 0.051 CD8_CTL L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -509866 sc-eQTL 8.93e-01 0.0207 0.154 0.051 CD8_CTL L2
ENSG00000134644 PUM1 -278875 sc-eQTL 5.57e-01 0.0877 0.149 0.051 CD8_CTL L2
ENSG00000162511 LAPTM5 29342 sc-eQTL 4.70e-01 0.119 0.165 0.051 CD8_CTL L2
ENSG00000162517 PEF1 -857780 sc-eQTL 5.59e-01 -0.0841 0.144 0.051 CD8_CTL L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 68612 sc-eQTL 6.02e-01 0.0905 0.174 0.051 CD8_CTL L2
ENSG00000287510 AL137857.1 55423 sc-eQTL 7.33e-01 -0.0558 0.163 0.051 CD8_CTL L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -509672 sc-eQTL 4.46e-01 0.14 0.184 0.051 CD8_Naive L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -509866 sc-eQTL 8.74e-01 0.0252 0.159 0.051 CD8_Naive L2
ENSG00000134644 PUM1 -278875 sc-eQTL 3.64e-02 -0.266 0.127 0.051 CD8_Naive L2
ENSG00000162511 LAPTM5 29342 sc-eQTL 6.98e-01 0.0476 0.122 0.051 CD8_Naive L2
ENSG00000162517 PEF1 -857780 sc-eQTL 6.15e-01 0.0858 0.17 0.051 CD8_Naive L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 68612 sc-eQTL 6.96e-01 -0.0599 0.153 0.051 CD8_Naive L2
ENSG00000287510 AL137857.1 55423 sc-eQTL 4.86e-02 0.327 0.165 0.051 CD8_Naive L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -509672 sc-eQTL 2.90e-01 0.216 0.203 0.051 CD8_TCM L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -509866 sc-eQTL 1.39e-01 -0.276 0.186 0.051 CD8_TCM L2
ENSG00000134644 PUM1 -278875 sc-eQTL 7.83e-01 0.0484 0.176 0.051 CD8_TCM L2
ENSG00000162511 LAPTM5 29342 sc-eQTL 7.98e-01 0.0471 0.184 0.051 CD8_TCM L2
ENSG00000162517 PEF1 -857780 sc-eQTL 1.95e-01 -0.243 0.187 0.051 CD8_TCM L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 68612 sc-eQTL 9.65e-01 -0.00741 0.17 0.051 CD8_TCM L2
ENSG00000287510 AL137857.1 55423 sc-eQTL 2.69e-01 0.19 0.172 0.051 CD8_TCM L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -509672 sc-eQTL 8.02e-01 -0.0481 0.192 0.053 CD8_TEM L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -509866 sc-eQTL 1.38e-01 -0.272 0.183 0.053 CD8_TEM L2
ENSG00000134644 PUM1 -278875 sc-eQTL 4.23e-01 0.151 0.188 0.053 CD8_TEM L2
ENSG00000162511 LAPTM5 29342 sc-eQTL 8.21e-01 0.0401 0.177 0.053 CD8_TEM L2
ENSG00000162517 PEF1 -857780 sc-eQTL 3.76e-01 0.147 0.166 0.053 CD8_TEM L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 68612 sc-eQTL 3.64e-01 -0.166 0.183 0.053 CD8_TEM L2
ENSG00000287510 AL137857.1 55423 sc-eQTL 9.84e-01 0.00338 0.166 0.053 CD8_TEM L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -509672 sc-eQTL 5.30e-01 -0.122 0.194 0.052 MAIT L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -509866 sc-eQTL 7.27e-01 0.0602 0.172 0.052 MAIT L2
ENSG00000134644 PUM1 -278875 sc-eQTL 7.22e-02 -0.296 0.164 0.052 MAIT L2
ENSG00000162511 LAPTM5 29342 sc-eQTL 9.10e-01 0.0176 0.156 0.052 MAIT L2
ENSG00000162517 PEF1 -857780 sc-eQTL 2.10e-01 0.214 0.17 0.052 MAIT L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 68612 sc-eQTL 8.31e-01 0.0371 0.173 0.052 MAIT L2
ENSG00000287510 AL137857.1 55423 sc-eQTL 6.02e-01 -0.0933 0.178 0.052 MAIT L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -509672 sc-eQTL 9.32e-01 -0.0169 0.199 0.053 NK_CD56bright L2
ENSG00000121753 ADGRB2 -977777 sc-eQTL 4.21e-01 -0.125 0.155 0.053 NK_CD56bright L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -509866 sc-eQTL 5.69e-01 0.0958 0.168 0.053 NK_CD56bright L2
ENSG00000134644 PUM1 -278875 sc-eQTL 6.53e-01 -0.0792 0.176 0.053 NK_CD56bright L2
ENSG00000162511 LAPTM5 29342 sc-eQTL 5.02e-01 0.117 0.174 0.053 NK_CD56bright L2
ENSG00000162517 PEF1 -857780 sc-eQTL 3.45e-01 -0.16 0.169 0.053 NK_CD56bright L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 68612 sc-eQTL 4.83e-01 -0.123 0.175 0.053 NK_CD56bright L2
ENSG00000287510 AL137857.1 55423 sc-eQTL 2.72e-01 -0.189 0.172 0.053 NK_CD56bright L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -509672 sc-eQTL 9.41e-01 0.0138 0.188 0.052 NK_CD56dim L2
ENSG00000121753 ADGRB2 -977777 sc-eQTL 4.16e-01 0.134 0.165 0.052 NK_CD56dim L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -509866 sc-eQTL 7.79e-01 -0.0389 0.139 0.052 NK_CD56dim L2
ENSG00000134644 PUM1 -278875 sc-eQTL 5.84e-01 -0.078 0.142 0.052 NK_CD56dim L2
ENSG00000162511 LAPTM5 29342 sc-eQTL 1.81e-01 -0.203 0.151 0.052 NK_CD56dim L2
ENSG00000162517 PEF1 -857780 sc-eQTL 8.55e-01 0.0247 0.135 0.052 NK_CD56dim L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 68612 sc-eQTL 6.02e-01 0.0993 0.19 0.052 NK_CD56dim L2
ENSG00000287510 AL137857.1 55423 sc-eQTL 6.91e-01 -0.0624 0.157 0.052 NK_CD56dim L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -509672 sc-eQTL 2.50e-01 0.225 0.195 0.055 NK_HLA L2
ENSG00000121753 ADGRB2 -977777 sc-eQTL 8.98e-01 0.02 0.155 0.055 NK_HLA L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -509866 sc-eQTL 1.14e-01 0.275 0.174 0.055 NK_HLA L2
ENSG00000134644 PUM1 -278875 sc-eQTL 6.63e-01 -0.0743 0.17 0.055 NK_HLA L2
ENSG00000162511 LAPTM5 29342 sc-eQTL 8.88e-02 -0.276 0.161 0.055 NK_HLA L2
ENSG00000162517 PEF1 -857780 sc-eQTL 9.01e-02 -0.31 0.182 0.055 NK_HLA L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 68612 sc-eQTL 2.66e-01 0.192 0.172 0.055 NK_HLA L2
ENSG00000287510 AL137857.1 55423 sc-eQTL 9.34e-01 -0.0138 0.167 0.055 NK_HLA L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -509672 sc-eQTL 8.65e-01 -0.0315 0.185 0.052 NK_cytokine L2
ENSG00000121753 ADGRB2 -977777 sc-eQTL 5.41e-01 -0.102 0.167 0.052 NK_cytokine L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -509866 sc-eQTL 9.41e-01 -0.0106 0.145 0.052 NK_cytokine L2
ENSG00000134644 PUM1 -278875 sc-eQTL 2.62e-01 -0.176 0.156 0.052 NK_cytokine L2
ENSG00000162511 LAPTM5 29342 sc-eQTL 8.24e-01 0.0383 0.172 0.052 NK_cytokine L2
ENSG00000162517 PEF1 -857780 sc-eQTL 9.51e-01 -0.00912 0.147 0.052 NK_cytokine L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 68612 sc-eQTL 1.73e-01 -0.248 0.182 0.052 NK_cytokine L2
ENSG00000287510 AL137857.1 55423 sc-eQTL 3.32e-01 0.165 0.169 0.052 NK_cytokine L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -509672 sc-eQTL 1.50e-01 0.291 0.201 0.052 PB L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -509866 sc-eQTL 2.72e-01 0.258 0.234 0.052 PB L2
ENSG00000134644 PUM1 -278875 sc-eQTL 1.58e-01 0.288 0.203 0.052 PB L2
ENSG00000162510 MATN1 63531 sc-eQTL 5.87e-01 -0.104 0.19 0.052 PB L2
ENSG00000162511 LAPTM5 29342 sc-eQTL 9.80e-01 -0.00339 0.136 0.052 PB L2
ENSG00000162517 PEF1 -857780 sc-eQTL 2.87e-01 0.223 0.209 0.052 PB L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 68612 sc-eQTL 2.94e-01 0.195 0.185 0.052 PB L2
ENSG00000287510 AL137857.1 55423 sc-eQTL 2.26e-01 -0.24 0.197 0.052 PB L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -509672 sc-eQTL 6.16e-01 0.0742 0.147 0.05 Pro_T L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -509866 sc-eQTL 2.93e-02 0.406 0.185 0.05 Pro_T L2
ENSG00000134644 PUM1 -278875 sc-eQTL 1.96e-01 0.226 0.174 0.05 Pro_T L2
ENSG00000162511 LAPTM5 29342 sc-eQTL 2.53e-02 -0.279 0.124 0.05 Pro_T L2
ENSG00000162517 PEF1 -857780 sc-eQTL 5.51e-01 0.11 0.184 0.05 Pro_T L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 68612 sc-eQTL 7.10e-01 0.0653 0.175 0.05 Pro_T L2
ENSG00000287510 AL137857.1 55423 sc-eQTL 2.03e-01 -0.205 0.16 0.05 Pro_T L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -509672 sc-eQTL 2.63e-01 -0.212 0.189 0.051 Treg L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -509866 sc-eQTL 2.50e-01 -0.211 0.183 0.051 Treg L2
ENSG00000134644 PUM1 -278875 sc-eQTL 4.23e-01 -0.118 0.147 0.051 Treg L2
ENSG00000162511 LAPTM5 29342 sc-eQTL 1.39e-01 -0.248 0.167 0.051 Treg L2
ENSG00000162517 PEF1 -857780 sc-eQTL 8.35e-01 0.038 0.182 0.051 Treg L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 68612 sc-eQTL 2.78e-01 -0.186 0.171 0.051 Treg L2
ENSG00000287510 AL137857.1 55423 sc-eQTL 8.32e-01 0.0363 0.171 0.051 Treg L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -509672 sc-eQTL 3.27e-01 0.193 0.197 0.054 cDC L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -509866 sc-eQTL 6.30e-01 -0.103 0.213 0.054 cDC L2
ENSG00000134644 PUM1 -278875 sc-eQTL 7.82e-02 -0.322 0.182 0.054 cDC L2
ENSG00000162511 LAPTM5 29342 sc-eQTL 2.65e-01 -0.143 0.128 0.054 cDC L2
ENSG00000162517 PEF1 -857780 sc-eQTL 2.35e-01 0.221 0.185 0.054 cDC L2
ENSG00000168528 SERINC2 -622449 sc-eQTL 9.27e-01 0.0151 0.165 0.054 cDC L2
ENSG00000284543 LINC01226 -719110 sc-eQTL 4.25e-01 0.13 0.162 0.054 cDC L2
ENSG00000287510 AL137857.1 55423 sc-eQTL 5.46e-01 -0.105 0.174 0.054 cDC L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -509672 sc-eQTL 4.37e-01 0.12 0.154 0.051 cMono_IL1B L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -509866 sc-eQTL 2.93e-02 0.373 0.17 0.051 cMono_IL1B L2
ENSG00000134644 PUM1 -278875 sc-eQTL 5.80e-01 -0.0644 0.116 0.051 cMono_IL1B L2
ENSG00000162511 LAPTM5 29342 sc-eQTL 4.66e-02 0.202 0.101 0.051 cMono_IL1B L2
ENSG00000162512 SDC3 -121642 sc-eQTL 9.09e-01 -0.0221 0.192 0.051 cMono_IL1B L2
ENSG00000162517 PEF1 -857780 sc-eQTL 6.79e-01 -0.065 0.157 0.051 cMono_IL1B L2
ENSG00000168528 SERINC2 -622449 sc-eQTL 5.83e-01 0.107 0.194 0.051 cMono_IL1B L2
ENSG00000284543 LINC01226 -719110 sc-eQTL 5.38e-01 -0.106 0.172 0.051 cMono_IL1B L2
ENSG00000287510 AL137857.1 55423 sc-eQTL 9.15e-01 0.0172 0.16 0.051 cMono_IL1B L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -509672 sc-eQTL 1.44e-01 0.238 0.162 0.051 cMono_S100A L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -509866 sc-eQTL 5.79e-01 0.107 0.192 0.051 cMono_S100A L2
ENSG00000134644 PUM1 -278875 sc-eQTL 1.94e-01 -0.18 0.138 0.051 cMono_S100A L2
ENSG00000162511 LAPTM5 29342 sc-eQTL 1.10e-01 0.17 0.106 0.051 cMono_S100A L2
ENSG00000162512 SDC3 -121642 sc-eQTL 1.85e-01 -0.244 0.184 0.051 cMono_S100A L2
ENSG00000162517 PEF1 -857780 sc-eQTL 2.80e-01 0.18 0.166 0.051 cMono_S100A L2
ENSG00000168528 SERINC2 -622449 sc-eQTL 9.50e-01 0.0122 0.195 0.051 cMono_S100A L2
ENSG00000284543 LINC01226 -719110 sc-eQTL 3.87e-01 0.137 0.158 0.051 cMono_S100A L2
ENSG00000287510 AL137857.1 55423 sc-eQTL 9.52e-01 0.00965 0.159 0.051 cMono_S100A L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -509672 sc-eQTL 5.79e-01 -0.12 0.216 0.064 gdT L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -509866 sc-eQTL 8.65e-01 0.0315 0.185 0.064 gdT L2
ENSG00000134644 PUM1 -278875 sc-eQTL 9.82e-01 0.00424 0.191 0.064 gdT L2
ENSG00000162511 LAPTM5 29342 sc-eQTL 1.46e-01 -0.301 0.206 0.064 gdT L2
ENSG00000162517 PEF1 -857780 sc-eQTL 6.22e-01 0.0938 0.19 0.064 gdT L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 68612 sc-eQTL 4.67e-01 -0.139 0.191 0.064 gdT L2
ENSG00000287510 AL137857.1 55423 sc-eQTL 9.33e-01 -0.0157 0.186 0.064 gdT L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -509672 sc-eQTL 3.04e-01 0.206 0.2 0.053 intMono L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -509866 sc-eQTL 8.88e-01 0.0304 0.216 0.053 intMono L2
ENSG00000134644 PUM1 -278875 sc-eQTL 9.08e-02 0.309 0.182 0.053 intMono L2
ENSG00000162511 LAPTM5 29342 sc-eQTL 4.71e-01 0.104 0.143 0.053 intMono L2
ENSG00000162512 SDC3 -121642 sc-eQTL 7.65e-01 0.0589 0.197 0.053 intMono L2
ENSG00000162517 PEF1 -857780 sc-eQTL 8.93e-01 0.0279 0.207 0.053 intMono L2
ENSG00000168528 SERINC2 -622449 sc-eQTL 9.78e-01 0.00576 0.206 0.053 intMono L2
ENSG00000284543 LINC01226 -719110 sc-eQTL 2.03e-01 -0.248 0.194 0.053 intMono L2
ENSG00000287510 AL137857.1 55423 sc-eQTL 3.99e-01 0.165 0.195 0.053 intMono L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -509672 sc-eQTL 2.85e-01 0.176 0.164 0.054 ncMono L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -509866 sc-eQTL 1.86e-01 0.232 0.175 0.054 ncMono L2
ENSG00000134644 PUM1 -278875 sc-eQTL 3.71e-01 -0.129 0.143 0.054 ncMono L2
ENSG00000162511 LAPTM5 29342 sc-eQTL 5.06e-01 0.0868 0.13 0.054 ncMono L2
ENSG00000162512 SDC3 -121642 sc-eQTL 1.72e-01 -0.199 0.145 0.054 ncMono L2
ENSG00000162517 PEF1 -857780 sc-eQTL 4.28e-01 -0.133 0.167 0.054 ncMono L2
ENSG00000168528 SERINC2 -622449 sc-eQTL 7.24e-01 -0.0565 0.159 0.054 ncMono L2
ENSG00000284543 LINC01226 -719110 sc-eQTL 5.48e-01 0.0959 0.159 0.054 ncMono L2
ENSG00000287510 AL137857.1 55423 sc-eQTL 2.80e-01 -0.178 0.165 0.054 ncMono L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -509672 sc-eQTL 4.33e-01 -0.164 0.209 0.054 pDC L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -509866 sc-eQTL 5.75e-02 -0.434 0.227 0.054 pDC L2
ENSG00000134644 PUM1 -278875 sc-eQTL 4.45e-01 0.146 0.19 0.054 pDC L2
ENSG00000162511 LAPTM5 29342 sc-eQTL 2.27e-01 0.214 0.176 0.054 pDC L2
ENSG00000162517 PEF1 -857780 sc-eQTL 1.71e-01 0.314 0.228 0.054 pDC L2
ENSG00000168528 SERINC2 -622449 sc-eQTL 8.46e-01 -0.0417 0.215 0.054 pDC L2
ENSG00000284543 LINC01226 -719110 sc-eQTL 6.09e-01 0.0854 0.167 0.054 pDC L2
ENSG00000287510 AL137857.1 55423 sc-eQTL 9.45e-01 -0.0136 0.196 0.054 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000060688 SNRNP40 -509672 sc-eQTL 7.06e-01 0.0716 0.19 0.051 B_Memory LOneK1K
ENSG00000121766 ZCCHC17 -509866 sc-eQTL 8.22e-01 0.0356 0.158 0.051 B_Memory LOneK1K
ENSG00000134644 PUM1 -278875 sc-eQTL 7.92e-01 -0.037 0.14 0.051 B_Memory LOneK1K
ENSG00000162510 MATN1 63531 sc-eQTL 7.02e-02 0.288 0.158 0.051 B_Memory LOneK1K
ENSG00000162511 LAPTM5 29342 sc-eQTL 9.55e-01 -0.00568 0.1 0.051 B_Memory LOneK1K
ENSG00000162517 PEF1 -857780 sc-eQTL 6.94e-01 0.0655 0.166 0.051 B_Memory LOneK1K
ENSG00000186056 MATN1-AS1 68612 sc-eQTL 6.82e-01 -0.0545 0.133 0.051 B_Memory LOneK1K
ENSG00000287510 AL137857.1 55423 sc-eQTL 7.36e-01 0.0488 0.145 0.051 B_Memory LOneK1K
ENSG00000060688 SNRNP40 -509672 sc-eQTL 7.55e-01 0.0541 0.173 0.051 B_Naive LOneK1K
ENSG00000121766 ZCCHC17 -509866 sc-eQTL 3.20e-01 0.136 0.136 0.051 B_Naive LOneK1K
ENSG00000134644 PUM1 -278875 sc-eQTL 2.12e-01 -0.161 0.129 0.051 B_Naive LOneK1K
ENSG00000162510 MATN1 63531 sc-eQTL 9.86e-01 -0.00217 0.125 0.051 B_Naive LOneK1K
ENSG00000162511 LAPTM5 29342 sc-eQTL 7.51e-01 -0.0278 0.0877 0.051 B_Naive LOneK1K
ENSG00000162517 PEF1 -857780 sc-eQTL 7.62e-01 0.0486 0.16 0.051 B_Naive LOneK1K
ENSG00000186056 MATN1-AS1 68612 sc-eQTL 7.35e-01 -0.0383 0.113 0.051 B_Naive LOneK1K
ENSG00000287510 AL137857.1 55423 sc-eQTL 5.16e-01 0.0874 0.134 0.051 B_Naive LOneK1K
ENSG00000060688 SNRNP40 -509672 sc-eQTL 1.79e-01 0.197 0.146 0.051 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000121766 ZCCHC17 -509866 sc-eQTL 6.36e-02 0.308 0.165 0.051 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000134644 PUM1 -278875 sc-eQTL 4.08e-01 -0.0877 0.106 0.051 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000162511 LAPTM5 29342 sc-eQTL 5.79e-02 0.176 0.0924 0.051 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000162512 SDC3 -121642 sc-eQTL 3.89e-01 -0.164 0.19 0.051 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000162517 PEF1 -857780 sc-eQTL 7.04e-01 0.0508 0.134 0.051 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000168528 SERINC2 -622449 sc-eQTL 5.74e-01 0.11 0.195 0.051 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000284543 LINC01226 -719110 sc-eQTL 9.74e-01 0.00531 0.16 0.051 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000287510 AL137857.1 55423 sc-eQTL 9.05e-01 0.0179 0.15 0.051 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000060688 SNRNP40 -509672 sc-eQTL 2.96e-02 0.349 0.16 0.052 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000121766 ZCCHC17 -509866 sc-eQTL 5.18e-01 0.114 0.176 0.052 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000134644 PUM1 -278875 sc-eQTL 8.12e-01 0.0344 0.145 0.052 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000162511 LAPTM5 29342 sc-eQTL 9.99e-01 0.000105 0.116 0.052 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000162512 SDC3 -121642 sc-eQTL 8.53e-01 0.0313 0.169 0.052 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000162517 PEF1 -857780 sc-eQTL 2.38e-01 -0.181 0.153 0.052 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000168528 SERINC2 -622449 sc-eQTL 9.81e-01 0.0041 0.175 0.052 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000284543 LINC01226 -719110 sc-eQTL 7.72e-01 0.0483 0.166 0.052 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000287510 AL137857.1 55423 sc-eQTL 4.69e-01 -0.121 0.166 0.052 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000060688 SNRNP40 -509672 sc-eQTL 7.60e-01 0.0548 0.179 0.052 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000121753 ADGRB2 -977777 sc-eQTL 6.67e-01 0.0657 0.152 0.052 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000121766 ZCCHC17 -509866 sc-eQTL 8.83e-01 -0.0181 0.122 0.052 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000134644 PUM1 -278875 sc-eQTL 3.58e-01 -0.123 0.134 0.052 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000162511 LAPTM5 29342 sc-eQTL 4.18e-01 -0.121 0.149 0.052 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000162517 PEF1 -857780 sc-eQTL 8.54e-01 0.021 0.114 0.052 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000186056 MATN1-AS1 68612 sc-eQTL 7.71e-01 0.0502 0.173 0.052 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000287510 AL137857.1 55423 sc-eQTL 9.64e-01 -0.00666 0.149 0.052 NK_CD56dim LOneK1K

Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF
ENSG00000186056 MATN1-AS1 68612 eQTL 4.81e-02 0.0547 0.0276 0.0 0.0 0.0564
ENSG00000229447 AC114495.2 -476565 eQTL 0.045 -0.151 0.0753 0.0 0.0 0.0564

Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina